View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10238_low_2 (Length: 372)

Name: NF10238_low_2
Description: NF10238
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10238_low_2
NF10238_low_2
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (15-364)||(19038199-19038548)
chr5 (15-364)||(28238769-28239118)
chr5 (15-366)||(28879268-28879619)
chr5 (17-364)||(30707719-30708066)
chr5 (15-364)||(8577575-8577924)
chr5 (65-364)||(8739-9038)
chr5 (15-361)||(7760012-7760351)
chr5 (15-361)||(38407887-38408226)
chr5 (15-361)||(5199442-5199781)
chr5 (15-361)||(511646-511985)
chr5 (15-361)||(42538468-42538814)
chr5 (23-337)||(8699470-8699784)
chr5 (15-361)||(38970716-38971062)
chr5 (15-361)||(42937692-42938019)
chr5 (15-337)||(15939344-15939666)
chr5 (15-85)||(40623041-40623111)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (15-364)||(17423138-17423487)
chr2 (15-364)||(30493997-30494346)
chr2 (15-364)||(15833928-15834277)
chr2 (15-364)||(43981193-43981542)
chr2 (15-364)||(5354643-5354992)
chr2 (15-364)||(43536740-43537089)
chr2 (15-364)||(28471200-28471549)
chr2 (15-364)||(45431177-45431526)
chr2 (15-364)||(39950166-39950515)
chr2 (15-361)||(29398641-29398987)
chr2 (27-364)||(7189485-7189822)
chr2 (15-361)||(10825954-10826293)
chr2 (203-364)||(22680191-22680351)
chr2 (19-361)||(36653536-36653878)
chr2 (15-344)||(7416474-7416803)
chr2 (111-361)||(40538214-40538464)
chr2 (15-118)||(20067493-20067596)
chr2 (287-361)||(45292545-45292619)
chr2 (38-73)||(22529914-22529949)
chr2 (15-85)||(40538476-40538546)
[»] chr3 (32 HSPs)
chr3 (15-364)||(46401377-46401726)
chr3 (15-364)||(42901192-42901541)
chr3 (15-364)||(46698347-46698696)
chr3 (15-364)||(49141550-49141899)
chr3 (15-364)||(50477809-50478158)
chr3 (15-364)||(54388797-54389146)
chr3 (15-364)||(34048097-34048446)
chr3 (15-364)||(2272088-2272437)
chr3 (15-364)||(36130157-36130506)
chr3 (15-364)||(4005443-4005791)
chr3 (15-361)||(47071219-47071558)
chr3 (15-361)||(599550-599888)
chr3 (15-326)||(17562375-17562686)
chr3 (15-281)||(9473034-9473300)
chr3 (15-361)||(20353216-20353562)
chr3 (15-361)||(41614944-41615282)
chr3 (15-361)||(49266401-49266747)
chr3 (15-361)||(16646183-16646516)
chr3 (15-361)||(44232393-44232732)
chr3 (15-361)||(48565551-48565890)
chr3 (15-361)||(42759337-42759676)
chr3 (15-340)||(48891213-48891538)
chr3 (108-340)||(50758795-50759027)
chr3 (238-364)||(52388827-52388953)
chr3 (15-205)||(52388630-52388820)
chr3 (15-127)||(2648608-2648720)
chr3 (15-340)||(42804993-42805318)
chr3 (236-361)||(51807851-51807976)
chr3 (15-251)||(50214199-50214428)
chr3 (15-361)||(30253126-30253472)
chr3 (292-364)||(3495550-3495622)
chr3 (15-178)||(6927989-6928146)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (15-360)||(27638424-27638769)
chr6 (15-364)||(6203821-6204170)
chr6 (15-364)||(11690788-11691137)
chr6 (15-364)||(30826654-30827003)
chr6 (15-364)||(22303902-22304251)
chr6 (15-364)||(31770746-31771088)
chr6 (93-364)||(26440113-26440384)
chr6 (17-352)||(26172594-26172936)
chr6 (15-361)||(2406918-2407257)
chr6 (15-340)||(24085850-24086177)
chr6 (15-361)||(32642567-32642912)
chr6 (15-178)||(2406059-2406222)
chr6 (15-340)||(18005475-18005800)
chr6 (15-361)||(3384104-3384449)
chr6 (42-138)||(21603282-21603378)
chr6 (15-73)||(32641897-32641955)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (15-364)||(1055198-1055547)
chr8 (15-364)||(23019323-23019672)
chr8 (15-364)||(26662119-26662468)
chr8 (15-364)||(15033801-15034150)
chr8 (15-364)||(22532-22881)
chr8 (15-364)||(42482542-42482891)
chr8 (15-364)||(486769-487118)
chr8 (15-361)||(34367646-34367992)
chr8 (15-361)||(39603963-39604308)
chr8 (15-364)||(43214075-43214405)
chr8 (15-352)||(34819646-34819983)
chr8 (15-361)||(41243120-41243447)
chr8 (15-361)||(20858688-20859034)
chr8 (15-361)||(39831787-39832125)
chr8 (15-361)||(5301343-5301689)
chr8 (15-361)||(21176349-21176695)
chr8 (15-337)||(45132438-45132760)
chr8 (15-361)||(35554270-35554609)
chr8 (15-337)||(40075736-40076051)
chr8 (15-337)||(5679558-5679882)
chr8 (15-340)||(51778-52103)
chr8 (17-178)||(30761310-30761485)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (15-364)||(41883212-41883561)
chr7 (15-364)||(48406030-48406379)
chr7 (15-364)||(9368438-9368787)
chr7 (15-364)||(17460298-17460647)
chr7 (15-364)||(17592567-17592916)
chr7 (15-364)||(35607427-35607776)
chr7 (15-363)||(42504970-42505318)
chr7 (15-364)||(15071319-15071655)
chr7 (15-364)||(17837632-17837974)
chr7 (15-364)||(10521503-10521851)
chr7 (15-361)||(5538587-5538933)
chr7 (15-364)||(13322706-13323055)
chr7 (15-361)||(16680134-16680480)
chr7 (15-361)||(17654370-17654716)
chr7 (15-361)||(27450723-27451069)
chr7 (15-320)||(34741444-34741742)
chr7 (145-361)||(11630427-11630643)
chr7 (15-337)||(47670239-47670561)
chr7 (157-361)||(11632680-11632884)
chr7 (15-294)||(37342992-37343271)
chr7 (15-174)||(47522013-47522172)
chr7 (108-340)||(9491989-9492221)
chr7 (15-85)||(11630317-11630387)
chr7 (223-340)||(36980256-36980373)
chr7 (238-361)||(17747944-17748067)
chr7 (15-127)||(16488281-16488394)
chr7 (108-178)||(41734630-41734700)
chr7 (15-51)||(41734713-41734749)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (15-364)||(6178840-6179189)
chr4 (15-364)||(41796075-41796424)
chr4 (15-364)||(49168183-49168532)
chr4 (15-364)||(31424412-31424761)
chr4 (15-364)||(1306170-1306521)
chr4 (15-364)||(49093093-49093443)
chr4 (15-364)||(21018628-21018977)
chr4 (15-364)||(40355453-40355802)
chr4 (93-364)||(30723877-30724148)
chr4 (15-361)||(44677020-44677366)
chr4 (15-361)||(50277829-50278175)
chr4 (15-361)||(37016633-37016967)
chr4 (15-352)||(8109835-8110172)
chr4 (15-337)||(10730030-10730352)
chr4 (15-337)||(10943799-10944121)
chr4 (67-361)||(51685810-51686104)
chr4 (15-352)||(50904047-50904377)
chr4 (15-349)||(71624-71958)
chr4 (15-358)||(50020734-50021065)
chr4 (15-340)||(13624569-13624894)
chr4 (219-361)||(50196076-50196218)
chr4 (27-361)||(14317284-14317618)
chr4 (111-337)||(41931108-41931334)
chr4 (150-361)||(46438743-46438954)
chr4 (15-283)||(30706657-30706925)
chr4 (15-85)||(30723777-30723847)
chr4 (15-138)||(50196224-50196351)
chr4 (15-122)||(55278820-55278927)
chr4 (18-100)||(46438956-46439038)
chr4 (212-360)||(21535449-21535597)
chr4 (24-115)||(12891833-12891924)
chr4 (243-361)||(12891586-12891703)
chr4 (42-138)||(40886693-40886789)
chr4 (223-361)||(40886874-40887012)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (15-364)||(3729379-3729729)
chr1 (15-364)||(13637036-13637385)
chr1 (15-364)||(26878388-26878730)
chr1 (15-364)||(19158692-19159041)
chr1 (15-364)||(95132-95474)
chr1 (15-364)||(31780697-31781039)
chr1 (15-364)||(22526674-22527016)
chr1 (17-361)||(19522316-19522653)
chr1 (15-333)||(52804570-52804888)
chr1 (26-361)||(47505016-47505350)
chr1 (15-361)||(11196537-11196883)
chr1 (15-361)||(47660547-47660893)
chr1 (15-361)||(45828251-45828596)
chr1 (243-361)||(50341407-50341525)
chr1 (15-340)||(49855053-49855377)
chr1 (15-138)||(50617929-50618052)
chr1 (252-361)||(21143654-21143763)
chr1 (15-202)||(21143770-21143950)
chr1 (15-295)||(38120195-38120475)
chr1 (238-340)||(35256520-35256622)
chr1 (270-361)||(23273541-23273632)
chr1 (15-172)||(16269827-16269984)
chr1 (34-113)||(23273427-23273506)
chr1 (15-55)||(35256442-35256482)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (15-361)||(12025-12371)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (35-138)||(56476-56579)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (32-100)||(22343-22411)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 19038199 - 19038548
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038199 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 19038298  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038299 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 19038398  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038399 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 19038498  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038499 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 19038548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 28238769 - 28239118
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28238769 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccccaggacatagccatccgccacccgccatg 28238868  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28238869 tatcctctcctgcctgctcacctcgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 28238968  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28238969 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgggcgccgcacataatccat 28239068  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28239069 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 28239118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 28879619 - 28879268
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28879619 tcatttgcaggcctcggaagatctcctgaaagaggtggaaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 28879520  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28879519 tatcctctcctgcctgctcatcccgatcgtccgccttaatcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacacctgcacaatggaagacggtgggaggtccctaac 28879420  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  28879419 atcaatcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacatgatccag 28879320  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctcct 366  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28879319 cctgaataccagaaaatctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctcct 28879268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 17 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 30708066 - 30707719
Alignment:
Q  17 atttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||     
T  30708066 atttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccacccgccatgta 30707967  T
Q  117 tcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  30707966 tcctctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaatcgtgtgagtgcggaagtcaacgaacacctgcataatggaagacggtgggaggtccctaacag 30707867  T
Q  217 cagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatcc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  30707866 cagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccacacataatccaccc 30707767  T
Q  317 agaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30707766 ataataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 30707719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 8577575 - 8577924
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||    
T  8577575 tcatttgcaggcctcagaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatctgccgtccgccatg 8577674  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||   |||||  ||   |||    
T  8577675 tctcctctcctgcctgctgaccccgatcgtccgccttaatcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaagggaatgggatctctacaac 8577774  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  8577775 atccgtgggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccac 8577874  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8577875 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 8577924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 65 - 364
Target Start/End: Original strand, 8739 - 9038
Alignment:
Q  65 gtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtg 164  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  8739 gtgagacaccctagtgtaccataggacatagtcatccgtcatccgtcatgtctcctctcctgcctgctcaccccgatcgtctgccttaagcgtgtgagtg 8838  T
Q  165 ccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaa 264  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8839 cggaagtcgacgaacacctgcacaatgggaggcggcgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatctgtactgcctcaaaa 8938  T
Q  265 ccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8939 ccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccagccaaaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 9038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 7760351 - 7760012
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||       |||    
T  7760351 tcatttgcaggcctcagaagatctcctggaagaggtgacaagatttgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgcc-------atg 7760259  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| || ||||||| |||||   |||    
T  7760258 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaagcggtggcaggtctacaac 7760159  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7760158 atccgttagatgtctggggatggtctggacgtattcgcactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccat 7760059  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    | |||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||    
T  7760058 caagaataccagaaaacctgttcaaagtcttggatctccctgtgctc 7760012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 38407887 - 38408226
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||       |||    
T  38407887 tcatttgctggcctaggaagatctcctggaagaggtggcaagatctaagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgcc-------atg 38407979  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| || ||   |||    
T  38407980 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtgaggcggtggcagctctacaac 38408079  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||  ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  38408080 atccgttagatgtatggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccag 38408179  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  38408180 ccagaataccagaaaacctcctcaaaatcatggatctccctgtgctc 38408226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5199781 - 5199442
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||       |||    
T  5199781 tcatttgctggcctcggaagatctcctagaagagatggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatccgcc-------atg 5199689  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| |||||||||||||||||| |   || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   || ||||||   ||||||||  || ||   |||    
T  5199688 tctgctctcctgcctgctcacctcaatcggccgccttaaacgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctacacaatttgaggcggtgacagctctacaac 5199589  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||     
T  5199588 atccgtcggatgtctagggaccctctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacatcgcacataattcag 5199489  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  5199488 cctgaataccagaaaacctcttcaaaatcctggatctccctgtgctc 5199442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 511646 - 511985
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||| |||       |||    
T  511646 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccatctgcc-------atg 511738  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | | ||||  ||||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||   ||| |||||   ||||||||| || ||   |||    
T  511739 tattctcttgtgcctgctcaccccaatcggccgccttaaacgtgtgagtgcggaagtcgatgaatgcctgtacaatctgaggcggtggcagctctacaac 511838  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| |||| |||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  511839 atccgtcgaatgtctagggacgctctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccag 511938  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    |  |||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  511939 catgaataccagaaaacctcctcaaaatcctagatctccctgtgctc 511985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 42538814 - 42538468
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||| |  |||||||||||| ||  |   |||     
T  42538814 tcatttgctggtctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgaaacactttagtgtaccataacacatagccatccaccatctatcata 42538715  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||   ||  |||  ||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||   ||| ||||| || ||   |||    
T  42538714 tctgctcttgtgcctgctcaccccaatcggtcgctgtaagcgtgtgagtgcggaagtcgacaaatgcctgcacaatctgaggtggtggcagctctacaac 42538615  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||||||||||| |||| | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||     
T  42538614 atccgtcggatgtctagggacgctctggacatattcgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctatgaacaccgcacataatccag 42538515  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||    
T  42538514 cctgaataccagaaaacctcctcaaaatcctggatctccatgtgctc 42538468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 337
Target Start/End: Original strand, 8699470 - 8699784
Alignment:
Q  23 aggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctct 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    | ||||||  | |||||| |||| | |   |||||||||| ||||    
T  8699470 aggcctcggaatatctcctggaagaagtggcaaaatctgagggtgagacacaacggtgtaccatcgtacataggcatctgtcaaacgccatgtctgctct 8699569  T
Q  123 cctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcg 222  Q
    ||||| ||||||||||   || || ||| |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   || ||| |  || ||   |||||| | ||    
T  8699570 cctgcatgctcaccccaatcggcctcctcaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctcagccggcgacagctctacaacatccgacg 8699669  T
Q  223 gatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaata 322  Q
    ||||||| |||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||    
T  8699670 gatgtctaggggcggtctagacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgatcaccgcacataatccagcctgaata 8699769  T
Q  323 ccagaaaacctcctc 337  Q
    |||||| ||||||||    
T  8699770 ccagaatacctcctc 8699784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 38971062 - 38970716
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||  |   |||||||    
T  38971062 tcatttgctggcctaggaagatctcctggaagaggtggaaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccacaacacatagccctccctcatacgccatg 38970963  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||   ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||  |||||||||  || ||   |||    
T  38970962 tctgctctgctgtctgctcaccccaatcggtcgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcttgcacaatctaaggcggtgtcagctctacaac 38970863  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||  ||| ||||||  |||||  |||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || | || | ||| ||||||||     
T  38970862 attcgtcagatgtccagggatcttctgtacgtatctgtactgcctcaacaccctctcaggcaagtgacggtacaccttatgaacactgcaaataatccag 38970763  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || |||||||| || | |||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  38970762 cctgaataccataatatctcctcaaaaccctggatctccctgtgctc 38970716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 42937692 - 42938019
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtacc-acaggacatagccatccgccgcccgccat 113  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||       ||    
T  42937692 tcatttgctagcctgggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtacccatagcacatagccatccgcc-------at 42937784  T
Q  114 gtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaa 213  Q
    ||||            |||||||||   ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||   ||||||||| || ||   ||    
T  42937785 gtct------------gctcaccccaatcggtcgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatatgaggcggtggaagctctacaa 42937872  T
Q  214 catcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatcca 313  Q
    |||| ||| |||| || ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| || |||||||| |||||    
T  42937873 catccgtcagatgcctagggacagtctggacgtatctgtactgcctcaaaaccccctcgggcaagtgac-gaacaccctacgaacaccgcacatgatcca 42937971  T
Q  314 tccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
     || ||| |||||||||||||||  || || |||||||| ||||||||    
T  42937972 gcctgaaaaccagaaaacctcctaaaaatcttggatctccctgtgctc 42938019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15939666 - 15939344
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | ||| |||||| |  |||||||| |||  |   |||| ||    
T  15939666 tcatttgctggcctcgaaagatatcctggaagaggtggcaaaatctaagggtgagacaacttagtgtaccataacacatagccctccctcatacgccttg 15939567  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||   ||  | |||||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||   ||||||||| || ||   |||    
T  15939566 tctgctctactgcctgctcatcccaatcggtctccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacaaaagcctgcacaatatgaggcggtggcagctcaacaac 15939467  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    |||| |||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| | |||  |||| |||||| ||||| || || |||||||| |||    
T  15939466 atcaatcggatgtctagggaccgtctggacatatccgtactgcctcaaaatcctcttgagcagatgacagtacactctacgaacaccacacataattcat 15939367  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctc 337  Q
    || |||||| |||||| ||||||    
T  15939366 cctgaatactagaaaagctcctc 15939344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Original strand, 40623041 - 40623111
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtacca 85  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| |||| ||| ||||||    
T  40623041 tcatttgctggcctcggaagatctcttggaagaggtggcaaaatctgaggatgaggcaccttagtgtacca 40623111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17423487 - 17423138
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423487 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 17423388  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423387 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 17423288  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423287 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 17423188  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423187 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 17423138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 30493997 - 30494346
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30493997 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 30494096  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30494097 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 30494196  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30494197 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 30494296  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30494297 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 30494346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15834277 - 15833928
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15834277 tcatttgcaggcctcagaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 15834178  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15834177 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 15834078  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15834077 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcggacaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 15833978  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15833977 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 15833928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 43981542 - 43981193
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43981542 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgcctcccgccatg 43981443  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43981442 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgatgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 43981343  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43981342 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 43981243  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43981242 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 43981193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 5354992 - 5354643
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5354992 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 5354893  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5354892 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgatgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 5354793  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5354792 atcagtcggatgtctggggatggtctacacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 5354693  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5354692 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctatgctcctc 5354643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 43536740 - 43537089
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43536740 tcatttgcaggcctcggaagatctactggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatctgccacccgccatg 43536839  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43536840 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 43536939  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43536940 atcagtcagatgtctggggatagtctgcatgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 43537039  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43537040 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 43537089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 28471549 - 28471200
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28471549 tcatttgcaggtctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccgcccgccatg 28471450  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28471449 tatcctctcctacctgctcaccccgatcgtccgccttaatcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacacctgcacaatggaagacggtgggagatccctaac 28471350  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  28471349 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatctgtactacctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccac 28471250  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28471249 ccagaataccaaaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 28471200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 45431526 - 45431177
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  45431526 tcatttgcaggcctcggaagatctcctagaaaaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccacccgccatg 45431427  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45431426 tatcctttcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaatcgtgtgagtgcggaagttgacgaacacctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 45431327  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  45431326 atcagtaggatgtctggggatggtctgcacgtatccatactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccacacataatccag 45431227  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45431226 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 45431177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 39950515 - 39950166
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  39950515 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgccatccgccatg 39950416  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||   |||    
T  39950415 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgtacaatgtaaggcggtgggaggtctgcaac 39950316  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  39950315 atcagtcggatgtctgcggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacagacaccgcacataatccag 39950216  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  39950215 ccagaataccagaaaacctcctcaaagtcctggatctccctgtgctcctc 39950166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 29398641 - 29398987
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||  ||||||||    
T  29398641 tcatttgcaggcctaggaagatttcctggaagagatgacaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagtcatccgccatccgccatg 29398740  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| | |||   |||    
T  29398741 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtggcaagtctacaac 29398840  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  29398841 atccgtcggatgtctggggatggtcaggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtaacggtacaccctacgaacaccgcacataatccag 29398940  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29398941 ccagaataccagaaaacctcctcaaagtcctggatctccctgtgctc 29398987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 27 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 7189822 - 7189485
Alignment:
Q  27 ctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctg 126  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||    
T  7189822 ctcggaagatctcctgaaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcatatagccatccgtcatcagccatgtctgctctcctg 7189723  T
Q  127 cctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatg 226  Q
    ||||||||||||   || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||    
T  7189722 cctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtacggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcagtgggaggtctacaacatcagtcggatg 7189623  T
Q  227 tctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccag 326  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  7189622 tctggggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccagtcagaataccag 7189523  T
Q  327 aaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  7189522 aaaacctcttcaaagtcctggatctccatgtgctcctc 7189485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 10825954 - 10826293
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||       ||||    
T  10825954 tcatttgcaggcctcggaatatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgc-------catg 10826046  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| || | |||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||   |||    
T  10826047 tctgctattctgcctgctcaccccaatcgtccgccttaagcatgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtggcaggtctacaac 10826146  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  10826147 atccgtcggatgtctgcggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccag 10826246  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  10826247 ccagaataccagaaaacctcatcaaagtcttggatctccctgtgctc 10826293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 203 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22680351 - 22680191
Alignment:
Q  203 gaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccg 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22680351 gaggtccctaacatcagtcggatgtctggg-atggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccg 22680253  T
Q  303 cacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22680252 cacataatccaaccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 22680191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 361
Target Start/End: Original strand, 36653536 - 36653878
Alignment:
Q  19 ttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctc 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||| |  ||||||||||||| |  || ||||||||     
T  36653536 ttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggcgagacacccgagtataccataacacatagccatccgtcatccaccatgtctg 36653635  T
Q  119 ctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatca 218  Q
    |||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || |||||    ||||||||  || ||   ||||||     
T  36653636 ctctcctgtctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgccttcacaaactgaggcggtgacagctctacaacatcg 36653735  T
Q  219 gtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccag 318  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| || |    
T  36653736 gtcggatgtctggggacggtctggacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcggacaagtgacggtacaccctatgaacaccgcacataatccaacctg 36653835  T
Q  319 aataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    ||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  36653836 aataccaaaaaacctcctcaaaatcatggatctccctgtgctc 36653878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 7416803 - 7416474
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| |  | ||||||||  | ||||||||||| |||    ||||||    
T  7416803 tcatttggaggcctcggaatatctcctggaagaagtggcaaaatctgagagtgagacgcaatggcgtaccatcgtacatagccatctgccatatgccatg 7416704  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||||||||||||| |||||||| |   || | ||||||||||||||||||| |||||||| |||  | ||||||||   || |||||  || ||   |||    
T  7416703 tctcctctcctgcatgctcaccgcaatcggctgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgaagaaagtatgcacaatctcagtcggtgacagctctacaac 7416604  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| | ||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |   ||||||||||||     
T  7416603 atccgacggatgtctagggacggtctggacatatccgtactgcctcaaaaccctatcgggcaagtgacggtgcaccttacgatcattgcacataatccag 7416504  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcc 344  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  7416503 cctgaataccagaatacctcctggaagtcc 7416474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 111 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 40538464 - 40538214
Alignment:
Q  111 catgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccc 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||   || ||||||   || |||||  || ||      
T  40538464 catgtctcctctcctgcatgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgtggaagtcgacaaaagcctacacaatctcagccggtgacagctcta 40538365  T
Q  211 taacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataat 310  Q
     ||| ||   | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |  ||||||||||    
T  40538364 caacctccaacagatgtctagggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggaaagtgacggtgcaccctacgatcatcgcacataat 40538265  T
Q  311 ccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    ||| || |||||||| || |||||||||||  ||||||  || ||||||||    
T  40538264 ccagcctgaataccaaaatacctcctcgaaagcctggaagtccctgtgctc 40538214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Original strand, 20067493 - 20067596
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||| ||  |||||||     
T  20067493 tcattagctggcctcggaagatctcctagaagaagtggcaaaatcagagggtgagacaccctaatgtaccatattacatagccatcctccatccgccatt 20067592  T
Q  115 tctc 118  Q
    ||||    
T  20067593 tctc 20067596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 45292619 - 45292545
Alignment:
Q  287 caccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  45292619 caccctacgaacactgcacataatccagcctgaatactagaaaacctcctcaaaatcccggatctccctgtgctc 45292545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 73
Target Start/End: Original strand, 22529914 - 22529949
Alignment:
Q  38 tcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacac 73  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22529914 tcctggaataggtggcaaaatctgagggtgagacac 22529949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 40538546 - 40538476
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtacca 85  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||    
T  40538546 tcatttggaggcctcagaatatctcttggaagaagtggcaaaatctgagggtgagacacaatggcgtacca 40538476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 46401726 - 46401377
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401726 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 46401627  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401626 tctcctctcctgcctgctcaccccggacgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 46401527  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401526 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 46401427  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401426 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 46401377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 42901192 - 42901541
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42901192 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 42901291  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42901292 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 42901391  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42901392 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 42901491  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42901492 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 42901541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 46698347 - 46698696
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46698347 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 46698446  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46698447 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgtcttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 46698546  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46698547 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 46698646  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46698647 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 46698696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 49141550 - 49141899
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49141550 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 49141649  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49141650 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaaatcgatgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 49141749  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49141750 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 49141849  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49141850 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 49141899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 50477809 - 50478158
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50477809 tcatttgcaggcctcggaagatctactggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 50477908  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50477909 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcaacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 50478008  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50478009 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 50478108  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50478109 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 50478158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 54389146 - 54388797
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54389146 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 54389047  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  54389046 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgatgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaaa 54388947  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54388946 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacgccctacggacgccgcacataatccat 54388847  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54388846 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 54388797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 34048446 - 34048097
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34048446 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 34048347  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34048346 tatcctctcctgcctgctcaccccaagctaccgccttaagcgtgtgagtgcgaaaatcgatgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 34048247  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34048246 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctatggacgccgcacataatccat 34048147  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34048146 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctatgtgctcctc 34048097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 2272088 - 2272437
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2272088 tcatttgcaggcctcaaaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgccatccgccatg 2272187  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  2272188 tctgctctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatggaaagcggtgggaggtctgcaac 2272287  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  2272288 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccag 2272387  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2272388 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 2272437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 36130506 - 36130157
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| |||  ||||||||    
T  36130506 tcatttgcaggcctcggaagatctccagggagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcatatagccatcagccatccgccatg 36130407  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | | ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||| ||   |||    
T  36130406 tatgctctcctgcctgctcaccccaatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaagggagtgggagctctacaac 36130307  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  36130306 atccgtgggatgtctggggatggtctgcacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcgggaaagtgacggtacaccctacggacaccacacataatccag 36130207  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36130206 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 36130157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 4005443 - 4005791
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| |||  ||||||||    
T  4005443 tcatttgcaggcctcggaagatctctagggagaggtggcaaagtatgagggtgagacaccctagtgtaccatagcatatagccatcagccatccgccatg 4005542  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||   || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||| ||   |||    
T  4005543 tctgctctcctgcctactcaccccaatcg-ccgctttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaagggagtgggagctctacaac 4005641  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  4005642 atccgtgggatgtctagggatggtctgcatgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccag 4005741  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4005742 ccagaataccagaaaacatcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 4005791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 47071219 - 47071558
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||       |||    
T  47071219 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggtaaaggtggcaagatccaagagtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgcc-------atg 47071311  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| |||||||||||||||||| |   |  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  47071312 tctgctctcctgcctgctcacctcaatcagccgccttaagcatgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctacacaatgtaaggcggtgggaggtctacaac 47071411  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  47071412 atccgtcggatgtctggggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaatcctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacgccgcatataatccag 47071511  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47071512 tcagaataccagaaaacctcctcaaagtcctggatctccctgtgctc 47071558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 599888 - 599550
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||| ||   ||||||||| |||  ||||||||    
T  599888 tcatttgcaggcctcggaagatctccaggaagaggtggcgaaatctgagggtgagacatcctagtgtaccatagctaatagccatcagccatccgccatg 599789  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
     || ||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| || ||   |||    
T  599788 actgctctcctgcctgctcaccccaatcgtccaccttaagcgtgtgagtgcagaagtcgacgaacacctgcacaatgtaaggcaatggcagctctacaac 599689  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  599688 atccgtgagatgtctgaggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccacacataatcca- 599590  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
            ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  599589 -------gccagaaaacctcctcaaagtcctggatctccctgtgctc 599550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 326
Target Start/End: Original strand, 17562375 - 17562686
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||   |||||||    
T  17562375 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagagatggcgagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatctgccatacgccatg 17562474  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||  ||| || ||  || ||   |||    
T  17562475 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagactgcacaatctaagacgatgacagctctacaac 17562574  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| | | ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  17562575 atccgacagatgtctagggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccag 17562674  T
Q  315 ccagaataccag 326  Q
    || |||||||||    
T  17562675 cctgaataccag 17562686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 9473300 - 9473034
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  9473300 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgccatccgtcatg 9473201  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| || |    |||    
T  9473200 tctcctctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtctgagtgcggaagtcgacgaacgcctggacaatgtgagacggtggcagctgtacaac 9473101  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtga 281  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9473100 atcgatcggatgtctggggacggtctggacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtga 9473034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20353562 - 20353216
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| || || |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  | ||||||    
T  20353562 tcatttgttggcctcagaagatctcgtgaaagaggtggaaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatccgccatcagccatg 20353463  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |   ||||||||| || ||   |||    
T  20353462 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgtggaagtcgacgaatgcctgcacagtctgaggcggtggtagctctacaac 20353363  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  20353362 atccgtcggatgtctagggatcgtctggacgtatccgtactgcctcaaacccctctcaggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccag 20353263  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || |||||    
T  20353262 cctgaataccagaaaatctcctcaaaatcctggatctccctatgctc 20353216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 41615282 - 41614944
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||       |||    
T  41615282 tcatttgctggcctcggaagatctcctgtaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatccgcc-------atg 41615190  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||||  || ||   |||    
T  41615189 tctgctctcctgcctgctcaccccat-cggccgccctaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtgacagctctacaac 41615091  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| | | ||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||     
T  41615090 atccgccagatgtctagggaccctctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacgatacaccctacgaacaccgcacataatccag 41614991  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  41614990 cctgaataccataaaacctcctcaaaatcctggatctccctgtgctc 41614944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 49266401 - 49266747
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| || |||| |||  ||||||||    
T  49266401 tcatttgctgacctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacacagtcatctgccatccgccatg 49266500  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| || ||||||||||||||||    || || ||||||||||||||||||  |||||||||||   |||||||||   ||||||||  || ||   |||    
T  49266501 tctgctttcctgcctgctcaccctaatcggccaccttaagcgtgtgagtgcgaaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtgacagctctacaac 49266600  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||| ||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | || |||||||||||     
T  49266601 atccgtcagatgtttggggacggtctggacgtctccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaaatgacggtagaccctacgaccacctcacataatccag 49266700  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    ||  ||||||||||||||||||| || | |||||||||  |||||||    
T  49266701 cctaaataccagaaaacctcctcaaaattctggatctccttgtgctc 49266747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16646516 - 16646183
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||  ||||| || |||||| ||||||||  ||||||||    
T  16646516 tcatttgcaagtctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatcaaagggtgagacaccctagtttaccatagcacatagtcatccgccatccgccatg 16646417  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | |            |||||||||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| |||||   |||    
T  16646416 tgt------------gctcaccccaatcgtctgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcataatgtaaggcggtggcaggtctacaac 16646329  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||   || ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  16646328 atacttcagatgtcttgggatggtctggatgtatccgtactgcctcaaaaccctatcgggaaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataat-cag 16646230  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16646229 ccagaataccagaataccttctcaaagtcctggatctccctgtgctc 16646183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 44232732 - 44232393
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| | |||| |||       |||    
T  44232732 tcatttgctggcctcggaagatctcctgaaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacattgtcatcagcc-------atg 44232640  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | | ||||| ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||   ||||||||| || ||   |||    
T  44232639 tatgctctcttgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagccgacgaatatctgcataatctgaggcggtggcagctctacaac 44232540  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| | || || |||||||||||     
T  44232539 atctgtcagatgtctggggacggtctggacgtatccgcactgcctcaaaaccctctcgaaaaagtgacagtacaccctatgaacaccacacataatccag 44232440  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || |||||||||||||||||||  || |||||||||||  |||||||    
T  44232439 cctgaataccagaaaacctccttaaaatcctggatctccatgtgctc 44232393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 48565890 - 48565551
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| |  |||||||||||||||       |||    
T  48565890 tcatttgctggcctcggaagatcttctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacacctcagtgtaccataacacatagccatccgcc-------atg 48565798  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||||| || ||   |||    
T  48565797 tctgctcttgtgcctgctcaccccattcgaccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtggcagctctacaac 48565698  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| |||||||||||   || | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| || || ||||||||| |     
T  48565697 atcggtcggatgtctaaagacgctctggacgtatctgtactgcctcaaaacccgctcgggtaagtgacagtacaccctacgaacaccacacataatctag 48565598  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||    
T  48565597 cctgaacaccagaaaacctcctcaaaatcctggatctcccagtgctc 48565551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 42759676 - 42759337
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||       |||    
T  42759676 tcatttgctggcctcggaagatctcttagaagaggtggcaaaatttgagggtgagacaccttagtgtaccataaaacatagccatccgcc-------atg 42759584  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||  || |||||||||||   || || |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||   ||||||||| || ||   |||    
T  42759583 tctgctcttgtgtctgctcaccccaatcgaccaccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcatgcacaatctgaggcggtggcagctctacaac 42759484  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||  ||||||||||| |||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  42759483 attcgtcggatgtctagggacgctctggatgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacgctacaccctacgaacaccgcacataattcag 42759384  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || ||||||||||||  |||||| || || |||||||| ||||||||    
T  42759383 cctgaataccagaaaggctcctcaaaatcttggatctccctgtgctc 42759337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 48891538 - 48891213
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    | ||||||  | ||||||||||| |||   |||||||    
T  48891538 tcatttggaggcctcgtaatatctcctggaagaagtggcaaaatctgagggtgagacacaacggtgtaccatcgtacatagccatctgccatacgccatg 48891439  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
     || ||||| ||| ||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||   || || ||  || ||   |||    
T  48891438 cctgctctcatgcatgctcactccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagtctgcacaatctcagccgatgacagctctacaac 48891339  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||||||     
T  48891338 atccgacggatgtctagggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccttacgaacactgcatataatccag 48891239  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaa 340  Q
    || ||||||||||| |||||||||||    
T  48891238 cctgaataccagaatacctcctcgaa 48891213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 108 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 50759027 - 50758795
Alignment:
Q  108 cgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggt 207  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   || |||||  || |    
T  50759027 cgccatgtctgctctcctgcatgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctcagccggtgacagct 50758928  T
Q  208 ccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacat 307  Q
    |   |||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | ||||||||    
T  50758927 ctacaacatccggcggatgtctagggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcggtcaagtgacggtacaccctacaatcaccgcacat 50758828  T
Q  308 aatccatccagaataccagaaaacctcctcgaa 340  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  50758827 aatccagcctgaataccagaatacctcctcgaa 50758795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 238 - 364
Target Start/End: Original strand, 52388827 - 52388953
Alignment:
Q  238 tctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctc 337  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52388827 tctgcacgtatctatactacctcaaaaccctctcggacaagtgacggtacaccctacggacaccgcacattatccagccagaataccagaaaacctcctc 52388926  T
Q  338 gaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  52388927 gaagtcctggatctctctgtgctcctc 52388953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 205
Target Start/End: Original strand, 52388630 - 52388820
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| |||  ||||||||    
T  52388630 tcatttgcaggcctcggaagatctccattgagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtctaccatagcatatagccatcagccatccgccatg 52388729  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggag 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||||    
T  52388730 tctactctcctgcctgctcaccccaatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaagggagtgggag 52388820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 127
Target Start/End: Original strand, 2648608 - 2648720
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  2648608 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccacccgccatg 2648707  T
Q  115 tctcctctcctgc 127  Q
    | |||||||||||    
T  2648708 tatcctctcctgc 2648720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 340
Target Start/End: Original strand, 42804993 - 42805318
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||  | | ||||||  | ||||||||||| |||   | |||||    
T  42804993 tcatttggaggcctcagaatatctcctggaagaagtggcaaaatctgagggtgagacacaatggtgtaccatcgtacatagccatctgccatacaccatg 42805092  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||   || |||||||||||||  |||||| ||||||||||||   |||||||||   || ||||   || ||   |||    
T  42805093 tctcctctcatgcatgctcaccccaatcgcccgccttaagcgtacgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctgagccggtaacagctctacaac 42805192  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| | ||||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| || |  | ||||||||||||||     
T  42805193 atccgacggatgtctagggacggtccgaacgtatctgtactgcctcaaaatcctctcgggctagtgacggtgcaccgtatgatcaccgcacataatccag 42805292  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaa 340  Q
    || ||||||||||| |||||||||||    
T  42805293 cctgaataccagaatacctcctcgaa 42805318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 236 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 51807976 - 51807851
Alignment:
Q  236 ggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcc 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  51807976 ggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccagcctgaataccagaaaacctcc 51807877  T
Q  336 tcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || || || |||||||| ||||||||    
T  51807876 tcaaaatcttggatctccctgtgctc 51807851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 251
Target Start/End: Original strand, 50214199 - 50214428
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||       ||||||||    
T  50214199 tcatttgctggcctcggaatatctcctggaagaggtggcaagatttgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccat-------ccgccatg 50214291  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||| |  |||||||||||   ||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||  || |||||||  ||||||||  || |    ||     
T  50214292 tctgctctcttagctgctcaccccaatcggtcgtcttaagcgtgtgagtgaggaagtcgacgaacgcctacacaatgtgaggcggtgacagctttacaat 50214391  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccg 251  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  50214392 atccgtcggatgtctggggacggtctggacgtatccg 50214428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 30253126 - 30253472
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  ||| | ||||||| |||||||  ||||||||      ||||||  | ||||||||||| |||   |||||||    
T  30253126 tcatttggaggcctcggaatatctcccagaagaagtggcaaaatctgagcatgagacacaacgatgtaccatcgtacatagccatctgccatacgccatg 30253225  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | |  |||| ||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||   |||| |||  || ||   |||    
T  30253226 tttgttctcttgcatgctcaccccagtcagccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgatgaaaacctgcacaatctcaggcagtgacagctctacaac 30253325  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| | ||||||||| |||| ||| || | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |  | || |||||||||||     
T  30253326 atccgacggatgtctagggacggtttggatgtatctgtactgcctcaaaaccctctcgagcaagtgacggtataccctctgatcaccacacataatccag 30253425  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || |||||||| || |||||||||||  ||||||  || ||||||||    
T  30253426 cctgaataccataatacctcctcgaaagcctggaagtccctgtgctc 30253472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 292 - 364
Target Start/End: Original strand, 3495550 - 3495622
Alignment:
Q  292 tacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3495550 tacggacaccgcacataatccacccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 3495622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 6928146 - 6927989
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtacca-caggacatagccatccgccgcccgccat 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||| ||||| ||| ||||||  |  ||||||||||       |||||||    
T  6928146 tcatttgctggcctcggaagatctcctgaaagaggtggcaaaatttgagggtgacacaccttagtgtaccataaacacatagccat-------ccgccat 6928054  T
Q  114 gtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaa 178  Q
    |||| ||||   |||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6928053 gtctgctcttgcgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaa 6927989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27638769 - 27638424
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27638769 tcatttgcaggcctcggaagatctcttggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 27638670  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27638669 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 27638570  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27638569 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 27638470  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgct 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27638469 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgct 27638424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 6204170 - 6203821
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6204170 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 6204071  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6204070 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 6203971  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6203970 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 6203871  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6203870 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 6203821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11691137 - 11690788
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11691137 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 11691038  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11691037 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 11690938  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11690937 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 11690838  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11690837 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 11690788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 30826654 - 30827003
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30826654 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 30826753  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30826754 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 30826853  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30826854 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 30826953  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30826954 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 30827003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22304251 - 22303902
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22304251 tcatttgcaggcctcagaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 22304152  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22304151 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 22304052  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304051 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 22303952  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22303951 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 22303902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 31771088 - 31770746
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||       |||    
T  31771088 tcatttgctggcctcggaagatctcctgaaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgcc-------atg 31770996  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||  ||||||||| || ||   |||    
T  31770995 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctacacaatgtgaggcggtggcagctctacaac 31770896  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  31770895 atccgtcggatgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcaggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccag 31770796  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  31770795 ccagaataccataaaacctcctcaaaatcatggatctctctgtgctcctc 31770746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 93 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 26440384 - 26440113
Alignment:
Q  93 tagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatgg 192  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||   |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||     
T  26440384 tagccatccgccatccgccatgtctgctctcctgccggctcaccccaatcagtcgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcttgcacaatgt 26440285  T
Q  193 aaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccct 292  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26440284 aaggcagtgggaggtctacaacatcagtcagatgtctagggatggtctggacgtatccgtattgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccct 26440185  T
Q  293 acggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  26440184 acggacaccgcacataatccaaccagaataccagaaaacctcctcaaagtcatggatctccttgtgctcctc 26440113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 26172936 - 26172594
Alignment:
Q  17 atttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtc 116  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||  |||| |||||    
T  26172936 atttgctggcgtcggaagatctcctcgaagaggtggcaaaatttgagg-tgagacaccctagtgtaccataacacatagacatccgccatccgcaatgtc 26172838  T
Q  117 tcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacat 216  Q
    | |||||||||||||| | |||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||||| || ||   |||||    
T  26172837 tgctctcctgcctgcttatcccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtggcagctctacaacat 26172738  T
Q  217 cagt--------cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacata 308  Q
    | ||        |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  26172737 ccgttcatccgtcggatgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaactctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacata 26172638  T
Q  309 atccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctc 352  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26172637 atccagcctgaataccagaaaacctcctcaaaatcctggatctc 26172594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 2407257 - 2406918
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||       ||     
T  2407257 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatccgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatctgcc-------att 2407165  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||   |||  |||| || ||   |||    
T  2407164 tctgctctcctgcctgttcacctcgatcggccgccttaagcgtgtaagtgcggaagtcgacgaatgtctgcacaatttgaggtagtggcagctctacaac 2407065  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||||||||| | |||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||     
T  2407064 atccgtcggatgtttagggacggtctagacgtatccgtattgccttaaaaccctctcgagcaagtgacagtagaccctacgtacaccgcatataatccag 2406965  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2406964 cctgaataccagaaaacctactcaaagtcctggatctccctgtgctc 2406918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 340
Target Start/End: Original strand, 24085850 - 24086177
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||  || | ||||||| |||||||||||||||||    | ||||||  | ||||||||||| |||   |||||||    
T  24085850 tcatttggaggcctccgaatatctcctacaagaagtggcaaaatctgagggtgagacacaacggtgtaccatcgtacatagccatctgccatacgccatg 24085949  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
     || ||||||||| ||||||||||   || |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||   || |||||  || ||   |||    
T  24085950 cctgctctcctgcatgctcaccccaatcggccgccttaagtgtgtgagtgcggaagtcgacgaaaacatgcacaatctcagtcggtgacagctctacaac 24086049  T
Q  215 atcagtcggatgtctg-gggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcggg-caagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatcc 312  Q
    ||| | || ||||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  24086050 atccgacgaatgtctaagggacggtctggacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcggggcaagtgacggtacaccctacgatcaccgcacataatcc 24086149  T
Q  313 atccagaataccagaaaacctcctcgaa 340  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24086150 atcctgaataccagaatacctcctcgaa 24086177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 32642912 - 32642567
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||    | ||||||  | ||||||||||| | |   |||||||    
T  32642912 tcatttggaggcctcggaatatctcctggaagaagtggcaaaatttgagggtgagacacaacggtgtaccatcgtacatagccatctgtcatacgccatg 32642813  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| | ||||| | |||||||||     | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||   || |||||  |  ||   |||    
T  32642812 tctaccctcctacatgctcacccaatcag-ccgccttaagcgtgtgagtacggaagtcgacgaaagcctgcacaatctcagccggtgacaactctacaac 32642714  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| | ||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||     
T  32642713 atccgacggatgtctagggacggtcaggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgatcaccgcacataattcag 32642614  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || ||||||||||| |||||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  32642613 cctgaataccagaatacctcctcgaaagcctggaagtctctgtgctc 32642567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 2406059 - 2406222
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||| || ||| ||||    
T  2406059 tcatttgctggcctcggaagatctcttggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacacccttgtgtaccataacacatagccatccgtcgtccgtcatg 2406158  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaa 178  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2406159 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaa 2406222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 340
Target Start/End: Original strand, 18005475 - 18005800
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    | |||||   | ||||||||||| |||   | |||||    
T  18005475 tcatttggaggcctcggaaaatctcctggaagaagtggcaaaatctgagggtgagacacaacggtgtaccttcgtacatagccatctgccatacaccatg 18005574  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | |||||| |||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   || |||||  |  ||   |||    
T  18005575 tttcctctgctgcatgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctcagtcggtgacatctctacaac 18005674  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    | |   | ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   | || ||| |||||||     
T  18005675 agctaacagatgtctagggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgatggtgcaccctacaatcaccacacgtaatccag 18005774  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaa 340  Q
    || |||||| |||| |||||||||||    
T  18005775 cctgaatactagaatacctcctcgaa 18005800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3384449 - 3384104
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||| ||| || |  |||||||| |||  |    ||||||    
T  3384449 tcatttgctggcctcggaagatctc-tggaagagatggcaaaatctgagggtgagacatcttagtgtatcataacacatagccctccctcatatgccatg 3384351  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| |||| ||||||||||||  |   ||  | |||||||||||||| ||   ||||| |||||  ||||||||||   |||| |||  |  ||   |||    
T  3384350 tctgctctgctgcctgctcacttcaatcggtctccttaagcgtgtgaatgtgaaagtctacgaatgtctgcacaatctgaggcagtgtcatctctacaac 3384251  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| || |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||     
T  3384250 atccgtaggatgtctagggatcgtatggacgtatccgtactgcctcaacaccctctcaggcaagtgacggtgcaccctacgaacaccgcaaataatccag 3384151  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || |||||||| || | || ||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  3384150 cctgaataccataatatcttctcaaaaccctggatctccctgtgctc 3384104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 21603378 - 21603282
Alignment:
Q  42 ggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgctcacccc 138  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||||||  ||  |  ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  21603378 ggaataggtggaaaaatctgagggtgagacaccgtagtgtaccatagtatatagccatcatccatcttccatgtcgcctctcctgctggctcacccc 21603282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 73
Target Start/End: Original strand, 32641897 - 32641955
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacac 73  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| || ||||||||||||||    
T  32641897 tcatttggaggcctcggaatatctcctggaagaagtgacaaaatttgagggtgagacac 32641955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1055547 - 1055198
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1055547 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 1055448  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1055447 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 1055348  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055347 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 1055248  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055247 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 1055198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 23019323 - 23019672
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23019323 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 23019422  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23019423 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 23019522  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019523 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 23019622  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019623 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 23019672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 26662468 - 26662119
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26662468 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 26662369  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26662368 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 26662269  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26662268 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 26662169  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26662168 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 26662119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 15033801 - 15034150
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15033801 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccatccgccatg 15033900  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15033901 tatcctctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggttcctaac 15034000  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15034001 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccac 15034100  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15034101 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 15034150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 22532 - 22881
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  22532 tcatttgcaggcctcggaatatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagtcatctgccacccgccatg 22631  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22632 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 22731  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22732 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggatgccacacataatccat 22831  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22832 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctagatctctctgtgctcctc 22881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 42482542 - 42482891
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  42482542 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggatatagccatccgccacccaccatg 42482641  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42482642 tatcctttcctgcctgctcaccccgagcgtccgcctcaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 42482741  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42482742 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaatcctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 42482841  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42482842 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctttctgtgctcctc 42482891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 486769 - 487118
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  486769 tcatttgcaggcctcgaaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 486868  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  486869 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgataaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 486968  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  486969 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacagacgccgcacataatccat 487068  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  487069 ccagaataccaggaaacctcctcgaagtcctgaatctctttgtgctcctc 487118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 34367646 - 34367992
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  34367646 tcatttgcaggcctcagaagatctcctgaaagaggtggcaagatctgagggtgagataccctagtgtaccatagcacatagccatccgccatccgccatg 34367745  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  34367746 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcgaaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtgggaggtctacaac 34367845  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||     
T  34367846 atcagtcggatgtctgaggatggtctggacgtattcgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgaaggtacaccatacagacaccgcacataatccag 34367945  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  34367946 ccagaataccagaaaacctcctcaaagtcctggatctccctatgctc 34367992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 39604308 - 39603963
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||    
T  39604308 tcatttgcaggcctcagaagatttcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagtcatccgccatccgtcatg 39604209  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||   || || |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||   |||    
T  39604208 tctactctcctgcatgctcaccccaatcggccaccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtggcaggtctacaac 39604109  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39604108 atccgtcggatgtct-gggatggtctggacgtattcgtactgcctcaaaaccctcttgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccat 39604010  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  39604009 ccagaatacgagaaaaccacctcaaagtcctggatctccctgtgctc 39603963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 43214405 - 43214075
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||       |||    
T  43214405 tcatttgcaggcctcataatatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgcc-------atg 43214313  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    |||            |||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||   |||    
T  43214312 tct------------gctcaccccaatcgttcgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtcggaggtctgcaac 43214225  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  43214224 atcagtcggatgtctggggatggtctggacgtattcgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacatcctacggacaccgcacataatccag 43214125  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  43214124 ccagaataccagaaaacctcctcaaagtcctgcatctccctgtgctcctc 43214075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 352
Target Start/End: Original strand, 34819646 - 34819983
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||  ||||||||    
T  34819646 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggaaaaatctgagggtgaaacaccttagtgtaccataacacatagccatccgccatccgccatg 34819745  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| |||   ||||||||||||||   || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||   ||||||||| || ||   |||    
T  34819746 tctgctcctgtgcctgctcaccccaatcggctgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctacacaatctgaggcggtggcagctctacaac 34819845  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||     
T  34819846 atccgtcggatgtctagggacgctctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacatcctacgaataccgcacataatccag 34819945  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctc 352  Q
    || |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  34819946 cctgaataccagaaaacctcctcaaaatcttggatctc 34819983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 41243120 - 41243447
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||              
T  41243120 tcatttgcaggccttggaagatctcctggaagaggtgacaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatctgcca--------- 41243210  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
              ||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||   |||    
T  41243211 ----------tgcctgctcaccccaatcgtctgccttaagcgtgtcagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtggcaggtctacaac 41243300  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||     
T  41243301 atctgtcggatgtctggggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaacactctctggcaagtgacggtacaccctacgaacagcgcacataatccag 41243400  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  41243401 ccagaataccataaaatctcctcaaagtcatggatctccctgtgctc 41243447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20859034 - 20858688
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  |  |||||    
T  20859034 tcatttgcttgcctcgaaagatctcctggaagaggtggaaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatccgccatcatccatg 20858935  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | | ||||||||||||||||| ||    | |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||   |||||||||  |||||||||  |  ||   |||    
T  20858934 tatgctctcctgcctgctcactccaataggccgccttaagggtgtgagtgtggaagttgacgaatgcctgcacaatctaaggcggtgacaactctacaac 20858835  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  20858834 atccgtcggatgtttggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccag 20858735  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || |||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||    
T  20858734 cctgaataccagaaaacctcctcaaaattctggatctccctatgctc 20858688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 39831787 - 39832125
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||  ||||||||       |||    
T  39831787 tcatttgctggcctcggaagatctcttggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacacc-tagtgtaccataacacataatcatccgcc-------atg 39831878  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||||  || ||   |||    
T  39831879 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcgaccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtgacagctctacaac 39831978  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || | || ||||||||||||||     
T  39831979 atcggtcggatgtctggagacggtctggacgtatccgtactgccttaaaaccctctcgggtaagtgacggtacaccttaggaacaccgcacataatccag 39832078  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  39832079 cctgaataccacaaaacctcctcaaaatcctggatctccctgtgctc 39832125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 5301343 - 5301689
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||  ||  ||||    
T  5301343 tcatttgctggccttggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagtcatccgccatccatcatg 5301442  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||||||||| || |   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   |||  ||||||| ||   |||    
T  5301443 tctgctctcctgcctgctcgcctcaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggtagtgggagctctacaac 5301542  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||     
T  5301543 atccgtcggatgtctagggacggtatggacgtatccgtactacctcaaaatccacttggacaagtgacggtagacccaacaaacaccgcacataatccag 5301642  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||    
T  5301643 cttgaataccagaaaacctcctcaaaatcctggatcttcctgtgctc 5301689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 21176349 - 21176695
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||  || |||||| || |||||| |||||  |   |||||||    
T  21176349 tcatttgctggcctcagaagatcttctggaagaggtgtcaaaatctgagggtgtgacaccgcagtgtaccatagcacatagtcatccctcatacgccatg 21176448  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||||||   ||||| | | || ||   |||    
T  21176449 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcgtgctccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgatgaatgcctccacaatctgaggcgatcgcagctctacaac 21176548  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||     
T  21176549 atccgtcggatgtctagggatgctctggacgtatccttactgccgcaaaaccctctcaagaaagtgacggtacatcctacgaacaccgcacataatccag 21176648  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  21176649 cctgaataccagaaaacctcctcaaaaccctggatctccctgtgctc 21176695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 45132760 - 45132438
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||| |||  |   |||||||    
T  45132760 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccctccctcatacgccatg 45132661  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    |||  ||| || ||||||||||||   || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||    ||||||||   ||||||||| || ||   |||    
T  45132660 tctgatctgctacctgctcaccccaatcggcctccttaagcatgtgagtgcggaagtcgacgaaagcttgcacaatctgaggcggtggcagctcaacaac 45132561  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  45132560 atccgtcggatgtctagggaccatctggacgtatccgtactacctcaaaaccctctcgggcagatgtcggtacactctacgaacaccgcacataatccat 45132461  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctc 337  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  45132460 cctgaataccaaaaaacctcctc 45132438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 35554609 - 35554270
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||       |||    
T  35554609 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccatccgcc-------atg 35554517  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| || |  ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||||  || ||   |      
T  35554516 tctgcttttgtgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaattcctgcacaatctgaggcggtgtcagctctacatt 35554417  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||     
T  35554416 atccgtcggatgtctagggaccctctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccacaaataatccag 35554317  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || | ||||||||| | |||||  ||  ||||||||||  |||||||    
T  35554316 cctggataccagaatatctccttaaaaccctggatctccatgtgctc 35554270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 337
Target Start/End: Original strand, 40075736 - 40076051
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||       |||    
T  40075736 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccatccgcc-------atg 40075828  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||   ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||| ||||  || ||   |||    
T  40075829 tctgctcttgtgcctgctcaccccaatcggttgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggtggtgtcagctctacaac 40075928  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||| ||||||| |||||  |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||     
T  40075929 atccgtctgatgtctagggattctctggatgtatctgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacgatacaccctacgaacaccgcacataatccag 40076028  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctc 337  Q
    || |||||| |||||| ||||||    
T  40076029 cctgaatactagaaaatctcctc 40076051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 5679882 - 5679558
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||||  |   |||||||    
T  5679882 tcatttgctagcctcggaagatctactggaagaggtggcaaaatccgagggtgagacaccgtagtataccatagcacatagccatccctcatacgccatg 5679783  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   ||  | |||||||||||||||||| |||||||| |||   |||||||||   ||||||| |  | ||   |||    
T  5679782 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcgggctccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgatgaatggctgcacaatctgaggcggtcgccgctctacaac 5679683  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacgg--tacaccctacggacgccgcacataatcc 312  Q
    ||| ||  | ||||| |||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  || ||| |||||||||    
T  5679682 atccgttagttgtctagggacgctctggacgtatccgtactgccgcaaaaccctctcaggcaagtgacggtatacaccctacaaacaccgtacataatcc 5679583  T
Q  313 atccagaataccagaaaacctcctc 337  Q
    | || ||||||||||||||||||||    
T  5679582 agcctgaataccagaaaacctcctc 5679558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 52103 - 51778
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || | |||| || || ||||||||||||||    | ||||||  | ||||||||||| | |    ||||||    
T  52103 tcatttggaggcctcggaatatctcatgaaagaagtggaaaaatgtgagggtgagacacaacggtgtaccatcgtacatagccatctgtcatatgccatg 52004  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   || |||||  || ||   |||    
T  52003 tctgctctcatgcatgctcaccccaatcgaccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaatcctgcacaatctgagtcggtgacagctctacaac 51904  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| | ||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |     
T  51903 atctgacggatgtctagggacggactggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgatcaccgcacataatctag 51804  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaa 340  Q
    |  ||||| ||||| ||| |||||||    
T  51803 catgaatatcagaataccccctcgaa 51778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 178
Target Start/End: Original strand, 30761310 - 30761485
Alignment:
Q  17 atttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccat--- 113  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||  |||||||       
T  30761310 atttgctggcctcggaagatctcttggaagaggtggaaaaatttgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagtcatccgccatccgccatctg 30761409  T
Q  114 -----------gtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaa 178  Q
               |||| ||||||||| ||||||||||   || || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30761410 ccatccaccatgtctgctctcctgcatgctcaccccaatcggccaccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaa 30761485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41883561 - 41883212
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41883561 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 41883462  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41883461 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 41883362  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41883361 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 41883262  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41883261 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 41883212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 48406379 - 48406030
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48406379 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 48406280  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48406279 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 48406180  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48406179 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 48406080  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48406079 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 48406030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 9368438 - 9368787
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  9368438 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccgtg 9368537  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368538 tatcctctcctgcctgcacaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgatgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 9368637  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368638 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 9368737  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368738 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 9368787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 17460298 - 17460647
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17460298 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatatgagggtgaaacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 17460397  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17460398 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 17460497  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17460498 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 17460597  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17460598 caagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 17460647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17592916 - 17592567
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17592916 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatatgagggtgaaacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 17592817  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17592816 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 17592717  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17592716 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 17592617  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17592616 caagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 17592567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 35607427 - 35607776
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  35607427 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacctgccatg 35607526  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35607527 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 35607626  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35607627 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccatactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 35607726  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35607727 ctagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 35607776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 42504970 - 42505318
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  42504970 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggcagcaagatatgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccacccgccatg 42505069  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42505070 tatcctctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatgaaaggcggtgggaggtccctaac 42505169  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42505170 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctcttgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccat 42505269  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42505270 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcct 42505318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 15071319 - 15071655
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  15071319 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccacccgccatg 15071418  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15071419 tatcctctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaagcatgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 15071518  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||          ||   || ||||    
T  15071519 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgatggtacaccct----------ca---aaaccat 15071605  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15071606 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctatgctcctc 15071655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17837974 - 17837632
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||       |||    
T  17837974 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgcc-------atg 17837882  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  17837881 tctgctctcctgcttgctcaccccaatcgtctgccttaagcgtgtaagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatggaaggcggtgggaggtctgcaac 17837782  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  17837781 atcagtcggatgtctggggatggtctggacgtatccatactgcctcaaaaccatctcgggcaagtgacggtacaccatacggacaccgcacataatccag 17837682  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17837681 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctatgctcctc 17837632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10521851 - 10521503
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  ||||||||    
T  10521851 tcatttgcaggtctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatatgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccatccgccatg 10521752  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||  ||||||| |||||||   |||    
T  10521751 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcgaaagtcgacgaacgcctgtacaatgtcaggcggtcggaggtctgcaac 10521652  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  10521651 atcagtcggatgtctggggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaa-cctcttgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccag 10521553  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||    
T  10521552 ccagaataccagaaaacctcctcaaagtcatgcatctccatgtgctcctc 10521503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 5538587 - 5538933
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  5538587 tcatttgctggcctcgaaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgccatccgccatg 5538686  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||| || ||   |||    
T  5538687 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagtgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtgaggcgatggcagctctacaac 5538786  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    |||  |||||||||| ||| ||||||  | ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||     
T  5538787 atccatcggatgtctagggttggtctagatgtatttgtactgcctcaaaacccactcgggcaagtgacggtacaccgtacgaacaccgcacataatccaa 5538886  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  5538887 ccagaataccagaaaacctcctcaaaatcctggatctccctgtgctc 5538933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13323055 - 13322706
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||||||  ||||||||    
T  13323055 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaatatctgagggtgagacaccatagtgtaccatagaacatcgccatccgccatccgccatg 13322956  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||  ||| ||||| || ||   |||    
T  13322955 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggcccccttaagcgtgtgagtgctaaagtcgatgaacgcctgcacaatgtgaggtggtggcagctctacaac 13322856  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||| |||||     
T  13322855 atctttcggatgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccttacgaacaccacacattatccag 13322756  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||    
T  13322755 ccagaataccataaaacctcctcaaaatcctggatctctctattctcctc 13322706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16680480 - 16680134
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  |||||| |    
T  16680480 tcatttgctggcctcggaagatctcatggaacaggtggcaaaatctgagggtgacacaccctagtgtaccataacacatagccatccgccatccgccaag 16680381  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| |||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||||| || ||   |||    
T  16680380 tctgctctcctgcctgctcaccctaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtggcagctcgacaac 16680281  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  16680280 atccgtcggatgtctggggacaggctggacgtattcgtactgcctcaaaaccctattggacaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccag 16680181  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || |||||||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  16680180 cctgaataccataaaacctcctaaaaatcctggatctccctgtgctc 16680134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17654716 - 17654370
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  |||||| |    
T  17654716 tcatttgctggcctcggaagatctcatggaacaggtggcaaaatctgagggtgacacaccctagtgtaccataacacatagccatccgccatccgccaag 17654617  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| |||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||||| || ||   |||    
T  17654616 tctgctctcctgcctgctcaccctaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtggcagctcgacaac 17654517  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  17654516 atccgtcggatgtctggggacaggctggacgtattcgtactgcctcaaaaccctattggacaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccag 17654417  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || |||||||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  17654416 cctgaataccataaaacctcctaaaaatcctggatctccctgtgctc 17654370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 27450723 - 27451069
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||  ||||||||    
T  27450723 tcatttgctggcctcggaagatctcttggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacacagccatccgccatccgccatg 27450822  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||| ||||  || ||   |||    
T  27450823 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggtggtgacagctctacaac 27450922  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    |||  |||||| ||||| || ||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   || ||||||||||||||     
T  27450923 atcgttcggatatctggagacggtttggacgtatccgtactacctcaaaaccctcttgggaaagtgacggtacaccctataaacaccgcacataatccag 27451022  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  27451023 cctgaataccagaaaacctcctcaaaatcctggatctccctgtgctc 27451069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 34741742 - 34741444
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||| |  |||||||||||||||       |||    
T  34741742 tcatttgctggtctcagaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgaggttgagacagcctagtgtaccataacacatagccatccgcc-------atg 34741650  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| || ||   |||    
T  34741649 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggctgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtgaggcggtggcagctctacaac 34741550  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  34741549 atccgtcagatgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcttcaaaaccctatcgggcaagtgacagtacattctacgaacaccgcacataatccag 34741450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 145 - 361
Target Start/End: Original strand, 11630427 - 11630643
Alignment:
Q  145 ccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcac 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||   ||||||||| || ||   |||||| ||||||||||| |||| |||||  ||    
T  11630427 ccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcaacgaatgcctgcacaatctgaggcggtggcagctctacaacatccgtcggatgtctagggacggtcttgac 11630526  T
Q  245 gtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcc 344  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||    
T  11630527 gtatacgtactgcctcaaaaccctctcgggaaagtgatggtagaccctacgaacaccgcacataatccagcctgaataccagaaaacctcctcaaaatcc 11630626  T
Q  345 tggatctctctgtgctc 361  Q
    |||||||| ||||||||    
T  11630627 tggatctccctgtgctc 11630643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 337
Target Start/End: Original strand, 47670239 - 47670561
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||    ||||||||||  ||    |||||||    
T  47670239 tcatttggaggcctcgaaatatctcctggaagaagtggcaaattctgagggtgagacacaatggcgtaccatcatacatagccatatgctatacgccatg 47670338  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||||||||||||  ||||||||||   || ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||   |||||||||   || |||||  || ||   |||    
T  47670339 tctcctctcctggatgctcaccccaatcggccgacttaagcgcgtgagtgcggaagttgacgaaagcctgcacaatctcagccggtgacagctctacaac 47670438  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
     || | ||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||     
T  47670439 ctccgacggatgtctaggtacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctttcgggcaagtgacggtgcaccctacgatcaccgcacataatccag 47670538  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctc 337  Q
    || ||||||||||| ||||||||    
T  47670539 cctgaataccagaatacctcctc 47670561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 157 - 361
Target Start/End: Original strand, 11632680 - 11632884
Alignment:
Q  157 tgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactg 256  Q
    ||||||||| |||||| |||||   |||||||||   ||||||||| || ||   |||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||    
T  11632680 tgtgagtgcggaagtcaacgaatgcctgcacaatctgaggcggtggcagctctacaacatccgtcggatgtctagggacggtcttgacgtatacgtactg 11632779  T
Q  257 cctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctg 356  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  11632780 cctcaaaaccctctcgggaaagtgatggtagaccctacgaacaccgcacataatccagcctgaataccagaaaacctcctcaaaatcctggatctccctg 11632879  T
Q  357 tgctc 361  Q
    |||||    
T  11632880 tgctc 11632884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37343271 - 37342992
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||| |||  |    ||||||    
T  37343271 tcatttgctggcctcggaagatctcctgaaagaggtggaaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccctccctcatatgccatg 37343172  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| |||| |||||||||||||||   || || |||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||||||   ||||||||  || ||   |||    
T  37343171 tctgctctgctgcctgctcaccccaatcggcctccttaagcgtgtgagtgcggaagtatacgaatgtctgcacaatctgaggcggtgtcagctctacaac 37343072  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctac 294  Q
    ||| | ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37343071 atccgccggatgtctagggtttgtctggacgtatccgtattgccttaacaccctctcaggcaagtgacggtacaccctac 37342992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 174
Target Start/End: Original strand, 47522013 - 47522172
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||  ||||||||    
T  47522013 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaataggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagtcatccgccatccgccatg 47522112  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcga 174  Q
    ||| || |||||||||||||||||   || ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  47522113 tctgctttcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaaacgtgtaagtgcggaagtcga 47522172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 340
Target Start/End: Original strand, 9491989 - 9492221
Alignment:
Q  108 cgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggt 207  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||    |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   || |||||  || |    
T  9491989 cgccatgtctcctctcctacatgctcaccccaattggtcgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctcagccggtgacagct 9492088  T
Q  208 ccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacat 307  Q
    |   |||||| | ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  | || |||||    
T  9492089 ctacaacatccgacggatgtctagggatggtctgggtgtatccgtactgccttaaaaccctctcgggaaagtgacggtacactctacgatcaccacacat 9492188  T
Q  308 aatccatccagaataccagaaaacctcctcgaa 340  Q
    |||| | || |||| | |||| |||| ||||||    
T  9492189 aatcaaacctgaatgctagaataccttctcgaa 9492221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Original strand, 11630317 - 11630387
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtacca 85  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11630317 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtacca 11630387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36980373 - 36980256
Alignment:
Q  223 gatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaata 322  Q
    ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| || || |||||    
T  36980373 gatgtctagggacagtctggacgtatccgtactgcctcaaaatcctctcgggaaagtgacggtacaccctacgatcaccacacataattcagcctgaata 36980274  T
Q  323 ccagaaaacctcctcgaa 340  Q
    |  ||| |||||||||||    
T  36980273 caggaatacctcctcgaa 36980256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 361
Target Start/End: Original strand, 17747944 - 17748067
Alignment:
Q  238 tctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctc 337  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||  |||||| |    || | ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||    
T  17747944 tctgcacgtatccgtactgccgcctaactctctcaggcaagtgacaatacaccttgtcaacactgcacataatccaaactgaataccagaaaatctcctc 17748043  T
Q  338 gaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
     || ||||||||||| ||||||||    
T  17748044 aaaatcctggatctccctgtgctc 17748067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16488394 - 16488281
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctga-gggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccat 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||| ||| |||||| |  ||||| ||||||     |||||||    
T  16488394 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcacaatctgaggggtgaaacaccttagtgtaccataacacatatccatcccttatccgccat 16488295  T
Q  114 gtctcctctcctgc 127  Q
    |||| |||||||||    
T  16488294 gtctgctctcctgc 16488281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 41734700 - 41734630
Alignment:
Q  108 cgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaa 178  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||   || || |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  41734700 cgccatgtctgctctgctgcctgctcaccccaatcggcctccttaagcgtgtgagtgcggaagtctacgaa 41734630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 41734749 - 41734713
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtg 51  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  41734749 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtg 41734713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 6178840 - 6179189
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6178840 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 6178939  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6178940 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 6179039  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6179040 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 6179139  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6179140 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 6179189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 41796075 - 41796424
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  41796075 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaagacatagccatcccccgcccgccatg 41796174  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41796175 tctcctctcctacctgctcaccccaggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 41796274  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41796275 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtattgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacagtacaccctacggacgccgcacataatccat 41796374  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41796375 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 41796424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 49168532 - 49168183
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49168532 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 49168433  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49168432 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 49168333  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49168332 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 49168233  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49168232 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 49168183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 31424761 - 31424412
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31424761 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtgccacaggacatagccatccgccacccgccatg 31424662  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  31424661 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccttaac 31424562  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31424561 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 31424462  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31424461 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctgaatctctctgtgctcctc 31424412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 1306170 - 1306521
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgc--ca 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  1306170 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgcgcca 1306269  T
Q  113 tgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtcccta 212  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1306270 tgtatcctctcctacctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtcccta 1306369  T
Q  213 acatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306370 acatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatcc 1306469  T
Q  313 atccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306470 atccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 1306521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 49093443 - 49093093
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgcc-at 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  49093443 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgcccat 49093344  T
Q  114 gtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaa 213  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49093343 gtatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcatgtgagtgcggaagtcgatgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaa 49093244  T
Q  214 catcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatcca 313  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49093243 catcagtcggatgtctagggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatcca 49093144  T
Q  314 tccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49093143 tccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 49093093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 21018628 - 21018977
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21018628 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatcttagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgccatccgccatg 21018727  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  21018728 tctcctctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacacctgcataatgaaaggcggtgggaggtccctaac 21018827  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||     
T  21018828 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccttctcgggaaagtgacggtacacgctacagacaccgcacataatccag 21018927  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21018928 ccagaataccagaaaacctcctctaagtcctggatctctctatgctcctc 21018977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 40355453 - 40355802
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||| |||||||||    
T  40355453 tcatttgcaggtctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggttagacaccctagtgtaccatatgacattgccattcgccacccgccatg 40355552  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40355553 tatcctctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaatcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacacctgcacaatggaagacggtgggaggtccctaac 40355652  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||     
T  40355653 agcagtcggatgtctagggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacactacacataatccac 40355752  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40355753 ccagaataccataaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 40355802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 93 - 364
Target Start/End: Original strand, 30723877 - 30724148
Alignment:
Q  93 tagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatgg 192  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  30723877 tagccatccgccacccgccatgtatcctctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaattg 30723976  T
Q  193 aaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccct 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30723977 aaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccct 30724076  T
Q  293 acggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30724077 acggacaccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 30724148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 44677020 - 44677366
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||    ||||||    
T  44677020 tcatttacaggcctcgaaaaatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacacagccatccgccatgtgccatg 44677119  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    |||  |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    |||    
T  44677120 tctgttctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtgggaggtttacaac 44677219  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  44677220 atcagtcagatgcctggggatggtctggatgtatccgtactgcctcaaaaccctcttgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccag 44677319  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  44677320 ccagaataccaaaaaacctcctcaaagtcctggatctccctgtgctc 44677366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 50278175 - 50277829
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||| || ||| |  |||||||||||||||  ||||||||    
T  50278175 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtgacaaaatatgagggtgagacaccctagtgtgccataacacatagccatccgccatccgccatg 50278076  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||   ||||||||| |  ||   |||    
T  50278075 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggctgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatatgaggcggtggcaactctacaac 50277976  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||     
T  50277975 atccgtcggatgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacaaacaccgcacataatccag 50277876  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  50277875 ccagaataccagaaaacctcctcaaaatcctggatctctctgtgctc 50277829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 37016633 - 37016967
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  37016633 tcatttgcaggcctcggaagatctactgaaagaggtggcaagatcttagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgccatccgccatg 37016732  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    |||            |||||||||   ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||   |||    
T  37016733 tct------------gctcaccccaatcgtccgccttaagtgtgtgagtgcggaagtcaacgaacgtctgcacaatgtaaggcgatgggaggtctacaac 37016820  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  37016821 atccgtcagatgtctggggatggtcttgacgtatccgtattgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccacacataatccaa 37016920  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||    
T  37016921 ccagaataccagaaaacctcctcaaagttctggatctccctatgctc 37016967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 8110172 - 8109835
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  |  |||||    
T  8110172 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagatgtggaaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatccgccatcaaccatg 8110073  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||   || | ||||||||||| |||||||  |||||||||||   |||||||||   || |||||| || ||   |||    
T  8110072 tctgctctcttgcctgctcaccccaatcggctgccttaagcgtatgagtgcgaaagtcgacgaatgcctgcacaatctgagacggtggcagctctacaac 8109973  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  8109972 attcgtcggatgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccacacataatccag 8109873  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctc 352  Q
    || |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  8109872 cctgaataccagaaaacctcctcaaaatcttggatctc 8109835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 337
Target Start/End: Original strand, 10730030 - 10730352
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||| |||  |   || ||||    
T  10730030 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccctccctcatacgtcatg 10730129  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||   || || |||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||| | || ||   |||    
T  10730130 tctgctctcgtgcctgctcaccccaatcggcctccttcagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctgaggcggtagcagctcaacaac 10730229  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||     
T  10730230 atccgtcggatttctagggatggtctggacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcaggcaagtgacggtacactctacgaacaccgcacaaaatccag 10730329  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctc 337  Q
    ||  |||||||||||||||||||    
T  10730330 cctaaataccagaaaacctcctc 10730352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 337
Target Start/End: Original strand, 10943799 - 10944121
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||| |||  |   || ||||    
T  10943799 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccctccctcatacgtcatg 10943898  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||   || || |||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||| | || ||   |||    
T  10943899 tctgctctcgtgcctgctcaccccaatcggcctccttcagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctgaggcggtagcagctcaacaac 10943998  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||     
T  10943999 atccgtcggatttctagggatggtctggacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcaggcaagtgacggtacactctacgaacaccgcacaaaatccag 10944098  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctc 337  Q
    ||  |||||||||||||||||||    
T  10944099 cctaaataccagaaaacctcctc 10944121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 67 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 51686104 - 51685810
Alignment:
Q  67 gagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgcc 166  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||||||| | |  |||||||||||  |||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||     
T  51686104 gagacaccctagtgtaccataacacatagccatctgtcatccgccatgtctgttctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgca 51686005  T
Q  167 gaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaacc 266  Q
    ||||| ||||||   |||||||||   ||||||||| || ||   |||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  51686004 gaagttgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtggcagctctacaacatccgtcggatgtctagggacggtctggacgtatctgtactgcctcaaaacc 51685905  T
Q  267 ctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||    
T  51685904 ctctcgggcaagtgacggtagaccctacgaacaccgcatataatccagcctgaataccagaaaacctcctcaaaatcttagatctctctgtgctc 51685810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 50904377 - 50904047
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||||       |||    
T  50904377 tcatttgctggcctgggaagatcttctgaaagaggtgacaaaatctgagggtgagataccctagtgtaccatagcacatagccgtccgcc-------atg 50904285  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |   || || |||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||   ||||||||| || ||   |||    
T  50904284 tctgctctcctacctgctcacctcaatcggccaccttaagcgtgtgagtgcggaaatcgacgaacgcctgcacaatatgaggcggtggaagctctacaac 50904185  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||     
T  50904184 atccgtcggatgcctggggacggtctggacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcggacaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacatgatccaa 50904085  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctc 352  Q
    || ||| |||| ||| ||||||| || |||||||||||    
T  50904084 cctgaaaaccaaaaaccctcctcaaaatcctggatctc 50904047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 71958 - 71624
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| | ||| ||| |||||||||||||||||    | ||||||  | |||||||||||||||   |||||||    
T  71958 tcatttggaggcctcagaatatctcctagaagaagtgacaaaatctgagggtgagacacaacggtgtaccatcgtacatagccatccgccatacgccatg 71859  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   || || ||  || ||   |||    
T  71858 tctgctctcctgcatgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctgagccgatgacagctctacaac 71759  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  71758 atccgacagatgtctagggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcggccaagtgacggaacaccctacgatcaccgcacataatccag 71659  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggat 349  Q
    || |||||||| || |||||||||||  |||||||    
T  71658 cctgaataccataatacctcctcgaaagcctggat 71624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 358
Target Start/End: Original strand, 50020734 - 50021065
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |  | |||||||||||||  | ||||||    
T  50020734 tcatttgctggcctcggaagatctcttggaagaggtggcaaaatttgagggtgagacaccctagtgtaccataacatatagccatccgccatcagccatg 50020833  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    |||            |||||||||   || || |||| ||| |||||||||   ||| ||||||   |||||||||   || |||||| || ||   |||    
T  50020834 tct------------gctcaccccaatcggcctccttgagcatgtgagtgcgagagttgacgaatgcctgcacaatctgagtcggtggtagctctacaac 50020921  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  50020922 atccgtcggatgtctggggacggtatggacgtacccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccaa 50021021  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtg 358  Q
    || |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  50021022 cctgaataccagaaaacctcctcaaaatcatgtatctccctgtg 50021065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 340
Target Start/End: Original strand, 13624569 - 13624894
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||| |||| || ||| ||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||      ||||||    ||||||||||| |||   |||||||    
T  13624569 tcatttggaggcatcagaatatctcctggaagatgtggaaaaatctgagggtgagacacaacgatgtaccatcatacatagccatctgccatacgccatg 13624668  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   || |||||  || ||   |||    
T  13624669 tctgctctcttgcatgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctcagccggtgacagatctacaac 13624768  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||     
T  13624769 atccgacggatgtctagggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctcttgggcaagtgacggtacgccctacgatcaccgcacataatccaa 13624868  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaa 340  Q
    || ||||||||||| || ||||||||    
T  13624869 cctgaataccagaatacttcctcgaa 13624894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 219 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 50196218 - 50196076
Alignment:
Q  219 gtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccag 318  Q
    |||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |    
T  50196218 gtcgaatgtctggggacggcctgaacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccaacctg 50196119  T
Q  319 aataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  50196118 aataccagaaaacctcctcaaaattctggatctccctgtgctc 50196076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14317618 - 14317284
Alignment:
Q  27 ctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctg 126  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||| |||  |   |||||||| | |||||| |    
T  14317618 ctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatatgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccctccctcatacgccatgtttgctctcccg 14317519  T
Q  127 cctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatg 226  Q
    || |||||||||   |   | |||||||||||||||||| |||||| |  ||    ||||||||   |||  |||| || ||   |||||| ||||||||    
T  14317518 ccggctcaccccattcaggctccttaagcgtgtgagtgcggaagtcaagaaatgcttgcacaatctgaggtagtggcagctctacaacatccgtcggatg 14317419  T
Q  227 tctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccag 326  Q
     || ||||  || || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  14317418 actagggacagtttggacgtatctgtaccgcctcaaaaccctctcgggcaagtgatggtataccctacgaacaccgcacataatccagcctgaataccag 14317319  T
Q  327 aaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    ||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||    
T  14317318 aaaacctcctcaaaaccctgaatctccctgtgctc 14317284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Original strand, 41931108 - 41931334
Alignment:
Q  111 catgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccc 210  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||   || || |||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||   ||||||||| || ||      
T  41931108 catgtctgctctgctgcctgctcaccccaatcggcctccttaatcatgtgagtgcggaagtcgacgaaagtctgcacaatctgaggcggtggcagctcaa 41931207  T
Q  211 taacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataat 310  Q
     |||||||||||||||||| ||||  || || |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  | ||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  41931208 caacatcagtcggatgtctagggactgtttggacgtatccgtgctgcctcaaaaccctcttgggtagataacggtacactctacgaacaccgcacataat 41931307  T
Q  311 ccatccagaataccagaaaacctcctc 337  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||    
T  41931308 ccatccttaataccagaaaacctcctc 41931334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 46438954 - 46438743
Alignment:
Q  150 ttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatc 249  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||   ||||||||  || ||   |||||| ||||||||||| ||||   |||| |||||||    
T  46438954 ttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgtctgcacaatctgaggcggtgtcagctctacaacatccgtcggatgtctagggaccctctggacgtatc 46438855  T
Q  250 cgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggat 349  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||| |||| | |||||| ||  |||||||    
T  46438854 tgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtaacggtacaccctacgaacaccgcaaataatccagcctgaatactagaatatctcctcaaatccctggat 46438755  T
Q  350 ctctctgtgctc 361  Q
    |||  |||||||    
T  46438754 ctccttgtgctc 46438743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 30706925 - 30706657
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| || |  ||| | |  |||  |   |||||||    
T  30706925 tcatttgttggcctccgaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtatcataacacacaacattccctcatacgccatg 30706826  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||   || || |||||| ||||||||||| |||||| |||||   |||||||||   ||||||||  || ||   |||    
T  30706825 tctgctctgctgccagctcaccccaatcggcctccttaaacgtgtgagtgcagaagtctacgaatgcctgcacaatctgaggcggtgtcagctctacaac 30706726  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacg 283  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30706725 atccgtcggatgtctagggatcgtctagacgtattcgtactgcctcaacaccctctcaggcaagtgacg 30706657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Original strand, 30723777 - 30723847
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtacca 85  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30723777 tcatttacaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtacca 30723847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 50196351 - 50196224
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccct----agcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgc 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||| |  |||||||||||| ||  | ||    
T  50196351 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgagtgtaccataacacatagccatccaccatcagc 50196252  T
Q  111 catgtctcctctcctgcctgctcacccc 138  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  50196251 catgtctgctctcctacctgcacacccc 50196224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Original strand, 55278820 - 55278927
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||| ||  ||||||||    
T  55278820 tcattagctggcctcggaagatatcctggaagaagtggcaaaatcagagggtgagtcaccctagtgtaccatagtacatagccatcctccatccgccatg 55278919  T
Q  115 tctcctct 122  Q
    ||||||||    
T  55278920 tctcctct 55278927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 46439038 - 46438956
Alignment:
Q  18 tttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||    
T  46439038 tttgctggcctcggaagatctcatggaagaggtggcaaaatttgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccatc 46438956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 360
Target Start/End: Original strand, 21535449 - 21535597
Alignment:
Q  212 aacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatc 311  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||   || | |||||||| |    
T  21535449 aacatccgtcggatgtctagggacggtctcgacatatccgtacagccgcaaaactctctcaggcaagtgacgatacaccctaataacactgcacataacc 21535548  T
Q  312 catccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgct 360  Q
     | || ||||| || |||| |||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  21535549 tagcctgaataacataaaatctcctcaaaaccctggatctccctgtgct 21535597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 12891924 - 12891833
Alignment:
Q  24 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgt 115  Q
    ||||||| ||||||||| | || | ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||||||||| ||  |||||||||    
T  12891924 ggcctcgaaagatctcccgaaagaagtggcaaaatctgagggtgatacaccctagtgtaccaccgtatatagccatcctccatccgccatgt 12891833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12891703 - 12891586
Alignment:
Q  243 acgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagt 342  Q
    |||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||| |||||   ||  || |||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||| ||      
T  12891703 acgtatccgtactgccgcctaactctctcaggcaagtgacgatacacttaaca-acaccgcacataacccagcctgaataccagaaaatctcctcaaaac 12891605  T
Q  343 cctggatctctctgtgctc 361  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  12891604 cctggatctccctgtgctc 12891586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 138
Target Start/End: Original strand, 40886693 - 40886789
Alignment:
Q  42 ggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgctcacccc 138  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  | ||| |||||  ||  | |||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  40886693 ggaataagtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacatataaccatcatccatctgccatgtcacctctcatgccggctcacccc 40886789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 361
Target Start/End: Original strand, 40886874 - 40887012
Alignment:
Q  223 gatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaata 322  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||| |  ||| |||||  | |||||||| |||||  |    || |||||||||||||| || |||||    
T  40886874 gatgtctagggacgttctgcacgtatccttactgccgcctaactctctcaagaaagtgacgatacacgttgtcaacaccgcacataatccagcctgaata 40886973  T
Q  323 ccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    ||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||    
T  40886974 ccataaaatctcctcaaaatcttggatctctctatgctc 40887012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 3729379 - 3729729
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3729379 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgtcacccgccatg 3729478  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaagg-cggtgggaggtccctaa 213  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3729479 tatcctctcctgcctactcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcaacgaacatctgcacaatggaagggcggggggaggtccctaa 3729578  T
Q  214 catcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatcca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3729579 catcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatcca 3729678  T
Q  314 tccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3729679 tccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 3729729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 13637036 - 13637385
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  13637036 tcatttgcaggcctcagaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccacccgccatg 13637135  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13637136 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggagctccctaac 13637235  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13637236 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgatggtacaccctacggacgccgcacataatccat 13637335  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13637336 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 13637385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 26878730 - 26878388
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||       |||    
T  26878730 tcatttgcaggcctcagaagatctactggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccccagtgtaccacaggacatagccattcgcc-------atg 26878638  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26878637 tatcctctcctgcttgctcaccccgagcttccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 26878538  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26878537 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgtctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 26878438  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26878437 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcatggatctctctgtgctcctc 26878388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19159041 - 19158692
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19159041 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccgtccgccatg 19158942  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||| ||   |||    
T  19158941 tctcctctcctgcctgctgaccccgatcgtccgccttaatcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaagggagtgggagctctacaac 19158842  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  19158841 atccgtgggatgtttggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggaaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccac 19158742  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19158741 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 19158692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 95132 - 95474
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||       ||||    
T  95132 tcatttgcaggcctcagaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtactataggacatagccatccgc-------catg 95224  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| |||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  95225 tctactctcctgtctgctcaccccaatcatccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtgggaggtctacaac 95324  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  95325 atcagtcggatgtctggggatggtctggaaatatccgtactgcctcaaaaccctatcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccacacataatccag 95424  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  95425 ccagaataccagaaaacctcctcaaagtcctggatctccctgtgctcctc 95474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 31780697 - 31781039
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||       ||||    
T  31780697 tcatttgcaggcctcggaagatctgctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgc-------catg 31780789  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  31780790 tctgctctcctgcctactcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgtctgcacaatgtaaggcggtgggaggtctacaac 31780889  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  31780890 atcagtcggatgtttggggatggtctggacgtatccgtactgcctcataaccctctcgggcaagtgatggtacaccctacagacaccgcacataatccaa 31780989  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31780990 ccagaataccagaaaatcccctcaaagtcctggatctccctgtgctcctc 31781039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22527016 - 22526674
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||       |||    
T  22527016 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgcc-------atg 22526924  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    | | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| || ||   |||    
T  22526923 tttgctctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagggcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtgaggcggtggcagctctacaac 22526824  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  22526823 atcggtcggatgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccag 22526724  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 364  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  22526723 ccagagtactagaaaacctcctcaaagtcctagatctccatgtgctcctc 22526674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Original strand, 19522316 - 19522653
Alignment:
Q  17 atttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtc 116  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||       |||||    
T  19522316 atttgctggcctcgaaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatccgcc-------atgtc 19522408  T
Q  117 tcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacat 216  Q
    | ||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||||| || ||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||| || ||   |||||    
T  19522409 tgctctcctgcctgctcaccccaatcggctgccttaagcgtgtgagggcggaagttgacgaacgcctgcacaatgtgaggcggtggcagctctacaacat 19522508  T
Q  217 cagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatcc 316  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  19522509 ccgtcgaatgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacgatacaccctacgaacaccgcacataatccagcc 19522608  T
Q  317 agaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  19522609 agaataccagaaaacctcctcaatatcctgtatctctctgtgctc 19522653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 52804888 - 52804570
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |  || |||||    
T  52804888 tcatttgctggcctcggaatatctactggaagagctggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgtcatcctccatg 52804789  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   |  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| || ||   |||    
T  52804788 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcagccgccttaagtgtgtgagtgtggaagtcgacgaacgtctgcacaatgtgaggcagtggcagctctacaac 52804689  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  52804688 atccgtcggatgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacacctcacataatccaa 52804589  T
Q  315 ccagaataccagaaaacct 333  Q
     || |||||||||||||||    
T  52804588 gcataataccagaaaacct 52804570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 47505350 - 47505016
Alignment:
Q  26 cctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcct 125  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  47505350 cctcgaaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatctgccatccgccatgtctgctctcct 47505251  T
Q  126 gcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggat 225  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||||   ||||||||   | ||   |||||| |||||||    
T  47505250 gcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagcgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtgatcgctctacaacatccgtcggat 47505151  T
Q  226 gtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatacca 325  Q
    |||||||||  ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| || || |||||    
T  47505150 gtctggggacagtctggacgtatttgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccc-acgaacaccgcacataatccagcctgattacca 47505052  T
Q  326 gaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  47505051 gaaaacctcctcaaaatcctggatctccctgtgctc 47505016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 11196883 - 11196537
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||| |||  |   || ||||    
T  11196883 tcatttgctggcctcggaagatctcctgaaagaggtggcaaaatacgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccctccctcatacgacatg 11196784  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| |||| ||||||||||||||    || ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||  || ||   |||    
T  11196783 tctgctctgctgcctgctcaccctaatcggccgccttaagcatgtgagtgcggaaatcgacgaatgtctgcacaatctaaggcggtgtcagctctacaac 11196684  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||  ||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||     
T  11196683 attcgtcggatgtctagggatcatctggacgtatccgtactgcctcaacaccctctcagacaagtgacggtacaccctacgaataccgcacataatccag 11196584  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  11196583 cctgaataccaaaaaacctcctcaaaatcctggatttctttgtgctc 11196537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 47660893 - 47660547
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||| ||||||||  ||||||||    
T  47660893 tcatttgctggcctcagaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagtcatccgccatccgccatg 47660794  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||| || | |||||||||   || || |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||| ||||  || ||   |||    
T  47660793 tctgctctcgtgtcggctcaccccaatcggccaccttaagcgtgtgagtgcagaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggtggtgtcagctctacaac 47660694  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||  ||| ||||||| ||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||     
T  47660693 attcgtccgatgtctagggaccctctggacgtatccgtacttcctcaaaaccctctcgggtaagtgacggtacaccctacaaacaccgcagataatccag 47660594  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || ||||||||||| | |||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  47660593 cctgaataccagaatatctcctcaaaaccctggatctccctgtgctc 47660547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 45828596 - 45828251
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| || || ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| |  |||||||||||| ||   |||||||    
T  45828596 tcatttgctggcctcataagatctcatgaaagaggtggcaaaatctgagggtgaaacaccttagtgtaccataacacatagccatcctccattcgccatg 45828497  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   |||| |||| || ||   |||    
T  45828496 tctgctcttgtgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatg-ctgcacaatctgaggcagtggcagctctacaac 45828398  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| || |||||||| |||| | | || ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||     
T  45828397 atctgtaggatgtctagggacgctatgaacgtatttgtactacctcaaaaccctcttgggcaagtgacggtataccctatgaacaccgcacataatccag 45828298  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  45828297 cctgaataccagaaaacctcctcaaaatcctggatctccctgtgctc 45828251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Original strand, 50341407 - 50341525
Alignment:
Q  243 acgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |    
T  50341407 acgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccagcctgaataccagaaaacctcctctaaat 50341506  T
Q  343 cctggatctctctgtgctc 361  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  50341507 cctggatctccctgtgctc 50341525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 340
Target Start/End: Original strand, 49855053 - 49855377
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| | || | ||||||| |||||||||||||||||    | ||||||  | ||||||||||| |||   |||||||    
T  49855053 tcatttggaggccttggaatatctcccgaaagaagtggcaaaatctgagggtgagacacaacggtgtaccatcgtacatagccatctgccatacgccatg 49855152  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||   || |||||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||   || |||||  || ||   |||    
T  49855153 tctgctctcctgcatgctcaccccaatcggccgccttaagtgtgtgagtgcgcaagtcgacgaaagtctgcacaatttgagccggtgacagctctacaac 49855252  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| | | ||||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||     
T  49855253 atccgacagatgtctagggacggtctggacgtatctgtagtgcctcaaa-ccctctcgggcaagtcacggtacaccctacgatcaccgcacataatccaa 49855351  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaa 340  Q
    |  ||||||||||| ||| |||||||    
T  49855352 cttgaataccagaataccccctcgaa 49855377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Original strand, 50617929 - 50618052
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||| |||| |||  ||||||||    
T  50617929 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggttgcaagatctgagggtgagacaccctggtgtaccatagcacatagtcatctgccatccgccatg 50618028  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcacccc 138  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  50618029 tctgctctcctgcctgctcacccc 50618052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 252 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21143763 - 21143654
Alignment:
Q  252 tactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatct 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | || |||| |||||    
T  21143763 tactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccagccagaataccagaaaaccttcacaaaatcctagatct 21143664  T
Q  352 ctctgtgctc 361  Q
    | ||||||||    
T  21143663 ccctgtgctc 21143654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21143950 - 21143770
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||       |||| ||    
T  21143950 tcatttgctggcctcggaagaactcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacacccaagtgtaccatagcacatagccatc-------cgccttg 21143858  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgg 202  Q
    ||| |||| |||| ||||||||||   || || ||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  |||||||||    
T  21143857 tctgctcttctgcttgctcaccccaatcggccaccttaagtgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtgaggcggtgg 21143770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 295
Target Start/End: Original strand, 38120195 - 38120475
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||| || |  ||| ||| |||||| |  |||||||| |||  |   |||||||    
T  38120195 tcatttgctggcatcggaagatctcctagaagaggtggaaaaatctgaggatgggttaccttagtgtaccataacacatagccctccctcatacgccatg 38120294  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| |||| || ||||||||||||   || | |||| |||||||||||||  ||||||||||||   |||||||||   |||| |||  || ||   |||    
T  38120295 tctgctctgctacctgctcaccccaatcggcggcctgaagcgtgtgagtgtggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcagtgtcagctctacaac 38120394  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacg 295  Q
    ||| ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38120395 atccgtcagatgtttagggatcgtctggacgtatccgtactgcctcaacaccctctcaggcaagtgacggtacaccctacg 38120475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 238 - 340
Target Start/End: Original strand, 35256520 - 35256622
Alignment:
Q  238 tctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctc 337  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  35256520 tctgaacgtatccgtactgtctcaaaactctctcaggcaagtgacggtacaccctacgatcaccgcacataatccagcctgaataccagaatacctcctc 35256619  T
Q  338 gaa 340  Q
    |||    
T  35256620 gaa 35256622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 270 - 361
Target Start/End: Original strand, 23273541 - 23273632
Alignment:
Q  270 tcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  23273541 tcgggcaagtgacggtagaccctacgaacaccgcatataatccagccggaataccaaaaaacctcctcaaaatcctggatctccctgtgctc 23273632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 172
Target Start/End: Original strand, 16269827 - 16269984
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| | ||| |||||| |  ||||||| ||||  |  ||||||||    
T  16269827 tcatttgctggcctcacaagatctcctggaagaggtggcacaatctaagggtgagacatcgtagtgtaccataacacatagcgatccctcatccgccatg 16269926  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtc 172  Q
    ||| |||||||||| |||||||||    |  | |||||||||||||||||| ||||||    
T  16269927 tctgctctcctgccggctcaccccaattgggctccttaagcgtgtgagtgcggaagtc 16269984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 113
Target Start/End: Original strand, 23273427 - 23273506
Alignment:
Q  34 gatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccat 113  Q
    |||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  |||||||    
T  23273427 gatctcctagaagagatggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatccgccatccgccat 23273506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Original strand, 35256442 - 35256482
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaa 55  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  35256442 tcatttggaggcctcggaatatctcctggaataagtggcaa 35256482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12371 - 12025
Alignment:
Q  15 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 114  Q
    |||||||  |||||||||| || |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||  | | ||||||    |||||||||||||||   |||||||    
T  12371 tcatttggtggcctcggaatatttcctggaagaagtggcaaaatctgagggtgagacacaatggtgtaccatcctacatagccatccgccatacgccatg 12272  T
Q  115 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 214  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||   || || |||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||   ||||||||  || ||   |||    
T  12271 tctgctctcctgcatgctcaccccaatcgacctccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagactacacaatctgaggcggtgacagctctacaac 12172  T
Q  215 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 314  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||     
T  12171 atccgacggatgtctagggatggtcaggacgtattcgtactgcctcaaaaccctctcgagcaaatgacggtacaccctacgatcaccgcacataatccag 12072  T
Q  315 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 361  Q
    || ||||||||||| || ||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  12071 cctgaataccagaatacgtcctcaaaagcctggatctccctgtgctc 12025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 56579 - 56476
Alignment:
Q  35 atctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgctca 134  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||| |||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56579 atctcctggaagaggttgcaagatctgagggtgagacaccctggtgtaccatagcacatagtcatctgccatccgccatgtctgctctcctgcctgctca 56480  T
Q  135 cccc 138  Q
    ||||    
T  56479 cccc 56476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 100
Target Start/End: Original strand, 22343 - 22411
Alignment:
Q  32 aagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatc 100  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  22343 aagatctcctagaagaagtggcaaaatcagaggttgagacaccctagtgtaccatagtatatagccatc 22411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University