View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10233A_low_80 (Length: 326)

Name: NF10233A_low_80
Description: NF10233A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10233A_low_80
NF10233A_low_80
[»] chr6 (72 HSPs)
chr6 (100-312)||(34963364-34963576)
chr6 (100-312)||(30676669-30676881)
chr6 (100-299)||(12742321-12742520)
chr6 (100-299)||(19005050-19005249)
chr6 (100-299)||(22782231-22782430)
chr6 (100-299)||(24422551-24422750)
chr6 (100-299)||(33861798-33861997)
chr6 (100-299)||(33864282-33864481)
chr6 (100-299)||(8055033-8055232)
chr6 (100-299)||(18334551-18334750)
chr6 (100-299)||(19858878-19859077)
chr6 (100-299)||(2291139-2291338)
chr6 (100-299)||(26924599-26924798)
chr6 (101-299)||(25656633-25656831)
chr6 (111-299)||(25754813-25755001)
chr6 (100-299)||(1540870-1541069)
chr6 (100-298)||(25688507-25688705)
chr6 (100-299)||(1595553-1595752)
chr6 (111-299)||(20556864-20557050)
chr6 (124-287)||(18456735-18456898)
chr6 (129-299)||(16448514-16448685)
chr6 (125-299)||(3852001-3852175)
chr6 (154-287)||(18461895-18462028)
chr6 (141-305)||(25629310-25629475)
chr6 (141-308)||(18409782-18409950)
chr6 (124-312)||(19847932-19848122)
chr6 (144-305)||(29060541-29060703)
chr6 (141-305)||(20360915-20361080)
chr6 (181-305)||(20593774-20593899)
chr6 (158-305)||(17287768-17287916)
chr6 (141-305)||(16496245-16496410)
chr6 (181-305)||(19303536-19303660)
chr6 (141-291)||(25644335-25644487)
chr6 (194-305)||(20076701-20076812)
chr6 (126-305)||(22780166-22780347)
chr6 (141-287)||(18821801-18821946)
chr6 (156-305)||(20638253-20638403)
chr6 (126-291)||(20109153-20109322)
chr6 (124-305)||(8227448-8227631)
chr6 (194-312)||(23992421-23992540)
chr6 (245-305)||(25714418-25714478)
chr6 (245-305)||(27333277-27333338)
chr6 (245-305)||(27394017-27394078)
chr6 (100-141)||(12942363-12942404)
chr6 (185-287)||(23019425-23019528)
chr6 (141-305)||(35245587-35245749)
chr6 (192-291)||(9098518-9098620)
chr6 (178-279)||(15041542-15041644)
chr6 (208-312)||(25603406-25603512)
chr6 (208-312)||(25611744-25611850)
chr6 (192-291)||(19668386-19668488)
chr6 (192-289)||(28496477-28496575)
chr6 (192-289)||(29808888-29808986)
chr6 (259-305)||(22080799-22080845)
chr6 (185-292)||(19652209-19652316)
chr6 (253-305)||(1561304-1561356)
chr6 (100-140)||(15875469-15875509)
chr6 (100-140)||(28289294-28289334)
chr6 (248-279)||(19790842-19790873)
chr6 (248-299)||(19862981-19863032)
chr6 (248-299)||(19873123-19873174)
chr6 (253-287)||(11185524-11185558)
chr6 (254-312)||(16929658-16929716)
chr6 (254-312)||(16965378-16965436)
chr6 (245-279)||(21766718-21766752)
chr6 (218-299)||(22432252-22432334)
chr6 (218-299)||(22438802-22438884)
chr6 (156-305)||(16920602-16920750)
chr6 (245-285)||(22831524-22831565)
chr6 (100-136)||(18913994-18914030)
chr6 (100-136)||(18937252-18937288)
chr6 (245-285)||(33443068-33443108)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (100-312)||(11279-11491)
[»] chr2 (68 HSPs)
chr2 (100-312)||(32214880-32215092)
chr2 (100-299)||(18808947-18809146)
chr2 (100-299)||(23709491-23709690)
chr2 (100-299)||(23711972-23712171)
chr2 (100-299)||(39682317-39682516)
chr2 (100-299)||(571401-571600)
chr2 (100-299)||(6725999-6726198)
chr2 (100-299)||(21155019-21155218)
chr2 (100-299)||(23130866-23131065)
chr2 (100-299)||(23133333-23133532)
chr2 (100-299)||(26505383-26505582)
chr2 (100-299)||(26507861-26508060)
chr2 (100-299)||(34402481-34402680)
chr2 (100-299)||(23135594-23135793)
chr2 (100-295)||(24367782-24367977)
chr2 (100-299)||(32039457-32039656)
chr2 (100-299)||(24898154-24898354)
chr2 (100-299)||(24900637-24900837)
chr2 (100-299)||(24903114-24903314)
chr2 (100-299)||(24905591-24905791)
chr2 (100-299)||(24908066-24908266)
chr2 (100-299)||(28577103-28577302)
chr2 (100-299)||(22105416-22105616)
chr2 (100-299)||(45029813-45030012)
chr2 (125-299)||(43137303-43137477)
chr2 (124-299)||(24529511-24529687)
chr2 (100-299)||(38967378-38967577)
chr2 (141-305)||(22337116-22337281)
chr2 (111-218)||(24642826-24642933)
chr2 (141-305)||(23060514-23060679)
chr2 (141-305)||(23076443-23076608)
chr2 (126-305)||(19671831-19672010)
chr2 (141-305)||(22731189-22731354)
chr2 (141-305)||(22738135-22738299)
chr2 (141-299)||(298769-298929)
chr2 (141-305)||(23285866-23286027)
chr2 (141-305)||(23660024-23660188)
chr2 (225-299)||(24643034-24643108)
chr2 (141-305)||(23654341-23654506)
chr2 (207-305)||(38136-38234)
chr2 (126-291)||(23708558-23708725)
chr2 (185-292)||(28405990-28406099)
chr2 (178-312)||(25616179-25616314)
chr2 (111-180)||(22173799-22173868)
chr2 (178-305)||(23103389-23103515)
chr2 (141-287)||(7688-7835)
chr2 (245-305)||(23040249-23040309)
chr2 (156-305)||(20309109-20309257)
chr2 (230-305)||(8946658-8946734)
chr2 (100-141)||(20261381-20261422)
chr2 (135-211)||(22459511-22459587)
chr2 (124-164)||(29601478-29601518)
chr2 (245-299)||(7679592-7679647)
chr2 (124-225)||(23791357-23791458)
chr2 (145-292)||(25175864-25176010)
chr2 (124-287)||(20520130-20520295)
chr2 (124-287)||(23207296-23207461)
chr2 (100-140)||(10684724-10684764)
chr2 (178-287)||(32451920-32452031)
chr2 (245-308)||(22134266-22134329)
chr2 (253-291)||(18786971-18787009)
chr2 (248-279)||(24869903-24869934)
chr2 (248-279)||(25961597-25961628)
chr2 (255-305)||(23072019-23072069)
chr2 (245-279)||(24655398-24655432)
chr2 (124-225)||(24697543-24697644)
chr2 (245-285)||(23287384-23287424)
chr2 (245-285)||(26392403-26392443)
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (100-301)||(16413275-16413476)
chr8 (100-299)||(14409403-14409602)
chr8 (100-299)||(1484406-1484605)
chr8 (100-299)||(5853251-5853450)
chr8 (100-299)||(20403231-20403430)
chr8 (100-299)||(22001757-22001956)
chr8 (100-299)||(15203190-15203389)
chr8 (100-299)||(20046154-20046353)
chr8 (100-299)||(4483285-4483483)
chr8 (100-299)||(4542332-4542531)
chr8 (105-299)||(19896269-19896466)
chr8 (124-299)||(41598192-41598367)
chr8 (100-299)||(14823778-14823976)
chr8 (100-303)||(45290653-45290857)
chr8 (124-308)||(26223914-26224098)
chr8 (111-299)||(19936975-19937164)
chr8 (100-290)||(15070571-15070763)
chr8 (111-299)||(25484245-25484426)
chr8 (126-287)||(19801367-19801527)
chr8 (141-305)||(16092297-16092462)
chr8 (141-305)||(6759259-6759421)
chr8 (126-305)||(18818348-18818529)
chr8 (141-308)||(28648999-28649167)
chr8 (153-305)||(7372779-7372932)
chr8 (141-305)||(20536209-20536374)
chr8 (156-305)||(21918969-21919120)
chr8 (161-299)||(26219721-26219858)
chr8 (141-305)||(22875066-22875230)
chr8 (140-305)||(23406380-23406548)
chr8 (158-305)||(21923900-21924048)
chr8 (185-299)||(26225292-26225405)
chr8 (141-305)||(22626737-22626901)
chr8 (124-303)||(13508022-13508203)
chr8 (124-303)||(13597554-13597735)
chr8 (100-190)||(24486003-24486093)
chr8 (141-305)||(18879191-18879351)
chr8 (178-312)||(23648547-23648682)
chr8 (124-287)||(20498581-20498746)
chr8 (100-180)||(32810054-32810134)
chr8 (178-312)||(18678094-18678229)
chr8 (156-305)||(31971258-31971407)
chr8 (135-305)||(17612059-17612230)
chr8 (178-312)||(32121726-32121861)
chr8 (145-305)||(38855212-38855371)
chr8 (207-305)||(45131019-45131116)
chr8 (192-305)||(6520369-6520483)
chr8 (185-297)||(21285606-21285719)
chr8 (124-287)||(37116366-37116532)
chr8 (207-305)||(16199666-16199764)
chr8 (192-305)||(5866280-5866394)
chr8 (204-305)||(17140917-17141019)
chr8 (192-305)||(21490996-21491110)
chr8 (192-291)||(983410-983512)
chr8 (192-305)||(21389458-21389570)
chr8 (192-305)||(21395988-21396100)
chr8 (192-305)||(21778784-21778896)
chr8 (192-305)||(21790481-21790593)
chr8 (245-291)||(23760903-23760950)
chr8 (124-225)||(17266930-17267031)
chr8 (256-305)||(21249385-21249434)
chr8 (256-305)||(21255223-21255272)
chr8 (185-292)||(21673718-21673826)
chr8 (141-225)||(17439461-17439544)
chr8 (253-292)||(26355766-26355805)
chr8 (248-302)||(39094987-39095041)
chr8 (253-302)||(20856492-20856541)
chr8 (100-140)||(35026855-35026895)
[»] chr4 (69 HSPs)
chr4 (100-312)||(19618131-19618343)
chr4 (100-312)||(14970666-14970878)
chr4 (100-299)||(3515011-3515210)
chr4 (100-299)||(18215233-18215432)
chr4 (100-299)||(15118311-15118510)
chr4 (100-299)||(52312514-52312713)
chr4 (100-299)||(12266-12465)
chr4 (100-303)||(15355283-15355487)
chr4 (100-299)||(19242703-19242903)
chr4 (100-299)||(44615292-44615491)
chr4 (100-299)||(44773046-44773245)
chr4 (100-299)||(1837468-1837667)
chr4 (100-299)||(18239378-18239577)
chr4 (100-299)||(50222298-50222497)
chr4 (111-299)||(51463838-51464026)
chr4 (111-299)||(23803235-23803423)
chr4 (124-299)||(44102218-44102393)
chr4 (111-299)||(12610954-12611135)
chr4 (135-299)||(44928873-44929038)
chr4 (100-299)||(7641151-7641340)
chr4 (124-305)||(15367691-15367873)
chr4 (124-305)||(15402704-15402886)
chr4 (124-287)||(21815568-21815731)
chr4 (124-305)||(15371203-15371385)
chr4 (124-305)||(15373484-15373666)
chr4 (129-299)||(20149833-20150004)
chr4 (124-305)||(15370019-15370200)
chr4 (127-305)||(16223533-16223712)
chr4 (185-299)||(14280320-14280434)
chr4 (161-299)||(54798729-54798868)
chr4 (141-305)||(7088878-7089043)
chr4 (126-305)||(7798775-7798956)
chr4 (141-299)||(14038655-14038814)
chr4 (141-298)||(16377478-16377634)
chr4 (141-305)||(12902758-12902923)
chr4 (141-304)||(22636437-22636601)
chr4 (194-305)||(52873375-52873487)
chr4 (130-287)||(22353852-22354010)
chr4 (141-305)||(7893704-7893869)
chr4 (141-305)||(16270191-16270355)
chr4 (141-305)||(44052830-44052995)
chr4 (143-305)||(16239927-16240089)
chr4 (185-299)||(8574868-8574981)
chr4 (141-305)||(6899892-6900056)
chr4 (124-287)||(13788-13953)
chr4 (141-301)||(23374314-23374475)
chr4 (124-291)||(52243131-52243302)
chr4 (126-291)||(43198492-43198661)
chr4 (221-305)||(3096294-3096379)
chr4 (197-305)||(39706299-39706408)
chr4 (143-232)||(15464888-15464977)
chr4 (181-292)||(12774021-12774132)
chr4 (207-305)||(14053323-14053421)
chr4 (100-141)||(15534343-15534384)
chr4 (192-291)||(12288214-12288316)
chr4 (100-140)||(14048740-14048780)
chr4 (100-140)||(36038033-36038073)
chr4 (245-305)||(15551818-15551879)
chr4 (100-140)||(49547733-49547773)
chr4 (207-287)||(6190481-6190563)
chr4 (124-287)||(46640393-46640558)
chr4 (245-305)||(17046488-17046549)
chr4 (100-140)||(15497030-15497070)
chr4 (100-140)||(19857607-19857647)
chr4 (100-139)||(52873137-52873176)
chr4 (245-279)||(11250621-11250655)
chr4 (245-279)||(15353367-15353401)
chr4 (248-306)||(20157522-20157580)
chr4 (245-292)||(8846370-8846418)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (100-312)||(12208-12420)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (100-304)||(10772-10976)
[»] chr3 (89 HSPs)
chr3 (100-312)||(13544016-13544228)
chr3 (100-312)||(12567551-12567763)
chr3 (100-299)||(9707566-9707765)
chr3 (100-299)||(16454240-16454439)
chr3 (100-299)||(17463182-17463381)
chr3 (100-299)||(45606866-45607065)
chr3 (100-299)||(7781306-7781505)
chr3 (100-299)||(8899098-8899297)
chr3 (100-299)||(34159330-34159529)
chr3 (100-299)||(55476495-55476694)
chr3 (100-299)||(6469093-6469292)
chr3 (100-299)||(10247682-10247881)
chr3 (100-299)||(16282770-16282969)
chr3 (100-299)||(17446614-17446812)
chr3 (100-299)||(28848570-28848769)
chr3 (100-295)||(38961850-38962045)
chr3 (100-299)||(13151749-13151949)
chr3 (100-299)||(13154214-13154414)
chr3 (100-299)||(41123894-41124090)
chr3 (111-295)||(50242830-50243014)
chr3 (124-299)||(29172565-29172741)
chr3 (124-299)||(17672630-17672805)
chr3 (100-299)||(8499522-8499723)
chr3 (104-299)||(15412433-15412630)
chr3 (124-299)||(12119707-12119883)
chr3 (124-287)||(53070636-53070799)
chr3 (111-287)||(43550448-43550625)
chr3 (173-299)||(15977519-15977645)
chr3 (141-305)||(14972855-14973020)
chr3 (192-299)||(55500946-55501053)
chr3 (100-299)||(27165254-27165455)
chr3 (141-299)||(40213676-40213834)
chr3 (100-299)||(53301463-53301665)
chr3 (161-299)||(36166602-36166739)
chr3 (141-305)||(17487857-17488022)
chr3 (141-305)||(17499339-17499504)
chr3 (141-305)||(25476340-25476505)
chr3 (125-288)||(42386428-42386593)
chr3 (126-298)||(43840940-43841114)
chr3 (141-305)||(13442275-13442440)
chr3 (126-305)||(26686888-26687069)
chr3 (141-292)||(14576788-14576939)
chr3 (161-293)||(21618459-21618590)
chr3 (156-305)||(12399210-12399360)
chr3 (192-305)||(18438535-18438649)
chr3 (156-305)||(20698405-20698555)
chr3 (141-305)||(23083316-23083481)
chr3 (200-299)||(10556989-10557088)
chr3 (204-299)||(44494813-44494908)
chr3 (124-305)||(24340660-24340843)
chr3 (141-299)||(24153164-24153322)
chr3 (205-299)||(17737240-17737337)
chr3 (141-305)||(11424718-11424879)
chr3 (178-292)||(14572603-14572717)
chr3 (124-288)||(23274705-23274871)
chr3 (126-287)||(52523666-52523831)
chr3 (178-312)||(46822259-46822394)
chr3 (124-305)||(37642202-37642385)
chr3 (178-312)||(30029834-30029968)
chr3 (192-312)||(12511051-12511172)
chr3 (126-225)||(2051138-2051238)
chr3 (124-187)||(17248224-17248287)
chr3 (181-302)||(32307681-32307802)
chr3 (135-232)||(22147474-22147571)
chr3 (250-299)||(45577947-45577996)
chr3 (185-291)||(15470939-15471046)
chr3 (192-305)||(13210333-13210447)
chr3 (192-305)||(14234488-14234602)
chr3 (245-299)||(28194697-28194752)
chr3 (126-292)||(16097342-16097509)
chr3 (126-292)||(16103794-16103960)
chr3 (100-140)||(54520985-54521025)
chr3 (192-292)||(12174265-12174366)
chr3 (100-138)||(29544801-29544839)
chr3 (124-287)||(37251105-37251270)
chr3 (245-306)||(14665397-14665458)
chr3 (245-299)||(856143-856197)
chr3 (248-302)||(3389999-3390053)
chr3 (248-306)||(14668553-14668611)
chr3 (245-299)||(23077537-23077591)
chr3 (100-133)||(12305315-12305348)
chr3 (201-292)||(49668091-49668183)
chr3 (248-299)||(15878114-15878165)
chr3 (248-302)||(3403019-3403073)
chr3 (201-292)||(9512934-9513026)
chr3 (201-292)||(9520909-9521001)
chr3 (254-299)||(26196500-26196545)
chr3 (245-285)||(13919350-13919390)
chr3 (100-140)||(15977696-15977736)
[»] chr1 (50 HSPs)
chr1 (100-304)||(21840766-21840970)
chr1 (100-299)||(23593693-23593893)
chr1 (100-312)||(16361908-16362121)
chr1 (100-299)||(13988870-13989069)
chr1 (100-299)||(21923250-21923449)
chr1 (100-299)||(21475046-21475245)
chr1 (100-299)||(29776692-29776891)
chr1 (100-299)||(29298141-29298339)
chr1 (100-299)||(31612317-31612516)
chr1 (100-299)||(22123026-22123226)
chr1 (100-299)||(16275322-16275522)
chr1 (124-305)||(13212844-13213026)
chr1 (100-299)||(15859967-15860167)
chr1 (124-299)||(21346965-21347141)
chr1 (111-287)||(45574812-45574989)
chr1 (124-299)||(21342100-21342276)
chr1 (124-299)||(21707171-21707346)
chr1 (124-299)||(21711713-21711888)
chr1 (129-299)||(40389158-40389329)
chr1 (124-299)||(433016-433190)
chr1 (141-308)||(50210168-50210336)
chr1 (141-305)||(27250684-27250849)
chr1 (181-299)||(34509787-34509906)
chr1 (141-305)||(22532270-22532435)
chr1 (141-312)||(22468651-22468823)
chr1 (124-287)||(21896193-21896358)
chr1 (178-312)||(20135181-20135316)
chr1 (127-287)||(21861510-21861672)
chr1 (141-290)||(21026696-21026846)
chr1 (245-312)||(20454613-20454680)
chr1 (135-291)||(16758664-16758822)
chr1 (205-305)||(20847173-20847274)
chr1 (124-287)||(35261018-35261180)
chr1 (126-291)||(33681022-33681188)
chr1 (181-302)||(21754049-21754170)
chr1 (124-287)||(41049973-41050138)
chr1 (124-286)||(14295493-14295652)
chr1 (192-292)||(20248293-20248394)
chr1 (141-230)||(22354527-22354616)
chr1 (185-292)||(22921868-22921976)
chr1 (192-290)||(20918620-20918719)
chr1 (145-291)||(22237642-22237788)
chr1 (248-299)||(21714549-21714600)
chr1 (248-306)||(24783155-24783213)
chr1 (253-291)||(52928038-52928076)
chr1 (100-140)||(43543214-43543254)
chr1 (231-292)||(21161730-21161792)
chr1 (245-299)||(42865273-42865327)
chr1 (128-225)||(50686695-50686792)
chr1 (135-219)||(12271642-12271725)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (100-301)||(17399-17600)
scaffold0023 (100-299)||(94415-94614)
scaffold0023 (144-299)||(44458-44614)
scaffold0023 (145-292)||(100388-100534)
scaffold0023 (245-305)||(119876-119937)
scaffold0023 (145-292)||(40135-40281)
scaffold0023 (248-299)||(38542-38593)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (102-312)||(501075-501285)
scaffold0001 (124-299)||(85562-85738)
scaffold0001 (192-292)||(160698-160798)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (103-299)||(4698-4894)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (100-304)||(9241-9445)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (100-299)||(20751-20950)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (100-299)||(37825-38024)
[»] chr7 (85 HSPs)
chr7 (100-299)||(456325-456524)
chr7 (100-299)||(11393246-11393445)
chr7 (100-299)||(15376672-15376871)
chr7 (100-299)||(16232524-16232723)
chr7 (100-299)||(20385082-20385281)
chr7 (100-299)||(21189554-21189753)
chr7 (100-299)||(32125495-32125694)
chr7 (100-299)||(41522921-41523120)
chr7 (100-299)||(41525383-41525582)
chr7 (100-299)||(11972500-11972699)
chr7 (100-299)||(14949081-14949280)
chr7 (100-299)||(18640276-18640475)
chr7 (100-299)||(24702242-24702441)
chr7 (100-299)||(27216864-27217063)
chr7 (100-299)||(16213688-16213887)
chr7 (100-299)||(16410063-16410262)
chr7 (100-305)||(18430710-18430915)
chr7 (100-299)||(24704692-24704888)
chr7 (124-299)||(44116513-44116688)
chr7 (125-299)||(3386337-3386511)
chr7 (154-312)||(24275162-24275320)
chr7 (111-287)||(13647344-13647521)
chr7 (100-299)||(13869350-13869551)
chr7 (124-299)||(17061898-17062073)
chr7 (126-299)||(20110560-20110723)
chr7 (100-299)||(26355942-26356152)
chr7 (100-299)||(26358394-26358604)
chr7 (124-299)||(38898359-38898535)
chr7 (124-287)||(12756654-12756817)
chr7 (184-299)||(48273396-48273512)
chr7 (177-299)||(13831377-13831499)
chr7 (141-299)||(3564319-3564478)
chr7 (141-305)||(12698832-12698998)
chr7 (141-299)||(18456368-18456526)
chr7 (141-305)||(9509190-9509355)
chr7 (141-305)||(38227482-38227646)
chr7 (135-290)||(26212012-26212168)
chr7 (124-291)||(2280056-2280225)
chr7 (111-210)||(15081919-15082019)
chr7 (192-290)||(10589055-10589154)
chr7 (185-291)||(15144037-15144143)
chr7 (184-305)||(67746-67868)
chr7 (185-305)||(22072914-22073036)
chr7 (124-305)||(19486681-19486864)
chr7 (100-158)||(13841157-13841215)
chr7 (124-305)||(10063760-10063938)
chr7 (207-305)||(16386268-16386368)
chr7 (253-305)||(47831808-47831860)
chr7 (201-299)||(14932749-14932848)
chr7 (201-299)||(15356184-15356283)
chr7 (201-299)||(15360298-15360397)
chr7 (192-305)||(34200787-34200901)
chr7 (156-304)||(40443393-40443541)
chr7 (126-284)||(12255730-12255892)
chr7 (145-292)||(18005660-18005806)
chr7 (100-141)||(11303409-11303450)
chr7 (185-291)||(16056343-16056449)
chr7 (124-305)||(16495403-16495581)
chr7 (135-219)||(15113031-15113114)
chr7 (100-152)||(18627717-18627769)
chr7 (208-312)||(15211450-15211557)
chr7 (209-305)||(28505321-28505418)
chr7 (197-292)||(811142-811238)
chr7 (135-219)||(15116568-15116651)
chr7 (100-140)||(16108648-16108688)
chr7 (100-140)||(23664912-23664952)
chr7 (100-140)||(29796771-29796811)
chr7 (100-140)||(29800590-29800630)
chr7 (194-292)||(44014192-44014291)
chr7 (248-306)||(2832504-2832562)
chr7 (245-299)||(18154901-18154955)
chr7 (192-291)||(16219723-16219823)
chr7 (253-305)||(11996095-11996147)
chr7 (100-140)||(14270021-14270061)
chr7 (253-305)||(15754955-15755007)
chr7 (124-225)||(20220127-20220225)
chr7 (281-312)||(16213622-16213653)
chr7 (248-299)||(19649552-19649603)
chr7 (245-279)||(9446218-9446252)
chr7 (245-299)||(12187022-12187076)
chr7 (124-225)||(15008436-15008536)
chr7 (245-299)||(17138120-17138174)
chr7 (245-279)||(20569656-20569690)
chr7 (192-305)||(27847838-27847950)
chr7 (100-140)||(8468803-8468843)
[»] chr5 (68 HSPs)
chr5 (100-299)||(264727-264926)
chr5 (100-299)||(42245324-42245523)
chr5 (100-299)||(39363388-39363587)
chr5 (100-299)||(10732899-10733098)
chr5 (100-299)||(20909016-20909215)
chr5 (100-299)||(29345984-29346183)
chr5 (100-299)||(32027397-32027596)
chr5 (100-299)||(29348457-29348656)
chr5 (100-299)||(29350930-29351129)
chr5 (100-299)||(39245140-39245339)
chr5 (100-299)||(29329938-29330134)
chr5 (100-299)||(20917911-20918106)
chr5 (124-299)||(36154766-36154938)
chr5 (126-299)||(11581184-11581357)
chr5 (124-299)||(20901991-20902168)
chr5 (124-299)||(2154596-2154772)
chr5 (129-299)||(18319021-18319192)
chr5 (124-299)||(31061072-31061248)
chr5 (100-299)||(38619438-38619639)
chr5 (124-299)||(10775659-10775834)
chr5 (102-299)||(23064515-23064714)
chr5 (129-299)||(24067111-24067282)
chr5 (141-305)||(1096468-1096633)
chr5 (141-305)||(23390451-23390616)
chr5 (141-305)||(9077953-9078118)
chr5 (141-305)||(25421533-25421698)
chr5 (141-305)||(21729019-21729184)
chr5 (141-305)||(21808344-21808509)
chr5 (199-305)||(21997547-21997654)
chr5 (181-299)||(24529227-24529346)
chr5 (141-305)||(8286797-8286963)
chr5 (141-286)||(25431414-25431560)
chr5 (141-305)||(24493570-24493734)
chr5 (161-299)||(22412191-22412329)
chr5 (141-305)||(13025312-13025476)
chr5 (141-305)||(13095496-13095660)
chr5 (141-290)||(22075035-22075185)
chr5 (141-287)||(22144068-22144215)
chr5 (178-312)||(17517193-17517328)
chr5 (124-305)||(40725854-40726037)
chr5 (208-296)||(18418590-18418678)
chr5 (161-248)||(20766095-20766181)
chr5 (245-305)||(21329556-21329617)
chr5 (126-292)||(21565556-21565723)
chr5 (158-303)||(37723906-37724050)
chr5 (192-287)||(20026945-20027043)
chr5 (207-305)||(21292992-21293089)
chr5 (197-305)||(21502167-21502276)
chr5 (128-287)||(22178161-22178323)
chr5 (244-299)||(20806845-20806900)
chr5 (192-292)||(22959538-22959639)
chr5 (245-305)||(19660894-19660955)
chr5 (100-140)||(9776521-9776561)
chr5 (207-279)||(21873277-21873350)
chr5 (245-305)||(36314578-36314639)
chr5 (185-291)||(26012034-26012141)
chr5 (248-279)||(26680605-26680636)
chr5 (248-299)||(26704078-26704129)
chr5 (248-279)||(26952212-26952243)
chr5 (248-299)||(26973811-26973862)
chr5 (245-299)||(22032326-22032380)
chr5 (245-287)||(26740705-26740747)
chr5 (242-299)||(23501412-23501469)
chr5 (245-290)||(26732892-26732937)
chr5 (135-231)||(18356389-18356485)
chr5 (253-305)||(19668899-19668951)
chr5 (248-292)||(23535642-23535686)
chr5 (100-140)||(37804862-37804902)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (100-299)||(13951-14150)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (100-299)||(13396-13595)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (100-299)||(136684-136883)
scaffold0028 (100-299)||(139153-139352)
scaffold0028 (100-299)||(144091-144290)
scaffold0028 (100-299)||(134215-134414)
scaffold0028 (100-299)||(141622-141821)
scaffold0028 (181-292)||(132672-132784)
scaffold0028 (202-288)||(62216-62303)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (111-299)||(82076-82264)
scaffold0037 (126-291)||(22610-22776)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (124-299)||(158433-158608)
scaffold0003 (141-291)||(339905-340053)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (104-299)||(40404-40599)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (111-299)||(110-298)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (124-299)||(16788-16963)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (124-299)||(4301-4476)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (111-299)||(12068-12250)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (124-299)||(9753-9929)
scaffold0145 (141-305)||(32943-33107)
scaffold0145 (141-305)||(38762-38926)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (124-299)||(4218-4393)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (124-289)||(29946-30111)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (111-299)||(1250-1439)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (124-287)||(79267-79430)
scaffold0056 (141-308)||(17170-17340)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (124-287)||(20363-20524)
scaffold0031 (141-305)||(128752-128916)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (124-295)||(2111-2283)
scaffold0247 (124-305)||(17964-18147)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (124-299)||(161072-161248)
scaffold0007 (124-224)||(164573-164674)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (141-299)||(22890-23048)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (100-299)||(38615-38816)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (161-299)||(44682-44821)
scaffold0122 (141-299)||(26020-26179)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (141-305)||(3106-3270)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (141-305)||(13212-13377)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (135-305)||(51914-52085)
scaffold0011 (156-305)||(167948-168098)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (141-305)||(16555-16720)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (141-305)||(1852-2017)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (141-308)||(3141-3309)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (141-292)||(4522-4673)
scaffold0228 (141-292)||(12104-12255)
scaffold0228 (141-292)||(22056-22207)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (161-299)||(116434-116571)
scaffold0022 (124-287)||(128907-129072)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (141-297)||(39486-39642)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (141-297)||(75170-75326)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (156-305)||(1018-1168)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (141-305)||(4850-5015)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (141-305)||(3471-3636)
scaffold0292 (141-305)||(344-508)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (141-305)||(32913-33076)
scaffold0120 (141-305)||(45929-46092)
scaffold0120 (142-305)||(16114-16278)
scaffold0120 (244-305)||(17388-17449)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (126-305)||(8472-8649)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (141-305)||(6076-6244)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (192-305)||(28415-28529)
scaffold0046 (192-305)||(11293-11407)
scaffold0046 (253-305)||(1998-2050)
scaffold0046 (253-305)||(4553-4605)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (141-298)||(25904-26061)
scaffold0026 (141-305)||(39859-40023)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (141-288)||(24257-24406)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (126-291)||(8481-8650)
scaffold0621 (145-305)||(6536-6695)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (192-305)||(8480-8594)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (141-242)||(3485-3586)
scaffold0327 (248-299)||(292-343)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (156-305)||(1953-2103)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (124-291)||(27686-27855)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (146-219)||(13092-13165)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (124-305)||(11465-11648)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (124-305)||(38193-38376)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (124-287)||(53486-53651)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (141-305)||(39914-40078)
scaffold0080 (186-287)||(19883-19987)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (124-287)||(13147-13313)
scaffold0357 (124-291)||(16037-16206)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (216-305)||(4713-4803)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (126-254)||(13144-13274)
scaffold0175 (250-298)||(281-329)
scaffold0175 (192-305)||(34124-34238)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (124-232)||(225482-225590)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (100-180)||(6070-6150)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (141-305)||(10381-10543)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (156-305)||(32068-32216)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (124-287)||(12587-12751)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (207-299)||(11464-11557)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (141-305)||(15420-15583)
scaffold0114 (245-299)||(7298-7352)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (158-287)||(174785-174913)
scaffold0021 (245-305)||(121767-121827)
scaffold0021 (141-217)||(124675-124751)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (207-290)||(13513-13596)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (124-303)||(6220-6400)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (141-305)||(20911-21077)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (124-197)||(12039-12112)
scaffold0503 (227-287)||(11982-12042)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (192-299)||(15668-15776)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (141-226)||(27911-27996)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (145-292)||(129919-130066)
scaffold0010 (124-287)||(60652-60818)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (126-291)||(10481-10647)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (245-305)||(4893-4953)
scaffold0395 (141-230)||(918-1006)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (124-225)||(7996-8098)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (197-305)||(6134-6243)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (145-292)||(19278-19424)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (156-285)||(4545-4675)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (253-305)||(1102-1154)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (253-305)||(6612-6664)
scaffold0333 (253-305)||(13992-14044)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (253-305)||(15845-15897)
scaffold0020 (248-299)||(178901-178952)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (145-292)||(5657-5803)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (245-299)||(15298-15352)
scaffold0106 (192-305)||(1290-1402)
scaffold0106 (192-305)||(7267-7379)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (185-292)||(2805-2913)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (192-305)||(16283-16395)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (124-305)||(1011-1189)
scaffold0184 (245-279)||(4286-4320)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (126-292)||(45732-45899)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (185-292)||(14696-14804)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (205-287)||(1051-1134)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (253-297)||(1091-1135)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (100-140)||(3186-3226)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (124-291)||(25121-25289)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (185-291)||(32551-32657)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (201-299)||(29561-29660)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (156-242)||(6675-6761)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (124-225)||(97089-97190)
scaffold0006 (124-225)||(106367-106468)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (145-292)||(143-290)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (100-140)||(1591-1631)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (208-305)||(192997-193097)
scaffold0017 (248-302)||(15273-15327)
scaffold0017 (248-302)||(19795-19849)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (185-232)||(8090-8137)
scaffold0556 (192-292)||(6826-6927)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (253-292)||(2713-2752)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (248-299)||(23846-23897)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (192-287)||(51601-51695)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (125-214)||(18176-18265)
scaffold0138 (192-291)||(12954-13054)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (253-299)||(36457-36503)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (181-292)||(32112-32224)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (192-291)||(8078-8180)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (201-291)||(23898-23989)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (185-291)||(10542-10649)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (253-292)||(12780-12819)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (248-299)||(162-213)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (248-299)||(21866-21917)
scaffold0210 (248-299)||(29758-29809)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (141-283)||(38339-38483)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (248-299)||(69797-69848)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (245-299)||(1884-1938)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (253-287)||(5196-5230)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (245-279)||(7330-7364)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (245-299)||(10582-10636)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (245-279)||(5003-5037)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (254-292)||(28839-28877)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (207-305)||(46996-47093)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (156-305)||(1021-1169)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 72)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 34963576 - 34963364
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34963576 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 34963477  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963476 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 34963377  T
Q  300 ttgatgatgatgt 312  Q
    |||||||||||||    
T  34963376 ttgatgatgatgt 34963364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Original strand, 30676669 - 30676881
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30676669 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 30676768  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676769 cttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 30676868  T
Q  300 ttgatgatgatgt 312  Q
    |||||||||||||    
T  30676869 ttgatgatgatgt 30676881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12742520 - 12742321
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12742520 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 12742421  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742420 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12742321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19005249 - 19005050
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19005249 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 19005150  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005149 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19005050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22782430 - 22782231
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22782430 tgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttga 22782331  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782330 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22782231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24422750 - 24422551
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24422750 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 24422651  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422650 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24422551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33861997 - 33861798
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33861997 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 33861898  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861897 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 33861798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33864481 - 33864282
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33864481 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 33864382  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864381 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 33864282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8055232 - 8055033
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8055232 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 8055133  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055132 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 8055033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 18334551 - 18334750
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18334551 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 18334650  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334651 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18334750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 19858878 - 19859077
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19858878 tgatgttttaagatgttgattgttatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 19858977  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858978 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19859077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 2291139 - 2291338
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2291139 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 2291238  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291239 cttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 2291338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 26924599 - 26924798
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26924599 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 26924698  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924699 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 26924798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 101 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25656831 - 25656633
Alignment:
Q  101 gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  25656831 gatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaac 25656732  T
Q  201 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656731 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25656633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 111 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25755001 - 25754813
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25755001 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25754902  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754901 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25754813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 1540870 - 1541069
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1540870 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 1540969  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1540970 cttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatg 1541069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25688705 - 25688507
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25688705 tgatgttttaagatgttgattaccatttggtgttgttatattgtgatatgattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 25688606  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25688605 cttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagat 25688507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1595752 - 1595553
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1595752 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 1595653  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1595652 attgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 1595553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 111 - 299
Target Start/End: Original strand, 20556864 - 20557050
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20556864 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa--attgagacgttgttgacttgcatttga 20556961  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20556962 tattattatgccatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatg 20557050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18456898 - 18456735
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 18456799  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18456798 tgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 129 - 299
Target Start/End: Original strand, 16448514 - 16448685
Alignment:
Q  129 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448514 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 16448613  T
Q  228 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16448614 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 16448685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 125 - 299
Target Start/End: Original strand, 3852001 - 3852175
Alignment:
Q  125 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3852001 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcat 3852100  T
Q  225 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3852101 gctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3852175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 154 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18462028 - 18461895
Alignment:
Q  154 tatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 253  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18462028 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgt 18461929  T
Q  254 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18461928 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Original strand, 25629310 - 25629475
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25629310 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatact 25629409  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25629410 gcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 25629475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 141 - 308
Target Start/End: Original strand, 18409782 - 18409950
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||| ||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18409782 tgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatact 18409881  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatg 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18409882 gcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 18409950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 124 - 312
Target Start/End: Original strand, 19847932 - 19848122
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| || || |||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||     
T  19847932 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtg 19848031  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 312  Q
     |||||||  ||||  |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19848032 ttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 19848122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29060703 - 29060541
Alignment:
Q  144 gatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 242  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  29060703 gatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc 29060604  T
Q  243 tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  29060603 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatg 29060541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Original strand, 20360915 - 20361080
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20360915 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgct 20361014  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||    
T  20361015 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatg 20361080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 181 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20593899 - 20593774
Alignment:
Q  181 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||    
T  20593899 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattc 20593800  T
Q  280 ggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||    
T  20593799 ggtctaagttgatgaagatgatgatg 20593774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 158 - 305
Target Start/End: Original strand, 17287768 - 17287916
Alignment:
Q  158 tgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgt 256  Q
    |||||||||||||  |||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||    
T  17287768 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgt 17287867  T
Q  257 tatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17287868 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 17287916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16496410 - 16496245
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16496410 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 16496311  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  16496310 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 16496245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 181 - 305
Target Start/End: Original strand, 19303536 - 19303660
Alignment:
Q  181 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac-tgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19303536 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 19303634  T
Q  280 ggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||    
T  19303635 ggtctaagatgatgaagatgatgatg 19303660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 25644487 - 25644335
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  25644487 tgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatact 25644388  T
Q  241 g-ctgtgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    | || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25644387 gcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 194 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076701
Alignment:
Q  194 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T
Q  293 taagatgttgatg 305  Q
     |||||| |||||    
T  20076713 gaagatgatgatg 20076701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 305
Target Start/End: Original strand, 22780166 - 22780347
Alignment:
Q  126 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |   |||||||||||||  |||  |||||| || ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22780166 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaa 22780265  T
Q  225 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||| || || ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  22780266 gctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 22780347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 287
Target Start/End: Original strand, 18821801 - 18821946
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 239  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||   ||  ||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18821801 tgtgatataatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcgtt-gatattgttatggcatgctgtttttgtatac 18821898  T
Q  240 tgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18821899 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 305
Target Start/End: Original strand, 20638253 - 20638403
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 254  Q
    |||||||||||||||  || | |||||| |  ||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  20638253 tatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt 20638352  T
Q  255 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  20638353 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 20638403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109153
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataat--tatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |     
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatt 20109223  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20109222 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20109153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 305
Target Start/End: Original strand, 8227448 - 8227631
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  8227448 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 8227547  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||| || ||||| |||||| ||  ||||||| |  |||  |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  8227548 atgatg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatg 8227631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 194 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23992540 - 23992421
Alignment:
Q  194 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23992540 tgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgat 23992441  T
Q  293 taagatgttgatgatgatgt 312  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  23992440 taagatgttgataatgatgt 23992421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714418
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 25714418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 27333277 - 27333338
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27333277 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 27333338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 27394017 - 27394078
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27394017 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 27394078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 12942404 - 12942363
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12942404 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 12942363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23019528 - 23019425
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||| |||||  ||||||||| ||||| |||||||    
T  23019528 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggt 23019430  T
Q  283 ctaag 287  Q
    |||||    
T  23019429 ctaag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 35245749 - 35245587
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  35245749 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 35245654  T
Q  241 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || | ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  35245653 gcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 35245587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 291
Target Start/End: Original strand, 9098518 - 9098620
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||   | ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9098518 gttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 9098617  T
Q  289 tga 291  Q
    |||    
T  9098618 tga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 279
Target Start/End: Original strand, 15041542 - 15041644
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    |||||| || ||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| || || | || ||||||||||||||||||||||||    
T  15041542 tgaatacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatga 15041641  T
Q  277 gtc 279  Q
    |||    
T  15041642 gtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 312
Target Start/End: Original strand, 25603406 - 25603512
Alignment:
Q  208 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgttgatg 305  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||  |||| | || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||    
T  25603406 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 25603505  T
Q  306 atgatgt 312  Q
     ||||||    
T  25603506 ttgatgt 25603512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 312
Target Start/End: Original strand, 25611744 - 25611850
Alignment:
Q  208 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgttgatg 305  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||  |||| | || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||    
T  25611744 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 25611843  T
Q  306 atgatgt 312  Q
     ||||||    
T  25611844 ttgatgt 25611850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19668488 - 19668386
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||  || |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19668488 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T
Q  288 ttga 291  Q
    ||||    
T  19668389 ttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 289
Target Start/End: Original strand, 28496477 - 28496575
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28496477 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 289
Target Start/End: Original strand, 29808888 - 29808986
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29808888 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 305
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080845
Alignment:
Q  259 tttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatg 22080845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19652316 - 19652209
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19652316 ttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggt 19652219  T
Q  283 ctaagttgat 292  Q
    ||||||||||    
T  19652218 ctaagttgat 19652209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561304
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 1561304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 15875509 - 15875469
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15875509 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 15875469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Original strand, 28289294 - 28289334
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28289294 tgatgttttaagatgttaattaccatttgatgtcgttatat 28289334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 279
Target Start/End: Original strand, 19790842 - 19790873
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19790842 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 19790873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19863032 - 19862981
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  19863032 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatg 19862981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19873174 - 19873123
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  19873174 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatg 19873123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11185558 - 11185524
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11185558 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 312
Target Start/End: Original strand, 16929658 - 16929716
Alignment:
Q  254 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 312  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  16929658 tgttaattaaccaagttgcatgagtcagtttaagatgattaagacgttgttgatgatgt 16929716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 312
Target Start/End: Original strand, 16965378 - 16965436
Alignment:
Q  254 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 312  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  16965378 tgttaattaaccaagttgcatgagtcagtttaagatgattaagacgttgttgatgatgt 16965436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21766752 - 21766718
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21766752 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 21766718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22432334 - 22432252
Alignment:
Q  218 atgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  22432334 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatg 22432252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22438884 - 22438802
Alignment:
Q  218 atgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  22438884 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatg 22438802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 305
Target Start/End: Original strand, 16920602 - 16920750
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 254  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| | | |||||||||  |||||||||| ||||   ||||||||| | || |||||||    
T  16920602 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgctgctgtt 16920698  T
Q  255 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | |||||| |||||    
T  16920699 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatg 16920750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 22831565 - 22831524
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22831565 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18914030 - 18913994
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18914030 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18913994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18937288 - 18937252
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18937288 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18937252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33443108 - 33443068
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 285  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  33443108 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 11491 - 11279
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11491 tgatgttttaagatgttgattaccatttgattttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 11392  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11391 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatg 11292  T
Q  300 ttgatgatgatgt 312  Q
    |||||||| ||||    
T  11291 ttgatgataatgt 11279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 68)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Original strand, 32214880 - 32215092
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32214880 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 32214979  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214980 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 32215079  T
Q  300 ttgatgatgatgt 312  Q
    |||||||||||||    
T  32215080 ttgatgatgatgt 32215092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18809146 - 18808947
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18809146 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 18809047  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809046 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18808947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 23709491 - 23709690
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23709491 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 23709590  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709591 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23709690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 23711972 - 23712171
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23711972 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 23712071  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712072 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23712171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39682516 - 39682317
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39682516 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 39682417  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682416 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 39682317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 571600 - 571401
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  571600 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttga 571501  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571500 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 571401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6726198 - 6725999
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6726198 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 6726099  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726098 cttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 6725999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 21155019 - 21155218
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21155019 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 21155118  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155119 cttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21155218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23131065 - 23130866
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23131065 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 23130966  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130965 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23130866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23133532 - 23133333
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23133532 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 23133433  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133432 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23133333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26505582 - 26505383
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26505582 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 26505483  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505482 cttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 26505383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26508060 - 26507861
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26508060 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 26507961  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507960 cttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 26507861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 34402481 - 34402680
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34402481 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 34402580  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402581 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 34402680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23135793 - 23135594
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23135793 tgatgttttaagatgctgattatcatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 23135694  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135693 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23135594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24367977 - 24367782
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24367977 tgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 24367878  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaa 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24367877 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 24367782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 32039457 - 32039656
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32039457 tgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 32039556  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32039557 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatg 32039656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 24898154 - 24898354
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24898154 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 24898253  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898254 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 24898353  T
Q  299 g 299  Q
    |    
T  24898354 g 24898354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 24900637 - 24900837
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24900637 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 24900736  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900737 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 24900836  T
Q  299 g 299  Q
    |    
T  24900837 g 24900837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 24903114 - 24903314
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24903114 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 24903213  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903214 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 24903313  T
Q  299 g 299  Q
    |    
T  24903314 g 24903314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 24905591 - 24905791
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24905591 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 24905690  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905691 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 24905790  T
Q  299 g 299  Q
    |    
T  24905791 g 24905791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 24908066 - 24908266
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24908066 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 24908165  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908166 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 24908265  T
Q  299 g 299  Q
    |    
T  24908266 g 24908266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28577302 - 28577103
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  28577302 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgg 28577203  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577202 cttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgttgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 28577103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22105616 - 22105416
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22105616 tgatgttttaagatgttgattataatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttga 22105517  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105516 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 22105417  T
Q  299 g 299  Q
    |    
T  22105416 g 22105416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 45029813 - 45030012
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45029813 tgatgttttaagatgatgattattatttcatgttgttatattgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 45029912  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029913 cttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45030012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 125 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 43137477 - 43137303
Alignment:
Q  125 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137477 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 43137378  T
Q  225 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137377 gttgtttttgtatattactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 43137303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Original strand, 24529511 - 24529687
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24529511 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtc 24529610  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529611 atgctgtttttgtatactgatgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24529687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 38967577 - 38967378
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttg 198  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  38967577 tgatgtcttaagatgttgattattatttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattg 38967479  T
Q  199 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967478 acttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatattgttgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 38967379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22337281 - 22337116
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22337281 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatataca 22337182  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22337181 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 22337116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Original strand, 24642826 - 24642933
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642826 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 24642925  T
Q  211 tattatta 218  Q
    ||||||||    
T  24642926 tattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23060679 - 23060514
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23060679 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23060580  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23060579 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23060514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23076608 - 23076443
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076608 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23076509  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  23076508 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatg 23076443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 126 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671831
Alignment:
Q  126 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  19672010 ttgatgttgttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-attgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatg 19671912  T
Q  226 ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
     || ||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  19671911 atg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 19671831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Original strand, 22731189 - 22731354
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22731189 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22731288  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  22731289 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatg 22731354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Original strand, 22738135 - 22738299
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22738135 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22738234  T
Q  241 gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22738235 gcctatttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatg 22738299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 298769 - 298929
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  298769 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 298868  T
Q  241 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298869 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 298929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23286027 - 23285866
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||  | || |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  23286027 tgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatact 23285932  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23285931 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23285866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23660188 - 23660024
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| | ||   |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  23660188 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttc-gtatact 23660090  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23660089 gcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23660024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 299
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643108
Alignment:
Q  225 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24643108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Original strand, 23654341 - 23654506
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| | |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  23654341 tgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgct 23654440  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || | || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  23654441 gcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 23654506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 207 - 305
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38234
Alignment:
Q  207 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 38234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Original strand, 23708558 - 23708725
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| || | ||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  23708558 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcat 23708657  T
Q  225 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    | || ||||| |||||| || ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23708658 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga 23708725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28406099 - 28405990
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28406099 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 28406000  T
Q  283 ctaagttgat 292  Q
    ||||||||||    
T  28405999 ctaagttgat 28405990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 178 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25616314 - 25616179
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25616314 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatga 25616215  T
Q  277 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 312  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  25616214 gtcagtctaagttgattaagatgttaataatgatgt 25616179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 180
Target Start/End: Original strand, 22173799 - 22173868
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtga 180  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22173799 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 22173868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 305
Target Start/End: Original strand, 23103389 - 23103515
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23103389 tgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatga 23103486  T
Q  277 gtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||||||||||| || | |||||| |||||    
T  23103487 gtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 23103515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 287
Target Start/End: Original strand, 7688 - 7835
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||    
T  7688 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 7786  T
Q  241 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    | || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  7787 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 23040249 - 23040309
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23040249 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23040309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20309257 - 20309109
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 254  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||| ||    
T  20309257 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctatt 20309161  T
Q  255 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  20309160 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 20309109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946658
Alignment:
Q  230 ttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8946658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 20261422 - 20261381
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20261422 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 20261381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 211
Target Start/End: Original strand, 22459511 - 22459587
Alignment:
Q  135 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgat 211  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  22459511 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgat 22459587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 29601518 - 29601478
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29601518 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 29601478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7679647 - 7679592
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7679647 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 7679592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23791458 - 23791357
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| | |||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  23791458 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatat-aatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatc 23791360  T
Q  223 atg 225  Q
    |||    
T  23791359 atg 23791357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25176010 - 25175864
Alignment:
Q  145 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 243  Q
    |||||||||||||| | |||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  25176010 atataattatatatacgttatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 25175914  T
Q  244 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  25175913 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgat 25175864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 20520130 - 20520295
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| || ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  20520130 atttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 20520227  T
Q  223 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||  ||| |||| | |||||| | |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20520228 atgaactg-ttttatgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23207461 - 23207296
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| || | | |||  |||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  23207461 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttat-aatg-ttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatc 23207364  T
Q  223 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||  |||||||  |||||||| | |||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23207363 atgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Original strand, 10684724 - 10684764
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10684724 tgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 10684764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 178 - 287
Target Start/End: Original strand, 32451920 - 32452031
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcat 274  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| || |||| | |||||||||| | | |||||| ||| |||||    
T  32451920 tgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcat 32452018  T
Q  275 gagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||||||    
T  32452019 gagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 308
Target Start/End: Original strand, 22134266 - 22134329
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatg 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||| | |||| ||||||||    
T  22134266 tgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatgatg 22134329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 291
Target Start/End: Original strand, 18786971 - 18787009
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18786971 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24869934 - 24869903
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24869934 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 24869903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 279
Target Start/End: Original strand, 25961597 - 25961628
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25961597 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 25961628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 305
Target Start/End: Original strand, 23072019 - 23072069
Alignment:
Q  255 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  23072019 gttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatg 23072069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 279
Target Start/End: Original strand, 24655398 - 24655432
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24655398 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 24655432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Original strand, 24697543 - 24697644
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||  ||| ||||   |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  24697543 attttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagt-ttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatc 24697641  T
Q  223 atg 225  Q
    |||    
T  24697642 atg 24697644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 23287424 - 23287384
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 285  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23287424 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26392443 - 26392403
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 285  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26392443 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 100 - 301
Target Start/End: Original strand, 16413275 - 16413476
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16413275 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 16413374  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413375 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T
Q  300 tt 301  Q
    ||    
T  16413475 tt 16413476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 14409403 - 14409602
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14409403 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 14409502  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409503 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 14409602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1484605 - 1484406
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1484605 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 1484506  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484505 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 1484406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 5853251 - 5853450
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5853251 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 5853350  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853351 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 5853450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20403430 - 20403231
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20403430 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 20403331  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403330 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20403231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22001956 - 22001757
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22001956 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 22001857  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001856 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22001757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 15203190 - 15203389
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15203190 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 15203289  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15203290 cttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatg 15203389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 20046154 - 20046353
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20046154 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttga 20046253  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046254 cttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20046353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4483483 - 4483285
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4483483 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 4483384  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483383 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4483285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 4542332 - 4542531
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4542332 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttga 4542431  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542432 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4542531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 105 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19896466 - 19896269
Alignment:
Q  105 ttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgc 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896466 ttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgc 19896367  T
Q  205 atttgatatta---ttatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896366 atttgatattattattatgtcatgctgtttttgtataccgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19896269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 41598367 - 41598192
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598367 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 41598268  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598267 tgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41598192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14823976 - 14823778
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14823976 tgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 14823877  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  14823876 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatg 14823778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 100 - 303
Target Start/End: Original strand, 45290653 - 45290857
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  45290653 tgatgttttaagatgttgattattatttgacgttgttatactgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattg 45290752  T
Q  199 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290753 gcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 45290852  T
Q  299 gttga 303  Q
    |||||    
T  45290853 gttga 45290857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 124 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26224098 - 26223914
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224098 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 26223999  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatg 308  Q
    |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26223998 tgctatttttgtatattgctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatgatg 26223914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 111 - 299
Target Start/End: Original strand, 19936975 - 19937164
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19936975 gatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataactgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttg 19937074  T
Q  210 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19937075 atcttattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 19937164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15070763 - 15070571
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-tt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||  || || |||||||||||||||||||| ||    
T  15070763 tgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattcagatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgatt 15070664  T
Q  198 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15070663 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 111 - 299
Target Start/End: Original strand, 25484245 - 25484426
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25484245 gatgttgattatgatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25484344  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  25484345 tattattatgtcatgctgtttttgtatac-------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatg 25484426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 126 - 287
Target Start/End: Original strand, 19801367 - 19801527
Alignment:
Q  126 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 225  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19801367 ttgatgttgttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatg 19801466  T
Q  226 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19801467 ctg-ttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Original strand, 16092297 - 16092462
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092297 tgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16092396  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16092397 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 16092462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6759421 - 6759259
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| ||  ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6759421 tgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgaga---tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 6759325  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6759324 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6759259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 305
Target Start/End: Original strand, 18818348 - 18818529
Alignment:
Q  126 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18818348 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcat 18818447  T
Q  225 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18818448 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18818529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 141 - 308
Target Start/End: Original strand, 28648999 - 28649167
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||| ||   || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28648999 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 28649098  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatg 308  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  28649099 gcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 28649167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 153 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7372932 - 7372779
Alignment:
Q  153 atatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgct 251  Q
    ||||| ||||||||||||  |||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7372932 atataagcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 7372833  T
Q  252 gttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7372832 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7372779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20536374 - 20536209
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536374 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20536275  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20536274 gcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 20536209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 156 - 305
Target Start/End: Original strand, 21918969 - 21919120
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcat-atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgt 253  Q
    |||||||||||||||  || || |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21918969 tatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt 21919068  T
Q  254 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  21919069 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21919120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26219858 - 26219721
Alignment:
Q  161 attacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 260  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26219858 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatact-attttgtatactgctgtgtcgctgttgttatt 26219760  T
Q  261 taactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26219759 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattatgatg 26219721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22875230 - 22875066
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22875230 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 22875132  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  22875131 gcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatg 22875066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 140 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23406548 - 23406380
Alignment:
Q  140 ttgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgtt--gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 237  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23406548 ttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtat 23406449  T
Q  238 actgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23406448 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23406380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 305
Target Start/End: Original strand, 21923900 - 21924048
Alignment:
Q  158 tgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgt 256  Q
    |||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  21923900 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgt 21923999  T
Q  257 tatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21924000 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 21924048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 185 - 299
Target Start/End: Original strand, 26225292 - 26225405
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 284  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26225292 ttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 26225390  T
Q  285 aagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||    
T  26225391 aagttgattaagatg 26225405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22626901 - 22626737
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22626901 tgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 22626803  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22626802 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 22626737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 124 - 303
Target Start/End: Original strand, 13508022 - 13508203
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  13508022 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 13508121  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 303  Q
    ||| || || || ||| || || |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||    
T  13508122 atgatg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttga 13508203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 124 - 303
Target Start/End: Original strand, 13597554 - 13597735
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  13597554 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 13597653  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 303  Q
    ||| || ||||| || |||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||    
T  13597654 atgatg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttga 13597735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 24486003 - 24486093
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgaga 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24486003 tgatgttctaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Original strand, 18879191 - 18879351
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||    
T  18879191 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatact 18879285  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18879286 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18879351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 178 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23648682 - 23648547
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    |||||| || ||| |||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23648682 tgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatga 23648583  T
Q  277 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 312  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23648582 gtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 23648547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20498746 - 20498581
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  20498746 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 20498647  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||  ||||  |||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20498646 atgct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 32810134 - 32810054
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtga 180  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  32810134 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 32810054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 312
Target Start/End: Original strand, 18678094 - 18678229
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18678094 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 18678193  T
Q  277 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 312  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18678194 gtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 18678229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31971407 - 31971258
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 254  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  31971407 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgtt 31971309  T
Q  255 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  31971308 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 31971258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 305
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612230
Alignment:
Q  135 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 234  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| || |||||    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 17612157  T
Q  235 tatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
     |||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  17612158 catactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 17612230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 178 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32121861 - 32121726
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32121861 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 32121762  T
Q  277 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 312  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32121761 gtcattctaagttgattaagatgttgataatgatgt 32121726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 305
Target Start/End: Original strand, 38855212 - 38855371
Alignment:
Q  145 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 243  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  38855212 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 38855308  T
Q  244 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38855309 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 38855371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 207 - 305
Target Start/End: Original strand, 45131019 - 45131116
Alignment:
Q  207 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  45131019 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 45131116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6520483 - 6520369
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6520483 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 6520385  T
Q  290 gattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||| |||||    
T  6520384 gattaagatgatgatg 6520369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21285719 - 21285606
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21285719 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggt 21285621  T
Q  283 ctaagttgattaaga 297  Q
    |||||||||||||||    
T  21285620 ctaagttgattaaga 21285606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 37116532 - 37116366
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  37116532 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37116434  T
Q  223 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||  ||| |||| | ||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37116433 atgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 305
Target Start/End: Original strand, 16199666 - 16199764
Alignment:
Q  207 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 304  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  | |||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  16199666 ttgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 16199763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Original strand, 5866280 - 5866394
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  5866280 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 5866378  T
Q  290 gattaagatgttgatg 305  Q
    | | |||||| |||||    
T  5866379 gttgaagatgatgatg 5866394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17141019 - 17140917
Alignment:
Q  204 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 301  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  || | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  17141019 cattcgatattattatgtcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 17140921  T
Q  302 gatg 305  Q
    ||||    
T  17140920 gatg 17140917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21491110 - 21490996
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21491110 gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21491012  T
Q  290 gattaagatgttgatg 305  Q
    | | |||||| |||||    
T  21491011 gttgaagatgatgatg 21490996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 291
Target Start/End: Original strand, 983410 - 983512
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt-tttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||   || |||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  983410 gttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 983509  T
Q  289 tga 291  Q
    |||    
T  983510 tga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Original strand, 21389458 - 21389570
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  21389458 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21389554  T
Q  290 gattaagatgttgatg 305  Q
    | | |||||| |||||    
T  21389555 gttgaagatgatgatg 21389570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Original strand, 21395988 - 21396100
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  21395988 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21396084  T
Q  290 gattaagatgttgatg 305  Q
    | | |||||| |||||    
T  21396085 gttgaagatgatgatg 21396100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Original strand, 21778784 - 21778896
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  21778784 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21778880  T
Q  290 gattaagatgttgatg 305  Q
    | | |||||| |||||    
T  21778881 gttgaagatgatgatg 21778896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Original strand, 21790481 - 21790593
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  21790481 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21790577  T
Q  290 gattaagatgttgatg 305  Q
    | | |||||| |||||    
T  21790578 gttgaagatgatgatg 21790593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 291
Target Start/End: Original strand, 23760903 - 23760950
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23760903 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23760950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Original strand, 17266930 - 17267031
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  17266930 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 17267028  T
Q  223 atg 225  Q
    |||    
T  17267029 atg 17267031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249385
Alignment:
Q  256 ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21249385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255223
Alignment:
Q  256 ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21255223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21673826 - 21673718
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| | ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  21673826 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggt 21673728  T
Q  283 ctaagttgat 292  Q
    ||||||||||    
T  21673727 ctaagttgat 21673718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 225
Target Start/End: Original strand, 17439461 - 17439544
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 225  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  17439461 tgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 17439544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 253 - 292
Target Start/End: Original strand, 26355766 - 26355805
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26355766 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26355805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Original strand, 39094987 - 39095041
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  39094987 tgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 39095041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 302
Target Start/End: Original strand, 20856492 - 20856541
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  20856492 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 20856541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Original strand, 35026855 - 35026895
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  35026855 tgatgttttaagatgttgattatcgtttgatattgttatat 35026895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Original strand, 19618131 - 19618343
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19618131 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttga 19618230  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618231 cttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19618330  T
Q  300 ttgatgatgatgt 312  Q
    |||||||| ||||    
T  19618331 ttgatgataatgt 19618343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Original strand, 14970666 - 14970878
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14970666 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 14970765  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  14970766 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatg 14970865  T
Q  300 ttgatgatgatgt 312  Q
    |||||||||||||    
T  14970866 ttgatgatgatgt 14970878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3515210 - 3515011
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3515210 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 3515111  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515110 cttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3515011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 18215233 - 18215432
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18215233 tgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 18215332  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215333 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18215432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 15118311 - 15118510
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15118311 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 15118410  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118411 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15118510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 52312713 - 52312514
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52312713 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 52312614  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312613 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 52312514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 12266 - 12465
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12266 tgatgttttaagatgttgattattattggatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 12365  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12366 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 303
Target Start/End: Original strand, 15355283 - 15355487
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15355283 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattg 15355382  T
Q  199 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355383 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 15355482  T
Q  299 gttga 303  Q
    |||||    
T  15355483 gttga 15355487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19242903 - 19242703
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19242903 tgatgttttaagatgttgattaccatttggagttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttg 19242804  T
Q  199 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242803 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 19242704  T
Q  299 g 299  Q
    |    
T  19242703 g 19242703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44615491 - 44615292
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44615491 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 44615392  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615391 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44615292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 44773046 - 44773245
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  44773046 tgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttga 44773145  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773146 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44773245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 1837468 - 1837667
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1837468 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 1837567  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837568 cttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 1837667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 18239378 - 18239577
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18239378 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 18239477  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239478 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18239577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 50222298 - 50222497
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50222298 tgatgttttaagatgttgattattatttgatattgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 50222397  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222398 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 50222497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 111 - 299
Target Start/End: Original strand, 51463838 - 51464026
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51463838 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 51463937  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463938 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 51464026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 111 - 299
Target Start/End: Original strand, 23803235 - 23803423
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23803235 gatgttgattatgattttatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttga 23803334  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803335 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23803423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44102393 - 44102218
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44102393 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 44102294  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102293 tgctgtttttgtatactactgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44102218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 111 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12611135 - 12610954
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12611135 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 12611036  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611035 tattattatgtcatgctgtttttgt-------tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12610954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Original strand, 44928873 - 44929038
Alignment:
Q  135 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44928873 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttg 44928972  T
Q  235 tatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928973 tatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44929038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 7641151 - 7641340
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7641151 tgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttga 7641250  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641251 cttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt----------tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 7641340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 124 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15367873 - 15367691
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15367873 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15367774  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  15367773 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15367691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 124 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15402886 - 15402704
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15402886 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15402787  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  15402786 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15402704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 21815568 - 21815731
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21815568 atttgatgttgttatattatgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtca 21815667  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21815668 tgctgtttttgtatacagttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 124 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15371385 - 15371203
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15371385 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15371286  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  15371285 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15371203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 124 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15373666 - 15373484
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15373666 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15373567  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  15373566 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15373484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 129 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20150004 - 20149833
Alignment:
Q  129 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20150004 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 20149905  T
Q  228 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20149904 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 20149833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 124 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15370200 - 15370019
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15370200 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15370102  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  15370101 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15370019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 127 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16223712 - 16223533
Alignment:
Q  127 tgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16223712 tgatgttgttatattgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatg 16223613  T
Q  226 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  16223612 ctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 16223533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 185 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14280434 - 14280320
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 284  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14280434 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 14280335  T
Q  285 aagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||    
T  14280334 aagttgattaagatg 14280320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 161 - 299
Target Start/End: Original strand, 54798729 - 54798868
Alignment:
Q  161 attacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttat 259  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54798729 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttat 54798828  T
Q  260 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798829 tcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 54798868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7089043 - 7088878
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7089043 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7088944  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7088943 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7088878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7798956 - 7798775
Alignment:
Q  126 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7798956 ttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcat 7798857  T
Q  225 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7798856 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7798775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14038814 - 14038655
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14038814 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatact 14038715  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14038714 gcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 14038655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 298
Target Start/End: Original strand, 16377478 - 16377634
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16377478 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatact 16377575  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16377576 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 16377634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12902923 - 12902758
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902923 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12902824  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  12902823 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 12902758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 141 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 22636601 - 22636437
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22636601 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22636502  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 304  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22636501 gtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 194 - 305
Target Start/End: Original strand, 52873375 - 52873487
Alignment:
Q  194 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52873375 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 52873474  T
Q  293 taagatgttgatg 305  Q
     |||||| |||||    
T  52873475 gaagatgatgatg 52873487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22354010 - 22353852
Alignment:
Q  130 tgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||| |||    
T  22354010 tgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgt 22353911  T
Q  230 ttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |  |  |  ||| || || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22353910 tgctacaatctgcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaag 22353852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7893869 - 7893704
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893869 tgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7893770  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7893769 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7893704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Original strand, 16270191 - 16270355
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16270191 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 16270289  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  16270290 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatg 16270355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 44052995 - 44052830
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052995 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44052896  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  44052895 gcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatg 44052830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 16239927 - 16240089
Alignment:
Q  143 tgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg- 241  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| ||  |||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  16239927 tgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgc 16240025  T
Q  242 ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  16240026 ctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 16240089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 185 - 299
Target Start/End: Original strand, 8574868 - 8574981
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 284  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8574868 ttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 8574966  T
Q  285 aagttgattaagatg 299  Q
    ||||| |||||||||    
T  8574967 aagttaattaagatg 8574981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6900056 - 6899892
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||    
T  6900056 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-gtatact 6899958  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6899957 gcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6899892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 13788 - 13953
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  13788 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 13887  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13888 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 141 - 301
Target Start/End: Original strand, 23374314 - 23374475
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  23374314 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 23374413  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 301  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  23374414 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatgtt 23374475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 124 - 291
Target Start/End: Original strand, 52243131 - 52243302
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||    
T  52243131 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatc 52243230  T
Q  223 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    |||  |||  |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52243231 atgaactg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198661
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcat 43198591  T
Q  225 g-ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    |  |  ||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43198592 gaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096294
Alignment:
Q  221 tcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 3096294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 305
Target Start/End: Original strand, 39706299 - 39706408
Alignment:
Q  197 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 294  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39706299 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 39706397  T
Q  295 agatgttgatg 305  Q
    ||||| |||||    
T  39706398 agatgatgatg 39706408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 232
Target Start/End: Original strand, 15464888 - 15464977
Alignment:
Q  143 tgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 232  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  15464888 tgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 15464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12774132 - 12774021
Alignment:
Q  181 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 278  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12774132 ataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 12774035  T
Q  279 cggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||    
T  12774034 cggtctaagttgat 12774021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 305
Target Start/End: Original strand, 14053323 - 14053421
Alignment:
Q  207 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || || || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||| ||||    
T  14053323 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgat 14053420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15534384 - 15534343
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534384 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 15534343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 291
Target Start/End: Original strand, 12288214 - 12288316
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12288214 gttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12288312  T
Q  288 ttga 291  Q
    ||||    
T  12288313 ttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 14048780 - 14048740
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14048780 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 14048740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 36038073 - 36038033
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36038073 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 36038033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15551879 - 15551818
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  15551879 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 15551818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Original strand, 49547733 - 49547773
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49547733 tgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatat 49547773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 6190563 - 6190481
Alignment:
Q  207 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| || |||| | |||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6190563 ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 46640393 - 46640558
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||    |||||| ||| |||| || ||||||||||| |||| ||    
T  46640393 atttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg--ttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatc 46640490  T
Q  223 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||  |||||||  ||||||| || |||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46640491 atgaactgtttta-tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17046549 - 17046488
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  17046549 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 17046488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Original strand, 15497030 - 15497070
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15497030 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 15497070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19857647 - 19857607
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19857647 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 19857607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 139
Target Start/End: Original strand, 52873137 - 52873176
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 139  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  52873137 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 52873176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 279
Target Start/End: Original strand, 11250621 - 11250655
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11250621 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 11250655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 279
Target Start/End: Original strand, 15353367 - 15353401
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15353367 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 15353401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 306
Target Start/End: Original strand, 20157522 - 20157580
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 306  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| | ||||||    
T  20157522 tgctattgttatttaactaatttgcatgagtctatataagttgattaagacgatgatga 20157580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 8846418 - 8846370
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  8846418 tgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgat 8846370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Original strand, 12208 - 12420
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  12208 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttga 12307  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12308 cttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatg 12407  T
Q  300 ttgatgatgatgt 312  Q
    |||||||||||||    
T  12408 ttgatgatgatgt 12420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 100 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 10976 - 10772
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10976 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttga 10877  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10876 cttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10777  T
Q  300 ttgat 304  Q
    |||||    
T  10776 ttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 89)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13544228 - 13544016
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13544228 tgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 13544129  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544128 cttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13544029  T
Q  300 ttgatgatgatgt 312  Q
    ||||| |||||||    
T  13544028 ttgataatgatgt 13544016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12567763 - 12567551
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12567763 tgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 12567664  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567663 cttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T
Q  300 ttgatgatgatgt 312  Q
    ||| | |||||||    
T  12567563 ttgtttatgatgt 12567551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 9707566 - 9707765
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9707566 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 9707665  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707666 cttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9707765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 16454240 - 16454439
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16454240 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 16454339  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454340 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16454439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17463381 - 17463182
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17463381 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 17463282  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463281 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17463182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 45606866 - 45607065
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45606866 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 45606965  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606966 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45607065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 7781306 - 7781505
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7781306 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 7781405  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781406 tttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 7781505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8899297 - 8899098
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8899297 tgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 8899198  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8899197 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatg 8899098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34159529 - 34159330
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34159529 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 34159430  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159429 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 34159330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 55476694 - 55476495
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55476694 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 55476595  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476594 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 55476495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 6469093 - 6469292
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6469093 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttga 6469192  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469193 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 6469292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 10247682 - 10247881
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10247682 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 10247781  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10247782 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 10247881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 16282770 - 16282969
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16282770 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 16282869  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282870 cttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16282969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 17446614 - 17446812
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17446614 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttga 17446713  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17446714 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatg 17446812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 28848570 - 28848769
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28848570 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 28848669  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848670 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 28848769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 295
Target Start/End: Original strand, 38961850 - 38962045
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38961850 tgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 38961949  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaa 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38961950 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 38962045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 13151749 - 13151949
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13151749 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 13151848  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151849 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 13151948  T
Q  299 g 299  Q
    |    
T  13151949 g 13151949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 13154214 - 13154414
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13154214 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 13154313  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154314 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 13154413  T
Q  299 g 299  Q
    |    
T  13154414 g 13154414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 41124090 - 41123894
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41124090 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 41123991  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123990 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41123894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 111 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 50243014 - 50242830
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50243014 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 50242915  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaa 295  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50242914 tattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 50242830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Original strand, 29172565 - 29172741
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172565 atttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 29172664  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172665 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29172741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17672805 - 17672630
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17672805 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtca 17672706  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672705 tgctgtttttgtatactgctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17672630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8499723 - 8499522
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-tt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||  || || |||||||||||||||| ||| ||    
T  8499723 tgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacattgatt 8499624  T
Q  198 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaaga 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499623 gacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 8499524  T
Q  298 tg 299  Q
    ||    
T  8499523 tg 8499522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 104 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15412630 - 15412433
Alignment:
Q  104 gttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgact 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||  || || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15412630 gttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgact 15412531  T
Q  202 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412530 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15412433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Original strand, 12119707 - 12119883
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12119707 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 12119806  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119807 atgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12119883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 53070636 - 53070799
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53070636 atttgatgttgttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtct 53070735  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53070736 tgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 111 - 287
Target Start/End: Original strand, 43550448 - 43550625
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550448 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 43550547  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43550548 tattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 173 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15977645 - 15977519
Alignment:
Q  173 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15977645 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgc 15977546  T
Q  273 atgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  15977545 atgagtcggtctaagttgattaagatg 15977519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14973020 - 14972855
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||   || |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14973020 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14972921  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  14972920 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 14972855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 55501053 - 55500946
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55501053 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 55500954  T
Q  292 ttaagatg 299  Q
    ||||||||    
T  55500953 ttaagatg 55500946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27165455 - 27165254
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||  ||| ||    
T  27165455 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatg 27165356  T
Q  199 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaag 296  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||| |||||| | |||||| || | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27165355 acttgcatttgatattggtatatcatgttgtttt-gcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 27165257  T
Q  297 atg 299  Q
    |||    
T  27165256 atg 27165254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 40213676 - 40213834
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| || ||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40213676 tgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatact 40213775  T
Q  241 gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213776 gctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatg 40213834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 53301463 - 53301665
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgt-t 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | | ||||||||| |||| |||||| ||||||  |||  |    
T  53301463 tgatgttttaagatgttgattaccattttatgttgtttatattgtgatataattgtatacgtaatacttgaattatatatgaatatttgagatattgaat 53301562  T
Q  198 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaa 295  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53301563 gacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaa 53301661  T
Q  296 gatg 299  Q
    ||||    
T  53301662 gatg 53301665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 161 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166602
Alignment:
Q  161 attacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 260  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatt 36166641  T
Q  261 taactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166640 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 36166602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17488022 - 17487857
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488022 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17487923  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17487922 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17487857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17499504 - 17499339
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499504 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17499405  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17499404 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17499339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Original strand, 25476340 - 25476505
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476340 tgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25476439  T
Q  241 -gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
      |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25476440 acctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 25476505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 125 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 42386593 - 42386428
Alignment:
Q  125 tttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42386593 tttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtca 42386494  T
Q  224 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42386493 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 43841114 - 43840940
Alignment:
Q  126 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43841114 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 43841015  T
Q  225 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43841014 gctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagat 43840940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13442440 - 13442275
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13442440 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 13442341  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13442340 gcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13442275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26687069 - 26686888
Alignment:
Q  126 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||   ||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26687069 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 26686970  T
Q  225 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  26686969 gctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatg 26686888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 141 - 292
Target Start/End: Original strand, 14576788 - 14576939
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14576788 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatact 14576886  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14576887 gtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgat 14576939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21618590 - 21618459
Alignment:
Q  161 attacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 260  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21618590 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatt 21618492  T
Q  261 taactaagttgcatgagtcggtctaagttgatt 293  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21618491 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 21618459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 156 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12399360 - 12399210
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 254  Q
    ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  12399360 tatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt 12399261  T
Q  255 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  12399260 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 12399210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18438649 - 18438535
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18438649 gttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 18438550  T
Q  291 attaagatgttgatg 305  Q
    || |||||| |||||    
T  18438549 atgaagatgatgatg 18438535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 156 - 305
Target Start/End: Original strand, 20698405 - 20698555
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 254  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20698405 tatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 20698504  T
Q  255 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20698505 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 20698555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Original strand, 23083316 - 23083481
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| |||  | |  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23083316 tgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatact 23083415  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23083416 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23083481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 200 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10557088 - 10556989
Alignment:
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557088 cttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctgatgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10556989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 204 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494813
Alignment:
Q  204 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatg 44494813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 305
Target Start/End: Original strand, 24340660 - 24340843
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  24340660 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 24340759  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||| || || || ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  24340760 atgatg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 24340843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 24153164 - 24153322
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||| |||||  |||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24153164 tgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 24153262  T
Q  241 -gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
      || ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153263 acctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24153322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 205 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737240
Alignment:
Q  205 atttgatattattatgtcatgctgtttttgta---tactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17737240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Original strand, 11424718 - 11424879
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||||||||||   |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11424718 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga---tgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatact 11424813  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  11424814 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 11424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 178 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14572717 - 14572603
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    |||||| || ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14572717 tgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 14572619  T
Q  277 gtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||    
T  14572618 gtcggtctaagttgat 14572603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23274871 - 23274705
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  23274871 atttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 23274772  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23274771 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 287
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523831
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 52523765  T
Q  225 g--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |  ||| ||||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52523766 gaactg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 178 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 46822394 - 46822259
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46822394 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 46822295  T
Q  277 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 312  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46822294 gtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 46822259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 305
Target Start/End: Original strand, 37642202 - 37642385
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  37642202 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 37642301  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||| |||||| | ||||||| | |||||||| |  |||  |||||||| |||||||||||||| |||| | | ||||||||||||    
T  37642302 atgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatg 37642385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 178 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30029968 - 30029834
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| || || |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  30029968 tgaatatttaagacgttgt-gaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 30029870  T
Q  277 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 312  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30029869 gtcagtctaagttgaatgagatgttgatgatgatgt 30029834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12511172 - 12511051
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 290  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12511172 gttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttg 12511073  T
Q  291 attaagatgttgatgatgatgt 312  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  12511072 attaagatgttgataatgatgt 12511051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 225
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051238
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 2051237  T
Q  225 g 225  Q
    |    
T  2051238 g 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 187
Target Start/End: Original strand, 17248224 - 17248287
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17248224 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaataattg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 181 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 32307802 - 32307681
Alignment:
Q  181 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 278  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32307802 ataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 32307705  T
Q  279 cggtctaagttgattaagatgttg 302  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  32307704 cggtctaagttgatgatgatgttg 32307681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 232
Target Start/End: Original strand, 22147474 - 22147571
Alignment:
Q  135 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 232  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  22147474 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt 22147571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 250 - 299
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45577996
Alignment:
Q  250 ctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45577996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15471046 - 15470939
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15471046 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggt 15470948  T
Q  283 ctaagttga 291  Q
    |||||||||    
T  15470947 ctaagttga 15470939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Original strand, 13210333 - 13210447
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13210333 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13210431  T
Q  290 gattaagatgttgatg 305  Q
    | | |||||| |||||    
T  13210432 gttgaagatgatgatg 13210447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14234602 - 14234488
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  14234602 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagtt 14234504  T
Q  290 gattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||| |||||    
T  14234503 gattaagatgatgatg 14234488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28194752 - 28194697
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194752 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 28194697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16097509 - 16097342
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| | ||    
T  16097509 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgat 16097411  T
Q  225 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    | || ||| | ||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16097410 gatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16097342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16103960 - 16103794
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||  ||||| || | ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  16103960 ttgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcat 16103863  T
Q  225 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16103862 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16103794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 54521025 - 54520985
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54521025 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 54520985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 292
Target Start/End: Original strand, 12174265 - 12174366
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||  ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12174265 gttgttgttttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12174363  T
Q  290 gat 292  Q
    |||    
T  12174364 gat 12174366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 138
Target Start/End: Original strand, 29544801 - 29544839
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29544801 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 29544839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 37251105 - 37251270
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| || | |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  37251105 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatg--ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37251202  T
Q  223 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||  ||| |||| ||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  37251203 atgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14665458 - 14665397
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 306  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  14665458 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 14665397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 856197 - 856143
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  856197 tgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 856143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Original strand, 3389999 - 3390053
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  3389999 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 3390053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14668611 - 14668553
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  14668611 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 14668553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Original strand, 23077537 - 23077591
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  23077537 tgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatg 23077591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 12305348 - 12305315
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305348 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 12305315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 201 - 292
Target Start/End: Original strand, 49668091 - 49668183
Alignment:
Q  201 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  49668091 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 49668183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 299
Target Start/End: Original strand, 15878114 - 15878165
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  15878114 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatg 15878165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Original strand, 3403019 - 3403073
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  3403019 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 3403073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 9513026 - 9512934
Alignment:
Q  201 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9513026 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9512934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 9521001 - 9520909
Alignment:
Q  201 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9521001 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9520909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 299
Target Start/End: Original strand, 26196500 - 26196545
Alignment:
Q  254 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  26196500 tgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatg 26196545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 13919390 - 13919350
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 285  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13919390 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 15977736 - 15977696
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  15977736 tgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatat 15977696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 50)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 100 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 21840970 - 21840766
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21840970 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttga 21840871  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840870 cttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21840771  T
Q  300 ttgat 304  Q
    |||||    
T  21840770 ttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 23593693 - 23593893
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23593693 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttg 23593792  T
Q  199 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593793 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 23593892  T
Q  299 g 299  Q
    |    
T  23593893 g 23593893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16362121 - 16361908
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16362121 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttg 16362022  T
Q  199 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16362021 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 16361922  T
Q  299 gttgatgatgatgt 312  Q
    ||||||||||||||    
T  16361921 gttgatgatgatgt 16361908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13989069 - 13988870
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13989069 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 13988970  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988969 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13988870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 21923250 - 21923449
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21923250 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 21923349  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923350 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21923449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 21475046 - 21475245
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21475046 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 21475145  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21475146 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatg 21475245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29776891 - 29776692
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29776891 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 29776792  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776791 cttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29776692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29298339 - 29298141
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29298339 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 29298240  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298239 cttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29298141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31612516 - 31612317
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31612516 tgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttga 31612417  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612416 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 31612317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 22123026 - 22123226
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  22123026 tgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttga 22123125  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22123126 cttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagat 22123225  T
Q  299 g 299  Q
    |    
T  22123226 g 22123226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 16275322 - 16275522
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttg 198  Q
    |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  16275322 tgatgtttcaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattg 16275421  T
Q  199 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16275422 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagat 16275521  T
Q  299 g 299  Q
    |    
T  16275522 g 16275522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 124 - 305
Target Start/End: Original strand, 13212844 - 13213026
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13212844 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 13212943  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13212944 atgttgtttttgtatactgttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 13213026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 15859967 - 15860167
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttg 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| || ||||| ||||| |||||||| |||    
T  15859967 tgatgtcttaagatgttgattaccatctgatgttgttatattgtgatataattgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattaagacgttgattg 15860066  T
Q  199 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15860067 acttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagat 15860166  T
Q  299 g 299  Q
    |    
T  15860167 g 15860167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21347141 - 21346965
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21347141 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21347042  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347041 atgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21346965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 111 - 287
Target Start/End: Original strand, 45574812 - 45574989
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45574812 gatgttgattatgatttgatgttcttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttgg 45574911  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45574912 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21342276 - 21342100
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21342276 atttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21342177  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342176 atgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21342100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21707346 - 21707171
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21707346 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21707247  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707246 tgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21707171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21711888 - 21711713
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21711888 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21711789  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711788 tgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21711713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 129 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 40389329 - 40389158
Alignment:
Q  129 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40389329 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 40389230  T
Q  228 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40389229 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatg 40389158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 433190 - 433016
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433190 atttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 433091  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
     || ||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433090 ttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 433016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 141 - 308
Target Start/End: Original strand, 50210168 - 50210336
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50210168 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50210267  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatg 308  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  50210268 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 50210336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Original strand, 27250684 - 27250849
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250684 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27250783  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  27250784 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 27250849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 181 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34509906 - 34509787
Alignment:
Q  181 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34509906 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 34509807  T
Q  280 ggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  34509806 ggtctaagttgatgaagatg 34509787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22532435 - 22532270
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||   |||||| || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532435 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22532336  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  22532335 gcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 22532270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 141 - 312
Target Start/End: Original strand, 22468651 - 22468823
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttga-atcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 239  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  |    
T  22468651 tgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattat-tgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatc 22468749  T
Q  240 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 312  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22468750 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgaagatgt 22468823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 21896193 - 21896358
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  21896193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 21896292  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21896293 atgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 178 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20135316 - 20135181
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    |||||| || ||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||| | || |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  20135316 tgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatga 20135217  T
Q  277 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 312  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20135216 gtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 20135181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 287
Target Start/End: Original strand, 21861510 - 21861672
Alignment:
Q  127 tgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 225  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21861510 tgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 21861609  T
Q  226 ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    ||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21861610 ctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 141 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21026846 - 21026696
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  21026846 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatact 21026747  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 290  Q
    || | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21026746 gcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21026696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 245 - 312
Target Start/End: Original strand, 20454613 - 20454680
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20454613 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgt 20454680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16758822 - 16758664
Alignment:
Q  135 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttt 232  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||| || |||||||  ||| |||||||||| |||| |||||  ||| |||    
T  16758822 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatg-ttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactggttt 16758724  T
Q  233 tgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
     | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16758723 -gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 305
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847274
Alignment:
Q  205 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 303  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 20847272  T
Q  304 tg 305  Q
    ||    
T  20847273 tg 20847274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 35261018 - 35261180
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  35261018 atttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatc 35261114  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35261115 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 33681188 - 33681022
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || |||||| ||||  |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  33681188 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcat 33681090  T
Q  225 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681089 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 33681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 181 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21754170 - 21754049
Alignment:
Q  181 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 278  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21754170 ataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 21754073  T
Q  279 cggtctaagttgattaagatgttg 302  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  21754072 cggtctaagttgatgatgatgttg 21754049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 41049973 - 41050138
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  41049973 atttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatg--ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 41050070  T
Q  223 atgctgt-ttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||   | |||| ||||||| || |||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41050071 atgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 286
Target Start/End: Original strand, 14295493 - 14295652
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| | |  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  14295493 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 14295588  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 286  Q
    || || ||| | ||||| | | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14295589 tgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14295652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20248394 - 20248293
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20248394 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 20248296  T
Q  290 gat 292  Q
    |||    
T  20248295 gat 20248293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 230
Target Start/End: Original strand, 22354527 - 22354616
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 230  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22354527 tgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 292
Target Start/End: Original strand, 22921868 - 22921976
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22921868 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 22921966  T
Q  283 ctaagttgat 292  Q
    ||||| ||||    
T  22921967 ctaagatgat 22921976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20918719 - 20918620
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20918719 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20918621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22237788 - 22237642
Alignment:
Q  145 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 243  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| |    
T  22237788 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcct 22237691  T
Q  244 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
     ||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  22237690 atgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttga 22237642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21714600 - 21714549
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21714600 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 21714549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 306
Target Start/End: Original strand, 24783155 - 24783213
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 306  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||    
T  24783155 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatga 24783213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 291
Target Start/End: Original strand, 52928038 - 52928076
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52928038 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 43543254 - 43543214
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43543254 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 43543214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21161792 - 21161730
Alignment:
Q  231 tttgtatactgctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||| |||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21161792 tttgcatactgttttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgat 21161730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Original strand, 42865273 - 42865327
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||    
T  42865273 tgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatg 42865327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50686792 - 50686695
Alignment:
Q  128 gatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 225  Q
    |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||    
T  50686792 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatg 50686695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12271725 - 12271642
Alignment:
Q  135 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 219  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||| | | ||| || |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12271725 ttataatgtgatataattgtatatatattactttagttatacgtaaata-ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 12271642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 100 - 301
Target Start/End: Original strand, 17399 - 17600
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17399 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatactgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 17498  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T
Q  300 tt 301  Q
    ||    
T  17599 tt 17600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 94614 - 94415
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  94614 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 94515  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94514 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 94415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 144 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44458
Alignment:
Q  144 gatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgc 242  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt 44515  T
Q  243 tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44514 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 100534 - 100388
Alignment:
Q  145 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 243  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  ||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  100534 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcct 100438  T
Q  244 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  100437 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 100388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 119937 - 119876
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  119937 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 119876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 292
Target Start/End: Original strand, 40135 - 40281
Alignment:
Q  145 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 243  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |  |||||| |    
T  40135 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcct 40231  T
Q  244 gtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
     ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  40232 atgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 40281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 299
Target Start/End: Original strand, 38542 - 38593
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  38542 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatg 38593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 102 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 501285 - 501075
Alignment:
Q  102 atgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgact 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  501285 atgttttaagatgttgattactatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgact 501186  T
Q  202 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501185 tgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 501086  T
Q  302 gatgatgatgt 312  Q
    | |||| ||||    
T  501085 gttgattatgt 501075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Original strand, 85562 - 85738
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  85562 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 85661  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  85662 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatg 85738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 160798 - 160698
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  160798 gttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 160701  T
Q  290 gat 292  Q
    |||    
T  160700 gat 160698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 103 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4894 - 4698
Alignment:
Q  103 tgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgactt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4894 tgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 4795  T
Q  203 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4794 gcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatg 4698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 100 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9445 - 9241
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9445 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttga 9346  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9345 cttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9246  T
Q  300 ttgat 304  Q
    |||||    
T  9245 ttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20950 - 20751
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20950 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 20851  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20850 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 38024 - 37825
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38024 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 37925  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37924 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 37825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 85)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 456524 - 456325
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  456524 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 456425  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456424 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 456325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 11393246 - 11393445
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11393246 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 11393345  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393346 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 11393445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 15376672 - 15376871
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15376672 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 15376771  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376772 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15376871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16232723 - 16232524
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16232723 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 16232624  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232623 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16232524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 20385082 - 20385281
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20385082 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 20385181  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385182 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20385281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 21189554 - 21189753
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21189554 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 21189653  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189654 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21189753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32125694 - 32125495
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32125694 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 32125595  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125594 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 32125495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 41523120 - 41522921
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41523120 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 41523021  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523020 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41522921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 41525582 - 41525383
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41525582 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 41525483  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525482 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41525383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11972699 - 11972500
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11972699 tgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 11972600  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972599 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 11972500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 14949081 - 14949280
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14949081 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 14949180  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949181 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 14949280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18640475 - 18640276
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18640475 tgatgttttaagatgttgattattattttatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 18640376  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640375 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18640276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24702441 - 24702242
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24702441 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 24702342  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702341 cttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24702242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27217063 - 27216864
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27217063 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 27216964  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27216963 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatg 27216864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16213887 - 16213688
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16213887 tgatgttttcatatgttgattaccatttgatgttgttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttga 16213788  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213787 cttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16213688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16410262 - 16410063
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16410262 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactatgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 16410163  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410162 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16410063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18430915 - 18430710
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18430915 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttga 18430816  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430815 cttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18430716  T
Q  300 ttgatg 305  Q
     |||||    
T  18430715 atgatg 18430710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24704888 - 24704692
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24704888 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 24704789  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704788 cttgcatttgatattattatgtc---ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24704692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44116688 - 44116513
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116688 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 44116589  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116588 tgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44116513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 125 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3386511 - 3386337
Alignment:
Q  125 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3386511 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcat 3386412  T
Q  225 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386411 gctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3386337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 154 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275162
Alignment:
Q  154 tatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 253  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 24275221  T
Q  254 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24275220 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgttgattatgt 24275162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 111 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13647521 - 13647344
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647521 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 13647422  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13647421 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13869551 - 13869350
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-tt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||  || || | |||||||||||||||||| ||    
T  13869551 tgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctttgaataattgagacgttgatt 13869452  T
Q  198 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaaga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869451 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 13869352  T
Q  298 tg 299  Q
    ||    
T  13869351 tg 13869350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Original strand, 17061898 - 17062073
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17061898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtca 17061997  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17061998 tgct-attttgtatactgctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17062073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 126 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20110723 - 20110560
Alignment:
Q  126 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110723 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 20110624  T
Q  226 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||          |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110623 ctgtttttgtata----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20110560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 26355942 - 26356152
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26355942 tgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 26356041  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtt-----------gctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||           | |||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |    
T  26356042 cttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaat 26356141  T
Q  289 tgattaagatg 299  Q
    |||||||||||    
T  26356142 tgattaagatg 26356152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 26358394 - 26358604
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26358394 tgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 26358493  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtt-----------gctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||           | |||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |    
T  26358494 cttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaat 26358593  T
Q  289 tgattaagatg 299  Q
    |||||||||||    
T  26358594 tgattaagatg 26358604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Original strand, 38898359 - 38898535
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38898359 atttgacgttgttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 38898458  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38898459 atgctgtttttatatactgctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 12756654 - 12756817
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12756654 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 12756753  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  12756754 tgttgtttttgtatattgttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 184 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273396
Alignment:
Q  184 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  48273512 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  283 ctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatg 48273396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 177 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831377
Alignment:
Q  177 gtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 13831400  T
Q  277 gtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  13831399 gtcggtctaaattgattaagatg 13831377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 3564319 - 3564478
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||| ||   || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3564319 tgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 3564418  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3564419 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 3564478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12698998 - 12698832
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 239  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12698998 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatac 12698899  T
Q  240 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12698898 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 12698832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 18456368 - 18456526
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18456368 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 18456466  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    | || ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456467 gcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18456526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 9509355 - 9509190
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9509355 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatact 9509256  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9509255 gcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 9509190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 38227646 - 38227482
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| |||||  |||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38227646 tgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 38227548  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  38227547 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatg 38227482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26212168 - 26212012
Alignment:
Q  135 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 234  Q
    ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26212168 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttg 26212069  T
Q  235 tatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 290  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26212068 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttg 26212012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 291
Target Start/End: Original strand, 2280056 - 2280225
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  2280056 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatc 2280155  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    |||||| ||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2280156 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 2280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 210
Target Start/End: Original strand, 15081919 - 15082019
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttg 209  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15081919 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttg 15082018  T
Q  210 a 210  Q
    |    
T  15082019 a 15082019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10589154 - 10589055
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 290  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10589154 gttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 185 - 291
Target Start/End: Original strand, 15144037 - 15144143
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 284  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15144037 ttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgagatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 15144136  T
Q  285 aagttga 291  Q
    |||||||    
T  15144137 aagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 67868 - 67746
Alignment:
Q  184 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgg 281  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  67868 attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 67770  T
Q  282 tctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  67769 tctaagttgattaagatgatgatg 67746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072914
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  283 ctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  22072936 ctaagttgattaagatgatgatg 22072914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 305
Target Start/End: Original strand, 19486681 - 19486864
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  19486681 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 19486780  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||| |||||| | ||||||| | |||||||| |  |||  |||||||| |||||||||||||| |||| | | ||||||||||||    
T  19486781 atgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatg 19486864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13841215 - 13841157
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatat 158  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13841215 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatat 13841157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 305
Target Start/End: Original strand, 10063760 - 10063938
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||      |||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||| ||    
T  10063760 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgt-----ttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatc 10063854  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||| |||| | | |||| || | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||||||||    
T  10063855 atgatgttgt-gcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatg 10063938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 305
Target Start/End: Original strand, 16386268 - 16386368
Alignment:
Q  207 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 304  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  16386268 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 16386367  T
Q  305 g 305  Q
    |    
T  16386368 g 16386368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 47831860 - 47831808
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47831860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 47831808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 299
Target Start/End: Original strand, 14932749 - 14932848
Alignment:
Q  201 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || | || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14932749 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 14932848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 299
Target Start/End: Original strand, 15356184 - 15356283
Alignment:
Q  201 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || | || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15356184 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15356283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 299
Target Start/End: Original strand, 15360298 - 15360397
Alignment:
Q  201 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || | || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15360298 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15360397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 34200901 - 34200787
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34200901 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34200803  T
Q  290 gattaagatgttgatg 305  Q
    | | |||||| |||||    
T  34200802 gttgaagatgatgatg 34200787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 40443541 - 40443393
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 254  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||||    
T  40443541 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcgtatgttgctgtt 40443444  T
Q  255 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 304  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  40443443 tgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 284
Target Start/End: Original strand, 12255730 - 12255892
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||| || || ||||||||||| |||| ||||    
T  12255730 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcat 12255829  T
Q  225 g-ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 284  Q
    |  |   |||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12255830 gaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 18005806 - 18005660
Alignment:
Q  145 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg 244  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||||     
T  18005806 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgctt 18005710  T
Q  245 -tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18005709 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18005660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 11303450 - 11303409
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303450 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 11303409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16056449 - 16056343
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||  | ||| || || |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16056449 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggt 16056352  T
Q  283 ctaagttga 291  Q
    |||||||||    
T  16056351 ctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16495581 - 16495403
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| | |  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  16495581 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 16495486  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  16495485 tgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 16495403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15113114 - 15113031
Alignment:
Q  135 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 219  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15113114 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 15113031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18627769 - 18627717
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 152  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18627769 tgatgttttaagatgttgattagtatttgatcttgttatattgtgatataatt 18627717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15211557 - 15211450
Alignment:
Q  208 tgatattattatgtcatgctgtttttgt-atactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgttgat 304  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||| || |||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||    
T  15211557 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgat 15211458  T
Q  305 gatgatgt 312  Q
    | ||||||    
T  15211457 gttgatgt 15211450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 305
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505418
Alignment:
Q  209 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatg 28505418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 292
Target Start/End: Original strand, 811142 - 811238
Alignment:
Q  197 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  811142 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 811238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15116651 - 15116568
Alignment:
Q  135 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 219  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  15116651 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcaattgatattgttat 15116568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Original strand, 16108648 - 16108688
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16108648 tgatgttttaagatgttgattaccgtttgatgttgttatat 16108688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Original strand, 23664912 - 23664952
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23664912 tgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 23664952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 29796811 - 29796771
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29796811 tgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29796771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 29800630 - 29800590
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29800630 tgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29800590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 44014291 - 44014192
Alignment:
Q  194 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44014291 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 44014193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 306
Target Start/End: Original strand, 2832504 - 2832562
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  2832504 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 2832562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Original strand, 18154901 - 18154955
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18154901 tgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 18154955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 291
Target Start/End: Original strand, 16219723 - 16219823
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16219723 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 16219821  T
Q  290 ga 291  Q
    ||    
T  16219822 ga 16219823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Original strand, 11996095 - 11996147
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  11996095 ttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 11996147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Original strand, 14270021 - 14270061
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14270021 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 14270061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755007
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 15755007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Original strand, 20220127 - 20220225
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| || ||  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  20220127 atttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatc 20220222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 281 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16213653 - 16213622
Alignment:
Q  281 gtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213653 gtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 16213622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 299
Target Start/End: Original strand, 19649552 - 19649603
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  19649552 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatg 19649603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 279
Target Start/End: Original strand, 9446218 - 9446252
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9446218 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 9446252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12187076 - 12187022
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  12187076 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 12187022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Original strand, 15008436 - 15008536
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| || ||  |||||  |||||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  15008436 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgaggtgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 15008533  T
Q  223 atg 225  Q
    |||    
T  15008534 atg 15008536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Original strand, 17138120 - 17138174
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  17138120 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 17138174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 279
Target Start/End: Original strand, 20569656 - 20569690
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20569656 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 20569690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Original strand, 27847838 - 27847950
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||   ||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  27847838 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactgtt---gtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagat 27847934  T
Q  290 gattaagatgttgatg 305  Q
    | | |||||| |||||    
T  27847935 gttgaagatgatgatg 27847950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8468843 - 8468803
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8468843 tgatgttttatgatgttgattattatttgatgttgttatat 8468803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 68)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 264727 - 264926
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  264727 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 264826  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264827 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 264926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 42245324 - 42245523
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42245324 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 42245423  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245424 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 42245523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39363587 - 39363388
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39363587 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 39363488  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363487 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 39363388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 10732899 - 10733098
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10732899 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatacggtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 10732998  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732999 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10733098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20909215 - 20909016
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20909215 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 20909116  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909115 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20909016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29346183 - 29345984
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29346183 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 29346084  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  29346083 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 29345984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32027596 - 32027397
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32027596 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 32027497  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32027496 cttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 32027397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29348656 - 29348457
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29348656 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 29348557  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  29348556 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 29348457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29351129 - 29350930
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29351129 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 29351030  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  29351029 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 29350930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39245339 - 39245140
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  39245339 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattga 39245240  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245239 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 39245140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29330134 - 29329938
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29330134 tgatgttttaagatgattatta---tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 29330038  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330037 cttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29329938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 20917911 - 20918106
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20917911 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgctttacttgaattagatgtgaataattgagacgttgttga 20918010  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918011 ct----ttttatattattttgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Original strand, 36154766 - 36154938
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154766 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 36154865  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154866 tgctgtttttgtatactgctgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 36154938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 126 - 299
Target Start/End: Original strand, 11581184 - 11581357
Alignment:
Q  126 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581184 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 11581283  T
Q  226 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581284 ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 11581357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Original strand, 20901991 - 20902168
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20901991 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtc 20902090  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg-attaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20902091 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatg 20902168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Original strand, 2154596 - 2154772
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2154596 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtc 2154695  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154696 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 2154772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 129 - 299
Target Start/End: Original strand, 18319021 - 18319192
Alignment:
Q  129 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319021 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 18319120  T
Q  228 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18319121 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 18319192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31061248 - 31061072
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31061248 atttgatgttgttatattgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 31061149  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061148 atgctgtttttgtatactactgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 31061072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 38619639 - 38619438
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-tt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| | ||  || || |||||||||||||||||||| ||    
T  38619639 tgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattggaatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgatt 38619540  T
Q  198 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaaga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619539 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 38619440  T
Q  298 tg 299  Q
    ||    
T  38619439 tg 38619438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Original strand, 10775659 - 10775834
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10775659 atttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 10775757  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775758 atgctggttttatatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10775834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 102 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23064714 - 23064515
Alignment:
Q  102 atgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttga 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||  || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  23064714 atgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattga 23064615  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064614 cttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23064515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 129 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24067282 - 24067111
Alignment:
Q  129 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24067282 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 24067183  T
Q  228 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24067182 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatg 24067111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1096633 - 1096468
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||   || |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  1096633 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatact 1096534  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1096533 acctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatg 1096468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Original strand, 23390451 - 23390616
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23390451 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23390550  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23390551 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23390616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 9078118 - 9077953
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| | ||   || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9078118 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 9078019  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  9078018 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 9077953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25421698 - 25421533
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25421698 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25421599  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25421598 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 25421533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Original strand, 21729019 - 21729184
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21729019 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21729118  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  21729119 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21729184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Original strand, 21808344 - 21808509
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21808344 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21808443  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  21808444 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21808509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 199 - 305
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997654
Alignment:
Q  199 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaaga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21997646  T
Q  298 tgttgatg 305  Q
    || |||||    
T  21997647 tgatgatg 21997654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24529346 - 24529227
Alignment:
Q  181 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24529346 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 24529247  T
Q  280 ggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  24529246 ggtctaagttgatgaagatg 24529227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Original strand, 8286797 - 8286963
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-gtatac 239  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  || | ||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8286797 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatac 8286896  T
Q  240 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8286897 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8286963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 141 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25431560 - 25431414
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25431560 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25431461  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 286  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431460 gcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24493734 - 24493570
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||||||  |||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24493734 tgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 24493636  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24493635 gcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 24493570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22412329 - 22412191
Alignment:
Q  161 attacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttat 259  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | | |||||    
T  22412329 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttatcgttat 22412231  T
Q  260 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412230 ttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatg 22412191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13025476 - 13025312
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| |||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  13025476 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatact 13025378  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || | ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13025377 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13025312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13095660 - 13095496
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| |||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  13095660 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatact 13095562  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || | ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13095561 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13095496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22075185 - 22075035
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22075185 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatact 22075086  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 290  Q
     | | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22075085 tcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttg 22075035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 141 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22144215 - 22144068
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||    
T  22144215 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatact 22144117  T
Q  241 gc-tgtgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
     | | ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22144116 acctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 178 - 312
Target Start/End: Original strand, 17517193 - 17517328
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17517193 tgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 17517292  T
Q  277 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 312  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17517293 gtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 17517328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40726037 - 40725854
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  40726037 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 40725938  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||| ||  |||| |||||| ||  ||||||| |  |||  |||||||| |||||||||||||| |||| | | ||||||||||||    
T  40725937 atgatg-ctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatg 40725854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18418678 - 18418590
Alignment:
Q  208 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttattt-aactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaag 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18418678 tgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgattaag 18418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 248
Target Start/End: Original strand, 20766095 - 20766181
Alignment:
Q  161 attacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtt 248  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20766095 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtt 20766181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 21329556 - 21329617
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21329556 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 21329617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21565723 - 21565556
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || |||| | |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  21565723 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 21565625  T
Q  225 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21565624 gatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21565556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37724050 - 37723906
Alignment:
Q  158 tgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgt-tg 255  Q
    |||||||||||||| ||   ||||| ||||||| |||| ||| ||  ||||||||| || |||||||||||||   ||||||||| | ||||||||| ||    
T  37724050 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtctg 37723954  T
Q  256 ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  37723953 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatgttga 37723906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 287
Target Start/End: Original strand, 20026945 - 20027043
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20026945 gttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 305
Target Start/End: Original strand, 21292992 - 21293089
Alignment:
Q  207 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || | |||||| |||||    
T  21292992 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21293089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 305
Target Start/End: Original strand, 21502167 - 21502276
Alignment:
Q  197 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 294  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||| | |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21502167 tgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 21502265  T
Q  295 agatgttgatg 305  Q
    ||||| |||||    
T  21502266 agatgatgatg 21502276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 287
Target Start/End: Original strand, 22178161 - 22178323
Alignment:
Q  128 gatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat-- 224  Q
    |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||      
T  22178161 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatga 22178259  T
Q  225 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22178260 gctg-ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 299
Target Start/End: Original strand, 20806845 - 20806900
Alignment:
Q  244 gtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20806845 gtgtcgctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatg 20806900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 292
Target Start/End: Original strand, 22959538 - 22959639
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22959538 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22959636  T
Q  290 gat 292  Q
    |||    
T  22959637 gat 22959639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 19660894 - 19660955
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  19660894 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 19660955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 9776561 - 9776521
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9776561 tgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 9776521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21873350 - 21873277
Alignment:
Q  207 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||||||| | ||||||||| | |||||| |||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21873350 ttgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 36314639 - 36314578
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  36314639 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 36314578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 291
Target Start/End: Original strand, 26012034 - 26012141
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||    
T  26012034 ttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgcttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 26012132  T
Q  283 ctaagttga 291  Q
    |||||||||    
T  26012133 ctaagttga 26012141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26680636 - 26680605
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680636 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26680605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26704129 - 26704078
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26704129 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 26704078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26952243 - 26952212
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26952243 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26952212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26973862 - 26973811
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26973862 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 26973811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22032380 - 22032326
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  22032380 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 22032326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 287
Target Start/End: Original strand, 26740705 - 26740747
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26740705 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 299
Target Start/End: Original strand, 23501412 - 23501469
Alignment:
Q  242 ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| ||||||    
T  23501412 ctgtgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatg 23501469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 290
Target Start/End: Original strand, 26732892 - 26732937
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 290  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26732892 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18356485 - 18356389
Alignment:
Q  135 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 231  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||| |   |||| |||||| |  ||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  18356485 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt 18356389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19668951 - 19668899
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  19668951 ttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatg 19668899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 292
Target Start/End: Original strand, 23535642 - 23535686
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  23535642 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagttgat 23535686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Original strand, 37804862 - 37804902
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  37804862 tgatgttttaagatgttaattagaatttgatgttgttatat 37804902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14150 - 13951
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14150 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 14051  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14050 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13595 - 13396
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13595 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 13496  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13495 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 136883 - 136684
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  136883 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 136784  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136783 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 136684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 139352 - 139153
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  139352 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 139253  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139252 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 139153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 144290 - 144091
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  144290 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 144191  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144190 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 144091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 134414 - 134215
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  134414 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 134315  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  134314 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatg 134215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 141821 - 141622
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  141821 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 141722  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  141721 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatg 141622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 132784 - 132672
Alignment:
Q  181 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 278  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| || | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  132784 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagt 132686  T
Q  279 cggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||| ||||    
T  132685 cggtctaagatgat 132672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 62303 - 62216
Alignment:
Q  202 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    |||||| |||||||||||  |||| |||||||  ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  62303 tgcattcgatattattataccatgatgtttttc-atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 111 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 82264 - 82076
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  82264 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 82165  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  82164 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatg 82076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Original strand, 22610 - 22776
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22610 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 22708  T
Q  225 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    | || ||| | |||||| || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22709 gatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Original strand, 158433 - 158608
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158433 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 158532  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158533 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 158608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 141 - 291
Target Start/End: Original strand, 339905 - 340053
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  339905 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 340002  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    || | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  340003 gcctatgttgttgt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 340053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 104 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 40599 - 40404
Alignment:
Q  104 gttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttg 203  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40599 gttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttg 40500  T
Q  204 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40499 catttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatg 40404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 111 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 110
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  298 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 199  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  198 tattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatg 110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16963 - 16788
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 16864  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16863 tgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4476 - 4301
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4476 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtca 4377  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4376 tgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 111 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12250 - 12068
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 12151  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12150 tattattatgtcatgctgttttagtatactgctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9929 - 9753
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9929 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtc 9830  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9829 attctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 33107 - 32943
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33107 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 33009  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  33008 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatg 32943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 38926 - 38762
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38926 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 38828  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  38827 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatg 38762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4393 - 4218
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4393 atttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 4295  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4294 atgctggttttgtatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 124 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 30111 - 29946
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtca 30012  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30011 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 111 - 299
Target Start/End: Original strand, 1250 - 1439
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttg 209  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttg 1349  T
Q  210 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1350 atattattatgtcatgctgtttttgtatactcatgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 79267 - 79430
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  79267 atttgatgttgttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtca 79366  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  79367 tgctgtttttatatactgtcgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 308
Target Start/End: Original strand, 17170 - 17340
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt--gtata 238  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||| ||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17170 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtata 17269  T
Q  239 ctgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatg 308  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17270 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 17340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 20363 - 20524
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20363 atttgatgtt-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 20461  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20462 tgttg-ttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 128916 - 128752
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |    
T  128916 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttt 128817  T
Q  241 gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
      | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  128816 tttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatg 128752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 124 - 295
Target Start/End: Original strand, 2111 - 2283
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtc 2210  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaa 295  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2211 atgttgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaa 2283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 305
Target Start/End: Original strand, 17964 - 18147
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  17964 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 18063  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||| || || || ||| ||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  18064 atgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 18147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Original strand, 161072 - 161248
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  161072 atttgatattgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 161171  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  161172 attatgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatg 161248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 224
Target Start/End: Original strand, 164573 - 164674
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  164573 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 164672  T
Q  223 at 224  Q
    ||    
T  164673 at 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23048 - 22890
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23048 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22949  T
Q  241 gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22948 ggtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 38615 - 38816
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| | |||| ||||||  ||| ||    
T  38615 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatg 38714  T
Q  199 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaag 296  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  38715 acttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaag 38813  T
Q  297 atg 299  Q
    |||    
T  38814 atg 38816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 161 - 299
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44821
Alignment:
Q  161 attacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttat 259  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  260 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44782 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 44821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 26020 - 26179
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26020 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26119  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26120 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Original strand, 3106 - 3270
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3106 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 3204  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3205 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 3270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13377 - 13212
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13377 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13278  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  13277 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 13212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 135 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 52085 - 51914
Alignment:
Q  135 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 234  Q
    |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52085 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 51986  T
Q  235 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  51985 tatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 51914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 156 - 305
Target Start/End: Original strand, 167948 - 168098
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 254  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  167948 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt 168047  T
Q  255 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  168048 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 168098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Original strand, 16555 - 16720
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16555 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 16654  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  16655 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatg 16720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2017 - 1852
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2017 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1918  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1917 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 1852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 141 - 308
Target Start/End: Original strand, 3141 - 3309
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3141 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 3240  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatg 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3241 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 3309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 141 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4673 - 4522
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4673 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 4574  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4573 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgat 4522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 141 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12255 - 12104
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12255 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 12156  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12155 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgat 12104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 141 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22207 - 22056
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22207 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 22108  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22107 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgat 22056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 116571 - 116434
Alignment:
Q  161 attacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 260  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  116571 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatt 116473  T
Q  261 taactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116472 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 116434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 128907 - 129072
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||||| ||||| |||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  128907 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 129005  T
Q  223 atg-ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||  |  |||| | ||||| || |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  129006 atgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 141 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 39642 - 39486
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39642 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 39544  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaaga 297  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39543 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 39486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 141 - 297
Target Start/End: Original strand, 75170 - 75326
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  75170 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 75268  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaaga 297  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  75269 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 75326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 156 - 305
Target Start/End: Original strand, 1018 - 1168
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 254  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  1018 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt 1117  T
Q  255 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  1118 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 1168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 5015 - 4850
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5015 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatact 4916  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  4915 gcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 4850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3636 - 3471
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3636 tgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3537  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3536 gcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 3471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 344
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||   ||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  508 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctatttt-gtatact 410  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || | ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  409 gcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatg 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Original strand, 32913 - 33076
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| |||  |||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32913 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 33010  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33011 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 33076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 46092 - 45929
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| |||  |||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46092 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 45995  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  45994 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 45929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16278 - 16114
Alignment:
Q  142 gtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 241  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| | ||   || ||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  16278 gtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactg 16179  T
Q  242 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16178 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 16114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Original strand, 17388 - 17449
Alignment:
Q  244 gtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17388 gtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 305
Target Start/End: Original strand, 8472 - 8649
Alignment:
Q  126 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8472 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 8571  T
Q  225 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8572 gctgtttttg-atactgcctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Original strand, 6076 - 6244
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6076 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 6175  T
Q  241 gc---tg-tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
     |   || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6176 acctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 28529 - 28415
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 290  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28529 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 28430  T
Q  291 attaagatgttgatg 305  Q
    || |||||| |||||    
T  28429 atgaagatgatgatg 28415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11293
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11407 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11309  T
Q  290 gattaagatgttgatg 305  Q
    | | |||||| |||||    
T  11308 gttgaagatgatgatg 11293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2050 - 1998
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  2050 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 1998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4553
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 4553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26061 - 25904
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||  |||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  26061 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 25963  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25962 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagat 25904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40023 - 39859
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||  |||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  40023 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 39925  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  39924 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 39859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 288
Target Start/End: Original strand, 24257 - 24406
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 239  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24257 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatac 24356  T
Q  240 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24357 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8481
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataat--tatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 8551  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    |||||| ||||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8550 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6695 - 6536
Alignment:
Q  145 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 243  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  6695 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 6599  T
Q  244 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  6598 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatg 6536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8594 - 8480
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 290  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  8594 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttg 8495  T
Q  291 attaagatgttgatg 305  Q
    || |||||| |||||    
T  8494 atgaagatgatgatg 8480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 141 - 242
Target Start/End: Original strand, 3485 - 3586
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3485 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3584  T
Q  241 gc 242  Q
    ||    
T  3585 gc 3586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 343 - 292
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  343 tgcttttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatg 292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1953
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 254  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| || ||| ||||||    
T  2103 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt 2004  T
Q  255 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  2003 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 1953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 291
Target Start/End: Original strand, 27686 - 27855
Alignment:
Q  124 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||    
T  27686 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 27785  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    |||||||||| | ||||| | | ||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27786 atgctgtttt-gcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13165 - 13092
Alignment:
Q  146 tataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 219  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13165 tataattatatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11648 - 11465
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  11648 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 11549  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| | | ||||||||||||    
T  11548 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatg 11465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 305
Target Start/End: Original strand, 38193 - 38376
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  38193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 38292  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| | | ||||||||||||    
T  38293 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatg 38376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 53486 - 53651
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  53486 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 53585  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  53586 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40078 - 39914
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||    |||| || ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40078 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 39980  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  39979 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 39914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 287
Target Start/End: Original strand, 19883 - 19987
Alignment:
Q  186 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgg 281  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| |||| ||||||| || |||||||| |||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  19883 tgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcgg 19981  T
Q  282 tctaag 287  Q
    ||||||    
T  19982 tctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13313 - 13147
Alignment:
Q  124 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaat-aattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgt 221  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||   || ||| |||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  13313 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatat 13214  T
Q  222 catgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    ||||||| ||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13213 catgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 291
Target Start/End: Original strand, 16037 - 16206
Alignment:
Q  124 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||    
T  16037 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 16136  T
Q  223 atgctgtttttgtatact-gctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    ||| || ||||| |||||  || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16137 atgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4713
Alignment:
Q  216 ttatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 4713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13274 - 13144
Alignment:
Q  126 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13274 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 13175  T
Q  225 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 254  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13174 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 250 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 281
Alignment:
Q  250 ctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagat 281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 34238 - 34124
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34238 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 34140  T
Q  290 gattaagatgttgatg 305  Q
    | | |||||| |||||    
T  34139 gttgaagatgatgatg 34124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 225590 - 225482
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  225590 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatc 225492  T
Q  223 atgctgtttt 232  Q
    | ||||||||    
T  225491 acgctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 6150 - 6070
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtga 180  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6150 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatttaattgcatatgcattacttgaattatatgtga 6070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Original strand, 10381 - 10543
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || ||| || ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  10381 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatact 10476  T
Q  241 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || |||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  10477 gcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 10543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 32216 - 32068
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 254  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  || |||||| | ||||||||||    
T  32216 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 32119  T
Q  255 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  32118 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 32068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12751 - 12587
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| | | || |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  12751 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 12653  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12652 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 299
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11557
Alignment:
Q  207 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  11464 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatg 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Original strand, 15420 - 15583
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15420 tgtgatataat-atttatgcattacttgaagaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 15517  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  15518 gcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 15583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7352 - 7298
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  7352 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatg 7298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 174913 - 174785
Alignment:
Q  158 tgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttg 255  Q
    |||||||||||||| ||   ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   |||||||||| || |||||||| |||    
T  174913 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttg 174817  T
Q  256 ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  174816 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 121827 - 121767
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  121827 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 121767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 124751 - 124675
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 217  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || | |||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  124751 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 207 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13596 - 13513
Alignment:
Q  207 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 290  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13596 ttgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 303
Target Start/End: Original strand, 6220 - 6400
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||    
T  6220 atttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatc 6318  T
Q  223 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 303  Q
    |||  |||||||  |||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  6319 atgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatga--aagatgttga 6400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21077 - 20911
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||| |  | || ||||||  | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  21077 tgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatatt 20978  T
Q  241 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    | || |||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  20977 gcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatg 20911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12112 - 12039
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgtt 197  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  12112 atttgatactgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgaggcgttgtt 12039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12042 - 11982
Alignment:
Q  227 tgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12042 tgttttggtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15776 - 15668
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15776 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 15678  T
Q  290 gattaagatg 299  Q
    ||||||||||    
T  15677 gattaagatg 15668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27996 - 27911
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 226  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27996 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 130066 - 129919
Alignment:
Q  145 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 243  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  130066 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 129969  T
Q  244 gtgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  129968 atgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgat 129919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 60652 - 60818
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatat-tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  60652 atttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattggtatatc 60750  T
Q  223 at--gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    ||  |||| |||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  60751 atgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Original strand, 10481 - 10647
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  10481 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 10579  T
Q  225 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10580 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 4893 - 4953
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  4893 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 4953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 230
Target Start/End: Original strand, 918 - 1006
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 230  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||   |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  918 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgca-ttgatattattatgccatgctgtt 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Original strand, 7996 - 8098
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||  || ||| |||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  7996 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatc 8095  T
Q  223 atg 225  Q
    |||    
T  8096 atg 8098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 305
Target Start/End: Original strand, 6134 - 6243
Alignment:
Q  197 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 294  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6134 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 6232  T
Q  295 agatgttgatg 305  Q
    ||||| |||||    
T  6233 agatgatgatg 6243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19424 - 19278
Alignment:
Q  145 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 243  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  19424 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 19328  T
Q  244 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19327 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 4675 - 4545
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 254  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||||| ||  |||||||||||| || || ||||| | ||| ||||||| | || || ||||    
T  4675 tatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt 4576  T
Q  255 gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4575 gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1154
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1102 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 1154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6664 - 6612
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6664 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14044 - 13992
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14044 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 13992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Original strand, 15845 - 15897
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15845 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 15897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 178952 - 178901
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  178952 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 178901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 5803 - 5657
Alignment:
Q  145 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 243  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||||| |    
T  5803 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcct 5707  T
Q  244 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
     |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5706 atgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Original strand, 15298 - 15352
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15298 tgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatg 15352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1402 - 1290
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1402 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 1306  T
Q  290 gattaagatgttgatg 305  Q
    | | |||||| |||||    
T  1305 gttgaagatgatgatg 1290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7379 - 7267
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  7379 gttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 7283  T
Q  290 gattaagatgttgatg 305  Q
    | | |||||| |||||    
T  7282 gttgaagatgatgatg 7267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 292
Target Start/End: Original strand, 2805 - 2913
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2805 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2903  T
Q  283 ctaagttgat 292  Q
    ||||| ||||    
T  2904 ctaagatgat 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16395 - 16283
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16395 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 16299  T
Q  290 gattaagatgttgatg 305  Q
    | | |||||| |||||    
T  16298 gttgaagatgatgatg 16283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 305
Target Start/End: Original strand, 1011 - 1189
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| | |  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  1011 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 1106  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
    || || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  1107 tgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 1189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 279
Target Start/End: Original strand, 4286 - 4320
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4286 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 292
Target Start/End: Original strand, 45732 - 45899
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||| || ||||| || | ||| ||||||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  45732 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttga-taattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcat 45830  T
Q  225 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    | || ||| | ||||||| | | || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45831 gatgattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 292
Target Start/End: Original strand, 14696 - 14804
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| || |||| | |||||| | |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14696 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggt 14794  T
Q  283 ctaagttgat 292  Q
    ||||||||||    
T  14795 ctaagttgat 14804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1134 - 1051
Alignment:
Q  205 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1134 atttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1135 - 1091
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaaga 297  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1135 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 3226 - 3186
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3226 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 3186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 25289 - 25121
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||| ||||| |||| ||| |  |||||| |||||||| ||||||| |||||  |||| |||    
T  25289 atttgatgttgtaataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatca 25192  T
Q  224 tg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    ||  |||||||  |||||||| | |||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25191 tgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 32657 - 32551
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| | |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||    
T  32657 ttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 32560  T
Q  283 ctaagttga 291  Q
    |||||||||    
T  32559 ctaagttga 32551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29660 - 29561
Alignment:
Q  201 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || | || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29660 ttgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatg 29561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6761 - 6675
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 242  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  6761 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgc 6675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 97190 - 97089
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  97190 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 97092  T
Q  223 atg 225  Q
    |||    
T  97091 atg 97089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 106468 - 106367
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  106468 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 106370  T
Q  223 atg 225  Q
    |||    
T  106369 atg 106367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 143
Alignment:
Q  145 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 243  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  290 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 193  T
Q  244 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
     ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  192 atgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 1631 - 1591
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1631 tgattttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 305
Target Start/End: Original strand, 192997 - 193097
Alignment:
Q  208 tgatattattatgtcatgctgtttttgt-atactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgttgat 304  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||| || |||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||    
T  192997 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgat 193096  T
Q  305 g 305  Q
    |    
T  193097 g 193097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Original strand, 15273 - 15327
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  15273 tgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 15327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Original strand, 19795 - 19849
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  19795 tgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 19849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8137 - 8090
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8137 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6927 - 6826
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  6927 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagat 6829  T
Q  290 gat 292  Q
    |||    
T  6828 gat 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 292
Target Start/End: Original strand, 2713 - 2752
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2713 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 2752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23897 - 23846
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23897 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 23846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 51695 - 51601
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51695 gttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 214
Target Start/End: Original strand, 18176 - 18265
Alignment:
Q  125 tttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 214  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18176 tttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 18265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13054 - 12954
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  13054 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 12956  T
Q  290 ga 291  Q
    ||    
T  12955 ga 12954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36457
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 36457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 32224 - 32112
Alignment:
Q  181 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 278  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  32224 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagt 32126  T
Q  279 cggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||| ||||    
T  32125 cggtctaagatgat 32112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 291
Target Start/End: Original strand, 8078 - 8180
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||  ||| ||| ||||||||| | |||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8078 gttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8176  T
Q  288 ttga 291  Q
    ||||    
T  8177 ttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 291
Target Start/End: Original strand, 23898 - 23989
Alignment:
Q  201 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23898 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 23989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10649 - 10542
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||  ||| |||||||||||||    
T  10649 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggt 10551  T
Q  283 ctaagttga 291  Q
    |||||||||    
T  10550 ctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 253 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12819 - 12780
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12819 ttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 213 - 162
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  213 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatg 162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 299
Target Start/End: Original strand, 21866 - 21917
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  21866 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 21917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 299
Target Start/End: Original strand, 29758 - 29809
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  29758 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 29809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 141 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 38483 - 38339
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgtttttgtata 238  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| |||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||  |||| |||| ||||    
T  38483 tgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctg-ttttatata 38386  T
Q  239 ctg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 283  Q
    ||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  38385 ctgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 69848 - 69797
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  69848 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatg 69797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1938 - 1884
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  1938 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 1884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 287
Target Start/End: Original strand, 5196 - 5230
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5196 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 279
Target Start/End: Original strand, 7330 - 7364
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7330 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Original strand, 10582 - 10636
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 299  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| ||||||    
T  10582 tgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatg 10636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 279
Target Start/End: Original strand, 5003 - 5037
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5003 tgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtc 5037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 292
Target Start/End: Original strand, 28839 - 28877
Alignment:
Q  254 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28839 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 47093 - 46996
Alignment:
Q  207 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 304  Q
    |||||||||||||||||||||| |   ||| ||||| | ||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  47093 ttgatattattatgtcatgctgct---gtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 46997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 305
Target Start/End: Original strand, 1021 - 1169
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 254  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||| ||||    
T  1021 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgatgtt 1117  T
Q  255 g-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 305  Q
      ||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  1118 tattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University