View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10233A_low_94 (Length: 314)

Name: NF10233A_low_94
Description: NF10233A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10233A_low_94
NF10233A_low_94
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (100-292)||(11299-11491)
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (100-292)||(16413275-16413467)
chr8 (100-292)||(14409403-14409595)
chr8 (100-292)||(1484413-1484605)
chr8 (100-292)||(5853251-5853443)
chr8 (100-292)||(20403238-20403430)
chr8 (100-292)||(22001764-22001956)
chr8 (100-292)||(15203190-15203382)
chr8 (100-292)||(20046154-20046346)
chr8 (100-292)||(4483292-4483483)
chr8 (100-292)||(4542332-4542524)
chr8 (105-292)||(19896276-19896466)
chr8 (124-292)||(41598199-41598367)
chr8 (100-292)||(14823785-14823976)
chr8 (100-292)||(45290653-45290846)
chr8 (100-290)||(15070571-15070763)
chr8 (126-287)||(19801367-19801527)
chr8 (111-292)||(19936975-19937157)
chr8 (124-292)||(26223930-26224098)
chr8 (111-292)||(25484245-25484419)
chr8 (141-299)||(16092297-16092456)
chr8 (141-299)||(6759265-6759421)
chr8 (126-299)||(18818348-18818523)
chr8 (153-299)||(7372785-7372932)
chr8 (141-299)||(20536215-20536374)
chr8 (141-299)||(28648999-28649158)
chr8 (161-299)||(26219721-26219858)
chr8 (156-299)||(21918969-21919114)
chr8 (141-299)||(22875072-22875230)
chr8 (140-299)||(23406386-23406548)
chr8 (158-299)||(21923900-21924042)
chr8 (141-299)||(22626743-22626901)
chr8 (185-292)||(26225292-26225398)
chr8 (100-190)||(24486003-24486093)
chr8 (124-288)||(13508022-13508188)
chr8 (124-288)||(13597554-13597720)
chr8 (141-299)||(18879191-18879345)
chr8 (124-287)||(20498581-20498746)
chr8 (100-180)||(32810054-32810134)
chr8 (156-299)||(31971264-31971407)
chr8 (135-288)||(17612059-17612213)
chr8 (207-287)||(45131019-45131098)
chr8 (178-292)||(18678094-18678209)
chr8 (178-292)||(23648567-23648682)
chr8 (145-292)||(38855212-38855358)
chr8 (185-292)||(21285611-21285719)
chr8 (124-287)||(37116366-37116532)
chr8 (178-292)||(32121746-32121861)
chr8 (192-292)||(6520382-6520483)
chr8 (207-287)||(16199666-16199746)
chr8 (185-298)||(21673712-21673826)
chr8 (245-299)||(23760903-23760958)
chr8 (192-291)||(983410-983512)
chr8 (253-299)||(26355766-26355812)
chr8 (192-287)||(5866280-5866376)
chr8 (204-299)||(17140923-17141019)
chr8 (192-299)||(21491002-21491110)
chr8 (192-287)||(21389458-21389552)
chr8 (192-287)||(21395988-21396082)
chr8 (192-287)||(21778784-21778878)
chr8 (192-287)||(21790481-21790575)
chr8 (124-225)||(17266930-17267031)
chr8 (141-225)||(17439461-17439544)
chr8 (256-299)||(21249391-21249434)
chr8 (256-299)||(21255229-21255272)
chr8 (253-297)||(14398167-14398211)
chr8 (253-297)||(21383656-21383700)
chr8 (253-297)||(21387076-21387120)
chr8 (100-140)||(35026855-35026895)
[»] chr6 (71 HSPs)
chr6 (100-292)||(34963384-34963576)
chr6 (100-292)||(30676669-30676861)
chr6 (100-292)||(12742328-12742520)
chr6 (100-292)||(19005057-19005249)
chr6 (100-292)||(22782238-22782430)
chr6 (100-292)||(24422558-24422750)
chr6 (100-292)||(33861805-33861997)
chr6 (100-292)||(33864289-33864481)
chr6 (100-292)||(8055040-8055232)
chr6 (100-292)||(18334551-18334743)
chr6 (100-292)||(19858878-19859070)
chr6 (100-292)||(2291139-2291331)
chr6 (100-292)||(26924599-26924791)
chr6 (101-292)||(25656640-25656831)
chr6 (111-292)||(25754820-25755001)
chr6 (100-292)||(1540870-1541062)
chr6 (100-292)||(25688513-25688705)
chr6 (100-292)||(1595560-1595752)
chr6 (124-287)||(18456735-18456898)
chr6 (111-292)||(20556864-20557043)
chr6 (129-292)||(16448514-16448678)
chr6 (125-292)||(3852001-3852168)
chr6 (154-287)||(18461895-18462028)
chr6 (141-299)||(25629310-25629469)
chr6 (144-299)||(29060547-29060703)
chr6 (141-299)||(18409782-18409941)
chr6 (141-294)||(20360915-20361069)
chr6 (181-299)||(20593780-20593899)
chr6 (141-299)||(16496251-16496410)
chr6 (141-291)||(25644335-25644487)
chr6 (158-292)||(17287768-17287903)
chr6 (181-299)||(19303536-19303654)
chr6 (124-292)||(19847932-19848102)
chr6 (194-299)||(20076707-20076812)
chr6 (141-287)||(18821801-18821946)
chr6 (126-299)||(22780166-22780341)
chr6 (156-299)||(20638253-20638397)
chr6 (126-291)||(20109153-20109322)
chr6 (124-300)||(8227448-8227626)
chr6 (245-292)||(25714431-25714478)
chr6 (100-141)||(12942363-12942404)
chr6 (185-299)||(19652202-19652316)
chr6 (185-287)||(23019425-23019528)
chr6 (194-292)||(23992441-23992540)
chr6 (192-291)||(9098518-9098620)
chr6 (178-279)||(15041542-15041644)
chr6 (141-287)||(35245605-35245749)
chr6 (192-291)||(19668386-19668488)
chr6 (245-292)||(27333277-27333325)
chr6 (245-292)||(27394017-27394065)
chr6 (192-289)||(28496477-28496575)
chr6 (192-289)||(29808888-29808986)
chr6 (253-299)||(31155465-31155511)
chr6 (100-140)||(15875469-15875509)
chr6 (100-140)||(28289294-28289334)
chr6 (253-296)||(11185515-11185558)
chr6 (248-279)||(19790842-19790873)
chr6 (253-299)||(1561310-1561356)
chr6 (245-279)||(21766718-21766752)
chr6 (245-297)||(4185880-4185933)
chr6 (245-285)||(22831524-22831565)
chr6 (253-297)||(5616874-5616918)
chr6 (100-136)||(18913994-18914030)
chr6 (100-136)||(18937252-18937288)
chr6 (248-292)||(19862988-19863032)
chr6 (248-292)||(19873130-19873174)
chr6 (253-297)||(23414648-23414692)
chr6 (208-279)||(25603406-25603478)
chr6 (208-279)||(25611744-25611816)
chr6 (253-297)||(27556406-27556450)
chr6 (245-285)||(33443068-33443108)
[»] chr2 (68 HSPs)
chr2 (100-292)||(32214880-32215072)
chr2 (100-292)||(18808954-18809146)
chr2 (100-292)||(23709491-23709683)
chr2 (100-292)||(23711972-23712164)
chr2 (100-292)||(39682324-39682516)
chr2 (100-292)||(571408-571600)
chr2 (100-292)||(6726006-6726198)
chr2 (100-292)||(21155019-21155211)
chr2 (100-292)||(23130873-23131065)
chr2 (100-292)||(23133340-23133532)
chr2 (100-292)||(24367785-24367977)
chr2 (100-292)||(26505390-26505582)
chr2 (100-292)||(26507868-26508060)
chr2 (100-292)||(34402481-34402673)
chr2 (100-292)||(23135601-23135793)
chr2 (100-292)||(32039457-32039649)
chr2 (100-292)||(24898154-24898347)
chr2 (100-292)||(24900637-24900830)
chr2 (100-292)||(24903114-24903307)
chr2 (100-292)||(24905591-24905784)
chr2 (100-292)||(24908066-24908259)
chr2 (100-292)||(28577110-28577302)
chr2 (100-292)||(22105423-22105616)
chr2 (100-292)||(45029813-45030005)
chr2 (125-292)||(43137310-43137477)
chr2 (124-292)||(24529511-24529680)
chr2 (100-292)||(38967385-38967577)
chr2 (141-299)||(22337122-22337281)
chr2 (111-218)||(24642826-24642933)
chr2 (141-299)||(23060520-23060679)
chr2 (141-299)||(23076449-23076608)
chr2 (141-299)||(22731189-22731348)
chr2 (126-288)||(19671848-19672010)
chr2 (141-292)||(22738135-22738286)
chr2 (141-299)||(23285872-23286027)
chr2 (141-299)||(23660030-23660188)
chr2 (141-292)||(298769-298922)
chr2 (185-299)||(28405983-28406099)
chr2 (141-299)||(23654341-23654500)
chr2 (207-299)||(38136-38228)
chr2 (126-291)||(23708558-23708725)
chr2 (225-292)||(24643034-24643101)
chr2 (111-180)||(22173799-22173868)
chr2 (141-287)||(7688-7835)
chr2 (178-287)||(23103389-23103497)
chr2 (245-299)||(23040249-23040303)
chr2 (145-299)||(25175857-25176010)
chr2 (156-287)||(20309127-20309257)
chr2 (178-292)||(25616199-25616314)
chr2 (230-299)||(8946664-8946734)
chr2 (100-141)||(20261381-20261422)
chr2 (135-211)||(22459511-22459587)
chr2 (124-164)||(29601478-29601518)
chr2 (245-299)||(22134266-22134320)
chr2 (124-225)||(23791357-23791458)
chr2 (124-287)||(20520130-20520295)
chr2 (124-287)||(23207296-23207461)
chr2 (100-140)||(10684724-10684764)
chr2 (178-287)||(32451920-32452031)
chr2 (253-291)||(18786971-18787009)
chr2 (245-292)||(7679599-7679647)
chr2 (248-279)||(24869903-24869934)
chr2 (248-279)||(25961597-25961628)
chr2 (245-279)||(24655398-24655432)
chr2 (124-225)||(24697543-24697644)
chr2 (255-299)||(23072019-23072063)
chr2 (245-285)||(23287384-23287424)
chr2 (245-285)||(26392403-26392443)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (103-292)||(4705-4894)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (100-292)||(10784-10976)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (100-292)||(17399-17591)
scaffold0023 (100-292)||(94422-94614)
scaffold0023 (144-292)||(44465-44614)
scaffold0023 (145-299)||(100381-100534)
scaffold0023 (145-299)||(40135-40288)
scaffold0023 (245-299)||(119882-119937)
scaffold0023 (253-299)||(101506-101552)
[»] chr4 (70 HSPs)
chr4 (100-292)||(3515018-3515210)
chr4 (100-292)||(19618131-19618323)
chr4 (100-292)||(18215233-18215425)
chr4 (100-292)||(14970666-14970858)
chr4 (100-292)||(15118311-15118503)
chr4 (100-292)||(52312521-52312713)
chr4 (100-292)||(12266-12458)
chr4 (100-292)||(19242710-19242903)
chr4 (100-292)||(44615299-44615491)
chr4 (100-292)||(44773046-44773238)
chr4 (100-292)||(15355283-15355476)
chr4 (100-292)||(1837468-1837660)
chr4 (100-292)||(18239378-18239570)
chr4 (100-292)||(50222298-50222490)
chr4 (111-292)||(51463838-51464019)
chr4 (111-292)||(23803235-23803416)
chr4 (124-292)||(44102225-44102393)
chr4 (111-292)||(12610961-12611135)
chr4 (124-287)||(21815568-21815731)
chr4 (135-292)||(44928873-44929031)
chr4 (100-292)||(7641151-7641333)
chr4 (124-288)||(15367708-15367873)
chr4 (124-288)||(15402721-15402886)
chr4 (124-288)||(15371220-15371385)
chr4 (124-288)||(15373501-15373666)
chr4 (124-288)||(15370036-15370200)
chr4 (129-292)||(20149840-20150004)
chr4 (127-288)||(16223550-16223712)
chr4 (141-299)||(7088884-7089043)
chr4 (126-299)||(7798781-7798956)
chr4 (141-299)||(14038655-14038814)
chr4 (185-292)||(14280327-14280434)
chr4 (141-294)||(16377478-16377630)
chr4 (161-292)||(54798729-54798861)
chr4 (141-299)||(12902764-12902923)
chr4 (141-299)||(22636442-22636601)
chr4 (130-287)||(22353852-22354010)
chr4 (194-299)||(52873375-52873481)
chr4 (141-299)||(7893710-7893869)
chr4 (141-299)||(16270191-16270349)
chr4 (141-299)||(44052836-44052995)
chr4 (143-299)||(16239927-16240083)
chr4 (141-299)||(6899898-6900056)
chr4 (124-287)||(13788-13953)
chr4 (185-289)||(8574868-8574971)
chr4 (141-300)||(23374314-23374474)
chr4 (124-291)||(52243131-52243302)
chr4 (126-291)||(43198492-43198661)
chr4 (221-299)||(3096300-3096379)
chr4 (181-299)||(12774014-12774132)
chr4 (143-232)||(15464888-15464977)
chr4 (100-141)||(15534343-15534384)
chr4 (192-291)||(12288214-12288316)
chr4 (100-140)||(14048740-14048780)
chr4 (100-140)||(36038033-36038073)
chr4 (207-287)||(14053323-14053403)
chr4 (197-292)||(39706299-39706395)
chr4 (100-140)||(49547733-49547773)
chr4 (245-299)||(8846363-8846418)
chr4 (245-299)||(15551824-15551879)
chr4 (207-287)||(6190481-6190563)
chr4 (124-287)||(46640393-46640558)
chr4 (100-140)||(15497030-15497070)
chr4 (100-140)||(19857607-19857647)
chr4 (245-287)||(17046506-17046549)
chr4 (100-139)||(52873137-52873176)
chr4 (245-279)||(11250621-11250655)
chr4 (245-279)||(15353367-15353401)
chr4 (253-297)||(18236894-18236938)
chr4 (253-297)||(43256471-43256515)
[»] chr1 (50 HSPs)
chr1 (100-292)||(21840778-21840970)
chr1 (100-292)||(23593693-23593886)
chr1 (100-292)||(13988877-13989069)
chr1 (100-292)||(21923250-21923442)
chr1 (100-292)||(21475046-21475238)
chr1 (100-292)||(29776699-29776891)
chr1 (100-292)||(16361928-16362121)
chr1 (100-292)||(29298148-29298339)
chr1 (100-292)||(31612324-31612516)
chr1 (100-288)||(22123026-22123215)
chr1 (100-292)||(16275322-16275515)
chr1 (111-287)||(45574812-45574989)
chr1 (124-292)||(13212844-13213013)
chr1 (100-292)||(15859967-15860160)
chr1 (124-292)||(21346972-21347141)
chr1 (124-292)||(21342107-21342276)
chr1 (124-292)||(21707178-21707346)
chr1 (124-292)||(21711720-21711888)
chr1 (129-292)||(40389165-40389329)
chr1 (124-292)||(433023-433190)
chr1 (141-299)||(50210168-50210327)
chr1 (141-299)||(27250684-27250843)
chr1 (181-299)||(34509787-34509906)
chr1 (141-299)||(22532276-22532435)
chr1 (124-287)||(21896193-21896358)
chr1 (141-292)||(22468651-22468803)
chr1 (141-299)||(21026687-21026846)
chr1 (127-287)||(21861510-21861672)
chr1 (135-291)||(16758664-16758822)
chr1 (126-299)||(33681014-33681188)
chr1 (124-287)||(35261018-35261180)
chr1 (205-299)||(20847173-20847268)
chr1 (181-300)||(21754051-21754170)
chr1 (178-292)||(20135201-20135316)
chr1 (192-299)||(20248286-20248394)
chr1 (185-299)||(22921868-22921983)
chr1 (245-292)||(20454613-20454660)
chr1 (145-299)||(22237634-22237788)
chr1 (124-287)||(41049973-41050138)
chr1 (124-286)||(14295493-14295652)
chr1 (231-299)||(21161723-21161792)
chr1 (141-230)||(22354527-22354616)
chr1 (192-290)||(20918620-20918719)
chr1 (253-296)||(52928038-52928081)
chr1 (248-292)||(21714556-21714600)
chr1 (100-140)||(43543214-43543254)
chr1 (128-225)||(50686695-50686792)
chr1 (248-297)||(36819364-36819413)
chr1 (135-219)||(12271642-12271725)
chr1 (253-297)||(33797285-33797329)
[»] chr3 (89 HSPs)
chr3 (100-292)||(12567571-12567763)
chr3 (100-292)||(13544036-13544228)
chr3 (100-292)||(9707566-9707758)
chr3 (100-292)||(16454240-16454432)
chr3 (100-292)||(17463189-17463381)
chr3 (100-292)||(45606866-45607058)
chr3 (100-292)||(7781306-7781498)
chr3 (100-292)||(8899105-8899297)
chr3 (100-292)||(34159337-34159529)
chr3 (100-292)||(38961850-38962042)
chr3 (100-292)||(55476502-55476694)
chr3 (100-292)||(6469093-6469285)
chr3 (100-292)||(10247682-10247874)
chr3 (100-292)||(16282770-16282962)
chr3 (100-292)||(17446614-17446805)
chr3 (100-292)||(28848570-28848762)
chr3 (100-292)||(13151749-13151942)
chr3 (100-292)||(13154214-13154407)
chr3 (100-292)||(41123901-41124090)
chr3 (111-292)||(50242833-50243014)
chr3 (124-292)||(29172565-29172734)
chr3 (124-292)||(17672637-17672805)
chr3 (124-287)||(53070636-53070799)
chr3 (100-292)||(8499529-8499723)
chr3 (104-292)||(15412440-15412630)
chr3 (124-292)||(12119707-12119876)
chr3 (111-287)||(43550448-43550625)
chr3 (173-292)||(15977526-15977645)
chr3 (141-299)||(14972861-14973020)
chr3 (192-292)||(55500953-55501053)
chr3 (141-299)||(17487863-17488022)
chr3 (141-299)||(17499345-17499504)
chr3 (100-292)||(27165261-27165455)
chr3 (141-292)||(40213676-40213827)
chr3 (125-288)||(42386428-42386593)
chr3 (100-292)||(53301463-53301658)
chr3 (141-299)||(14576788-14576946)
chr3 (141-299)||(25476340-25476499)
chr3 (161-292)||(36166609-36166739)
chr3 (126-294)||(43840944-43841114)
chr3 (141-299)||(13442281-13442440)
chr3 (161-292)||(21618460-21618590)
chr3 (126-291)||(26686902-26687069)
chr3 (156-299)||(12399216-12399360)
chr3 (192-299)||(18438541-18438649)
chr3 (156-299)||(20698405-20698549)
chr3 (141-299)||(23083316-23083475)
chr3 (200-292)||(10556996-10557088)
chr3 (204-292)||(44494820-44494908)
chr3 (178-300)||(14572595-14572717)
chr3 (124-288)||(24340660-24340826)
chr3 (141-292)||(24153164-24153315)
chr3 (124-288)||(23274705-23274871)
chr3 (141-299)||(11424718-11424873)
chr3 (205-292)||(17737247-17737337)
chr3 (126-287)||(52523666-52523831)
chr3 (181-300)||(32307683-32307802)
chr3 (126-225)||(2051138-2051238)
chr3 (124-187)||(17248224-17248287)
chr3 (124-288)||(37642202-37642368)
chr3 (185-299)||(15470931-15471046)
chr3 (126-299)||(16097335-16097509)
chr3 (126-299)||(16103787-16103960)
chr3 (192-299)||(12174265-12174373)
chr3 (135-232)||(22147474-22147571)
chr3 (178-292)||(46822279-46822394)
chr3 (178-291)||(30029855-30029968)
chr3 (192-299)||(13210333-13210441)
chr3 (201-299)||(49668091-49668190)
chr3 (100-140)||(54520985-54521025)
chr3 (100-138)||(29544801-29544839)
chr3 (124-287)||(37251105-37251270)
chr3 (250-292)||(45577947-45577989)
chr3 (192-292)||(12511071-12511172)
chr3 (201-299)||(9512927-9513026)
chr3 (201-299)||(9520902-9521001)
chr3 (245-292)||(28194704-28194752)
chr3 (192-292)||(14234501-14234602)
chr3 (100-133)||(12305315-12305348)
chr3 (248-279)||(3389999-3390030)
chr3 (245-279)||(14665424-14665458)
chr3 (245-279)||(23077537-23077571)
chr3 (248-297)||(15482665-15482714)
chr3 (253-297)||(8489530-8489574)
chr3 (253-297)||(12339469-12339513)
chr3 (245-285)||(13919350-13919390)
chr3 (253-297)||(15464868-15464912)
chr3 (248-292)||(15878114-15878158)
chr3 (100-140)||(15977696-15977736)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (102-292)||(501095-501285)
scaffold0001 (124-292)||(85562-85731)
scaffold0001 (192-299)||(160691-160798)
scaffold0001 (253-297)||(173294-173338)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (100-292)||(12208-12400)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (100-292)||(9253-9445)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (100-292)||(20758-20950)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (100-292)||(37832-38024)
[»] chr7 (84 HSPs)
chr7 (100-292)||(456332-456524)
chr7 (100-292)||(11393246-11393438)
chr7 (100-292)||(15376672-15376864)
chr7 (100-292)||(16232531-16232723)
chr7 (100-292)||(20385082-20385274)
chr7 (100-292)||(21189554-21189746)
chr7 (100-292)||(32125502-32125694)
chr7 (100-292)||(41522928-41523120)
chr7 (100-292)||(41525390-41525582)
chr7 (100-292)||(11972507-11972699)
chr7 (100-292)||(14949081-14949273)
chr7 (100-292)||(18640283-18640475)
chr7 (100-292)||(24702249-24702441)
chr7 (100-292)||(27216871-27217063)
chr7 (100-292)||(16213695-16213887)
chr7 (100-292)||(16410070-16410262)
chr7 (100-292)||(18430723-18430915)
chr7 (100-292)||(24704699-24704888)
chr7 (124-292)||(44116520-44116688)
chr7 (111-287)||(13647344-13647521)
chr7 (125-292)||(3386344-3386511)
chr7 (154-292)||(24275182-24275320)
chr7 (100-292)||(13869357-13869551)
chr7 (124-292)||(17061898-17062066)
chr7 (100-248)||(26355942-26356090)
chr7 (100-248)||(26358394-26358542)
chr7 (124-287)||(12756654-12756817)
chr7 (126-292)||(20110567-20110723)
chr7 (124-292)||(38898359-38898528)
chr7 (141-299)||(3564319-3564478)
chr7 (184-292)||(48273403-48273512)
chr7 (177-292)||(13831384-13831499)
chr7 (141-299)||(12698838-12698998)
chr7 (135-290)||(26212012-26212168)
chr7 (141-299)||(9509196-9509355)
chr7 (141-299)||(38227488-38227646)
chr7 (141-292)||(18456368-18456519)
chr7 (124-291)||(2280056-2280225)
chr7 (111-210)||(15081919-15082019)
chr7 (192-290)||(10589055-10589154)
chr7 (185-291)||(15144037-15144143)
chr7 (145-299)||(18005653-18005806)
chr7 (124-288)||(19486681-19486847)
chr7 (184-292)||(67759-67868)
chr7 (100-158)||(13841157-13841215)
chr7 (185-292)||(22072927-22073036)
chr7 (197-299)||(811142-811245)
chr7 (124-288)||(10063760-10063921)
chr7 (194-299)||(44014185-44014291)
chr7 (126-284)||(12255730-12255892)
chr7 (207-299)||(16386268-16386362)
chr7 (156-287)||(40443410-40443541)
chr7 (100-141)||(11303409-11303450)
chr7 (185-291)||(16056343-16056449)
chr7 (192-299)||(34200793-34200901)
chr7 (135-219)||(15113031-15113114)
chr7 (100-152)||(18627717-18627769)
chr7 (124-287)||(16495421-16495581)
chr7 (192-299)||(16219723-16219831)
chr7 (201-292)||(14932749-14932841)
chr7 (135-219)||(15116568-15116651)
chr7 (201-292)||(15356184-15356276)
chr7 (201-292)||(15360298-15360390)
chr7 (100-140)||(16108648-16108688)
chr7 (100-140)||(23664912-23664952)
chr7 (209-299)||(28505321-28505412)
chr7 (100-140)||(29796771-29796811)
chr7 (100-140)||(29800590-29800630)
chr7 (253-292)||(47831821-47831860)
chr7 (100-140)||(14270021-14270061)
chr7 (124-225)||(20220127-20220225)
chr7 (245-288)||(18154901-18154944)
chr7 (245-279)||(9446218-9446252)
chr7 (253-299)||(11996095-11996141)
chr7 (124-225)||(15008436-15008536)
chr7 (253-299)||(15754955-15755001)
chr7 (245-279)||(20569656-20569690)
chr7 (248-297)||(13635524-13635573)
chr7 (208-279)||(15211484-15211557)
chr7 (253-297)||(1859144-1859188)
chr7 (100-140)||(8468803-8468843)
chr7 (253-297)||(13918838-13918882)
chr7 (248-292)||(19649552-19649596)
chr7 (253-297)||(25927561-25927605)
[»] chr5 (69 HSPs)
chr5 (100-292)||(264727-264919)
chr5 (100-292)||(42245324-42245516)
chr5 (100-292)||(39363395-39363587)
chr5 (100-292)||(10732899-10733091)
chr5 (100-292)||(20909023-20909215)
chr5 (100-292)||(29345991-29346183)
chr5 (100-292)||(32027404-32027596)
chr5 (100-292)||(29348464-29348656)
chr5 (100-292)||(29350937-29351129)
chr5 (100-292)||(39245147-39245339)
chr5 (100-292)||(29329945-29330134)
chr5 (124-291)||(20901991-20902159)
chr5 (100-292)||(20917911-20918099)
chr5 (124-292)||(36154766-36154931)
chr5 (126-292)||(11581184-11581350)
chr5 (124-292)||(2154596-2154765)
chr5 (129-292)||(18319021-18319185)
chr5 (124-292)||(31061079-31061248)
chr5 (100-292)||(38619445-38619639)
chr5 (124-292)||(10775659-10775827)
chr5 (102-292)||(23064522-23064714)
chr5 (129-292)||(24067118-24067282)
chr5 (141-299)||(23390451-23390610)
chr5 (141-300)||(1096473-1096633)
chr5 (141-299)||(9077959-9078118)
chr5 (141-299)||(25421539-25421698)
chr5 (141-299)||(21729019-21729178)
chr5 (141-299)||(21808344-21808503)
chr5 (181-299)||(24529227-24529346)
chr5 (141-286)||(25431414-25431560)
chr5 (199-299)||(21997547-21997648)
chr5 (141-299)||(8286797-8286957)
chr5 (141-299)||(24493576-24493734)
chr5 (141-299)||(13025318-13025476)
chr5 (141-299)||(13095502-13095660)
chr5 (141-290)||(22075035-22075185)
chr5 (161-292)||(22412198-22412329)
chr5 (141-287)||(22144068-22144215)
chr5 (126-299)||(21565549-21565723)
chr5 (161-248)||(20766095-20766181)
chr5 (124-225)||(40725935-40726037)
chr5 (192-299)||(22959538-22959646)
chr5 (192-287)||(20026945-20027043)
chr5 (208-292)||(18418594-18418678)
chr5 (207-287)||(21292992-21293071)
chr5 (158-300)||(37723909-37724050)
chr5 (128-287)||(22178161-22178323)
chr5 (178-292)||(17517193-17517308)
chr5 (100-140)||(9776521-9776561)
chr5 (245-292)||(21329556-21329604)
chr5 (245-299)||(19660894-19660949)
chr5 (253-299)||(19668905-19668951)
chr5 (197-292)||(21502167-21502263)
chr5 (207-279)||(21873277-21873350)
chr5 (248-297)||(23535642-23535691)
chr5 (244-292)||(20806845-20806893)
chr5 (185-291)||(26012034-26012141)
chr5 (248-279)||(26680605-26680636)
chr5 (248-279)||(26952212-26952243)
chr5 (245-287)||(36314596-36314639)
chr5 (245-287)||(26740705-26740747)
chr5 (245-290)||(26732892-26732937)
chr5 (253-297)||(18355960-18356004)
chr5 (135-231)||(18356389-18356485)
chr5 (253-297)||(20911229-20911273)
chr5 (248-288)||(26704089-26704129)
chr5 (254-297)||(26742806-26742850)
chr5 (248-288)||(26973822-26973862)
chr5 (100-140)||(37804862-37804902)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (100-292)||(13958-14150)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (100-292)||(13403-13595)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (100-292)||(136691-136883)
scaffold0028 (100-292)||(139160-139352)
scaffold0028 (100-292)||(144098-144290)
scaffold0028 (100-292)||(134222-134414)
scaffold0028 (100-292)||(141629-141821)
scaffold0028 (181-299)||(132665-132784)
scaffold0028 (202-299)||(62205-62303)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (111-292)||(82083-82264)
scaffold0037 (126-291)||(22610-22776)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (124-292)||(158433-158601)
scaffold0003 (141-291)||(339905-340053)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (104-292)||(40411-40599)
scaffold0044 (253-297)||(12906-12950)
scaffold0044 (253-297)||(19190-19234)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (111-292)||(117-298)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (124-292)||(16795-16963)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (124-292)||(4308-4476)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (111-292)||(12075-12250)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (124-289)||(29946-30111)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (124-292)||(9760-9929)
scaffold0145 (141-299)||(32949-33107)
scaffold0145 (141-299)||(38768-38926)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (124-287)||(79267-79430)
scaffold0056 (141-299)||(17170-17331)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (124-292)||(4225-4393)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (124-287)||(20363-20524)
scaffold0031 (141-292)||(128765-128916)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (111-292)||(1250-1432)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (124-292)||(2111-2280)
scaffold0247 (124-288)||(17964-18130)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (124-290)||(161072-161239)
scaffold0007 (124-224)||(164573-164674)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (141-292)||(22897-23048)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (100-292)||(38615-38809)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (141-299)||(3106-3264)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (141-299)||(13218-13377)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (141-299)||(26020-26179)
scaffold0122 (161-292)||(44682-44814)
[»] scaffold0228 (4 HSPs)
scaffold0228 (141-294)||(4520-4673)
scaffold0228 (141-294)||(12102-12255)
scaffold0228 (141-294)||(22054-22207)
scaffold0228 (248-297)||(18687-18736)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (135-299)||(51920-52085)
scaffold0011 (156-299)||(167948-168092)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (141-299)||(16555-16714)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (141-299)||(1858-2017)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (141-294)||(39489-39642)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (141-294)||(75170-75323)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (141-299)||(3141-3300)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (156-299)||(1018-1162)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (141-299)||(4856-5015)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (141-299)||(3477-3636)
scaffold0292 (141-288)||(361-508)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (161-292)||(116441-116571)
scaffold0022 (124-287)||(128907-129072)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (141-299)||(32913-33070)
scaffold0120 (141-299)||(45935-46092)
scaffold0120 (142-299)||(16120-16278)
scaffold0120 (244-299)||(17388-17443)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (141-294)||(25908-26061)
scaffold0026 (141-299)||(39865-40023)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (126-299)||(8472-8643)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (141-288)||(24257-24406)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (141-299)||(6076-6238)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (192-299)||(28421-28529)
scaffold0046 (192-299)||(11299-11407)
scaffold0046 (253-299)||(2004-2050)
scaffold0046 (253-299)||(4559-4605)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (126-291)||(8481-8650)
scaffold0621 (145-299)||(6542-6695)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (141-242)||(3485-3586)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (192-299)||(8486-8594)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (124-291)||(27686-27855)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (146-219)||(13092-13165)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (156-287)||(1971-2103)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (124-287)||(53486-53651)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (124-288)||(11482-11648)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (124-287)||(13147-13313)
scaffold0357 (124-291)||(16037-16206)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (124-288)||(38193-38359)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (141-299)||(39920-40078)
scaffold0080 (186-287)||(19883-19987)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (126-254)||(13144-13274)
scaffold0175 (250-294)||(285-329)
scaffold0175 (192-299)||(34130-34238)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (124-232)||(225482-225590)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (100-180)||(6070-6150)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (216-299)||(4719-4803)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (141-299)||(10381-10537)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (124-287)||(12587-12751)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (145-297)||(129914-130066)
scaffold0010 (124-287)||(60652-60818)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (207-299)||(11464-11557)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (156-299)||(32074-32216)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (145-299)||(19271-19424)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (158-287)||(174785-174913)
scaffold0021 (245-299)||(121773-121827)
scaffold0021 (141-217)||(124675-124751)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (207-290)||(13513-13596)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (141-299)||(15420-15577)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (126-296)||(10481-10652)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (124-197)||(12039-12112)
scaffold0503 (227-287)||(11982-12042)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (124-287)||(6220-6386)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (141-226)||(27911-27996)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (185-299)||(2805-2920)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (126-299)||(45732-45906)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (185-299)||(14696-14811)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (124-225)||(7996-8098)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (245-299)||(4893-4947)
scaffold0395 (141-230)||(918-1006)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (156-285)||(4545-4675)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (145-295)||(5654-5803)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (141-288)||(20928-21077)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (145-299)||(136-290)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (192-292)||(15675-15776)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (253-299)||(2713-2759)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (205-287)||(1051-1134)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (100-140)||(3186-3226)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (181-299)||(32105-32224)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (124-291)||(25121-25289)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (185-291)||(32551-32657)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (192-287)||(16301-16395)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (124-287)||(1011-1171)
scaffold0184 (245-279)||(4286-4320)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (156-242)||(6675-6761)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (124-225)||(97089-97190)
scaffold0006 (124-225)||(106367-106468)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (197-292)||(6134-6230)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (254-299)||(28839-28884)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (192-299)||(12946-13054)
scaffold0138 (125-214)||(18176-18265)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (100-140)||(1591-1631)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (201-299)||(23898-23997)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (253-292)||(1096-1135)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (185-232)||(8090-8137)
scaffold0556 (192-296)||(6822-6927)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (253-292)||(1102-1141)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (253-292)||(6625-6664)
scaffold0333 (253-292)||(14005-14044)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (192-287)||(1308-1402)
scaffold0106 (245-292)||(15298-15345)
scaffold0106 (192-287)||(7285-7379)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (192-287)||(51601-51695)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (253-292)||(15845-15884)
scaffold0020 (248-288)||(178912-178952)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (253-295)||(12777-12819)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (192-291)||(8078-8180)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (248-292)||(23853-23897)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (185-291)||(10542-10649)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (253-297)||(228432-228476)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (141-283)||(38339-38483)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (253-292)||(36464-36503)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (253-287)||(5196-5230)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (245-279)||(7330-7364)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (245-279)||(5003-5037)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (208-279)||(192997-193070)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (253-297)||(2732-2776)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (248-292)||(69804-69848)


Alignment Details
Target: scaffold0029 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11491 - 11299
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11491 tgatgttttaagatgttgattaccatttgattttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 11392  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11391 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgat 11299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 16413275 - 16413467
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16413275 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 16413374  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16413375 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16413467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 14409403 - 14409595
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14409403 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 14409502  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14409503 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14409595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1484605 - 1484413
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1484605 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 1484506  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1484505 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1484413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 5853251 - 5853443
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5853251 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 5853350  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5853351 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 5853443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20403430 - 20403238
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20403430 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 20403331  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20403330 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20403238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22001956 - 22001764
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22001956 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 22001857  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22001856 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22001764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 15203190 - 15203382
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15203190 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 15203289  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15203290 cttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgat 15203382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 20046154 - 20046346
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20046154 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttga 20046253  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20046254 cttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20046346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4483483 - 4483292
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4483483 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 4483384  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4483383 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4483292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 4542332 - 4542524
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4542332 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttga 4542431  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4542432 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4542524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 105 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19896466 - 19896276
Alignment:
Q  105 ttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgc 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896466 ttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgc 19896367  T
Q  205 atttgatatta---ttatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19896366 atttgatattattattatgtcatgctgtttttgtataccgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19896276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 41598367 - 41598199
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598367 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 41598268  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41598267 tgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41598199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14823976 - 14823785
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14823976 tgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 14823877  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||    
T  14823876 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgat 14823785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 45290653 - 45290846
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  45290653 tgatgttttaagatgttgattattatttgacgttgttatactgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattg 45290752  T
Q  199 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45290753 gcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45290846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15070763 - 15070571
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-tt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||  || || |||||||||||||||||||| ||    
T  15070763 tgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattcagatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgatt 15070664  T
Q  198 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15070663 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 126 - 287
Target Start/End: Original strand, 19801367 - 19801527
Alignment:
Q  126 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 225  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19801367 ttgatgttgttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatg 19801466  T
Q  226 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19801467 ctg-ttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 111 - 292
Target Start/End: Original strand, 19936975 - 19937157
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19936975 gatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataactgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttg 19937074  T
Q  210 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19937075 atcttattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 19937157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 26224098 - 26223930
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224098 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 26223999  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||    
T  26223998 tgctatttttgtatattgctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgat 26223930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 111 - 292
Target Start/End: Original strand, 25484245 - 25484419
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25484245 gatgttgattatgatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25484344  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  25484345 tattattatgtcatgctgtttttgtatac-------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgat 25484419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 16092297 - 16092456
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092297 tgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16092396  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16092397 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 16092456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6759421 - 6759265
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| ||  ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6759421 tgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgaga---tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 6759325  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6759324 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 6759265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 126 - 299
Target Start/End: Original strand, 18818348 - 18818523
Alignment:
Q  126 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18818348 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcat 18818447  T
Q  225 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18818448 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 18818523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 153 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7372932 - 7372785
Alignment:
Q  153 atatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgct 251  Q
    ||||| ||||||||||||  |||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7372932 atataagcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 7372833  T
Q  252 gttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7372832 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 7372785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20536374 - 20536215
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536374 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20536275  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20536274 gcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 20536215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 28648999 - 28649158
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||| ||   || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28648999 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 28649098  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28649099 gcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 28649158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26219858 - 26219721
Alignment:
Q  161 attacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 260  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26219858 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatact-attttgtatactgctgtgtcgctgttgttatt 26219760  T
Q  261 taactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26219759 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattatgatg 26219721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 299
Target Start/End: Original strand, 21918969 - 21919114
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcat-atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgt 253  Q
    |||||||||||||||  || || |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21918969 tatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt 21919068  T
Q  254 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21919069 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 21919114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22875230 - 22875072
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22875230 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 22875132  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22875131 gcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatg 22875072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 140 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23406548 - 23406386
Alignment:
Q  140 ttgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgtt--gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 237  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23406548 ttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtat 23406449  T
Q  238 actgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23406448 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23406386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 158 - 299
Target Start/End: Original strand, 21923900 - 21924042
Alignment:
Q  158 tgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgt 256  Q
    |||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  21923900 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgt 21923999  T
Q  257 tatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21924000 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 21924042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22626901 - 22626743
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22626901 tgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 22626803  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22626802 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 22626743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 185 - 292
Target Start/End: Original strand, 26225292 - 26225398
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 284  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26225292 ttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 26225390  T
Q  285 aagttgat 292  Q
    ||||||||    
T  26225391 aagttgat 26225398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 24486003 - 24486093
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgaga 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24486003 tgatgttctaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 288
Target Start/End: Original strand, 13508022 - 13508188
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  13508022 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 13508121  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    ||| || || || ||| || || |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13508122 atgatg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13508188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 288
Target Start/End: Original strand, 13597554 - 13597720
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  13597554 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 13597653  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    ||| || ||||| || |||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13597654 atgatg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 18879191 - 18879345
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||    
T  18879191 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatact 18879285  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18879286 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 18879345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20498746 - 20498581
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  20498746 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 20498647  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||  ||||  |||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20498646 atgct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 32810134 - 32810054
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtga 180  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  32810134 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 32810054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 156 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31971407 - 31971264
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 254  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  31971407 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgtt 31971309  T
Q  255 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31971308 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 31971264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 288
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612213
Alignment:
Q  135 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 234  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| || |||||    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 17612157  T
Q  235 tatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
     |||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17612158 catactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 17612213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 207 - 287
Target Start/End: Original strand, 45131019 - 45131098
Alignment:
Q  207 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45131019 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45131098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 292
Target Start/End: Original strand, 18678094 - 18678209
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18678094 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 18678193  T
Q  277 gtcggtctaagttgat 292  Q
    ||| ||||||||||||    
T  18678194 gtcagtctaagttgat 18678209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23648682 - 23648567
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    |||||| || ||| |||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23648682 tgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatga 23648583  T
Q  277 gtcggtctaagttgat 292  Q
    ||| ||||||||||||    
T  23648582 gtcagtctaagttgat 23648567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 292
Target Start/End: Original strand, 38855212 - 38855358
Alignment:
Q  145 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 243  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  38855212 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 38855308  T
Q  244 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38855309 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38855358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21285719 - 21285611
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21285719 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggt 21285621  T
Q  283 ctaagttgat 292  Q
    ||||||||||    
T  21285620 ctaagttgat 21285611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 37116532 - 37116366
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  37116532 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37116434  T
Q  223 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||  ||| |||| | ||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37116433 atgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 32121861 - 32121746
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32121861 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 32121762  T
Q  277 gtcggtctaagttgat 292  Q
    |||  |||||||||||    
T  32121761 gtcattctaagttgat 32121746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6520483 - 6520382
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6520483 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 6520385  T
Q  290 gat 292  Q
    |||    
T  6520384 gat 6520382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 287
Target Start/End: Original strand, 16199666 - 16199746
Alignment:
Q  207 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  | |||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16199666 ttgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16199746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21673826 - 21673712
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| | ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  21673826 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggt 21673728  T
Q  283 ctaagttgatgatgat 298  Q
    ||||||||||||||||    
T  21673727 ctaagttgatgatgat 21673712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Original strand, 23760903 - 23760958
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23760903 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatg 23760958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 291
Target Start/End: Original strand, 983410 - 983512
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt-tttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||   || |||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  983410 gttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 983509  T
Q  289 tga 291  Q
    |||    
T  983510 tga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 299
Target Start/End: Original strand, 26355766 - 26355812
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355766 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 26355812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 287
Target Start/End: Original strand, 5866280 - 5866376
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5866280 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5866376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17141019 - 17140923
Alignment:
Q  204 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  || | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17141019 cattcgatattattatgtcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 17140923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21491110 - 21491002
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21491110 gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21491012  T
Q  290 gatgatgatg 299  Q
    | ||| ||||    
T  21491011 gttgaagatg 21491002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 287
Target Start/End: Original strand, 21389458 - 21389552
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21389458 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21389552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 287
Target Start/End: Original strand, 21395988 - 21396082
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21395988 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21396082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 287
Target Start/End: Original strand, 21778784 - 21778878
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21778784 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21778878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 287
Target Start/End: Original strand, 21790481 - 21790575
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21790481 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21790575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Original strand, 17266930 - 17267031
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  17266930 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 17267028  T
Q  223 atg 225  Q
    |||    
T  17267029 atg 17267031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 225
Target Start/End: Original strand, 17439461 - 17439544
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 225  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  17439461 tgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 17439544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249391
Alignment:
Q  256 ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 21249391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255229
Alignment:
Q  256 ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 21255229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Original strand, 14398167 - 14398211
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  14398167 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 14398211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21383700 - 21383656
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  21383700 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 21383656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21387120 - 21387076
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  21387120 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 21387076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Original strand, 35026855 - 35026895
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  35026855 tgatgttttaagatgttgattatcgtttgatattgttatat 35026895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 71)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 34963576 - 34963384
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34963576 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 34963477  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963476 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 34963384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 30676669 - 30676861
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30676669 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 30676768  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30676769 cttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 30676861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12742520 - 12742328
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12742520 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 12742421  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12742420 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12742328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19005249 - 19005057
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19005249 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 19005150  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19005149 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19005057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22782430 - 22782238
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22782430 tgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttga 22782331  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22782330 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22782238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24422750 - 24422558
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24422750 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 24422651  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24422650 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24422558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 33861997 - 33861805
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33861997 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 33861898  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33861897 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 33861805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 33864481 - 33864289
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33864481 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 33864382  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33864381 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 33864289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 8055232 - 8055040
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8055232 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 8055133  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8055132 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 8055040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 18334551 - 18334743
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18334551 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 18334650  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18334651 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18334743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 19858878 - 19859070
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19858878 tgatgttttaagatgttgattgttatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 19858977  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19858978 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19859070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 2291139 - 2291331
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2291139 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 2291238  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2291239 cttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 2291331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 26924599 - 26924791
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26924599 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 26924698  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26924699 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26924791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 101 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25656831 - 25656640
Alignment:
Q  101 gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  25656831 gatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaac 25656732  T
Q  201 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25656731 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25656640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 111 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25755001 - 25754820
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25755001 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25754902  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25754901 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25754820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 1540870 - 1541062
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1540870 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 1540969  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1540970 cttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgat 1541062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25688705 - 25688513
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25688705 tgatgttttaagatgttgattaccatttggtgttgttatattgtgatatgattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 25688606  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25688605 cttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgat 25688513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1595752 - 1595560
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1595752 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 1595653  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1595652 attgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 1595560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18456898 - 18456735
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 18456799  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18456798 tgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 111 - 292
Target Start/End: Original strand, 20556864 - 20557043
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20556864 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa--attgagacgttgttgacttgcatttga 20556961  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20556962 tattattatgccatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 20557043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 129 - 292
Target Start/End: Original strand, 16448514 - 16448678
Alignment:
Q  129 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448514 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 16448613  T
Q  228 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16448614 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 16448678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 125 - 292
Target Start/End: Original strand, 3852001 - 3852168
Alignment:
Q  125 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3852001 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcat 3852100  T
Q  225 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3852101 gctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3852168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 154 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18462028 - 18461895
Alignment:
Q  154 tatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 253  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18462028 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgt 18461929  T
Q  254 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18461928 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 25629310 - 25629469
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25629310 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatact 25629409  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25629410 gcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 25629469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 144 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29060703 - 29060547
Alignment:
Q  144 gatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 242  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  29060703 gatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc 29060604  T
Q  243 tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29060603 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatg 29060547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 18409782 - 18409941
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||| ||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18409782 tgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatact 18409881  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18409882 gcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 18409941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 141 - 294
Target Start/End: Original strand, 20360915 - 20361069
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20360915 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgct 20361014  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 294  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20361015 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatga 20361069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 181 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20593899 - 20593780
Alignment:
Q  181 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||    
T  20593899 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattc 20593800  T
Q  280 ggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  20593799 ggtctaagttgatgaagatg 20593780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16496410 - 16496251
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16496410 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 16496311  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16496310 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 16496251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 25644487 - 25644335
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  25644487 tgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatact 25644388  T
Q  241 g-ctgtgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    | || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25644387 gcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 158 - 292
Target Start/End: Original strand, 17287768 - 17287903
Alignment:
Q  158 tgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgt 256  Q
    |||||||||||||  |||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||    
T  17287768 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgt 17287867  T
Q  257 tatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17287868 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17287903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 181 - 299
Target Start/End: Original strand, 19303536 - 19303654
Alignment:
Q  181 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac-tgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19303536 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 19303634  T
Q  280 ggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||| |||||| ||||    
T  19303635 ggtctaagatgatgaagatg 19303654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Original strand, 19847932 - 19848102
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtg-aataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||| || |||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||     
T  19847932 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtg 19848031  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
     |||||||  ||||  ||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19848032 ttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 19848102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 194 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076707
Alignment:
Q  194 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T
Q  293 gatgatg 299  Q
    || ||||    
T  20076713 gaagatg 20076707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 287
Target Start/End: Original strand, 18821801 - 18821946
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 239  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||   ||  ||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18821801 tgtgatataatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcgtt-gatattgttatggcatgctgtttttgtatac 18821898  T
Q  240 tgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18821899 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 126 - 299
Target Start/End: Original strand, 22780166 - 22780341
Alignment:
Q  126 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |   |||||||||||||  |||  |||||| || ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22780166 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaa 22780265  T
Q  225 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||||| || || ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22780266 gctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 22780341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 299
Target Start/End: Original strand, 20638253 - 20638397
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 254  Q
    |||||||||||||||  || | |||||| |  ||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  20638253 tatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt 20638352  T
Q  255 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20638353 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatg 20638397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109153
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataat--tatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |     
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatt 20109223  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20109222 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20109153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 300
Target Start/End: Original strand, 8227448 - 8227626
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  8227448 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 8227547  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgt 300  Q
    ||| || ||||| |||||| ||  ||||||| |  |||  |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  8227548 atgatg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgt 8227626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714431
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25714431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 12942404 - 12942363
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12942404 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 12942363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19652316 - 19652202
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19652316 ttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggt 19652219  T
Q  283 ctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||||||||    
T  19652218 ctaagttgatgatgatg 19652202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23019528 - 23019425
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||| |||||  ||||||||| ||||| |||||||    
T  23019528 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggt 23019430  T
Q  283 ctaag 287  Q
    |||||    
T  23019429 ctaag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23992540 - 23992441
Alignment:
Q  194 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23992540 tgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgat 23992441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 291
Target Start/End: Original strand, 9098518 - 9098620
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||   | ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9098518 gttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 9098617  T
Q  289 tga 291  Q
    |||    
T  9098618 tga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 279
Target Start/End: Original strand, 15041542 - 15041644
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    |||||| || ||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| || || | || ||||||||||||||||||||||||    
T  15041542 tgaatacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatga 15041641  T
Q  277 gtc 279  Q
    |||    
T  15041642 gtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35245749 - 35245605
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  35245749 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 35245654  T
Q  241 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    || | ||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35245653 gcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35245605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19668488 - 19668386
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||  || |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19668488 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T
Q  288 ttga 291  Q
    ||||    
T  19668389 ttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 292
Target Start/End: Original strand, 27333277 - 27333325
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27333277 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 27333325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 292
Target Start/End: Original strand, 27394017 - 27394065
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27394017 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 27394065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 289
Target Start/End: Original strand, 28496477 - 28496575
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28496477 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 289
Target Start/End: Original strand, 29808888 - 29808986
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29808888 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 299
Target Start/End: Original strand, 31155465 - 31155511
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  31155465 ttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatg 31155511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 15875509 - 15875469
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15875509 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 15875469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Original strand, 28289294 - 28289334
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28289294 tgatgttttaagatgttaattaccatttgatgtcgttatat 28289334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 253 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 11185558 - 11185515
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatg 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  11185558 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgatg 11185515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 279
Target Start/End: Original strand, 19790842 - 19790873
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19790842 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 19790873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561310
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatg 1561310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21766752 - 21766718
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21766752 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 21766718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 297
Target Start/End: Original strand, 4185880 - 4185933
Alignment:
Q  245 tgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4185880 tgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatgatga 4185933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 22831565 - 22831524
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22831565 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Original strand, 5616874 - 5616918
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  5616874 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 5616918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18914030 - 18913994
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18914030 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18913994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18937288 - 18937252
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18937288 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18937252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19863032 - 19862988
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19863032 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgat 19862988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19873174 - 19873130
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19873174 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgat 19873130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23414692 - 23414648
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  23414692 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 23414648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Original strand, 25603406 - 25603478
Alignment:
Q  208 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||  |||| | || ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25603406 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25603478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Original strand, 25611744 - 25611816
Alignment:
Q  208 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||  |||| | || ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25611744 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25611816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27556450 - 27556406
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  27556450 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 27556406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33443108 - 33443068
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 285  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  33443108 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 68)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 32214880 - 32215072
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32214880 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 32214979  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32214980 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32215072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 18809146 - 18808954
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18809146 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 18809047  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18809046 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18808954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 23709491 - 23709683
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23709491 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 23709590  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23709591 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23709683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 23711972 - 23712164
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23711972 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 23712071  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23712072 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23712164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 39682516 - 39682324
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39682516 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 39682417  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39682416 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39682324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 571600 - 571408
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  571600 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttga 571501  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  571500 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 571408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6726198 - 6726006
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6726198 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 6726099  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6726098 cttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6726006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 21155019 - 21155211
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21155019 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 21155118  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21155119 cttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21155211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23131065 - 23130873
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23131065 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 23130966  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23130965 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23130873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23133532 - 23133340
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23133532 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 23133433  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23133432 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23133340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24367977 - 24367785
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24367977 tgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 24367878  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24367877 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24367785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 26505582 - 26505390
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26505582 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 26505483  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26505482 cttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26505390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 26508060 - 26507868
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26508060 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 26507961  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26507960 cttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26507868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 34402481 - 34402673
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34402481 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 34402580  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34402581 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 34402673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23135793 - 23135601
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23135793 tgatgttttaagatgctgattatcatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 23135694  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23135693 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23135601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 32039457 - 32039649
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32039457 tgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 32039556  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  32039557 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgat 32039649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 24898154 - 24898347
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24898154 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 24898253  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24898254 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24898347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 24900637 - 24900830
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24900637 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 24900736  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24900737 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24900830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 24903114 - 24903307
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24903114 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 24903213  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24903214 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24903307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 24905591 - 24905784
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24905591 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 24905690  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24905691 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24905784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 24908066 - 24908259
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24908066 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 24908165  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24908166 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24908259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28577302 - 28577110
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  28577302 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgg 28577203  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28577202 cttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgttgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28577110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22105616 - 22105423
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22105616 tgatgttttaagatgttgattataatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttga 22105517  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22105516 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22105423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 45029813 - 45030005
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45029813 tgatgttttaagatgatgattattatttcatgttgttatattgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 45029912  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45029913 cttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45030005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 125 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 43137477 - 43137310
Alignment:
Q  125 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137477 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 43137378  T
Q  225 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43137377 gttgtttttgtatattactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 43137310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Original strand, 24529511 - 24529680
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24529511 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtc 24529610  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24529611 atgctgtttttgtatactgatgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgat 24529680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38967577 - 38967385
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttg 198  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  38967577 tgatgtcttaagatgttgattattatttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattg 38967479  T
Q  199 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38967478 acttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatattgttgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22337281 - 22337122
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22337281 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatataca 22337182  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22337181 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 22337122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Original strand, 24642826 - 24642933
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642826 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 24642925  T
Q  211 tattatta 218  Q
    ||||||||    
T  24642926 tattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23060679 - 23060520
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23060679 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23060580  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23060579 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23060520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23076608 - 23076449
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076608 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23076509  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23076508 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatg 23076449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 22731189 - 22731348
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22731189 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22731288  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22731289 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatg 22731348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671848
Alignment:
Q  126 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  19672010 ttgatgttgttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-attgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatg 19671912  T
Q  226 ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
     || ||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19671911 atg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 19671848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 141 - 292
Target Start/End: Original strand, 22738135 - 22738286
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22738135 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22738234  T
Q  241 gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||    ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22738235 gcctatttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22738286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23286027 - 23285872
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||  | || |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  23286027 tgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatact 23285932  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23285931 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23285872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23660188 - 23660030
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| | ||   |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  23660188 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttc-gtatact 23660090  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23660089 gcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23660030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 141 - 292
Target Start/End: Original strand, 298769 - 298922
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  298769 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 298868  T
Q  241 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  298869 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 298922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28406099 - 28405983
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28406099 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 28406000  T
Q  283 ctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||||||||    
T  28405999 ctaagttgatgatgatg 28405983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 23654341 - 23654500
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| | |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  23654341 tgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgct 23654440  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23654441 gcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 23654500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 207 - 299
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38228
Alignment:
Q  207 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 38228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Original strand, 23708558 - 23708725
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| || | ||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  23708558 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcat 23708657  T
Q  225 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    | || ||||| |||||| || ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23708658 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga 23708725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 292
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643101
Alignment:
Q  225 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24643101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 180
Target Start/End: Original strand, 22173799 - 22173868
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtga 180  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22173799 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 22173868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 287
Target Start/End: Original strand, 7688 - 7835
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||    
T  7688 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 7786  T
Q  241 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    | || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  7787 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 287
Target Start/End: Original strand, 23103389 - 23103497
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23103389 tgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatga 23103486  T
Q  277 gtcggtctaag 287  Q
    |||||||||||    
T  23103487 gtcggtctaag 23103497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Original strand, 23040249 - 23040303
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23040249 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23040303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25176010 - 25175857
Alignment:
Q  145 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 243  Q
    |||||||||||||| | |||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  25176010 atataattatatatacgttatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 25175914  T
Q  244 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  25175913 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatg 25175857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20309257 - 20309127
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 254  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||| ||    
T  20309257 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctatt 20309161  T
Q  255 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20309160 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20309127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25616314 - 25616199
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25616314 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatga 25616215  T
Q  277 gtcggtctaagttgat 292  Q
    ||| ||||||||||||    
T  25616214 gtcagtctaagttgat 25616199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946664
Alignment:
Q  230 ttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 8946664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 20261422 - 20261381
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20261422 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 20261381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 211
Target Start/End: Original strand, 22459511 - 22459587
Alignment:
Q  135 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgat 211  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  22459511 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgat 22459587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 29601518 - 29601478
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29601518 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 29601478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Original strand, 22134266 - 22134320
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22134266 tgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatg 22134320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23791458 - 23791357
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| | |||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  23791458 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatat-aatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatc 23791360  T
Q  223 atg 225  Q
    |||    
T  23791359 atg 23791357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 20520130 - 20520295
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| || ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  20520130 atttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 20520227  T
Q  223 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||  ||| |||| | |||||| | |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20520228 atgaactg-ttttatgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23207461 - 23207296
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| || | | |||  |||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  23207461 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttat-aatg-ttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatc 23207364  T
Q  223 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||  |||||||  |||||||| | |||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23207363 atgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Original strand, 10684724 - 10684764
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10684724 tgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 10684764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 178 - 287
Target Start/End: Original strand, 32451920 - 32452031
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcat 274  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| || |||| | |||||||||| | | |||||| ||| |||||    
T  32451920 tgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcat 32452018  T
Q  275 gagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||||||    
T  32452019 gagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 291
Target Start/End: Original strand, 18786971 - 18787009
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18786971 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 7679647 - 7679599
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7679647 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 7679599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24869934 - 24869903
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24869934 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 24869903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 279
Target Start/End: Original strand, 25961597 - 25961628
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25961597 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 25961628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 279
Target Start/End: Original strand, 24655398 - 24655432
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24655398 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 24655432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Original strand, 24697543 - 24697644
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||  ||| ||||   |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  24697543 attttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagt-ttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatc 24697641  T
Q  223 atg 225  Q
    |||    
T  24697642 atg 24697644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 299
Target Start/End: Original strand, 23072019 - 23072063
Alignment:
Q  255 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  23072019 gttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatg 23072063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 23287424 - 23287384
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 285  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23287424 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26392443 - 26392403
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 285  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26392443 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 103 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4894 - 4705
Alignment:
Q  103 tgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgactt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4894 tgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 4795  T
Q  203 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4794 gcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 10976 - 10784
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10976 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttga 10877  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10876 cttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 10784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 17399 - 17591
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17399 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatactgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 17498  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17499 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 94614 - 94422
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  94614 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 94515  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  94514 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 94422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 144 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44465
Alignment:
Q  144 gatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgc 242  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt 44515  T
Q  243 tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44514 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 100534 - 100381
Alignment:
Q  145 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 243  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  ||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  100534 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcct 100438  T
Q  244 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100437 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 100381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Original strand, 40135 - 40288
Alignment:
Q  145 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 243  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |  |||||| |    
T  40135 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcct 40231  T
Q  244 gtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
     ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40232 atgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatg 40288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 119937 - 119882
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  119937 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 119882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 101552 - 101506
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  101552 ttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatg 101506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 70)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 3515210 - 3515018
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3515210 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 3515111  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3515110 cttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3515018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 19618131 - 19618323
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19618131 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttga 19618230  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19618231 cttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19618323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 18215233 - 18215425
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18215233 tgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 18215332  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18215333 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18215425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 14970666 - 14970858
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14970666 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 14970765  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14970766 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 14970858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 15118311 - 15118503
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15118311 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 15118410  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15118411 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15118503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 52312713 - 52312521
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52312713 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 52312614  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52312613 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 52312521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 12266 - 12458
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12266 tgatgttttaagatgttgattattattggatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 12365  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12366 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19242903 - 19242710
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19242903 tgatgttttaagatgttgattaccatttggagttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttg 19242804  T
Q  199 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19242803 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19242710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 44615491 - 44615299
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44615491 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 44615392  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44615391 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44615299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 44773046 - 44773238
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  44773046 tgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttga 44773145  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44773146 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44773238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 15355283 - 15355476
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15355283 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattg 15355382  T
Q  199 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15355383 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15355476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 1837468 - 1837660
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1837468 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 1837567  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1837568 cttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1837660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 18239378 - 18239570
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18239378 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 18239477  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18239478 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18239570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 50222298 - 50222490
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50222298 tgatgttttaagatgttgattattatttgatattgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 50222397  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50222398 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 50222490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 111 - 292
Target Start/End: Original strand, 51463838 - 51464019
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51463838 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 51463937  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51463938 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 51464019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 111 - 292
Target Start/End: Original strand, 23803235 - 23803416
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23803235 gatgttgattatgattttatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttga 23803334  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23803335 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23803416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 44102393 - 44102225
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44102393 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 44102294  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44102293 tgctgtttttgtatactactgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44102225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 111 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12611135 - 12610961
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12611135 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 12611036  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12611035 tattattatgtcatgctgtttttgt-------tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12610961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 21815568 - 21815731
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21815568 atttgatgttgttatattatgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtca 21815667  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21815668 tgctgtttttgtatacagttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 135 - 292
Target Start/End: Original strand, 44928873 - 44929031
Alignment:
Q  135 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44928873 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttg 44928972  T
Q  235 tatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44928973 tatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44929031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 7641151 - 7641333
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7641151 tgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttga 7641250  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7641251 cttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt----------tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 7641333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 124 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15367873 - 15367708
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15367873 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15367774  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15367773 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15367708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 124 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15402886 - 15402721
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15402886 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15402787  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15402786 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15402721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 124 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15371385 - 15371220
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15371385 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15371286  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15371285 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15371220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 124 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15373666 - 15373501
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15373666 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15373567  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15373566 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15373501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 124 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15370200 - 15370036
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15370200 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15370102  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15370101 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15370036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 129 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20150004 - 20149840
Alignment:
Q  129 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20150004 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 20149905  T
Q  228 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20149904 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgat 20149840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 127 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16223712 - 16223550
Alignment:
Q  127 tgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16223712 tgatgttgttatattgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatg 16223613  T
Q  226 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16223612 ctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 16223550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7089043 - 7088884
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7089043 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7088944  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7088943 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 7088884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 126 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7798956 - 7798781
Alignment:
Q  126 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7798956 ttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcat 7798857  T
Q  225 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7798856 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 7798781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14038814 - 14038655
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14038814 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatact 14038715  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14038714 gcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 14038655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 185 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14280434 - 14280327
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 284  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14280434 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 14280335  T
Q  285 aagttgat 292  Q
    ||||||||    
T  14280334 aagttgat 14280327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 294
Target Start/End: Original strand, 16377478 - 16377630
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16377478 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatact 16377575  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 294  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16377576 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 16377630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 161 - 292
Target Start/End: Original strand, 54798729 - 54798861
Alignment:
Q  161 attacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttat 259  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54798729 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttat 54798828  T
Q  260 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54798829 tcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 54798861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12902923 - 12902764
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902923 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12902824  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12902823 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 12902764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22636601 - 22636442
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22636601 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22636502  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22636501 gtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 22636442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22354010 - 22353852
Alignment:
Q  130 tgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||| |||    
T  22354010 tgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgt 22353911  T
Q  230 ttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |  |  |  ||| || || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22353910 tgctacaatctgcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaag 22353852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 194 - 299
Target Start/End: Original strand, 52873375 - 52873481
Alignment:
Q  194 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52873375 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 52873474  T
Q  293 gatgatg 299  Q
    || ||||    
T  52873475 gaagatg 52873481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7893869 - 7893710
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893869 tgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7893770  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7893769 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatg 7893710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 16270191 - 16270349
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16270191 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 16270289  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16270290 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatg 16270349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44052995 - 44052836
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052995 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44052896  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  44052895 gcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatg 44052836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 143 - 299
Target Start/End: Original strand, 16239927 - 16240083
Alignment:
Q  143 tgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg- 241  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| ||  |||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  16239927 tgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgc 16240025  T
Q  242 ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    || | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16240026 ctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatg 16240083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6900056 - 6899898
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||    
T  6900056 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-gtatact 6899958  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6899957 gcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 6899898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 13788 - 13953
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  13788 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 13887  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13888 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 185 - 289
Target Start/End: Original strand, 8574868 - 8574971
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 284  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8574868 ttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 8574966  T
Q  285 aagtt 289  Q
    |||||    
T  8574967 aagtt 8574971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 141 - 300
Target Start/End: Original strand, 23374314 - 23374474
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  23374314 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 23374413  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgt 300  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  23374414 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatgt 23374474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 124 - 291
Target Start/End: Original strand, 52243131 - 52243302
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||    
T  52243131 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatc 52243230  T
Q  223 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    |||  |||  |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52243231 atgaactg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198661
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcat 43198591  T
Q  225 g-ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    |  |  ||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43198592 gaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 221 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096300
Alignment:
Q  221 tcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 3096300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12774132 - 12774014
Alignment:
Q  181 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 278  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12774132 ataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 12774035  T
Q  279 cggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12774034 cggtctaagttgatgatgatg 12774014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 232
Target Start/End: Original strand, 15464888 - 15464977
Alignment:
Q  143 tgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 232  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  15464888 tgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 15464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15534384 - 15534343
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534384 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 15534343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 291
Target Start/End: Original strand, 12288214 - 12288316
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12288214 gttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12288312  T
Q  288 ttga 291  Q
    ||||    
T  12288313 ttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 14048780 - 14048740
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14048780 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 14048740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 36038073 - 36038033
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36038073 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 36038033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 287
Target Start/End: Original strand, 14053323 - 14053403
Alignment:
Q  207 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || || || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14053323 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 14053403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 292
Target Start/End: Original strand, 39706299 - 39706395
Alignment:
Q  197 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39706299 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39706395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Original strand, 49547733 - 49547773
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49547733 tgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatat 49547773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8846418 - 8846363
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  8846418 tgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatg 8846363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15551879 - 15551824
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15551879 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 15551824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 6190563 - 6190481
Alignment:
Q  207 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| || |||| | |||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6190563 ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 46640393 - 46640558
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||    |||||| ||| |||| || ||||||||||| |||| ||    
T  46640393 atttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg--ttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatc 46640490  T
Q  223 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||  |||||||  ||||||| || |||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46640491 atgaactgtttta-tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Original strand, 15497030 - 15497070
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15497030 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 15497070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19857647 - 19857607
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19857647 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 19857607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17046549 - 17046506
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17046549 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17046506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 139
Target Start/End: Original strand, 52873137 - 52873176
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 139  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  52873137 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 52873176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 279
Target Start/End: Original strand, 11250621 - 11250655
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11250621 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 11250655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 279
Target Start/End: Original strand, 15353367 - 15353401
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15353367 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 15353401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18236938 - 18236894
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  18236938 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 18236894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Original strand, 43256471 - 43256515
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  43256471 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 43256515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 50)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21840970 - 21840778
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21840970 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttga 21840871  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21840870 cttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21840778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 23593693 - 23593886
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23593693 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttg 23593792  T
Q  199 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23593793 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23593886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13989069 - 13988877
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13989069 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 13988970  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13988969 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13988877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 21923250 - 21923442
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21923250 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 21923349  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21923350 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21923442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 21475046 - 21475238
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21475046 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 21475145  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21475146 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 21475238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 29776891 - 29776699
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29776891 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 29776792  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29776791 cttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29776699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16362121 - 16361928
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16362121 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttg 16362022  T
Q  199 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16362021 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16361928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 29298339 - 29298148
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29298339 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 29298240  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29298239 cttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29298148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 31612516 - 31612324
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31612516 tgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttga 31612417  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31612416 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 31612324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 288
Target Start/End: Original strand, 22123026 - 22123215
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  22123026 tgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttga 22123125  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22123126 cttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22123215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 16275322 - 16275515
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttg 198  Q
    |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  16275322 tgatgtttcaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattg 16275421  T
Q  199 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16275422 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgat 16275515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 111 - 287
Target Start/End: Original strand, 45574812 - 45574989
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45574812 gatgttgattatgatttgatgttcttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttgg 45574911  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45574912 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Original strand, 13212844 - 13213013
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13212844 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 13212943  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13212944 atgttgtttttgtatactgttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13213013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 15859967 - 15860160
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttg 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| || ||||| ||||| |||||||| |||    
T  15859967 tgatgtcttaagatgttgattaccatctgatgttgttatattgtgatataattgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattaagacgttgattg 15860066  T
Q  199 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15860067 acttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 15860160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21347141 - 21346972
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21347141 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21347042  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21347041 atgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21346972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21342276 - 21342107
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21342276 atttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21342177  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21342176 atgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21342107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21707346 - 21707178
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21707346 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21707247  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21707246 tgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21707178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21711888 - 21711720
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21711888 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21711789  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21711788 tgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21711720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 129 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 40389329 - 40389165
Alignment:
Q  129 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40389329 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 40389230  T
Q  228 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  40389229 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgat 40389165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 433190 - 433023
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433190 atttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 433091  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
     || ||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  433090 ttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 433023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 50210168 - 50210327
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50210168 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50210267  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50210268 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 50210327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 27250684 - 27250843
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250684 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27250783  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  27250784 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 27250843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 181 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34509906 - 34509787
Alignment:
Q  181 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34509906 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 34509807  T
Q  280 ggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  34509806 ggtctaagttgatgaagatg 34509787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22532435 - 22532276
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||   |||||| || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532435 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22532336  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22532335 gcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatg 22532276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 21896193 - 21896358
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  21896193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 21896292  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21896293 atgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 141 - 292
Target Start/End: Original strand, 22468651 - 22468803
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttga-atcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 239  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  |    
T  22468651 tgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattat-tgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatc 22468749  T
Q  240 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22468750 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 22468803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21026846 - 21026687
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  21026846 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatact 21026747  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    || | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21026746 gcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatg 21026687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 287
Target Start/End: Original strand, 21861510 - 21861672
Alignment:
Q  127 tgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 225  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21861510 tgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 21861609  T
Q  226 ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    ||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21861610 ctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16758822 - 16758664
Alignment:
Q  135 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttt 232  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||| || |||||||  ||| |||||||||| |||| |||||  ||| |||    
T  16758822 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatg-ttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactggttt 16758724  T
Q  233 tgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
     | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16758723 -gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33681188 - 33681014
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || |||||| ||||  |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  33681188 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcat 33681090  T
Q  225 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33681089 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgaagatgatg 33681014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 35261018 - 35261180
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  35261018 atttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatc 35261114  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35261115 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 299
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847268
Alignment:
Q  205 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 20847268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21754170 - 21754051
Alignment:
Q  181 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 278  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21754170 ataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 21754073  T
Q  279 cggtctaagttgatgatgatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21754072 cggtctaagttgatgatgatgt 21754051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20135316 - 20135201
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    |||||| || ||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||| | || |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  20135316 tgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatga 20135217  T
Q  277 gtcggtctaagttgat 292  Q
    ||| ||||||||||||    
T  20135216 gtcagtctaagttgat 20135201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20248394 - 20248286
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20248394 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 20248296  T
Q  290 gatgatgatg 299  Q
    ||||||||||    
T  20248295 gatgatgatg 20248286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 299
Target Start/End: Original strand, 22921868 - 22921983
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22921868 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 22921966  T
Q  283 ctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||| |||||||||||    
T  22921967 ctaagatgatgatgatg 22921983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 292
Target Start/End: Original strand, 20454613 - 20454660
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20454613 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20454660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22237788 - 22237634
Alignment:
Q  145 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 243  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| |    
T  22237788 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcct 22237691  T
Q  244 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
     ||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22237690 atgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgaagatgatg 22237634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 41049973 - 41050138
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  41049973 atttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatg--ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 41050070  T
Q  223 atgctgt-ttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||   | |||| ||||||| || |||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41050071 atgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 286
Target Start/End: Original strand, 14295493 - 14295652
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| | |  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  14295493 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 14295588  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 286  Q
    || || ||| | ||||| | | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14295589 tgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14295652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21161792 - 21161723
Alignment:
Q  231 tttgtatactgctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||| |||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21161792 tttgcatactgttttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatg 21161723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 230
Target Start/End: Original strand, 22354527 - 22354616
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 230  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22354527 tgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20918719 - 20918620
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20918719 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20918621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 296
Target Start/End: Original strand, 52928038 - 52928081
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatg 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  52928038 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatg 52928081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21714600 - 21714556
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21714600 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21714556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 43543254 - 43543214
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43543254 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 43543214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50686792 - 50686695
Alignment:
Q  128 gatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 225  Q
    |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||    
T  50686792 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatg 50686695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 297
Target Start/End: Original strand, 36819364 - 36819413
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  36819364 tgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagttgatgatga 36819413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12271725 - 12271642
Alignment:
Q  135 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 219  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||| | | ||| || |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12271725 ttataatgtgatataattgtatatatattactttagttatacgtaaata-ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 12271642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33797329 - 33797285
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  33797329 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 33797285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 89)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12567763 - 12567571
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12567763 tgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 12567664  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12567663 cttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12567571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13544228 - 13544036
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13544228 tgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 13544129  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13544128 cttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13544036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 9707566 - 9707758
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9707566 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 9707665  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9707666 cttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 9707758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 16454240 - 16454432
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16454240 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 16454339  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454340 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 16454432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 17463381 - 17463189
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17463381 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 17463282  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17463281 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17463189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 45606866 - 45607058
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45606866 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 45606965  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45606966 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45607058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 7781306 - 7781498
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7781306 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 7781405  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7781406 tttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 7781498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 8899297 - 8899105
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8899297 tgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 8899198  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8899197 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgat 8899105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 34159529 - 34159337
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34159529 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 34159430  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34159429 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 34159337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 38961850 - 38962042
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38961850 tgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 38961949  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38961950 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38962042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 55476694 - 55476502
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55476694 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 55476595  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55476594 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 55476502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 6469093 - 6469285
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6469093 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttga 6469192  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6469193 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6469285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 10247682 - 10247874
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10247682 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 10247781  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10247782 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 10247874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 16282770 - 16282962
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16282770 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 16282869  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16282870 cttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16282962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 17446614 - 17446805
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17446614 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttga 17446713  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17446714 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgat 17446805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 28848570 - 28848762
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28848570 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 28848669  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28848670 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28848762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 13151749 - 13151942
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13151749 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 13151848  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13151849 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13151942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 13154214 - 13154407
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13154214 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 13154313  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13154314 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13154407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 41124090 - 41123901
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41124090 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 41123991  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41123990 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41123901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 111 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 50243014 - 50242833
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50243014 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 50242915  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50242914 tattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 50242833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Original strand, 29172565 - 29172734
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172565 atttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 29172664  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29172665 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29172734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 17672805 - 17672637
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17672805 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtca 17672706  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17672705 tgctgtttttgtatactgctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17672637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 53070636 - 53070799
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53070636 atttgatgttgttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtct 53070735  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53070736 tgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 8499723 - 8499529
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-tt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||  || || |||||||||||||||| ||| ||    
T  8499723 tgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacattgatt 8499624  T
Q  198 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8499623 gacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 8499529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 104 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15412630 - 15412440
Alignment:
Q  104 gttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgact 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||  || || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15412630 gttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgact 15412531  T
Q  202 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15412530 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15412440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Original strand, 12119707 - 12119876
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12119707 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 12119806  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12119807 atgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12119876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 111 - 287
Target Start/End: Original strand, 43550448 - 43550625
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550448 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 43550547  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43550548 tattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 173 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15977645 - 15977526
Alignment:
Q  173 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15977645 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgc 15977546  T
Q  273 atgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15977545 atgagtcggtctaagttgat 15977526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14973020 - 14972861
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||   || |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14973020 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14972921  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14972920 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 14972861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 192 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 55501053 - 55500953
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55501053 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 55500954  T
Q  292 t 292  Q
    |    
T  55500953 t 55500953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17488022 - 17487863
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488022 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17487923  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17487922 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 17487863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17499504 - 17499345
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499504 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17499405  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17499404 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 17499345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27165455 - 27165261
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||  ||| ||    
T  27165455 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatg 27165356  T
Q  199 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| |||||| || | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27165355 acttgcatttgatattggtatatcatgttg-ttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 27165261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 292
Target Start/End: Original strand, 40213676 - 40213827
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| || ||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40213676 tgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatact 40213775  T
Q  241 gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  40213776 gctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 40213827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 125 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 42386593 - 42386428
Alignment:
Q  125 tttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42386593 tttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtca 42386494  T
Q  224 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42386493 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 53301463 - 53301658
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgt-t 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | | ||||||||| |||| |||||| ||||||  |||  |    
T  53301463 tgatgttttaagatgttgattaccattttatgttgtttatattgtgatataattgtatacgtaatacttgaattatatatgaatatttgagatattgaat 53301562  T
Q  198 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53301563 gacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgat 53301658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 14576788 - 14576946
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14576788 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatact 14576886  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14576887 gtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgatgttgatg 14576946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 25476340 - 25476499
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476340 tgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25476439  T
Q  241 -gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
      |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25476440 acctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 25476499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166609
Alignment:
Q  161 attacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 260  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatt 36166641  T
Q  261 taactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36166640 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 36166609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 43841114 - 43840944
Alignment:
Q  126 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43841114 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 43841015  T
Q  225 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 294  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  43841014 gctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatga 43840944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13442440 - 13442281
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13442440 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 13442341  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13442340 gcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 13442281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21618590 - 21618460
Alignment:
Q  161 attacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 260  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21618590 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatt 21618492  T
Q  261 taactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21618491 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26687069 - 26686902
Alignment:
Q  126 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||   ||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26687069 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 26686970  T
Q  225 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26686969 gctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26686902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12399360 - 12399216
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 254  Q
    ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  12399360 tatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt 12399261  T
Q  255 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12399260 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 12399216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18438649 - 18438541
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18438649 gttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 18438550  T
Q  291 atgatgatg 299  Q
    |||| ||||    
T  18438549 atgaagatg 18438541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 299
Target Start/End: Original strand, 20698405 - 20698549
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 254  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20698405 tatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 20698504  T
Q  255 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20698505 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 20698549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 23083316 - 23083475
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| |||  | |  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23083316 tgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatact 23083415  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23083416 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23083475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 200 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 10557088 - 10556996
Alignment:
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10557088 cttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctgatgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 10556996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 204 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494820
Alignment:
Q  204 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgat 44494820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 178 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14572717 - 14572595
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    |||||| || ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14572717 tgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 14572619  T
Q  277 gtcggtctaagttgatgatgatgt 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  14572618 gtcggtctaagttgatgttgatgt 14572595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 288
Target Start/End: Original strand, 24340660 - 24340826
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  24340660 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 24340759  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    ||| || || || ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  24340760 atgatg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 24340826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 141 - 292
Target Start/End: Original strand, 24153164 - 24153315
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||| |||||  |||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24153164 tgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 24153262  T
Q  241 -gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
      || ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24153263 acctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24153315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23274871 - 23274705
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  23274871 atttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 23274772  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23274771 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 11424718 - 11424873
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||||||||||   |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11424718 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga---tgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatact 11424813  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11424814 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 11424873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 205 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737247
Alignment:
Q  205 atttgatattattatgtcatgctgtttttgta---tactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17737247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 287
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523831
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 52523765  T
Q  225 g--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |  ||| ||||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52523766 gaactg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 32307802 - 32307683
Alignment:
Q  181 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 278  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32307802 ataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 32307705  T
Q  279 cggtctaagttgatgatgatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32307704 cggtctaagttgatgatgatgt 32307683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 225
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051238
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 2051237  T
Q  225 g 225  Q
    |    
T  2051238 g 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 187
Target Start/End: Original strand, 17248224 - 17248287
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17248224 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaataattg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 288
Target Start/End: Original strand, 37642202 - 37642368
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  37642202 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 37642301  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    ||| |||||| | ||||||| | |||||||| |  |||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37642302 atgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 37642368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15471046 - 15470931
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15471046 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggt 15470948  T
Q  283 ctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||||||| |||||||    
T  15470947 ctaagttgaagatgatg 15470931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16097509 - 16097335
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| | ||    
T  16097509 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgat 16097411  T
Q  225 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || ||| | ||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097410 gatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 16097335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16103960 - 16103787
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||  ||||| || | ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  16103960 ttgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcat 16103863  T
Q  225 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103862 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 16103787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Original strand, 12174265 - 12174373
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||  ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12174265 gttgttgttttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12174363  T
Q  290 gatgatgatg 299  Q
    ||||||||||    
T  12174364 gatgatgatg 12174373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 232
Target Start/End: Original strand, 22147474 - 22147571
Alignment:
Q  135 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 232  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  22147474 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt 22147571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 46822394 - 46822279
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46822394 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 46822295  T
Q  277 gtcggtctaagttgat 292  Q
    ||| ||||||||||||    
T  46822294 gtcagtctaagttgat 46822279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 30029968 - 30029855
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| || || |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  30029968 tgaatatttaagacgttgt-gaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 30029870  T
Q  277 gtcggtctaagttga 291  Q
    ||| |||||||||||    
T  30029869 gtcagtctaagttga 30029855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Original strand, 13210333 - 13210441
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13210333 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13210431  T
Q  290 gatgatgatg 299  Q
    | ||| ||||    
T  13210432 gttgaagatg 13210441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 299
Target Start/End: Original strand, 49668091 - 49668190
Alignment:
Q  201 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgat 298  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49668091 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgat 49668189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 54521025 - 54520985
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54521025 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 54520985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 138
Target Start/End: Original strand, 29544801 - 29544839
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29544801 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 29544839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 37251105 - 37251270
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| || | |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  37251105 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatg--ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37251202  T
Q  223 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||  ||| |||| ||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  37251203 atgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 292
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45577989
Alignment:
Q  250 ctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45577989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12511172 - 12511071
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 290  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12511172 gttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttg 12511073  T
Q  291 at 292  Q
    ||    
T  12511072 at 12511071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9513026 - 9512927
Alignment:
Q  201 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgat 298  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9513026 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgat 9512928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9521001 - 9520902
Alignment:
Q  201 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgat 298  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9521001 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgat 9520903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28194752 - 28194704
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28194752 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28194704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14234602 - 14234501
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  14234602 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagtt 14234504  T
Q  290 gat 292  Q
    |||    
T  14234503 gat 14234501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 12305348 - 12305315
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305348 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 12305315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 279
Target Start/End: Original strand, 3389999 - 3390030
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3389999 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 3390030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 14665458 - 14665424
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14665458 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 14665424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 279
Target Start/End: Original strand, 23077537 - 23077571
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23077537 tgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtc 23077571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15482714 - 15482665
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  15482714 tgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagttgatgatga 15482665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Original strand, 8489530 - 8489574
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  8489530 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 8489574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12339513 - 12339469
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  12339513 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 12339469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 13919390 - 13919350
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 285  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13919390 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15464912 - 15464868
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  15464912 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 15464868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 292
Target Start/End: Original strand, 15878114 - 15878158
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15878114 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgat 15878158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 15977736 - 15977696
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  15977736 tgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatat 15977696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 102 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 501285 - 501095
Alignment:
Q  102 atgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgact 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  501285 atgttttaagatgttgattactatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgact 501186  T
Q  202 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  501185 tgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 501095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Original strand, 85562 - 85731
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  85562 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 85661  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  85662 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 85731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 160798 - 160691
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  160798 gttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 160701  T
Q  290 gatgatgatg 299  Q
    ||||||||||    
T  160700 gatgatgatg 160691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 173338 - 173294
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  173338 ttgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagttgatgatga 173294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 12208 - 12400
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  12208 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttga 12307  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12308 cttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgat 12400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 9445 - 9253
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9445 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttga 9346  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9345 cttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 9253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20950 - 20758
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20950 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 20851  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20850 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38024 - 37832
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38024 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 37925  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37924 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 37832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 84)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 456524 - 456332
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  456524 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 456425  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  456424 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 456332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 11393246 - 11393438
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11393246 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 11393345  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11393346 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 11393438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 15376672 - 15376864
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15376672 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 15376771  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15376772 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15376864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16232723 - 16232531
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16232723 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 16232624  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16232623 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16232531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 20385082 - 20385274
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20385082 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 20385181  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20385182 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20385274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 21189554 - 21189746
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21189554 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 21189653  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21189654 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21189746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 32125694 - 32125502
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32125694 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 32125595  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32125594 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32125502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 41523120 - 41522928
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41523120 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 41523021  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41523020 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41522928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 41525582 - 41525390
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41525582 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 41525483  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41525482 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41525390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11972699 - 11972507
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11972699 tgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 11972600  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11972599 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 11972507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 14949081 - 14949273
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14949081 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 14949180  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14949181 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14949273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 18640475 - 18640283
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18640475 tgatgttttaagatgttgattattattttatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 18640376  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18640375 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18640283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24702441 - 24702249
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24702441 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 24702342  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24702341 cttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24702249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27217063 - 27216871
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27217063 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 27216964  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27216963 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 27216871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16213887 - 16213695
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16213887 tgatgttttcatatgttgattaccatttgatgttgttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttga 16213788  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16213787 cttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16213695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16410262 - 16410070
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16410262 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactatgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 16410163  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16410162 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16410070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 18430915 - 18430723
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18430915 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttga 18430816  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18430815 cttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18430723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24704888 - 24704699
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24704888 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 24704789  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24704788 cttgcatttgatattattatgtc---ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24704699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 44116688 - 44116520
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116688 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 44116589  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44116588 tgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44116520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 111 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13647521 - 13647344
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647521 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 13647422  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13647421 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 125 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 3386511 - 3386344
Alignment:
Q  125 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3386511 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcat 3386412  T
Q  225 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3386411 gctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3386344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 154 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275182
Alignment:
Q  154 tatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 253  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 24275221  T
Q  254 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24275220 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24275182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13869551 - 13869357
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-tt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||  || || | |||||||||||||||||| ||    
T  13869551 tgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctttgaataattgagacgttgatt 13869452  T
Q  198 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13869451 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13869357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Original strand, 17061898 - 17062066
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17061898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtca 17061997  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17061998 tgct-attttgtatactgctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17062066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 248
Target Start/End: Original strand, 26355942 - 26356090
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26355942 tgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 26356041  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26356042 cttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtt 26356090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 248
Target Start/End: Original strand, 26358394 - 26358542
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26358394 tgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 26358493  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26358494 cttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtt 26358542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 12756654 - 12756817
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12756654 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 12756753  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  12756754 tgttgtttttgtatattgttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 126 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20110723 - 20110567
Alignment:
Q  126 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110723 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 20110624  T
Q  226 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20110623 ctgtttttgtata----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20110567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Original strand, 38898359 - 38898528
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38898359 atttgacgttgttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 38898458  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  38898459 atgctgtttttatatactgctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 38898528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 3564319 - 3564478
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||| ||   || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3564319 tgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 3564418  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3564419 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 3564478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 184 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273403
Alignment:
Q  184 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  48273512 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  283 ctaagttgat 292  Q
    ||||||||||    
T  48273412 ctaagttgat 48273403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 177 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831384
Alignment:
Q  177 gtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 13831400  T
Q  277 gtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||| |||||    
T  13831399 gtcggtctaaattgat 13831384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12698998 - 12698838
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 239  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12698998 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatac 12698899  T
Q  240 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12698898 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 12698838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26212168 - 26212012
Alignment:
Q  135 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 234  Q
    ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26212168 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttg 26212069  T
Q  235 tatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 290  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26212068 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttg 26212012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9509355 - 9509196
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9509355 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatact 9509256  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9509255 gcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 9509196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 38227646 - 38227488
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| |||||  |||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38227646 tgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 38227548  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  38227547 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatg 38227488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 292
Target Start/End: Original strand, 18456368 - 18456519
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18456368 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 18456466  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    | || ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18456467 gcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18456519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 291
Target Start/End: Original strand, 2280056 - 2280225
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  2280056 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatc 2280155  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    |||||| ||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2280156 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 2280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 210
Target Start/End: Original strand, 15081919 - 15082019
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttg 209  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15081919 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttg 15082018  T
Q  210 a 210  Q
    |    
T  15082019 a 15082019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10589154 - 10589055
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 290  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10589154 gttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 185 - 291
Target Start/End: Original strand, 15144037 - 15144143
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 284  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15144037 ttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgagatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 15144136  T
Q  285 aagttga 291  Q
    |||||||    
T  15144137 aagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18005806 - 18005653
Alignment:
Q  145 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg 244  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||||     
T  18005806 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgctt 18005710  T
Q  245 -tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005709 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 18005653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 288
Target Start/End: Original strand, 19486681 - 19486847
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  19486681 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 19486780  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    ||| |||||| | ||||||| | |||||||| |  |||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19486781 atgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 19486847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 67868 - 67759
Alignment:
Q  184 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgg 281  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  67868 attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 67770  T
Q  282 tctaagttgat 292  Q
    |||||||||||    
T  67769 tctaagttgat 67759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13841215 - 13841157
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatat 158  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13841215 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatat 13841157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072927
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| || || ||||| || |||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  283 ctaagttgat 292  Q
    ||||||||||    
T  22072936 ctaagttgat 22072927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Original strand, 811142 - 811245
Alignment:
Q  197 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 294  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  811142 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 811240  T
Q  295 tgatg 299  Q
    |||||    
T  811241 tgatg 811245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 288
Target Start/End: Original strand, 10063760 - 10063921
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||      |||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||| ||    
T  10063760 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgt-----ttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatc 10063854  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    ||| || || || |||| | || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10063855 atgatg-ttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 10063921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44014291 - 44014185
Alignment:
Q  194 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44014291 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 44014193  T
Q  292 tgatgatg 299  Q
    ||||||||    
T  44014192 tgatgatg 44014185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 284
Target Start/End: Original strand, 12255730 - 12255892
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||| || || ||||||||||| |||| ||||    
T  12255730 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcat 12255829  T
Q  225 g-ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 284  Q
    |  |   |||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12255830 gaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 299
Target Start/End: Original strand, 16386268 - 16386362
Alignment:
Q  207 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16386268 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 16386362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 40443541 - 40443410
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 254  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||||    
T  40443541 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcgtatgttgctgtt 40443444  T
Q  255 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40443443 tgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 40443410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 11303450 - 11303409
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303450 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 11303409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 185 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16056449 - 16056343
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||  | ||| || || |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16056449 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggt 16056352  T
Q  283 ctaagttga 291  Q
    |||||||||    
T  16056351 ctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34200901 - 34200793
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34200901 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34200803  T
Q  290 gatgatgatg 299  Q
    | ||| ||||    
T  34200802 gttgaagatg 34200793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15113114 - 15113031
Alignment:
Q  135 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 219  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15113114 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 15113031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18627769 - 18627717
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 152  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18627769 tgatgttttaagatgttgattagtatttgatcttgttatattgtgatataatt 18627717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16495581 - 16495421
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| | |  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  16495581 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 16495486  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    || || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16495485 tgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16495421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Original strand, 16219723 - 16219831
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16219723 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 16219821  T
Q  290 gatgatgatg 299  Q
    || |||||||    
T  16219822 gaagatgatg 16219831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 292
Target Start/End: Original strand, 14932749 - 14932841
Alignment:
Q  201 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || | || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14932749 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgat 14932841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15116651 - 15116568
Alignment:
Q  135 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 219  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  15116651 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcaattgatattgttat 15116568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 292
Target Start/End: Original strand, 15356184 - 15356276
Alignment:
Q  201 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || | || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15356184 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgat 15356276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 292
Target Start/End: Original strand, 15360298 - 15360390
Alignment:
Q  201 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || | || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15360298 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgat 15360390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Original strand, 16108648 - 16108688
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16108648 tgatgttttaagatgttgattaccgtttgatgttgttatat 16108688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Original strand, 23664912 - 23664952
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23664912 tgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 23664952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 299
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505412
Alignment:
Q  209 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatg 28505412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 29796811 - 29796771
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29796811 tgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29796771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 29800630 - 29800590
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29800630 tgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29800590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 47831860 - 47831821
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47831860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 47831821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Original strand, 14270021 - 14270061
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14270021 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 14270061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Original strand, 20220127 - 20220225
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| || ||  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  20220127 atttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatc 20220222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 288
Target Start/End: Original strand, 18154901 - 18154944
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18154901 tgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 18154944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 279
Target Start/End: Original strand, 9446218 - 9446252
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9446218 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 9446252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 299
Target Start/End: Original strand, 11996095 - 11996141
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  11996095 ttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 11996141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Original strand, 15008436 - 15008536
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| || ||  |||||  |||||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  15008436 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgaggtgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 15008533  T
Q  223 atg 225  Q
    |||    
T  15008534 atg 15008536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 299
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755001
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatg 15755001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 279
Target Start/End: Original strand, 20569656 - 20569690
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20569656 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 20569690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 297
Target Start/End: Original strand, 13635524 - 13635573
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  13635524 tgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagttgatgatga 13635573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15211557 - 15211484
Alignment:
Q  208 tgatattattatgtcatgctgtttttgt-atactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||| || |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15211557 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Original strand, 1859144 - 1859188
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  1859144 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 1859188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8468843 - 8468803
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8468843 tgatgttttatgatgttgattattatttgatgttgttatat 8468803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Original strand, 13918838 - 13918882
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  13918838 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 13918882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 292
Target Start/End: Original strand, 19649552 - 19649596
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19649552 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgat 19649596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Original strand, 25927561 - 25927605
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  25927561 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 25927605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 69)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 264727 - 264919
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  264727 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 264826  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  264827 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 264919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 42245324 - 42245516
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42245324 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 42245423  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245424 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 42245516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 39363587 - 39363395
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39363587 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 39363488  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39363487 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39363395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 10732899 - 10733091
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10732899 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatacggtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 10732998  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10732999 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 10733091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20909215 - 20909023
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20909215 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 20909116  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20909115 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20909023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 29346183 - 29345991
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29346183 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 29346084  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  29346083 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 29345991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 32027596 - 32027404
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32027596 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 32027497  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32027496 cttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgat 32027404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 29348656 - 29348464
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29348656 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 29348557  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  29348556 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 29348464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 29351129 - 29350937
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29351129 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 29351030  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  29351029 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 29350937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 39245339 - 39245147
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  39245339 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattga 39245240  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39245239 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39245147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 29330134 - 29329945
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29330134 tgatgttttaagatgattatta---tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 29330038  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29330037 cttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29329945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 124 - 291
Target Start/End: Original strand, 20901991 - 20902159
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20901991 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtc 20902090  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20902091 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20902159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 20917911 - 20918099
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20917911 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgctttacttgaattagatgtgaataattgagacgttgttga 20918010  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20918011 ct----ttttatattattttgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20918099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Original strand, 36154766 - 36154931
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154766 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 36154865  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36154866 tgctgtttttgtatactgctgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 36154931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 126 - 292
Target Start/End: Original strand, 11581184 - 11581350
Alignment:
Q  126 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581184 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 11581283  T
Q  226 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11581284 ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 11581350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Original strand, 2154596 - 2154765
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2154596 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtc 2154695  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2154696 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 2154765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 129 - 292
Target Start/End: Original strand, 18319021 - 18319185
Alignment:
Q  129 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319021 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 18319120  T
Q  228 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18319121 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 18319185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 31061248 - 31061079
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31061248 atttgatgttgttatattgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 31061149  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061148 atgctgtttttgtatactactgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 31061079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38619639 - 38619445
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-tt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| | ||  || || |||||||||||||||||||| ||    
T  38619639 tgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattggaatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgatt 38619540  T
Q  198 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38619539 gacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38619445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Original strand, 10775659 - 10775827
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10775659 atttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 10775757  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10775758 atgctggttttatatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 10775827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23064714 - 23064522
Alignment:
Q  102 atgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttga 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||  || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  23064714 atgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattga 23064615  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23064614 cttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23064522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 129 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24067282 - 24067118
Alignment:
Q  129 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24067282 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 24067183  T
Q  228 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  24067182 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgat 24067118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 23390451 - 23390610
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23390451 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23390550  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23390551 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23390610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 141 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1096633 - 1096473
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||   || |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  1096633 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatact 1096534  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgt 300  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1096533 acctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgt 1096473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9078118 - 9077959
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| | ||   || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9078118 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 9078019  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  9078018 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatg 9077959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25421698 - 25421539
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25421698 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25421599  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25421598 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 25421539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 21729019 - 21729178
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21729019 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21729118  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21729119 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 21729178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 21808344 - 21808503
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21808344 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21808443  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21808444 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 21808503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24529346 - 24529227
Alignment:
Q  181 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24529346 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 24529247  T
Q  280 ggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  24529246 ggtctaagttgatgaagatg 24529227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 141 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25431560 - 25431414
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25431560 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25431461  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 286  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431460 gcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997648
Alignment:
Q  199 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21997646  T
Q  298 tg 299  Q
    ||    
T  21997647 tg 21997648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 8286797 - 8286957
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-gtatac 239  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  || | ||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8286797 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatac 8286896  T
Q  240 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8286897 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 8286957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24493734 - 24493576
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||||||  |||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24493734 tgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 24493636  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24493635 gcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 24493576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13025476 - 13025318
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| |||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  13025476 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatact 13025378  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    || | ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13025377 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 13025318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13095660 - 13095502
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| |||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  13095660 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatact 13095562  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    || | ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13095561 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 13095502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22075185 - 22075035
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22075185 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatact 22075086  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 290  Q
     | | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22075085 tcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttg 22075035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22412329 - 22412198
Alignment:
Q  161 attacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttat 259  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | | |||||    
T  22412329 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttatcgttat 22412231  T
Q  260 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22412230 ttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 22412198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 141 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22144215 - 22144068
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||    
T  22144215 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatact 22144117  T
Q  241 gc-tgtgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
     | | ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22144116 acctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21565723 - 21565549
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || |||| | |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  21565723 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 21565625  T
Q  225 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565624 gatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 21565549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 248
Target Start/End: Original strand, 20766095 - 20766181
Alignment:
Q  161 attacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtt 248  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20766095 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtt 20766181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40726037 - 40725935
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  40726037 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 40725938  T
Q  223 atg 225  Q
    |||    
T  40725937 atg 40725935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Original strand, 22959538 - 22959646
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22959538 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22959636  T
Q  290 gatgatgatg 299  Q
    ||||||||||    
T  22959637 gatgatgatg 22959646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 287
Target Start/End: Original strand, 20026945 - 20027043
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20026945 gttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 18418678 - 18418594
Alignment:
Q  208 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttattt-aactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18418678 tgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgat 18418594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 287
Target Start/End: Original strand, 21292992 - 21293071
Alignment:
Q  207 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21292992 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaag 21293071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37724050 - 37723909
Alignment:
Q  158 tgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgt-tg 255  Q
    |||||||||||||| ||   ||||| ||||||| |||| ||| ||  ||||||||| || |||||||||||||   ||||||||| | ||||||||| ||    
T  37724050 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtctg 37723954  T
Q  256 ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgt 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  37723953 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatgt 37723909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 287
Target Start/End: Original strand, 22178161 - 22178323
Alignment:
Q  128 gatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat-- 224  Q
    |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||      
T  22178161 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatga 22178259  T
Q  225 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22178260 gctg-ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 292
Target Start/End: Original strand, 17517193 - 17517308
Alignment:
Q  178 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 276  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17517193 tgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 17517292  T
Q  277 gtcggtctaagttgat 292  Q
    ||| ||||||||||||    
T  17517293 gtcagtctaagttgat 17517308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 9776561 - 9776521
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9776561 tgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 9776521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 292
Target Start/End: Original strand, 21329556 - 21329604
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21329556 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21329604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Original strand, 19660894 - 19660949
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19660894 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 19660949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19668951 - 19668905
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19668951 ttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatg 19668905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 292
Target Start/End: Original strand, 21502167 - 21502263
Alignment:
Q  197 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||| | |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21502167 tgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21502263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21873350 - 21873277
Alignment:
Q  207 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||||||| | ||||||||| | |||||| |||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21873350 ttgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 297
Target Start/End: Original strand, 23535642 - 23535691
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  23535642 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagttgatgatga 23535691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 292
Target Start/End: Original strand, 20806845 - 20806893
Alignment:
Q  244 gtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20806845 gtgtcgctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgat 20806893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 291
Target Start/End: Original strand, 26012034 - 26012141
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||    
T  26012034 ttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgcttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 26012132  T
Q  283 ctaagttga 291  Q
    |||||||||    
T  26012133 ctaagttga 26012141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26680636 - 26680605
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680636 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26680605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26952243 - 26952212
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26952243 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26952212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36314639 - 36314596
Alignment:
Q  245 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36314639 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 36314596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 287
Target Start/End: Original strand, 26740705 - 26740747
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26740705 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 290
Target Start/End: Original strand, 26732892 - 26732937
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 290  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26732892 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18356004 - 18355960
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  18356004 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 18355960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18356485 - 18356389
Alignment:
Q  135 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 231  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||| |   |||| |||||| |  ||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  18356485 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt 18356389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Original strand, 20911229 - 20911273
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  20911229 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 20911273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 26704129 - 26704089
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26704129 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 26704089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 297
Target Start/End: Original strand, 26742806 - 26742850
Alignment:
Q  254 tgttatttaactaagttgcatgagtc-ggtctaagttgatgatga 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  26742806 tgttatttaactaagttgcatgagtctgaactaagttgatgatga 26742850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 26973862 - 26973822
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26973862 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 26973822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Original strand, 37804862 - 37804902
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  37804862 tgatgttttaagatgttaattagaatttgatgttgttatat 37804902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14150 - 13958
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14150 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 14051  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14050 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13595 - 13403
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13595 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 13496  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13495 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 136883 - 136691
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  136883 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 136784  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  136783 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 136691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 139352 - 139160
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  139352 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 139253  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  139252 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 139160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 144290 - 144098
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  144290 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 144191  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  144190 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 144098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 134414 - 134222
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  134414 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 134315  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  134314 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgat 134222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 141821 - 141629
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  141821 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 141722  T
Q  200 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  141721 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 141629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 132784 - 132665
Alignment:
Q  181 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 278  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| || | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  132784 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagt 132686  T
Q  279 cggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  132685 cggtctaagatgatgatgatg 132665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 62303 - 62205
Alignment:
Q  202 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||| |||||||||||  |||| |||||||  ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  62303 tgcattcgatattattataccatgatgtttttc-atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagtcgaagatgatg 62205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 111 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 82264 - 82083
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  82264 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 82165  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  82164 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgat 82083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Original strand, 22610 - 22776
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22610 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 22708  T
Q  225 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    | || ||| | |||||| || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22709 gatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Original strand, 158433 - 158601
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158433 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 158532  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  158533 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 158601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 141 - 291
Target Start/End: Original strand, 339905 - 340053
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  339905 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 340002  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    || | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  340003 gcctatgttgttgt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 340053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 104 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 40599 - 40411
Alignment:
Q  104 gttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttg 203  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40599 gttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttg 40500  T
Q  204 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  40499 catttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgat 40411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12950 - 12906
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  12950 ttgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagttgatgatga 12906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19234 - 19190
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  19234 ttgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagttgatgatga 19190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 111 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 117
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  298 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 199  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  198 tattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgat 117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16963 - 16795
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 16864  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16863 tgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4476 - 4308
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4476 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtca 4377  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4376 tgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 111 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12250 - 12075
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 210  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 12151  T
Q  211 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12150 tattattatgtcatgctgttttagtatactgctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 124 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 30111 - 29946
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtca 30012  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30011 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 9929 - 9760
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9929 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtc 9830  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9829 attctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 9760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33107 - 32949
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33107 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 33009  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33008 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatg 32949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 38926 - 38768
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38926 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 38828  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  38827 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatg 38768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 79267 - 79430
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  79267 atttgatgttgttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtca 79366  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  79367 tgctgtttttatatactgtcgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 17170 - 17331
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttttgtata 238  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17170 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtata 17269  T
Q  239 ctg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17270 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 17331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4393 - 4225
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4393 atttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 4295  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4294 atgctggttttgtatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 4225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 20363 - 20524
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20363 atttgatgtt-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 20461  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20462 tgttg-ttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 128916 - 128765
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |    
T  128916 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttt 128817  T
Q  241 gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
      | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  128816 tttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgat 128765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 111 - 292
Target Start/End: Original strand, 1250 - 1432
Alignment:
Q  111 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttg 209  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttg 1349  T
Q  210 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1350 atattattatgtcatgctgtttttgtatactcatgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Original strand, 2111 - 2280
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtc 2210  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2211 atgttgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgat 2280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 288
Target Start/End: Original strand, 17964 - 18130
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  17964 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 18063  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    ||| || || || ||| ||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18064 atgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 124 - 290
Target Start/End: Original strand, 161072 - 161239
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  161072 atttgatattgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 161171  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 290  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  161172 attatgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 161239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 224
Target Start/End: Original strand, 164573 - 164674
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  164573 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 164672  T
Q  223 at 224  Q
    ||    
T  164673 at 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 141 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23048 - 22897
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23048 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22949  T
Q  241 gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22948 ggtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 38615 - 38809
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| | |||| ||||||  ||| ||    
T  38615 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatg 38714  T
Q  199 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  38715 acttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgat 38809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 3106 - 3264
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3106 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 3204  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3205 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 3264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13377 - 13218
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13377 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13278  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13277 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 13218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 26020 - 26179
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26020 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26119  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26120 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 161 - 292
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44814
Alignment:
Q  161 attacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttat 259  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  260 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44782 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 44814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4673 - 4520
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4673 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 4574  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4573 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgatga 4520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12255 - 12102
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12255 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 12156  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12155 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgatga 12102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22207 - 22054
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22207 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 22108  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22107 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgatga 22054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 297
Target Start/End: Original strand, 18687 - 18736
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  18687 tgctattgttatttacctaagttgcatgagtctgaataagttgatgatga 18736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 52085 - 51920
Alignment:
Q  135 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 234  Q
    |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52085 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 51986  T
Q  235 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51985 tatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 51920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 299
Target Start/End: Original strand, 167948 - 168092
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 254  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  167948 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt 168047  T
Q  255 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  168048 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 168092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 16555 - 16714
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16555 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 16654  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16655 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatg 16714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2017 - 1858
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2017 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1918  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1917 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 1858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 141 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39642 - 39489
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39642 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 39544  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 294  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39543 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 39489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 141 - 294
Target Start/End: Original strand, 75170 - 75323
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  75170 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 75268  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 294  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  75269 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 75323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 3141 - 3300
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3141 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 3240  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3241 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 3300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 299
Target Start/End: Original strand, 1018 - 1162
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 254  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  1018 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt 1117  T
Q  255 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1118 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 1162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5015 - 4856
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5015 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatact 4916  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4915 gcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 4856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3636 - 3477
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3636 tgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3537  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3536 gcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 3477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 361
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||   ||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  508 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctatttt-gtatact 410  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    || | ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  409 gcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 161 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 116571 - 116441
Alignment:
Q  161 attacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 260  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  116571 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatt 116473  T
Q  261 taactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  116472 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 116441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 128907 - 129072
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||||| ||||| |||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  128907 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 129005  T
Q  223 atg-ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||  |  |||| | ||||| || |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  129006 atgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 32913 - 33070
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| |||  |||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32913 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 33010  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33011 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 33070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 46092 - 45935
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| |||  |||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46092 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 45995  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45994 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 45935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 142 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16278 - 16120
Alignment:
Q  142 gtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 241  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| | ||   || ||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  16278 gtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactg 16179  T
Q  242 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16178 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 16120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 299
Target Start/End: Original strand, 17388 - 17443
Alignment:
Q  244 gtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17388 gtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 17443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26061 - 25908
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||  |||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  26061 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 25963  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 294  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25962 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatga 25908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 40023 - 39865
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||  |||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  40023 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 39925  T
Q  241 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  39924 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatg 39865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 126 - 299
Target Start/End: Original strand, 8472 - 8643
Alignment:
Q  126 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8472 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 8571  T
Q  225 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8572 gctgtttttg-atactgcctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 8643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 288
Target Start/End: Original strand, 24257 - 24406
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 239  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24257 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatac 24356  T
Q  240 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24357 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 6076 - 6238
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6076 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 6175  T
Q  241 gc---tg-tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
     |   || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6176 acctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 6238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28529 - 28421
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 290  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28529 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 28430  T
Q  291 atgatgatg 299  Q
    |||| ||||    
T  28429 atgaagatg 28421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11299
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11407 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11309  T
Q  290 gatgatgatg 299  Q
    | ||| ||||    
T  11308 gttgaagatg 11299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2050 - 2004
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2050 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 2004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4559
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 4559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8481
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataat--tatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 8551  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    |||||| ||||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8550 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6695 - 6542
Alignment:
Q  145 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 243  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  6695 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 6599  T
Q  244 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6598 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 6542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 141 - 242
Target Start/End: Original strand, 3485 - 3586
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3485 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3584  T
Q  241 gc 242  Q
    ||    
T  3585 gc 3586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8594 - 8486
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 290  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  8594 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttg 8495  T
Q  291 atgatgatg 299  Q
    |||| ||||    
T  8494 atgaagatg 8486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 291
Target Start/End: Original strand, 27686 - 27855
Alignment:
Q  124 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||    
T  27686 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 27785  T
Q  223 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    |||||||||| | ||||| | | ||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27786 atgctgtttt-gcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13165 - 13092
Alignment:
Q  146 tataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 219  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13165 tataattatatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1971
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 254  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| || ||| ||||||    
T  2103 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt 2004  T
Q  255 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2003 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 53486 - 53651
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  53486 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 53585  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  53586 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11648 - 11482
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  11648 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 11549  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  11548 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagt 11482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13313 - 13147
Alignment:
Q  124 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaat-aattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgt 221  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||   || ||| |||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  13313 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatat 13214  T
Q  222 catgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    ||||||| ||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13213 catgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 291
Target Start/End: Original strand, 16037 - 16206
Alignment:
Q  124 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||    
T  16037 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 16136  T
Q  223 atgctgtttttgtatact-gctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    ||| || ||||| |||||  || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16137 atgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 288
Target Start/End: Original strand, 38193 - 38359
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  38193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 38292  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  38293 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagt 38359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 40078 - 39920
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||    |||| || ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40078 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 39980  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    || | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  39979 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatg 39920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 287
Target Start/End: Original strand, 19883 - 19987
Alignment:
Q  186 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgg 281  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| |||| ||||||| || |||||||| |||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  19883 tgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcgg 19981  T
Q  282 tctaag 287  Q
    ||||||    
T  19982 tctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13274 - 13144
Alignment:
Q  126 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13274 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 13175  T
Q  225 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 254  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13174 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 250 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 285
Alignment:
Q  250 ctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 294  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatga 285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34238 - 34130
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34238 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 34140  T
Q  290 gatgatgatg 299  Q
    | ||| ||||    
T  34139 gttgaagatg 34130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 225590 - 225482
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  225590 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatc 225492  T
Q  223 atgctgtttt 232  Q
    | ||||||||    
T  225491 acgctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 6150 - 6070
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtga 180  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6150 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatttaattgcatatgcattacttgaattatatgtga 6070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 216 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4719
Alignment:
Q  216 ttatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 4719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 10381 - 10537
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || ||| || ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  10381 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatact 10476  T
Q  241 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || |||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  10477 gcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 10537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12751 - 12587
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| | | || |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  12751 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 12653  T
Q  223 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12652 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 130066 - 129914
Alignment:
Q  145 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 243  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  130066 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 129969  T
Q  244 gtgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  129968 atgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgatga 129914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 60652 - 60818
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatat-tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  60652 atttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattggtatatc 60750  T
Q  223 at--gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    ||  |||| |||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  60751 atgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 299
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11557
Alignment:
Q  207 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  11464 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatg 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32216 - 32074
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 254  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  || |||||| | ||||||||||    
T  32216 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 32119  T
Q  255 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  32118 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 32074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19424 - 19271
Alignment:
Q  145 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 243  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  19424 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 19328  T
Q  244 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19327 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 19271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 174913 - 174785
Alignment:
Q  158 tgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttg 255  Q
    |||||||||||||| ||   ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   |||||||||| || |||||||| |||    
T  174913 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttg 174817  T
Q  256 ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  174816 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 121827 - 121773
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  121827 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 121773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 124751 - 124675
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 217  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || | |||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  124751 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 207 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13596 - 13513
Alignment:
Q  207 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 290  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13596 ttgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 15420 - 15577
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15420 tgtgatataat-atttatgcattacttgaagaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 15517  T
Q  241 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  15518 gcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatg 15577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 296
Target Start/End: Original strand, 10481 - 10652
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  10481 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 10579  T
Q  225 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatg 296  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10580 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgaagatg 10652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12112 - 12039
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgtt 197  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  12112 atttgatactgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgaggcgttgtt 12039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12042 - 11982
Alignment:
Q  227 tgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12042 tgttttggtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 6220 - 6386
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||    
T  6220 atttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatc 6318  T
Q  223 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||  |||||||  |||||||| | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6319 atgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27996 - 27911
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 226  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27996 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 299
Target Start/End: Original strand, 2805 - 2920
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2805 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2903  T
Q  283 ctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||| |||||||||||    
T  2904 ctaagatgatgatgatg 2920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 299
Target Start/End: Original strand, 45732 - 45906
Alignment:
Q  126 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 224  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||| || ||||| || | ||| ||||||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  45732 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttga-taattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcat 45830  T
Q  225 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    | || ||| | ||||||| | | || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45831 gatgattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 45906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 299
Target Start/End: Original strand, 14696 - 14811
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| || |||| | |||||| | |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14696 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggt 14794  T
Q  283 ctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||||||||    
T  14795 ctaagttgatgatgatg 14811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Original strand, 7996 - 8098
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||  || ||| |||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  7996 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatc 8095  T
Q  223 atg 225  Q
    |||    
T  8096 atg 8098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Original strand, 4893 - 4947
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4893 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatg 4947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 230
Target Start/End: Original strand, 918 - 1006
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 230  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||   |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  918 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgca-ttgatattattatgccatgctgtt 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 4675 - 4545
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 254  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||||| ||  |||||||||||| || || ||||| | ||| ||||||| | || || ||||    
T  4675 tatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt 4576  T
Q  255 gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4575 gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5803 - 5654
Alignment:
Q  145 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 243  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||||| |    
T  5803 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcct 5707  T
Q  244 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgat 295  Q
     |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5706 atgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgat 5654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 141 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21077 - 20928
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 240  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||| |  | || ||||||  | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  21077 tgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatatt 20978  T
Q  241 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    | || |||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  20977 gcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagt 20928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 136
Alignment:
Q  145 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 243  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  290 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 193  T
Q  244 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
     ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  192 atgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatg 136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15776 - 15675
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15776 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 15678  T
Q  290 gat 292  Q
    |||    
T  15677 gat 15675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 299
Target Start/End: Original strand, 2713 - 2759
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2713 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 2759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1134 - 1051
Alignment:
Q  205 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1134 atttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 3226 - 3186
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3226 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 3186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32224 - 32105
Alignment:
Q  181 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 278  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  32224 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagt 32126  T
Q  279 cggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  32125 cggtctaagatgatgatgatg 32105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 25289 - 25121
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||| ||||| |||| ||| |  |||||| |||||||| ||||||| |||||  |||| |||    
T  25289 atttgatgttgtaataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatca 25192  T
Q  224 tg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 291  Q
    ||  |||||||  |||||||| | |||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25191 tgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 32657 - 32551
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| | |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||    
T  32657 ttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 32560  T
Q  283 ctaagttga 291  Q
    |||||||||    
T  32559 ctaagttga 32551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16395 - 16301
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16395 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 1011 - 1171
Alignment:
Q  124 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 223  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| | |  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  1011 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 1106  T
Q  224 tgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    || || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1107 tgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 279
Target Start/End: Original strand, 4286 - 4320
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4286 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6761 - 6675
Alignment:
Q  156 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 242  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  6761 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgc 6675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 97190 - 97089
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  97190 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 97092  T
Q  223 atg 225  Q
    |||    
T  97091 atg 97089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 106468 - 106367
Alignment:
Q  124 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 222  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  106468 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 106370  T
Q  223 atg 225  Q
    |||    
T  106369 atg 106367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 292
Target Start/End: Original strand, 6134 - 6230
Alignment:
Q  197 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6134 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 299
Target Start/End: Original strand, 28839 - 28884
Alignment:
Q  254 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 299  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28839 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 28884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13054 - 12946
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  13054 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 12956  T
Q  290 gatgatgatg 299  Q
    || |||||||    
T  12955 gaagatgatg 12946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 214
Target Start/End: Original strand, 18176 - 18265
Alignment:
Q  125 tttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 214  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18176 tttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 18265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 1631 - 1591
Alignment:
Q  100 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 140  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1631 tgattttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 299
Target Start/End: Original strand, 23898 - 23997
Alignment:
Q  201 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgat 298  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23898 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgat 23996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1135 - 1096
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1135 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8137 - 8090
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8137 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 6927 - 6822
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 289  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  6927 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagat 6829  T
Q  290 gatgatg 296  Q
    |||||||    
T  6828 gatgatg 6822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 292
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1141
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1102 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6664 - 6625
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6664 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14044 - 14005
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14044 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1402 - 1308
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1402 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 292
Target Start/End: Original strand, 15298 - 15345
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15298 tgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgat 15345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 7379 - 7285
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7379 gttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 7285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 51695 - 51601
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51695 gttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 292
Target Start/End: Original strand, 15845 - 15884
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15845 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 178952 - 178912
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 288  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  178952 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 178912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12819 - 12777
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgat 295  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12819 ttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgat 12777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 291
Target Start/End: Original strand, 8078 - 8180
Alignment:
Q  192 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||  ||| ||| ||||||||| | |||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8078 gttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8176  T
Q  288 ttga 291  Q
    ||||    
T  8177 ttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23897 - 23853
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23897 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10649 - 10542
Alignment:
Q  185 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 282  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||  ||| |||||||||||||    
T  10649 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggt 10551  T
Q  283 ctaagttga 291  Q
    |||||||||    
T  10550 ctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Original strand, 228432 - 228476
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  228432 ttgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagttgatgatga 228476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 141 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 38483 - 38339
Alignment:
Q  141 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgtttttgtata 238  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| |||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||  |||| |||| ||||    
T  38483 tgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctg-ttttatata 38386  T
Q  239 ctg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 283  Q
    ||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  38385 ctgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 253 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36464
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 36464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 287
Target Start/End: Original strand, 5196 - 5230
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 287  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5196 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 279
Target Start/End: Original strand, 7330 - 7364
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7330 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 279
Target Start/End: Original strand, 5003 - 5037
Alignment:
Q  245 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5003 tgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtc 5037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Original strand, 192997 - 193070
Alignment:
Q  208 tgatattattatgtcatgctgtttttgt-atactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 279  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||| || |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  192997 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 193070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Original strand, 2732 - 2776
Alignment:
Q  253 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  2732 ttgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagttgatgatga 2776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 69848 - 69804
Alignment:
Q  248 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 292  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  69848 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgat 69804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University