View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10233_low_4 (Length: 367)

Name: NF10233_low_4
Description: NF10233
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10233_low_4
NF10233_low_4
[»] chr8 (116 HSPs)
chr8 (1-365)||(19880065-19880428)
chr8 (25-365)||(26453947-26454287)
chr8 (21-361)||(23478321-23478660)
chr8 (1-316)||(11775008-11775322)
chr8 (80-316)||(8414241-8414476)
chr8 (17-259)||(19882311-19882552)
chr8 (1-169)||(17795664-17795832)
chr8 (21-198)||(17460759-17460936)
chr8 (1-182)||(21861072-21861253)
chr8 (1-198)||(27941341-27941538)
chr8 (21-179)||(361684-361842)
chr8 (21-179)||(32950023-32950181)
chr8 (21-198)||(25483946-25484123)
chr8 (21-198)||(41680606-41680783)
chr8 (7-169)||(44432293-44432455)
chr8 (21-194)||(364195-364368)
chr8 (21-182)||(38185558-38185719)
chr8 (1-185)||(39694980-39695164)
chr8 (21-178)||(18024167-18024324)
chr8 (25-185)||(15635656-15635816)
chr8 (21-185)||(20454655-20454819)
chr8 (21-169)||(44522898-44523046)
chr8 (1-198)||(19808049-19808246)
chr8 (20-185)||(21579678-21579843)
chr8 (21-185)||(20455412-20455576)
chr8 (21-185)||(20460390-20460554)
chr8 (21-179)||(5760955-5761113)
chr8 (21-179)||(6102225-6102383)
chr8 (21-179)||(19140187-19140345)
chr8 (21-179)||(20178993-20179151)
chr8 (1-170)||(18833902-18834071)
chr8 (1-198)||(22237706-22237903)
chr8 (21-169)||(42818379-42818527)
chr8 (1-170)||(44476854-44477024)
chr8 (1-170)||(44480116-44480286)
chr8 (1-166)||(42266047-42266209)
chr8 (21-196)||(42560000-42560174)
chr8 (17-179)||(21321808-21321970)
chr8 (21-179)||(39936483-39936640)
chr8 (21-170)||(39363955-39364104)
chr8 (11-170)||(8728399-8728558)
chr8 (21-175)||(6573528-6573682)
chr8 (17-179)||(21326406-21326568)
chr8 (21-175)||(5082684-5082838)
chr8 (49-165)||(14397604-14397720)
chr8 (21-176)||(17437790-17437945)
chr8 (21-175)||(22207693-22207847)
chr8 (17-179)||(29763337-29763499)
chr8 (1-179)||(22483169-22483346)
chr8 (1-170)||(23914355-23914523)
chr8 (1-179)||(20084090-20084268)
chr8 (258-360)||(17461118-17461220)
chr8 (1-178)||(20517570-20517746)
chr8 (21-128)||(23660688-23660795)
chr8 (21-179)||(18816934-18817091)
chr8 (17-179)||(22344464-22344625)
chr8 (17-179)||(22356124-22356285)
chr8 (258-347)||(23659373-23659462)
chr8 (7-179)||(18815281-18815452)
chr8 (260-360)||(19808430-19808530)
chr8 (1-169)||(22258756-22258923)
chr8 (258-361)||(18833514-18833617)
chr8 (258-365)||(23409743-23409850)
chr8 (258-361)||(37515657-37515760)
chr8 (1-179)||(4381245-4381422)
chr8 (258-356)||(19278430-19278528)
chr8 (258-360)||(22238085-22238186)
chr8 (258-361)||(18862792-18862895)
chr8 (258-361)||(21828161-21828264)
chr8 (258-356)||(21976817-21976915)
chr8 (258-356)||(22111792-22111890)
chr8 (258-356)||(43251674-43251772)
chr8 (1-177)||(23670073-23670248)
chr8 (21-176)||(17501350-17501505)
chr8 (258-340)||(16402068-16402150)
chr8 (256-361)||(19929554-19929660)
chr8 (17-179)||(36305081-36305242)
chr8 (19-177)||(38988890-38989047)
chr8 (19-177)||(39019987-39020144)
chr8 (17-170)||(36405528-36405680)
chr8 (7-179)||(17978875-17979046)
chr8 (1-105)||(36732976-36733080)
chr8 (258-361)||(21410806-21410909)
chr8 (258-361)||(21805298-21805401)
chr8 (217-365)||(5760629-5760779)
chr8 (17-179)||(24907198-24907358)
chr8 (7-179)||(22474174-22474345)
chr8 (258-321)||(23914029-23914092)
chr8 (1-77)||(14397363-14397438)
chr8 (1-77)||(18677687-18677762)
chr8 (21-105)||(21399206-21399290)
chr8 (21-105)||(21793699-21793783)
chr8 (7-77)||(4542002-4542071)
chr8 (21-179)||(21513743-21513899)
chr8 (16-179)||(25757575-25757737)
chr8 (7-77)||(24485672-24485741)
chr8 (258-356)||(21972732-21972826)
chr8 (95-179)||(21345945-21346029)
chr8 (7-54)||(22002239-22002286)
chr8 (16-179)||(25295555-25295717)
chr8 (258-361)||(14397928-14398023)
chr8 (17-98)||(24624171-24624252)
chr8 (231-320)||(13665163-13665254)
chr8 (231-320)||(13724438-13724529)
chr8 (36-179)||(18118651-18118794)
chr8 (132-179)||(5080431-5080478)
chr8 (1-40)||(8414201-8414240)
chr8 (16-179)||(19332044-19332204)
chr8 (244-320)||(23669687-23669765)
chr8 (229-323)||(22381649-22381745)
chr8 (21-64)||(16198371-16198414)
chr8 (139-170)||(18122329-18122360)
chr8 (181-235)||(13661596-13661649)
chr8 (181-235)||(13720239-13720292)
chr8 (181-269)||(22244737-22244824)
chr8 (17-169)||(18827656-18827807)
[»] chr3 (170 HSPs)
chr3 (1-361)||(35961339-35961699)
chr3 (11-316)||(41813-42117)
chr3 (21-361)||(13029748-13030089)
chr3 (21-294)||(16979218-16979490)
chr3 (21-361)||(13026156-13026497)
chr3 (9-316)||(16325001-16325307)
chr3 (23-365)||(22652068-22652409)
chr3 (21-320)||(6805433-6805733)
chr3 (21-185)||(14642022-14642186)
chr3 (21-194)||(2248442-2248615)
chr3 (21-198)||(10833811-10833988)
chr3 (17-185)||(6158813-6158981)
chr3 (21-197)||(50243137-50243313)
chr3 (1-194)||(8928117-8928310)
chr3 (1-170)||(10554698-10554867)
chr3 (21-198)||(24152916-24153093)
chr3 (21-198)||(43550149-43550326)
chr3 (21-185)||(3394474-3394638)
chr3 (21-179)||(11192503-11192661)
chr3 (1-178)||(3803258-3803435)
chr3 (21-185)||(12275965-12276129)
chr3 (1-179)||(5206106-5206284)
chr3 (21-179)||(14441590-14441748)
chr3 (1-170)||(38311455-38311625)
chr3 (21-198)||(16643408-16643585)
chr3 (1-185)||(1988684-1988868)
chr3 (21-169)||(10989275-10989423)
chr3 (1-177)||(11913145-11913321)
chr3 (1-181)||(50351452-50351632)
chr3 (21-179)||(17693490-17693648)
chr3 (21-179)||(40807418-40807576)
chr3 (21-179)||(44273896-44274054)
chr3 (21-179)||(54875955-54876113)
chr3 (1-198)||(9533532-9533729)
chr3 (1-198)||(14763413-14763610)
chr3 (1-170)||(20248436-20248605)
chr3 (21-169)||(179179-179327)
chr3 (21-185)||(10563125-10563289)
chr3 (21-176)||(40812258-40812413)
chr3 (1-179)||(14508270-14508447)
chr3 (21-179)||(17538529-17538687)
chr3 (1-198)||(23371159-23371356)
chr3 (28-177)||(37038242-37038391)
chr3 (21-169)||(17670181-17670329)
chr3 (21-169)||(17685315-17685463)
chr3 (7-198)||(14966405-14966596)
chr3 (21-179)||(6819531-6819689)
chr3 (1-179)||(10541910-10542088)
chr3 (1-179)||(14671246-14671424)
chr3 (17-179)||(18889786-18889948)
chr3 (21-185)||(13522882-13523047)
chr3 (1-170)||(55292093-55292262)
chr3 (23-179)||(17519347-17519503)
chr3 (23-179)||(17534209-17534365)
chr3 (21-185)||(18367230-18367394)
chr3 (25-177)||(43928775-43928927)
chr3 (21-167)||(15931979-15932125)
chr3 (21-170)||(31224425-31224575)
chr3 (21-175)||(53646532-53646686)
chr3 (21-170)||(17513011-17513160)
chr3 (1-198)||(51300798-51300995)
chr3 (21-179)||(12470224-12470382)
chr3 (2-179)||(13519704-13519882)
chr3 (1-175)||(17044392-17044566)
chr3 (21-175)||(33564555-33564709)
chr3 (21-179)||(35065053-35065210)
chr3 (21-179)||(35354021-35354179)
chr3 (17-158)||(18893067-18893208)
chr3 (17-165)||(5223566-5223714)
chr3 (21-177)||(50348498-50348654)
chr3 (21-179)||(2841935-2842092)
chr3 (21-179)||(22307055-22307213)
chr3 (21-179)||(43889271-43889429)
chr3 (49-165)||(15465337-15465453)
chr3 (49-165)||(26055128-26055244)
chr3 (1-185)||(42324673-42324857)
chr3 (21-179)||(12511270-12511428)
chr3 (2-170)||(19443942-19444110)
chr3 (21-179)||(41172842-41173001)
chr3 (21-179)||(18699945-18700103)
chr3 (1-179)||(14519685-14519862)
chr3 (21-176)||(49900153-49900316)
chr3 (20-137)||(14567683-14567800)
chr3 (258-361)||(324186-324289)
chr3 (1-179)||(6156128-6156305)
chr3 (258-360)||(52989788-52989890)
chr3 (7-179)||(14152857-14153029)
chr3 (258-365)||(12469848-12469955)
chr3 (258-361)||(12339657-12339760)
chr3 (257-360)||(14966121-14966224)
chr3 (258-361)||(16796437-16796540)
chr3 (258-365)||(43889692-43889799)
chr3 (83-194)||(52989492-52989603)
chr3 (1-179)||(50755834-50756011)
chr3 (258-347)||(16643137-16643226)
chr3 (1-179)||(9511618-9511795)
chr3 (1-179)||(9519593-9519770)
chr3 (258-365)||(11300577-11300684)
chr3 (258-357)||(18700373-18700472)
chr3 (258-360)||(11914082-11914184)
chr3 (1-179)||(15565936-15566113)
chr3 (258-360)||(17691774-17691876)
chr3 (17-179)||(25104670-25104831)
chr3 (258-360)||(54876456-54876558)
chr3 (82-179)||(11258889-11258986)
chr3 (261-361)||(5223255-5223355)
chr3 (17-177)||(17207766-17207925)
chr3 (258-361)||(4588920-4589023)
chr3 (258-356)||(4111396-4111494)
chr3 (258-356)||(7109562-7109660)
chr3 (258-356)||(7113497-7113595)
chr3 (258-356)||(11069932-11070030)
chr3 (258-356)||(11165676-11165774)
chr3 (261-347)||(21837390-21837476)
chr3 (258-356)||(22321528-22321626)
chr3 (258-356)||(22336583-22336681)
chr3 (258-356)||(27409791-27409889)
chr3 (258-356)||(28949588-28949686)
chr3 (1-179)||(54330758-54330935)
chr3 (258-356)||(55022731-55022829)
chr3 (258-361)||(15964828-15964931)
chr3 (258-361)||(15968752-15968855)
chr3 (258-361)||(15972676-15972779)
chr3 (258-361)||(37439783-37439886)
chr3 (258-356)||(4107544-4107642)
chr3 (2-179)||(12952464-12952640)
chr3 (1-179)||(24546259-24546440)
chr3 (258-347)||(30065819-30065908)
chr3 (83-179)||(14682745-14682841)
chr3 (21-96)||(17046631-17046706)
chr3 (261-347)||(15617247-15617333)
chr3 (217-321)||(14441308-14441414)
chr3 (258-359)||(11854594-11854695)
chr3 (260-361)||(19775624-19775725)
chr3 (17-105)||(18739391-18739479)
chr3 (21-92)||(5215156-5215227)
chr3 (258-321)||(14670914-14670977)
chr3 (258-356)||(14499189-14499287)
chr3 (121-179)||(19568940-19568998)
chr3 (258-319)||(15465068-15465129)
chr3 (1-105)||(17938022-17938126)
chr3 (1-72)||(46723078-46723149)
chr3 (7-77)||(15977997-15978066)
chr3 (7-77)||(28848250-28848319)
chr3 (21-71)||(51603072-51603122)
chr3 (224-333)||(37427814-37427925)
chr3 (258-321)||(14682413-14682476)
chr3 (230-345)||(17046278-17046395)
chr3 (9-77)||(7780977-7781044)
chr3 (1-77)||(12305587-12305662)
chr3 (7-54)||(16453908-16453955)
chr3 (128-198)||(18892993-18893063)
chr3 (1-71)||(19568863-19568933)
chr3 (1-54)||(54521309-54521362)
chr3 (17-77)||(26054903-26054962)
chr3 (1-77)||(29544464-29544539)
chr3 (94-179)||(42353218-42353304)
chr3 (258-365)||(14569026-14569133)
chr3 (21-77)||(15465619-15465674)
chr3 (21-64)||(5223860-5223903)
chr3 (133-179)||(17046584-17046630)
chr3 (17-105)||(8023718-8023806)
chr3 (17-55)||(11986874-11986912)
chr3 (217-255)||(17685649-17685687)
chr3 (217-255)||(17691611-17691649)
chr3 (217-255)||(54876289-54876327)
chr3 (17-69)||(8631274-8631326)
chr3 (139-179)||(14568649-14568689)
chr3 (317-361)||(16979176-16979220)
chr3 (20-56)||(36528062-36528098)
[»] chr5 (79 HSPs)
chr5 (21-361)||(263098-263437)
chr5 (21-361)||(17010966-17011306)
chr5 (1-316)||(33473016-33473330)
chr5 (1-179)||(27869027-27869205)
chr5 (1-185)||(17812812-17812996)
chr5 (1-198)||(6766064-6766261)
chr5 (21-198)||(18418815-18418992)
chr5 (25-198)||(29448241-29448414)
chr5 (1-185)||(24277058-24277242)
chr5 (1-185)||(24384971-24385155)
chr5 (1-178)||(41876045-41876222)
chr5 (1-170)||(22336751-22336920)
chr5 (21-196)||(36460375-36460550)
chr5 (21-198)||(22412410-22412586)
chr5 (21-198)||(30138636-30138812)
chr5 (7-179)||(32607783-32607955)
chr5 (21-170)||(17875430-17875579)
chr5 (1-170)||(22340289-22340458)
chr5 (1-198)||(38145190-38145387)
chr5 (18-169)||(22758360-22758511)
chr5 (21-179)||(20565976-20566134)
chr5 (21-179)||(21399475-21399633)
chr5 (21-198)||(21557516-21557694)
chr5 (1-198)||(28370708-28370905)
chr5 (7-195)||(42960783-42960971)
chr5 (17-170)||(22750375-22750528)
chr5 (1-198)||(37598569-37598766)
chr5 (21-179)||(21554850-21555009)
chr5 (21-175)||(8833671-8833824)
chr5 (21-179)||(19921056-19921214)
chr5 (21-198)||(31456201-31456378)
chr5 (1-170)||(19511617-19511787)
chr5 (21-177)||(20198060-20198216)
chr5 (21-175)||(26761827-26761981)
chr5 (21-175)||(33895354-33895508)
chr5 (21-179)||(36509248-36509407)
chr5 (258-361)||(22107500-22107603)
chr5 (258-360)||(6765781-6765883)
chr5 (1-179)||(16062908-16063085)
chr5 (1-179)||(18744072-18744249)
chr5 (258-365)||(20910982-20911089)
chr5 (258-364)||(29447952-29448058)
chr5 (258-361)||(33895711-33895814)
chr5 (21-179)||(22111022-22111179)
chr5 (1-177)||(8504321-8504496)
chr5 (258-361)||(18356148-18356251)
chr5 (17-179)||(1627849-1628010)
chr5 (17-179)||(14026276-14026437)
chr5 (258-356)||(15236982-15237080)
chr5 (258-356)||(19472867-19472965)
chr5 (258-356)||(20295708-20295806)
chr5 (7-177)||(23199847-23200017)
chr5 (258-365)||(40723734-40723841)
chr5 (7-179)||(16605062-16605233)
chr5 (21-100)||(40917445-40917524)
chr5 (107-185)||(12122080-12122158)
chr5 (260-361)||(10753220-10753321)
chr5 (1-72)||(24617375-24617446)
chr5 (1-72)||(24713606-24713677)
chr5 (1-72)||(24746634-24746705)
chr5 (1-72)||(24668649-24668720)
chr5 (1-72)||(24738418-24738489)
chr5 (1-72)||(24751187-24751258)
chr5 (7-77)||(10732569-10732638)
chr5 (7-77)||(42244994-42245063)
chr5 (37-177)||(26749538-26749677)
chr5 (1-77)||(37804525-37804600)
chr5 (258-321)||(18356308-18356370)
chr5 (258-321)||(20910863-20910925)
chr5 (58-176)||(28901346-28901463)
chr5 (58-176)||(28937741-28937858)
chr5 (45-179)||(30611975-30612108)
chr5 (45-179)||(30613935-30614068)
chr5 (20-170)||(31478803-31478951)
chr5 (17-105)||(17908963-17909051)
chr5 (229-269)||(20469804-20469843)
chr5 (1-77)||(29346444-29346519)
chr5 (1-77)||(29348917-29348992)
chr5 (1-77)||(29351390-29351465)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (1-365)||(70280-70643)
scaffold0057 (21-71)||(71941-71991)
[»] chr7 (163 HSPs)
chr7 (21-361)||(32160674-32161012)
chr7 (21-365)||(16550476-16550819)
chr7 (21-365)||(16614843-16615186)
chr7 (21-320)||(709027-709327)
chr7 (1-317)||(48812121-48812438)
chr7 (17-259)||(14191554-14191795)
chr7 (17-259)||(14188760-14189001)
chr7 (21-320)||(16462316-16462616)
chr7 (21-320)||(47975383-47975683)
chr7 (21-198)||(18456120-18456297)
chr7 (7-185)||(58876-59054)
chr7 (1-198)||(18607690-18607887)
chr7 (21-198)||(13647645-13647822)
chr7 (21-185)||(17070765-17070929)
chr7 (21-185)||(47094496-47094660)
chr7 (1-179)||(13745228-13745406)
chr7 (20-178)||(14415955-14416113)
chr7 (1-179)||(14422207-14422385)
chr7 (1-185)||(8756848-8757032)
chr7 (21-198)||(30820728-30820905)
chr7 (21-169)||(4325488-4325636)
chr7 (17-185)||(11661521-11661689)
chr7 (21-185)||(12755178-12755342)
chr7 (1-179)||(15213921-15214099)
chr7 (1-170)||(10896446-10896615)
chr7 (1-198)||(16008781-16008978)
chr7 (1-198)||(18872563-18872760)
chr7 (21-170)||(40555215-40555364)
chr7 (21-185)||(832495-832659)
chr7 (21-185)||(1197675-1197839)
chr7 (1-185)||(13699341-13699525)
chr7 (7-198)||(147821-148012)
chr7 (21-179)||(12465732-12465890)
chr7 (17-179)||(19282514-19282676)
chr7 (21-198)||(36685721-36685899)
chr7 (21-179)||(46386559-46386717)
chr7 (1-170)||(17505456-17505625)
chr7 (1-170)||(17547589-17547758)
chr7 (1-170)||(38828492-38828661)
chr7 (21-185)||(13408188-13408352)
chr7 (21-193)||(34957579-34957751)
chr7 (17-185)||(37727395-37727563)
chr7 (20-179)||(13745671-13745830)
chr7 (23-169)||(32771760-32771906)
chr7 (21-179)||(33001336-33001494)
chr7 (21-179)||(44374368-44374526)
chr7 (21-179)||(44383233-44383391)
chr7 (7-176)||(8851617-8851786)
chr7 (1-198)||(14566405-14566602)
chr7 (17-170)||(15167406-15167559)
chr7 (21-177)||(48743727-48743883)
chr7 (28-179)||(12371697-12371848)
chr7 (21-179)||(11066890-11067048)
chr7 (21-179)||(12127636-12127794)
chr7 (21-179)||(13147944-13148102)
chr7 (7-179)||(16580082-16580254)
chr7 (7-179)||(16585409-16585581)
chr7 (44-179)||(13894517-13894652)
chr7 (57-198)||(14273751-14273892)
chr7 (17-165)||(13918235-13918383)
chr7 (22-198)||(16998829-16999011)
chr7 (21-175)||(15119767-15119921)
chr7 (21-191)||(29004232-29004402)
chr7 (14-179)||(16460397-16460562)
chr7 (49-165)||(25926993-25927109)
chr7 (21-169)||(32434061-32434209)
chr7 (21-179)||(14258774-14258932)
chr7 (1-179)||(14928784-14928962)
chr7 (1-179)||(15352250-15352428)
chr7 (21-179)||(20585778-20585932)
chr7 (21-151)||(13864867-13864997)
chr7 (1-146)||(12323382-12323527)
chr7 (21-126)||(29052627-29052732)
chr7 (21-179)||(32301604-32301762)
chr7 (4-177)||(14153427-14153599)
chr7 (258-360)||(15719948-15720050)
chr7 (21-170)||(20619717-20619866)
chr7 (258-365)||(32301235-32301342)
chr7 (258-360)||(8940202-8940304)
chr7 (258-360)||(14258403-14258505)
chr7 (258-360)||(16998545-16998647)
chr7 (1-179)||(39292189-39292366)
chr7 (258-360)||(46580741-46580843)
chr7 (258-361)||(1858897-1859000)
chr7 (258-361)||(2530202-2530304)
chr7 (258-361)||(13918591-13918694)
chr7 (258-365)||(16460831-16460938)
chr7 (17-179)||(21538657-21538818)
chr7 (258-365)||(8468665-8468772)
chr7 (257-360)||(15112896-15112999)
chr7 (258-361)||(16579710-16579813)
chr7 (258-361)||(16585850-16585953)
chr7 (258-361)||(25927314-25927417)
chr7 (21-179)||(18875318-18875476)
chr7 (258-347)||(14273480-14273569)
chr7 (7-179)||(4691354-4691525)
chr7 (17-176)||(3192761-3192920)
chr7 (257-356)||(26292256-26292355)
chr7 (17-179)||(43277211-43277374)
chr7 (258-356)||(32968-33066)
chr7 (258-356)||(12704806-12704904)
chr7 (258-356)||(12714725-12714823)
chr7 (258-356)||(12718529-12718627)
chr7 (258-360)||(16324004-16324105)
chr7 (258-356)||(16907348-16907446)
chr7 (258-336)||(17060490-17060568)
chr7 (258-356)||(18279264-18279362)
chr7 (258-356)||(18283227-18283325)
chr7 (1-179)||(25941860-25942037)
chr7 (1-179)||(48213397-48213574)
chr7 (1-100)||(15720250-15720349)
chr7 (258-361)||(39722122-39722225)
chr7 (258-356)||(12723440-12723538)
chr7 (258-356)||(16114102-16114200)
chr7 (258-356)||(16117255-16117353)
chr7 (1-179)||(20252794-20252971)
chr7 (1-179)||(24270434-24270611)
chr7 (258-360)||(45170153-45170255)
chr7 (258-347)||(70912-71001)
chr7 (258-347)||(75021-75110)
chr7 (20-177)||(8514217-8514373)
chr7 (18-175)||(9743550-9743706)
chr7 (107-198)||(46580468-46580559)
chr7 (23-177)||(14161329-14161482)
chr7 (258-360)||(17232871-17232973)
chr7 (17-179)||(3287419-3287574)
chr7 (7-179)||(15576289-15576460)
chr7 (258-365)||(15116428-15116535)
chr7 (17-176)||(15978524-15978682)
chr7 (80-179)||(20487865-20487964)
chr7 (49-111)||(1857092-1857154)
chr7 (1-179)||(18080170-18080347)
chr7 (58-176)||(28719885-28720003)
chr7 (18-179)||(8564060-8564220)
chr7 (217-360)||(1490077-1490222)
chr7 (273-361)||(15084052-15084140)
chr7 (258-321)||(20487533-20487596)
chr7 (7-77)||(24702693-24702762)
chr7 (7-77)||(24705140-24705209)
chr7 (7-77)||(32125955-32126024)
chr7 (7-77)||(41523382-41523451)
chr7 (7-77)||(41525844-41525913)
chr7 (7-64)||(14948751-14948808)
chr7 (298-360)||(14981541-14981603)
chr7 (298-360)||(15411017-15411079)
chr7 (121-179)||(15720198-15720256)
chr7 (1-77)||(16108311-16108386)
chr7 (1-77)||(23664575-23664650)
chr7 (1-73)||(46580376-46580448)
chr7 (2-77)||(11303712-11303786)
chr7 (132-179)||(21675491-21675538)
chr7 (26-175)||(3136721-3136869)
chr7 (113-165)||(1858637-1858689)
chr7 (1-77)||(29797075-29797150)
chr7 (1-77)||(29800894-29800969)
chr7 (16-97)||(46473562-46473643)
chr7 (21-77)||(13918045-13918100)
chr7 (1-77)||(18431176-18431251)
chr7 (21-77)||(25926772-25926827)
chr7 (21-64)||(1856872-1856915)
chr7 (229-270)||(15281595-15281635)
chr7 (250-308)||(43277518-43277574)
chr7 (229-269)||(4071059-4071098)
[»] chr1 (77 HSPs)
chr1 (21-365)||(46198197-46198540)
chr1 (21-365)||(29764106-29764453)
chr1 (21-361)||(50000714-50001054)
chr1 (1-169)||(296787-296955)
chr1 (21-194)||(20031362-20031535)
chr1 (17-198)||(28312751-28312932)
chr1 (1-179)||(20437679-20437857)
chr1 (17-190)||(2332678-2332851)
chr1 (21-198)||(22130537-22130714)
chr1 (21-170)||(16401099-16401248)
chr1 (21-185)||(8276464-8276628)
chr1 (21-185)||(44822594-44822758)
chr1 (7-185)||(21180783-21180961)
chr1 (1-179)||(21239747-21239925)
chr1 (1-179)||(51082638-51082816)
chr1 (21-198)||(13881088-13881265)
chr1 (21-184)||(38057123-38057286)
chr1 (21-179)||(41227176-41227334)
chr1 (21-166)||(22350023-22350168)
chr1 (17-170)||(23195019-23195172)
chr1 (21-185)||(24815324-24815488)
chr1 (17-179)||(12710310-12710472)
chr1 (1-179)||(14238064-14238242)
chr1 (1-170)||(16372181-16372351)
chr1 (21-179)||(19676133-19676291)
chr1 (21-179)||(20588101-20588259)
chr1 (21-179)||(20592639-20592797)
chr1 (21-179)||(41225923-41226081)
chr1 (21-179)||(42912472-42912630)
chr1 (21-179)||(7792324-7792482)
chr1 (21-179)||(51323697-51323855)
chr1 (21-179)||(16058786-16058944)
chr1 (21-179)||(21046521-21046679)
chr1 (21-179)||(4596317-4596475)
chr1 (1-179)||(7052507-7052686)
chr1 (17-198)||(45574520-45574690)
chr1 (22-194)||(294443-294624)
chr1 (1-179)||(45496367-45496546)
chr1 (21-179)||(20634106-20634265)
chr1 (21-179)||(38887559-38887718)
chr1 (258-360)||(51326745-51326847)
chr1 (1-177)||(1643020-1643195)
chr1 (258-347)||(13881447-13881536)
chr1 (1-177)||(14793014-14793189)
chr1 (7-179)||(22823865-22824036)
chr1 (258-361)||(33797473-33797576)
chr1 (258-360)||(27653288-27653390)
chr1 (261-361)||(48520463-48520563)
chr1 (21-179)||(50544274-50544431)
chr1 (258-356)||(1010584-1010682)
chr1 (258-360)||(12271507-12271609)
chr1 (258-356)||(16375606-16375704)
chr1 (258-356)||(21407216-21407314)
chr1 (1-179)||(39060518-39060695)
chr1 (1-178)||(24720146-24720322)
chr1 (258-361)||(1925276-1925379)
chr1 (258-361)||(20924290-20924393)
chr1 (258-361)||(48603404-48603507)
chr1 (1-179)||(17902214-17902391)
chr1 (258-361)||(20228956-20229059)
chr1 (17-179)||(18121027-18121188)
chr1 (258-356)||(52639402-52639500)
chr1 (1-105)||(6833710-6833814)
chr1 (258-332)||(22130972-22131047)
chr1 (17-166)||(44891883-44892031)
chr1 (1-77)||(16362383-16362458)
chr1 (7-77)||(21841231-21841300)
chr1 (7-77)||(21922920-21922989)
chr1 (7-77)||(41372936-41373005)
chr1 (258-321)||(41781654-41781718)
chr1 (1-54)||(23593356-23593409)
chr1 (58-176)||(16655793-16655910)
chr1 (1-104)||(9784795-9784898)
chr1 (21-60)||(21659685-21659724)
chr1 (17-56)||(10812837-10812876)
chr1 (258-308)||(43543133-43543183)
chr1 (21-77)||(13227328-13227383)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (21-361)||(5699-6038)
[»] chr2 (99 HSPs)
chr2 (7-361)||(21914863-21915216)
chr2 (21-258)||(26903502-26903738)
chr2 (146-358)||(34492089-34492300)
chr2 (1-169)||(23338852-23339020)
chr2 (21-198)||(18358441-18358618)
chr2 (21-198)||(21081443-21081620)
chr2 (2-194)||(41301426-41301618)
chr2 (21-187)||(25183601-25183767)
chr2 (1-198)||(27472656-27472853)
chr2 (21-179)||(24273731-24273889)
chr2 (2-198)||(9242163-9242359)
chr2 (21-169)||(10039606-10039754)
chr2 (1-198)||(19662107-19662304)
chr2 (21-198)||(22173500-22173677)
chr2 (21-170)||(24883817-24883966)
chr2 (21-184)||(31520534-31520697)
chr2 (21-179)||(9975351-9975509)
chr2 (21-167)||(18388769-18388915)
chr2 (21-175)||(20915531-20915685)
chr2 (21-179)||(36839593-36839751)
chr2 (17-198)||(21073195-21073376)
chr2 (21-179)||(5031602-5031760)
chr2 (1-179)||(43707737-43707914)
chr2 (1-170)||(20590774-20590943)
chr2 (1-194)||(34858837-34859030)
chr2 (1-194)||(34873899-34874092)
chr2 (1-170)||(6482949-6483119)
chr2 (1-170)||(6486416-6486586)
chr2 (1-179)||(9785004-9785182)
chr2 (21-179)||(17306909-17307067)
chr2 (25-177)||(27484946-27485098)
chr2 (21-179)||(23068922-23069080)
chr2 (21-179)||(24781312-24781470)
chr2 (1-198)||(6260830-6261027)
chr2 (21-179)||(24515608-24515766)
chr2 (1-179)||(23969075-23969253)
chr2 (21-179)||(28652974-28653132)
chr2 (21-169)||(28349340-28349497)
chr2 (28-176)||(19201680-19201828)
chr2 (49-165)||(31345379-31345495)
chr2 (7-176)||(21368532-21368701)
chr2 (258-361)||(23069349-23069452)
chr2 (4-179)||(21316117-21316291)
chr2 (258-360)||(23707354-23707456)
chr2 (258-360)||(24918063-24918165)
chr2 (258-360)||(27472372-27472474)
chr2 (258-360)||(34874278-34874380)
chr2 (258-360)||(22459628-22459730)
chr2 (258-360)||(24670948-24671050)
chr2 (1-179)||(29113784-29113961)
chr2 (1-177)||(22690105-22690280)
chr2 (58-185)||(2524240-2524365)
chr2 (258-360)||(21081802-21081904)
chr2 (258-360)||(24681367-24681469)
chr2 (1-177)||(22694701-22694876)
chr2 (258-365)||(1283241-1283348)
chr2 (258-361)||(18358799-18358902)
chr2 (258-361)||(41531151-41531254)
chr2 (1-179)||(22686262-22686439)
chr2 (17-179)||(23609899-23610060)
chr2 (258-356)||(24628626-24628724)
chr2 (181-320)||(24834729-24834869)
chr2 (258-356)||(27379580-27379678)
chr2 (258-356)||(27383626-27383724)
chr2 (258-356)||(27601657-27601755)
chr2 (17-178)||(21335921-21336081)
chr2 (260-356)||(12901661-12901757)
chr2 (95-170)||(22501299-22501374)
chr2 (95-170)||(22509233-22509308)
chr2 (258-361)||(30345138-30345241)
chr2 (258-361)||(31345068-31345171)
chr2 (258-356)||(24649218-24649316)
chr2 (1-179)||(25587139-25587316)
chr2 (80-185)||(30643812-30643917)
chr2 (258-347)||(10101792-10101881)
chr2 (1-175)||(1384138-1384311)
chr2 (17-179)||(22332140-22332300)
chr2 (1-179)||(28345528-28345705)
chr2 (258-321)||(9784673-9784736)
chr2 (7-77)||(23136044-23136113)
chr2 (1-77)||(24897818-24897893)
chr2 (1-77)||(24900301-24900376)
chr2 (1-77)||(24902778-24902853)
chr2 (1-77)||(24905255-24905330)
chr2 (1-77)||(24907730-24907805)
chr2 (1-77)||(38967944-38968019)
chr2 (297-360)||(24316190-24316252)
chr2 (1-77)||(10684385-10684460)
chr2 (1-77)||(20261684-20261759)
chr2 (179-285)||(24793482-24793585)
chr2 (17-105)||(23778763-23778852)
chr2 (79-179)||(24841375-24841474)
chr2 (244-320)||(20915322-20915400)
chr2 (270-345)||(39827952-39828027)
chr2 (17-102)||(20272855-20272940)
chr2 (21-77)||(31345644-31345699)
chr2 (317-360)||(20320723-20320766)
chr2 (21-101)||(24302220-24302300)
chr2 (25-61)||(40911863-40911899)
[»] chr6 (125 HSPs)
chr6 (21-361)||(15173927-15174266)
chr6 (1-316)||(23956148-23956462)
chr6 (17-259)||(13764696-13764937)
chr6 (1-179)||(28947766-28947944)
chr6 (21-185)||(611156-611320)
chr6 (21-185)||(18658622-18658786)
chr6 (21-185)||(19825961-19826125)
chr6 (21-179)||(27851425-27851583)
chr6 (21-179)||(19655701-19655859)
chr6 (21-198)||(20556565-20556742)
chr6 (1-198)||(20733899-20734095)
chr6 (21-198)||(25619429-25619606)
chr6 (7-170)||(8759974-8760137)
chr6 (7-170)||(8767721-8767884)
chr6 (21-169)||(29847975-29848125)
chr6 (1-198)||(15817210-15817406)
chr6 (21-196)||(34296741-34296916)
chr6 (21-179)||(7827394-7827552)
chr6 (21-179)||(17318594-17318752)
chr6 (21-198)||(14979094-14979271)
chr6 (17-170)||(20182995-20183147)
chr6 (17-170)||(22152844-22152996)
chr6 (19-176)||(25601747-25601904)
chr6 (21-179)||(18702986-18703144)
chr6 (21-179)||(18708921-18709079)
chr6 (1-198)||(4477061-4477258)
chr6 (17-190)||(16133138-16133311)
chr6 (21-190)||(19443752-19443921)
chr6 (21-170)||(25347557-25347706)
chr6 (21-179)||(31734130-31734286)
chr6 (21-179)||(23150739-23150896)
chr6 (1-157)||(23838443-23838599)
chr6 (7-131)||(25807602-25807726)
chr6 (21-164)||(15891183-15891326)
chr6 (1-177)||(20177170-20177345)
chr6 (17-165)||(27556905-27557053)
chr6 (24-179)||(27125952-27126107)
chr6 (21-179)||(19773181-19773339)
chr6 (1-177)||(5834187-5834362)
chr6 (7-167)||(18928157-18928317)
chr6 (1-177)||(22158646-22158821)
chr6 (50-161)||(23415151-23415262)
chr6 (1-143)||(1254215-1254357)
chr6 (21-179)||(27318027-27318185)
chr6 (257-361)||(18913897-18914001)
chr6 (257-361)||(18937155-18937259)
chr6 (7-179)||(23491629-23491801)
chr6 (7-179)||(23497227-23497399)
chr6 (21-179)||(15705083-15705241)
chr6 (258-365)||(17743325-17743432)
chr6 (258-365)||(19773608-19773715)
chr6 (258-360)||(28103964-28104066)
chr6 (258-358)||(15817587-15817687)
chr6 (261-365)||(15875331-15875435)
chr6 (258-361)||(27416005-27416108)
chr6 (181-320)||(15896049-15896189)
chr6 (7-136)||(23655804-23655933)
chr6 (258-365)||(22805880-22805987)
chr6 (258-361)||(23414836-23414939)
chr6 (258-361)||(27556594-27556697)
chr6 (1-179)||(18455524-18455701)
chr6 (1-179)||(25921152-25921329)
chr6 (258-347)||(14979453-14979542)
chr6 (258-361)||(15705509-15705612)
chr6 (258-365)||(17377863-17377970)
chr6 (258-361)||(18917413-18917516)
chr6 (1-116)||(31022149-31022264)
chr6 (17-179)||(22556671-22556833)
chr6 (21-134)||(755-868)
chr6 (258-361)||(22952920-22953023)
chr6 (258-361)||(23871408-23871511)
chr6 (258-361)||(23875364-23875467)
chr6 (258-356)||(8243722-8243820)
chr6 (258-356)||(11566723-11566821)
chr6 (1-179)||(13285131-13285308)
chr6 (17-179)||(18398341-18398502)
chr6 (258-356)||(19870451-19870549)
chr6 (258-356)||(23394929-23395027)
chr6 (17-179)||(32259270-32259430)
chr6 (258-347)||(22862816-22862905)
chr6 (7-179)||(18585042-18585212)
chr6 (258-361)||(16760151-16760254)
chr6 (258-361)||(22948964-22949067)
chr6 (258-361)||(31477957-31478060)
chr6 (7-177)||(20411130-20411299)
chr6 (258-356)||(23989781-23989879)
chr6 (19-176)||(17857162-17857319)
chr6 (258-361)||(1644564-1644667)
chr6 (229-365)||(19656047-19656185)
chr6 (258-356)||(18955910-18956008)
chr6 (1-105)||(29044806-29044910)
chr6 (258-320)||(18696480-18696542)
chr6 (1-77)||(15892031-15892106)
chr6 (258-345)||(12618991-12619076)
chr6 (2-77)||(12742782-12742856)
chr6 (258-361)||(14472127-14472230)
chr6 (2-77)||(17883121-17883195)
chr6 (258-317)||(18706301-18706360)
chr6 (1-104)||(34141077-34141180)
chr6 (1-104)||(34153693-34153796)
chr6 (17-175)||(15938694-15938851)
chr6 (7-77)||(33862258-33862327)
chr6 (125-198)||(25752953-25753026)
chr6 (125-198)||(25755123-25755196)
chr6 (181-321)||(22376544-22376686)
chr6 (181-321)||(16245457-16245601)
chr6 (7-77)||(1540540-1540609)
chr6 (1-77)||(12942654-12942729)
chr6 (21-73)||(22806277-22806329)
chr6 (21-65)||(27330444-27330488)
chr6 (21-65)||(27391184-27391228)
chr6 (7-77)||(19858551-19858620)
chr6 (1-166)||(23221301-23221465)
chr6 (7-64)||(28288965-28289022)
chr6 (215-347)||(18259851-18259985)
chr6 (101-176)||(16135519-16135594)
chr6 (17-175)||(22523437-22523594)
chr6 (21-77)||(23415429-23415484)
chr6 (229-323)||(20078089-20078181)
chr6 (244-320)||(20411491-20411569)
chr6 (132-179)||(29044684-29044731)
chr6 (137-179)||(19234619-19234661)
chr6 (21-77)||(27557187-27557242)
chr6 (181-269)||(31735554-31735640)
chr6 (17-176)||(31161927-31162085)
[»] chr4 (105 HSPs)
chr4 (21-361)||(10694719-10695058)
chr4 (21-361)||(10908485-10908824)
chr4 (21-361)||(15008206-15008546)
chr4 (21-361)||(40619771-40620110)
chr4 (1-316)||(28385529-28385843)
chr4 (51-365)||(15883917-15884230)
chr4 (21-365)||(15990274-15990619)
chr4 (1-169)||(33849174-33849342)
chr4 (1-198)||(18212969-18213166)
chr4 (21-179)||(3337521-3337679)
chr4 (21-197)||(630375-630551)
chr4 (21-185)||(9638423-9638587)
chr4 (21-198)||(12611254-12611431)
chr4 (21-170)||(15447888-15448037)
chr4 (23-198)||(23802938-23803113)
chr4 (8-185)||(24046993-24047170)
chr4 (21-185)||(10704914-10705078)
chr4 (21-185)||(10918684-10918848)
chr4 (21-198)||(51463539-51463716)
chr4 (21-194)||(56115308-56115481)
chr4 (7-179)||(33243754-33243926)
chr4 (21-179)||(19609746-19609904)
chr4 (21-179)||(25091075-25091233)
chr4 (21-179)||(53630945-53631103)
chr4 (1-198)||(10056875-10057072)
chr4 (1-170)||(16277779-16277948)
chr4 (1-170)||(53387389-53387558)
chr4 (21-179)||(10356908-10357066)
chr4 (1-179)||(35660268-35660446)
chr4 (17-185)||(33186317-33186485)
chr4 (21-179)||(14549048-14549206)
chr4 (1-179)||(16997952-16998125)
chr4 (21-175)||(37019095-37019249)
chr4 (21-179)||(42875221-42875379)
chr4 (1-175)||(9923622-9923796)
chr4 (1-175)||(11479063-11479237)
chr4 (1-179)||(3485333-3485508)
chr4 (21-176)||(15114648-15114802)
chr4 (17-179)||(14630248-14630410)
chr4 (257-361)||(15497100-15497204)
chr4 (21-179)||(11425377-11425525)
chr4 (17-179)||(19435165-19435328)
chr4 (21-133)||(15011985-15012097)
chr4 (1-179)||(19566371-19566548)
chr4 (1-169)||(10237950-10238117)
chr4 (258-360)||(14746649-14746751)
chr4 (181-320)||(27996025-27996165)
chr4 (258-361)||(17048200-17048303)
chr4 (258-361)||(43256224-43256327)
chr4 (181-320)||(15365183-15365323)
chr4 (1-177)||(15344301-15344475)
chr4 (258-361)||(13591992-13592094)
chr4 (17-179)||(25513165-25513326)
chr4 (7-177)||(44024062-44024231)
chr4 (7-177)||(45314795-45314964)
chr4 (258-361)||(14954314-14954417)
chr4 (217-361)||(53631279-53631425)
chr4 (258-356)||(9556391-9556489)
chr4 (258-356)||(14757569-14757667)
chr4 (181-320)||(19738360-19738500)
chr4 (17-179)||(26445307-26445468)
chr4 (17-166)||(16026397-16026545)
chr4 (258-361)||(25689726-25689829)
chr4 (258-347)||(4561481-4561570)
chr4 (258-347)||(5757085-5757174)
chr4 (258-347)||(17810142-17810231)
chr4 (1-177)||(40229727-40229903)
chr4 (1-177)||(46740623-46740798)
chr4 (109-184)||(9871126-9871201)
chr4 (258-361)||(10712712-10712815)
chr4 (258-361)||(10926482-10926585)
chr4 (21-176)||(15214517-15214672)
chr4 (1-88)||(18108330-18108417)
chr4 (258-361)||(27533882-27533985)
chr4 (17-179)||(2425089-2425250)
chr4 (258-361)||(12487567-12487670)
chr4 (1-89)||(55582703-55582791)
chr4 (100-179)||(13036328-13036407)
chr4 (40-179)||(14508184-14508322)
chr4 (258-360)||(19857474-19857576)
chr4 (17-175)||(20595899-20596056)
chr4 (1-77)||(12033396-12033471)
chr4 (270-358)||(14650778-14650866)
chr4 (258-345)||(33742252-33742337)
chr4 (1-77)||(44615753-44615828)
chr4 (1-77)||(50221962-50222037)
chr4 (1-72)||(22725537-22725608)
chr4 (103-169)||(43251116-43251183)
chr4 (40-170)||(12622803-12622932)
chr4 (1-77)||(19243165-19243240)
chr4 (1-77)||(29267818-29267893)
chr4 (298-360)||(26013436-26013498)
chr4 (181-321)||(50160275-50160417)
chr4 (20-156)||(13046116-13046251)
chr4 (1-77)||(15534646-15534721)
chr4 (132-179)||(26922254-26922301)
chr4 (258-301)||(10056650-10056693)
chr4 (1-64)||(49547396-49547459)
chr4 (1-77)||(14049042-14049117)
chr4 (1-77)||(36038335-36038410)
chr4 (17-100)||(19081809-19081892)
chr4 (132-179)||(55582626-55582673)
chr4 (8-56)||(14185427-14185475)
chr4 (111-176)||(12134421-12134486)
chr4 (21-77)||(30147380-30147435)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (21-361)||(22241-22580)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (21-365)||(4267-4614)
[»] scaffold0306 (2 HSPs)
scaffold0306 (21-365)||(4267-4614)
scaffold0306 (258-359)||(14951-15052)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (50-365)||(33154-33469)
scaffold0138 (21-77)||(33636-33691)
[»] scaffold0462 (3 HSPs)
scaffold0462 (21-361)||(10462-10801)
scaffold0462 (1-177)||(744-918)
scaffold0462 (1-177)||(6250-6424)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (4-316)||(176078-176389)
scaffold0001 (4-316)||(168724-169036)
scaffold0001 (21-194)||(152682-152855)
scaffold0001 (21-185)||(77103-77267)
scaffold0001 (183-320)||(446606-446744)
scaffold0001 (270-320)||(497538-497588)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (21-320)||(21361-21661)
scaffold0026 (1-198)||(110890-111087)
scaffold0026 (7-170)||(124018-124181)
scaffold0026 (21-179)||(146154-146312)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (21-259)||(3414-3651)
scaffold0338 (181-321)||(11456-11597)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (7-262)||(11037-11291)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (20-259)||(11978-12216)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (1-182)||(21674-21855)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (21-179)||(28840-28998)
[»] scaffold0672 (1 HSPs)
scaffold0672 (1-182)||(8008-8189)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (21-198)||(15976-16153)
scaffold0156 (258-365)||(15689-15797)
[»] scaffold0635 (1 HSPs)
scaffold0635 (21-169)||(7316-7464)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (21-185)||(19116-19280)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (1-170)||(3137-3306)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (21-198)||(12372-12549)
[»] scaffold0290 (2 HSPs)
scaffold0290 (21-198)||(396-573)
scaffold0290 (258-360)||(112-214)
[»] scaffold0220 (3 HSPs)
scaffold0220 (21-185)||(13362-13526)
scaffold0220 (21-185)||(16180-16344)
scaffold0220 (21-151)||(8686-8816)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (21-179)||(21155-21313)
[»] scaffold0061 (5 HSPs)
scaffold0061 (21-179)||(15058-15216)
scaffold0061 (21-179)||(24116-24274)
scaffold0061 (258-356)||(67449-67546)
scaffold0061 (217-265)||(15392-15440)
scaffold0061 (217-265)||(24450-24498)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (21-198)||(420-596)
[»] scaffold0019 (4 HSPs)
scaffold0019 (1-198)||(133153-133350)
scaffold0019 (1-198)||(133616-133813)
scaffold0019 (1-179)||(29580-29758)
scaffold0019 (1-36)||(33803-33838)
[»] scaffold1783 (2 HSPs)
scaffold1783 (2-170)||(680-848)
scaffold1783 (258-343)||(387-472)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (23-179)||(1507-1663)
scaffold0334 (23-116)||(1-94)
[»] scaffold0077 (5 HSPs)
scaffold0077 (1-169)||(23001-23169)
scaffold0077 (17-170)||(17725-17878)
scaffold0077 (40-170)||(23381-23511)
scaffold0077 (21-146)||(33794-33919)
scaffold0077 (17-134)||(22647-22765)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (21-179)||(78486-78644)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (21-198)||(9428-9605)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (21-185)||(8480-8644)
[»] scaffold0599 (2 HSPs)
scaffold0599 (1-177)||(421-597)
scaffold0599 (258-360)||(1358-1460)
[»] scaffold0546 (3 HSPs)
scaffold0546 (1-165)||(7411-7575)
scaffold0546 (21-55)||(10389-10423)
scaffold0546 (129-179)||(11217-11267)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (21-169)||(6231-6379)
[»] scaffold0109 (4 HSPs)
scaffold0109 (7-179)||(435-607)
scaffold0109 (1-165)||(5732-5896)
scaffold0109 (21-169)||(2771-2918)
scaffold0109 (258-361)||(36089-36192)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (21-169)||(8489-8637)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (21-196)||(82392-82566)
scaffold0037 (258-340)||(80482-80564)
[»] scaffold1283 (2 HSPs)
scaffold1283 (21-179)||(939-1097)
scaffold1283 (217-361)||(1273-1419)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (21-179)||(5185-5343)
scaffold0737 (1-198)||(6129-6327)
[»] scaffold0575 (2 HSPs)
scaffold0575 (1-179)||(5778-5956)
scaffold0575 (258-324)||(6225-6291)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (21-179)||(7857-8015)
[»] scaffold0125 (3 HSPs)
scaffold0125 (21-198)||(1582-1758)
scaffold0125 (21-179)||(27722-27880)
scaffold0125 (258-360)||(1940-2042)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (21-166)||(36043-36188)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (21-201)||(6425-6605)
scaffold0123 (258-360)||(490-592)
scaffold0123 (17-179)||(16360-16521)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (21-169)||(26358-26506)
scaffold0104 (21-169)||(27740-27888)
scaffold0104 (3-179)||(7641-7817)
scaffold0104 (3-179)||(14272-14448)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (21-169)||(51390-51538)
scaffold0042 (1-78)||(67191-67268)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (21-169)||(162716-162864)
scaffold0023 (1-198)||(105316-105512)
scaffold0023 (258-315)||(105078-105135)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-169)||(138207-138375)
scaffold0003 (258-361)||(71253-71356)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (21-179)||(7555-7713)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (21-179)||(9477-9635)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (21-179)||(22263-22421)
scaffold0080 (21-194)||(29139-29312)
scaffold0080 (21-194)||(34604-34777)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (1-198)||(2179-2376)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (21-166)||(159422-159567)
[»] scaffold0108 (2 HSPs)
scaffold0108 (17-185)||(5833-6001)
scaffold0108 (18-179)||(7251-7411)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (21-176)||(143038-143193)
scaffold0020 (21-143)||(169469-169591)
scaffold0020 (258-360)||(169815-169917)
[»] scaffold0529 (2 HSPs)
scaffold0529 (21-179)||(7939-8097)
scaffold0529 (35-149)||(8152-8266)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (1-179)||(3692-3870)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (21-179)||(13008-13166)
scaffold0111 (118-179)||(19372-19433)
[»] scaffold0083 (3 HSPs)
scaffold0083 (1-179)||(434-612)
scaffold0083 (1-179)||(5738-5916)
scaffold0083 (1-56)||(1480-1535)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (21-166)||(12769-12914)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (21-169)||(8775-8923)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (21-176)||(1332-1487)
[»] scaffold0452 (3 HSPs)
scaffold0452 (21-179)||(13137-13295)
scaffold0452 (21-176)||(8122-8277)
scaffold0452 (306-361)||(13490-13545)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (1-179)||(39521-39699)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (21-179)||(120332-120490)
scaffold0034 (21-138)||(29669-29786)
scaffold0034 (258-361)||(119960-120063)
scaffold0034 (221-255)||(29786-29820)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (21-179)||(126170-126328)
scaffold0011 (258-361)||(125907-126010)
scaffold0011 (7-177)||(32878-33047)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (26-179)||(22480-22633)
[»] scaffold0032 (4 HSPs)
scaffold0032 (1-198)||(67497-67694)
scaffold0032 (258-360)||(67214-67316)
scaffold0032 (1-179)||(62422-62600)
scaffold0032 (17-176)||(116873-117032)
[»] scaffold0371 (2 HSPs)
scaffold0371 (7-175)||(10905-11073)
scaffold0371 (42-137)||(17223-17318)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (23-179)||(58170-58326)
[»] scaffold0293 (3 HSPs)
scaffold0293 (42-165)||(19945-20068)
scaffold0293 (258-361)||(20276-20379)
scaffold0293 (21-64)||(19731-19774)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (1-179)||(10381-10560)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (21-179)||(6935-7093)
[»] scaffold0241 (3 HSPs)
scaffold0241 (21-179)||(1986-2144)
scaffold0241 (89-179)||(5139-5229)
scaffold0241 (21-97)||(5413-5489)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (1-179)||(30034-30212)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (33-179)||(9711-9856)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (21-179)||(21074-21232)
scaffold0018 (258-294)||(20769-20805)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (25-170)||(7065-7210)
[»] scaffold0051 (4 HSPs)
scaffold0051 (1-170)||(64521-64690)
scaffold0051 (49-165)||(31386-31502)
scaffold0051 (258-361)||(31075-31178)
scaffold0051 (21-64)||(31680-31723)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (21-146)||(106675-106800)
scaffold0040 (224-319)||(11259-11355)
scaffold0040 (224-319)||(22359-22455)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (21-145)||(11101-11225)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (21-144)||(23676-23799)
[»] scaffold0632 (1 HSPs)
scaffold0632 (21-179)||(587-745)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (17-179)||(11581-11743)
scaffold0439 (21-179)||(3841-4000)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (42-184)||(21058-21200)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (21-179)||(627-785)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (21-175)||(5139-5293)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (21-175)||(1130-1284)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (21-179)||(21490-21648)
scaffold0096 (258-361)||(21118-21221)
[»] scaffold1186 (1 HSPs)
scaffold1186 (17-179)||(1133-1295)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (17-179)||(186973-187135)
scaffold0005 (270-358)||(166426-166514)
[»] scaffold0200 (3 HSPs)
scaffold0200 (49-165)||(17836-17952)
scaffold0200 (258-327)||(17559-17628)
scaffold0200 (21-77)||(18118-18173)
[»] scaffold0117 (4 HSPs)
scaffold0117 (49-165)||(39515-39631)
scaffold0117 (258-360)||(39205-39307)
scaffold0117 (1-73)||(21289-21361)
scaffold0117 (21-77)||(39797-39852)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (1-130)||(4568-4697)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (258-365)||(1231-1338)
scaffold0017 (258-365)||(7982-8089)
scaffold0017 (21-179)||(25938-26095)
[»] scaffold1766 (1 HSPs)
scaffold1766 (21-143)||(1166-1288)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (258-360)||(2779-2881)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (17-179)||(18587-18748)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (1-177)||(56401-56576)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (17-177)||(66500-66660)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (258-360)||(7007-7109)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (258-360)||(53904-54006)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (258-361)||(804-907)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (257-360)||(24662-24764)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (258-360)||(3393-3495)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (258-360)||(512-614)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (7-179)||(168859-169032)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (17-177)||(8244-8403)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (257-361)||(207648-207752)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (7-177)||(65439-65608)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (258-360)||(85498-85600)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (263-360)||(10155-10252)
scaffold0107 (257-338)||(15479-15560)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (17-177)||(18122-18281)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (1-177)||(62143-62318)
[»] scaffold0379 (2 HSPs)
scaffold0379 (1-179)||(10133-10300)
scaffold0379 (181-321)||(14479-14621)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (258-361)||(36233-36336)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (258-361)||(189524-189627)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (258-356)||(65675-65773)
scaffold0029 (258-356)||(61759-61857)
scaffold0029 (258-361)||(80571-80674)
scaffold0029 (1-77)||(11754-11829)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (258-356)||(58866-58964)
scaffold0028 (11-77)||(134675-134740)
scaffold0028 (11-77)||(137144-137209)
scaffold0028 (11-77)||(139613-139678)
scaffold0028 (11-77)||(142082-142147)
scaffold0028 (11-77)||(144551-144616)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (260-356)||(12283-12379)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (87-179)||(3059-3151)
scaffold0256 (1-73)||(2505-2577)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (18-179)||(34687-34843)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (181-318)||(55136-55274)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (17-176)||(11686-11844)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (261-356)||(5251-5346)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (258-361)||(14234-14337)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (17-175)||(13244-13402)
scaffold0317 (258-343)||(6968-7053)
[»] scaffold1551 (1 HSPs)
scaffold1551 (181-274)||(3-95)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (258-347)||(4022-4111)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (7-179)||(18584-18756)
[»] scaffold1160 (1 HSPs)
scaffold1160 (1-177)||(110-285)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (7-179)||(7313-7483)
scaffold0230 (1-77)||(14412-14487)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (21-176)||(822-977)
[»] scaffold0825 (2 HSPs)
scaffold0825 (21-88)||(1106-1173)
scaffold0825 (106-169)||(1372-1435)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (258-361)||(251-354)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (258-365)||(7783-7889)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (258-361)||(11648-11751)
[»] scaffold0676 (2 HSPs)
scaffold0676 (258-356)||(311-409)
scaffold0676 (1-86)||(2403-2488)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (36-176)||(11694-11833)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (258-361)||(32807-32910)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (92-170)||(2377-2455)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (21-102)||(1-82)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (18-179)||(35986-36146)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (181-321)||(1160-1301)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (1-105)||(8072-8176)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (1-177)||(11799-11974)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (36-176)||(2267-2406)
scaffold0409 (36-176)||(10522-10661)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (270-358)||(15537-15625)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (21-176)||(7931-8086)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (272-358)||(7625-7711)
[»] scaffold0741 (2 HSPs)
scaffold0741 (291-360)||(6851-6920)
scaffold0741 (258-306)||(4335-4383)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (4-77)||(9706-9778)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-77)||(41-116)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-77)||(21213-21288)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (119-182)||(2359-2422)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (270-345)||(56936-57011)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (18-175)||(880-1036)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (1-83)||(7829-7911)
scaffold0013 (132-179)||(7929-7976)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (1-70)||(767-836)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (300-361)||(6871-6932)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (58-170)||(32675-32786)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (270-347)||(8974-9051)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (132-177)||(24586-24631)
scaffold0162 (244-320)||(24826-24904)
scaffold0162 (17-65)||(24531-24579)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (1-77)||(6411-6486)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (244-320)||(46775-46853)
[»] scaffold0369 (2 HSPs)
scaffold0369 (1-54)||(16440-16493)
scaffold0369 (107-179)||(16528-16600)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (1-77)||(3488-3563)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (1-64)||(8495-8558)
[»] scaffold1662 (1 HSPs)
scaffold1662 (129-179)||(1-51)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (38-105)||(40902-40969)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (1-40)||(9601-9640)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (258-308)||(36096-36146)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 116)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19880428 - 19880065
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19880428 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaact 19880329  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaa 200  Q
    ||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19880328 tattggataattccaaatctcgaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttggtccttggggcagaa 19880229  T
Q  201 acaaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaa 300  Q
    || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19880228 acgaagttgtatataa-tattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaa 19880130  T
Q  301 tgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtgttgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19880129 tgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatatttttatgttgagaattgcttgtgttgt 19880065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 25 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26454287 - 26453947
Alignment:
Q  25 atgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||    
T  26454287 atgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacatcaaa 26454188  T
Q  125 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtcctt-ggggtagaaacaaagttgcttataattattaa 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  26454187 actagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttggtccttgggggtagaaacgaggttgtttataa-tattaa 26454089  T
Q  224 tgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgat 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26454088 tgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgat 26453989  T
Q  324 gcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtgttgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26453988 gcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgt 26453947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23478660 - 23478321
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23478660 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatgcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct 23478561  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||    
T  23478560 caaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttcatagtatttaacatatgttgtgagttggtccttggggtagaaatgaagttgtttttaa-tat 23478462  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23478461 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatattgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 23478362  T
Q  321 gatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtg 361  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23478361 tatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtg 23478321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11775322 - 11775008
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  11775322 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaact 11775223  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaa 200  Q
    || || |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11775222 tagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtagaa 11775123  T
Q  201 acaaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaa 300  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11775122 acgaagttgtttataa-tattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaa 11775024  T
Q  301 tgtatgatgtttaagt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  11775023 tgtatgatgtttaagt 11775008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 80 - 316
Target Start/End: Original strand, 8414241 - 8414476
Alignment:
Q  80 tttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8414241 tttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgt 8414340  T
Q  180 tagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataa 279  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8414341 gagttggtccttggggtaaaaacgaagttgtttataat-attaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataa 8414439  T
Q  280 ttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8414440 ctatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 8414476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19882552 - 19882311
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19882552 gagttataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcccaaacttatggaataattccaa 19882453  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataa 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  19882452 acctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagggtatttaacctatgttgtgagttggtccttagggtagaaacgaagttgtttataa 19882353  T
Q  217 ttattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatg 259  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19882352 -tattaatgttgttcagagagtctgcaattaagatgattaatg 19882311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 17795832 - 17795664
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17795832 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 17795733  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17795732 tatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacaagtatttaa 17795664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 17460759 - 17460936
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17460759 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaccct 17460858  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17460859 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatccttggggtag 17460936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 21861072 - 21861253
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  21861072 atgatatttggtttttgagatatgctgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtttatccaaaact 21861171  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttag 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21861172 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgttag 21861253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 27941341 - 27941538
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27941341 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaact 27941440  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  27941441 tatgggataattccaatgctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaatagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 27941538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 361684 - 361842
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  361684 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 361783  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  361784 caaaactaggagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 361842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 32950181 - 32950023
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  32950181 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 32950082  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  32950081 caaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgt 32950023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 25483946 - 25484123
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25483946 tatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaacgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccct 25484045  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25484046 caaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtag 25484123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 41680606 - 41680783
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  41680606 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagct 41680705  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  |||||||||||    
T  41680706 caaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgacccttggggtag 41680783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 44432455 - 44432293
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44432455 tttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 44432356  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44432355 ataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 44432293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 364368 - 364195
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  364368 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 364269  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||||  |||||||    
T  364268 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaatccatgttgtgagttgaaccttggg 364195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 182
Target Start/End: Original strand, 38185558 - 38185719
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  38185558 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 38185657  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttag 182  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  38185658 caaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgttag 38185719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 39694980 - 39695164
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  39694980 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 39695079  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    || || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  39695080 taaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttg 39695164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 178
Target Start/End: Original strand, 18024167 - 18024324
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||    
T  18024167 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggcatagttccaaggct 18024266  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18024267 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 18024324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 185
Target Start/End: Original strand, 15635656 - 15635816
Alignment:
Q  25 atgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaa 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15635656 atgaagatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaatcctcaaa 15635755  T
Q  125 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  15635756 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 15635816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20454819 - 20454655
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20454819 tatgatgaaaatactcgaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattcaaaccca 20454720  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  20454719 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 20454655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Original strand, 44522898 - 44523046
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  44522898 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctcatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 44522997  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44522998 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaa 44523046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 19808049 - 19808246
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  19808049 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatcctctaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 19808148  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    || || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  19808149 tagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtag 19808246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 185
Target Start/End: Original strand, 21579678 - 21579843
Alignment:
Q  20 ttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21579678 ttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccc 21579777  T
Q  120 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  21579778 tcaaaattagaaatactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttg 21579843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20455576 - 20455412
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20455576 tatgatgaaaataccccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccatccct 20455477  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  20455476 caaaactagaagtactatgaggtcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 20455412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20460554 - 20460390
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20460554 tatgatgaaaataccccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccatccct 20460455  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  20460454 caaaactagaagtactatgaggtcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 20460390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5761113 - 5760955
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  5761113 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaggttaatcaaaaacttatggaataattccaaacct 5761014  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5761013 caaaactagaagtaccatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 5760955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 6102225 - 6102383
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  6102225 tatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 6102324  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  6102325 caaaactagaagtactatgagttcaattaggatatttaagagtatttaacctatgttgt 6102383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19140345 - 19140187
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  19140345 tatgatgcaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 19140246  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19140245 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaacagtatttaacctatgttgt 19140187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 20178993 - 20179151
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||    
T  20178993 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacct 20179092  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20179093 caaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 20179151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18834071 - 18833902
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||    
T  18834071 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatcaaaaact 18833972  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  18833971 tatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 18833902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 22237706 - 22237903
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22237706 atgatttttggtttttgagatatgttgaaaatactccaaggaggtcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 22237805  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    || || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  22237806 tagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattatgttgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtag 22237903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Original strand, 42818379 - 42818527
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  42818379 tatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 42818478  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  42818479 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaa 42818527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 44477024 - 44476854
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  44477024 atgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 44476925  T
Q  101 tatgggataattccaaccctc-aaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    || || |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44476924 tagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaac 44476854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 44480286 - 44480116
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  44480286 atgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 44480187  T
Q  101 tatgggataattccaaccctc-aaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    || || |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44480186 tagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaac 44480116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 42266047 - 42266209
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||    
T  42266047 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctta---aaattcagtataaccttttctaagttaatccaaagct 42266143  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 166  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42266144 tatggaataattccaaccctccaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 42266209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Original strand, 42560000 - 42560174
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||    
T  42560000 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaagct 42560099  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggt 196  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |  |||||||||    
T  42560100 c-aaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttggggt 42560174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 21321808 - 21321970
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21321808 gagttatgatcaaaatactccaagatggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccagttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 21321907  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
      || |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21321908 ggctaaaaattataagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgt 21321970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 39936483 - 39936640
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  ||    
T  39936483 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagaaataattccaaatct 39936582  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39936583 cgaaactagaagtactatgagttcaact-aggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 39936640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 39364104 - 39363955
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  39364104 tatgataaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 39364005  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39364004 ccaaactagaagtgctatgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaac 39363955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 8728399 - 8728558
Alignment:
Q  11 gtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  8728399 gtttaggagttatgatgaaaatactacaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcc-aaacttagggaataa 8728497  T
Q  111 ttcc-aaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    |||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8728498 ttccaaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 8728558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 175
Target Start/End: Original strand, 6573528 - 6573682
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  6573528 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 6573627  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  6573628 caaaactagaggtactaggggttcaattaagttgtttaagagtatctaacatatg 6573682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 21326406 - 21326568
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21326406 gagttatgatcaaaatactccaagatggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccagttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 21326505  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
      || |||| || |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21326506 ggctaaaaattaaaagtacaatgagttcaattaaagagtttaagagtatttaacctatgttgt 21326568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 175
Target Start/End: Original strand, 5082684 - 5082838
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  5082684 tatgatgaaaatactccaagtaggtctgagtgaaattttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacct 5082783  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5082784 caaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacttatg 5082838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 165
Target Start/End: Original strand, 14397604 - 14397720
Alignment:
Q  49 agtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14397604 agtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 14397703  T
Q  149 aaggtgtttaagagtat 165  Q
    |||||||||||||||||    
T  14397704 aaggtgtttaagagtat 14397720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Original strand, 17437790 - 17437945
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  17437790 tatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaatttaatccaaaacttatggaataattccaaatct 17437889  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
    ||||||||||| || || || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17437890 caaaactagaaataataggattttaattaaggagtttaagagtatttaacctatgt 17437945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22207847 - 22207693
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22207847 tatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaaattaatccaaaacttatggaataattccaaacct 22207748  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
     |||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22207747 gaaaactagaagtatcaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 22207693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 29763337 - 29763499
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | || ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  29763337 gagttataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaatttagaataatcatttctaagttaatccgaaacttatagaataattccaa 29763436  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||| |||||| ||||||||    
T  29763437 ccctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagatgggaaagagtgtttaacctatgttgt 29763499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22483346 - 22483169
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  22483346 atgatatttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaact 22483247  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||  |   ||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22483246 tatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttgt 22483169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23914523 - 23914355
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  23914523 atgatttttggtttagaagttatgatgaaaatacttcaagtaggtcctattgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaact 23914424  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  23914423 tatggaataatttcaaacctcaaaagtagaagtactaggagtt-tattaaggggtttaacagtatttaac 23914355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 20084090 - 20084268
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||    
T  20084090 atgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcagtccaaaact 20084189  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||||| |||||||| ||||||||    
T  20084190 tagagaataattccaaacctc-aaactagaagtactaggagtttaattaagggggcttaagattatttaacctatgttgt 20084268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Original strand, 17461118 - 17461220
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17461118 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtaagatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 17461217  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  17461218 tgt 17461220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 20517570 - 20517746
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||  ||||||||| || ||||||||    
T  20517570 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactgtttctaagtcaacccaaaact 20517669  T
Q  101 tatgggataat-tccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttg 178  Q
    ||| ||||  | ||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20517670 tat-ggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 20517746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23660795 - 23660688
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23660795 tatgatgaaattagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccct 23660696  T
Q  121 caaaacta 128  Q
    ||||||||    
T  23660695 caaaacta 23660688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 18816934 - 18817091
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||| | |    
T  18816934 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataattatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacat 18817033  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18817034 caaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 18817091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22344625 - 22344464
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||  |   || ||    
T  22344625 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaa 22344526  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     | ||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22344525 acttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 22344464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22356285 - 22356124
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||  |   || ||    
T  22356285 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaa 22356186  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     | ||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22356185 acttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 22356124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 258 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23659462 - 23659373
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgtt 347  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23659462 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgtttttcattaatattgttatgtt 23659373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 18815281 - 18815452
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||     
T  18815281 tttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgga 18815380  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     |   ||||| | |||||  | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18815381 ttgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgt 18815452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 360
Target Start/End: Original strand, 19808430 - 19808530
Alignment:
Q  260 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttg 359  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  19808430 ttgttggttatgtgaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatatttttatgttgtgaattgcttg 19808529  T
Q  360 t 360  Q
    |    
T  19808530 t 19808530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 22258756 - 22258923
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || ||||||||    
T  22258756 atgatttttggttttttagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaact 22258855  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    |||||  |   ||||| | ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22258856 tatggattgtatccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 22258923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18833617 - 18833514
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  18833617 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttttttatgcttctcattaatattgatatgttgtgaattgct 18833518  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  18833517 tgtg 18833514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23409850 - 23409743
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23409850 tgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatatttaagttgttgatgttcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 23409751  T
Q  358 tgtgttgt 365  Q
    ||||||||    
T  23409750 tgtgttgt 23409743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 37515760 - 37515657
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  37515760 tgttgttggttatgtgaaatatttatgtgccttatgtggaaaaagtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgatatgttgtgaattgct 37515661  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  37515660 tgtg 37515657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 4381245 - 4381422
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  4381245 atgatttttggtttttgagttacgataaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaact 4381344  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||   |   ||||| | ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4381345 tatgaattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 4381422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 19278430 - 19278528
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19278430 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttctgaattgc 19278528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Original strand, 22238085 - 22238186
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22238085 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaa-tgtatgatgtttaagttgttgatcctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 22238183  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  22238184 tgt 22238186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 18862792 - 18862895
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  18862792 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 18862891  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  18862892 tgtg 18862895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 21828161 - 21828264
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  21828161 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 21828260  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  21828261 tgtg 21828264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 21976817 - 21976915
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  21976817 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 21976915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22111890 - 22111792
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  22111890 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 22111792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43251772 - 43251674
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  43251772 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 43251674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23670248 - 23670073
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||||||| || || ||||||||    
T  23670248 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttattaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaact 23670149  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    ||||   |   ||||| | |||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23670148 tatgaattgtatccaaacttcaaagattg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 23670073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17501505 - 17501350
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||| || ||| ||||| | ||||| || || | ||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  17501505 tatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaaattagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaatatttccaaacct 17501406  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  17501405 caaaactagaagtactaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 17501350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 340
Target Start/End: Original strand, 16402068 - 16402150
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattg 340  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16402068 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatactcttcattaatattg 16402150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 256 - 361
Target Start/End: Original strand, 19929554 - 19929660
Alignment:
Q  256 aatgttgttggttat-gtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaatt 354  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||    
T  19929554 aatgttgttgattattgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattaatattgttatgctgtgaatt 19929653  T
Q  355 gcttgtg 361  Q
    |||||||    
T  19929654 gcttgtg 19929660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 36305242 - 36305081
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||  |   |||||    
T  36305242 gagttatgataaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtaaacccaaaactcatggattgtctccaa 36305143  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     | |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  36305142 acttcaaaacttg-tgtactatgagtccaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttgt 36305081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38989047 - 38988890
Alignment:
Q  19 gttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||  | || ||| |||||||||  |   ||||| |    
T  38989047 gttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctagttcaacccagaacttatggattgtctccaaac 38988948  T
Q  119 ctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
     ||||| || |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38988947 ttcaaagcttg-tgtactataagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 38988890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 39020144 - 39019987
Alignment:
Q  19 gttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||  | || ||| |||||||||  |   ||||| |    
T  39020144 gttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctagttcaacccagaacttatggattgtctccaaac 39020045  T
Q  119 ctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
     ||||| || |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39020044 ttcaaagcttg-tgtactataagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 39019987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Original strand, 36405528 - 36405680
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || ||||||||||||   |   |||||    
T  36405528 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtctccaa 36405627  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
     | ||||| || |  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  36405628 acttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaatgtgtttaatagtatttaac 36405680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 17978875 - 17979046
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| |||||||||| || |||||||||||||     
T  17978875 tttggtttttgagttatgatgaaaatatttcaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattccggataactatttctaagtcaacccaaaacttatgga 17978974  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     |   ||||| | |||||  | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17978975 ttgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgt 17979046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 36732976 - 36733080
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  36732976 atgatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaatgaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaact 36733075  T
Q  101 tatgg 105  Q
    |||||    
T  36733076 tatgg 36733080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21410909 - 21410806
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||||    
T  21410909 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 21410810  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  21410809 tgtg 21410806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21805401 - 21805298
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||||    
T  21805401 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 21805302  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  21805301 tgtg 21805298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 217 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5760779 - 5760629
Alignment:
Q  217 ttattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattata--tgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaa 314  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| |||||  ||  |||||||||| |||||||||||| ||    
T  5760779 ttattattgttgttcagagagtctaaaattaagatgattaatgatgttagtaatgtgatatacttatacatgtattatgtggaatatgtatgatgttgaa 5760680  T
Q  315 gttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtgttgt 365  Q
    ||||| | || || || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  5760679 gttgtagttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcttgtgttgt 5760629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24907358 - 24907198
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||||||| || |||||||||||||  |  ||||||    
T  24907358 gagttatgacgaaaatactctaaggaggtttgagtgaaattttatgaaaattccgcataactaattctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaa 24907259  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  24907258 -cttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaagttgtttaagaatatttaacctatattgt 24907198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22474345 - 22474174
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  || ||  ||||||| || || |||||| ||||||     
T  22474345 tttggtttttgaattatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaactccacataattatttctaggtcaacccaaaatttatgga 22474246  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     |   ||||| | ||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22474245 ttgtctccaaacttcaaagcttgt-gtactatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttgt 22474174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23914092 - 23914029
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 321  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23914092 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 23914029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 14397363 - 14397438
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||    
T  14397363 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaatttatg-aatttcagcacaac 14397438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 18677687 - 18677762
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  18677687 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 18677762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 21399290 - 21399206
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||    
T  21399290 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 21399206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 21793783 - 21793699
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||    
T  21793783 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 21793699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 4542002 - 4542071
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  4542002 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 4542071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21513899 - 21513743
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || |||||| ||||||  |   ||||| | |    
T  21513899 tatgatcaaaatactccaag-aggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaactt 21513801  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||| ||    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21513800 caaagct-tttgcactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatattttgt 21513743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25757737 - 25757575
Alignment:
Q  16 ggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcca 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||  |||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||  ||||||  |  |||||    
T  25757737 ggagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttagcaaaactttatgaaaattcagcataattattcctaagttaaaccaaactttatggtttgtttcca 25757638  T
Q  116 accctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    | | |||||| | | |||| || ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25757637 aacttcaaaatttg-agtattaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgttgt 25757575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 24485672 - 24485741
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  24485672 tttggtttaggagttatgattaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 24485741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 21972732 - 21972826
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    || ||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  21972732 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa----ttaatgcttcacataaatattgttatgttgtgaattgc 21972826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 179
Target Start/End: Original strand, 21345945 - 21346029
Alignment:
Q  95 aaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||    
T  21345945 aaaacttagggaataattccaaatctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgt 21346029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 22002286 - 22002239
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22002286 tttggtttaggagttatgatgaaaataccccaaggaggtcttagtgaa 22002239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25295717 - 25295555
Alignment:
Q  16 ggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcca 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||  | |||||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||  ||||||  |  |||||    
T  25295717 ggagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttagcaaaacttcatgaaaattcagcataattattcctaagttaaaccaaactttatggtttgtttcca 25295618  T
Q  116 accctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    | | |||||| | | |||| || ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25295617 aacttcaaaatttg-agtattaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgttgt 25295555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 14397928 - 14398023
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||        ||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||  |||||| |    
T  14397928 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgc--------gaagatgtatgatgtttaagttgttgttgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgtt 14398019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 24624252 - 24624171
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||| || ||| |||||||||| || ||||||    
T  24624252 gagttatgatgaaaatactccaagtaggtctttgtgcaattttacgaaaattcaacataactatttctaagtgaacccaaaa 24624171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 320
Target Start/End: Original strand, 13665163 - 13665254
Alignment:
Q  231 cagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataat--tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||| |  ||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  13665163 cagagtgtctgaaaataagatgattaatgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgcggaatatgtatgatgttgaagttgtt 13665254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 320
Target Start/End: Original strand, 13724438 - 13724529
Alignment:
Q  231 cagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataat--tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||| |  ||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  13724438 cagagtgtctgaaaataagatgattaatgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgcggaatatgtatgatgttgaagttgtt 13724529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 179
Target Start/End: Original strand, 18118651 - 18118794
Alignment:
Q  36 ccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtac 135  Q
    ||||| ||||||| || || | ||| |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||  |  | |||| | |||||||| || |||     
T  18118651 ccaagtaggtcttggtaaatttttacgaaaattcagcctaaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggtttgttcccaaacttcaaaacttga-gtat 18118749  T
Q  136 tatg-agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    || | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18118750 tagggagttcaattaaggtgttttagagtatttaacctatgttgt 18118794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5080478 - 5080431
Alignment:
Q  132 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  5080478 gtactgtgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgttgt 5080431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 8414201 - 8414240
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaag 40  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8414201 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaag 8414240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Original strand, 19332044 - 19332204
Alignment:
Q  16 ggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcca 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| |||||||| |||| ||  ||| ||||||||| ||||| |||||||  |  |||||    
T  19332044 ggagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttagt-aaaactt-tgaaaatttagcataaatattcctaagttaaaccaaatcttatggtttgtttcca 19332141  T
Q  116 accctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    | | |||||| |  ||||| |  || || |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19332142 aacttcaaaa-tttaagtattcggattttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgttgt 19332204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23669765 - 23669687
Alignment:
Q  244 attaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattat--atgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||| ||| ||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  23669765 attaagatgattaatgttgttagtgatatgatatagttatttatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtt 23669687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 323
Target Start/End: Original strand, 22381649 - 22381745
Alignment:
Q  229 ttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatat--gccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgat 323  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||| || || |||||| |||| |||||  || ||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  22381649 ttcagtgagtctgacataaagatgatgaatgttattagtaatgtgatataaatatatatgcgttatgtgtaagatgtatgatgttgaagttgttgat 22381745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 16198414 - 16198371
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 64  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16198414 tatgattaaaatactccacggaggtcttagtgaaattttatgaa 16198371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 170
Target Start/End: Original strand, 18122329 - 18122360
Alignment:
Q  139 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122329 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 18122360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 235
Target Start/End: Original strand, 13661596 - 13661649
Alignment:
Q  181 agttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattattaatgttcttcagag 235  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  13661596 agttggtccttggggtagaaacgaagtggtttataa-tattaatgttgttcagag 13661649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 235
Target Start/End: Original strand, 13720239 - 13720292
Alignment:
Q  181 agttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattattaatgttcttcagag 235  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  13720239 agttggtccttggggtagaaacgaagtggtttataa-tattaatgttgttcagag 13720292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22244824 - 22244737
Alignment:
Q  181 agttggtccttggggtagaaac-aaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggtta 269  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||||||| |||||||||| | |||  ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22244824 agttggtctttggggtaggaatgaaagttgtttataattat-attgtggttcagtgagtctgaa-ttaaaatgattaatgttgttggtta 22244737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18827807 - 18827656
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||| |||||||||| |||| || ||||  |||||| ||| ||||||||| || ||  |||| | ||  |||||||||  |||||  | |||||||    
T  18827807 gagttatggtgaaaatactacaagtagatcttgctgaaattttacgaaaattcaacataattatttttgagcgaatccaaaagatatggtttgattccaa 18827708  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
      ||||||||| || |||||| ||||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  18827707 aactcaaaacttga-gtactaggagtctaattaggatgtttaagagtatttaa 18827656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 170)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 35961339 - 35961699
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  35961339 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaaattagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 35961438  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaa 200  Q
    || || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35961439 tagggaataattccaaacctcaaaaatagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtagaa 35961538  T
Q  201 acaaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaa 300  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35961539 acgaagttgtttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaa 35961638  T
Q  301 tgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtg 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  35961639 tgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatatttttatgttgagaattgcttgtg 35961699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42117 - 41813
Alignment:
Q  11 gtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  42117 gtttaagagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataa 42018  T
Q  111 ttccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgc 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||     
T  42017 ttccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtagaaacgaagttgt 41918  T
Q  211 ttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgt 310  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41917 ttataa-tattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgt 41819  T
Q  311 ttaagt 316  Q
    ||||||    
T  41818 ttaagt 41813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 361
Target Start/End: Original strand, 13029748 - 13030089
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  13029748 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 13029847  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattat 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  13029848 caaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtcattggggtagaaacgaagttgtttat-attat 13029946  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattat--atgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttg 318  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| ||||  |||| |||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  13029947 taatgttgttcagagagtctgaaattaagatgattaatgatgttagtaatgtgatatagttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgatgttg 13030046  T
Q  319 ttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtg 361  Q
    | | || || || |||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  13030047 tggttgtttatcgttaatattgttattatgtgaattgcttgtg 13030089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 21 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16979490 - 16979218
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16979490 tatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttataaaaattcagcatgaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct 16979391  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattat 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||    
T  16979390 caaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtagaaacgaggttgtttataa-tat 16979292  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgt 294  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16979291 taatgttctttagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgt 16979218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 361
Target Start/End: Original strand, 13026156 - 13026497
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  13026156 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaaattatgggataattccaaagct 13026255  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattat 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  13026256 caaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtcattggggtagaaacgaagttgtttat-attat 13026354  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattat--atgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttg 318  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| ||||  |||| |||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  13026355 taatgttgttcagagagtctgaaattaagatgattaatgctgttagtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgatgttg 13026454  T
Q  319 ttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtg 361  Q
    | | || || || |||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  13026455 tggttgtttatcgttaatattgttattatgtgaattgcttgtg 13026497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 16325001 - 16325307
Alignment:
Q  9 tggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggat 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16325001 tggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatcggat 16325100  T
Q  109 aattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagtt 208  Q
    |||| |||  || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16325101 aatttcaaggctaaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttatgaatatttatcctaagttgtgagttggtccttggggtagaaacgaagtt 16325200  T
Q  209 gcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgat 308  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16325201 gtttataa-tattaatgttcttcagagaatctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataactatatgccttacgtggaaaatgtatgat 16325299  T
Q  309 gtttaagt 316  Q
    ||||||||    
T  16325300 gtttaagt 16325307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22652409 - 22652068
Alignment:
Q  23 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||| | |||    
T  22652409 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttca 22652310  T
Q  123 aaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaaca--aagttgcttataattat 220  Q
    || || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||||| ||||||| ||    
T  22652309 aagcttgt-gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtaaaaaaacgaagttgtttataat-at 22652212  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22652211 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgcattatgtgg-aaatgtatgatgtttaagttgtt 22652113  T
Q  321 gatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtgttgt 365  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  22652112 gatgcttttcattaatactgttatgttgtgaattgcttgtgttgt 22652068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 320
Target Start/End: Original strand, 6805433 - 6805733
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  6805433 tatgatgaaaatactccaaggaggtcctagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacct 6805532  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattat 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  6805533 caaaattagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggttcttggggtagaaacaaagttgtttataa-taa 6805631  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataatta--tatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttg 318  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  6805632 taatgttgttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttagtgatgtgatatagttatttatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttg 6805731  T
Q  319 tt 320  Q
    ||    
T  6805732 tt 6805733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 14642022 - 14642186
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14642022 tatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct 14642121  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  14642122 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 14642186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 2248442 - 2248615
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2248442 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 2248541  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggg 194  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  2248542 taaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggg 2248615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 10833811 - 10833988
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10833811 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 10833910  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  10833911 caaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 10833988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 6158981 - 6158813
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6158981 gagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcaacataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 6158882  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6158881 acctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 6158813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 50243313 - 50243137
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50243313 tatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaccct 50243214  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||    
T  50243213 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggta 50243137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 8928117 - 8928310
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8928117 atgatttttggtttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagataatccaaaact 8928216  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggg 194  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  8928217 tatgggataattccaaggctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggg 8928310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10554867 - 10554698
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  10554867 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaact 10554768  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10554767 tatgggataattcaaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaac 10554698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 24152916 - 24153093
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24152916 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccct 24153015  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24153016 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtctaagagtacttaacccatgttgtgagttgatccttggggtag 24153093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 43550149 - 43550326
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43550149 tatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccct 43550248  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43550249 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtag 43550326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 3394474 - 3394638
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  3394474 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagct 3394573  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  3394574 caaaactagaagtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 3394638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11192661 - 11192503
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  11192661 tatgatgaaaatactccaaggaggccttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 11192562  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11192561 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 11192503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3803435 - 3803258
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||    
T  3803435 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatcaaaatct 3803336  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttg 178  Q
    || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3803335 tagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 3803258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12276129 - 12275965
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  12276129 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaagccaaaacttatgggataattccaaagct 12276030  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||    
T  12276029 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacccatgttgtgagttg 12275965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 5206106 - 5206284
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  5206106 atgatatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 5206205  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  5206206 taaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattatggtgtttaagattatttaacctatgttgt 5206284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14441748 - 14441590
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  14441748 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacct 14441649  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14441648 caaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 14441590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 38311455 - 38311625
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38311455 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaact 38311554  T
Q  101 tatgggataattcc-aaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    || || |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38311555 tagggaataattccaaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 38311625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16643585 - 16643408
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16643585 tatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaacact 16643486  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16643485 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatccttggggtag 16643408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 1988684 - 1988868
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  1988684 atgatatttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgcaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 1988783  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||    
T  1988784 tatgggataattccaaccctcaaaactataactactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaaccaatgttgtgagttg 1988868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Original strand, 10989275 - 10989423
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10989275 tatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 10989374  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989375 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 10989423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11913321 - 11913145
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  11913321 atgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaact 11913222  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11913221 tatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgtt 11913145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 50351452 - 50351632
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  50351452 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccatttctaagtcgatccaaaact 50351551  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgtta 181  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50351552 tatggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtta 50351632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17693648 - 17693490
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  17693648 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 17693549  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17693548 caaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 17693490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40807576 - 40807418
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  40807576 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 40807477  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40807476 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 40807418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 44274054 - 44273896
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  44274054 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 44273955  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  44273954 caaaactagaagtactatgagttcaattagggtttttaagagtatttaacctatgttgt 44273896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 54875955 - 54876113
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  54875955 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 54876054  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54876055 caaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 54876113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9533729 - 9533532
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  9533729 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 9533630  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  9533629 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 9533532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 14763413 - 14763610
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  14763413 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 14763512  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  14763513 tgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 14763610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 20248436 - 20248605
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  20248436 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 20248535  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    || || ||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20248536 tagggaatatttccaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaac 20248605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Original strand, 179179 - 179327
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  179179 tatgatgaaaataccccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 179278  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  179279 caaaactagaagtactatgagttgaattaaggtgtttaacagtatttaa 179327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10563289 - 10563125
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10563289 tatgatgaacatactcaaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacct 10563190  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10563189 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 10563125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40812413 - 40812258
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  40812413 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 40812314  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40812313 caaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgt 40812258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14508447 - 14508270
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  14508447 atgatttttggttcatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttt-taagttaatccaaaact 14508349  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14508348 taaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 14508270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17538687 - 17538529
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||    
T  17538687 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccttttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcgaaacct 17538588  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17538587 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 17538529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 23371159 - 23371356
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  23371159 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 23371258  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
      ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  23371259 ggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 23371356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37038391 - 37038242
Alignment:
Q  28 aaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaact 127  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  37038391 aaaatactccagagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcaaaacctcaaaact 37038292  T
Q  128 agaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  37038291 agaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 37038242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Original strand, 17670181 - 17670329
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17670181 tatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 17670280  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17670281 caaaactagaaatactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaa 17670329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Original strand, 17685315 - 17685463
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17685315 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 17685414  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17685415 caaaactagaaatactatgaattcaattagggtgtttaagagtatttaa 17685463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14966596 - 14966405
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  14966596 tttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaggga 14966497  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||||    
T  14966496 ataattctaaacctaaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatcattggggtag 14966405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6819689 - 6819531
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  6819689 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattaaggataaccgtttctaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaagct 6819590  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6819589 caaaactataagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgt 6819531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 10541910 - 10542088
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  10541910 atgatttttggtttaggagttatcatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 10542009  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    || || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||    
T  10542010 tagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgt 10542088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14671424 - 14671246
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||    
T  14671424 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttgtaagttaatccaaaact 14671325  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||    
T  14671324 tatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgt 14671246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18889948 - 18889786
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18889948 gagttatgatggaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattccgcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatagttccaa 18889849  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
      |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18889848 ggctcaaatctagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgt 18889786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 13522882 - 13523047
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaa-cttatgggataattccaaccc 119  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |    
T  13522882 tatgatgagaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttaatccaaaaacttatgcgataattccaaggc 13522981  T
Q  120 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  13522982 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 13523047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 55292093 - 55292262
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  55292093 atgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaacccaaaact 55292192  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55292193 tatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaac 55292262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 179
Target Start/End: Original strand, 17519347 - 17519503
Alignment:
Q  23 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||| || |||||| ||| |||||    
T  17519347 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttcaaacctca 17519446  T
Q  123 aaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17519447 aaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgt 17519503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 179
Target Start/End: Original strand, 17534209 - 17534365
Alignment:
Q  23 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||| || |||||| ||| |||||    
T  17534209 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttcaaacctca 17534308  T
Q  123 aaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17534309 aaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgt 17534365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 18367230 - 18367394
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18367230 tatgatgaaaatatttcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataacccgttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccct 18367329  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  18367330 caaagctagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 18367394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 43928927 - 43928775
Alignment:
Q  25 atgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  43928927 atgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttgatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaa 43928828  T
Q  125 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  43928827 attagaagtactatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacatatgtt 43928775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Original strand, 15931979 - 15932125
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||    
T  15931979 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagaaataattccaaacct 15932078  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15932079 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtattt 15932125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Original strand, 31224425 - 31224575
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  31224425 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaatttcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacct 31224524  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtg-tttaagagtatttaac 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31224525 caaaactagaagtactatgagttcaattagggtgttttaagagtatttaac 31224575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 175
Target Start/End: Original strand, 53646532 - 53646686
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  53646532 tatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 53646631  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53646632 caaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatg 53646686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17513160 - 17513011
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||    
T  17513160 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttattgaataattccaaacct 17513061  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17513060 ccaaactagaagtgctatgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaac 17513011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 51300995 - 51300798
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  51300995 atgatttttggtttaggatttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 51300896  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
      ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  51300895 ggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 51300798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12470382 - 12470224
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  12470382 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttatggaataatttcaaacct 12470283  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  12470282 caaaactagaagtactatgagtttaattaaggggtttaagagtatttaacatgtgttgt 12470224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13519882 - 13519704
Alignment:
Q  2 tgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaactt 101  Q
    |||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  13519882 tgatttttggtttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaactt 13519783  T
Q  102 atgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13519782 atggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttgattaagggggtttaagagtatttaacctatgttgt 13519704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 17044566 - 17044392
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||    
T  17044566 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcaacataactgtttctaagttaatccaaaact 17044467  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17044466 tatggaataattccaaacctcaaaattagaaatactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 17044392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 33564709 - 33564555
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  33564709 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctatgttaatccaaaacttatggaataattccaatcct 33564610  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33564609 caaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 33564555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 35065053 - 35065210
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  35065053 tatgatgaaaatactcccatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatt-caaacct 35065151  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35065152 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 35065210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 35354179 - 35354021
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  35354179 tatgatgaaaatactccaacgagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacct 35354080  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  35354079 caaaactagaagtactgggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgt 35354021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 18893208 - 18893067
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18893208 gagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcagaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 18893109  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttta 158  Q
      |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18893108 ggctcaaaactacaagtaatatgagtttaattaaggtgttta 18893067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5223714 - 5223566
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||| ||| ||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5223714 gagttatgatcaaattactccacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatcaaaaacttatgggataataccaa 5223615  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5223614 ccctcaaaactagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 5223566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 177
Target Start/End: Original strand, 50348498 - 50348654
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  50348498 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaactcatgggataattccaaacct 50348597  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    |||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  50348598 caaaactataagtactaggggtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 50348654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 2841935 - 2842092
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  2841935 tatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttcc-aagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacct 2842033  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2842034 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 2842092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 22307055 - 22307213
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || |||    
T  22307055 tatgatgaaaatactcgaaggaggtcttactgaaatcctatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcccaaacttaaggaataattcaaaacct 22307154  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22307155 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacttatgttgt 22307213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 43889271 - 43889429
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  43889271 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaatttatggaataattccaaacct 43889370  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||    
T  43889371 caaaactagaagtactaggagtttaattaagggttttaagagtatttaacatgtgttgt 43889429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15465453 - 15465337
Alignment:
Q  49 agtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15465453 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 15465354  T
Q  149 aaggtgtttaagagtat 165  Q
    |||||||||||||||||    
T  15465353 aaggtgtttaagagtat 15465337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 165
Target Start/End: Original strand, 26055128 - 26055244
Alignment:
Q  49 agtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26055128 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 26055227  T
Q  149 aaggtgtttaagagtat 165  Q
    |||||||||||||||||    
T  26055228 aaggtgtttaagagtat 26055244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 42324673 - 42324857
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||    
T  42324673 atgatttttggtttttgagatataatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttagaaaaattcagtataaccatttctaagttagtcaaaaact 42324772  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    ||  | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  42324773 tagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 42324857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12511428 - 12511270
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  12511428 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 12511329  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  12511328 taaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacatgtgttgt 12511270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19444110 - 19443942
Alignment:
Q  2 tgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaactt 101  Q
    |||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  19444110 tgatttttggtttttgagatattatgaaaatactccaaggaggtcttattaaaattttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaactt 19444011  T
Q  102 atgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  19444010 atgggataattccaaagctccaaactagaagtgccatgagttcaattaaggtgtttgagaatatttaac 19443942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 41172842 - 41173001
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||| |||    
T  41172842 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataatttcaaacct 41172941  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41172942 caaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaacctatgttgt 41173001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 18699945 - 18700103
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  18699945 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttttggaataattccaaacct 18700044  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| | ||||||  |||||||||||||||| | ||||||    
T  18700045 caaaactagaagtgctaggagtttagttaagggatttaagagtatttaacatgtgttgt 18700103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14519862 - 14519685
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  14519862 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaatccaaaact 14519763  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||  |   ||||| | ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14519762 tatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 14519685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 49900316 - 49900153
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagtt--------aatccaaaacttatgggataatt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||        |||||||||||||||| ||||||    
T  49900316 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtttctaagttaatccaaaacttatggaataatt 49900217  T
Q  113 ccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  49900216 ccaaacctcaaaactagaagtactagaagtttaattaaggattttaagagtatttaacctatgt 49900153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 137
Target Start/End: Original strand, 14567683 - 14567800
Alignment:
Q  20 ttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccc 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  14567683 ttatgatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgaaataattccaaacc 14567782  T
Q  120 tcaaaactagaagtacta 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14567783 tcaaaactagaagtacta 14567800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 324289 - 324186
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  324289 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 324190  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  324189 tgtg 324186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6156305 - 6156128
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  6156305 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaact 6156206  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||  |   ||||| | ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6156205 tatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 6156128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Original strand, 52989788 - 52989890
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  52989788 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 52989887  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  52989888 tgt 52989890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 14152857 - 14153029
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||     
T  14152857 tttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaacttttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgga 14152956  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     |   ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14152957 ttgtctccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgt 14153029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 258 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 12469955 - 12469848
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |    
T  12469955 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtgtgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattggt 12469856  T
Q  358 tgtgttgt 365  Q
    ||||||||    
T  12469855 tgtgttgt 12469848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12339760 - 12339657
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12339760 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 12339661  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  12339660 tgtg 12339657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 257 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14966224 - 14966121
Alignment:
Q  257 atgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||     
T  14966224 atgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgt 14966125  T
Q  357 ttgt 360  Q
    ||||    
T  14966124 ttgt 14966121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16796540 - 16796437
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16796540 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 16796441  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  16796440 tgtg 16796437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 365
Target Start/End: Original strand, 43889692 - 43889799
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  43889692 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtagaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtctctcattaatattgttatgttgtgaattgct 43889791  T
Q  358 tgtgttgt 365  Q
    ||||||||    
T  43889792 tgtgttgt 43889799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 194
Target Start/End: Original strand, 52989492 - 52989603
Alignment:
Q  83 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttag 182  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  52989492 ctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgag 52989591  T
Q  183 ttggtccttggg 194  Q
    ||| ||||||||    
T  52989592 ttgatccttggg 52989603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 50755834 - 50756011
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||| |    
T  50755834 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggtggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaatt 50755933  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||  |   ||||| | ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50755934 tatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 50756011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 258 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16643226 - 16643137
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgtt 347  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16643226 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcagtaatattgttatgtt 16643137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 9511618 - 9511795
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  9511618 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaact 9511717  T
Q  101 tatgggataat-tccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||| ||||  | ||||| | |||||||| |  |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9511718 tat-ggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagattaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttgt 9511795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 9519593 - 9519770
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  9519593 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaact 9519692  T
Q  101 tatgggataat-tccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||| ||||  | ||||| | |||||||| |  |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9519693 tat-ggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagattaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttgt 9519770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 365
Target Start/End: Original strand, 11300577 - 11300684
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||||    
T  11300577 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 11300676  T
Q  358 tgtgttgt 365  Q
    ||||||||    
T  11300677 tgtgttgt 11300684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 357
Target Start/End: Original strand, 18700373 - 18700472
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18700373 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgggaaatgtatgatgtttaagtttttgatgtttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 18700472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Original strand, 11914082 - 11914184
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11914082 tgttgttggctatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 11914181  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  11914182 tgt 11914184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15566113 - 15565936
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  15566113 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcatagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaact 15566014  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||  |   ||||| | ||||| |   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15566013 tatggattgtctccaaacttcaaagc-ctatttactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 15565936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Original strand, 17691774 - 17691876
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  17691774 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgacgcatttcgttaatattgttatgtgttgaattgct 17691873  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  17691874 tgt 17691876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 25104670 - 25104831
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| ||| ||||| |||| || |||||||||||||  |  ||||||    
T  25104670 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttacgaaaattccgcataactatttccaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaa 25104769  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     | |||||| | |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25104770 acttcaaaatttg-tgtactatcagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttgt 25104831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Original strand, 54876456 - 54876558
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||   |||||||    
T  54876456 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgacgcatttccttaatattgttatgttgtaaattgct 54876555  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  54876556 tgt 54876558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11258986 - 11258889
Alignment:
Q  82 tctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11258986 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 11258889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5223355 - 5223255
Alignment:
Q  261 tgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgt 360  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  5223355 tgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgtttgt 5223256  T
Q  361 g 361  Q
    |    
T  5223255 g 5223255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17207925 - 17207766
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||||| |  |   |||||    
T  17207925 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatgttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttattgattgtctccaa 17207826  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
     | ||||| || |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17207825 acttcaaagcttg-tgtactatgagttcaaataaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17207766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 4588920 - 4589023
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4588920 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 4589019  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  4589020 tgtg 4589023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 4111396 - 4111494
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  4111396 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 4111494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7109660 - 7109562
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  7109660 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 7109562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7113595 - 7113497
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  7113595 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 7113497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11070030 - 11069932
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  11070030 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 11069932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 11165676 - 11165774
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  11165676 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 11165774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 261 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21837476 - 21837390
Alignment:
Q  261 tgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgtt 347  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21837476 tgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttatgttgttgatgcttttcatgaatattattatgtt 21837390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22321626 - 22321528
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  22321626 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 22321528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22336681 - 22336583
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  22336681 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 22336583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 27409791 - 27409889
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  27409791 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 27409889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28949686 - 28949588
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  28949686 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 28949588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 54330758 - 54330935
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| || || || ||||||||    
T  54330758 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaacacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaggtcaacccaaaact 54330857  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||  |   ||||| | ||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54330858 tatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 54330935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 55022829 - 55022731
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  55022829 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 55022731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15964931 - 15964828
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  15964931 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttttgttgtgaattgct 15964832  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  15964831 tgtg 15964828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15968855 - 15968752
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  15968855 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttttgttgtgaattgct 15968756  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  15968755 tgtg 15968752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15972779 - 15972676
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  15972779 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttttgttgtgaattgct 15972680  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  15972679 tgtg 15972676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 37439783 - 37439886
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||||    
T  37439783 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 37439882  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  37439883 tgtg 37439886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 4107544 - 4107642
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  4107544 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgtttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 4107642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12952640 - 12952464
Alignment:
Q  2 tgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaactt 101  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||| ||||| |||| || |||||||||    
T  12952640 tgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaatcccgcataactatttcaaagtcaacccaaaactt 12952541  T
Q  102 atgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    || |  |   ||||| | ||||| || |  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12952540 atagattgtgtccaaacttcaaatcttg-tgttctatgagctcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 12952464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24546440 - 24546259
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga----aaattcagcacaaccatttctaagttaatccaa 96  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    |||||| ||| ||| |||||||||| || ||||    
T  24546440 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaattaaattccgcataactatttctaagtcaacccaa 24546341  T
Q  97 aacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||| ||||  |   ||||| | ||||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24546340 aactcatggattgtctccaaacttcaaagcctg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 24546259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30065908 - 30065819
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgtt 347  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30065908 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 30065819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14682841 - 14682745
Alignment:
Q  83 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||    
T  14682841 ctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgt 14682745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 17046706 - 17046631
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  17046706 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaa 17046631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 261 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15617333 - 15617247
Alignment:
Q  261 tgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgtt 347  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15617333 tgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 15617247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 217 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14441414 - 14441308
Alignment:
Q  217 ttattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattat--atgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaa 314  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  14441414 ttattattgttgttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgtttgtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaa 14441315  T
Q  315 gttgttg 321  Q
    |||||||    
T  14441314 gttgttg 14441308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 258 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11854695 - 11854594
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||    
T  11854695 tgttgttggttatgtgaaatgtttatatgtcttatgaggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctccgtattaatattgttatgttgtgaattgct 11854596  T
Q  358 tg 359  Q
    ||    
T  11854595 tg 11854594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19775725 - 19775624
Alignment:
Q  260 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttg 359  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||||  |||||| |||    
T  19775725 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgctatgttgtgaattgtttg 19775626  T
Q  360 tg 361  Q
    ||    
T  19775625 tg 19775624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 18739479 - 18739391
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||| |||||||    
T  18739479 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaccttatgg 18739391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 5215227 - 5215156
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaat 92  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5215227 tatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 5215156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14670977 - 14670914
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 321  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14670977 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 14670914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14499287 - 14499189
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    |||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  14499287 tgttgtgggttatgtaaaatattaatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagtggttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 14499189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 179
Target Start/End: Original strand, 19568940 - 19568998
Alignment:
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19568940 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 19568998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 258 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15465129 - 15465068
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgt 319  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15465129 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttatgttgt 15465068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 17938126 - 17938022
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||| ||    
T  17938126 atgatttttggtttttgatttatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaacct 17938027  T
Q  101 tatgg 105  Q
    |||||    
T  17938026 tatgg 17938022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 46723078 - 46723149
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 72  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  46723078 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactaaaatcttatgaaaattcagc 46723149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15978066 - 15977997
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  15978066 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 15977997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 28848250 - 28848319
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  28848250 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 28848319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 71
Target Start/End: Original strand, 51603072 - 51603122
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51603072 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 51603122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 224 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 37427925 - 37427814
Alignment:
Q  224 tgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataat--tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 321  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||| ||| |  ||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  37427925 tgttgttcagagagtctgaaaataagatgattgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttg 37427826  T
Q  322 atgcttttcatt 333  Q
    ||| || |||||    
T  37427825 atgattatcatt 37427814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14682476 - 14682413
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 321  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  14682476 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaattgacgatgtttaagttgttg 14682413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17046395 - 17046278
Alignment:
Q  230 tcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattat--atgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctt 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||  |||| |||||||||| || ||||||||| ||||||| | || ||    
T  17046395 tcagagagtctgaaattaaaatgattaatgttgttagtattgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatatatgatgttgaagttgtggttgttt 17046296  T
Q  328 ttcattaatattgttatg 345  Q
     || ||||||||||||||    
T  17046295 atcgttaatattgttatg 17046278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 77
Target Start/End: Original strand, 7780977 - 7781044
Alignment:
Q  9 tggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  7780977 tggtttaggcgttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 7781044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 12305662 - 12305587
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  12305662 atgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 12305587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 16453908 - 16453955
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16453908 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaa 16453955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18893063 - 18892993
Alignment:
Q  128 agaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||  |||||||||||    
T  18893063 agaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagatgacccttggggtag 18892993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 19568863 - 19568933
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 71  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19568863 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcttagtgaaatcttagcaaaattcag 19568933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 54521362 - 54521309
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaa 54  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54521362 atgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaa 54521309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 77
Target Start/End: Original strand, 26054903 - 26054962
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  26054903 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 26054962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 29544464 - 29544539
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||    
T  29544464 atgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaatttttatg-aatttcagcacaac 29544539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 179
Target Start/End: Original strand, 42353218 - 42353304
Alignment:
Q  94 caaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggt-gtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||| || ||||||| || ||||||||| | ||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  42353218 caaaacttagggaataattctaaacctcaaaacaaaaagtattaggagtttaattaagggagtttaagagtatttaacgtatgttgt 42353304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 365
Target Start/End: Original strand, 14569026 - 14569133
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatg-tgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    |||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||||| ||||  ||||||  ||||| |    
T  14569026 tgttgttggttatggtaaaatatgtatataccttatgtggaaaatgtatgatgttaaag-agttgatgtttgtcattattattcatatgttgtgaattac 14569124  T
Q  357 ttgtgttgt 365  Q
    |||||||||    
T  14569125 ttgtgttgt 14569133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15465674 - 15465619
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  15465674 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 15465619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 5223903 - 5223860
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5223903 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 5223860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17046630 - 17046584
Alignment:
Q  133 tactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17046630 tactattagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 17046584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 8023806 - 8023718
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| ||| | | ||||||| |||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  8023806 gagttatgatgaaaatactacaagtaggttttggtgcaatttaacgaaaatttagcataactatttttaagtcaacccaaaacttatgg 8023718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 55
Target Start/End: Original strand, 11986874 - 11986912
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 55  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11986874 gagttatgatgaaaatactacaagggggtcttagtgaaa 11986912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 255
Target Start/End: Original strand, 17685649 - 17685687
Alignment:
Q  217 ttattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgatt 255  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17685649 ttattattgttgttcagagagtctgaaattaagatgatt 17685687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 255
Target Start/End: Original strand, 17691611 - 17691649
Alignment:
Q  217 ttattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgatt 255  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17691611 ttattattgttgttcagagagtctgaaattaagatgatt 17691649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 255
Target Start/End: Original strand, 54876289 - 54876327
Alignment:
Q  217 ttattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgatt 255  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54876289 ttattattgttgttcagagagtctgaaattaagatgatt 54876327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 8631326 - 8631274
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 69  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||    
T  8631326 gagttatgttgaaaacactccaaggagatcttattgaaattttacgaaaattc 8631274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 179
Target Start/End: Original strand, 14568649 - 14568689
Alignment:
Q  139 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14568649 gagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgt 14568689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16979220 - 16979176
Alignment:
Q  317 tgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtg 361  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16979220 tgttgttggttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtg 16979176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 36528098 - 36528062
Alignment:
Q  20 ttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaat 56  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  36528098 ttatgatgaaaataccccaaggaggtcttagcgaaat 36528062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 79)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 21 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 263437 - 263098
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  263437 tatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgcaaacct 263338  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  263337 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtagaaacgaagttgtttataa-tat 263239  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  263238 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatgtgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 263139  T
Q  321 gatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtg 361  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  263138 gatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtg 263098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 21 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17011306 - 17010966
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  17011306 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaactt 17011207  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtcctt-ggggtagaaacaaagttgcttataatta 219  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||| ||    
T  17011206 caaaactaaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttgggggtagaaacgaggttgtttataa-ta 17011108  T
Q  220 ttaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17011107 ttaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgt 17011008  T
Q  320 tgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtg 361  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17011007 tgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtg 17010966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 33473016 - 33473330
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  33473016 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaact 33473115  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaa 200  Q
    || || |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33473116 tagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtagaa 33473215  T
Q  201 acaaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaa 300  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33473216 acgaagttgtttataa-tattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaa 33473314  T
Q  301 tgtatgatgtttaagt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  33473315 tgtatgatgtttaagt 33473330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 27869027 - 27869205
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27869027 atgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaacatttctaagttaatccaaaact 27869126  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27869127 tatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaacctatgttgt 27869205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17812996 - 17812812
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  17812996 atgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 17812897  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  17812896 taagggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 17812812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6766261 - 6766064
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  6766261 atgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttggtaaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 6766162  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  6766161 tatgggataattccaaacctcaaaaatagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtag 6766064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18418992 - 18418815
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18418992 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataatcgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccct 18418893  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18418892 caaaactagaagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtag 18418815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29448414 - 29448241
Alignment:
Q  25 atgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  29448414 atgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaa 29448315  T
Q  125 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  29448314 actagaagtagtatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtag 29448241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 24277058 - 24277242
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  24277058 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaact 24277157  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  24277158 tatgggataattccaaccctcaaaactataagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 24277242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24385155 - 24384971
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  24385155 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaact 24385056  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  24385055 tatgggataattccaaccctcaaaactataagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 24384971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 41876045 - 41876222
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  41876045 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaatct 41876144  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttg 178  Q
    || || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41876145 tagggaataattccaaacctcaaaactaaaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 41876222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22336920 - 22336751
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22336920 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaact 22336821  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22336820 tatgggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagagtatttaac 22336751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 36460550 - 36460375
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  36460550 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 36460451  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |  |||||||||    
T  36460450 caaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttggggt 36460375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22412586 - 22412410
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22412586 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaagttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 22412487  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| | ||||||||||    
T  22412486 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgat-cttggggtag 22412410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 30138636 - 30138812
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30138636 tatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaac-cttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaacccaaaatttatgggataatttcaaccct 30138734  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30138735 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtag 30138812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 32607783 - 32607955
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  32607783 tttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagctaatccaaaacttatgga 32607882  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32607883 ataattccaaacctcaaaactagaagtactataagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 32607955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17875579 - 17875430
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  17875579 tatgataaaaatactccgaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttatagaataattccaaccct 17875480  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17875479 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 17875430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22340458 - 22340289
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22340458 atgatttttggtttaagagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaact 22340359  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22340358 tataggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagagtatttaac 22340289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 38145190 - 38145387
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  38145190 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 38145289  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  38145290 tgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatacgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 38145387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Original strand, 22758360 - 22758511
Alignment:
Q  18 agttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaac 117  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22758360 agttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaag 22758459  T
Q  118 cctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22758460 gctcaaaactagaagcactatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaa 22758511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20566134 - 20565976
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  20566134 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacct 20566035  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20566034 caaaactagaattactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 20565976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 21399475 - 21399633
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  21399475 tatgataaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 21399574  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21399575 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctattttgt 21399633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 21557516 - 21557694
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21557516 tatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaaatcttacgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct 21557615  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttt-aagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| |  |||||||||||    
T  21557616 aaaaactagaagtactataagttcaattaaggtgtttaaagagtatttaaactatgttgtgagtcgacccttggggtag 21557694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 28370708 - 28370905
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  28370708 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 28370807  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
      ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  28370808 ggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 28370905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 42960971 - 42960783
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  42960971 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttcgggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtggg 42960872  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttgggg 195  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||    
T  42960871 ataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgcttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggg 42960783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22750528 - 22750375
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22750528 gagttatgatggaaatactccaagtaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaa 22750429  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22750428 acctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 22750375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 37598569 - 37598766
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  37598569 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 37598668  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    | ||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  37598669 tgtgggacaattccaaggctcaaaactagaattaatatgagtgcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 37598766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 21554850 - 21555009
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  21554850 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtctaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacct 21554949  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttt-aagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  21554950 caaaactagaagtactacgagttcaattaaggtgtttaaagagtatttaacccatgttgt 21555009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 175
Target Start/End: Original strand, 8833671 - 8833824
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  8833671 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 8833770  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  8833771 caaaactagaagtactaggggttc-attaagttgtttaagagtatttaacctatg 8833824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19921214 - 19921056
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  19921214 tatgatgaaaatactccaaggaaatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacct 19921115  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19921114 taaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacatatgttgt 19921056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31456378 - 31456201
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  31456378 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgggaaaattaagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaaaaattccaaccct 31456279  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| |  |||||||||||    
T  31456278 caaaactagaaatactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacccatattgtgagtcgacccttggggtag 31456201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19511787 - 19511617
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  19511787 atgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtggaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 19511688  T
Q  101 tatgggataattccaaccctc-aaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    || || |||||| ||| |||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19511687 tagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagcattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaac 19511617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 177
Target Start/End: Original strand, 20198060 - 20198216
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  20198060 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgacattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacct 20198159  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  20198160 caaaacttgaagtactaggagtttaattaaggggtataagagtatttaacctatgtt 20198216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 26761981 - 26761827
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  26761981 tatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaacattcaacataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataactccaaacct 26761882  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26761881 caaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 26761827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 175
Target Start/End: Original strand, 33895354 - 33895508
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||    
T  33895354 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattgtgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttatagaataaatccaaacct 33895453  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  33895454 caaaactataagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatg 33895508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 36509248 - 36509407
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||| |||    
T  36509248 tatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataatttcaaacct 36509347  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36509348 caaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaacctatgttgt 36509407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 22107500 - 22107603
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22107500 tgttgttggttatgtcaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 22107599  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  22107600 tgtg 22107603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 6765883 - 6765781
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6765883 tgttgttggttgtgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 6765784  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  6765783 tgt 6765781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16063085 - 16062908
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  16063085 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaact 16062986  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||| |  |   || || | ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16062985 tatagattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 16062908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18744249 - 18744072
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||||||| || || ||||||||    
T  18744249 atgatatttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaact 18744150  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||  |   ||||| | ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18744149 tatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 18744072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 365
Target Start/End: Original strand, 20910982 - 20911089
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| |    
T  20910982 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgtt 20911081  T
Q  358 tgtgttgt 365  Q
    ||||||||    
T  20911082 tgtgttgt 20911089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 29448058 - 29447952
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttg-ttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  29448058 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgg-aaatgtataatgtttaaattgattgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 29447960  T
Q  357 ttgtgttg 364  Q
    ||||||||    
T  29447959 ttgtgttg 29447952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 33895711 - 33895814
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  33895711 tgttgtgggttttgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaactgct 33895810  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  33895811 tgtg 33895814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22111179 - 22111022
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||| | |    
T  22111179 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaactt 22111080  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||| || |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22111079 caaagcttg-tgtactgtgagttctattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 22111022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 8504321 - 8504496
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || ||||||||    
T  8504321 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaact 8504420  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    |||||  |   | ||| | ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8504421 tatggattgtcttcaaacttcaaagcttg-tgtactatgaattcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 8504496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18356251 - 18356148
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| |    
T  18356251 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttgagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgtt 18356152  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  18356151 tgtg 18356148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 1627849 - 1628010
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||  |   |||||    
T  1627849 gagttatgatgaaaatactcgaaggaggtcttaatgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattttctccaa 1627948  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     | ||||| || |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1627949 acttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaacgtgtttaagagtatttaacctatgttgt 1628010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 14026276 - 14026437
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||  ||| |||||||||| || ||||||| |||||  |   |||||    
T  14026276 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatcccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacatatggattgtctccaa 14026375  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     | ||||| || |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14026376 acttcaaatcttg-tgtactatgagttgaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 14026437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 15236982 - 15237080
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  15236982 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 15237080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 19472867 - 19472965
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  19472867 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 19472965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20295806 - 20295708
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  20295806 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 20295708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Original strand, 23199847 - 23200017
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||     
T  23199847 tttggtttctgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgga 23199946  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttt-aagagtatttaacgtatgtt 177  Q
     |   |||||   ||||| || |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  23199947 ttgtctccaaaattcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaagtgtttgaagagtatttaacctatgtt 23200017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 365
Target Start/End: Original strand, 40723734 - 40723841
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   | || ||||||||||||  ||||||||    
T  40723734 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataatagtattgttatgttgtgaattgct 40723833  T
Q  358 tgtgttgt 365  Q
    ||||||||    
T  40723834 tgtgttgt 40723841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 16605062 - 16605233
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||     
T  16605062 tttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaagtttatgaaaattccgcataactatttataagtcaacccaaaacttatgga 16605161  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     |   ||||| | ||||| || |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16605162 ttgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgt 16605233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 100
Target Start/End: Original strand, 40917445 - 40917524
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  40917445 tatgatgaaaatactcaaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 40917524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 185
Target Start/End: Original strand, 12122080 - 12122158
Alignment:
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  12122080 ataattctaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttg 12122158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 10753321 - 10753220
Alignment:
Q  260 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttg 359  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  10753321 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgctatgttgtgaattgcttg 10753222  T
Q  360 tg 361  Q
    ||    
T  10753221 tg 10753220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 24617375 - 24617446
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 72  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24617375 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24617446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 24713606 - 24713677
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 72  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24713606 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24713677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 24746634 - 24746705
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 72  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24746634 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24746705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 24668649 - 24668720
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 72  Q
    ||||| ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24668649 atgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24668720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 24738418 - 24738489
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 72  Q
    ||||| ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24738418 atgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24738489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 24751187 - 24751258
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 72  Q
    ||||| ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24751187 atgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24751258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 10732569 - 10732638
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  10732569 tttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 10732638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 42244994 - 42245063
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  42244994 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 42245063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26749677 - 26749538
Alignment:
Q  37 caaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtact 136  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| |||| || || || |||||| ||||||  |   ||||| | ||||| ||    |||||    
T  26749677 caaggaggtcttagcgaaattttatgaaaattccgcataactatttataggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagctttt-gtact 26749579  T
Q  137 atgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26749578 atgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 26749538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 37804525 - 37804600
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  37804525 atgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 37804600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18356370 - 18356308
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 321  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18356370 tgttgttggttatctgaaatatttatatgctttat-tggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 18356308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 321
Target Start/End: Original strand, 20910863 - 20910925
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 321  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20910863 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttat-tggaaaatgtatgatgtataagttgttg 20910925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 28901463 - 28901346
Alignment:
Q  58 ttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttt 157  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||   |||     
T  28901463 ttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagtttaattaaaaggttg 28901365  T
Q  158 aagagtatttaacgtatgt 176  Q
     |||||||||||| |||||    
T  28901364 gagagtatttaacctatgt 28901346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 28937858 - 28937741
Alignment:
Q  58 ttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttt 157  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||   |||     
T  28937858 ttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagtttaattaaaaggttg 28937760  T
Q  158 aagagtatttaacgtatgt 176  Q
     |||||||||||| |||||    
T  28937759 gagagtatttaacctatgt 28937741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 30612108 - 30611975
Alignment:
Q  45 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 144  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| |||| ||||| || |||||| ||||||  |   |||||   |||||||| |  ||||||||||||     
T  30612108 tcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttgtaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaaattcaaaacttgt-gtactatgagttg 30612010  T
Q  145 aattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30612009 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 30611975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 30614068 - 30613935
Alignment:
Q  45 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 144  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||  |   |  ||   ||||| || |  ||||||||||||     
T  30614068 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctttaaaattcaaagcttgt-gtactatgagttg 30613970  T
Q  145 aattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30613969 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 30613935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 31478951 - 31478803
Alignment:
Q  20 ttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccc 119  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||||  |||||  |  ||||||  |    
T  31478951 ttatgatgaaaatactaca-gtaggtcttggtgaaattttacgaaaattcagcataaccatttttaagtgaactcaaaagctatggtttggttccaaaac 31478853  T
Q  120 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    |||||||| | ||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  31478852 tcaaaacttg-agtactaggagtttaattatgatgtttaagagtatttaac 31478803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 17909051 - 17908963
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||  ||| |||||||| ||||||   | ||||||| || ||||| |||||||    
T  17909051 gagttatgatgaaaatactctaaggaggttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtctctaagtcaacccaaaccttatgg 17908963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 269
Target Start/End: Original strand, 20469804 - 20469843
Alignment:
Q  229 ttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggtta 269  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20469804 ttcagagagtctgaa-ttaaaatgattaatgttgttggtta 20469843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 29346519 - 29346444
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  29346519 atgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 29346444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 29348992 - 29348917
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  29348992 atgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 29348917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 29351465 - 29351390
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  29351465 atgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 29351390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Original strand, 70280 - 70643
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  70280 atgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatcaaaaact 70379  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaa 200  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  70380 tatgagataattccaaaactcaaaactagaagtactataagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttggtccttggggtagaa 70479  T
Q  201 acaaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaa 300  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70480 acgaagttgtttataa-tattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttcttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaa 70578  T
Q  301 tgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtgttgt 365  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  70579 tatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtttgtgttgt 70643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 71991 - 71941
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 71  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  71991 tatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcag 71941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 163)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 21 - 361
Target Start/End: Original strand, 32160674 - 32161012
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32160674 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct 32160773  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||    
T  32160774 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttagggtagaaacgaagttgtttataa-tat 32160872  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  32160873 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgg-aattgtatgatgtttaagttgtt 32160971  T
Q  321 gatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtg 361  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32160972 gatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtg 32161012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 21 - 365
Target Start/End: Original strand, 16550476 - 16550819
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16550476 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattgagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct 16550575  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||| |||    
T  16550576 caaaactagaagtactatgagtttaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgttccttggggtagaaacgaggttgtttataa-tat 16550674  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16550675 taatgttattcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaacgtatgatgtttaagttgtt 16550774  T
Q  321 gatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtgttgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16550775 gatgcttttcattaatattgttatgttttgaattgcttgtgttgt 16550819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 21 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16615186 - 16614843
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16615186 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattgagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct 16615087  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||| |||    
T  16615086 caaaactagaagtactatgagtttaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgttccttggggtagaaacgaggttgtttataa-tat 16614988  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16614987 taatgttattcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaacgtatgatgtttaagttgtt 16614888  T
Q  321 gatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtgttgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16614887 gatgcttttcattaatattgttatgttttgaattgcttgtgttgt 16614843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 21 - 320
Target Start/End: Original strand, 709027 - 709327
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  709027 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcttaactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 709126  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  709127 caaaactagaagtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtagaaacgaagttgtttataa-tat 709225  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataatta--tatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttg 318  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  709226 taatgttgttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttagtgatgtgatatagttatttatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttg 709325  T
Q  319 tt 320  Q
    ||    
T  709326 tt 709327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 48812438 - 48812121
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  48812438 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactgcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 48812339  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaa 200  Q
    ||  | |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48812338 tagagaataattccaaacctcaaaactagaagtattaggagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtagaa 48812239  T
Q  201 acaaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataatta--tatgccttatgtggaa 298  Q
    || |||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  ||||  ||||||||||    
T  48812238 acgaagttatttat-attattaatgttgttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttagttatgtgatatagttatttatgtattatgtggaa 48812140  T
Q  299 aatgtatgatgtttaagtt 317  Q
     |||||||||||| |||||    
T  48812139 tatgtatgatgttgaagtt 48812121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 14191554 - 14191795
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14191554 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 14191653  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataa 216  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14191654 acctcaaaactataagtactataagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtagaaacgaagttgtttataa 14191753  T
Q  217 ttattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatg 259  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14191754 -tattaatgttgttcagagagtctgaaattaagatgattaatg 14191795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 14188760 - 14189001
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14188760 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtctttgtgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 14188859  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataa 216  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14188860 acctcaaaactataagtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtagaaacgaagttgtttataa 14188959  T
Q  217 ttattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatg 259  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14188960 -tattaatgttgttcagagagtctgaaattaagatgattaatg 14189001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16462616 - 16462316
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  16462616 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcatagctgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 16462517  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  16462516 caaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgattaacagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtagaaacgaagttgtttataa-tat 16462418  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataatta--tatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttg 318  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||  ||||  |||||||||| ||| |||||||| ||| ||    
T  16462417 taaagttgttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttagtgatgtgatatagttatttatgtattatgtggaatatgcatgatgttgaaggtg 16462318  T
Q  319 tt 320  Q
    ||    
T  16462317 tt 16462316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 320
Target Start/End: Original strand, 47975383 - 47975683
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |    
T  47975383 tatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacat 47975482  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||    
T  47975483 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttcgtccttggggtagaaacgaagttctttataa-tat 47975581  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataatta--tatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttg 318  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| |||  ||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  47975582 taatattgttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttagtgatgtgttatagttatttatacattatgtggaatatgtatgatgttgaagttg 47975681  T
Q  319 tt 320  Q
    ||    
T  47975682 tt 47975683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 18456120 - 18456297
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456120 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccct 18456219  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18456220 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtag 18456297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 185
Target Start/End: Original strand, 58876 - 59054
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58876 tttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 58975  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  58976 ataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 59054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18607887 - 18607690
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18607887 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttaaggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaact 18607788  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  18607787 tatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 18607690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13647822 - 13647645
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13647822 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccct 13647723  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13647722 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtag 13647645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 17070765 - 17070929
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  17070765 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttattgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaattct 17070864  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  17070865 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttg 17070929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 47094660 - 47094496
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47094660 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct 47094561  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  47094560 caaaactagtagtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 47094496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 13745228 - 13745406
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  13745228 atgatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcgatccaaaact 13745327  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  13745328 tatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttcagagtatttaacctatgttgt 13745406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 178
Target Start/End: Original strand, 14415955 - 14416113
Alignment:
Q  20 ttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  14415955 ttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacc 14416054  T
Q  120 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14416055 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 14416113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14422385 - 14422207
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14422385 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaact 14422286  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  14422285 tatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagcatttaacccatgttgt 14422207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 8756848 - 8757032
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  8756848 atgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccgaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 8756947  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  8756948 tttgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 8757032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 30820728 - 30820905
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30820728 tatgataaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagataatccaaaacttatgggataattccaaacct 30820827  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |  |||||||||||    
T  30820828 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtcgacccttggggtag 30820905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4325636 - 4325488
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  4325636 tatgatgaaaatactccaagaaggtcttaatgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgcgataattccaaagct 4325537  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4325536 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 4325488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11661689 - 11661521
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11661689 gagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 11661590  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  11661589 ggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 11661521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 12755178 - 12755342
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12755178 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 12755277  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  12755278 taaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttgacccatgttgtgagttg 12755342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15214099 - 15213921
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  15214099 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaact 15214000  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  15213999 tatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaatttatgttgt 15213921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 10896446 - 10896615
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10896446 atgatttttagtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaact 10896545  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    || || |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10896546 tagggaataattccaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaagctgtttaagagtatttaac 10896615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16008978 - 16008781
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  16008978 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 16008879  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  16008878 tgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 16008781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18872760 - 18872563
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  18872760 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 18872661  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  18872660 tgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 18872563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Original strand, 40555215 - 40555364
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  40555215 tatgatgtaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 40555314  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40555315 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagtgtatttaac 40555364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 832495 - 832659
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  832495 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagact 832594  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  832595 caaaactagaagtaatatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 832659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 1197675 - 1197839
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  1197675 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagact 1197774  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  1197775 caaaactagaagtaatatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 1197839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 13699341 - 13699525
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||    
T  13699341 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggccttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccatttctaagttaatctgaaact 13699440  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  13699441 tatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 13699525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 148012 - 147821
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  148012 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggg 147913  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||  |||||||||||    
T  147912 ataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgaattgacccttggggtag 147821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 12465732 - 12465890
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  12465732 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 12465831  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12465832 caaaactagaagtactatgacttcaattaggatgtttaagagtatttaacttatgttgt 12465890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19282676 - 19282514
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  19282676 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaa 19282577  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19282576 acctcaaaaatagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 19282514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 36685721 - 36685899
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  36685721 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcgtaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacct 36685820  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtg-tttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||| ||| |  |||||||||||    
T  36685821 caaaactagaagtactatgagttcaattaagatgttttaagagtatttaacccatgttgtgagtcgacccttggggtag 36685899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 46386559 - 46386717
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  46386559 tatgatgaaaatattccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 46386658  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46386659 caaaactagaagtactatgagttcaactatggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 46386717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 17505456 - 17505625
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  17505456 atgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaact 17505555  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17505556 tatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaac 17505625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17547758 - 17547589
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  17547758 atgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaact 17547659  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17547658 tatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaac 17547589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 38828661 - 38828492
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38828661 atgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaactatttctaagttaatccaaaact 38828562  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38828561 tatgagacaattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 38828492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13408352 - 13408188
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  13408352 tatgatgaaaattctccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaggct 13408253  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  13408252 caaaactagaagtactatgagttcaattaagttttttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 13408188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34957751 - 34957579
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  34957751 tatgattaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaaggtaatccaaaacttatgggataattccaaggat 34957652  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttgg 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| |||||||    
T  34957651 caaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttatgagttgatccttgg 34957579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Original strand, 37727395 - 37727563
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37727395 gagttatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaa 37727494  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  37727495 ccatcaaaactagaagtactatgagttcaatcaaggtgtttaagagtttttaacctatgttgtgagttg 37727563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 179
Target Start/End: Original strand, 13745671 - 13745830
Alignment:
Q  20 ttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||    
T  13745671 ttatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatagccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaataattccaaacc 13745770  T
Q  120 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13745771 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 13745830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 32771906 - 32771760
Alignment:
Q  23 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctca 122  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  32771906 tgatgaaaataatccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctca 32771807  T
Q  123 aaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32771806 aaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 32771760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 33001494 - 33001336
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  33001494 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 33001395  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33001394 caaaactagaaatactatgagttcaattaaggtgtttaagagaatttaacctatgttgt 33001336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 44374526 - 44374368
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||    
T  44374526 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacct 44374427  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44374426 caaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 44374368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 44383391 - 44383233
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||    
T  44383391 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacct 44383292  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44383291 caaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 44383233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 8851617 - 8851786
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  8851617 tttggttctggagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgga 8851716  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  8851717 ataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagattatttaacctatgt 8851786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14566602 - 14566405
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  14566602 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 14566503  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
      ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  14566502 ggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 14566405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15167559 - 15167406
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  15167559 gagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaa 15167460  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15167459 acctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 15167406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 48743883 - 48743727
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  48743883 tatgatgaaaatacttcaaggagaacttagtgaaatcttataaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 48743784  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  48743783 caaaactagatgtactatgagttcaattaaggtgtttaggagtatttaacatatgtt 48743727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12371848 - 12371697
Alignment:
Q  28 aaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaact 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  12371848 aaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaact 12371749  T
Q  128 agaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12371748 agaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtatttaacctatgttgt 12371697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11067048 - 11066890
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  11067048 tatgatgaaaatactccatggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattgcaaacct 11066949  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11066948 caaaactagaagtactatgatttcaactagggtgtttaagagtatttaacttatgttgt 11066890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 12127636 - 12127794
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||    
T  12127636 tatgatgaaaatacttcagggaggtattagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaagttaaggaataattccaaacct 12127735  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12127736 caaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 12127794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 13147944 - 13148102
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  13147944 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 13148043  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13148044 caaaactacaagtattatgagatcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 13148102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16580254 - 16580082
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  16580254 tttggtttaggagttgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaggga 16580155  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||    
T  16580154 ataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgt 16580082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 16585409 - 16585581
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  16585409 tttggtttaggagttgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaggga 16585508  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||    
T  16585509 ataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgt 16585581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13894652 - 13894517
Alignment:
Q  44 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagtt 143  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13894652 gtcttagtgaaatcttattaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaagctcaaaactagaagtactatgagtt 13894553  T
Q  144 caattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13894552 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 13894517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 57 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14273892 - 14273751
Alignment:
Q  57 cttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtt 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14273892 cttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtt 14273793  T
Q  157 taagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14273792 taagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtag 14273751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 13918235 - 13918383
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||| | ||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13918235 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaa 13918334  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13918335 ccctcaaaactagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 13918383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16999011 - 16998829
Alignment:
Q  22 atgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16999011 atgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctatgttaatccaaaacttatagaataattccaaccctc 16998912  T
Q  122 aaaactagaagt------actatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16998911 aaaactagaagtaccatcaccatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtag 16998829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 175
Target Start/End: Original strand, 15119767 - 15119921
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  15119767 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttataaatattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaact 15119866  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15119867 caaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 15119921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 29004402 - 29004232
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   ||    
T  29004402 tatgatgaaaatactcaagggaggtcctagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccgtttccaagttaatcgaaaacttatgggataattccaggact 29004303  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtcctt 191  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  29004302 aaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcctt 29004232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 179
Target Start/End: Original strand, 16460397 - 16460562
Alignment:
Q  14 taggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattc 113  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16460397 taggcgttaggatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattc 16460496  T
Q  114 caaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||||||    
T  16460497 caaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaatattatttaacatgtgttgt 16460562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 165
Target Start/End: Original strand, 25926993 - 25927109
Alignment:
Q  49 agtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25926993 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 25927092  T
Q  149 aaggtgtttaagagtat 165  Q
    |||||||||||||||||    
T  25927093 aaggtgtttaagagtat 25927109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Original strand, 32434061 - 32434209
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  | |||||| ||| |||    
T  32434061 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttaatgaataatttcaaacct 32434160  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  32434161 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaa 32434209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14258932 - 14258774
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  14258932 tatgatgaaaggactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 14258833  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  14258832 caaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacatttgttgt 14258774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 14928784 - 14928962
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14928784 atgatttttggtttacgagttatgatgaaaataatacaaggagtacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 14928883  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    || || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  14928884 tagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaaagtgtttaaaagtatctaacctatgttgt 14928962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 15352250 - 15352428
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15352250 atgatttttggtttacgagttatgatgaaaataatacaaggagtacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 15352349  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    || || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  15352350 tagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaatgtgtttaaaagtatctaacctatgttgt 15352428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20585932 - 20585778
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  20585932 tatgatgaaaatactccaaggaggt----gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacct 20585837  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20585836 caaaattagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacttatgttgt 20585778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 151
Target Start/End: Original strand, 13864867 - 13864997
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  13864867 tatgaggaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttagaaaaattcagtacaaccttttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 13864966  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaag 151  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13864967 caaaagtagaagtactatgagttcaattaag 13864997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 12323382 - 12323527
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12323382 atgatatttggttcttgagatatgatgaaaatacttgaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 12323481  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaa 146  Q
    || || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12323482 taaggaataattccaaacctcaaaactaaaagtactatgagttcaa 12323527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 126
Target Start/End: Original strand, 29052627 - 29052732
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29052627 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct 29052726  T
Q  121 caaaac 126  Q
    ||||||    
T  29052727 caaaac 29052732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 32301762 - 32301604
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  32301762 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttaatgaaattttatgaaaatacagcataaccgtttataagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacct 32301663  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  32301662 caaaactataagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacatgtgttgt 32301604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Original strand, 14153427 - 14153599
Alignment:
Q  4 atatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttat 103  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14153427 atatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttat 14153526  T
Q  104 gggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    ||  |   ||||| | ||||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14153527 ggattgtctccaaacttcaaagcctg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14153599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15720050 - 15719948
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15720050 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 15719951  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  15719950 tgt 15719948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20619866 - 20619717
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||    
T  20619866 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttaataaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccataacttatggaataattccaaaact 20619767  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    ||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||||||||    
T  20619766 caaaattagaagtattaggattttaattaaggggtttaagagtatttaac 20619717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 258 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 32301342 - 32301235
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32301342 tgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatacttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 32301243  T
Q  358 tgtgttgt 365  Q
    ||||||||    
T  32301242 tgtgttgt 32301235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 8940304 - 8940202
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8940304 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 8940205  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  8940204 tgt 8940202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14258505 - 14258403
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14258505 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttgagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 14258406  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  14258405 tgt 14258403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16998647 - 16998545
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16998647 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgttgaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 16998548  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  16998547 tgt 16998545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 39292189 - 39292366
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||| | ||  |||||||    
T  39292189 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaaatcaactcaaaact 39292288  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||  |  |||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39292289 tatggattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 39292366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Original strand, 46580741 - 46580843
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  46580741 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgctgtgaattgct 46580840  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  46580841 tgt 46580843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 1858897 - 1859000
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  1858897 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgatatgttgtgaattgct 1858996  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  1858997 tgtg 1859000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 2530202 - 2530304
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2530202 tgttgttggttatgtgaaata-ttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 2530300  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  2530301 tgtg 2530304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 13918591 - 13918694
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13918591 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatatggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 13918690  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  13918691 tgtg 13918694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 365
Target Start/End: Original strand, 16460831 - 16460938
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  16460831 tgttgttagttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcatcaatattgttatgttgtgaattgct 16460930  T
Q  358 tgtgttgt 365  Q
    | ||||||    
T  16460931 tttgttgt 16460938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 21538657 - 21538818
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||| || ||||||||||| |  |  ||||||    
T  21538657 gagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataatcatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtttccaa 21538756  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     | |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21538757 acttcaaaacttg-tgtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 21538818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 8468772 - 8468665
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8468772 tgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 8468673  T
Q  358 tgtgttgt 365  Q
    ||| ||||    
T  8468672 tgtattgt 8468665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 257 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15112999 - 15112896
Alignment:
Q  257 atgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  15112999 atgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtagaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaatttc 15112900  T
Q  357 ttgt 360  Q
    ||||    
T  15112899 ttgt 15112896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16579813 - 16579710
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16579813 tgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtgtaaaatgtattatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 16579714  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  16579713 tgtg 16579710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 16585850 - 16585953
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16585850 tgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtgtaaaatgtattatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 16585949  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  16585950 tgtg 16585953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 25927314 - 25927417
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25927314 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 25927413  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  25927414 tgtg 25927417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 18875318 - 18875476
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||  |   ||||| |||    
T  18875318 tatgataaaaatactccaaggatgtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaatccaaaacttgtggattgtctccaaacct 18875417  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18875418 caaaactagaagtaacaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgt 18875476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 258 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14273569 - 14273480
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgtt 347  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  14273569 tgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgtttttcattaatattgttatgtt 14273480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 4691354 - 4691525
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||     
T  4691354 tttggtttttgatttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgga 4691453  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     |   ||||| | |||||  | |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4691454 ttgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtatttaaccaatgttgt 4691525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Original strand, 3192761 - 3192920
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||| || ||||||||||||   |  ||| ||    
T  3192761 gagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattgtgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgatttgtttctaa 3192860  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
     | ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  3192861 acttcaaaactagaagtattatgagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 3192920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 257 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26292355 - 26292256
Alignment:
Q  257 atgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  26292355 atgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 26292256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 43277211 - 43277374
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa-ttcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcca 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||| ||| ||||||| || ||  ||||||||||||  |   ||||    
T  43277211 gagttatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaaattttatcaaaaattccgcataactatttctaggtcaactcaaaacttatggattgtctcca 43277310  T
Q  116 accctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  43277311 aacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacatatgttgt 43277374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33066 - 32968
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  33066 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 32968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 12704806 - 12704904
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  12704806 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12704904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12714823 - 12714725
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  12714823 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12714725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12718627 - 12718529
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  12718627 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12718529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16324105 - 16324004
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16324105 tgttgttggttatgtgaaatg-ttatatgccttttgtggaaaatgcatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 16324007  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  16324006 tgt 16324004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 16907348 - 16907446
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  16907348 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 16907446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 336
Target Start/End: Original strand, 17060490 - 17060568
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaat 336  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17060490 tgttgttggttatgtgaaatatttatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaat 17060568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18279362 - 18279264
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  18279362 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttttgaattgc 18279264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18283325 - 18283227
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  18283325 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 18283227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25942037 - 25941860
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |  ||||||| || || ||||| ||    
T  25942037 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcatgataatttctaggtcaacccaaatct 25941938  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||  |   ||||| | ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25941937 tatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 25941860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 48213397 - 48213574
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||||| || | ||||||    
T  48213397 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaagtcaacctaaaact 48213496  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||  |   ||||| | ||||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  48213497 tatggattgtctccaaacttcaaagc-atgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaacctatgttgt 48213574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 15720349 - 15720250
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15720349 atgatttttggtttttgaggtatgataaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 15720250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 39722225 - 39722122
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||  ||||||||    
T  39722225 tgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgct 39722126  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  39722125 tgtg 39722122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12723538 - 12723440
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  12723538 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagctgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12723440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16114200 - 16114102
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  16114200 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 16114102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16117353 - 16117255
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  16117353 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 16117255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 20252794 - 20252971
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||| |    
T  20252794 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtaaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaatt 20252893  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||  |   ||||| | ||||| ||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  20252894 tatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttgt 20252971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 24270434 - 24270611
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||||| || | ||||||    
T  24270434 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaagtcaaccgaaaact 24270533  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||  |   ||||| | ||||| || |  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24270534 tatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 24270611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Original strand, 45170153 - 45170255
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||| |    
T  45170153 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgtt 45170252  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  45170253 tgt 45170255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 347
Target Start/End: Original strand, 70912 - 71001
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgtt 347  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  70912 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgtcgatgcttcacattaatattgttatgtt 71001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 347
Target Start/End: Original strand, 75021 - 75110
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgtt 347  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  75021 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgtcgatgcttcacattaatattgttatgtt 75110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 177
Target Start/End: Original strand, 8514217 - 8514373
Alignment:
Q  20 ttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||  |   |  || |     
T  8514217 ttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttgtgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtcttaaaact 8514316  T
Q  120 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8514317 tcaaatcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 8514373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 175
Target Start/End: Original strand, 9743550 - 9743706
Alignment:
Q  18 agttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||  |   |||||     
T  9743550 agttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcggcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaa 9743649  T
Q  118 cctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
    | | ||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  9743650 ctttaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggcgtttaagcgtatttaacctatg 9743706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 198
Target Start/End: Original strand, 46580468 - 46580559
Alignment:
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  46580468 ataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtag 46580559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 14161329 - 14161482
Alignment:
Q  23 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctca 122  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||| | |||    
T  14161329 tgataaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttca 14161428  T
Q  123 aaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    || || |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14161429 aagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 14161482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 17232973 - 17232871
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||    
T  17232973 tgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgtcatgttataaattgct 17232874  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  17232873 tgt 17232871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3287574 - 3287419
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||       
T  3287574 gagttatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctc--- 3287478  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
        |||| ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  3287477 ----caaacctagaagtattaggagtttaattaaggggtttaagaatatttaacgtatgttgt 3287419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 15576289 - 15576460
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||     
T  15576289 tttggtttttgagttatcataaaaatgctccaagaaggttttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgga 15576388  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     |   ||||| | ||||| || |   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15576389 ttgtctccaaacttcaaagcttg-tctactatgagttcaattaaggtgtttaagggtatttaacttatgttgt 15576460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15116535 - 15116428
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  15116535 tgttgtttgttatgtgaaatgtgcatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttacgttgttgatgtttttcattaatattgttattttgtgaatttct 15116436  T
Q  358 tgtgttgt 365  Q
    ||| ||||    
T  15116435 tgtattgt 15116428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Original strand, 15978524 - 15978682
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||  |||||||||||  ||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| ||  ||||||    
T  15978524 gagttatgatgaaaacactccaaggaggtctcggtaaaactttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggaatgtttccaa 15978623  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
     |||||||||||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||| | ||||| |||||    
T  15978624 acctcaaaactagaagtactaggggtt-aattaagaggtttaagagcacttaacctatgt 15978682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20487964 - 20487865
Alignment:
Q  80 tttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||    
T  20487964 tttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactaggagtactaggtgtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgt 20487865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 111
Target Start/End: Original strand, 1857092 - 1857154
Alignment:
Q  49 agtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1857092 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 1857154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 18080170 - 18080347
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||||||| || || ||||||||    
T  18080170 atgatttttggtttttgacttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatttaatgaaaattccgcataactatttctatgtcaacccaaaact 18080269  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||  |  |||||| | |  ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18080270 tatggattgtttccaaacttagaaacttg-tgtactatgaattcgattaaggtgtttcagggtatttaagttatgttgt 18080347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 28720003 - 28719885
Alignment:
Q  58 ttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttt 157  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||  ||||    
T  28720003 ttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagggaatatttccaaacctcaaaactatgagtactaggagtttaattaagaggttt 28719904  T
Q  158 aagagtatttaacgtatgt 176  Q
    || |||||||||| |||||    
T  28719903 aaaagtatttaacctatgt 28719885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 179
Target Start/End: Original strand, 8564060 - 8564220
Alignment:
Q  18 agttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| || |||  |||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| || ||||  |  ||||||     
T  8564060 agttatgatgaaaatactccaagtgggtcttggtaaaactttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaacccaaagctaatggtttgtttccaaa 8564159  T
Q  118 cctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |  ||||| | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8564160 ctccaaaaattg-tgtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 8564220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 360
Target Start/End: Original strand, 1490077 - 1490222
Alignment:
Q  217 ttattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattat--atgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaa 314  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||  |||| |||||||||| || ||||||||| |     
T  1490077 ttattattgttgttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttaataatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatatatgatgttgat 1490176  T
Q  315 gttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgt 360  Q
    ||||| | || || || |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  1490177 gttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcttgt 1490222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 273 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15084140 - 15084052
Alignment:
Q  273 gaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtg 361  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15084140 gaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtg 15084052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20487596 - 20487533
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 321  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20487596 tgttgttggttatgtgaaatatttatatggcttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 20487533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 24702762 - 24702693
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  24702762 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 24702693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 24705209 - 24705140
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  24705209 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 24705140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 32126024 - 32125955
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  32126024 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 32125955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 41523451 - 41523382
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  41523451 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 41523382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 41525913 - 41525844
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  41525913 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 41525844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 64
Target Start/End: Original strand, 14948751 - 14948808
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14948751 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 14948808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 298 - 360
Target Start/End: Original strand, 14981541 - 14981603
Alignment:
Q  298 aaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgt 360  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14981541 aaatgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgt 14981603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 298 - 360
Target Start/End: Original strand, 15411017 - 15411079
Alignment:
Q  298 aaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgt 360  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15411017 aaatgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgt 15411079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15720256 - 15720198
Alignment:
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15720256 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacttatgttgt 15720198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 16108311 - 16108386
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  16108311 atgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 16108386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 23664575 - 23664650
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  23664575 atgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 23664650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 46580376 - 46580448
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 73  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  46580376 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagttcttactgaaattttatgaaaattcagca 46580448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 11303786 - 11303712
Alignment:
Q  2 tgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  11303786 tgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 11303712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 179
Target Start/End: Original strand, 21675491 - 21675538
Alignment:
Q  132 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21675491 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 21675538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 3136869 - 3136721
Alignment:
Q  26 tgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaa 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||| |||| |||  |||| |||| || |||||||||||||  |  |||||| | ||||||    
T  3136869 tgaaaatactccaagtaggtcttggtaaaattttaagaaaattaagcataactgtttccaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacatcaaaa 3136770  T
Q  126 ctagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
    || | ||||||| ||||| ||||| | ||||||||||| |||||| ||||    
T  3136769 cttg-agtactaagagtttaattaggatgtttaagagtgtttaacctatg 3136721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 165
Target Start/End: Original strand, 1858637 - 1858689
Alignment:
Q  113 ccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 165  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1858637 ccaaccatcaaaactagaagttctacgagttcaattaaggtgtttaagagtat 1858689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 29797150 - 29797075
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  29797150 atgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 29797075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 29800969 - 29800894
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  29800969 atgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 29800894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 46473643 - 46473562
Alignment:
Q  16 ggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaa 97  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  |||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||    
T  46473643 ggaggtatgatgaaaatactccaagcgggtcttagtaaaactttatgaaaattcagcataattattcctaagttaaaccaaa 46473562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 77
Target Start/End: Original strand, 13918045 - 13918100
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  13918045 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 13918100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 18431251 - 18431176
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  18431251 atgattttcggtttaggtgttatgatgaaaatactcaaagtaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 18431176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 77
Target Start/End: Original strand, 25926772 - 25926827
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  25926772 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 25926827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 64
Target Start/End: Original strand, 1856872 - 1856915
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1856872 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 1856915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15281635 - 15281595
Alignment:
Q  229 ttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttat 270  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15281635 ttcagagagtctgaatttaa-atgattaatgttgttggttat 15281595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 308
Target Start/End: Original strand, 43277518 - 43277574
Alignment:
Q  250 atgattaatgttgttggtt-atgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||   ||||||||||||||||||||    
T  43277518 atgattaatgttgttggttaatgtgaaatacatatat---ttatgtggaaaatgtatgat 43277574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 4071098 - 4071059
Alignment:
Q  229 ttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggtta 269  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4071098 ttcagagagtctgaa-ttaaaatgattaatgttgttggtta 4071059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 77)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 21 - 365
Target Start/End: Original strand, 46198197 - 46198540
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  46198197 tatgatgaaaatacttcaaggaggtcttaatgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacct 46198296  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  46198297 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatattgtgagttggtccttggggtagaaacgaagttgtttataa-tat 46198395  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46198396 taatgttcttcagagagtctgaaattatgatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 46198495  T
Q  321 gatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtgttgt 365  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  46198496 gaggcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgt 46198540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 21 - 365
Target Start/End: Original strand, 29764106 - 29764453
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaac--- 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  29764106 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaatta 29764205  T
Q  118 -cctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataa 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  29764206 acctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtagaaacgaagttgtttataa 29764305  T
Q  217 ttattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 316  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29764306 t-attaatgttctttagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 29764404  T
Q  317 tgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtgttgt 365  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29764405 tgttgatgttttcaattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgt 29764453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 50001054 - 50000714
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaa-cttatgggataattccaaccc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||    
T  50001054 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaaacttatgagataattcaaaacc 50000955  T
Q  120 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataatta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||| |    
T  50000954 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtcttttggttagaaacgaagttgtttataat-a 50000856  T
Q  220 ttaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50000855 ttaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgt 50000756  T
Q  320 tgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtg 361  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  50000755 tgatgattttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtg 50000714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 296955 - 296787
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  296955 atgatatttgatttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaaattaatccaaaact 296856  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  296855 tatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaa 296787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 20031362 - 20031535
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20031362 tatgatgaaaatactcaatggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 20031461  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggg 194  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  20031462 taaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaggagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggg 20031535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28312932 - 28312751
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28312932 gagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaa 28312833  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  28312832 ggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 28312751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 20437679 - 20437857
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20437679 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaact 20437778  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20437779 tatgggataattccaaggcttaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgt 20437857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 190
Target Start/End: Original strand, 2332678 - 2332851
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2332678 gagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 2332777  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtcct 190  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  2332778 agctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcct 2332851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 22130537 - 22130714
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22130537 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataatcttttctaatttaatccaaaacttatgggataataccaaccct 22130636  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  22130637 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtttatccttggggtag 22130714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16401248 - 16401099
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401248 tatgatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcaaaatcgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 16401149  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16401148 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaac 16401099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 8276464 - 8276628
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  8276464 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaacct 8276563  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8276564 caaaactagaagtactataggttcaattaaggcgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 8276628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 44822594 - 44822758
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  44822594 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttacgggataattccaaacct 44822693  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  44822694 caaaactagaagtaatatgagttcaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 44822758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 185
Target Start/End: Original strand, 21180783 - 21180961
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21180783 tttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaatttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggg 21180882  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  21180883 ataattccaattcttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 21180961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 21239747 - 21239925
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  21239747 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaact 21239846  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  21239847 taaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatttttaacctatgttgt 21239925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 51082816 - 51082638
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  51082816 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttaagaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 51082717  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    || || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  51082716 tagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgt 51082638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 13881088 - 13881265
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13881088 tatgatgaaattagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccct 13881187  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13881188 caaaactaaaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtag 13881265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 184
Target Start/End: Original strand, 38057123 - 38057286
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  38057123 tatgatgaaaatactccaagggggtattagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatacaaaacttatgggattattccaaacct 38057222  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagtt 184  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  38057223 caaaactagaagtactatgagtacaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtt 38057286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 41227176 - 41227334
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  41227176 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 41227275  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  41227276 caaaactagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtatttaacctatgttgt 41227334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22350168 - 22350023
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22350168 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccct 22350069  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 166  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350068 caaaactagaagtactacgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 22350023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Original strand, 23195019 - 23195172
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23195019 gagttatgataaaaatactcctaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 23195118  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23195119 ccctccaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaac 23195172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 24815324 - 24815488
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  24815324 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattctaaggct 24815423  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  24815424 caaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 24815488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12710472 - 12710310
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  12710472 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaatttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccgaaacttatggaataactccaa 12710373  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12710372 acctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 12710310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 14238064 - 14238242
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||    
T  14238064 atgatttttagtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctgagttaatccaaaact 14238163  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    || || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14238164 tagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgt 14238242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16372351 - 16372181
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16372351 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaact 16372252  T
Q  101 tatgggataattccaaccct-caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| || ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16372251 tatgggataattccaaggctacaaaaataaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagagtatttaac 16372181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19676291 - 19676133
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  19676291 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 19676192  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19676191 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaatatatgttgt 19676133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20588259 - 20588101
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  20588259 tatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 20588160  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20588159 caaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 20588101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20592797 - 20592639
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  20592797 tatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 20592698  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20592697 caaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 20592639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 41225923 - 41226081
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  41225923 tatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 41226022  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  41226023 caaaactagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtatttaacctatgttgt 41226081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 42912630 - 42912472
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  42912630 tatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 42912531  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  42912530 caaaactagaagtactataagttcaattagggtgtttaagagtatttaatatatgttgt 42912472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 7792324 - 7792482
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  7792324 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 7792423  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  7792424 caaaactagaagtaatgtgagttcaattaaggtgtttaagagcatttaacccatgttgt 7792482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 51323855 - 51323697
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||    
T  51323855 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaattcaaaacttatggaataactccaaacct 51323756  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51323755 taaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgt 51323697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 16058786 - 16058944
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  16058786 tatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 16058885  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  16058886 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagattatttaagctatgttgt 16058944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 21046521 - 21046679
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  21046521 tatgatgaaaataatccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 21046620  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21046621 caaaactagaagtactatgggttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgttgt 21046679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 4596317 - 4596475
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  4596317 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacct 4596416  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||| |||  |||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  4596417 caaaactagaagtaatataggttcaactagggtgcttaagagtatttaacctatgttgt 4596475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 7052507 - 7052686
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||| | |||||||||    
T  7052507 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtattagtgaaattttatgaaaattctgcataaccgtttctaagtcagtccaaaact 7052606  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    || || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7052607 tagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaacctatgttgt 7052686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 45574520 - 45574690
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45574520 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaat-----------tcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaa 45574608  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45574609 ccctcaaaactagaagtgctatgagttcaattaaggtgtttaagcgtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtag 45574690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 294624 - 294443
Alignment:
Q  22 atgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggat---------aatt 112  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||    
T  294624 atgatggaaatactccaagtatgtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgggataatt 294525  T
Q  113 ccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggg 194  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||  |||||||    
T  294524 ccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaaccttggg 294443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 45496546 - 45496367
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  45496546 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaactcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaact 45496447  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtg-tttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    || || |||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  45496446 tagggaataatttcaaacctccaaactagaagtactctgagtttaattaaggggatttaagagtatttaacctatgttgt 45496367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 20634106 - 20634265
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||   | |||||| ||| |||    
T  20634106 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctatgtcaatccaaaacttggagaataatttcaaacct 20634205  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaag-gtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20634206 caaaactagaagtactaggagtttaattaagagggtttaagagtatttaacctatgttgt 20634265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 38887559 - 38887718
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||  ||    
T  38887559 tatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataattacaaaact 38887658  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  38887659 caaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaacctatgttgt 38887718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 51326847 - 51326745
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  51326847 tgttgttggttatgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 51326748  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  51326747 tgt 51326745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1643195 - 1643020
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || ||||||||    
T  1643195 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctatgtcaacccaaaact 1643096  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    |||||  |   ||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1643095 tatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 1643020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 258 - 347
Target Start/End: Original strand, 13881447 - 13881536
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgtt 347  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13881447 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgtt 13881536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 14793014 - 14793189
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||| || || ||||||||    
T  14793014 atgatttttggttttagagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaggtcaacccaaaact 14793113  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    |||||  |   ||||| | ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14793114 tatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14793189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 22823865 - 22824036
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||     
T  22823865 tttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgga 22823964  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     |   ||||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22823965 ttgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgt 22824036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 33797576 - 33797473
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33797576 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 33797477  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  33797476 tgtg 33797473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Original strand, 27653288 - 27653390
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  27653288 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtagaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 27653387  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  27653388 tgt 27653390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 48520563 - 48520463
Alignment:
Q  261 tgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgt 360  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  48520563 tgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtataatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgatatgttgtgaattgcttgt 48520464  T
Q  361 g 361  Q
    |    
T  48520463 g 48520463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 50544431 - 50544274
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||  |   |||||   |    
T  50544431 tatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaaattcggcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaattt 50544332  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50544331 caaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 50544274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1010682 - 1010584
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  1010682 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 1010584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 12271609 - 12271507
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  ||||||||    
T  12271609 tgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttttcattaattttgttatgctgtgaattgct 12271510  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  12271509 tgt 12271507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 16375606 - 16375704
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  16375606 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 16375704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21407314 - 21407216
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  21407314 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 21407216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39060695 - 39060518
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | | ||| |||||||||| || ||||||||    
T  39060695 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgtataactatttctaagtcaacccaaaact 39060596  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||  |   || || |  |||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  39060595 tatggattgtctctaaactccaaagcttg-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttgt 39060518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 24720146 - 24720322
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||   |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  24720146 atgatttttggttttttagttatgatgaaaatacttcatggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaact 24720245  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttg 178  Q
    |||||  |   ||||| | ||||| || |  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24720246 tatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcactatgagttcagttaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 24720322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 1925276 - 1925379
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||||    
T  1925276 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 1925375  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  1925376 tgtg 1925379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 20924290 - 20924393
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20924290 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 20924389  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  20924390 tgtg 20924393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 48603507 - 48603404
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |   |||||||    
T  48603507 tgttgttggctatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgatggaaattgct 48603408  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  48603407 tgtg 48603404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 17902214 - 17902391
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  17902214 atgatttttggttttcaagttatgatgaaaatactccaaggtggtcttgatgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaact 17902313  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||  |   |||||   ||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17902314 tatggattgtctccaaaattcaaagc-atgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 17902391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 20228956 - 20229059
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||  ||||||||    
T  20228956 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgct 20229055  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  20229056 tgtg 20229059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18121188 - 18121027
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||  ||||||| || || |||||||||||||  |   |||||    
T  18121188 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataattatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaa 18121089  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     | ||||| |  |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18121088 acttcaaagcctg-tgcactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 18121027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 52639500 - 52639402
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  52639500 tgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtggaagatgtttgatgtctaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 52639402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 6833814 - 6833710
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | | ||| |||||||||| || ||||||||    
T  6833814 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgaataactatttctaagtcaacccaaaact 6833715  T
Q  101 tatgg 105  Q
    |||||    
T  6833714 tatgg 6833710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 332
Target Start/End: Original strand, 22130972 - 22131047
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatg-tttaagttgttgatgcttttcat 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22130972 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttttaagttgttgatgcttctcat 22131047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 44892031 - 44891883
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || |||||| ||||||  |   |||||    
T  44892031 gagttatgatgaaaatactctaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaa 44891932  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 166  Q
     | ||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44891931 acttcaaatcttgta-tactatgagtacaattaaggtgtttaagagtatt 44891883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 16362458 - 16362383
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  16362458 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 16362383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 21841300 - 21841231
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  21841300 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 21841231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 21922920 - 21922989
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  21922920 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 21922989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 41373005 - 41372936
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  41373005 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 41372936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 321
Target Start/End: Original strand, 41781654 - 41781718
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgg-aaaatgtatgatgtttaagttgttg 321  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  41781654 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaaatgtacgatgtttaagttgttg 41781718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 23593356 - 23593409
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaa 54  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23593356 atgatttttggtttaggagttatgatgaaattactccaaggaggtcttagtgaa 23593409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16655910 - 16655793
Alignment:
Q  58 ttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttt 157  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||   |||     
T  16655910 ttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagtttaattaaaaggttg 16655812  T
Q  158 aagagtatttaacgtatgt 176  Q
     |||||||||||| |||||    
T  16655811 gagagtatttaacctatgt 16655793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 9784795 - 9784898
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| |||||||  || ||| || || |||| || ||||||||    
T  9784795 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagatcttggtgaaattttataaaaattccacataactatctccaagtcaacccaaaact 9784894  T
Q  101 tatg 104  Q
    ||||    
T  9784895 tatg 9784898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 21659724 - 21659685
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctta 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21659724 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctta 21659685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 56
Target Start/End: Original strand, 10812837 - 10812876
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaat 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10812837 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagcgaaat 10812876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 43543183 - 43543133
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  43543183 tgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgat 43543133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 13227383 - 13227328
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  13227383 tatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 13227328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 6038 - 5699
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6038 tatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct 5939  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattat 220  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||    
T  5938 caaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtgagttggtccttggggtagaaacgaggttgtttataa-tat 5840  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5839 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 5740  T
Q  321 gatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtg 361  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  5739 gatgcttttcattaatatagttatgttgtgaattgcttgtg 5699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 99)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21915216 - 21914863
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  21915216 tttggtttaggagttatgatgaaaataccccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagga 21915117  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaag 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  21915116 ataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtagaaacgaag 21915017  T
Q  207 ttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatg 306  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21915016 ttgttgataa-tattaatgttcttcagagagtttgaaattaagatgattaatgttgtaggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatg 21914918  T
Q  307 atgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtg 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21914917 atgtttaagttgttgatgcttttatttaatattgttatgttgagaattgcttgtg 21914863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26903738 - 26903502
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  26903738 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 26903639  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattat 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||     
T  26903638 caaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatattgtgagttggtcattggggtagaaacgaagttgtttat-attac 26903540  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaat 258  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26903539 taatgttgttcagagagtctgaaattaagatgattaat 26903502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 146 - 358
Target Start/End: Original strand, 34492089 - 34492300
Alignment:
Q  146 attaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34492089 attaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtagaaacaaagttgtttataat-attaatgttcttcagagagtctgaaat 34492187  T
Q  246 taagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatg 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34492188 taagatgattattgttgttggttatgtgaaataattatataccttatgtggaaaatgtataatgtttaagttgttgatgctttttattaatattgttatg 34492287  T
Q  346 ttcagaattgctt 358  Q
    || ||||||||||    
T  34492288 ttgagaattgctt 34492300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 23338852 - 23339020
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23338852 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 23338951  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23338952 tatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaa 23339020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 18358441 - 18358618
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18358441 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct 18358540  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  18358541 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtag 18358618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 21081443 - 21081620
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21081443 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct 21081542  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21081543 caaaactagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 21081620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Original strand, 41301426 - 41301618
Alignment:
Q  2 tgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaactt 101  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  41301426 tgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaactt 41301525  T
Q  102 atgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggg 194  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  41301526 atgagataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggg 41301618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25183767 - 25183601
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25183767 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct 25183668  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggt 187  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25183667 caaaactataagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggt 25183601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27472853 - 27472656
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27472853 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 27472754  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  27472753 tagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttatgagttgatccttggggtag 27472656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 24273731 - 24273889
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  24273731 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 24273830  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  24273831 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagtgtatttaacctatgttgt 24273889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9242359 - 9242163
Alignment:
Q  2 tgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaactt 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9242359 tgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagatcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaactt 9242260  T
Q  102 atgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  9242259 atgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaactaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 9242163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Original strand, 10039606 - 10039754
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10039606 tatgatgaaaatactccagggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 10039705  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10039706 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 10039754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 19662107 - 19662304
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  19662107 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 19662206  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  19662207 tgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 19662304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 22173500 - 22173677
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22173500 tatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaccct 22173599  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22173600 caaaactcaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtag 22173677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24883966 - 24883817
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24883966 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccctttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaccct 24883867  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24883866 caaaactagaattactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 24883817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 31520697 - 31520534
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31520697 tatgatgaaaatactccaaggaggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaccct 31520598  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagtt 184  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  31520597 caaaactgaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaactcatgttgtgagtt 31520534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9975509 - 9975351
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  9975509 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacct 9975410  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9975409 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 9975351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Original strand, 18388769 - 18388915
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18388769 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctttggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccct 18388868  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388869 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 18388915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20915685 - 20915531
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20915685 tatgatgaaaatactccaatgatatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct 20915586  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20915585 caaaactagaagtactatgagttcaattaagctgtttaagagtatttaacctatg 20915531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 36839751 - 36839593
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  36839751 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 36839652  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36839651 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 36839593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 21073195 - 21073376
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21073195 gagttatgatggaaatactccaagtaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaattcaaaacttatgggataattccaa 21073294  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
      |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  21073295 tactcaaaactagaagcaatatgagttcaattaaggtatttcagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 21073376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 5031602 - 5031760
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  5031602 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 5031701  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5031702 caaaactataagtactatgagttcaactaggctgtttaagagtatttaacatatgttgt 5031760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 43707737 - 43707914
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||    
T  43707737 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtt-ctaagttaatctaaaact 43707835  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  43707836 tatggaataattcgaaacctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgt 43707914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 20590774 - 20590943
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  20590774 atgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaact 20590873  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20590874 taagggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaac 20590943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 34858837 - 34859030
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  34858837 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 34858936  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggg 194  Q
    || || |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||    
T  34858937 tagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggg 34859030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 34873899 - 34874092
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  34873899 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 34873998  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggg 194  Q
    || || |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||    
T  34873999 tagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggg 34874092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 6483119 - 6482949
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  6483119 atgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 6483020  T
Q  101 tatgggataattccaaccctc-aaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    || || |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6483019 tagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaac 6482949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 6486586 - 6486416
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  6486586 atgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 6486487  T
Q  101 tatgggataattccaaccctc-aaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    || || |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6486486 tagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaac 6486416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9785182 - 9785004
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  9785182 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaact 9785083  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||    
T  9785082 tatggaataattccaaacctcaaaactagaagaactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgt 9785004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17307067 - 17306909
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||    
T  17307067 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttcttagttaatccaaaacttaaggaataattccaaaact 17306968  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  17306967 caaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagatcatttaacatatgttgt 17306909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 177
Target Start/End: Original strand, 27484946 - 27485098
Alignment:
Q  25 atgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaa 124  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27484946 atgaaaatactccaagtaggtcttagtggaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaa 27485045  T
Q  125 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27485046 actagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacatatgtt 27485098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 23068922 - 23069080
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  23068922 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 23069021  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  23069022 caaaactataagtactaagagtttaattaaggggtttaagagtatttaacatgtgttgt 23069080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 24781312 - 24781470
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  24781312 tatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacct 24781411  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24781412 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagaatatttaacctatgttgt 24781470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 6260830 - 6261027
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  6260830 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 6260929  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||||    
T  6260930 tgtgggataattccaaggctcaaaactagaaatattacgagtgaaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttagggtag 6261027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24515766 - 24515608
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||| |||||||||||||||| || |||| | |||  ||    
T  24515766 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataatcgtttctacgttaatccaaaacttaaggaataaattcaaatct 24515667  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24515666 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgt 24515608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 23969075 - 23969253
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| || |||||||||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  23969075 atgatttttggtttttgagatacgatgaaaataattaatggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaact 23969174  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23969175 tagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 23969253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 28652974 - 28653132
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||||| || |||||||||| |||    
T  28652974 tatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatggaaattcagcataaccgtttttaggttaatccgaaacttaaggaataattccaaacct 28653073  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  28653074 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacatatcttgt 28653132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28349497 - 28349340
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggat---------aat 111  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||    
T  28349497 tatgatggaaatactccaagtaggtcttcgtgaaatcttatgaaaattcagctcaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgggataat 28349398  T
Q  112 tccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28349397 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 28349340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Original strand, 19201680 - 19201828
Alignment:
Q  28 aaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaact 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||    
T  19201680 aaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatttaataatttcaaacctcaaaact 19201779  T
Q  128 agaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19201780 agaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgt 19201828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 31345495 - 31345379
Alignment:
Q  49 agtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31345495 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttataggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 31345396  T
Q  149 aaggtgtttaagagtat 165  Q
    |||||||||||||||||    
T  31345395 aaggtgtttaagagtat 31345379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21368701 - 21368532
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  21368701 tttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaaattatgga 21368602  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  21368601 ataattctaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaaataagaggtttaagagtatttaacctatgt 21368532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 23069349 - 23069452
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23069349 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 23069448  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  23069449 tgtg 23069452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Original strand, 21316117 - 21316291
Alignment:
Q  4 atatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttat 103  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||||||| || |||||||||||    
T  21316117 atatttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcttaactatttctaagtcaacccaaaacttat 21316216  T
Q  104 gggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||  |   ||||| | ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21316217 ggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 21316291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Original strand, 23707354 - 23707456
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23707354 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcattatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 23707453  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  23707454 tgt 23707456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24918165 - 24918063
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24918165 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 24918066  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  24918065 tgt 24918063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27472474 - 27472372
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  27472474 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattattatgttgtgaattgct 27472375  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  27472374 tgt 27472372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Original strand, 34874278 - 34874380
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34874278 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 34874377  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  34874378 tgt 34874380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Original strand, 22459628 - 22459730
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22459628 tgttgtcggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtataatgttgaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 22459727  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  22459728 tgt 22459730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24671050 - 24670948
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24671050 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgggttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 24670951  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  24670950 tgt 24670948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29113961 - 29113784
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  || ||| ||| |||||| || ||||||||    
T  29113961 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactattcctaagtcaacccaaaact 29113862  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||  |  |||||| | |||||| | |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29113861 tatggattgtttccaaacttcaaaatttg-tgtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 29113784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22690280 - 22690105
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||| |||||||||| || ||||||||    
T  22690280 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctaagtcaacccaaaact 22690181  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    |||||  |   ||||| | |||||   ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22690180 tatggattgtctccaaacttcaaagtcag-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 22690105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 185
Target Start/End: Original strand, 2524240 - 2524365
Alignment:
Q  58 ttatgaaaattcagcacaaccatttctaa-gttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtt 156  Q
    |||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  2524240 ttatgaaaattcagcataacc---tctaaagttaatctaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaatcaaggtatt 2524336  T
Q  157 taagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2524337 taagagtatttaacctatgttgtgagttg 2524365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Original strand, 21081802 - 21081904
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21081802 tgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttattgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 21081901  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  21081902 tgt 21081904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24681469 - 24681367
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  24681469 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcgtcattagtattgttatgttgtgaattgct 24681370  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  24681369 tgt 24681367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22694876 - 22694701
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||| ||||||| || || ||||||||    
T  22694876 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctatgtcaacccaaaact 22694777  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    |||||  |   ||||| | |||||   ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22694776 tatggattgtctccaaacttcaaagtcag-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 22694701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1283348 - 1283241
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||||    
T  1283348 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 1283249  T
Q  358 tgtgttgt 365  Q
    ||||||||    
T  1283248 tgtgttgt 1283241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 18358799 - 18358902
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||    
T  18358799 tgttgttggttttgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattattatgttgtgaatttct 18358898  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  18358899 tgtg 18358902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 41531151 - 41531254
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  41531151 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 41531250  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  41531251 tgtg 41531254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22686439 - 22686262
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||    
T  22686439 atgatttttggtttttgaggtatgatgaaaacactctaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcacaactatttctaattcaacccaaaact 22686340  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||  |   || || | ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22686339 tatggattgtctcgaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 22686262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23610060 - 23609899
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||| |||||  |   |||||    
T  23610060 gagttatgatgaaaatactcgaaggaggtcttagtgaaattttatgcaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacctatggattgtctccaa 23609961  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     | ||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23609960 acttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 23609899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 24628626 - 24628724
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  24628626 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 24628724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 320
Target Start/End: Original strand, 24834729 - 24834869
Alignment:
Q  181 agttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataat 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |    
T  24834729 agttggtccttggggtagaaacgaagttgtttataat-agtaatgttgttcagaaagtctgaaattaagatgattaatgttgttagtaatgtgatatagt 24834827  T
Q  281 --tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
      ||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  24834828 tatatatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaaattgtt 24834869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 27379580 - 27379678
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  27379580 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgcgaattgc 27379678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 27383626 - 27383724
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  27383626 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgcgaattgc 27383724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27601755 - 27601657
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  27601755 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 27601657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 178
Target Start/End: Original strand, 21335921 - 21336081
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||  |||||  |   |||||    
T  21335921 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaagttttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaagctatggattgtctccaa 21336020  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttg 178  Q
     | ||||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  21336021 acttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttg 21336081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 12901661 - 12901757
Alignment:
Q  260 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  12901661 ttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12901757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 95 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22501374 - 22501299
Alignment:
Q  95 aaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22501374 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 22501299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 95 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22509308 - 22509233
Alignment:
Q  95 aaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22509308 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 22509233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 30345138 - 30345241
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||||    
T  30345138 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 30345237  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  30345238 tgtg 30345241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31345171 - 31345068
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||  ||||| ||    
T  31345171 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttaatgcttcacactaatattgttatgttgtgaattact 31345072  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  31345071 tgtg 31345068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24649316 - 24649218
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  24649316 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgcttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 24649218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 25587139 - 25587316
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||| ||||||| || || ||||||||    
T  25587139 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctaggtcaacccaaaact 25587238  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||  |   ||||| | ||||| || |  ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  25587239 tatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaagatgtttaagaaaatttaacctatgttgt 25587316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 185
Target Start/End: Original strand, 30643812 - 30643917
Alignment:
Q  80 tttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  30643812 tttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgt 30643911  T
Q  180 tagttg 185  Q
     |||||    
T  30643912 gagttg 30643917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 258 - 347
Target Start/End: Original strand, 10101792 - 10101881
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgtt 347  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  10101792 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgtttcacattaatattgttatgtt 10101881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 1384138 - 1384311
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  || ||| |||||||||| ||  |||||||    
T  1384138 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctaagtcaactcaaaact 1384237  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
    ||||   |   ||||| | ||||| || |  |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1384238 tatgaattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtaccatgagttctattaaggtgtttacgagtatttaacctatg 1384311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22332300 - 22332140
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||  |  ||||||    
T  22332300 gagttatggcgaaaacactccaatgaggtcttggtgaatt-ttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaa 22332202  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     | |||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22332201 acttcaaaaattgt-gtactatgagttcaattaaggtgttcaagagtatttaacctatgttgt 22332140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 28345528 - 28345705
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||||||||  || | ||||||    
T  28345528 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagccaaccaaaaact 28345627  T
Q  101 tatgggataat-tccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||| ||||  | ||||| | |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||    
T  28345628 tat-ggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcatttaaggtgtttaatagtacttaatctatgttgt 28345705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9784736 - 9784673
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 321  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9784736 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaaattgttg 9784673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 23136113 - 23136044
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  23136113 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 23136044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 24897818 - 24897893
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  24897818 atgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 24897893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 24900301 - 24900376
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  24900301 atgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 24900376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 24902778 - 24902853
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  24902778 atgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 24902853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 24905255 - 24905330
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  24905255 atgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 24905330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 24907730 - 24907805
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  24907730 atgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 24907805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 38968019 - 38967944
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  38968019 atgattttttgtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 38967944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 297 - 360
Target Start/End: Original strand, 24316190 - 24316252
Alignment:
Q  297 aaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24316190 aaaatgtatgatgtttaagttgt-gatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgt 24316252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 10684385 - 10684460
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  10684385 atgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 10684460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 20261759 - 20261684
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  20261759 atgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 20261684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 285
Target Start/End: Original strand, 24793482 - 24793585
Alignment:
Q  179 ttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaata 278  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | | ||| || ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  24793482 ttagttggtccttggggtagaaacgaagttgtttataactgt-aatattgtt--gagagtttgaaattaagatgattaatgttgttagtaatgtgatata 24793578  T
Q  279 attatat 285  Q
     ||||||    
T  24793579 gttatat 24793585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Original strand, 23778763 - 23778852
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatg-aaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| | ||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||| |||||||    
T  23778763 gagttatgatgaaaatactctaaggaggttttagtgaaattttacgaaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaccttatgg 23778852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24841474 - 24841375
Alignment:
Q  79 atttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttg 178  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||| |  |||||| |  ||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24841474 atttccaagtcaacccaaaacttatgggttgtttccaaactccaaaacttgt-gtactatgagttcaattaaggtatttaagagtatttaacctatgttg 24841376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20915400 - 20915322
Alignment:
Q  244 attaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataatta--tatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  20915400 attaagatgattaatgttgttagttatgtgatatagttatttatgcattatgtggaatatgtatgatgttgtagttgtt 20915322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 345
Target Start/End: Original strand, 39827952 - 39828027
Alignment:
Q  270 tgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatg 345  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||| |||| ||||||    
T  39827952 tgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttaattcttatcattgatatggttatg 39828027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 20272940 - 20272855
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaactta 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || | |||  ||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||    
T  20272940 gagttatgatggaaatactccaagtaggtcttggtaaatttttaccaaaattcagcataaccgtttctatgtcaatccaaaactta 20272855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 31345699 - 31345644
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || |||||||||||    
T  31345699 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaatttttatg-aatttcagcacaac 31345644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 317 - 360
Target Start/End: Original strand, 20320723 - 20320766
Alignment:
Q  317 tgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  20320723 tgttgatgcttttcattaatattgtcatgttgtgaattgcttgt 20320766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 24302300 - 24302220
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaactt 101  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||  || |||  || |||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||||    
T  24302300 tatgatgaaaatactacaagtaggtcttgatgcaattgtacgaaaattcagcataactatttttaagtgaacccaaaactt 24302220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 40911899 - 40911863
Alignment:
Q  25 atgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttat 61  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  40911899 atgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatcttat 40911863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 125)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 21 - 361
Target Start/End: Original strand, 15173927 - 15174266
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15173927 tatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct 15174026  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||    
T  15174027 caaaactagaagtactatgagttcaattaaattgtttaagggtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtagaaacgaggttgtttataa-tat 15174125  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15174126 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgacttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 15174225  T
Q  321 gatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtg 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15174226 gatgcttttcattaatattgttatgttgagaattacttgtg 15174266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23956462 - 23956148
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  23956462 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaact 23956363  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaa 200  Q
    || || |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23956362 tagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtagaa 23956263  T
Q  201 acaaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaa 300  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23956262 acgaagttgtttataa-tattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaa 23956164  T
Q  301 tgtatgatgtttaagt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  23956163 tgtatgatgtttaagt 23956148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13764937 - 13764696
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13764937 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttaatgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaa 13764838  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataa 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||    
T  13764837 acctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgttttagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttagggtagaaatgaagttgtttataa 13764738  T
Q  217 ttattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatg 259  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  13764737 -tattaatgttgttcaaagagtctgaaattaagatgactaatg 13764696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 28947944 - 28947766
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28947944 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 28947845  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28947844 tatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 28947766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 611320 - 611156
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  611320 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 611221  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  611220 caaaactaaaattactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 611156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18658786 - 18658622
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  18658786 tatgataaaaatactccgaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaacct 18658687  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  18658686 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 18658622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 19825961 - 19826125
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  19825961 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatcggataattccaaacct 19826060  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  19826061 taaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaattatgttgtgagttg 19826125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 27851583 - 27851425
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  27851583 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagct 27851484  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27851483 caaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 27851425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 19655701 - 19655859
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  19655701 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacct 19655800  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19655801 caaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 19655859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 20556565 - 20556742
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20556565 tatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 20556664  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  20556665 caaaactagaaatactatgagttaaattaaggtgttaaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttcgggtag 20556742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 20733899 - 20734095
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  20733899 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatct-atgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaact 20733997  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  |||||||||||    
T  20733998 tatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgacccttggggtag 20734095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 25619429 - 25619606
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25619429 tatgatggaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccct 25619528  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||    
T  25619529 caaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcattggggtag 25619606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 8759974 - 8760137
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8759974 tttggtttttgagatattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatggg 8760073  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8760074 ataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaac 8760137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 8767721 - 8767884
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8767721 tttggtttttgagatattatgaaagtactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatggg 8767820  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8767821 ataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaac 8767884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Original strand, 29847975 - 29848125
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa--ttcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacc 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  29847975 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttaatgaaatcttatgaaaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaag 29848074  T
Q  119 ctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29848075 ctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 29848125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 15817210 - 15817406
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15817210 atgatatttggtttttgagatatgatgataatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 15817309  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  15817310 taagggataattccaaccctcaaaactagaagtattatgaggtcaattaagttgtttaagattatttaacccatgttgtgagttgat-cttggggtag 15817406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Original strand, 34296741 - 34296916
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  34296741 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 34296840  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggt 196  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |  |||||||||    
T  34296841 caaaactagaaggactatgagtttaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttggggt 34296916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7827552 - 7827394
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  7827552 tatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 7827453  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7827452 caaaattagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 7827394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 17318594 - 17318752
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  17318594 tatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaggtaatccaaaacttaaggaataatttcaaacct 17318693  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17318694 caaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 17318752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 14979094 - 14979271
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  14979094 tatgatgaaaatagtccaaggaggtcttggtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaatttaatccaaaacttatagaataatttcaaccct 14979193  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||    
T  14979194 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcattggggtag 14979271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20183147 - 20182995
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20183147 gagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaa 20183048  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
     |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20183047 acctc-aagctagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaac 20182995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Original strand, 22152844 - 22152996
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22152844 gagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaa 22152943  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
     |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22152944 acctc-aagctagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaac 22152996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 176
Target Start/End: Original strand, 25601747 - 25601904
Alignment:
Q  19 gttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  25601747 gttatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaac 25601846  T
Q  119 ctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25601847 ctcaaaactagaagtaataagagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgt 25601904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18703144 - 18702986
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  18703144 tatgatgaaaatactccaagcaggtcatagtgaaatctaatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 18703045  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  18703044 caaaactagaagtactatgagttcaattagggtttttaagagtatttaacctatgttgt 18702986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18709079 - 18708921
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  18709079 tatgatgaaaatactccaagcaggtcatagtgaaatctaatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 18708980  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18708979 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 18708921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4477258 - 4477061
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||    
T  4477258 atgatttttggtttatgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatcaaaaact 4477159  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
      ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  4477158 ggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 4477061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 190
Target Start/End: Original strand, 16133138 - 16133311
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  16133138 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaattcataggaaaattcagcataaccatttccaagttaatcggaaacttatgggataattccag 16133237  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtcct 190  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  16133238 gactaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcct 16133311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 190
Target Start/End: Original strand, 19443752 - 19443921
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   ||    
T  19443752 tatgaagaaaatactccacgtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttccaagttaatcgaaaacttatgggataattccagaact 19443851  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtcct 190  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  19443852 aaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcct 19443921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 25347706 - 25347557
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  25347706 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 25347607  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25347606 ccaaactagaagtgccatgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaac 25347557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31734286 - 31734130
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  31734286 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 31734187  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31734186 caaaactagaagtac--tgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 31734130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 23150739 - 23150896
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  23150739 tatgatgaaaatattccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 23150838  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23150839 caaaattagaagtactatgagttcaact-aggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 23150896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23838599 - 23838443
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23838599 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtatgtcttagggaaatcttaagaaaattcagcacaaccattaccaagttaatccaaaact 23838500  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttt 157  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23838499 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtaatatgagtgcaattaaggtgttt 23838443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 25807726 - 25807602
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25807726 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 25807627  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaa 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||    
T  25807626 ataattccaaggctcaaaactagaa 25807602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 164
Target Start/End: Original strand, 15891183 - 15891326
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  15891183 tatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 15891282  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 164  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15891283 aaaaactagaagtactatgatttcaattagggtgtttaagagta 15891326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20177345 - 20177170
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||     
T  20177345 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-caatccaaaaca 20177247  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    || || ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20177246 tagggaataattctaaacctcaaaactataagtactaggagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacctatgtt 20177170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 27557053 - 27556905
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||| | ||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27557053 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaa 27556954  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 165  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27556953 ccctcaaaattagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 27556905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 179
Target Start/End: Original strand, 27125952 - 27126107
Alignment:
Q  24 gatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaa 123  Q
    ||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||    
T  27125952 gatgaaaatactttaaaaaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaagaataattccaaacctcaa 27126051  T
Q  124 aactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27126052 aactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 27126107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 19773181 - 19773339
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19773181 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaatttagcataactgtttttaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 19773280  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  19773281 caaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacatgtgttgt 19773339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 5834187 - 5834362
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||     
T  5834187 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-taatccaaaaca 5834285  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    || || ||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  5834286 tagggaataattctaaatctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgactaagagtatttaacctatgtt 5834362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18928317 - 18928157
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  18928317 tttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatgga 18928218  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 167  Q
    || |||| ||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18928217 atgattcaaaaactcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtattt 18928157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 22158646 - 22158821
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||     
T  22158646 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-aaatccaaaaca 22158744  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    || || ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  22158745 tagggaataattctaaacctcaaaactaaaagtactaggagttcaattaaggtgactaagagtatttaacctatgtt 22158821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23415262 - 23415151
Alignment:
Q  50 gtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaatta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23415262 gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatta 23415163  T
Q  150 aggtgtttaaga 161  Q
    ||||||||||||    
T  23415162 aggtgtttaaga 23415151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1254357 - 1254215
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  1254357 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaact 1254258  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagtt 143  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1254257 tatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagtt 1254215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 27318027 - 27318185
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||   || ||||||| || |||    
T  27318027 tatgatgaaaatactccaaagaggttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaattcaaaactagaggaataattcaaaacct 27318126  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  27318127 caaaactagaagtactatgagttcaaatatggtgtttaagagtatttaacctacgttgt 27318185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 257 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18914001 - 18913897
Alignment:
Q  257 atgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18914001 atgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgagaattgc 18913902  T
Q  357 ttgtg 361  Q
    |||||    
T  18913901 ttgtg 18913897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 257 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18937259 - 18937155
Alignment:
Q  257 atgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18937259 atgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgagaattgc 18937160  T
Q  357 ttgtg 361  Q
    |||||    
T  18937159 ttgtg 18937155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 23491629 - 23491801
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| |      
T  23491629 tttggtttttgagatatgatgacaatattccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgttactaagttaatccaaaacttaggta 23491728  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23491729 ataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacatatgttgt 23491801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 23497227 - 23497399
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| |      
T  23497227 tttggtttttgagatatgatgacaatattccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgttactaagttaatccaaaacttaggta 23497326  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23497327 ataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacatatgttgt 23497399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 15705083 - 15705241
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  15705083 tatgatgaaaatacctcaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttcttagttaatccaaaatttatggaataattccaaacct 15705182  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  15705183 caaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacatgtgttgt 15705241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 258 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17743432 - 17743325
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17743432 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 17743333  T
Q  358 tgtgttgt 365  Q
    ||||||||    
T  17743332 tgtgttgt 17743325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 258 - 365
Target Start/End: Original strand, 19773608 - 19773715
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19773608 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 19773707  T
Q  358 tgtgttgt 365  Q
    ||||||||    
T  19773708 tgtgttgt 19773715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Original strand, 28103964 - 28104066
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28103964 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 28104063  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  28104064 tgt 28104066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 258 - 358
Target Start/End: Original strand, 15817587 - 15817687
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15817587 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtagttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 15817686  T
Q  358 t 358  Q
    |    
T  15817687 t 15817687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15875435 - 15875331
Alignment:
Q  261 tgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgt 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15875435 tgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgataattttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgt 15875336  T
Q  361 gttgt 365  Q
    |||||    
T  15875335 gttgt 15875331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 27416005 - 27416108
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27416005 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 27416104  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  27416105 tgtg 27416108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 181 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15896189 - 15896049
Alignment:
Q  181 agttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataat 280  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |    
T  15896189 agttggtccttggggtagaaatgaagttgcttataat-attaatgttgttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttagtaatgtgatatagt 15896091  T
Q  281 --tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
      ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15896090 tatatatgcattatgtggaaaatgtaagatgttcaagttgtt 15896049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23655933 - 23655804
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||  |     
T  23655933 tttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagaga 23655834  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtact 136  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23655833 ataattccaaacctcaaaactagaagtact 23655804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22805987 - 22805880
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22805987 tgttgttggttatgtgaaatatttatattcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 22805888  T
Q  358 tgtgttgt 365  Q
     |||||||    
T  22805887 cgtgttgt 22805880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23414939 - 23414836
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23414939 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 23414840  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  23414839 tgtg 23414836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27556697 - 27556594
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27556697 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 27556598  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  27556597 tgtg 27556594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 18455524 - 18455701
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  18455524 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggttttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaact 18455623  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||  |   ||||| | ||||| || | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  18455624 tatggattgtctccaaacttcaaagcttgta-tactatgagttcaattaaggtctttaagagtatttaacctatgttgt 18455701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25921329 - 25921152
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  25921329 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaact 25921230  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||   |   ||||| | |||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25921229 tatgaattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 25921152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 258 - 347
Target Start/End: Original strand, 14979453 - 14979542
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgtt 347  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  14979453 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgattttcattaatattgttatgtt 14979542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 15705509 - 15705612
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15705509 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtataagttgatgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 15705608  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  15705609 tgtg 15705612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 365
Target Start/End: Original strand, 17377863 - 17377970
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17377863 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtttatgttcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 17377962  T
Q  358 tgtgttgt 365  Q
    ||| ||||    
T  17377963 tgtattgt 17377970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 18917413 - 18917516
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18917413 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 18917512  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  18917513 tgtg 18917516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 31022149 - 31022264
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||    
T  31022149 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattcactaaaaccgtttctaagttaatccaaaact 31022248  T
Q  101 tatgggataattccaa 116  Q
    || || ||||||||||    
T  31022249 tagggaataattccaa 31022264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22556833 - 22556671
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| || || |||||||||||||  |   |||||    
T  22556833 gagttatgatgaacatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattttgcataaccatttctaggtcaacccaaaacttatggactgtctccaa 22556734  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     | |||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22556733 acatcaaaactagaagtactaggagtttcattaaggggtttaagagtatttaacctattttgt 22556671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 868 - 755
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||    
T  868 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataattgtttctaagttaatctaaaatttatggaataattccaaagct 769  T
Q  121 caaaactagaagta 134  Q
    ||||||||||||||    
T  768 caaaactagaagta 755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22953023 - 22952920
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22953023 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgagaattgct 22952924  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  22952923 tgtg 22952920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23871511 - 23871408
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23871511 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgagaattgct 23871412  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  23871411 tgtg 23871408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23875467 - 23875364
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23875467 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgagaattgct 23875368  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  23875367 tgtg 23875364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8243820 - 8243722
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  8243820 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 8243722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11566821 - 11566723
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  11566821 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 11566723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13285308 - 13285131
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||  || ||||||||    
T  13285308 atgatttttggtttttgatttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagccaacccaaaact 13285209  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||  |   ||||| | |||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13285208 tatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcatttaaggtgtttaagagtatttaacctatattgt 13285131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18398502 - 18398341
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||||| |  |   |||||    
T  18398502 gagttatgatgaaaatactccagggaggtcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtgtccaa 18398403  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     | |||||||| |  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18398402 acttcaaaacttg-tgttctatgagctcaattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttgt 18398341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19870549 - 19870451
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  19870549 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 19870451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23395027 - 23394929
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  23395027 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 23394929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 32259430 - 32259270
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||  |   |||||    
T  32259430 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaa 32259331  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     | || || || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  32259330 acttc-aagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttgt 32259270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 258 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22862905 - 22862816
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgtt 347  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22862905 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 22862816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18585212 - 18585042
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || || |||||||| ||    
T  18585212 tttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttat-gg 18585114  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||  |  ||| | ||||| || |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  18585113 attgtctcaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctaagttgt 18585042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16760254 - 16760151
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  16760254 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatatatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 16760155  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  16760154 tgtg 16760151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22949067 - 22948964
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  22949067 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 22948968  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  22948967 tgtg 22948964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 31477957 - 31478060
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||||    
T  31477957 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 31478056  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  31478057 tgtg 31478060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Original strand, 20411130 - 20411299
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||     
T  20411130 tttggtttttgaggtatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgga 20411229  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
     |   ||||| | ||||| || |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20411230 ttgtatccaaacttcaaagcttg-tgtaatatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacctatgtt 20411299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23989879 - 23989781
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  23989879 tgttgttggttaggtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 23989781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 176
Target Start/End: Original strand, 17857162 - 17857319
Alignment:
Q  19 gttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacc 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | | ||| |||||||||| || |||||||||||||  |  |||||| |    
T  17857162 gttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccggataactatttctaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaac 17857261  T
Q  119 ctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
     ||||||| ||||||| || || || |||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  17857262 ttcaaaacgagaagtattaggaatttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 17857319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1644667 - 1644564
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||  ||||||||    
T  1644667 tgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgct 1644568  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  1644567 tgtg 1644564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 229 - 365
Target Start/End: Original strand, 19656047 - 19656185
Alignment:
Q  229 ttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattat--atgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgct 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | || |    
T  19656047 ttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttagtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtt 19656146  T
Q  327 tttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtgttgt 365  Q
    | || |||||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  19656147 tatcgttaatattgttatgatgtgaattgcatgtgttgt 19656185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 18955910 - 18956008
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||  |||||||    
T  18955910 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgc 18956008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 29044910 - 29044806
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  29044910 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagatcttagtgaaatgttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaact 29044811  T
Q  101 tatgg 105  Q
    |||||    
T  29044810 tatgg 29044806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18696542 - 18696480
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18696542 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 18696480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 15892031 - 15892106
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  15892031 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatg-aatttcagcacaac 15892106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 345
Target Start/End: Original strand, 12618991 - 12619076
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12618991 tgttgttggttatgtgaaatatttatgt--cttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatg 12619076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 12742856 - 12742782
Alignment:
Q  2 tgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  12742856 tgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 12742782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14472230 - 14472127
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||   | |||||||||||||||  |||||||     
T  14472230 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtataatgttgaagttattgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgca 14472131  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  14472130 tgtg 14472127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 77
Target Start/End: Original strand, 17883121 - 17883195
Alignment:
Q  2 tgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  17883121 tgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 17883195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18706360 - 18706301
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtt 317  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18706360 tgtttttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtt 18706301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 34141077 - 34141180
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  34141077 atgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccaagaagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaact 34141176  T
Q  101 tatg 104  Q
    ||||    
T  34141177 tatg 34141180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 34153693 - 34153796
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  34153693 atgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccaagaagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaact 34153792  T
Q  101 tatg 104  Q
    ||||    
T  34153793 tatg 34153796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Original strand, 15938694 - 15938851
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||  |  ||||||    
T  15938694 gagttatgatgaaaatactctaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaatttagcataactatttttaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaa 15938793  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
       |||||| | | |||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15938794 aattcaaaaattg-agtgttaggagttcaattaaggtgtttaagggtatttaacctatg 15938851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 33862327 - 33862258
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  33862327 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 33862258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25753026 - 25752953
Alignment:
Q  125 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25753026 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatccttggggtag 25752953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25755196 - 25755123
Alignment:
Q  125 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25755196 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatccttggggtag 25755123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 321
Target Start/End: Original strand, 22376544 - 22376686
Alignment:
Q  181 agttggtccttggggtagaaacaa-agttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaata- 278  Q
    |||||||||||||||||| ||  | ||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  22376544 agttggtccttggggtaggaatgagagttgtttaaaat-attattgttgttcagagagtctgagactaagatgattaatgttgttggtaatgtgatatag 22376642  T
Q  279 -attatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 321  Q
     | ||||||  ||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  22376643 taatatatgtattatgtgaaaaatgtatgatgttgaggttgttg 22376686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 181 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16245601 - 16245457
Alignment:
Q  181 agttggtccttggggtagaaacaa-agttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgatt-aatgttgttggttatgtgaaata 278  Q
    |||||||||||||||||| ||  | ||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  16245601 agttggtccttggggtaggaatgagagttgtttatgat-attaatgtagttcagagagtctgaaattaagatgattaaatgttgttggtaatgtgatata 16245503  T
Q  279 attatat---gccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 321  Q
     ||||||      |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16245502 gttatatatgtatttatgtggaaaatgtatgatattgaagttgttg 16245457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 1540540 - 1540609
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  1540540 tttggtttaggcgttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 1540609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 12942729 - 12942654
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  12942729 atgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 12942654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 22806329 - 22806277
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 73  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22806329 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagca 22806277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 65
Target Start/End: Original strand, 27330444 - 27330488
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27330444 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 27330488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 65
Target Start/End: Original strand, 27391184 - 27391228
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27391184 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 27391228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 19858551 - 19858620
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  19858551 tttggtttaggagttatgatgaaaatactcaaaggagatcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 19858620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23221465 - 23221301
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||  |||||||||||||||| ||   || |||||||||  |||| ||    
T  23221465 atgatatttagatttggagttatgatgaaaatactccatgtgggtcttagtaaaactttatgaaaattcagcataatttttcctaagttaaatcaaacct 23221366  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 166  Q
    |||||  |  |||||| | |||||| | | |||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23221365 tatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagtttaattaagatgtttaagagtatt 23221301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 64
Target Start/End: Original strand, 28288965 - 28289022
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 64  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28288965 tttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 28289022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 347
Target Start/End: Original strand, 18259851 - 18259985
Alignment:
Q  215 aattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatat--gccttatgtggaaaatgtatgatgttt 312  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||  |||||  |  |||||||||||||||||||||||     
T  18259851 aattaatattgttgttcagagagtctgag-ttaagatgattaacgttgttggtaatgtgatgtagctatatatgtattatgtggaaaatgtatgatgttc 18259949  T
Q  313 aagttgttgatgcttttcattaat-attgttatgtt 347  Q
    ||||||||| || || ||||| || |||||||||||    
T  18259950 aagttgttgttgattatcattgatcattgttatgtt 18259985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16135594 - 16135519
Alignment:
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  16135594 tatggaatatttccaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 16135519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Original strand, 22523437 - 22523594
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| |||| ||||| || ||| || ||||||  |  |  |||    
T  22523437 gagttatggtgaaaatactaaaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaattcagcataactatttttaagtgaacccataagttatggtttggtcgcaa 22523536  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
     |||||||||| | ||||||| ||||| ||| | | |||||||||||||||||| ||||    
T  22523537 acctcaaaacttg-agtactaggagtttaataaggatgtttaagagtatttaacctatg 22523594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 23415484 - 23415429
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  23415484 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 23415429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 323
Target Start/End: Original strand, 20078089 - 20078181
Alignment:
Q  229 ttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgat 323  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||| || || |||||| |||  ||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  20078089 ttcagtgagtctgacataaagatgataaatgttattagtaatgtgatata--tatatgcgttatgtgtaagatgtatgatgttgaagttgttgat 20078181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 320
Target Start/End: Original strand, 20411491 - 20411569
Alignment:
Q  244 attaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataatta--tatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  20411491 attaagatgattaatgttgttagtgatgtgatatagttatttatgcattatgtggaatatgtatgatgttggagttgtt 20411569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29044731 - 29044684
Alignment:
Q  132 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  29044731 gtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatataacctatgttgt 29044684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19234661 - 19234619
Alignment:
Q  137 atgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19234661 atgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgttgt 19234619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 27557242 - 27557187
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  27557242 tatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 27557187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 269
Target Start/End: Original strand, 31735554 - 31735640
Alignment:
Q  181 agttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggtta 269  Q
    |||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||| | |||  ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  31735554 agttggtctttggggtaggaatgaagttgtttataattat-attgtggttcagtgagtctgaa-ttaaaatgattaatgttgttggtta 31735640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Original strand, 31161927 - 31162085
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||| | ||||| ||||  || ||||| |||| || |||||||||||||  |  ||||||    
T  31161927 gagttatgttgaaaacactccaagtaggtcttggagaaattttaagtaaatttagcatgactatttccaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaa 31162026  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
       |||||||| | |||| || ||||| ||||| | ||||||| |||||||||| |||||    
T  31162027 atttcaaaacttg-agtattaagagtttaattatgatgtttaaaagtatttaacctatgt 31162085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 105)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 21 - 361
Target Start/End: Original strand, 10694719 - 10695058
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10694719 tatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacct 10694818  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  10694819 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtagaaacgaagttgtttataa-tat 10694917  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10694918 taatgttcttcagatagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtaaaataattatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 10695017  T
Q  321 gatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtg 361  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10695018 gatatttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtg 10695058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 21 - 361
Target Start/End: Original strand, 10908485 - 10908824
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10908485 tatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacct 10908584  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  10908585 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtagaaacgaagttgtttataa-tat 10908683  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908684 taatgttcttcagatagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtaaaataattatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 10908783  T
Q  321 gatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtg 361  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10908784 gatatttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtg 10908824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15008546 - 15008206
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  15008546 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggcataattcgaaacct 15008447  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtcctt-ggggtagaaacaaagttgcttataatta 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||| ||    
T  15008446 caaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttggtccttgggggtagaaacgaggttgtttataa-ta 15008348  T
Q  220 ttaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15008347 ttaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatatcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgt 15008248  T
Q  320 tgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtg 361  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  15008247 tgatgcttttcattaatattgatatgttgtgaattgcttgtg 15008206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 40620110 - 40619771
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  40620110 tatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaatct 40620011  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||    
T  40620010 caaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtattatacctatgttgtgagttggtccttggggtagaaacgaggttgtttataa-tat 40619912  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40619911 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatattgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtaagatgtttaggttgtt 40619812  T
Q  321 gatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtg 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  40619811 gatgcttttcattaatatttttatgttgtgaattgcttgtg 40619771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28385843 - 28385529
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28385843 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaact 28385744  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaa 200  Q
    || || |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28385743 tagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccaagttgtgagttggtccttggggtagaa 28385644  T
Q  201 acaaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaa 300  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28385643 acgaagttgtttataatt-ttaatgttcttcagagagtctaaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaa 28385545  T
Q  301 tgtatgatgtttaagt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  28385544 tgtatgatgtttaagt 28385529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 51 - 365
Target Start/End: Original strand, 15883917 - 15884230
Alignment:
Q  51 tgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa 150  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15883917 tgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttgatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa 15884016  T
Q  151 ggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaaga 250  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15884017 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtggaaacgaagttgtttataat-attaaggttcttcagagagtctgaaattaaga 15884115  T
Q  251 tgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcag 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  15884116 tgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgttatgttgag 15884215  T
Q  351 aattgcttgtgttgt 365  Q
    |||||||||||||||    
T  15884216 aattgcttgtgttgt 15884230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15990619 - 15990274
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  15990619 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaagct 15990520  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattat 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| |||| |||||    
T  15990519 caaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttggtcattggggtaggaacgaagttgtttat-attat 15990421  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattat--atgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttg 318  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||| ||||  |||| |||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  15990420 taatgttgttcagagagtctgaaattaagatgattaatgatgtcagtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgatgttg 15990321  T
Q  319 ttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtgttgt 365  Q
    | | || || || |||||||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  15990320 tggttgtttatcgttaatattgttataatgtgaattgcttgtgttgt 15990274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 33849342 - 33849174
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33849342 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 33849243  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33849242 tatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaa 33849174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18213166 - 18212969
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18213166 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaact 18213067  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  18213066 tatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 18212969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3337679 - 3337521
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  3337679 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 3337580  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3337579 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 3337521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Original strand, 630375 - 630551
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  630375 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttatgggataataccaaccct 630474  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||    
T  630475 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggta 630551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9638587 - 9638423
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  9638587 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaatct 9638488  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  9638487 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtgagttg 9638423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12611431 - 12611254
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12611431 tatgatgaaaatagtccaacgaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccct 12611332  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12611331 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtag 12611254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Original strand, 15447888 - 15448037
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15447888 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 15447987  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15447988 caaaactggaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 15448037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 198
Target Start/End: Original strand, 23802938 - 23803113
Alignment:
Q  23 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctca 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23802938 tgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctca 23803037  T
Q  123 aaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||||    
T  23803038 aaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttatgagttgatccttggggtag 23803113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 185
Target Start/End: Original strand, 24046993 - 24047170
Alignment:
Q  8 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggga 107  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24046993 ttggtttttgagttatgatggaaatactctaggtaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggga 24047092  T
Q  108 taattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  24047093 taattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 24047170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10705078 - 10704914
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  10705078 tatgatgaaaatattgcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 10704979  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  10704978 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 10704914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10918848 - 10918684
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  10918848 tatgatgaaaatattgcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 10918749  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  10918748 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 10918684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 51463539 - 51463716
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  51463539 tatgatgaaaatagtctaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaatttatgcgataataccaaccct 51463638  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  51463639 caaaactagaagtactatgagtttaattaaggcgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtag 51463716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 56115308 - 56115481
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  56115308 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 56115407  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggg 194  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||  |||||||    
T  56115408 caaaagcagaagtactatgagttctattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaaccttggg 56115481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 33243754 - 33243926
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33243754 tttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaaggggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 33243853  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  33243854 atgattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattgaggtgtttaagagtagctaacctatgttgt 33243926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19609904 - 19609746
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  19609904 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttaaggtataattccaaacct 19609805  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19609804 caaaactagaagtactatcagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 19609746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25091233 - 25091075
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  25091233 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 25091134  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25091133 cgaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaaccaatgttgt 25091075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 53630945 - 53631103
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  53630945 tatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaacct 53631044  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53631045 caaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 53631103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10057072 - 10056875
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  10057072 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaact 10056973  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    || || |||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  10056972 tagggaataattccaaacctcaaatctagaagtaccaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttatgagttgatcctttgggtag 10056875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 16277779 - 16277948
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  16277779 atgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggttttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaact 16277878  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16277879 tatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaac 16277948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 53387389 - 53387558
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  53387389 atgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaact 53387488  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53387489 tatgggataattccaagactcaaaattagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaac 53387558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 10356908 - 10357066
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  10356908 tatgatgaaaatacaccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacct 10357007  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10357008 caaaactagaagtattatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 10357066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 35660446 - 35660268
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  35660446 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaact 35660347  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35660346 tatggaataatctcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgt 35660268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 33186485 - 33186317
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | |||  ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  33186485 gagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataacattttctaagttagtccaaaacttatggaataactccaa 33186386  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  33186385 ccctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttg 33186317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14549206 - 14549048
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  14549206 tatgatgaaagtactccatggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 14549107  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14549106 caagactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttagcctatgttgt 14549048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16998125 - 16997952
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  16998125 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 16998026  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    || || |||||||||| |||||||     |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16998025 taaggaataattccaaacctcaaa-----aagtactatgagttgaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 16997952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 37019249 - 37019095
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  37019249 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttataagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacct 37019150  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37019149 caaaactagaagtactatgggttcaactaaggtgtttaagagtatttaacctatg 37019095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 42875379 - 42875221
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||    
T  42875379 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcgtaactgtttctaagttaatccaaaacttaatgaataattccaaacct 42875280  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  42875279 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaggagtatttaacctatgttgt 42875221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9923796 - 9923622
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||    
T  9923796 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaact 9923697  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  9923696 tatggaatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaatagtgtttaacctatg 9923622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 11479063 - 11479237
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  11479063 atgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttccaagttaatccaaaact 11479162  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11479163 tatggaatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatg 11479237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3485508 - 3485333
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  3485508 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaattgtta--aaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 3485411  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    || || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  3485410 tagggaataattccaaccc-caagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctagcatatgttgt 3485333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15114802 - 15114648
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15114802 tatgatgaaaatactcaaagtaggtcttagtgaaat-ttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 15114704  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
     |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15114703 taaaactagaagtactaggagtttaattaaggagtttaagagtatttaacctatgt 15114648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14630410 - 14630248
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||  |   |||||    
T  14630410 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaa 14630311  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14630310 acctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgttgt 14630248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 257 - 361
Target Start/End: Original strand, 15497100 - 15497204
Alignment:
Q  257 atgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15497100 atgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgagaattga 15497199  T
Q  357 ttgtg 361  Q
    |||||    
T  15497200 ttgtg 15497204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11425525 - 11425377
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||          |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  11425525 tatgatgaaaatattccaaggaggtcttagtgaaa----------attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 11425436  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11425435 caaaactagaagtactattagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 11425377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 19435165 - 19435328
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||||||||    
T  19435165 gagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattatatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcagtctaaaatttagggaataattccaa 19435264  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19435265 acctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaacctatgttgt 19435328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Original strand, 15011985 - 15012097
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15011985 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 15012084  T
Q  121 caaaactagaagt 133  Q
    |||||||||||||    
T  15012085 caaaactagaagt 15012097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 19566371 - 19566548
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  19566371 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaattttgtgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaact 19566470  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||  |   ||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19566471 tatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 19566548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 10237950 - 10238117
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  10237950 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaact 10238049  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    |||||  |  |||||| | |||||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10238050 tatggattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttaaattaatgtgtttaagagtatttaa 10238117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Original strand, 14746649 - 14746751
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14746649 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 14746748  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  14746749 tgt 14746751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 181 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 27996165 - 27996025
Alignment:
Q  181 agttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataat 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||    
T  27996165 agttggtccttggggtagaaacgaagttgtttataat-attaatgttgttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttagtaatgtgatacaat 27996067  T
Q  281 --tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
      ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27996066 tatatatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtt 27996025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 17048200 - 17048303
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17048200 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 17048299  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  17048300 tgtg 17048303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 43256224 - 43256327
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  43256224 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgatatgttgtgaattgct 43256323  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  43256324 tgtg 43256327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15365323 - 15365183
Alignment:
Q  181 agttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataat 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |    
T  15365323 agttggtccttggggtagaaacgaagttgtttataat-attaatgttgttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttagtaatgtgatatagt 15365225  T
Q  281 --tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
      ||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15365224 tatatatgaattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtt 15365183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15344475 - 15344301
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || || |||||    
T  15344475 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaact 15344376  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    |||||  |   |||||   ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15344375 tatggattgtctccaa-attcaaagct-tatgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 15344301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 13591992 - 13592094
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  13591992 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaa-tgtatgatgtttaagttgatgatgcttttcattaatattgatatgttgtgaattgct 13592090  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  13592091 tgtg 13592094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25513326 - 25513165
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||| |   | |||    
T  25513326 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaagttccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgggttgtcttcaa 25513227  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     ||||||| || |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  25513226 acctcaaagcttg-tgtactacgagttcaattacggtgtttaagaatatttaacctatgttgt 25513165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Original strand, 44024062 - 44024231
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||  |||||| || || |||||||||||||     
T  44024062 tttggtttctgagttattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactgtttctaggtcaacccaaaacttatgga 44024161  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
     |   ||||| | ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44024162 ttgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 44024231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Original strand, 45314795 - 45314964
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||| |||     
T  45314795 tttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttgtgga 45314894  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
     |   ||||| | ||||| || |  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45314895 ttgtctccaaacttcaaagcttg-tgcattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 45314964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 14954314 - 14954417
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  14954314 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 14954413  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  14954414 tgtg 14954417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 217 - 361
Target Start/End: Original strand, 53631279 - 53631425
Alignment:
Q  217 ttattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattat--atgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaa 314  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  53631279 ttattattgttgttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaa 53631378  T
Q  315 gttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtg 361  Q
    ||||| | || || || |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  53631379 gttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcttgtg 53631425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9556489 - 9556391
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  9556489 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 9556391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 14757569 - 14757667
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  14757569 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 14757667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19738500 - 19738360
Alignment:
Q  181 agttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataat 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||| | ||| |    
T  19738500 agttggtccttggggtagaaacgaagttgtttataat-attaatgttgttcagagaatctgaaattaagatgattaatgttgatagtaatgttatatagt 19738402  T
Q  281 --tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
      ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19738401 tatatatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtt 19738360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26445468 - 26445307
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  | | ||| |||||||||| || |||||||||||||  |   |||||    
T  26445468 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaatttcggataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaa 26445369  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     | ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26445368 acttcaaagcttg-tgtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 26445307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 166
Target Start/End: Original strand, 16026397 - 16026545
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||  |   | |||    
T  16026397 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataagtatttctaagttaacccaaaacttatggattgtctacaa 16026496  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 166  Q
     | |||||  | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16026497 acttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 16026545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 25689829 - 25689726
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  25689829 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 25689730  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  25689729 tgtg 25689726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 347
Target Start/End: Original strand, 4561481 - 4561570
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgtt 347  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  4561481 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaataatgttatgtt 4561570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 347
Target Start/End: Original strand, 5757085 - 5757174
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgtt 347  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  5757085 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttggtgcttcacattaatattgttatgtt 5757174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17810231 - 17810142
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgtt 347  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  17810231 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 17810142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 40229903 - 40229727
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt-agtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaac 99  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||| || || |||||||    
T  40229903 atgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaggaggtcttaagtgaaattttatgaaaattctgcataattatttctaggtcaacccaaaac 40229804  T
Q  100 ttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    ||||||  |   ||||| | ||||| || |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40229803 ttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 40229727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 46740798 - 46740623
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||| ||||||| || || ||||||||    
T  46740798 atgatgtttggtttttgagttatgataaaaatactccaaagacgtcttagtgaaattttgtgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaact 46740699  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    |||||  |   ||||| | ||||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  46740698 tatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 46740623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 184
Target Start/End: Original strand, 9871126 - 9871201
Alignment:
Q  109 aattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagtt 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  9871126 aattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtt 9871201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 10712815 - 10712712
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  10712815 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttgtgttgtgaattgct 10712716  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  10712715 tgtg 10712712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 10926585 - 10926482
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  10926585 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttgtgttgtgaattgct 10926486  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  10926485 tgtg 10926482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Original strand, 15214517 - 15214672
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||| || ||| ||||| | ||||| || || | |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||    
T  15214517 tatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaatatttccaaacct 15214616  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
    | ||||| ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  15214617 cgaaactggaagtactaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 15214672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 18108330 - 18108417
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagt 88  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  18108330 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagt 18108417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27533985 - 27533882
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||  |||||||     
T  27533985 tgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgca 27533886  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  27533885 tgtg 27533882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 2425089 - 2425250
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||  |   |||||    
T  2425089 gagttatgatgaaactactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaatttccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaa 2425188  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
       |||||  | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2425189 aattcaaaggttg-tgcactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 2425250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12487670 - 12487567
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||||    
T  12487670 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaaattgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 12487571  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  12487570 tgtg 12487567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 55582791 - 55582703
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagtt 89  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  55582791 atgatgtttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtt 55582703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 179
Target Start/End: Original strand, 13036328 - 13036407
Alignment:
Q  100 ttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13036328 ttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatattgt 13036407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14508322 - 14508184
Alignment:
Q  40 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatg 139  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||| | | ||| || |  ||||||||    
T  14508322 ggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaactttaaagcttgt-gtactatg 14508224  T
Q  140 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14508223 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 14508184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19857576 - 19857474
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||| ||    
T  19857576 tgttgttggttatgtgaaatgttcataagccttatgtggagaatatatgatatttaagttgttgatgtttttcattaatattgtcatgttgtgaattact 19857477  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  19857476 tgt 19857474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Original strand, 20595899 - 20596056
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||  | || ||||    
T  20595899 gagttatgatgaaaatacttcaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaattcagcataattatttgtaagtcaaccccaaacttatggtttgatgccaa 20595998  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
     |||||||||| | |||  || ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  20595999 acctcaaaacttg-agttataggagttcaattatgatgtttaagagtatttaacctatg 20596056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 12033396 - 12033471
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  12033396 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 12033471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 270 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 14650866 - 14650778
Alignment:
Q  270 tgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgctt 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||    
T  14650866 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaatatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgctt 14650778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33742337 - 33742252
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33742337 tgttgttggttatgtgaaatatttatgt--cttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatg 33742252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 44615828 - 44615753
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  44615828 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 44615753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 50221962 - 50222037
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  50221962 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 50222037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 22725537 - 22725608
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 72  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22725537 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaagtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 22725608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 169
Target Start/End: Original strand, 43251116 - 43251183
Alignment:
Q  103 tgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtg-tttaagagtatttaa 169  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43251116 tgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttttaagagtatttaa 43251183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 12622932 - 12622803
Alignment:
Q  40 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatg 139  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| || || || |||||||||||||  |   ||||| | ||||| || |  ||||||||    
T  12622932 ggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgt-gtactatg 12622834  T
Q  140 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12622833 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 12622803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 19243240 - 19243165
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  19243240 atgatttttggtttaggtgttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 19243165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 29267893 - 29267818
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||    
T  29267893 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctcagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 29267818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 298 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26013498 - 26013436
Alignment:
Q  298 aaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgt 360  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26013498 aaatgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgt 26013436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 50160417 - 50160275
Alignment:
Q  181 agttggtccttggggtagaaacaa-agttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgatta-atgttgttggttatgtgaaata 278  Q
    |||||||||||||||||| ||  | ||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||| |||    
T  50160417 agttggtccttggggtaggaatgatagttgtttatgat-attaatgttgttcagagagtctgaa-ttaagatgattttatgttgttggtgatgtgatata 50160320  T
Q  279 attatat--gccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 321  Q
     ||||||  |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  50160319 gttatatatgtgttatgtggaaaatgtatgaagttgaagttgttg 50160275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 156
Target Start/End: Original strand, 13046116 - 13046251
Alignment:
Q  20 ttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccc 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||| || |||||||||||| | || |||||| ||||||  |  |||||| ||    
T  13046116 ttatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtaaaattttacgaaaattcaacataaccatttctaaatcaacccaaaagttatggtttgtttccaatcc 13046215  T
Q  120 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtt 156  Q
    |||||| | | ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  13046216 tcaaaaattg-agtactaggagtttaattagggtgtt 13046251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15534721 - 15534646
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  15534721 atgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 15534646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 179
Target Start/End: Original strand, 26922254 - 26922301
Alignment:
Q  132 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26922254 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 26922301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10056693 - 10056650
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaat 301  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10056693 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaat 10056650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 49547396 - 49547459
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 64  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  49547396 atgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttaatgaatttttatgaa 49547459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 14049117 - 14049042
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  14049117 atgatatttggtttttgagatatcataaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 14049042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 36038410 - 36038335
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  36038410 atgatttttggtttatgagatatgataaaaatactcaaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 36038335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 100
Target Start/End: Original strand, 19081809 - 19081892
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||    
T  19081809 gagttatgatgaaaacacttcaaggagatcttggtaaaattttacgaaaattcagcataaccgtttccaagtcaacccaaaact 19081892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 55582673 - 55582626
Alignment:
Q  132 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  55582673 gtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaatctatgttgt 55582626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 14185475 - 14185427
Alignment:
Q  8 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaat 56  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14185475 ttggtttttgagttatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagcgaaat 14185427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 176
Target Start/End: Original strand, 12134421 - 12134486
Alignment:
Q  111 ttccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
    |||||| | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  12134421 ttccaaacttcaaaactaaaagtattaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 12134486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 30147435 - 30147380
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  30147435 tatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 30147380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 361
Target Start/End: Original strand, 22241 - 22580
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22241 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaagattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacct 22340  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattat 220  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||    
T  22341 aaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtagaaacgaggttgtttataa-tat 22439  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22440 taatgttcttaagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttgattatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 22539  T
Q  321 gatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtg 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  22540 gatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtttgtg 22580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 21 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4614 - 4267
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaac--- 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  4614 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaatta 4515  T
Q  118 -cctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataa 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4514 acctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtagaaacgaagttgtttataa 4415  T
Q  217 ttattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 316  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4414 t-attaatgttcttcaaagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatatgaaattattatatgtcttatgtggaaaatgtctgatgtttaagt 4316  T
Q  317 tgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtgttgt 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4315 tgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgt 4267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 2)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 21 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4614 - 4267
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaac--- 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  4614 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaatta 4515  T
Q  118 -cctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataa 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4514 acctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtagaaacgaagttgtttataa 4415  T
Q  217 ttattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 316  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4414 t-attaatgttcttcaaagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatatgaaattattatatgtcttatgtggaaaatgtctgatgtttaagt 4316  T
Q  317 tgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtgttgt 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4315 tgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgt 4267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 258 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15052 - 14951
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||| ||||||| |||| | | |||||||    
T  15052 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgggaaaaatgtatgatgttaaagttgtagacgctctccataaatattgatatgatgaaaattgct 14953  T
Q  358 tg 359  Q
    ||    
T  14952 tg 14951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 50 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 33469 - 33154
Alignment:
Q  50 gtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaatta 149  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33469 gtgaaatcttatgaaaattcagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaacctcaaaactagaagcactatgagttcaatta 33370  T
Q  150 aggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaag 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33369 aggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccgtagggtagaaacgaagttgtttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaag 33270  T
Q  250 atgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttca 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  33269 atgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgcttttaattaatattgttatgttga 33170  T
Q  350 gaattgcttgtgttgt 365  Q
    ||||||||||||||||    
T  33169 gaattgcttgtgttgt 33154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 33691 - 33636
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  33691 tatgatgaaaatactccgaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 33636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 3)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 21 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 10801 - 10462
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccattt-ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccc 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  10801 tatgatgaaaatactccaaagaggacttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaaac 10702  T
Q  120 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataatta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||| ||    
T  10701 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtcctttgggtaaaaacgaggttgtttataa-ta 10603  T
Q  220 ttaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  10602 ttaatgttcttcagagagtctgaatttaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttt-agtttt 10504  T
Q  320 tgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtg 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10503 tgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtg 10462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 918 - 744
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || ||||||||    
T  918 atgatttttggtttctgagttatgatgaaaatactc-aatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcagaactatttctatgtcaacccaaaact 820  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    |||||  |   ||||| | ||||| ||    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  819 tatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactataaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6424 - 6250
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || ||||||||    
T  6424 atgatttttggtttctgagttatgatgaaaatactc-aatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcagaactatttctatgtcaacccaaaact 6326  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    |||||  |   ||||| | ||||| ||    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6325 tatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactataaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 6250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 176389 - 176078
Alignment:
Q  4 atatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  176389 atatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttag 176290  T
Q  104 gggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaaca 203  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  176289 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtagaaacg 176190  T
Q  204 aagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgt 303  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  176189 aagttgtttataa-tattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgt 176091  T
Q  304 atgatgtttaagt 316  Q
    |||||||||||||    
T  176090 atgatgtttaagt 176078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 4 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 169036 - 168724
Alignment:
Q  4 atatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  169036 atatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttag 168937  T
Q  104 gggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggg-gtagaaac 202  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  168936 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggagtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttgggtgtagaaac 168837  T
Q  203 aaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatg 302  Q
     |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  168836 gaagttgtttataa-tattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttgcttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatg 168738  T
Q  303 tatgatgtttaagt 316  Q
    ||||||||||||||    
T  168737 tatgatgtttaagt 168724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 152682 - 152855
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  152682 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 152781  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggg 194  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||    
T  152782 taaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtaagttgatccttggg 152855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 77267 - 77103
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  77267 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataagcgtttctaagttaattcaaaacttatgggataattccaaacct 77168  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  77167 caaaactagaagtacaatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttg 77103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 446744 - 446606
Alignment:
Q  183 ttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataat-- 280  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |      
T  446744 ttggtccttggggtagaaacgaagttgtttataat-attaatgttattcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttagtaatgtgatatagtta 446646  T
Q  281 tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  446645 tatatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtt 446606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 497588 - 497538
Alignment:
Q  270 tgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  497588 tgtgaaatatttatataacttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtt 497538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21661 - 21361
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  21661 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatccagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 21562  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  21561 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttcacctatgttgtgagttggtccttggggtagaaacaaagttgtttataa-tag 21463  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataatta--tatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttg 318  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||  ||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21462 taatgttgttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttagtgatgtgatatagttatttatggattatgtggaatatgtatgatgttgaagttg 21363  T
Q  319 tt 320  Q
    ||    
T  21362 tt 21361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 111087 - 110890
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  111087 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 110988  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  110987 tgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 110890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 124018 - 124181
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  124018 tttggtttttgagatattatgaaaatactccaatgaggtgttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatggg 124117  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  124118 ataatttcaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaac 124181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 146312 - 146154
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || |||    
T  146312 tatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagaataacagtttctaagttaatccaaaacatatgtaataattcaaaacct 146213  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||    
T  146212 caaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaatctatgttgt 146154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 3414 - 3651
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3414 tatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct 3513  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  3514 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagttggcccttggggtagaaacgaagttgtttataa-tat 3612  T
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatg 259  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3613 taatgttgttcagggagtctgaaattaagatgattaatg 3651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 321
Target Start/End: Original strand, 11456 - 11597
Alignment:
Q  181 agttggtccttggggtagaaac-aaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataa 279  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  | |||     
T  11456 agttggtctttggggtagaaatgaaagttgtttataat-attattgttgttcagagagtctgaa-ttaagatgattaatgttgttggtgatgcaatatag 11553  T
Q  280 t--tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 321  Q
    |  ||||||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  11554 ttatatatgtattatgtgaaaagtgtatgatgttgaagttgttg 11597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 11291 - 11037
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||     
T  11291 tttggtttttgagatatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttaggga 11192  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaag 206  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||     
T  11191 ataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtagaaacgaaa 11092  T
Q  207 ttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttg 262  Q
    ||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11091 ttgttaataa-tattaatgttgttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttg 11037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 259
Target Start/End: Original strand, 11978 - 12216
Alignment:
Q  20 ttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccc 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  11978 ttattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataactgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacc 12077  T
Q  120 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataatta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||    
T  12078 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtaattaacctatgttgtgagtttgtccttggggtagaaacgaagttatttataa-ta 12176  T
Q  220 ttaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatg 259  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12177 ttaatgttgttcagagagtgtgaaattaagatgattaatg 12216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 21855 - 21674
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21855 atgatatttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaact 21756  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttag 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21755 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgttag 21674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 28840 - 28998
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  28840 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 28939  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  28940 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgttgt 28998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0672 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0672
Description:

Target: scaffold0672; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 8008 - 8189
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  8008 atgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 8107  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttag 182  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||    
T  8108 tatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttatgattatttaacccatgttgttag 8189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16153 - 15976
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16153 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 16054  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  16053 caaaactagaaatactataagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagtttatccttggggtag 15976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15797 - 15689
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaata-attatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15797 tgttgttggttatgtgaaaaatattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 15698  T
Q  357 ttgtgttgt 365  Q
    |||| ||||    
T  15697 ttgtattgt 15689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0635
Description:

Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7464 - 7316
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  7464 tatgatgaaaatactccagggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 7365  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7364 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 7316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 19116 - 19280
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19116 tatgatgaaaatactacaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct 19215  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  19216 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 19280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3306 - 3137
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  3306 atgatattttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 3207  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3206 tatgagataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaac 3137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12549 - 12372
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12549 tatgaagaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 12450  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||||||||    
T  12449 caaaactagaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaacccattttgtgagttgatccttggggtag 12372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 573 - 396
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  573 tatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 474  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| ||||| ||||||||||||    
T  473 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagcatttaacccgtgttgtgagttgatccttggggtag 396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 214 - 112
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  214 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttaggtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 115  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  114 tgt 112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13526 - 13362
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||    
T  13526 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacatatgagataattcccaacct 13427  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13426 caaaactagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 13362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16344 - 16180
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  16344 tatgatgaaaatactttaaggaggtcttagtgaaatcttatgaatattcagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataattctcaacct 16245  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16244 caaaactagaagtactatgagttcaatgaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 16180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 8816 - 8686
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||    
T  8816 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacatatgagataattcccaacct 8717  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaag 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8716 caaaactagaagtactatgagttcaattaag 8686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21313 - 21155
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||    
T  21313 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaagaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattttaattct 21214  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21213 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 21155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 5)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 15058 - 15216
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  15058 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacct 15157  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15158 caaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 15216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 24116 - 24274
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  24116 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacct 24215  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24216 caaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 24274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 67449 - 67546
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  67449 tgttgttggttatgt-aaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 67546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 217 - 265
Target Start/End: Original strand, 15392 - 15440
Alignment:
Q  217 ttattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttg 265  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15392 ttattattgttgttcagagagtctgaaaataagatgattaatgttgttg 15440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 217 - 265
Target Start/End: Original strand, 24450 - 24498
Alignment:
Q  217 ttattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttg 265  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24450 ttattattgttgttcagagagtctgaaaataagatgattaatgttgttg 24498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 596 - 420
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  596 tatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccct 497  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||    
T  496 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtg-ttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatctttggggtag 420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 4)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 133350 - 133153
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  133350 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactcaaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccattttcaagttaatccaaaact 133251  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  133250 tatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagaggtttaagtgtatttaactcatgttgtgagttgacccttggggtag 133153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 133616 - 133813
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  133616 atgattttttgtttaggagttatgttgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaatttcagcacaaccatttccaagttaatccaaaact 133715  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  133716 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 133813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29758 - 29580
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  29758 atgatttttggtttagtagttatgatgaaaatactacaaggaatacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 29659  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    || || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  29658 tagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaagagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgt 29580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 33838 - 33803
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactc 36  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33838 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactc 33803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 848 - 680
Alignment:
Q  2 tgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaactt 101  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  848 tgatatttcgtttttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaactt 749  T
Q  102 atgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  748 atgggataattccaaccctccaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaac 680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 472 - 387
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgtta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  472 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgtta 387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 1663 - 1507
Alignment:
Q  23 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  1663 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccaattctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctca 1564  T
Q  123 aaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1563 aaacaagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 1507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 94 - 1
Alignment:
Q  23 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccaattctatgttaatccaaaacttatgggataattccaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 5)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23169 - 23001
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23169 atgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacatccatttctaagttaatccaaaact 23070  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23069 tatgggataattccaatgctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 23001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Original strand, 17725 - 17878
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17725 gagttatgatggaaatactctagggatgtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacagccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 17824  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17825 ggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaac 17878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 170
Target Start/End: Original strand, 23381 - 23511
Alignment:
Q  40 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatg 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  23381 ggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatg 23480  T
Q  140 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23481 agttcaattaaggtgtttaagaatatttaac 23511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33919 - 33794
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  33919 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 33820  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaa 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  33819 caaaactataagtactatgagttcaa 33794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Original strand, 22647 - 22765
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaagg-aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcca 115  Q
    ||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22647 gagttatgatggaaatactctaggggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcca 22746  T
Q  116 accctcaaaactagaagta 134  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  22747 aggctcaaaactagaagta 22765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 78644 - 78486
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  78644 tatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 78545  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  78544 caaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgttaaagagtatttaacctatgttgt 78486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 9428 - 9605
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  9428 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgataattcagcacaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 9527  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  9528 caaaactagaagtaatatgagtacaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 9605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8644 - 8480
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  8644 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttggtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 8545  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8544 caaaactacaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 8480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 597 - 421
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  597 atgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaact 498  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  497 tatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactttgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgtt 421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Original strand, 1358 - 1460
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1358 tgttgttggctatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 1457  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  1458 tgt 1460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 7575 - 7411
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  7575 atgatttttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 7476  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 165  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7475 tatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtat 7411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 55
Target Start/End: Original strand, 10389 - 10423
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10389 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 10423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11267 - 11217
Alignment:
Q  129 gaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11267 gaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgt 11217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6379 - 6231
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  6379 tatgatgaaaaaactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttttgggataattccaaagct 6280  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6279 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtttttaa 6231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 4)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 435 - 607
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  435 tttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaggga 534  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  535 ataattccaaacctcaaaactcgaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgt 607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 5732 - 5896
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  5732 atgatttttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 5831  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 165  Q
    || || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5832 tagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtat 5896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2918 - 2771
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||    
T  2918 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcc-aagcttatgggataattccaaagct 2820  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2819 caaaactagaaatactacgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 2771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 36089 - 36192
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||  |||||||     
T  36089 tgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgca 36188  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  36189 tgtg 36192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 8637 - 8489
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  8637 tatgatgaaaatactctaaggaggtgttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 8538  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8537 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaa 8489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 82566 - 82392
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  82566 tatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaattcaaaacttatgggataataccaaccct 82467  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggt 196  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  82466 caaaactagaagtattatgagttcaattaaggtg-ttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggt 82392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 258 - 340
Target Start/End: Original strand, 80482 - 80564
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattg 340  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  80482 tgttgttggttatatgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattg 80564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 939 - 1097
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  939 tatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaacct 1038  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1039 caaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 1097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 217 - 361
Target Start/End: Original strand, 1273 - 1419
Alignment:
Q  217 ttattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattat--atgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaa 314  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  1273 ttattattgttgttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaa 1372  T
Q  315 gttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtg 361  Q
    ||||| | || || || |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  1373 gttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcttgtg 1419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 5185 - 5343
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  5185 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 5284  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5285 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaaactatgttgt 5343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 6129 - 6327
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  6129 atgaaatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttataaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 6228  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagg-tgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||| ||| |  |||||||||||    
T  6229 tatggaataattccaaagatcaaaactagaagtactatgagttcaattagggttttttaagagtatttaacttatgttgtgagtagacccttggggtag 6327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 5778 - 5956
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  5778 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaact 5877  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||    
T  5878 tatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgt 5956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 258 - 324
Target Start/End: Original strand, 6225 - 6291
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatg 324  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6225 tgttgttggttatgtgaaatatttatatggcttatgtggaaaatatacgatgtttaagttgttgatg 6291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 7857 - 8015
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |    
T  7857 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaactt 7956  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7957 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 8015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1758
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  1582 tatgatgaaaatactccatggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaacccc 1681  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1682 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggt-tttaagattatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtag 1758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 27880 - 27722
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  27880 tatgatgaaaataattccaggaggtcttactgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacct 27781  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27780 caaaactagaagtactatgagtacaattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgt 27722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Original strand, 1940 - 2042
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1940 tgttattggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 2039  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  2040 tgt 2042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Original strand, 36043 - 36188
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36043 tatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccct 36142  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36143 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 36188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6605 - 6425
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  6605 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataatcatttataagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacct 6506  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtagaaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| | ||| | ||||| |||||||||    
T  6505 caaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtgtttaacctatgttatgagtagatccttagggtagaaa 6425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 592 - 490
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  592 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 493  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  492 tgt 490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16521 - 16360
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||  |   |||||    
T  16521 gagttatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattttctccaa 16422  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     | |||||  |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16421 acttcaaagat-catgtactatgagttcaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgt 16360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26506 - 26358
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  26506 tatgatgaaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagct 26407  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26406 caaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 26358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27888 - 27740
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  27888 tatgatgaaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagct 27789  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27788 caaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 27740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7817 - 7641
Alignment:
Q  3 gatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaactta 102  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||    
T  7817 gatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagaaggtctttgtgtaattttatgaaaattcagcataattgtttgtaagttaatccaaaactta 7718  T
Q  103 tgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7717 tggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttagttaaggggtttaagagtatttaacctatgttgt 7641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14448 - 14272
Alignment:
Q  3 gatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaactta 102  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||    
T  14448 gatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagaaggtctttgtgtaattttatgaaaattcagcataattgtttgtaagttaatccaaaactta 14349  T
Q  103 tgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14348 tggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttagttaaggggtttaagagtatttaacctatgttgt 14272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 51538 - 51390
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  51538 tatgatcaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaagct 51439  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  51438 caaaactagaagtactatgagttaaaataaggtgtttaagagtatttaa 51390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 67268 - 67191
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaacc 78  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  67268 atgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataacc 67191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 162864 - 162716
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  162864 tatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacatatgggataattccaaagct 162765  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  162764 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 162716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 105512 - 105316
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  105512 atgatatttagtttttgagatatgatgaaaatacaccaaggaggtctaagtgaaattttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaact 105413  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  105412 tatggaataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgat-cttggggtag 105316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 105135 - 105078
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaag 315  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  105135 tgttgtcggttatgcgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaag 105078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 138375 - 138207
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  138375 atgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttcgtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 138276  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  138275 tatgtgataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaa 138207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 71356 - 71253
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  71356 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 71257  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  71256 tgtg 71253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7713 - 7555
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||    
T  7713 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtcaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaagct 7614  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  7613 caaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgtttattagtatttaacctatgttgt 7555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9635 - 9477
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||    
T  9635 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattaagcataactatttctaagttaatccaaaacttatgagacaattccaaggct 9536  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  9535 caaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgt 9477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 22263 - 22421
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  22263 tatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 22362  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22363 caaaacttgaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 22421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 29312 - 29139
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||   ||    
T  29312 tatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccatgttaatcaaaaacttatgggataattccaggact 29213  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggg 194  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||    
T  29212 aaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaagccatgttgtgagttgatccttggg 29139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 34777 - 34604
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||   ||    
T  34777 tatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccatgttaatcaaaaacttatgggataattccaggact 34678  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggg 194  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||    
T  34677 aaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaagccatgttgtgagttgatccttggg 34604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 2179 - 2376
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||    
T  2179 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatcaaaaact 2278  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
      ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  2279 ggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 2376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Original strand, 159422 - 159567
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  159422 tatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattcaaaagct 159521  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  159522 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgattaagagtatt 159567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 6001 - 5833
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||| | ||||||||||| || ||||||||||    
T  6001 gagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttcaaagtcagtccaaaacttagggaataattccaa 5902  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttg 185  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  5901 acctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagttg 5833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 179
Target Start/End: Original strand, 7251 - 7411
Alignment:
Q  18 agttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaac 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||| ||||||  |   |||||     
T  7251 agttatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaa 7350  T
Q  118 cctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
      |||||  | |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7351 attcaaagtttg-tgtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 7411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 143193 - 143038
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  143193 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 143094  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  143093 caaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgt 143038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Original strand, 169469 - 169591
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  169469 tatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacct 169568  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagtt 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  169569 caaaactagaagtactaggagtt 169591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Original strand, 169815 - 169917
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  169815 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 169914  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  169915 tgt 169917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 8097 - 7939
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  8097 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacct 7998  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7997 caaaactagaagtactatgagtttaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 7939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 149
Target Start/End: Original strand, 8152 - 8266
Alignment:
Q  35 tccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagta 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||     
T  8152 tccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtt 8251  T
Q  135 ctatgagttcaatta 149  Q
    |||||||||||||||    
T  8252 ctatgagttcaatta 8266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3870 - 3692
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  3870 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaact 3771  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||||||    
T  3770 tatggaataattccaaacctcaaaactagaaggactaggagtttaattaaggggtttaacaatatttaacatgtgttgt 3692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 13008 - 13166
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  13008 tatgttgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccatttttaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacct 13107  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13108 caaaactaaaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 13166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 179
Target Start/End: Original strand, 19372 - 19433
Alignment:
Q  118 cctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19372 cctcaaaactaaaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 19433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 434 - 612
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  434 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttctaagttaatccaaaact 533  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  534 tatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttaaattaaggtgtttaagagaatttaatctatgttgt 612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 5738 - 5916
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  5738 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttctaagttaatccaaaact 5837  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  5838 tatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttaaattaaggtgtttaagagaatttaatctatgttgt 5916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 1535 - 1480
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaat 56  Q
    ||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1535 atgatattttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaat 1480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 12914 - 12769
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  12914 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaatcca 12815  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 166  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12814 taaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 12769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Original strand, 8775 - 8923
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  8775 tatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacct 8874  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8875 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaa 8923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1487 - 1332
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  1487 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 1388  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1387 caaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgt 1332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 13137 - 13295
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13137 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 13236  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  13237 caaaaatagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacatgtgttgt 13295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Original strand, 8122 - 8277
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||| || ||| ||||| | ||||| || || | |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||  ||    
T  8122 tatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaactcaatccaaaacttatggaatatttccaaaact 8221  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8222 caaaactagaaatactaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacgtatgt 8277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 361
Target Start/End: Original strand, 13490 - 13545
Alignment:
Q  306 gatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtg 361  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13490 gatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtg 13545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39699 - 39521
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || | |||||| ||||||||||||||    
T  39699 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagggcttagtgaaatcttatgaaaattcaggataatcgtttctatgttaatccaaaact 39600  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  39599 tatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgatttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgt 39521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 120490 - 120332
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  120490 tatgatgaaaatacttcaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 120391  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  120390 caaaactagaagtactatgagtttaattaaggggtttaagagtatttaacatgtgttgt 120332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 138
Target Start/End: Original strand, 29669 - 29786
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29669 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct 29768  T
Q  121 caaaactagaagtactat 138  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29769 caaaactagaagtactat 29786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 120063 - 119960
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  120063 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattattatgttgtgaattgct 119964  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  119963 tgtg 119960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 255
Target Start/End: Original strand, 29786 - 29820
Alignment:
Q  221 taatgttcttcagagagtctgaaattaagatgatt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29786 taatgttcttcagagagtctgaaattaagaagatt 29820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 126328 - 126170
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  126328 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattctaaacct 126229  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  126228 caaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacatgtgttgt 126170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 126010 - 125907
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  126010 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 125911  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  125910 tgtg 125907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33047 - 32878
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||| || || || |||||||||||||     
T  33047 tttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactttttttaggtcaacccaaaacttatgga 32948  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
     |   ||||| | ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32947 ttgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 32878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22633 - 22480
Alignment:
Q  26 tgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  22633 tgaaaatactccaaggaggtcgtagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaa 22534  T
Q  126 ctagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22533 ctagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgt 22480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 4)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 67694 - 67497
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  67694 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 67595  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagttggtccttggggtag 198  Q
    ||  | ||||||||||  || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| || |||||||||    
T  67594 tagagaataattccaaatctgaaaactagaagtactaggatttcaattaaggtgtttaagaatatttaacctatgttaagagttgatcattggggtag 67497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 67316 - 67214
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  67316 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgaataatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 67217  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  67216 tgt 67214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 62422 - 62600
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  62422 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaaccaaaact 62521  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttta-agagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    | |||  |   ||||| | || || |  |  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  62522 tgtggattgtctccaaacttctaagcctg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttagggagtatttaacctatgttgt 62600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Original strand, 116873 - 117032
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   | ||| |||||||||| || |||||||||||||  |  ||||||    
T  116873 gagttatgaggaaaccattccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattctatataactatttctaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaa 116972  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
     | ||||||| ||||||| || ||||| || ||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  116973 acttcaaaaccagaagtattaggagtttaagtaagaggtttaagagtattaaacctatgt 117032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 175
Target Start/End: Original strand, 10905 - 11073
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  10905 tttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattcagaataactgtttctaagttaatccaaaacttatgga 11004  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11005 ataattcgaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 11073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 17318 - 17223
Alignment:
Q  42 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtacta 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  17318 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattttaaatctcaaaactagaagtacta 17223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 58326 - 58170
Alignment:
Q  23 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctca 122  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||    
T  58326 tgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataagcgtttctaagttaatccaaaacataaggaataattccaaacctca 58227  T
Q  123 aaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  58226 aaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctgtgttgt 58170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 165
Target Start/End: Original strand, 19945 - 20068
Alignment:
Q  42 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgag 141  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19945 aggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgag 20044  T
Q  142 ttcaattaaggtgtttaagagtat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20045 ttcaattaaggtgtttaagagtat 20068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 20276 - 20379
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20276 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 20375  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  20376 tgtg 20379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 64
Target Start/End: Original strand, 19731 - 19774
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19731 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 19774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 10381 - 10560
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  10381 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaacgtttctaagttaatccaaaact 10480  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  10481 tatagaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttatgagtatttaacctacgttgt 10560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7093 - 6935
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  7093 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 6994  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  6993 caaaactagaagtactaagagtttaattaaggggtttaagagtatttaacatgtgttgt 6935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2144 - 1986
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||  |||    
T  2144 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcatacct 2045  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  2044 caaaactagaagtattatgagttctattagggtatttaagggtatttaacctatgttgt 1986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5229 - 5139
Alignment:
Q  89 taatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5229 taatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 5139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 5489 - 5413
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaa 97  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  5489 tatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 5413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 30212 - 30034
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  30212 atgatttttgatttaggagttatgatgaaaatactacaaggagtacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 30113  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    || |  |||||||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  30112 taggaaataattccaaacctcaagactagaagtaataggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacttatgttgt 30034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 33 - 179
Target Start/End: Original strand, 9711 - 9856
Alignment:
Q  33 actccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaag 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  9711 actccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaag 9810  T
Q  133 tactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  9811 tactatgagttcaact-aggtgtttaagagtatttaacctatattgt 9856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21232 - 21074
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  21232 tatgatgaaaatactccaagtagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 21133  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||    
T  21132 caaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaatagtatttaacatgtgttgt 21074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20805 - 20769
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20805 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgt 20769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 170
Target Start/End: Original strand, 7065 - 7210
Alignment:
Q  25 atgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaa 124  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  7065 atgaaaatactccaagtagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaa 7164  T
Q  125 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7165 actagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 7210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 64521 - 64690
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  64521 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaact 64620  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    | ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  64621 tgtggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtagttaac 64690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 31502 - 31386
Alignment:
Q  49 agtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31502 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaatccttaaaactagaagttctatgagttcaatt 31403  T
Q  149 aaggtgtttaagagtat 165  Q
    |||||||||||||||||    
T  31402 aaggtgtttaagagtat 31386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31178 - 31075
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31178 tgttgttagttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttttgaattgct 31079  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  31078 tgtg 31075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 31723 - 31680
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31723 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 31680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 146
Target Start/End: Original strand, 106675 - 106800
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  106675 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 106774  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  106775 caaaactagaagtactatgagttcaa 106800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 11355 - 11259
Alignment:
Q  224 tgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataatt--atatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgt 319  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || || |||||| ||| ||  |||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  11355 tgttgttcagagagtctgaaat-aagaagattaatgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatttggattatatatgatgtttaagttgt 11259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 22455 - 22359
Alignment:
Q  224 tgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataatt--atatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgt 319  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || || |||||| ||| ||  |||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  22455 tgttgttcagagagtctgaaat-aagaagattaatgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatatggattatatatgatgtttaagttgt 22359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11225 - 11101
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  11225 tatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaagct 11126  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttca 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11125 caaaactagaagtactatgagttca 11101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 144
Target Start/End: Original strand, 23676 - 23799
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23676 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataagcgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccct 23775  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttc 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23776 caaaactagaagtactatgagttc 23799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0632
Description:

Target: scaffold0632; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 745 - 587
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| || ||||| | ||| || |||||||||| |||    
T  745 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaaggtagtccaatatttaaggaataattccaaacct 646  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  645 caaaactagaagtactatgagtccaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11743 - 11581
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  11743 gagttattatcaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaaattcagcacagccgtttctaagttaatccaaaacctagggaataattccaa 11644  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11643 acctcaaaactagaagtattaggagtttaattacggtgtttaagagtatttgacctatgttgt 11581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4000 - 3841
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||   |||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  4000 tatgatgaaaatactccatggagatcttagtgaaattttatgaaaatttagtttaacagtttctaagtcaatccaaaacttagggaataattccaaacct 3901  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  3900 caaaactggaagtactaggagtttaattaagggggttttagagtatttaacctatgttgt 3841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21200 - 21058
Alignment:
Q  42 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgag 141  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21200 aggtctcagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgag 21101  T
Q  142 ttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttagtt 184  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  21100 ttcaattaagggttttaagagcatttaacctatgttgtgagtt 21058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 785 - 627
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||    
T  785 tatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcaacataaccgtttctaagttaattcaaaacttaaggaataattccaaacct 686  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  685 caaaactataagtactatgagttcaactagggggtttaagagtatttaacctattttgt 627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 175
Target Start/End: Original strand, 5139 - 5293
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  5139 tatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacct 5238  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5239 caaaactagaagttctaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 5293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 1284 - 1130
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  1284 tatgatgaaaatactccaaggatatcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 1185  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  1184 caaaactagaagtactaggggttcaattaagatggttaagagtatttaacctatg 1130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21648 - 21490
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  21648 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaact 21549  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  21548 caaaactagaagtattaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacatgtgttgt 21490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21221 - 21118
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  21221 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcagtaatattgttatgttgtgaattgct 21122  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  21121 tgtg 21118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 1295 - 1133
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||  |   |||||    
T  1295 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaa 1196  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1195 acctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgttgt 1133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 186973 - 187135
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||  |   |||||    
T  186973 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaa 187072  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  187073 acctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgttgt 187135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 270 - 358
Target Start/End: Original strand, 166426 - 166514
Alignment:
Q  270 tgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgctt 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||    
T  166426 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaatatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgctt 166514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 17952 - 17836
Alignment:
Q  49 agtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17952 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtttatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactataagttctatgagttcaatt 17853  T
Q  149 aaggtgtttaagagtat 165  Q
    ||| |||||||||||||    
T  17852 aagatgtttaagagtat 17836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 258 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 17628 - 17559
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctt 327  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17628 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctt 17559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 18173 - 18118
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  18173 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 18118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 39631 - 39515
Alignment:
Q  49 agtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 148  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  39631 agtgaaatcttaagaaaattcaggataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaatttctatgagttcaatt 39532  T
Q  149 aaggtgtttaagagtat 165  Q
    |||||||||||||||||    
T  39531 aaggtgtttaagagtat 39515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 39307 - 39205
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  39307 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 39208  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  39207 tgt 39205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 21361 - 21289
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 73  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21361 atgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagca 21289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 39852 - 39797
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  39852 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaacttttatg-aatttcagcacaac 39797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 4697 - 4568
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  4697 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 4598  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactaga 130  Q
    || || |||||||||| |||||||||||||    
T  4597 tagggaataattccaaacctcaaaactaga 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 258 - 365
Target Start/End: Original strand, 1231 - 1338
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  1231 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatgcttttcattaatattgttaagttgtgaattgct 1330  T
Q  358 tgtgttgt 365  Q
    ||||||||    
T  1331 tgtgttgt 1338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 258 - 365
Target Start/End: Original strand, 7982 - 8089
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  7982 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatgcttttcattaatattgttaagttgtgaattgct 8081  T
Q  358 tgtgttgt 365  Q
    ||||||||    
T  8082 tgtgttgt 8089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26095 - 25938
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat-tccaaccc 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||| || ||||  | | ||| |     
T  26095 tatgatgaaaataccccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactgat-ggatcgtcttcaatct 25997  T
Q  120 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25996 tcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 25938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1766 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1766
Description:

Target: scaffold1766; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Original strand, 1166 - 1288
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  1166 tatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacct 1265  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagtt 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  1266 caaaactagaagtactaggagtt 1288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Original strand, 2779 - 2881
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2779 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 2878  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  2879 tgt 2881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18748 - 18587
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||  |   |||||    
T  18748 gagttatgatgaaaatactccaaggaagtcttagagaaatcttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaatccaaaacttatggattgtctccaa 18649  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     | ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18648 acttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgt 18587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 56576 - 56401
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || ||||||||    
T  56576 atgatttttggttttggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaact 56477  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    |||||  |   ||||| | ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  56476 tatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 56401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 66500 - 66660
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||||||| || |||||||||||||  |   |||||    
T  66500 gagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaa 66599  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  66600 gcttcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 66660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Original strand, 7007 - 7109
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  7007 tgttgttggttatgtgaaatatgtatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 7106  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  7107 tgt 7109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Original strand, 53904 - 54006
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  53904 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 54003  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  54004 tgt 54006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 907 - 804
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  907 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 808  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  807 tgtg 804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 257 - 360
Target Start/End: Original strand, 24662 - 24764
Alignment:
Q  257 atgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24662 atgttgatggttatgtgaaatatttatatgccttatctggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgc-tttcattaatattgttatgttctgaattgc 24760  T
Q  357 ttgt 360  Q
    ||||    
T  24761 ttgt 24764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Original strand, 3393 - 3495
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3393 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgaattatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 3492  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  3493 tgt 3495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 614 - 512
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  614 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattattatgttgtgaattgct 515  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  514 tgt 512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 169032 - 168859
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||||||| ||     
T  169032 tttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggagatcttagtgaaattttatgaaaatttagtataacagtttctaagtcaatccaaaacttaggga 168933  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  168932 ataattccaaacctctaaactggaagtactaggagtttaattaagggggttttagagtatttaacttatgttgt 168859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8403 - 8244
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||  |   |||||    
T  8403 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaa 8304  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
     | ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8303 acttcaaagcttg-tgtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 8244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 257 - 361
Target Start/End: Original strand, 207648 - 207752
Alignment:
Q  257 atgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||    
T  207648 atgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatcttgtgaattgc 207747  T
Q  357 ttgtg 361  Q
    |||||    
T  207748 ttgtg 207752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Original strand, 65439 - 65608
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || ||||||||||||      
T  65439 tttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaa 65538  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
     |   ||||| | ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  65539 ttgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 65608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 85600 - 85498
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  85600 tgttgttggttatgtgaaatgttcagatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 85501  T
Q  358 tgt 360  Q
    |||    
T  85500 tgt 85498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 263 - 360
Target Start/End: Original strand, 10155 - 10252
Alignment:
Q  263 ttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgt 360  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||    
T  10155 ttggttatgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaattttgttattttgtgaattgcttgt 10252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 257 - 338
Target Start/End: Original strand, 15479 - 15560
Alignment:
Q  257 atgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatat 338  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15479 atgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcgcattaatat 15560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 18122 - 18281
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||  |   |||||    
T  18122 gagttatgatgaaaatactccaagcaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaa 18221  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
     | ||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18222 acttcaaagcttg-tgtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 62318 - 62143
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||||| || || ||||||||    
T  62318 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactacttctaggtcaacccaaaact 62219  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    |||||  |   ||||| | ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  62218 tatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 62143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 10300 - 10133
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| || ||          |||||| |||||||||||    
T  10300 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaatt-ttatgaaaagtccgc----------ctaagtcaatccaaaact 10212  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  10211 tatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttgagagtatttaacctatgttgt 10133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 321
Target Start/End: Original strand, 14479 - 14621
Alignment:
Q  181 agttggtccttggggtagaaacaa-agttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatga-ttaatgttgttggttatgtgaaata 278  Q
    |||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||    
T  14479 agttggtccttggggtaggaatgagagttgtttata-ttattaatgttgttcagagagtctg-gattaagatgatttaaagttgttggtaatgtgatata 14576  T
Q  279 at--tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 321  Q
    ||  ||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||| |||||    
T  14577 attatatatgcattatgtggaatatgtattatgttgaagctgttg 14621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 36233 - 36336
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  36233 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 36332  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  36333 tgtg 36336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 189524 - 189627
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  189524 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 189623  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  189624 tgtg 189627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 65675 - 65773
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  65675 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 65773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 61759 - 61857
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  61759 tgttgttgaatatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 61857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 80674 - 80571
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||  |||||| |    
T  80674 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgat 80575  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  80574 tgtg 80571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 11829 - 11754
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  11829 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 11754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 58866 - 58964
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  58866 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 58964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 134740 - 134675
Alignment:
Q  11 gtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  134740 gtttaggagttatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 134675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 137209 - 137144
Alignment:
Q  11 gtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  137209 gtttaggagttatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 137144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 139678 - 139613
Alignment:
Q  11 gtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  139678 gtttaggagttatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 139613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 142147 - 142082
Alignment:
Q  11 gtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  142147 gtttaggagttatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 142082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 144616 - 144551
Alignment:
Q  11 gtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  144616 gtttaggagttatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 144551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12379 - 12283
Alignment:
Q  260 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  12379 ttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 179
Target Start/End: Original strand, 3059 - 3151
Alignment:
Q  87 gttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3059 gttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 3151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 2505 - 2577
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 73  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2505 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagca 2577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 34843 - 34687
Alignment:
Q  18 agttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| |||||||    || |||||||||||||  |   |||||     
T  34843 agttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaataccgcataactatttcta----aacccaaaacttatggattttctccaaa 34748  T
Q  118 cctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    | ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34747 cttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 34687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 181 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 55274 - 55136
Alignment:
Q  181 agttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataat 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| |    
T  55274 agttggtccttggggtagaaacgaagttatttataat-attaatgttgttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttagtgatgtgttatagt 55176  T
Q  281 ta--tatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttg 318  Q
    ||  ||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  55175 tatttatgcattatgtgaaatatgtatgatgttgaagttg 55136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Original strand, 11686 - 11844
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||  |  ||||||    
T  11686 gagttatgatggaaatactccaaggcggtcttggtaaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaa 11785  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  11786 acctcaaaactagaagtactaggagtttaattaa-gaggttaagagtatttaacctatgt 11844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 261 - 356
Target Start/End: Original strand, 5251 - 5346
Alignment:
Q  261 tgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  5251 tgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 5346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 14234 - 14337
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  14234 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatatatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 14333  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  14334 tgtg 14337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Original strand, 13244 - 13402
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 116  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||  |  | ||||    
T  13244 gagttatgatgaaaacactcgaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgttcccaa 13343  T
Q  117 ccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
     | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  13344 acttcaaaactataagtattacgagtttaattaagaggtttaagagtatttaacatatg 13402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Original strand, 6968 - 7053
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgtta 343  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6968 tgttgttggttatgtgaaatttttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatactgtta 7053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1551 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1551
Description:

Target: scaffold1551; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 181 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 95 - 3
Alignment:
Q  181 agttggtccttggggtagaaacaaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtga 274  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  95 agttggtccttggggtagaaacgaagttgtttataat-attaatgttgttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttagtaatgtga 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 347
Target Start/End: Original strand, 4022 - 4111
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgtt 347  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4022 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttaatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 4111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 18584 - 18756
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||     
T  18584 tttggtttttgatttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcggcataactatttctaagtcaaaccaaaacttatgga 18683  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttt-aagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
     |   ||||| | || ||| |    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18684 ttgtctccaaacttc-aaagtctgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaaagagtatttaacctatgttgt 18756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 285 - 110
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||| || || | ||||||    
T  285 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactgtaaggagatcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaggtcaacctaaaact 186  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    |||||  |   ||||| | ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  185 tatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 7313 - 7483
Alignment:
Q  7 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatggg 106  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || || |||||||| ||    
T  7313 tttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaagtttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttat-gg 7411  T
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||  |  ||| | ||||| || |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  7412 attgtctcaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctaagttgt 7483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 14487 - 14412
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  14487 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 14412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Original strand, 822 - 977
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||| || ||| ||||| | ||||| || || | |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| | ||| |||||| |||    
T  822 tatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatacaaaacttatagaatatttccaaacct 921  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
    | ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  922 cgaaactagaagtactaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 88
Target Start/End: Original strand, 1106 - 1173
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagt 88  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1106 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagt 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 169
Target Start/End: Original strand, 1372 - 1435
Alignment:
Q  106 gataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 169  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1372 gataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 1435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 354 - 251
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||||    
T  354 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 255  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  254 tgtg 251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 258 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7889 - 7783
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||  |||||| |    
T  7889 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgaag-ttaagtggttgatgcttctcattaatattgacatgttgtgaattgtt 7791  T
Q  358 tgtgttgt 365  Q
    ||||||||    
T  7790 tgtgttgt 7783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 11648 - 11751
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||||    
T  11648 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 11747  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  11748 tgtg 11751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 409 - 311
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  409 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaagatgtttgatgtttaagttattgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 2488 - 2403
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaa 86  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  2488 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactacaaagaggtcttagtgaagttttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 176
Target Start/End: Original strand, 11694 - 11833
Alignment:
Q  36 ccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtac 135  Q
    ||||| ||||||| || || | ||||| |||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11694 ccaagcaggtcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagtac 11793  T
Q  136 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
    || ||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  11794 taggagtttaattaagaggtttaagagt-tttaacctatgt 11833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 32807 - 32910
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||||    
T  32807 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaaattgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 32906  T
Q  358 tgtg 361  Q
    ||||    
T  32907 tgtg 32910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 170
Target Start/End: Original strand, 2377 - 2455
Alignment:
Q  92 tccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2377 tccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 2455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 82 - 1
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaactta 102  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  82 tatgatggaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaactta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 179
Target Start/End: Original strand, 35986 - 36146
Alignment:
Q  18 agttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaac 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| |||||||||| ||  |||||||||||   |   |||||     
T  35986 agttatgatgaaaatactcaaaggatgtcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttctaagtcaactcaaaacttatgtattgtctccaaa 36085  T
Q  118 cctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    | ||||| || |  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36086 cttcaaagcttg-tgtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 36146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 181 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 1301 - 1160
Alignment:
Q  181 agttggtccttggggtagaaac-aaagttgcttataattattaatgttcttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataa 279  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||| | | ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  1301 agttggtccttggggtaggaatgaaagttgttcaaaat-attattgttgttcagagagtctgaa-ttaagatgattaatgttgttggtaatgtgaaatag 1204  T
Q  280 t--tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 321  Q
    |  ||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1203 ttatatatgcattaattggaaaatgtatgatgttgaagttgttg 1160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 8072 - 8176
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||| ||| || ||||||||    
T  8072 atgatatttggtttttgagttatgaagaaaataccacaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttcttagtcaacccaaaact 8171  T
Q  101 tatgg 105  Q
    |||||    
T  8172 tatgg 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 11799 - 11974
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaact 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||| ||||||| || || | ||||||    
T  11799 atgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaagggggtcttagtgaaattttatgaaaatttcacataactatttctaggtcaaccgaaaact 11898  T
Q  101 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    |||||  |   ||||| | ||||| || |  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11899 tatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 11974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 176
Target Start/End: Original strand, 2267 - 2406
Alignment:
Q  36 ccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtac 135  Q
    ||||| ||||||| || || | ||||| |||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  2267 ccaagtaggtcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagaac 2366  T
Q  136 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
    || ||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  2367 taggagtttaattaagaggtttaagagt-tttaacctatgt 2406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 176
Target Start/End: Original strand, 10522 - 10661
Alignment:
Q  36 ccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtac 135  Q
    ||||| ||||||| || || | ||||| |||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  10522 ccaagtaggtcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagaac 10621  T
Q  136 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
    || ||||| |||||||  |||| ||||| |||||| |||||    
T  10622 taggagtttaattaagaggtttgagagt-tttaacctatgt 10661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15625 - 15537
Alignment:
Q  270 tgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgctt 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||    
T  15625 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgatgtgaattgctt 15537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8086 - 7931
Alignment:
Q  21 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccct 120  Q
    ||||||| || ||| ||||| | ||||| || || | |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||  ||  |||||| |||    
T  8086 tatgatggaattaccccaagaaagtcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacatatgaaatgtttccaaacct 7987  T
Q  121 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgt 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||| |||||||| |||||    
T  7986 caaaactagaagtactaggagtttaattaagaggtttgagaatatttaacctatgt 7931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 272 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 7711 - 7625
Alignment:
Q  272 tgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgctt 358  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||    
T  7711 tgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgctt 7625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 291 - 360
Target Start/End: Original strand, 6851 - 6920
Alignment:
Q  291 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgt 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  6851 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgatgtgaattgcttgt 6920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 306
Target Start/End: Original strand, 4335 - 4383
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  4335 tgttgttggttatgtgaaatatttatatacgttatgtggaaaatgtatg 4383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 9778 - 9706
Alignment:
Q  4 atatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  9778 atatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 9706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 116 - 41
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  116 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 41  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 21288 - 21213
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  21288 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 21213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 2422 - 2359
Alignment:
Q  119 ctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgttag 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2422 ctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgttag 2359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 270 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 57011 - 56936
Alignment:
Q  270 tgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatg 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  57011 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtcgatgcttatcattgatattgttatg 56936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 1036 - 880
Alignment:
Q  18 agttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||  |||  ||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||  |  ||||||     
T  1036 agttatgatgaaaatactccaagtgggtcttaggaaaactttacaaaaattcagcataaccatttcttagtcaacccaaagcttatggtttgtttccaaa 937  T
Q  118 cctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatg 175  Q
    |  |||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  936 ctccaaaact-tatgtactttgagttcaattaaggtgtttaagggtatttaacctatg 880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 7829 - 7911
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttc 83  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||||    
T  7829 atgatttttggtttgagagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttc 7911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 179
Target Start/End: Original strand, 7929 - 7976
Alignment:
Q  132 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  7929 gtactatgagtttaattaaggtgcttaagagtatttaacctctgttgt 7976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 836 - 767
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattca 70  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  836 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgacattttatgaaaattca 767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 300 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 6932 - 6871
Alignment:
Q  300 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttcagaattgcttgtg 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6932 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtg 6871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 32786 - 32675
Alignment:
Q  58 ttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttt 157  Q
    ||||||||||| |||| || | ||||||| | |||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||     
T  32786 ttatgaaaatt-agcataatcgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagaagttg 32688  T
Q  158 aagagtatttaac 170  Q
     ||||||||||||    
T  32687 gagagtatttaac 32675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 270 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9051 - 8974
Alignment:
Q  270 tgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgtt 347  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||  || ||| ||||| |||||||||||||    
T  9051 tgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtgaattcttatcattgatattgttatgtt 8974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 177
Target Start/End: Original strand, 24586 - 24631
Alignment:
Q  132 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24586 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 24631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 320
Target Start/End: Original strand, 24826 - 24904
Alignment:
Q  244 attaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattat--atgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24826 attaagatgattaatgttgttagtgatgtgatatagttatttatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtt 24904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Original strand, 24531 - 24579
Alignment:
Q  17 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 65  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  24531 gagttatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaa 24579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 6486 - 6411
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| | ||||| || |||||||||||    
T  6486 atgatttttggtttaggagttatgatgcaaatactcaaaggaggtcttaatgaatttttatg-aatttcagcacaac 6411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 320
Target Start/End: Original strand, 46775 - 46853
Alignment:
Q  244 attaagatgattaatgttgttggttatgtgaaataattat--atgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  46775 attaagatgattaatgttgttagtgatgtgatatagttatttatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtt 46853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 16440 - 16493
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaa 54  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16440 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaa 16493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 179
Target Start/End: Original strand, 16528 - 16600
Alignment:
Q  107 ataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||  ||||| | |||||||| ||||||||    
T  16528 ataattcaaaacctcaaaactataagtactaggaatttaattaagggttttaaaaatatttaacctatgttgt 16600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 3563 - 3488
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaac 77  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  3563 atgatatttggtttttgagatatgacgaaaataatccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttcagcacaac 3488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 8558 - 8495
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 64  Q
    ||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8558 atgatattttgtttttgagatatgatgaaaataatccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 8495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 179
Target Start/End: Original strand, 1 - 51
Alignment:
Q  129 gaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacgtatgttgt 179  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1 gaagtgctatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 51  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 105
Target Start/End: Original strand, 40902 - 40969
Alignment:
Q  38 aaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 105  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||  | || |||||||||||||    
T  40902 aaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctatatcaaaccaaaacttatgg 40969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 9640 - 9601
Alignment:
Q  1 atgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaag 40  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9640 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaag 9601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 308
Target Start/End: Original strand, 36096 - 36146
Alignment:
Q  258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  36096 tgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgat 36146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University