View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10233A_low_22 (Length: 428)

Name: NF10233A_low_22
Description: NF10233A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10233A_low_22
NF10233A_low_22
[»] chr3 (47 HSPs)
chr3 (2-414)||(13505758-13506170)
chr3 (2-413)||(12161308-12161719)
chr3 (4-388)||(15643640-15644024)
chr3 (4-414)||(10161431-10161841)
chr3 (2-255)||(3340594-3340847)
chr3 (219-414)||(15945391-15945586)
chr3 (246-414)||(3340462-3340630)
chr3 (2-282)||(15945147-15945427)
chr3 (132-413)||(22165548-22165829)
chr3 (17-413)||(10603777-10604173)
chr3 (132-390)||(16654406-16654664)
chr3 (251-413)||(4369482-4369644)
chr3 (246-413)||(20157697-20157864)
chr3 (247-391)||(3278274-3278418)
chr3 (247-391)||(17386561-17386704)
chr3 (246-388)||(13693682-13693824)
chr3 (2-198)||(14446994-14447190)
chr3 (317-391)||(7599230-7599304)
chr3 (317-391)||(15630222-15630296)
chr3 (317-391)||(16374745-16374819)
chr3 (324-391)||(10145892-10145959)
chr3 (324-391)||(13137435-13137502)
chr3 (317-391)||(13188683-13188757)
chr3 (317-391)||(13196695-13196769)
chr3 (2-168)||(17386343-17386509)
chr3 (317-413)||(13689541-13689637)
chr3 (132-255)||(4369390-4369513)
chr3 (317-387)||(12188345-12188415)
chr3 (5-198)||(12423807-12424000)
chr3 (2-178)||(13693465-13693641)
chr3 (252-319)||(12423714-12423781)
chr3 (317-387)||(12194759-12194829)
chr3 (2-63)||(20158020-20158081)
chr3 (131-178)||(3278185-3278232)
chr3 (247-391)||(14446831-14446972)
chr3 (118-178)||(7599070-7599130)
chr3 (118-178)||(10145725-10145785)
chr3 (118-178)||(13188857-13188917)
chr3 (131-195)||(20157888-20157952)
chr3 (131-178)||(13137609-13137656)
chr3 (131-178)||(13196869-13196916)
chr3 (131-178)||(15630396-15630443)
chr3 (118-178)||(12188515-12188575)
chr3 (118-178)||(12194929-12194989)
chr3 (2-69)||(3278056-3278123)
chr3 (131-178)||(16374919-16374966)
chr3 (254-295)||(7599179-7599220)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (2-414)||(23160618-23161030)
chr2 (2-414)||(23571875-23572287)
chr2 (2-414)||(27630066-27630478)
chr2 (4-388)||(16774218-16774602)
chr2 (4-414)||(24796538-24796948)
chr2 (1-246)||(116090-116335)
chr2 (104-413)||(24821347-24821637)
chr2 (246-414)||(116308-116475)
chr2 (335-414)||(27770044-27770123)
chr2 (248-413)||(17867294-17867459)
chr2 (317-391)||(22045926-22046000)
chr2 (317-391)||(25356386-25356460)
chr2 (317-391)||(27626468-27626542)
chr2 (311-391)||(26192888-26192968)
chr2 (247-336)||(25372285-25372374)
chr2 (317-391)||(12880-12954)
chr2 (2-172)||(25372422-25372592)
chr2 (313-388)||(25368890-25368965)
chr2 (132-178)||(17867499-17867545)
chr2 (131-178)||(25369025-25369072)
chr2 (131-178)||(13054-13101)
chr2 (131-178)||(22046100-22046147)
chr2 (131-178)||(24170067-24170114)
chr2 (131-178)||(25356239-25356286)
chr2 (131-178)||(27626321-27626368)
chr2 (317-384)||(24170208-24170275)
chr2 (317-391)||(25146057-25146131)
chr2 (254-295)||(12964-13005)
chr2 (254-295)||(22046010-22046051)
chr2 (17-74)||(24169953-24170010)
chr2 (254-295)||(25356335-25356376)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (2-414)||(24129-24541)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (2-414)||(20439407-20439819)
chr5 (2-414)||(25117389-25117801)
chr5 (2-414)||(25176480-25176892)
chr5 (4-388)||(24954446-24954830)
chr5 (2-413)||(26846226-26846637)
chr5 (219-413)||(30760886-30761080)
chr5 (132-413)||(18071600-18071881)
chr5 (17-413)||(20792027-20792423)
chr5 (2-413)||(20597084-20597495)
chr5 (2-413)||(20603381-20603792)
chr5 (132-413)||(20609700-20609981)
chr5 (2-176)||(30764587-30764759)
chr5 (251-391)||(21387115-21387255)
chr5 (172-282)||(30761044-30761154)
chr5 (317-391)||(15734408-15734482)
chr5 (317-391)||(20621037-20621111)
chr5 (317-391)||(23746925-23746999)
chr5 (317-391)||(22318750-22318824)
chr5 (317-391)||(25008049-25008123)
chr5 (251-388)||(22947239-22947376)
chr5 (16-178)||(23520627-23520789)
chr5 (132-178)||(22947147-22947193)
chr5 (126-178)||(22318924-22318976)
chr5 (131-178)||(15734261-15734308)
chr5 (2-69)||(22947017-22947084)
chr5 (131-178)||(23746778-23746825)
chr5 (131-178)||(25008223-25008270)
chr5 (131-178)||(20620890-20620937)
chr5 (254-295)||(15734357-15734398)
chr5 (17-69)||(21386911-21386963)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (71-414)||(20392120-20392463)
chr1 (4-414)||(21799917-21800327)
chr1 (2-360)||(19783592-19783935)
chr1 (2-413)||(3988668-3989058)
chr1 (247-388)||(8651829-8651970)
chr1 (2-178)||(8651611-8651787)
chr1 (254-388)||(19876943-19877077)
chr1 (16-195)||(20072367-20072546)
chr1 (322-391)||(20236360-20236429)
chr1 (2-178)||(8948893-8949070)
chr1 (248-384)||(20072205-20072341)
chr1 (132-198)||(19877106-19877172)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (2-413)||(16530604-16531014)
chr7 (2-413)||(16634648-16635058)
chr7 (4-391)||(13672418-13672805)
chr7 (4-388)||(18594538-18594922)
chr7 (4-388)||(18616762-18617146)
chr7 (2-413)||(16761035-16761431)
chr7 (2-413)||(16150747-16151158)
chr7 (248-413)||(824432-824597)
chr7 (248-413)||(15064566-15064731)
chr7 (2-178)||(15921441-15921616)
chr7 (247-387)||(20107080-20107220)
chr7 (2-178)||(15064350-15064526)
chr7 (2-181)||(824216-824395)
chr7 (317-391)||(8716738-8716812)
chr7 (317-391)||(14549970-14550044)
chr7 (317-391)||(18286499-18286573)
chr7 (5-178)||(20106865-20107038)
chr7 (314-391)||(48803125-48803202)
chr7 (322-413)||(15918013-15918104)
chr7 (312-391)||(16466881-16466960)
chr7 (317-413)||(13656807-13656903)
chr7 (131-178)||(48803299-48803346)
chr7 (131-178)||(8716591-8716638)
chr7 (131-178)||(14549823-14549870)
chr7 (131-178)||(18286352-18286399)
chr7 (133-178)||(16467055-16467100)
chr7 (131-178)||(13656660-13656707)
chr7 (254-295)||(8716687-8716728)
chr7 (254-295)||(14549919-14549960)
chr7 (248-297)||(15921352-15921401)
chr7 (17-69)||(48803408-48803460)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (2-414)||(29068-29465)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (4-388)||(20017509-20017893)
chr6 (4-388)||(22166824-22167208)
chr6 (2-413)||(21561694-21562105)
chr6 (4-414)||(22768373-22768783)
chr6 (4-388)||(20168794-20169178)
chr6 (173-413)||(11218339-11218579)
chr6 (247-391)||(18447012-18447156)
chr6 (2-178)||(18446794-18446970)
chr6 (317-391)||(24856510-24856584)
chr6 (131-178)||(18010575-18010622)
chr6 (312-391)||(25966513-25966592)
chr6 (317-391)||(18010720-18010794)
chr6 (131-178)||(8725441-8725488)
chr6 (131-178)||(24856684-24856731)
chr6 (326-388)||(29685447-29685509)
chr6 (248-295)||(8725351-8725398)
chr6 (326-388)||(23519007-23519069)
[»] chr4 (11 HSPs)
chr4 (4-388)||(13821470-13821854)
chr4 (2-255)||(15261461-15261714)
chr4 (246-414)||(15261329-15261497)
chr4 (2-413)||(3353178-3353587)
chr4 (2-75)||(16680954-16681027)
chr4 (247-391)||(15864309-15864453)
chr4 (3-201)||(15864092-15864290)
chr4 (317-391)||(22109834-22109908)
chr4 (317-391)||(15253219-15253294)
chr4 (131-178)||(22109687-22109734)
chr4 (131-178)||(15253072-15253119)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (2-389)||(25655-26036)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (2-413)||(3300-3696)
[»] chr8 (35 HSPs)
chr8 (1-255)||(21825970-21826224)
chr8 (109-413)||(19766163-19766467)
chr8 (246-414)||(21826188-21826356)
chr8 (132-413)||(29333300-29333580)
chr8 (16-413)||(21100057-21100451)
chr8 (247-391)||(21942720-21942864)
chr8 (248-413)||(11348192-11348357)
chr8 (6-178)||(21942906-21943078)
chr8 (247-364)||(22830706-22830823)
chr8 (6-178)||(11348397-11348569)
chr8 (2-178)||(22368546-22368722)
chr8 (248-391)||(22368762-22368905)
chr8 (317-391)||(8313342-8313416)
chr8 (317-391)||(8324117-8324191)
chr8 (317-391)||(22100891-22100965)
chr8 (2-178)||(22289626-22289802)
chr8 (283-391)||(22289865-22289973)
chr8 (317-391)||(21380967-21381041)
chr8 (317-413)||(16419844-16419940)
chr8 (2-69)||(22035079-22035146)
chr8 (2-178)||(22830488-22830664)
chr8 (317-391)||(21954953-21955027)
chr8 (317-391)||(22034796-22034870)
chr8 (317-391)||(22098097-22098171)
chr8 (131-178)||(8313195-8313242)
chr8 (131-178)||(8324291-8324338)
chr8 (131-178)||(17132526-17132573)
chr8 (131-178)||(21954806-21954853)
chr8 (131-178)||(22101065-22101112)
chr8 (17-69)||(21267939-21267991)
chr8 (131-178)||(21380820-21380867)
chr8 (131-178)||(22034970-22035017)
chr8 (131-178)||(22097950-22097997)
chr8 (254-295)||(22034880-22034921)
chr8 (359-391)||(22831958-22831990)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (2-413)||(22237-22648)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (2-413)||(21442-21852)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (2-413)||(12040-12451)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (2-195)||(19410-19603)
scaffold0004 (254-413)||(19219-19378)
scaffold0004 (118-178)||(253248-253308)
scaffold0004 (345-388)||(253154-253197)
scaffold0004 (4-45)||(253395-253436)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (246-413)||(90087-90254)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (132-413)||(19513-19775)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (132-413)||(122069-122342)
[»] scaffold0525 (2 HSPs)
scaffold0525 (246-413)||(942-1110)
scaffold0525 (132-255)||(856-978)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (16-413)||(8228-8623)
[»] scaffold0346 (2 HSPs)
scaffold0346 (6-178)||(5043-5215)
scaffold0346 (322-391)||(4857-4926)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (132-296)||(24047-24210)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (2-178)||(44020-44196)
scaffold0037 (2-178)||(51409-51585)
scaffold0037 (247-391)||(44238-44382)
scaffold0037 (247-391)||(51627-51771)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (247-413)||(132431-132597)
scaffold0026 (2-178)||(132216-132392)
[»] scaffold0402 (2 HSPs)
scaffold0402 (247-413)||(6690-6856)
scaffold0402 (2-178)||(6472-6648)
[»] scaffold0059 (2 HSPs)
scaffold0059 (2-178)||(10733-10909)
scaffold0059 (2-178)||(18734-18910)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (2-178)||(234489-234665)
[»] scaffold1400 (1 HSPs)
scaffold1400 (2-97)||(6-101)
[»] scaffold0375 (3 HSPs)
scaffold0375 (314-413)||(11400-11499)
scaffold0375 (132-178)||(11257-11303)
scaffold0375 (251-299)||(11349-11397)
[»] scaffold0216 (2 HSPs)
scaffold0216 (314-391)||(10288-10365)
scaffold0216 (135-178)||(10148-10191)
[»] scaffold1095 (2 HSPs)
scaffold1095 (8-178)||(1870-2038)
scaffold1095 (246-391)||(2079-2224)
[»] scaffold1571 (2 HSPs)
scaffold1571 (317-391)||(1496-1570)
scaffold1571 (131-178)||(1349-1396)
[»] scaffold0577 (3 HSPs)
scaffold0577 (317-391)||(4980-5054)
scaffold0577 (131-178)||(4833-4880)
scaffold0577 (254-295)||(4929-4970)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (246-388)||(7763-7905)
scaffold0156 (118-178)||(7946-8006)
[»] scaffold0473 (3 HSPs)
scaffold0473 (317-391)||(12912-12986)
scaffold0473 (131-178)||(12765-12812)
scaffold0473 (248-295)||(12855-12902)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (2-69)||(1750-1817)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (322-391)||(3-72)
[»] scaffold1879 (2 HSPs)
scaffold1879 (131-178)||(356-403)
scaffold1879 (317-391)||(188-262)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (313-388)||(32847-32921)
scaffold0117 (131-178)||(32993-33040)
[»] scaffold1620 (3 HSPs)
scaffold1620 (317-381)||(271-335)
scaffold1620 (131-178)||(429-476)
scaffold1620 (17-74)||(533-590)
[»] scaffold0231 (2 HSPs)
scaffold0231 (118-178)||(21620-21680)
scaffold0231 (317-413)||(21792-21888)
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (317-384)||(39013-39080)
scaffold0116 (17-74)||(39278-39335)
scaffold0116 (131-178)||(39174-39221)
[»] scaffold0020 (4 HSPs)
scaffold0020 (317-391)||(115521-115594)
scaffold0020 (317-391)||(119825-119898)
scaffold0020 (131-178)||(115374-115421)
scaffold0020 (131-178)||(119678-119725)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (131-178)||(54968-55015)
[»] scaffold1184 (1 HSPs)
scaffold1184 (351-388)||(387-424)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 13506170 - 13505758
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  13506170 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactcaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatcccctttgtttatacactca 13506071  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgca 201  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13506070 agctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgca 13505971  T
Q  202 catagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaa 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13505970 catagaacaacataatgaagaagcagaaggtgcacgcttgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaa 13505871  T
Q  302 ggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaa 401  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13505870 ggtgaaacaaatgaaaatacaagatgggcatggatgaaaaccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataa 13505771  T
Q  402 ggaatgatgtcca 414  Q
    |||||||||||||    
T  13505770 ggaatgatgtcca 13505758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 2 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 12161719 - 12161308
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||    
T  12161719 caagggataaacaagattgagggaaacaataggttaaacatagagacccttatctctatgaatttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactca 12161620  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgca 201  Q
      ||||  ||||||| |||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12161619 aactcaacgtgcccattttgatcttactgccttacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacagatgca 12161520  T
Q  202 catagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaa 301  Q
      |||||||  |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  12161519 tgtagaacataataatgaagacgaggaaggtgcacacttgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgcatcatgatgaggagcaccatgactatgatgac 12161420  T
Q  302 ggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaa 401  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  12161419 ggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgagaggataaacaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgacgggactaa 12161320  T
Q  402 ggaatgatgtcc 413  Q
    ||||||||||||    
T  12161319 ggaatgatgtcc 12161308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 388
Target Start/End: Original strand, 15643640 - 15644024
Alignment:
Q  4 agggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtcacg 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||| ||| ||||||||||||| ||       
T  15643640 agggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaatttcatcaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaa 15643739  T
Q  104 ctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcaca 203  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  15643740 ctcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgctgatgacccacaggtgcaca 15643839  T
Q  204 tagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaagg 303  Q
    |||| |||| |||||||||| | || | ||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||| | ||||||     
T  15643840 tagagcagcctaatgaagaaacagaggatgcacacttgcatcaggaagaggaaggtgcacaactgcaccatgatgaggcataccatgaccctaatgaaga 15643939  T
Q  304 tgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 388  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15643940 tgaaacaaatgaggatgcaagatgggcatggatgactaccgaggttgaaagaataaacaccaagcaacaaaggcaaggtgttgaa 15644024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 10161841 - 10161431
Alignment:
Q  4 agggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtcacg 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| ||| || |||||||||| ||       
T  10161841 agggataaacaagatagagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaatttcataaaaactcgagtcccctatgtctatacactccaa 10161742  T
Q  104 ctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcaca 203  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  10161741 ctcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgcactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgctgatgacccacaggtgcaca 10161642  T
Q  204 tagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaagg 303  Q
    ||||||| | |||||||||| | || | ||||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||     
T  10161641 tagaacaacctaatgaagaaacagaggatgcacacttgcatccggaagaggaaggtgcacaactgcaccatgaagaggcataccatgaccataatgaaga 10161542  T
Q  304 tgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaagg 403  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||    
T  10161541 tgaaacaaatgcggatgcaagatgggcatggatgactaccgaggttgaaagaataaacaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatgagcataagg 10161442  T
Q  404 aatgatgtcca 414  Q
     ||||||||||    
T  10161441 catgatgtcca 10161431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3340847 - 3340594
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||    
T  3340847 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaacctcgaatcccctttgtttatacactca 3340748  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgca 201  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3340747 agctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgca 3340648  T
Q  202 catagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagagga 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  3340647 catagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacaaatgcaccatgatgagga 3340594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 219 - 414
Target Start/End: Original strand, 15945391 - 15945586
Alignment:
Q  219 aagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15945391 aagaagcggaaggtgcacacttgcaccacgaagaggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggaacaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaa 15945490  T
Q  319 tgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcca 414  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15945491 tgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgagaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaatgatgtcca 15945586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 246 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 3340630 - 3340462
Alignment:
Q  246 aagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccga 345  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3340630 aagaagcggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccga 3340531  T
Q  346 ggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcca 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3340530 ggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaatgatgtcca 3340462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 282
Target Start/End: Original strand, 15945147 - 15945427
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||| |||||  |||    
T  15945147 caagggctatacaagattgagggaaacaataggctgaacatagaaacccttatctctatgaatttcattaaaactcgaatcccctttgtttatacgctca 15945246  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgca 201  Q
     ||| | ||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15945247 agcttaatgtacctattttgatattattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgca 15945346  T
Q  202 catagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgagga 282  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  15945347 catagagcagcataatgaagaggcagatggtgcacacttgcaccaagaagcggaaggtgcacacttgcaccacgaagagga 15945427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 132 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 22165829 - 22165548
Alignment:
Q  132 ctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcacatagaacagcataatgaagaagcggaagg 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||| ||   ||||||  |||||||||  | | |||     
T  22165829 ctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaacacgataatgaaggcgagaaaga 22165730  T
Q  232 tgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggca 331  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  22165729 tgcacatttgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgtaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggataaacaaatgaaaatgcaagatgagca 22165630  T
Q  332 tggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    |||||| ||||||||| | | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||||| ||||||    
T  22165629 tggatgcataccgaggactagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaattatgtcc 22165548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 10604173 - 10603777
Alignment:
Q  17 attgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactt-tgtc-tatacagtcacgctcactgtgcc 114  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||  ||||||   |||| || ||| |||  |||| ||||||    
T  10604173 attgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagcccc--atccacccatgtcctacacactcaaactcattgtgcc 10604076  T
Q  115 cactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcacatagaacagcat 214  Q
     | ||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||   ||||||  ||    
T  10604075 tattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattgttgatgatccacaggtacatgaagaacacgat 10603976  T
Q  215 aatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatg 314  Q
    |||||||  | ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||    
T  10603975 aatgaaggcgaggaagatgcacatttgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgtaccatgataaggagcaccatgaccatgatgccggataaacaaatg 10603876  T
Q  315 aaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||||   |||| |||||||| ||||||    
T  10603875 aaaatgcaagatgggcatggatgcatactgaggctgagaggataaacaccaagcaactaagggaaggtgtggaattgtcgggactaaggaattatgtcc 10603777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 132 - 390
Target Start/End: Original strand, 16654406 - 16654664
Alignment:
Q  132 ctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcacatagaacagcataatgaagaagcggaagg 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||| ||   ||||||  |||||||||  | |||||     
T  16654406 ctaacccatctcggactaacaccgaggtgtaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaacacgataatgaaggcgaggaaga 16654505  T
Q  232 tgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggca 331  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16654506 tgcacatttgcaccaagaagaagaaggtgcacaattgtaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggataaacaaatgaaaatgcaagatgggca 16654605  T
Q  332 tggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatt 390  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  16654606 tggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgatgaatt 16654664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 251 - 413
Target Start/End: Original strand, 4369482 - 4369644
Alignment:
Q  251 gaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcg 350  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  4369482 gaggaaggtgcgcaattgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggataaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccg 4369581  T
Q  351 aaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  4369582 agaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattttcgggactaaggaatgatgtcc 4369644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 246 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 20157864 - 20157697
Alignment:
Q  246 aagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccga 345  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||    
T  20157864 aagaagaggaaggtgcacacttgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggagaaaacaatgaaaatgaaagatgagcatggatacataccga 20157765  T
Q  346 ggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    ||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    |||||||| ||||||||||    
T  20157764 ggtggagaggataagcaccgagaaacaaaggcagggtgttgaattttcaggattaagaaatgatgtcc 20157697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 247 - 391
Target Start/End: Original strand, 3278274 - 3278418
Alignment:
Q  247 agaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgag 346  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||  |||||||||| |||||||||||||||| | || |||    
T  3278274 agaagaggaaggtgcacacttgcaccatgatgaggaacaccatgaccatgatgtcggagaaaacaatgaaaatgaaagatgggcatggatgcaaactgag 3278373  T
Q  347 gtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    || || ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3278374 gttgagaggataaacaccaagcaacaaagacaaggtgttgaatta 3278418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 247 - 391
Target Start/End: Original strand, 17386561 - 17386704
Alignment:
Q  247 agaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgag 346  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||  |||| ||||| |||||||||||||||  | ||| ||    
T  17386561 agaagaggaaggtgcacacttgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggaagaaataatg-aaatgaaagatgggcatggatacacacctag 17386659  T
Q  347 gtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17386660 gttgagaggataagcaacgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 17386704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 246 - 388
Target Start/End: Original strand, 13693682 - 13693824
Alignment:
Q  246 aagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccga 345  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||   || | ||  || ||  ||| ||||||| |||||||| | |||||    
T  13693682 aagaagcggaaggtgcacacttgcaccatgatgaggagcaccatggccatgatatcggaggaaacaacgatcatgaaagatggacatggatgtaaaccga 13693781  T
Q  346 ggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 388  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13693782 ggttgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 13693824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14447190 - 14446994
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatcca-ctttgt-ctatacagt 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |  |  ||||| |  ||| ||| ||| |    
T  14447190 caagggataaacaaaattgagggtaacaatagacttaacatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatc--atccacccatgtcctacacact 14447093  T
Q  100 cacgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggt 198  Q
    ||  |||  ||||||   ||| ||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||    
T  14447092 caaactcgatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggt 14446994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 7599230 - 7599304
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7599230 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 7599304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 15630296 - 15630222
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15630296 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 15630222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16374819 - 16374745
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16374819 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 16374745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 324 - 391
Target Start/End: Original strand, 10145892 - 10145959
Alignment:
Q  324 gatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10145892 gatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 10145959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 324 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 13137502 - 13137435
Alignment:
Q  324 gatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13137502 gatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 13137435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 13188757 - 13188683
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13188757 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataggcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 13188683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 13196769 - 13196695
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13196769 aatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 13196695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Original strand, 17386343 - 17386509
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |  ||    | | |   ||||||| |||    
T  17386343 caagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcgtccacccatgacctatacactca 17386442  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaa 168  Q
      |||| |||||| | ||| ||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17386443 aactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaa 17386509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 317 - 413
Target Start/End: Original strand, 13689541 - 13689637
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    |||| |||||||||||||||| | || |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||    
T  13689541 aatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaaggaatgatgtcc 13689637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 255
Target Start/End: Original strand, 4369390 - 4369513
Alignment:
Q  132 ctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcacatagaacagcataatgaagaagcggaagg 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||| ||   ||||||  |||||||||  | ||||||    
T  4369390 ctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaacacgataatgaaggcgaggaagg 4369489  T
Q  232 tgcacacgtgcaccaagaagagga 255  Q
    ||| ||  ||||||| || |||||    
T  4369490 tgcgcaattgcaccatgatgagga 4369513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 317 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 12188415 - 12188345
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttga 387  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12188415 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagaaccgagcaacaaaggcaaggtgttga 12188345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12424000 - 12423807
Alignment:
Q  5 gggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactt-tgtc-tatacagtcac 102  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||  |||||   |||| || ||| |||     
T  12424000 gggattaacaacattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagccccg--tccacccatgtcctacacattcaa 12423903  T
Q  103 gctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggt 198  Q
     |||| |||||| | ||||||| || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||| ||||||||    
T  12423902 actcaatgtgcctattttgattatactttctaacacatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttcttttatgttgttgatgatccacaggt 12423807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 13693465 - 13693641
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||| |||   | | |    |||||| |||    
T  13693465 caagggatcaacaagattgaggggaataataggcttaacatagagatccttgtctctatgaacttcattaaacctcgaccacccatgacttatacactca 13693564  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
     |||||  |||||   ||||||| || | ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13693565 agctcaacgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcagactaacaccgaggtggatgaaaatttgttgtat 13693641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 12423781 - 12423714
Alignment:
Q  252 aggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaat 319  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  12423781 aggaagatgcacaattgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggagaaaccaatgaaaat 12423714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 12194829 - 12194759
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttga 387  Q
    |||| ||| |||||||||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12194829 aatgaaaggtgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagaaccgagcaacaaaggcaaggtgttga 12194759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 20158081 - 20158020
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaa 63  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  20158081 caagggataaacaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaa 20158020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 3278185 - 3278232
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3278185 cctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgatgtat 3278232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 14446972 - 14446831
Alignment:
Q  247 agaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgag 346  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||   |||||||||||||| |  |  |  |  ||||| |||| ||||||| |||||||  | |  |||    
T  14446972 agaagaggaaggtgcacatttgcaccatgatgag---caccatgaccatgacgccgaaggcaacaatgacaatgaaagatggacatggatacacaatgag 14446876  T
Q  347 gtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    || || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14446875 gttgagaggataagcaccgagcaaaaaagggaaggtgttgaatta 14446831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Original strand, 7599070 - 7599130
Alignment:
Q  118 tttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    |||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  7599070 tttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 7599130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Original strand, 10145725 - 10145785
Alignment:
Q  118 tttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    |||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10145725 tttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 10145785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13188917 - 13188857
Alignment:
Q  118 tttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    |||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13188917 tttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 13188857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20157952 - 20157888
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccaca 195  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||    
T  20157952 cctaacccatcttggactaacaccgaggtgaaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccaca 20157888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13137656 - 13137609
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13137656 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 13137609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13196916 - 13196869
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13196916 cctaacccatctcggactaacaccgaggtggaggcaaatttgttgtat 13196869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15630443 - 15630396
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15630443 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 15630396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12188575 - 12188515
Alignment:
Q  118 tttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    |||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  12188575 tttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgtagtat 12188515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12194989 - 12194929
Alignment:
Q  118 tttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    |||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  12194989 tttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgtagtat 12194929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 69
Target Start/End: Original strand, 3278056 - 3278123
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcat 69  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||   ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  3278056 caagggataaacatgatcgagggaaacaatttgctaaacatagagaccctcatttctatgaatttcat 3278123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16374966 - 16374919
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  16374966 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttcttgtat 16374919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 295
Target Start/End: Original strand, 7599179 - 7599220
Alignment:
Q  254 gaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccat 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  7599179 gaaggtgcacacatgcaccatgaagaggagccccatgaccat 7599220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 23161030 - 23160618
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  23161030 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactcaacatagatacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatcccctttgtttatacactca 23160931  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgca 201  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23160930 agctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttcatgatgacccacaggtgca 23160831  T
Q  202 catagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaa 301  Q
    |||||| || ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23160830 catagaccaacatcatgaagaagcagaaggtgcacacttgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcaccatgaccctgatgaa 23160731  T
Q  302 ggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaa 401  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  23160730 ggtgacacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagtaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactaatgggcataa 23160631  T
Q  402 ggaatgatgtcca 414  Q
    |||| ||||||||    
T  23160630 ggaacgatgtcca 23160618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 23572287 - 23571875
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  23572287 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactcaacatagatacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatcccctttgtttatacactca 23572188  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgca 201  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23572187 agctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttcatgatgacccacaggtgca 23572088  T
Q  202 catagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaa 301  Q
    |||||| || ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23572087 catagaccaacatcatgaagaagcagaaggtgcacacttgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcaccatgaccctgatgaa 23571988  T
Q  302 ggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaa 401  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  23571987 ggtgacacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagtaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactaatgggcataa 23571888  T
Q  402 ggaatgatgtcca 414  Q
    |||| ||||||||    
T  23571887 ggaacgatgtcca 23571875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 2 - 414
Target Start/End: Original strand, 27630066 - 27630478
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  27630066 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactcaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatcccctttgtttatacactca 27630165  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgca 201  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  27630166 agctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttcatgatgacccacaagtgca 27630265  T
Q  202 catagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaa 301  Q
    |||||| || ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27630266 catagaccaacatcatgaagaagcagaaggtgcacacttgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcaccatgaccctgatgaa 27630365  T
Q  302 ggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaa 401  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  27630366 ggtgacacacatgaaaatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactaatgggcataa 27630465  T
Q  402 ggaatgatgtcca 414  Q
    ||||  |||||||    
T  27630466 ggaacaatgtcca 27630478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 388
Target Start/End: Original strand, 16774218 - 16774602
Alignment:
Q  4 agggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtcacg 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||| |||  |||||||||||| ||       
T  16774218 agggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaatttcatcaaaactcgagtcccttttgtctatacactccaa 16774317  T
Q  104 ctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcaca 203  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16774318 ctcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgatgatgacccacaggtgcaca 16774417  T
Q  204 tagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaagg 303  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  16774418 tagaacagcataatgaagaaacagagggtgcacacttgcatcaagaagaggaaggtgctcaactgcaccatgatgaggaacaccatgaccctaatgaagg 16774517  T
Q  304 tgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 388  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16774518 tgaaacaaatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 16774602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 4 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 24796948 - 24796538
Alignment:
Q  4 agggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtcacg 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||| ||| ||||||||||||| ||       
T  24796948 agggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaatttcatcaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaa 24796849  T
Q  104 ctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcaca 203  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  24796848 ctcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgatgatgacccgcaggtgcaca 24796749  T
Q  204 tagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaagg 303  Q
    |||||||||||||||||||| | || | ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  24796748 tagaacagcataatgaagaaacagaggatgcacacttgcatcaagaagaggaaggtgctcaactgcaccatgatgaggaacaccatgaccctaatgaagg 24796649  T
Q  304 tgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaagg 403  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||    
T  24796648 tgaaacaaatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataaacaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatgagcataagg 24796549  T
Q  404 aatgatgtcca 414  Q
     ||||||||||    
T  24796548 catgatgtcca 24796538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 116090 - 116335
Alignment:
Q  1 tcaagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||| ||    
T  116090 tcaagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaaccagaatcccctttgtttatacactc 116189  T
Q  101 acgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgc 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  116190 aagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaactcatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgc 116289  T
Q  201 acatagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcacca 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||  |||||||    
T  116290 acatagaacagcataataaagaagagaaaggtgcacaattgcacca 116335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 24821637 - 24821347
Alignment:
Q  104 ctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcaca 203  Q
    |||| |||||| | ||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||| ||      
T  24821637 ctcaatgtgcctattttgattgtacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccataggtacatg 24821538  T
Q  204 tagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaagg 303  Q
     ||||||  || ||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  24821537 aagaacacgatgatgaaggcgaggaaggtgcacacttgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccgg 24821438  T
Q  304 tgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaagg 403  Q
     ||||| ||||||||||||||||                   |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  24821437 agaaaccaatgaaaatgcaagat-------------------ggtcgagaggataagcaccgagcatcaaaggcaaggtgttgaattatcgggactaagg 24821357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 246 - 414
Target Start/End: Original strand, 116308 - 116475
Alignment:
Q  246 aagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccga 345  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  116308 aagaagagaaaggtgcacaattgcaccatgaggaagagcac-atgaccataatgaagaagaaacaaatgaaaatgcgagatgggcatggatgcataccga 116406  T
Q  346 ggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcca 414  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  116407 ggtcgagaggataagcatcgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggactaaggaatgatgtcca 116475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 335 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 27770123 - 27770044
Alignment:
Q  335 atgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcca 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27770123 atgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaatgatgtcca 27770044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 248 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 17867459 - 17867294
Alignment:
Q  248 gaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgagg 347  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||    || | || |||||| |||| ||||||| ||||||||   |||||||    
T  17867459 gaagaggaaggtgcacacttgcaccaagaagaggatcaccatgaccatgaaactggaggaaaaaatgataatgaaagatggacatggatgcgaaccgagg 17867360  T
Q  348 tcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  17867359 ttgaaaggataagcaccgagcaactaaggctaggtgttgaattatcgggactaaggaatgatgtcc 17867294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22046000 - 22045926
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046000 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 22045926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 25356386 - 25356460
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25356386 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 25356460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 27626468 - 27626542
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27626468 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 27626542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 311 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26192968 - 26192888
Alignment:
Q  311 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26192968 aatgataatgaaagatggacatggatgcaaaccgaggttgaaaggataagcaccgagtaacaaaggcaaggtgttgaatta 26192888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 247 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25372374 - 25372285
Alignment:
Q  247 agaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggat 336  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  || | ||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  25372374 agaagaggaaggtgcacacttgcaccatgatgaggagcaacatgaccatgatgccggaggaaacaatgaaaatgaaagatgggcatggat 25372285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 12954 - 12880
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12954 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaagaataagcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaatta 12880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 25372592 - 25372422
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |  ||    | | |   ||||||| |||    
T  25372592 caagggataaacaagattgagggaaacaataggtttaacatatagacccttatctctatgaacttcattaagcatcgtccacccatgacctatacactca 25372493  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttg 172  Q
      |||| |||||| | ||| ||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25372492 aactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttg 25372422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 313 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 25368965 - 25368890
Alignment:
Q  313 tgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 388  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | || |||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25368965 tgaaaatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggttcagaggataagcaccgagcaacaaaggcaagatgttgaa 25368890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17867545 - 17867499
Alignment:
Q  132 ctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17867545 ctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 17867499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25369072 - 25369025
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25369072 cctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagacaatttgttgtat 25369025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13101 - 13054
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13101 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 13054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22046147 - 22046100
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22046147 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 22046100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 24170067 - 24170114
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24170067 cctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagcaaattttttgtat 24170114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 25356239 - 25356286
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25356239 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 25356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 27626321 - 27626368
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27626321 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 27626368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 384
Target Start/End: Original strand, 24170208 - 24170275
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgt 384  Q
    |||| ||||||| |||||||| | || |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24170208 aatggaagatggtcatggatgcaaactgaggtacaaaggattagcactgagcaacaaaggcaaggtgt 24170275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 25146131 - 25146057
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | |  |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  25146131 aatgaaagatgggcatggatgcaaaatgaggtacaaaggattagcaccgagcaacagaggcaagttgtcgaatta 25146057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13005 - 12964
Alignment:
Q  254 gaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccat 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13005 gaaggtgcacacatgcaccatgaagaggagccccatgaccat 12964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22046051 - 22046010
Alignment:
Q  254 gaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccat 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22046051 gaaggtgcacacatgcaccatgaagaggagccccatgaccat 22046010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Original strand, 24169953 - 24170010
Alignment:
Q  17 attgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaac 74  Q
    |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  24169953 attgagggaatcaataggctaaacattgaaaccctcatttctatgaatttcattaaac 24170010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 295
Target Start/End: Original strand, 25356335 - 25356376
Alignment:
Q  254 gaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccat 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25356335 gaaggtgcacacatgcaccatgaagaggagccccatgaccat 25356376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 2 - 414
Target Start/End: Original strand, 24129 - 24541
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| |||    
T  24129 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcctaaaacctcgaatcccctttgtttatacactca 24228  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgca 201  Q
     ||| | |||||| | |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24229 agcttaatgtgcctattttgatattattacctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgca 24328  T
Q  202 catagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaa 301  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24329 catagagcagcataatgaagaagcagacggtgcacacttgcaccaagaagaggaagatgcacaattgcaccatgatgaggagcaccataaccatgatgaa 24428  T
Q  302 ggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaa 401  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24429 ggtgaaacaaatgaaaatacaagatgggaatggatgcatactgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggactaa 24528  T
Q  402 ggaatgatgtcca 414  Q
    |||||||||||||    
T  24529 ggaatgatgtcca 24541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 2 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 20439819 - 20439407
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||   |||    
T  20439819 caagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctctatgaatttcataaaacctcgaatcccctttgtttatatgctca 20439720  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgca 201  Q
     ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20439719 agcttaatgtgcccactttgatattattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgatgatgacccacaggtgca 20439620  T
Q  202 catagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaa 301  Q
     |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  20439619 tatagaacagcctaatgaagacgtggaaggtgcacacccgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcaccatgaccacaatgaa 20439520  T
Q  302 ggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  20439519 ggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgagaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaattggaataa 20439420  T
Q  402 ggaatgatgtcca 414  Q
    |||||||||||||    
T  20439419 ggaatgatgtcca 20439407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 2 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 25117801 - 25117389
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||    
T  25117801 caagagataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctctatgaatttcataaaacctcgaatcccctttgtttatacactca 25117702  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgca 201  Q
      ||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25117701 aactcaacgtgcccactttgatattactgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgca 25117602  T
Q  202 catagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaa 301  Q
      |||||||| | ||||||||   ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25117601 tgtagaacagaacaatgaagacatggaaggtgcacaattgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgcacaatgatgagaagcaccatgaccatgatgaa 25117502  T
Q  302 ggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25117501 ggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatattgaggtcgggaggataagcaccgagtaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggactaa 25117402  T
Q  402 ggaatgatgtcca 414  Q
    |||||||||||||    
T  25117401 ggaatgatgtcca 25117389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 2 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 25176892 - 25176480
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||    
T  25176892 caagagataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctctatgaatttcataaaacctcgaatcccctttgtttatacactca 25176793  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgca 201  Q
      ||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25176792 aactcaacgtgcccactttgatattactgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgca 25176693  T
Q  202 catagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaa 301  Q
      |||||||| | ||||||||   ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25176692 tgtagaacagaacaatgaagacatggaaggtgcacaattgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgcacaatgatgagaagcaccatgaccatgatgaa 25176593  T
Q  302 ggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25176592 ggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatattgaggtcgggaggataagcaccgagtaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggactaa 25176493  T
Q  402 ggaatgatgtcca 414  Q
    |||||||||||||    
T  25176492 ggaatgatgtcca 25176480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 24954830 - 24954446
Alignment:
Q  4 agggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtcacg 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||| ||       
T  24954830 agggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaatttcatcaaaacttgagtcccctttgtctatacactccaa 24954731  T
Q  104 ctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcaca 203  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24954730 ctcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgatgatgacccacaggtgcaca 24954631  T
Q  204 tagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaagg 303  Q
    ||||||||||||||||||||   || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  24954630 tagaacagcataatgaagaaatagagggtgcacacttgcatcaagaagaggaaggtgctcaactgcaccatgataaggaacaccatgaccctaatgaagg 24954531  T
Q  304 tgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 388  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24954530 tgaaacaaatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 24954446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 413
Target Start/End: Original strand, 26846226 - 26846637
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactt-tgtc-tatacagt 99  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||  |||||   |||| || ||| |    
T  26846226 caagggattaacaacattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagccccg--tccacccatgtcctacacact 26846323  T
Q  100 cacgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtg 199  Q
    ||  |||| |||||| | ||||||| || |  |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||| ||||     
T  26846324 caaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatcttggaataacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatcatccataggta 26846423  T
Q  200 cacatagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatg 299  Q
    ||   ||||||  || ||||||  | ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26846424 catgaagaacacgatgatgaaggtgaggaagatgaacatttgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatg 26846523  T
Q  300 aaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggatt 399  Q
      || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||      
T  26846524 ccggagaaaccaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcacaccgaggtcgagaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgtcgggacc 26846623  T
Q  400 aaggaatgatgtcc 413  Q
    ||||||||||||||    
T  26846624 aaggaatgatgtcc 26846637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 219 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 30761080 - 30760886
Alignment:
Q  219 aagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaa 318  Q
    |||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  30761080 aagaagagcaaggtgcacaattgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcaccatgaccataatgaagaagaaacaaatgaaaa 30760981  T
Q  319 tgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30760980 tgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgagaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggactaagaaatgatgtcc 30760886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 132 - 413
Target Start/End: Original strand, 18071600 - 18071881
Alignment:
Q  132 ctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcacatagaacagcataatgaagaagcggaagg 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||| ||   ||||||  |||||||||  | |||||     
T  18071600 ctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaacacgataatgaaggcgaggaaga 18071699  T
Q  232 tgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggca 331  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18071700 tgcacattagcaccaagaagaggaaggtgcacaattgtaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggataaacaaatgaaaatgcaagatgggca 18071799  T
Q  332 tggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    |||||| ||||||||| | | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||||| ||||||    
T  18071800 tggatgcataccgaggactagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaattatgtcc 18071881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 20792423 - 20792027
Alignment:
Q  17 attgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactt-tgtc-tatacagtcacgctcactgtgcc 114  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||  ||||||   |||| || ||| |||  |||| ||||||    
T  20792423 attgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagcccc--atccacccatgtcctacacactcaaactcattgtgcc 20792326  T
Q  115 cactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcacatagaacagcat 214  Q
     | ||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||  ||   ||||||  ||    
T  20792325 tattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggcacatgaagaacacgat 20792226  T
Q  215 aatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatg 314  Q
    |||||||    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||    
T  20792225 aatgaaggcaaggaagatgcacatttgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgtaccatgataaggagcaccatgaccatgatgccggataaacaaatg 20792126  T
Q  315 aaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||   |||| |||||||| ||||||    
T  20792125 aaaatgcaagatgggcatggatgcatacagaggccgagaggataagcaccaagaaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaattatgtcc 20792027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 20597495 - 20597084
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactt-tgtc-tatacagt 99  Q
    |||||||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||  ||||||   |||| ||  || |    
T  20597495 caagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagcccc--atccacccatgtcctacgcact 20597398  T
Q  100 cacgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtg 199  Q
    ||  |||| |||||| | ||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||     
T  20597397 caaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggta 20597298  T
Q  200 cacatagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatg 299  Q
    ||   ||||||  |||||||||  | ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20597297 catgaagaacacgataatgaaggcgaggaagatgcatatttgcaccaagaagaggaaggtggacaattgtaccatgataaggagcaccatgaccatgatg 20597198  T
Q  300 aaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggatt 399  Q
      ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||| |    
T  20597197 ccggataaacaaatgaaaatgcaagacgggcatggatgcctaacgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggact 20597098  T
Q  400 aaggaatgatgtcc 413  Q
    ||||||| ||||||    
T  20597097 aaggaattatgtcc 20597084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 20603792 - 20603381
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactt-tgtc-tatacagt 99  Q
    |||||||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||  ||||||   |||| ||  || |    
T  20603792 caagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagcccc--atccacccatgtcctacgcact 20603695  T
Q  100 cacgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtg 199  Q
    ||  |||| |||||| | ||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||     
T  20603694 caaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggta 20603595  T
Q  200 cacatagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatg 299  Q
    ||   ||||||  |||||||||  | ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20603594 catgaagaacacgataatgaaggcgaggaagatgcatatttgcaccaagaagaggaaggtggacaattgtaccatgataaggagcaccatgaccatgatg 20603495  T
Q  300 aaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggatt 399  Q
      ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||| |    
T  20603494 ccggataaacaaatgaaaatgcaagacgggcatggatgcctaacgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggact 20603395  T
Q  400 aaggaatgatgtcc 413  Q
    ||||||| ||||||    
T  20603394 aaggaattatgtcc 20603381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 132 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 20609981 - 20609700
Alignment:
Q  132 ctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcacatagaacagcataatgaagaagcggaagg 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||| ||   ||||||  |||||||||  | |||||     
T  20609981 ctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaacacgataatgaaggcgaggaaga 20609882  T
Q  232 tgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggca 331  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  20609881 tgcatatttgcaccaagaagaggaaggtggacaattgtaccatgataaggagcaccatgaccatgatgccggataaacaaatgaaaatgcaagacgggca 20609782  T
Q  332 tggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    ||||||  || ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||   |||| |||||||| ||||||    
T  20609781 tggatgcctaacgaggccgagaggataagcaccaagcaactaagacaaggtgttgaattgtcgggactaaggaattatgtcc 20609700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30764759 - 30764587
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||    
T  30764759 caagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatagctatgaatttcataaaacctcgaatcccctttgtttataca--ca 30764662  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgt 176  Q
      ||||  ||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30764661 aactcaacgtgcccattttgatattattgtctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagcgaatttgttgt 30764587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 251 - 391
Target Start/End: Original strand, 21387115 - 21387255
Alignment:
Q  251 gaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcg 350  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||     | ||||    |||||||| ||| |||||||||||| | || ||||| |    
T  21387115 gaggaaggtgcaaacttgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgacacttgagaaaactttgaaaatgaaaggtgggcatggatgcaaactgaggttg 21387214  T
Q  351 aaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21387215 aaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtattgaatta 21387255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 30761154 - 30761044
Alignment:
Q  172 gttgtatattaatgatgacccacaggtgcacatagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcac 271  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30761154 gttgtatgttcataatgacccacaggtgcacatagaagaaaataatgaagatgtggaaggtgcacacttgcaccaagaagagcaaggtgcacaattgcac 30761055  T
Q  272 catgatgagga 282  Q
    || || |||||    
T  30761054 caagaagagga 30761044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 15734408 - 15734482
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15734408 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 15734482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 20621037 - 20621111
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20621037 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 20621111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 23746925 - 23746999
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23746925 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 23746999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22318824 - 22318750
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22318824 aatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 22318750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 25008123 - 25008049
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| ||||||| |||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25008123 aatgaaagatggacatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 25008049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 388
Target Start/End: Original strand, 22947239 - 22947376
Alignment:
Q  251 gaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcg 350  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||    || | || |  |||||||| ||||||| |||||||| | || |||||      
T  22947239 gaggaaggtgcaaacttgcaccatgttgaggagcaccatgaccatgacaccggaggaaaatttgaaaatgaaagatggccatggatgcaaacggaggttt 22947338  T
Q  351 aaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 388  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22947339 agaggataagcaccaagcaacaaaggcaaggtgttgaa 22947376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23520789 - 23520627
Alignment:
Q  16 gattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactt-tgtc-tatacagtcacgctcactgtgc 113  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||  |||||   |||| |||||| ||| ||||| |||||    
T  23520789 gattgagggaaacaataggcttaacatagatacccttgtctctatgaacttcatcaaacctcg--tccacccatgtcctatacactcaagctcaatgtgc 23520692  T
Q  114 ccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    | | | | |||  | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23520691 ctattctaattgcacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 23520627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 178
Target Start/End: Original strand, 22947147 - 22947193
Alignment:
Q  132 ctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22947147 ctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 22947193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22318976 - 22318924
Alignment:
Q  126 tattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22318976 tatttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaggcaaatttgttgtat 22318924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 15734261 - 15734308
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15734261 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 15734308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 69
Target Start/End: Original strand, 22947017 - 22947084
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcat 69  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  22947017 caagggataaatcagattgagggcaacaataggcttaacatagagacccttatttctatgaacttcat 22947084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 23746778 - 23746825
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  23746778 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 23746825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25008270 - 25008223
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25008270 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 25008223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 20620890 - 20620937
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  20620890 cctaacccatctcggactaaccccaaggtggaggaaaatttgttgtat 20620937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 295
Target Start/End: Original strand, 15734357 - 15734398
Alignment:
Q  254 gaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccat 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15734357 gaaggtgcacacatgcaccatgaagaggagccccatgaccat 15734398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Original strand, 21386911 - 21386963
Alignment:
Q  17 attgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcat 69  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  21386911 attgagggcaacaatagacttaacattgaaaccctcatttctatgaacttcat 21386963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 71 - 414
Target Start/End: Original strand, 20392120 - 20392463
Alignment:
Q  71 aaaccccgaatccactttgtctatacagtcacgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatt 170  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20392120 aaacctcgaatcccctttgtttatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatt 20392219  T
Q  171 tgttgtatattaatgatgacccacaggtgcacatagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgca 270  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20392220 tgttgtatgttaatgatgacccacaggtgcacatagaacagcgtaatgaagaagcagaaggtgcccacttgcactaagaagaggaaggtgcacaaatgca 20392319  T
Q  271 ccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaa 370  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20392320 ccatgatgaggagcaccataaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcacgatgggcatggatgaatatcgaggtcgaaaggataagcaccgagcaa 20392419  T
Q  371 caaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcca 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20392420 caaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaacgatgtcca 20392463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 21800327 - 21799917
Alignment:
Q  4 agggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtcacg 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||| ||| ||||||||||||| ||       
T  21800327 agggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaatttcatcaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaa 21800228  T
Q  104 ctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcaca 203  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  21800227 ctcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgctgatgacccacaggtgcaca 21800128  T
Q  204 tagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaagg 303  Q
    |||| |||| |||||||||| | || | ||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||| | ||||||     
T  21800127 tagagcagcctaatgaagaaacagaggatgcacacttgcatcaggaagaggaaggtgcacaactgcaccatgatgaggcataccatgaccctaatgaaga 21800028  T
Q  304 tgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaagg 403  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||    
T  21800027 tgaaacaaatgaggatgcaagatgggcatggatgactaccgaggttgaaagaataaacaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatgagcataagg 21799928  T
Q  404 aatgatgtcca 414  Q
     ||||||||||    
T  21799927 catgatgtcca 21799917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 360
Target Start/End: Original strand, 19783592 - 19783935
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||    
T  19783592 caaggtataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctctatgaacttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactca 19783691  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgca 201  Q
      ||||  ||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19783692 aactcaacgtgcccattttgattttactttctaacctatctctgactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgca 19783791  T
Q  202 catagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaa 301  Q
      |||||||  |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |               ||||||||||| |||||      
T  19783792 tgtagaacacgataatgaagacgaggaaggtgcacacttgcaccaagaagaggaaggtgcacaatt---------------gcaccatgaccgtgatgcc 19783876  T
Q  302 ggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataag 360  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  19783877 ggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataag 19783935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 413
Target Start/End: Original strand, 3988668 - 3989058
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactt-tgtc-tatacagt 99  Q
    |||||||| | ||| |||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||  |||||   |||| || ||| |    
T  3988668 caagggattaccaaaattgagggaagcaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagccccg--tccacccatgtcctacacact 3988765  T
Q  100 cacgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtg 199  Q
    ||  |||| |||| | | ||||||| || |  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||||| ||| ||||     
T  3988766 caaactcaatgtgtctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccaaggtggaagaaaatatgttgtatgttgttgatgatccataggta 3988865  T
Q  200 cacatagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatg 299  Q
    ||   ||||||  |||||||||  | ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||                     |||||||    
T  3988866 catgaagaacacgataatgaaggcgaggaagatgcacatttgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgcac---------------------catgatg 3988944  T
Q  300 aaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggatt 399  Q
      ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||| |    
T  3988945 ccggataaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggact 3989044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 388
Target Start/End: Original strand, 8651829 - 8651970
Alignment:
Q  247 agaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgag 346  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||| | ||||  || | ||  ||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  8651829 agaagaggaaggtgcacacttgcaccattatgatgagcaccatgacgaggatgccggaggaaacaatgagaatgaaagatgggcatggatgcacaccgag 8651928  T
Q  347 gtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 388  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8651929 gttgaaatgataagcaccgagcaacaaaggcaatgtgttgaa 8651970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 8651611 - 8651787
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||   || | | | ||||||| |||    
T  8651611 caagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaacttcattaaacctcgtccccccatggcctatacactca 8651710  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
       ||| |||||| | ||| ||| || | ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8651711 aattcaatgtgcctattttaattatacttcctaacctatctcggactaacactgaggtggaagaaaatttgttgtat 8651787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 254 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 19877077 - 19876943
Alignment:
Q  254 gaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaa 353  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    || | ||    || ||||| |||||||||||||||| | || |||||| |||    
T  19877077 gaaggtgcaaacttgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgacaccggaggaaactttgcaaatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtccaaa 19876978  T
Q  354 ggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19876977 ggataagcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaa 19876943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20072546 - 20072367
Alignment:
Q  16 gattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactt-tgtc-tatacagtcacgctcactgtgc 113  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||  |||||   |||| |||||| ||| ||||| |||||    
T  20072546 gattgagggaaacaataggcttaacatagatacccttgtctctatgaacttcatcaaacctcg--tccacccatgtcctatacactcaagctcaatgtgc 20072449  T
Q  114 ccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccaca 195  Q
    | | | | |||  | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  20072448 ctattctaattgcacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaattttttgtatgttgatgatgacccaca 20072367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 391
Target Start/End: Original strand, 20236360 - 20236429
Alignment:
Q  322 aagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20236360 aagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 20236429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8949070 - 8948893
Alignment:
Q  2 caagggataaa-caagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||   |||| | |  |||||| |     
T  8949070 caagggataaaacaagattgagggaaacaataagcttaacatagagaccctcatctctatgaacttcattaaacctcgtccccacatggcatatacattt 8948971  T
Q  101 acgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    |  |||| ||||||   ||| ||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8948970 aaactcaatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggttgaagaaaatttgttgtat 8948893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20072341 - 20072205
Alignment:
Q  248 gaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgagg 347  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||  || | ||  ||| | |||| |||||||||||||||  | |  ||||    
T  20072341 gaagcggatggtgcacaaatgcaccaaaatgaggagcaccatgaccctgatgtcggaggaatcaataacaatgaaagatgggcatggatacacaatgagg 20072242  T
Q  348 tcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgt 384  Q
    | || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20072241 tagagaggataaacaccgagaaacaaaggcaaggtgt 20072205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19877172 - 19877106
Alignment:
Q  132 ctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggt 198  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||||    
T  19877172 ctaacctatctcggactaacaccgaggtggaagaaaacttgttgtatgttggtgatgatccacaggt 19877106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 2 - 413
Target Start/End: Original strand, 16530604 - 16531014
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||    
T  16530604 caagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctctatgaatttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactca 16530703  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgca 201  Q
      ||||  ||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16530704 aactcaacgtgcccattttgatattactgcctaacccatctcagactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgca 16530803  T
Q  202 catagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaa 301  Q
      |||||||| |||  ||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16530804 tgtagaacagaatag-gaagacgtggaaggtgcacaattgcaccaagaagaggaaggtgcacaattacaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaa 16530902  T
Q  302 ggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  16530903 ggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgagaggataagcaccgagcaagaaaggcaaggtattgaattgatgggactaa 16531002  T
Q  402 ggaatgatgtcc 413  Q
    ||||||||||||    
T  16531003 ggaatgatgtcc 16531014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 2 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16635058 - 16634648
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||    
T  16635058 caagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctctatgaatttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactca 16634959  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgca 201  Q
      ||||  ||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16634958 aactcaacgtgcccattttgatattactgcctaacccatctcagactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgca 16634859  T
Q  202 catagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaa 301  Q
      |||||||| |||  ||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16634858 tgtagaacagaatag-gaagacgtggaaggtgcacaattgcaccaagaagaggaaggtgcacaattacaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaa 16634760  T
Q  302 ggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  16634759 ggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgagaggataagcaccgagcaagaaaggcaaggtattgaattgatgggactaa 16634660  T
Q  402 ggaatgatgtcc 413  Q
    ||||||||||||    
T  16634659 ggaatgatgtcc 16634648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 4 - 391
Target Start/End: Original strand, 13672418 - 13672805
Alignment:
Q  4 agggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtcacg 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| ||       
T  13672418 agggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaatttcataaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaa 13672517  T
Q  104 ctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcaca 203  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13672518 ctcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgatgatgacccacaggtgcaca 13672617  T
Q  204 tagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaagg 303  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  13672618 tagaacagcataatgaagaaacagagggtgcacacttgcatcaagaagaggaaggtgctcaactgcaccatgatgaggaacaccatgaccctaatgaagg 13672717  T
Q  304 tgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13672718 tgaaacaaatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 13672805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 18594922 - 18594538
Alignment:
Q  4 agggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtcacg 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| ||       
T  18594922 agggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaatttcataaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaa 18594823  T
Q  104 ctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcaca 203  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18594822 ctcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgatgatgacccacaggtgcaca 18594723  T
Q  204 tagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaagg 303  Q
    | |||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  18594722 ttgaacagcataatgaagaaacagcgggtgcacacttgcatcaagaagaggaaggtgcacaactgcaccatgatgaggaccaccatgaccctaatgaagg 18594623  T
Q  304 tgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 388  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18594622 tgaaacaaatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcactgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 18594538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 388
Target Start/End: Original strand, 18616762 - 18617146
Alignment:
Q  4 agggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtcacg 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| ||       
T  18616762 agggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaatttcataaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaa 18616861  T
Q  104 ctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcaca 203  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18616862 ctcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgatgatgacccacaggtgcaca 18616961  T
Q  204 tagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaagg 303  Q
    | |||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  18616962 ttgaacagcataatgaagaaacagcgggtgcacacttgcatcaagaagaggaaggtgcacaactgcaccatgatgaggaccaccatgaccctaatgaagg 18617061  T
Q  304 tgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 388  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18617062 tgaaacaaatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcactgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 18617146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16761431 - 16761035
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||    
T  16761431 caagagataaacaagattaagggaaacaataggctaaacataaacacccttatctctatgaatttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactca 16761332  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgca 201  Q
      ||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16761331 aactcaacgtgcccattttgattttactgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgca 16761232  T
Q  202 catagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaa 301  Q
      |||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |               |||||||||||||||||||    
T  16761231 tgtagaacagaataatgaagacgtggaaggtgcacacttgcaccaagaggaggaaggtgcacaatt---------------gcaccatgaccatgatgaa 16761147  T
Q  302 ggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaa 401  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || || |||    
T  16761146 ggtgaaacaaacgtaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgagaggataagcacctagcaactaaggcaaggtgttgaattgttgtgactaa 16761047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16151158 - 16150747
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactt-tgtc-tatacagt 99  Q
    |||||||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||  ||||||   |||| ||  || |    
T  16151158 caagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagcccc--atccacccatgtcctacgcact 16151061  T
Q  100 cacgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtg 199  Q
    ||  |||  |||||| | ||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| || |||||     
T  16151060 caaactccatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccccaggta 16150961  T
Q  200 cacatagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatg 299  Q
    ||   ||||||  |||||||||  | ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16150960 catgaagaacacgataatgaaggcgaggaagatgcacatttgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgtaccatgatgaggagcaccatgaccatgatg 16150861  T
Q  300 aaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggatt 399  Q
      ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||| |    
T  16150860 ccggataaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggact 16150761  T
Q  400 aaggaatgatgtcc 413  Q
    ||||||| ||||||    
T  16150760 aaggaattatgtcc 16150747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 248 - 413
Target Start/End: Original strand, 824432 - 824597
Alignment:
Q  248 gaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggt-gaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgag 346  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||    ||  ||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| | || |||    
T  824432 gaagaggaaggtgcacacctgcaccaagaagaggatcaccatgaccatgaaaccggacgaaacaa-tgataatgaaagatggacatggatgcaaactgag 824530  T
Q  347 gtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  824531 gttgaaaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattatcgggactaaggaatgatgtcc 824597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 248 - 413
Target Start/End: Original strand, 15064566 - 15064731
Alignment:
Q  248 gaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgagg 347  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||    || | ||  ||||| |||  ||||||| |||||||| | |||||||    
T  15064566 gaagaggaaggtgcacacttgcaccaagaagaggatcaccatgaccatgaaaccggaggaaacaatgataataaaagatggacatggatgcaaaccgagg 15064665  T
Q  348 tcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  15064666 ttgaaaggataagcaccgagcaactacggcaaggtgttgaattatcgggactaaggaatgatgtcc 15064731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15921616 - 15921441
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||   | | | | ||||||| | |    
T  15921616 caagggataa-caagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctttgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacactta 15921518  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
      |||| ||||||   ||| ||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15921517 aactcaatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 15921441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 387
Target Start/End: Original strand, 20107080 - 20107220
Alignment:
Q  247 agaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgag 346  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||   || | ||  ||||| |||| |||||||||||||||| | |  |||    
T  20107080 agaagaggaaggtgtacacttgcaccatgctgaggagcaccatgaccatgataccggaggaaacaatgataatgaaagatgggcatggatgcacatagag 20107179  T
Q  347 gtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttga 387  Q
    || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20107180 gttgagaggataagcaccgtgcaacaaaggcaaggtgttga 20107220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 15064350 - 15064526
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||   | | | | ||||||| | |    
T  15064350 caagggattaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagaggcccttatctctttgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacactta 15064449  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
      | ||  ||||| | ||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15064450 aacccaacgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 15064526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 181
Target Start/End: Original strand, 824216 - 824395
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||| || ||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| |||   | | | | ||||||| | |    
T  824216 caagggattaacaagattgaggaaaacaataggcttaacatagaggcccttatctttatgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacactta 824315  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatatt 181  Q
      |||| ||||||   ||| ||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  824316 aactcaatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttttatatt 824395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 8716738 - 8716812
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8716738 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 8716812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 14549970 - 14550044
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14549970 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 14550044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 18286499 - 18286573
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286499 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 18286573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 178
Target Start/End: Original strand, 20106865 - 20107038
Alignment:
Q  5 gggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtcacgc 104  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||   || | |   ||||||| | |  |    
T  20106865 gggataaacaagattgaggaaaacaataggcttaacatagagactctcatctctatgaacttcattaaacctcgtccccccatgacctatacacttaaac 20106964  T
Q  105 tcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||| |||||||  ||| ||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20106965 tcaatgtgcccgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 20107038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 314 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 48803202 - 48803125
Alignment:
Q  314 gaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48803202 gaaaatggaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 48803125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 322 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 15918104 - 15918013
Alignment:
Q  322 aagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    ||||||| ||| |||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  15918104 aagatggacatcgatgcaaactgaggttgaaaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattatcgggactaaggaatgatgtcc 15918013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16466960 - 16466881
Alignment:
Q  312 atgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16466960 atgacaatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacagaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 16466881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 317 - 413
Target Start/End: Original strand, 13656807 - 13656903
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    |||| |||||||||||||||| | || |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||    
T  13656807 aatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaaggaatgatgtcc 13656903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 48803346 - 48803299
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48803346 cctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtat 48803299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 8716591 - 8716638
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8716591 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 8716638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 14549823 - 14549870
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  14549823 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 14549870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 18286352 - 18286399
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  18286352 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 18286399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16467100 - 16467055
Alignment:
Q  133 taacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16467100 taacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 16467055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 13656660 - 13656707
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  13656660 cctaacccatctcggactaacaccgaggtggaggcgaatttgttgtat 13656707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 295
Target Start/End: Original strand, 8716687 - 8716728
Alignment:
Q  254 gaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccat 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8716687 gaaggtgcacacatgcaccatgaagaggagccccatgaccat 8716728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 295
Target Start/End: Original strand, 14549919 - 14549960
Alignment:
Q  254 gaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccat 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14549919 gaaggtgcacacatgcaccatgaagaggagccccatgaccat 14549960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15921401 - 15921352
Alignment:
Q  248 gaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatga 297  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  15921401 gaagaggaaggtgcacacttgcaccaagaagaggatcaccatgaccatga 15921352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 48803460 - 48803408
Alignment:
Q  17 attgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcat 69  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  48803460 attgagggcaacaataggcttaacattgaaaccctcatttctatgaatttcat 48803408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 2 - 414
Target Start/End: Original strand, 29068 - 29465
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||    
T  29068 caagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaacctcgaatcccctttgtttatacgctca 29167  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgca 201  Q
     ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  29168 agctcaatgtgccaactttgatattattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgcc 29267  T
Q  202 catagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |               ||||||||||||| ||||     
T  29268 catagaacagcataatgaagacgtggaaggtgcacacccgcaccaagaagaggaaggtgcacaatt---------------gcaccatgaccataatgac 29352  T
Q  302 ggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaa 401  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29353 ggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgagaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataa 29452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 4 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 20017893 - 20017509
Alignment:
Q  4 agggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtcacg 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| ||       
T  20017893 agggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaatttcataaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaa 20017794  T
Q  104 ctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcaca 203  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20017793 ctcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgatgatgacccacaggtgcaca 20017694  T
Q  204 tagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaagg 303  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  20017693 tagaacagcataatgaagaaacagagggtgcacacttgcatcaagaagaggaaggtgctcaactgcaccatgatgaggaacaccatgaccctaatgaagg 20017594  T
Q  304 tgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 388  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20017593 tgaaacaaatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 20017509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 4 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22167208 - 22166824
Alignment:
Q  4 agggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtcacg 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| ||       
T  22167208 agggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaatttcataaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaa 22167109  T
Q  104 ctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcaca 203  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22167108 ctcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgatgatgacccacaggtgcaca 22167009  T
Q  204 tagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaagg 303  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  22167008 tagaacagcataatgaagaaacagagggtgcacacttgcatcaagaagaggaaggtgctcaactgcaccatgatgaggaacaccatgaccctaatgaagg 22166909  T
Q  304 tgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 388  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22166908 tgaaacaaatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 22166824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21562105 - 21561694
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||  || ||| |||||| |||||| |||    
T  21562105 caaggaataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacgcccttatttctatgaacttcataaaaccttgactcccctttgtttatacactca 21562006  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgca 201  Q
      ||||  ||||||| |||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  21562005 aactcaacgtgcccattttgattttacttcctaacccatttcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccaaatgtgca 21561906  T
Q  202 catagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaa 301  Q
      |||| ||  || ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||      
T  21561905 tgtagaccacgatgatgaagacgaggaaggtgcacacttgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcatcatgaccgtgatgcc 21561806  T
Q  302 ggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaa 401  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||    
T  21561805 ggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatcgaggtcgagaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaa 21561706  T
Q  402 ggaatgatgtcc 413  Q
    ||||||||||||    
T  21561705 ggaatgatgtcc 21561694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 4 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 22768783 - 22768373
Alignment:
Q  4 agggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtcacg 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| ||       
T  22768783 agggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaatttcataaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaa 22768684  T
Q  104 ctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcaca 203  Q
    || | ||||||||  || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  22768683 ctgaatgtgcccatcttaattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgaagatgacccacaggtgcaca 22768584  T
Q  204 tagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaagg 303  Q
    |||| ||||||||||||||| | || | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||     
T  22768583 tagagcagcataatgaagaaacagaggatgcacacttgcatcaagaagaggaaggtgcacaactgcaccatgatgaggaataccatgaccctaatgaaga 22768484  T
Q  304 tgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaagg 403  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||    
T  22768483 tgaaacaaatgaagatgcgagatgggaatggatgactaccgaggttgaaagaataaacaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatgagcataagg 22768384  T
Q  404 aatgatgtcca 414  Q
     ||||||||||    
T  22768383 catgatgtcca 22768373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 388
Target Start/End: Original strand, 20168794 - 20169178
Alignment:
Q  4 agggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtcacg 103  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| ||| || ||||||| || ||       
T  20168794 agggataaacaaaatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaatttcataaaaactcgagtcccctatgtctatgcactccaa 20168893  T
Q  104 ctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcaca 203  Q
    || | ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  20168894 ctaaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccacctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtacgttgctgatgacccacaggtgcaca 20168993  T
Q  204 tagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaagg 303  Q
    ||||||||| |||||||||| | || | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||      
T  20168994 tagaacagcctaatgaagaaacagaggatgcacacttgcatcaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggaataccatgaccctaatgaaaa 20169093  T
Q  304 tgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 388  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20169094 tgaaacaaatgaagatgcgagatgggcatggatgactaccgaggttgaaagaataaacaccaagcaacaaaggcaaggtgttgaa 20169178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 173 - 413
Target Start/End: Original strand, 11218339 - 11218579
Alignment:
Q  173 ttgtatattaatgatgacccacaggtgcacatagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcacc 272  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||   |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11218339 ttgtatgttaatgatgacccacaggtgcatgtagaacacaataatgaagacatggaaggtgcagaattgcaccaagaagaggaaggtgcacaactgcacc 11218438  T
Q  273 atgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaaca 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| || |||     
T  11218439 atgatgaggagcaccatgaccatgatgccggagaaacaaatgaaaatgtaatatgggcatggatgcatactgaggtcgagaggataagcacctagtaact 11218538  T
Q  373 aaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    || | |||||||||||||    ||| |||||||||||||||    
T  11218539 aatgtaaggtgttgaattgtctggactaaggaatgatgtcc 11218579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 391
Target Start/End: Original strand, 18447012 - 18447156
Alignment:
Q  247 agaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgat---gaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaatacc 343  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||    |||||  |||||| ||| |||| ||||||| |||||||  | |||    
T  18447012 agaagaggaaggtgcacacttgcaccaagaggaggagcaccatgaccatgaaaccgaagg--aaacaa-tgataatgaaagatggacatggatacaaacc 18447108  T
Q  344 gaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18447109 gaggttgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 18447156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 18446794 - 18446970
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||   | | | | ||||||| |||    
T  18446794 caagggatcaacaagattgaggtaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacactca 18446893  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
      |||| ||||||   ||| ||| || | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18446894 aactcaatgtgcctgttttcattatacttcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 18446970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24856584 - 24856510
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24856584 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 24856510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 18010575 - 18010622
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18010575 cctaacccatctcggactaacaccaaggtggaagaaaatttgttgtat 18010622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 391
Target Start/End: Original strand, 25966513 - 25966592
Alignment:
Q  312 atgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||| | || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25966513 atgataatgaaagatgagcatggatgcaaactgaagttgagaggataagcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaatta 25966592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 18010720 - 18010794
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | |  |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18010720 aatgaaagatgggcatggatgcaaaatgaggtacaaaggataagcaccgagcaacagaggcaaggtgtcgaatta 18010794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8725488 - 8725441
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8725488 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 8725441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24856731 - 24856684
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  24856731 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 24856684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 388
Target Start/End: Original strand, 29685447 - 29685509
Alignment:
Q  326 tgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 388  Q
    |||||||||||| | ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29685447 tgggcatggatgcaaaccgaagttcaaaggataatcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaa 29685509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8725398 - 8725351
Alignment:
Q  248 gaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccat 295  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8725398 gaagacgaaggtgcacacatgcaccatgaagaggagccccatgaccat 8725351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 326 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23519069 - 23519007
Alignment:
Q  326 tgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 388  Q
    |||||||||||| | ||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23519069 tgggcatggatgcaaaccgaagttcaaagaataagcaccgagtaacaaagacaaggtgttgaa 23519007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 11)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 4 - 388
Target Start/End: Original strand, 13821470 - 13821854
Alignment:
Q  4 agggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtcacg 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||| ||| ||||||||||||| ||       
T  13821470 agggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaatttcatcaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaa 13821569  T
Q  104 ctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcaca 203  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13821570 ctcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgatgatgacccacaggtgcaca 13821669  T
Q  204 tagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaagg 303  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  13821670 tagaacagcataatgaagaaacagagggtgcacacttgcatcaagaagaggaaggtgctcaactgcaccatgatgaggaacaccatgaccctaatgaagg 13821769  T
Q  304 tgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 388  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13821770 tgaaacaaatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 13821854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15261714 - 15261461
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| |||    
T  15261714 caagggataaacaagatcgagggtaacaataggctgaacatagaaaccgttatctctatgaatttcataaaaactcgaatcccctttgtttatacactca 15261615  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgca 201  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15261614 agctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgca 15261515  T
Q  202 catagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagagga 255  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  15261514 catagaacagcataatgaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgagga 15261461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 246 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 15261497 - 15261329
Alignment:
Q  246 aagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccga 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15261497 aagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccga 15261398  T
Q  346 ggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcca 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15261397 ggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggcataaggaatgatgtcca 15261329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 413
Target Start/End: Original strand, 3353178 - 3353587
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactt-tgtc-tatacagt 99  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||||   |||| || ||| |    
T  3353178 caagggattaacaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaacttcattaagccccg--tccacccatgtcctacacact 3353275  T
Q  100 cacgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtg 199  Q
    ||  |||| |||||| | ||||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||      
T  3353276 caaactcaatgtgcctattttgattgtacttcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggca 3353375  T
Q  200 cacatagaacagcataatgaagaagcggaagg----tgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccat 295  Q
    ||   ||||||  || ||||||  | ||||||    |||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |    
T  3353376 catgaagaacacgatgatgaaggcgaggaaggaaggtgcatatttgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcaccatga---t 3353472  T
Q  296 gatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgg 395  Q
    || ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  3353473 gacgaag---aaaccaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcacaccgaggtcgagaggataagtaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgtcgg 3353569  T
Q  396 gattaaggaatgatgtcc 413  Q
    || |||||||||||||||    
T  3353570 gactaaggaatgatgtcc 3353587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 75
Target Start/End: Original strand, 16680954 - 16681027
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaacc 75  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680954 caagggataaagaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctctatgaatttcataaaacc 16681027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 391
Target Start/End: Original strand, 15864309 - 15864453
Alignment:
Q  247 agaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgag 346  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  |  |||||||||  ||||||| |||||||  | |  |||    
T  15864309 agaagaggaaggtgcacatttgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgctggaggcaacaatgaaaataaaagatggacatggatacacaatgag 15864408  T
Q  347 gtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    || || ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  15864409 gttgagaggataagcactgagcaacaatgacaaggtgttgaatta 15864453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 201
Target Start/End: Original strand, 15864092 - 15864290
Alignment:
Q  3 aagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtcac 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |  |  |  | | ||  ||| ||| |||     
T  15864092 aagggataaacaaaattgagggtaacaataggcttaacatagagacccttatttctatgaacttcattaagcatcatacacccatttcctacacactcaa 15864191  T
Q  103 gctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgca 201  Q
     |||| ||||||   ||| ||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  15864192 actcaatgtgcctgttttaattgtacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaatttttttgtatgttattgatgatccacaggtgca 15864290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 22109834 - 22109908
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22109834 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 22109908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 15253219 - 15253294
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccg-aggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| ||||| |||||||||| | |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15253219 aatgaaagattggcatggatgcaaaccgcaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 15253294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 22109687 - 22109734
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22109687 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 22109734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 15253072 - 15253119
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15253072 cctaatccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 15253119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 26036 - 25655
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||    
T  26036 caagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagaaacccttatctctatgaacttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactca 25937  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgca 201  Q
      ||||  ||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||||||||||||||    
T  25936 aactcaacgtgcccattttgatcttactgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctgtat------gatgacccacaggtgca 25843  T
Q  202 catagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaa 301  Q
      |||||||  ||||||||||   |||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  25842 tgtagaacacaataatgaagacatggaaggtgcaaaattgcaccaagaagatgaaggtgcacaactgcaccatgatgaggagcaccatgaccgtgatgcc 25743  T
Q  302 ggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaat 389  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25742 ggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatactgaggtcgagaggataagcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaat 25655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 3696 - 3300
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||    
T  3696 caaggaataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctctatgaacttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactca 3597  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgca 201  Q
      ||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3596 aactcaacgtgcccattttgattttacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgca 3497  T
Q  202 catagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaa 301  Q
      |||||||  |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |               ||||||||||| |||||      
T  3496 tgtagaacacgataatgaagacgaggaaggtgcacacttgcaccaagaagaggaaggtgcacaatt---------------gcaccatgaccgtgatgcc 3412  T
Q  302 ggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaa 401  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  3411 ggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgacgggactaa 3312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 35)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 21825970 - 21826224
Alignment:
Q  1 tcaagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||    
T  21825970 tcaagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaacccgaatcccctttgtttatacactc 21826069  T
Q  101 acgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgc 200  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21826070 aagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgc 21826169  T
Q  201 acatagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagagga 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  21826170 acatagaacagcataatgaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgagga 21826224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 109 - 413
Target Start/End: Original strand, 19766163 - 19766467
Alignment:
Q  109 tgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcacatagaa 208  Q
    |||||| | |||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||| ||   ||||    
T  19766163 tgtgcctattttgattttactttctaacccatctcagactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaa 19766262  T
Q  209 cagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaa 308  Q
    ||  || |||||| || ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  19766263 cacgatgatgaaggagaggaagatgcacatttgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggagaaa 19766362  T
Q  309 caaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatga 408  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||    
T  19766363 ccaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcaaacagaggtcgagaagataagcaccgagcaaaaaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatga 19766462  T
Q  409 tgtcc 413  Q
    |||||    
T  19766463 tgtcc 19766467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 246 - 414
Target Start/End: Original strand, 21826188 - 21826356
Alignment:
Q  246 aagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccga 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21826188 aagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcacgatgggcatggatgaataccga 21826287  T
Q  346 ggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcca 414  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21826288 ggtcgaaaggataaccaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaacgatgtcca 21826356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 132 - 413
Target Start/End: Original strand, 29333300 - 29333580
Alignment:
Q  132 ctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcacat-agaacagcataatgaagaagcggaag 230  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||  |||| ||||||  || ||||||  | |||||    
T  29333300 ctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggt--acatgagaacacgatgatgaaggcgaggaag 29333397  T
Q  231 gtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggc 330  Q
     ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29333398 atgcacatttgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgcaccatgatgaagagcaccatgaccatgatgcaggagaaaccaatgaaaatgcaagatgggc 29333497  T
Q  331 atggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  29333498 atggatgcataccgaggtcgagaggataagcaccgagcaactaacgcaaagtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcc 29333580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21100451 - 21100057
Alignment:
Q  16 gattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactt-tgtc-tatacagtcacgctcactgtgc 113  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||  |||||   |||| |||||| ||| ||||| |||||    
T  21100451 gattgagggaaacaataggcttaacatagatacccttgtctctatgaacttcatcaaacctcg--tccacccatgtcctatacactcaagctcaatgtgc 21100354  T
Q  114 ccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcacatagaacagca 213  Q
    | | | | |||  | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||| ||||    
T  21100353 ctattctaattgcacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgatgatgacccacaggt--acat-gaagagca 21100257  T
Q  214 taatgaa---gaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaaca 310  Q
    |||| ||   |||||||| | ||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||  || | ||      
T  21100256 taatcaaggtgaagcggatgatgcacacttgcacc---atgaggaaggtgcacaaatgcaccaaaatgaggagcaccatgaccctgatgtcggaggaatc 21100160  T
Q  311 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatg 410  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||  | |  ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||   ||| |||| |||||||    
T  21100159 aataacaatgaaagatgggcatggatacacaatgaggtagagaggataaacaccgagcaacaaaggcaaggtgtcggattatccggactaagaaatgatg 21100060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 247 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 21942864 - 21942720
Alignment:
Q  247 agaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgag 346  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||    || | ||  ||||| |||| ||||||| |||||||| | ||||||    
T  21942864 agaagaggaaggtgcacacttgcaccaagaggaggagcaccatgaccatgaaaccggaggaaacaatgataatgaaagatggacatggatgcaaaccgag 21942765  T
Q  347 gtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21942764 gttgaaaggataagcaccgagtaacaaaggcaaggtgttgaatta 21942720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 248 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 11348357 - 11348192
Alignment:
Q  248 gaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgagg 347  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||    || | ||  ||||| |||| ||||||| |||||||| | |||||||    
T  11348357 gaagaggaaggtgcacacttgcaccaagaagaggatcaccatgaccatgaaaccggaggaaacaatgataatgaaagatggacatggatgcaaaccgagg 11348258  T
Q  348 tcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||    
T  11348257 ttgaaaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgtcaaattatcgggactaaggaatgatgtcc 11348192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21943078 - 21942906
Alignment:
Q  6 ggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtcacgct 105  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||   | | | | ||||||| | |  ||    
T  21943078 ggattaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagaggcccttatctctatgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacacttaaact 21942979  T
Q  106 cactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    || ||||||   ||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21942978 caatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaggaaaatttgttgtat 21942906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 247 - 364
Target Start/End: Original strand, 22830706 - 22830823
Alignment:
Q  247 agaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgag 346  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||  |||||||||| ||||||||||||||| || || |||    
T  22830706 agaagaggaaggtgcacacttgcaccatgatgaggagcaccatgactatgatgccggaggaatcaatgaaaatgaaagatgggcatggataaacactgag 22830805  T
Q  347 gtcgaaaggataagcacc 364  Q
    || || ||||||||||||    
T  22830806 gttgagaggataagcacc 22830823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11348569 - 11348397
Alignment:
Q  6 ggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtcacgct 105  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||   | | | | ||||||| | |  ||    
T  11348569 ggattaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagaggcccttatctctttgaaattcataaaacctcgaccacccatggcctatacacttaaact 11348470  T
Q  106 cactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    || ||||||   ||| ||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11348469 caatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 11348397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 22368546 - 22368722
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||  ||   | | | | ||||||| | |    
T  22368546 caagggattaacaagattgagggaaaaaataggcttaacatagaggcccttatctctatgaactttataaaaccttgaccacccatggcctatacactta 22368645  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
      |||| ||||||   ||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22368646 aactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 22368722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 248 - 391
Target Start/End: Original strand, 22368762 - 22368905
Alignment:
Q  248 gaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgagg 347  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||    |  | ||  ||||| |||| ||||||| |||||||| | |||||||    
T  22368762 gaagaggaaggtgcacacttgcaccaagaagaggatcaccatgaccatgaaaccgtaggaaacaatgataatgaaagatggacatggatgcaaaccgagg 22368861  T
Q  348 tcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22368862 ttgaaaggatatgcaccgagtaacaaaggcaaggtgttgaatta 22368905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 8313342 - 8313416
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8313342 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 8313416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8324191 - 8324117
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8324191 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 8324117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22100965 - 22100891
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22100965 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 22100891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 22289626 - 22289802
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |  ||    | | |   ||||||| |||    
T  22289626 caagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaacttcattaatcatcgtccacccatgacctatacactca 22289725  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
      |||| |||||| | ||| ||| || | |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22289726 aactcaatgtgcctattttaattatacttcctatctcatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 22289802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 283 - 391
Target Start/End: Original strand, 22289865 - 22289973
Alignment:
Q  283 gcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggt 382  Q
    |||||||||||||||||  || | ||  |||||||||| |||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22289865 gcaccatgaccatgatgccggaggaagcaatgaaaatgaaagatgggcatgaatgcaaactgaggttgagaggataagcaccgagcaacaaaggcaagat 22289964  T
Q  383 gttgaatta 391  Q
    |||||||||    
T  22289965 gttgaatta 22289973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 21380967 - 21381041
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21380967 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgtcgaatta 21381041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 317 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16419940 - 16419844
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    |||| |||||||||||||||| | || |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||    
T  16419940 aatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaaggaatgatgtcc 16419844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 22035146 - 22035079
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcat 69  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  22035146 caagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagaaacccttgttgctatgaatttcat 22035079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 22830488 - 22830664
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatcca-ctttgtc-tatacagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  |||| |  || | |||||| |    
T  22830488 caagggataaacaagattgagggaaacaataagcttaacatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcg--tccacccatgacatatacact 22830585  T
Q  100 cacgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||  |||| |||||  | ||| ||| || | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22830586 caaactcaatgtgcatattttaattatacttcctaacccatctcggactaataccgaggtggaagaaaatttgttgtat 22830664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 21954953 - 21955027
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21954953 aatgaaagatgggcatggatccaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaatta 21955027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22034870 - 22034796
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22034870 aatgaaagattggcatggatgcaaaccgaggtacaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 22034796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 22098097 - 22098171
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22098097 aatgaaagatgggcatggatgcaaatcgaggtacaaaggataagcactgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 22098171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 8313195 - 8313242
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8313195 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 8313242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8324338 - 8324291
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8324338 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 8324291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 17132526 - 17132573
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  17132526 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 17132573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 21954806 - 21954853
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  21954806 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 21954853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22101112 - 22101065
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22101112 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 22101065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Original strand, 21267939 - 21267991
Alignment:
Q  17 attgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcat 69  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21267939 attgagggcaacaataggcttaacattgaaacccttatttctatgaatttcat 21267991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 21380820 - 21380867
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  21380820 cctaacccttctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 21380867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22035017 - 22034970
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22035017 cctaacccatctcgtactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 22034970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 22097950 - 22097997
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  22097950 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggagaatttgttgtat 22097997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22034921 - 22034880
Alignment:
Q  254 gaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccat 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22034921 gaaggtgcacacatgcaccatgaagaggagccccatgaccat 22034880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 359 - 391
Target Start/End: Original strand, 22831958 - 22831990
Alignment:
Q  359 agcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22831958 agcaccgagcaacaaaggcaagatgttgaatta 22831990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 22648 - 22237
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtc-tatacagtc 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| || |||||  ||  |  |||| || ||| ||    
T  22648 caagggattaacaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacctttatctttatgaacttcattaagccccgt-tcgcccatgtcctacacactc 22550  T
Q  101 acgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgc 200  Q
    |  |||| |||||| | ||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||| |    
T  22549 aaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtac 22450  T
Q  201 acatagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatga 300  Q
    |   ||||||  |||||||||  | ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22449 atgaagaacacgataatgaaggcgaggaagatgcacatttgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgtaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgc 22350  T
Q  301 aggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggatta 400  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||| ||    
T  22349 cggataaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggacta 22250  T
Q  401 aggaatgatgtcc 413  Q
    |||||||||||||    
T  22249 aggaatgatgtcc 22237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 413
Target Start/End: Original strand, 21442 - 21852
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactt-tgtc-tatacagt 99  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||  ||||||   |||| || ||| |    
T  21442 caagggattaacaacattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagcccc--atccacccatgtcctacacact 21539  T
Q  100 cacgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtg 199  Q
    ||  |||| |||||| | ||||||| || |  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||| ||| ||||     
T  21540 caaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacactgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttaatgatccataggt- 21638  T
Q  200 cacat-agaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgat 298  Q
     |||| ||||||  || ||||||  | ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21639 -acatgagaacacgatgatgaaggcgaggaagatgcacatttgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcactatgaccatgat 21737  T
Q  299 gaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggat 398  Q
    |  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||     
T  21738 gccggagaaaccaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgagaggataagcaccgagcaacaaaggaaaggtgttgaattgtcgggac 21837  T
Q  399 taaggaatgatgtcc 413  Q
    |||||||||||||||    
T  21838 taaggaatgatgtcc 21852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 413
Target Start/End: Original strand, 12040 - 12451
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactt-tgtc-tatacagt 99  Q
    |||||||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||  ||||||   |||| ||  || |    
T  12040 caagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagcccc--atccacccatgtcctacgcact 12137  T
Q  100 cacgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtg 199  Q
    ||  |||| |||||| | ||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| || |||||     
T  12138 caaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccccaggta 12237  T
Q  200 cacatagaacagcataatgaagaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatg 299  Q
    ||   ||||||  |||||||||  | ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||     
T  12238 catgaagaacacgataatgaaggcgaggaagatgcacatttgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgtaccatgatgaggagcaccatgaccatgatt 12337  T
Q  300 aaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggatt 399  Q
      ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||   |||| |    
T  12338 ccggataaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaatgtgttgaattgtcgggact 12437  T
Q  400 aaggaatgatgtcc 413  Q
    ||||||| ||||||    
T  12438 aaggaattatgtcc 12451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19603 - 19410
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||    
T  19603 caagggataaacaagattgagggtaacaataggctaaacatagatacccttatctctatgaatttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactca 19504  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccaca 195  Q
      ||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19503 aactcaacgtgcccattttgattttacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgatgatgacccaca 19410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 254 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 19378 - 19219
Alignment:
Q  254 gaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaa 353  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  19378 gaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcatcattaccgtgatgccggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatgccgaggtcgaga 19279  T
Q  354 ggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||    
T  19278 ggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaagaaatgatgtcc 19219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 253308 - 253248
Alignment:
Q  118 tttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  253308 tttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 253248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 253197 - 253154
Alignment:
Q  345 aggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 388  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  253197 aggttgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 253154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 253436 - 253395
Alignment:
Q  4 agggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacataga 45  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  253436 agggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacataga 253395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 246 - 413
Target Start/End: Original strand, 90087 - 90254
Alignment:
Q  246 aagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccga 345  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  90087 aagaagaggaaggtgcacaattgcagcatgatgaggaacaccatgaccatgatgacagagacacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccga 90186  T
Q  346 ggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  90187 ggacgagaggataaacaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgacgggactaaggaatgatgtcc 90254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 132 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 19775 - 19513
Alignment:
Q  132 ctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcacatagaacagcataatgaagaagcggaagg 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||| ||   ||||||  || ||||||  | ||||||    
T  19775 ctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccataggtacatgaagaacacgatgatgaaggcgaggaagg 19676  T
Q  232 tgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggca 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||         
T  19675 tgcacacttgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggagaaaccaatgaaaatgcaagat----- 19581  T
Q  332 tggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
                  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  19580 --------------ggtcgagaggataagcaccgagcatcaaaggcaaggtgttgaattatcgggactaaggaatgatgtcc 19513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 132 - 413
Target Start/End: Original strand, 122069 - 122342
Alignment:
Q  132 ctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcacatagaacagcataatgaagaagcggaagg 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||| ||   ||||||  |||||||||  | |||||     
T  122069 ctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaacacgataatgaaggtgaggaaga 122168  T
Q  232 tgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggca 331  Q
    |||||        |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  122169 tgcac--------caagaagaggaaggtgtacaattgcaccaggatgaggagcaccatgaccatgataccagagaaacaaacgaaaatgcaagatgggca 122260  T
Q  332 tggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    |||||| ||||||||| |||  ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||   |||| |||||||| ||||||    
T  122261 tggatgcataccgaggccgaggggataagcaccaagcaactaaggtaaggtgttgaattgtcgggactaaggaataatgtcc 122342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 246 - 413
Target Start/End: Original strand, 942 - 1110
Alignment:
Q  246 aagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaa-gatgggcatggatgaataccg 344  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  942 aagaagaggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggagaaaccaataaaaatgcaaagatgggcatggatgcataccg 1041  T
Q  345 aggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  1042 aggtcgggaggataagcatcgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcc 1110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 255
Target Start/End: Original strand, 856 - 978
Alignment:
Q  132 ctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcacat-agaacagcataatgaagaagcggaag 230  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||  |||| ||||||  || ||||||||| |||||    
T  856 ctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggt--acatgagaacacgatgatgaagaagaggaag 953  T
Q  231 gtgcacacgtgcaccaagaagagga 255  Q
    |||||||  ||||||| || |||||    
T  954 gtgcacaattgcaccatgatgagga 978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 8623 - 8228
Alignment:
Q  16 gattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactt-tgtc-tatacagtcacgctcactgtgc 113  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||  |||||   |||| |||||| ||| ||||| |||||    
T  8623 gatttagggaaacaataggcttaacatagatacccttgtctctatgaacttcatcaaacctcg--tccacccatgtcctatacactcaagctcaatgtgc 8526  T
Q  114 ccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcacatagaacagca 213  Q
    | | | | |||  | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||| ||||    
T  8525 ctattctaattgcacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgatgatgacccacaggt--acat-gaagagca 8429  T
Q  214 taatgaa---gaagcggaaggtgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaaca 310  Q
    |||| ||   |||||||| | ||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||  || | ||      
T  8428 taatcaaggtgaagcggatgatgcacacttgcacc---atgaggaaggtgcacaaatgcaccaaaatgaggaacaccatgaccctgatgtcggaggaatc 8332  T
Q  311 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggat-aagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgat 409  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||  | |  ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||   ||| |||| ||||||    
T  8331 aataacaatgaaagatgggcatggatacacaatgaggtagagaggataaaacaccgagcaacaaaggcaaggtgtcggattatccggactaagaaatgat 8232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5215 - 5043
Alignment:
Q  6 ggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtcacgct 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| ||| | | |||||| |||||| |||  ||    
T  5215 ggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagaaactcttgtctctatgaacttcatcaaacctcgactaccctttgtttatacactcaaact 5116  T
Q  106 cactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||  ||||| | ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5115 caacgtgcctattttaattttacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagagaatttgttgtat 5043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4926 - 4857
Alignment:
Q  322 aagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4926 aagatggacatggatgcaaaccgaggttgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 4857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 132 - 296
Target Start/End: Original strand, 24047 - 24210
Alignment:
Q  132 ctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatattaatgatgacccacaggtgcacatagaacagcataatgaagaagcggaagg 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||| ||   ||||||  || ||||||  | |||||     
T  24047 ctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaacacgatgatgaaggcgaggaaga 24146  T
Q  232 tgcacacgtgcaccaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatg 296  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24147 tgcaca-ttgcaccaagaaggggaaggtgcacaattgcaccatgctgaggagcaccatgaccatg 24210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 44020 - 44196
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||   | | | |  |||||| | |    
T  44020 caagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaacttcataaaacctcgaccacccatggcatatacactaa 44119  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
       ||| ||||||   ||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44120 aaatcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 44196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 51409 - 51585
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||   | | | |  |||||| | |    
T  51409 caagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaacttcataaaacctcgaccacccatggcatatacactaa 51508  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
       ||| ||||||   ||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51509 aaatcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 51585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 247 - 391
Target Start/End: Original strand, 44238 - 44382
Alignment:
Q  247 agaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgag 346  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |  ||| ||||||||||||||||    || | ||  ||||| |||| || |||| |||||||  | ||||||    
T  44238 agaagaggaaggtgcacacttgcaccaagtggagaagcaccatgaccatgaaaccggaggaaacaatgataatgaaatatggacatggatataaaccgag 44337  T
Q  347 gtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44338 gttgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaagtgttgaatta 44382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 247 - 391
Target Start/End: Original strand, 51627 - 51771
Alignment:
Q  247 agaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgag 346  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |  ||| ||||||||||||||||    || | ||  ||||| |||| || |||| |||||||  | ||||||    
T  51627 agaagaggaaggtgcacacttgcaccaagtggagaagcaccatgaccatgaaaccggaggaaacaatgataatgaaatatggacatggatataaaccgag 51726  T
Q  347 gtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51727 gttgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaagtgttgaatta 51771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 247 - 413
Target Start/End: Original strand, 132431 - 132597
Alignment:
Q  247 agaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgat---gaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaatacc 343  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||||    |||||  |||||| ||| |||| ||||||| |||||||| | |||    
T  132431 agaaaaggaaggtgcacaattgcaccaagaaaaggatcaccatgaccatgaaaccgaagg--aaacaa-tgataatgaaagatggacatggatgcaaacc 132527  T
Q  344 gaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  132528 gaggttgaaaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattatcgggactaaggaatgatgtcc 132597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 132216 - 132392
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||| ||||| |||| ||||||||||| |||   | | | | ||||||| | |    
T  132216 caagggattaacaagattgagggtaacaataggcttaacatagaggcccttttctctttgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacactta 132315  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
      |||| |||||| | ||| ||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132316 aactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 132392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0402 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0402
Description:

Target: scaffold0402; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 247 - 413
Target Start/End: Original strand, 6690 - 6856
Alignment:
Q  247 agaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgag 346  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||    |||||||| ||||| |||||||||| | || |||    
T  6690 agaagaggaaggtgcacacttgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggaggaaactttgaaaatgaaagatcggcatggatgtaaactgag 6789  T
Q  347 gtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    ||  ||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | ||  |||| ||||||||||    
T  6790 gtacaaatgataagcaccgagcaataaaagcaagatgttgaattattcgggctaagaaatgatgtcc 6856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0402; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 6472 - 6648
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||  |||||||| ||||| || |  ||    | | |   ||||||| |||    
T  6472 caagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttaattctatgaacttcattaagcatcgtccacccatgacctatacactca 6571  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
      |||| |||| | |  || ||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6572 aactcaatgtggctatattaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 6648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 10733 - 10909
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||    | | |   ||||||| |||    
T  10733 caagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaacttcattaaacatcgtccacccatgacctatacactca 10832  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
      |||| |||||| | ||| ||| || | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10833 aactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaacgaggtggaagaaaatttgttgtat 10909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 18734 - 18910
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||    | | |   ||||||| |||    
T  18734 caagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaacttcattaaacatcgtccacccatgacctatacactca 18833  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
      |||| |||||| | ||| ||| || | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18834 aactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaacgaggtggaagaaaatttgttgtat 18910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 234665 - 234489
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||    | | |   ||||||| |||    
T  234665 caagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaacttcattaaacatcgtccacccatgacctatacactca 234566  T
Q  102 cgctcactgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
      |||| |||||| | ||| ||| || | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  234565 aactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaacgaggtggaagaaaatttgttgtat 234489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1400 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1400
Description:

Target: scaffold1400; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 101 - 6
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctataca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  101 caagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatagcaatgaatttcataaaacctcgaatcccctttgtttataca 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 314 - 413
Target Start/End: Original strand, 11400 - 11499
Alignment:
Q  314 gaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||    
T  11400 gaaaatgcaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaattattcgggctaagaaatgatgtcc 11499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 178
Target Start/End: Original strand, 11257 - 11303
Alignment:
Q  132 ctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11257 ctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagcgaatttgttgtat 11303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 299
Target Start/End: Original strand, 11349 - 11397
Alignment:
Q  251 gaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatg 299  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11349 gaggacggtgcacacttgcaccatgaagaggagcatcatgaccatgatg 11397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 314 - 391
Target Start/End: Original strand, 10288 - 10365
Alignment:
Q  314 gaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10288 gaaaatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 10365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 178
Target Start/End: Original strand, 10148 - 10191
Alignment:
Q  135 acccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10148 acccatctcggactaacactgaggtggaagcaaatttgttgtat 10191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 1870 - 2038
Alignment:
Q  8 ataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatccactttgtctatacagtcacgctca 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||  || | | |  |||||| |||  ||||    
T  1870 ataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttgtct--atgaacttcataaaacctcgaccccccatggcttatacactcaaactca 1967  T
Q  108 ctgtgcccactttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
     |||| |   ||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1968 atgtgactgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 2038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 391
Target Start/End: Original strand, 2079 - 2224
Alignment:
Q  246 aagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccga 345  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||  |||||||| |  | | ||  ||||| || | ||||||| |||||||| | |||||    
T  2079 aagaagcggaaggtgcacacttgcactatgagaaggagcaccaaaaccatgataacagaggaaataatgataaagaaagatggacatggatgcaaaccga 2178  T
Q  346 ggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2179 ggttgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaagatgttgaatta 2224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1571 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold1571
Description:

Target: scaffold1571; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 1496 - 1570
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1496 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 1570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1571; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 1349 - 1396
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  1349 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 1396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0577
Description:

Target: scaffold0577; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 4980 - 5054
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4980 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 5054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 4833 - 4880
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4833 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtat 4880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 295
Target Start/End: Original strand, 4929 - 4970
Alignment:
Q  254 gaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccat 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4929 gaaggtgcacacatgcaccatgaagaggagccccatgaccat 4970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 7905 - 7763
Alignment:
Q  246 aagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccga 345  Q
    |||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||   || | ||  || ||  ||| ||||||| |||||||| | |||||    
T  7905 aagaagcggaagatgcacacttgcaccatgaggaggagcaccatggccatgatatcggaggaaacaacgatcatgaaagatggacatggatgcaaaccga 7806  T
Q  346 ggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 388  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7805 ggttgaaaggataagcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaa 7763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8006 - 7946
Alignment:
Q  118 tttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8006 tttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagctggaagaaaatttgttgtat 7946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 12912 - 12986
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12912 aatgtaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaatta 12986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 12765 - 12812
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  12765 cctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaattagttgtat 12812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 295
Target Start/End: Original strand, 12855 - 12902
Alignment:
Q  248 gaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccat 295  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12855 gaagaagaaggtgcacacatgcaccatgaagaggagccccatgaccat 12902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 69
Target Start/End: Original strand, 1750 - 1817
Alignment:
Q  2 caagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcat 69  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1750 caagggataaacaaaattgagggtaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaacttcat 1817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 391
Target Start/End: Original strand, 3 - 72
Alignment:
Q  322 aagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||||||||||||||  | || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3 aagatgggcatggatacaaactgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 72  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1879 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold1879
Description:

Target: scaffold1879; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 403 - 356
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  403 cctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1879; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 262 - 188
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||||||||||||| | |  |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  262 aatgaaagatgggcatggatgcaaaatgaggtacaaaggattagcaccgagcaacagaggcaaggtgtcgaatta 188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 313 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 32921 - 32847
Alignment:
Q  313 tgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 388  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | || |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32921 tgaaaatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgagcaac-aaggcaaggtgttgaa 32847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33040 - 32993
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33040 cctaacccatctcgcactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtat 32993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1620 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold1620
Description:

Target: scaffold1620; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 335 - 271
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaagg 381  Q
    |||| |||||||||||||||| | || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  335 aatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaagg 271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1620; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 476 - 429
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  476 cctaacccatctcggactaacacggaggtggaagcaaatttgttgtat 429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1620; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 590 - 533
Alignment:
Q  17 attgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaac 74  Q
    |||||||| |||||||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  590 attgaggggaacaatatgctaaacattgaaaccctcatttctatgaatttcataaaac 533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Original strand, 21620 - 21680
Alignment:
Q  118 tttgattttattgcctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21620 tttgattatctttcctaacccatctcggaataacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 21680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 413
Target Start/End: Original strand, 21792 - 21888
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggattaaggaatgatgtcc 413  Q
    |||| |||||||||||||||| | || |||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||| |||||||    
T  21792 aatgaaagatgggcatggatgcaaacggaggttcagaggataagcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaaataaccgggctaaggaacgatgtcc 21888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 39080 - 39013
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgt 384  Q
    |||| |||||||||||||||| | || |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39080 aatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggattagcaccgagcaacaaaggcaaggtgt 39013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 39335 - 39278
Alignment:
Q  17 attgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaatttcataaaac 74  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  39335 attgagggaaacaatagactaaacattgaaaccctcatttctatgaatttcattaaac 39278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 39221 - 39174
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39221 cctaacccatcttggactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtat 39174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 4)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 115521 - 115594
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||| ||||||||| | |||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  115521 aatgaaagatgagcatggatgcaaaccgaggaacaaaggataagcaccgagcaac-aaggcaaggtgttgaatta 115594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 119825 - 119898
Alignment:
Q  317 aatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaatta 391  Q
    |||| |||||| ||||||||| | |||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  119825 aatgaaagatgagcatggatgcaaaccgaggaacaaaggataagcaccgagcaac-aaggcaaggtgttgaatta 119898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 115374 - 115421
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  115374 cctaacccatctcggattaacaccgaggtggaggcaaatttgttgtat 115421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 119678 - 119725
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  119678 cctaacccatctcggattaacaccgaggtggaggcaaatttgttgtat 119725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 54968 - 55015
Alignment:
Q  131 cctaacccaactcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 178  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54968 cctaacccatctcggattaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtat 55015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1184 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1184
Description:

Target: scaffold1184; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 424 - 387
Alignment:
Q  351 aaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  424 aaaggataagcaccgagcaacaaagacaaggtgctgaa 387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University