View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10233A_low_357 (Length: 216)

Name: NF10233A_low_357
Description: NF10233A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10233A_low_357
NF10233A_low_357
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (1-216)||(14079413-14079628)
chr8 (1-216)||(30825640-30825855)
chr8 (1-216)||(33424841-33425056)
chr8 (1-215)||(38961365-38961579)
chr8 (1-216)||(6478075-6478290)
chr8 (1-215)||(38991710-38991923)
chr8 (1-216)||(19247302-19247516)
chr8 (1-216)||(19320486-19320700)
chr8 (1-215)||(41628092-41628295)
chr8 (1-213)||(41907051-41907262)
chr8 (1-215)||(20663527-20663741)
chr8 (1-215)||(30548890-30549104)
chr8 (1-215)||(44213644-44213858)
chr8 (1-216)||(23626927-23627142)
chr8 (1-216)||(44383523-44383738)
chr8 (4-214)||(41155830-41156040)
chr8 (1-214)||(12759668-12759880)
chr8 (35-216)||(23967006-23967186)
chr8 (35-216)||(37029159-37029339)
chr8 (35-216)||(42061280-42061460)
chr8 (35-216)||(44939763-44939943)
chr8 (1-132)||(41976732-41976863)
chr8 (1-104)||(42811518-42811621)
chr8 (1-216)||(39203831-39204035)
chr8 (72-216)||(36602722-36602866)
chr8 (16-133)||(22343102-22343217)
chr8 (16-133)||(22354762-22354877)
chr8 (35-216)||(6301103-6301272)
chr8 (68-215)||(19396015-19396162)
chr8 (1-102)||(12250777-12250878)
chr8 (34-216)||(29433245-29433419)
chr8 (1-102)||(39444329-39444430)
chr8 (1-77)||(36598122-36598198)
chr8 (1-72)||(45294681-45294752)
chr8 (133-216)||(42811665-42811748)
chr8 (133-216)||(45294767-45294850)
chr8 (157-216)||(41976658-41976717)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (1-216)||(1073866-1074081)
chr6 (1-216)||(18599589-18599804)
chr6 (1-216)||(14888540-14888755)
chr6 (1-216)||(34855384-34855599)
chr6 (1-216)||(2520592-2520807)
chr6 (1-216)||(11935283-11935498)
chr6 (1-216)||(11946072-11946287)
chr6 (1-216)||(15275087-15275302)
chr6 (1-216)||(7222173-7222388)
chr6 (1-216)||(7219467-7219682)
chr6 (1-216)||(33322056-33322271)
chr6 (1-216)||(17938951-17939166)
chr6 (1-215)||(249342-249556)
chr6 (1-216)||(4423813-4424016)
chr6 (4-215)||(34320522-34320733)
chr6 (1-215)||(12580399-12580613)
chr6 (1-216)||(25532694-25532897)
chr6 (1-216)||(9979662-9979866)
chr6 (35-216)||(13457350-13457530)
chr6 (1-216)||(24445409-24445613)
chr6 (1-216)||(1220006-1220204)
chr6 (1-213)||(1931475-1931677)
chr6 (1-215)||(33978403-33978606)
chr6 (1-216)||(22374444-22374670)
chr6 (1-45)||(4424087-4424131)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (1-216)||(34687040-34687255)
chr1 (1-216)||(41830631-41830846)
chr1 (1-216)||(18813672-18813887)
chr1 (3-216)||(52522152-52522365)
chr1 (1-216)||(31619142-31619357)
chr1 (1-216)||(41963512-41963727)
chr1 (1-215)||(38845806-38846020)
chr1 (1-216)||(34691578-34691783)
chr1 (1-216)||(10694771-10694986)
chr1 (1-216)||(28566299-28566514)
chr1 (1-211)||(52309292-52309502)
chr1 (1-216)||(12713930-12714145)
chr1 (1-216)||(29841269-29841484)
chr1 (1-214)||(48339779-48339997)
chr1 (1-216)||(13662984-13663199)
chr1 (1-216)||(42681843-42682058)
chr1 (1-216)||(4891582-4891786)
chr1 (1-216)||(15314714-15314918)
chr1 (35-216)||(18111171-18111351)
chr1 (1-216)||(29186701-29186905)
chr1 (35-216)||(43255170-43255350)
chr1 (35-216)||(50395584-50395764)
chr1 (1-216)||(33361191-33361389)
chr1 (1-215)||(50560507-50560710)
chr1 (1-216)||(51966315-51966519)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-216)||(9373-9588)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (1-216)||(14308379-14308594)
chr7 (1-216)||(23767038-23767253)
chr7 (1-216)||(8926490-8926705)
chr7 (1-216)||(5962148-5962363)
chr7 (1-213)||(9226820-9227032)
chr7 (1-215)||(33639274-33639488)
chr7 (1-216)||(4481799-4482014)
chr7 (1-216)||(42917299-42917514)
chr7 (1-211)||(9148815-9149025)
chr7 (1-216)||(3794959-3795174)
chr7 (1-216)||(27735648-27735863)
chr7 (1-215)||(19034255-19034469)
chr7 (1-215)||(20720167-20720381)
chr7 (1-215)||(20764828-20765042)
chr7 (1-215)||(29490407-29490621)
chr7 (1-215)||(34282704-34282918)
chr7 (1-215)||(33230561-33230775)
chr7 (2-216)||(39649551-39649754)
chr7 (1-216)||(31898389-31898593)
chr7 (1-216)||(19520623-19520830)
chr7 (35-216)||(6911977-6912157)
chr7 (1-216)||(17170508-17170712)
chr7 (35-216)||(47573955-47574135)
chr7 (1-216)||(42245455-42245659)
chr7 (1-208)||(48528358-48528554)
chr7 (1-141)||(42687076-42687216)
chr7 (1-216)||(47173936-47174140)
chr7 (1-215)||(33030258-33030460)
chr7 (1-216)||(23300319-23300523)
chr7 (1-216)||(17477349-17477553)
chr7 (1-216)||(17575661-17575865)
chr7 (9-216)||(47164159-47164373)
chr7 (1-216)||(17481795-17482000)
chr7 (1-216)||(17571214-17571419)
chr7 (1-102)||(38435149-38435250)
chr7 (1-102)||(42996016-42996117)
chr7 (159-216)||(42687018-42687075)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (1-216)||(21097179-21097394)
chr2 (1-216)||(16724946-16725161)
chr2 (1-216)||(26821100-26821315)
chr2 (1-215)||(42884872-42885086)
chr2 (1-215)||(1515587-1515801)
chr2 (1-213)||(14752656-14752868)
chr2 (1-211)||(18093310-18093519)
chr2 (1-216)||(4811029-4811244)
chr2 (1-216)||(30567462-30567666)
chr2 (1-216)||(36633683-36633887)
chr2 (1-216)||(9917286-9917504)
chr2 (1-215)||(30571147-30571350)
chr2 (1-216)||(17036749-17036964)
chr2 (1-216)||(17091257-17091472)
chr2 (1-215)||(3710376-3710590)
chr2 (1-215)||(11866826-11867040)
chr2 (1-215)||(35358219-35358433)
chr2 (1-214)||(45205615-45205833)
chr2 (1-216)||(17025072-17025287)
chr2 (1-216)||(9544215-9544419)
chr2 (35-216)||(6343343-6343523)
chr2 (35-216)||(14323827-14324007)
chr2 (1-216)||(33664392-33664596)
chr2 (35-215)||(1993555-1993734)
chr2 (1-216)||(10048592-10048796)
chr2 (35-216)||(28501763-28501943)
chr2 (1-216)||(19168240-19168441)
chr2 (1-112)||(11447950-11448061)
chr2 (1-216)||(4291249-4291447)
chr2 (1-113)||(10822523-10822635)
chr2 (1-133)||(16883488-16883620)
chr2 (1-133)||(17041178-17041310)
chr2 (115-215)||(11447130-11447230)
chr2 (133-216)||(10822651-10822734)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (1-216)||(26955-27170)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (1-216)||(14830121-14830336)
chr4 (1-216)||(54332252-54332467)
chr4 (1-216)||(34057173-34057388)
chr4 (1-216)||(23478372-23478589)
chr4 (1-216)||(13627516-13627731)
chr4 (3-216)||(53341874-53342087)
chr4 (1-216)||(17739504-17739719)
chr4 (1-215)||(55999307-55999521)
chr4 (1-216)||(40621612-40621827)
chr4 (31-216)||(39745486-39745671)
chr4 (1-215)||(19832007-19832210)
chr4 (1-215)||(10259933-10260147)
chr4 (1-215)||(21564308-21564522)
chr4 (1-215)||(26924872-26925086)
chr4 (1-215)||(43331829-43332043)
chr4 (1-216)||(574756-574968)
chr4 (1-216)||(33503608-33503812)
chr4 (1-215)||(24078002-24078216)
chr4 (1-215)||(51451896-51452110)
chr4 (1-216)||(28135676-28135880)
chr4 (56-216)||(5274409-5274569)
chr4 (1-214)||(36856566-36856767)
chr4 (35-216)||(740923-741103)
chr4 (35-216)||(15520312-15520492)
chr4 (1-216)||(39715120-39715324)
chr4 (1-216)||(52800507-52800711)
chr4 (1-135)||(17698721-17698855)
chr4 (1-215)||(19590311-19590514)
chr4 (17-210)||(35496149-35496331)
chr4 (55-216)||(7644773-7644934)
chr4 (1-216)||(28120831-28121034)
chr4 (1-213)||(47720679-47720881)
chr4 (1-113)||(1944058-1944170)
chr4 (1-102)||(26870894-26870995)
chr4 (1-63)||(7644394-7644456)
chr4 (1-59)||(37702209-37702267)
chr4 (1-61)||(5272865-5272925)
chr4 (138-216)||(17698470-17698548)
chr4 (1-37)||(39743356-39743392)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (1-215)||(2194577-2194791)
chr5 (1-216)||(7285088-7285303)
chr5 (1-216)||(26321668-26321883)
chr5 (1-214)||(33611733-33611946)
chr5 (1-216)||(20996537-20996752)
chr5 (1-216)||(21029519-21029734)
chr5 (1-216)||(27065313-27065528)
chr5 (1-216)||(30688726-30688935)
chr5 (1-212)||(3151197-3151408)
chr5 (1-216)||(9701663-9701878)
chr5 (1-216)||(3397731-3397949)
chr5 (1-215)||(37463796-37464010)
chr5 (1-213)||(290022-290234)
chr5 (1-216)||(12588873-12589088)
chr5 (1-216)||(30141985-30142189)
chr5 (1-216)||(3210791-3211005)
chr5 (1-216)||(25697116-25697320)
chr5 (1-215)||(4881697-4881899)
chr5 (1-216)||(34717072-34717276)
chr5 (1-216)||(41690758-41690962)
chr5 (1-216)||(1852523-1852725)
chr5 (35-216)||(19394900-19395079)
chr5 (1-216)||(20349351-20349549)
chr5 (35-216)||(31296170-31296339)
chr5 (1-82)||(19447546-19447627)
chr5 (62-216)||(3027871-3028014)
chr5 (1-63)||(3028312-3028374)
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (1-216)||(11326237-11326452)
chr3 (1-216)||(31369612-31369827)
chr3 (1-216)||(35088433-35088645)
chr3 (1-216)||(49112519-49112734)
chr3 (1-215)||(48976130-48976344)
chr3 (1-216)||(23192906-23193121)
chr3 (3-216)||(11951572-11951785)
chr3 (1-213)||(35436429-35436641)
chr3 (1-216)||(52854037-52854252)
chr3 (1-216)||(6104721-6104925)
chr3 (1-216)||(11598559-11598774)
chr3 (1-216)||(40827630-40827845)
chr3 (1-216)||(51247817-51248021)
chr3 (1-216)||(22477152-22477367)
chr3 (1-216)||(55295374-55295589)
chr3 (1-213)||(36168046-36168258)
chr3 (1-216)||(16495338-16495553)
chr3 (1-216)||(21700165-21700369)
chr3 (1-216)||(8242150-8242359)
chr3 (35-216)||(5252872-5253052)
chr3 (1-216)||(52841129-52841333)
chr3 (1-216)||(50771842-50772046)
chr3 (1-215)||(44073316-44073525)
chr3 (1-216)||(50740808-50741012)
chr3 (1-216)||(19893964-19894168)
chr3 (1-215)||(918127-918330)
chr3 (1-216)||(11382618-11382828)
chr3 (1-119)||(48521617-48521736)
chr3 (35-216)||(39796971-39797140)
chr3 (1-107)||(2845452-2845558)
chr3 (32-216)||(9879550-9879723)
chr3 (1-84)||(54793560-54793643)
chr3 (116-216)||(54793665-54793764)
chr3 (133-216)||(28164813-28164896)
chr3 (157-212)||(54512407-54512462)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (1-215)||(119486-119700)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (1-216)||(152749-152964)
scaffold0006 (1-113)||(65230-65342)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (1-186)||(4684-4869)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (1-216)||(18981-19185)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (17-216)||(4866-5065)
scaffold0032 (17-216)||(11315-11514)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (68-214)||(10991-11137)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (53-215)||(13493-13655)
[»] scaffold1555 (1 HSPs)
scaffold1555 (72-199)||(1521-1648)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (1-102)||(898-999)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-102)||(54695-54796)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (59-216)||(13249-13395)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (1-78)||(1-78)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (32-214)||(49515-49687)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 14079413 - 14079628
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14079413 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 14079512  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  14079513 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaaca 14079612  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  14079613 ttgttgaaacaaatgg 14079628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30825855 - 30825640
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30825855 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcaaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 30825756  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  30825755 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcctcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaaca 30825656  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  30825655 ttgttgaaacaaatgg 30825640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 33424841 - 33425056
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33424841 aatattagtctaatgcatatttacacggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataacggattttaagctaaaga 33424940  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  33424941 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaaca 33425040  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  33425041 ttgttgaaacaaatgg 33425056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38961579 - 38961365
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38961579 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaata 38961480  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    |||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||| | | |||||||||    
T  38961479 aaatatagcatgacttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtagattatatgtaccccgttgatcaattaaca 38961380  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    |||||||||||||||    
T  38961379 ttgttgaaacaaatg 38961365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 6478075 - 6478290
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6478075 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaatgtagcataactgattttaagctaaaga 6478174  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | | ||||||| |    
T  6478175 aaatgtagcatgacttctaatttattttcctattatcttcccataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgatcaattaata 6478274  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||| ||||||||||    
T  6478275 ttgttaaaacaaatgg 6478290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38991923 - 38991710
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38991923 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaa-taaaggtagcataactgattttaagctaaata 38991825  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    |||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||| | | |||||||||    
T  38991824 aaatatagcatgacttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtagattatatgtaccccgttgatcaattaaca 38991725  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    |||||||||||||||    
T  38991724 ttgttgaaacaaatg 38991710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19247516 - 19247302
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19247516 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataattcataaa-taaaggtagcataactaattttaagctaaaga 19247418  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    |||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| | ||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  19247417 aaatgtattatgacttttaatttatcttcctgttatcttcctataaaggctagataaatgcatgcatgtgcattatatgaatcccgtttaccaattaaca 19247318  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  19247317 ttgttgaaacaaatgg 19247302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19320700 - 19320486
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19320700 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataattcataaa-taaaggtagcataactaattttaagctaaaga 19320602  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    |||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| | ||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  19320601 aaatgtattatgacttttaatttatcttcctgttatcttcctataaaggctagataaatgcatgcatgtgcattatatgaatcccgtttaccaattaaca 19320502  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  19320501 ttgttgaaacaaatgg 19320486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41628295 - 41628092
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41628295 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaata 41628196  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| || || ||||||||           |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  41628195 aaatgtagcaggacttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 41628107  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    |||||||||||||||    
T  41628106 ttgttgaaacaaatg 41628092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41907262 - 41907051
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41907262 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatacaaatataattacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagctaaaga 41907163  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |  |||||||| |||||| |  |||| |||||    
T  41907162 aaatgtatcatgacttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccccgttggccaa-taaca 41907064  T
Q  201 ttgttgaaacaaa 213  Q
    |||||||||||||    
T  41907063 ttgttgaaacaaa 41907051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 20663527 - 20663741
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20663527 aatattaatctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 20663626  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  20663627 aaatgtaccatgacttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaaca 20663726  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  20663727 tttttgaaacaaatg 20663741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 30548890 - 30549104
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30548890 aatattaatctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 30548989  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  30548990 aaatgtatcatgacttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaaca 30549089  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  30549090 tttttgaaacaaatg 30549104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 44213644 - 44213858
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44213644 aatattaatctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 44213743  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  44213744 aaatgtaccatgacttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaaca 44213843  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  44213844 tttttgaaacaaatg 44213858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 23626927 - 23627142
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  23626927 aatattagtctaatgcatattattatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcatgatagattttaagctaaaga 23627026  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |  |||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  23627027 aaatgtaccatgacttctaatttatcttcctactatcttcctataaattctagataaatgcatgcatgttgattatatgtaccccgttggccaattaaca 23627126  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  23627127 ttgttgaaacaaatgg 23627142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 44383523 - 44383738
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44383523 aatattagtctaatgcatatcaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagttaaaga 44383622  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||| || | || | |||  | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  44383623 acatgtatcatgacttctaatttatcttcttttttttttcttaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 44383722  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  44383723 ttgttgaaacaaatgg 44383738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41156040 - 41155830
Alignment:
Q  4 attagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41156040 attagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgtgaatatagttacatataatttataaaataaaggtaacataactgaatttaagctaaagaaaa 41155941  T
Q  104 tgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattg 203  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||  | ||||| ||| ||||    
T  41155940 tgtatcatgacttctaatttatcttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaacaccattgaccaaataaaattg 41155841  T
Q  204 ttgaaacaaat 214  Q
    |||||||||||    
T  41155840 ttgaaacaaat 41155830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12759880 - 12759668
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  12759880 aatattagtctaattcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttatatataatttataaaataaaggtagcataattgattttaagctaaaaa 12759781  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    || |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| | |||| | ||||||||| |    
T  12759780 aattgtatcatgacttctaatttatcttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatg-aacccgttaaccaattaaaa 12759682  T
Q  201 ttgttgaaacaaat 214  Q
    ||||||||||||||    
T  12759681 ttgttgaaacaaat 12759668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Original strand, 23967006 - 23967186
Alignment:
Q  35 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  23967006 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 23967104  T
Q  135 atcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23967105 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 23967186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37029339 - 37029159
Alignment:
Q  35 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  37029339 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 37029241  T
Q  135 atcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37029240 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 37029159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Original strand, 42061280 - 42061460
Alignment:
Q  35 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  42061280 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 42061378  T
Q  135 atcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  42061379 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 42061460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44939943 - 44939763
Alignment:
Q  35 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  44939943 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 44939845  T
Q  135 atcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  44939844 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 44939763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 41976863 - 41976732
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41976863 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 41976764  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatccta 132  Q
    |||||||  |||| |||||||||||| |||||    
T  41976763 aaatgtacaatgacttctaatttatcttccta 41976732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 42811518 - 42811621
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42811518 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 42811617  T
Q  101 aaat 104  Q
    ||||    
T  42811618 aaat 42811621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39204035 - 39203831
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  39204035 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacataaaatttataaaatgaatgtagcataattgattttaagctaaaga 39203936  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| || || ||||||||           |||||||| ||||||||||||| |||||||  || |  |||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  39203935 aaatgtaccacgacttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgcatgaatgtggattatatgtaccccgttcgccaattaaca 39203847  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  39203846 ttgttgaaacaaatgg 39203831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 216
Target Start/End: Original strand, 36602722 - 36602866
Alignment:
Q  72 aggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttac 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  36602722 aggtagcataactgattttaagctacagaaaatgtaacatgacttctaatttatcttcctattatcatcctataaagtctagataaatgcatgcatgtac 36602821  T
Q  172 attatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  36602822 attatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 36602866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Original strand, 22343102 - 22343217
Alignment:
Q  16 catatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22343102 catatttacatggataagatgtatgcgaata--gttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgact 22343199  T
Q  116 tctaatttatcatcctat 133  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  22343200 tctaatttatcttcctat 22343217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Original strand, 22354762 - 22354877
Alignment:
Q  16 catatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22354762 catatttacatggataagatgtatgcgaata--gttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgact 22354859  T
Q  116 tctaatttatcatcctat 133  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  22354860 tctaatttatcttcctat 22354877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Original strand, 6301103 - 6301272
Alignment:
Q  35 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||           ||    
T  6301103 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactga-tttaagctaaagaaaatgtatcatgacttctaat-----------tt 6301190  T
Q  135 atcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6301191 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 6301272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 215
Target Start/End: Original strand, 19396015 - 19396162
Alignment:
Q  68 ataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcat 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||| || |||    
T  19396015 ataaaggtagcttaactgattttaagctaaagaaaatgtagcatgacgtctaatttatcttccaattatcttcgtataaagtctagataaatgtatgcat 19396114  T
Q  168 ttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatg 215  Q
     ||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19396115 gtacattatatgtactccattgaccaattaacattgttgaaacaaatg 19396162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 12250777 - 12250878
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  12250777 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgggaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcatgacaaattttaagctaaaga 12250876  T
Q  101 aa 102  Q
    ||    
T  12250877 aa 12250878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29433419 - 29433245
Alignment:
Q  34 atgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctat 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||    
T  29433419 atgtatgcgaataaagttacatataatttataaaatgaaggtagcataacagattttaagctaaagaaaatgtaacatgacttct--------ttcctat 29433328  T
Q  134 tatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||| ||| |  |||| ||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29433327 tatcttcctataaagttaagataaatgcatgcatgtggattacatgtaccctgttggccaattaacattgttgaaacaaatgg 29433245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 39444430 - 39444329
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  39444430 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgggaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcatgacaaattttaagctaaaga 39444331  T
Q  101 aa 102  Q
    ||    
T  39444330 aa 39444329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 36598122 - 36598198
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtag 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36598122 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatataattacatataatttataaaataaaggtag 36598198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 45294681 - 45294752
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaa 72  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45294681 aatattagtctaatgcatattaacatggataaaatgtatgtgaatatagttacatataattcataaaataaa 45294752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 216
Target Start/End: Original strand, 42811665 - 42811748
Alignment:
Q  133 ttatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  42811665 ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacgttgttgaaacaaatgg 42811748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 216
Target Start/End: Original strand, 45294767 - 45294850
Alignment:
Q  133 ttatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| | ||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  45294767 ttatcttcctataaaggctagataaatgcatgcatgtgcattatatgaaccccattgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 45294850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41976717 - 41976658
Alignment:
Q  157 aatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  41976717 aatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacaatgttgaaacaaatgg 41976658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 1073866 - 1074081
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1073866 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 1073965  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1073966 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaaca 1074065  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  1074066 ttgttgaaacaaatgg 1074081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 18599589 - 18599804
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18599589 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 18599688  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18599689 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaaca 18599788  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  18599789 ttgttgaaacaaatgg 18599804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 14888540 - 14888755
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14888540 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 14888639  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  14888640 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaatgaaca 14888739  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  14888740 ttgttgaaacaaatgg 14888755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34855599 - 34855384
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34855599 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 34855500  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  34855499 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccctgttgaccaattaaca 34855400  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  34855399 ttgttgaaacaaatgg 34855384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2520807 - 2520592
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2520807 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtatcataactgattttaagctaaaga 2520708  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2520707 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatctacctataaagtctagataaatgcatgcaagtacattatatgcaccccgttgaccaattaaca 2520608  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  2520607 ttgttgaaacaaatgg 2520592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 11935283 - 11935498
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11935283 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaatgtagcataactgattttaagctaaaga 11935382  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  11935383 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttactataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 11935482  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  11935483 ttgttgaaacaaatgg 11935498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 11946072 - 11946287
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11946072 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaatgtagcataactgattttaagctaaaga 11946171  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  11946172 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttactataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 11946271  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  11946272 ttgttgaaacaaatgg 11946287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15275302 - 15275087
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15275302 aatattagtataatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagttaaaga 15275203  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  15275202 aaatgtagcatgacttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgaatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 15275103  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  15275102 ttgttgaaacaaatgg 15275087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7222388 - 7222173
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7222388 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatacagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagttaaaga 7222289  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||| | ||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  7222288 aaatgcagcatgacttctaatttctcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 7222189  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  7222188 ttgttgaaacaaatgg 7222173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 7219467 - 7219682
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7219467 aataatagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatctaatttataaaataaaggtagcataactgattttaagttaaaga 7219566  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||    
T  7219567 aaatgtaccatgacttctaatttatcttcctattatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgatcaattaaca 7219666  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  7219667 ttgttgaaacaaatgg 7219682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 33322056 - 33322271
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33322056 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcagatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 33322155  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  33322156 aaatgtatcatgacttctaatttatcttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 33322255  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  33322256 ttgttgaaacaaatgg 33322271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17939166 - 17938951
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17939166 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtattcgaatatagttacaaataatttattaaataaaggtaccataactgattttaagctaaaga 17939067  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    | ||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  17939066 acatgtagcataacttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattaaatgtaccccgttgaccaattaaca 17938967  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  17938966 ttgttgaaacaaatgg 17938951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 249556 - 249342
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  249556 aatattaatctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 249457  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  249456 aaatgtaccatgacttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaaca 249357  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  249356 tttttgaaacaaatg 249342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4424016 - 4423813
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424016 aatattagtctaatgc-tatttacatggataaaatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 4423918  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||           |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  4423917 aaatgtagcatgacttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttaaccaattaaca 4423829  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  4423828 ttgttgaaacaaatgg 4423813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 34320733 - 34320522
Alignment:
Q  4 attagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaa 103  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34320733 attagtctaatacatattaacatggatgagatttatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagataaagaaaa 34320634  T
Q  104 tgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattg 203  Q
    ||||  |||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| |  |||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  34320633 tgtattatgacttctaatatatgttcctattatcttcctataaaggctagataaatgcatgcatgtgaattatatgaaccccgttgaccaattaacattg 34320534  T
Q  204 ttgaaacaaatg 215  Q
    ||||||||||||    
T  34320533 ttgaaacaaatg 34320522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 12580399 - 12580613
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12580399 aatattaatctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 12580498  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  12580499 aaatgtaccatgacttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccattgaccaattaaca 12580598  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  12580599 tttttgaaacaaatg 12580613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25532897 - 25532694
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25532897 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgtgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 25532798  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||            |||  |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  25532797 aaatgtatcatgacttctaatttatcttccta------------aaatgctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 25532710  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  25532709 ttgttgaaacaaatgg 25532694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 9979662 - 9979866
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9979662 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 9979761  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| || ||||           ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  9979762 aaatgtatcatgacttttaat-----------ttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 9979850  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  9979851 ttgttgaaacagatgg 9979866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Original strand, 13457350 - 13457530
Alignment:
Q  35 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  13457350 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 13457448  T
Q  135 atcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13457449 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 13457530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24445613 - 24445409
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24445613 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 24445514  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| || ||||           ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  24445513 aaatgtatcatgacttttaat-----------ttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 24445425  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  24445424 ttgttgaaacagatgg 24445409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1220204 - 1220006
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1220204 aatattagtctaatgcatattaacatggataa------tgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 1220111  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||           |||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  1220110 aaatgtatcatgacttctaatt-----------tatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 1220022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1931677 - 1931475
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||    
T  1931677 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgtgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagca----------taagctaaaga 1931588  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |  |||||||| |||||| |  | ||||||||    
T  1931587 aaatgtatcatgacttctaatttatcttcctattagcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccccgttggctaattaaca 1931488  T
Q  201 ttgttgaaacaaa 213  Q
    |||||||| ||||    
T  1931487 ttgttgaagcaaa 1931475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33978606 - 33978403
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  33978606 aatattagtatgatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaata 33978507  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||           |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  33978506 aaatgtaccatgacttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccattgaccaattaaca 33978418  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  33978417 ttattgaaacaaatg 33978403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 22374444 - 22374670
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatt-----tataaaataa-----aggtagcataactg---at 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |     ||||||||||     || || ||||  ||   ||    
T  22374444 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatatatgcgaatatagttacatatatatgtaactataaaataatttatagtta-catatatgcgaat 22374542  T
Q  88 tttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgc 187  Q
     |||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||  |||||     
T  22374543 attagtctaaagaaaatgtagcatgacttctaatttatcttcttattatcttctta-aaagtctagataaatgcatgcatgtatattatatgttccccgt 22374641  T
Q  188 ttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22374642 tgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 22374670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 4424131 - 4424087
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaat 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4424131 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgtgaat 4424087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34687255 - 34687040
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34687255 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 34687156  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  34687155 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaaca 34687056  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  34687055 ttgttgaaacaaatgg 34687040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 41830631 - 41830846
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41830631 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 41830730  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  41830731 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaaca 41830830  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  41830831 ttgttgaaacaaatgg 41830846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18813887 - 18813672
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813887 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 18813788  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  18813787 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 18813688  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  18813687 ttgttgaaacaaatgg 18813672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 52522152 - 52522365
Alignment:
Q  3 tattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52522152 tattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataattgattttaagctaaagaaa 52522251  T
Q  103 atgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacatt 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||    
T  52522252 atgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaactaacatt 52522351  T
Q  203 gttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||    
T  52522352 gttgaaacaaatgg 52522365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31619357 - 31619142
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31619357 aatattagtttaatgcatatttacatagataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 31619258  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31619257 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtgcattatatgcaccccgttgaccaattaaca 31619158  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  31619157 ttgttgaaacaaatgg 31619142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 41963512 - 41963727
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41963512 aatattagtataatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcgtaactgattttaagctaaaga 41963611  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  41963612 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctcttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccattgaccaattaaca 41963711  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  41963712 ttgttgaaacaaatgg 41963727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 38845806 - 38846020
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38845806 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatttgaatatatttacatataatttataaaataaaggtagcatgactgattttaagctaaaga 38845905  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  38845906 aaatgtagcatgacttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaacgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 38846005  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    |||||||||||||||    
T  38846006 ttgttgaaacaaatg 38846020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34691783 - 34691578
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34691783 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagtt----------tataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 34691694  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  34691693 aaatgtaacacgacttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcgtgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 34691594  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  34691593 ttgttgaaacaaatgg 34691578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 10694771 - 10694986
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  10694771 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaatgtagcataacttactttaagctaaaga 10694870  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| || | |||||||||||    
T  10694871 aaatgtatcatgacctctaattgatcttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaacctcgttgaccaattaaca 10694970  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  10694971 ttgttgaaacaaatgg 10694986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 28566299 - 28566514
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28566299 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgtgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagttaaaga 28566398  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||  |||||| ||| |  |||||||| |||| | |  ||||||||||    
T  28566399 aaatgtaccatgacttctaatttatcttcctattatattcctataaagtctagatatatgcatgcatgtggattatatgtaccctgttggccaattaaca 28566498  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  28566499 ttgttgaaacaaatgg 28566514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 52309502 - 52309292
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52309502 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacatatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcatgactgattttaagctaaaga 52309403  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||  |  ||| |||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  52309402 aaatgtatcatgacttctaatttatcttcctattatcttcttaagaaggctaggtaaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 52309303  T
Q  201 ttgttgaaaca 211  Q
    |||||||||||    
T  52309302 ttgttgaaaca 52309292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12714145 - 12713930
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  12714145 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgtgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtatcataactgattttaagttaaaaa 12714046  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||  | |  ||||||||||    
T  12714045 aaatgtaccatgacttctaatttatctttctattatattcctataaagtctagattaatgcatgcatgtggattatatgcaccttgttggccaattaaca 12713946  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  12713945 ttgttgaaacaaatgg 12713930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 29841269 - 29841484
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29841269 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagataaaga 29841368  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    |||||||  |||| ||| |||||||  |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | ||||| ||| |    
T  29841369 aaatgtattatgacttcaaatttattttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaactaata 29841468  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    | ||||||||||||||    
T  29841469 tcgttgaaacaaatgg 29841484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48339997 - 48339779
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataattta-----taaaataaaggtagcataactgattttaagct 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  48339997 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttaatttataaaataaaggtatcataactgattttaagtt 48339898  T
Q  96 aaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaat 195  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| || | ||||||    
T  48339897 aaagaaaatgcaccatgatttctaatttatcttcctattatcttaatataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtacctcgttgaccaat 48339798  T
Q  196 taacattgttgaaacaaat 214  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  48339797 taacatttttgaaacaaat 48339779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 13662984 - 13663199
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13662984 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgttaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagttaaaga 13663083  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |  |||||||| ||| || |  ||||||||||    
T  13663084 aaatgtaccatgacttctaatgtatcgtcctattatattcctataaaatctagataaatgcatgcatgtggattatatgtacctcgttggccaattaaca 13663183  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  13663184 ttgttgaaacaaatgg 13663199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42682058 - 42681843
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42682058 aatattagtctaatggatattaacatggataaaatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 42681959  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    |||||||  |||| ||| |||||||  |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| | |||| | ||||| ||| |    
T  42681958 aaatgtattatgacttcaaatttattttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaatcccgttgaccaactaata 42681859  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    || |||||||||||||    
T  42681858 ttattgaaacaaatgg 42681843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4891786 - 4891582
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4891786 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 4891687  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| || ||||           ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  4891686 aaatgtatcatgacttttaat-----------ttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 4891598  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  4891597 ttgttgaaacagatgg 4891582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15314918 - 15314714
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15314918 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgcaaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagctaaaga 15314819  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||           |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |  |||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  15314818 aaatgtaccatgacttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccccgttggccaattaaca 15314730  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  15314729 ttgttgaaacaaatgg 15314714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18111351 - 18111171
Alignment:
Q  35 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  18111351 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 18111253  T
Q  135 atcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18111252 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 18111171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 29186701 - 29186905
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29186701 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 29186800  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| || ||||           ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  29186801 aaatgtatcatgacttttaat-----------ttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 29186889  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  29186890 ttgttgaaacagatgg 29186905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Original strand, 43255170 - 43255350
Alignment:
Q  35 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  43255170 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 43255268  T
Q  135 atcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  43255269 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 43255350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Original strand, 50395584 - 50395764
Alignment:
Q  35 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  50395584 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 50395682  T
Q  135 atcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  50395683 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 50395764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33361389 - 33361191
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33361389 aatattagtctaatgcatattaacatggataa------tgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 33361296  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||           |||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  33361295 aaatgtatcatgacttctaatt-----------tatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 33361207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50560710 - 50560507
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  50560710 aatattagtctagtgcatattaacatggataagacgtatgtgaatatagttacatataatttataaaataaagatagcataactgattttaagctaaata 50560611  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||           |||||||| | |||| |||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  50560610 aaatgtatcatgacttctaatt-----------tatcttcctaaaaaggctagataaattcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 50560522  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    |||||||||||||||    
T  50560521 ttgttgaaacaaatg 50560507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 51966315 - 51966519
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51966315 aatattagtttaatacatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaatataggtagcataattgattttaagctaaaga 51966414  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||           ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||| | |||||||||||    
T  51966415 aaatgtatcatgacttctaat-----------ttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaactccgttgaccaattaaca 51966503  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  51966504 ttgttgatacaaatgg 51966519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 184; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9588 - 9373
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9588 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 9489  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9488 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaaca 9389  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  9388 ttgttgaaacaaatgg 9373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 184; Significance: 1e-100; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14308594 - 14308379
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14308594 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 14308495  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  14308494 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaacccgttgaccaattaaca 14308395  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  14308394 ttgttgaaacaaatgg 14308379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 23767038 - 23767253
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23767038 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcatgactgattttaagctaaaga 23767137  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  23767138 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaaca 23767237  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  23767238 ttgttgaaacaaatgg 23767253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 8926490 - 8926705
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8926490 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgtgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 8926589  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  8926590 aaatgtaacatgacttttaatttatcatcctattatcttcctgtaaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaaca 8926689  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  8926690 ttgttgaaacaaatgg 8926705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5962363 - 5962148
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5962363 aatattagtctaatgcatatttacatggataaaatgtatgcgaatataattacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 5962264  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  5962263 aaatgtagcatgacttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 5962164  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||  | ||||||||||    
T  5962163 ttaataaaacaaatgg 5962148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 9226820 - 9227032
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9226820 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgtgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagctaaaga 9226919  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |  |||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  9226920 aaatgtaccatgacttctaatttatcttcctattagcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccccgttggccaattaaca 9227019  T
Q  201 ttgttgaaacaaa 213  Q
    |||||||||||||    
T  9227020 ttgttgaaacaaa 9227032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 33639274 - 33639488
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33639274 aatattagtctattacatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 33639373  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||| |||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  33639374 aaatgtatcatgaattctaatttatcttcatattattttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 33639473  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    |||||||||||||||    
T  33639474 ttgttgaaacaaatg 33639488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 4481799 - 4482014
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  4481799 aatattagtttaatgcatattaacatagataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataattgattttaaactaaaga 4481898  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || |  |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  4481899 aaatgtatcatgacttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgtatatggattatatgtaccccgttgaccaattaaca 4481998  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  4481999 ttgttgaaacaaatgg 4482014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42917514 - 42917299
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42917514 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataattcataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 42917415  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    |||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||  || |||  ||||| ||||||| ||| | ||||||||| ||  || | |||||||||||    
T  42917414 aaatgtattatgacttctaatttatcttcctattatcttcatatgaaggttagataaatgcatgcatgtgcattatatgaacttcgttaaccaattaaca 42917315  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  42917314 ttgttgaaacaaatgg 42917299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9149025 - 9148815
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9149025 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacatatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagaataactgattttaagctaaaga 9148926  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| | ||||  ||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  9148925 aaatgtatcatgacttctaatttatctttctattatcttcctaaaaagggtagataaatacattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 9148826  T
Q  201 ttgttgaaaca 211  Q
    |||||||||||    
T  9148825 ttgttgaaaca 9148815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3795174 - 3794959
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3795174 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagataaaga 3795075  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    |||||||  |||| ||| |||||||  |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | ||||| ||| |    
T  3795074 aaatgtattatgacttcaaatttattttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaactaata 3794975  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    | ||||||||||||||    
T  3794974 tcgttgaaacaaatgg 3794959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 27735648 - 27735863
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27735648 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgtgaatatagttacatataatttataaaagaaaggtagcataactgattttaagttaaaga 27735747  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||| | || ||||||||    
T  27735748 aaatgtatcatgacttctaatttatcttcctattatcttcctgaaaaggctagaaaaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgacaaattaaca 27735847  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  27735848 ttgttgaaacagatgg 27735863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 19034255 - 19034469
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19034255 aatattaatctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 19034354  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  19034355 aaatgtaccatgacttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaaca 19034454  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  19034455 tttttgaaacaaatg 19034469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20720381 - 20720167
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20720381 aatattaatctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 20720282  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  20720281 aaatgtaccatgacttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaaca 20720182  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  20720181 tttttgaaacaaatg 20720167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20765042 - 20764828
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20765042 aatattaatctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 20764943  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  20764942 aaatgtaccatgacttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaaca 20764843  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  20764842 tttttgaaacaaatg 20764828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 29490621 - 29490407
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29490621 aatattaatctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 29490522  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  29490521 aaatgtaccatgacttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaaca 29490422  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  29490421 tttttgaaacaaatg 29490407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 34282704 - 34282918
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34282704 aatattaatctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 34282803  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  34282804 aaatgtatcatgacttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaaca 34282903  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  34282904 tttttgaaacaaatg 34282918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 33230561 - 33230775
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33230561 aatattaatctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 33230660  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  33230661 aaatgtaccatgacttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtacccctttgaccaattaaca 33230760  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  33230761 tttttgaaacaaatg 33230775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 39649551 - 39649754
Alignment:
Q  2 atattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39649551 atattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaa 39649650  T
Q  102 aatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacat 201  Q
    |||||| ||||| |||||||           ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  39649651 aatgtatcatgacttctaat-----------ttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacat 39649739  T
Q  202 tgttgaaacaaatgg 216  Q
    |||||||||||||||    
T  39649740 tgttgaaacaaatgg 39649754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 31898389 - 31898593
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31898389 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 31898488  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||           ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  31898489 aaatgtatcatgacttctaat-----------ttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 31898577  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  31898578 ttgttgaaacagatgg 31898593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19520830 - 19520623
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19520830 aatattagtctaatgcatatttacattgataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 19520731  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttac---attatatgcaccccgcttaccaatta 197  Q
    ||||||| ||||||||||| |           ||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| | |   |||||||| |||||| | ||||||||    
T  19520730 aaatgtagcatgatttctagt-----------ttatcttcctataaagtctagataaattcatgcatgtgcatgattatatgtaccccgttgaccaatta 19520642  T
Q  198 acattgttgaaacaaatgg 216  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19520641 acattgttgaaacaaatgg 19520623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Original strand, 6911977 - 6912157
Alignment:
Q  35 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  6911977 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 6912075  T
Q  135 atcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6912076 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 6912157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17170712 - 17170508
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17170712 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 17170613  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| || ||||           ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  17170612 aaatgtatcatgacttttaat-----------ttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 17170524  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  17170523 ttgttgaaacagatgg 17170508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Original strand, 47573955 - 47574135
Alignment:
Q  35 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  47573955 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 47574053  T
Q  135 atcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  47574054 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 47574135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 42245455 - 42245659
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245455 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagctaaaga 42245554  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    || |||| ||||| |||||||           ||||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||| |  |||||||| |||||| || ||||||||||    
T  42245555 aactgtaccatgacttctaat-----------ttatcttcctataaagtttggataaatgcatgcatgtggattatatgtaccccgtttgccaattaaca 42245643  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  42245644 ttgttgaaacaaatgg 42245659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 48528358 - 48528554
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48528358 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 48528457  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||           ||||||||  | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  48528458 aaatgtatcatgacttctaat-----------ttatcttcgtaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 48528546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 42687216 - 42687076
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42687216 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagatacatgtaatttataaaataaaggtagcataactaattttaagctaaaga 42687117  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttcc 141  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  42687116 aaatgtagcatgacctctaatttatcttcctattatcttcc 42687076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 47174140 - 47173936
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47174140 aatattagtttaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatataattatatataatttataaagtaaaggtagcataaccgattttaagctaaaga 47174041  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||           |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||| ||| || | |||||||||||    
T  47174040 aaatgtaccatgacttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgcacgcatgtgcattatatgtacctcgttgaccaattaaca 47173952  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  47173951 ttgttgaaacaaatgg 47173936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33030460 - 33030258
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33030460 aatattagcataatgcatatttacatggataagatgtatgcaaatatagttacatataatttat-aaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 33030362  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| | ||| |||||||           ||||||||| ||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  33030361 aaatgtagcgtgacttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgtatgtatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 33030273  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  33030272 ttcttgaaacaaatg 33030258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 23300319 - 23300523
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23300319 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacatatgcgaatatagttacatgtaatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 23300418  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| || ||||            |||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||| |  ||||| | |||||||||||    
T  23300419 aaatgtatcatgacttttaat-----------atatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattataggatccccgttgaccaattaaca 23300507  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  23300508 ttgttgaaacaaatgg 23300523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17477553 - 17477349
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  17477553 aatattagtctaatgcatatttacatggataaaatgtatgcaaatatagttacatatagtttattaaataaaggtaccataactgattttaagctaaaaa 17477454  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    |||| || ||||| ||  |||           ||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  17477453 aaatatagcatgacttaaaat-----------ttatcttcctataaaggctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 17477365  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||| ||||||||||    
T  17477364 ttgttcaaacaaatgg 17477349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 17575661 - 17575865
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  17575661 aatattagtctaatgcatatttacatggataaaatgtatgcaaatatagttacatatagtttattaaataaaggtaccataactgattttaagctaaaaa 17575760  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    |||| || ||||| ||  |||           ||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  17575761 aaatatagcatgacttaaaat-----------ttatcttcctataaaggctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 17575849  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||| ||||||||||    
T  17575850 ttgttcaaacaaatgg 17575865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 216
Target Start/End: Original strand, 47164159 - 47164373
Alignment:
Q  9 tctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaa 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47164159 tctaatgcatattaacatggataagatgtatgcaaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtac 47164258  T
Q  109 catg-------atttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacat 201  Q
    || |       ||  |||||||||| || ||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||| |  | |||||| | |||| |  |||||||||||    
T  47164259 caggaagtagcataactaatttatcttcatattatcttcctatagagtatagataaatgcatgcatgtgaactatatgtatcccgttggccaattaacat 47164358  T
Q  202 tgttgaaacaaatgg 216  Q
    |||||||||||||||    
T  47164359 tgttgaaacaaatgg 47164373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17482000 - 17481795
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagct-aaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  17482000 aatattagtctaatgcatatttacatggataaaatgtatgcaaatatagttacatatagtttattaaataaaggtaccataactgattttaagctaaaaa 17481901  T
Q  100 aaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaac 199  Q
    ||||| || ||||| ||  |||           ||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  17481900 aaaatatagcatgacttaaaat-----------ttatcttcctataaaggctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaac 17481812  T
Q  200 attgttgaaacaaatgg 216  Q
    |||||| ||||||||||    
T  17481811 attgttcaaacaaatgg 17481795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 17571214 - 17571419
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagct-aaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  17571214 aatattagtctaatgcatatttacatggataaaatgtatgcaaatatagttacatatagtttattaaataaaggtaccataactgattttaagctaaaaa 17571313  T
Q  100 aaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaac 199  Q
    ||||| || ||||| ||  |||           ||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  17571314 aaaatatagcatgacttaaaat-----------ttatcttcctataaaggctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaac 17571402  T
Q  200 attgttgaaacaaatgg 216  Q
    |||||| ||||||||||    
T  17571403 attgttcaaacaaatgg 17571419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 38435149 - 38435250
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  38435149 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgggaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcatgacaaattttaagctaaaga 38435248  T
Q  101 aa 102  Q
    ||    
T  38435249 aa 38435250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 42996117 - 42996016
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  42996117 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgggaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcatgacaaattttaagctaaaga 42996018  T
Q  101 aa 102  Q
    ||    
T  42996017 aa 42996016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42687075 - 42687018
Alignment:
Q  159 tgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  42687075 tgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaacattgttgaaataaatgg 42687018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 184; Significance: 1e-100; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21097394 - 21097179
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21097394 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactaattttaagctaaaga 21097295  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21097294 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaaca 21097195  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  21097194 ttgttgaaacaaatgg 21097179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 16724946 - 16725161
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16724946 aatattagtctaatgcatatttacatggctaagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 16725045  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  16725046 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcatcccgttgaccaattaaca 16725145  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  16725146 ttgttgaaacaaatgg 16725161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26821315 - 26821100
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821315 aatattagtctaatgcatatttacatagataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 26821216  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  26821215 aaatgtaacatggcttctaatttatcatcttattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 26821116  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  26821115 ttgttgaaacaaatgg 26821100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42885086 - 42884872
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  42885086 aatattagtttaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtaacattactgattttaagctaaaga 42884987  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  42884986 aaatgtagcatgacttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 42884887  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    |||||||||||||||    
T  42884886 ttgttgaaacaaatg 42884872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 1515587 - 1515801
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1515587 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgtgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 1515686  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  1515687 aaatgtatcatgacttctaatttatcttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 1515786  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    |||||||||||||||    
T  1515787 ttgttgaaacaaatg 1515801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14752868 - 14752656
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14752868 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgtgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagctaaaga 14752769  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |  |||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  14752768 aaatgtaccatgacttctaatttatcttcctattagcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccccgttggccaattaaca 14752669  T
Q  201 ttgttgaaacaaa 213  Q
    |||||||||||||    
T  14752668 ttgttgaaacaaa 14752656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 18093310 - 18093519
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18093310 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcata-ctgattttaagctaaaga 18093408  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  18093409 aaatgtatcatgacttctaatttatcttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 18093508  T
Q  201 ttgttgaaaca 211  Q
    ||| |||||||    
T  18093509 ttgctgaaaca 18093519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4811244 - 4811029
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4811244 aatatcagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgcaaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcgtaactgattttaagctaaaaa 4811145  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  4811144 aaatgtatcatgacttctaatttatattcctattatcttcatataaagtctagatatatgcatgcatgttcattatatgtaccccgttgaccaattaaca 4811045  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  4811044 ttgttgaaacaaatgg 4811029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 30567462 - 30567666
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30567462 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 30567561  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||           ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||| | | |||||||||||    
T  30567562 aaatgtagcatgacttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccctgttgaccaattaaca 30567650  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  30567651 ttgttgaaacaaatgg 30567666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 36633683 - 36633887
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36633683 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtaatcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 36633782  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| |||||||           ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  36633783 aaatgtaacatgacttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 36633871  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  36633872 ttgttgaaacaaatgg 36633887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 9917286 - 9917504
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattt---taagctaa 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  9917286 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaataagctaa 9917385  T
Q  98 agaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaatta 197  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | ||||||||    
T  9917386 agaaaatgtattatgacttctaatttattttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaatta 9917485  T
Q  198 acattgttgaaacaaatgg 216  Q
    | |||||||||||||||||    
T  9917486 atattgttgaaacaaatgg 9917504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 30571147 - 30571350
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30571147 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 30571246  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||           ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||| | | |||||||||||    
T  30571247 aaatgtagcatgacttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccctgttgaccaattaaca 30571335  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    |||||||||||||||    
T  30571336 ttgttgaaacaaatg 30571350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17036964 - 17036749
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  17036964 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcatgatagattttaagctaaaga 17036865  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |  |||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  17036864 aaatgtaccatgacttctaatttatcttcctactatcttcctataaattctagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccccgttggccaattaaca 17036765  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  17036764 ttgttgaaacaaatgg 17036749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17091472 - 17091257
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  17091472 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcatgatagattttaagctaaaga 17091373  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |  |||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  17091372 aaatgtaccatgacttctaatttatcttcctactatcttcctataaattctagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccccgttggccaattaaca 17091273  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  17091272 ttgttgaaacaaatgg 17091257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3710590 - 3710376
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3710590 aatattaatctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 3710491  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  3710490 aaatgtaccatgacttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaaca 3710391  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  3710390 tttttgaaacaaatg 3710376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 11866826 - 11867040
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11866826 aatattaatctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 11866925  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  11866926 aaatgtaccatgacttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaaca 11867025  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  11867026 tttttgaaacaaatg 11867040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 35358219 - 35358433
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35358219 aatattaatctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 35358318  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  35358319 aaatgtaccatgacttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaaca 35358418  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  35358419 tttttgaaacaaatg 35358433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 45205615 - 45205833
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataat-----ttataaaataaaggtagcataactgattttaagct 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45205615 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttaatttataaaataaaggtagcataactgattttaagtt 45205714  T
Q  96 aaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaat 195  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| || | ||||||    
T  45205715 aaagaaaatgcaccatgacttctaatttatcttcctattatcttaatataaagtctagataaatgcatgcatctacattatatgtacctcgttgaccaat 45205814  T
Q  196 taacattgttgaaacaaat 214  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  45205815 taacatttttgaaacaaat 45205833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17025287 - 17025072
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  17025287 aatattagtctaatgcatattattatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcatgatagattttaagctaaaga 17025188  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |  |||||||| |||||| |  |||||||| |    
T  17025187 aaatgtaccatgacttctaatttatcttcctactatcttcctataaattctagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccccgttggccaattaata 17025088  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  17025087 ttgttgaaacaaatgg 17025072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 9544215 - 9544419
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544215 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 9544314  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||           ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  9544315 aaatgtatcatgacttctaat-----------ttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 9544403  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  9544404 ttgttgaaacagatgg 9544419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Original strand, 6343343 - 6343523
Alignment:
Q  35 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  6343343 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 6343441  T
Q  135 atcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6343442 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 6343523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Original strand, 14323827 - 14324007
Alignment:
Q  35 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  14323827 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 14323925  T
Q  135 atcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14323926 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 14324007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 33664392 - 33664596
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33664392 aatattagtctagtacatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttattaaataaaggtaccataactgattttaaactaaaga 33664491  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||           ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||| | |||||||||||    
T  33664492 aaatgtagcatgacttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtactccgttgaccaattaaca 33664580  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  33664581 ttgttgaaacaaatgg 33664596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Original strand, 1993555 - 1993734
Alignment:
Q  35 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  1993555 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 1993653  T
Q  135 atcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatg 215  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || | ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1993654 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatg 1993734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 10048592 - 10048796
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10048592 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacatatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagttaaaga 10048691  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    |||| || ||||| |||||||           ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  10048692 aaatatatcatgacttctaat-----------ttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 10048780  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  10048781 ttgttgaaacaaatgg 10048796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28501943 - 28501763
Alignment:
Q  35 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||    
T  28501943 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcttatt 28501845  T
Q  135 atcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||| |||  || | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  28501844 atcttcctagaaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 28501763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 19168240 - 19168441
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19168240 aatattagt-taatgcatatttacatggataagatgtctgcgaatatagttacatataatttttaaaataaaggtagtataactgattttaagctaaaga 19168338  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||             ||||||||| | ||||| ||| |||| |||||| |||||| | |||||||||||    
T  19168339 aaatgtagcatgacttctaatttatcttcctat-------------agtctagataactgcatgcatgtacaatatatgtaccccgttgaccaattaaca 19168425  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  19168426 ttgttgaaacaaatgg 19168441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 11448061 - 11447950
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11448061 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatatattttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 11447962  T
Q  101 aaatgtaacatg 112  Q
    ||||||| ||||    
T  11447961 aaatgtaccatg 11447950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 4291249 - 4291447
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4291249 aatattagtctaatgcatattaacatggataa------tgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 4291342  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||           ||||||| | | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  4291343 aaatgtatcatgacttctaat-----------ttatctttctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 4291431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 10822523 - 10822635
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10822523 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatatgatttataaaatgaaggtagcaaaactgattttaagctaaaga 10822622  T
Q  101 aaatgtaacatga 113  Q
    ||||||| |||||    
T  10822623 aaatgtaccatga 10822635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16883620 - 16883488
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16883620 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgaatatatagttacatataagttataaaatgaaggtagcataactgattttaagctaaaga 16883521  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctat 133  Q
    |||||||  |||| || ||||||||| ||||||    
T  16883520 aaatgtattatgacttataatttatcttcctat 16883488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17041310 - 17041178
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17041310 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgaatatatagttacatataagttataaaatgaaggtagcataactgattttaagctaaaga 17041211  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctat 133  Q
    |||||||  |||| || ||||||||| ||||||    
T  17041210 aaatgtattatgacttataatttatcttcctat 17041178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11447230 - 11447130
Alignment:
Q  115 ttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaat 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  11447230 ttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaacccgttgaccaattaacattgttgaaacaaat 11447131  T
Q  215 g 215  Q
    |    
T  11447130 g 11447130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 216
Target Start/End: Original strand, 10822651 - 10822734
Alignment:
Q  133 ttatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||| |  |||||||| ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10822651 ttatcttcctatatagtatagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccacgttggccaattaacattgttgaaacaaatgg 10822734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 26955 - 27170
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26955 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 27054  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27055 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtgcattatatgcaccccgttgaccaattaaca 27154  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  27155 ttgttgaaacaaatgg 27170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 14830121 - 14830336
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14830121 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 14830220  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  14830221 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtgcattatatgcaccccgttgaccaattaaca 14830320  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  14830321 ttgttgaaacaaatgg 14830336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 54332252 - 54332467
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54332252 aatattagtctaatgcatatttacatagataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 54332351  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  54332352 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcatattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 54332451  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  54332452 ttgttgaaacaaatgg 54332467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 34057173 - 34057388
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34057173 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 34057272  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  || | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  34057273 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcatattatcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 34057372  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  34057373 ttgttgaaacaaatgg 34057388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23478589 - 23478372
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaag-ctaaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23478589 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagactaaag 23478490  T
Q  100 -aaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaa 198  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23478489 taaaatgtaacatgacttctaatttattatcctattatcttcctataaagtctagataaacgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaa 23478390  T
Q  199 cattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23478389 cattgttgaaacaaatgg 23478372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13627731 - 13627516
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13627731 aatattaatctaatccatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaaactaaaaa 13627632  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  13627631 aaatgtagcatgacttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcattcatgtacattacatgtaccccgttgaccaattaaca 13627532  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  13627531 ttgttgaaacaaatgg 13627516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 53342087 - 53341874
Alignment:
Q  3 tattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53342087 tattagtctaatgcatatttacatggataagatatatgcgaatatagttatatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaa 53341988  T
Q  103 atgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacatt 202  Q
    ||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  53341987 atgtagcatgacttctaatttgtcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgaatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacatt 53341888  T
Q  203 gttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||| ||||||||    
T  53341887 gttgagacaaatgg 53341874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17739719 - 17739504
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17739719 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgtgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 17739620  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||  || ||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  17739619 aaatgtatcatgacttctaatttatcttcctattatcttcctaaaaaagctggataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 17739520  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  17739519 ttgttgaaacaaatgg 17739504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 55999307 - 55999521
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55999307 aatattagtctaatgcatatttacatgtataagatgtatgcaaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 55999406  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  55999407 aaatgtagcatgacttataatttatcttgatattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgaacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 55999506  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    ||||||||| |||||    
T  55999507 ttgttgaaataaatg 55999521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40621827 - 40621612
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40621827 aatattagtctaatacatattaacatggataagacgtatgcaaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 40621728  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||  |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| | | |||||||||||    
T  40621727 aaatgtatcatgacttctaatttatcttcctattatcttcctaaaaatgctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccctgttgaccaattaaca 40621628  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  40621627 ttgttgaaacaaatgg 40621612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 216
Target Start/End: Original strand, 39745486 - 39745671
Alignment:
Q  31 aagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  39745486 aagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaaaaaatgtagcatgacttctaatttatcttcc 39745585  T
Q  131 tattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  39745586 tattatcttcctatagagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 39745671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 19832007 - 19832210
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19832007 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttgagctaaaga 19832106  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||           ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  19832107 aaatgtagcatgacttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatctacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 19832195  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    |||||||||||||||    
T  19832196 ttgttgaaacaaatg 19832210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 10259933 - 10260147
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10259933 aatattaatctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 10260032  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  10260033 aaatgtaccatgacttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaaca 10260132  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  10260133 tttttgaaacaaatg 10260147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21564522 - 21564308
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21564522 aatattaatctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 21564423  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  21564422 aaatgtaccatgacttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaaca 21564323  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  21564322 tttttgaaacaaatg 21564308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 26924872 - 26925086
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26924872 aatattaatctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 26924971  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  26924972 aaatgtatcatgacttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaaca 26925071  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  26925072 tttttgaaacaaatg 26925086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43332043 - 43331829
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43332043 aatattaatctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 43331944  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  43331943 aaatgtaccatgacttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaaca 43331844  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  43331843 tttttgaaacaaatg 43331829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 574756 - 574968
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  574756 aatattagtctaatgcatattaacatagataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactga---taagctaaaga 574852  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    |||||||  |||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | ||||||||| |    
T  574853 aaatgtattatgacttctaatttattttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaata 574952  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  574953 ttgttgaaacaaatgg 574968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 33503608 - 33503812
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33503608 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 33503707  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||           ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | | || | | |||||||||    
T  33503708 aaatgtagcatgacttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtatctcgttaatcaattaaca 33503796  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  33503797 ttgttgaaacaaatgg 33503812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 24078002 - 24078216
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24078002 aatattaatctaatgcatattaacatggataagatgtatgcaaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 24078101  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  24078102 aaatgtatcatgacttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaaca 24078201  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  24078202 tttttgaaacaaatg 24078216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 51452110 - 51451896
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51452110 aatattaatctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 51452011  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  51452010 aaatgtaccatgacttctaatttatttttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaaca 51451911  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  51451910 tttttgaaacaaatg 51451896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 28135676 - 28135880
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28135676 aatattagtctaatgcatatttacatagataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgatttttatctaaaga 28135775  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||           ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||| | |||||||||||    
T  28135776 aaatgtagcatgacttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtactccgttgaccaattaaca 28135864  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  28135865 ttgttgaaacaaatgg 28135880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Original strand, 5274409 - 5274569
Alignment:
Q  56 ataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagat 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  5274409 ataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgacttctaatttatcatcatatcatcttcctataaagtctagat 5274508  T
Q  156 taatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
     ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  5274509 aaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 5274569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36856767 - 36856566
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36856767 aatattagtctaatacatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaagtatcataactgattttaagctaaaga 36856668  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||           |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  36856667 aaatgtaacatgacttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 36856579  T
Q  201 ttgttgaaacaaat 214  Q
    || |||||||||||    
T  36856578 tt-ttgaaacaaat 36856566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Original strand, 740923 - 741103
Alignment:
Q  35 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  740923 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 741021  T
Q  135 atcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  741022 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgatgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 741103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15520492 - 15520312
Alignment:
Q  35 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  15520492 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 15520394  T
Q  135 atcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15520393 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 15520312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 39715120 - 39715324
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39715120 aatattagtctaatgcatattaacatagataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 39715219  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||           ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  39715220 aaatgtatcatgacttctaat-----------ttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 39715308  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  39715309 ttgttgaaacagatgg 39715324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 52800711 - 52800507
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52800711 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 52800612  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| || ||||           ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  52800611 aaatgtatcatgacttttaat-----------ttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 52800523  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  52800522 ttgttgaaacagatgg 52800507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 17698855 - 17698721
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17698855 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatatttacatataatttataaaataaaggtaccataactgattttaagctaaaga 17698756  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctatta 135  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||    
T  17698755 aaatgtagcatgacttctaatttatctttctatta 17698721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19590514 - 19590311
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  19590514 aatattagtataatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaata 19590415  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||           |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||| | |||  | |||||||||||    
T  19590414 aaatgtaccatgacttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtgcattatatgtatcccattgaccaattaaca 19590326  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    |||||||||||||||    
T  19590325 ttgttgaaacaaatg 19590311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 35496149 - 35496331
Alignment:
Q  17 atatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgattt 116  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  35496149 atatttacatgggtaagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgactt 35496248  T
Q  117 ctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaac 210  Q
    |||||           ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  35496249 ctaat-----------ttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaac 35496331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 216
Target Start/End: Original strand, 7644773 - 7644934
Alignment:
Q  55 tataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctaga 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  7644773 tataatttataaaataaaggtagcataactgattttacgctaaagaaaatgtagcatgacgtctaatttatcttcatattatcttcctataaagtctaga 7644872  T
Q  155 ttaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||| | |||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7644873 taaatgcatgcatgtacattatatgtagcccgttgaccaattaacattgttaaaacaaatgg 7644934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 28120831 - 28121034
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28120831 aatattagtctgatgcatattaacatggataagatgtatgtgaatatagt-acatataatttataaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 28120929  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||           ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||| ||||   | |||||||||||    
T  28120930 aaatgtatcatgacttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatccatgtgcattatatgtaccctattgaccaattaaca 28121018  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  28121019 ttgttgaaacaaatgg 28121034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 47720679 - 47720881
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||          |||||||||||    
T  47720679 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgtgaatatagttacatataatttataaaataaaggtggca----------taagctaaaga 47720768  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |  |||||||| ||| || |  | ||||||||    
T  47720769 aaatgtaccatgacttctaatttatcttcatattagcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtgaattatatgtacctcgttggctaattaaca 47720868  T
Q  201 ttgttgaaacaaa 213  Q
    |||||||||||||    
T  47720869 ttgttgaaacaaa 47720881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 1944170 - 1944058
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1944170 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtattcgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagctaaaga 1944071  T
Q  101 aaatgtaacatga 113  Q
    ||||||| |||||    
T  1944070 aaatgtaccatga 1944058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 26870894 - 26870995
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  26870894 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgggaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcatgacaaattttaagctaaaga 26870993  T
Q  101 aa 102  Q
    ||    
T  26870994 aa 26870995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 7644394 - 7644456
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataattta 63  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7644394 aatatcagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataattta 7644456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 37702209 - 37702267
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataa 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37702209 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataa 37702267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 5272865 - 5272925
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatt 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5272865 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgtgaatatagttacatataatt 5272925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17698548 - 17698470
Alignment:
Q  138 ttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | |||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17698548 ttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaacccgttgaccgattaacattgttgaaacaaatgg 17698470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 39743356 - 39743392
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgt 37  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39743356 aatattagtctaatgtatatttacatggataagatgt 39743392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2194791 - 2194577
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2194791 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgtgaatatagttatatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 2194692  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2194691 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaaca 2194592  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    |||||||||||||||    
T  2194591 ttgttgaaacaaatg 2194577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7285303 - 7285088
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7285303 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatctataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 7285204  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  7285203 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcttattatcttccaataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccattgaccaattaaca 7285104  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  7285103 ttgttgaaacaaatgg 7285088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 26321668 - 26321883
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26321668 aatattagtctaatgaatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 26321767  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  26321768 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcactccgttgaccaattaaca 26321867  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  26321868 ttgttgaaacaaatgg 26321883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 33611733 - 33611946
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33611733 aatattagtataatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 33611832  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  33611833 aaatgtaacacgacttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcaagcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 33611932  T
Q  201 ttgttgaaacaaat 214  Q
    ||||||||||||||    
T  33611933 ttgttgaaacaaat 33611946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 20996537 - 20996752
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20996537 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataacatattttaagctaaaga 20996636  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  20996637 aaacgtaacatgacttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 20996736  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  20996737 ttgttgaaacaaatgg 20996752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21029734 - 21029519
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21029734 aatattagtgtaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 21029635  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    |||||||   ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  21029634 aaatgtagtttgacttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 21029535  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  21029534 ttgttgaaacaaatgg 21029519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27065528 - 27065313
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27065528 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagtataactgattttaaactaaaga 27065429  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  27065428 aaatgtagcatgacttctaaattatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 27065329  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    || |||||||||||||    
T  27065328 ttattgaaacaaatgg 27065313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30688935 - 30688726
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30688935 aatattagtctaatgcatat------ggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 30688842  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  30688841 aaatgtaacttgacttctactttatcatcctattatcttcctataaattctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaaca 30688742  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  30688741 ttgttgaaacaaatgg 30688726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 3151197 - 3151408
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3151197 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatatatgcgaatataattacatataatttataaaataaaggtagcataactaattttaagctaaaga 3151296  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  3151297 aaatgtagcattacttctaatttatcttcatattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 3151396  T
Q  201 ttgttgaaacaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  3151397 ttgttgaaacaa 3151408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9701878 - 9701663
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  9701878 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcatgatagattttaagctaaaga 9701779  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  9701778 aaatgtaccatgacttctaatttatcttcctactatcttcctataaattctagataaatgcatgcatgtagattatatgtaccccgttggccaattaaca 9701679  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  9701678 ttgttgaaacaaatgg 9701663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 3397731 - 3397949
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatg----tatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagcta 96  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3397731 aatattagtctaatacatatttacatagataagatgatcttatgcaaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagcta 3397830  T
Q  97 aagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaatt 196  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| |||| |||||  |||||| | |||||||    
T  3397831 aagaaaatgtagcatgacttctaatttatcttcccattatcttcctataaagtctagataaatgtatacatgtaca-tatatttaccccgttgaccaatt 3397929  T
Q  197 aacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3397930 aacattgttgaaacaaatgg 3397949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 37464010 - 37463796
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37464010 aatattaatctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 37463911  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  37463910 aaatgtaccatgacttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccattgaccaattaaca 37463811  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  37463810 tttttgaaacaaatg 37463796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 290234 - 290022
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  290234 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatatatgtgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaaactaaaga 290135  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    |||| ||  |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| ||| || |||||||| | |||| |  ||||||||||    
T  290134 aaatatacaatgacttctaatttatcttcctattagcttcctataaagtctaggtaaatgcatgcatgtagattatatgtatcccgttggccaattaaca 290035  T
Q  201 ttgttgaaacaaa 213  Q
    |||||||||||||    
T  290034 ttgttgaaacaaa 290022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 12588873 - 12589088
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12588873 aatattaatctaatggatattaacatggataaaatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 12588972  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    |||||||  |||| ||| |||||||  |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | ||||| ||| |    
T  12588973 aaatgtattatgacttcaaatttattttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaactaata 12589072  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    || |||||||||||||    
T  12589073 ttattgaaacaaatgg 12589088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30142189 - 30141985
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30142189 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 30142090  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||           |||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  30142089 aaatgtatcatgacttctaatt-----------tatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 30142001  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  30142000 ttgttgaaacaaatgg 30141985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 3210791 - 3211005
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||    
T  3210791 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatgtaatttataaaatgaatgtagcataattcattttaagctaaaga 3210890  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |  |||||||| | |||| |  |||||||| |    
T  3210891 aaatgtatcatgacttctaatttatcttcccattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtggattatatgta-cccgttggccaattaata 3210989  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  3210990 ttgttgaaacaaatgg 3211005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 25697116 - 25697320
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25697116 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 25697215  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||           ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  25697216 aaatgtatcatgacttctaat-----------ttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 25697304  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  25697305 ttgttgaaacagatgg 25697320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4881899 - 4881697
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4881899 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtat-cgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgatcttaagctaaaga 4881801  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||           |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| |||| | | |||||||||||    
T  4881800 aaatgtagcatgacttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtatattatatgtaccctgttgaccaattaaca 4881712  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    ||||||||| |||||    
T  4881711 ttgttgaaataaatg 4881697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34717276 - 34717072
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34717276 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 34717177  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| || ||||           ||||||||| | ||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  34717176 aaatgtatcatgacttttaat-----------ttatcttcctaaaaaggttagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 34717088  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  34717087 ttgttgaaacagatgg 34717072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41690962 - 41690758
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41690962 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacatatgtgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 41690863  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| || ||||           ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  41690862 aaatgtatcatgacttttaat-----------ttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 41690774  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  41690773 ttgttgaaacagatgg 41690758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 1852523 - 1852725
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1852523 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatatacacgaatataa--acatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 1852620  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||           ||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||| |||| | | |||||||||||    
T  1852621 aaatgtagcatgacttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgtatgcatgtacattatatgtaccctgttgaccaattaaca 1852709  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  1852710 ttgttgaaacaaatgg 1852725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19395079 - 19394900
Alignment:
Q  35 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  19395079 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactga-tttaagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 19394981  T
Q  135 atcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| |||  | || ||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  19394980 atcttcttataaagtctagataaatacatgta-ttgcattatatgaacctcgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 19394900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20349549 - 20349351
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |      ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  20349549 aatattagtctaatgcatatttacatggataaaatgtatcc------agttacatataatttattaaataaaggtaccataactgattttaagctaaaaa 20349456  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| || ||||           ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  20349455 aaatgtagcatgacttataat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 20349367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Original strand, 31296170 - 31296339
Alignment:
Q  35 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||           ||    
T  31296170 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactga-tttaagctaaagaaaatgtatcatgacttctaat-----------tt 31296257  T
Q  135 atcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||| |||  || | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  31296258 atcttcctataaagtttagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 31296339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 19447627 - 19447546
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataa 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19447627 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatacgaatatagttatatataatttataaaataaaggtagcataa 19447546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3028014 - 3027871
Alignment:
Q  62 tataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||           |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3028014 tataaaataaaggtagcataactgattttaagctatagaaaatgtagcataacttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgc 3027926  T
Q  162 attcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    || ||| ||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  3027925 atgcatgtacattatatgtaccacgttgaccaattaacattgttgaaataaatgg 3027871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 3028374 - 3028312
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataattta 63  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3028374 aatattagtccaatacatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataattta 3028312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 176; Significance: 5e-95; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 11326237 - 11326452
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11326237 aatattactctaatgcatatttacatggataagatgtattcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 11326336  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  11326337 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 11326436  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  11326437 ttgttgaaacaaatgg 11326452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 31369612 - 31369827
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31369612 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatatgaatatagttacgtataatttataaaataaaggtagcataacttattttaagctaaaga 31369711  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31369712 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttcctctaaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaaca 31369811  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  31369812 ttgttgaaacaaatgg 31369827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 35088433 - 35088645
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35088433 aatattagtctaatgcatatttacatagataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 35088532  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  35088533 aaatgtaacatgacttctaatttatcatcctattatcttc---aaaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 35088629  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  35088630 ttgttgaaacaaatgg 35088645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 49112734 - 49112519
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49112734 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtattcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 49112635  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||  ||||    
T  49112634 aaatgtagcatgaattctaatttatcttcttattatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaaacaaca 49112535  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  49112534 ttgttgaaacaaatgg 49112519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 48976344 - 48976130
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48976344 aatattagtctaatgcatatttacatagataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 48976245  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  48976244 aaatgtagcttgacttctaatttatcttcatattatcttcctataaagtatagataaatgcatacatgtacattatatgtaccccgttggccaattaaca 48976145  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    |||||||||||||||    
T  48976144 ttgttgaaacaaatg 48976130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23193121 - 23192906
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23193121 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatttaatttttataataaaggtagcataactgattttaagttaaaga 23193022  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | |||| | |||||||||||    
T  23193021 aaatgtaccatgacttctaatttatcttcctattatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtatcccgttgaccaattaaca 23192922  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  23192921 ttgttgaaacaaatgg 23192906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 11951572 - 11951785
Alignment:
Q  3 tattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11951572 tattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgatttcaagctaaagaaa 11951671  T
Q  103 atgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacatt 202  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | ||||||||| |||    
T  11951672 atgtatcatgacttctaatttatcttcctattatcttcttaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaatatt 11951771  T
Q  203 gttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||    
T  11951772 gttgaaacaaatgg 11951785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35436641 - 35436429
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35436641 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgtgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagctaaaga 35436542  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |  |||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  35436541 aaatgtaccatgacttctaatttatcttcctattagcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccccgttggccaattaaca 35436442  T
Q  201 ttgttgaaacaaa 213  Q
    |||||||||||||    
T  35436441 ttgttgaaacaaa 35436429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 52854037 - 52854252
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  52854037 aatattagtataatgaatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaagatatcataactaattttaagctaaaga 52854136  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| || | |||||||||||    
T  52854137 aaatgtagcatgacttctaatttatcttcctatcatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccacgttgaccaattaaca 52854236  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  52854237 ttgttgaaacaaatgg 52854252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 6104721 - 6104925
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6104721 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgcatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 6104820  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||||||||| |||||||           ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  6104821 aaatgtaacatgacttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgtagaccaattaaca 6104909  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  6104910 ttgttgaaacaaatgg 6104925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 11598559 - 11598774
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  11598559 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgctaatatagttacatataatttataaaataaaggtatcttaattgattttaagctaaaga 11598658  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  11598659 aaatgtatcatgacttctaatttatcttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcactcatatgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 11598758  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  11598759 ttgttgaaacaaatgg 11598774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 40827630 - 40827845
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40827630 aatattaatctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagtataactgattttaagctaaaga 40827729  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| | | || | ||||| |||||    
T  40827730 aaatgtatcatcacttctaatttatcttcctattatcttccaaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaactcgttgaccaactaaca 40827829  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  40827830 ttgttgaaacaaatgg 40827845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 51248021 - 51247817
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51248021 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 51247922  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||           |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  51247921 aaatgtagcatgacttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgcacgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 51247833  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  51247832 ttgttgaaacaaatgg 51247817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22477367 - 22477152
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22477367 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 22477268  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    |||||||  |||| ||| |||||||  |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||| | ||||| ||| |    
T  22477267 aaatgtattatgacttcaaatttattttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaactccgttgaccaactaata 22477168  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  22477167 ttgttgaaacaaatgg 22477152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 55295374 - 55295589
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55295374 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaagaaaggtagcataacttattttaagctaaaga 55295473  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||| | || ||||||||    
T  55295474 aaatgtatcatgacttctaatttatcttcctattatcttcctgaaaaggctagaaaaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgacaaattaaca 55295573  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  55295574 ttgttgaaacagatgg 55295589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 36168046 - 36168258
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36168046 aatattagtctaatgcgtattaacatggataagatgtatgtgaatatagttacatataatttataaaatcaaggtatcataactgattttaagctaaaga 36168145  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| ||| |  ||||||||||||| | |  ||||||||||    
T  36168146 aaatgtaccatgacttctaatttatcttcttattagcttcctataaagtctagaaaaatgcatgcatgtggattatatgcaccctgttggccaattaaca 36168245  T
Q  201 ttgttgaaacaaa 213  Q
    |||||||||||||    
T  36168246 ttgttgaaacaaa 36168258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16495553 - 16495338
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16495553 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgttaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagttaaaga 16495454  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |  |||||||| ||| || |  ||||||||||    
T  16495453 aaatgtaccatgacttctaatgtatcgtcctattatattcctataaaatctagataaatgcatgcatgtggattatatgtacctcgttggccaattaaca 16495354  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  16495353 ttgttgaaacaaatgg 16495338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 21700165 - 21700369
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21700165 aatatcagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatattatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 21700264  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||           ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||  |||| | | |||||||||||    
T  21700265 aaatgtagcatgacttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatttaccctgttgaccaattaaca 21700353  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  21700354 ttgttgaaacaaatgg 21700369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8242359 - 8242150
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||     
T  8242359 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatgtagttacatataatttataaaataaaggtag-----ctgattttaagctaaag- 8242266  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  8242265 aaatgtatcatgacttctaatttatcttcctcttatcttcttatagagtctagataaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttaaccaattaaca 8242166  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  8242165 ttgttgaaacaaatgg 8242150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Original strand, 5252872 - 5253052
Alignment:
Q  35 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  5252872 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 5252970  T
Q  135 atcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  5252971 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 5253052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 52841129 - 52841333
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  52841129 aatataagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttatgaaataaaggtggcataaccgattttaagctaaaga 52841228  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||           ||||||||| | |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  52841229 aaatgtagcatgacttctaat-----------ttatcttcctacaaagtccagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaaca 52841317  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  52841318 ttgttgaaacaaatgg 52841333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 50771842 - 50772046
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  50771842 aatattagtctaatgcatatttacatggataaaatgtatgcaaatatagttacatataatttattaaataaaggtaccataactgattttaagctaaaaa 50771941  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| || ||||           ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  50771942 aaatgtagcatgacttataat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccattgaccaattaaca 50772030  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||| ||||||||||    
T  50772031 ttgttcaaacaaatgg 50772046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 44073316 - 44073525
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44073316 aatattaatctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 44073415  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||     |||||||||  ||||||| ||| | ||||||||| ||| || | |||||||||||    
T  44073416 aaatgtaccatgacttctaatttatctttctattatcttc-----aagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtacctcgttgaccaattaaca 44073510  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  44073511 tttttgaaacaaatg 44073525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 50741012 - 50740808
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  50741012 aatattagtctaatgcatatttacatggataaaatgtatgcaaatatagttacatataatttattaaataaaggtaccataactgattttaagctaaaaa 50740913  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| || ||||           ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  50740912 aaatgtagcatgacttataat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgaaccccattgaccaattaaca 50740824  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||| ||||||||||    
T  50740823 ttgttcaaacaaatgg 50740808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 19893964 - 19894168
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19893964 aatattactctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataacttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 19894063  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||         |||  || |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  19894064 aaatgtatcatgacttctaatttatcttccta---------aat--aggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgtagaccaattaaca 19894152  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  19894153 ttgttgaaacagatgg 19894168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 918330 - 918127
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  918330 aatattaatctaatgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaaga 918231  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||           |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  918230 aaatgtatcatgacttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccattgaccaattaaca 918142  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    || ||||||||||||    
T  918141 tttttgaaacaaatg 918127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11382828 - 11382618
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  11382828 aatattagtctaatgcacattaacatggataaaatgtctgcgaatatagttatatataatttataaaatgaaggtaacgtaactgattttaagctaaaga 11382729  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| ||     | ||||| |||||||| | || ||| ||| ||| |  |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  11382728 aaatgtaccatgacttgtaatttatcctc-----agcttcctataaagtccatataaatccatgcatgtggattatatgtaccccgttgaccaattaaca 11382634  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  11382633 ttgttgaaacaaatgg 11382618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 48521617 - 48521736
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactga-ttttaagctaaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48521617 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgatttttaagctaaag 48521716  T
Q  100 aaaatgtaacatgatttcta 119  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  48521717 aaaatgtatcatgacttcta 48521736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Original strand, 39796971 - 39797140
Alignment:
Q  35 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||           ||    
T  39796971 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactga-tttaagctaaagaaaatgtatcatgacttctaat-----------tt 39797058  T
Q  135 atcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||  || | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  39797059 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 39797140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 2845452 - 2845558
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  2845452 aatattagtctaatgcatattaacatgtgtaaggtgtatgtaaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataattgattttaagctaaagc 2845551  T
Q  101 aaatgta 107  Q
    |||||||    
T  2845552 aaatgta 2845558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 216
Target Start/End: Original strand, 9879550 - 9879723
Alignment:
Q  32 agatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcct 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | || ||||              
T  9879550 agatgtatgcgaatataattacatataatttataaaatgaaggtagcataattgattttaaactaaagaaaatgtatcatcacttttaat---------- 9879639  T
Q  132 attatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
     ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |  |||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  9879640 -ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtggattatatgtactccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 9879723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 54793560 - 54793643
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataact 84  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  54793560 aatattagtctgatgcatattaacatggataagatgtatgtgaatataattacatataatttataaaatgaaggtagcacaact 54793643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 216
Target Start/End: Original strand, 54793665 - 54793764
Alignment:
Q  116 tctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatg 215  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |  |||||||| | |||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  54793665 tctaatttatcttcctattatattcctataaagtctagataaatgcatgcatgtggattatatgta-cccgttggccaattaacattgttgaaacaaatg 54793763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 216
Target Start/End: Original strand, 28164813 - 28164896
Alignment:
Q  133 ttatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||| ||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||    
T  28164813 ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgcacattatatgaacctcgttgatcaattaacatttttgaaacgaatgg 28164896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 54512462 - 54512407
Alignment:
Q  157 aatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaa 212  Q
    ||||||| ||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  54512462 aatgcatgcatgtacattttatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaa 54512407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 119700 - 119486
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119700 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtaagtgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 119601  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    |||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||| |||||| | | |||||||||    
T  119600 aaatgtattatgacttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgaatgcatgtgcattatatgtaccccgttgagcaattaaca 119501  T
Q  201 ttgttgaaacaaatg 215  Q
    |||||||||||||||    
T  119500 ttgttgaaacaaatg 119486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 152749 - 152964
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  152749 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgggaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagttaaaga 152848  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |  |||||||| ||| || |  ||||||||||    
T  152849 aaatgtaccatgacttctaatgtatcgtcctattatattcctataaaatctagataaatgcatgcatgtggattatatgtacctcgttggccaattaaca 152948  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  152949 ttgttgaaacaaatgg 152964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 65230 - 65342
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65230 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtattcgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagctaaaga 65329  T
Q  101 aaatgtaacatga 113  Q
    ||||||| |||||    
T  65330 aaatgtaccatga 65342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 4684 - 4869
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4684 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 4783  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccg 186  Q
    |||||||  |||| ||| |||||||  |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  4784 aaatgtattatgacttcaaatttattttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccg 4869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 122; Significance: 9e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 18981 - 19185
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18981 aatattagtctaatgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 19080  T
Q  101 aaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||           ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  19081 aaatgtatcatgacttctaat-----------ttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaaca 19169  T
Q  201 ttgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  19170 ttgttgaaacagatgg 19185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Original strand, 4866 - 5065
Alignment:
Q  17 atatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgattt 116  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| ||    
T  4866 atattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaataaaatatataatgactt 4965  T
Q  117 ctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    || ||||||| |||||||||||||| | |||| |||||| ||| || |||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4966 ctgatttatcttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatccactcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 5065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Original strand, 11315 - 11514
Alignment:
Q  17 atatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgattt 116  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| ||    
T  11315 atattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaataaaatatataatgactt 11414  T
Q  117 ctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    || ||||||| |||||||||||||| | |||| |||||| ||| || |||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11415 ctgatttatcttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatccactcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 11514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 214
Target Start/End: Original strand, 10991 - 11137
Alignment:
Q  68 ataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcat 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||  ||||| |||||||| ||    
T  10991 ataaaggtagcataactaattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctattatcttcctaaaaaggttagataaatgcattgat 11090  T
Q  168 ttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaat 214  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  11091 gtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaat 11137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 53 - 215
Target Start/End: Original strand, 13493 - 13655
Alignment:
Q  53 catataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtcta 152  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||  | |||| |||    
T  13493 catataagttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatctttctattatcttcataaaaaggcta 13592  T
Q  153 gattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatg 215  Q
    ||| || |||||||| | |||||||||  |||   | ||||||||||||||||||||||||||    
T  13593 gataaaagcattcatgtgcattatatgagcccaattgaccaattaacattgttgaaacaaatg 13655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1555 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1555
Description:

Target: scaffold1555; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 199
Target Start/End: Original strand, 1521 - 1648
Alignment:
Q  72 aggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttac 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  1521 aggtagcataactgattttaagctacagaaaatgtaacatgacttctaatttatcttcctattatcatcctataaagtctagataaatgcatgcatgtac 1620  T
Q  172 attatatgcaccccgcttaccaattaac 199  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||    
T  1621 attatatgtaccccgttgaccaattaac 1648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 999 - 898
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  999 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgggaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcatgacaaattttaagctaaaga 900  T
Q  101 aa 102  Q
    ||    
T  899 aa 898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 54695 - 54796
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  54695 aatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgggaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcatgacaaattttaagctaaaga 54794  T
Q  101 aa 102  Q
    ||    
T  54795 aa 54796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13395 - 13249
Alignment:
Q  59 atttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcctattatcttccaataaagtctagattaa 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||           |||||||| | |||| |||||| ||    
T  13395 atttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatt-----------tatcttcctaaaaaggctagataaa 13307  T
Q  159 tgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaatgg 216  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13306 tgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 13249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 78 - 1
Alignment:
Q  1 aatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagc 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78 aatattagtctaatgcatatttacatggataggatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 49687 - 49515
Alignment:
Q  32 agatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgatttctaatttatcatcct 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||||    
T  49687 agatgtatgtgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataa----------gctaaataaaatgtaccatgacttctaatttatattcct 49598  T
Q  132 attatcttccaataaagtctagattaatgcattcatttacattatatgcaccccgcttaccaattaacattgttgaaacaaat 214  Q
    |||| ||||  |||||| |||||| ||||||| ||| |  |||||||| |||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  49597 attagcttcttataaagcctagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccccgttggctaattaacattgttgaaacaaat 49515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University