View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10233A_low_54 (Length: 359)

Name: NF10233A_low_54
Description: NF10233A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10233A_low_54
NF10233A_low_54
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (8-359)||(16755205-16755556)
chr8 (8-359)||(28329780-28330131)
chr8 (8-359)||(28892649-28893000)
chr8 (11-359)||(21039316-21039664)
chr8 (8-359)||(33034526-33034877)
chr8 (8-224)||(25682332-25682548)
chr8 (8-359)||(15946548-15946899)
chr8 (8-359)||(10686105-10686456)
chr8 (8-243)||(18867627-18867862)
chr8 (8-243)||(35743284-35743519)
chr8 (53-309)||(26299313-26299569)
[»] chr6 (8 HSPs)
chr6 (8-359)||(13880624-13880975)
chr6 (8-359)||(35204008-35204359)
chr6 (8-359)||(25943554-25943905)
chr6 (8-359)||(17692800-17693151)
chr6 (11-359)||(22348919-22349267)
chr6 (56-359)||(33332917-33333220)
chr6 (44-243)||(14739529-14739728)
chr6 (57-246)||(24433274-24433463)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (8-359)||(10096751-10097102)
chr3 (8-359)||(10203637-10203988)
chr3 (8-359)||(6305196-6305547)
chr3 (8-359)||(16459349-16459700)
chr3 (8-359)||(54190393-54190744)
chr3 (8-359)||(10898894-10899245)
chr3 (12-359)||(22623928-22624275)
chr3 (8-359)||(29911898-29912249)
chr3 (8-359)||(10610718-10611073)
chr3 (8-359)||(47880833-47881184)
chr3 (8-359)||(8514989-8515340)
chr3 (53-359)||(2674061-2674367)
chr3 (8-359)||(32478235-32478586)
chr3 (8-359)||(1308766-1309117)
chr3 (74-309)||(3325429-3325664)
chr3 (192-276)||(16262441-16262525)
[»] chr7 (13 HSPs)
chr7 (8-359)||(3322733-3323084)
chr7 (8-359)||(25407299-25407650)
chr7 (8-359)||(7071936-7072287)
chr7 (8-359)||(25353237-25353588)
chr7 (8-359)||(44012475-44012826)
chr7 (8-359)||(16882822-16883173)
chr7 (8-359)||(24263164-24263515)
chr7 (8-243)||(4860627-4860862)
chr7 (8-359)||(21643932-21644283)
chr7 (53-243)||(24271956-24272146)
chr7 (53-243)||(18411597-18411788)
chr7 (8-297)||(9187048-9187337)
chr7 (74-359)||(21986881-21987166)
[»] chr2 (8 HSPs)
chr2 (8-359)||(39684133-39684483)
chr2 (8-359)||(45569275-45569626)
chr2 (8-359)||(2738090-2738441)
chr2 (8-359)||(22715179-22715530)
chr2 (8-359)||(17933969-17934320)
chr2 (8-359)||(20052705-20053056)
chr2 (8-309)||(19347173-19347474)
chr2 (88-359)||(25393861-25394132)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (8-359)||(9523613-9523964)
chr1 (113-359)||(2397278-2397524)
chr1 (74-359)||(41396200-41396485)
chr1 (8-81)||(2397200-2397273)
chr1 (231-359)||(14189722-14189850)
chr1 (74-297)||(47100721-47100945)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (8-359)||(49151-49502)
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (8-359)||(25447372-25447723)
chr5 (8-359)||(37558443-37558794)
chr5 (8-309)||(33789251-33789552)
chr5 (8-359)||(31398833-31399184)
chr5 (8-243)||(43595016-43595251)
chr5 (8-243)||(43627810-43628045)
chr5 (8-359)||(27447718-27448069)
chr5 (8-247)||(24557537-24557776)
chr5 (8-247)||(24598569-24598808)
chr5 (8-246)||(28836196-28836434)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (8-359)||(18211-18562)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (8-359)||(4567224-4567575)
chr4 (8-359)||(15314203-15314552)
chr4 (8-359)||(16634376-16634727)
chr4 (192-359)||(47564647-47564814)
chr4 (8-144)||(47564813-47564949)
chr4 (8-359)||(18858471-18858822)
chr4 (88-321)||(9226280-9226513)
chr4 (8-243)||(16625950-16626185)
chr4 (88-359)||(5145883-5146154)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (8-276)||(1089-1357)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (8-359)||(16150-16501)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (8-297)||(403-692)
scaffold0006 (8-297)||(8559-8848)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 16755205 - 16755556
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16755205 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctcacgcgctcca 16755304  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16755305 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacagttctatgcctctttatacctttcttcctgcaaaactcattaaa 16755404  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755405 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacactttcagtttggtaccaatctgattttctacaagtgtatcccattccttgaatttttca 16755504  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755505 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 16755556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28330131 - 28329780
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  28330131 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagcttctaacagcatacacctcacgcgctcca 28330032  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28330031 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctctttatacctttcttcctgcaaaactcattaaa 28329932  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28329931 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacactttcagtttggtaccaatctgattttctacaagtgtatcccattccttgaatttttca 28329832  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28329831 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 28329780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28893000 - 28892649
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  28893000 gatggacatatgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcccaatagcatacacctcacacgctcca 28892901  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  28892900 acaaagtcctgttaattctttcagcaagaccattctgttgaggtatgtgtgccatggttctatgcctctttatacctttattcctgcaaaactcattaaa 28892801  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28892800 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttctcaacactttcagtttagtgccaatctgattttctataagtatatcccattctttgaatttttca 28892701  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28892700 aaggcgtcacttttattcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 28892649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21039664 - 21039316
Alignment:
Q  11 ggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctccaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21039664 ggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcttctccccagaaactcttggacaatccagctcccaacaacatacacctcacacgctccaaca 21039565  T
Q  111 gagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaactg 210  Q
     |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  21039564 aagtcatattcattctttaagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctctttataccttttttcctgcaaaactcattaaactg 21039465  T
Q  211 ttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttcaaaa 310  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| |||||| || ||||||||||||    
T  21039464 ctctgaaacaaactccaggccattgtcagttctcaacactttcagtttagtaccaatctgattttctaaaagtatataccattctttaaatttttcaaaa 21039365  T
Q  311 gcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21039364 gcatcacttttattcttcagaatgtaaacacatactcttctagaataat 21039316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33034877 - 33034526
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  33034877 gatggacatctgttaatcaaatatgttgcagtactaacagcttctccccagaaactcttggacaatctagctcccaacaacatacacctcacacgctcca 33034778  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||    
T  33034777 acaaggtcatgttcattctttcagcaagaccattttgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctctttatacctcttttcctgcaaaactcattaaa 33034678  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||||||| |||||| || |||||||||    
T  33034677 ctgctctgaaacgaacttcaggccattgtcagttctcaacactttcagtttagttccaatctgattttctacaagtgtatgccattctttaaatttttca 33034578  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  33034577 aaagcgtcacttttattctttagaatgtaaactcataccattttagaataat 33034526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25682548 - 25682332
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25682548 gatggacatttgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccctagaaactcttggacaatccagctcataacagcatacacctcacatgctcca 25682449  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  25682448 acagagtccggttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctctttatacctttcttcctgaaaaactcattaaa 25682349  T
Q  208 ctgttctgaaacaaact 224  Q
    |||||||||||||||||    
T  25682348 ctgttctgaaacaaact 25682332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15946899 - 15946548
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| ||| | ||||    
T  15946899 gatggacatcttttaatcaaatatgttgcagtactaacagcttctccccaaaaactcttggacaatccagttctcaacaacatacacctcacatggtcca 15946800  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    |||  ||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   ||  |||||||  | |||||    
T  15946799 acaaggtcttattcattctttcagctagaccattcttttgaggtgtgtatgtcacggttctatgcctctttatacctcgttttctgcaaaacgcgttaaa 15946700  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||||||| || ||||| |||||||| | |||| ||| |||||| || |||||||||    
T  15946699 ctgctctgaaaaaaactccaagacattgtcaaatcttaacactttcagtttagttccaatatgattttctacaagtttatgccattctttaaatttttca 15946600  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    |||||||||||||| || |||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15946599 aaagcatcacttttatttttctaaatgtaaacccatacccttctagaataat 15946548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10686456 - 10686105
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||  | || || || |||||||||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  10686456 gatggacatctattgatcaaataagcagccgttgtcacggcttcaccccagaaactcttaggtaacccagctcctagaatcatacacctcacacgctcca 10686357  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | |||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||| || || ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  10686356 aaagagtcctattcatgcgttccgcaagaccattttgttgcggtgttcttggtacggttctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaa 10686257  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||||| || || || |||||||| || || || | |||||| ||||| ||||||    
T  10686256 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttcttaaaccttttagtttagttcccatttgattttctatgagagtgtgccattctttgaacttttca 10686157  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    || |  |||||||| || |||| ||   | ||||| ||||| ||||||||||    
T  10686156 aaggtgtcacttttgtttttcaaaacaaagacccacactctcctagaataat 10686105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18867862 - 18867627
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||  | || || || |||||||||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  18867862 gatggacatctattgatcaaataagcagccgttgtcactgcttcaccccagaaactcttaggtaacccagctcctagaatcatacacctcacacgctcca 18867763  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | |||||||| || || | ||||||||||||||| ||||| |||||    |  |||||||||||||| || || ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  18867762 aaagagtcctatttatgcgttcagcaagaccattttgttgcggtgttctcggtacggttctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaa 18867663  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttct 243  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18867662 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttct 18867627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 243
Target Start/End: Original strand, 35743284 - 35743519
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||  | || || || |||||||||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||    
T  35743284 gatggacatctattgatcaaataagcagccgttgtcacggcttcaccccagaaactcttaggtaacccagctcctagaatcatacacctcacatgctcca 35743383  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | || ||||| ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||| || || ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  35743384 aaagtgtcctattcatgcgttccgcaaggccattttgttgcggtgttattggtacggttctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaa 35743483  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttct 243  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35743484 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttct 35743519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 309
Target Start/End: Original strand, 26299313 - 26299569
Alignment:
Q  53 ccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctccaacagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtg 152  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26299313 ccccagaaactcttaggtaacccagctcctagaatcatacacctcacacgctccaaaagggtcctattcatgcgttcagcaagaccattttgttgcggtg 26299412  T
Q  153 tgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaactgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacatttt 252  Q
    |    |  ||||| |||||||| || || ||||||  | ||||||| |||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||    
T  26299413 ttctcggtacggtcctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaattgctttgaaacaaactccaggccattgtcagttcttaaaccttt 26299512  T
Q  253 cagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttcaaa 309  Q
     ||||| || || || |||||||| || || || | ||||||||| || ||||||||    
T  26299513 tagtttagttcccatttgattttctatgagagtgtgccattccttaaacttttcaaa 26299569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 8)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13880975 - 13880624
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  13880975 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcccaacagcatacatctcacacgctcca 13880876  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13880875 acagagtcctattcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctctttatacctttcttcctgcaaaactcattaaa 13880776  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13880775 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacactttcagtttggtaccaatctgattttctataagtatatcccattccttgaatttttca 13880676  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13880675 aaagcatcacttttcttcttcagaatgaaaacccatactcttctagaataat 13880624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 35204008 - 35204359
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35204008 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctcccaagaaactcttggacaatccagctcccaacagcatacacctcacacgctcca 35204107  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  35204108 acaaagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccactgttctatgcctctttatacctttctttctgcaaaactcattaaa 35204207  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||| ||||||||||||    
T  35204208 ctgttctgaaacaaattccaagccattgtcagttctcaacactttcagtttggtaccaatctgattttctataagtatatttcattctttgaatttttca 35204307  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35204308 aaggcatcacttttattcttcataatgtaaatccatactcttctagaataat 35204359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25943905 - 25943554
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25943905 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccctagaaactcttggacaatccagctcccaacagcatacacctcacacgctcca 25943806  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  25943805 acaaagtccggttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctctttatacctttcttcctacaaaactcattaaa 25943706  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  25943705 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttctcaacacttttagtttagttccaatctgattttctataagtatattccattctttgaatttttca 25943606  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25943605 aaggcatcacttttattcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 25943554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 17692800 - 17693151
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  17692800 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccctataaactcttggacaatccagctcccaacagcatacatctcacacgctcca 17692899  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17692900 acattgtccttttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctctttatacctttcttcctgcaaaactcattaaa 17692999  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||| ||||||   |||| | |||||||| ||||||||||||    
T  17693000 ctattctgaaacaaactccaggccattgtcagttctcaacactttccgtttagttccaatctaattttctgcaagtatgtcccattctttgaatttttca 17693099  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17693100 aaagcatcactcttcttcttcagaatgtacacccatactcttctagaataat 17693151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 359
Target Start/End: Original strand, 22348919 - 22349267
Alignment:
Q  11 ggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctccaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22348919 ggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcttctcccaagaaactcttggacaatccagctcccaacagcatacacctcacacgctccaaca 22349018  T
Q  111 gagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaactg 210  Q
      ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  22349019 aggtcctattcattctttcagcaacaccattttgttaaggtgtgtatgccacggttctattcctctttataccttttttcctgcaaaactcattaaactg 22349118  T
Q  211 ttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttcaaaa 310  Q
     | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||| ||| |||||  |  | ||||||||||    
T  22349119 ctttgaaacaaactccaggccattgtcagttctcaacactttcagtttagttccaatctgattttctacaagtatatgccatttttaaattttttcaaaa 22349218  T
Q  311 gcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22349219 gcatcacttttattcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 22349267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33333220 - 33332917
Alignment:
Q  56 cagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctccaacagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgt 155  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||      
T  33333220 cagaaactcttaggtaacccagctcctagaatcatacacctcacacgctccaaaagagtcctattcatgcgttccgcaagaccattttgttgaggtgttc 33333121  T
Q  156 atgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaactgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcag 255  Q
     ||  |||||||||||||| || || ||||||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||    
T  33333120 ttggtacggttctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaactgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttcttaaaccttttag 33333021  T
Q  256 tttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttcaaaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaa 355  Q
    ||| || || || |||||||| || || || | |||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || |||| ||   | ||||| ||||| ||||||    
T  33333020 tttagttcccatttgattttctatgagagtgtgccattctttgaacttttcaaaggtgtcacttttgtttttcaaaacaaagacccacactctcctagaa 33332921  T
Q  356 taat 359  Q
    ||||    
T  33332920 taat 33332917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14739728 - 14739529
Alignment:
Q  44 acagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctccaacagagtcctgttcattctttcagcaagaccattct 143  Q
    ||||| || ||||||| |||||| |  || ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||   ||| ||||||||||| |    
T  14739728 acagcttcaccccagagactcttaggtaacccagctcctagaatcatacacctcacacgctccaaaagagtcctattcatgtgttccgcaagaccatttt 14739629  T
Q  144 gttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaactgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttct 243  Q
    |||| |||||    |  |||||||||||||| || || ||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14739628 gttgcggtgttctcggtacggttctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaactgctctgaaacaaactccagaccattgtcagttct 14739529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24433463 - 24433274
Alignment:
Q  57 agaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctccaacagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgta 156  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||| | || |||||||||||| ||||| |||||       
T  24433463 agaaactcttaggtaacccagctcctagaagcatacacctcacctgctccaaaagggtcctattcatgcgttaagcaagaccattttgttgtggtgttct 24433364  T
Q  157 tgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaactgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaa 246  Q
    ||  |||||||||||||| || ||   ||||  | | ||||| |||||||| || | ||||||||||| || |||||| ||| |||||||    
T  24433363 tggtacggttctatgcctcttgatttatttcaacctacaaaactcattaaattgctttgaaacaaacttcaggccattatcacttctcaa 24433274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 10096751 - 10097102
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  10096751 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcccaacagcatacatctcacacgctcca 10096850  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10096851 acagagtcctattcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctctttatacctttcttcctgcaaaactcattaaa 10096950  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10096951 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacactttcagtttggtaccaatctgattttctataagtatatcccattccttgaatttttca 10097050  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10097051 aaagcatcacttttcttcttcagaatgaaaacccatactcttctagaataat 10097102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 10203637 - 10203988
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  10203637 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcccaacagcatacatctcacacgctcca 10203736  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10203737 acagagtcctattcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctctttatacctttcttcctgcaaaactcattaaa 10203836  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10203837 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacactttcagtttggtaccaatctgattttctataagtatatcccattccttgaatttttca 10203936  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10203937 aaagcatcacttttcttcttcagaatgaaaacccatactcttctagaataat 10203988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6305547 - 6305196
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  6305547 gatggacatatgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcccaacagcatacacctcacacgctcta 6305448  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6305447 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctctttatacctttcttcctgcaaaactcattaaa 6305348  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6305347 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaatactttcagtttggtaccaatctgattttctacaagtgtatcccattccttgaatttttca 6305248  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6305247 aaagcatcacttttcttcttgagaatgtaaacccatactcttctagaataat 6305196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16459700 - 16459349
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16459700 gatggacatcttttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccctagaaactcttggacaatccagctcccaacagcatacacctcacacgctcca 16459601  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16459600 acaatgtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacagttctatgcctctttatacctttcttcctgcaaaactcattaaa 16459501  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16459500 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttctcaacactttcagtttagttccaatctgattttctacaagtatatcccattccttgaatttttca 16459401  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16459400 aaggcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 16459349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 54190744 - 54190393
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  54190744 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcaatactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcccagcagcatacacctcacacgctcca 54190645  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  54190644 acaaagtcctgttcattctttcagcaagaccattccgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctctttatacctttcttcctgcaaaactcattaaa 54190545  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54190544 ctgctctgaaacaaacttcaggccattgtcagttctcaacactttcagtttagttccaatctgattttctacaagtgtatcccattctttgaatttttca 54190445  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54190444 aaagcatcacttttattcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 54190393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10899245 - 10898894
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  10899245 gatggacatctgttaatcaaatatgctacagtactaacagcgtctccccagaaactcttggacaatccagctcccaacagcatacacctcacacgctcca 10899146  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10899145 acaaagtcctgttcattctttctgcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctctttatacctttcttcctgcaaaactcattaaa 10899046  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||| || |||||||| |||||||||||    
T  10899045 ctactttgaaacaaactccaggccattgtcagttctcaacactttcagtttagttccaatctgattttctacaagtataacccattccatgaatttttca 10898946  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10898945 aaagcatcacttttattcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 10898894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 22623928 - 22624275
Alignment:
Q  12 gacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctccaacag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  22623928 gacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccataaactcttggacaatccagctcccaacagcatacacctcacacgctccaacaa 22624027  T
Q  112 agtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaactgt 211  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||     
T  22624028 agtcttattcattctttcagcaagaccattttgttgaggtgtgtatgccacggttctatccctctttatacctttcttcctacaaaactcattaaactgc 22624127  T
Q  212 tctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttcaaaag 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  22624128 tctgaaacaaactccaggccattgtcagttctcaacactttcagtttagttccaatctgattttctataagtatatcccattctttgaatttttcaaagg 22624227  T
Q  312 catcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22624228 catcacttttattcttcagaatgtaaacccacactcttctagaataat 22624275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 29911898 - 29912249
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||    
T  29911898 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcttcaccccagaaacttttggacaatccagctcccaacatcatacacctcacacactcca 29911997  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    ||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29911998 acaaagtcctattcattctttctgcaaggccattctgttgaggtgtgtatgccacaattctatgcctctttatacctttcttcctgcaaaactcattaaa 29912097  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  29912098 ctgctctgaaacaaactccagaccattgtcagttctcaacactttcagtttagttccaatctgattttctacaagtgtacaccattctttgaatttttca 29912197  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29912198 aaggcatcacttttcttcttcagaatgtaaacacatactcttctagaataat 29912249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 10610718 - 10611073
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  10610718 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccctagaaactcttggacaatccaactcccaacagcatacacctcaaacgctcca 10610817  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattct----gttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcat 203  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  10610818 acaaggtcctattcattctttcagcaagaccattatatatgttgaggtgtgtatgccacagttttatgcctctttatacctttcttcctacaaaactcat 10610917  T
Q  204 taaactgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaattt 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||    
T  10610918 taaactgctctgaaacaaactccagaccattgtcagttctcaacactttcagtttagttccaatctgattttctacaagtatatcccattctttgaattt 10611017  T
Q  304 ttcaaaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10611018 ttcaaaagcatcacttttattccttagaatgtaaacccatactcttctagaataat 10611073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 47880833 - 47881184
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  47880833 gatggacatatgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcttctccctagaaactcttggacaatccagctcccaacaacatacatctcacacgctcca 47880932  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| | ||||| ||||||||    
T  47880933 acaaggtcctattcattctttcagcaagacaattttgttgaggtgtgtatgccacgattctatgcctctttatacctcttttcgtacaaaactcattaaa 47881032  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||| | |||||||| |||||| || |||||||||    
T  47881033 ctgctctgaaacaaactacaggccattgtcggttctcaacactttcagtttagtttcaatctaattttctacaagtgtatgccattctttaaatttttca 47881132  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47881133 aaagcgtcacttttattcttcagaatgtaaacctatactcttctagaataat 47881184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 8514989 - 8515340
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||  | || || || |||||||||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  8514989 gatggacatctattgatcaaataagcagccgttgtcacggcttcaccccagaaactcttaggtaacccagctcctagaatcatacacctcacacgctcca 8515088  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | |||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||   ||  |||||||||||||| || || ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  8515089 aaagagtcctattcatgcgttccgcaagaccattttgttgaggtgttcttggtacggttctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaa 8515188  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||||| || || || |||||||| || || || | |||||| ||||| ||||||    
T  8515189 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttcttaaaccttttagtttagttcccatttgattttctatgagagtgtgccattctttgaacttttca 8515288  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    || |  |||||||| || |||| ||   | ||||| ||||| ||||||||||    
T  8515289 aaggtgtcacttttgtttttcaaaacaaagacccacactctcctagaataat 8515340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 53 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 2674367 - 2674061
Alignment:
Q  53 ccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctccaacagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtg 152  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  2674367 ccccagaaactcttaggtaacccagctcctagaatcatacacctcacacgctccaaaagagtcctattcatgcgttccgcaagaccattttgttgcggtg 2674268  T
Q  153 tgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaactgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacatttt 252  Q
    |   ||  |||||||||||||| || || ||||||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||    
T  2674267 ttcttggtacggttctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaactgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttcttaaaccttt 2674168  T
Q  253 cagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttcaaaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttcta 352  Q
     ||||| || || || |||||||| || || || | |||||| ||||| |||||||| | ||||||||| || |||| ||   | ||||| ||||| |||    
T  2674167 tagtttagttcccatttgattttctatgagagtgtgccattctttgaacttttcaaaggtatcacttttgtttttcaaaacaaagacccacactctccta 2674068  T
Q  353 gaataat 359  Q
    |||||||    
T  2674067 gaataat 2674061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 32478235 - 32478586
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||  | || || || |||||||||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  32478235 gatggacatctattgatcaaataagcagccgttgtcacggcttcaccccagaaactcttaggtaacccagctcctagaatcatacacctcacacgctcca 32478334  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||   ||  |||||||||||||| || || ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  32478335 aaagggtcctattcatgcgttccgcaagaccattttgttgaggtgttcttggtacggttctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaa 32478434  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||||| || || || |||||||| || || || | |||||| ||||| ||||||    
T  32478435 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttcttaaaccttttagtttagttcccatttgattttctatgagagtgtgccattctttgaacttttca 32478534  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    || |  |||||||| || |||| ||   | ||||| ||||| ||||||||||    
T  32478535 aaggtgtcacttttgtttttcaaaacaaagacccacactctcctagaataat 32478586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 1308766 - 1309117
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||  | || || || |||||||||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  1308766 gatggacatctattgatcaaataagcagcagttgtcactgcttcaccccagaaactcttaggtaacccagctcctagaatcatacacctcacacgctcca 1308865  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | || ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||    |  ||||| |||||||| || || | ||||  | ||||||| ||||||||    
T  1308866 aaagggtcctattcatgcgttcagcaagaccattttgttgcgatgttctcggtacggtcctatgcctcttgattcttttcaacatgcaaaactcattaaa 1308965  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
     || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||||| || || || |||||||| || || || | ||||||||| || ||||||    
T  1308966 ttgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttcttaaaccttttagtttagttcccatttgattttctatgagagtgtgccattccttcaacttttca 1309065  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    || |  |||||||| || |||| ||   | || || ||||||||||||||||    
T  1309066 aatgtgtcacttttgtttttcaaaacaaagactcacactcttctagaataat 1309117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3325664 - 3325429
Alignment:
Q  74 ccagctcctaacagcatacacctaacacgctccaacagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcc 173  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||| |||||| || ||| | ||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||    |  |||||  ||||||    
T  3325664 ccagctcctagaagcatacacctcacacactccaaaagggtcatattcatgcgttcagcaaaaccattttgttgcggtgttctcggtacggtcatatgcc 3325565  T
Q  174 tttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaactgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgatt 273  Q
    | || || ||||||  | ||||||| |||||||| || ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||  ||| ||||| || || || |||||    
T  3325564 tcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaattgatctgaaacaaacttcgggccattgtcagttcttaacccttttagtttagttcccatttgatt 3325465  T
Q  274 ttccataagtgtatcccattccttgaatttttcaaa 309  Q
    ||| || || || | |||||| ||||| ||||||||    
T  3325464 ttctatgagagtgtgccattctttgaacttttcaaa 3325429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Original strand, 16262441 - 16262525
Alignment:
Q  192 tgcaaaattcattaaactgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttc 276  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||| || || || ||||||||    
T  16262441 tgcaaaactcattaaattactctgaaacaaactccatgccattgtcagttcttaacccttttagtttagttcccatttgattttc 16262525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 13)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 3322733 - 3323084
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  3322733 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcccaacagcatacacctcacgcgctcca 3322832  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  3322833 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctctttatacctttctttctgcaaaactcattaaa 3322932  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3322933 ctgttctgaaacaaattccaagccattgtcagttctcaacactttcagtttggtaccaatctgattttctacaagtgtatcccattctttgaatttttca 3323032  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3323033 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 3323084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25407650 - 25407299
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25407650 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcaatactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcccaacagcatacacctcacacgctcca 25407551  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25407550 acaaagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctctttatacctttcttcctgcaaaactcattaaa 25407451  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25407450 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttctcaacactttcagtttagttccaatctgattttctacaagtgtatcccattctttgaatttttca 25407351  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25407350 aaagcatcacttttattcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 25407299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7072287 - 7071936
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||    
T  7072287 gatggacatctgttaatcaaatatgttgcagtactaacagcctctccctagaaactcttggacaatccagctcccaacagcatacacctcacacattcca 7072188  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7072187 acaaagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgctacggttctatgcctctttatacctttcttcctgcaaaactcattaaa 7072088  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7072087 ctgttctgaaacaaactccaagccattgttagttctcaacactttcagtttggtaccaatctgattctctataagtatatcccattctttgaatttttca 7071988  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7071987 aaggcatcacttttattcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 7071936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25353588 - 25353237
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  25353588 gatggacatctgttaatcaaatatgttgcagtactaacagcttcaccccagaaactcttggacaatccagctcccaacaacatacacctcacacgctcca 25353489  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25353488 acaaagtcctattcattctttctgcaagaccattctgttgagttgtgtatgccacagttctatgcctctttatacctttcttcctgcaaaactcattaaa 25353389  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25353388 ctgctctgaaacaaactcaaggctattgtcagttctcaacactttcagtttagttccaatctgattttctataagtgtattccattctttgaatttttca 25353289  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25353288 aaggcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 25353237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 44012475 - 44012826
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  44012475 gatggacatctgttaatcaaatatgttgcaatactaacagcttctccccagaaactcttggacaatccagctcccaacaacatacacctcacacgctcca 44012574  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  44012575 acaaggtcctgttcattctttcagcaagaccattttgttgaggtgtgtatgtcacggttctatgcctctttataccttttttcctgcaaaactcattaaa 44012674  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||  ||||| || |||||||||    
T  44012675 cttctctgaaacaaactccaggccattgtcagttctcaacactttcagtttagttccaatctgattttctacaagtgtatgtcattctttaaatttttca 44012774  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44012775 aaagcgtcacttttattcttcataatgtaaactcatacccttctagaataat 44012826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 16882822 - 16883173
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||  | || || || |||||||||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  16882822 gatggacatctattgatcaaataagcagccgttgtcacggcttcaccccagaaactcttaggtaacccagctcctagaatcatacacctcacacgctcca 16882921  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||   ||  |||||||||||||| || || ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  16882922 aaagggtcctattcatgcgttccgcaagaccattttgttgaggtgttcttggtacggttctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaa 16883021  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||||| || || || |||||||| || || || | |||||| ||||| ||||||    
T  16883022 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttcttaaaccttttagtttagttcccatttgattttctatgagagtgtgccattctttgaacttttca 16883121  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    || |  |||||||| || |||| ||   | ||||| ||||| ||||||||||    
T  16883122 aaggtgtcacttttgtttttcaaaacaaagacccacactctcctagaataat 16883173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24263515 - 24263164
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||  | || || || |||||||||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  24263515 gatggacatctattgatcaaataagcagccgttgtcacggcttcaccccagaaactcttaggtaacccagctcctagaatcatacacctcacacgctcca 24263416  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | |||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||| || || ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  24263415 aaagagtcctattcatgcgttccgcaagaccattttgttgcggtgttcttggtacggttctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaa 24263316  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||||| || || || |||||||| || || || | |||||| ||||| ||||||    
T  24263315 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttcttaaaccttttagtttagttcccatttgattttctatgagagtgtgccattctttgaacttttca 24263216  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    || |  |||||||| || |||| ||   | ||||| ||||| ||||||||||    
T  24263215 aaggtgtcacttttgtttttcaaaacaaagacccacactctcctagaataat 24263164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 243
Target Start/End: Original strand, 4860627 - 4860862
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||  | || || || ||| |||||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||    
T  4860627 gatggacatctattgatcaaataagcagccgttgtcactgcttcaccctagaaactcttaggtaacccagctcctagaatcatacacctcacacgcttca 4860726  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | |||||| | ||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||| || || ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  4860727 aaagagtcttattcatgcgttctgcaagaccattttgttgtggtgttcttggtacggttctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaa 4860826  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttct 243  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4860827 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttct 4860862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 21643932 - 21644283
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||  | ||||| || |||||||||||||| |  || | ||||||||  | ||| || || ||||||||||    
T  21643932 gatggacatctattgatcaaataagcagccgttgtcacagcttcaccccagaaactcttaggtaacctagctcctagaatcatgcatctcacacgctcca 21644031  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| |  |  ||||| |||||||| || || |||||   | ||||||| ||||||||    
T  21644032 aaagagtcctattcatgcgttcagcaagaccattttgttgcggtgttttcggtacggtcctatgcctcttgattcctttaaacctgcaaaactcattaaa 21644131  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||| ||||| || || || |||||||| || || || | ||||||||| || ||||||    
T  21644132 ttgctctgaaacaaactccaagccattgtcagatcttaaaccttttagtttagttcccatttgattttctatgagagtgtgccattccttaaacttttca 21644231  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    || |  |||||||| || |||| ||   | ||||| ||||| ||||||||||    
T  21644232 aatgtgtcacttttgtttttcaaaacaaagacccacactctcctagaataat 21644283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 243
Target Start/End: Original strand, 24271956 - 24272146
Alignment:
Q  53 ccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctccaacagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtg 152  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24271956 ccccagaaactcttaggtaacccagctcctagaagcatacaccttacacgctccaaaagggtcctattcatgcgttcagcaagaccattttgttgcggtg 24272055  T
Q  153 tgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaactgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttct 243  Q
    |    |  |||||||||||||| || || |||||   | ||||||| |||||||| || |||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  24272056 ttctcggtacggttctatgcctcttgattccttttaacctgcaaaactcattaaattgctctgaaacaaactctaggccattgtcatttct 24272146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 243
Target Start/End: Original strand, 18411597 - 18411788
Alignment:
Q  53 ccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctccaacagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtg 152  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18411597 ccccagaaactcttaggtaacccagctcctagaatcatacacctcacacgctccaaaagagtcctatacatgcgttcagcaagaccattttgttgcggtg 18411696  T
Q  153 tgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgc-aaaattcattaaactgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttct 243  Q
    |    |  ||||| |||||||| || || ||||||  | ||| |||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18411697 ttctcggtacggtcctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaaaatcattaaattgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttct 18411788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9187337 - 9187048
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||  | || || || ||| ||||||| || |  || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  9187337 gatggacatctattgatcaaataggcagcagttgtcactgcttcaccctagaaacttttaggtaacccagctcctagaagcatacacctcacacgctcca 9187238  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | || ||||| |||||   ||||||||||||||| ||||| |||||    |  ||||| |||||||| || || ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  9187237 aaagggtcctattcatgagttcagcaagaccattttgttgcggtgttctcggtacggtcctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaa 9187138  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattcctt 297  Q
     || | |||||||||||| | |||||||| |||||| |||  ||| ||||| || || || |||||||| || || || | |||||||||    
T  9187137 ttgctatgaaacaaactctaggccattgttagttcttaacccttttagtttagttcccatttgattttctatgagagtgtgccattcctt 9187048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 359
Target Start/End: Original strand, 21986881 - 21987166
Alignment:
Q  74 ccagctcctaacagcatacacctaacacgctccaacagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcc 173  Q
    ||||||||||  | ||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| |    |  ||||| |||||||    
T  21986881 ccagctcctagaatcatacacctcacacgctcaaaaagggtcctattcatgcgttcagcaagaccattttgttgtggtattctcggtacggtcctatgcc 21986980  T
Q  174 tttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaactgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgatt 273  Q
    | || || | |||   | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||| || || || |||||    
T  21986981 tcttgattcattttaacctgcaaaactcattaaattgctctgaaacaaactccatgccattgtcagttcttaacccttttagtttagttcccatttgatt 21987080  T
Q  274 ttccataagtgtatcccattccttgaatttttcaaaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    ||| ||||| || |  |||||||| || || ||||| |  |||||||| || |||| ||   | ||||| ||||||||||||||||    
T  21987081 ttctataagagtgtgtcattccttaaacttctcaaatgtgtcacttttgtttttcaaaacaaagacccacactcttctagaataat 21987166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 8)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 39684483 - 39684133
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  39684483 gatggacatctgttaatcaaatatgttgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctcacgcgctcca 39684384  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  39684383 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctctttatacctttcttcctgcaaaactcattaaa 39684284  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39684283 ctgttctgaaacaaacttcaagccattgtcagttctcaaca-cttcagtttggtaccaatctgattttctacaagtgtatcccattccttgaatttttca 39684185  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39684184 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 39684133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 45569626 - 45569275
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  45569626 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcccaacagcatacacctcactcgctcta 45569527  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  45569526 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctctttatacctttcttcctgcaaaactcattaaa 45569427  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45569426 ctgttctgaaacaaattccaagccattgtcagttctcaacactttcagtttggtatcaatctgattttctacaagtgtatcccattctttgaatttttca 45569327  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45569326 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 45569275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 2738441 - 2738090
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  2738441 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctcttcccagaaaatcttggacaatcctgcttccaacagcatacacctcacacgctcca 2738342  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2738341 acagagtcctgttcattctttcagcaagatcattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctctttatacctttcttcctgcaaaactcattaaa 2738242  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  2738241 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacactttcagtttggtaccaatctgattttctataagtatattccattctttgaatttttca 2738142  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2738141 aaggcatcacttttattcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 2738090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 22715179 - 22715530
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22715179 gatggacatcttttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccctaaaaactcttggacaatccagctcccaacagcatacacctcacacgctcca 22715278  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22715279 acaaagtccagttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacagttctatgcctctttatacctttcttcctgcaaaactcattaaa 22715378  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  22715379 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttctcaacactttcagtttagttccaatctgattttctacaagtatataccattcattgaatttttca 22715478  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22715479 aaggcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 22715530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17934320 - 17933969
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17934320 gatggacatatgttaatcaaatatgctgtagtactaacagcttctccccggaaactcttggacaatccagctcccaacagcatacacctcacacgctcca 17934221  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    ||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17934220 acaaagtcctattcattctttctgcaaggccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctctttatacctttcttcctgcaaaactcattaaa 17934121  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17934120 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttctcaacactttcagtttagtcccaatctgattttctacaagtgtattccattctttgaatttttca 17934021  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17934020 aaggcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 17933969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 20052705 - 20053056
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||    
T  20052705 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcccaataacatacacctcacacgctcca 20052804  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||| ||| ||||||||    
T  20052805 acaaggtcctattcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttttatgcctctttatacctttttacctgctaaactcattaaa 20052904  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||| |||||||||| || |||||||||    
T  20052905 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttctcaacactttcagtttagttccaatctgattttctacaagtatatcccattctttaaatttttca 20053004  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20053005 aaagcatcactcttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 20053056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 309
Target Start/End: Original strand, 19347173 - 19347474
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||  | || || || |||||||||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  19347173 gatggacatctattgatcaaataagcagccgttgtcacggcttcaccccagaaactcttaggtaacccagctcctagaatcatacacctcacacgctcca 19347272  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | || ||||| ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||| || || ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  19347273 aaagtgtcctattcatgcgttccgcaaggccattttgttgcggtgttcttggtacggttctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaa 19347372  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||||| || || || |||||||| || || || | |||||| ||||| ||||||    
T  19347373 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttcttaaaccttttagtttagttcccatttgattttctatgagagtgtgccattctttgaacttttca 19347472  T
Q  308 aa 309  Q
    ||    
T  19347473 aa 19347474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 88 - 359
Target Start/End: Original strand, 25393861 - 25394132
Alignment:
Q  88 catacacctaacacgctccaacagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttc 187  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||    |  |||||||||||||| || || ||||||    
T  25393861 catacacctcacacgctccaaaagagtcttattcatgcgttcagcaagaccattttgttgcggtgttctcggtacggttctatgcctcttgattcctttc 25393960  T
Q  188 ttcttgcaaaattcattaaactgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtat 287  Q
      | ||||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||   ||| ||||| || || || |||||||| || || || |    
T  25393961 aacctgcaaaactcattaaattgctctgaaacaaactctaggccattgtcagttctcaaaccttttagtttagttcccatttgattttctatgagagtgt 25394060  T
Q  288 cccattccttgaatttttcaaaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
     ||||||||| || |||||||| |  |||||||| || |||| ||   | ||||| ||||| ||||||||||    
T  25394061 gccattccttaaacttttcaaatgtgtcacttttgtttttcaaaacaaagacccacactctcctagaataat 25394132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9523964 - 9523613
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  9523964 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcccaacagcatacacctcacacgctcca 9523865  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9523864 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctctttatacctttcttcctgcaaaactcattaaa 9523765  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9523764 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttctcaaaactttcagtttagttccaatctgattttctataagtatatcccattctttgaatttttca 9523665  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9523664 aaggcatcacttttattcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 9523613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 113 - 359
Target Start/End: Original strand, 2397278 - 2397524
Alignment:
Q  113 gtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaactgtt 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |    
T  2397278 gtcctattcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctctttataccttttttcctgcaaaactcattaaactgct 2397377  T
Q  213 ctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttcaaaagc 312  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| | |||||||| |||||| || |||||||||||||     
T  2397378 ctgaaacaaactccatgccattattagttctcaacactttcagtttagttctaatctgattttctacaagtgtatgccattctttaaatttttcaaaagt 2397477  T
Q  313 atcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2397478 gtcacttttattcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 2397524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 359
Target Start/End: Original strand, 41396200 - 41396485
Alignment:
Q  74 ccagctcctaacagcatacacctaacacgctccaacagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcc 173  Q
    ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||    |  |||||||||||||    
T  41396200 ccagctcctagaatcatacacctcacacgctccaaaagagtcctattcatgcgttccgcaagaccattttgttgcggtgttctcggtacggttctatgcc 41396299  T
Q  174 tttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaactgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgatt 273  Q
    | || || ||||||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||||| || || || |||||    
T  41396300 tcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaactgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttcttaaaccttttagtttagttcccatttgatt 41396399  T
Q  274 ttccataagtgtatcccattccttgaatttttcaaaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    ||| || || || | |||||| ||||| |||||||| | ||||| ||| || |||| ||   | ||||| ||||| ||||||||||    
T  41396400 ttctatgagagtgtgccattctttgaacttttcaaaggtatcacgtttgtttttcaaaacaaagacccacactctcctagaataat 41396485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Original strand, 2397200 - 2397273
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcc 81  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2397200 gatggacatctattaatcaaatatgttgtagtactaacagcttctccccaaaaactcttggacaatccagctcc 2397273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14189850 - 14189722
Alignment:
Q  231 cattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttcaaaagcatcacttttcttcttcag 330  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||  |||||| |||||| || | |||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  14189850 cattgtcggttcttaacactttcagtttagtttcaatctaattttctatgattgtatgtcattctttaaatttttcaaaagcgtcacttttatttttcag 14189751  T
Q  331 aatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    |||| || |||| || |||||||||||||    
T  14189750 aatggaatcccacacccttctagaataat 14189722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 47100945 - 47100721
Alignment:
Q  74 ccagctcctaacagcatacacctaacacgctccaaca-gagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgc 172  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | | ||| | ||||| | ||||||||||||||| | ||| |||||    |  ||||| ||||||    
T  47100945 ccagctcctagaagcatacacctcacacgctccaaaaagggtcatattcatgcgttcagcaagaccattttattgcggtgttctcggtacggtcctatgc 47100846  T
Q  173 ctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaactgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgat 272  Q
    || || || |||||   | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||| || || || ||||    
T  47100845 ctcttgattccttttaacctgcaaaactcattaaattgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttcttaacccttttagtttagttcccatttgat 47100746  T
Q  273 tttccataagtgtatcccattcctt 297  Q
    |||| || || || | |||||||||    
T  47100745 tttctatgagagtgtgccattcctt 47100721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 49151 - 49502
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  49151 gatggacatctgttaatcaaatatgttgcagtattaacagcctctccccataaactcttggacaatccagctcccaacagcatacacctcacacgctcca 49250  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  49251 acaaagtcctgttcattctttcagcaagaccattcttttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctctttatacctttcttcctgcaaaactcattaaa 49350  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  49351 ctgctatgaaacaaactccaggccattgtcagttctcaacacttttagtttagttccaatctgattttctataagtatatcccattctttgaatttttca 49450  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49451 aaagcatcacttttattcttcagaatgtaaactcatactcttctagaataat 49502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25447723 - 25447372
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  25447723 gatggacatctattaatcaaatatgttgcagtactaacagcctctccctagaaactcttggacaatccagctcccaacatcatacacctcacacgctcca 25447624  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  25447623 acaaagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacagttctatgcctctttatacctttcttcctgaaaaactcattaaa 25447524  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25447523 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttctcaacactttcagtttagttccaatctgattttctacaagtgtatcccattctttgaatttttca 25447424  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25447423 aaaccatcacttttattcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 25447372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 37558794 - 37558443
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||  | || || || |||||||||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  37558794 gatggacatctattgatcaaataagcagctgttgtcacggcttcaccccagaaactcttaggtaacccagctcctagaatcatacacctcacacgctcca 37558695  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | |||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||   ||  |||||||||||||| || || ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  37558694 aaagagtcctattcatgcgttccgcaagaccattttgttgaggtgttcttggtacggttctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaa 37558595  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||| || || || |||||||| || || || | |||||| ||||| ||||||    
T  37558594 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttctcaaaccttttagtttagttcccatttgattttctatgagagtgtgccattctttgaacttttca 37558495  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    || | ||||||||| || |||| ||   | ||||| ||||| ||||||||||    
T  37558494 aaggtatcacttttgtttttcaaaacaaagacccacactctcctagaataat 37558443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 309
Target Start/End: Original strand, 33789251 - 33789552
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||  | || || || |||||||||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  33789251 gatggacatctattgatcaaataagcagccgttgtcacggcttcaccccagaaactcttaggtaacccagctcctagaatcatacacctcacacgctcca 33789350  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||| || || ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  33789351 aaagtgtcctattcatgcgttccgcaagaccattttgttgcggtgttcttggtacggttctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaa 33789450  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||||| || || || |||||||| || || || | |||||| ||||| ||||||    
T  33789451 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttcttaaaccttttagtttagttcccatttgattttctatgagggtgtgccattctttgaacttttca 33789550  T
Q  308 aa 309  Q
    ||    
T  33789551 aa 33789552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31399184 - 31398833
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||  | || || || |||||||||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  31399184 gatggacatctattgatcaaataagcagccgttgtcacggcttcaccccagaaactcttaggtaacccagctcctagaatcatacacctcacacgctcca 31399085  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | || ||||| ||||| | ||| ||||| ||||| |||||  ||||   ||  |||||||||||||| || || ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  31399084 aaagtgtcctattcatgcgttccgcaaggccattttgttgcagtgttcttggtacggttctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaa 31398985  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||||| || || || |||||||| || || || | |||||| ||||| ||||||    
T  31398984 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttcttaaaccttttagtttagttcccatttgattttctatgagagtgtgccattctttgaacttttca 31398885  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    || |  |||||||| || |||| ||   | ||||| ||||| ||||||||||    
T  31398884 aaggtgtcacttttgtttttcaaaacaaagacccacactctcctagaataat 31398833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 243
Target Start/End: Original strand, 43595016 - 43595251
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||  | || || || |||||||||||||| |  || ||||||||||  | |||||| || ||||||||||    
T  43595016 gatggacatctattgatcaaataagcagccgttgtcacggcttcaccccagaaactcttaggtaacccagctcctagaatcatacatctcacacgctcca 43595115  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | |||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||    |  |||||||||||||| || || ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  43595116 aaagagtcctattcatgcgttccgcaagaccattttgttgtggtgttctcggtacggttctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaa 43595215  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttct 243  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43595216 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttct 43595251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 243
Target Start/End: Original strand, 43627810 - 43628045
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||  | || || || |||||||||||||| |  || ||||||||||  | |||||| || ||||||||||    
T  43627810 gatggacatctattgatcaaataagcagccgttgtcacggcttcaccccagaaactcttaggtaacccagctcctagaatcatacatctcacacgctcca 43627909  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | |||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||    |  |||||||||||||| || || ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  43627910 aaagagtcctattcatgcgttccgcaagaccattttgttgtggtgttctcggtacggttctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaa 43628009  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttct 243  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43628010 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttct 43628045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 27447718 - 27448069
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||  | || || || |||||||||||||| |  || ||||||||||  | |||||| || ||||||||||    
T  27447718 gatggacatctattgatcaaataagcagccgttgtcacggcttcaccccagaaactcttaggtaacccagctcctagaatcatacatctcacacgctcca 27447817  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | |||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||    |  |||||||||||||| || || ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  27447818 aaagagtcctattcatgcgttccgcaagaccattttgttgcggtgttctcggtacggttctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaa 27447917  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||   ||| ||||| || ||||| |||||||| || || || | |||||| || || ||||||    
T  27447918 ctgctctgaaacaaacttcagaccattgtcagttcttaaaccttttagtttagttccaatttgattttctatgagagtgtgccattctttaaacttttca 27448017  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    || |  |||||||| || |||| ||   | ||||| ||||| ||||||||||    
T  27448018 aaggtgtcacttttgtttttcaaaacaaagacccacactctcctagaataat 27448069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24557776 - 24557537
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||  | |  || || ||| |||||||||| |  || ||||||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  24557776 gatggacatctattgatcaaataagcagcagttgtcattgcttcaccctagaaactcttaggtaacccagctccttaaagcatacacctcacccgctcca 24557677  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | || ||| | |||||   ||||||||||||||| ||||| |||||       ||||| |||||||| || || ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  24557676 aaagggtcatattcatgtgttcagcaagaccattttgttgcggtgttctcagtacggtcctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaa 24557577  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaac 247  Q
     || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24557576 ttgctcttaaacaaactccaggccattgtcagttctcaac 24557537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24598808 - 24598569
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||  | |  || || ||| |||||||||| |  || ||||||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  24598808 gatggacatctattgatcaaataagcagcagttgtcattgcttcaccctagaaactcttaggtaacccagctccttaaagcatacacctcacccgctcca 24598709  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | || ||| | |||||   ||||||||||||||| ||||| |||||       ||||| |||||||| || || ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  24598708 aaagggtcatattcatgtgttcagcaagaccattttgttgcggtgttctcagtacggtcctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaa 24598609  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaac 247  Q
     || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24598608 ttgctcttaaacaaactccaggccattgtcagttctcaac 24598569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Original strand, 28836196 - 28836434
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||  ||||  | || || || ||| |||||||||| |  || ||||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  28836196 gatggacatctattgatcaaataagcaacagttgtcactgcttcaccctagaaactcttaggtaacccagctcctagaagcatacacctcacacactcca 28836295  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | || ||| | |||||   ||||||||||||||| ||||| |||||    |  || || |||||||| || |  || |||  | ||||||| ||||||||    
T  28836296 aaagggtcatattcatgtgttcagcaagaccattttgttgcggtgttctcggtacagtcctatgcctcttgaatccattcaacctgcaaaactcattaaa 28836395  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaa 246  Q
     || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  28836396 ttgctctgaaacaaactccaggccattatcagttctcaa 28836434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18562 - 18211
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18562 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcttctccccagaaattcttggacaatccagctcccaacagcatacacctcacacgttcca 18463  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    |||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  18462 acaaggtcatgttcattcttttagcatgaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctctttataccctttttcctgcaaaactcattaaa 18363  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||| ||| |||||| || |||||||||    
T  18362 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttctcaacactttcagtttagttccaatctgattttctacaagtatatgccattctttaaatttttca 18263  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18262 aaagcatcacttttattcttcagaatgtaaactcatactcttctagaataat 18211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4567575 - 4567224
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  4567575 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcttctccctagaaactcttggacaatccagctcccaacagcatacacctcacacgctcca 4567476  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | ||| | ||||| ||||||||    
T  4567475 acaaggtcctattcattctttcagcaagaccattatgttgaggtgtgtatgtcacggttctatgcccctttatacctcttttcctacaaaactcattaaa 4567376  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| | |||||||| |||||| || |||||||||    
T  4567375 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttctcaacactttcaatttagttccaatctgattttctacaagtgtatgccattctttaaatttttca 4567276  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4567275 aaagcgtcacttttattcttcagaatgtaaacccatacccttctagaataat 4567224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15314552 - 15314203
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  15314552 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccctagaaactcttggacaatccagctcccagcagcatacacctcacacgctcca 15314453  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15314452 acaaggtcctgttcattctttcagcaagaccgttcagttgaggtgt--atgccacaattctatgcctctttatacctttcttcctgcaaaactcattaaa 15314355  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15314354 ctgctctaaaacaaactcctggccattgtcagttcttaacactttcagtttagttccaatctgattttctacaagtatatcccattccttgaatttttca 15314255  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15314254 aaagcatcacttttattcttcaaaatataaacccatactcttctagagtaat 15314203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16634727 - 16634376
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  | ||| ||| ||    
T  16634727 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcttcttcccagaaactcttggataatccagctcccaacaacatacatgtcacatgcttca 16634628  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    |||  ||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| | ||| | ||||| ||||||||    
T  16634627 acaaggtcttgttcattcttttcgctagaccattctgttgaggtgtgtatgcaacgattctatgcttctttatacctcttttccttcaaaactcattaaa 16634528  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||| |||||| |||||||||| |||||| || |||||||||    
T  16634527 ctgctctgaaacaaactccagaccattgtcagttcttaacactttcagtttagtttcaatctaattttctataagtgtatgccattctttaaatttttca 16634428  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16634427 aaagcgtcacttttattcttcagaatgtaaacccatacccttctagaataat 16634376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 192 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 47564814 - 47564647
Alignment:
Q  192 tgcaaaattcattaaactgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatccca 291  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||  ||    
T  47564814 tgcaaaactcattaaactgctctgaaacaaacttcaggtcattgtaagttctcaacactttcagtttagttccaatctgattttctacaagtgtatgtca 47564715  T
Q  292 ttccttgaatttttcaaaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47564714 ttctttaaatttttcaaaagcgtcacttttattcttcagaatgtaaacccatacccttctagaataat 47564647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 47564949 - 47564813
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  47564949 gatggacatattttaatcaaatatgctgcagtactaacaacttctccccagaaactcttggacaatccaactcccaacaacatacacctcacacgctcca 47564850  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctg 144  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47564849 acaaggtcctgttcattctttcagcaagatcattctg 47564813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 18858471 - 18858822
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||  | || || || |||||||||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  18858471 gatggacatctattgatcaaataagcagccgttgtcacggcttcaccccagaaactcttaggtaacccagctcctagaatcatacacctcacacgctcca 18858570  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | |||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||| || || ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  18858571 aaagagtcctattcatgcgttccgcaagaccattttgttgcggtgttcttggtacggttctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaa 18858670  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||||| || || || |||||||| || || || | |||||| ||||| ||||||    
T  18858671 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttcttaaaccttttagtttagttcccatttgattttctatgagagtgtgccattctttgaacttttca 18858770  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    || |  |||||||| || |||| ||   | ||||| ||||| ||||||||||    
T  18858771 aaggtgtcacttttgtttttcaaaacaaagacccacactctcctagaataat 18858822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 88 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9226513 - 9226280
Alignment:
Q  88 catacacctaacacgctccaacagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttc 187  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||| || || ||||||    
T  9226513 catacacctcacacgctccaaaagagtcctgttcatgcgttccgcaagaccattttgttgcggtgttcttggtacggttctatgcctcttgattcctttc 9226414  T
Q  188 ttcttgcaaaattcattaaactgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtat 287  Q
      | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||||| || || || |||||||| || || || |    
T  9226413 aacctgcaaaactcattaaactgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttcttaaaccttttagtttagttcccatttgattttctatgagagtgt 9226314  T
Q  288 cccattccttgaatttttcaaaagcatcactttt 321  Q
     |||||| ||||| |||||||| | |||||||||    
T  9226313 gccattctttgaacttttcaaaggtatcactttt 9226280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16626185 - 16625950
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||  | ||  | || |||||||||||||| |  || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  16626185 gatggacatctattgatcaaataagcagcagttgtcactacttcaccccagaaactcttaggtaacccagctcctaggagcatacacctcacacgctcca 16626086  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | || ||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||||  ||||    |  ||||| |||||||| || || |||||   | ||||||| ||||||||    
T  16626085 aaagggtcctattcatgcgttcagcaagactattttgttgcagtgttctcggtacggtcctatgcctcttgattcctttaaacctgcaaaactcattaaa 16625986  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttct 243  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16625985 ttgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttct 16625950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 359
Target Start/End: Original strand, 5145883 - 5146154
Alignment:
Q  88 catacacctaacacgctccaacagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttc 187  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||    |  |||||  ||||||| || || |||||     
T  5145883 catacacctcacacgctccaaaagggtcatattcatgcattcagcaagaccattttgttgcggtgttctcggtacggtcatatgcctcttgattcctttt 5145982  T
Q  188 ttcttgcaaaattcattaaactgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtat 287  Q
      | ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| || || || || || |||||||| ||||| || |    
T  5145983 aacgtgcaaaactcattaaattgctctgaaataaactccaagccattgtcagttcttaacccttttagattagttcccatttgattttctataagagtgt 5146082  T
Q  288 cccattccttgaatttttcaaaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
     ||||||||| || || ||||| |  |||||||| || |||| ||   | ||||| ||||||||||||||||    
T  5146083 gccattccttaaacttctcaaatgtgtcacttttgtttttcaaaacaaagacccaaactcttctagaataat 5146154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 8 - 276
Target Start/End: Original strand, 1089 - 1357
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  1089 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcccaacaacatacaactcacacgctcca 1188  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1189 acaaagtcatattcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacagttctatgcctctttatacctttcttcctgcaaaactcattaaa 1288  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttc 276  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  1289 ctgctctgaaacaaactccaggctattgtcagttctcaacactttcagtttagttccaatctgattttc 1357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16501 - 16150
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||  | || || || |||||||||||||| |  || ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  16501 gatggacatctattgatcaaataagcagccgttgtcacggcttcaccccagaaactcttaggtaacccagctcctagaatcatacacctcacacgctcca 16402  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | |||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||| || || ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  16401 aaagagtcctattcatgcgttccgcaagaccattttgttgcggtgttcttggtacggttctatgcctcttgattcctttcaacctgcaaaactcattaaa 16302  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattccttgaatttttca 307  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||||| || || || |||||||| || || || | |||||| ||||| ||||||    
T  16301 ctgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttcttaaaccttttagtttagttcccatttgattttctatgagagtgtgccattctttgaacttttca 16202  T
Q  308 aaagcatcacttttcttcttcagaatgtaaacccatactcttctagaataat 359  Q
    || |  |||||||| || |||| ||   | ||||| ||||| ||||||||||    
T  16201 aaggtgtcacttttgtttttcaaaacaaagacccacactctcctagaataat 16150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 297
Target Start/End: Original strand, 403 - 692
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||  | || || || | |||||| ||||| |  || ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  403 gatggacatctattaatcaaataagcagcagttgtcactgcttcactccagaatctcttaggtaacccaactcctagaagcatacacctcacacgctcca 502  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | || ||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||    |  |||||  ||||||| || || |||||   | ||| ||| ||||||||    
T  503 aaagggtcatattcatgcgttcagcaagaccattttgttgcggtgttctcggtacggtcgtatgcctcttgattccttttaacctgccaaactcattaaa 602  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattcctt 297  Q
     || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||| || || || |||||||| || || || | |||||||||    
T  603 ttgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttcttaacccttttagtttagttcccatttgattttctatgagagtgtgccattcctt 692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 297
Target Start/End: Original strand, 8559 - 8848
Alignment:
Q  8 gatggacatctgttaatcaaatatgctgcagtactaacagcctctccccagaaactcttggacaatccagctcctaacagcatacacctaacacgctcca 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||  | || || || | |||||| ||||| |  || ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  8559 gatggacatctattaatcaaataagcagcagttgtcactgcttcactccagaatctcttaggtaacccaactcctagaagcatacacctcacacgctcca 8658  T
Q  108 acagagtcctgttcattctttcagcaagaccattctgttgaggtgtgtatgccacggttctatgcctttttatacctttcttcttgcaaaattcattaaa 207  Q
    | || ||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||    |  |||||  ||||||| || || |||||   | ||| ||| ||||||||    
T  8659 aaagggtcatattcatgcgttcagcaagaccattttgttgcggtgttctcggtacggtcgtatgcctcttgattccttttaacctgccaaactcattaaa 8758  T
Q  208 ctgttctgaaacaaactccaagccattgtcagttctcaacattttcagtttggtaccaatctgattttccataagtgtatcccattcctt 297  Q
     || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||| || || || |||||||| || || || | |||||||||    
T  8759 ttgctctgaaacaaactccaggccattgtcagttcttaacccttttagtttagttcccatttgattttctatgagagtgtgccattcctt 8848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University