View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10233_low_1 (Length: 535)

Name: NF10233_low_1
Description: NF10233
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10233_low_1
NF10233_low_1
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (10-476)||(15069328-15069794)
chr8 (10-476)||(18811469-18811932)
chr8 (10-476)||(27827746-27828209)
chr8 (10-475)||(43080363-43080825)
chr8 (30-420)||(31577457-31577846)
chr8 (14-422)||(34255623-34256032)
chr8 (31-476)||(17848308-17848753)
chr8 (32-422)||(4732318-4732708)
chr8 (14-333)||(5591527-5591846)
chr8 (152-422)||(41366111-41366383)
chr8 (12-209)||(41383416-41383613)
chr8 (21-191)||(21481268-21481438)
chr8 (284-422)||(29542940-29543078)
chr8 (17-182)||(10684832-10684997)
chr8 (17-182)||(35744744-35744909)
chr8 (17-129)||(18853731-18853843)
chr8 (23-182)||(6813047-6813206)
chr8 (267-347)||(4819484-4819564)
chr8 (267-347)||(16756505-16756585)
chr8 (267-347)||(28328764-28328844)
chr8 (17-116)||(26300758-26300857)
chr8 (267-346)||(33033496-33033575)
chr8 (267-333)||(15945514-15945580)
chr8 (267-359)||(18853981-18854073)
chr8 (267-347)||(28891620-28891700)
chr8 (107-192)||(10380449-10380534)
chr8 (267-359)||(26300515-26300607)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (10-476)||(51750743-51751206)
chr1 (10-476)||(27338240-27338706)
chr1 (10-474)||(28841128-28841589)
chr1 (12-476)||(16226876-16227337)
chr1 (10-476)||(28202807-28203272)
chr1 (10-476)||(20300837-20301300)
chr1 (10-476)||(47178068-47178531)
chr1 (10-304)||(51758240-51758534)
chr1 (32-476)||(8348178-8348616)
chr1 (22-476)||(13126844-13127296)
chr1 (14-474)||(3805240-3805707)
chr1 (14-422)||(31657846-31658254)
chr1 (14-422)||(50168468-50168875)
chr1 (14-422)||(28222539-28222947)
chr1 (10-209)||(25250655-25250854)
chr1 (12-197)||(6996292-6996477)
chr1 (14-203)||(50078174-50078363)
chr1 (14-209)||(16429658-16429853)
chr1 (10-209)||(31736850-31737049)
chr1 (10-209)||(29003345-29003544)
chr1 (42-286)||(16456388-16456632)
chr1 (10-203)||(28997635-28997828)
chr1 (10-209)||(31424408-31424595)
chr1 (14-168)||(3157305-3157459)
chr1 (17-182)||(41397593-41397758)
chr1 (318-422)||(776019-776123)
chr1 (16-182)||(17346081-17346247)
chr1 (16-129)||(47099385-47099498)
chr1 (17-116)||(19359406-19359505)
chr1 (28-186)||(33094225-33094383)
chr1 (271-337)||(45654910-45654976)
chr1 (267-347)||(2400469-2400549)
chr1 (267-333)||(14997891-14997957)
chr1 (314-359)||(19359703-19359748)
[»] chr5 (37 HSPs)
chr5 (10-476)||(6745774-6746240)
chr5 (10-476)||(34478529-34478992)
chr5 (10-476)||(18467390-18467856)
chr5 (13-476)||(10750407-10750867)
chr5 (10-476)||(15355959-15356422)
chr5 (10-476)||(23665752-23666215)
chr5 (10-476)||(31543439-31543902)
chr5 (124-476)||(20505313-20505665)
chr5 (14-422)||(29721017-29721425)
chr5 (14-422)||(9788339-9788747)
chr5 (14-422)||(16407977-16408385)
chr5 (14-417)||(40380758-40381161)
chr5 (34-422)||(42427549-42427937)
chr5 (14-417)||(16545079-16545485)
chr5 (14-298)||(26171409-26171693)
chr5 (34-422)||(534421-534788)
chr5 (14-422)||(13694259-13694667)
chr5 (10-194)||(658724-658908)
chr5 (30-194)||(20043710-20043874)
chr5 (10-209)||(27911138-27911337)
chr5 (218-422)||(13486871-13487075)
chr5 (10-186)||(25806167-25806343)
chr5 (42-209)||(18510788-18510955)
chr5 (293-422)||(26173701-26173830)
chr5 (17-182)||(33790669-33790834)
chr5 (17-182)||(37557192-37557357)
chr5 (84-210)||(13294851-13294977)
chr5 (17-177)||(27449181-27449341)
chr5 (16-195)||(31397559-31397738)
chr5 (17-129)||(43598139-43598251)
chr5 (17-129)||(43603631-43603743)
chr5 (17-129)||(43609123-43609235)
chr5 (222-362)||(32584706-32584846)
chr5 (272-347)||(28788583-28788658)
chr5 (28-148)||(34842004-34842124)
chr5 (267-347)||(43596310-43596390)
chr5 (267-347)||(43629104-43629184)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (10-476)||(18098278-18098744)
chr3 (10-476)||(43226762-43227228)
chr3 (10-476)||(4309617-4310083)
chr3 (10-476)||(456592-457055)
chr3 (10-476)||(5192335-5192798)
chr3 (10-476)||(5898094-5898560)
chr3 (10-476)||(10957433-10957896)
chr3 (10-476)||(6064903-6065366)
chr3 (10-476)||(11168786-11169249)
chr3 (13-443)||(7769243-7769673)
chr3 (30-476)||(23634150-23634578)
chr3 (14-421)||(23199257-23199664)
chr3 (14-443)||(27421327-27421755)
chr3 (14-422)||(37407331-37407739)
chr3 (14-421)||(5259441-5259848)
chr3 (35-422)||(29811532-29811919)
chr3 (14-417)||(10209843-10210246)
chr3 (22-422)||(7762921-7763321)
chr3 (14-417)||(4599842-4600245)
chr3 (14-422)||(6717155-6717563)
chr3 (14-417)||(10056887-10057290)
chr3 (14-417)||(10061331-10061734)
chr3 (14-417)||(10063553-10063956)
chr3 (14-417)||(10065775-10066178)
chr3 (14-417)||(10059109-10059512)
chr3 (14-362)||(9635301-9635649)
chr3 (14-446)||(15830335-15830767)
chr3 (34-421)||(32891752-32892138)
chr3 (56-476)||(15821753-15822169)
chr3 (14-333)||(22834215-22834534)
chr3 (10-209)||(3315367-3315566)
chr3 (10-209)||(28101382-28101581)
chr3 (10-209)||(42990984-42991183)
chr3 (21-209)||(43422844-43423030)
chr3 (12-209)||(53917048-53917245)
chr3 (30-176)||(1619882-1620027)
chr3 (260-391)||(5192816-5192944)
chr3 (37-151)||(25634589-25634703)
chr3 (16-195)||(32479681-32479860)
chr3 (16-195)||(8516435-8516614)
chr3 (14-110)||(53597915-53598011)
chr3 (405-476)||(35918946-35919017)
chr3 (34-207)||(30844876-30845049)
chr3 (62-347)||(54189161-54189446)
chr3 (267-347)||(10612022-10612102)
chr3 (35-177)||(20628753-20628895)
chr3 (14-129)||(23409742-23409857)
chr3 (62-347)||(10897656-10897941)
chr3 (267-347)||(6304167-6304247)
chr3 (267-347)||(10204936-10205016)
chr3 (267-347)||(22625224-22625304)
chr3 (267-347)||(29913200-29913280)
chr3 (267-347)||(47882133-47882213)
chr3 (267-346)||(10098041-10098120)
chr3 (16-129)||(3324114-3324228)
chr3 (267-333)||(16458322-16458388)
chr3 (314-359)||(9602711-9602756)
chr3 (314-359)||(16263540-16263585)
chr3 (267-347)||(28489992-28490072)
[»] chr7 (51 HSPs)
chr7 (10-477)||(44725290-44725757)
chr7 (10-476)||(1048399-1048862)
chr7 (10-476)||(38394701-38395162)
chr7 (10-476)||(7350761-7351224)
chr7 (10-476)||(7093571-7094034)
chr7 (10-476)||(22135518-22135981)
chr7 (10-476)||(40550545-40551008)
chr7 (10-476)||(36165-36628)
chr7 (10-475)||(13289611-13290072)
chr7 (14-476)||(24816470-24816933)
chr7 (35-476)||(26213460-26213900)
chr7 (32-422)||(48490065-48490455)
chr7 (14-414)||(18391297-18391697)
chr7 (14-417)||(6593656-6594059)
chr7 (11-422)||(47675255-47675666)
chr7 (42-443)||(6047231-6047632)
chr7 (10-236)||(31159049-31159262)
chr7 (232-476)||(31157395-31157636)
chr7 (30-209)||(24749322-24749501)
chr7 (12-197)||(7471367-7471552)
chr7 (10-197)||(28486280-28486467)
chr7 (21-209)||(21678785-21678973)
chr7 (28-186)||(20298048-20298206)
chr7 (32-257)||(6570647-6570872)
chr7 (36-333)||(3890642-3890938)
chr7 (22-123)||(4295401-4295502)
chr7 (17-182)||(12405691-12405856)
chr7 (17-182)||(24261891-24262056)
chr7 (16-195)||(16884268-16884447)
chr7 (154-333)||(3903694-3903869)
chr7 (119-209)||(4294091-4294181)
chr7 (17-129)||(5817753-5817865)
chr7 (17-129)||(18413065-18413177)
chr7 (135-209)||(9679498-9679572)
chr7 (62-347)||(7070446-7070731)
chr7 (477-516)||(44725740-44725779)
chr7 (62-347)||(25352003-25352288)
chr7 (267-347)||(3324032-3324112)
chr7 (17-129)||(21645432-21645544)
chr7 (267-359)||(21988097-21988189)
chr7 (267-347)||(25406270-25406350)
chr7 (30-182)||(49091031-49091183)
chr7 (35-114)||(3903899-3903978)
chr7 (36-129)||(21988327-21988420)
chr7 (272-333)||(44015924-44015985)
chr7 (267-359)||(18412835-18412927)
chr7 (314-359)||(5818051-5818096)
chr7 (16-129)||(9185724-9185837)
chr7 (314-359)||(9186022-9186067)
chr7 (314-359)||(21645202-21645247)
chr7 (314-359)||(49090854-49090899)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (10-476)||(22133727-22134190)
chr4 (10-476)||(22781847-22782310)
chr4 (10-476)||(11007678-11008141)
chr4 (10-476)||(16933258-16933721)
chr4 (10-476)||(22045825-22046288)
chr4 (11-476)||(12402203-12402668)
chr4 (10-476)||(12399928-12400394)
chr4 (10-471)||(9175587-9176045)
chr4 (14-422)||(52094480-52094888)
chr4 (14-417)||(8394060-8394463)
chr4 (14-417)||(5136734-5137137)
chr4 (11-476)||(26558348-26558813)
chr4 (14-417)||(7123350-7123753)
chr4 (14-351)||(5872457-5872794)
chr4 (10-257)||(12395186-12395432)
chr4 (38-421)||(5206781-5207165)
chr4 (43-422)||(4588623-4589001)
chr4 (14-264)||(12743204-12743454)
chr4 (10-196)||(47563515-47563701)
chr4 (14-190)||(18536898-18537073)
chr4 (10-197)||(36920884-36921071)
chr4 (12-209)||(22802111-22802308)
chr4 (267-422)||(12749056-12749211)
chr4 (23-209)||(14788807-14788993)
chr4 (31-194)||(10113639-10113802)
chr4 (267-422)||(12740850-12741005)
chr4 (14-194)||(3578083-3578263)
chr4 (21-209)||(16454074-16454262)
chr4 (17-182)||(9224972-9225137)
chr4 (14-114)||(36379048-36379148)
chr4 (368-476)||(5099598-5099706)
chr4 (17-129)||(16624573-16624685)
chr4 (267-359)||(15313174-15313266)
chr4 (272-347)||(4559067-4559142)
chr4 (87-166)||(5350578-5350657)
chr4 (222-399)||(18913739-18913916)
chr4 (35-132)||(42191445-42191542)
chr4 (267-355)||(9225222-9225310)
chr4 (267-359)||(5147078-5147170)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (10-476)||(72624-73090)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (10-476)||(19503446-19503909)
chr2 (10-476)||(35217080-35217543)
chr2 (10-476)||(36560251-36560714)
chr2 (10-476)||(21519804-21520267)
chr2 (14-475)||(28569531-28569994)
chr2 (14-196)||(22405317-22405499)
chr2 (61-422)||(42019007-42019368)
chr2 (14-209)||(6263528-6263723)
chr2 (17-182)||(19348631-19348796)
chr2 (10-114)||(34574627-34574731)
chr2 (17-182)||(25403004-25403169)
chr2 (17-182)||(23079035-23079200)
chr2 (272-347)||(17932982-17933057)
chr2 (62-347)||(2736856-2737141)
chr2 (17-129)||(10446008-10446120)
chr2 (267-347)||(39680902-39680982)
chr2 (267-347)||(20054005-20054085)
chr2 (267-359)||(25402827-25402919)
chr2 (62-333)||(22716492-22716763)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (10-476)||(22832-23295)
[»] scaffold1899 (1 HSPs)
scaffold1899 (10-476)||(330-793)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (10-476)||(33309595-33310058)
chr6 (10-476)||(26067505-26067968)
chr6 (53-441)||(25462608-25462995)
chr6 (14-417)||(16651578-16651982)
chr6 (14-417)||(16553318-16553721)
chr6 (14-417)||(16629874-16630277)
chr6 (14-476)||(12157961-12158423)
chr6 (14-443)||(30444003-30444432)
chr6 (14-417)||(34165526-34165929)
chr6 (22-422)||(5408194-5408587)
chr6 (22-422)||(5412519-5412912)
chr6 (10-227)||(26931919-26932136)
chr6 (21-274)||(12936558-12936811)
chr6 (119-407)||(16567733-16568021)
chr6 (10-190)||(17012769-17012948)
chr6 (63-274)||(12910882-12911093)
chr6 (10-209)||(15533976-15534175)
chr6 (11-146)||(3395103-3395238)
chr6 (30-214)||(3631312-3631496)
chr6 (14-183)||(26944234-26944403)
chr6 (17-182)||(14738140-14738305)
chr6 (17-175)||(33331014-33331172)
chr6 (267-347)||(17694096-17694176)
chr6 (62-347)||(25942320-25942605)
chr6 (201-337)||(10456883-10457019)
chr6 (267-347)||(13879595-13879675)
chr6 (18-121)||(18232275-18232378)
chr6 (278-369)||(22350194-22350285)
chr6 (17-129)||(9035704-9035816)
chr6 (267-347)||(14738390-14738470)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (10-476)||(34256-34727)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (14-422)||(115245-115653)
[»] scaffold1908 (1 HSPs)
scaffold1908 (143-422)||(137-416)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (10-190)||(26284-26463)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (36-417)||(26539-26920)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (10-209)||(80572-80771)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (23-209)||(50737-50923)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (10-209)||(826-1025)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (17-182)||(14877-15042)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (17-182)||(445-610)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (16-195)||(149522-149701)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (267-347)||(17181-17261)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (17-108)||(18512-18603)
scaffold0188 (267-359)||(18757-18849)
[»] scaffold1991 (1 HSPs)
scaffold1991 (56-129)||(1028-1101)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (32-129)||(1914-2011)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (314-359)||(4059-4104)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 399; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 15069328 - 15069794
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15069328 agcaaatgaaccaactgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 15069427  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15069428 tcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 15069527  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15069528 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctatcgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 15069627  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15069628 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagttcatgaacacggtgaaggcctaagtgtctcaagagggaacggtgga 15069727  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15069728 gatagaggtaaccagagaaagagtggtaataagtcaaagtctgaatgctttaactgtcacaagatgg 15069794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 18811469 - 18811932
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18811469 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagatggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 18811568  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18811569 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 18811668  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18811669 aggataaagctatacttttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatggtctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 18811768  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18811769 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgagagcctaagtgtctcaagagggaatggtgga 18811865  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18811866 ggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgg 18811932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 27827746 - 27828209
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27827746 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctac 27827845  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827846 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 27827945  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27827946 aggatcaagttatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctatatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 27828045  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  27828046 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgagggcctaagtgtctcaagagggaatggtgca 27828142  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  27828143 ggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaagtttgaatgctttaactatcacaagatgg 27828209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 475
Target Start/End: Original strand, 43080363 - 43080825
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  43080363 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaaacaacgactctac 43080462  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43080463 tcattcaggatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 43080562  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43080563 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 43080662  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43080663 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgatggcctaagtgtcacaagagggaatggtgga 43080759  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatg 475  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  43080760 ggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaaggcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatg 43080825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 30 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 31577846 - 31577457
Alignment:
Q  30 catcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtc 129  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  31577846 catcgatgtggtcaaagttggagtctgtgtatatgacaaagtctttggctcttcggcaattcctaaagcaacaactctact-attcaagatggtggagtc 31577748  T
Q  130 aaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttg 229  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31577747 aatggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccatgatgacttggagaatattgaggtgcatcttgaggatgaagataaaactatactcttg 31577648  T
Q  230 ttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaa 329  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31577647 ttgtgtgctttaccgagatcttttgaatctttcaaagatactatgctatatggcaaagaaggcactattaccttggaagaagttcaagcggctttgagaa 31577548  T
Q  330 ccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaa 420  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||||||| || || || |  |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  31577547 ccaatgagttaaccaagtccaaggacttgagaattgattaaaatggtgaaggcctaagtgtttcaagagtgaatggtggaggtagaggtaa 31577457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 34256032 - 34255623
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34256032 aaggaaccaaccgcaacatcgatgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 34255933  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg-agg 212  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||     
T  34255932 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 34255833  T
Q  213 ataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagt 312  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34255832 acaaggctatactcttgttgtgtgctctaccgagatcatttgaatccttcaaggatatcatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagt 34255733  T
Q  313 tcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggt 412  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | || ||| ||||||||||||    
T  34255732 tcaagtggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtttcaaaaggaaatggtggaggt 34255633  T
Q  413 agaggtaacc 422  Q
    ||||||||||    
T  34255632 agaggtaacc 34255623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 31 - 476
Target Start/End: Original strand, 17848308 - 17848753
Alignment:
Q  31 atcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtca 130  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||    
T  17848308 atcgatgtggtcaaagttggagtctttgtatatgacaatctctttggctcatcggaaattcctaaagcaacaactctactcattgaagatgttggagtca 17848407  T
Q  131 aaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgt 230  Q
    |||  |||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||| |    
T  17848408 aagttcatcatggagtaacttacgaagttcaatacaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcatcttaaggatgaagataaaattatactcttct 17848507  T
Q  231 tgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaac 330  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||  ||| |||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17848508 tgtgtgctctaccgagatcatttgaatctttcaaggatatcatgctttatggctaaaaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagctgctttgagaac 17848607  T
Q  331 caaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaacccgagaaag 430  Q
    |||||||   ||||||||||| |||||||||| | ||||| || |||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||    
T  17848608 caaggagcaaaccaagtccaaggacttgagagctgatgaaaacggtgaaggcatatctgtttcaagagggaatggtggaggtataggtaaccaaggaaag 17848707  T
Q  431 agtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    |||||||||||||||| || | | |||||||| |  ||||||||||    
T  17848708 agtggtaacaagtcaaagtttaattgctttaattatcacaagatgg 17848753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 32 - 422
Target Start/End: Original strand, 4732318 - 4732708
Alignment:
Q  32 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaa 131  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4732318 tcgatgtggtcaaagttggagacattgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaa 4732417  T
Q  132 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgtt 231  Q
    || || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||  |||||||||||||    
T  4732418 agaccgtgatggagcaattaacggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaagacaagactatactcttgtt 4732517  T
Q  232 gtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaacc 331  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4732518 gtgtgctctaccgagatcatttgaatccttcaaggataccatgctctatagcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaaaaacc 4732617  T
Q  332 aaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaacc 422  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||   ||||| || |||||| ||| ||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4732618 aaggagttgaccaagtccaaggacatgagagcggatgaaaacagtgaagaccttagtgtttcaagaggaaatggtggaggtggaggtaacc 4732708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Original strand, 5591527 - 5591846
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5591527 aaggaaccaaccgcggcgtcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgatcaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcat 5591626  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| |||| |||| || | |  |||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || ||    
T  5591627 tcaagatggtggagttaaagaccgtgacagagcaattgacggagttcaacaaaattcttgatgatttggagaacattgaggtgcaaattgaggacgaaga 5591726  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  5591727 taaaactatactcttgttgtgtgctctaccgagatcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcaccgtcaccttggaagaaatt 5591826  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaa 333  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5591827 caagcggctttgagaaccaa 5591846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 152 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 41366383 - 41366111
Alignment:
Q  152 acggagttcaacaaaatccttgat--gacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatc 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  41366383 acggagttcaacaaaatccttgatatgatttggagaacattgaggtgcaaattgaggacgaagataaagctatactcttgttgtgtgttttaccgagatc 41366284  T
Q  250 ttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtcc 349  Q
     |||| ||| || ||  |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41366283 atttggatcctttaaggataccatgctctatggcaaaaaaggcaccgtcaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtcc 41366184  T
Q  350 aatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaacc 422  Q
    || ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41366183 aaagacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtttcaagaggaaatggtggaggtagaggtaacc 41366111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 209
Target Start/End: Original strand, 41383416 - 41383613
Alignment:
Q  12 caaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactc 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  41383416 caaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcaaatatttgtatatgacaaagtctttgactcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactc 41383515  T
Q  112 attcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||   ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41383516 atttgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatg 41383613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Original strand, 21481268 - 21481438
Alignment:
Q  21 caaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggat 120  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||| |||    
T  21481268 caaccgcgacatcaatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcgccaattcctaaagaaacaattttactcattcaagat 21481367  T
Q  121 ggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattg 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21481368 ggtagagtcaaagaccatcatggagaaccttgcggagttcaacagaatccttgatgacttggagtatattg 21481438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 284 - 422
Target Start/End: Original strand, 29542940 - 29543078
Alignment:
Q  284 aaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcc 383  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||   ||||| || |||||||||    
T  29542940 aaagaaggcactgtcaccatggaggaagttcaagcggctttaagacccaaggagttgaccaagtccaagaacttgagagcggatgaaaacagtgaaggcc 29543039  T
Q  384 taagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaacc 422  Q
    ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29543040 taagtgtttcaagaggaaatggtggtggtagaggtaacc 29543078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 10684832 - 10684997
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||    
T  10684832 gaagctaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattca 10684931  T
Q  117 ggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 182  Q
     |||||| ||||| ||  | |||  ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  10684932 agatggtggagtctaaatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 10684997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 35744909 - 35744744
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| | ||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  35744909 gaagctaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcatagacaactcttgaagcaacaactctactcattca 35744810  T
Q  117 ggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 182  Q
     |||||| ||||| ||  | |||  ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  35744809 agatggtggagtctaaatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 35744744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 129
Target Start/End: Original strand, 18853731 - 18853843
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | || ||||||||||| |||||||    
T  18853731 gaagcaaccgcggcatcgatgtgggctaaattggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattca 18853830  T
Q  117 ggatggtagagtc 129  Q
     |||||| |||||    
T  18853831 agatggtggagtc 18853843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 6813206 - 6813047
Alignment:
Q  23 accgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatgg 122  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||| || || || | || ||||||||||||||||| | |||||    
T  6813206 accgcgacatcaatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatcgttggctcataggaaactcttgaaacaacaactctactcattgaagatgg 6813107  T
Q  123 tagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 182  Q
    | ||||| ||  | |||| ||||||| | ||  | || |||||||| |||||||||||||    
T  6813106 tggagtctaaatcaatcacggagcaattgacaaaatttaacaaaattcttgatgacttgg 6813047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4819564 - 4819484
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||    
T  4819564 atactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcggctttaagaaccaaagagttaaccaagt 4819484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16756585 - 16756505
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||    
T  16756585 atactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 16756505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Original strand, 28328764 - 28328844
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||    
T  28328764 atactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 28328844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 26300857 - 26300758
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| | ||| || | || ||||||||||| |||||||    
T  26300857 gaagctaccgcagcattgatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacaaaatctttggctcatagacaactcttgaaacaacaactctattcattca 26300758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 346
Target Start/End: Original strand, 33033496 - 33033575
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaag 346  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||| | ||||||    
T  33033496 atacaatgctttatggcaaagaaggcactatcactttggaggaagttcaagcagttttgagaaccaaagagttaaccaag 33033575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 333
Target Start/End: Original strand, 15945514 - 15945580
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaa 333  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15945514 atacaatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagtccaagcggctttgagaaccaa 15945580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 359
Target Start/End: Original strand, 18853981 - 18854073
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttga 359  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  18853981 ataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 18854073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Original strand, 28891620 - 28891700
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||| ||||| |||||||||||  ||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||    
T  28891620 atactatgctttatggcaaagagagcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 28891700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10380534 - 10380449
Alignment:
Q  107 tactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattga 192  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |  || | |||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||    
T  10380534 tactcattcgggatggtggagtcaaaagccatcataaagcaattggcgcaattcaacaaaatctttgatgatttggtgaacattga 10380449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 267 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26300607 - 26300515
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttga 359  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||    
T  26300607 ataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaatgaattgaccaagttcaaggacttga 26300515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 51750743 - 51751206
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750743 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 51750842  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750843 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 51750942  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51750943 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 51751042  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  51751043 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgagggcctaagtgtcacaagagggaatggtgga 51751139  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  51751140 ggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgg 51751206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 27338706 - 27338240
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27338706 agcaaaggaatgaatcgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttgactcattggcaattcctaaagcaacaactctac 27338607  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27338606 tcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggataatattgaggtgcaacttgaggatg 27338507  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27338506 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatgggaaagaaggcactgttaccttggaaga 27338407  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27338406 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaagacttgagaattcaagaacacggtgaaggcctaagtgtctcaagagggaatggtgga 27338307  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27338306 ggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaagcctgaatgctttaactgtcacaagatgg 27338240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 474
Target Start/End: Original strand, 28841128 - 28841589
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28841128 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 28841227  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28841228 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgaaacttgaggatg 28841327  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  28841328 aggataaagttatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaagacactgttaccttggaaga 28841427  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28841428 agttcaagaggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaaggcctaagtgtctcaagagggaatggtgga 28841524  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagat 474  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  28841525 ggtagaggtaaccgaagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagat 28841589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 476
Target Start/End: Original strand, 16226876 - 16227337
Alignment:
Q  12 caaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactc 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16226876 caaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactc 16226975  T
Q  112 attcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgag 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226976 attcaggatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgag 16227075  T
Q  212 gataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16227076 gataaagctatactcttgttgtgtgctctactgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaag 16227175  T
Q  312 ttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggagg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16227176 ttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgagggcctaagtgtcacaagagggaatggtggagg 16227272  T
Q  412 tagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16227273 tagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgg 16227337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 28203272 - 28202807
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28203272 agcaaaggaaccaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtataagacaaagtctttgactcatcgacaattcctaaagcaacaactctac 28203173  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28203172 tcattcaagatggtggagtcaaaagccatcatggagcaactgacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 28203073  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  28203072 aagataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaagaaggcactg-taccttggatga 28202974  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28202973 aattcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaagaacttgagaattcatgaacacggtgaaggcctaagtgtctcaagagggaatggtgga 28202874  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28202873 ggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaagtctgaatgctttaactgtcacaagatgg 28202807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 20300837 - 20301300
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||  ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20300837 agcaaaggaacaaaccgtggcatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgtcaattcctaaagcaacaactctac 20300936  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20300937 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgaagacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 20301036  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20301037 aggataaagctatactcctgttgtgtggtctactgaaatcttttcaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 20301136  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20301137 agttcaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaaggcctaagtgtctcaagagggaatggtgga 20301233  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20301234 ggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgg 20301300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 47178068 - 47178531
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  47178068 agcaaaggaagcaatcgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtcattggctcatcggcaattcctaaaacaacgactctac 47178167  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47178168 tcattcaggatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggacg 47178267  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47178268 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttacattggaaga 47178367  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  47178368 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgagggcctaagtgtcacaagagggaatggtgga 47178464  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  47178465 ggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaggcttgaatgctttaactgtcacaagatgg 47178531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Original strand, 51758240 - 51758534
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51758240 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaaattggaatctttgtatacgacaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctac 51758339  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51758340 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagtaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 51758439  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51758440 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatctttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttg 51758534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 32 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 8348616 - 8348178
Alignment:
Q  32 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaa 131  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8348616 tcgatgtggtcaaagttagagtctttgtatatgacaaagtctttgggacatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaa 8348517  T
Q  132 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgtt 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||      ||||||||||    
T  8348516 aggccatcatgtagcaacttacggagttcaacaaaatctttgatgacttggaaaataatgaggtgcatcttgaggatgaagata------tactcttgtt 8348423  T
Q  232 gtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaacc 331  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8348422 gtgtgctctaccgagatcttttgaatcgttcaaagatatcatgctctatggcaaataaggcactattatcttggaagaagttcaagcggctttgagaacc 8348323  T
Q  332 aaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaacccgagaaaga 431  Q
    |||||| | |||||||||||  |||||| ||||  |||| || |||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8348322 aaggagttaaccaagtccaagaacttgatagttggtgaaaacagtgaaggcctaagtgtttcaaaaggaaatggtggaggtagaggtaaccagagaaaga 8348223  T
Q  432 gtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||| ||  |||||||||    
T  8348222 gtggtaacaagtcaaagtttaaatgctttaattgtaacaagatgg 8348178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 22 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 13127296 - 13126844
Alignment:
Q  22 aaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatg 121  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||    
T  13127296 aaccgcgacatcgatgtcttcaaagttggagtctttgtatatgacaaattctttggctcatcgacaattcttaaagaaacaactatactcattcaatatg 13127197  T
Q  122 gtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagcta 221  Q
    |  |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13127196 gcggagtcaaagatcatcatgtagcaacttatggagtttaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcatcttgaggatgaagataaagcta 13127097  T
Q  222 tactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggc 321  Q
    ||||  |||||||||||||||||| || |||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13127096 tact--tgttgtgtgctctaccgagatattttgaatctatcgaagataccatgctctatggcaaagaaggtactgttaccttggaagaagttcaagcagc 13126999  T
Q  322 tttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaac 421  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||||| |  |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13126998 tttgagaaccaaggagttgaccaaatccaaggacttgagagctgatgaaaatggtgaaggcgtaagtgtttcaagagggaatggtggaggtagatgtaac 13126899  T
Q  422 ccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    | | |||||| || ||||||||||| || | |||||||||||||  |||||||||    
T  13126898 cggggaaagactgataacaagtcaaagtttaaatgctttaactgtaacaagatgg 13126844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 3805707 - 3805240
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| || |  |||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  3805707 aaggaaccaaccgcgacatcgatgtggtcaacgttagagttgttgtttatgaccaaatctttggctcattggcaattcctaaagcaacaactgtaatcat 3805608  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||    
T  3805607 tcaagatggcagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaattcttgatgacttggagaacattgaggtgcatcttgaggattaaga 3805508  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaa-------acataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttgga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||       | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  3805507 taaagctatactcttgttgtgtattctaccgagatcttttgaatctttcaaggataccatataccatgctctatggcaaagaagacactgtcaccttaga 3805408  T
Q  307 agaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||| |  |||||||| | ||||| | |||||||||||||    
T  3805407 agaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtcctatgacttgagaactgatgaaaatggtgaaggcttgagtgtttcaagagggaatggt 3805308  T
Q  407 ggaggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagat 474  Q
    |||||||||||||||| |  ||| |||| |||||||| || || | | ||||||||||| || |||||    
T  3805307 ggaggtagaggtaaccgggaaaatagtgataacaagttaaagtttaagtgctttaactgtcataagat 3805240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 422
Target Start/End: Original strand, 31657846 - 31658254
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| || || ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31657846 aaggaaccaaccgcggcgtcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgaccaaatctttggcttataggaaattccttaagcaacaactttactcat 31657945  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | |  |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||  | ||    
T  31657946 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgacagagcaattaacggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgaagcttgaggacaaaga 31658045  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31658046 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgagatcatttgaatccttcaaggataccatgctctatggcaaagaaggcattgtcaccttggaagaagtt 31658145  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  31658146 caagcggctttaagaaccaaggaattgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtttcaagaggaaatggtggaggta 31658245  T
Q  414 gaggtaacc 422  Q
    |||||||||    
T  31658246 gaggtaacc 31658254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 50168875 - 50168468
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  50168875 aaggaaccaaccacgacgtcgatatggtcaaagttggagtctt-gtatatgaccaagtttttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcat 50168777  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  50168776 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattaatggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 50168677  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  50168676 taattttatactcttgttgtgtgctctaccgagatcatttgaatccttcaaggataccatgctctatggaaaagaaggcattgtcaccttggaagaagtt 50168577  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||  |||| | |||||| |||||||||||||    
T  50168576 caaacggctttgagaaccaaggagttgatcaagtccaatgacttgagagcaaatgaaaacagtgaaggcctttgtgtttcaagaggaaatggtggaggta 50168477  T
Q  414 gaggtaacc 422  Q
    |||||||||    
T  50168476 gaggtaacc 50168468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28222947 - 28222539
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||  || ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28222947 aaggaaccaaccgcagcatcgatgtggtcaaagttggtgtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcat 28222848  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | |  |||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||  | ||    
T  28222847 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgacagagcaattgacagagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgaaacttgaggacaaaga 28222748  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28222747 caaagcaatacttttgttgtgtgctctaccgagatcatttgaatccttcaaggataccatgctatatggaaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 28222648  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||    
T  28222647 caggcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaagacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtttcaagaggaaatggtggacgta 28222548  T
Q  414 gaggtaacc 422  Q
    ||| |||||    
T  28222547 gagataacc 28222539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25250854 - 25250655
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25250854 agcaaaggaaacaaccgcggtatcgatgtggttaaagttcaaatatttgtatatggcaaagtctttggctcttcggtaattcctaaagcaacaactctac 25250755  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| || |||| ||||||||||    
T  25250754 tcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagaaacttacggagttcaacaaaatcattgatgatttggacaacattaagctgcaccttgaggatg 25250655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 197
Target Start/End: Original strand, 6996292 - 6996477
Alignment:
Q  12 caaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactc 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  6996292 caaaggatccaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactc 6996391  T
Q  112 attcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgc 197  Q
    ||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  6996392 atttaagatggtaaagtcaaagaccatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgc 6996477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 50078363 - 50078174
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  50078363 aaggaaacaactgcggcatcaatgtggtcaaagtttgaatatttgtatatgacaaaatcttgggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 50078264  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttg 203  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  50078263 tcaagattatagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttg 50078174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 16429658 - 16429853
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| | |||||| | |||||||||  ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16429658 aaggaatctaccgcggcgtcgatgtggttaaagttcaagtgtttgtatatgacaaagtctttggctcatcagaaattcctaaagtaacaactttactcat 16429757  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16429758 tcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttgtggagttcaacaaaacccttgatgatttggagattattgaggtgcatcttgaggatg 16429853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31737049 - 31736850
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  31737049 agcaaaggaacgaaccgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggaaagtcctaaagcaacaactttac 31736950  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||  ||||||||||    
T  31736949 tcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatg 31736850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29003544 - 29003345
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  29003544 agcaaaggatacaaccacgacatcaatgtggtcaaagttcaaatatttgtatatgacaaaatctttgactcatcggcaagtcctaaagcaacaactttac 29003445  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||| |||||| | |  |||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29003444 tcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatgcaactgcttatggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatg 29003345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 286
Target Start/End: Original strand, 16456388 - 16456632
Alignment:
Q  42 caaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcat 141  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | || |     
T  16456388 caaagttggagtcattgtatatgaccaagactttggctcataggcaaatcctaaagcaacaactctactcattcaagatgatagagtcaaagacaatgac 16456487  T
Q  142 ggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgtgtgctcta 241  Q
     |||||| | |||||||| |  ||||| ||| |||| |||||||| |||||| |||||  |||| || | || |||| |||||||||||| |||||| ||    
T  16456488 agagcaattaacggagtttattaaaatacttaatgatttggagaacattgagttgcaatatgagaataaagacaaagatatactcttgttatgtgcttta 16456587  T
Q  242 ccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaa 286  Q
    |||  ||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  16456588 ccgtgatcatttgaatcattcaaggataccatgctctatggcaaa 16456632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 28997828 - 28997635
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  28997828 agcaaaggatacaaccacgacatcaatgtggtcaaagttcaaatatttgtatatgacaaaatctttgactcatcggcaagtcctaaagcaacaactttac 28997729  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttg 203  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||| |||||| | |  |||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  28997728 tcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatgcaactgcttatggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttg 28997635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31424595 - 31424408
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||  ||||| |||||||||||  | |||    
T  31424595 agcaaaggaaccaaccacgacatagatgtgggcaaagttggaatctttgt------------ctttggctcatcaacaatttctaaagcaacatatttac 31424508  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||   ||||||||||    
T  31424507 tcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggatctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgtgtcttgaggatg 31424408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 3157305 - 3157459
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3157305 aaggaacctaccgcggcgtcgatgtggtcaaagttggagtcattctatatgaccaagtctttggctcatagacaattccttaagcaacaactctattcat 3157404  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaat 168  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | | ||||||| | |||||||||||||||||    
T  3157405 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgacggagcaattgacggagttcaacaaaat 3157459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 41397758 - 41397593
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||    
T  41397758 gaagctaccgcggcatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattca 41397659  T
Q  117 ggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 182  Q
     |||| | ||||| ||  | |||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  41397658 agatgatggagtctaaatcgatctcggagcaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 41397593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 318 - 422
Target Start/End: Original strand, 776019 - 776123
Alignment:
Q  318 cggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagagg 417  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||   ||||| || ||||||||||  |||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  776019 cggctttgagaaccaagaagttgaccaagtccaaggacttgagagcgaatgaaaacagtgaaggcctttgtgtttcaagaggaaatggtggaggtagagg 776118  T
Q  418 taacc 422  Q
    |||||    
T  776119 taacc 776123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Original strand, 17346081 - 17346247
Alignment:
Q  16 ggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattc 115  Q
    |||||| |||||  |||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || || |||| | || ||||| || | || ||||||||||||||||||    
T  17346081 ggaagctaccgcatcatcaatgtgggctaaattggagtcattgtacatgacgaaatcgttggttgataggcaactcttgaaacaacaactctactcattc 17346180  T
Q  116 aggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 182  Q
    | |||||||||||| ||  | |||||||||||| | | ||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  17346181 aagatggtagagtctaaatcaatcatggagcaattgatggaatttaacaaaattcttgatgatttgg 17346247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 129
Target Start/End: Original strand, 47099385 - 47099498
Alignment:
Q  16 ggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattc 115  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || || || ||||| || || ||||||||| ||||| || | || ||||||||||| ||||||    
T  47099385 ggaagctaccgcggcatcgatgtgggctaagttggagtcattttacatgacgaaatcgttggctcataggcaactcgtgaaacaacaactctattcattc 47099484  T
Q  116 aggatggtagagtc 129  Q
    | |||||| |||||    
T  47099485 aagatggtggagtc 47099498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Original strand, 19359406 - 19359505
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||| | || ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| || | || ||||||||||| |||||||    
T  19359406 gaagctaccgcggcatcgatgtgggctaagttgaagtcattgtacatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattca 19359505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 33094383 - 33094225
Alignment:
Q  28 gacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagag 127  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||  || | ||||  | ||||||| || ||| ||||||||||||| || ||||| |||    
T  33094383 gacaacgatgtggtcaaggttggagtctttatatatgaccaagttgttaggtcatatgtaattcctcaaacaataactctactcatttagaatggtggag 33094284  T
Q  128 tcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaa 186  Q
    |||||  ||||||   ||||| | ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  33094283 tcaaaatccatcacaaagcaattgactaagttcaacaaaatccttaatgatttggagaa 33094225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 45654976 - 45654910
Alignment:
Q  271 catgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggag 337  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45654976 catgctctatggcaaaaaagacattgtcaaattggaagaagttcaaaaggctttgagaaccaaggag 45654910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2400549 - 2400469
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||    
T  2400549 atactatgctttatggcaaagatggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgaaaaccaaagagttaaccaagt 2400469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 333
Target Start/End: Original strand, 14997891 - 14997957
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaa 333  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  14997891 atactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagtctaagcggctttgagaaccaa 14997957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 359
Target Start/End: Original strand, 19359703 - 19359748
Alignment:
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttga 359  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  19359703 caagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 19359748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 6745774 - 6746240
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745774 agcaaaggaacgaaccgcggcatcaatgtgggcaaagttgtaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 6745873  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745874 tcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 6745973  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745974 aggaaaaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 6746073  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  6746074 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaatgacttgagagttcgtgaacacgatgaaggcctaagtgtctcaagaggaaatggtgga 6746173  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6746174 ggtagaggtaatcggagaaagagtggtaacaagtcaaagtctgaatgctttaactgtcacaagatgg 6746240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 34478992 - 34478529
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34478992 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctac 34478893  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34478892 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggaaaatattgaggtgcaacttgaggatg 34478793  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34478792 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccaaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcattgttaccttggaaga 34478693  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34478692 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgagggcctaagtgtctcaagagggaatggtgga 34478596  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  34478595 ggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgg 34478529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 18467390 - 18467856
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18467390 agcaaaggaacgaaccgcgacatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 18467489  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  18467490 tcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatggagcaatttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgtggata 18467589  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18467590 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaagaagggactgttaccttggaaga 18467689  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18467690 agttcaagcggctttgagaatcaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagttcatgaacacggtgaaggcctaagtgtttcaagagggaatggtgga 18467789  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18467790 ggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaagcctgaatgctttaactgtcacaagatgg 18467856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Original strand, 10750407 - 10750867
Alignment:
Q  13 aaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactca 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10750407 aaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactca 10750506  T
Q  113 ttcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10750507 ttcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggacgagg 10750606  T
Q  213 ataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10750607 ataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagt 10750706  T
Q  313 tcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    ||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10750707 tcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaatacggtgatggcctaagtgtcacaagagggaatggtggaggt 10750803  T
Q  413 agaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10750804 agaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgg 10750867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 15356422 - 15355959
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15356422 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 15356323  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15356322 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggacg 15356223  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15356222 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 15356123  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    ||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15356122 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaatacggtgatggcctaagtgtcacaagagggaatggtgga 15356026  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  15356025 ggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcataagatgg 15355959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 23665752 - 23666215
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23665752 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 23665851  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23665852 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggacg 23665951  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23665952 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 23666051  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    ||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23666052 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaatacggtgatggcctaagtgtcacaagagggaatggtgga 23666148  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  23666149 ggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcataagatgg 23666215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 31543439 - 31543902
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31543439 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttagaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctac 31543538  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31543539 tcattcaagatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 31543638  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31543639 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 31543738  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31543739 agttcaagcagctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacagtgagggcctaagtgtcacaagagggaatggtgga 31543835  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  31543836 ggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcgcaagatgg 31543902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 124 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 20505665 - 20505313
Alignment:
Q  124 agagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctata 223  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20505665 agagtcaaaggacattatggagcaacttacggagtttaacaaaatccttaatgacttggagaatattaaggtgcaacttgagtatgaggataaagctata 20505566  T
Q  224 ctcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctt 323  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20505565 ctcttgttgtgtgctctactgaaatcttttgaatcgttcaaagatactatgctctatgggaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctt 20505466  T
Q  324 tgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaaccc 423  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  20505465 tgagaactaaggagttgaccaagtccaaggacttgagaattcatgaacacggtgaagtcttaagtgtctcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccg 20505366  T
Q  424 gagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20505365 gagaaagagtggtaacaagtcaaaatctgaatgttttaactgtcacaagatgg 20505313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 14 - 422
Target Start/End: Original strand, 29721017 - 29721425
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29721017 aaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtcaaagttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 29721116  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  29721117 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 29721216  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29721217 caaggctatactcttgttgtgtgcgctaccgagatcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 29721316  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||   ||||| || |||||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||    
T  29721317 caagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttaagagcagatgaaaacagtgaaggccttagtgtttcaaaaggaaatggtggaggta 29721416  T
Q  414 gaggtaacc 422  Q
    |||||||||    
T  29721417 gaggtaacc 29721425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 9788747 - 9788339
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9788747 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtcaaagttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 9788648  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  9788647 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 9788548  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||    
T  9788547 caaggctatactcttgttgtgtgctctaccgagatcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaataatgcactgtcaccttgaaagaagtt 9788448  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| || |||| ||||| ||||| | || ||| |||||||||||||    
T  9788447 caagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgacggccttagtgtttcaaaaggaaatggtggaggta 9788348  T
Q  414 gaggtaacc 422  Q
    |||||||||    
T  9788347 gaggtaacc 9788339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 14 - 422
Target Start/End: Original strand, 16407977 - 16408385
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16407977 aaggaaccaaccgcggaatcgatatgatcaaagttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 16408076  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| |||| |||| || | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  16408077 tcaagatggtggagtaaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 16408176  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16408177 caaggctatactcttgttgtgtgcgctaccgagatcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 16408276  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||  ||||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||    
T  16408277 caagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaagacaatgaaggccttagtgtttcaaaaggaaatggtggaggta 16408376  T
Q  414 gaggtaacc 422  Q
    |||||||||    
T  16408377 gaggtaacc 16408385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Original strand, 40380758 - 40381161
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  40380758 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcat 40380857  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  40380858 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacggtttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 40380957  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40380958 caaggctatactcttgttgtgtgctctaccgagatcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 40381057  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||    
T  40381058 caagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtgtcaaaaggaaatggtggaggta 40381157  T
Q  414 gagg 417  Q
    ||||    
T  40381158 gagg 40381161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 34 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 42427937 - 42427549
Alignment:
Q  34 gatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaag 133  Q
    ||||||| |||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  42427937 gatgtggtcaaagttgtagtcattgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcaaag 42427838  T
Q  134 gccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgt 233  Q
     || | | ||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  42427837 accgtgacggaacaattaacagagttcaacaaaatccttgatgattttgagaacattgaggtgcaacttgaggatgaagacaaagctatactcttgttgt 42427738  T
Q  234 gtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaa 333  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| |||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  42427737 atgctctaccgagatcatttgaatccttcaactataccacactctatggcaaaaaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcgactttaagaaccaa 42427638  T
Q  334 ggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaacc 422  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||   ||||| || |||||||||| ||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  42427637 ggagttgaccaagtccaaggacttcagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtttcaagaagaaatggtggaggtagaggtaacc 42427549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Original strand, 16545079 - 16545485
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaa---gtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctact 110  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||   ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16545079 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaacaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctact 16545178  T
Q  111 cattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatga 210  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16545179 cattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacga 16545278  T
Q  211 ggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaa 310  Q
     || || ||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16545279 agacaaggctatactcttgttgtgcgcactaccgaggtcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaa 16545378  T
Q  311 gttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggag 410  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | || ||| ||||||||||    
T  16545379 gttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtgtcaaaaggaaatggtggag 16545478  T
Q  411 gtagagg 417  Q
    |||||||    
T  16545479 gtagagg 16545485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 298
Target Start/End: Original strand, 26171409 - 26171693
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||| | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26171409 aaggaaccaaccgtggcatcgatatggtcaaagttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 26171508  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||| || ||    
T  26171509 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattaaggtgcaaattgaggacgaaga 26171608  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgtt 298  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26171609 caaggctatactcttgttgtgtgcgctaccgagatcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtt 26171693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 34 - 422
Target Start/End: Original strand, 534421 - 534788
Alignment:
Q  34 gatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaag 133  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  534421 gatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgaccaagtctttggttgataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaag 534520  T
Q  134 gccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgt 233  Q
     || | ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||    
T  534521 accgtgatggagcaattaacggagttcaacaaaatacttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggatgaagacaaggctatactgttgttgt 534620  T
Q  234 gtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaa 333  Q
    ||||||||| || ||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||                     |||||||||||| ||| ||||||||    
T  534621 gtgctctacagagatcatttgaatccttcaaggataccatgctctatggcaaag---------------------aagttcaagcggatttaagaaccaa 534699  T
Q  334 ggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaacc 422  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| || ||||| |||| ||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  534700 ggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaatgccttagtgtttcaagaagaaatggtggaggtagaggtaacc 534788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13694667 - 13694259
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| | ||||||| || ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  13694667 aaggaacctaccgcgatattgatgtggtcaaatttggagtcgttgtatatgaccaaatctttggctcatatgcaattcctatatcaacaactctacttat 13694568  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    | | |||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||    
T  13694567 ttaagatggtggagtcaaatgtcatcatggagcaactaacggagttcaacaaaatccttgatgagttggaaaacattgaggtgcatctctaagatgaaga 13694468  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || | |||||||||||||| | |||||| || ||| |||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||| || ||| || ||| | |||||     
T  13694467 caaggttatactcttgttgttttctctactgagatcatttgaatccttcaaggatgccatgctctatggcaaagaagacattgtcactttgaaggaagtc 13694368  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||| || ||||||| | ||||| ||  |||||||||||||   | | ||||||||||||||||||    
T  13694367 caagcggctttgaggaccaatgagttaaccaagttcaaggagttgagagctaatgaaaacaatgaaggcctaagtacttcatgagggaatggtggaggta 13694268  T
Q  414 gaggtaacc 422  Q
    ||| |||||    
T  13694267 gagataacc 13694259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 658724 - 658908
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  658724 agcaaaggaaccaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttac 658823  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 194  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||   ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  658824 tcattcaagatggtaaagtcaaaggccatcatggacctacttgtagagttcaacaaaatcattggtgatttggagaatattgagg 658908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 20043710 - 20043874
Alignment:
Q  30 catcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtc 129  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  20043710 catcgatgtagtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactttactcattcaagatggcagagtc 20043809  T
Q  130 aaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20043810 aaaggccatcatggagcaacttgtggagttcaaaacaatccttgatgacttggagaacattgagg 20043874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 27911138 - 27911337
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  27911138 agcaaaggaatcaactgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggaaagtcctaaagcaacaactttac 27911237  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||  ||||||||||    
T  27911238 tcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatg 27911337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 218 - 422
Target Start/End: Original strand, 13486871 - 13487075
Alignment:
Q  218 gctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaag 317  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  13486871 gctatactcttgttgtgtgttctaccgagatcatttgaatcattcaaggataccatgctctatggtaaagaaggcactgtcaccttggaatatgttcaag 13486970  T
Q  318 cggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagagg 417  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||   ||||| ||  ||||||| | ||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  13486971 cggctttaaaaaccaaggagttgaccaagtctaaggacttaagagcggatgaaaacaatgaaggcattagtgtttcaagagggaatggtgaaggtagagg 13487070  T
Q  418 taacc 422  Q
    |||||    
T  13487071 taacc 13487075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Original strand, 25806167 - 25806343
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||| |||| |||||||  ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||    
T  25806167 agcaatggaaacaaccgcagcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatattacaaagtctttggctcattggaaagtcctaaagcaacaactttac 25806266  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaa 186  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  25806267 tcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaa 25806343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18510955 - 18510788
Alignment:
Q  42 caaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcat 141  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  18510955 caaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggcttatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcat 18510856  T
Q  142 ggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||| ||||  | |||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||  ||||||||||    
T  18510855 ggagctacttgtgcagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatg 18510788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 293 - 422
Target Start/End: Original strand, 26173701 - 26173830
Alignment:
Q  293 actgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtct 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| |    
T  26173701 actgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgttt 26173800  T
Q  393 taagagggaatggtggaggtagaggtaacc 422  Q
     || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  26173801 caaaaggaaatggtggaggtagaggtaacc 26173830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33790834 - 33790669
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| | ||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  33790834 gaagctaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcatagacaactcttgaagcaacaactctactcattca 33790735  T
Q  117 ggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 182  Q
     |||||| ||||| ||  | |||  ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  33790734 agatggtggagtctaaatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 33790669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 37557192 - 37557357
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||    
T  37557192 gaagctaccgcgacatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattca 37557291  T
Q  117 ggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 182  Q
     |||||| ||||| ||  | |||  ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  37557292 agatggtggagtctaaatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 37557357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 210
Target Start/End: Original strand, 13294851 - 13294977
Alignment:
Q  84 ggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgga 183  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  | || ||||||||| |||||    
T  13294851 ggcaattcagaaagcaacaactctactcattcatgatggtggagtcaaagggcatcatggagcaacttactgagttcagtagaagccttgatgatttgga 13294950  T
Q  184 gaatattgaggtgcaacttgaggatga 210  Q
    ||| ||||  ||||| ||| |||||||    
T  13294951 gaacattggagtgcatcttaaggatga 13294977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27449341 - 27449181
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||    
T  27449341 gaagctaccgcggcatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacaaaatctttagctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattca 27449242  T
Q  117 ggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatga 177  Q
     |||||| ||||| ||  | |||  ||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||    
T  27449241 agatggtggagtctaaatcaatctcggagcaattgacggagtttaacaagattcttgatga 27449181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Original strand, 31397559 - 31397738
Alignment:
Q  16 ggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattc 115  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||     
T  31397559 ggaagctaccgcggcatcaatgtgggaaaagttggagtcattctatatgacaaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattt 31397658  T
Q  116 aggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggt 195  Q
    | |||||| ||||| ||  | |||  ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||  || ||||||||    
T  31397659 aagatggtggagtctaaatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaggt 31397738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 43598251 - 43598139
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||    
T  43598251 gaagctaccgcggcatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttagctcatgggcaactcttgaagcaacaactctattcattca 43598152  T
Q  117 ggatggtagagtc 129  Q
     |||||| |||||    
T  43598151 agatggtggagtc 43598139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 43603743 - 43603631
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||    
T  43603743 gaagctaccgcggcatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttagctcatgggcaactcttgaagcaacaactctattcattca 43603644  T
Q  117 ggatggtagagtc 129  Q
     |||||| |||||    
T  43603643 agatggtggagtc 43603631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 43609235 - 43609123
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||    
T  43609235 gaagctaccgcggcatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttagctcatgggcaactcttgaagcaacaactctattcattca 43609136  T
Q  117 ggatggtagagtc 129  Q
     |||||| |||||    
T  43609135 agatggtggagtc 43609123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 362
Target Start/End: Original strand, 32584706 - 32584846
Alignment:
Q  222 tactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||| || ||||   |||||||| | |||||||| ||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||     
T  32584706 tactcttgttgtgtgctttacctagatcttttgagtccttcatggataccatgatttatggcaaggaaggaactatcacctttgaggaagtccaagcgga 32584805  T
Q  322 tttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagag 362  Q
     ||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  32584806 attgagaaccaaagagttaaccaagtccatggacttgagag 32584846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 347
Target Start/End: Original strand, 28788583 - 28788658
Alignment:
Q  272 atgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28788583 atgctttatggcaaagaagacactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttgaccaagt 28788658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 34842124 - 34842004
Alignment:
Q  28 gacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagag 127  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||| ||||| |||| | | |||||  | ||  |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  34842124 gacatcgatgtgggctaagttggagccattgtacatgacaaaatctttagctcgtagacaatttttgaaataacaactctactcattcaagatggtggag 34842025  T
Q  128 tcaaaggccatcatggagcaa 148  Q
    || ||  | ||||||||||||    
T  34842024 tctaaacctatcatggagcaa 34842004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 43596390 - 43596310
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43596390 ataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagt 43596310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 43629184 - 43629104
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43629184 ataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagt 43629104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 18098744 - 18098278
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18098744 agcaaaggaaccaaccgcggcatcaatgtgggcaaagatggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcataggcaattcctaaagcaacaactctac 18098645  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18098644 ttattcaggatggttgagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 18098545  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18098544 aggataaagctatactcttgttgtgtgctcttacgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 18098445  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18098444 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagatcatgaacacggtgaaggcctaagtgtctcaagagggaatggtgga 18098345  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18098344 ggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaagtctgaatgctttaactgtcacaagatgg 18098278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 43226762 - 43227228
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226762 agcaaaggaacgaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 43226861  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226862 tcattcaagatggtggagtcaaagaccatcatggagcaacttacgaagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 43226961  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43226962 aggataaagctatactcttgttgtgtgttctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaagaagacactgttaccttggaaga 43227061  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43227062 agttcaagaggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagttcatgaacacggtgaaggcctaagtgtctcaagagggaatggtgga 43227161  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43227162 ggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaagtctgaatgctttaactgtcacaagatgg 43227228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 4310083 - 4309617
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||  ||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4310083 agcaaaggaacgaaccgcggcatcaatatgggcaaagttgaaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 4309984  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4309983 tcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 4309884  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4309883 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctatatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 4309784  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4309783 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagttcatgaacacggtgaaggcctaagtgtttcaagagggaatggtgga 4309684  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4309683 ggtagaggtaaccggagaaagagtagtaacaagtcaaagtttgaatgctttaactgtcacaagatgg 4309617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 456592 - 457055
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456592 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 456691  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  456692 tcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggacg 456791  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  456792 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 456891  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  456892 agttcgagcggctttgagaaccaatgagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgagggcctaagtgtcacaagagggaatggtgga 456988  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  456989 ggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaggcttgaatgctttaactgtcacaagatgg 457055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 5192335 - 5192798
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5192335 agcaaaggaagcaactgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcagcaattcctaaagcaacgactctac 5192434  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5192435 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcattgagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 5192534  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5192535 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttaaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 5192634  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    ||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5192635 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcacgaacacggtgagggcctaagtgtctcaagagggaatggtgga 5192731  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5192732 ggtagaggtaaccggataaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgg 5192798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 5898094 - 5898560
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5898094 agcaaaggaacgaaccgcgacatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcttaaagcaacaactctac 5898193  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5898194 tcatttaagatggtggagtcgaagaccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 5898293  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5898294 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccattctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 5898393  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5898394 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagatcatgaacacggtgaaggccttagtgtctcaagagggaatggtgga 5898493  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5898494 ggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaggtcaaagcctgaatgctttaactgtcacaagatgg 5898560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 10957896 - 10957433
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10957896 agcaaaggaaccaaccgtggcatcgatttgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 10957797  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10957796 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacgaagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 10957697  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10957696 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcattgttaccttggaaga 10957597  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  10957596 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaaggtctaagtgtctcaagagggaatggtggc 10957500  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10957499 ggtagaggtaatcggagaaagagtggtaacaagtaaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgg 10957433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 6065366 - 6064903
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6065366 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatacgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 6065267  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6065266 tcattcaagatcgtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggacg 6065167  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6065166 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 6065067  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    ||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6065066 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacgttgagggcctaagtgtcacaagagggaatggtgga 6064970  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6064969 ggtagaggtaactggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgg 6064903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 11168786 - 11169249
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11168786 agcagaggaagcaaccgcagcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaactactctac 11168885  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11168886 tcattctggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 11168985  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11168986 aggataaagttatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcattcaaagataccatgctctgtggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 11169085  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  11169086 agttcaaccggttttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaaggcctaagtgtctcaatagggaatggtgga 11169182  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11169183 agtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgg 11169249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 443
Target Start/End: Original strand, 7769243 - 7769673
Alignment:
Q  13 aaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactca 112  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7769243 aaaggaaccaattgcgacatcgatgtggtcaaagttggagtctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagaaacaactctactca 7769342  T
Q  113 ttcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagg 212  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  7769343 ttcaagatggtggagtcaaaggctatcatggagcaacttacggagttctaaaaaatccttgatgacgtggagaatattgaggtgcatcttgaggatgaag 7769442  T
Q  213 ataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagt 312  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  7769443 ataaagctatattcttgttgtgtgctctaccgagatcttttaaatctttcaaagttaccatgctctatggcaaagaaggcaatgttatctaggaagaagt 7769542  T
Q  313 tcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggt 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  | | ||||| || |||||||||| | ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7769543 tcaagtggctttgagaaccaaggagtaggcaaagtctaaggacttgagagatgatgaaaacggtgaaggcctaagtgttttaagagggaatggtggaggt 7769642  T
Q  413 agaggtaacccgagaaagagtggtaacaagt 443  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  7769643 agaggtaaccggggaaagagtggtaacaagt 7769673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 476
Target Start/End: Original strand, 23634150 - 23634578
Alignment:
Q  30 catcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtc 129  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  23634150 catcgatgaggtcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatttctaaagcaacaactctagtcattcaagatggtggagtc 23634249  T
Q  130 aaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttg 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23634250 aaaggccatcatggagcaatttatagagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaagataaaactatactcttg 23634349  T
Q  230 ttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaa 329  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23634350 ttgtgtgctttaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctatatggaaaagaaggaactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaa 23634449  T
Q  330 ccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaacccgagaaa 429  Q
                      ||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23634450 ------------------ccaatgacttgagaactgatgaaaacggtgaaggcctaagtgtttcaagaggtaatggtggaggtagaggtaactagagaaa 23634531  T
Q  430 gagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23634532 gagtggtaacaagtcaaagtctaaatgctttaactgtcacaagatgg 23634578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 23199664 - 23199257
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23199664 aaggaaccaaccgcgacatcgatatggtcaaagttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctaatcat 23199565  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  23199564 tcaagatggtggagtcaaagaccatgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttagagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 23199465  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23199464 caaagttatactcttgttgtgtgtgctaccgagatcatttgaatcctttaaagataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 23199365  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||    
T  23199364 caagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtttcaaaaggaaatggtggaggta 23199265  T
Q  414 gaggtaac 421  Q
    ||||||||    
T  23199264 gaggtaac 23199257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 443
Target Start/End: Original strand, 27421327 - 27421755
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27421327 aaggaaccaaccgcgacattgatgtggtcaaagttggagtcgttgttattgacaaaatctttggctcatcggcaattcctaaaacaacaactttactcat 27421426  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||    
T  27421427 tcaagatggtagagtcaaaggtcatcatggagcaacttacggagttcaacaagatccttgatgacttggagaatattgaggtgcatcttgcagatgaaga 27421526  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||    
T  27421527 taaagctatactctttttgtgtgctctactgaaatcttttgaatccttcaaggataccatgctctatggcaaagaaggcattgtcactttgaaagaagtt 27421626  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || ||||||| | || || |  || |||| ||||| || | ||||||||||||||||| ||    
T  27421627 caagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtcaagggaattgagagctgataaaaatggtaaaggtctaagcgtttcaagagggaatggtggagata 27421726  T
Q  414 gaggtaacccgagaaagagtggtaacaagt 443  Q
    ||||||| ||| |||| | |||||||||||    
T  27421727 gaggtaa-ccgggaaaaattggtaacaagt 27421755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 14 - 422
Target Start/End: Original strand, 37407331 - 37407739
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37407331 aaggaaccaaccgcggcatcaatgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 37407430  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| |||| |||| || | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||    
T  37407431 tcaagatggtggagttaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggaaaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 37407530  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37407531 caaggctatactcttgttgtgtgctctaccgagatcatttgaatccttcaaggatatcatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 37407630  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| || |||||||| | ||||| | || ||| |||||||||||||    
T  37407631 caaccggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggctttagtgtttcaaaaggaaatggtggaggta 37407730  T
Q  414 gaggtaacc 422  Q
    |||||||||    
T  37407731 gaggtaacc 37407739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 14 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 5259848 - 5259441
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5259848 aaggaaccaaccgcggcatctatgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 5259749  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  5259748 tcaagatggtggagtcaaagaccttgatggagcaattggcagagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 5259649  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5259648 caaggctatactcttgttgtgtgctctaccgagatcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcattgtcaccttggaagaagtt 5259549  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| || |||||| ||| ||||| | |  ||| |||||||||||||    
T  5259548 caagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaagaccttagtgtttcagaaggaaatggtggaggta 5259449  T
Q  414 gaggtaac 421  Q
    ||||||||    
T  5259448 gaggtaac 5259441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 35 - 422
Target Start/End: Original strand, 29811532 - 29811919
Alignment:
Q  35 atgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaagg 134  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||| || | |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  29811532 atgtggtcaaagttggagtcattgtatataaccaggtctttggctcataagcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaga 29811631  T
Q  135 ccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgtg 234  Q
    || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||    
T  29811632 ccgtgatggagcaattaacggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaagacaaggctatactcttgttgtg 29811731  T
Q  235 tgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaag 334  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  29811732 tgctctaccgagatcatttgaatccttcaaggataccatgctctatggcaaataagacactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaaccaaa 29811831  T
Q  335 gagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaacc 422  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29811832 gagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtttcaagagaaaatggtggaggtagaggtaacc 29811919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Original strand, 10209843 - 10210246
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10209843 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcattgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 10209942  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  10209943 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatccttgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 10210042  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || ||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10210043 caaggctatactcttgttgtgcgcactaccgaggtcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 10210142  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||    
T  10210143 caagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaagacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtgtcaaaaggaaatggtggaggta 10210242  T
Q  414 gagg 417  Q
    ||||    
T  10210243 gagg 10210246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 422
Target Start/End: Original strand, 7762921 - 7763321
Alignment:
Q  22 aaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatg 121  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| ||||| | ||||    
T  7762921 aaccgcggaatcgatgtggtcaaagttggagtcattatatatgaccaagtctttggctcataagcaattctttaagcaacaactctattcatttaagatg 7763020  T
Q  122 gtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagcta 221  Q
    || ||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||    
T  7763021 gtggagtcaaagaccgtgatggagcaattaacggagttcaacaaaatccttgatgattttgagaacattgaggtgcaacttgaggacgaagacaaggcta 7763120  T
Q  222 tactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggc 321  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7763121 tactcttgttgtatgctctaccgagatcatttgaatccttcaaggataccatgctctatggcaaagaaggcattgtcaccttggaagaagttcaagcggc 7763220  T
Q  322 tttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaac 421  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||  | |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7763221 tttaagaaccaaggagttaaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacggtgaaggccttagtgcttcaagaggaaatgatggaggtagaggtaac 7763320  T
Q  422 c 422  Q
    |    
T  7763321 c 7763321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 4600245 - 4599842
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4600245 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 4600146  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | || |||||| |  ||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  4600145 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatagagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 4600046  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || ||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4600045 caaggctatactcttgttgtgcgcactaccgaggtcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 4599946  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||    
T  4599945 caagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtgtcaaaaggaaatggtggaggta 4599846  T
Q  414 gagg 417  Q
    ||||    
T  4599845 gagg 4599842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 422
Target Start/End: Original strand, 6717155 - 6717563
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| |||| ||||||||||||||    
T  6717155 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacatttccttaagcgacaactctactcat 6717254  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | || |||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  6717255 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatagagcaattggcggagttcaacaagatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 6717354  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6717355 caaggctatactcttgttgtgtgctctaccgagatcatttgaatcctttatggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 6717454  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||    
T  6717455 caagtggctttaagaaccaaggagttgaccaagtctaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtttcaaaggggaatggtggaggta 6717554  T
Q  414 gaggtaacc 422  Q
    |||| ||||    
T  6717555 gaggcaacc 6717563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Original strand, 10056887 - 10057290
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10056887 aaggaaccaactgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 10056986  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  10056987 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 10057086  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || ||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10057087 caaggctatactcttgttgtgcgcactaccgaggtcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 10057186  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||    
T  10057187 caagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtctaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtgtcaaaaggaaatggtggaggta 10057286  T
Q  414 gagg 417  Q
    ||||    
T  10057287 gagg 10057290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Original strand, 10061331 - 10061734
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10061331 aaggaaccaactgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 10061430  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  10061431 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 10061530  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || ||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10061531 caaggctatactcttgttgtgcgcactaccgaggtcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 10061630  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||    
T  10061631 caagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtctaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtgtcaaaaggaaatggtggaggta 10061730  T
Q  414 gagg 417  Q
    ||||    
T  10061731 gagg 10061734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Original strand, 10063553 - 10063956
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10063553 aaggaaccaactgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 10063652  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  10063653 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 10063752  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || ||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10063753 caaggctatactcttgttgtgcgcactaccgaggtcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 10063852  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||    
T  10063853 caagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtctaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtgtcaaaaggaaatggtggaggta 10063952  T
Q  414 gagg 417  Q
    ||||    
T  10063953 gagg 10063956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Original strand, 10065775 - 10066178
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10065775 aaggaaccaactgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 10065874  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  10065875 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 10065974  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || ||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10065975 caaggctatactcttgttgtgcgcactaccgaggtcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 10066074  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||    
T  10066075 caagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtctaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtgtcaaaaggaaatggtggaggta 10066174  T
Q  414 gagg 417  Q
    ||||    
T  10066175 gagg 10066178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Original strand, 10059109 - 10059512
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10059109 aaggaaccaactgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 10059208  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| || | |||| || | ||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  10059209 tcaagatggtggatttaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 10059308  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || ||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10059309 caaggctatactcttgttgtgcgcactaccgaggtcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 10059408  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||    
T  10059409 caagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtctaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtgtcaaaaggaaatggtggaggta 10059508  T
Q  414 gagg 417  Q
    ||||    
T  10059509 gagg 10059512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9635649 - 9635301
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9635649 aaggaaccaaccgcggcatctacgtggtcaaagttggagccgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaaatctactcat 9635550  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| ||||||  | |||||| || | ||||||||| |  || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  9635549 tcaagatggtgcattcaaagaccgtgatggagcaattggcgtagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 9635450  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9635449 caaggctatactcttgttgtgtgctttaccgagatcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 9635350  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagag 362  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9635349 caagcggctttaagaaccaatgagttgaccaagtccaaggacttgagag 9635301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 15830767 - 15830335
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  15830767 aaggaacctaccacgacatcgaggtggtcaaagttggagttattgtatatgactaagtctatggttcataggcaattcctaaagcaagaactttactcat 15830668  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    | | |||||| ||||||||| || |    |||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||    
T  15830667 ttaagatggtggagtcaaagaccgtagcagagcaaccaacagagttcaacaaaatccttgatgatttagagaacattgaggcgcatcttgaggataaaga 15830568  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     |  |||||||| |||||||||||| ||||   ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||    
T  15830567 catggctatacttttgttgtgtgctataccacgatcatttgaatccttcaaagataccatggtctatggcaaagaaggaactgccaccttggaaaaagtt 15830468  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||| | ||||| || ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  15830467 caagcggctttgagaaccaaggagttaacacagtccaaggacttgagagctgatgaaaacggtgaaggtctaagtgcttcaagagggaatggtggaggta 15830368  T
Q  414 gaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaa 446  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15830367 gaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaa 15830335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 34 - 421
Target Start/End: Original strand, 32891752 - 32892138
Alignment:
Q  34 gatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaag 133  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||    
T  32891752 gatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcatttaaggtggtggagtcaaag 32891851  T
Q  134 gccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgt 233  Q
     || | |   ||||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  32891852 accgtgacaaagcaattaacggggttcaacaaaatccatgatgatttggagaacattgaggtggatcttgaggacgaagacaaagcgatactcttgttgt 32891951  T
Q  234 gtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaa 333  Q
     ||||||| ||| ||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32891952 ttgctctatcgagatcatttgaatccttcaaggataccatgctctatgggaaagaaggcactgccaccttggaagaagttcaaccggctttgagaaccaa 32892051  T
Q  334 ggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaac 421  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| |  |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32892052 ggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaa-aaagtgaaggccttagtgtttcaagaggaaatggtggaggtagaggtaac 32892138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 56 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 15822169 - 15821753
Alignment:
Q  56 ttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacgg 155  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||| || | |  |||||||| |||     
T  15822169 ttgtatatgactaagtctttagctcatatgtaattcctaaagcaacaactctactcgtttaaaatggtggagtcaaagaccttaacagagcaactaacga 15822070  T
Q  156 agttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttga 255  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||  | | | |||||    
T  15822069 agttcaacaaaatccttaatgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatgaagacaagactatactcttgttgtgtgctctacttagaccatttga 15821970  T
Q  256 atcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgac 355  Q
    ||| |||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  15821969 atctttcaatgataccatgccctatggcatagaaggcaccgtcaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccgagtccaaggac 15821870  T
Q  356 ttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaat 455  Q
    ||||||||| || ||    |||| || |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| || | | |    
T  15821869 ttgagagttgattaa----gtgatggtctaagtgcttcaagagggaatggtggaggtagaggtaaccagggaataagtggtaacaagtcaaagtttaagt 15821774  T
Q  456 gctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||| ||  |||||||||    
T  15821773 gctttaattgtgacaagatgg 15821753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22834534 - 22834215
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22834534 aaggaaccaaccgcggcgtcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgatcaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcat 22834435  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| |||| |||| || | |  |||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || ||    
T  22834434 tcaagatggtggagttaaagaccgtgacagagcaattgacggagttcaacaaaattcttgatgatttggagaacattgaggtgcaaattgaggacgaaga 22834335  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  22834334 taaaactatactcttgttgtgtgctctaccgagatcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcaccgtcaccttggaagaaatt 22834235  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaa 333  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22834234 caagcggctttgagaaccaa 22834215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 3315367 - 3315566
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  3315367 agcaaaggaaccaaccgcgacatcgatgtgtgcaaagttggaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactttat 3315466  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3315467 tcattcaagatggtagagtcaaaggccatcacggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttagagaacattgaggtgcatcttgaggatg 3315566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28101581 - 28101382
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28101581 agcaaaagaaccaaccgcgacatcaatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggtaattcctaaagtaacaactctac 28101482  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28101481 tcattcaagatggtaaagttaaaggccatcatggagctacttatggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatg 28101382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 42990984 - 42991183
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  42990984 agcaaaggaacgaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttatatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttac 42991083  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||| || ||||||  |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||    
T  42991084 tcattcaatatggtaaagtcaaaggccttcttggagctgcttgtggagttcaacaaaatcattgctgatttggagaacattaagttgcgacttgaggatg 42991183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43423030 - 43422844
Alignment:
Q  21 caaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||  ||||    
T  43423030 caaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcccaaatcaacaactttactcatt--ggat 43422933  T
Q  121 ggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43422932 tgtaaagtcaaaggccatcatggagctacttgtcgagttcaacaaaatcattggtgatttgaagaacattgaggtgcatcttgaggatg 43422844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 53917245 - 53917048
Alignment:
Q  12 caaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactc 111  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  53917245 caaaggaaacaactgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactc 53917146  T
Q  112 attcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||  ||||||||||    
T  53917145 atttaagatggtaaagtcaaagaccatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatg 53917048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1620027 - 1619882
Alignment:
Q  30 catcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtc 129  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||   |    
T  1620027 catcgatgtggtcaaagttggagtctttgcatatgacaaagtctttggctcattggtaattcctaaagcaacaactctactcattcaagat-gaagcaac 1619929  T
Q  130 aaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatg 176  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1619928 aaaatccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatg 1619882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 260 - 391
Target Start/End: Original strand, 5192816 - 5192944
Alignment:
Q  260 ttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttga 359  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5192816 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga 5192915  T
Q  360 gagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtc 391  Q
        |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  5192916 ---ctcatgaacacggtgagggcctaagtgtc 5192944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 151
Target Start/End: Original strand, 25634589 - 25634703
Alignment:
Q  37 gtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggcc 136  Q
    |||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25634589 gtggtcaaagttagagtctttatatatgacaaagtctttgactcatcagcaattcctaaagccacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaggcc 25634688  T
Q  137 atcatggagcaactt 151  Q
    |||||||||||||||    
T  25634689 atcatggagcaactt 25634703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 32479860 - 32479681
Alignment:
Q  16 ggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattc 115  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||     
T  32479860 ggaagctaccgcagcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattt 32479761  T
Q  116 aggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggt 195  Q
    | |||||| ||||| ||  | |||  ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||  || ||||||||    
T  32479760 aagatggtggagtctaaatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaggt 32479681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8516614 - 8516435
Alignment:
Q  16 ggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattc 115  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||     
T  8516614 ggaagctaccgcggcatcgatgtgggcaaagttagagtcattatatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattt 8516515  T
Q  116 aggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggt 195  Q
    | |||||| ||||| ||  | |||  ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||  || ||||||||    
T  8516514 aagatggtggagtctaaatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaggt 8516435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 110
Target Start/End: Original strand, 53597915 - 53598011
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctact 110  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  53597915 aaggaatcaaccgcggcatcgatgtggtcaaaattgaagtctttgtatatgacaaagtctttacctcatcggcaatttctaaagcaagaactctact 53598011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 405 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 35919017 - 35918946
Alignment:
Q  405 gtggaggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35919017 gtggaggtagaggtaaccggggaaagagtggtaacaagtcaaagtctgaatgctttaactgtcacaagatgg 35918946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30845049 - 30844876
Alignment:
Q  34 gatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaag 133  Q
    |||||||| || |||||| || |||||||| || ||||| ||||||||| | |||||| | |  ||| |||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  30845049 gatgtgggaaaggttggagtcgttgtatataaccaagtcattggctcatagacaattcatcatacaaaaactctactcattcagaatggtggaatctaaa 30844950  T
Q  134 gccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 207  Q
     ||||||| |||||| | ||  |||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| ||| || |||||||    
T  30844949 accatcatagagcaattgacaaagttcaacaaaatccttgatgatttggtgcacattgaagtgaaaattgagga 30844876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 347
Target Start/End: Original strand, 54189161 - 54189446
Alignment:
Q  62 atgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttca 161  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||  || || |||||||||||||  | | | ||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||    
T  54189161 atgaccaagtctttggcacatagacaatgtctgaaacaacaactctacttttaccgaatggtggagtcaaaacctataatggagcaactgacggagttca 54189260  T
Q  162 acaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgtt 261  Q
    | || ||  ||||| | |||| ||| || || ||  | || || || |||||||||||  ||| | ||||||||||| |||| |  || |||||    ||    
T  54189261 ataagattattgataatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctgttgtgtgctttacctaggtcctttgagaattt 54189360  T
Q  262 caaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||  |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  54189361 caaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttgaccaagt 54189446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10612102 - 10612022
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10612102 atactatgctctatggcaaagacggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttgaccaagt 10612022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 177
Target Start/End: Original strand, 20628753 - 20628895
Alignment:
Q  35 atgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaagg 134  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||  ||| ||||||| | ||||||| ||||| | || ||      
T  20628753 atgtgggaaaggttggattatttgtatatgaccaagtcattggctcatagacaattactaacacaaaaactctattaattcagggtggtaaaatctaaat 20628852  T
Q  135 ccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatga 177  Q
    | ||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  20628853 caatcatagagcaattgacggagttcaacaaaatcattgatga 20628895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23409857 - 23409742
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| | |||||| | ||||| ||| |||| || || || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  23409857 aaggaacctaccgcggcgtcgatatggtcaaattttgagtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaactccttaagcaacaactctacttat 23409758  T
Q  114 tcaggatggtagagtc 129  Q
    | | |||||| |||||    
T  23409757 ttaagatggtggagtc 23409742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 347
Target Start/End: Original strand, 10897656 - 10897941
Alignment:
Q  62 atgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttca 161  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||  || || |||||||||||||  | | | ||||| ||||||||  | || || |||||||| ||||||||||    
T  10897656 atgaccaagtctttggcccataggcaatgtctgaaacaacaactctacttttaccgaatggtggagtcaaaacctataatcgagcaactgacggagttca 10897755  T
Q  162 acaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgtt 261  Q
    | || ||  ||||||| |||| ||| || || ||  | || || || |||||||||||  ||| | |  |||||||| |||| |  || |||||    ||    
T  10897756 ataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctactgtgtgctttacctaggtcctttgagaattt 10897855  T
Q  262 caaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||  |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||    
T  10897856 caaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagttttgagaaccaaagagttgaccaagt 10897941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Original strand, 6304167 - 6304247
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||    
T  6304167 atactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 6304247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10205016 - 10204936
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||    
T  10205016 atactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 10204936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22625304 - 22625224
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||    
T  22625304 atactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 22625224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29913280 - 29913200
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  29913280 atactatgctttatggcaaatagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttgaccaagt 29913200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 47882213 - 47882133
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  47882213 atactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcaactttgagaaccaaagagttgaccaagt 47882133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10098120 - 10098041
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaag 346  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||    
T  10098120 atactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaag 10098041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 129
Target Start/End: Original strand, 3324114 - 3324228
Alignment:
Q  16 ggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgac-aaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcatt 114  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| | ||| ||| || ||||||||| ||||| || | || ||||||||||| |||||    
T  3324114 ggaagctaccgcggcgtcgatgtgggctaagttggagtcattgtacaagacgaaaatcgttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcatt 3324213  T
Q  115 caggatggtagagtc 129  Q
    || |||||| |||||    
T  3324214 caagatggtggagtc 3324228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 333
Target Start/End: Original strand, 16458322 - 16458388
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaa 333  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  16458322 atactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagttttgagaaccaa 16458388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 359
Target Start/End: Original strand, 9602711 - 9602756
Alignment:
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttga 359  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  9602711 caagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 9602756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16263585 - 16263540
Alignment:
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttga 359  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  16263585 caagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 16263540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Original strand, 28489992 - 28490072
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  28489992 ataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagt 28490072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 477
Target Start/End: Original strand, 44725290 - 44725757
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44725290 agcaaaggaaccaaccgcggcatcgatttgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagtaacaactctac 44725389  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44725390 ttattcaggatggtggagtcaaaggccatcatagagcaacttatggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 44725489  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44725490 aggataaagctatactcttgttttgtgctataccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaagaaggcactgttatcttggaaga 44725589  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44725590 agttcaagcggctttgagaaccaagaagttgaccaagtccaaggacttgagagttcatgaacacggtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatgatgga 44725689  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatggt 477  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44725690 ggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgtcacaagatggt 44725757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 1048862 - 1048399
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1048862 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggcgcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 1048763  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1048762 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 1048663  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1048662 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctatcgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 1048563  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1048562 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgagggcctaagtgtcacaagagggaatggtgga 1048466  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1048465 ggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgg 1048399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 38394701 - 38395162
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394701 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 38394800  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394801 tcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 38394900  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38394901 aggataaagctatactcttgttgtgtgctct--cgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 38394998  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38394999 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgaaggcctaagtgtctcaagagggaatggtgga 38395095  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  38395096 ggtataggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaggtttgaatgctttaattgtcacaagatgg 38395162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 7351224 - 7350761
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351224 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 7351125  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7351124 tcattcaagatggtagagtcaaaggtcatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggacg 7351025  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7351024 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 7350925  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7350924 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgagggcctaagtgtcacaagagggaatggtgga 7350828  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7350827 ggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaggcttgaatgctttaactgtcacaagatgg 7350761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 7094034 - 7093571
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7094034 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggagtctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctac 7093935  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7093934 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 7093835  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7093834 aggataaatttatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 7093735  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||     ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7093734 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---cccatgaacatggtgaaggcctaagtgtctcaagagggaacggtgga 7093638  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7093637 ggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaaacctgaatgctttaactgtcacaagatgg 7093571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 22135518 - 22135981
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135518 agcaaaggaagcaaccgcggcatcaatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 22135617  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22135618 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggacg 22135717  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22135718 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 22135817  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22135818 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgagggcctaagtgtcacaagagggaatggtgga 22135914  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  22135915 ggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcataagatgg 22135981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 40550545 - 40551008
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40550545 agcaaaggaagcaaccgcggcatcaatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 40550644  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40550645 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggacg 40550744  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40550745 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 40550844  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40550845 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgagggcctaagtgtcacaagagggaatggtgga 40550941  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  40550942 ggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcataagatgg 40551008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 36165 - 36628
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36165 agcaaaggaagctaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttagctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 36264  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36265 tcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtacaacttgaggatg 36364  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36365 aggataaagctatactcttattgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaaaataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 36464  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36465 aattcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaactccaaggacttga---ctcatgaacacgatgaaggcctaagtgtctcaagagggaatggtgga 36561  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  36562 ggtagaggtaaccggagaaagagcggtaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgg 36628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 13290072 - 13289611
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13290072 agcaaaggaaccaaccgggacattgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgacaaagtctttggctcatcggtaattcctaaagcaacaactctac 13289973  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  13289972 tcattcaagatggtggagttaaaggccatcatggagcaacttatggagttcaacaaattccttgatgacttggagaatatggaggtgcatcttgacgatg 13289873  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||   |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13289872 aagataaagctatactcttgttgtgtgctataccgagatctttttaatctttcatggataccatgttctatggcaaagaaggcactgtcacattggaaga 13289773  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||| | |||| | |||||||||||||||     
T  13289772 agttcaaacaactttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagatgatgaaaactttgaaggcccatgtgtttcaagagggaatggtgg- 13289674  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatg 475  Q
       |||||||||| | |||||||||||||||||| || || | | | ||||||||| |||||||||    
T  13289673 ---agaggtaaccggggaaagagtggtaacaagtaaaagtttaagttctttaactgtcacaagatg 13289611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 14 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 24816933 - 24816470
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24816933 aaggaaccaaccgcgacatcgatgcggtcaaagttggaatttttg------acaaagtctttggctcatctacaattcctaaagcaacaactctactcat 24816840  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||| |     
T  24816839 tcaagatggtggattcaaaggtcatcatggagcaacttacggagttcaacaaaattcttgatgacttggagatgattaaggtgcatcttgaagatgaagt 24816740  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctct-------atggcaaagaaggcactgttaccttgga 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24816739 taaagctatactcttgttgtgttctctaccaagatattttgaatcgttcaaagataccatgctctatggactatggaaaagaaggcactgttaccttgga 24816640  T
Q  307 agaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| || | ||||| || | |||||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  24816639 agaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgacccagtccaagaacttgaaagctgatgaaaacggggaaggcataagtgtttcaagagggaacggt 24816540  T
Q  407 ggaggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  |||||||||    
T  24816539 ggaggtagaggtaatcgtagaaaaagtggtaacaagtcaaggtttaaatgatttaactgtaacaagatgg 24816470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 35 - 476
Target Start/End: Original strand, 26213460 - 26213900
Alignment:
Q  35 atgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaagg 134  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||||| ||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26213460 atgtggtcaaatttggagtcattgtataggaccaaatctttggctcatttgcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagg 26213559  T
Q  135 ccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgtg 234  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  26213560 cc-tcatggagaaacttacagagttcaacaaaatctttgatgacttggagaatattgaggtgcctattgaggataaagataaagttatactcttgttgtg 26213658  T
Q  235 tgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaag 334  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  26213659 tgctctaccgagatcttttgaatccttcaagaataccatgatctatggcaaagaaggcactgtcaccatggaagaagttcaagtggctttaagaaccaat 26213758  T
Q  335 gagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaacccgagaaagagtg 434  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| |  |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  26213759 gagctgaccaagtccaaggacttgagagcttatgaaaatggtgaaggccttagtgtttcaagaggtaatggtggaggtagaggtaatcggggaaagagtg 26213858  T
Q  435 gtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||| ||  | | | ||||||||||| ||||||||||    
T  26213859 gtaacaagttaaattttaagtgctttaactgtcacaagatgg 26213900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 32 - 422
Target Start/End: Original strand, 48490065 - 48490455
Alignment:
Q  32 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaa 131  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  48490065 tcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatattacaaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaa 48490164  T
Q  132 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgtt 231  Q
    || || | ||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || || || ||| |||||||||     
T  48490165 agaccgtgatggagcatttaacggagttcaacaaaatccttaatgatttggagaacattgaggtgaaacttgaggacgaagaaaaggctgtactcttgtc 48490264  T
Q  232 gtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaacc 331  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48490265 gtgtgctctaccgagatcatttgaatccttcaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagttcaagcggctttaagaacc 48490364  T
Q  332 aaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaacc 422  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  48490365 aaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtttcaagaggaaatggtggaggtaaaggaaacc 48490455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18391697 - 18391297
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18391697 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 18391598  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  18391597 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 18391498  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || ||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18391497 caaggctatactcttgttgtgcgcactaccgaggtcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 18391398  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||    
T  18391397 caagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtgtcaaaaggaaatggtggaggta 18391298  T
Q  414 g 414  Q
    |    
T  18391297 g 18391297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 6594059 - 6593656
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6594059 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 6593960  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  6593959 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 6593860  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || |||||||||||||  || || |||||||  || |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6593859 caaggctatactcttgtattgcgcactaccgaggtcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 6593760  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||    
T  6593759 caagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtgtcaaaaggaaatggtggaggta 6593660  T
Q  414 gagg 417  Q
    ||||    
T  6593659 gagg 6593656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 47675666 - 47675255
Alignment:
Q  11 gcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctact 110  Q
    ||||||||| | |||||| | ||||||||| ||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  47675666 gcaaaggaacctaccgcggcgtcgatgtggtcaaagtttgagtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctaat 47675567  T
Q  111 cattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatga 210  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || | ||    
T  47675566 cattcaagatggtggagtcaaagactgtgatggagcaattaacggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttaagaacga 47675467  T
Q  211 ggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaa 310  Q
     || || | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47675466 agacaaggttatactcttgttgtgtgctctaccgagatcatttgaatccttcaaggataccatgctctgtggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaa 47675367  T
Q  311 gttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggag 410  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||    |||| || ||||||  || ||||| | |||||| ||||||||||    
T  47675366 gttcaagcggctttaagaaccagggagttgaccaagtctaaggacttgagagcgggtgaaaacagtgaagttcttagtgtttcaagaggaaatggtggag 47675267  T
Q  411 gtagaggtaacc 422  Q
    ||||||||||||    
T  47675266 gtagaggtaacc 47675255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 42 - 443
Target Start/End: Original strand, 6047231 - 6047632
Alignment:
Q  42 caaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcat 141  Q
    |||| ||||| || ||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  6047231 caaatttggagtcgttgtatatgaacaaatctttggctcatacgcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagtccatcat 6047330  T
Q  142 ggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgtgtgctcta 241  Q
      || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||  || ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6047331 tcagtaacttacggagttaaacaatatccttgatgacttggagaacattgagatgcatttttaggatgaagataaagttattctcttgttgtgtgctcta 6047430  T
Q  242 ccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatga 341  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |    
T  6047431 ccgagatcttttgaatccttcaaggataccattctatatggcaaagaaggcattgtcaccttggaagaagttcaagcggctttgagaatcaacgagttta 6047530  T
Q  342 ccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaa 441  Q
    ||||||||||  ||||||||  | ||||| || ||||| ||||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||    
T  6047531 ccaagtccaagaacttgagaactgatgaaaacggtgaacgcctaagtgtctcgagagggactagtggaggtaaaggtaatcggggaaagagtggtaacaa 6047630  T
Q  442 gt 443  Q
    ||    
T  6047631 gt 6047632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31159262 - 31159049
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31159262 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaa-------------gtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 31159176  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31159175 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggacg 31159076  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  31159075 aggataaagctatactcttgttgtgtg 31159049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 232 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 31157636 - 31157395
Alignment:
Q  232 gtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaacc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  31157636 gtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagatatcatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcagctttgagaact 31157537  T
Q  332 aaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaacccgagaaaga 431  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31157536 aaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgatggcctaagtgtcacaagagggaatggtggaggtagaggtaaccggagaaaga 31157440  T
Q  432 gtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31157439 gtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaacatgg 31157395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 24749322 - 24749501
Alignment:
Q  30 catcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtc 129  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24749322 catcgatgtgggcaaagttgaaatctttgtatatgacaaagtctttggctgatcggcaattcctaaagcaataactctactcattcaggatggtggagtc 24749421  T
Q  130 aaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24749422 aaaggccatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatg 24749501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7471552 - 7471367
Alignment:
Q  12 caaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactc 111  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  7471552 caaaggatacaaccgcggcatcgatgtggtcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactc 7471453  T
Q  112 attcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgc 197  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  7471452 attcaagatggtaaagtaaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgc 7471367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 197
Target Start/End: Original strand, 28486280 - 28486467
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  28486280 agcaacggaaacaaccgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggaaagtcctaaagcaacaactttac 28486379  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgc 197  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  28486380 tcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgc 28486467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 21678785 - 21678973
Alignment:
Q  21 caaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggat 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  21678785 caaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatctttgtattttacaaagtctttggctcatcggcagttcctaaagcaacaactttactcattcaagat 21678884  T
Q  121 ggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||| | | |||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  21678885 ggtaaaataaaaggcaatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 21678973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Original strand, 20298048 - 20298206
Alignment:
Q  28 gacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagag 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  20298048 gacatcgatgtgggcaaagtcggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaag 20298147  T
Q  128 tcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaa 186  Q
    ||||||||| |||||||||  |||  |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  20298148 tcaaaggccttcatggagctgcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaa 20298206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 6570647 - 6570872
Alignment:
Q  32 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaa 131  Q
    ||||||||| |||||||| | || ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||    
T  6570647 tcgatgtggtcaaagttgcagtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctcctcattcaagattgtggagtcaa 6570746  T
Q  132 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgtt 231  Q
    || || | |  |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||  || || ||||| |||||||| ||    
T  6570747 agaccgtaacagagcaattaacggagttcaataaaatacttgatgatttggagaacattgaggtgaaacctgagggcgaagacaaagcgatactcttatt 6570846  T
Q  232 gtgtgctctaccgaaatcttttgaat 257  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||    
T  6570847 gtgtgctctaccgagatcatttgaat 6570872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 3890938 - 3890642
Alignment:
Q  36 tgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggc 135  Q
    |||||||||||||| | |  ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||| ||||| |  ||||  ||||||||||     
T  3890938 tgtgggcaaagttgaagttattgtatatgaccaagcctttgactcataggcaattcctaaaaccaaaactctattcattaaatatgggggagtcaaaggt 3890839  T
Q  136 catcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgtgt 235  Q
    ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||| | ||| |  | |||| || ||||||||| |||    
T  3890838 catcatgaagcaactaatagagttcaacaaaatccttaatgatatggagaacattgaggtgcatcttaaagataaaaacaaagttaaactcttgttttgt 3890739  T
Q  236 gctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaa 333  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||  ||||| || ||||||||| ||||||    
T  3890738 gctctacctagatcgtttgaatcgttcaaa-agtccatgctctatggcaacgaagacactgtcaccttagagaaagtttaaacggctttgaaaaccaa 3890642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 4295502 - 4295401
Alignment:
Q  22 aaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatg 121  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4295502 aaccgcggcatcgatgtgggaaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatg 4295403  T
Q  122 gt 123  Q
    ||    
T  4295402 gt 4295401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 12405856 - 12405691
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||    
T  12405856 gaagctaccgcgacatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattca 12405757  T
Q  117 ggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 182  Q
     |||||| ||||| ||  | |||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  12405756 agatggtggagtctaaatcaatctcggagcaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 12405691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 24261891 - 24262056
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||    
T  24261891 gaagctaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattca 24261990  T
Q  117 ggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 182  Q
     |||||| ||||| ||  | |||  ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  24261991 agatggtggagtctaaatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 24262056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16884447 - 16884268
Alignment:
Q  16 ggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattc 115  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||     
T  16884447 ggaagctaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattt 16884348  T
Q  116 aggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggt 195  Q
    | |||||| ||||| ||  | |||  ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||  || ||||||||    
T  16884347 aagatggtggagtctaaatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaggt 16884268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 3903869 - 3903694
Alignment:
Q  154 ggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatctttt 253  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||||||||   | |||| ||||| |||    
T  3903869 ggagttcaacaaaattcttgataatttggagaacattgaggtgcatcttgaagatgaagacaaagttatactcttgttgtg---tatacctaaatcgttt 3903773  T
Q  254 gaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaa 333  Q
    ||||| ||| |  | ||||| |||||||||||||||| || ||| ||||| ||  ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  3903772 gaatccttc-aggagaccattctctatggcaaagaagacattgtcaccttagagaaagtttaagtggctttgaaaaccaa 3903694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4294181 - 4294091
Alignment:
Q  119 atggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  4294181 atggtaaagtcaaaggccttcatggagctacttatggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttggggatg 4294091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 129
Target Start/End: Original strand, 5817753 - 5817865
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||| ||||| || || || | || |||||||||||||||||||    
T  5817753 gaagctaccgcggcatcgatgtgggctaagttggagtcattgtatatgacaaaatcgttgactcataggaaactcttgaaacaacaactctactcattca 5817852  T
Q  117 ggatggtagagtc 129  Q
     |||||| |||||    
T  5817853 agatggtggagtc 5817865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 18413177 - 18413065
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| |||||| |||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| || | || ||||||||||| |||||||    
T  18413177 gaagctaccgcggcatcgatgtgagctaagttggagtcattgtacatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattca 18413078  T
Q  117 ggatggtagagtc 129  Q
     |||||| |||||    
T  18413077 agatggtggagtc 18413065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 209
Target Start/End: Original strand, 9679498 - 9679572
Alignment:
Q  135 ccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9679498 ccatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatg 9679572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 347
Target Start/End: Original strand, 7070446 - 7070731
Alignment:
Q  62 atgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttca 161  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||  || || |||||||||||||  |   | ||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||    
T  7070446 atgaccaagtctttggcacataggcaatgtctgaaacaacaactctacttttatcgtatggtggagtcaaaacctataatggagcaactgacggagttca 7070545  T
Q  162 acaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgtt 261  Q
    | || ||  ||||||| |||| ||| || || ||  | || || || |||||||||||  ||| | |  |||||||| |||| |  || |||||    ||    
T  7070546 ataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctactgtgtgctttacctaggtcctttgagaattt 7070645  T
Q  262 caaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||  |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  7070646 caaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcggctttgagaaccaaagagttaaccaagt 7070731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 477 - 516
Target Start/End: Original strand, 44725740 - 44725779
Alignment:
Q  477 taactgtcacaagatggtggaggtagagaatgctttaact 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44725740 taactgtcacaagatggtggaggtagagaatgctttaact 44725779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 347
Target Start/End: Original strand, 25352003 - 25352288
Alignment:
Q  62 atgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttca 161  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||  || || |||||||||||||  | | | ||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||    
T  25352003 atgaccaagtctttggcacatagacaatgtctgaaacaacaactctacttttaccgaatggtggagtcaaaacctataatggagcaactgacggagttca 25352102  T
Q  162 acaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgtt 261  Q
    | || ||  ||||||| |||| ||| || || ||  | || || || |||||||||||  ||| | |  |||||||| |||| |  || |||||    ||    
T  25352103 ataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctactgtgtgctttacctaggtcctttgagaattt 25352202  T
Q  262 caaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||  |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||    
T  25352203 caaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 25352288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3324112 - 3324032
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||    
T  3324112 atactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 3324032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21645544 - 21645432
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||||  |||| || | || |||||||| || |||||||    
T  21645544 gaagctaccgcgacatcgatgtgggctaagttggagttattgtacatgacgaaatctttagctcataagcaactcttgaaacaacaactttattcattca 21645445  T
Q  117 ggatggtagagtc 129  Q
     |||||| |||||    
T  21645444 agatggtggagtc 21645432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21988189 - 21988097
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttga 359  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  21988189 ataccatcctttatggtaaagagggcactactactttgaaggaagtccaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 21988097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Original strand, 25406270 - 25406350
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||    
T  25406270 atactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 25406350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 49091183 - 49091031
Alignment:
Q  30 catcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtc 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||| ||||| || | || |||||| |||| ||||||| |||||| |||||    
T  49091183 catcgatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatcgttggctcataggcaactcttgaaacaacaattctattcattcaagatggtggagtc 49091084  T
Q  130 aaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 182  Q
     ||  | |||  ||||||| | | ||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  49091083 taaatcaatctcggagcaattgatggaatttaacaaaattcttgatgatttgg 49091031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 3903978 - 3903899
Alignment:
Q  35 atgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcatt 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| | | ||||||||||| ||| |  ||||||||||    
T  3903978 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgaccaagtctttgactcctagacaattcctaaaacaaaatttctactcatt 3903899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21988420 - 21988327
Alignment:
Q  36 tgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtc 129  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| ||||| || | || ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21988420 tgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatcgttggatcataggcaactcttgaaacaacaactctactcattcaagatggtggagtc 21988327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 44015985 - 44015924
Alignment:
Q  272 atgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaa 333  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  44015985 atgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaa 44015924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18412927 - 18412835
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttga 359  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  18412927 ataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 18412835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 359
Target Start/End: Original strand, 5818051 - 5818096
Alignment:
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttga 359  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  5818051 caagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 5818096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 129
Target Start/End: Original strand, 9185724 - 9185837
Alignment:
Q  16 ggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattc 115  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||| |||||||| || |||||  |||  || |||||||||||| ||||  ||   || ||||||||||| ||||||    
T  9185724 ggaagctaccgtggcatcgatgtgggctaagttggagtcattgtacgtgatgaaatctttggctcataggcagctctcgaaacaacaactctattcattc 9185823  T
Q  116 aggatggtagagtc 129  Q
    | |||||| |||||    
T  9185824 aagatggtggagtc 9185837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 359
Target Start/End: Original strand, 9186022 - 9186067
Alignment:
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttga 359  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  9186022 caagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 9186067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21645247 - 21645202
Alignment:
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttga 359  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  21645247 caagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 21645202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 49090899 - 49090854
Alignment:
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttga 359  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  49090899 caagcggctttgagaaacaaggaattgaccaagttcaatgacttga 49090854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 22134190 - 22133727
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134190 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttttatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 22134091  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134090 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 22133991  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22133990 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 22133891  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||      
T  22133890 agttcaagcggctttgagaaccaagcagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgagggcctaagtgtctcaagagggaatggtgtt 22133794  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22133793 ggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgg 22133727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 22782310 - 22781847
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22782310 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctac 22782211  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22782210 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggacg 22782111  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22782110 aggataaagatatactcttgttgtgcgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 22782011  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22782010 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgagggcctaagtgtcacaagagggaatggtgga 22781914  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22781913 ggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaggcttgaatgctttaactgtcacaagatgg 22781847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 11008141 - 11007678
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  11008141 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggaaaagatggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgaatctac 11008042  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11008041 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcgacttgaggatg 11007942  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11007941 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 11007842  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  11007841 agttcaagtggctttgagaaccaaggagttgactaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgagggcctaagtgtctcaagagggaatggtgaa 11007745  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11007744 ggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgg 11007678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 16933721 - 16933258
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16933721 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaaacaacgactctac 16933622  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933621 tcattcaggatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 16933522  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16933521 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagatatcatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 16933422  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16933421 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgatggcctaagtgtcacaagagggaatggtgga 16933325  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||    
T  16933324 ggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggcttgaatgctttaactttcacaagatgg 16933258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 22046288 - 22045825
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22046288 agcaaagtaagcaacctcggcatcgatgtgggcaaatttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctac 22046189  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046188 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 22046089  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22046088 aggataaagctatactcttgttgtctgctctaccgaaatctattgaatcgtttaaagataccatgctctttggcaaggaaggcattgttaccttggaaga 22045989  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22045988 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgagggcctaagtgtctcaagagggaatggtgga 22045892  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  22045891 ggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcataagatgg 22045825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 12402668 - 12402203
Alignment:
Q  11 gcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctact 110  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12402668 gcaaaggaaccaaccgtgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctact 12402569  T
Q  111 cattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatga 210  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12402568 cattcaggatggtggagtcgaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccgtgatgacttggagaatattgaggtgcaacttaaggatga 12402469  T
Q  211 ggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaa 310  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12402468 agataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctacggcaaagaaggcactattacctttgaagaa 12402369  T
Q  311 gttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggag 410  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| || || | | || ||||| |  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12402368 gttcaagcggatttgagaaccaagaagttgaccaagtccaaggatttcatattttatgaaaatggtgaaggcctaaatgtctcaagagggaatggtggag 12402269  T
Q  411 gtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12402268 gtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaagtctgaatgctttaactgtcacaagatgg 12402203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 12400394 - 12399928
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12400394 agcaaaggagccaaccgtgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtat-tgaaaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 12400296  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12400295 tcattcaggatggtggaatcgaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccgtgatgacttggagaatattgaggagtaacttgaggatg 12400196  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcac-tgttaccttggaag 308  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  12400195 aagataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaagaaggcacttgttaccttggaaa 12400096  T
Q  309 aagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||| || ||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12400095 aagttcaagcggctttgagaaccaggaagttgaccaagtccaaggacttgagaatttatgaaaacggtgaaggcctaaatgtctcaagagggaatggtgg 12399996  T
Q  409 aggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  12399995 aggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaagtctgaatgctttaactgtcataagatgg 12399928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 9176045 - 9175587
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9176045 agcaaaggaagcaaccacgacatcgatgtgggaaaagtgggaatctttgtatatgacaaagtctttggctgatcggcaattcctaaagcaacgactctac 9175946  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9175945 tcattcaggatggaagactcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggacg 9175846  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9175845 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctcaatggcaaggaaggcactgctaccttggaaga 9175746  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9175745 agttcaagcggctttgagaatcaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacaaggtgagggcctaagtgtcacaagagggaatggtgga 9175649  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaa 471  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  9175648 ggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaggcttgaatgctttaattgtcacaa 9175587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 14 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 52094888 - 52094480
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52094888 aaggaacctaccgcggcatcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 52094789  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| || |||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||    
T  52094788 tcaagatggtggattcaaagaccgtgatggagcaattgacggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacaaaga 52094689  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  52094688 caaggttatactcttgttgtgtgctctaccgagatcatttgaattcttcaaagataccatgctctatggcaaagaaggcattgtcaccttggaagaagtt 52094589  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | |||||  |||||||||||||    
T  52094588 caagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaatgacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtttcaagagaaaatggtggaggta 52094489  T
Q  414 gaggtaacc 422  Q
    |||||||||    
T  52094488 gaggtaacc 52094480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Original strand, 8394060 - 8394463
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8394060 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattcctcaagcaacaactctactcat 8394159  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  8394160 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 8394259  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8394260 caaggctatactcttgttgtgtgctctaccgagatcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 8394359  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | ||  ||||||||||| ||||    
T  8394360 caagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtttcaaaggggaatggtggtggta 8394459  T
Q  414 gagg 417  Q
    ||||    
T  8394460 gagg 8394463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Original strand, 5136734 - 5137137
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5136734 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 5136833  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  5136834 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 5136933  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || ||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5136934 caaggctatactcttgttgtgcgcactaccgaggtcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 5137033  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||    
T  5137034 caagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtgtcaaaaggaaatggtggaggta 5137133  T
Q  414 gagg 417  Q
    ||||    
T  5137134 gagg 5137137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 476
Target Start/End: Original strand, 26558348 - 26558813
Alignment:
Q  11 gcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctact 110  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||||| |  || |||||| ||  |||||| | |||||| ||||||||||    
T  26558348 gcaaaggaaccaaccgcggcatggatatggtcaaagttggagtcgttgtatatgaccatatccttggcttatatgcaatttcgaaagcatcaactctact 26558447  T
Q  111 cattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatga 210  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||  ||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26558448 cattcaagatggtggagtcaaaggccatcactgagcaactcacatagttcaacaaattccttgaagatttggaaaatattgaggtgcatcttgaggatga 26558547  T
Q  211 ggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaa 310  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||  |||  |||||||    
T  26558548 agataaagctatactcttgttgtgtgctttatcgagatctttcgaatctttcaaggataccatgctctaaggcaaaaaaggcactgccacccaggaagaa 26558647  T
Q  311 gttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggag 410  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  26558648 gttcaaacgactttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagttgatgaaaacagtgaagacctaagtgtttcaagagggaatgatggag 26558747  T
Q  411 gtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||   |||| | |||||||||||||| || | | | ||||||||  ||||||||||    
T  26558748 gtagaggtaaccgtggaaataatggtaacaagtcaaagtttaagtactttaactatcacaagatgg 26558813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Original strand, 7123350 - 7123753
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| ||| |||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  7123350 aaggaaccaaacgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcat 7123449  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  7123450 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 7123549  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7123550 caaggctatactcttgttgtgtgctctaccgagatcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 7123649  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   |||||  | |||||||||| ||||| | || ||| ||||||| |||||    
T  7123650 caagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaagcagtgaaggccttagtgtgtcaaaaggaaatggtgaaggta 7123749  T
Q  414 gagg 417  Q
    ||||    
T  7123750 gagg 7123753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 5872457 - 5872794
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5872457 aaggaaccaaccgcgccgtcgatgtggtcaaagttggagtcgttgcatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaaatctactcat 5872556  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  5872557 tcaagatggtggagtcaaagaccatgatggagcaattaatggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 5872656  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5872657 caaaactatacccttgttgtgtgctctaccgagatcatttgaatccttcaaggatatcatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 5872756  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  5872757 caagcggctttaagaaccaaggagttgaacaagtccaa 5872794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12395432 - 12395186
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12395432 agcaaaggagccaaccgtgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtat-tgaaaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 12395334  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12395333 tcattcaggatggtggaatcgaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccgtgatgacttggagaatattgaggagtaacttgaggatg 12395234  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaat 257  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12395233 aagataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaat 12395186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 38 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 5207165 - 5206781
Alignment:
Q  38 tgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggcca 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||| |||||||||| | ||| ||   || |||| ||     
T  5207165 tgggcaaagttggagtctttgtatatgacaaagtctttggctcatagacaaatcctaaatcaacaaatctactcatttaagatagtgaggttaaagaccg 5207066  T
Q  138 tcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgtgtgc 237  Q
    | ||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  5207065 taatggagcaactaacgacgttcaacaaaatcctttatgatttagagaacattgaggtgcatcttaaggatgaagacaaggctatactcttgttgtgtgc 5206966  T
Q  238 tctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggag 337  Q
    |||||| | ||| |||||||| ||| |  ||||||| |||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||    
T  5206965 tctaccaagatcatttgaatccttccaggataccatcctctatggaaaagaagacactatcaccttggaggaagtccaagcagctttaagaaccaagaag 5206866  T
Q  338 atgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacact-gtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaac 421  Q
     ||||||||||||| ||||||||||   ||||| | | ||||||||||||| || | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  5206865 ttgaccaagtccaaggacttgagagcgaatgaaaaatagtgaaggcctaagcgtttcaagagggaatgacggaggtagaggtaac 5206781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 43 - 422
Target Start/End: Original strand, 4588623 - 4589001
Alignment:
Q  43 aaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatg 142  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |  | |      
T  4588623 aaagttggagtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaattctactcattcaagatggtggagtcaaagactgtaaca 4588722  T
Q  143 gagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgtgtgctctac 242  Q
    |||||| | || ||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||| | ||| | |||||||| || |  ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  4588723 gagcaattaacagagttcaacaaaatcgttgatgattaggagaacattcaagtgaatcttgaggacgaaggaaaagctatactcttgttctgttctctac 4588822  T
Q  243 cgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgac 342  Q
    ||| ||| |||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4588823 cgagatcatttgaatccttcaaggataccatgctctattgcaaataagacactgtcaccatgaacgaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgac 4588922  T
Q  343 caagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaacc 422  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||| |  |||||| ||| ||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4588923 caagtccaaagacttgagag-ggatgaaaatagtgaagaccttagtgtttcaagaggaagtggtggaggtagaggtaacc 4589001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12743454 - 12743204
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| | |||||| | ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  12743454 aaggaacctaccgcggcgtcgatgtggtcaaagttgaaatcattgtatatgaccaagtctttggcttataggcaattccttaagaaacaactatactcat 12743355  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  12743354 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattaacggagttcaacaaaatctttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 12743255  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaa 264  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  12743254 caaggctatactcttgttgtgtgctctaccgagatcatttgaatccttcaa 12743204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 196
Target Start/End: Original strand, 47563515 - 47563701
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  47563515 agcaaaggatacaaccgcgacatcgatgtgggaaaagttggaatctttgtatatgacaaagtcgttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactttac 47563614  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtg 196  Q
    ||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||  |||||||||    
T  47563615 tcattcaagatggtaaatttaaaggccatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagagcattgaggtg 47563701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18537073 - 18536898
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18537073 aaggaaccaatcgcggcatcgatgtggtcaaagttcgtatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactttactcat 18536974  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 190  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  18536973 tcaagatggaagagtcgaaggccatcatggagcaacttgcggagttcaacagaat-cttgatgacttggaaaatatt 18536898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36921071 - 36920884
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||  ||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||    
T  36921071 agcaaaggatccaatcgcggcatcgatgtggtcaaagtttgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcattggcaagtcttaaagcaacaactttac 36920972  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgc 197  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  36920971 tcattcaagatggtaaagtcaaaggccatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgc 36920884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22802308 - 22802111
Alignment:
Q  12 caaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactc 111  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22802308 caaaggaaacaaccgcgacatcaatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactc 22802209  T
Q  112 attcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| | || |||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  22802208 attcaagatggtaaagtcaaaggtcgtcgtggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgattttgagaacattaagttgcatcttgaggatg 22802111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 267 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12749211 - 12749056
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttca 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |    
T  12749211 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcacctttgaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagtgga 12749112  T
Q  367 tgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaacc 422  Q
    |||| || |||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12749111 tgaaaacagtgaaggccttagtgtttcaagaggaaatggtggaggtagaggtaacc 12749056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14788993 - 14788807
Alignment:
Q  23 accgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatgg 122  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  14788993 accgcggcatcgatgtggtcaaagatcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatgg 14788894  T
Q  123 tagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||  ||||||||||    
T  14788893 taaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatg 14788807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Original strand, 10113639 - 10113802
Alignment:
Q  31 atcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtca 130  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  10113639 atcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgactaagtctttggctcacaggcaattcctaaatcaacaactctactcattcaagacggtggagtca 10113738  T
Q  131 aaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 194  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  10113739 aaggccatcatggagcgactaacagagttcaacaaaatccttgatgatttggaaaacattgagg 10113802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 267 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12741005 - 12740850
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttca 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   |    
T  12741005 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcacctttgaagaagttcaagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcgga 12740906  T
Q  367 tgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaacc 422  Q
    |||| || |||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12740905 tgaaaacagtgaaggccttagtgtttcaagaggaaatggtggaggtagaggtaacc 12740850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3578263 - 3578083
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||||    
T  3578263 aaggaaccaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttggagtctttatatatgacaaagtctttggatcatcgccaacttttaaagcaacaactctactcat 3578164  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 194  Q
    ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || || | |||| | |||||||| |||||||    
T  3578163 tcaagatggtggagacaaagtccatcatggagcaacttacagagttcaaaaatattcctgattatttggagaacattgagg 3578083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 16454074 - 16454262
Alignment:
Q  21 caaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggat 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  16454074 caaccgcgacatcgatgtggtcaaattttgaatatttgtatacgacaaagactttggctcatcgacaagtcctaaagcaacaactttactaattcaagat 16454173  T
Q  121 ggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  16454174 ggtaaagtcaaaggccaccatagagctaattgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 16454262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 9224972 - 9225137
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||    
T  9224972 gaagctaccgcggcatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattca 9225071  T
Q  117 ggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 182  Q
     |||||| ||||| ||  | |||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  9225072 agatggtggagtctaaatcaatctcggagcaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 9225137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 36379048 - 36379148
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||| | ||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  36379048 aaggaaccaaccgtggcatcgatgtagtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 36379147  T
Q  114 t 114  Q
    |    
T  36379148 t 36379148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 368 - 476
Target Start/End: Original strand, 5099598 - 5099706
Alignment:
Q  368 gaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgcc 467  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||| |    
T  5099598 gaacacggtgaaggtctaagtgtctcaagagggaatgatggaggtacaggtaaccggagaaagagtggtaaaaagtcaacgtttgaaagctttaactgtc 5099697  T
Q  468 acaagatgg 476  Q
    | |||||||    
T  5099698 ataagatgg 5099706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 129
Target Start/End: Original strand, 16624573 - 16624685
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||| || || || | || ||||||||||| |||||||    
T  16624573 gaagctaccgcggcatcgatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatcgttggctcataggaaactcttgaaacaacaactctattcattca 16624672  T
Q  117 ggatggtagagtc 129  Q
     |||||| |||||    
T  16624673 agatggtggagtc 16624685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 359
Target Start/End: Original strand, 15313174 - 15313266
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttga 359  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  15313174 atactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcaactttgataaccaaagagttgaccaagttcaaagacttga 15313266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 347
Target Start/End: Original strand, 4559067 - 4559142
Alignment:
Q  272 atgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  4559067 atgctttatggaaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcggctttgagaaccaaagagttaaccaagt 4559142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 166
Target Start/End: Original strand, 5350578 - 5350657
Alignment:
Q  87 aattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaa 166  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  5350578 aattcttaaaacaacaactctactcatttaagaaggtggagtcaaatgccgtcatggaccaacttatagagttcaacaaa 5350657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 399
Target Start/End: Original strand, 18913739 - 18913916
Alignment:
Q  222 tactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggc 321  Q
    |||||||||| |||||| |||| | ||||||||| |  |||||  |||||||| | |||||||| ||||||| ||| | ||| || |||||  |||| |     
T  18913739 tactcttgttttgtgctttacctagatcttttgagttcttcaaggataccatgatatatggcaaggaaggcattgtcaacttagaggaagtctaagcagt 18913838  T
Q  322 tttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagg 399  Q
     |||||||| |||||| | |||||||||||||| || ||| || ||||     |||||||| ||||||||| ||||||    
T  18913839 gttgagaactaaggagttaaccaagtccaatgatttaagatttgatgatagtggtgaaggcttaagtgtctcaagagg 18913916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 42191542 - 42191445
Alignment:
Q  35 atgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaa 132  Q
    |||||||| ||||| || || || || ||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  42191542 atgtgggctaagttagagtcattatacatgaccaagtcgttggttcatagtcaattcctaaaacaaaaactctactcatttaggatagtggagtcaaa 42191445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 355
Target Start/End: Original strand, 9225222 - 9225310
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgac 355  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  9225222 ataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaatgac 9225310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 267 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5147170 - 5147078
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttga 359  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||| |||||||    
T  5147170 ataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaagtccaagcggctttgagaaccaaacaattgaccaagttcaaggacttga 5147078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 383; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 73090 - 72624
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73090 agcaaaggaacgaactgcggcatctatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaaatctttgactcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 72991  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  72990 tcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatggagcaacttacagagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 72891  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  72890 aggataaaactatactcttgttatgtgctctatcgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 72791  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  72790 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagttcatgaacacggtgaaggcctaagtgtctcaagagggaatggtgga 72691  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  72690 ggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaagtctgaatgctttaactgtcacaagatgg 72624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 381; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 19503909 - 19503446
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19503909 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcaattcctaaagcaatgactctac 19503810  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19503809 tcattcaggatgatagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 19503710  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19503709 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaagtaaggcactgttaccttggaaga 19503610  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19503609 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgagggcctaagtgtctcaagagggaatggtgga 19503513  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19503512 ggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgg 19503446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 35217543 - 35217080
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35217543 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttatatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 35217444  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35217443 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggacg 35217344  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35217343 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 35217244  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35217243 agttcaagcagctttgagaaccaaggatttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgagggcctaagtgtcacaagagggaatggtgga 35217147  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35217146 ggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcacaagatgg 35217080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 36560714 - 36560251
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36560714 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 36560615  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36560614 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggacg 36560515  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36560514 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 36560415  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    ||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36560414 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaatacggtgatggcctaagtgtcacaagagggaatggtgga 36560318  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  36560317 ggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaaggcaaggtttgaatgctttaactatcacaagatgg 36560251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 21520267 - 21519804
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21520267 agcaaaggaaccaaccgcagcatcgatgtggccaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 21520168  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21520167 tcatttaggatggtggagttaaatgccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattaaggtgcaacttaaggatg 21520068  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21520067 aggataaagttatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcattcaaagatatcatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 21519968  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21519967 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgacccagtccaaggacttgagagtttattaacacagtgaaggcctaagtgtctcaagagggaatggtgga 21519868  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| ||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21519867 ggtagaggtaaccggagaaaga---ataacaagtcaaagtctgaatgctttaactgtcacaagatgg 21519804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 28569994 - 28569531
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||  |||||||||| || | ||||||||| || ||||| |||||||| ||  ||||||| ||| |||| |||||||    
T  28569994 aaggaaccaaccgcggaatcgatatgatcaaagttggagtcgtggtatatgaccaaatctttagctcatcgacagatcctaaaacaaaaactttactcat 28569895  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  28569894 tcaagatggtagagtcaaaggccatcatggatcaacttacggagttcaacaaaatccttgaagacatgaagactattaaggtgcatcttgaggatgaaga 28569795  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcac--tgttaccttggaagaag 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||| |||||||    
T  28569794 taaagttatactcttgttgtgtgctctaccgagatcttttaaatccttcaaggatatcatgctctatggcaaagaaggcacattgtcaacttagaagaag 28569695  T
Q  312 ttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggagg 411  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  28569694 ttcaagtgactttgagaaccaaggagatgaccaagtccaaggacttgagagctgatgaaaacggtgaagacctaagtgtttcaacagggaattgtggagg 28569595  T
Q  412 tagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatg 475  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||| ||| | || || |   ||||||||||| |||||||||    
T  28569594 tagaggtaaccggggaaagagtagtaccaaattaaagtttaggtgctttaactgtcacaagatg 28569531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22405499 - 22405317
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22405499 aaggaaccaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggcttatcagcaattcctaaagcaacgattctactcat 22405400  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtg 196  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22405399 tcaagatggtggagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttagagaatattaaggtg 22405317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 61 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 42019368 - 42019007
Alignment:
Q  61 tatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttc 160  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| || ||||| ||  |||| | |||||| |||||||||| |||| ||||| |||| ||  |||||    
T  42019368 tatgaccaagtctttggcttataggcaattcctaaaacaccaactttatacatttaagatggtggagtcaaaggtcatcgtggagtaactaacaaagttc 42019269  T
Q  161 aacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgt 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| | || |||| |||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||  |    
T  42019268 aacaaaatccatgatgacttggagaacattgaggtgcatcttaaggataaagacaaagttatactcttgttgtatgctataccgagatcatttgaattct 42019169  T
Q  261 tcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgag 360  Q
    ||||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| || |||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||    
T  42019168 tcaaggataccatgctctatttcaaagaaggcattgtcaccttggaggaattccaatcgacttttagaaccaagaagttaaccaagtccaaggacttgag 42019069  T
Q  361 agttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaacc 422  Q
    |||| ||||| |  |||||||| ||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  42019068 agttgatgaaaatagtgaaggcataagtatttccagagggaatgatggaggtagaggtaacc 42019007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6263723 - 6263528
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6263723 aaggaaacaaccgcggcatcgatgtggtcaaagttcagatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 6263624  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6263623 tcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttatggagttcaacaaaacagttggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatg 6263528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 19348796 - 19348631
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| | ||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  19348796 gaagctaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcatagacaactcttgaagcaacaactctactcattca 19348697  T
Q  117 ggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 182  Q
     |||||| ||||| ||  | |||  ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  19348696 agatggtggagtctaaatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 19348631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 34574731 - 34574627
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  34574731 agcaaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtcaaagttggagtctttgtatatgacaaagcctttggctcataggcaattccaaatgcaacaactctac 34574632  T
Q  110 tcatt 114  Q
    |||||    
T  34574631 tcatt 34574627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 25403169 - 25403004
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| || | || ||||||||||| |||||||    
T  25403169 gaagctaccgcggcatcgatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattca 25403070  T
Q  117 ggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 182  Q
     |||||| ||||| ||  | |||  ||||||| | ||||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  25403069 agatggtggagtctaaatcaatctcggagcaattgacggaatttaacaagattcttgatgatttgg 25403004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 23079035 - 23079200
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| || | || ||||||||||| |||||||    
T  23079035 gaagctactgcggcatcgatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattca 23079134  T
Q  117 ggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 182  Q
     |||||| ||||| ||  | |||  ||||||| |  |||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  23079135 agatggtggagtctaaatcaatctcggagcaattggcggaatttaacaaaattcttgatgatttgg 23079200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 347
Target Start/End: Original strand, 17932982 - 17933057
Alignment:
Q  272 atgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17932982 atgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcggctttgagaaccaaagagttgaccaagt 17933057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 347
Target Start/End: Original strand, 2736856 - 2737141
Alignment:
Q  62 atgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttca 161  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || || |||||||||||||  |   | ||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||    
T  2736856 atgaccaagtctttggcacataggcaatttctgaaacaacaactctacttttatcgtatggtggagtcaaaacctataatggagcaactgacggagttca 2736955  T
Q  162 acaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgtt 261  Q
    | || ||  ||||||| |||| ||| || || ||  | || || || |||||||||||  ||| | |  |||||||| |||| |  || |||||    ||    
T  2736956 ataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctactgtgtgctttacccaggtcctttgagaattt 2737055  T
Q  262 caaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||  |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | |||||||    
T  2737056 caaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagtttaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 2737141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 129
Target Start/End: Original strand, 10446008 - 10446120
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||| || || || | || ||||||||||| |||||||    
T  10446008 gaagctaccgcggcgtcgatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatcgttggctcataggaaactcttgaaacaacaactctattcattca 10446107  T
Q  117 ggatggtagagtc 129  Q
     |||||| |||||    
T  10446108 agatggtggagtc 10446120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Original strand, 39680902 - 39680982
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||    
T  39680902 atactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 39680982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20054085 - 20054005
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  20054085 atactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcaactttgagaaccaaagagttaaccaagt 20054005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25402919 - 25402827
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttga 359  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  25402919 ataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaagaggtccaagcggctttaagaaccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 25402827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22716763 - 22716492
Alignment:
Q  62 atgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttca 161  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||  || || |||||||||||||  | | | ||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||    
T  22716763 atgaccaagtctttggcacatagacaatgtctgaaacaacaactctacttttaccgaatggtggagtcaaaacctataatggagcaactgacggagttca 22716664  T
Q  162 acaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgtt 261  Q
    | || ||  ||||||| |||| ||| || || ||  | || || || |||||||||||  ||| | |  |||||||| |||| |  || |||||    ||    
T  22716663 ataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctactgtgtgctttacctaggtcctttgagaattt 22716564  T
Q  262 caaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaa 333  Q
    |||  |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  22716563 caaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagttttgagaaccaa 22716492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 22832 - 23295
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22832 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 22931  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22932 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggacg 23031  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23032 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 23131  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    ||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23132 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaatacggtgatggcctaagtgtcacaagagggaatggtgga 23228  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  23229 ggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgctttaactgtcataagatgg 23295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 330 - 793
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  330 agcaaaggaagcaaccgtggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagcctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctac 429  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  430 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgaaacttgaggatg 529  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  530 aggataaagttatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactattaccttggaaga 629  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  630 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtcaaaggacttga---ctcatgaacacggtgaaggcctaagtgtcacaagagggaatggtgga 726  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  727 ggtagaggtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaagtttgaatgctttaactgtcacaagatgg 793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 33309595 - 33310058
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33309595 agcaaaggaagcaaccgcagcatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 33309694  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33309695 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggacg 33309794  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33309795 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaaga 33309894  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    || |||| || |||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  33309895 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcgtgaatacggtgagggcctaagtgttacaagagggaatggtgga 33309991  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33309992 ggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaatgtttgaatgctttaactgtcacaagatgg 33310058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 26067968 - 26067505
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26067968 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcagcaattcctaaagcaacgactctac 26067869  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26067868 tcattcaggatggaagagtcaaaggccatcattgagcaacttacggagttcaaaaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggacg 26067769  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26067768 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactattaccttggaaga 26067669  T
Q  310 agttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtgga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26067668 agttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttga---ctcatgaacacggtgatggcctaagtgtcacaagagggaatggtgga 26067572  T
Q  410 ggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26067571 ggtagaggtaaccggagaaagagtggaaacaagtcaaggtttgaatgcttcaactgtcacaagatgg 26067505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 53 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 25462995 - 25462608
Alignment:
Q  53 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 152  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25462995 tctttgtatatgacaaagtcttaggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaggccatcatggagcaactta 25462896  T
Q  153 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttt 252  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| | ||||||| | ||||    
T  25462895 cggagttcaacaaaatctttgatgacttggagaatattgaggtgcatcttgaggatgaagataaatttatactcttgttgtgtaccctaccgaga-cttt 25462797  T
Q  253 tgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaat 352  Q
    |||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||     
T  25462796 tgaatctttcaaagatatcatgctttatggtaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcgactttgagaaccaaggagttgaccgagttcaag 25462697  T
Q  353 gacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaa 441  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  25462696 gacttgagaattgatgaaaacagtgaaggcctaagtgtttcaagagggaatggtgaaggtagaggtaatcggggaaagagtggtaacaa 25462608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Original strand, 16651578 - 16651982
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16651578 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcat 16651677  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggaga-atattgaggtgcaacttgaggatgagg 212  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  16651678 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatccttgatgacttggagacacattgaggtgcaacttgaggatgaag 16651777  T
Q  213 ataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagt 312  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16651778 acaaggctatactcttgttgtgtgctctaccgagatcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagt 16651877  T
Q  313 tcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggt 412  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | || ||| ||||||||||||    
T  16651878 tcaagtggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtgtcaaaaggaaatggtggaggt 16651977  T
Q  413 agagg 417  Q
    |||||    
T  16651978 agagg 16651982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Original strand, 16553318 - 16553721
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16553318 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcat 16553417  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  16553418 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatccttgatgacttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 16553517  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16553518 caaggctatactcttgttgtgtgctctactgagatcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 16553617  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||    
T  16553618 caagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccagggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtgtcaaaaggaaatggtggaggta 16553717  T
Q  414 gagg 417  Q
    ||||    
T  16553718 gagg 16553721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Original strand, 16629874 - 16630277
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16629874 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcat 16629973  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  16629974 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatccttgatgacttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 16630073  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16630074 caaggctatactcttgttgtgtgctctactgagatcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 16630173  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||    
T  16630174 caagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccagggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtgtcaaaaggaaatggtggaggta 16630273  T
Q  414 gagg 417  Q
    ||||    
T  16630274 gagg 16630277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 476
Target Start/End: Original strand, 12157961 - 12158423
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12157961 aaggaaccaaacgcgacatcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgacaaagtctttggctcattggcaattcctaaagcaagcactctactcat 12158060  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||    
T  12158061 tcaagatggtggagtcaaagaccaccatggagaaacttacagagttcaacaagatccttgatgatttggagaacattgaggtgcatcttgtggatgaaga 12158160  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||  || ||||| ||| |  |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  12158161 taaagatatactcttgttctgtgcgctaccgagattattggaatctttcgaggatacaatgatttatggcaaagaaggcactgtcaccttagaagatgtt 12158260  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| || | ||||| || ||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  12158261 caaacggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaaggatttgatagctgatgaaaacggtgaaggtctaagtgtttcaagagggcatggtggaggta 12158360  T
Q  414 gaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||| | ||||||| | ||||| |||||||  | | | ||||||||||| |||| |||||    
T  12158361 gaggtaatcagagaaagggcggtaaaaagtcaaaatttaagtgctttaactgtcacatgatgg 12158423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 443
Target Start/End: Original strand, 30444003 - 30444432
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  30444003 aaggaaccaaccacggcatcgatgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgaccaagtctttggctcatagacaatttctaaagccacaactctactcat 30444102  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    | | |||| | || | | |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||    
T  30444103 ttaagatgatggatttatacaccatcatggagcaacttacgaagttcaacaaaatcctttataatttggagaacattgaggtgtatcttgagcatgaaga 30444202  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30444203 taaagttatactctacttgtgtgctctaccgagatcttttgaatttgtcaacgataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcacctaggaagaagtt 30444302  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||   ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  30444303 caagtggctttgagaaccaaggagttgaccaagtccaagggcttgagagccgatgaaaacggtgaaggcctaagtgttttatgagggaatggtagaggta 30444402  T
Q  414 gaggtaacccgagaaagagtggtaacaagt 443  Q
    ||||||||    ||||||| ||||||||||    
T  30444403 gaggtaactgaggaaagagcggtaacaagt 30444432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Original strand, 34165526 - 34165929
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34165526 aaggaaccaactgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 34165625  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  34165626 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaaga 34165725  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
     || ||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34165726 caaggctatactcttgttgtgcgcactaccgaggtcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 34165825  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||    
T  34165826 caagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtctaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtgtcaaaaggaaatggtggaggta 34165925  T
Q  414 gagg 417  Q
    ||||    
T  34165926 gagg 34165929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5408587 - 5408194
Alignment:
Q  22 aaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatg 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5408587 aaccgcgacatcgatgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgacaaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatg 5408488  T
Q  122 gtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagcta 221  Q
    || ||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || || ||  |||    
T  5408487 gtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagatcattgaggtgcaacttgaggacgaagacaagacta 5408388  T
Q  222 tactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggc 321  Q
    |||| ||||||||| |||||  || ||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||     
T  5408387 tactattgttgtgtactctattgatatcatttgaatccttcaaggataccatgctctatggaaaagaaggcactatcaccttggaagaagttcaagcgga 5408288  T
Q  322 tttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaac 421  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||   |||||       ||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||||||||||    
T  5408287 tttaagaaccaaggagttgaccaagtctaaggacttgagagcggatgaa-------aaggccttagtgtttcaaaaggaaatggtggaggtagaggtaac 5408195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5412912 - 5412519
Alignment:
Q  22 aaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatg 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5412912 aaccgcgacatcgatgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgacaaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatg 5412813  T
Q  122 gtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagcta 221  Q
    || ||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || || ||  |||    
T  5412812 gtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagatcattgaggtgcaacttgaggacgaagacaagacta 5412713  T
Q  222 tactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggc 321  Q
    |||| ||||||||| |||||  || ||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||     
T  5412712 tactattgttgtgtactctattgatatcatttgaatccttcaaggataccatgctctatggaaaagaaggcactatcaccttggaagaagttcaagcgga 5412613  T
Q  322 tttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaac 421  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||   |||||       ||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||||||||||    
T  5412612 tttaagaaccaaggagttgaccaagtctaaggacttgagagcggatgaa-------aaggccttagtgtttcaaaaggaaatggtggaggtagaggtaac 5412520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26932136 - 26931919
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26932136 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgttgtgggcaaagttgaaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctac 26932037  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26932036 tcattcaagatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggacg 26931937  T
Q  210 aggataaagctatactct 227  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26931936 aggataaagctatactct 26931919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12936811 - 12936558
Alignment:
Q  21 caaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggat 120  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  12936811 caaccgcgccatcgatgtggtcaaagttggagtctttgtatatgacaaaatctttggctcattggcaattcctaaagcaacaactctactcatttaagat 12936712  T
Q  121 ggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagct 220  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||||| | | ||||  |    
T  12936711 ggtggagttaaaggccatcatggagcaacttacggagtttaacaaaatccttgatgacttaaagactattgaggtgcatattgaggataaaggtaaaatt 12936612  T
Q  221 atactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatg 274  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12936611 atactcatgttgtgtgctctaccgagaacttatgaatcattcaaagataccatg 12936558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 119 - 407
Target Start/End: Original strand, 16567733 - 16568021
Alignment:
Q  119 atggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaag 218  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||      
T  16567733 atggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaagacaaga 16567832  T
Q  219 ctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16567833 ctatactcttgttgtgtgctctaccgagatcatttgaatcctttaaggataccatgctctatggcaaagaaggcattgtcaccttggaagaagttcaagc 16567932  T
Q  319 ggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtg 407  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| | || ||| |||||||    
T  16567933 ggctttaagaaccaagaagttgaccaagtccaaggacttgagagcggatgaaaacagtgaaggccttagtgtttcaaaaggaaatggtg 16568021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 17012769 - 17012948
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  17012769 agcaaaggaaccaactgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgataaagtctttggctcatcggcaattccaaaagcaacaactttac 17012868  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 190  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17012869 tcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagaaacttgcggagttcaa-aaaatccttgatgacttggagaatatt 17012948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12911093 - 12910882
Alignment:
Q  63 tgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaa 162  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12911093 tgacaaagtctttggctcattgggaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagttaaaggccatcatggagcaacttacggagtttaa 12910994  T
Q  163 caaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttc 262  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||||| | | ||||  ||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||| |||    
T  12910993 caaaatccttgatgacttaaagactattgaggtgcatattgaggataaaggtaaaattatactcatgttgtgtgctcttccgagaacttatgaatctttc 12910894  T
Q  263 aaacataccatg 274  Q
    ||| ||||||||    
T  12910893 aaagataccatg 12910882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15534175 - 15533976
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  15534175 agcaaaggaaccaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcattggcaagtcctaaagcaacaactttac 15534076  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  15534075 tcattcaagatggtagagtcaaaaaccatcatggagctacttgtggagttcgacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 15533976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Original strand, 3395103 - 3395238
Alignment:
Q  11 gcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctact 110  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3395103 gcaaaggaaccaaccgccgcatcgatgtgtgcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcattggcaattcctaaagcaacaactttact 3395202  T
Q  111 cattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagc 146  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3395203 cattcaagatggtagagtcaaaggccatcacggagc 3395238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3631496 - 3631312
Alignment:
Q  30 catcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtc 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  3631496 catcgatgtggccaaagttggaagctttgtatatgacaaagtctttgactcatcaacaattcctaaagcaataactttactcattcaagatggtaaagtc 3631397  T
Q  130 aaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggat 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||    
T  3631396 aaaggccatcatggagctacttgtagagttcaataaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtggat 3631312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 183
Target Start/End: Original strand, 26944234 - 26944403
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || | ||    
T  26944234 aaggaaccaaccgcgccatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggcttatcgacaattcctaaagcgacaactttaataat 26944333  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgga 183  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||  ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26944334 tcaagatggtagagtcaaaggccatcatagagaactttgtggagttcaacagaatccttgataacttgga 26944403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 14738140 - 14738305
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||    
T  14738140 gaagctaccgcggcatcgatgttggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattca 14738239  T
Q  117 ggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 182  Q
     |||| | ||||| ||  | |||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  14738240 agatgatggagtctaaatcgatctcggagcaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 14738305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Original strand, 33331014 - 33331172
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||    
T  33331014 gaagctaccgcagcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgatgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattca 33331113  T
Q  117 ggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgat 175  Q
     |||||| ||||| ||  | |||  ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  33331114 agatggtggagtctaaatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgat 33331172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17694176 - 17694096
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17694176 atactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttgaccaagt 17694096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 347
Target Start/End: Original strand, 25942320 - 25942605
Alignment:
Q  62 atgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttca 161  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||  || || |||||||||||||  | | | ||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||    
T  25942320 atgaccaagtctttggcacatagacaatgtctgaaacaacaactctacttttaccgaatggtggagtcaaaacctataatggagcaactgacggagttca 25942419  T
Q  162 acaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgtt 261  Q
    | || ||  ||||||| |||| ||| || || ||  | || || || |||||||||||  ||| | |  |||||||| |||| |  || |||||    ||    
T  25942420 ataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctactgtgtgctttacctaggtcctttgagaattt 25942519  T
Q  262 caaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||  |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||    
T  25942520 caaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 25942605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 10457019 - 10456883
Alignment:
Q  201 ttgaggatgaggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttac 300  Q
    |||||||||| || ||| || ||| |||||||||| || |||| | ||||||||  || |||||  |||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||    
T  10457019 ttgaggatgaagacaaaactctacccttgttgtgtactttacctagatcttttgggtccttcaatgataccatgctttatgacaacgaaggcagtgtcac 10456920  T
Q  301 cttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggag 337  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  10456919 cttagaggaagtccaagcggcattttgaaccaaggag 10456883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Original strand, 13879595 - 13879675
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||    
T  13879595 atactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 13879675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 18232378 - 18232275
Alignment:
Q  18 aagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcag 117  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||| || ||||||||| || || || | || ||||||||||| |||||||     
T  18232378 aagctaccacgacatcgatgtgggctacgttggagtcattgtacatgacaaaatcgttggctcataggaaactcttgaaacaacaactctattcattcaa 18232279  T
Q  118 gatg 121  Q
    ||||    
T  18232278 gatg 18232275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22350285 - 22350194
Alignment:
Q  278 tatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatga 369  Q
    ||||||||||| |||| | | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| || |||| |||| ||||    
T  22350285 tatggcaaagatggcattatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttgaccaagttcaaagagttgaaagttgatga 22350194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 9035816 - 9035704
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | | || ||||| ||||  || |||||||| ||| || || |  | || ||||||||||||| |||||    
T  9035816 gaagctaccgcgacatcgatgtgggcaaagtcgaagtcattgtacatgatgaaatctttggcccataggaaactgttgaaacaacaactctactgattca 9035717  T
Q  117 ggatggtagagtc 129  Q
     |||||| |||||    
T  9035716 agatggtggagtc 9035704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Original strand, 14738390 - 14738470
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||| ||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14738390 ataccatcctttatggtaaggagggcactgctactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagt 14738470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 34256 - 34727
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34256 agcaaaggaaacaacaacggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactccac 34355  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34356 tcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatggagcaactcacggagttaaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 34455  T
Q  210 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttacc-----ttg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||    
T  34456 aggataaagctatactcttgttgtgtgctctaccaaaatcttttgaattgttcaaagataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttgcattg 34555  T
Q  305 gaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatg 404  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34556 gaagaagttcaagtggctttgagaaccaaggggttgaccaagtccaaggacttgagagttcatgaacacggtgaaggcctaagtgtctcaagagggaatg 34655  T
Q  405 gtggaggtagaggtaacccgagaaagagtggtaacaagtcaaggtctgaatgctttaactgccacaagatgg 476  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  34656 gtggaggtagaagtaaccggagaaagagtggtaacaagtcaaagtcataatgctttaactgtcacaagatgg 34727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 422
Target Start/End: Original strand, 115245 - 115653
Alignment:
Q  14 aaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||| |||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  115245 aaggaaccaaccgcggcatcgacgtggtcaaagttgtagtcattgtatatgaccaagtctttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcat 115344  T
Q  114 tcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgagga 213  Q
    ||| |||||| || |||||| || | ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| || | || ||    
T  115345 tcaagatggtggattcaaagaccgtgatggagcaattgacagagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgaaactttagaacgaaga 115444  T
Q  214 taaagctatactcttgttgtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagtt 313  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  115445 acaggctatactcttgttgtgtgctctaccgagatcatttgaatccttcaaggataccatgctctatggcaaagaaggcactgtcaccttggaagaagtt 115544  T
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggta 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||  ||||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||    
T  115545 caagcggctttaagaaccaaggagttgaccaagtccaaggacttgagagaggatgaaaacaatgaaggccttagtgtttcaaaaggaaatggtggaggta 115644  T
Q  414 gaggtaacc 422  Q
    |||||||||    
T  115645 gaggtaacc 115653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1908 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1908
Description:

Target: scaffold1908; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 143 - 422
Target Start/End: Original strand, 137 - 416
Alignment:
Q  143 gagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgtgtgctctac 242  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  137 gagcaattaacggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggacgaagacaaagctatactcttgttgtgtgctctac 236  T
Q  243 cgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgac 342  Q
    ||| ||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  237 cgagatcatttgaatccttcaaggataccatgctctatggcaaagaacgcagtgtcaccttggaagaagttcaatcaactttgagaaccaaagagttgac 336  T
Q  343 caagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagaggtaacc 422  Q
    || |||||| |||||| |||   || || || || |||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  337 caggtccaaggacttgggagcggataaaaacagttaaggtcttagtgtttcaagggggaatggtggaggtagaggtaacc 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26463 - 26284
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  26463 agcaaaggaaccaactgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgataaagtctttggctcatcggcaattccaaaagcaacaactttac 26364  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 190  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26363 tcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagaaacttgcggagttcaa-aaaatccttgatgacttggagaatatt 26284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 26920 - 26539
Alignment:
Q  36 tgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggc 135  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||   ||||||||||| | ||| |||||||| || | |||||| ||||||||||     
T  26920 tgtggtcaaagttggagtcgttgtatgtgacaaattctttggctcatacacaattcctaaaactacatctctactcgtttaagatggtggagtcaaaggt 26821  T
Q  136 catcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgttgtgt 235  Q
      || |||||||||| | |||||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||    
T  26820 tgtcttggagcaactaatggagttcaaacaaattcttgatgatttggagaacattgatgtgcatcttgaggatgaaggcaaagctatactctttttgtgt 26721  T
Q  236 gctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaacataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaagg 335  Q
    |||||||||  ||| |||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| | || || ||||||| ||||||||||||||    
T  26720 gctctaccgtgatcatttgaatccttcaagggtaccatgctctatggtaaagaaggcactgccaccttgaaggacgtccaagcggatttgagaaccaagg 26621  T
Q  336 agatgaccaagtccaatgacttgagagttcatgaacactgtgaaggcctaagtgtcttaagagggaatggtggaggtagagg 417  Q
    || | || |||||||| ||||||| || | ||||| |  ||||||| |||||| | | |||| | |||||||| | ||||||    
T  26620 agttaactaagtccaaggacttgatagatgatgaaaatagtgaaggtctaagtatttcaagatgaaatggtggggttagagg 26539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 80572 - 80771
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||    
T  80572 agcaaaggaaacaaccgcgccatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaacggaaagtcctaaagcaacaactttac 80671  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||  ||||||||||    
T  80672 tcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatg 80771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Original strand, 50737 - 50923
Alignment:
Q  23 accgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatgg 122  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  50737 accgcggcatcgatgtggtcaaagatcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatgg 50836  T
Q  123 tagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||  ||||||||||    
T  50837 taaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatg 50923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1025 - 826
Alignment:
Q  10 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  1025 agcaaaggaaacaaccgcgtcatcgatgtggtcaaattttgaatttttgtatatgacaaagtctttggcttatcggaaagtcctaaagcaacaactttac 926  T
Q  110 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 209  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||  ||||||||||    
T  925 tcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggtgctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatg 826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 14877 - 15042
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||    
T  14877 gaagctaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattca 14976  T
Q  117 ggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 182  Q
     |||||| ||||| ||  | |||  ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  14977 agatggtggagtctaaatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 15042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 445 - 610
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattca 116  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||||||| || |||||||    
T  445 gaagctacagcgacatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactttattcattca 544  T
Q  117 ggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 182  Q
     |||||| ||||| ||  | |||  ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  545 agatggtggagtctaaatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Original strand, 149522 - 149701
Alignment:
Q  16 ggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattc 115  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||     
T  149522 ggaagctaccgcggcatcaatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattt 149621  T
Q  116 aggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggt 195  Q
    | |||||| ||||| ||  | |||  ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||  || ||||||||    
T  149622 aagatggtggagtctaaatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaggt 149701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Original strand, 17181 - 17261
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagt 347  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||    
T  17181 atactatgctctatggcaaagagggcactattactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagaattgaccaagt 17261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 18512 - 18603
Alignment:
Q  17 gaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactcta 108  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| |  | || |||||||||||    
T  18512 gaagctaccgcggcatcgatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatctttggctcataggcaacttttgaaacaacaactcta 18603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 267 - 359
Target Start/End: Original strand, 18757 - 18849
Alignment:
Q  267 ataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttga 359  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||    
T  18757 ataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaacgaattgaccaagttcaaggacttga 18849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1991 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1991
Description:

Target: scaffold1991; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 129
Target Start/End: Original strand, 1028 - 1101
Alignment:
Q  56 ttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtc 129  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | || ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  1028 ttgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattcaagatggtggagtc 1101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 2011 - 1914
Alignment:
Q  32 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtc 129  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||| ||||| || | || ||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  2011 tcgatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatcgttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattcaaaatggtggagtc 1914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 359
Target Start/End: Original strand, 4059 - 4104
Alignment:
Q  314 caagcggctttgagaaccaaggagatgaccaagtccaatgacttga 359  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  4059 caagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagttcaaggacttga 4104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University