View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10233A_low_48 (Length: 373)

Name: NF10233A_low_48
Description: NF10233A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10233A_low_48
NF10233A_low_48
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (10-293)||(17938893-17939177)
chr6 (10-332)||(1073801-1074139)
chr6 (10-332)||(18599524-18599862)
chr6 (10-332)||(11946007-11946345)
chr6 (10-332)||(14888475-14888813)
chr6 (10-292)||(7222115-7222398)
chr6 (11-332)||(34855327-34855664)
chr6 (10-332)||(15275029-15275367)
chr6 (10-292)||(2520534-2520817)
chr6 (10-293)||(7219456-7219740)
chr6 (51-332)||(11935218-11935515)
chr6 (10-295)||(33322043-33322329)
chr6 (11-332)||(4423756-4424081)
chr6 (10-293)||(249283-249567)
chr6 (10-293)||(12580388-12580672)
chr6 (10-249)||(13457350-13457588)
chr6 (10-293)||(34320463-34320747)
chr6 (10-293)||(25532636-25532908)
chr6 (10-293)||(33978344-33978617)
chr6 (16-295)||(1931420-1931690)
chr6 (10-293)||(9979651-9979924)
chr6 (10-293)||(24445351-24445624)
chr6 (10-292)||(22374434-22374728)
chr6 (10-293)||(1219948-1220215)
chr6 (10-103)||(1080374-1080467)
chr6 (245-332)||(4424093-4424196)
chr6 (289-354)||(17939188-17939253)
chr6 (295-329)||(2520835-2520869)
chr6 (295-329)||(22374382-22374416)
chr6 (295-332)||(249584-249621)
chr6 (295-332)||(1220232-1220269)
chr6 (295-332)||(9979597-9979634)
chr6 (295-332)||(12580334-12580371)
chr6 (295-332)||(24445641-24445678)
chr6 (295-332)||(25532925-25532962)
chr6 (295-332)||(33978634-33978671)
chr6 (295-332)||(34320764-34320801)
chr6 (295-329)||(1931705-1931739)
chr6 (295-332)||(7222416-7222453)
chr6 (295-332)||(33321991-33322028)
chr6 (300-328)||(7219406-7219434)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (10-332)||(18813614-18813952)
chr1 (10-332)||(34686982-34687320)
chr1 (10-332)||(41830566-41830904)
chr1 (10-332)||(52522085-52522423)
chr1 (10-292)||(38845796-38846079)
chr1 (10-332)||(31619084-31619422)
chr1 (10-292)||(41963502-41963785)
chr1 (10-290)||(28566291-28566572)
chr1 (10-332)||(34691520-34691848)
chr1 (10-290)||(12713872-12714153)
chr1 (19-293)||(48339728-48340008)
chr1 (10-249)||(18111113-18111351)
chr1 (10-249)||(43255170-43255408)
chr1 (10-249)||(50395584-50395822)
chr1 (10-293)||(10694760-10695044)
chr1 (10-290)||(13662976-13663257)
chr1 (10-293)||(52309229-52309513)
chr1 (10-293)||(15314656-15314929)
chr1 (10-283)||(29841268-29841542)
chr1 (10-283)||(42681785-42682059)
chr1 (10-293)||(4891524-4891797)
chr1 (10-293)||(29186690-29186963)
chr1 (10-293)||(51966304-51966577)
chr1 (10-293)||(33361133-33361400)
chr1 (10-293)||(50560448-50560721)
chr1 (10-84)||(10762949-10763023)
chr1 (289-330)||(52309524-52309565)
chr1 (289-332)||(29841204-29841247)
chr1 (289-332)||(41963447-41963490)
chr1 (295-332)||(4891814-4891851)
chr1 (295-332)||(15314946-15314983)
chr1 (295-332)||(29186636-29186673)
chr1 (295-332)||(38845741-38845778)
chr1 (295-332)||(50560738-50560775)
chr1 (289-332)||(10763072-10763115)
chr1 (289-332)||(42682080-42682123)
chr1 (289-328)||(48340019-48340058)
chr1 (295-332)||(33361417-33361454)
[»] chr8 (55 HSPs)
chr8 (10-332)||(14079348-14079686)
chr8 (10-292)||(33424831-33425114)
chr8 (10-292)||(38961306-38961589)
chr8 (10-332)||(30825583-30825920)
chr8 (10-292)||(38991651-38991933)
chr8 (13-292)||(6478065-6478345)
chr8 (10-292)||(41628033-41628305)
chr8 (10-293)||(20663516-20663800)
chr8 (10-293)||(30548879-30549163)
chr8 (10-293)||(41906990-41907273)
chr8 (10-293)||(44213633-44213916)
chr8 (10-293)||(19247244-19247527)
chr8 (10-293)||(19320428-19320711)
chr8 (53-293)||(23626916-23627157)
chr8 (10-249)||(23967006-23967244)
chr8 (10-249)||(37029101-37029339)
chr8 (10-249)||(42061280-42061518)
chr8 (10-249)||(44939705-44939943)
chr8 (10-212)||(36602722-36602924)
chr8 (10-332)||(42811453-42811806)
chr8 (10-293)||(44383512-44383796)
chr8 (10-292)||(12759605-12759890)
chr8 (10-293)||(41155770-41156054)
chr8 (10-216)||(19396015-19396221)
chr8 (10-292)||(39203773-39204045)
chr8 (10-293)||(41976600-41976874)
chr8 (10-249)||(6301103-6301330)
chr8 (22-293)||(29433199-29433454)
chr8 (13-151)||(45294767-45294905)
chr8 (86-267)||(22343102-22343271)
chr8 (86-267)||(22354762-22354931)
chr8 (208-292)||(36598112-36598197)
chr8 (182-293)||(12250766-12250878)
chr8 (182-293)||(39444329-39444441)
chr8 (10-91)||(22345560-22345641)
chr8 (10-91)||(22357220-22357301)
chr8 (212-293)||(45294670-45294752)
chr8 (295-331)||(33424777-33424813)
chr8 (295-329)||(36598060-36598094)
chr8 (295-332)||(6478010-6478047)
chr8 (295-332)||(20663462-20663499)
chr8 (295-332)||(30548825-30548862)
chr8 (295-332)||(38961607-38961644)
chr8 (295-332)||(38991951-38991988)
chr8 (295-328)||(41628323-41628356)
chr8 (295-332)||(41907290-41907327)
chr8 (295-332)||(44213579-44213616)
chr8 (295-332)||(45294095-45294132)
chr8 (289-332)||(22342330-22342373)
chr8 (295-332)||(12759908-12759945)
chr8 (297-330)||(19247546-19247579)
chr8 (297-330)||(19320730-19320763)
chr8 (263-292)||(22342385-22342414)
chr8 (295-332)||(23626862-23626899)
chr8 (295-332)||(41156071-41156108)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (10-292)||(11326227-11326510)
chr3 (10-332)||(31369547-31369885)
chr3 (10-292)||(35088423-35088703)
chr3 (10-292)||(49112461-49112744)
chr3 (10-292)||(52854027-52854310)
chr3 (10-292)||(48976071-48976354)
chr3 (10-293)||(23192848-23193132)
chr3 (10-292)||(51247759-51248031)
chr3 (10-293)||(35436368-35436652)
chr3 (10-293)||(52841118-52841391)
chr3 (10-292)||(21700155-21700427)
chr3 (10-331)||(50740750-50741076)
chr3 (10-292)||(50771832-50772104)
chr3 (10-292)||(36168036-36168319)
chr3 (10-295)||(11598546-11598832)
chr3 (10-292)||(6104711-6104983)
chr3 (13-295)||(8242095-8242372)
chr3 (10-280)||(11951572-11951843)
chr3 (10-293)||(55295363-55295647)
chr3 (10-249)||(5252872-5253110)
chr3 (10-283)||(22477094-22477368)
chr3 (10-290)||(16495280-16495561)
chr3 (10-293)||(44073305-44073584)
chr3 (10-293)||(918068-918341)
chr3 (35-293)||(40827619-40827878)
chr3 (12-293)||(11382562-11382839)
chr3 (10-249)||(39796971-39797198)
chr3 (10-252)||(9879550-9879781)
chr3 (13-293)||(19893953-19894223)
chr3 (10-168)||(54793665-54793822)
chr3 (10-151)||(28164813-28164954)
chr3 (10-127)||(54512345-54512462)
chr3 (165-293)||(48521606-48521736)
chr3 (10-107)||(2845554-2845651)
chr3 (177-292)||(2845442-2845558)
chr3 (10-103)||(11952053-11952146)
chr3 (208-290)||(54793552-54793635)
chr3 (289-332)||(8242381-8242424)
chr3 (289-328)||(52841068-52841107)
chr3 (295-331)||(50771778-50771814)
chr3 (289-332)||(21700100-21700143)
chr3 (295-332)||(6104656-6104693)
chr3 (295-332)||(23193149-23193186)
chr3 (295-332)||(35088368-35088405)
chr3 (295-332)||(36167981-36168018)
chr3 (295-332)||(44073251-44073288)
chr3 (295-332)||(55295309-55295346)
chr3 (295-331)||(48976372-48976408)
chr3 (295-331)||(54512468-54512504)
chr3 (294-329)||(49112761-49112796)
chr3 (303-332)||(918366-918395)
chr3 (295-328)||(11326176-11326209)
chr3 (295-332)||(40827565-40827602)
chr3 (295-332)||(48521552-48521589)
chr3 (295-332)||(52853972-52854009)
chr3 (295-332)||(54793495-54793532)
chr3 (296-332)||(2845387-2845423)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (10-332)||(9315-9653)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (14-292)||(21029465-21029744)
chr5 (10-332)||(20996472-20996810)
chr5 (10-332)||(27065255-27065593)
chr5 (10-292)||(33611723-33612006)
chr5 (10-332)||(26321603-26321941)
chr5 (10-292)||(2194518-2194801)
chr5 (10-292)||(7285030-7285313)
chr5 (10-332)||(30688668-30689000)
chr5 (10-292)||(3151187-3151469)
chr5 (10-293)||(37463737-37464021)
chr5 (10-292)||(3397721-3398007)
chr5 (10-292)||(4881638-4881909)
chr5 (53-293)||(9701648-9701889)
chr5 (10-293)||(3210780-3211063)
chr5 (10-293)||(20349293-20349560)
chr5 (10-295)||(289961-290247)
chr5 (10-292)||(1852513-1852783)
chr5 (10-283)||(12588872-12589146)
chr5 (10-293)||(30141927-30142200)
chr5 (10-249)||(19394842-19395079)
chr5 (10-292)||(25697106-25697378)
chr5 (10-293)||(34717014-34717287)
chr5 (10-293)||(41690700-41690973)
chr5 (10-218)||(3027813-3028010)
chr5 (10-249)||(31296170-31296398)
chr5 (201-292)||(19447545-19447637)
chr5 (221-292)||(3028312-3028384)
chr5 (295-330)||(1852460-1852495)
chr5 (289-332)||(3028396-3028439)
chr5 (289-332)||(19447649-19447692)
chr5 (295-332)||(2194819-2194856)
chr5 (295-332)||(3151132-3151169)
chr5 (10-43)||(19447484-19447517)
chr5 (295-332)||(20349577-20349614)
chr5 (295-332)||(21029762-21029799)
chr5 (295-332)||(25697051-25697088)
chr5 (295-332)||(33611668-33611705)
chr5 (295-332)||(37464038-37464075)
chr5 (295-332)||(41690990-41691027)
chr5 (295-331)||(290262-290298)
chr5 (295-330)||(4881927-4881962)
chr5 (289-332)||(12588808-12588851)
chr5 (295-332)||(3397666-3397703)
chr5 (295-332)||(7285331-7285368)
chr5 (295-332)||(9701906-9701943)
chr5 (295-332)||(30142217-30142254)
chr5 (295-332)||(34717304-34717341)
[»] chr7 (62 HSPs)
chr7 (10-292)||(23767028-23767311)
chr7 (12-292)||(5962092-5962373)
chr7 (10-332)||(8926425-8926763)
chr7 (13-292)||(14308324-14308604)
chr7 (10-293)||(4481788-4482072)
chr7 (10-293)||(9226809-9227093)
chr7 (10-293)||(19034244-19034528)
chr7 (10-293)||(20720108-20720392)
chr7 (10-293)||(20764770-20765053)
chr7 (10-293)||(33230550-33230834)
chr7 (10-293)||(34282693-34282977)
chr7 (10-292)||(29490348-29490631)
chr7 (10-293)||(17477291-17477564)
chr7 (10-293)||(17575650-17575923)
chr7 (10-292)||(19520565-19520840)
chr7 (10-293)||(27735637-27735921)
chr7 (10-293)||(42917241-42917525)
chr7 (10-249)||(6911977-6912215)
chr7 (10-332)||(17481737-17482065)
chr7 (10-293)||(17571203-17571477)
chr7 (10-249)||(47573955-47574193)
chr7 (10-292)||(42686960-42687226)
chr7 (10-332)||(33030199-33030525)
chr7 (10-283)||(33639273-33639547)
chr7 (10-283)||(3794901-3795175)
chr7 (10-293)||(9148752-9149036)
chr7 (10-281)||(39649551-39649812)
chr7 (10-292)||(47173879-47174150)
chr7 (10-283)||(31898388-31898651)
chr7 (10-293)||(17170450-17170723)
chr7 (22-293)||(42245444-42245705)
chr7 (10-293)||(47164140-47164431)
chr7 (10-293)||(48528347-48528621)
chr7 (10-293)||(23300308-23300581)
chr7 (182-293)||(38435138-38435250)
chr7 (182-293)||(42996016-42996128)
chr7 (295-332)||(17571149-17571186)
chr7 (295-332)||(5962391-5962428)
chr7 (295-332)||(17170740-17170777)
chr7 (295-332)||(17477581-17477618)
chr7 (295-332)||(17575596-17575633)
chr7 (295-332)||(19034190-19034227)
chr7 (295-332)||(20720409-20720446)
chr7 (295-332)||(20765070-20765107)
chr7 (295-328)||(23766977-23767010)
chr7 (295-332)||(29490649-29490686)
chr7 (295-332)||(31898324-31898361)
chr7 (295-332)||(33230496-33230533)
chr7 (295-332)||(42687244-42687281)
chr7 (295-332)||(42917542-42917579)
chr7 (295-332)||(47174168-47174205)
chr7 (295-332)||(48528293-48528330)
chr7 (295-331)||(9149053-9149089)
chr7 (289-332)||(3795196-3795239)
chr7 (297-332)||(23300254-23300289)
chr7 (295-332)||(14308622-14308659)
chr7 (295-332)||(34282639-34282676)
chr7 (295-328)||(39649487-39649520)
chr7 (295-332)||(47164086-47164123)
chr7 (300-332)||(27735583-27735615)
chr7 (300-332)||(33639209-33639241)
chr7 (300-332)||(42245390-42245422)
[»] chr2 (59 HSPs)
chr2 (10-292)||(21097121-21097404)
chr2 (10-292)||(26821042-26821325)
chr2 (10-292)||(42884813-42885096)
chr2 (10-332)||(16724881-16725219)
chr2 (10-292)||(36633673-36633945)
chr2 (10-293)||(33664381-33664654)
chr2 (10-292)||(30567452-30567724)
chr2 (14-293)||(4810975-4811255)
chr2 (10-293)||(14752595-14752879)
chr2 (10-293)||(3710317-3710601)
chr2 (10-293)||(11866815-11867099)
chr2 (10-293)||(35358208-35358492)
chr2 (10-283)||(1515586-1515860)
chr2 (10-293)||(18093299-18093582)
chr2 (53-293)||(17036734-17036975)
chr2 (53-293)||(17091242-17091483)
chr2 (10-293)||(45205604-45205893)
chr2 (10-249)||(1993555-1993793)
chr2 (10-249)||(6343343-6343581)
chr2 (10-249)||(14323827-14324065)
chr2 (10-283)||(9917285-9917562)
chr2 (10-249)||(28501705-28501943)
chr2 (53-293)||(17025057-17025298)
chr2 (69-292)||(30571137-30571350)
chr2 (10-293)||(9544204-9544477)
chr2 (10-282)||(10048592-10048854)
chr2 (10-171)||(11447071-11447232)
chr2 (10-293)||(16883358-16883631)
chr2 (10-293)||(17041048-17041321)
chr2 (15-295)||(10822510-10822787)
chr2 (60-292)||(19168230-19168449)
chr2 (10-293)||(4291238-4291505)
chr2 (172-332)||(11447950-11448126)
chr2 (295-332)||(33664327-33664364)
chr2 (289-332)||(19168175-19168218)
chr2 (295-330)||(21097422-21097457)
chr2 (295-332)||(3710618-3710655)
chr2 (295-332)||(4291184-4291221)
chr2 (295-332)||(4811272-4811309)
chr2 (295-332)||(9544150-9544187)
chr2 (295-332)||(11866761-11866798)
chr2 (295-332)||(26821343-26821380)
chr2 (295-332)||(35358154-35358191)
chr2 (295-332)||(36633618-36633655)
chr2 (289-332)||(1515522-1515565)
chr2 (297-332)||(42885116-42885151)
chr2 (288-330)||(9917223-9917265)
chr2 (295-329)||(16883647-16883681)
chr2 (295-329)||(17041337-17041371)
chr2 (295-332)||(10048527-10048564)
chr2 (295-332)||(10822458-10822495)
chr2 (295-332)||(17025315-17025352)
chr2 (295-332)||(17036992-17037029)
chr2 (295-332)||(17091500-17091537)
chr2 (295-332)||(18093245-18093282)
chr2 (295-328)||(30567401-30567434)
chr2 (295-328)||(30571086-30571119)
chr2 (295-328)||(45205554-45205587)
chr2 (295-331)||(14752896-14752932)
[»] chr4 (67 HSPs)
chr4 (13-292)||(54332242-54332522)
chr4 (10-292)||(14830111-14830394)
chr4 (10-328)||(13627458-13627792)
chr4 (10-292)||(53341816-53342099)
chr4 (10-292)||(34057163-34057447)
chr4 (10-332)||(23478314-23478654)
chr4 (10-253)||(39745486-39745729)
chr4 (10-332)||(55999242-55999580)
chr4 (10-354)||(19831920-19832269)
chr4 (10-293)||(10259922-10260206)
chr4 (10-293)||(21564249-21564533)
chr4 (10-293)||(26924861-26925145)
chr4 (10-293)||(43331770-43332054)
chr4 (10-293)||(24077991-24078275)
chr4 (10-293)||(51451837-51452121)
chr4 (10-292)||(28135666-28135938)
chr4 (13-292)||(33503598-33503867)
chr4 (10-293)||(17739446-17739730)
chr4 (10-249)||(15520254-15520492)
chr4 (10-332)||(36856507-36856832)
chr4 (10-249)||(740923-741161)
chr4 (10-293)||(40621552-40621838)
chr4 (10-228)||(5274409-5274627)
chr4 (10-332)||(19590252-19590579)
chr4 (10-292)||(28120821-28121092)
chr4 (10-293)||(47720668-47720942)
chr4 (13-229)||(7644773-7644989)
chr4 (10-293)||(39715109-39715382)
chr4 (10-293)||(52800449-52800722)
chr4 (56-283)||(574755-574980)
chr4 (10-266)||(35496149-35496395)
chr4 (10-292)||(1943902-1944180)
chr4 (149-292)||(17698721-17698865)
chr4 (10-146)||(17698412-17698548)
chr4 (182-293)||(26870883-26870995)
chr4 (225-292)||(37702199-37702267)
chr4 (223-332)||(5272800-5272925)
chr4 (221-292)||(7644384-7644456)
chr4 (10-81)||(35712922-35712993)
chr4 (289-332)||(39743291-39743334)
chr4 (295-332)||(35496088-35496125)
chr4 (295-331)||(14830057-14830093)
chr4 (295-332)||(7644329-7644366)
chr4 (295-332)||(10259868-10259905)
chr4 (295-332)||(17739747-17739784)
chr4 (295-332)||(21564550-21564587)
chr4 (295-332)||(26924807-26924844)
chr4 (295-332)||(28135611-28135648)
chr4 (295-332)||(33503543-33503580)
chr4 (295-332)||(39715055-39715092)
chr4 (295-332)||(40621855-40621892)
chr4 (295-332)||(43332071-43332108)
chr4 (295-332)||(51452138-51452175)
chr4 (295-332)||(52800739-52800776)
chr4 (295-332)||(53342117-53342154)
chr4 (296-332)||(28120766-28120802)
chr4 (289-332)||(35708173-35708216)
chr4 (295-329)||(38007551-38007585)
chr4 (247-292)||(39743346-39743392)
chr4 (295-354)||(47720592-47720651)
chr4 (295-332)||(17698883-17698920)
chr4 (295-332)||(24077937-24077974)
chr4 (295-332)||(34057108-34057145)
chr4 (295-332)||(37702144-37702181)
chr4 (259-292)||(38007500-38007533)
chr4 (300-332)||(3839916-3839948)
chr4 (295-327)||(54332192-54332224)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (10-292)||(26945-27228)
scaffold0047 (295-331)||(26891-26927)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (10-292)||(119428-119710)
scaffold0010 (295-332)||(119728-119765)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (10-293)||(152738-153022)
scaffold0006 (10-292)||(65220-65498)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (10-258)||(4875-5123)
scaffold0032 (10-258)||(11324-11572)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (10-293)||(18970-19243)
scaffold0057 (295-332)||(18916-18953)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (10-231)||(13493-13714)
scaffold0045 (300-332)||(13461-13493)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (10-295)||(49455-49724)
scaffold0051 (296-332)||(49740-49776)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (10-216)||(10991-11197)
[»] scaffold0385 (2 HSPs)
scaffold0385 (93-283)||(4683-4874)
scaffold0385 (289-332)||(4619-4662)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (10-225)||(13191-13395)
scaffold0069 (296-332)||(13448-13484)
[»] scaffold1555 (1 HSPs)
scaffold1555 (85-212)||(1521-1648)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (182-293)||(898-1010)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (182-293)||(54684-54796)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (208-332)||(3-143)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (289-332)||(30527-30570)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 17938893 - 17939177
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  17938893 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacattt 17938992  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17938993 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagttatgctacatgttctttagcttaaaatcagttatggta 17939092  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17939093 cctttatttaataaattatttgtaactatattcgaatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 17939177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1074139 - 1073801
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  1074139 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 1074040  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  1074039 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 1073940  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               |||||    
T  1073939 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 1073840  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1073839 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 1073801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18599862 - 18599524
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  18599862 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 18599763  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18599762 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 18599663  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               |||||    
T  18599662 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 18599563  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18599562 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 18599524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 11946345 - 11946007
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11946345 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcagaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 11946246  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  11946245 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatagtaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 11946146  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttc 293  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               |||||    
T  11946145 catttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 11946046  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11946045 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 11946007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14888813 - 14888475
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||    
T  14888813 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttcattggtcaacggggtgcatat 14888714  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14888713 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 14888614  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               |||||    
T  14888613 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 14888514  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14888513 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 14888475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 7222115 - 7222398
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  7222115 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcgtaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 7222214  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  7222215 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagagaaattagaagtcatgctgcattttctttaacttaaaatcagttatgcta 7222314  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7222315 cctttattttataaattatatgtaactgtattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 7222398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 332
Target Start/End: Original strand, 34855327 - 34855664
Alignment:
Q  11 acatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatata 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  34855327 acatcaatgtcaaatgatgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacagggtgcatata 34855426  T
Q  111 atgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtac 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  34855427 atgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctac 34855526  T
Q  211 ctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttct 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               |||||     
T  34855527 ctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcc 34855626  T
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34855627 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 34855664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Original strand, 15275029 - 15275367
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15275029 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatattcacatgcgaaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 15275128  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  15275129 aatgtacattcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 15275228  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttctc------------- 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |                 
T  15275229 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattatactaatattgaacttatttccctgtttagcatttc 15275328  T
Q  296 --aaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15275329 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 15275367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 2520534 - 2520817
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  2520534 gacatcaatgtcaaatggtgttggctatatatgcacatgcggaagagatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 2520633  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  2520634 aatgtacttgcatgcatttatctagactttataggtagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgata 2520733  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2520734 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 2520817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7219740 - 7219456
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  7219740 gacatcaatgtcaaattgtgctagctatatatgccaatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattgatcaacggggtacatat 7219641  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  7219640 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 7219541  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  7219540 cctttattttataaattagatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactattattacagttatttc 7219456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 51 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 11935515 - 11935218
Alignment:
Q  51 gaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagata 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11935515 gaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatgcatgcatttatctagactttatagtaagata 11935416  T
Q  151 ataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacat 250  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11935415 ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacatttattttataaattatatgtaactatattcgcatacat 11935316  T
Q  251 cttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11935315 cttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 11935218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 33322329 - 33322043
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  33322329 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcaaatgtggaagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 33322230  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  33322229 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 33322130  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttctc 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33322129 cctttattttataaattatatgtaactatatctgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttctc 33322043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 332
Target Start/End: Original strand, 4423756 - 4424081
Alignment:
Q  11 acatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatata 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  4423756 acattaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggttaacggggtacatata 4423855  T
Q  111 atgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtac 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  4423856 atgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctac 4423944  T
Q  211 ctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttct 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||               |||||     
T  4423945 ctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacattttatccatgtaaata-gcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcc 4424043  T
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424044 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 4424081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 249283 - 249567
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  249283 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 249382  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  249383 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 249482  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  249483 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttc 249567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12580672 - 12580388
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||    
T  12580672 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaatggggtacatat 12580573  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  12580572 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 12580473  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12580472 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttc 12580388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13457588 - 13457350
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  13457588 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 13457489  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||    
T  13457488 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 13457390  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaataca 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13457389 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 13457350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 34320463 - 34320747
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  34320463 gacatcaatgtcaaatggtgctagatatagatgcacaagcgggagtgatgtttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 34320562  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  34320563 aattcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaacatatattagaagtcataatacattttctttatcttaaaatcagttatgcta 34320662  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||| ||||||||||| |||  ||||||||    
T  34320663 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataaatctcatccatgttaatatgtattagactaatgttgttgttatttc 34320747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 25532636 - 25532908
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  25532636 gacatcaatgtcaaatggtgctatctatacatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 25532735  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||  |||            |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  25532736 aatgcacatgaatgcatttatctagcattt------------taggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 25532823  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25532824 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 25532908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 33978344 - 33978617
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||    
T  33978344 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaataatgttaattggtcaatggggtacatat 33978443  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  33978444 aatgcacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggaagataaattagaagtcatggtacattttatttagcttaaaatcagttatgtta 33978532  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  33978533 ccttcattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcatcatactaatattacaattatttc 33978617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 295
Target Start/End: Original strand, 1931420 - 1931690
Alignment:
Q  16 aatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataatgta 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| || |  | || |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||  |    
T  1931420 aatgtcaaatgatgctagctatagatgcccatgcaggagcgatgtttaatttccgtttgcttcaacaatgttaattagccaacggggtacatataatcca 1931519  T
Q  116 catgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtaccttta 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          ||||| ||||||||    
T  1931520 catgcatgcatttatctagactttataggaagctaataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagc----------ttatgctaccttta 1931609  T
Q  216 tttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttctc 295  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1931610 ttttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttctc 1931690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 9979924 - 9979651
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  9979924 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 9979825  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||           |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  9979824 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataa-----------attaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 9979736  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9979735 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 9979651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 24445351 - 24445624
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  24445351 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 24445450  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||           ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  24445451 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttagg-----------aagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 24445539  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24445540 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 24445624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22374728 - 22374434
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  22374728 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcagaagtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggaacatat 22374629  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaat---caattatg 206  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||   ||  |||     
T  22374628 aatatacatgcatgcatttatctagacttt-taagaagataataagaagataaattagaagtcatgctacattttctttagactaatattcgcatatat- 22374531  T
Q  207 gtacct-----ttatttaata-----aattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||| ||     |||||| |||     |  |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22374530 gtaactataaattattttatagttacatatatatgtaactatattcgcatatatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 22374434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 1219948 - 1220215
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  1219948 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 1220047  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| ||||            |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  1220048 aatgcacatgaatgcatttatctagccttt-----------ttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 1220136  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |      ||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1220137 cctttattttataaattatatgtaactatattcgca------ttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 1220215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 1080467 - 1080374
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggt 103  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1080467 gacatcaatgtcaaatggtgttggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggt 1080374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 245 - 332
Target Start/End: Original strand, 4424093 - 4424196
Alignment:
Q  245 atacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaa 328  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424093 atacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcttgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaa 4424192  T
Q  329 gcgc 332  Q
    ||||    
T  4424193 gcgc 4424196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 289 - 354
Target Start/End: Original strand, 17939188 - 17939253
Alignment:
Q  289 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcnnnnnnntcactatcattgatg 354  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  17939188 atttctcaaatgatgtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaagcaatcactatcattgatg 17939253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 329
Target Start/End: Original strand, 2520835 - 2520869
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaag 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2520835 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaag 2520869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22374416 - 22374382
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaag 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22374416 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaag 22374382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 249584 - 249621
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  249584 caaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 249621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 1220232 - 1220269
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1220232 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 1220269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 9979634 - 9979597
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9979634 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 9979597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12580371 - 12580334
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12580371 caaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 12580334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 24445641 - 24445678
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24445641 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 24445678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 25532925 - 25532962
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25532925 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 25532962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 33978634 - 33978671
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33978634 caaacgaggtgtcaagaataattctgaaaggaaagcgc 33978671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 34320764 - 34320801
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34320764 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 34320801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 329
Target Start/End: Original strand, 1931705 - 1931739
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaag 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1931705 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaag 1931739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 7222416 - 7222453
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7222416 caaacaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgc 7222453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 33322028 - 33321991
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  33322028 caaacgaggtgtcaagaacaattataaaaggaaagcgc 33321991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 300 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 7219434 - 7219406
Alignment:
Q  300 gaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaa 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7219434 gaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaa 7219406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Original strand, 18813614 - 18813952
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18813614 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 18813713  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18813714 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 18813813  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               |||||    
T  18813814 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 18813913  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813914 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 18813952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Original strand, 34686982 - 34687320
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  34686982 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 34687081  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  34687082 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 34687181  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               |||||    
T  34687182 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 34687281  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34687282 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 34687320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41830904 - 41830566
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  41830904 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 41830805  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  41830804 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 41830705  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               |||||    
T  41830704 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 41830605  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41830604 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 41830566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 52522423 - 52522085
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  52522423 gacatcaatgttaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttagttggtcaacggggtacatat 52522324  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52522323 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcaattatgcta 52522224  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||               |||||    
T  52522223 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatactgcagttattttcctatttagcatttc 52522124  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52522123 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 52522085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38846079 - 38845796
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  38846079 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacgtgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 38845980  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  38845979 aatgtacatgcatgcgtttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagtcatgcta 38845880  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38845879 cctttattttataaattatatgtaaatatattcaaatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 38845796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Original strand, 31619084 - 31619422
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  31619084 gacatcaatgtcaaatgatgccagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 31619183  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  31619184 aatgcacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 31619283  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||               |||||    
T  31619284 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatatgcattaaactaatattgcagttatttttctgtttggcatttc 31619383  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31619384 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 31619422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 41963785 - 41963502
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||    
T  41963785 gacatcaatgtcaaatggtaccggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaatggggtgcatat 41963686  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  41963685 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataagaggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttacgcta 41963586  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41963585 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattatactaatattgcagttattt 41963502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28566572 - 28566291
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  28566572 gacatcaatgtcaaatggtgttagctataaatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacagggtacatat 28566473  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  28566472 aatccacatgcatgcatatatctagactttataggaatataataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 28566373  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttat 290  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28566372 ccttcattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttat 28566291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Original strand, 34691520 - 34691848
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34691520 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgaagcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 34691619  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  34691620 aatgtacacgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcgtgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 34691719  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttc 293  Q
    ||||||||| |||          ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               |||||    
T  34691720 cctttattttata----------aactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcatatttagcatttc 34691809  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34691810 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 34691848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 290
Target Start/End: Original strand, 12713872 - 12714153
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||| |||||    
T  12713872 gacatcaatgtcaaatggtgttagctataaatgcacatgcaggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacaaggtgcatat 12713971  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||| ||    
T  12713972 aatccacatgcatgcattaatctagactttataggaatataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttttttaacttaaaatcagttatgata 12714071  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttat 290  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12714072 ccttcattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttat 12714153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 293
Target Start/End: Original strand, 48339728 - 48340008
Alignment:
Q  19 gtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataatgtacat 118  Q
    |||||||  |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  48339728 gtcaaattatgctagctatatatgcccatgcggaagtgatgcttaatttctatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacgaggtacatataatgtacat 48339827  T
Q  119 gcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacctttattt 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  48339828 gcatgcatttatctagactttatattaagataataggaagataaattagaaatcatggtgcattttctttaacttaaaatcagttatgatacctttattt 48339927  T
Q  219 -----aataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
         | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48339928 tataaattaaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttc 48340008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 18111113 - 18111351
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  18111113 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 18111212  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||    
T  18111213 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 18111311  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaataca 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18111312 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 18111351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43255408 - 43255170
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  43255408 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 43255309  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||    
T  43255308 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 43255210  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaataca 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43255209 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 43255170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 50395822 - 50395584
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  50395822 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 50395723  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||    
T  50395722 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 50395624  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaataca 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50395623 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 50395584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10695044 - 10694760
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||    
T  10695044 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtaatgcttagtttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgaggttcatat 10694945  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | | ||||| ||    
T  10694944 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagatcaattagaggtcatgatacattttctttagcttaaagtaagttatgcta 10694845  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10694844 catttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 10694760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13663257 - 13662976
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||    
T  13663257 gacatcaatgtaaaatggtgttagctataaatgcgcatgcaggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacgaggtacatat 13663158  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  13663157 aatccacatgcatgcatttatctagattttataggaatataataggacgatacattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 13663058  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttat 290  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13663057 ccttcattttataaattatatgtaactatattaacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttat 13662976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 52309229 - 52309513
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  52309229 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttgcatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 52309328  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| | |||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  52309329 aatgcacatgaatgcatttacctagccttcttaagaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagtcatgcta 52309428  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  52309429 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatatgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 52309513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 15314656 - 15314929
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  15314656 gacatcaatgtcaaatggtgatagctataaatgcaaatgaaggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatat 15314755  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||||||||||           ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15314756 aatccacatgcatgcatttatctagactttatag-----------gaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 15314844  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15314845 ccttcattttataaattatatgtaactatatttgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttc 15314929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 29841542 - 29841268
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  || | |||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||| |||| |||||    
T  29841542 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcggtgcttaatttccatttgtttcaacgatattagttggtcaacggggttcatat 29841443  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  29841442 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttctttatcttaaaatcagttatgcta 29841343  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattg 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  29841342 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattg 29841268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 283
Target Start/End: Original strand, 42681785 - 42682059
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| || | |||||    
T  42681785 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaataatattagttggtcaacgggattcatat 42681884  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  42681885 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 42681984  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattg 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  42681985 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacattttatccatgttaatatccattagactaatattg 42682059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 4891524 - 4891797
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  4891524 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 4891623  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||           ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  4891624 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttagg-----------aagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 4891712  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4891713 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 4891797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29186963 - 29186690
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  29186963 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 29186864  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||           |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  29186863 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataa-----------attaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 29186775  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  29186774 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 29186690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 51966577 - 51966304
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | || |||||    
T  51966577 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagagatgcttaatttccatttgtatcaacaatgttaattggtcaacggagttcatat 51966478  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51966477 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataa-----------attagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcaattatgcta 51966389  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||  ||||||||    
T  51966388 cctatattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgtattaaactaatattgttgttatttc 51966304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 33361133 - 33361400
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  33361133 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 33361232  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| ||||            |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  33361233 aatgcacatgaatgcatttatctagccttt-----------ttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 33361321  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |      ||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33361322 cctttattttataaattatatgtaactatattcgca------ttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 33361400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 50560448 - 50560721
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  50560448 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 50560547  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||| ||| |||||| |||| ||||           |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  50560548 aatgcacatgaatgaatttatctagcctttttagg-----------aagataaattagaagtcatgatacattttatttagcttaaaatcagttatgcta 50560636  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  50560637 tctttattttataaattatatgtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatatgcactagactaatattgttgttatttc 50560721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 84
Target Start/End: Original strand, 10762949 - 10763023
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaat 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10762949 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaat 10763023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 330
Target Start/End: Original strand, 52309524 - 52309565
Alignment:
Q  289 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagc 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52309524 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagc 52309565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29841247 - 29841204
Alignment:
Q  289 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  29841247 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgc 29841204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41963490 - 41963447
Alignment:
Q  289 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41963490 atttctcaaacggggtgtgaagaacaattctgaaaggaaagcgc 41963447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 4891814 - 4891851
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4891814 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 4891851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 15314946 - 15314983
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15314946 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgc 15314983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29186673 - 29186636
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29186673 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 29186636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 38845778 - 38845741
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38845778 caaacgaggtgtcaagaataattctgaaaggaaagcgc 38845741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 50560738 - 50560775
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50560738 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 50560775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 289 - 332
Target Start/End: Original strand, 10763072 - 10763115
Alignment:
Q  289 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10763072 atttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgc 10763115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 289 - 332
Target Start/End: Original strand, 42682080 - 42682123
Alignment:
Q  289 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  42682080 atttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgc 42682123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 289 - 328
Target Start/End: Original strand, 48340019 - 48340058
Alignment:
Q  289 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaa 328  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48340019 atttctcaaatgaggtgtcaagaacaattatgaaaggaaa 48340058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 33361417 - 33361454
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33361417 caaatgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 33361454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 55)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14079686 - 14079348
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  14079686 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 14079587  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14079586 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 14079487  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               |||||    
T  14079486 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 14079387  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14079386 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 14079348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 33425114 - 33424831
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  33425114 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcagaagtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 33425015  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  33425014 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatccgttatgcta 33424915  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcc-agtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33424914 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccgtgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 33424831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 38961306 - 38961589
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  38961306 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcatatgcgaaagtgatgtttaattttcatttgtttcaacaatgttaattgatcaacggggtacatat 38961405  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  38961406 aatctacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctatattttatttagcttaaaatcagttatgcta 38961505  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961506 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 38961589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Original strand, 30825583 - 30825920
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  30825583 gacatcaatg-caaatggtgttggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 30825681  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  30825682 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaggataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 30825781  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               ||||     
T  30825782 cctttattttataaattatatgtaactatatttgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttt 30825881  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30825882 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 30825920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 38991651 - 38991933
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  38991651 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcatatgcgaaagtgatgtttaattttcatttgtttcaacaatgttaattgatcaacggggtacatat 38991750  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  38991751 aatctacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctatattttatttagcttaaaatcagttatgcta 38991850  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38991851 cctttattt-ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 38991933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6478345 - 6478065
Alignment:
Q  13 atcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataat 112  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  6478345 atcaatgtcaaatggtggcagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaacttccatttgttttaacaatattaattgatcaacggggtacatataat 6478246  T
Q  113 gtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacct 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  6478245 gtacatgcatgcatttatctagactttatgggaagataataggaaaataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacat 6478146  T
Q  213 ttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6478145 ttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 6478065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 41628033 - 41628305
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41628033 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcgtaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 41628132  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||           |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  41628133 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggaagataaattagaagtcctgctacattttatttagcttaaaatcagttatgcta 41628221  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41628222 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcatttattt 41628305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20663800 - 20663516
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20663800 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 20663701  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  20663700 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 20663601  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20663600 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttc 20663516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 30549163 - 30548879
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  30549163 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 30549064  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  30549063 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 30548964  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30548963 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttc 30548879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 41906990 - 41907273
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||    
T  41906990 gacatcaatgtcaaatggtgctcgctatagatgcacatgcggaagcgatgcttaattttcgtttgtttcaacaatgtta-ttggccaacggggtacatat 41907088  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  41907089 aatccacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 41907188  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41907189 ccttcattttataaattatatgtaattatatttgtatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttc 41907273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 44213916 - 44213633
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtgga-agtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacata 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  44213916 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcaca--tggagagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacata 44213819  T
Q  109 taatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggt 208  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  44213818 taatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtt 44213719  T
Q  209 acctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  44213718 accttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttc 44213633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 19247244 - 19247527
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || | |||||    
T  19247244 gacatcaatgtcaaatggtgatagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtaaacgggattcatat 19247343  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  19247344 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataacaggaagataaattaaaagtcataatacattttctttagcttaaaattagttatgcta 19247443  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19247444 cctttattt-atgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 19247527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 19320428 - 19320711
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || | |||||    
T  19320428 gacatcaatgtcaaatggtgatagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtaaacgggattcatat 19320527  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  19320528 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataacaggaagataaattaaaagtcataatacattttctttagcttaaaattagttatgcta 19320627  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19320628 cctttattt-atgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 19320711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 53 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23627157 - 23626916
Alignment:
Q  53 agtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataat 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  23627157 agtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatataatcaacatgcatgcatttatctagaatttataggaagatagt 23627058  T
Q  153 aggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatct 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23627057 aggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatctatcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcgcatacatct 23626958  T
Q  253 tatccagta-aatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23626957 tatccataataatatgcattagactaatattgcagttatttc 23626916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23967244 - 23967006
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  23967244 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 23967145  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||    
T  23967144 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 23967046  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaataca 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23967045 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 23967006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 37029101 - 37029339
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  37029101 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 37029200  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||    
T  37029201 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 37029299  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaataca 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37029300 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 37029339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 42061518 - 42061280
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  42061518 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 42061419  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||    
T  42061418 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 42061320  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaataca 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42061319 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 42061280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 44939705 - 44939943
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  44939705 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 44939804  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||    
T  44939805 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 44939903  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaataca 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44939904 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 44939943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36602924 - 36602722
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  36602924 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 36602825  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  36602824 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataataggaagataaattagaagtcatgttacattttctgtagcttaaaatcagttatgcta 36602725  T
Q  210 cct 212  Q
    |||    
T  36602724 cct 36602722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 42811806 - 42811453
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  42811806 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaacgttaattggtcaacggggtacatat 42811707  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataa--tag----gaagataaatt----------agaagtcatgctacattttctttagctt 193  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||     | | || |||          ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  42811706 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctacatttttttttgaaagaagtcat-ctatattttctttagctt 42811608  T
Q  194 aaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---- 288  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        
T  42811607 aaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 42811508  T
Q  289 -----------atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
               ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42811507 tcttgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 42811453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 44383796 - 44383512
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  44383796 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 44383697  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| || ||| | || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  44383696 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaagaaaaaaaaaagaagataaattagaagtcatgatacatgttctttaacttaaaatcagttatgcta 44383597  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  44383596 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttgatatgcattagactaatattgttgttatttc 44383512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 12759605 - 12759890
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccat---ttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtaca 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||    
T  12759605 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccataatttgtttcaacaattttaattggttaac-gggttca 12759703  T
Q  107 tataatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatg 206  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12759704 tataatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacaatttttttagcttaaaatcaattatg 12759803  T
Q  207 gtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  12759804 ctacctttattttataaattatatataactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgaattagactaatattgttgttattt 12759890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 41155770 - 41156054
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||  | || |||||    
T  41155770 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcatatgcttgagtgatgcttaatttctatttgtttcaacaattttatttggtcaatggtgttcatat 41155869  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  41155870 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaattcagttatgtta 41155969  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  41155970 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatgttgttgttatttc 41156054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19396221 - 19396015
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  19396221 gacatcaatgtaaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaatggagtacatat 19396122  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  19396121 aatgtacatgcatacatttatctagactttatacgaagataattggaagataaattagacgtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttaagcta 19396022  T
Q  210 cctttat 216  Q
    |||||||    
T  19396021 cctttat 19396015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 39203773 - 39204045
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||    
T  39203773 gacatcaatgtcaaatggttctagctataaatgcgcatgcgggagtgaagcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggcgaacggggtacatat 39203872  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||  |||| |||||||| |||||||||||||||           |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39203873 aatccacattcatgcatttatctagactttatag-----------gaagataaattagaagtcgtggtacattttctttagcttaaaatcaattatgcta 39203961  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    | || |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  39203962 cattcattttataaattttatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgtcgttattt 39204045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 41976600 - 41976874
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||    
T  41976600 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacattgttaattggtcaacggggttcatat 41976699  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattg-atctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggt 208  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||| |||| ||||           |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  41976700 aatgcacatgaatgcattttatttagcctttttagg-----------aagataaattagaagtcattgtacattttctttagcttaaaatcagttatgct 41976788  T
Q  209 acctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41976789 acctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 41976874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6301330 - 6301103
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  6301330 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 6301231  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||    
T  6301230 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaag-----------ataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 6301143  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaataca 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6301142 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 6301103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Original strand, 29433199 - 29433454
Alignment:
Q  22 aaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataatgtacatgca 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||  |||||||    
T  29433199 aaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacagggtacatgtaatccacatgca 29433298  T
Q  122 tgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaat 221  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||    
T  29433299 tgcatttatcttaactttataggaagataataggaa--------agaagtcatgttacattttctttagcttaaaatctgttatgctaccttcattttat 29433390  T
Q  222 aaattatatgtaactatattcgaatacatcttatccagtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||        || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29433391 aaattatatgtaactttattcgcatacat--------gttaatatgcattagactaatattgcagttatttc 29433454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 45294905 - 45294767
Alignment:
Q  13 atcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataat 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||    
T  45294905 atcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcaaatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaatggggttcatataat 45294806  T
Q  113 gtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataa 151  Q
    | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  45294805 gcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataa 45294767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 86 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22343271 - 22343102
Alignment:
Q  86 ttaatttgtcaactgggtacatataatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttc 185  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||           ||||||||||||| |||||||||    
T  22343271 ttaattggtcaacggggtacatataatgtgcatacatgcatttatctagattttataggaagataa-----------attagaagtcatgttacattttc 22343183  T
Q  186 tttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatg 267  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22343182 tttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaac--tattcgcatacatcttatccatgtaaatatg 22343102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 86 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22354931 - 22354762
Alignment:
Q  86 ttaatttgtcaactgggtacatataatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttc 185  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||           ||||||||||||| |||||||||    
T  22354931 ttaattggtcaacggggtacatataatgtgcatacatgcatttatctagattttataggaagataa-----------attagaagtcatgttacattttc 22354843  T
Q  186 tttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatg 267  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22354842 tttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaac--tattcgcatacatcttatccatgtaaatatg 22354762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 36598197 - 36598112
Alignment:
Q  208 tacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36598197 tacctttattttataaattatatgtaattatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 36598112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12250878 - 12250766
Alignment:
Q  182 tttctttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaata 280  Q
    |||||||||||||||||   | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12250878 tttctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatatgcattagactaata 12250779  T
Q  281 ttgcagttatttc 293  Q
    |||||||||||||    
T  12250778 ttgcagttatttc 12250766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 293
Target Start/End: Original strand, 39444329 - 39444441
Alignment:
Q  182 tttctttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaata 280  Q
    |||||||||||||||||   | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39444329 tttctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatatgcattagactaata 39444428  T
Q  281 ttgcagttatttc 293  Q
    |||||||||||||    
T  39444429 ttgcagttatttc 39444441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 22345641 - 22345560
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatt 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22345641 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatacacatacggaagtgatgcttaatttccatttgtctgaacaatgttaatt 22345560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 22357301 - 22357220
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatt 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22357301 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatacacatacggaagtgatgcttaatttccatttgtctgaacaatgttaatt 22357220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 45294752 - 45294670
Alignment:
Q  212 tttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45294752 tttattttatgaattatatgtaactatattcacatacattttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 45294670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33424813 - 33424777
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcg 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33424813 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcg 33424777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 36598094 - 36598060
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaag 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36598094 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaag 36598060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6478047 - 6478010
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6478047 caaatgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 6478010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20663499 - 20663462
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20663499 caaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 20663462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 30548862 - 30548825
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30548862 caaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 30548825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 38961607 - 38961644
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38961607 caaacgaggtgtcaagaacaattttgaaaggaaagcgc 38961644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 38991951 - 38991988
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38991951 caaacgaggtgtcaagaacaattttgaaaggaaagcgc 38991988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 328
Target Start/End: Original strand, 41628323 - 41628356
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41628323 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaa 41628356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 41907290 - 41907327
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41907290 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgc 41907327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 44213616 - 44213579
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44213616 caaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 44213579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 45294132 - 45294095
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45294132 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 45294095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 289 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22342373 - 22342330
Alignment:
Q  289 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22342373 atttcccaaacgaggtgtcaagaagaattctgaatggaaagcgc 22342330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 12759908 - 12759945
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  12759908 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgc 12759945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 330
Target Start/End: Original strand, 19247546 - 19247579
Alignment:
Q  297 aacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagc 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19247546 aacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagc 19247579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 330
Target Start/End: Original strand, 19320730 - 19320763
Alignment:
Q  297 aacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagc 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19320730 aacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagc 19320763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22342414 - 22342385
Alignment:
Q  263 atatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22342414 atatgcattagactaatattgcagttattt 22342385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23626899 - 23626862
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23626899 caaacaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgc 23626862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 41156071 - 41156108
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41156071 caaacgcggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 41156108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11326510 - 11326227
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11326510 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 11326411  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  11326410 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 11326311  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11326310 cctttattttataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatccatgtaaatatgcattagagtaatattgtagttattt 11326227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31369885 - 31369547
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  31369885 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 31369786  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  31369785 aatgtacatgcatgcatttatctagactttagaggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaataagttatgcta 31369686  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               |||||    
T  31369685 cctttattttataaattatacgtaactatattcatatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 31369586  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31369585 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 31369547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 35088703 - 35088423
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  35088703 gacatcaatgtcaattggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 35088604  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  35088603 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt---tgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 35088507  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35088506 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 35088423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 49112461 - 49112744
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||    
T  49112461 gacatcaatgccagatggtgctggctatatatgcacatgcgaaagtgatgcataatttccatttgtttcaacaatgttgtttggtcaacggggtacatat 49112560  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  49112561 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataagaagataaattagaattcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 49112660  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49112661 cctttattttataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 49112744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 52854310 - 52854027
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  52854310 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatccacatgcagaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgtggtacatat 52854211  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  52854210 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagatgataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaattagttatgata 52854111  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  52854110 tctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatattcattatactaatattgcagttattt 52854027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 48976071 - 48976354
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  48976071 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatatatgcacatgcgaaagtgatgcataattttcatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatat 48976170  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  48976171 aatgtacatgtatgcatttatctatactttataggaagataatatgaagataaattagaagtcaagctacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 48976270  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48976271 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 48976354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 23192848 - 23193132
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  23192848 gacatcaatgtcaaattgtgctagctatatatgcccatgcgaaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgggatacatat 23192947  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  23192948 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 23193047  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23193048 cctttattataaaaattaaatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttc 23193132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 51247759 - 51248031
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  51247759 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacgtgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 51247858  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  51247859 aatgtacatgcgtgcatttatctagactttatag-----------gaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 51247947  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51247948 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 51248031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 35436368 - 35436652
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | || || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  35436368 gacatcaatgtcaactggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttttgtttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatat 35436467  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  35436468 aatccacatgcatgcatttatctagactttataggaagctaataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 35436567  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35436568 ccttcattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttc 35436652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 52841391 - 52841118
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  52841391 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcgaaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 52841292  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |    
T  52841291 aatgtacatgcatgcatttatctggactttgtaggaag-----------ataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcggttatgcca 52841203  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52841202 cctttatttcataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagacttatattgcagttatttc 52841118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21700427 - 21700155
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  21700427 gacatcaatgtcaaatggtgctaactatatatgcacatgcagaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacagggtaaatat 21700328  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21700327 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaag-----------ataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 21700239  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21700238 cctttattttataaataatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactgatattccagttattt 21700155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 331
Target Start/End: Original strand, 50740750 - 50741076
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||| |||||    
T  50740750 gacatcaatgtcaaatggtggtagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaatggggttcatat 50740849  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  50740850 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataa-----------attataagtcatgctacattttttttagcttaaaatcagttatggta 50740938  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt---------------c 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||               |    
T  50740939 cctttatttaataaattatatgtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctttttagcatttc 50741038  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcg 331  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50741039 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcg 50741076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 50772104 - 50771832
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||| |||||    
T  50772104 gacatcaatgtcaaatggtggtagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaatggggtgcatat 50772005  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  50772004 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataa-----------attataagtcatgctacattttttttagcttaaaatcagttatggta 50771916  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50771915 cctttatttaataaattatatgtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 50771832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 36168319 - 36168036
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||    
T  36168319 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccgtttgtttcaacaatgttaattggccaacagggtgcatat 36168220  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  36168219 aatccacatgcatgcatttttctagactttataggaagctaataagaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgata 36168120  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36168119 ccttgattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatacgcattagactaatattgcagttattt 36168036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11598832 - 11598546
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  11598832 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcaggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 11598733  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| | |||  |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  11598732 aatgcatatgagtgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcaattaagata 11598633  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttctc 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11598632 cctttattttataaattatatgtaactatattagcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttctc 11598546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6104983 - 6104711
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||    
T  6104983 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatatatggacatgcggaagtgatacttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtctacggggtgcatat 6104884  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  6104883 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 6104795  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6104794 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatgcatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 6104711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 295
Target Start/End: Original strand, 8242095 - 8242372
Alignment:
Q  13 atcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataat 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  8242095 atcaatgtcaaatggtgctagcaatagatgcacatgcgagagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggttaacggggtacatataat 8242194  T
Q  113 gtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacct 212  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||     | |||||    
T  8242195 gcacatgcatgcatttatctagactctataagaagataagaggaagataaattagaagtcatgataca-tttctttagcttaaaatca-----gctacct 8242288  T
Q  213 ttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttctc 295  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8242289 ttattttataaattatatgtaactacattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttctc 8242372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11951843 - 11951572
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||    
T  11951843 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatattaattggtcaacggggttcatat 11951744  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  11951743 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaagaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttgaaatcagttatgcta 11951644  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaata 280  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  11951643 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaata 11951572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 55295647 - 55295363
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| | || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  55295647 gacatcattgtcaaatggtgctagctataaattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaatttgtcaacggggttcatat 55295548  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| |||||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  55295547 aatgcacatgaatgcatttttctagccttttcaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaataagttatgcta 55295448  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  55295447 cctttcttttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 55295363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5253110 - 5252872
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  5253110 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 5253011  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||    
T  5253010 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 5252912  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaataca 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5252911 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 5252872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 283
Target Start/End: Original strand, 22477094 - 22477368
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| | || |||||    
T  22477094 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatattagttggtcaacggagttcatat 22477193  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22477194 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 22477293  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattg 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22477294 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattg 22477368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 290
Target Start/End: Original strand, 16495280 - 16495561
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||    
T  16495280 gacatcaatgtaaaatggtgttagctataaatgcgcatgcaggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacgaggtacatat 16495379  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  16495380 aatccacatgcatgcatttatctagattttataggaatataataggacgatacattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 16495479  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttat 290  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495480 ccttcattttataaattatatgtaactatattaacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttat 16495561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 44073584 - 44073305
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  44073584 gacatcaatatcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacgaggtacatat 44073485  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||     ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  44073484 aatgcacatgcatgcatttctctagactt-----gaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 44073390  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  44073389 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttc 44073305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 918068 - 918341
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||    
T  918068 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaatggggtacatat 918167  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  918168 aatgcacatgcatgcatttctctagacttt-----------ataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 918256  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  918257 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttc 918341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 40827878 - 40827619
Alignment:
Q  35 tatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataatgtacatgcatgcattgatctag 134  Q
    |||| ||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  40827878 tatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttagttggtcaacgagtttcatataatgcacatgaatgcatttatctag 40827779  T
Q  135 actttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaa 234  Q
     |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  40827778 ccttttttggaagataataggaagataaattagaagtgatgatacattttctttagcttaaaatcagttatactacctttattttataaattatatgtaa 40827679  T
Q  235 ctatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  40827678 ctatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagattaatattgttgttatttc 40827619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Original strand, 11382562 - 11382839
Alignment:
Q  12 catcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  11382562 catcaaagtcaaatggtgctagctatagatgtacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataa 11382661  T
Q  112 tgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacc 211  Q
    |  ||||||||| ||| || | |||||||||||||| |     || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  11382662 tccacatgcatggatttatatggactttataggaagct-----gaggataaattacaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttacgttacc 11382756  T
Q  212 tttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11382757 ttcattttataaattatatataactatattcgcagacattttatccatgttaatgtgcattagactaatattgcagtcatttc 11382839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39797198 - 39796971
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  39797198 gacattaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 39797099  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||    
T  39797098 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaag-----------ataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 39797011  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaataca 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39797010 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 39796971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 9879781 - 9879550
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  9879781 gacattaatgtcaaatgatgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggagtacatat 9879682  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||           |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  9879681 aatccacatgcatgcatttatctagactttataggaag-----------ataaattaaaagtgatgatacattttctttagtttaaaatcaattatgcta 9879593  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatct 252  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  9879592 ccttcattttataaattatatgtaattatattcgcatacatct 9879550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19894223 - 19893953
Alignment:
Q  13 atcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataat 112  Q
    |||| |||||||||||  |||||| | ||||||| | || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  19894223 atcattgtcaaatggtcttagctaaagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtctacggggttcatataat 19894124  T
Q  113 gtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacct 212  Q
    | ||||| ||||||| |||||| || | |||||||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19894123 gcacatgaatgcatttatctagcctatttaggaagataa-----------attagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacct 19894035  T
Q  213 ttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  19894034 ttattttataagttatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagagtaatattgttgttatttc 19893953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 54793822 - 54793665
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  54793822 gacatcaatgtcaaatggtgttagctataaatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaac-gggtacatat 54793724  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattaga 168  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54793723 aatccacatgcatgcatttatctagactttataggaatataataggaagataaattaga 54793665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 28164954 - 28164813
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||  ||| |||||    
T  28164954 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgagggagtgatgcttaatttccattcgtttcaaaaatgttaattgatcaacgaggttcatat 28164855  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataa 151  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28164854 aatgtgcatgcatgcatttatctagactttataggaagataa 28164813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 127
Target Start/End: Original strand, 54512345 - 54512462
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  54512345 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttctaattgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacataa 54512444  T
Q  110 aatgtacatgcatgcatt 127  Q
    ||||||||||||||||||    
T  54512445 aatgtacatgcatgcatt 54512462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 165 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 48521736 - 48521606
Alignment:
Q  165 tagaagtcatgctacattttctttagcttaaaa-tcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaa 262  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |    
T  48521736 tagaagtcatgatacattttctttagcttaaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgtta 48521637  T
Q  263 atatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  48521636 atatgcattagactaatattgttgttatttc 48521606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 2845651 - 2845554
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  2845651 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcatcaatgttaattggtcaaccgggtacat 2845554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 177 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 2845558 - 2845442
Alignment:
Q  177 tacattttctttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagac 275  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||  || || ||||||||||||||    
T  2845558 tacatttgctttagcttaaaatcaattatgctacctttattttataaattatatgtaactatatttacatacaccttacacatgttaatatgcattagac 2845459  T
Q  276 taatattgcagttattt 292  Q
    |||||||||||||||||    
T  2845458 taatattgcagttattt 2845442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 11952146 - 11952053
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  11952146 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatattaattggtcaacggggt 11952053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 54793635 - 54793552
Alignment:
Q  208 tacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttat 290  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54793635 taccttcattttataaattatatgtaattatattcacatacatcttatccatgttaatatgcatcagactaatattgcagttat 54793552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 332
Target Start/End: Original strand, 8242381 - 8242424
Alignment:
Q  289 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8242381 atttctcaaacgaggtgttaagaacaattctgaaaggaaagcgc 8242424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 52841107 - 52841068
Alignment:
Q  289 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52841107 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaa 52841068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 50771814 - 50771778
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcg 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50771814 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcg 50771778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21700143 - 21700100
Alignment:
Q  289 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21700143 atttctcaaacgacgtgtcaagaacaattttgaaaggaaagcgc 21700100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6104693 - 6104656
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6104693 caaacgagttgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 6104656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 23193149 - 23193186
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23193149 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgc 23193186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 35088405 - 35088368
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35088405 caaacgaggtgtcaagaacaattatgaaaggaaagcgc 35088368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36168018 - 36167981
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36168018 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgc 36167981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 44073288 - 44073251
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44073288 caaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 44073251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 55295346 - 55295309
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55295346 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 55295309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Original strand, 48976372 - 48976408
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcg 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48976372 caaacgaggtgtcaagaacaattatgaaaggaaagcg 48976408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Original strand, 54512468 - 54512504
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcg 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54512468 caaacaaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcg 54512504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 294 - 329
Target Start/End: Original strand, 49112761 - 49112796
Alignment:
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaag 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49112761 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaag 49112796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 332
Target Start/End: Original strand, 918366 - 918395
Alignment:
Q  303 gtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  918366 gtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 918395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11326209 - 11326176
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11326209 caaacgaggtgtcaagaacaattttgaaaggaaa 11326176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 40827602 - 40827565
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  40827602 caaacgaggtgtcatgaacaattctaaaaggaaagcgc 40827565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 48521589 - 48521552
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  48521589 caaacgaggtgtcaagaagaattctaaaaggaaagcgc 48521552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 52854009 - 52853972
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52854009 caaacgacgtgtcaagaacaattttgaaaggaaagcgc 52853972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 54793532 - 54793495
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  54793532 caaacgaggtgttaagaacaattctgaaagaaaagcgc 54793495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2845423 - 2845387
Alignment:
Q  296 aaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2845423 aaacgaggtgtcaataacaattccgaaaggaaagcgc 2845387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Original strand, 9315 - 9653
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  9315 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 9414  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  9415 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 9514  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               |||||    
T  9515 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 9614  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9615 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 9653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 292
Target Start/End: Original strand, 21029465 - 21029744
Alignment:
Q  14 tcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  21029465 tcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatg 21029564  T
Q  114 tacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacctt 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21029565 tacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcaaactacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctt 21029664  T
Q  214 tatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21029665 tattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattacactaatattgcagttattt 21029744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20996810 - 20996472
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20996810 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcagaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 20996711  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  20996710 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgttacgttttctttagcttaaaatatgttatgcta 20996611  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               |||||    
T  20996610 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 20996511  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20996510 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 20996472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Original strand, 27065255 - 27065593
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27065255 gacatcaatgtcaaatggtgctagctgtatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaataatgttaattggtcaacggggtacatat 27065354  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||    
T  27065355 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataatttagaagtcatgctacattttctttagtttaaaatcagttatacta 27065454  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               |||||    
T  27065455 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattctcctatttagcatttc 27065554  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27065555 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 27065593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 33612006 - 33611723
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33612006 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttctatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 33611907  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  33611906 aatgtacatgcttgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcgtgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 33611807  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33611806 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattatactaatattgcagttattt 33611723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26321941 - 26321603
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||    
T  26321941 gacatcaatgtcaaatgatgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggagtgcatat 26321842  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  26321841 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 26321742  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||               |||||    
T  26321741 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatattcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 26321642  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26321641 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 26321603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 2194518 - 2194801
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  2194518 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatatatgcacatgcggaagtaatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 2194617  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  2194618 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 2194717  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2194718 cctttattttataaattatatataactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 2194801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 7285030 - 7285313
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  7285030 gacatcaacgtcaaatggtgctaactatatatgcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaatggggtacatat 7285129  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7285130 aatgtacatgcatgcatttatctagactttattggaagataataagatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 7285229  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7285230 cctttattttatagattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcaattattt 7285313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Original strand, 30688668 - 30689000
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  30688668 gacatcaatgtcagatggtgctggctatatatgcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 30688767  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  30688768 aatgtacatgcatgcatttatctagaatttataggaagataataggatgataaagtagaagtcaagttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 30688867  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatccagtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttct 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||               |||||     
T  30688868 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatcc-----atatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcc 30688962  T
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30688963 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 30689000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 3151469 - 3151187
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3151469 gacatcaatgtcaaatggagctagctatatgtgcacatgcagaagtgatgcttaatttt-agttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 3151371  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  3151370 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataatatgaagataaattagaagtaatgctacattttctttagcttaaaattagttatgcta 3151271  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3151270 cctttattttataaattatatgtaattatattcgcatatatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgaagttattt 3151187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 37463737 - 37464021
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||    
T  37463737 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaatggggtacatat 37463836  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  37463837 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 37463936  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  37463937 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttc 37464021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 3398007 - 3397721
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  3398007 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcaaaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtaaatat 3397908  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  3397907 a-tgtacatgtatacatttatctagactttataggaagataatgggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 3397809  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaata----catcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3397808 cctttattttataaattatatgtaactatatttgcataagatcatcttatctatgtaaatatgtattagactaatattgcagttattt 3397721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 4881638 - 4881909
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4881638 gacatcaatatcaaatggtgctagctatatatgcacatgcagaagtgatgcttaattttcatttatttcaacaatgttaattggtcaacagggtacatat 4881737  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  4881738 aatatacatgcatgcatttatctagactttatag-----------gaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaagatcagttatgcta 4881826  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4881827 cctttattttataaattatatgtaactatattcg-atacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 4881909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 53 - 293
Target Start/End: Original strand, 9701648 - 9701889
Alignment:
Q  53 agtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataat 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  9701648 agtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatataatctacatgcatgcatttatctagaatttataggaagatagt 9701747  T
Q  153 aggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatct 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9701748 aggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatctatcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcgcatacatct 9701847  T
Q  253 tatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9701848 tatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttc 9701889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 3211063 - 3210780
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||    
T  3211063 gacatcaatgtcaaatggtgctagctataaatgcgcatgcgggagtgaagcttaatttccatttgtttcaacaatattaattggccaac-gggtacatat 3210965  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3210964 aatccacatgcatgcatttatctagactttataggaagataatgggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatgaattatgcta 3210865  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    | || |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3210864 cattcattttataaattacatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgtcgttatttc 3210780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 20349293 - 20349560
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20349293 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 20349392  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||           |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20349393 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggaagataaattataagtcatgctacattttttttagcttaaaatcagttatggta 20349481  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||      | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20349482 cctttatttaataaattatatgtaact------ggatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 20349560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 295
Target Start/End: Original strand, 289961 - 290247
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||    
T  289961 gacatcaatgtaaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttttgtttgtttcaacaatgttaattggccaacgggatacatat 290060  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  290061 aatctacatgcatgcatttacctagactttataggaagctaataggaagataaattagaagtcattgtatattttctttagtttaaaatcagttatgcta 290160  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttctc 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  290161 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatatatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgtagttatttctc 290247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1852783 - 1852513
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1852783 gacatcaatgtcaaatcgtgctagctatatatgcacatgcgaaagtgatacttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacagggtacatat 1852684  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  1852683 aatgtacatgcatacatttatctagactttataggaag-----------ataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 1852595  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||   ||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1852594 cctttattttataaattatatgt--ttatattcgtgtatatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 1852513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12589146 - 12588872
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| |||| |||||    
T  12589146 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaataatattagttggtcaacggggttcatat 12589047  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  12589046 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 12588947  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattg 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||    
T  12588946 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacattttatccatgttaatatccattagattaatattg 12588872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 30141927 - 30142200
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  30141927 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 30142026  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||           |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  30142027 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttagg-----------aagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 30142115  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30142116 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 30142200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 19394842 - 19395079
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||    
T  19394842 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgaggttcatat 19394941  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| | || |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||    
T  19394942 aatgca-atacatgtatttatctagactttataagaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 19395039  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaataca 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19395040 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 19395079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25697378 - 25697106
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  25697378 gacatcattgtaaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 25697279  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  25697278 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataa-----------attagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 25697190  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25697189 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttattt 25697106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 34717014 - 34717287
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  34717014 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 34717113  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||  |||| ||||           ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  34717114 aatgcacatgaatgcatttatctaacctttttagg-----------aagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 34717202  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34717203 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 34717287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 41690700 - 41690973
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  41690700 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 41690799  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||           ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  41690800 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttagg-----------aagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 41690888  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41690889 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatatgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 41690973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 3027813 - 3028010
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  3027813 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttatttcaacaatgttaattggtcaacgtggtacatat 3027912  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||           ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  3027913 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggaagataaattagaagttatgctacattttctatagcttaaaatcagttatgcta 3028001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31296398 - 31296170
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaa-tggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacata 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  31296398 gacatcaatgtcaaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcata 31296299  T
Q  109 taatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggt 208  Q
    ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||||           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | |    
T  31296298 taatgcacatacatgtatttatctaaactttataggaag-----------ataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagct 31296211  T
Q  209 acctttatttaataaattatatgtaactatattcgaataca 249  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31296210 acctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 31296170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 201 - 292
Target Start/End: Original strand, 19447545 - 19447637
Alignment:
Q  201 attatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19447545 attatgctacctttattttataaattatatataactatattcgtatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgtagttattt 19447637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 292
Target Start/End: Original strand, 3028312 - 3028384
Alignment:
Q  221 taaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3028312 taaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgtattggactaatattgcagttattt 3028384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 1852495 - 1852460
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagc 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1852495 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagc 1852460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 332
Target Start/End: Original strand, 3028396 - 3028439
Alignment:
Q  289 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3028396 atttctcaaatgaggtgtcaaaaacaattctgaaaggaaagcgc 3028439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 332
Target Start/End: Original strand, 19447649 - 19447692
Alignment:
Q  289 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19447649 atttctcaaatgagatgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 19447692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 2194819 - 2194856
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2194819 caaacgaagtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 2194856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3151169 - 3151132
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3151169 caaacgaggtgttaagaacaattctgaaaggaaagcgc 3151132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 43
Target Start/End: Original strand, 19447484 - 19447517
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgc 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19447484 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgc 19447517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 20349577 - 20349614
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20349577 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 20349614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 21029762 - 21029799
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21029762 caaacgaggtgtcaagaacaattcttaaaggaaagcgc 21029799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25697088 - 25697051
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25697088 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 25697051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 33611705 - 33611668
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33611705 caaacgaggtgtcaaaaacaattctgaaaggaaagcgc 33611668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 37464038 - 37464075
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37464038 caaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 37464075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 41690990 - 41691027
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41690990 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 41691027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Original strand, 290262 - 290298
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcg 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  290262 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcg 290298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 295 - 330
Target Start/End: Original strand, 4881927 - 4881962
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagc 330  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4881927 caaacgaggcgtcaagaacaattctgaaaggaaagc 4881962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 289 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12588851 - 12588808
Alignment:
Q  289 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  12588851 atttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgc 12588808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3397703 - 3397666
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3397703 caaaagaggtgtcaagaacaattttgaaaggaaagcgc 3397666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 7285331 - 7285368
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7285331 caaacgatatgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 7285368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 9701906 - 9701943
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9701906 caaacaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgc 9701943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 30142217 - 30142254
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  30142217 caaacgaggtttcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 30142254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 34717304 - 34717341
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  34717304 caaacgaggtgttaagaacaattctaaaaggaaagcgc 34717341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 62)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23767311 - 23767028
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  23767311 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 23767212  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  23767211 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagtcatgcta 23767112  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767111 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 23767028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 12 - 292
Target Start/End: Original strand, 5962092 - 5962373
Alignment:
Q  12 catcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5962092 catcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgttttattaatgttaattggtcaacggggtacatataa 5962191  T
Q  112 tgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacc 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5962192 tgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacc 5962291  T
Q  212 tttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5962292 tttattttataaattatatgtaattatattcgcatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 5962373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8926763 - 8926425
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  8926763 gacatcaatgtcaaatggtgctggctataaatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 8926664  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  8926663 aatgtacatgcatgcatttatctagactttacaggaagataataggatgataaattaaaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 8926564  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               |||||    
T  8926563 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctatttagcatttc 8926464  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8926463 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 8926425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 292
Target Start/End: Original strand, 14308324 - 14308604
Alignment:
Q  13 atcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataat 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||    
T  14308324 atcaatgtcaaatggtgctggctatatatacacatgcggaagtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgggttgcatataat 14308423  T
Q  113 gtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacct 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14308424 gtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacct 14308523  T
Q  213 ttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14308524 ttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgttgttattt 14308604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4482072 - 4481788
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4482072 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 4481973  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||  | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  4481972 aatccatatacatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagtttaaaatcaattatgcta 4481873  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4481872 ccttcattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgttaatatgcattaaactaatattgcagttatttc 4481788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 9227093 - 9226809
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  9227093 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcatatgcgggagcgatgcttaatttccgtttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatat 9226994  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  9226993 aatccacatgcatgcatttatctagactttataggaagctaataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 9226894  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9226893 ccttcattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttc 9226809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19034528 - 19034244
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19034528 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 19034429  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  19034428 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 19034329  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19034328 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttc 19034244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 20720108 - 20720392
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20720108 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 20720207  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  20720208 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 20720307  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20720308 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttc 20720392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 20764770 - 20765053
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20764770 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgggga-gtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 20764868  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  20764869 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 20764968  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20764969 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttc 20765053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 33230834 - 33230550
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||    
T  33230834 gacatcaatgtcaaatggtgctagctgtagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaaaggggtacatat 33230735  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  33230734 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 33230635  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33230634 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttc 33230550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 34282977 - 34282693
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34282977 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggaatgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 34282878  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  34282877 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 34282778  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  34282777 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttc 34282693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 29490348 - 29490631
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  29490348 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacattcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 29490447  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  29490448 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 29490547  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  29490548 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttattt 29490631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 17477291 - 17477564
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17477291 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgtggaagtgattcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 17477390  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||           |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  17477391 aatgtacatgcatgcatttatctagccttt-----------ataggaagataaattttaagtcatgctatattttttttagcttaaaatcagttatggta 17477479  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17477480 cctttatttaataaactatatgtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcaattatttc 17477564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17575923 - 17575650
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17575923 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgtggaagtgattcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 17575824  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||           |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  17575823 aatgtacatgcatgcatttatctagcctttataggaag-----------ataaattttaagtcatgctatattttttttagcttaaaatcagttatggta 17575735  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17575734 cctttatttaataaactatatgtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcaattatttc 17575650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 19520565 - 19520840
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19520565 gacataaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 19520664  T
Q  110 aat---gtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatg 206  Q
    |||   | ||||||||| ||| |||||||||||||||           ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19520665 aatcatgcacatgcatgaatttatctagactttatag-----------gaagataaactagaaatcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatg 19520753  T
Q  207 gtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19520754 ctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatcaatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 19520840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27735921 - 27735637
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27735921 gacatcattgtcaaatggtgctagctataaatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaatttgtcaacggggttcatat 27735822  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| |||||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  27735821 aatgcacatgaatgcatttttctagccttttcaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 27735722  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27735721 cctttcttttataaattatatgtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 27735637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 42917241 - 42917525
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   || |||||    
T  42917241 gacattaatgtcaaatggtgctacctatagacgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggttaacgaagttcatat 42917340  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  42917341 aatgcacatgcatgcatttatctaaccttcatatgaagataataggaagataaattagaagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 42917440  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  42917441 cctttattttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 42917525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6912215 - 6911977
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  6912215 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 6912116  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||    
T  6912115 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 6912017  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaataca 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6912016 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 6911977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Original strand, 17481737 - 17482065
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17481737 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgtggaagtgattcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 17481836  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttcttt-agcttaaaatcaattatggt 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||           |||  ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  17481837 aatgtacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataa-----------attttaagtcatgctatatttttttttagcttaaaatcagttatggt 17481925  T
Q  209 acctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttctc------------ 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |                
T  17481926 acctttatttaataaactatatgtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcaattatttccctgtttagcattt 17482025  T
Q  296 ---aaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17482026 cccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 17482065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17571477 - 17571203
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17571477 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgtggaagtgattcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 17571378  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctaca-ttttctttagcttaaaatcaattatggt 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||           |||||||  ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17571377 aatgtacatgcatgcatttatctagcctttataggaag-----------ataaattttaagtcatgctatatttttttttagcttaaaatcagttatggt 17571289  T
Q  209 acctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17571288 acctttatttaataaactatatgtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcaattatttc 17571203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 47574193 - 47573955
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  47574193 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 47574094  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||    
T  47574093 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 47573995  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaataca 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47573994 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 47573955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 42686960 - 42687226
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  42686960 gacatcaacgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttatttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 42687059  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    ||||||||||||||||                 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  42687060 aatgtacatgcatgca-----------------ggaagataataggaagataaattagaggtcatgctacattttctttagcttaaaattagttatgcta 42687142  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42687143 cctttattttataaattacatgtatctatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 42687226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Original strand, 33030199 - 33030525
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33030199 gacatcaatgtcaaatggtactagctatatatgcacatgcggaagtggtgcttaattttcatttgtttcaagaatgttaattggtcaacggggtacatat 33030298  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||           ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  33030299 aatgtacatacatacatttatctagactttatag-----------gaagataaattagaagtcacgctacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 33030387  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||               |||||    
T  33030388 cctttattt-ataaattatatgtaactatatttgcatacatcttatccatgtaaatatgcattatgctaatattgcagttatttttctatttagcatttc 33030486  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33030487 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 33030525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 33639547 - 33639273
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  33639547 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgtttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 33639448  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  33639447 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaaaataatatgaagataaattagaattcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 33639348  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattg 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| | |||||||||||||    
T  33639347 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgtaatagactaatattg 33639273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 283
Target Start/End: Original strand, 3794901 - 3795175
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  || | |||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||| |||| |||||    
T  3794901 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcggtgcttaatttccatttgtttcaacgatattagttggtcaacggggttcatat 3795000  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  3795001 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttctttatcttaaaatcagttatgcta 3795100  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattg 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  3795101 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattg 3795175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 9148752 - 9149036
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | || || ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  9148752 gacatcattgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagcgatacttaattttcatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 9148851  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||| ||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  9148852 aatgcacatgaatgtatttatctaccctttttaggaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttattcta 9148951  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9148952 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatatgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 9149036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 39649812 - 39649551
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  39649812 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 39649713  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  39649712 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataa-----------attagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 39649624  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatat 281  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  39649623 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatat 39649551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 47173879 - 47174150
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  47173879 gacatcaatgtcaaa-ggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaagttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgaggtacatat 47173977  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||           ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  47173978 aatgcacatgcgtgcatttatctagactttatag-----------gaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcggttatgcta 47174066  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    |||||| || ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47174067 cctttactttataaattatatataattatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattaaactaatattgcagttattt 47174150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31898651 - 31898388
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  31898651 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 31898552  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  31898551 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataa-----------attagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 31898463  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattg 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  31898462 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattg 31898388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 17170450 - 17170723
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  17170450 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 17170549  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||           ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  17170550 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttagg-----------aagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 17170638  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17170639 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 17170723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 42245705 - 42245444
Alignment:
Q  22 aaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataatgtacatgca 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||||||    
T  42245705 aaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggcaaacggggtacatataatccacatgca 42245606  T
Q  122 tgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaat 221  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||           ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  42245605 tgcatttatccaaactttataggaagataa-----------attagaagtcatggtacagtttctttagcttaaaatcagttatgctaccttcattttat 42245517  T
Q  222 aaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245516 aaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttc 42245444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 47164431 - 47164140
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||    
T  47164431 gacatcaatgttaaatggtgctagctataaatgcacatgcgagagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacgggatacatat 47164332  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattag-------aagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaat 202  Q
    | |  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||       |  || || |||||||||||||||||||||||| |    
T  47164331 agttcacatgcatgcatttatctatactctataggaagataatatgaagataaattagttatgctacttcctggtacattttctttagcttaaaatcagt 47164232  T
Q  203 tatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  47164231 tatgctaccttcattttataaattatatgtaactatatttgcatacatcttatccatgttaatatgcattagagtcatattgcagttatttc 47164140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 48528621 - 48528347
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgt-ttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacata 108  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  48528621 gacatcatcgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtgttcaacaatgttaattggtcaacggggttcata 48528522  T
Q  109 taatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggt 208  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||| |||| || ||||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  48528521 taatgcacatgaatgcatttatctagcctttttacgaagataa-----------attagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgct 48528433  T
Q  209 acctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  48528432 acctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 48528347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23300581 - 23300308
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  | |||    
T  23300581 gacatcaatgtcaaatggtgctagctataaatgcacatgcgggagtaatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggatcctat 23300482  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||            |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  23300481 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagatat-----------attaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 23300393  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23300392 cctttattttataaattacatgtaactatattcgcatatgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 23300308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 38435250 - 38435138
Alignment:
Q  182 tttctttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaata 280  Q
    |||||||||||||||||   | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  38435250 tttctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatatgcattagactaata 38435151  T
Q  281 ttgcagttatttc 293  Q
    |||||||||||||    
T  38435150 ttgcagttatttc 38435138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 293
Target Start/End: Original strand, 42996016 - 42996128
Alignment:
Q  182 tttctttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaata 280  Q
    |||||||||||||||||   | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  42996016 tttctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatatgcattagactaata 42996115  T
Q  281 ttgcagttatttc 293  Q
    |||||||||||||    
T  42996116 ttgcagttatttc 42996128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17571186 - 17571149
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17571186 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 17571149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 5962391 - 5962428
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5962391 caaacgaggtgtcaagaacatttctgaaaggaaagcgc 5962428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 17170740 - 17170777
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17170740 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 17170777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 17477581 - 17477618
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17477581 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgc 17477618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17575633 - 17575596
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17575633 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgc 17575596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19034227 - 19034190
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19034227 caaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 19034190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 20720409 - 20720446
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20720409 caaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 20720446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 20765070 - 20765107
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20765070 caaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 20765107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 23767010 - 23766977
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767010 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaa 23766977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 29490649 - 29490686
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29490649 caaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 29490686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31898361 - 31898324
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31898361 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 31898324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 33230533 - 33230496
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33230533 caaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 33230496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 42687244 - 42687281
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42687244 caaacgaagtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 42687281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 42917542 - 42917579
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42917542 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 42917579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 47174168 - 47174205
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47174168 caaacgaggtgtcaagaataattctgaaaggaaagcgc 47174205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 48528330 - 48528293
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48528330 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 48528293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Original strand, 9149053 - 9149089
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcg 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9149053 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcg 9149089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 289 - 332
Target Start/End: Original strand, 3795196 - 3795239
Alignment:
Q  289 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  3795196 atttctcaaacgaggtgtcaagaataattctaaaagaaaagcgc 3795239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 297 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23300289 - 23300254
Alignment:
Q  297 aacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23300289 aacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 23300254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 14308622 - 14308659
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14308622 caaacgatgtgtcaagaacaattctgaaagtaaagcgc 14308659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 34282676 - 34282639
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34282676 caaactaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 34282639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 39649520 - 39649487
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39649520 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaa 39649487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 47164123 - 47164086
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  47164123 caaacgaggtgtcaagaaaaattctgaaagaaaagcgc 47164086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 300 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27735615 - 27735583
Alignment:
Q  300 gaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27735615 gaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 27735583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 300 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 33639241 - 33639209
Alignment:
Q  300 gaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33639241 gaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 33639209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 300 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 42245422 - 42245390
Alignment:
Q  300 gaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42245422 gaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgc 42245390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 59)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 21097121 - 21097404
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  21097121 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 21097220  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  21097221 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaattagttatgcta 21097320  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21097321 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 21097404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 26821042 - 26821325
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26821042 gacatcaatgtcaattggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 26821141  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  26821142 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataagatgataaattagaagccatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 26821241  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821242 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 26821325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 42884813 - 42885096
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  42884813 gacatcaatgtcaaatggtgtcagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttacatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 42884912  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  42884913 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagtaatgtta 42885012  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  42885013 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattaaactaatattgtagttattt 42885096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16725219 - 16724881
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||    
T  16725219 gacatcaatgtcaaatgatgctagttatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgggatgcatat 16725120  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16725119 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 16725020  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||               |||||    
T  16725019 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttagccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctctttagcatttc 16724920  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16724919 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 16724881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 36633945 - 36633673
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  36633945 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 36633846  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||           ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  36633845 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaag-----------ataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 36633757  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36633756 cctttattttataaattatatgtaactatattcgattacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 36633673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 33664654 - 33664381
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  33664654 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggagtacatat 33664555  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  33664554 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaag-----------ataaattagaagtcatgctacattttctttagtttaaaatcagttatggta 33664466  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  33664465 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgtactagactaatattgcagttatttc 33664381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 30567724 - 30567452
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  30567724 gacatcaatttcaaatggttctagctatatatgcacatgtggtagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacagggtacatat 30567625  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  30567624 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataa-----------attagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 30567536  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30567535 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 30567452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 293
Target Start/End: Original strand, 4810975 - 4811255
Alignment:
Q  14 tcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataatg 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  4810975 tcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatg 4811074  T
Q  114 tacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacctt 213  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  4811075 aacatgcatgcatatatctagactttatatgaagataataggaatataaattagaagtcatgatacattttttttagcttaaaatcagttacgctacctt 4811174  T
Q  214 tatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4811175 tattttataaattatatgtaactatatttgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactgatattgcagttatttc 4811255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 14752595 - 14752879
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  14752595 gacattaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgtgggagcgatgcataattttcgtttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatat 14752694  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14752695 aatccacatgcatgcatttatctagactttataggaagctaataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 14752794  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14752795 ccttcattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttc 14752879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 3710317 - 3710601
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3710317 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 3710416  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  3710417 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 3710516  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3710517 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttc 3710601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11867099 - 11866815
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11867099 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 11867000  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  11866999 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 11866900  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11866899 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttc 11866815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 35358492 - 35358208
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  35358492 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 35358393  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  35358392 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 35358293  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  35358292 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttc 35358208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1515860 - 1515586
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  1515860 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 1515761  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  1515760 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 1515661  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattg 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1515660 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattg 1515586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18093582 - 18093299
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  18093582 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcggaagcgatgcttaattttcatctgtttcagcaatgttaattggtcaacggggttcatat 18093483  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  18093482 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatc-agtatgcta 18093384  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18093383 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 18093299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 53 - 293
Target Start/End: Original strand, 17036734 - 17036975
Alignment:
Q  53 agtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataat 152  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  17036734 agtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatataatccacatgcatgcatttatctagaatttataggaagatagt 17036833  T
Q  153 aggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatct 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17036834 aggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatctatcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcgcatacatct 17036933  T
Q  253 tatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17036934 tatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttc 17036975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 53 - 293
Target Start/End: Original strand, 17091242 - 17091483
Alignment:
Q  53 agtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataat 152  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  17091242 agtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatataatccacatgcatgcatttatctagaatttataggaagatagt 17091341  T
Q  153 aggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatct 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17091342 aggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatctatcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcgcatacatct 17091441  T
Q  253 tatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17091442 tatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttc 17091483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 45205893 - 45205604
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  45205893 gacatcaaggtcaaattgtgcaagctatatatgcccatgcggaagtgatgcttaatttctatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacgaggtacatat 45205794  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  45205793 aatgtagatgcatgcatttatctagactttatattaagataataggaagataaattagaagtcatggtgcattttctttaacttaaaatcagttatgcta 45205694  T
Q  210 cctttattt-----aataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||||||||     | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45205693 cctttattttataaattaaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgtagttatttc 45205604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1993793 - 1993555
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  1993793 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgtgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 1993694  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||    
T  1993693 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 1993595  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaataca 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1993594 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 1993555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6343581 - 6343343
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  6343581 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 6343482  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||    
T  6343481 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 6343383  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaataca 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6343382 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 6343343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14324065 - 14323827
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  14324065 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 14323966  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||    
T  14323965 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 14323867  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaataca 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14323866 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 14323827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9917562 - 9917285
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||    
T  9917562 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatattaattggtcaacggggttcatat 9917463  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagc---ttaaaatcaattatg 206  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| |||||    
T  9917462 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaattagaagtcataatacattttctttagcttattaaaatcagttatg 9917363  T
Q  207 gtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattg 283  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9917362 ctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattg 9917285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 28501705 - 28501943
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  28501705 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 28501804  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||    
T  28501805 aatgcacatacatgtatttatctagactttctaggaagataataagaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 28501903  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaataca 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28501904 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 28501943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 53 - 293
Target Start/End: Original strand, 17025057 - 17025298
Alignment:
Q  53 agtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataat 152  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  17025057 agtgatgtttcatttccatttgtttcaacaatattaattggccaacggggtacatataatccacatgcatgcatttatctagaatttataggaagatagt 17025156  T
Q  153 aggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatct 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17025157 aggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatctatcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcgcatacatct 17025256  T
Q  253 tatccagta-aatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17025257 tatccataataatatgcattagactaatattgcagttatttc 17025298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 30571350 - 30571137
Alignment:
Q  69 catttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattaga 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           ||||||    
T  30571350 catttgtttcaacaatgttaattggtcaacagggtacatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataa-----------attaga 30571262  T
Q  169 agtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatg 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30571261 agtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatg 30571162  T
Q  268 cattagactaatattgcagttattt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  30571161 cattagactaatattgcagttattt 30571137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 9544477 - 9544204
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  9544477 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 9544378  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  9544377 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataa-----------attagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 9544289  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9544288 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 9544204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10048854 - 10048592
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  10048854 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 10048755  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||           ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  10048754 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaag-----------ataaattagaagtcatgatatattttctttaacttaaaatcagttatgcta 10048666  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatatt 282  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  10048665 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatatgtcttatccatgttaatatgcattagactaatatt 10048592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Original strand, 11447071 - 11447232
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  11447071 gacatcaatgtcagatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgggttacatat 11447170  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagt 171  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447171 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagt 11447232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 16883358 - 16883631
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || | |||| | ||||||||    
T  16883358 gacatcaatgtcaaatggtgctagctataaatgcacatgcgggattgatgcttaattttcatttgtttcaacaattttacttggccaacggagtacatat 16883457  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||||||||||           |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16883458 aatccacatgcatgcatttatctagactttatag-----------gaagataaattataagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 16883546  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||||    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16883547 ccttcattttataacttatatgtaactatatattcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttc 16883631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 17041048 - 17041321
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || | |||| | ||||||||    
T  17041048 gacatcaatgtcaaatggtgctagctataaatgcacatgcgggattgatgcttaattttcatttgtttcaacaattttacttggccaacggagtacatat 17041147  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||||||||||           |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  17041148 aatccacatgcatgcatttatctagactttatag-----------gaagataaattataagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 17041236  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||||    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17041237 ccttcattttataacttatatgtaactatatattcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttc 17041321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10822787 - 10822510
Alignment:
Q  15 caatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataatgt 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||      
T  10822787 caatgttaaatggtgctagctataaatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacgtggtacatataatcc 10822688  T
Q  115 acatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattag---aagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacc 211  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||       || | |||    |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  10822687 acatgcatgcatttatctatactatataggaagataa-------attagttatgctacttcatggtacattttctttagcttaaaatcagttttgctacc 10822595  T
Q  212 tttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttctc 295  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10822594 ttcattttataaatcatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttctc 10822510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19168449 - 19168230
Alignment:
Q  60 cttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaaga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||             |||||||||    
T  19168449 cttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatatattgtacatgcatgcagttatctagact-------------ataggaaga 19168363  T
Q  160 taaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca- 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  19168362 taaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatactacctttattttaaaaattatatgtaactatattcgcagacatcttatccat 19168263  T
Q  259 gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19168262 gtaaatatgcatta-actaatattgtagttattt 19168230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4291505 - 4291238
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  4291505 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 4291406  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| ||||            ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  4291405 aatgcacatgaatgcatttatctagccttt-----------ttagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 4291317  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |      ||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4291316 cctttattttataaattatatgtaactatattcgca------ttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 4291238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 172 - 332
Target Start/End: Original strand, 11447950 - 11448126
Alignment:
Q  172 catgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcat 270  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  11447950 catggtacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaaatatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcat 11448049  T
Q  271 tagactaatattgcagttatttctc---------------aaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11448050 tagactaatattgaagttatttccctctttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 11448126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 33664364 - 33664327
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33664364 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 33664327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19168218 - 19168175
Alignment:
Q  289 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19168218 atttctcaaacgaggtgtcaagaataattctgaaaagaaagcgc 19168175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 330
Target Start/End: Original strand, 21097422 - 21097457
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagc 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21097422 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagc 21097457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 3710618 - 3710655
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3710618 caaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 3710655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4291221 - 4291184
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4291221 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 4291184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 4811272 - 4811309
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4811272 caaatgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 4811309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 9544187 - 9544150
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9544187 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 9544150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 11866798 - 11866761
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11866798 caaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 11866761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 26821343 - 26821380
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26821343 caaacgaggtgtcaagaacaattatgaaaggaaagcgc 26821380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 35358191 - 35358154
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35358191 caaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 35358154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36633655 - 36633618
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36633655 caaacgaggtgtcaagaacgattctgaaaggaaagcgc 36633618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 289 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1515565 - 1515522
Alignment:
Q  289 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1515565 atttcccaaacgagatgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 1515522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 297 - 332
Target Start/End: Original strand, 42885116 - 42885151
Alignment:
Q  297 aacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42885116 aacgaggtgttaagaacaattctgaaaggaaagcgc 42885151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 9917265 - 9917223
Alignment:
Q  288 tatttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagc 330  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9917265 tatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaagaaaagc 9917223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 329
Target Start/End: Original strand, 16883647 - 16883681
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaag 329  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16883647 caaacgaggtgtcaagaacaattttgaaaggaaag 16883681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 329
Target Start/End: Original strand, 17041337 - 17041371
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaag 329  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17041337 caaacgaggtgtcaagaacaattttgaaaggaaag 17041371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10048564 - 10048527
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10048564 caaaccaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 10048527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10822495 - 10822458
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10822495 caaacgaggtgtcaagaaaaattctgaaagaaaagcgc 10822458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 17025315 - 17025352
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17025315 caaacaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgc 17025352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 17036992 - 17037029
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17036992 caaacaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgc 17037029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 17091500 - 17091537
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17091500 caaacaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgc 17091537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18093282 - 18093245
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18093282 caaacgagatgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 18093245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 30567434 - 30567401
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaa 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30567434 caaacgaggtgtcatgaacaattctgaaaggaaa 30567401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 30571119 - 30571086
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaa 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30571119 caaacgaggtgtcatgaacaattctgaaaggaaa 30571086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 45205587 - 45205554
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaa 328  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45205587 caaacgaggtgtaaagaacaattctgaaaggaaa 45205554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Original strand, 14752896 - 14752932
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcg 331  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14752896 caaatgaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcg 14752932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 67)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 54332522 - 54332242
Alignment:
Q  13 atcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataat 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  54332522 atcaatgtcaattggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataat 54332423  T
Q  113 gtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacct 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  54332422 gtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataatatgatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacct 54332323  T
Q  213 ttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54332322 ttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 54332242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14830394 - 14830111
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  14830394 gacatcaatgtcaaatgatgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 14830295  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14830294 aatgcacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 14830195  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14830194 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 14830111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 328
Target Start/End: Original strand, 13627458 - 13627792
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  13627458 gacatcaatgtcaaatggttctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatgt 13627557  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||    
T  13627558 aatgtacatgaatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttttttagtttaaaatcagttatgcta 13627657  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||               |||||    
T  13627658 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatggattagattaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 13627757  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaa 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13627758 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaa 13627792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 53341816 - 53342099
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  53341816 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtctcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 53341915  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  53341916 aatgtacatgcattcatttatctagactttataggaagataataggaagacaaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 53342015  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  53342016 cctttattttataaattatatataactatattcgcatatatcttatccatgtaaatatgcattagactaatagtgcaattattt 53342099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 34057447 - 34057163
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaattt-ccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacata 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  34057447 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaattttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcata 34057348  T
Q  109 taatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggt 208  Q
    ||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  34057347 taatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataatatgatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgct 34057248  T
Q  209 acctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34057247 acctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 34057163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Original strand, 23478314 - 23478654
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  23478314 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 23478413  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacatttt-ctttag-cttaaaatcaattatgg 207  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||     
T  23478414 aatgtacatgcatgcgtttatctagactttataggaagataataggataataaattagaagtcatgttacattttactttagtcttaaaatcagttatgc 23478513  T
Q  208 tacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------att 291  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               |||    
T  23478514 tacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatt 23478613  T
Q  292 tctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23478614 tcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 23478654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39745729 - 39745486
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  39745729 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 39745630  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  39745629 aatgtacatgcatgcatttatctagactctataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttttttagcttaaaatcagttatgcta 39745530  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatctt 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39745529 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatctt 39745486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 55999580 - 55999242
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||| |||||||||| || |||| | |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  55999580 gacattaatgtcaaattgttctagttgtatatgcacatgcggaagtgatgcttaattttcatttatttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 55999481  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  55999480 aatgttcatgcatgcatttatctagactttataggaagataatatcaagataaattataagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 55999381  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||               |||||    
T  55999380 cctttattttataaattatatgtaactatatttgcatacatcttatacatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 55999281  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55999280 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 55999242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 19832269 - 19831920
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19832269 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatacacatgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 19832170  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  19832169 aatgtagatgcatgcatttatctagactttataggaagataa-----------attagaagtcatgctacattttctttagctcaaaatcagttatgcta 19832081  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtta-tttct------------- 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||                 
T  19832080 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcttgtttaacatttt 19831981  T
Q  295 -caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcnnnnnnntcactatcattgatg 354  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  19831980 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactatcattgatg 19831920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10260206 - 10259922
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10260206 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 10260107  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  10260106 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 10260007  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10260006 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttc 10259922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 21564249 - 21564533
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21564249 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 21564348  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21564349 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 21564448  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21564449 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttc 21564533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26925145 - 26924861
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26925145 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 26925046  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  26925045 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 26924946  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26924945 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttc 26924861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 43331770 - 43332054
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  43331770 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 43331869  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  43331870 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 43331969  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43331970 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttc 43332054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24078275 - 24077991
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24078275 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 24078176  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  24078175 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 24078076  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24078075 ccttcatttcataagttatatataactatatttgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttc 24077991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 51451837 - 51452121
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  51451837 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 51451936  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  51451937 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaaaataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 51452036  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  51452037 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttc 51452121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28135938 - 28135666
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  28135938 gacaccaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcgaaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggagtacatat 28135839  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||    
T  28135838 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaag-----------ataaattagaagtcatgctacattttctttagataaaaatcagttatgcta 28135750  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28135749 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatatgcattagactaatattgtagttattt 28135666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 33503867 - 33503598
Alignment:
Q  13 atcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||  | ||||||||||    
T  33503867 atcaatgtcaaatggtgctagctatttatgcagatgcggaagtgatgcttaatctccatttgtttcaacaatgttaattgattaacgagatacatataat 33503768  T
Q  113 gtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacct 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33503767 gtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataa-----------attagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacct 33503679  T
Q  213 ttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33503678 ttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 33503598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 17739446 - 17739730
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  17739446 gacatcaatgtcaaatggtactaactatagatgcaaatgaggaagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 17739545  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  17739546 aatgcacatgaatgcatttatccagcttttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 17739645  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17739646 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 17739730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 15520254 - 15520492
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  15520254 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 15520353  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||    
T  15520354 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 15520452  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaataca 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15520453 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 15520492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Original strand, 36856507 - 36856832
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  36856507 gacatcaatgttaaatgatgctagctatatatgca-atgcggaagtgatgcttaatttcaatttgtttcaa-aatgttaattggtcaacggggtacatat 36856604  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||           ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  36856605 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatag-----------gaagataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgata 36856693  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttc 293  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||               |||||    
T  36856694 cttttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgtattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 36856793  T
Q  294 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36856794 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 36856832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 741161 - 740923
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||    
T  741161 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcatcggggttcatat 741062  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||    
T  741061 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 740963  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaataca 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  740962 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 740923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 40621552 - 40621838
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaattt--ccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacat 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  40621552 gacatcaatgtcaaacggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacagggttcat 40621651  T
Q  108 ataatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatgg 207  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  40621652 ataatgcacatgaatgcatttatctagcatttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgc 40621751  T
Q  208 tacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  40621752 tacctttattttataaattatatgtaactatatttgcatacgtcttatccatgttaatatgtattagactaatattgttgttatttc 40621838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5274627 - 5274409
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  5274627 gacatcaatatcaaatggtgttggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 5274528  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5274527 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagatgatatgatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 5274428  T
Q  210 cctttatttaataaattat 228  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  5274427 cctttattttataaattat 5274409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Original strand, 19590252 - 19590579
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||    
T  19590252 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaatgggatacatat 19590351  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  19590352 aatgcacatgcatgcatttatctagactttataggaagataa-----------attagaagtcatggtacattttatttagcttaaaatcagttatgtta 19590440  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttctc------------- 295  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |                 
T  19590441 ccttcattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattatactaatattacagttatttccctgtttaacatttc 19590540  T
Q  296 --aaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19590541 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 19590579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28121092 - 28120821
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  28121092 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcaggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaatagggtacatat 28120993  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||           ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  28120992 aatgcacatggatgcatttatctagactttataggaag-----------ataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 28120904  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28120903 ccttcattttataaattatatgt-actatattcacatacatcttatccatgttaatatgcatcagactaatattgcagttattt 28120821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 47720942 - 47720668
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||    
T  47720942 gacatcaatgtcaaatgatgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccgtttgtttcaacaatgttaattagccaacgaggtacatat 47720843  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          |||||  |    
T  47720842 aattcacatgcatgcatttatctagactttataggaagctaatatgaagataaattagaagtcatggtacattttctttagc----------ttatgcca 47720753  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47720752 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttc 47720668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7644989 - 7644773
Alignment:
Q  13 atcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataat 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  7644989 atcaatgtgaaatggtgctagctatatatgcatatgcagaagtgatgattaattcccatttgttttaacaatgttaattggtcaacgggctacatataat 7644890  T
Q  113 gtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacct 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  7644889 gtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataatatgaagataaattagacgtcatgctacattttctttagcgtaaaatcagttatgctacct 7644790  T
Q  213 ttatttaataaattata 229  Q
    |||||| ||||||||||    
T  7644789 ttattttataaattata 7644773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 39715382 - 39715109
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  39715382 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 39715283  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  39715282 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataa-----------attagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 39715194  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  39715193 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatctatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 39715109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 52800449 - 52800722
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  52800449 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 52800548  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||           ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  52800549 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttagg-----------aagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 52800637  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  52800638 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 52800722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 56 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 574980 - 574755
Alignment:
Q  56 gatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatataatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataatagg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  574980 gatgcttaatttccatttgtttcaacaatattaattggtcaacggggttcatataatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataatagg 574881  T
Q  156 aagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttat 255  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  574880 aaaataaattagaagtcataatacattttctttagctt---atcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttat 574784  T
Q  256 cca-gtaaatatgcattagactaatattg 283  Q
    | | || ||||||||||||||||||||||    
T  574783 ctatgttaatatgcattagactaatattg 574755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35496395 - 35496149
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  35496395 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagtgatgcttaatttccatcagtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 35496296  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  35496295 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataa-----------attagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 35496207  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatat 266  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||    
T  35496206 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttacccatgtaaatat 35496149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 1943902 - 1944180
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| | || || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  1943902 gacatcaatgttaaacgctgctagctataaatgcacatgcgggagggatgcttaatt-ccatctgtttcaacaatgttaattggccaacagggtacatat 1944000  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattag---aagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatg 206  Q
    |||  ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||       || | |||    |  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1944001 aatccacatgcatgcatttatctatactctataggaagataa-------attagttatgctacttcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatg 1944093  T
Q  207 gtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1944094 ctaccttcattttataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttattt 1944180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 149 - 292
Target Start/End: Original strand, 17698721 - 17698865
Alignment:
Q  149 taataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatac 248  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  17698721 taatagaaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatggtacctttattttataaattatatgtaaatatattcgcatac 17698820  T
Q  249 atcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17698821 atcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 17698865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Original strand, 17698412 - 17698548
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||    
T  17698412 gacatgaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatcggtcaacgggttacatat 17698511  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaa 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17698512 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaa 17698548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26870995 - 26870883
Alignment:
Q  182 tttctttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaata 280  Q
    |||||||||||||||||   | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26870995 tttctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatatgcattagactaata 26870896  T
Q  281 ttgcagttatttc 293  Q
    |||||||||||||    
T  26870895 ttgcagttatttc 26870883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 37702267 - 37702199
Alignment:
Q  225 ttatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37702267 ttatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 37702199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 223 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5272925 - 5272800
Alignment:
Q  223 aattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------atttctcaaacgaggtgt 306  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               ||||| ||||||||||||    
T  5272925 aattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagtatttcccaaacgaggtgt 5272826  T
Q  307 caagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5272825 caagaacaattctgaaaggaaagcgc 5272800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 7644456 - 7644384
Alignment:
Q  221 taaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7644456 taaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactgatattgcaattattt 7644384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 35712993 - 35712922
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaac 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  35712993 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaac 35712922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39743334 - 39743291
Alignment:
Q  289 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39743334 atttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 39743291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 35496125 - 35496088
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35496125 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 35496088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14830093 - 14830057
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcg 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14830093 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcg 14830057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7644366 - 7644329
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7644366 caaacgaggtgttaagaacaattctgaaaggaaagcgc 7644329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10259905 - 10259868
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10259905 caaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 10259868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 17739747 - 17739784
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17739747 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 17739784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 21564550 - 21564587
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21564550 caaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 21564587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26924844 - 26924807
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924844 caaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 26924807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28135648 - 28135611
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28135648 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 28135611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 33503580 - 33503543
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33503580 caaacgaggtgtcaagaacaattttgaaaggaaagcgc 33503543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39715092 - 39715055
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39715092 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 39715055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 40621855 - 40621892
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40621855 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 40621892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 43332071 - 43332108
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43332071 caaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 43332108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 51452138 - 51452175
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51452138 caaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 51452175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 52800739 - 52800776
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52800739 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 52800776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 53342117 - 53342154
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53342117 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 53342154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28120802 - 28120766
Alignment:
Q  296 aaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28120802 aaacgaggcgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 28120766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 289 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 35708216 - 35708173
Alignment:
Q  289 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  35708216 atttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgc 35708173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 329
Target Start/End: Original strand, 38007551 - 38007585
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaag 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38007551 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaacggaaag 38007585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 39743392 - 39743346
Alignment:
Q  247 acatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  39743392 acatcttatccatgtaaatatacattagactaatattacagttattt 39743346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 47720651 - 47720592
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcnnnnnnntcactatcattgatg 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||       |||||||||||||||    
T  47720651 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaagaaatgcgcaaaacaatcactatcattgatg 47720592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 17698883 - 17698920
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17698883 caaacgaagtgtcaaaaacaattctgaaaggaaagcgc 17698920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24077974 - 24077937
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24077974 caaactaggtgtcaagaacaattatgaaaggaaagcgc 24077937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 34057145 - 34057108
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34057145 caaacgacgtgtcaagaacaattatgaaaggaaagcgc 34057108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 37702181 - 37702144
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37702181 caaacaaggtgtcaaaaacaattctgaaaggaaagcgc 37702144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 292
Target Start/End: Original strand, 38007500 - 38007533
Alignment:
Q  259 gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38007500 gtaaatatgcattagactgatattgcagttattt 38007533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 300 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3839948 - 3839916
Alignment:
Q  300 gaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3839948 gaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgc 3839916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 54332224 - 54332192
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54332224 caaacgaggtgtcaagaacaattgtgaaaggaa 54332192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27228 - 26945
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  27228 gacatcaatgtcaaatgatgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 27129  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27128 aatgcacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 27029  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27028 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 26945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26927 - 26891
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcg 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26927 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcg 26891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 119428 - 119710
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  119428 gacatcaatgtcaaa-ggtgctggctatagatgcacatgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattgctcaacggggtacatat 119526  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  119527 aatgcacatgcattcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 119626  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  119627 cctttattttataaattatatgtaactatattcacttacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgtggttattt 119710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Original strand, 119728 - 119765
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  119728 caaacgaggtgtcaagaataattctgaaaggaaagcgc 119765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 153022 - 152738
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||    
T  153022 gacatcaatgtaaaatggtgttagctataaatgcgcatgcaggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacgaggtacatat 152923  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  152922 aatccacatgcatgcatttatctagattttataggaatataataggacgatacattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 152823  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  152822 ccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttc 152738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 65498 - 65220
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| | || || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  65498 gacatcaatgttaaaagctgctagctataaatgcacatgcgggagggatgcttaatt-ccatctgtttcaacaatgttaattggccaacagggtacatat 65400  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattag---aagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatg 206  Q
    |||  ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||       || | |||    |  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  65399 aatccacatgcatgcatttatctatactctataggaagataa-------attagttatgctacttcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatg 65307  T
Q  207 gtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 292  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65306 ctaccttcattttataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttattt 65220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5123 - 4875
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  5123 gacatcaatgtctaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 5024  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||  || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  5023 aatgcacatgagtggatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaatcagaagtcattatatattttatttagcttaaaatcagttatgcta 4924  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca 258  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4923 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatcca 4875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 11572 - 11324
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  11572 gacatcaatgtctaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 11473  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| |||||  || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  11472 aatgcacatgagtggatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaatcagaagtcattatatattttatttagcttaaaatcagttatgcta 11373  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca 258  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11372 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatcca 11324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19243 - 18970
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  19243 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 19144  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  19143 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataa-----------attagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 19055  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagttatttc 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19054 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttc 18970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18953 - 18916
Alignment:
Q  295 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18953 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 18916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13714 - 13493
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||    
T  13714 gacatcaatgtcaaatagtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaattgggctcatat 13615  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| |||| || |||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13614 aatgcacatgaatgcttttatctagcctttttatgaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 13515  T
Q  210 cctttatttaataaattatatg 231  Q
    ||||||||| |||| |||||||    
T  13514 cctttattttataacttatatg 13493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 300 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13493 - 13461
Alignment:
Q  300 gaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13493 gaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 13461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 295
Target Start/End: Original strand, 49455 - 49724
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  49455 gacatcaatgtcaaatgatgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttctatttgtttcaacaatgttaattagccaacggggtacatat 49554  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||  ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||          ||||| ||    
T  49555 aatccacatgcatgcatttatctaggctttataagaagctaataggaatataaattagaagtcatggtacattttatttagc----------ttatgcta 49644  T
Q  210 cctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatccagtaaatatgcattagactaatattgcagttatttctc 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||      || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  49645 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatct------gttaatatgcattagactaatgttgcaattatttctc 49724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 332
Target Start/End: Original strand, 49740 - 49776
Alignment:
Q  296 aaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49740 aaacgaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgc 49776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11197 - 10991
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  11197 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttttatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 11098  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||  ||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  11097 aatgcacatcaatgcatttatctaacctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaattagttatgcta 10998  T
Q  210 cctttat 216  Q
    |||||||    
T  10997 cctttat 10991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 93 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4874 - 4683
Alignment:
Q  93 gtcaactgggtacatataatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagct 192  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  4874 gtcaacggggttcatataatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttctttagct 4775  T
Q  193 taaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattg 283  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4774 taaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattg 4683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 289 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4662 - 4619
Alignment:
Q  289 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  4662 atttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgc 4619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 13191 - 13395
Alignment:
Q  10 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacacgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatttgtcaactgggtacatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  13191 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 13290  T
Q  110 aatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcaattatggta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| ||||            |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13291 aatgcacatgaatgcatttatctagccttt-----------ttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 13379  T
Q  210 cctttatttaataaat 225  Q
    ||||||||| ||||||    
T  13380 cctttattttataaat 13395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 332
Target Start/End: Original strand, 13448 - 13484
Alignment:
Q  296 aaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13448 aaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgc 13484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1555 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1555
Description:

Target: scaffold1555; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1648 - 1521
Alignment:
Q  85 gttaatttgtcaactgggtacatataatgtacatgcatgcattgatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacatttt 184  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1648 gttaattggtcaacggggtacatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataataggaagataaattagaagtcatgttacatttt 1549  T
Q  185 ctttagcttaaaatcaattatggtacct 212  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||||    
T  1548 ctgtagcttaaaatcagttatgctacct 1521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 293
Target Start/End: Original strand, 898 - 1010
Alignment:
Q  182 tttctttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaata 280  Q
    |||||||||||||||||   | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  898 tttctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatatgcattagactaata 997  T
Q  281 ttgcagttatttc 293  Q
    |||||||||||||    
T  998 ttgcagttatttc 1010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 54796 - 54684
Alignment:
Q  182 tttctttagcttaaaatcaattatggtacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaata 280  Q
    |||||||||||||||||   | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  54796 tttctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatatgcattagactaata 54697  T
Q  281 ttgcagttatttc 293  Q
    |||||||||||||    
T  54696 ttgcagttatttc 54684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 208 - 332
Target Start/End: Original strand, 3 - 143
Alignment:
Q  208 tacctttatttaataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatcca-gtaaatatgcattagactaatattgcagtt---------------att 291  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |               |||    
T  3 tacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcctatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagctattttcctgtttagcatt 102  T
Q  292 tctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  103 tcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 30570 - 30527
Alignment:
Q  289 atttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30570 atttcccaaacgaggtgtcaagaacaattcttaaaggaaagcgc 30527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University