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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10240_low_4 (Length: 263)

Name: NF10240_low_4
Description: NF10240
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10240_low_4
NF10240_low_4
[»] chr8 (15 HSPs)
chr8 (13-259)||(44562923-44563169)
chr8 (13-259)||(19659186-19659432)
chr8 (13-259)||(9354444-9354690)
chr8 (18-259)||(22081025-22081263)
chr8 (37-263)||(16283292-16283521)
chr8 (37-242)||(14557470-14557675)
chr8 (175-259)||(33244649-33244733)
chr8 (37-242)||(16277397-16277605)
chr8 (37-254)||(2137411-2137631)
chr8 (19-254)||(19687923-19688161)
chr8 (79-254)||(27609057-27609235)
chr8 (19-242)||(18710411-18710637)
chr8 (19-149)||(19286290-19286420)
chr8 (19-242)||(31489914-31490140)
chr8 (82-149)||(31354412-31354479)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (14-259)||(31891505-31891750)
chr2 (13-259)||(34156829-34157075)
chr2 (13-259)||(34303480-34303726)
chr2 (13-259)||(3784472-3784718)
chr2 (13-259)||(16163417-16163663)
chr2 (13-259)||(27118506-27118752)
chr2 (22-259)||(19456598-19456835)
chr2 (22-263)||(21703337-21703578)
chr2 (37-242)||(27434638-27434846)
chr2 (18-166)||(27392813-27392961)
chr2 (37-254)||(23128748-23128968)
chr2 (37-242)||(12655381-12655589)
chr2 (37-242)||(28882053-28882261)
chr2 (39-242)||(20837759-20837965)
chr2 (82-242)||(37925377-37925540)
chr2 (85-242)||(11635380-11635543)
chr2 (79-242)||(13936738-13936904)
chr2 (79-242)||(34279330-34279496)
chr2 (85-242)||(32049685-32049845)
chr2 (85-242)||(11641569-11641732)
chr2 (79-242)||(21677376-21677542)
chr2 (190-259)||(27392964-27393033)
chr2 (82-195)||(261009-261122)
chr2 (37-149)||(37375000-37375112)
[»] chr7 (21 HSPs)
chr7 (13-259)||(31088538-31088784)
chr7 (13-259)||(45733283-45733529)
chr7 (22-263)||(16450068-16450309)
chr7 (22-263)||(16041155-16041396)
chr7 (175-263)||(26484679-26484767)
chr7 (175-263)||(2109075-2109163)
chr7 (175-263)||(18540784-18540872)
chr7 (175-263)||(39211093-39211181)
chr7 (37-254)||(16503459-16503679)
chr7 (37-254)||(16518495-16518715)
chr7 (175-263)||(2775344-2775432)
chr7 (64-254)||(10916947-10917137)
chr7 (19-242)||(5127818-5128044)
chr7 (19-225)||(5159348-5159554)
chr7 (79-242)||(11424867-11425033)
chr7 (61-242)||(5147431-5147615)
chr7 (37-149)||(2154417-2154529)
chr7 (85-242)||(45387235-45387395)
chr7 (61-146)||(26435125-26435210)
chr7 (82-149)||(4145310-4145377)
chr7 (82-146)||(11441449-11441513)
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (13-259)||(13522204-13522450)
chr6 (13-259)||(33374387-33374633)
chr6 (14-259)||(28162477-28162722)
chr6 (13-259)||(8892441-8892687)
chr6 (13-259)||(8903676-8903922)
chr6 (22-259)||(22477404-22477644)
chr6 (81-263)||(20160588-20160770)
chr6 (81-263)||(22172061-22172243)
chr6 (175-263)||(14143412-14143500)
chr6 (175-263)||(26787925-26788013)
chr6 (175-263)||(27196298-27196386)
chr6 (175-263)||(27252854-27252942)
chr6 (163-263)||(27290497-27290597)
chr6 (37-254)||(22935016-22935233)
chr6 (37-254)||(23857461-23857678)
chr6 (175-259)||(22457065-22457149)
chr6 (19-242)||(24304766-24304992)
chr6 (37-242)||(13299099-13299307)
chr6 (19-254)||(26918202-26918440)
chr6 (37-254)||(15424453-15424673)
chr6 (37-254)||(26988841-26989061)
chr6 (19-254)||(29549300-29549535)
chr6 (37-242)||(26999913-27000121)
chr6 (38-242)||(16749695-16749902)
chr6 (37-242)||(24863557-24863765)
chr6 (82-242)||(4525174-4525334)
chr6 (19-152)||(29501228-29501361)
chr6 (82-149)||(27044275-27044342)
chr6 (199-254)||(27272716-27272771)
chr6 (94-195)||(27629907-27630008)
chr6 (18-146)||(30558263-30558391)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (13-259)||(13184733-13184979)
chr5 (13-259)||(33877078-33877324)
chr5 (13-259)||(11325625-11325871)
chr5 (13-259)||(13440579-13440825)
chr5 (22-263)||(22888310-22888551)
chr5 (37-263)||(25198884-25199110)
chr5 (37-263)||(23892058-23892287)
chr5 (37-254)||(24969876-24970090)
chr5 (163-263)||(29889163-29889263)
chr5 (37-254)||(30934488-30934705)
chr5 (79-254)||(11549248-11549426)
chr5 (37-254)||(23718078-23718298)
chr5 (37-254)||(23752540-23752760)
chr5 (37-254)||(24688247-24688467)
chr5 (19-242)||(33777321-33777547)
chr5 (37-242)||(22999216-22999424)
chr5 (19-225)||(33292362-33292568)
chr5 (18-242)||(30168302-30168529)
chr5 (82-254)||(34616418-34616590)
chr5 (79-242)||(9548645-9548811)
chr5 (82-225)||(32599591-32599734)
chr5 (82-146)||(31431325-31431389)
chr5 (19-146)||(3789360-3789487)
chr5 (18-146)||(18375613-18375741)
chr5 (82-146)||(18500949-18501013)
chr5 (18-146)||(33516189-33516317)
chr5 (82-146)||(43078146-43078210)
[»] chr3 (44 HSPs)
chr3 (13-259)||(17994013-17994259)
chr3 (13-259)||(4625727-4625973)
chr3 (13-259)||(5652170-5652416)
chr3 (22-263)||(16626731-16626972)
chr3 (22-263)||(18530186-18530421)
chr3 (13-242)||(5713007-5713239)
chr3 (13-242)||(5723917-5724149)
chr3 (13-242)||(5757328-5757560)
chr3 (13-242)||(5768219-5768451)
chr3 (175-263)||(32292697-32292785)
chr3 (175-263)||(31034342-31034430)
chr3 (19-254)||(15892940-15893178)
chr3 (19-254)||(8301501-8301736)
chr3 (37-254)||(18051066-18051286)
chr3 (19-242)||(35880552-35880778)
chr3 (37-263)||(8295779-8296005)
chr3 (19-242)||(22387824-22388047)
chr3 (37-242)||(4796899-4797107)
chr3 (19-225)||(4892999-4893205)
chr3 (20-225)||(32438944-32439149)
chr3 (79-242)||(4721477-4721643)
chr3 (19-242)||(6192102-6192328)
chr3 (19-248)||(18330460-18330687)
chr3 (79-242)||(7073058-7073224)
chr3 (19-149)||(8211527-8211657)
chr3 (37-242)||(18277298-18277506)
chr3 (37-242)||(18292599-18292807)
chr3 (37-242)||(18307900-18308108)
chr3 (37-242)||(29149001-29149209)
chr3 (37-149)||(15741424-15741536)
chr3 (85-242)||(7996414-7996574)
chr3 (85-242)||(10642922-10643082)
chr3 (82-242)||(47023302-47023465)
chr3 (37-149)||(20065850-20065962)
chr3 (85-242)||(28116200-28116363)
chr3 (79-149)||(10395982-10396052)
chr3 (19-152)||(5596705-5596838)
chr3 (61-146)||(29665330-29665415)
chr3 (82-225)||(4346950-4347093)
chr3 (82-149)||(5466834-5466901)
chr3 (82-225)||(28021127-28021270)
chr3 (193-242)||(15741340-15741389)
chr3 (18-254)||(17985190-17985429)
chr3 (82-146)||(11110706-11110770)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (13-259)||(24460793-24461039)
chr4 (22-263)||(15227716-15227957)
chr4 (22-263)||(1900103-1900344)
chr4 (22-263)||(15285112-15285353)
chr4 (22-257)||(14235715-14235953)
chr4 (18-259)||(15391526-15391764)
chr4 (37-254)||(17013858-17014078)
chr4 (19-242)||(24592519-24592742)
chr4 (19-242)||(14664858-14665084)
chr4 (19-225)||(34189182-34189388)
chr4 (20-225)||(24112506-24112711)
chr4 (37-242)||(14763509-14763717)
chr4 (85-242)||(27163522-27163682)
chr4 (19-149)||(54833230-54833360)
chr4 (37-214)||(36344748-36344925)
chr4 (85-242)||(5005776-5005939)
chr4 (79-146)||(6569753-6569820)
chr4 (91-149)||(21969613-21969671)
chr4 (19-120)||(19373101-19373202)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (13-263)||(2842-3092)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (13-263)||(20340519-20340769)
chr1 (22-263)||(16208215-16208453)
chr1 (22-166)||(20460935-20461079)
chr1 (175-263)||(28151845-28151933)
chr1 (187-263)||(20461076-20461152)
chr1 (85-242)||(41793513-41793673)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (22-263)||(20240-20460)
scaffold0124 (37-225)||(30296-30486)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (18-259)||(21391-21629)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (163-263)||(212-312)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (37-254)||(29606-29826)
scaffold0089 (37-254)||(40262-40482)
scaffold0089 (79-254)||(47178-47356)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (37-254)||(27135-27355)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (19-254)||(322-561)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (82-149)||(8120-8187)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (18-146)||(15234-15362)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 15)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 44562923 - 44563169
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44562923 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 44563022  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563023 cgggacaacctcaggtacccgttaatgccgccgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 44563122  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563123 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 44563169  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19659432 - 19659186
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19659432 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 19659333  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19659332 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacaacctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 19659233  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19659232 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 19659186  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 9354444 - 9354690
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9354444 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 9354543  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9354544 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 9354643  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  9354644 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctactcctca 9354690  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22081263 - 22081025
Alignment:
Q  18 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||   |||||||||||||| | | || || |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||    
T  22081263 catcaatgctgctcagctacctccgccgtatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccg 22081167  T
Q  115 ggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctc 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    ||||||||    |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22081166 ggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcagcaacagccgttggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctc 22081070  T
Q  215 tgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
     |||||||||||| || || ||| ||||||||||| | |||||||    
T  22081069 cgataccaatgctgtacgccgagctgctcccgactttgcttctca 22081025  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 263
Target Start/End: Original strand, 16283292 - 16283521
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||| | | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  16283292 cctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcattagtatcctttgccaccaggtcaacctcaggtacccatta 16283391  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagct---caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| |||||||| || | | ||||||||   || | |   ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | |||||    
T  16283392 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgc 16283491  T
Q  234 tgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    ||||||||| |||||| |||| || |||||    
T  16283492 tgagttgcttccgactttactccttagagg 16283521  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 242
Target Start/End: Original strand, 14557470 - 14557675
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  14557470 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacctgtta 14557569  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctga 236  Q
    |||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| |||  | || |||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||    
T  14557570 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccaatgttatatgctga 14557669  T
Q  237 gttgct 242  Q
    ||||||    
T  14557670 gttgct 14557675  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 175 - 259
Target Start/End: Original strand, 33244649 - 33244733
Alignment:
Q  175 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  33244649 caacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgttgaattactcccgactctacttctca 33244733  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 242
Target Start/End: Original strand, 16277397 - 16277605
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16277397 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 16277496  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||    
T  16277497 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgc 16277596  T
Q  234 tgagttgct 242  Q
    |||||||||    
T  16277597 tgagttgct 16277605  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2137631 - 2137411
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || |||||  |||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  2137631 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgtcattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 2137532  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||    
T  2137531 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgc 2137432  T
Q  234 tgagttgctcccgactctact 254  Q
    ||||||||| |||||| ||||    
T  2137431 tgagttgcttccgactttact 2137411  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 254
Target Start/End: Original strand, 19687923 - 19688161
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||  || || |||| | | || ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||    
T  19687923 atcaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattcccagcatcctttctttccgccattctatcaccagtaccctctgccaccgggtc 19688022  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctct 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||    | | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || ||||     
T  19688023 aacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgtcggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctcc 19688122  T
Q  216 gataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctact 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  19688123 gataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttact 19688161  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27609235 - 27609057
Alignment:
Q  79 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 178  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||    
T  27609235 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 27609136  T
Q  179 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctact 254  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  27609135 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttact 27609057  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 242
Target Start/End: Original strand, 18710411 - 18710637
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  18710411 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 18710510  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaa---gctagacctacctttcctct 215  Q
    |||||||||| ||||| |||||  ||||||| || | | ||||||||   || | ||||||||  |||||||| |||   |||||||| || |||||||     
T  18710511 aacctcaggttcccgtcaatgcagttgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcc 18710610  T
Q  216 gataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||    
T  18710611 tataccaatgttgtatgctgagttgct 18710637  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 149
Target Start/End: Original strand, 19286290 - 19286420
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  19286290 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttaccaccgggcc 19286389  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctca 149  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||    
T  19286390 aacctcaggttcctgtcaatgccattgctca 19286420  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31490140 - 31489914
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  || ||| ||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  31490140 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtc 31490041  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctct 215  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| || || | | |||| |||   || | |||||||| ||| |   | || |||||||| ||||| || ||||     
T  31490040 aacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacagcagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctcc 31489941  T
Q  216 gataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31489940 gataccgatgttatatgctgagttgct 31489914  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 149
Target Start/End: Original strand, 31354412 - 31354479
Alignment:
Q  82 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctca 149  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  31354412 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 31354479  T

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Target: chr2 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31891750 - 31891505
Alignment:
Q  14 tggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891750 tggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatc 31891651  T
Q  114 gggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcct 213  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891650 gggacaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcct 31891551  T
Q  214 ctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31891550 ctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 31891505  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 34156829 - 34157075
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34156829 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 34156928  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34156929 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 34157028  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  34157029 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 34157075  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 34303726 - 34303480
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303726 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 34303627  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303626 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgtcgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 34303527  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  34303526 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 34303480  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 3784472 - 3784718
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3784472 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 3784571  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  3784572 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagtagcaacaggctagacctacctttcc 3784671  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  3784672 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 3784718  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 16163417 - 16163663
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16163417 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccat 16163516  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16163517 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 16163616  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16163617 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 16163663  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 27118506 - 27118752
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27118506 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgcatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 27118605  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27118606 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctaccttccc 27118705  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    || |||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27118706 tccgataccgatgttgtatgctgaattactcccgactctacttctca 27118752  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19456835 - 19456598
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19456835 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgcaatactttcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaac 19456736  T
Q  122 ctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 221  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19456735 ctcaggtgcccgttaatgccatcgtttagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgatacc 19456636  T
Q  222 aatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19456635 aatgctatatgccgagttactcccgactctacttctca 19456598  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21703578 - 21703337
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 121  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703578 aatgctgcctagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 21703479  T
Q  122 ctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 221  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||| |||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21703478 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgatacc 21703379  T
Q  222 aatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21703378 aatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagg 21703337  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27434846 - 27434638
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27434846 cctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 27434747  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||    
T  27434746 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgc 27434647  T
Q  234 tgagttgct 242  Q
    |||||||||    
T  27434646 tgagttgct 27434638  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 27392813 - 27392961
Alignment:
Q  18 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| |||   |||||||||||||| | | || || |||||||||||||| ||||||||    ||  |||||    
T  27392813 catcgatgctgctcagctacctccaccgtaccagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccgggt 27392912  T
Q  118 caacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagc 166  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27392913 caacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagc 27392961  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23128968 - 23128748
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23128968 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 23128869  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||    
T  23128868 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgc 23128769  T
Q  234 tgagttgctcccgactctact 254  Q
    ||||||||| |||||| ||||    
T  23128768 tgagttgcttccgactttact 23128748  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 242
Target Start/End: Original strand, 12655381 - 12655589
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  12655381 cctccgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 12655480  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||    
T  12655481 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgc 12655580  T
Q  234 tgagttgct 242  Q
    |||||||||    
T  12655581 tgagttgct 12655589  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 242
Target Start/End: Original strand, 28882053 - 28882261
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28882053 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 28882152  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||    
T  28882153 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgc 28882252  T
Q  234 tgagttgct 242  Q
    |||||||||    
T  28882253 tgagttgct 28882261  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 242
Target Start/End: Original strand, 20837759 - 20837965
Alignment:
Q  39 tccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaat 138  Q
    |||||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20837759 tccgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 20837858  T
Q  139 gccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctg 235  Q
    || || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||    
T  20837859 gcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctg 20837958  T
Q  236 agttgct 242  Q
    |||||||    
T  20837959 agttgct 20837965  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 37925377 - 37925540
Alignment:
Q  82 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaac 181  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || | | ||||||||   || | ||||||||    
T  37925377 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaac 37925476  T
Q  182 gacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
     ||| |   | || |||||||| ||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  37925477 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgct 37925540  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11635543 - 11635380
Alignment:
Q  85 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgac 184  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || | | ||||||||   || | |||||||| ||    
T  11635543 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 11635444  T
Q  185 agcagcaa------caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    | || |||      |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11635443 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 11635380  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13936904 - 13936738
Alignment:
Q  79 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 178  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || | | |||||||||  || | |||||    
T  13936904 tttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagctgccggttcaac 13936805  T
Q  179 aacgacagca---gcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    ||| ||||||    || ||||| |||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13936804 aacaacagcaaagtcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 13936738  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 242
Target Start/End: Original strand, 34279330 - 34279496
Alignment:
Q  79 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 178  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||    
T  34279330 tttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaac 34279429  T
Q  179 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  34279430 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 34279496  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Original strand, 32049685 - 32049845
Alignment:
Q  85 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgac 184  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||||| ||    
T  32049685 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 32049784  T
Q  185 agc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    | |   | || |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  32049785 aacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 32049845  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11641732 - 11641569
Alignment:
Q  85 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgac 184  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || | | ||||||||   || | |||||||| ||    
T  11641732 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 11641633  T
Q  185 agcagcaa------caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    | || |||      |||||||||||||| || |||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  11641632 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgatacagatgttatatgctgagttgct 11641569  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21677542 - 21677376
Alignment:
Q  79 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 178  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || | | ||||||||   || | |||||    
T  21677542 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaac 21677443  T
Q  179 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    ||| ||| |   | || |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21677442 aacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 21677376  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 259
Target Start/End: Original strand, 27392964 - 27393033
Alignment:
Q  190 caacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| | |||||||    
T  27392964 caacaaaccagacctacctttcctccgataccaatgatgtatgccgagctgctcccgactttgcttctca 27393033  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 261122 - 261009
Alignment:
Q  82 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaac 181  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || | | ||||||||   |||| ||||||||    
T  261122 ccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaac 261023  T
Q  182 gacagcagcaacaa 195  Q
     ||| || ||||||    
T  261022 aacaacaacaacaa 261009  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 149
Target Start/End: Original strand, 37375000 - 37375112
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  |||||||||| | | || || || || || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |    
T  37375000 cctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccgccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtca 37375099  T
Q  137 atgccattgctca 149  Q
    ||| ||| |||||    
T  37375100 atgtcatcgctca 37375112  T

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Target: chr7 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 21)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31088784 - 31088538
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088784 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 31088685  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31088684 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 31088585  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31088584 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 31088538  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 45733283 - 45733529
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45733283 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 45733382  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45733383 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 45733482  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||   |||||||||||||    
T  45733483 tctgataccaatgttatatgctgaattactcttaactctacttctca 45733529  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16450309 - 16450068
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16450309 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtacgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattttatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 16450210  T
Q  122 ctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 221  Q
    ||||||||||| |||||||| | | |||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16450209 ctcaggtacccattaatgccgtcgttcagcaagtgcaacaacagccaccagctcaacagcaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgatacc 16450110  T
Q  222 aatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16450109 aatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagg 16450068  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 263
Target Start/End: Original strand, 16041155 - 16041396
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16041155 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgtcatcgggtcaac 16041254  T
Q  122 ctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 221  Q
    ||||||||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16041255 ctcaggtacccgttaattccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgatacc 16041354  T
Q  222 aatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16041355 aatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagg 16041396  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 175 - 263
Target Start/End: Original strand, 26484679 - 26484767
Alignment:
Q  175 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484679 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 26484767  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 175 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 2109163 - 2109075
Alignment:
Q  175 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2109163 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 2109075  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 175 - 263
Target Start/End: Original strand, 18540784 - 18540872
Alignment:
Q  175 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18540784 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacttttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 18540872  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 175 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39211181 - 39211093
Alignment:
Q  175 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39211181 caacaacgaccgcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 39211093  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16503679 - 16503459
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  |||||||||| | | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16503679 cctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtta 16503580  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| |||||||| || | | |||||||||  || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||    
T  16503579 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagctgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgc 16503480  T
Q  234 tgagttgctcccgactctact 254  Q
    ||||||||| |||||| ||||    
T  16503479 tgagttgcttccgactttact 16503459  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16518715 - 16518495
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  |||||||||| | | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16518715 cctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtta 16518616  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| |||||||| || | | |||||||||  || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||    
T  16518615 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagctgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgc 16518516  T
Q  234 tgagttgctcccgactctact 254  Q
    ||||||||| |||||| ||||    
T  16518515 tgagttgcttccgactttact 16518495  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 175 - 263
Target Start/End: Original strand, 2775344 - 2775432
Alignment:
Q  175 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2775344 caacaacgacagtagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagtagctcccgactctacttctcagagg 2775432  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10917137 - 10916947
Alignment:
Q  64 tctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaac 163  Q
    ||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || | | ||||||    
T  10917137 tctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtatcctctgccaccgggtcaacctcaagtacctgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 10917038  T
Q  164 agcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctact 254  Q
    ||   |||| |||||||| |||  | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  10917037 agttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttact 10916947  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 242
Target Start/End: Original strand, 5127818 - 5128044
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5127818 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtatcctctgccaccgggtc 5127917  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctct 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| |||||||     
T  5127918 aacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcc 5128017  T
Q  216 gataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  5128018 gataccgatgttgtatgctgagttgct 5128044  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 5159348 - 5159554
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||| |  |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  5159348 atcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 5159447  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgat 218  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||| || || |||| |||||| |  ||||||||| | |||||||| || |||||||  ||    
T  5159448 aacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctat 5159547  T
Q  219 accaatg 225  Q
    |||||||    
T  5159548 accaatg 5159554  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11425033 - 11424867
Alignment:
Q  79 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 178  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||    
T  11425033 tttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 11424934  T
Q  179 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11424933 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 11424867  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5147615 - 5147431
Alignment:
Q  61 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaac 160  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || | | |||    
T  5147615 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaac 5147516  T
Q  161 aacagcctccagctcaacaacgacagcag---caacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    |||||   ||   |||||||| ||| ||    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5147515 aacagatgccgattcaacaacaacaacaaaatcaacaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgct 5147431  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 149
Target Start/End: Original strand, 2154417 - 2154529
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  2154417 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtatccgtta 2154516  T
Q  137 atgccattgctca 149  Q
    |||| ||||||||    
T  2154517 atgcaattgctca 2154529  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Original strand, 45387235 - 45387395
Alignment:
Q  85 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgac 184  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || | | ||||||||   || | |||||||| ||    
T  45387235 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 45387334  T
Q  185 agc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    | |   | || |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  45387335 aacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 45387395  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 146
Target Start/End: Original strand, 26435125 - 26435210
Alignment:
Q  61 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgc 146  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  26435125 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 26435210  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 4145377 - 4145310
Alignment:
Q  82 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctca 149  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  4145377 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 4145310  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 11441449 - 11441513
Alignment:
Q  82 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgc 146  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  11441449 ccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 11441513  T

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Target: chr6 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13522450 - 13522204
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522450 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 13522351  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13522350 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 13522251  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13522250 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 13522204  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33374633 - 33374387
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374633 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 33374534  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33374533 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 33374434  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  33374433 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 33374387  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Original strand, 28162477 - 28162722
Alignment:
Q  14 tggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatc 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162477 tggacatcaatgctgctcagctacctccatcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatc 28162576  T
Q  114 gggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcct 213  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162577 gggacaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcct 28162676  T
Q  214 ctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  28162677 ctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 28162722  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8892687 - 8892441
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  8892687 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtattctttgccat 8892588  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8892587 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 8892488  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8892487 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 8892441  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8903922 - 8903676
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8903922 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatctcttctttccaccattctatcatcagtattctttgccat 8903823  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8903822 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 8903723  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8903722 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 8903676  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22477644 - 22477404
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22477644 aatgctgcccaattacctctgtcgtacccgtatgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattctatcattagtatcctttgccatcgggtcaac 22477545  T
Q  122 ctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagct---caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgat 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| | || | |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22477544 ctcaggtacccgttaatgcaattgctcaacaaatgcaacaacagtcaccggttcaacaacaacgacaacagcaacaagctagacctacctttcctctgat 22477445  T
Q  219 accaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22477444 accaatgatgtatgccgagttactcccgactctacttctca 22477404  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 263
Target Start/End: Original strand, 20160588 - 20160770
Alignment:
Q  81 tccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaa 180  Q
    ||||||||| || |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  20160588 tccaccattttaccatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaaaacagcaacagccaccagctcaacaa 20160687  T
Q  181 cgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||    
T  20160688 caacaacagcaacaaactagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagg 20160770  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22172243 - 22172061
Alignment:
Q  81 tccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaa 180  Q
    ||||||||| || |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  22172243 tccaccattttaccatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaaaacagcaacagccaccagctcaacaa 22172144  T
Q  181 cgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||    
T  22172143 caacaacagcaacaaactagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagg 22172061  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 175 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14143500 - 14143412
Alignment:
Q  175 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14143500 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 14143412  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 175 - 263
Target Start/End: Original strand, 26787925 - 26788013
Alignment:
Q  175 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26787925 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 26788013  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 175 - 263
Target Start/End: Original strand, 27196298 - 27196386
Alignment:
Q  175 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27196298 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 27196386  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 175 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27252942 - 27252854
Alignment:
Q  175 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27252942 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 27252854  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 163 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27290597 - 27290497
Alignment:
Q  163 cagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagag 262  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290597 cagccaccggctcaacaacgacagcagcaataagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgagttgctcccgactctacttctcagag 27290498  T
Q  263 g 263  Q
    |    
T  27290497 g 27290497  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22935233 - 22935016
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || ||||| | | |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  22935233 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcccttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtca 22935134  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctga 236  Q
    |||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||||| |||  | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||    
T  22935133 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctga 22935034  T
Q  237 gttgctcccgactctact 254  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  22935033 gttgcttccgactttact 22935016  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23857678 - 23857461
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || ||||| | | |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  23857678 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcccttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtca 23857579  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctga 236  Q
    |||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||||| |||  | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||    
T  23857578 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctga 23857479  T
Q  237 gttgctcccgactctact 254  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  23857478 gttgcttccgactttact 23857461  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 175 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22457149 - 22457065
Alignment:
Q  175 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22457149 caacaacgacaacagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccgactctacttctca 22457065  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24304992 - 24304766
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  24304992 atcaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 24304893  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctct 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||  ||||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || ||||     
T  24304892 aacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagtttccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctcc 24304793  T
Q  216 gataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24304792 gataccgatgttatatgctgagttgct 24304766  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13299307 - 13299099
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13299307 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 13299208  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||    
T  13299207 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgc 13299108  T
Q  234 tgagttgct 242  Q
    |||||||||    
T  13299107 tgagttgct 13299099  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 254
Target Start/End: Original strand, 26918202 - 26918440
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  26918202 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 26918301  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctct 215  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||   || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || ||||     
T  26918302 aacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagacgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctcc 26918401  T
Q  216 gataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctact 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  26918402 gataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttact 26918440  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15424673 - 15424453
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15424673 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 15424574  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagct---caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |   ||||||| |||  | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||    
T  15424573 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttgaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgc 15424474  T
Q  234 tgagttgctcccgactctact 254  Q
    ||||||||| |||||| ||||    
T  15424473 tgagttgcttccgactttact 15424453  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Original strand, 26988841 - 26989061
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26988841 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 26988940  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaa---cgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||   | |||  | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||    
T  26988941 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacatcaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgc 26989040  T
Q  234 tgagttgctcccgactctact 254  Q
    ||||||||| |||||| ||||    
T  26989041 tgagttgcttccgactttact 26989061  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 254
Target Start/End: Original strand, 29549300 - 29549535
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  29549300 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 29549399  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgat 218  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||| || || |||| ||||||||  ||||||||| | |||||||| || |||||||  ||    
T  29549400 aacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacaacagcagcagcaatacgctagaccaacttttcctcctat 29549499  T
Q  219 accaatgctatatgctgagttgctcccgactctact 254  Q
    ||||||| | ||||| ||| | || || ||||||||    
T  29549500 accaatgttgtatgcagagcttcttccaactctact 29549535  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 242
Target Start/End: Original strand, 26999913 - 27000121
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26999913 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 27000012  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||    
T  27000013 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgc 27000112  T
Q  234 tgagttgct 242  Q
    |||||||||    
T  27000113 tgagttgct 27000121  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 242
Target Start/End: Original strand, 16749695 - 16749902
Alignment:
Q  38 ctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaa 137  Q
    ||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16749695 ctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 16749794  T
Q  138 tgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgct 234  Q
    ||| || ||||| || | | ||||||||   || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||    
T  16749795 tgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgct 16749894  T
Q  235 gagttgct 242  Q
    ||||||||    
T  16749895 gagttgct 16749902  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 242
Target Start/End: Original strand, 24863557 - 24863765
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| || ||||||| || ||||||||||    
T  24863557 cctccgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctaccaccgagtcaaccccaagtacccgtta 24863656  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||    
T  24863657 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgc 24863756  T
Q  234 tgagttgct 242  Q
    |||||||||    
T  24863757 tgagttgct 24863765  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 4525174 - 4525334
Alignment:
Q  82 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaac 181  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||    ||||| || || |||| |||||| |    
T  4525174 ccaccgttttatcatcagtatcctttgccaccaggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagc 4525273  T
Q  182 gacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
      ||||||||  |  ||||||| || |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  4525274 agcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgct 4525334  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 152
Target Start/End: Original strand, 29501228 - 29501361
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||||||||| |||  ||  || ||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| | || |    
T  29501228 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtacccatatatgccgtattctcagcatccattcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggcc 29501327  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctcagca 152  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  29501328 aacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcagca 29501361  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 149
Target Start/End: Original strand, 27044275 - 27044342
Alignment:
Q  82 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctca 149  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  27044275 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 27044342  T

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Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27272771 - 27272716
Alignment:
Q  199 agacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctact 254  Q
    |||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27272771 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactctact 27272716  T

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Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27630008 - 27629907
Alignment:
Q  94 catcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaac 193  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||  || || | || |||||| || |||| ||| |||| ||| |||||||    
T  27630008 catcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcaacagaagccacaacaaccaccagttcagcaacaacaacagcaac 27629909  T
Q  194 aa 195  Q
    ||    
T  27629908 aa 27629907  T

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Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 30558391 - 30558263
Alignment:
Q  18 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 117  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  || ||| ||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||     
T  30558391 catcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggc 30558292  T
Q  118 caacctcaggtacccgttaatgccattgc 146  Q
    || ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  30558291 cagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 30558263  T

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Target: chr5 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13184979 - 13184733
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184979 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 13184880  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13184879 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 13184780  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13184779 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 13184733  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 33877078 - 33877324
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877078 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 33877177  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33877178 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 33877277  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  33877278 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 33877324  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 11325625 - 11325871
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11325625 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 11325724  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11325725 tgggacaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 11325824  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  11325825 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 11325871  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13440825 - 13440579
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440825 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 13440726  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13440725 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 13440626  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  13440625 tctgataccaatgttatatgctaaattactcccgactctacttctca 13440579  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 263
Target Start/End: Original strand, 22888310 - 22888551
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888310 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 22888409  T
Q  122 ctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 221  Q
    |||||||| ||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22888410 ctcaggtaaccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgatacc 22888509  T
Q  222 aatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22888510 aatgttgtatgctgagttactcccgactctatttctcagagg 22888551  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 263
Target Start/End: Original strand, 25198884 - 25199110
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25198884 cctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtactcgtta 25198983  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctga 236  Q
    | ||| | | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||    
T  25198984 acgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttttctccgataccaatgttgtatgccga 25199083  T
Q  237 gttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25199084 gttactcccgactctacttctcagagg 25199110  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 263
Target Start/End: Original strand, 23892058 - 23892287
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||| | | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23892058 cctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaacattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtca 23892157  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagct---caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||| || | |   ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||    
T  23892158 atgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatcatgtatgc 23892257  T
Q  234 tgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23892258 cgagttgcttccgactctacttctcagagg 23892287  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Original strand, 24969876 - 24970090
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||||||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24969876 cctccgtcgtacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtta 24969975  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctga 236  Q
    |||| |||||||| || | | |||||||||  || | ||||||   ||| || ||||||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||||||    
T  24969976 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagctgccggttcaaca---acaacatcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctga 24970072  T
Q  237 gttgctcccgactctact 254  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  24970073 gttgcttccgactttact 24970090  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29889263 - 29889163
Alignment:
Q  163 cagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagag 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  29889263 cagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgctgagctactcccaactctacttctcagag 29889164  T
Q  263 g 263  Q
    |    
T  29889163 g 29889163  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Original strand, 30934488 - 30934705
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  30934488 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 30934587  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctga 236  Q
    |||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| |||  | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||    
T  30934588 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctga 30934687  T
Q  237 gttgctcccgactctact 254  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  30934688 gttgcttccgactttact 30934705  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 254
Target Start/End: Original strand, 11549248 - 11549426
Alignment:
Q  79 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||    
T  11549248 tttccaccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 11549347  T
Q  179 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctact 254  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11549348 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttact 11549426  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23718298 - 23718078
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23718298 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 23718199  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||    
T  23718198 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgc 23718099  T
Q  234 tgagttgctcccgactctact 254  Q
    ||||||||| |||||| ||||    
T  23718098 tgagttgcttccgactttact 23718078  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23752760 - 23752540
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23752760 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 23752661  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||    
T  23752660 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgc 23752561  T
Q  234 tgagttgctcccgactctact 254  Q
    ||||||||| |||||| ||||    
T  23752560 tgagttgcttccgactttact 23752540  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24688467 - 24688247
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || ||||| | | | || ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24688467 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 24688368  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    || | |||||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||  | |||||    
T  24688367 atacaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatattgtatgc 24688268  T
Q  234 tgagttgctcccgactctact 254  Q
    ||||||||| |||||| ||||    
T  24688267 tgagttgcttccgactttact 24688247  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 242
Target Start/End: Original strand, 33777321 - 33777547
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  33777321 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 33777420  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctct 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || ||||     
T  33777421 aacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctcc 33777520  T
Q  216 gataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  33777521 gataccgatgttgtatgctgagttgct 33777547  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22999424 - 22999216
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  22999424 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccgccgggtcaacctcaagtacccgtta 22999325  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||    
T  22999324 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgc 22999225  T
Q  234 tgagttgct 242  Q
    |||||||||    
T  22999224 tgagttgct 22999216  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 33292362 - 33292568
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||| |  |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  33292362 atcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 33292461  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgat 218  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||| || || |||| |||||| |  ||||| ||| | |||||||| || |||||||  ||    
T  33292462 aacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcaacaatatgctagaccaacttttcctcctat 33292561  T
Q  219 accaatg 225  Q
    |||||||    
T  33292562 accaatg 33292568  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Original strand, 30168302 - 30168529
Alignment:
Q  18 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 117  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  || ||| ||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  30168302 catcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggt 30168401  T
Q  118 caacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctc 214  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| || || | | ||||||||   || | |||||||| ||| |   | || |||||||| ||||| || ||||    
T  30168402 caacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctc 30168501  T
Q  215 tgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30168502 cgataccgatgttatatgctgagttgct 30168529  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 254
Target Start/End: Original strand, 34616418 - 34616590
Alignment:
Q  82 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaac 181  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| | ||  |||||||||| || || |||||||| ||||| ||    ||||| || || |||| |||||| |    
T  34616418 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggctaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagc 34616517  T
Q  182 gacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctact 254  Q
      ||||||||| | |||||||| || |||||||  ||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||    
T  34616518 agcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctact 34616590  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9548811 - 9548645
Alignment:
Q  79 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 178  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || | | ||||||||   ||   |||||    
T  9548811 tttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccgattcaac 9548712  T
Q  179 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  9548711 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgct 9548645  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32599734 - 32599591
Alignment:
Q  82 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaac 181  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||    ||||| || || |||| |||||| |    
T  32599734 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcagcaggtacaacatcaaccgccagttcaacagc 32599635  T
Q  182 gacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatg 225  Q
      ||||||||| | |||||||| || |||||||  |||||||||    
T  32599634 agcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatg 32599591  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 31431325 - 31431389
Alignment:
Q  82 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgc 146  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  31431325 ccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 31431389  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 146
Target Start/End: Original strand, 3789360 - 3789487
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  3789360 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 3789459  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgc 146  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  3789460 agcctcaggtgcccgtcaatgcaattgc 3789487  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 18375741 - 18375613
Alignment:
Q  18 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 117  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  || ||| ||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||     
T  18375741 catcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggc 18375642  T
Q  118 caacctcaggtacccgttaatgccattgc 146  Q
    || ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  18375641 cagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 18375613  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 18501013 - 18500949
Alignment:
Q  82 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgc 146  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  18501013 ccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 18500949  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Original strand, 33516189 - 33516317
Alignment:
Q  18 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 117  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  || ||| ||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||     
T  33516189 catcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggc 33516288  T
Q  118 caacctcaggtacccgttaatgccattgc 146  Q
    || ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  33516289 cagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 33516317  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 43078146 - 43078210
Alignment:
Q  82 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgc 146  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  43078146 ccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 43078210  T

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Target: chr3 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17994259 - 17994013
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17994259 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 17994160  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17994159 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 17994060  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17994059 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 17994013  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 4625727 - 4625973
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4625727 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtatcctttgccat 4625826  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4625827 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgtcgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 4625926  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4625927 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 4625973  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 5652170 - 5652416
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5652170 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcgtttgcaat 5652269  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5652270 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 5652369  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  5652370 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctactcctca 5652416  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16626972 - 16626731
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16626972 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtatgcacaatactctcagcatcccttctttccaccgttctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaac 16626873  T
Q  122 ctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 221  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16626872 ctccggtacccgttaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgatacc 16626773  T
Q  222 aatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    |||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  16626772 aatgatatatgtcgagttactccctactctacttcttagagg 16626731  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 263
Target Start/End: Original strand, 18530186 - 18530421
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  18530186 aatgctgcccagttacctccatcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaac 18530285  T
Q  122 ctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 221  Q
    |||| || |||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18530286 ctcaagtgcccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctca------acagcagcaacaagctagacctacctttcctccgatacc 18530379  T
Q  222 aatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    |||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18530380 aatgttgtatgctgagttactcctgactctacttctcagagg 18530421  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 242
Target Start/End: Original strand, 5713007 - 5713239
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  5713007 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccac 5713106  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctt 209  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| || || || || | | ||||||||   || | |||||||| ||| |   | || ||||| |||||||| ||    
T  5713107 cgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctacttt 5713206  T
Q  210 tcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
     |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5713207 ccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 5713239  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 242
Target Start/End: Original strand, 5723917 - 5724149
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  5723917 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccac 5724016  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctt 209  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| || || || || | | ||||||||   || | |||||||| ||| |   | || ||||| |||||||| ||    
T  5724017 cgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctacttt 5724116  T
Q  210 tcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
     |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5724117 ccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 5724149  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5757560 - 5757328
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  5757560 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccac 5757461  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctt 209  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| || || || || | | ||||||||   || | |||||||| ||| |   | || ||||| |||||||| ||    
T  5757460 cgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctacttt 5757361  T
Q  210 tcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
     |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5757360 ccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 5757328  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5768451 - 5768219
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  5768451 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccac 5768352  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctt 209  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| || || || || | | ||||||||   || | |||||||| ||| |   | || ||||| |||||||| ||    
T  5768351 cgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctacttt 5768252  T
Q  210 tcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
     |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5768251 ccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 5768219  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 175 - 263
Target Start/End: Original strand, 32292697 - 32292785
Alignment:
Q  175 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32292697 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 32292785  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 175 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31034430 - 31034342
Alignment:
Q  175 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31034430 caacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 31034342  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15893178 - 15892940
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||  |||||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15893178 atcaatgctgcccaaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgcccttctatcatcagtaccctttgccaccgggtc 15893079  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagct---caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctct 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||   || | |   ||||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||     
T  15893078 aacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctactttccctcc 15892979  T
Q  216 gataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctact 254  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  15892978 gataccaatgttgtatgctgagttgcttccgactttact 15892940  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8301736 - 8301501
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  8301736 atcaatgctgcccaaatgcctccgtcgtactcatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtc 8301637  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgat 218  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| |||  | || |||||||||||||| || |||| |||    
T  8301636 aacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgat 8301537  T
Q  219 accaatgctatatgctgagttgctcccgactctact 254  Q
    ||| ||| | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  8301536 accgatgttgtatgctgagttgcttccgactttact 8301501  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Original strand, 18051066 - 18051286
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || ||||| | | | || ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18051066 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 18051165  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||    
T  18051166 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgc 18051265  T
Q  234 tgagttgctcccgactctact 254  Q
    ||||||||| |||||| ||||    
T  18051266 tgagttgcttccgactttact 18051286  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 242
Target Start/End: Original strand, 35880552 - 35880778
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  35880552 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 35880651  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctct 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || ||||     
T  35880652 aacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctcc 35880751  T
Q  216 gataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35880752 gataccgatgttatatgctgagttgct 35880778  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 263
Target Start/End: Original strand, 8295779 - 8296005
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  8295779 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgtcaccgggtcaacctcaagtacctgtta 8295878  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctga 236  Q
    |||| || ||||| || | | ||||||||   |||  |||||||| |||  | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||||||    
T  8295879 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccaattcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctga 8295978  T
Q  237 gttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    |||||| |||||| |||| | ||||||    
T  8295979 gttgcttccgactttactccacagagg 8296005  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22388047 - 22387824
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||| | ||||||||||| | | || || ||| | || ||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  22388047 atcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccatactctcagcatccgttcttcccatcgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 22387948  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgat 218  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||| || || |||| |||||| |  ||||| ||| | |||||||| || |||||||  ||    
T  22387947 aacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcaacaatatgctagaccgacttttcctcctat 22387848  T
Q  219 accaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||    
T  22387847 accaatgttgtatgcagagttgct 22387824  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4797107 - 4796899
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  4797107 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 4797008  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||    
T  4797007 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgc 4796908  T
Q  234 tgagttgct 242  Q
    |||||||||    
T  4796907 tgagttgct 4796899  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 4892999 - 4893205
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||| |  |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  4892999 atcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 4893098  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgat 218  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||| || || |||| |||||| |  ||||||||| | |||||||| || |||||||  ||    
T  4893099 aacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctat 4893198  T
Q  219 accaatg 225  Q
    |||||||    
T  4893199 accaatg 4893205  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Original strand, 32438944 - 32439149
Alignment:
Q  20 tcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtca 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||| |  |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  32438944 tcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcca 32439043  T
Q  120 acctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgata 219  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||| || || |||| |||||| |  ||||||||| | |||||||| || |||||||  |||    
T  32439044 acctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctata 32439143  T
Q  220 ccaatg 225  Q
    ||||||    
T  32439144 ccaatg 32439149  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 242
Target Start/End: Original strand, 4721477 - 4721643
Alignment:
Q  79 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 178  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |   ||||||||   |||| |||||    
T  4721477 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagataaaacaacagttgccagttcaac 4721576  T
Q  179 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4721577 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 4721643  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 242
Target Start/End: Original strand, 6192102 - 6192328
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| | | || ||| | ||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||    
T  6192102 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttcttttcgccattttatcattagtaccctctgccaccgggtc 6192201  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctct 215  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || ||||     
T  6192202 aacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctcc 6192301  T
Q  216 gataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6192302 gataccgatgttatatgctgagttgct 6192328  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 248
Target Start/End: Original strand, 18330460 - 18330687
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| | | || ||||||||||| |||||||     ||| ||||| ||||||    
T  18330460 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccaccattttatcatc-----cctctgccaccgggtc 18330554  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcag---caacaagctagacctacctttcctct 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| ||    || |||||||||||||| || ||||     
T  18330555 aacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctcc 18330654  T
Q  216 gataccaatgctatatgctgagttgctcccgac 248  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  18330655 gataccgatgttatatgctgagttgcttccgac 18330687  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 242
Target Start/End: Original strand, 7073058 - 7073224
Alignment:
Q  79 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 178  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||    
T  7073058 tttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaac 7073157  T
Q  179 aacgacagcag---caacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    ||| ||| ||    || |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7073158 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgct 7073224  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 149
Target Start/End: Original strand, 8211527 - 8211657
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||||||  |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  8211527 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 8211626  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctca 149  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||    
T  8211627 aacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 8211657  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18277506 - 18277298
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |    
T  18277506 cctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtca 18277407  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    ||||||| ||||| ||   |||||| || |  || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||    
T  18277406 atgccatcgctcaacaggtgcaacatcaactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgc 18277307  T
Q  234 tgagttgct 242  Q
    |||||||||    
T  18277306 tgagttgct 18277298  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18292807 - 18292599
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |    
T  18292807 cctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtca 18292708  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    ||||||| ||||| ||   |||||| || |  || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||    
T  18292707 atgccatcgctcaacaggtgcaacatcaactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgc 18292608  T
Q  234 tgagttgct 242  Q
    |||||||||    
T  18292607 tgagttgct 18292599  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18308108 - 18307900
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |    
T  18308108 cctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtca 18308009  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    ||||||| ||||| ||   |||||| || |  || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||    
T  18308008 atgccatcgctcaacaggtgcaacatcaactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgc 18307909  T
Q  234 tgagttgct 242  Q
    |||||||||    
T  18307908 tgagttgct 18307900  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29149209 - 29149001
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  29149209 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtta 29149110  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| || ||||| || | | ||||||||   || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||    
T  29149109 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgc 29149010  T
Q  234 tgagttgct 242  Q
    |||||||||    
T  29149009 tgagttgct 29149001  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15741536 - 15741424
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15741536 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 15741437  T
Q  137 atgccattgctca 149  Q
    |||| || |||||    
T  15741436 atgcaatcgctca 15741424  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Original strand, 7996414 - 7996574
Alignment:
Q  85 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgac 184  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||||| ||    
T  7996414 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 7996513  T
Q  185 agc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    | |   | || |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7996514 aacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 7996574  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Original strand, 10642922 - 10643082
Alignment:
Q  85 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgac 184  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||||| ||    
T  10642922 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 10643021  T
Q  185 agc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    | |   | || |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10643022 aacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 10643082  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 47023302 - 47023465
Alignment:
Q  82 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaac 181  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | | ||||||||   || | ||||||||    
T  47023302 ccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaggtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaac 47023401  T
Q  182 gacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
     ||| |   | || |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  47023402 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 47023465  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 149
Target Start/End: Original strand, 20065850 - 20065962
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |    
T  20065850 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtca 20065949  T
Q  137 atgccattgctca 149  Q
    ||||||| |||||    
T  20065950 atgccatcgctca 20065962  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28116363 - 28116200
Alignment:
Q  85 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgac 184  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || | | ||||||||   || | |||||||| ||    
T  28116363 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 28116264  T
Q  185 agcagcaa------caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    | || |||      |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  28116263 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgct 28116200  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 149
Target Start/End: Original strand, 10395982 - 10396052
Alignment:
Q  79 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctca 149  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  10395982 tttccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 10396052  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 5596838 - 5596705
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||||||||| |||  ||  || ||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| | || |    
T  5596838 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtacccatatatgccgtattctcagcatccattcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggcc 5596739  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctcagca 152  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  5596738 aacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcagca 5596705  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 29665415 - 29665330
Alignment:
Q  61 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgc 146  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  29665415 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 29665330  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4347093 - 4346950
Alignment:
Q  82 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaac 181  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||    ||||| || || |||| |||||| |    
T  4347093 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagc 4346994  T
Q  182 gacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatg 225  Q
      ||||||||| | |||||||| || |||||||  |||||||||    
T  4346993 agcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatg 4346950  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 149
Target Start/End: Original strand, 5466834 - 5466901
Alignment:
Q  82 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctca 149  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  5466834 ccaccattttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 5466901  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Original strand, 28021127 - 28021270
Alignment:
Q  82 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaac 181  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||    ||||| || || |||| |||||| |    
T  28021127 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagc 28021226  T
Q  182 gacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatg 225  Q
      ||||||||| | |||||||| || |||||||  |||||||||    
T  28021227 agcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatg 28021270  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15741389 - 15741340
Alignment:
Q  193 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15741389 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 15741340  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17985429 - 17985190
Alignment:
Q  18 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 117  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  || ||| ||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||     
T  17985429 catcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggc 17985330  T
Q  118 caacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctc 214  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| || || | | ||||||||   || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| |||||||    
T  17985329 cagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctc 17985230  T
Q  215 tgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctact 254  Q
      ||||||||| | ||||| ||| | || || ||||||||    
T  17985229 ctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctact 17985190  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 11110770 - 11110706
Alignment:
Q  82 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgc 146  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  11110770 ccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 11110706  T

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Target: chr4 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24461039 - 24460793
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24461039 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccat 24460940  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24460939 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 24460840  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24460839 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 24460793  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 263
Target Start/End: Original strand, 15227716 - 15227957
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15227716 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaac 15227815  T
Q  122 ctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 221  Q
    |||||||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15227816 ctcaggtacccgttaatgctgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgatacc 15227915  T
Q  222 aatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15227916 aatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagg 15227957  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 263
Target Start/End: Original strand, 1900103 - 1900344
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900103 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 1900202  T
Q  122 ctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 221  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| |||| |||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1900203 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacatcaacaagctagacctacctttcctccgatacc 1900302  T
Q  222 aatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1900303 aatgctgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagg 1900344  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15285353 - 15285112
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15285353 aatgctgcccagttacctccattgtacccatatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaac 15285254  T
Q  122 ctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 221  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15285253 ctcaggtgcccgttaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccaactcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgatacc 15285154  T
Q  222 aatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    ||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15285153 aatgctatatttcgagttactcccgactctacttctcagagg 15285112  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14235953 - 14235715
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||| ||||  |||||||||||||| | | || || |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |    
T  14235953 aatgctgctcagttacctctgccgtaccagtatatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcatcagtaccctctaccatcgggtcacc 14235854  T
Q  122 ctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagca---acaagctagacctacctttcctctgat 218  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  14235853 cataggtacccgttaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgccggctcagcaacaacagcagcaacaacaagctagacctacctttcctctgat 14235754  T
Q  219 accaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttct 257  Q
    ||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  14235753 accaatgttgtatgccgagctgctcccgactctgcttct 14235715  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15391764 - 15391526
Alignment:
Q  18 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| | |||   |||||||||||||| | | || || |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||    
T  15391764 catcaatgttgctcagctacctccgccgtatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccg 15391668  T
Q  115 ggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctc 214  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15391667 ggtcaacctcaggtacccatcaatgccattgctcagcaaatgcagcaacagccgctggctcaaca---acagcagcaacaaaccagacctacctttcctc 15391571  T
Q  215 tgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
     |||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||    
T  15391570 cgataccaatgctgtacgccgagttgctcccgactttgcttctca 15391526  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Original strand, 17013858 - 17014078
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    ||||| || ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  17013858 cctccttcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 17013957  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| |||||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||    
T  17013958 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgc 17014057  T
Q  234 tgagttgctcccgactctact 254  Q
    ||||||||| |||||| ||||    
T  17014058 tgagttgcttccgactttact 17014078  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24592742 - 24592519
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  24592742 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 24592643  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgat 218  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   || | |||||||| |||  | || |||||||||||||| || |||| |||    
T  24592642 aacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgat 24592543  T
Q  219 accaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||    
T  24592542 accgatgttgtatgctgagttgct 24592519  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 242
Target Start/End: Original strand, 14664858 - 14665084
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||| |  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  14664858 atcaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcaccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 14664957  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctct 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || ||||     
T  14664958 aacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctcc 14665057  T
Q  216 gataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  14665058 gataccgatgttgtatgctgagttgct 14665084  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34189388 - 34189182
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||| |  |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  34189388 atcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 34189289  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgat 218  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||| || || |||| |||||| |  ||||||||| | |||||||| || |||||||  ||    
T  34189288 aacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctat 34189189  T
Q  219 accaatg 225  Q
    |||||||    
T  34189188 accaatg 34189182  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Original strand, 24112506 - 24112711
Alignment:
Q  20 tcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtca 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||| |  |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  24112506 tcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcca 24112605  T
Q  120 acctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgata 219  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||| || || |||| |||||| |  ||||||||| | |||||||| || |||||||  |||    
T  24112606 acctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctata 24112705  T
Q  220 ccaatg 225  Q
    ||||||    
T  24112706 ccaatg 24112711  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14763717 - 14763509
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |    
T  14763717 cctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtca 14763618  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    ||||||| ||||| ||   |||||| || |  || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||    
T  14763617 atgccatcgctcaacaggtgcaacatcaactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgc 14763518  T
Q  234 tgagttgct 242  Q
    |||||||||    
T  14763517 tgagttgct 14763509  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27163682 - 27163522
Alignment:
Q  85 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgac 184  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||||| ||    
T  27163682 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 27163583  T
Q  185 agc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    | |   | || |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27163582 aacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 27163522  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 149
Target Start/End: Original strand, 54833230 - 54833360
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  54833230 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttaccaccgggcc 54833329  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctca 149  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||    
T  54833330 aacctcaggttcctgtcaatgccattgctca 54833360  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36344925 - 36344748
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  |||||||||| | | || || | ||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || || |    
T  36344925 cctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcctaccgttttatcatcagtatcctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtca 36344826  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctc 214  Q
    ||||||| ||||| ||   |||||| || || |||| |||||| |  ||||||||| |  ||||||| || |||||||    
T  36344825 atgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatactagaccaacttttcctc 36344748  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Original strand, 5005776 - 5005939
Alignment:
Q  85 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgac 184  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || | | ||||||||   || | |||||||| ||    
T  5005776 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 5005875  T
Q  185 agcagcaa------caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    | || |||      |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5005876 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 5005939  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 146
Target Start/End: Original strand, 6569753 - 6569820
Alignment:
Q  79 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgc 146  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6569753 tttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgc 6569820  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 149
Target Start/End: Original strand, 21969613 - 21969671
Alignment:
Q  91 tatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctca 149  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  21969613 tatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctca 21969671  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 120
Target Start/End: Original strand, 19373101 - 19373202
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19373101 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtc 19373200  T
Q  119 aa 120  Q
    ||    
T  19373201 aa 19373202  T

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Target: scaffold0260 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3092 - 2842
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3092 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 2993  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2992 cgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaacagcctccagctcaacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcc 2893  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    || |||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  2892 tccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctcagagg 2842  T

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Target: chr1 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20340769 - 20340519
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340769 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 20340670  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20340669 cgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaacagcctccagctcaacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcc 20340570  T
Q  213 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    || |||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  20340569 tccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctcagagg 20340519  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16208453 - 16208215
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||| | |||   |||||||||||||| | | || || |||||||||||||| ||||||||    ||||||||||| |    
T  16208453 aatgctgcccagttacctccgccgtatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccaccaccatcgggtcagc 16208354  T
Q  122 ctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 221  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16208353 ctcaggtacccattaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacatca---acaagctagacctacctttcctccgatacc 16208257  T
Q  222 aatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    |||| | ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16208256 aatgttgtataccgagttactcccgactctacttctcagagg 16208215  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 166
Target Start/End: Original strand, 20460935 - 20461079
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  20460935 aatgctgcccagttacctccgccgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcaatatcctctaccatcgggtcaac 20461034  T
Q  122 ctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagc 166  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  20461035 ctcaggtacccgttaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagc 20461079  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 175 - 263
Target Start/End: Original strand, 28151845 - 28151933
Alignment:
Q  175 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28151845 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 28151933  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 263
Target Start/End: Original strand, 20461076 - 20461152
Alignment:
Q  187 cagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20461076 cagcaacaagctagacctacctttcctccgatactaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagg 20461152  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41793673 - 41793513
Alignment:
Q  85 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgac 184  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||  || | | ||||||||   || | |||||||| ||    
T  41793673 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctccacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 41793574  T
Q  185 agc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 242  Q
    | |   | || |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41793573 aacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 41793513  T

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Target: scaffold0124 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 263
Target Start/End: Original strand, 20240 - 20460
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20240 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccatcattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 20339  T
Q  122 ctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 221  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||                     |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20340 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac---------------------agcagcaacaagctagacctacctttcccccgatacc 20418  T
Q  222 aatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagg 263  Q
    |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20419 aatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagg 20460  T

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Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 225
Target Start/End: Original strand, 30296 - 30486
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || ||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  30296 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 30395  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatg 225  Q
    |||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || ||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  30396 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagaccta-ctttcctcctataccaatg 30486  T

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Target: scaffold0109 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 259
Target Start/End: Original strand, 21391 - 21629
Alignment:
Q  18 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||   |||||||||||||| | | || || |||||||||||||| ||||||||    ||  |||||    
T  21391 catcaatgcttctcagctacctccgccgtaccagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccaccaccgccgggt 21490  T
Q  118 caacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctga 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |  ||| ||||    ||||| |||||| | |||||||||||||||| ||    
T  21491 caacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagctgctggcttaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccga 21587  T
Q  218 taccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 259  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||    
T  21588 taccaatgctatatgccgagctgctcccgactttgcttctca 21629  T

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Target: scaffold0558 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 163 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 312 - 212
Alignment:
Q  163 cagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagag 262  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  312 cagccaccagctcaacagcaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagag 213  T
Q  263 g 263  Q
    |    
T  212 g 212  T

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Target: scaffold0089 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Original strand, 29606 - 29826
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29606 cctccatcgtacccgtatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 29705  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagct---caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| || ||||| || | | ||||||||   || | |   ||||||| ||| || ||||||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||    
T  29706 atgcaatagctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgc 29805  T
Q  234 tgagttgctcccgactctact 254  Q
    ||||||||| |||||| ||||    
T  29806 tgagttgcttccgactttact 29826  T

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Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 40482 - 40262
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
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T  40482 cctccgccgtacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttctgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtaa 40383  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||    
T  40382 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgc 40283  T
Q  234 tgagttgctcccgactctact 254  Q
    ||||||||| |||||| ||||    
T  40282 tgagttgcttccgactttact 40262  T

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Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 47356 - 47178
Alignment:
Q  79 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 178  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||    
T  47356 tttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 47257  T
Q  179 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctact 254  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  47256 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttact 47178  T

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Target: scaffold0143 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Original strand, 27135 - 27355
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 136  Q
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T  27135 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctaccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 27234  T
Q  137 atgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgc 233  Q
    |||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||    
T  27235 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgc 27334  T
Q  234 tgagttgctcccgactctact 254  Q
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T  27335 tgagttgcttccgactttact 27355  T

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Target: scaffold0029 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 561 - 322
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 118  Q
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T  561 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 462  T
Q  119 aacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctct 215  Q
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T  461 aacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctcc 362  T
Q  216 gataccaatgctatatgc-tgagttgctcccgactctact 254  Q
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T  361 gataccgatgttatatgctttagttgcttccgactttact 322  T

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Target: scaffold0336 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 149
Target Start/End: Original strand, 8120 - 8187
Alignment:
Q  82 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctca 149  Q
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T  8120 ccaccgttttatcatcagtatcctttgccaccaggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 8187  T

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Target: scaffold0237 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15362 - 15234
Alignment:
Q  18 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 117  Q
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T  15362 catcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggc 15263  T
Q  118 caacctcaggtacccgttaatgccattgc 146  Q
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T  15262 cagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 15234  T

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