View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10233A_low_160 (Length: 262)

Name: NF10233A_low_160
Description: NF10233A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10233A_low_160
NF10233A_low_160
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (5-262)||(22084035-22084292)
chr8 (6-262)||(17669216-17669472)
chr8 (6-262)||(17675868-17676124)
chr8 (6-262)||(21915216-21915472)
chr8 (6-258)||(5534085-5534337)
chr8 (6-262)||(20019586-20019842)
chr8 (6-262)||(20013510-20013765)
chr8 (6-257)||(28454968-28455219)
chr8 (6-262)||(19111430-19111686)
chr8 (6-262)||(19117721-19117977)
chr8 (6-258)||(8354409-8354661)
chr8 (10-258)||(22123035-22123283)
chr8 (10-262)||(18865535-18865787)
chr8 (10-258)||(16882822-16883070)
chr8 (10-262)||(18855140-18855392)
chr8 (10-258)||(29123293-29123541)
chr8 (10-258)||(22115370-22115618)
chr8 (6-262)||(22048150-22048406)
chr8 (6-262)||(19496594-19496850)
chr8 (20-258)||(20527657-20527895)
chr8 (10-133)||(22122072-22122195)
chr8 (61-258)||(19905705-19905901)
chr8 (10-169)||(20023578-20023737)
chr8 (20-239)||(26934836-26935055)
chr8 (20-257)||(18065540-18065777)
chr8 (20-239)||(3216488-3216707)
chr8 (20-89)||(23845443-23845512)
chr8 (128-258)||(22124296-22124426)
chr8 (194-239)||(23845595-23845640)
[»] chr4 (60 HSPs)
chr4 (5-262)||(36884380-36884637)
chr4 (6-262)||(19779936-19780192)
chr4 (6-259)||(18024074-18024327)
chr4 (6-262)||(12475223-12475479)
chr4 (5-262)||(15362336-15362593)
chr4 (6-257)||(17961971-17962222)
chr4 (5-259)||(22194826-22195080)
chr4 (5-262)||(15383139-15383396)
chr4 (10-262)||(4772300-4772552)
chr4 (6-262)||(8048142-8048398)
chr4 (6-262)||(8054755-8055011)
chr4 (6-262)||(23954351-23954607)
chr4 (6-262)||(23961013-23961269)
chr4 (5-258)||(15148663-15148916)
chr4 (5-262)||(16231487-16231744)
chr4 (5-262)||(18295829-18296086)
chr4 (6-262)||(12481853-12482109)
chr4 (6-257)||(8385043-8385294)
chr4 (6-257)||(8391698-8391949)
chr4 (6-257)||(14074039-14074290)
chr4 (6-257)||(15256817-15257068)
chr4 (6-257)||(17808622-17808873)
chr4 (6-257)||(17089624-17089875)
chr4 (6-257)||(29040545-29040796)
chr4 (6-258)||(14298474-14298726)
chr4 (10-258)||(20115350-20115598)
chr4 (20-258)||(14268118-14268356)
chr4 (5-258)||(14305097-14305350)
chr4 (10-258)||(40478355-40478603)
chr4 (20-258)||(7900831-7901069)
chr4 (10-258)||(26284558-26284806)
chr4 (10-258)||(40471682-40471930)
chr4 (20-258)||(51493478-51493716)
chr4 (10-262)||(6873026-6873278)
chr4 (20-258)||(15321754-15321992)
chr4 (10-261)||(18071373-18071624)
chr4 (10-178)||(17810560-17810728)
chr4 (10-178)||(14757072-14757240)
chr4 (20-262)||(9271764-9272006)
chr4 (6-121)||(17991315-17991430)
chr4 (20-258)||(23838641-23838879)
chr4 (20-258)||(14679170-14679408)
chr4 (20-258)||(14685378-14685617)
chr4 (49-258)||(35170836-35171045)
chr4 (43-258)||(12522292-12522507)
chr4 (20-140)||(386014-386134)
chr4 (43-258)||(41385428-41385643)
chr4 (20-258)||(35614147-35614384)
chr4 (20-257)||(12349234-12349471)
chr4 (20-239)||(16956310-16956529)
chr4 (10-169)||(27710042-27710201)
chr4 (20-239)||(53433604-53433823)
chr4 (20-252)||(55795672-55795903)
chr4 (126-257)||(12299664-12299795)
chr4 (10-169)||(19941804-19941963)
chr4 (10-169)||(23081885-23082044)
chr4 (20-258)||(30234838-30235076)
chr4 (194-258)||(386166-386230)
chr4 (20-169)||(9556827-9556976)
chr4 (20-91)||(22633861-22633932)
[»] chr3 (93 HSPs)
chr3 (5-262)||(26889660-26889917)
chr3 (6-262)||(37615596-37615852)
chr3 (6-259)||(14672845-14673098)
chr3 (6-262)||(418205-418461)
chr3 (6-262)||(26788450-26788706)
chr3 (6-262)||(26794040-26794296)
chr3 (6-262)||(6598923-6599179)
chr3 (6-262)||(6605603-6605859)
chr3 (6-262)||(5106529-5106785)
chr3 (6-262)||(10845929-10846184)
chr3 (10-262)||(31422202-31422454)
chr3 (20-262)||(10153394-10153636)
chr3 (6-257)||(48423578-48423829)
chr3 (6-257)||(48430356-48430607)
chr3 (10-261)||(16623704-16623955)
chr3 (6-257)||(16634061-16634312)
chr3 (6-257)||(16640671-16640922)
chr3 (6-257)||(43161336-43161587)
chr3 (6-257)||(43167573-43167824)
chr3 (6-257)||(1332706-1332956)
chr3 (6-262)||(16747484-16747740)
chr3 (6-262)||(16758216-16758472)
chr3 (6-262)||(13250924-13251180)
chr3 (6-262)||(13257570-13257826)
chr3 (10-258)||(53380001-53380247)
chr3 (10-258)||(53386653-53386899)
chr3 (20-262)||(5221609-5221851)
chr3 (10-258)||(16489319-16489567)
chr3 (10-258)||(41201447-41201695)
chr3 (10-258)||(15726581-15726829)
chr3 (6-262)||(20057048-20057304)
chr3 (6-262)||(20063686-20063942)
chr3 (10-258)||(23704418-23704666)
chr3 (10-258)||(23722874-23723122)
chr3 (10-258)||(23741330-23741578)
chr3 (20-252)||(5149627-5149859)
chr3 (10-258)||(15691927-15692175)
chr3 (6-262)||(3690824-3691080)
chr3 (10-258)||(41091996-41092244)
chr3 (6-178)||(30066237-30066409)
chr3 (10-169)||(14499625-14499784)
chr3 (10-178)||(11070359-11070527)
chr3 (10-178)||(11165179-11165347)
chr3 (20-261)||(10911105-10911346)
chr3 (20-258)||(24187985-24188223)
chr3 (20-257)||(839455-839692)
chr3 (20-261)||(10003843-10004084)
chr3 (98-261)||(10010490-10010653)
chr3 (98-261)||(10904433-10904596)
chr3 (20-258)||(55149186-55149424)
chr3 (10-258)||(19809237-19809485)
chr3 (10-140)||(22642988-22643118)
chr3 (10-239)||(15825891-15826120)
chr3 (10-169)||(17710241-17710400)
chr3 (10-140)||(55023174-55023304)
chr3 (10-169)||(15991753-15991912)
chr3 (20-258)||(7985915-7986152)
chr3 (20-258)||(20723209-20723447)
chr3 (20-258)||(6608688-6608926)
chr3 (20-239)||(17252716-17252935)
chr3 (10-258)||(15404143-15404390)
chr3 (20-257)||(12482638-12482875)
chr3 (20-257)||(15584379-15584616)
chr3 (20-257)||(15591037-15591274)
chr3 (10-95)||(22670536-22670621)
chr3 (10-169)||(410400-410559)
chr3 (10-169)||(1145201-1145360)
chr3 (20-239)||(10236054-10236272)
chr3 (20-239)||(12891633-12891852)
chr3 (43-254)||(28350844-28351055)
chr3 (10-258)||(15397552-15397799)
chr3 (20-169)||(4710596-4710744)
chr3 (20-257)||(5201433-5201670)
chr3 (10-169)||(15343255-15343414)
chr3 (10-169)||(15349898-15350057)
chr3 (20-258)||(5426362-5426600)
chr3 (10-258)||(15360901-15361148)
chr3 (20-169)||(4291069-4291218)
chr3 (20-169)||(13321269-13321418)
chr3 (20-252)||(5419964-5420196)
chr3 (10-169)||(8720805-8720964)
chr3 (10-169)||(9072692-9072851)
chr3 (10-89)||(15337810-15337889)
chr3 (20-258)||(16333381-16333618)
chr3 (116-239)||(13315943-13316066)
chr3 (20-165)||(10326154-10326299)
chr3 (198-258)||(15337642-15337702)
chr3 (20-91)||(4588463-4588534)
chr3 (20-91)||(12340154-12340225)
chr3 (194-239)||(4290999-4291044)
chr3 (42-91)||(12852034-12852083)
chr3 (194-239)||(30777057-30777102)
chr3 (195-239)||(15991938-15991982)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (6-262)||(30731-30987)
scaffold0044 (6-262)||(72544-72800)
scaffold0044 (10-258)||(8267-8515)
[»] chr7 (64 HSPs)
chr7 (6-262)||(40523007-40523263)
chr7 (6-262)||(9510658-9510914)
chr7 (6-262)||(18164319-18164575)
chr7 (5-259)||(60321-60575)
chr7 (6-262)||(14330990-14331246)
chr7 (6-262)||(14337574-14337830)
chr7 (6-257)||(21891-22142)
chr7 (6-257)||(8201720-8201971)
chr7 (9-258)||(11366408-11366657)
chr7 (6-257)||(15022338-15022590)
chr7 (10-258)||(14655066-14655314)
chr7 (6-262)||(44786120-44786376)
chr7 (6-262)||(44792761-44793017)
chr7 (10-258)||(18176312-18176560)
chr7 (10-258)||(18182984-18183232)
chr7 (6-262)||(12703033-12703311)
chr7 (10-230)||(15155819-15156039)
chr7 (10-258)||(15162470-15162718)
chr7 (10-258)||(16406944-16407192)
chr7 (10-258)||(13684670-13684918)
chr7 (10-258)||(13691285-13691533)
chr7 (10-258)||(20702641-20702889)
chr7 (10-258)||(32767882-32768130)
chr7 (10-169)||(11238621-11238780)
chr7 (104-262)||(49051574-49051732)
chr7 (10-169)||(11231934-11232093)
chr7 (45-258)||(1347716-1347928)
chr7 (10-178)||(33395-33563)
chr7 (10-178)||(70415-70583)
chr7 (20-258)||(4318205-4318443)
chr7 (10-178)||(74523-74692)
chr7 (20-258)||(14953405-14953643)
chr7 (43-258)||(18531452-18531667)
chr7 (20-258)||(11262536-11262774)
chr7 (51-169)||(12704349-12704467)
chr7 (20-258)||(14148777-14149015)
chr7 (20-258)||(14959371-14959609)
chr7 (45-258)||(12692703-12692916)
chr7 (43-258)||(25038893-25039108)
chr7 (20-257)||(18553192-18553429)
chr7 (20-257)||(18584960-18585197)
chr7 (20-258)||(10875736-10875973)
chr7 (20-258)||(23519614-23519852)
chr7 (20-252)||(10869662-10869893)
chr7 (46-238)||(11547953-11548145)
chr7 (46-238)||(11554549-11554741)
chr7 (20-239)||(6016831-6017050)
chr7 (20-249)||(8706212-8706441)
chr7 (20-249)||(8719628-8719857)
chr7 (46-169)||(9410241-9410364)
chr7 (20-90)||(44408019-44408089)
chr7 (194-258)||(26420207-26420271)
chr7 (20-90)||(26420353-26420423)
chr7 (194-258)||(44408171-44408235)
chr7 (20-91)||(39267294-39267365)
chr7 (6-56)||(1245667-1245717)
chr7 (20-150)||(7536501-7536631)
chr7 (132-258)||(13570102-13570227)
chr7 (20-91)||(2831954-2832025)
chr7 (20-91)||(9751198-9751269)
chr7 (20-91)||(18302580-18302651)
chr7 (200-258)||(11232123-11232181)
chr7 (200-258)||(11238810-11238868)
chr7 (194-258)||(9410152-9410216)
[»] chr5 (66 HSPs)
chr5 (6-262)||(22062527-22062783)
chr5 (6-262)||(22265149-22265405)
chr5 (6-262)||(27663435-27663691)
chr5 (6-262)||(27670075-27670331)
chr5 (6-262)||(23584344-23584600)
chr5 (6-262)||(41097868-41098124)
chr5 (6-262)||(17706576-17706832)
chr5 (6-262)||(41769446-41769702)
chr5 (6-262)||(27615549-27615805)
chr5 (6-262)||(41776020-41776276)
chr5 (18-262)||(27608943-27609187)
chr5 (10-262)||(34294202-34294454)
chr5 (5-262)||(40707326-40707582)
chr5 (5-262)||(40713968-40714224)
chr5 (6-257)||(25106993-25107244)
chr5 (6-257)||(25166086-25166337)
chr5 (6-262)||(23610106-23610362)
chr5 (6-262)||(23841502-23841758)
chr5 (10-262)||(24471897-24472149)
chr5 (6-257)||(16355054-16355305)
chr5 (6-257)||(16361713-16361964)
chr5 (6-257)||(34565047-34565298)
chr5 (6-257)||(34571702-34571953)
chr5 (10-258)||(19992091-19992339)
chr5 (10-258)||(15001328-15001576)
chr5 (10-258)||(14994685-14994933)
chr5 (6-262)||(27516956-27517211)
chr5 (6-262)||(27523593-27523848)
chr5 (10-258)||(1692086-1692334)
chr5 (10-258)||(18038317-18038565)
chr5 (10-258)||(27686978-27687226)
chr5 (5-258)||(37293128-37293381)
chr5 (10-258)||(22327813-22328061)
chr5 (10-238)||(22334467-22334695)
chr5 (5-258)||(37286425-37286678)
chr5 (20-252)||(25406639-25406871)
chr5 (20-258)||(22133206-22133444)
chr5 (20-258)||(22139898-22140136)
chr5 (20-258)||(22588302-22588540)
chr5 (10-258)||(17284274-17284522)
chr5 (10-258)||(29477604-29477852)
chr5 (10-258)||(41294084-41294332)
chr5 (6-262)||(37544245-37544502)
chr5 (10-258)||(29471009-29471257)
chr5 (10-178)||(15236430-15236598)
chr5 (20-258)||(21294923-21295161)
chr5 (43-258)||(23336971-23337186)
chr5 (43-258)||(25535196-25535411)
chr5 (98-261)||(33726064-33726227)
chr5 (20-258)||(14359479-14359717)
chr5 (20-258)||(15441614-15441852)
chr5 (125-251)||(20776103-20776229)
chr5 (20-258)||(24554742-24554979)
chr5 (6-169)||(19775241-19775404)
chr5 (7-169)||(19768645-19768807)
chr5 (22-239)||(22325588-22325805)
chr5 (20-257)||(22410258-22410495)
chr5 (20-257)||(29316627-29316864)
chr5 (10-169)||(23250237-23250396)
chr5 (20-258)||(22258133-22258370)
chr5 (48-257)||(21667494-21667703)
chr5 (20-239)||(25808146-25808365)
chr5 (10-89)||(24020637-24020716)
chr5 (20-239)||(22343724-22343943)
chr5 (43-148)||(22353194-22353299)
chr5 (20-91)||(22119841-22119912)
[»] chr2 (54 HSPs)
chr2 (6-262)||(26877214-26877470)
chr2 (6-262)||(22320632-22320888)
chr2 (6-262)||(22326785-22327041)
chr2 (6-257)||(27216275-27216526)
chr2 (6-257)||(16986153-16986404)
chr2 (6-257)||(28431558-28431809)
chr2 (6-257)||(13306235-13306486)
chr2 (6-257)||(9340492-9340743)
chr2 (6-257)||(9489126-9489377)
chr2 (6-257)||(9608387-9608638)
chr2 (10-262)||(24913614-24913866)
chr2 (6-262)||(27617500-27617756)
chr2 (6-262)||(16997254-16997510)
chr2 (10-257)||(19489574-19489821)
chr2 (6-262)||(17003887-17004143)
chr2 (20-258)||(29233737-29233975)
chr2 (20-258)||(29347036-29347274)
chr2 (6-258)||(1843291-1843543)
chr2 (10-258)||(23171246-23171494)
chr2 (10-258)||(23582503-23582751)
chr2 (52-258)||(27599472-27599678)
chr2 (20-250)||(12829286-12829516)
chr2 (91-257)||(16922741-16922907)
chr2 (92-262)||(16928560-16928730)
chr2 (10-178)||(10101295-10101463)
chr2 (20-262)||(10866576-10866818)
chr2 (20-262)||(10873743-10873985)
chr2 (20-258)||(27197093-27197331)
chr2 (6-87)||(29282430-29282511)
chr2 (20-258)||(21138931-21139169)
chr2 (6-106)||(16980563-16980663)
chr2 (10-169)||(41604381-41604540)
chr2 (10-169)||(41610278-41610437)
chr2 (20-258)||(21146949-21147187)
chr2 (46-239)||(37318502-37318695)
chr2 (6-90)||(16928832-16928916)
chr2 (20-258)||(24503318-24503556)
chr2 (10-169)||(13970019-13970178)
chr2 (20-239)||(30970639-30970858)
chr2 (10-169)||(45057075-45057234)
chr2 (20-258)||(24640621-24640858)
chr2 (126-258)||(44380959-44381090)
chr2 (43-169)||(24872090-24872216)
chr2 (43-169)||(24879975-24880101)
chr2 (126-258)||(44387629-44387760)
chr2 (18-169)||(24715009-24715160)
chr2 (45-239)||(19645662-19645856)
chr2 (20-257)||(27369511-27369748)
chr2 (20-257)||(27376021-27376258)
chr2 (20-169)||(15477901-15478050)
chr2 (194-239)||(24880126-24880171)
chr2 (20-77)||(27602186-27602243)
chr2 (194-239)||(41604565-41604610)
chr2 (194-239)||(41610462-41610507)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (6-262)||(9462-9718)
[»] chr6 (66 HSPs)
chr6 (6-262)||(6980863-6981119)
chr6 (6-262)||(20649439-20649695)
chr6 (5-262)||(20060854-20061111)
chr6 (6-262)||(2869782-2870037)
chr6 (6-262)||(2876397-2876652)
chr6 (6-262)||(4233144-4233400)
chr6 (10-262)||(12762906-12763158)
chr6 (6-262)||(14059262-14059518)
chr6 (6-257)||(8229097-8229348)
chr6 (6-257)||(18931286-18931537)
chr6 (6-257)||(29593466-29593717)
chr6 (6-257)||(29587325-29587576)
chr6 (6-262)||(30597422-30597678)
chr6 (10-257)||(30637780-30638026)
chr6 (10-258)||(27327706-27327954)
chr6 (10-258)||(27388446-27388694)
chr6 (43-258)||(18194207-18194422)
chr6 (43-250)||(30694579-30694786)
chr6 (20-258)||(1538604-1538842)
chr6 (20-258)||(1544703-1544941)
chr6 (6-258)||(28258100-28258351)
chr6 (6-258)||(28264724-28264975)
chr6 (6-258)||(28336849-28337100)
chr6 (6-258)||(28343473-28343724)
chr6 (20-259)||(8797398-8797637)
chr6 (10-261)||(27429933-27430184)
chr6 (10-242)||(26130692-26130925)
chr6 (58-258)||(17031079-17031279)
chr6 (20-258)||(17036995-17037233)
chr6 (20-261)||(20801962-20802202)
chr6 (20-258)||(22331648-22331886)
chr6 (43-258)||(16372067-16372282)
chr6 (20-258)||(34369633-34369871)
chr6 (20-258)||(19808735-19808973)
chr6 (10-258)||(25117652-25117900)
chr6 (20-239)||(25595012-25595231)
chr6 (115-258)||(28287565-28287707)
chr6 (20-252)||(28314786-28315018)
chr6 (20-169)||(34832952-34833101)
chr6 (10-258)||(25111049-25111297)
chr6 (20-258)||(27185918-27186156)
chr6 (20-258)||(27207754-27207992)
chr6 (20-258)||(27241236-27241474)
chr6 (20-258)||(27263084-27263322)
chr6 (20-169)||(14098924-14099073)
chr6 (20-257)||(32564902-32565139)
chr6 (20-252)||(16551680-16551912)
chr6 (20-252)||(16577041-16577273)
chr6 (20-252)||(16618107-16618339)
chr6 (20-252)||(16628236-16628468)
chr6 (10-178)||(14472558-14472726)
chr6 (126-257)||(17016688-17016819)
chr6 (46-165)||(3708168-3708287)
chr6 (10-239)||(24314729-24314958)
chr6 (10-239)||(31316742-31316971)
chr6 (20-258)||(22759061-22759297)
chr6 (43-169)||(4168222-4168348)
chr6 (44-169)||(4208902-4209027)
chr6 (20-169)||(23276938-23277087)
chr6 (43-91)||(31164529-31164577)
chr6 (194-258)||(34298457-34298521)
chr6 (10-89)||(24290723-24290802)
chr6 (21-90)||(34295728-34295797)
chr6 (198-258)||(25928505-25928565)
chr6 (194-258)||(3708316-3708380)
chr6 (20-91)||(21939785-21939856)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (5-261)||(59105-59361)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (5-261)||(139272-139528)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (6-262)||(20215574-20215830)
chr1 (6-262)||(44844528-44844785)
chr1 (5-262)||(51334957-51335214)
chr1 (6-257)||(46156966-46157217)
chr1 (5-262)||(51328322-51328580)
chr1 (6-257)||(43078649-43078900)
chr1 (10-258)||(41478226-41478475)
chr1 (10-239)||(18599755-18599984)
chr1 (6-262)||(16345420-16345676)
chr1 (6-262)||(16352068-16352324)
chr1 (20-258)||(21828922-21829160)
chr1 (20-258)||(21844435-21844673)
chr1 (10-178)||(1011011-1011179)
chr1 (6-262)||(41355933-41356189)
chr1 (6-262)||(41348496-41348752)
chr1 (23-258)||(19063728-19063963)
chr1 (23-258)||(19111618-19111853)
chr1 (20-262)||(47659421-47659663)
chr1 (20-258)||(23763419-23763657)
chr1 (20-258)||(19104961-19105199)
chr1 (20-258)||(20524875-20525113)
chr1 (20-258)||(21438002-21438240)
chr1 (20-257)||(44756314-44756552)
chr1 (20-257)||(27898319-27898556)
chr1 (20-257)||(43062936-43063173)
chr1 (20-257)||(49334781-49335018)
chr1 (10-169)||(33385873-33386032)
chr1 (10-169)||(33392517-33392676)
chr1 (20-239)||(50887412-50887631)
chr1 (20-258)||(18625935-18626172)
chr1 (10-169)||(21806850-21807009)
chr1 (10-169)||(21835663-21835822)
chr1 (128-257)||(33394056-33394185)
chr1 (59-239)||(8305363-8305543)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (6-260)||(108970-109224)
[»] scaffold0052 (3 HSPs)
scaffold0052 (6-257)||(10568-10819)
scaffold0052 (6-257)||(56990-57241)
scaffold0052 (6-262)||(698-954)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (10-262)||(67712-67964)
scaffold0028 (20-258)||(41745-41983)
scaffold0028 (20-258)||(57252-57490)
scaffold0028 (10-169)||(7301-7460)
scaffold0028 (10-138)||(23363-23491)
scaffold0028 (194-239)||(13756-13801)
scaffold0028 (194-239)||(23284-23329)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (6-257)||(38913-39164)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (10-255)||(26853-27098)
scaffold0109 (20-90)||(43667-43737)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (10-255)||(125763-126008)
scaffold0029 (43-255)||(105561-105773)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (10-252)||(307310-307553)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (6-262)||(38246-38502)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (6-262)||(76310-76566)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (10-261)||(57179-57430)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (10-169)||(12719-12878)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (20-258)||(14200-14438)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (20-178)||(3536-3694)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (20-258)||(29867-30105)
scaffold0138 (20-90)||(41863-41933)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (20-258)||(242265-242503)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (45-258)||(58103-58316)
scaffold0004 (10-169)||(78511-78671)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (46-170)||(3005-3129)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (20-258)||(9548-9786)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (20-169)||(3069-3218)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (10-169)||(12741-12900)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (20-258)||(36916-37153)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (21-258)||(5459-5696)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (20-258)||(10385-10623)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (20-242)||(24635-24857)
scaffold0256 (20-90)||(19792-19862)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (20-178)||(8537-8695)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (6-92)||(61180-61266)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (20-257)||(8998-9235)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (98-258)||(32050-32209)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (20-257)||(3738-3975)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (10-169)||(74293-74452)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (126-257)||(22413-22544)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (20-258)||(322-560)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (20-140)||(17392-17512)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (194-258)||(19411-19475)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (20-91)||(7942-8013)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (132-169)||(4052-4089)
scaffold0149 (132-169)||(8483-8520)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (45-258)||(14678-14891)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (43-91)||(430-478)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22084292 - 22084035
Alignment:
Q  5 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22084292 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 22084193  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22084192 gaacaaccttagtttgggagttgaggggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 22084093  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22084092 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 22084035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 17669216 - 17669472
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17669216 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 17669315  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17669316 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 17669415  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17669416 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 17669472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 17675868 - 17676124
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17675868 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 17675967  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17675968 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 17676067  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17676068 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 17676124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 21915216 - 21915472
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21915216 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 21915315  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21915316 aacaaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 21915415  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21915416 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccccaactgataatgagacctagtga 21915472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 258
Target Start/End: Original strand, 5534085 - 5534337
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5534085 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 5534184  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5534185 aacaaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 5534284  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5534285 tctgtgtcgcactcgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagaccta 5534337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 20019586 - 20019842
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20019586 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtaccagaacatagctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 20019685  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20019686 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgccttgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 20019785  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20019786 tcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtga 20019842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 20013510 - 20013765
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20013510 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtaccagaacatagctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 20013609  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20013610 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgccttgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtg-ttgtgcga 20013708  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20013709 tcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtga 20013765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28455219 - 28454968
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28455219 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 28455120  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28455119 aacaagctcagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgggagtacaaccaggatgaacttgcttatgtgtttgtgcga 28455020  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28455019 tctgtgtcgcactttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 28454968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19111686 - 19111430
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19111686 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 19111587  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  19111586 aacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 19111487  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19111486 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtga 19111430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19117977 - 19117721
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19117977 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 19117878  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  19117877 aacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 19117778  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19117777 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtga 19117721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 258
Target Start/End: Original strand, 8354409 - 8354661
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8354409 tttcgtgattcgaccttttcagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 8354508  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| || || ||||||||||    
T  8354509 aacaagcttagtttgggagttgagtggtattcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcga 8354608  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  8354609 tctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagaccta 8354661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 22123035 - 22123283
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| || || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22123035 gtgtttcgacatttttagttggaccttggatgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaacccagaaca 22123134  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  22123135 acattagtttgggagatgagtggtactctccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgtttgagtgtttgtgcgatctg 22123234  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||| | |||||||    
T  22123235 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagaccta 22123283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18865787 - 18865535
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  18865787 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 18865688  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||| ||||    
T  18865687 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgttctg 18865588  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||| | || ||||| |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  18865587 tgtcgcccgtgctgatcgagagggaacccctaattggtaatgaaacctagtga 18865535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 16882822 - 16883070
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| || || | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||    
T  16882822 gtgtttagacctttttagttggaccttggatgccttagagtgtctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtagaatcagattgaacccagaaca 16882921  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  16882922 acactagtttgggagatgagcggtactcgccatggcgagtaagaactttcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 16883021  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16883022 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 16883070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18855392 - 18855140
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  18855392 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacgtagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 18855293  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  18855292 acactagtgtgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 18855193  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||| | || ||||| |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  18855192 tgtcgcccgtgctgatcgagagggaacccctaattggtaatgaaacctagtga 18855140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 29123541 - 29123293
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |  | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  29123541 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgctttagagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 29123442  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  29123441 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 29123342  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29123341 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 29123293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 22115370 - 22115618
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||  | || || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22115370 gtgttccgacctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctgaacatacctagtattgattgggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 22115469  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatg-aacttgtttatgtgtttgtgcgatct 208  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||     |||| ||| |  ||||||  ||| | |||||||||    
T  22115470 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagctagcccagaatgtagtttgtttgagtg-tagtgcgatct 22115568  T
Q  209 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  22115569 gtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgagaccta 22115618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22048406 - 22048150
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||   ||  |||| |||    
T  22048406 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattagggatgattttaggacaggattgaacccag 22048307  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||| ||  ||||||||||||    
T  22048306 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtataaccagaaggtagttgcttgagtgtttgtgcga 22048207  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||||||    
T  22048206 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggcattgaggcctagtga 22048150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19496850 - 19496594
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||  | || || | ||||| | |||||||||    |||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  19496850 tttcgtgtttcgacctttttagttggatcttgagtgcctttaaatgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 19496751  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  19496750 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 19496651  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19496650 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtga 19496594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20527895 - 20527657
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  20527895 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 20527796  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  20527795 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 20527696  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20527695 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 20527657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 22122072 - 22122195
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22122072 gtgttccgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgaattggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 22122171  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggt 133  Q
    |  |||||||||||| ||||||||    
T  22122172 acattagtttgggagatgagtggt 22122195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19905901 - 19905705
Alignment:
Q  61 acctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcg 160  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  ||||||   ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19905901 acctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaccattagtttggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcg 19905802  T
Q  161 cctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  19905801 cctcgcgagcacttccagattggagtgtcttgagtgtttgtgcaatctgtgtcgcacat-ttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagaccta 19905705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 20023578 - 20023737
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||    || |||||||    
T  20023578 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggtaagattagacccagaaca 20023677  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | |||||||||||||| || ||| || |||||||||||||    
T  20023678 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcaagcaagaaccctcgcctcgcgag 20023737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 26934836 - 26935055
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  26934836 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 26934935  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  26934936 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 26935035  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccc 239  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  26935036 ttggatcaagagagaacccc 26935055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18065777 - 18065540
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  18065777 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 18065678  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  18065677 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagttcagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 18065578  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18065577 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 18065540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3216707 - 3216488
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||   ||  |||||||   |||||||    
T  3216707 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagattaaatccagaacagcattagttt 3216608  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||  ||||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  3216607 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgtctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 3216508  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccc 239  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  3216507 ttggatcaagagagaacccc 3216488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 23845443 - 23845512
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtagg 89  Q
    ||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23845443 ctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 23845512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 258
Target Start/End: Original strand, 22124296 - 22124426
Alignment:
Q  128 agtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaactt-gtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatc 226  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||     | || ||| | || ||||  ||||  |||||||||||||||||| |||||||     
T  22124296 agtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagctagcctagaatgtagtttgtttgagtgta-gtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatt 22124394  T
Q  227 aagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  22124395 aagagcgaacccctaattggtattgagaccta 22124426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Original strand, 23845595 - 23845640
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  23845595 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccc 23845640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 60)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Original strand, 36884380 - 36884637
Alignment:
Q  5 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36884380 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 36884479  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36884480 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 36884579  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36884580 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 36884637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 19779936 - 19780192
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19779936 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 19780035  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19780036 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 19780135  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19780136 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 19780192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Original strand, 18024074 - 18024327
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  18024074 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttaggatcagagggaacccag 18024173  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18024174 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgcgatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 18024273  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctag 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18024274 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctag 18024327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12475479 - 12475223
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12475479 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 12475380  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12475379 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 12475280  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12475279 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 12475223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15362593 - 15362336
Alignment:
Q  5 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  15362593 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccga 15362494  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15362493 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgcttgtgcg 15362394  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15362393 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 15362336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Original strand, 17961971 - 17962222
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17961971 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 17962070  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17962071 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaactcgtttatgtgtttatgcga 17962170  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17962171 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgaaacct 17962222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22195080 - 22194826
Alignment:
Q  5 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22195080 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatatccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 22194981  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22194980 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattttgtgtttgtgcg 22194881  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22194880 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctag 22194826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Original strand, 15383139 - 15383396
Alignment:
Q  5 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15383139 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 15383238  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15383239 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacagccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 15383338  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15383339 atctgtgtcgcactagttgatcaagagtgaacccctatctggtaatgagacctagtga 15383396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 4772552 - 4772300
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4772552 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgcctttgagtacctaaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 4772453  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4772452 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttggctatgtgtttgtgcgatctg 4772353  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4772352 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 4772300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 8048142 - 8048398
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8048142 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 8048241  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8048242 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 8048341  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8048342 tcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtga 8048398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 8054755 - 8055011
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8054755 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 8054854  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8054855 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 8054954  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8054955 tcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtga 8055011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23954607 - 23954351
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23954607 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 23954508  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23954507 aacaaccttagtttgggagttgagtggtacttgccatggcgagtaagttatctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 23954408  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23954407 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 23954351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23961269 - 23961013
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23961269 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 23961170  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23961169 aacaaccttagtttgggagttgagtggtacttgccatggcgagtaagttatctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 23961070  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23961069 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 23961013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15148916 - 15148663
Alignment:
Q  5 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15148916 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatatccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 15148817  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
     ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15148816 aaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 15148717  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15148716 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagaccta 15148663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Original strand, 16231487 - 16231744
Alignment:
Q  5 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16231487 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 16231586  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16231587 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtatagccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 16231686  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16231687 atctgtgtcgcactagttgatcaagagtaaacccctatctggtaatgagacctagtga 16231744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18296086 - 18295829
Alignment:
Q  5 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18296086 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 18295987  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||   |  |||| ||||||    
T  18295986 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcg 18295887  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18295886 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 18295829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12482109 - 12481853
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12482109 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 12482010  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12482009 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 12481910  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgat--caagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12481909 tctgtgtcgcact--gtgatnncaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 12481853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8385294 - 8385043
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8385294 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 8385195  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8385194 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 8385095  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8385094 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 8385043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8391949 - 8391698
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8391949 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 8391850  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8391849 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 8391750  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8391749 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 8391698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14074290 - 14074039
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14074290 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 14074191  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14074190 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 14074091  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14074090 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 14074039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15257068 - 15256817
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15257068 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 15256969  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15256968 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 15256869  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15256868 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 15256817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17808873 - 17808622
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17808873 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 17808774  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17808773 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 17808674  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17808673 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 17808622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Original strand, 17089624 - 17089875
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17089624 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 17089723  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17089724 aacaagcttagtttgtgagtggagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 17089823  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17089824 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 17089875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Original strand, 29040545 - 29040796
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29040545 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 29040644  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29040645 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 29040744  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  29040745 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 29040796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 258
Target Start/End: Original strand, 14298474 - 14298726
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  14298474 tttcgtgattcgacctttttagttggactttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaacccag 14298573  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| || |||||| ||||||    
T  14298574 aacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgcttgtgtgttggtgcga 14298673  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14298674 tctgtgtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactagtaataagaccta 14298726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20115598 - 20115350
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20115598 gtgtttcgacatttttagttggaccttggatgccctagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 20115499  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  20115498 actttagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 20115399  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||| || ||||||||||||  |||||||||  ||||| | |||||||    
T  20115398 tgtcggacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagaccta 20115350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 14268118 - 14268356
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14268118 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagttt 14268217  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||| | |    
T  14268218 gggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactttcgcctcgcgagcacagccaggatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcgcat 14268317  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14268318 gttgattaagagtgaacccctaattggtattgagaccta 14268356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 258
Target Start/End: Original strand, 14305097 - 14305350
Alignment:
Q  5 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||  | || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  14305097 gtttcgtgattcgacctttttagttggactttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaaccca 14305196  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| || |||||| |||||    
T  14305197 gaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcaagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgcttgtgtgttggtgcg 14305296  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    || |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14305297 atatgtgtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactagtaataagaccta 14305350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 40478603 - 40478355
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  40478603 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 40478504  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  40478503 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 40478404  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40478403 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 40478355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 7900831 - 7901069
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  7900831 ctttttagttggaccttgggtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 7900930  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  7900931 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 7901030  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  7901031 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 7901069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 26284558 - 26284806
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||  | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  26284558 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgtcttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 26284657  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  26284658 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 26284757  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26284758 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 26284806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 40471930 - 40471682
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||    
T  40471930 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacctagaaca 40471831  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  40471830 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 40471731  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40471730 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 40471682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 51493478 - 51493716
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  51493478 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 51493577  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  51493578 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 51493677  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  51493678 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 51493716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 6873026 - 6873278
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  6873026 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattatgaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 6873125  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||| ||||    
T  6873126 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgttctg 6873225  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||| | || |||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6873226 tgtcgcccgtgctgatcaagagggaacccctaattggtaatgaaacctagtga 6873278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 15321754 - 15321992
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  15321754 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 15321853  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| |    
T  15321854 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtaattgcttgagtgtttatgcgatctgtgtcgcacgt 15321953  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15321954 gttgatcaatagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 15321992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18071624 - 18071373
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| |||||||    
T  18071624 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctatgagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 18071525  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  18071524 acattagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 18071425  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 261  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18071424 tgtcgcacgagttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtg 18071373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17810728 - 17810560
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  17810728 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagcgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 17810629  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccag 178  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  17810628 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccag 17810560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Original strand, 14757072 - 14757240
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  14757072 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattaattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 14757171  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccag 178  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||    
T  14757172 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgccttgcgagcacatccag 14757240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 262
Target Start/End: Original strand, 9271764 - 9272006
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  ||   |||| ||||||||  |||||||    
T  9271764 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagcctgaacccagaacaactttagttt 9271863  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatg-aacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||| ||| |  ||||||  ||| | ||||||||||||||||||     
T  9271864 gggatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagtatgaccagaatgtaggttgtttgagtg-tagtgcgatctgtgtcgcacg 9271962  T
Q  219 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    | |||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  9271963 tattgatcaagagtgaacctctaattggtaatgaaacctagtga 9272006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 121
Target Start/End: Original strand, 17991315 - 17991430
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17991315 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 17991414  T
Q  106 aacaagcttagtttgg 121  Q
    ||||| ||||||||||    
T  17991415 aacaaccttagtttgg 17991430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23838879 - 23838641
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  23838879 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 23838780  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  23838779 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 23838680  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23838679 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 23838641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14679408 - 14679170
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| |||||| || || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||      
T  14679408 ctttttagttggaccttgaatgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagtag 14679309  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  |  | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  14679308 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattagagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 14679209  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14679208 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 14679170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14685617 - 14685378
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||  |||||||  ||| ||     
T  14685617 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggataagattgaacctagaacaacattatttg 14685518  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccag-gatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 218  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||   || | |  |||  ||||||||||||||||||||||||     
T  14685517 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagatttggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacg 14685418  T
Q  219 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14685417 ttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 14685378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 35171045 - 35170836
Alignment:
Q  49 gtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgag 148  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  35171045 gtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagtttggaaattgactggtactcgccatggcgag 35170946  T
Q  149 taagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggta 248  Q
    || | ||||||| |||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |||||    
T  35170945 taggaactctcgtctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaatccctaattggta 35170846  T
Q  249 atgagaccta 258  Q
    ||||||||||    
T  35170845 atgagaccta 35170836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12522507 - 12522292
Alignment:
Q  43 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||  |||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  12522507 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagatggaacctagaacaacattagttggggagttggcttgtactcgccat 12522408  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 242  Q
    ||  ||||  ||||||| ||||||||| ||  | ||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||     
T  12522407 ggaaagtagatactctcacctcgcgagcacttctagtttggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctag 12522308  T
Q  243 ctggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||||||||    
T  12522307 ttggtaatgagaccta 12522292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 140
Target Start/End: Original strand, 386014 - 386134
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  386014 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 386113  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgcc 140  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  386114 gggagatgagtggtactcgcc 386134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 258
Target Start/End: Original strand, 41385428 - 41385643
Alignment:
Q  43 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||| || ||||   | |||||||||||    
T  41385428 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggagtgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttcgcttgtactcgccat 41385527  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 242  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |    
T  41385528 ggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgcttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctga 41385627  T
Q  243 ctggtaatgagaccta 258  Q
     ||||||||| |||||    
T  41385628 ttggtaatgaaaccta 41385643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 35614384 - 35614147
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||  |||   |||  |||||||  |||||||    
T  35614384 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatatctagtaatgataagggatgaatgtaggactagattaaacctagaacaactttagttt 35614285  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||   |||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  35614284 ggtt-ttgtctggtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 35614186  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  35614185 tttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgagaccta 35614147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Original strand, 12349234 - 12349471
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  12349234 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 12349333  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  12349334 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 12349433  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12349434 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 12349471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 16956310 - 16956529
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || ||||||||  |||||||    
T  16956310 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggctagattagacccagaacaactttagttt 16956409  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    |||| |||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||  |  | |  | |  |||||||||||||||||||||||| |    
T  16956410 gggaattgtttcgtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttgtgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 16956509  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccc 239  Q
     ||||||||||  |||||||    
T  16956510 tttgatcaagagcgaacccc 16956529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27710201 - 27710042
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || || ||||    
T  27710201 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgagcatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccataaca 27710102  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  27710101 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 27710042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 53433823 - 53433604
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  53433823 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 53433724  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  53433723 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 53433624  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccc 239  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  53433623 ttggatcaagagagaacccc 53433604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 55795903 - 55795672
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  55795903 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 55795804  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |   ||| | ||| |||||||||||||||||||| |    
T  55795803 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagcagttga-gtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 55795705  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 252  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  55795704 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatga 55795672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 257
Target Start/End: Original strand, 12299664 - 12299795
Alignment:
Q  126 tgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  12299664 tgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgat 12299763  T
Q  226 caagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  12299764 caagagtgaacccctatttggtaatgaaacct 12299795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 19941804 - 19941963
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  19941804 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 19941903  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||| | |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  19941904 actttagtttggaaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 19941963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23082044 - 23081885
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || || ||||    
T  23082044 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccaaaaca 23081945  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  23081944 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 23081885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 30234838 - 30235076
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | ||  ||||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||  | || ||||||||  |||||||    
T  30234838 ctttttagttggaccttgagtgcctatgagtgcctgaacatacctagtaatgattatggattaatgtaggacaagattggacccagaacaactttagttt 30234937  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||  ||||| || | |       |||||||||||||||||||||||| |    
T  30234938 gggaattgtttggtactcgccatggcgagtaagaatcctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtataaggagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 30235037  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
       |||||||| ||||||||    |||||||||||||||    
T  30235038 tcagatcaagagtgaacccccttatggtaatgagaccta 30235076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 258
Target Start/End: Original strand, 386166 - 386230
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  386166 gtgtttgtgcgatatgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 386230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9556976 - 9556827
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||  ||||  ||||||| |||||||     
T  9556976 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtagggcaagattgaacctagaacaaccttagttg 9556877  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    || |  ||  | ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  9556876 ggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 9556827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 91
Target Start/End: Original strand, 22633861 - 22633932
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 91  Q
    ||||| |||||||| ||  || ||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22633861 cttttgagttgaactttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 22633932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 93)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26889917 - 26889660
Alignment:
Q  5 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26889917 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 26889818  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26889817 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 26889718  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26889717 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 26889660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 37615852 - 37615596
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37615852 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 37615753  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37615752 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 37615653  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37615652 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 37615596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Original strand, 14672845 - 14673098
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  14672845 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttaggatcagagggaacccag 14672944  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14672945 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgcgatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 14673044  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctag 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14673045 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctag 14673098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 418461 - 418205
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  418461 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 418362  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  418361 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 418262  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  418261 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 418205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 26788450 - 26788706
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26788450 tttcgtgttccgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtaccttaacatacctagtattggttaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 26788549  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26788550 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 26788649  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26788650 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 26788706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 26794040 - 26794296
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26794040 tttcgtgttccgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtaccttaacatacctagtattggttaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 26794139  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26794140 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 26794239  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26794240 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 26794296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6599179 - 6598923
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6599179 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 6599080  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6599079 aacaaccttagtttgggagatgagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcaa 6598980  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6598979 tctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 6598923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6605859 - 6605603
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6605859 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 6605760  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6605759 aacaaccttagtttgggagatgagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcaa 6605660  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6605659 tctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 6605603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 5106529 - 5106785
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  5106529 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggagcccag 5106628  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5106629 aacaaccttagtttgggagatgagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaactaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 5106728  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5106729 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtagtgagacctagtga 5106785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 10845929 - 10846184
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10845929 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtacctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 10846028  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  10846029 aacaaccttaatttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgtttgtgtg-ttgtgcga 10846127  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10846128 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactagtaatgagacctagtga 10846184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 31422202 - 31422454
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  31422202 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagaatgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 31422301  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31422302 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 31422401  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31422402 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 31422454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 20 - 262
Target Start/End: Original strand, 10153394 - 10153636
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10153394 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgtttgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagttt 10153493  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10153494 gggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 10153593  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10153594 gttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 10153636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 48423829 - 48423578
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48423829 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 48423730  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48423729 aacaagctcagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgcttatgtgtttgtgcga 48423630  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  48423629 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 48423578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 48430607 - 48430356
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48430607 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 48430508  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48430507 aacaagctcagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgcttatgtgtttgtgcga 48430408  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  48430407 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 48430356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 261
Target Start/End: Original strand, 16623704 - 16623955
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16623704 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctatgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 16623803  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  16623804 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 16623903  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 261  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16623904 tgtcgcacgtgttgaccaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtg 16623955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16634312 - 16634061
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16634312 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 16634213  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16634212 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 16634113  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16634112 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 16634061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16640922 - 16640671
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16640922 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 16640823  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16640822 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 16640723  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16640722 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 16640671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 43161587 - 43161336
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  43161587 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 43161488  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43161487 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 43161388  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43161387 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 43161336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 43167824 - 43167573
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  43167824 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 43167725  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43167724 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 43167625  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43167624 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 43167573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Original strand, 1332706 - 1332956
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1332706 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 1332805  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1332806 aacaagcttagtt-gtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 1332904  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||| ||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1332905 tctgtgtcgcgctttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 1332956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 16747484 - 16747740
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||    
T  16747484 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacctacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagaaagcccag 16747583  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16747584 aacaaccttagtttgggagaagagtgtcactcgccatggcgagtgagtgctctcgcctcgcgagtacaaccaggacgaacttgtttatgtgtttgtgcga 16747683  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16747684 tctgtgtcgcacttgtagattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 16747740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 16758216 - 16758472
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | |||    
T  16758216 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacctacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagataaagcccag 16758315  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16758316 aacaaccttagtttgggagaagagtgtcactcgccatggcgagtgagtgctctcgcctcgcgagtacaaccaggacgaacttgtttatgtgtttgtgcga 16758415  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16758416 tctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 16758472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13251180 - 13250924
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13251180 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 13251081  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  13251080 aacaagcttagtttggaagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 13250981  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13250980 tctgtgtcgcactcgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 13250924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13257826 - 13257570
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13257826 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 13257727  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  13257726 aacaagcttagtttggaagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 13257627  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13257626 tctgtgtcgcactcgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 13257570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 53380001 - 53380247
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  53380001 gtgtttcgacccttttagttgaatcttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggggacccataaca 53380100  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  53380101 accttagtttggaagttgagtggtactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgggtacaatcagaatgaacttgtttgtgt-tttgtgcgatctg 53380199  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  53380200 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-ccctaacttataatgagaccta 53380247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 53386653 - 53386899
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  53386653 gtgtttcgacccttttagttgaatcttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggggacccataaca 53386752  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  53386753 accttagtttggaagttgagtggtactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgggtacaatcagaatgaacttgtttgtgt-tttgtgcgatctg 53386851  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  53386852 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-ccctaacttataatgagaccta 53386899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5221851 - 5221609
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||  ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5221851 ctttttagttagaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagttt 5221752  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  5221751 gggagttgagtggtactcgacacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatatagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 5221652  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5221651 gttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 5221609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 16489319 - 16489567
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16489319 gtgtttcgacatttttagttggaccttggatgccctagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 16489418  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  16489419 actttagtttgggagatgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 16489518  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||    
T  16489519 tgtcgcacgtgctgatcaagagtgaacccctagttggtattaagaccta 16489567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 41201447 - 41201695
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  41201447 gtgtttcaacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 41201546  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  41201547 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 41201646  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41201647 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 41201695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 15726581 - 15726829
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||    
T  15726581 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgaaggatcagattgaacccagaaca 15726680  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  15726681 acactagtttgggagataagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 15726780  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15726781 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 15726829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 20057048 - 20057304
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  20057048 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 20057147  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  20057148 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 20057247  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20057248 tctgtgtcgcatgtgttgatcaggagtgaacccctaattggtattgagacctagtga 20057304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 20063686 - 20063942
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  20063686 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 20063785  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  20063786 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 20063885  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20063886 tctgtgtcgcatgtgttgatcaggagtgaacccctaattggtattgagacctagtga 20063942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 23704418 - 23704666
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  23704418 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 23704517  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  23704518 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 23704617  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||    
T  23704618 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattagtaatgaaaccta 23704666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 23722874 - 23723122
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  23722874 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 23722973  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  23722974 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 23723073  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||    
T  23723074 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattagtaatgaaaccta 23723122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 23741330 - 23741578
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  23741330 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 23741429  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  23741430 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 23741529  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||    
T  23741530 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattagtaatgaaaccta 23741578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 252
Target Start/End: Original strand, 5149627 - 5149859
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  5149627 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttgggatcagattgaacccagaacaacactagttt 5149726  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  5149727 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 5149826  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 252  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5149827 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatga 5149859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 15691927 - 15692175
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  15691927 gtgtttcgacctttttagtttgaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 15692026  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || | |||| | ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  15692027 acactagtttgggagatgagtggtactctccatggcgagtaagaactctcgcctcgcaagcataacctgaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 15692126  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15692127 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 15692175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3691080 - 3690824
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| | |||||||||    |||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  3691080 tttcgtgtttcgacctttttagttaaaccttgtatgcctttgagtgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 3690981  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  3690980 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 3690881  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  3690880 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattgggattgagacctagtga 3690824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 41091996 - 41092244
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41091996 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggagcagagggaacccagaaca 41092095  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatg-aacttgtttatgtgtttgtgcgatct 208  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||     |||| ||| |  ||||||  ||| | |||||||||    
T  41092096 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagctagcccagaatgtagtttgtttgagtg-tagtgcgatct 41092194  T
Q  209 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||| |||| | |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41092195 gtgttgcacgttttgaccaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 41092244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 30066409 - 30066237
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||    
T  30066409 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccag 30066310  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccag 178  Q
    |||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  30066309 aacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccag 30066237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14499784 - 14499625
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  14499784 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 14499685  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14499684 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 14499625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11070527 - 11070359
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  11070527 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 11070428  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccag 178  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  11070427 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccag 11070359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Original strand, 11165179 - 11165347
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || ||||    
T  11165179 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccaaaaca 11165278  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccag 178  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  11165279 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccag 11165347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10911346 - 10911105
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || |||||||   |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  | |||||    
T  10911346 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacatcagttt 10911247  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  10911246 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcatgt 10911147  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  10911146 gttgatcaagagtgaacccctaattggtgttgagacctagtg 10911105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24188223 - 24187985
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  24188223 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 24188124  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  24188123 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 24188024  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24188023 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 24187985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 839692 - 839455
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||| ||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  839692 cttttaagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 839593  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  839592 gggagttgacttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgtattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 839493  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  839492 tttgatcaagagtgaacccctaagtggtaatgagacct 839455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10004084 - 10003843
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || |||||||   |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  | |||||    
T  10004084 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacttcagttt 10003985  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  ||| |||||||||||||||||||  |    
T  10003984 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcatgt 10003885  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  10003884 gttgatcaagagtgaacccctaagtggtgttgagacctagtg 10003843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10010653 - 10010490
Alignment:
Q  98 gaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgt 197  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  |||     
T  10010653 gaacccagaacaacttcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgg 10010554  T
Q  198 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 261  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  10010553 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaagtggtgttgagacctagtg 10010490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10904596 - 10904433
Alignment:
Q  98 gaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgt 197  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  ||||    
T  10904596 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 10904497  T
Q  198 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 261  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  10904496 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcatgagtgaacccctaattggtgttgagacctagtg 10904433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 55149424 - 55149186
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  55149424 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 55149325  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  |  | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  55149324 ggaagttggattgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagatttgagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 55149225  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  55149224 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 55149186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19809485 - 19809237
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||   | || |||||||    
T  19809485 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggattgaatgtagggcaaggttggacccagaaca 19809386  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||  |  | |   ||  ||||||||||||||||    
T  19809385 actttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagctttgagtgtcttgagtgtttgtgcgatctg 19809286  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| | | |||||||| |||||||||   || ||||||||||||    
T  19809285 tgtcgcacatttggatcaagagtgaacccctttatgataatgagaccta 19809237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Original strand, 22642988 - 22643118
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||    
T  22642988 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagacttaacccagaaca 22643087  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgcc 140  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22643088 acactagtttgggagttgagttgtactcgcc 22643118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15826120 - 15825891
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||  | || |||||||    
T  15826120 gtgtttcgacctttttagttagaccttgagtgcctttgagtgtctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccagaaca 15826021  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||  |  | |   ||  ||||||||||||||||    
T  15826020 actttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagttttgagtgtcttgagtgtttgtgcgatctg 15825921  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 239  Q
    |||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  15825920 tgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccc 15825891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 17710241 - 17710400
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  17710241 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 17710340  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17710341 actttagtttgggaattgaatggtactcgccaaggcaagtaagaactctcgcctcgcgag 17710400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 55023304 - 55023174
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  55023304 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 55023205  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgcc 140  Q
    |   |||||||| || |||||||||||||||    
T  55023204 acactagtttggaagatgagtggtactcgcc 55023174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 15991753 - 15991912
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||  | || || ||||    
T  15991753 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcgtttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccaaaaca 15991852  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15991853 actttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaaggattctcgcctcgcgag 15991912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7986152 - 7985915
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||  |||  ||||  |||||||  |||||||    
T  7986152 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacttagtaatgattaggaaggaatgtaagacaagattgaacctagaacaacattagttt 7986053  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||||||  | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  7986052 gggagttggcttgaactcgccatggcgagtaggtactctcgcctcgcgagcattttcagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 7985953  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  7985952 tttgatcaagagtgaacccctta-tggtaatgagaccta 7985915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20723447 - 20723209
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  20723447 ctttttagttggaccttgagtgccattgagtgcttgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 20723348  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || || ||  | |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  20723347 ggaagctggcttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcatgt 20723248  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20723247 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 20723209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6608926 - 6608688
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  ||||||     
T  6608926 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 6608828  T
Q  120 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||| ||| | |  ||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  6608827 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgtgcgatccgtgtcgcacc 6608728  T
Q  219 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    | | |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  6608727 tttcgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaaccta 6608688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 17252716 - 17252935
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  17252716 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 17252815  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  17252816 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 17252915  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccc 239  Q
     | |||||||| ||||||||    
T  17252916 ttggatcaagagtgaacccc 17252935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 15404143 - 15404390
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||      
T  15404143 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaatg 15404242  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgt-ttgtgcgatct 208  Q
    |  ||||||| ||| |||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||  |  | |   ||||| || |||||||||||    
T  15404243 actttagttttggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagcacctccagctttgagt--gttatgagtgttgtgcgatct 15404340  T
Q  209 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||    
T  15404341 gtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattgataataagaccta 15404390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12482875 - 12482638
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  12482875 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 12482776  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  12482775 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 12482676  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12482675 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 12482638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Original strand, 15584379 - 15584616
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  15584379 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 15584478  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||  ||| | |||||||||||||||||| |    
T  15584479 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtaagaaccctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggtggtgcgatctgtgtcgcacct 15584578  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15584579 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacct 15584616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Original strand, 15591037 - 15591274
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  15591037 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 15591136  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||  ||| | |||||||||||||||||| |    
T  15591137 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtaagaaccctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggtggtgcgatctgtgtcgcacct 15591236  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15591237 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacct 15591274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 95
Target Start/End: Original strand, 22670536 - 22670621
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcaga 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670536 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcaga 22670621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 410400 - 410559
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  410400 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacgcagaaca 410499  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  410500 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 410559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 1145201 - 1145360
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  1145201 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 1145300  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  1145301 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 1145360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 10236054 - 10236272
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||  | || ||||||||  |||||||    
T  10236054 ctttttagttggaccttgagtgcctatgagtgcctgaacatacctagtaatgattagga-tgaatgtaggacaagattggacccagaacaactttagttt 10236152  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||  |  | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  10236153 gggaaatgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagctttgagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 10236252  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccc 239  Q
     | |||||||| ||||||||    
T  10236253 ttggatcaagagtgaacccc 10236272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12891852 - 12891633
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  12891852 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 12891753  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  12891752 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 12891653  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccc 239  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  12891652 ttggatcaagagagaacccc 12891633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 254
Target Start/End: Original strand, 28350844 - 28351055
Alignment:
Q  43 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||  |||||| ||||||||  |   |||||||||    
T  28350844 ccttgagtgcctgaacatacctagtgatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagttggggagttggcttcaactcgccat 28350943  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 242  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||| ||||      
T  28350944 ggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttaatcaagagtgaatcccttt 28351043  T
Q  243 ctggtaatgaga 254  Q
     |||||||||||    
T  28351044 atggtaatgaga 28351055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 15397552 - 15397799
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||      
T  15397552 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaatg 15397651  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgt-ttgtgcgatct 208  Q
    |  ||||||| ||| |||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||  |  | |   ||||| || ||||| |||||    
T  15397652 actttagttttggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagcacctccagctttgagt--gttatgagtgttgtgggatct 15397749  T
Q  209 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||    
T  15397750 gtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattgataataagaccta 15397799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4710744 - 4710596
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||   |||    || ||||||||  |||||||    
T  4710744 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaacaaatgtagggcaagattagac-cagaacaactttagttt 4710646  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4710645 gggatttgagtggtactcgccatggcgagtgaggactctcgcctcgcgag 4710596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 5201670 - 5201433
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  5201670 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 5201571  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  5201570 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcacctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 5201471  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5201470 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 5201433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 15343255 - 15343414
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || || ||||    
T  15343255 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccataaca 15343354  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  15343355 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 15343414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 15349898 - 15350057
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  15349898 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 15349997  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||    
T  15349998 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcacctcgcgag 15350057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 5426362 - 5426600
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  5426362 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 5426461  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   | || | | |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  5426462 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtctagaacgtagctgtttgggtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 5426561  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5426562 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 5426600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15361148 - 15360901
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || |||||      
T  15361148 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaattaatgtagggcaagattagacccagaatg 15361049  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgt-ttgtgcgatct 208  Q
    |  ||||||| ||| |||  | ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||  |  | |   ||||| || |||||||||||    
T  15361048 actttagttttggaattgtttagtactcgccatggtgagcaagaactctcgcctcgcgagcacctccagctttgagt--gttatgagtgttgtgcgatct 15360951  T
Q  209 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||    
T  15360950 gtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattgataataagaccta 15360901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4291218 - 4291069
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    ||  |||||||  || ||||    
T  4291218 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacctagaacaacttttgttt 4291119  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4291118 gggaattgtttggtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgag 4291069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13321418 - 13321269
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   || |||||||||  |||||||    
T  13321418 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaattcagaacaacattagttt 13321319  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    || | | |  | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13321318 ggaactagtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgag 13321269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 252
Target Start/End: Original strand, 5419964 - 5420196
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  5419964 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 5420063  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   | || | | |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  5420064 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtctagaacgtagctgtttgggtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 5420163  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 252  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5420164 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatga 5420196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 8720805 - 8720964
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  8720805 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 8720904  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | |||||||||||||| || | | || |||||||||||||    
T  8720905 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcaagcaggaaccctcgcctcgcgag 8720964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 9072692 - 9072851
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  9072692 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 9072791  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | |||||||||||||| || | | || |||||||||||||    
T  9072792 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcaagcaggaaccctcgcctcgcgag 9072851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 15337889 - 15337810
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtagg 89  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15337889 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 15337810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16333618 - 16333381
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| |||||   | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| || |||||  |||||||    
T  16333618 ctttttagttggaccttaagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccataacaactttagttt 16333519  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
     |   | |  ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  16333518 tgttct-gtctggtactcgccatggcgagtaggaaccctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 16333420  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||    
T  16333419 tttgatcaagagtgaatccctttatggtaatgagaccta 16333381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 239
Target Start/End: Original strand, 13315943 - 13316066
Alignment:
Q  116 gtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgc 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||  |  | |   ||  ||||||||||||||||||||||    
T  13315943 gtttgggatttgagtggtactcgccatggcgagtaataactctcgcctcgcgagcacttccagctttgagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgc 13316042  T
Q  216 acttgttgatcaagaatgaacccc 239  Q
    || | | |||||||| ||||||||    
T  13316043 acgtttggatcaagagtgaacccc 13316066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 10326299 - 10326154
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  10326299 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcttgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagctttagttt 10326200  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 165  Q
    ||   |||  ||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  10326199 ggtttttgtctggtactcgccatggcgagtaggaaccctcgcctcg 10326154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15337702 - 15337642
Alignment:
Q  198 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||    
T  15337702 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttcatcaagagtgaacccctaattgataataagaccta 15337642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 91
Target Start/End: Original strand, 4588463 - 4588534
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 91  Q
    ||||| |||||||||||  || || |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  4588463 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 4588534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 12340225 - 12340154
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 91  Q
    ||||| |||||||||||  || || |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12340225 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 12340154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4291044 - 4290999
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  4291044 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccc 4290999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 42 - 91
Target Start/End: Original strand, 12852034 - 12852083
Alignment:
Q  42 cccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 91  Q
    ||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12852034 cccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 12852083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Original strand, 30777057 - 30777102
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  30777057 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccc 30777102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 239
Target Start/End: Original strand, 15991938 - 15991982
Alignment:
Q  195 tgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  15991938 tgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccc 15991982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 221; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30987 - 30731
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30987 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 30888  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30887 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 30788  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 30731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 72544 - 72800
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  72544 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 72643  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  72644 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 72743  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  72744 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 72800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8515 - 8267
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| || || | |||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  8515 gtgtttcgacttttttagttggaccttggatgccttagagtccctgaacatacctgatattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 8416  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||  |  || ||  |||||||||| |||||    
T  8415 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcacgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcaatctg 8316  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8315 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 8267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 221; Significance: 1e-122; HSPs: 64)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 40523007 - 40523263
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40523007 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 40523106  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40523107 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 40523206  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40523207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 40523263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 9510658 - 9510914
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9510658 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 9510757  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9510758 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgagcttgtttatgtgtttatgcga 9510857  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9510858 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 9510914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 18164319 - 18164575
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18164319 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 18164418  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18164419 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 18164518  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18164519 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 18164575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 259
Target Start/End: Original strand, 60321 - 60575
Alignment:
Q  5 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  60321 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatatccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 60420  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  60421 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcg 60520  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  60521 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctag 60575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14331246 - 14330990
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14331246 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 14331147  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14331146 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaactaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 14331047  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14331046 tcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtga 14330990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14337830 - 14337574
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||| || |||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14337830 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttttatgcctttgagtaccataacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 14337731  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14337730 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 14337631  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14337630 tcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtga 14337574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22142 - 21891
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22142 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 22043  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22042 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 21943  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21942 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 21891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Original strand, 8201720 - 8201971
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8201720 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 8201819  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8201820 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 8201919  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8201920 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 8201971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 11366657 - 11366408
Alignment:
Q  9 cgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaac 108  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11366657 cgtgattcgacctttttagttggaccttgtgtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaacccagaac 11366558  T
Q  109 aagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatct 208  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11366557 aagtttatgttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgaagttgtttatgtgtttgtgcgatct 11366458  T
Q  209 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  11366457 gtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccccaactggtaataagaccta 11366408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15022590 - 15022338
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15022590 tttcttgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 15022491  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtg-tttgtgcg 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15022490 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgttttgtgcg 15022391  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15022390 atctgtgtcgcactttttgatccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 15022338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 14655066 - 14655314
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14655066 gtgttttgacctgtttagttgaaccttgcatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 14655165  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  14655166 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagcatagccaggatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 14655265  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14655266 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagaccta 14655314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 44786120 - 44786376
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  44786120 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggaccagagggaacccag 44786219  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  44786220 aacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 44786319  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44786320 tctgtgtcgcacctgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtga 44786376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 44792761 - 44793017
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  44792761 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggaccagagggaacccag 44792860  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  44792861 aacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 44792960  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44792961 tctgtgtcgcacctgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtga 44793017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18176560 - 18176312
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18176560 gtgtttctacctgtttagttggaccttgtgtacctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 18176461  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| || || ||||||||||||||    
T  18176460 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcgatctg 18176361  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18176360 tgtcgcacgtgttgattaagagtgaacccctaattggtattgagaccta 18176312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18183232 - 18182984
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18183232 gtgtttctacctgtttagttggaccttgtgtacctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 18183133  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| || || ||||||||||||||    
T  18183132 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcgatctg 18183033  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18183032 tgtcgcacgtgttgattaagagtgaacccctaattggtattgagaccta 18182984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 12703033 - 12703311
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12703033 tttcatgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 12703132  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggta----------------------ctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatga 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12703133 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggaaga 12703232  T
Q  184 acttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12703233 gcttgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 12703311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 15155819 - 15156039
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15155819 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 15155918  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  15155919 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 15156018  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaaga 230  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  15156019 tgtcgcacgtgttgatcaaga 15156039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 15162470 - 15162718
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15162470 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccaggaca 15162569  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  15162570 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 15162669  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||| | |||||||    
T  15162670 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagaccta 15162718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 16406944 - 16407192
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||  | | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16406944 gtgtttcgacatttttagttggaccttggatgtcatagggtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 16407043  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  16407044 acgttagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 16407143  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||| | |||||||    
T  16407144 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagaccta 16407192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13684918 - 13684670
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13684918 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccataaca 13684819  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  13684818 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 13684719  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| || |||||||||  |||||||||  ||||| | |||||||    
T  13684718 tgtcgcacgtgctgatcaagagcgaacccctagttggtattaagaccta 13684670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13691533 - 13691285
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13691533 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccataaca 13691434  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  13691433 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 13691334  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| || |||||||||  |||||||||  ||||| | |||||||    
T  13691333 tgtcgcacgtgctgatcaagagcgaacccctagttggtattaagaccta 13691285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 20702641 - 20702889
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  20702641 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 20702740  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  20702741 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 20702840  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20702841 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 20702889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 32768130 - 32767882
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  32768130 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 32768031  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  32768030 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 32767931  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32767930 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 32767882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 11238621 - 11238780
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11238621 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 11238720  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11238721 agtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgag 11238780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 49051732 - 49051574
Alignment:
Q  104 agaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgc 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||   |  ||||||||||    
T  49051732 agaaaaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcacgagtacaaccagaatgtagtttcctgagtgtttgtgc 49051633  T
Q  204 gatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49051632 gatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 49051574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 11231934 - 11232093
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |  | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11231934 gtgtttcgacctttttagttggacctcgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaataaatgtaggatcagagggaacccagaaca 11232033  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11232034 agtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgag 11232093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1347928 - 1347716
Alignment:
Q  45 ttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 144  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1347928 ttgagtgcctgaacatgcctagtatttattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatgg 1347829  T
Q  145 cgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaact 244  Q
    ||||| || |||||||||||||||||    |||| ||| | ||  ||  ||| | |||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||| |    
T  1347828 cgagtgagaactctcgcctcgcgagttagcccagaatgtagtttgttgagtg-tagtgcgatctgtgtcgcacgttttgaccaagagtgaacccctaatt 1347730  T
Q  245 ggtaatgagaccta 258  Q
    ||||| || |||||    
T  1347729 ggtaacgaaaccta 1347716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33563 - 33395
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  33563 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattaattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 33464  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccag 178  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  33463 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccag 33395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Original strand, 70415 - 70583
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  70415 gtgtttcgacctctttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 70514  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccag 178  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  70515 atactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccag 70583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 4318205 - 4318443
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||  |||| ||||||||   ||||||    
T  4318205 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatggatgtaggacaagattgaacccagaacaacactagttt 4318304  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  |||| ||| | |   ||  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  4318305 gggaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagaatggagtgtcttgagtgtttgcgcgatctgtgtcgcacgt 4318404  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  4318405 tttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagaccta 4318443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Original strand, 74523 - 74692
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaa-ctcagaac 108  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||    
T  74523 gtgtttcgacctctttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaaccccagaac 74622  T
Q  109 aagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccag 178  Q
    ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  74623 aatactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccag 74692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14953643 - 14953405
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  14953643 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 14953544  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | | ||||  ||||||||||||||||||||| || |    
T  14953543 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtggtttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgtacgt 14953444  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14953443 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 14953405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18531667 - 18531452
Alignment:
Q  43 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||  |||| ||||||||  ||||||||  | |||| | |||||||||||    
T  18531667 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagtttgaaacttgacttgtactcgccat 18531568  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 242  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||    
T  18531567 ggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcatgagtgaacccctaa 18531468  T
Q  243 ctggtaatgagaccta 258  Q
     ||||||||| |||||    
T  18531467 ttggtaatgaaaccta 18531452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 11262774 - 11262536
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  11262774 ctttttagttggaccttgagtgccattgaatgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 11262675  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  11262674 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 11262575  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11262574 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 11262536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 169
Target Start/End: Original strand, 12704349 - 12704467
Alignment:
Q  51 gcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagta 150  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12704349 gcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagta 12704448  T
Q  151 agtactctcgcctcgcgag 169  Q
    || ||||||||||||||||    
T  12704449 agaactctcgcctcgcgag 12704467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14149015 - 14148777
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||||    
T  14149015 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttt 14148916  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  14148915 ggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactcccgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 14148816  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| || | |||||| |||||||||||||||    
T  14148815 tttgatcaagagtggatccctaattggtaatgagaccta 14148777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14959609 - 14959371
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  14959609 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 14959510  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |  |||  |||||| ||||||||||||||||| |    
T  14959509 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcactttcagattggagtgttttgagtgtttatgcgatctgtgtcgcacgt 14959410  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14959409 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 14959371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12692916 - 12692703
Alignment:
Q  45 ttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||  ||||  |||||||  |||||| || |||||  | |||||||||||||    
T  12692916 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtcggacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatgg 12692817  T
Q  145 cgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaact 244  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |    
T  12692816 cgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgttttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaatccctaatt 12692717  T
Q  245 ggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| |||||    
T  12692716 ggtaatgaaaccta 12692703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 258
Target Start/End: Original strand, 25038893 - 25039108
Alignment:
Q  43 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||| || |||||  | |||||||||||    
T  25038893 ccttgagtgcctgaacatacctagaaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccat 25038992  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 242  Q
    || |||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |  |||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  25038993 ggtgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgtgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaa 25039092  T
Q  243 ctggtaatgagaccta 258  Q
     ||||||||| |||||    
T  25039093 ttggtaatgaaaccta 25039108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Original strand, 18553192 - 18553429
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||||| |||||  ||||||     
T  18553192 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaactcaaaacaacattagttg 18553291  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  18553292 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 18553391  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18553392 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 18553429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Original strand, 18584960 - 18585197
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  18584960 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 18585059  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| | ||||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  18585060 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagttgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 18585159  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18585160 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 18585197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10875973 - 10875736
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  10875973 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaccatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggaatgaacccaaaacaacattagttg 10875874  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||| | ||| |||||||||||||||||||| |    
T  10875873 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgttga-gtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 10875775  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10875774 tttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgaaaccta 10875736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 23519614 - 23519852
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  23519614 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgccttaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 23519713  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  23519714 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgaggactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 23519813  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23519814 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 23519852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10869893 - 10869662
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  10869893 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaccatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggaatgaacccaaaacaacattagttg 10869794  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||| | ||| |||||||||||||||||||| |    
T  10869793 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtacagaatgtagatgttga-gtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 10869695  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 252  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10869694 tttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 10869662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Original strand, 11547953 - 11548145
Alignment:
Q  46 tgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggc 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||| || |||||  | ||||||||||||||    
T  11547953 tgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggaaaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggc 11548052  T
Q  146 gagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaaccc 238  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||    
T  11548053 gagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgattaagagtgaaccc 11548145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Original strand, 11554549 - 11554741
Alignment:
Q  46 tgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggc 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||| || |||||  | ||||||||||||||    
T  11554549 tgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggaaaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggc 11554648  T
Q  146 gagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaaccc 238  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||    
T  11554649 gagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgattaagagtgaaccc 11554741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 6016831 - 6017050
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  6016831 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 6016930  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  6016931 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 6017030  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccc 239  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  6017031 ttggatcaagagagaacccc 6017050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8706441 - 8706212
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  8706441 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 8706342  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  8706341 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 8706242  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaa 249  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  8706241 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaa 8706212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8719857 - 8719628
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  8719857 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 8719758  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  8719757 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 8719658  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaa 249  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  8719657 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaa 8719628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9410364 - 9410241
Alignment:
Q  46 tgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggc 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||   |||    || || |||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  9410364 tgagtgcctgaacatacctagtaatgattaagaatgaatgtagggcaagattagacccaaaacaactttagtttgggaattgtttggtactcgccatggc 9410265  T
Q  146 gagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    ||||||| | ||||||||||||||    
T  9410264 gagtaaggattctcgcctcgcgag 9410241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 90
Target Start/End: Original strand, 44408019 - 44408089
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 90  Q
    ||||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44408019 ctttttagttgaaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 44408089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26420271 - 26420207
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26420271 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 26420207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 26420423 - 26420353
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 90  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26420423 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 26420353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 258
Target Start/End: Original strand, 44408171 - 44408235
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  44408171 gtgtttgtgtgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 44408235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 91
Target Start/End: Original strand, 39267294 - 39267365
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 91  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  39267294 cttttgagttgaaccttatatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 39267365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 56
Target Start/End: Original strand, 1245667 - 1245717
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctga 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||    
T  1245667 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctga 1245717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 7536631 - 7536501
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || | |||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  7536631 ctttttagttggaccttgagtgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagctttagttt 7536532  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagta 150  Q
    ||   |||  |||||||||||||||||||||    
T  7536531 ggtttttgtctggtactcgccatggcgagta 7536501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13570227 - 13570102
Alignment:
Q  132 gtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgt-ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaaga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||  |  | |   ||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13570227 gtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagcacctccagctttgagt--gttatgagtgttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaaga 13570130  T
Q  231 atgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||| |||||| || |||| |||||||    
T  13570129 gtgaatccctaattgataataagaccta 13570102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 91
Target Start/End: Original strand, 2831954 - 2832025
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 91  Q
    ||||| |||||||||||  || || |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2831954 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 2832025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 91
Target Start/End: Original strand, 9751198 - 9751269
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 91  Q
    ||||| |||||||||||  || || |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  9751198 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 9751269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 18302651 - 18302580
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 91  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |||  ||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  18302651 cttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatatttattaggaaagaatgtaggat 18302580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 258
Target Start/End: Original strand, 11232123 - 11232181
Alignment:
Q  200 gtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||||    
T  11232123 gtgcgatctgtgtcgcacgttttgaccaagagtgaacccctaattggtaacgaaaccta 11232181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 258
Target Start/End: Original strand, 11238810 - 11238868
Alignment:
Q  200 gtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||||    
T  11238810 gtgcgatctgtgtcgcacgttttgaccaagagtgaacccctaattggtaacgaaaccta 11238868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9410216 - 9410152
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | || ||||| ||||||||    |||||||||||||||    
T  9410216 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggaccaagagtgaacccccttatggtaatgagaccta 9410152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 221; Significance: 1e-122; HSPs: 66)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 22062527 - 22062783
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22062527 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 22062626  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22062627 aacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 22062726  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22062727 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 22062783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22265405 - 22265149
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22265405 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgagcattcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 22265306  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22265305 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 22265206  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22265205 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 22265149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 27663435 - 27663691
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27663435 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 27663534  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27663535 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 27663634  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27663635 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 27663691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 27670075 - 27670331
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27670075 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 27670174  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27670175 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 27670274  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27670275 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 27670331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23584600 - 23584344
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23584600 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 23584501  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||    
T  23584500 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagaacgaaattgtttttgtgtttgtgcga 23584401  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23584400 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgatcccctaactggtaatgagacctagtga 23584344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 41097868 - 41098124
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  41097868 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaaagtaggatcagagggaacccag 41097967  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41097968 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 41098067  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41098068 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 41098124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 17706576 - 17706832
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17706576 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagcacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 17706675  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17706676 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 17706775  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17706776 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 17706832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41769702 - 41769446
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  41769702 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaaagtaggatcagagggaacccag 41769603  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41769602 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 41769503  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41769502 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacatagtga 41769446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27615805 - 27615549
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27615805 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 27615706  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27615705 aacaaccttaatttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtaaaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 27615606  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27615605 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtga 27615549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41776276 - 41776020
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  41776276 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaaagtaggatcagagggaacctag 41776177  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41776176 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 41776077  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41776076 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacatagtga 41776020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27609187 - 27608943
Alignment:
Q  18 acctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagt 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  27609187 acctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaaccttaat 27609088  T
Q  118 ttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcac 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27609087 ttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcac 27608988  T
Q  218 ttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27608987 ttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtga 27608943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 34294202 - 34294454
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  34294202 gtgtttcgaccttttgagttggaccttggatgcctatgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttaggatcacagggaacccagaaca 34294301  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34294302 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccgtggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 34294401  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294402 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 34294454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 40707582 - 40707326
Alignment:
Q  5 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40707582 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 40707483  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||  | | |||| ||||||    
T  40707482 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagttcctga-gtgtctgtgcg 40707384  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40707383 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 40707326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 40714224 - 40713968
Alignment:
Q  5 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40714224 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 40714125  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||  | | |||| ||||||    
T  40714124 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagttcctga-gtgtctgtgcg 40714026  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40714025 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 40713968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25107244 - 25106993
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25107244 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 25107145  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25107144 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 25107045  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25107044 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 25106993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25166337 - 25166086
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25166337 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 25166238  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25166237 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 25166138  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25166137 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 25166086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23610362 - 23610106
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| ||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  23610362 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtacctaaacacatctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggaaacccag 23610263  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  23610262 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagcacaaccagaatggaattgtttatgtgtttgtgcga 23610163  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23610162 tctgtgtcgcacttgatgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 23610106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23841758 - 23841502
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| ||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  23841758 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtacctaaacacatctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggaaacccag 23841659  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  23841658 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagcacaaccagaatggaattgtttatgtgtttgtgcga 23841559  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23841558 tctgtgtcgcacttgatgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 23841502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 24471897 - 24472149
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || | || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  24471897 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagaatgcttgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 24471996  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24471997 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 24472096  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24472097 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 24472149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16355305 - 16355054
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16355305 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 16355206  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16355205 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 16355106  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16355105 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 16355054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16361964 - 16361713
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16361964 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 16361865  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16361864 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 16361765  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16361764 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 16361713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34565298 - 34565047
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  34565298 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 34565199  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34565198 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 34565099  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34565098 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 34565047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34571953 - 34571702
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  34571953 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 34571854  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34571853 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 34571754  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34571753 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 34571702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19992339 - 19992091
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19992339 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 19992240  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| || |||||| ||||||||||    
T  19992239 agtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgcttgtgtgttggtgcgatctg 19992140  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19992139 tgtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactagtaataagaccta 19992091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 15001328 - 15001576
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| || || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15001328 gtgtttcgacattttcagttggaccttggatgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 15001427  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||    
T  15001428 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgcttgagtatttgtgcgatctg 15001527  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||    
T  15001528 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtattaagaccta 15001576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 14994685 - 14994933
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| || || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14994685 gtgtttcgacattttcagttggaccttggatgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 14994784  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  14994785 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 14994884  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||| ||| |||||||||| | ||||||||||  ||||| | |||||||    
T  14994885 tgtcccacgtgttgatcaaaagtgaacccctagttggtattaagaccta 14994933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27517211 - 27516956
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| || || |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  27517211 tttcgtgtttcgacctttctagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggaaacccag 27517112  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  27517111 aacaagcttag-ttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 27517013  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27517012 tctgtgtcgcacttgttgatctagagtgaacccctaactggtaatgagatctagtga 27516956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27523848 - 27523593
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| || || |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  27523848 tttcgtgtttcgacctttctagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggaaacccag 27523749  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  27523748 aacaagcttag-ttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 27523650  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27523649 tctgtgtcgcacttgttgatctagagtgaacccctaactggtaatgagatctagtga 27523593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 1692086 - 1692334
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  1692086 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagagaacccagaaca 1692185  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  1692186 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 1692285  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||| | |||||||    
T  1692286 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagaccta 1692334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 18038317 - 18038565
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||| || | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  18038317 gtgtttcgacatttttagttggactttggatgctctagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccaaaaca 18038416  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  18038417 actttagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 18038516  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||| | |||||||    
T  18038517 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagaccta 18038565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 27686978 - 27687226
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27686978 gtgtttcgacatttttagttggaccttggatgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagagaacccagaaca 27687077  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27687078 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 27687177  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||| | |||||||    
T  27687178 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagaccta 27687226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 258
Target Start/End: Original strand, 37293128 - 37293381
Alignment:
Q  5 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  |    
T  37293128 gttttgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaaccta 37293227  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||    
T  37293228 gaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcg 37293327  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||||    
T  37293328 atctgtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgaggccta 37293381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 22327813 - 22328061
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22327813 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagttcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 22327912  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||| | ||| |  |||||||||||||||||    
T  22327913 agtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactttcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgctggtgtgtttgtgcgatctg 22328012  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  |||| |||||||    
T  22328013 agtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactactaataagaccta 22328061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 238
Target Start/End: Original strand, 22334467 - 22334695
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22334467 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 22334566  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||| | ||| |  |||||||||||||||||    
T  22334567 agtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactatcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgctggtgtgtttgtgcgatctg 22334666  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaaccc 238  Q
     ||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  22334667 agtcgcacgtgttgatctagagtgaaccc 22334695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 258
Target Start/End: Original strand, 37286425 - 37286678
Alignment:
Q  5 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  |    
T  37286425 gttttgtgttttgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaaccta 37286524  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||    
T  37286525 gaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcg 37286624  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||||    
T  37286625 atctgtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgaggccta 37286678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 25406871 - 25406639
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  25406871 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 25406772  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  25406771 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 25406672  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 252  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25406671 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatga 25406639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22133444 - 22133206
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  22133444 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtatgatcagattgaacccagaacaacactagttt 22133345  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  22133344 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 22133245  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22133244 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 22133206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22140136 - 22139898
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  22140136 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtatgatcagattgaacccagaacaacactagttt 22140037  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  22140036 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 22139937  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22139936 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 22139898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22588540 - 22588302
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||    
T  22588540 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaactcagaacaacactagttt 22588441  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  22588440 gggagatgagtggtactcgccaaggcgagtaagaactctcgcctcgcaagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 22588341  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22588340 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 22588302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17284522 - 17284274
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  17284522 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 17284423  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  17284422 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccataatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 17284323  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17284322 tgtcccacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 17284274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 29477604 - 29477852
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||    
T  29477604 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagttttgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccataaca 29477703  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  29477704 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaactagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 29477803  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29477804 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 29477852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 41294084 - 41294332
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||| || || | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  41294084 gtgtttcgacccttttagttggactttggatgccttagagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 41294183  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  | ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  41294184 acactagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaacttgaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 41294283  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  41294284 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgagaccta 41294332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 37544502 - 37544245
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  37544502 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtaccataacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 37544403  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagt-tgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    |||||  | ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||    
T  37544402 aacaacatcagtttgggagaatcagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcg 37544303  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37544302 atctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtga 37544245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 29471009 - 29471257
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||    
T  29471009 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagttttgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccataaca 29471108  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  29471109 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaactagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 29471208  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29471209 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 29471257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Original strand, 15236430 - 15236598
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  15236430 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 15236529  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccag 178  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  15236530 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccag 15236598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 21294923 - 21295161
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  21294923 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 21295022  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  21295023 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 21295122  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21295123 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 21295161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 258
Target Start/End: Original strand, 23336971 - 23337186
Alignment:
Q  43 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||| || |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  23336971 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccataacaactttagtttggaaattgaatggtactcgccat 23337070  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 242  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |   |   |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||     
T  23337071 ggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggattgcctggagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctag 23337170  T
Q  243 ctggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||||||||    
T  23337171 ttggtaatgagaccta 23337186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25535411 - 25535196
Alignment:
Q  43 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||| || |||||  | |||||||||||    
T  25535411 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccat 25535312  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 242  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  25535311 ggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaa 25535212  T
Q  243 ctggtaatgagaccta 258  Q
     ||||||||| |||||    
T  25535211 ttggtaatgaaaccta 25535196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 33726227 - 33726064
Alignment:
Q  98 gaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgt 197  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  |||     
T  33726227 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgg 33726128  T
Q  198 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 261  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||    
T  33726127 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaagcggtgttgagacctagtg 33726064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 14359479 - 14359717
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||| ||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||  ||||  |||||||  || ||||    
T  14359479 cttttgagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacatgattgaacctagaacaacattggttt 14359578  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  14359579 ggaatttgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 14359678  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||    
T  14359679 tttgatcaagagtgaatccctatttggtaatgagaccta 14359717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 15441614 - 15441852
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||| || |||||  ||||||     
T  15441614 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccataacaacattagttg 15441713  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||||||  | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  |  | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  15441714 gggagttggcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattagagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 15441813  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||    
T  15441814 tttgatcaagagtgaatccctttatggtaatgagaccta 15441852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 125 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 20776229 - 20776103
Alignment:
Q  125 ttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttga 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||| ||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  20776229 ttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctttttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcaccttttga 20776130  T
Q  225 tcaagaatgaacccctaactggtaatg 251  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20776129 tcaagagtgaacccctaattggtaatg 20776103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24554979 - 24554742
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  24554979 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaatatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 24554880  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||| ||  ||||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  24554879 ggaagttggctagtactcgcaatggcgagtagatactctcgccttacgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 24554780  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24554779 -ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 24554742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19775404 - 19775241
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||    
T  19775404 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccag 19775305  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  19775304 aacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 19775241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19768807 - 19768645
Alignment:
Q  7 ttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcaga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || ||||    
T  19768807 ttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccaga 19768708  T
Q  107 acaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    ||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  19768707 acaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 19768645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Original strand, 22325588 - 22325805
Alignment:
Q  22 ttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgg 121  Q
    ||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||  |||| |||||||   |||||||||    
T  22325588 ttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggaaaagattgaacccagaacagcattagtttgg 22325687  T
Q  122 gagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgt 221  Q
     | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | |    
T  22325688 aacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttt 22325787  T
Q  222 tgatcaagaatgaacccc 239  Q
     |||||||| ||||||||    
T  22325788 ggatcaagagtgaacccc 22325805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Original strand, 22410258 - 22410495
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  22410258 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 22410357  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||| ||| |  | |||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  22410358 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctttttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 22410457  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
     |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22410458 tttgatcaagagtgaacccgtaattggtaatgagacct 22410495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29316864 - 29316627
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  29316864 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 29316765  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  29316764 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 29316665  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  29316664 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 29316627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23250396 - 23250237
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  23250396 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 23250297  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  23250296 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 23250237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 22258133 - 22258370
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  22258133 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 22258232  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||| | ||| |||||||||||||||||||| |    
T  22258233 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgttga-gtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 22258331  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  22258332 tttgatcaagagtgaatccctaactggtaatgaaaccta 22258370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 257
Target Start/End: Original strand, 21667494 - 21667703
Alignment:
Q  48 agtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcga 147  Q
    ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  |||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  21667494 agtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggtactcgccatggcga 21667593  T
Q  148 gtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggt 247  Q
    || || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  21667594 gtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtgattgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctaattggt 21667693  T
Q  248 aatgagacct 257  Q
    ||||| ||||    
T  21667694 aatgaaacct 21667703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 25808146 - 25808365
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| |||||| || || | || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || ||||||||  || ||||    
T  25808146 ctttttagttggaccttgaatgccttagaatgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaacaacttttgttt 25808245  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    |||| |||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||  |  | |  | |  |||||||||||||||||||||||| |    
T  25808246 gggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttatgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 25808345  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccc 239  Q
     ||||||||||  |||||||    
T  25808346 tttgatcaagagcgaacccc 25808365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 24020716 - 24020637
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtagg 89  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24020716 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggattgaatgtagg 24020637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22343943 - 22343724
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  |||   ||| || |||||  |||||||    
T  22343943 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatataggacaagattaaacccaaaacaacattagttt 22343844  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||  | | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||  ||||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  22343843 ggaacttgtcttgaactcgccatggcgagtaagaattctcgcatcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 22343744  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccc 239  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  22343743 ttggatcaagagagaacccc 22343724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22353299 - 22353194
Alignment:
Q  43 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   ||||||||| | |||  | |||||||||||    
T  22353299 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagtttggaacttgtcttgtactcgccat 22353200  T
Q  143 ggcgag 148  Q
    ||||||    
T  22353199 ggcgag 22353194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 91
Target Start/End: Original strand, 22119841 - 22119912
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 91  Q
    ||||| |||||||||||  || || |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22119841 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 22119912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 221; Significance: 1e-122; HSPs: 54)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 26877214 - 26877470
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26877214 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgtatgcctatgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 26877313  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26877314 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 26877413  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26877414 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 26877470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 22320632 - 22320888
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22320632 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 22320731  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22320732 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 22320831  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22320832 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 22320888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 22326785 - 22327041
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22326785 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 22326884  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22326885 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 22326984  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22326985 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 22327041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27216526 - 27216275
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27216526 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 27216427  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27216426 aacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 27216327  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27216326 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 27216275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16986404 - 16986153
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16986404 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 16986305  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16986304 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 16986205  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16986204 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 16986153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Original strand, 28431558 - 28431809
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28431558 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 28431657  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28431658 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 28431757  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28431758 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 28431809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Original strand, 13306235 - 13306486
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13306235 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgccttcgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 13306334  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13306335 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 13306434  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13306435 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 13306486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 9340743 - 9340492
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  9340743 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 9340644  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9340643 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 9340544  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9340543 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 9340492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 9489377 - 9489126
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  9489377 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 9489278  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9489277 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 9489178  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9489177 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 9489126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 9608638 - 9608387
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  9608638 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 9608539  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9608538 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 9608439  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9608438 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 9608387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 24913614 - 24913866
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24913614 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 24913713  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  24913714 acactagtttgggagttgagtggtactcgccgtggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgaagttgcttgtgtgtttgtgcgatctg 24913813  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24913814 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 24913866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27617756 - 27617500
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27617756 tttcgtgtttcaacctttttagtcgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 27617657  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||   |  ||||||||||||    
T  27617656 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagtttcctgagtgtttgtgcga 27617557  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27617556 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 27617500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16997510 - 16997254
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  16997510 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggaccagagggaacccag 16997411  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  16997410 aacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 16997311  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16997310 tctgtgtcgcacctgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtga 16997254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 257
Target Start/End: Original strand, 19489574 - 19489821
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| || ||  ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||    
T  19489574 gtgtttcgaccttttgagttggaccttggatgcctatgagtgcctgaacctacctagtattgtttaggaacgaatttaggatcagagggaacccataaca 19489673  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  19489674 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttttgcgatccg 19489773  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19489774 tgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 19489821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17004143 - 17003887
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17004143 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctaatattgattaggaatgaatgtaggaccagagggaacccag 17004044  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  17004043 aacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 17003944  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17003943 tctgtgtcgcacctgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtga 17003887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 29233975 - 29233737
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29233975 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagttt 29233876  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||||| |    
T  29233875 gggagttgagtggtactcgccacgacgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 29233776  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29233775 gttgatcaagggtgaacccctaattggtattgagaccta 29233737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 29347274 - 29347036
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29347274 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagttt 29347175  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||||| |    
T  29347174 gggagttgagtggtactcgccacgacgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 29347075  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29347074 gttgatcaagggtgaacccctaattggtattgagaccta 29347036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1843543 - 1843291
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  1843543 tttcgtgattcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaacctag 1843444  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| ||||||    
T  1843443 aacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcttcgcgagcacaaccaggatgcagttgcttgtgtgttggtgcga 1843344  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1843343 tctgtgtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactagtaataagaccta 1843291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23171494 - 23171246
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23171494 gtgtttcgacttttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 23171395  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  23171394 acactaatttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 23171295  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  23171294 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgagaccta 23171246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23582751 - 23582503
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23582751 gtgtttcgacttttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 23582652  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  23582651 acactaatttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 23582552  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  23582551 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgagaccta 23582503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 52 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27599678 - 27599472
Alignment:
Q  52 cctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27599678 cctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaacccagaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 27599579  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatg 251  Q
    | |||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||     
T  27599578 gaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgcttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactagtaata 27599479  T
Q  252 agaccta 258  Q
    |||||||    
T  27599478 agaccta 27599472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12829516 - 12829286
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  12829516 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 12829417  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  12829416 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacat 12829317  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaat 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12829316 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaat 12829286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 91 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16922907 - 16922741
Alignment:
Q  91 tcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtt 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16922907 tcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgat 16922808  T
Q  191 tatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16922807 tatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 16922741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 92 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16928730 - 16928560
Alignment:
Q  92 cagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgttt 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||   |    
T  16928730 cagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcct 16928631  T
Q  192 atgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
      |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16928630 gagtgtctgtgcgatctgtgtcgcacctgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtga 16928560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Original strand, 10101295 - 10101463
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  10101295 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagcgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 10101394  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccag 178  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  10101395 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccag 10101463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10866818 - 10866576
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  | |||||    
T  10866818 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacatcagttt 10866719  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||  ||||||| |||||||||||||||  |    
T  10866718 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgtttgcgcgatctgtgtcgcatgt 10866619  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  10866618 gttgatcaagagtgaacccctaattggcattgagacctagtga 10866576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10873985 - 10873743
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  | |||||    
T  10873985 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacatcagttt 10873886  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||  ||||||| |||||||||||||||  |    
T  10873885 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgtttgcgcgatctgtgtcgcatgt 10873786  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  10873785 gttgatcaagagtgaacccctaattggcattgagacctagtga 10873743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27197331 - 27197093
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  ||||||   |||||||    
T  27197331 ctttttagttggaccttgagtgccattgtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaccattagttt 27197232  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  27197231 ggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 27197132  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  27197131 tttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagaccta 27197093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 87
Target Start/End: Original strand, 29282430 - 29282511
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgta 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29282430 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgta 29282511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 21138931 - 21139169
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||  |||| |||||||   |||||||    
T  21138931 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtatgacaagattgaacccagaacagctttagttt 21139030  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |  ||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  21139031 ggaacctgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 21139130  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21139131 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 21139169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 16980663 - 16980563
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16980663 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 16980564  T
Q  106 a 106  Q
    |    
T  16980563 a 16980563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 41604381 - 41604540
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  41604381 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 41604480  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41604481 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgag 41604540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 41610278 - 41610437
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  41610278 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 41610377  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41610378 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgag 41610437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 21146949 - 21147187
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||  |||| ||||| |   |||||||    
T  21146949 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctggacatacctagtaatgattatgaatgaatgtaggacaagattgaacccagaatagctttagttt 21147048  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |  ||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  21147049 ggaacctgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacat 21147148  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21147149 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 21147187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37318695 - 37318502
Alignment:
Q  46 tgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggc 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||    || ||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  37318695 tgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggtaagattagacccagaacaactttagtttgggaattgtttggtactcgccatggc 37318596  T
Q  146 gagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||    
T  37318595 gagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagcttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcatgtttggatcaagagtgaacccc 37318502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 16928916 - 16928832
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16928916 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 16928832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24503556 - 24503318
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  24503556 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 24503457  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    |  |||||  | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||   ||   || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  24503456 gaaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcccgagcactttcatattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 24503357  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     ||||||| ||  |||||||||| ||||||||| |||||    
T  24503356 tttgatcaggagcgaacccctaattggtaatgaaaccta 24503318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 13970019 - 13970178
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  13970019 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 13970118  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  13970119 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 13970178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 30970639 - 30970858
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  30970639 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 30970738  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  30970739 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 30970838  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccc 239  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  30970839 ttggatcaagagagaacccc 30970858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 45057075 - 45057234
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  45057075 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 45057174  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  45057175 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 45057234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 24640621 - 24640858
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || ||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  24640621 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgccagaacaaacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagctttagttt 24640720  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||   |||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  24640721 ggtt-ttgtctggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacctccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 24640819  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  24640820 tttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaaccta 24640858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 258
Target Start/End: Original strand, 44380959 - 44381090
Alignment:
Q  126 tgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||| | ||| ||||| |||||||||||||| | |||||    
T  44380959 tgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgttga-gtggttgtgtgatctgtgtcgcaccttttgat 44381057  T
Q  226 caagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  44381058 caagagtgaacccctaactggtaatgaaaccta 44381090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 169
Target Start/End: Original strand, 24872090 - 24872216
Alignment:
Q  43 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||   ||| ||||||||  ||||||||| | |||  | |||||||||||    
T  24872090 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacaacattagtttggaacttgtcttgtactcgccat 24872189  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24872190 ggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 24872216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 169
Target Start/End: Original strand, 24879975 - 24880101
Alignment:
Q  43 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||   ||| ||||||||  ||||||||| | |||  | |||||||||||    
T  24879975 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacaacattagtttggaacttgtcttgtactcgccat 24880074  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24880075 ggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 24880101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 258
Target Start/End: Original strand, 44387629 - 44387760
Alignment:
Q  126 tgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||| | ||| ||||| |||||||||||||| | |||||    
T  44387629 tgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgttga-gtggttgtgtgatctgtgtcgcaccttttgat 44387727  T
Q  226 caagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44387728 caagagtgaacccctaactagtaatgaaaccta 44387760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 24715160 - 24715009
Alignment:
Q  18 acctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagt 117  Q
    ||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || ||||||||  |||||    
T  24715160 acctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaacaactttagt 24715061  T
Q  118 ttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  24715060 ttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 24715009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 239
Target Start/End: Original strand, 19645662 - 19645856
Alignment:
Q  45 ttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   ||||||||| | |||  | |||||||||||||    
T  19645662 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagtattagtttggaacttgtcttgtactcgccatgg 19645761  T
Q  145 cgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 239  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||  ||||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||    
T  19645762 cgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagagaacccc 19645856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27369748 - 27369511
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  27369748 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 27369649  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   | || | | |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  27369648 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtctagaacgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 27369549  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
     ||||||| || ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  27369548 tttgatcaggagtgaacccctagttggtaatgaaacct 27369511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27376258 - 27376021
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  27376258 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 27376159  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   | || | | |  |||||  ||| ||||| |||||||||||||| |    
T  27376158 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtctagaacgtagctgtttgagtggttgtgagatctgtgtcgcacct 27376059  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
     ||||||| || ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  27376058 tttgatcaggagtgaacccctagttggtaatgaaacct 27376021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15478050 - 15477901
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||   |||  ||||  ||||||| |||||||     
T  15478050 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgtctgaacatacctagttatgattagggatgaatgtagggcaagattgaacctagaacaatcttagttg 15477951  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    || |  ||  | ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  15477950 ggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15477901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Original strand, 24880126 - 24880171
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  24880126 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccc 24880171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 27602243 - 27602186
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattagg 77  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  27602243 ctttttagttggaccttgagtacctttgagtgcctgaacatacctactaatgattagg 27602186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Original strand, 41604565 - 41604610
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  41604565 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccc 41604610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Original strand, 41610462 - 41610507
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  41610462 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccc 41610507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 9462 - 9718
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9462 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 9561  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9562 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcacctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 9661  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9662 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 9718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 66)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6981119 - 6980863
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6981119 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 6981020  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6981019 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 6980920  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6980919 tctgtgtcgcacttgttgatcgagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 6980863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 20649439 - 20649695
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20649439 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 20649538  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20649539 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaatttgtttatgtgtttatgcga 20649638  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20649639 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 20649695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20061111 - 20060854
Alignment:
Q  5 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20061111 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatatccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 20061012  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20061011 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccaaggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 20060912  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060911 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 20060854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 2869782 - 2870037
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2869782 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcc-ttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 2869880  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2869881 aacaaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 2869980  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2869981 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactagtaatgagacctagtga 2870037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 2876397 - 2876652
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2876397 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcc-ttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 2876495  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2876496 aacaaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 2876595  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2876596 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactagtaatgagacctagtga 2876652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 4233144 - 4233400
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4233144 tttcatgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgtctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 4233243  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4233244 aacaaccttattttgggagttgagtggtactcgtcatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 4233343  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4233344 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 4233400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12763158 - 12762906
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  12763158 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctatgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttaggatcagagggaacccagaaca 12763059  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12763058 agcttagtttgggagttgagaggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcacgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 12762959  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12762958 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctagctggtaatgagacctggtga 12762906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 14059262 - 14059518
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14059262 tttcgtgtttcgaccctttttgttgaaccttgtatacctttgagtgcccgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 14059361  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  14059362 aacaagcttagtttggaagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgagattgtttatgtgtttgtgcga 14059461  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  14059462 tctgtgtcgcacttgttaatcaagagtgaaccgctaactggtattgagacctagtga 14059518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8229348 - 8229097
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8229348 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 8229249  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8229248 aacaagcttagtttgtgagttgagtggttctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 8229149  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8229148 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 8229097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18931537 - 18931286
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18931537 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 18931438  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18931437 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 18931338  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18931337 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 18931286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Original strand, 29593466 - 29593717
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29593466 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 29593565  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29593566 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 29593665  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  29593666 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 29593717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Original strand, 29587325 - 29587576
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29587325 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 29587424  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29587425 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 29587524  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  29587525 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattcgtaatgaaacct 29587576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30597678 - 30597422
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  30597678 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtacctgaacacatctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaaggaacccag 30597579  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  30597578 aacaaccttggtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagcacaaccaatatggaattgtttatgtgtttgtgcga 30597479  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30597478 tctgtgtcgcacttgatgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 30597422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 257
Target Start/End: Original strand, 30637780 - 30638026
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30637780 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 30637879  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30637880 agcttagtt-gtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgagtatgtgtttgtgcgatctg 30637978  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||| |||  | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30637979 tgtcgcactttttggcccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 30638026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 27327706 - 27327954
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27327706 gtgtttcgacctgtttagttggaccttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 27327805  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  27327806 agattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaatcagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 27327905  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27327906 tgtcgcacgtgttgaccaagagtgaacccctaattggtattgagaccta 27327954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 27388446 - 27388694
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27388446 gtgtttcgacctgtttagttggaccttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 27388545  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  27388546 agattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaatcagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 27388645  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27388646 tgtcgcacgtgttgaccaagagtgaacccctaattggtattgagaccta 27388694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 43 - 258
Target Start/End: Original strand, 18194207 - 18194422
Alignment:
Q  43 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18194207 cctttagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccac 18194306  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 242  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  18194307 ggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgattaagagtgaacccctaa 18194406  T
Q  243 ctggtaatgagaccta 258  Q
     ||||| |||||||||    
T  18194407 ttggtattgagaccta 18194422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 43 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30694786 - 30694579
Alignment:
Q  43 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30694786 ccttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccaaaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccat 30694687  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 242  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  30694686 ggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgcttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatctagggtgaacccctaa 30694587  T
Q  243 ctggtaat 250  Q
    || |||||    
T  30694586 ctagtaat 30694579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 1538604 - 1538842
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  1538604 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 1538703  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||  ||  |||||||||||||| ||||||||| |    
T  1538704 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagtttcttgagtgtttgtgcgatcggtgtcgcacgt 1538803  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1538804 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 1538842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 1544703 - 1544941
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  1544703 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 1544802  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||  ||  |||||||||||||| ||||||||| |    
T  1544803 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagtttcttgagtgtttgtgcgatcggtgtcgcacgt 1544902  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1544903 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 1544941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 258
Target Start/End: Original strand, 28258100 - 28258351
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  28258100 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 28258199  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  ||| ||||||||    
T  28258200 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcga 28258298  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  28258299 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaaccta 28258351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 258
Target Start/End: Original strand, 28264724 - 28264975
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  28264724 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 28264823  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  ||| ||||||||    
T  28264824 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcga 28264922  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  28264923 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaaccta 28264975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 258
Target Start/End: Original strand, 28336849 - 28337100
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  28336849 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 28336948  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  ||| ||||||||    
T  28336949 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcga 28337047  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  28337048 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaaccta 28337100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 258
Target Start/End: Original strand, 28343473 - 28343724
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  28343473 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 28343572  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  ||| ||||||||    
T  28343573 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcga 28343671  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  28343672 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaaccta 28343724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8797637 - 8797398
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  | |||||    
T  8797637 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacatcagttt 8797538  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8797537 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgcgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 8797438  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctag 259  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8797437 gttgatcaagagtgaacctctaattggtaatgagacctag 8797398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 261
Target Start/End: Original strand, 27429933 - 27430184
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| |||||||    
T  27429933 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctatgagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 27430032  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  27430033 acattagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 27430132  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 261  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27430133 tgtcgcacgagttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtg 27430184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26130925 - 26130692
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26130925 gtgttccgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattgggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 26130826  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatg-aacttgtttatgtgtttgtgcgatct 208  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||     |||||||| |  ||||||  |||||||| ||||||    
T  26130825 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtgagaactttcgtctcgcgagctagcccaggatgtagtttgtttgagtgtttgtacgatct 26130726  T
Q  209 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 242  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||    
T  26130725 gtgtcgcacgtgtggatcaagagcgaacccctaa 26130692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 58 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17031279 - 17031079
Alignment:
Q  58 catacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactc 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  |||| || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17031279 catacctagtattgattaggaatgaatgtaggacaggatagaacccaaaacaacattagtttgggaattgagtggtactcgccatggcgagtaagaactc 17031180  T
Q  158 tcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17031179 tcgcctcgcgagcacaaacagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtattgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 17031080  T
Q  258 a 258  Q
    |    
T  17031079 a 17031079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 17036995 - 17037233
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  |||| ||||||||  |||||||    
T  17036995 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggacaggattgaacccagaacaacattagttt 17037094  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatg-aacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 218  Q
    |||| || ||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||| ||| |  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||     
T  17037095 gggaattaagtggtacttgccatgacgagtgagaactctcgcctcgcgagcacatccagaatgtaggttgtttgagtg-ttgtgcgatctgtgtcgcacg 17037193  T
Q  219 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17037194 ttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagaccta 17037233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20802202 - 20801962
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  |||||||    
T  20802202 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagttt 20802103  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||      
T  20802102 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcgatctgtgtcgcacga 20802004  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20802003 gttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtg 20801962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22331886 - 22331648
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||||    
T  22331886 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacgttagttt 22331787  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  22331786 ggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 22331687  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  22331686 tttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagaccta 22331648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16372282 - 16372067
Alignment:
Q  43 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||  |||  |||| ||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  16372282 ccttgagtgcctgaacatatctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagtttggaaattgactggtactcgccat 16372183  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 242  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  16372182 ggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaa 16372083  T
Q  243 ctggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||||||||    
T  16372082 ttggtaatgagaccta 16372067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 34369633 - 34369871
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||  |||| ||||||||  |||||||    
T  34369633 ctttttagttggaccttgagtgtcattgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagttt 34369732  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    |  | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||| ||| |    
T  34369733 gtaatttgacttgtactcgccatggcgagtatgtactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcacacgt 34369832  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  34369833 tttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagaccta 34369871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19808973 - 19808735
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||   ||||  |||||||  || ||||    
T  19808973 ctttttagttggaccttgagtgccattgtgtgcctggacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagtttgaacctagaacaacattggttt 19808874  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||  ||||  || | |   ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19808873 ggaatttgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcacgagcacttccagattggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 19808774  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  19808773 tttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagaccta 19808735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25117900 - 25117652
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||  | || |||||||    
T  25117900 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtagtgattaggaatgaatgtagggcaagattggacccagaaca 25117801  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  ||| |||||||  ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||  ||||  |  | |   ||  ||||||||||||||||    
T  25117800 actttaatttgggaaatgtttggtactcgccatggctagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagctttgagtgtcttgagtgtttgtgcgatctg 25117701  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| | | |||||||| ||||||||    |||||||||||||||    
T  25117700 tgtcgcacgtttggatcaagagtgaaccccattatggtaatgagaccta 25117652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 25595012 - 25595231
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  |||  | || ||||||||  |||||||    
T  25595012 ctttttagttgaaccttgagtgcccttgagtgcctaaacatacctagtaatgattagggatggatgtaggacgagattggacccagaacaactttagttt 25595111  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    |||| |||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||| || | |    |  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  25595112 gggaattgttgggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtaatgagtgcttgtgcgatctgtgtcgcacgt 25595211  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccc 239  Q
     |||||||||| ||||||||    
T  25595212 tttgatcaagagtgaacccc 25595231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28287707 - 28287565
Alignment:
Q  115 agtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcg 214  Q
    |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  28287707 agttggggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcgatctgtgtcg 28287609  T
Q  215 cacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  28287608 catgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaaccta 28287565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 28315018 - 28314786
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  ||||||     
T  28315018 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 28314920  T
Q  120 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||| ||| | |  ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  28314919 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacc 28314820  T
Q  219 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 252  Q
    | |||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  28314819 ttttgatcaagagtgaacccctagttggtaatga 28314786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 34833101 - 34832952
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||  | || ||||||||  |||||||    
T  34833101 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccagaacaactttagttt 34833002  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34833001 gggaattgtgtggtactcgctatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 34832952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25111297 - 25111049
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||   |||  | || |||||||    
T  25111297 gtgtttggacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtagcgattaggaatgaatgtagggcaagattggacccagaaca 25111198  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  ||| |||||||  ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||  ||||  |  | |   ||  ||||||||||||||||    
T  25111197 actttaatttgggaaatgtttggtactcgccatggctagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagctttgagtgtcttgagtgtttgtgcgatctg 25111098  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| | | |||||||| ||||||||    |||||||||||||||    
T  25111097 tgtcgcacgtttggatcaagagtgaaccccattatggtaatgagaccta 25111049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27186156 - 27185918
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| |||||| || || || |||||||   |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  ||||||     
T  27186156 ctttttagttggaccttgaatgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 27186058  T
Q  120 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||| ||| | |  ||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  27186057 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgcgcgatctgtgtcgcacc 27185958  T
Q  219 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    | |||||||||| |||||||||   ||||||||| |||||    
T  27185957 ttttgatcaagagtgaacccctggttggtaatgaaaccta 27185918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27207992 - 27207754
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| |||||| || || || |||||||   |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  ||||||     
T  27207992 ctttttagttggaccttgaatgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 27207894  T
Q  120 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||| ||| | |  ||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  27207893 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgcgcgatctgtgtcgcacc 27207794  T
Q  219 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    | |||||||||| |||||||||   ||||||||| |||||    
T  27207793 ttttgatcaagagtgaacccctggttggtaatgaaaccta 27207754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 27241236 - 27241474
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| |||||| || || || |||||||   |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  ||||||     
T  27241236 ctttttagttggaccttgaatgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 27241334  T
Q  120 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||| ||| | |  ||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  27241335 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgcgcgatctgtgtcgcacc 27241434  T
Q  219 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    | |||||||||| |||||||||   ||||||||| |||||    
T  27241435 ttttgatcaagagtgaacccctggttggtaatgaaaccta 27241474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 27263084 - 27263322
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| |||||| || || || |||||||   |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  ||||||     
T  27263084 ctttttagttggaccttgaatgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 27263182  T
Q  120 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||| ||| | |  ||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  27263183 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgcgcgatctgtgtcgcacc 27263282  T
Q  219 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    | |||||||||| |||||||||   ||||||||| |||||    
T  27263283 ttttgatcaagagtgaacccctggttggtaatgaaaccta 27263322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14099073 - 14098924
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || ||||||||  |||||||    
T  14099073 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaacaactttagttt 14098974  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  14098973 gggaattgtttggtactcgccatggcgagtaaggattctcgcctcgcgag 14098924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Original strand, 32564902 - 32565139
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  32564902 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 32565001  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  32565002 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 32565101  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  32565102 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 32565139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 252
Target Start/End: Original strand, 16551680 - 16551912
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  16551680 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 16551779  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  16551780 ggaatttgagtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttaagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 16551879  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 252  Q
     ||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  16551880 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatga 16551912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16577273 - 16577041
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  16577273 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 16577174  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  16577173 ggaatttgagtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttaagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 16577074  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 252  Q
     ||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  16577073 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatga 16577041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 252
Target Start/End: Original strand, 16618107 - 16618339
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  16618107 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 16618206  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  16618207 ggaatttgagtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttaagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 16618306  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 252  Q
     ||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  16618307 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatga 16618339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 252
Target Start/End: Original strand, 16628236 - 16628468
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  16628236 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 16628335  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  16628336 ggaatttgagtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttaagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 16628435  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 252  Q
     ||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  16628436 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatga 16628468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14472726 - 14472558
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  14472726 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 14472627  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccag 178  Q
    | ||||||| || | |||  | ||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||| ||| ||||    
T  14472626 accttagttgggaatttggcttgtactcgccatggcgagcatatgctctcgcctcgcgagcacatccag 14472558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 257
Target Start/End: Original strand, 17016688 - 17016819
Alignment:
Q  126 tgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  17016688 tgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgat 17016787  T
Q  226 caagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  17016788 caagagtgaacccctatttggtaatgaaacct 17016819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 165
Target Start/End: Original strand, 3708168 - 3708287
Alignment:
Q  46 tgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggc 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || ||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  3708168 tgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaacaactttagtttgggaattgtttggtactcgccatggc 3708267  T
Q  146 gagtaagtactctcgcctcg 165  Q
    ||||||| | ||||||||||    
T  3708268 gagtaaggattctcgcctcg 3708287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 24314729 - 24314958
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |  | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||     || |||||||    
T  24314729 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgctttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagtttagacccagaaca 24314828  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  ||||||||||| |||  | |||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||| ||  ||||  |  | |  |||  ||||||||||||| ||    
T  24314829 actttagtttgggaattgtttagtactcaccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttttgagtgtttgtgcgatttg 24314928  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 239  Q
    |||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  24314929 tgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccc 24314958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 31316742 - 31316971
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||   ||     || |||||||    
T  31316742 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtatgcctgaacatgcctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagtttagacccagaaca 31316841  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||  ||||  |  | |  |||  ||||||||||||| ||    
T  31316842 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttttgagtgtttgtgcgatttg 31316941  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 239  Q
    |||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  31316942 tgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccc 31316971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22759297 - 22759061
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||  ||||||  | || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  22759297 ctttttagtttgaccttgagtgcctttgagtgcttgaacatacctagtattgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagctttagttt 22759198  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatga-acttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 218  Q
     ||  |||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||| ||| | | |   ||  ||||||||||||||||| ||||||     
T  22759197 -ggttttgtctggtacttgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttcca-gataagagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtatcgcacg 22759100  T
Q  219 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    | |||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||    
T  22759099 t-ttgatcaagagtgaaaccctaattggtaatgaaaccta 22759061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4168348 - 4168222
Alignment:
Q  43 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || || |||||  ||||||||||| |||  ||||| |||||||    
T  4168348 ccttgagtgcctgcacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccataacaactttagtttgggaattgtttggtaatcgccat 4168249  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  4168248 ggcgattaaggattctcgcctcgcgag 4168222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4209027 - 4208902
Alignment:
Q  44 cttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatg 143  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || || |||||  ||||||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  4209027 cttgagtgcctgcacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccataacaactttagtttgggaattgtttggtaatcgccatg 4208928  T
Q  144 gcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||| |||| | ||||||||||||||    
T  4208927 gcgattaaggattctcgcctcgcgag 4208902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Original strand, 23276938 - 23277087
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||    || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  23276938 ctttttagttggaccttgagctcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacatcattagttt 23277037  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    || | | |    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23277038 ggaactagtcccgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgag 23277087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 91
Target Start/End: Original strand, 31164529 - 31164577
Alignment:
Q  43 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 91  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31164529 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggat 31164577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 258
Target Start/End: Original strand, 34298457 - 34298521
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34298457 gtgtttgtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 34298521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Original strand, 24290723 - 24290802
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtagg 89  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24290723 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgcttcagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 24290802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 90
Target Start/End: Original strand, 34295728 - 34295797
Alignment:
Q  21 tttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 90  Q
    |||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  34295728 tttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtgatgattaggaatgaatgtagga 34295797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25928565 - 25928505
Alignment:
Q  198 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  25928565 ttgtgcgatatgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaaaccctaaatggtaatgagaccta 25928505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 258
Target Start/End: Original strand, 3708316 - 3708380
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    |||||||||||||||    
T  3708316 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatggtaatgagaccta 3708380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 21939856 - 21939785
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 91  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  21939856 cttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtgtaatattgattaggaaagaatgtaggat 21939785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 261
Target Start/End: Original strand, 59105 - 59361
Alignment:
Q  5 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  59105 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgaaggatcagagggaaccca 59204  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  59205 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtgctctcgcctcacgagtacaaccaggatgagcttgtttatgtgtttgtgcg 59304  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 261  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59305 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtg 59361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 139528 - 139272
Alignment:
Q  5 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  139528 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgaaggatcagagggaaccca 139429  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  139428 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtgctctcgcctcacgagtacaaccaggatgagcttgtttatgtgtttgtgcg 139329  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 261  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139328 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtg 139272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 20215574 - 20215830
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20215574 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 20215673  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20215674 aacaaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 20215773  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20215774 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccccaactggtaatgagacctagtga 20215830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 44844528 - 44844785
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  44844528 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatataggatcagagggaacccag 44844627  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaa-ccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44844628 aacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaacccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 44844727  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44844728 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 44844785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Original strand, 51334957 - 51335214
Alignment:
Q  5 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51334957 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 51335056  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||   |  |||| ||||||    
T  51335057 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcaagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcg 51335156  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51335157 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 51335214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Original strand, 46156966 - 46157217
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46156966 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 46157065  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46157066 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 46157165  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  46157166 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 46157217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Original strand, 51328322 - 51328580
Alignment:
Q  5 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcc-tgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51328322 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtaccctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccc 51328421  T
Q  104 agaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||   |  |||| |||||    
T  51328422 agaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcaagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgc 51328521  T
Q  204 gatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51328522 gatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 51328580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 43078900 - 43078649
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  43078900 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 43078801  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43078800 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 43078701  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43078700 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 43078649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 41478226 - 41478475
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41478226 gtgtttcgacatttttagttggactttggatgccctagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 41478325  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaacc-aggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatct 208  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | ||| ||  |||||||||||||||    
T  41478326 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccaagaatgtaattgcttgagtgtttgtgcgatct 41478425  T
Q  209 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||    
T  41478426 gtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtattaagaccta 41478475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 18599755 - 18599984
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||| ||| |||||||||| | |||| || |||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  18599755 gtgttttgacatttttagttggatcttggatgccctagagtgccataacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccataaca 18599854  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||   |||||||||||||||    
T  18599855 actttagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgaatgtttgtgcgatctg 18599954  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  18599955 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccc 18599984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 16345420 - 16345676
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||    |||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  16345420 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 16345519  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  16345520 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 16345619  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16345620 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtga 16345676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 16352068 - 16352324
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||    |||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  16352068 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 16352167  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  16352168 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 16352267  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16352268 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtga 16352324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21829160 - 21828922
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  21829160 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtatggattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 21829061  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||      
T  21829060 gggagttgagtggtactcgccttggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaactagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacga 21828961  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21828960 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 21828922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21844673 - 21844435
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  21844673 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtatggattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 21844574  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||      
T  21844573 gggagatgagtggtactcgccttggtgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacga 21844474  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21844473 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 21844435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1011179 - 1011011
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  1011179 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 1011080  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccag 178  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  1011079 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccag 1011011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 41355933 - 41356189
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||  | || || | ||||| | |||||||||    |||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  41355933 tttcgtgtttcgacctttttagttggatcttgagtgcctttaaatgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 41356032  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  41356033 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 41356132  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41356133 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtga 41356189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 41348496 - 41348752
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||  | || || | ||||| | |||||||||    |||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  41348496 tttcgtgtttcgacctttttagttggatcttgagtgcctttaaatgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 41348595  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  41348596 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcacgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 41348695  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41348696 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtga 41348752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19063963 - 19063728
Alignment:
Q  23 tttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttggg 122  Q
    |||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||  |||||||||     
T  19063963 tttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagtttgga 19063864  T
Q  123 agttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgtt 222  Q
      |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19063863 tattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttt 19063764  T
Q  223 gatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19063763 gatcaagagtgaacccctaattggtaatgagaccta 19063728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19111853 - 19111618
Alignment:
Q  23 tttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttggg 122  Q
    |||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||  |||||||||     
T  19111853 tttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagtttgga 19111754  T
Q  123 agttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgtt 222  Q
      |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19111753 tattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttt 19111654  T
Q  223 gatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19111653 gatcaagagtgaacccctaattggtaatgagaccta 19111618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 47659663 - 47659421
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || |||||||   |||||||||||||||||||| |||| | |||||   ||  |||| ||||||||  | |||||    
T  47659663 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctagacatacctagtattgattagggatgattttaggacaggattgaacccagaacaacatcagttt 47659564  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  47659563 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcatgt 47659464  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | | |||||||||||||    
T  47659463 gttgatcaagagtgaacccctaattagcattgagacctagtga 47659421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23763657 - 23763419
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  23763657 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 23763558  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  23763557 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 23763458  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23763457 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 23763419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19105199 - 19104961
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||| || |||||  |||||||    
T  19105199 ctttttagttggaccttgagtgactttgagtgcctaaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccataacaacattagttt 19105100  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  19105099 ggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 19105000  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19104999 tttgatcaaaagtgaacccctaattggtaatgagaccta 19104961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 20524875 - 20525113
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  | |||||  |||||||    
T  20524875 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctataacaacattagttt 20524974  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  |||   || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  20524975 ggaagttgattggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaaattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 20525074  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||    
T  20525075 tttgatcaaaagtgaatccctaattggtaatgagaccta 20525113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21438240 - 21438002
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  21438240 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 21438141  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  21438140 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgttttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacat 21438041  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  21438040 tttgatcaagagtgaacccctatttggtaatgaaaccta 21438002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 44756552 - 44756314
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagt-attgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtt 118  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||  ||||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||    
T  44756552 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagtt 44756453  T
Q  119 tgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 218  Q
     || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||  ||| ||||||||||||||||||||     
T  44756452 gggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacc 44756353  T
Q  219 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    | ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  44756352 ttttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 44756314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Original strand, 27898319 - 27898556
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  27898319 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 27898418  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  27898419 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 27898518  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27898519 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 27898556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Original strand, 43062936 - 43063173
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  43062936 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 43063035  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  43063036 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 43063135  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43063136 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 43063173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 49335018 - 49334781
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  49335018 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 49334919  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  49334918 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 49334819  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  49334818 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 49334781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 33385873 - 33386032
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  33385873 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 33385972  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  33385973 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 33386032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 33392517 - 33392676
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  33392517 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 33392616  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  33392617 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 33392676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 50887412 - 50887631
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  50887412 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 50887511  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  50887512 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 50887611  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccc 239  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  50887612 ttggatcaagagagaacccc 50887631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 18625935 - 18626172
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  18625935 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 18626034  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||| | ||| |||||||||||||||||||| |    
T  18626035 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgttga-gtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 18626133  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18626134 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 18626172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 21806850 - 21807009
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  21806850 gtgtttcgacctttttagttggacattgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagatttgacccagaaca 21806949  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  21806950 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 21807009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 21835822 - 21835663
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    ||  ||||||    
T  21835822 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagatttgacctagaaca 21835723  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  21835722 actttagtatgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 21835663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33394185 - 33394056
Alignment:
Q  128 agtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatca 227  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| | ||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33394185 agtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagttgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatca 33394086  T
Q  228 agaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
     || ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  33394085 ggagtgaacccctagttggtaatgaaacct 33394056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8305543 - 8305363
Alignment:
Q  59 atacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactct 158  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| ||||||||  ||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||    
T  8305543 atacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacaacattagtttggaacttgtctcgtactcgccatggcgagtaagaattct 8305444  T
Q  159 cgcctcgcgagtacaaccaggat-gaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 239  Q
     |||||||||| ||  ||||| | ||   |||| | ||| |||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  8305443 tgcctcgcgagcacttccaggttagagtgtgttga-gtgcttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccc 8305363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 6 - 260
Target Start/End: Original strand, 108970 - 109224
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  108970 tttcgtgtttcgaccttttaagttgaaccttgtatacctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 109069  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  109070 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcacctcgcgagtacaaccagaatgagattgtttatgtgtttgtgcga 109169  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagt 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  109170 tctgtgtcgcacttgttaatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagt 109224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10819 - 10568
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10819 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 10720  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10719 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 10620  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10619 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 10568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 57241 - 56990
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  57241 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 57142  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  57141 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 57042  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  57041 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 56990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 698 - 954
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  698 tttcgtgattcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 797  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||    
T  798 aacaacactagtttgggagttgagtggtactcgccgtggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgaagttgcttgagtgtttgtgcga 897  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  898 tctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctggtga 954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 67964 - 67712
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  67964 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagaatgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 67865  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  67864 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 67765  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67764 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtga 67712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 41983 - 41745
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||   ||||||    
T  41983 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcatattgaacccagaacaacactagttt 41884  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  41883 gggatttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 41784  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41783 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 41745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 57490 - 57252
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  57490 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtagaatcagattgaacccagaacaacactagttt 57391  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  57390 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 57291  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  57290 ggtgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 57252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7460 - 7301
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||   | || |||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||  | || |||||||    
T  7460 gtgtttcgacctttttagttagaccttaagtgccattgagtgcctgaacgtacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccagaaca 7361  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  7360 actttagtttgggaattgtttggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 7301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 23491 - 23363
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||  | || |||||||    
T  23491 gtgtttcgacctttttagttataccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccagaaca 23392  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcg 138  Q
    |  ||||||||||| |||  |||||||||    
T  23391 actttagtttgggaattgtttggtactcg 23363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13801 - 13756
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  13801 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccc 13756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23329 - 23284
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  23329 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccc 23284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 39164 - 38913
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  39164 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 39065  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39064 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 38965  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  38964 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 38913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27098 - 26853
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||    
T  27098 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccaaaaca 26999  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  26998 acactagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaacctgaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 26899  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagac 255  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  26898 tgtcgcacgtgttgatccagagtgaacccctatttggtaatgagac 26853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 43737 - 43667
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 90  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43737 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagttcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 43667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 255
Target Start/End: Original strand, 125763 - 126008
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  125763 gtgtttcaacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 125862  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||| | |   ||  ||||||||||||||||    
T  125863 gcactggtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactttcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagtgacttgagtgtttgtgcgatctg 125962  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagac 255  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  125963 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagac 126008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 255
Target Start/End: Original strand, 105561 - 105773
Alignment:
Q  43 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  105561 ccttgagtgcctaaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccataacagcactggtttgggagttgagtggtactcgccat 105660  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 242  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  105661 ggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagtgacttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaa 105760  T
Q  243 ctggtaatgagac 255  Q
     ||||||||||||    
T  105761 ttggtaatgagac 105773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 307553 - 307310
Alignment:
Q  10 gtgtttcgaccttttt-agttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  307553 gtgtttcgaccttttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaac 307454  T
Q  109 aagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatct 208  Q
    ||   || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  |  || ||  |||||||||||||||    
T  307453 aacactaatttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatct 307354  T
Q  209 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 252  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  307353 gtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatga 307310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 38502 - 38246
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||   ||  |||| |||    
T  38502 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattagggatgattttaggacaggattgaacccag 38403  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||  ||||||||||||    
T  38402 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgtttgtgcga 38303  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  38302 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggcattgagacctagtga 38246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 76310 - 76566
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||   ||  |||| |||    
T  76310 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattagggatgattttaggacaggattgaacccag 76409  T
Q  106 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 205  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||  ||||||||||||    
T  76410 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgtttgtgcga 76509  T
Q  206 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtga 262  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  76510 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggcattgagacctagtga 76566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 57430 - 57179
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| |||||||    
T  57430 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctatgagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 57331  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  57330 acattagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 57231  T
Q  210 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 261  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  57230 tgtcgcacgagttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtg 57179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12878 - 12719
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  ||||||    
T  12878 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacctagaaca 12779  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12778 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 12719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 14200 - 14438
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||  ||||||     
T  14200 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagttg 14299  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||||||  | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  14300 gggagttggcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 14399  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14400 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagaccta 14438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 178
Target Start/End: Original strand, 3536 - 3694
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||   |||||     
T  3536 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagtta 3635  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccag 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  3636 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccag 3694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 29867 - 30105
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||| ||     
T  29867 ctttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattatttg 29966  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  29967 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 30066  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30067 tttgatcaagagtgaacccctaaatggtaatgagaccta 30105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 90
Target Start/End: Original strand, 41863 - 41933
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 90  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41863 ctttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 41933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 242503 - 242265
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  242503 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattgaacctagaacaacattagttg 242404  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  242403 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 242304  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  242303 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 242265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 258
Target Start/End: Original strand, 58103 - 58316
Alignment:
Q  45 ttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||| || |||||  | |||||||||||||    
T  58103 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatgg 58202  T
Q  145 cgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaact 244  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |    
T  58203 cgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaatt 58302  T
Q  245 ggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||| |||||    
T  58303 ggtaatgaaaccta 58316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 78671 - 78511
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgta-ggatcagagggaactcagaac 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||   |||  | || ||||||    
T  78671 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggattgaatgtagggcaaagattggacccagaac 78572  T
Q  109 aagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    ||  |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  78571 aactttagtttgggaaatgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 78511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3129 - 3005
Alignment:
Q  46 tgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggc 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3129 tgagtgcctgatcatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacgttagtttgggaattgagtggtactcgccatggc 3030  T
Q  146 gagtaagtactctcgcctcgcgagt 170  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  3029 gagtaagaactctcgcctcgcgagt 3005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9786 - 9548
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||  ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||  ||||||     
T  9786 ctttttagttttaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagttg 9687  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||||||    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  9686 gggagttggcctgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 9587  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||    
T  9586 tttgatcaagagtgaatccctttatggtaatgagaccta 9548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 3218 - 3069
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||    || |||||||| ||||||||    
T  3218 ctttttagttggaccttgagtgcccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattagacccagaacaaccttagttt 3119  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||| |||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3118 gggaattgtttggtacttgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 3069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12900 - 12741
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||  | || |||||||    
T  12900 gtgtttcgacctttttagttagaccttgagtgcctttgagtgtctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccagaaca 12801  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12800 actttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 12741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 37153 - 36916
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||  |||| |||||||   |||| ||    
T  37153 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtagggcaagattgaacccagaacagcattagctt 37054  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||| | ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  37053 ggaacttgacttgtactcgccttggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 36954  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36953 tttgatcaagagtgaacccctaa-tggtaatgagaccta 36916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 5459 - 5696
Alignment:
Q  21 tttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttg 120  Q
    |||||||||| ||||||  | || |||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||  ||||  | |||||  |||| |||    
T  5459 tttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctaaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggataagattgaacctaaaacaacattaggttg 5558  T
Q  121 ggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttg 220  Q
    | | |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||  || | |   ||  |||||||||||||||| ||||||| |     
T  5559 gaacttgacttgtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcacgagcactaccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgcgtcgcacgtt 5658  T
Q  221 ttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5659 ttgatcatgagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 5696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10623 - 10385
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    |||||||| || ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||  ||||||     
T  10623 ctttttagatggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagttg 10524  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||||||  | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||| ||| |    
T  10523 gggagttggcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcacacgt 10424  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     |||||||||| |||  ||||   |||||||||||||||    
T  10423 tttgatcaagagtgagtccctttatggtaatgagaccta 10385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 242
Target Start/End: Original strand, 24635 - 24857
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||  ||||  |||| ||  ||||||     
T  24635 ctttttagttggaccttgagtaccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattgggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaataacattagttg 24734  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||||||  | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||  | ||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  24735 gggagttggcttgtactcgccatggtgagtaggtactctcgcctcgcgggcacttctagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcatgt 24834  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaa 242  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  24835 gttgatcaagagtgaacccctaa 24857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 90
Target Start/End: Original strand, 19792 - 19862
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 90  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19792 ctttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattgggaatgaatgtagga 19862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 178
Target Start/End: Original strand, 8537 - 8695
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| |||||   | || |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||  |||| ||    
T  8537 ctttttagttggaccttaagtgcctttgagtgcgtgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggataagattgaacccagaacaacattaggtt 8636  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccag 178  Q
    || | |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  8637 ggaacttgacttgtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcactaccag 8695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 61266 - 61180
Alignment:
Q  6 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatc 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61266 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatc 61180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 9235 - 8998
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  9235 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 9136  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  9135 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 9036  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9035 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 8998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 258
Target Start/End: Original strand, 32050 - 32209
Alignment:
Q  98 gaactcagaacaagcttagtttgggag-ttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtg 196  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||| ||| | || ||| ||||    
T  32050 gaacccagaacaaccttagtt-gggagattgagtggtacttgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtt-tttgtgtg 32147  T
Q  197 tttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||    
T  32148 tttgtgcgatctgtgtcgcaccatttgatcaagagtggacccctaattggtaatgaaaccta 32209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Original strand, 3738 - 3975
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  3738 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 3837  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  3838 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 3937  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3938 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 3975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 74452 - 74293
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  74452 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 74353  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  74352 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 74293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22544 - 22413
Alignment:
Q  126 tgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  22544 tgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgat 22445  T
Q  226 caagaatgaacccctaactggtaatgagacct 257  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  22444 caagagtgaacccctatttggtaatgaaacct 22413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 560 - 322
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||   ||| |||||||   |||||||    
T  560 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggtatgaatgtaggattagattaaacccagaacatcattagttt 461  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||  ||||| || | |    |  ||| ||||||||| |||||||||| |    
T  460 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcacgagcacttccaggttggagtgtaatgagtgcttgtgcgatttgtgtcgcacgt 361  T
Q  220 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
     | |||||||| ||||||||    |||||||||||||||    
T  360 ttggatcaagagtgaacccccttatggtaatgagaccta 322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 140
Target Start/End: Original strand, 17392 - 17512
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  ||||||   |||||||    
T  17392 ctttttagttggaccttgagtgccattgtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaccattagttt 17491  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgcc 140  Q
    || | |||| |||||||||||    
T  17492 ggaaattgactggtactcgcc 17512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 258
Target Start/End: Original strand, 19411 - 19475
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 258  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19411 gtgtttgtgcgatctgcgtcgcacgtattgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 19475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 91
Target Start/End: Original strand, 7942 - 8013
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 91  Q
    ||||| |||||||||||  || || |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  7942 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 8013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4089 - 4052
Alignment:
Q  132 gtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4089 gtactcgccatggcgagtaaatgctctcgcctcgcgag 4052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 8520 - 8483
Alignment:
Q  132 gtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  8520 gtactcgccatggcgagtaaatgctctcgcctcgcgag 8483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 258
Target Start/End: Original strand, 14678 - 14891
Alignment:
Q  45 ttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 144  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||| |  ||| |||||  |||   ||| |||||||   ||||||||| | |||  | |||||||||||||    
T  14678 ttgagtgcctaaacatacctagtaatgattagggaaaaatataggacaagattaaacccagaacagcattagtttggaacttgtcttgtactcgccatgg 14777  T
Q  145 cgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaact 244  Q
    ||||||||  ||||||||| | ||| ||  ||||| || | |    |  ||| |||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    |    
T  14778 cgagtaagagctctcgccttgtgagcacttccaggttggagtgtaatgagtgcttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttat 14877  T
Q  245 ggtaatgagaccta 258  Q
    ||||||||||||||    
T  14878 ggtaatgagaccta 14891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 478 - 430
Alignment:
Q  43 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 91  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  478 ccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University