View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10241_low_9 (Length: 271)

Name: NF10241_low_9
Description: NF10241
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10241_low_9
NF10241_low_9
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (16-269)||(26484780-26485033)
chr7 (24-269)||(2108817-2109062)
chr7 (16-269)||(2775445-2775698)
chr7 (16-269)||(39210827-39211080)
chr7 (18-271)||(16041407-16041660)
chr7 (24-271)||(16449810-16450057)
chr7 (16-220)||(4200682-4200886)
chr7 (16-227)||(26682804-26683015)
chr7 (29-271)||(31088281-31088523)
chr7 (29-271)||(45733544-45733786)
chr7 (17-271)||(16518221-16518475)
chr7 (16-271)||(10916672-10916927)
chr7 (16-271)||(11424580-11424835)
chr7 (17-271)||(16503185-16503439)
chr7 (14-271)||(5128076-5128333)
chr7 (16-271)||(2154657-2154912)
chr7 (16-268)||(3445393-3445645)
chr7 (16-268)||(31564194-31564446)
chr7 (16-268)||(26274898-26275150)
chr7 (16-268)||(26435344-26435596)
chr7 (16-268)||(5147144-5147396)
chr7 (16-268)||(11441659-11441911)
chr7 (16-268)||(26537674-26537926)
chr7 (16-268)||(4144927-4145179)
chr7 (16-268)||(16736264-16736516)
chr7 (16-268)||(16751318-16751570)
chr7 (16-268)||(17523619-17523871)
chr7 (16-268)||(17529344-17529596)
chr7 (16-268)||(24592345-24592597)
chr7 (16-268)||(26319673-26319925)
chr7 (16-268)||(9618738-9618990)
chr7 (16-268)||(26669718-26669970)
chr7 (16-268)||(31125007-31125259)
chr7 (16-268)||(45387430-45387682)
chr7 (47-269)||(18540885-18541107)
chr7 (90-265)||(5159609-5159784)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (16-269)||(14143146-14143399)
chr6 (16-269)||(26788026-26788279)
chr6 (16-269)||(27196399-27196652)
chr6 (16-269)||(27252588-27252841)
chr6 (21-271)||(13521939-13522189)
chr6 (16-271)||(22456795-22457050)
chr6 (16-271)||(27290231-27290486)
chr6 (29-271)||(33374130-33374372)
chr6 (16-271)||(22934741-22934996)
chr6 (16-271)||(23857186-23857441)
chr6 (29-271)||(8892185-8892426)
chr6 (29-271)||(8903420-8903661)
chr6 (29-271)||(28162737-28162979)
chr6 (19-268)||(16749937-16750186)
chr6 (16-271)||(24304479-24304734)
chr6 (16-271)||(24863797-24864052)
chr6 (16-268)||(29549558-29549810)
chr6 (16-271)||(26989081-26989336)
chr6 (16-271)||(13298812-13299067)
chr6 (16-271)||(26918460-26918715)
chr6 (30-271)||(27000153-27000394)
chr6 (16-271)||(27272441-27272696)
chr6 (122-271)||(22477240-22477389)
chr6 (15-268)||(27359852-27360105)
chr6 (15-268)||(27450195-27450448)
chr6 (16-268)||(4757847-4758099)
chr6 (16-268)||(4773089-4773341)
chr6 (16-268)||(27007810-27008062)
chr6 (16-268)||(4525369-4525621)
chr6 (16-268)||(4545636-4545888)
chr6 (16-268)||(15424178-15424430)
chr6 (21-271)||(20160781-20161031)
chr6 (21-271)||(22171800-22172050)
chr6 (16-268)||(16674222-16674474)
chr6 (16-268)||(26116271-26116523)
chr6 (16-268)||(28207537-28207789)
chr6 (16-268)||(30557877-30558129)
chr6 (16-265)||(17025363-17025612)
chr6 (16-268)||(3696164-3696416)
chr6 (16-265)||(29573099-29573348)
chr6 (16-268)||(4723995-4724247)
chr6 (16-268)||(29501498-29501750)
chr6 (16-268)||(34463207-34463459)
chr6 (15-268)||(26777475-26777728)
chr6 (16-268)||(27485212-27485464)
chr6 (16-268)||(27044470-27044723)
chr6 (16-268)||(16943888-16944140)
chr6 (16-145)||(17092301-17092430)
chr6 (48-166)||(27629593-27629711)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (16-269)||(31034076-31034329)
chr3 (16-269)||(32292798-32293051)
chr3 (21-271)||(16626470-16626720)
chr3 (18-271)||(18530432-18530685)
chr3 (29-271)||(17993756-17993998)
chr3 (16-271)||(18051306-18051561)
chr3 (16-271)||(22387537-22387792)
chr3 (29-271)||(4625988-4626230)
chr3 (29-271)||(5652431-5652673)
chr3 (29-268)||(5713274-5713513)
chr3 (29-268)||(5724184-5724423)
chr3 (29-268)||(5757054-5757293)
chr3 (29-268)||(5767945-5768184)
chr3 (16-271)||(8296016-8296271)
chr3 (16-271)||(15741053-15741308)
chr3 (16-271)||(15892665-15892920)
chr3 (16-268)||(29148714-29148966)
chr3 (16-271)||(18330713-18330968)
chr3 (16-271)||(4796612-4796867)
chr3 (16-271)||(6192360-6192615)
chr3 (16-271)||(8301226-8301481)
chr3 (16-268)||(4416966-4417218)
chr3 (16-268)||(7073259-7073511)
chr3 (16-268)||(11110308-11110560)
chr3 (16-268)||(28021322-28021574)
chr3 (16-268)||(28115913-28116165)
chr3 (16-265)||(29664929-29665178)
chr3 (16-268)||(10396180-10396432)
chr3 (16-268)||(48465974-48466226)
chr3 (16-268)||(51782070-51782322)
chr3 (16-271)||(35880810-35881065)
chr3 (16-265)||(8211788-8212037)
chr3 (16-265)||(22870815-22871064)
chr3 (16-265)||(22885874-22886123)
chr3 (16-268)||(4346646-4346898)
chr3 (16-268)||(5467032-5467284)
chr3 (16-268)||(6542421-6542673)
chr3 (16-268)||(18277011-18277263)
chr3 (16-268)||(18292312-18292564)
chr3 (16-268)||(18307613-18307865)
chr3 (16-268)||(21674740-21674992)
chr3 (16-268)||(36997036-36997288)
chr3 (16-271)||(4721675-4721930)
chr3 (16-265)||(20576806-20577055)
chr3 (16-268)||(51797159-51797412)
chr3 (16-268)||(5609281-5609533)
chr3 (16-268)||(17984915-17985167)
chr3 (16-268)||(28339349-28339601)
chr3 (16-268)||(5596316-5596568)
chr3 (16-268)||(24328206-24328458)
chr3 (16-268)||(31964432-31964684)
chr3 (16-268)||(50134030-50134282)
chr3 (16-268)||(5013759-5014011)
chr3 (16-268)||(7996609-7996861)
chr3 (16-268)||(10643117-10643369)
chr3 (16-268)||(18242786-18243038)
chr3 (16-268)||(47023500-47023752)
chr3 (16-268)||(18225238-18225490)
chr3 (47-265)||(32439204-32439422)
chr3 (47-265)||(20066093-20066311)
chr3 (138-265)||(4893260-4893387)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (16-269)||(28151946-28152199)
chr1 (16-271)||(20340253-20340508)
chr1 (18-271)||(16207951-16208204)
chr1 (18-271)||(20461163-20461416)
chr1 (16-265)||(51638306-51638555)
chr1 (16-268)||(10962755-10963007)
chr1 (16-268)||(41793226-41793478)
chr1 (16-268)||(28585066-28585318)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (16-271)||(2576-2831)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (16-271)||(29888897-29889152)
chr5 (16-271)||(23892298-23892553)
chr5 (21-271)||(33877339-33877589)
chr5 (30-271)||(22888562-22888803)
chr5 (29-271)||(11325886-11326128)
chr5 (18-271)||(25199121-25199374)
chr5 (29-271)||(13184476-13184718)
chr5 (16-271)||(24687972-24688227)
chr5 (29-271)||(13440322-13440564)
chr5 (16-271)||(23752265-23752520)
chr5 (16-271)||(30934725-30934980)
chr5 (16-271)||(11549446-11549701)
chr5 (16-271)||(23717803-23718058)
chr5 (16-271)||(24970110-24970365)
chr5 (16-268)||(9548358-9548610)
chr5 (16-268)||(37671298-37671550)
chr5 (16-271)||(22998929-22999184)
chr5 (16-271)||(33777579-33777834)
chr5 (16-268)||(15658575-15658827)
chr5 (16-268)||(31431535-31431787)
chr5 (16-268)||(28649330-28649582)
chr5 (16-265)||(13324644-13324893)
chr5 (16-268)||(15758672-15758924)
chr5 (16-268)||(31826222-31826474)
chr5 (16-268)||(43078347-43078599)
chr5 (30-268)||(18500559-18500797)
chr5 (16-268)||(2511146-2511398)
chr5 (16-268)||(30168564-30168816)
chr5 (16-268)||(33516451-33516703)
chr5 (16-268)||(37770802-37771054)
chr5 (15-268)||(32599286-32599539)
chr5 (16-268)||(8665290-8665542)
chr5 (16-268)||(9317546-9317798)
chr5 (16-268)||(12132250-12132502)
chr5 (16-268)||(30152113-30152365)
chr5 (16-268)||(37358458-37358710)
chr5 (16-268)||(37755075-37755327)
chr5 (16-265)||(24681538-24681787)
chr5 (16-265)||(24724065-24724314)
chr5 (16-265)||(40473364-40473613)
chr5 (16-268)||(6874400-6874652)
chr5 (16-268)||(18375227-18375479)
chr5 (16-268)||(26480487-26480739)
chr5 (16-268)||(3789636-3789888)
chr5 (16-268)||(29966881-29967133)
chr5 (16-268)||(30029510-30029762)
chr5 (16-268)||(34616613-34616865)
chr5 (15-268)||(28959600-28959853)
chr5 (16-268)||(5638005-5638257)
chr5 (47-268)||(41674804-41675025)
chr5 (47-265)||(33292623-33292841)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (18-271)||(1838-2090)
scaffold0415 (30-268)||(6098-6338)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (18-271)||(20471-20723)
scaffold0124 (16-268)||(30538-30790)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (18-271)||(21703073-21703326)
chr2 (21-271)||(19456333-19456583)
chr2 (29-271)||(27118767-27119009)
chr2 (51-271)||(27393048-27393268)
chr2 (16-271)||(34303210-34303465)
chr2 (29-271)||(3784733-3784975)
chr2 (16-262)||(9349889-9350135)
chr2 (16-268)||(40233593-40233845)
chr2 (16-271)||(27434351-27434606)
chr2 (29-271)||(16163678-16163920)
chr2 (29-271)||(34157090-34157331)
chr2 (16-271)||(23128473-23128728)
chr2 (16-271)||(28882293-28882548)
chr2 (16-268)||(22925935-22926187)
chr2 (16-268)||(20838000-20838252)
chr2 (29-271)||(31891248-31891490)
chr2 (16-271)||(12655621-12655876)
chr2 (16-265)||(12586895-12587144)
chr2 (16-265)||(13936451-13936700)
chr2 (16-268)||(16829245-16829497)
chr2 (16-268)||(16891984-16892236)
chr2 (16-268)||(37375243-37375495)
chr2 (16-265)||(27777307-27777556)
chr2 (16-265)||(27817065-27817314)
chr2 (16-268)||(21677089-21677341)
chr2 (16-268)||(39890156-39890408)
chr2 (16-265)||(12716509-12716758)
chr2 (51-268)||(34286436-34286653)
chr2 (51-268)||(34291496-34291713)
chr2 (16-265)||(39051729-39051978)
chr2 (16-268)||(260660-260912)
chr2 (16-268)||(32049880-32050132)
chr2 (19-265)||(27803792-27804038)
chr2 (16-268)||(11635093-11635345)
chr2 (16-268)||(11641282-11641534)
chr2 (16-268)||(19416406-19416658)
chr2 (16-268)||(31876363-31876615)
chr2 (16-268)||(34861762-34862014)
chr2 (16-268)||(37685816-37686068)
chr2 (16-268)||(37701081-37701333)
chr2 (16-268)||(37925575-37925827)
chr2 (101-268)||(34279531-34279698)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (3-271)||(1900355-1900623)
chr4 (21-271)||(15284851-15285101)
chr4 (18-271)||(15227968-15228221)
chr4 (51-271)||(15391291-15391511)
chr4 (29-271)||(14235456-14235698)
chr4 (29-271)||(24460536-24460778)
chr4 (16-271)||(17014098-17014353)
chr4 (16-271)||(14665116-14665371)
chr4 (16-271)||(24592232-24592487)
chr4 (16-268)||(36344433-36344685)
chr4 (16-268)||(5005974-5006226)
chr4 (16-268)||(6569954-6570206)
chr4 (16-268)||(14763222-14763474)
chr4 (16-268)||(18800531-18800783)
chr4 (16-268)||(27163235-27163487)
chr4 (16-265)||(33673716-33673965)
chr4 (16-265)||(39850742-39850991)
chr4 (16-268)||(40105556-40105808)
chr4 (16-268)||(14098642-14098894)
chr4 (16-268)||(31126436-31126688)
chr4 (16-262)||(21969808-21970054)
chr4 (16-268)||(30753855-30754107)
chr4 (16-265)||(54833491-54833740)
chr4 (47-265)||(34188909-34189127)
chr4 (47-265)||(24112766-24112984)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (51-271)||(22080790-22081010)
chr8 (16-271)||(16283532-16283787)
chr8 (16-268)||(18710672-18710924)
chr8 (29-271)||(44563184-44563424)
chr8 (16-271)||(27608782-27609037)
chr8 (29-271)||(19658930-19659171)
chr8 (31-271)||(33244748-33244988)
chr8 (16-271)||(19688181-19688436)
chr8 (16-271)||(16277637-16277892)
chr8 (16-268)||(12092601-12092853)
chr8 (16-271)||(14557707-14557962)
chr8 (16-271)||(29829405-29829660)
chr8 (16-268)||(3329384-3329636)
chr8 (16-271)||(2137136-2137391)
chr8 (16-271)||(9354705-9354961)
chr8 (16-268)||(31489627-31489879)
chr8 (16-268)||(19674527-19674779)
chr8 (16-268)||(31354610-31354862)
chr8 (16-268)||(19208237-19208489)
chr8 (16-265)||(19286551-19286800)
chr8 (16-268)||(28361832-28362084)
chr8 (16-268)||(33258809-33259061)
chr8 (16-192)||(189256-189432)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (71-271)||(1-201)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (16-271)||(21644-21899)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (16-271)||(39987-40242)
scaffold0089 (16-271)||(46903-47158)
scaffold0089 (16-271)||(29846-30101)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (17-271)||(27375-27629)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (16-271)||(47-302)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (16-268)||(9652-9904)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (51-208)||(571-728)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (16-268)||(8035-8287)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (16-268)||(7157-7409)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (16-268)||(8984-9236)
scaffold0159 (16-268)||(20101-20353)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (16-268)||(14848-15100)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (16-268)||(26119-26372)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (60-268)||(46764-46981)
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (48-166)||(277-395)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26485033 - 26484780
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26485033 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 26484934  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484933 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26484834  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctg 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26484833 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctg 26484780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 24 - 269
Target Start/End: Original strand, 2108817 - 2109062
Alignment:
Q  24 agtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaact 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2108817 agtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaact 2108916  T
Q  124 ttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcaga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2108917 ttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcaga 2109016  T
Q  224 ccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctg 269  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2109017 ccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctg 2109062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2775698 - 2775445
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  2775698 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 2775599  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775598 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 2775499  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctg 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2775498 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctg 2775445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 269
Target Start/End: Original strand, 39210827 - 39211080
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  39210827 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 39210926  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39210927 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccaaagcaccttgatggaaatcacatttg 39211026  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctg 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  39211027 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaagcttcccctgtctg 39211080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16041660 - 16041407
Alignment:
Q  18 acatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaag 117  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041660 acatcgagtctgggagcttcctcgtatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 16041561  T
Q  118 ttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgag 217  Q
    |||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16041560 ttaactttccctgatcaatgagctttttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactttag 16041461  T
Q  218 gtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041460 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 16041407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 271
Target Start/End: Original strand, 16449810 - 16450057
Alignment:
Q  24 agtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaact 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16449810 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagttaact 16449909  T
Q  124 ttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcaga 223  Q
    |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16449910 ttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 16450009  T
Q  224 ccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
     || ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16450010 acgaaacctgggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 16450057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4200886 - 4200682
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  4200886 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttatcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 4200787  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4200786 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 4200687  T
Q  216 aggtc 220  Q
    |||||    
T  4200686 aggtc 4200682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 227
Target Start/End: Original strand, 26682804 - 26683015
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||    
T  26682804 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgacgacatgagggacgttattctcaaa 26682903  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
     || || ||||||||||  ||||| || || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26682904 ggtcaattttccttggtctatgagtttttttaaaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26683003  T
Q  216 aggtcagaccgg 227  Q
    ||||| ||||||    
T  26683004 aggtcggaccgg 26683015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Original strand, 31088281 - 31088523
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  31088281 gggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcct 31088380  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    ||||  ||||| || || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  31088381 tggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacgga 31088480  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088481 acttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 31088523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 45733786 - 45733544
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  45733786 gggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcct 45733687  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    ||||  ||||| || || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  45733686 tggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacgga 45733587  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45733586 acttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 45733544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Original strand, 16518221 - 16518475
Alignment:
Q  17 gacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaa 116  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  16518221 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaa 16518320  T
Q  117 gttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttga 216  Q
    || ||||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16518321 gtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttga 16518420  T
Q  217 ggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    | || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16518421 gatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 16518475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 10916672 - 10916927
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  10916672 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 10916771  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  10916772 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 10916871  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10916872 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 10916927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 11424580 - 11424835
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  11424580 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11424679  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  11424680 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 11424779  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11424780 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 11424835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Original strand, 16503185 - 16503439
Alignment:
Q  17 gacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaa 116  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  16503185 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaa 16503284  T
Q  117 gttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttga 216  Q
    || | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16503285 gtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttga 16503384  T
Q  217 ggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    | || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16503385 gatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 16503439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5128333 - 5128076
Alignment:
Q  14 atggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctca 113  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  5128333 atggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctca 5128234  T
Q  114 aaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatt 213  Q
    ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  5128233 aaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatt 5128134  T
Q  214 tgaggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    |||| ||||||| |||||| | ||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  5128133 tgagatcagacctgaaccttggaggcaacggattaggtgggggcttaccctgtctggt 5128076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2154912 - 2154657
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  2154912 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 2154813  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  2154812 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttg 2154713  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2154712 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 2154657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3445645 - 3445393
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  3445645 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 3445546  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  3445545 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 3445446  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3445445 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 3445393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 31564194 - 31564446
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  31564194 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31564293  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||    
T  31564294 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 31564393  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31564394 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 31564446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 26274898 - 26275150
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  26274898 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26274997  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  26274998 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26275097  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26275098 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 26275150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26435596 - 26435344
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  26435596 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26435497  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  26435496 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 26435397  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26435396 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 26435344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 5147144 - 5147396
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  5147144 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5147243  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  5147244 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5147343  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5147344 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 5147396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11441911 - 11441659
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  11441911 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11441812  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  11441811 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 11441712  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11441711 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 11441659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 26537674 - 26537926
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  26537674 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 26537773  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  26537774 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 26537873  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26537874 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 26537926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 4144927 - 4145179
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  4144927 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4145026  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  4145027 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 4145126  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4145127 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 4145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 16736264 - 16736516
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  16736264 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 16736363  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||    
T  16736364 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 16736463  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16736464 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtct 16736516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 16751318 - 16751570
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  16751318 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 16751417  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||    
T  16751418 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 16751517  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16751518 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtct 16751570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17523871 - 17523619
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  17523871 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 17523772  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||    
T  17523771 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 17523672  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17523671 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtct 17523619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 17529344 - 17529596
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  17529344 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 17529443  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||    
T  17529444 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 17529543  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17529544 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtct 17529596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 24592345 - 24592597
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  24592345 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 24592444  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  24592445 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 24592544  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24592545 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 24592597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 26319673 - 26319925
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  26319673 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26319772  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  26319773 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26319872  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26319873 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 26319925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9618990 - 9618738
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  9618990 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9618891  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  9618890 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 9618791  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9618790 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 9618738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 26669718 - 26669970
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  26669718 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26669817  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  26669818 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 26669917  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| |  || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26669918 agatcagacctgaaccttgggggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 26669970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31125259 - 31125007
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  31125259 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31125160  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||    
T  31125159 agtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31125060  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31125059 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 31125007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 45387682 - 45387430
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  45387682 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 45387583  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  45387582 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 45387483  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  45387482 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 45387430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18541107 - 18540885
Alignment:
Q  47 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttc 146  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |  || ||||||||     
T  18541107 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 18541008  T
Q  147 acaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctggaaggtaacggat 246  Q
    || ||||| || | ||||||||| || || |||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| | |||||| || |    
T  18541007 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 18540908  T
Q  247 caggtggaggcttgccctgtctg 269  Q
    | ||||||||||| |||||||||    
T  18540907 ccggtggaggcttcccctgtctg 18540885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5159784 - 5159609
Alignment:
Q  90 aggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgaccca 189  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||||| || ||||| || | ||||||||| || |  |||||||| || |    
T  5159784 aggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccccttaacatcatgcccta 5159685  T
Q  190 gagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
     ||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||    
T  5159684 aagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctg 5159609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 269
Target Start/End: Original strand, 14143146 - 14143399
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14143146 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 14143245  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14143246 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 14143345  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctg 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14143346 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctg 14143399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26788279 - 26788026
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26788279 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 26788180  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26788179 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26788080  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctg 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26788079 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctg 26788026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27196652 - 27196399
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27196652 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 27196553  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27196552 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 27196453  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctg 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27196452 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctg 27196399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 269
Target Start/End: Original strand, 27252588 - 27252841
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27252588 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 27252687  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27252688 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 27252787  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctg 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27252788 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctg 27252841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 13521939 - 13522189
Alignment:
Q  21 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagtta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  13521939 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 13522038  T
Q  121 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13522039 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 13522138  T
Q  221 agaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
     || |||||| ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522139 cgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 13522189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 22456795 - 22457050
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22456795 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaaattattctcaaa 22456894  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22456895 agttaactttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 22456994  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22456995 aggtaagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 22457050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 27290231 - 27290486
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27290231 ggacatcaagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatatttacagtagcatgattcggaagaagattgttgaggacatgagggacattgttctcaaa 27290330  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27290331 agttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 27290430  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290431 aggtcagaacggaacttgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 27290486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Original strand, 33374130 - 33374372
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  33374130 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagtcaattttcct 33374229  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    ||||  ||||| || || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  33374230 tggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacgga 33374329  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374330 acttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 33374372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 22934741 - 22934996
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  22934741 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 22934840  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22934841 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 22934940  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22934941 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 22934996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 23857186 - 23857441
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  23857186 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 23857285  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23857286 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 23857385  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23857386 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 23857441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Original strand, 8892185 - 8892426
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  8892185 gggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcct 8892284  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    ||||  ||||| || || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  8892285 tggtctatgagtttttt-acaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacgga 8892383  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8892384 acttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 8892426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Original strand, 8903420 - 8903661
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  8903420 gggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcct 8903519  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    ||||  ||||| || || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  8903520 tggtctatgagtttttt-acaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacgga 8903618  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8903619 acttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 8903661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28162979 - 28162737
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  28162979 gggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcct 28162880  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    ||||  ||||| || || ||||||||  |||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  28162879 tggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatcctccgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacgga 28162780  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || ||| |||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28162779 acttgggaggcgatggatcaagtggaggcttgccctgtctggt 28162737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16750186 - 16749937
Alignment:
Q  19 catcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagt 118  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16750186 catcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagt 16750087  T
Q  119 taactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgagg 218  Q
     | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||     
T  16750086 cagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaga 16749987  T
Q  219 tcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16749986 tcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtct 16749937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 24304479 - 24304734
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  24304479 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24304578  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24304579 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaatcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 24304678  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24304679 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 24304734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24864052 - 24863797
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  24864052 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24863953  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  24863952 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 24863853  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24863852 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 24863797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 29549810 - 29549558
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  29549810 ggacatcaagtccaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29549711  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  29549710 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 29549611  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29549610 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 29549558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26989336 - 26989081
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  26989336 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 26989237  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  26989236 agtcagctttccttgatcaatgagcttctttacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 26989137  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26989136 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 26989081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 13298812 - 13299067
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  13298812 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 13298911  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  13298912 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagtgtagcatccctcgacgtcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 13299011  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13299012 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 13299067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26918715 - 26918460
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  26918715 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26918616  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  26918615 agtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 26918516  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26918515 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 26918460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27000394 - 27000153
Alignment:
Q  30 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcctt 129  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  27000394 ggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcctt 27000295  T
Q  130 ggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaa 229  Q
    | | ||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||| |||    
T  27000294 gatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaa 27000195  T
Q  230 cctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27000194 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 27000153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 27272441 - 27272696
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  27272441 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggaagaggattatcgaggacatgcggaacattattctcaaa 27272540  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
     || | ||| ||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27272541 ggtcagcttcccttgatcgatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttg 27272640  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    ||||| |||| |||||||| |||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27272641 aggtcggacctgaacctgggaggcgacggatcaggtgggggcttaccctgtctggt 27272696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 122 - 271
Target Start/End: Original strand, 22477240 - 22477389
Alignment:
Q  122 ctttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtca 221  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22477240 ctttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtta 22477339  T
Q  222 gaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22477340 gaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 22477389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 268
Target Start/End: Original strand, 27359852 - 27360105
Alignment:
Q  15 tggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaa 114  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  27359852 tggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaa 27359951  T
Q  115 aagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacattt 214  Q
    |||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||    
T  27359952 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 27360051  T
Q  215 gaggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    ||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27360052 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 27360105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 268
Target Start/End: Original strand, 27450195 - 27450448
Alignment:
Q  15 tggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaa 114  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  27450195 tggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaa 27450294  T
Q  115 aagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacattt 214  Q
    |||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||    
T  27450295 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 27450394  T
Q  215 gaggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    ||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27450395 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 27450448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4758099 - 4757847
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  4758099 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 4758000  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  4757999 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4757900  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4757899 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 4757847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4773341 - 4773089
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  4773341 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 4773242  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||    
T  4773241 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 4773142  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4773141 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 4773089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27008062 - 27007810
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  27008062 ggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27007963  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| |||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  27007962 agtcagctttccctggtcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 27007863  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27007862 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 27007810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4525621 - 4525369
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4525621 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 4525522  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  4525521 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4525422  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
     | ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4525421 ggatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 4525369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 4545636 - 4545888
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4545636 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 4545735  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||    
T  4545736 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 4545835  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4545836 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 4545888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 15424178 - 15424430
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| |  ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  15424178 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatactttgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaa 15424277  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  15424278 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttg 15424377  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15424378 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtct 15424430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20161031 - 20160781
Alignment:
Q  21 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagtta 120  Q
    |||||||  |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  20161031 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtca 20160932  T
Q  121 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 220  Q
     ||| | |||||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  20160931 gcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatc 20160832  T
Q  221 agaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
     || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20160831 ggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggt 20160781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 22171800 - 22172050
Alignment:
Q  21 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagtta 120  Q
    |||||||  |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  22171800 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtca 22171899  T
Q  121 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 220  Q
     ||| | |||||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  22171900 gcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatc 22171999  T
Q  221 agaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
     || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22172000 ggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggt 22172050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16674474 - 16674222
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  16674474 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16674375  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  16674374 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 16674275  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16674274 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 16674222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 26116271 - 26116523
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  26116271 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 26116370  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  26116371 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 26116470  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26116471 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 26116523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28207789 - 28207537
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  28207789 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 28207690  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | |||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||    
T  28207689 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 28207590  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  28207589 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtct 28207537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 30557877 - 30558129
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  30557877 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30557976  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||     
T  30557977 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 30558076  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30558077 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 30558129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17025612 - 17025363
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  17025612 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 17025513  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||     
T  17025512 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 17025413  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    || ||||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||    
T  17025412 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctg 17025363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3696416 - 3696164
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  3696416 ggacatcaagtctaggagcttcatcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 3696317  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  3696316 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 3696217  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3696216 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 3696164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29573348 - 29573099
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  29573348 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29573249  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  29573248 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 29573149  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  29573148 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctg 29573099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 4723995 - 4724247
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  4723995 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattgttctcaaa 4724094  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | |||||| |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  4724095 agtcagctttccctgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4724194  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4724195 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtct 4724247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 29501750 - 29501498
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  29501750 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 29501651  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  29501650 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 29501551  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29501550 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 29501498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 34463207 - 34463459
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  34463207 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 34463306  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  34463307 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 34463406  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  34463407 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggctttccttgtct 34463459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 268
Target Start/End: Original strand, 26777475 - 26777728
Alignment:
Q  15 tggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaa 114  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  26777475 tggacatcaagtctaggattttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaa 26777574  T
Q  115 aagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacattt 214  Q
    |||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||    
T  26777575 aagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 26777674  T
Q  215 gaggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    ||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26777675 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 26777728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27485464 - 27485212
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  27485464 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27485365  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||    
T  27485364 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 27485265  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27485264 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 27485212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27044723 - 27044470
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  27044723 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 27044624  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagc-atccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacattt 214  Q
    ||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| || || ||||||||||| | | || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||    
T  27044623 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataaccacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattt 27044524  T
Q  215 gaggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    ||| ||||||| |||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27044523 gagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgtct 27044470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 16943888 - 16944140
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  16943888 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 16943987  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  16943988 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 16944087  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16944088 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 16944140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 145
Target Start/End: Original strand, 17092301 - 17092430
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||||||||||  || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||  ||| ||||||||    
T  17092301 ggacatcaagtttggtagcttcctcacatacctcagtcatgttcacagcagcgtggtttggaaggggattatcgaggacatgaggggtattattctcaaa 17092400  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttctt 145  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  17092401 agtcaactttccctggtcaatgagcttctt 17092430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 166
Target Start/End: Original strand, 27629593 - 27629711
Alignment:
Q  48 tcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttca 147  Q
    ||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| |||  |    
T  27629593 tcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttggtcaataagcctctgga 27629692  T
Q  148 caatgtatttcaaagcata 166  Q
    |||| || || ||||||||    
T  27629693 caatatactttaaagcata 27629711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 269
Target Start/End: Original strand, 31034076 - 31034329
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31034076 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 31034175  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31034176 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 31034275  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctg 269  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31034276 aggtcagaccggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctg 31034329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 32293051 - 32292798
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  32293051 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 32292952  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32292951 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 32292852  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctg 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  32292851 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggagacttcccctgtctg 32292798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 16626470 - 16626720
Alignment:
Q  21 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagtta 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |    
T  16626470 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagtgtgattcggaagaggattgtcaaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 16626569  T
Q  121 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 220  Q
    | ||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16626570 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 16626669  T
Q  221 agaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626670 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 16626720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18530685 - 18530432
Alignment:
Q  18 acatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaag 117  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || |||||||| |    
T  18530685 acattaagtctgggagctccctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacacgagggacgttattctcaaagg 18530586  T
Q  118 ttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgag 217  Q
    | || ||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18530585 tcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 18530486  T
Q  218 gtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530485 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 18530432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Original strand, 17993756 - 17993998
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  17993756 gggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcct 17993855  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    ||||  ||||| || || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  17993856 tggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacgga 17993955  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17993956 acttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 17993998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18051561 - 18051306
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  18051561 ggacatcaagtctaggagctttctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 18051462  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  18051461 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatagaaatcacatttg 18051362  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18051361 agatcggacctgaacctgggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 18051306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 22387537 - 22387792
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  22387537 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 22387636  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  22387637 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 22387736  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22387737 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 22387792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4626230 - 4625988
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  4626230 gggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcct 4626131  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    ||||  ||||| || || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  4626130 tggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacgga 4626031  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4626030 acttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 4625988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5652673 - 5652431
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  5652673 gggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcct 5652574  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    ||||  ||||| || || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  5652573 tggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacgga 5652474  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || ||| |||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5652473 acttgggaggcgacgggtcaggtgaaggcttgccctgtctggt 5652431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5713513 - 5713274
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  5713513 gggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttccct 5713414  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||    
T  5713413 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 5713314  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    |||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5713313 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 5713274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5724423 - 5724184
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  5724423 gggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttccct 5724324  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||    
T  5724323 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 5724224  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    |||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5724223 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 5724184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 268
Target Start/End: Original strand, 5757054 - 5757293
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  5757054 gggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttccct 5757153  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||    
T  5757154 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 5757253  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    |||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5757254 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 5757293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 268
Target Start/End: Original strand, 5767945 - 5768184
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  5767945 gggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttccct 5768044  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||    
T  5768045 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 5768144  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    |||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5768145 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 5768184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8296271 - 8296016
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  8296271 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 8296172  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8296171 agtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 8296072  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||||| ||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  8296071 agatcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtaggggcttgccctgtctggt 8296016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 15741053 - 15741308
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  15741053 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 15741152  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15741153 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagagcgccttgatgaaaatcacatttg 15741252  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15741253 agatcggacctgaaccttggaggcaacgaatcaggtgggggcttgccctgtctggt 15741308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 15892665 - 15892920
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  15892665 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 15892764  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15892765 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 15892864  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15892865 agatcggacctgaacctgggaggcaaaggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 15892920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 29148714 - 29148966
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  29148714 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 29148813  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  29148814 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 29148913  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29148914 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtct 29148966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18330968 - 18330713
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  18330968 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18330869  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  18330868 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 18330769  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18330768 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 18330713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 4796612 - 4796867
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  4796612 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4796711  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  4796712 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 4796811  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4796812 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 4796867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6192615 - 6192360
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  6192615 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 6192516  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  6192515 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 6192416  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    ||||| |||| |||||| | ||| | | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  6192415 aggtcggacctgaaccttggaggcagcagatcaggtgggggcttgccctgtctggt 6192360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 8301226 - 8301481
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  8301226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 8301325  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  8301326 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctctacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 8301425  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8301426 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 8301481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4417218 - 4416966
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  4417218 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 4417119  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||    
T  4417118 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 4417019  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  4417018 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtct 4416966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7073511 - 7073259
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  7073511 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 7073412  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  7073411 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 7073312  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| ||||||||||| || ||||| || |||||    
T  7073311 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgggggcttaccttgtct 7073259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 11110308 - 11110560
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  11110308 ggacatcaagtcttggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11110407  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  11110408 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 11110507  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11110508 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttaccctgtct 11110560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28021574 - 28021322
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  28021574 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgggggacattattctcaaa 28021475  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  28021474 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcataacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 28021375  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28021374 agatcagacctgaaccttggaggtaatggatcaggtggtggcttgccctgtct 28021322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 28115913 - 28116165
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  28115913 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28116012  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
     || | ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  28116013 tgtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 28116112  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  28116113 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaagtgggggcttgccctgtct 28116165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Original strand, 29664929 - 29665178
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  29664929 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29665028  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||     
T  29665029 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacattta 29665128  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    || ||||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||    
T  29665129 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctg 29665178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10396432 - 10396180
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  10396432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 10396333  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
     || | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  10396332 ggtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 10396233  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10396232 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 10396180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 48466226 - 48465974
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  48466226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 48466127  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  48466126 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 48466027  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  48466026 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 48465974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 51782322 - 51782070
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  51782322 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51782223  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  51782222 agtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 51782123  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51782122 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 51782070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 35881065 - 35880810
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  35881065 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 35880966  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  35880965 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttg 35880866  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  35880865 agatcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtttggt 35880810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8212037 - 8211788
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  8212037 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 8211938  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  8211937 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 8211838  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  8211837 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctg 8211788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Original strand, 22870815 - 22871064
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  22870815 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 22870914  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  22870915 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22871014  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  22871015 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctg 22871064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Original strand, 22885874 - 22886123
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  22885874 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 22885973  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  22885974 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22886073  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  22886074 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctg 22886123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 4346646 - 4346898
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||    
T  4346646 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4346745  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  4346746 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 4346845  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4346846 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 4346898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5467284 - 5467032
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  5467284 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5467185  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| |  || ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  5467184 agtcagtttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5467085  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5467084 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 5467032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 6542421 - 6542673
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  6542421 ggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 6542520  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  6542521 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 6542620  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6542621 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 6542673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 18277011 - 18277263
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  18277011 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18277110  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  18277111 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18277210  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18277211 agatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtct 18277263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 18292312 - 18292564
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  18292312 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18292411  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  18292412 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18292511  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18292512 agatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtct 18292564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 18307613 - 18307865
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  18307613 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18307712  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  18307713 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18307812  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18307813 agatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtct 18307865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21674992 - 21674740
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  21674992 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggagcattattctcaaa 21674893  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  21674892 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 21674793  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21674792 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 21674740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 36997036 - 36997288
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||  |||||||| ||||||||    
T  36997036 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatatgggacattattctcaaa 36997135  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  36997136 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 36997235  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36997236 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 36997288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4721930 - 4721675
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||| | || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| |||    
T  4721930 ggacatcgagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctaaaa 4721831  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  4721830 agtcagctttccttgatcaatgagatttttcacgatatacttcaaagtgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 4721731  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    ||||| |||| |||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4721730 aggtcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 4721675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Original strand, 20576806 - 20577055
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  20576806 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 20576905  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||     
T  20576906 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 20577005  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    || ||||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||    
T  20577006 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctg 20577055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 51797412 - 51797159
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  51797412 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51797313  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  51797312 agtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 51797213  T
Q  216 aggtcagaccggaacc-tggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51797212 agatcagacctgaaccttgtgaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 51797159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 5609281 - 5609533
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  5609281 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 5609380  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  5609381 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccttcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5609480  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5609481 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 5609533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 17984915 - 17985167
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  17984915 ggacatcaagtctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 17985014  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| || ||||||||     
T  17985015 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 17985114  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17985115 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 17985167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28339601 - 28339349
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  28339601 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 28339502  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  28339501 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 28339402  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28339401 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 28339349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 5596316 - 5596568
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  5596316 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 5596415  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  5596416 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5596515  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5596516 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 5596568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24328458 - 24328206
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  24328458 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 24328359  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  24328358 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 24328259  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24328258 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 24328206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 31964432 - 31964684
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  31964432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 31964531  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  31964532 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 31964631  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31964632 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 31964684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 50134030 - 50134282
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  50134030 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 50134129  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  50134130 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 50134229  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50134230 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 50134282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5014011 - 5013759
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  5014011 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 5013912  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  5013911 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 5013812  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5013811 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 5013759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7996861 - 7996609
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  7996861 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 7996762  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  7996761 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 7996662  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7996661 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 7996609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10643369 - 10643117
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  10643369 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 10643270  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  10643269 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 10643170  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10643169 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 10643117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18243038 - 18242786
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  18243038 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 18242939  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||    
T  18242938 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18242839  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18242838 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 18242786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 47023752 - 47023500
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  47023752 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 47023653  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  47023652 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 47023553  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  47023552 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 47023500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18225490 - 18225238
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  18225490 ggacatcaagcctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18225391  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  18225390 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18225291  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18225290 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 18225238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 32439422 - 32439204
Alignment:
Q  47 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttc 146  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |  || ||||||||     
T  32439422 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 32439323  T
Q  147 acaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctggaaggtaacggat 246  Q
    || ||||| || | ||||||||| || || |||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| | |||||| || |    
T  32439322 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 32439223  T
Q  247 caggtggaggcttgccctg 265  Q
    | |||||||||||||||||    
T  32439222 ccggtggaggcttgccctg 32439204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20066311 - 20066093
Alignment:
Q  47 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttc 146  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || || |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |  || ||||||||     
T  20066311 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcatattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 20066212  T
Q  147 acaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctggaaggtaacggat 246  Q
    || ||||| || | ||||||||| || || |||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| | |||||| ||      
T  20066211 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggc 20066112  T
Q  247 caggtggaggcttgccctg 265  Q
    | |||||||||||||||||    
T  20066111 ccggtggaggcttgccctg 20066093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4893387 - 4893260
Alignment:
Q  138 agcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctggaag 237  Q
    |||||||| || ||||| || | ||||||||| || || |||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| || || |||||  ||||||| | ||    
T  4893387 agcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagtggaaccttggag 4893288  T
Q  238 gtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    |||| || || |||||||| ||||||||    
T  4893287 gtaaagggtccggtggaggtttgccctg 4893260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28152199 - 28151946
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  28152199 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatatctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 28152100  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28152099 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 28152000  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctg 269  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  28151999 aggtcagaccggagcctgggaggtaacagatcaggtggaggcttcccctgtctg 28151946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 20340253 - 20340508
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20340253 ggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaa 20340352  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20340353 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 20340452  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340453 aggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 20340508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Original strand, 16207951 - 16208204
Alignment:
Q  18 acatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaag 117  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16207951 acatcaagtctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 16208050  T
Q  118 ttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgag 217  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16208051 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 16208150  T
Q  218 gtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16208151 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggttttccctgtctggt 16208204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20461416 - 20461163
Alignment:
Q  18 acatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaag 117  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  | || ||||| |    
T  20461416 acatcaagtctgcgagcttgctcatatacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattatcgaggacatgagggacgatattttcaaagg 20461317  T
Q  118 ttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgag 217  Q
    | || ||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20461316 tcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacctagagcaccttgatgaaaatcacacttgag 20461217  T
Q  218 gtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461216 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 20461163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 51638555 - 51638306
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  51638555 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51638456  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  51638455 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 51638356  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    || ||||||| |||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  51638355 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctg 51638306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10963007 - 10962755
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  10963007 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 10962908  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  10962907 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaagtcacatttg 10962808  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10962807 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 10962755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 41793226 - 41793478
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  41793226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 41793325  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  | |||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  41793326 agtcagcttcccttgatcgacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 41793425  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41793426 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 41793478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28585318 - 28585066
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  28585318 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28585219  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||  ||||||||||| || || ||||||    
T  28585218 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcgcatttg 28585119  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28585118 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 28585066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 2576 - 2831
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2576 ggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaa 2675  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2676 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 2775  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2776 aggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 2831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 29888897 - 29889152
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29888897 ggacatcaagtctgggagcttcctcatacacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 29888996  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29888997 agtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatatg 29889096  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29889097 aggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 29889152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 23892553 - 23892298
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23892553 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 23892454  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892453 agttaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcagagcatagcatctttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 23892354  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892353 aggtcggaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 23892298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33877589 - 33877339
Alignment:
Q  21 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagtta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  33877589 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 33877490  T
Q  121 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33877489 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 33877390  T
Q  221 agaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
     || |||||| ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877389 cgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 33877339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22888803 - 22888562
Alignment:
Q  30 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcctt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888803 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcctt 22888704  T
Q  130 ggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaa 229  Q
    | | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22888703 gatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaa 22888604  T
Q  230 cctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888603 cctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 22888562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11326128 - 11325886
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11326128 gggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcaacgtgattcggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttcct 11326029  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  11326028 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacgga 11325929  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11325928 acttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 11325886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 25199374 - 25199121
Alignment:
Q  18 acatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaag 117  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199374 acatcaagtctgggggctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 25199275  T
Q  118 ttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgag 217  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25199274 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 25199175  T
Q  218 gtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199174 atcagaacggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 25199121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Original strand, 13184476 - 13184718
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  13184476 gggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcct 13184575  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    ||||  ||||| || || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  13184576 tggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacgga 13184675  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184676 acttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 13184718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 24687972 - 24688227
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  24687972 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24688071  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24688072 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttg 24688171  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24688172 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 24688227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Original strand, 13440322 - 13440564
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  13440322 gggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcagaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcct 13440421  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    ||||  ||||| || || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  13440422 tggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacgga 13440521  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440522 acttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 13440564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 23752265 - 23752520
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  23752265 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 23752364  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  23752365 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 23752464  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    ||||| |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23752465 aggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 23752520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30934980 - 30934725
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |  ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  30934980 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatatacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 30934881  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  30934880 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 30934781  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30934780 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 30934725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11549701 - 11549446
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  11549701 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11549602  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  11549601 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 11549502  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11549501 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 11549446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 23717803 - 23718058
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  23717803 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 23717902  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  23717903 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 23718002  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23718003 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 23718058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24970365 - 24970110
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  ||| |  ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  24970365 ggacatcaagtctaggagcttcctcacgtactttgatcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 24970266  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    |||   ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24970265 agtccgctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 24970166  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24970165 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 24970110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 9548358 - 9548610
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  9548358 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 9548457  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  9548458 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttg 9548557  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9548558 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 9548610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 37671298 - 37671550
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  37671298 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 37671397  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  37671398 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 37671497  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37671498 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 37671550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 22998929 - 22999184
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  22998929 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatggtttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 22999028  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  22999029 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttg 22999128  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22999129 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 22999184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33777834 - 33777579
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  33777834 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 33777735  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  33777734 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 33777635  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    ||||| |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33777634 aggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 33777579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 15658575 - 15658827
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  15658575 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 15658674  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  15658675 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 15658774  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15658775 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 15658827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31431787 - 31431535
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  31431787 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31431688  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  31431687 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31431588  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31431587 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 31431535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28649582 - 28649330
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  28649582 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 28649483  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  28649482 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 28649383  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28649382 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 28649330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Original strand, 13324644 - 13324893
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  13324644 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 13324743  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||    
T  13324744 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 13324843  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    || ||||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||    
T  13324844 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctg 13324893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 15758672 - 15758924
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  15758672 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 15758771  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  15758772 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 15758871  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15758872 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 15758924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 31826222 - 31826474
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  31826222 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 31826321  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  31826322 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31826421  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31826422 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 31826474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 43078599 - 43078347
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  43078599 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 43078500  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | || |||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  43078499 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 43078400  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  43078399 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 43078347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 268
Target Start/End: Original strand, 18500559 - 18500797
Alignment:
Q  30 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcctt 129  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| |    
T  18500559 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccct 18500658  T
Q  130 ggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaa 229  Q
    | | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  18500659 gatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaa 18500758  T
Q  230 cctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18500759 ccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 18500797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2511398 - 2511146
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  2511398 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 2511299  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  2511298 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 2511199  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2511198 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 2511146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30168816 - 30168564
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||| ||| ||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30168816 ggacatcaagtctaggagtttcttcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtgggacattattctcaaa 30168717  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  30168716 agtgagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 30168617  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30168616 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 30168564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33516703 - 33516451
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  33516703 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 33516604  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||     
T  33516603 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 33516504  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33516503 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 33516451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 37770802 - 37771054
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  37770802 ggacatcaagtctagaagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 37770901  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||  || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  37770902 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcatgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 37771001  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37771002 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 37771054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 268
Target Start/End: Original strand, 32599286 - 32599539
Alignment:
Q  15 tggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaa 114  Q
    |||||||||||||  || ||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  32599286 tggacatcaagtctaggggcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaa 32599385  T
Q  115 aagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacattt 214  Q
    |||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||    
T  32599386 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaatgcaccttgatgaaaatcacattt 32599485  T
Q  215 gaggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    ||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  32599486 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 32599539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 8665290 - 8665542
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  8665290 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 8665389  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  8665390 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 8665489  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665490 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 8665542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9317798 - 9317546
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  9317798 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9317699  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  9317698 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 9317599  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9317598 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 9317546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12132502 - 12132250
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  12132502 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 12132403  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  12132402 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 12132303  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12132302 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 12132250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30152365 - 30152113
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  30152365 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30152266  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  30152265 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 30152166  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  30152165 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 30152113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 37358458 - 37358710
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || | ||| ||||||||    
T  37358458 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaatattattctcaaa 37358557  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | |||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||    
T  37358558 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 37358657  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37358658 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 37358710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37755327 - 37755075
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  37755327 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 37755228  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  37755227 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 37755128  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  37755127 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtct 37755075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24681787 - 24681538
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  24681787 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 24681688  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||     
T  24681687 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 24681588  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    || ||||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||    
T  24681587 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctg 24681538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24724314 - 24724065
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  24724314 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 24724215  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||     
T  24724214 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 24724115  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    || ||||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||    
T  24724114 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctg 24724065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Original strand, 40473364 - 40473613
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  40473364 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 40473463  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||     
T  40473464 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 40473563  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    || ||||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||    
T  40473564 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctg 40473613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6874652 - 6874400
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  6874652 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 6874553  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  || ||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  6874552 agtcagcttcccttgatcgataagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 6874453  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6874452 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 6874400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 18375227 - 18375479
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  18375227 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18375326  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  18375327 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18375426  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18375427 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 18375479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26480739 - 26480487
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  26480739 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26480640  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  26480639 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 26480540  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26480539 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtct 26480487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3789888 - 3789636
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  3789888 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 3789789  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  3789788 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 3789689  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3789688 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 3789636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 29966881 - 29967133
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  29966881 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 29966980  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  29966981 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 29967080  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29967081 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 29967133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30029762 - 30029510
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  30029762 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 30029663  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  30029662 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 30029563  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  30029562 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 30029510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34616865 - 34616613
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  34616865 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 34616766  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  34616765 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 34616666  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34616665 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 34616613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 268
Target Start/End: Original strand, 28959600 - 28959853
Alignment:
Q  15 tggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaa 114  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  28959600 tggacatcaagtctaggagtctcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaa 28959699  T
Q  115 aagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacattt 214  Q
    |||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||    
T  28959700 aagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 28959799  T
Q  215 gaggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    ||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28959800 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 28959853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5638257 - 5638005
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||    
T  5638257 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattttcaaa 5638158  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  5638157 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5638058  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5638057 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 5638005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41675025 - 41674804
Alignment:
Q  47 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttc 146  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  || ||||||||     
T  41675025 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattattctcaaaagtcagcttcccttgatctataagcttcttg 41674926  T
Q  147 acaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctggaaggtaacggat 246  Q
    || ||||| || | ||||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| | ||| |||||||    
T  41674925 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatggcctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggat 41674826  T
Q  247 caggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    ||||||| ||||| ||||||||    
T  41674825 caggtgggggcttaccctgtct 41674804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 33292841 - 33292623
Alignment:
Q  47 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttc 146  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||| || || || || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |  || ||||||||     
T  33292841 ctcaatcatattcacggcatcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 33292742  T
Q  147 acaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctggaaggtaacggat 246  Q
    || ||||| || | ||||||||| || || |||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| | |||||| || |    
T  33292741 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 33292642  T
Q  247 caggtggaggcttgccctg 265  Q
    | |||||||||||||||||    
T  33292641 ccggtggaggcttgccctg 33292623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Original strand, 1838 - 2090
Alignment:
Q  18 acatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaag 117  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1838 acatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 1937  T
Q  118 ttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgag 217  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1938 ttaa-tttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 2036  T
Q  218 gtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2037 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 2090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6338 - 6098
Alignment:
Q  30 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcctt 129  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| |    
T  6338 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccct 6239  T
Q  130 ggttaatgagcttcttcacaatgtatttc-aaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatg-gaaatcacatttgaggtcagaccgg 227  Q
    | | ||||||||||||||| || || ||| |||||||| || || |||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |    
T  6238 gatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaaatcacatttgagatcagacctg 6139  T
Q  228 aacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6138 aaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 6098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20723 - 20471
Alignment:
Q  18 acatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaag 117  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20723 acatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 20624  T
Q  118 ttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgag 217  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20623 ttaa-tttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 20525  T
Q  218 gtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20524 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 20471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30790 - 30538
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  30790 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30691  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||     
T  30690 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 30591  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30590 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 30538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Original strand, 21703073 - 21703326
Alignment:
Q  18 acatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaag 117  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703073 acatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 21703172  T
Q  118 ttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgag 217  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21703173 ttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcctttgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 21703272  T
Q  218 gtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21703273 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgtcctgtctggt 21703326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 19456333 - 19456583
Alignment:
Q  21 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagtta 120  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || |    
T  19456333 tcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 19456432  T
Q  121 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 220  Q
    | ||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19456433 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcattcttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 19456532  T
Q  221 agaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456533 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 19456583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27119009 - 27118767
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| || || ||||||    
T  27119009 gggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttcct 27118910  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    ||||  ||||| || || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  27118909 tggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacgga 27118810  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27118809 acttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 27118767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 51 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27393268 - 27393048
Alignment:
Q  51 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 150  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||    
T  27393268 atcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttctttacaa 27393169  T
Q  151 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcagg 250  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||| ||| ||||| | |||    
T  27393168 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgggttagg 27393069  T
Q  251 tggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  27393068 tggaggcttgccctgcctggt 27393048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 34303210 - 34303465
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || ||||||||    
T  34303210 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttatagcagcatgtttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaa 34303309  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
     || || ||||||||||  ||||| || || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  34303310 ggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttg 34303409  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    ||||| || |||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303410 aggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 34303465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3784975 - 3784733
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  3784975 gggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcct 3784876  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    ||||  ||||| || || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  3784875 tggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacgga 3784776  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3784775 acttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 3784733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 262
Target Start/End: Original strand, 9349889 - 9350135
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  9349889 ggacgtcaagaccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 9349988  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||     
T  9349989 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 9350088  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgcc 262  Q
    || ||||| |||||||| | |||||| || || ||||||||||||||    
T  9350089 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgcc 9350135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 40233845 - 40233593
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  40233845 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcattttcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 40233746  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40233745 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 40233646  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40233645 aggtcagaccggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 40233593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 27434351 - 27434606
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  27434351 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 27434450  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27434451 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 27434550  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    ||||| |||| |||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27434551 aggtcggacctgaacttgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 27434606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16163920 - 16163678
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  16163920 gggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcct 16163821  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    ||||  ||||| || || ||||||||  |||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  16163820 tggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgccatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacgga 16163721  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16163720 acttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 16163678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 34157331 - 34157090
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  34157331 gggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcct 34157232  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    ||||  ||||| || || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  34157231 tggtctatgagtttttt-acaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacgga 34157133  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34157132 acttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 34157090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 23128473 - 23128728
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  23128473 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 23128572  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  23128573 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 23128672  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23128673 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 23128728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28882548 - 28882293
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  28882548 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28882449  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  28882448 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 28882349  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28882348 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 28882293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 22925935 - 22926187
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  22925935 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 22926034  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  22926035 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22926134  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22926135 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 22926187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20838252 - 20838000
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||  || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  20838252 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcaaatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 20838153  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  20838152 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacattta 20838053  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  20838052 aggtcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtgggggcttgccctgtct 20838000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Original strand, 31891248 - 31891490
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| || |||| ||| || || ||||||    
T  31891248 gggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacgtgagggacgttattcttaaaggtcaattttcct 31891347  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    ||||  ||||| || || ||||||||  |||| || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||| ||    
T  31891348 tggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 31891447  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891448 accttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 31891490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12655876 - 12655621
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  12655876 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 12655777  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  12655776 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 12655677  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12655676 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 12655621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12587144 - 12586895
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  12587144 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 12587045  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||     
T  12587044 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 12586945  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    || ||||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||    
T  12586944 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctg 12586895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Original strand, 13936451 - 13936700
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  13936451 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 13936550  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||     
T  13936551 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 13936650  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    || ||||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||    
T  13936651 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctg 13936700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 16829245 - 16829497
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  16829245 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16829344  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||     
T  16829345 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 16829444  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16829445 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 16829497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16892236 - 16891984
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  16892236 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16892137  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||     
T  16892136 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 16892037  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16892036 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 16891984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37375495 - 37375243
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  ||||||||| || | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  37375495 ggacatcaagtctaggagcttccccacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 37375396  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | || |||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  37375395 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 37375296  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37375295 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 37375243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27777556 - 27777307
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  27777556 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 27777457  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||     
T  27777456 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 27777357  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    || ||||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||    
T  27777356 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctg 27777307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27817314 - 27817065
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  27817314 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 27817215  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||     
T  27817214 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 27817115  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    || ||||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||    
T  27817114 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctg 27817065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 21677089 - 21677341
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  21677089 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 21677188  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  21677189 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 21677288  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677289 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 21677341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 39890408 - 39890156
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  39890408 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 39890309  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| || || |||| |||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  39890308 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcagagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 39890209  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || |||| || |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39890208 agatcagccctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 39890156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Original strand, 12716509 - 12716758
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  12716509 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 12716608  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||     
T  12716609 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 12716708  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    || ||||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||    
T  12716709 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctg 12716758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34286653 - 34286436
Alignment:
Q  51 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 150  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  34286653 atcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 34286554  T
Q  151 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcagg 250  Q
    | || ||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||    
T  34286553 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 34286454  T
Q  251 tggaggcttgccctgtct 268  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  34286453 tgggggcttaccctgtct 34286436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34291713 - 34291496
Alignment:
Q  51 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 150  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  34291713 atcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 34291614  T
Q  151 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcagg 250  Q
    | || ||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||    
T  34291613 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 34291514  T
Q  251 tggaggcttgccctgtct 268  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  34291513 tgggggcttaccctgtct 34291496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Original strand, 39051729 - 39051978
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  39051729 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 39051828  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||     
T  39051829 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 39051928  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    || ||||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||    
T  39051929 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctg 39051978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 260660 - 260912
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||    
T  260660 ggacatcaagtctaggaacttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgttgaggacatgcgggacattattctcaaa 260759  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  260760 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 260859  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  260860 agatcagacctgaaccttggaggcaacagatcaggtgggggcttaccctgtct 260912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 32050132 - 32049880
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  32050132 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 32050033  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  32050032 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 32049933  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| ||||| || ||||| || || ||||||||    
T  32049932 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtgggggtttaccctgtct 32049880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27804038 - 27803792
Alignment:
Q  19 catcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagt 118  Q
    |||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  27804038 catcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagt 27803939  T
Q  119 taactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgagg 218  Q
     | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  27803938 cagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaaga 27803839  T
Q  219 tcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    ||||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||    
T  27803838 tcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctg 27803792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 11635093 - 11635345
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  11635093 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaa 11635192  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||    
T  11635193 agtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 11635292  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11635293 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtct 11635345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 11641282 - 11641534
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  11641282 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaa 11641381  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||    
T  11641382 agtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 11641481  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11641482 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtct 11641534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 19416406 - 19416658
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  19416406 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 19416505  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  19416506 agtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 19416605  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19416606 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 19416658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31876615 - 31876363
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  31876615 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 31876516  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  31876515 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31876416  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31876415 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 31876363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34862014 - 34861762
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||| ||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  34862014 ggacatctagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 34861915  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  34861914 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 34861815  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34861814 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 34861762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 37685816 - 37686068
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  37685816 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37685915  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  37685916 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 37686015  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37686016 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 37686068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 37701081 - 37701333
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  37701081 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37701180  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  37701181 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 37701280  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37701281 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 37701333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37925827 - 37925575
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  37925827 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37925728  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||    
T  37925727 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatggaagtcgcatttg 37925628  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  37925627 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcgggtgggggcttaccctgtct 37925575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 101 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34279698 - 34279531
Alignment:
Q  101 gacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttga 200  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||    
T  34279698 gacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttga 34279599  T
Q  201 tggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34279598 tgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 34279531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1900623 - 1900355
Alignment:
Q  3 gttgcaatgagatggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgaggga 102  Q
    |||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1900623 gttgcaatgttatgaacatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaaggacataaggga 1900524  T
Q  103 cattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 202  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1900523 cattattctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagtgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatg 1900424  T
Q  203 gaaatcacatttgaggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||  | | |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1900423 gaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgagaagcaacggatcaggtggaggcttaccatgtctggt 1900355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 15284851 - 15285101
Alignment:
Q  21 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagtta 120  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || |    
T  15284851 tcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcaacgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 15284950  T
Q  121 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 220  Q
    | ||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15284951 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 15285050  T
Q  221 agaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15285051 agaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 15285101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15228221 - 15227968
Alignment:
Q  18 acatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaag 117  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||| |    
T  15228221 acatcaagtctgggagctatctcatataccccaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgacggacgttattctcaaagg 15228122  T
Q  118 ttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgag 217  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15228121 ttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcgtgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 15228022  T
Q  218 gtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    |||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15228021 gtcagaacggaacctgggaggcaatggatcaggtggaggcttaccctgtctggt 15227968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 51 - 271
Target Start/End: Original strand, 15391291 - 15391511
Alignment:
Q  51 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||    
T  15391291 atcatgttcacagcagcgtgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctagtcaatgagcttctttacaa 15391390  T
Q  151 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcagg 250  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| | |||    
T  15391391 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttagg 15391490  T
Q  251 tggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    ||||||||| ||||| |||||    
T  15391491 tggaggcttcccctgcctggt 15391511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Original strand, 14235456 - 14235698
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14235456 gggagcttcttcataggtctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacgtgagggacattgttctcaaaagttaactttccc 14235555  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    ||||  ||||||||||| |||||| | |||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||    
T  14235556 tggtctatgagcttctttacaatgaacttcaaagcgtaacatccctcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcgaaatgga 14235655  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    |||||| ||| || || | ||||||||||||||||||||||||    
T  14235656 acctgggaggcaaagggttaggtggaggcttgccctgtctggt 14235698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Original strand, 24460536 - 24460778
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  24460536 gggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcct 24460635  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    ||||  ||||| || || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  24460636 tggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacgga 24460735  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24460736 acttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 24460778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17014353 - 17014098
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  17014353 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 17014254  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  17014253 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 17014154  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17014153 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 17014098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14665371 - 14665116
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  14665371 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggatattattctcaaa 14665272  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  14665271 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 14665172  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14665171 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 14665116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 24592232 - 24592487
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  24592232 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgattgggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24592331  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  24592332 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 24592431  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24592432 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 24592487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 36344433 - 36344685
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  36344433 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 36344532  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | || |||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  36344533 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 36344632  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  36344633 agatcagacctgaacctcggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 36344685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5006226 - 5005974
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  5006226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcagaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5006127  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  5006126 agtcaacttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5006027  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5006026 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccttgtct 5005974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6570206 - 6569954
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  6570206 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 6570107  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  6570106 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 6570007  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6570006 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 6569954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 14763222 - 14763474
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  14763222 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 14763321  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  14763322 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 14763421  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14763422 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtct 14763474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 18800531 - 18800783
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  18800531 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 18800630  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  18800631 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 18800730  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18800731 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 18800783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 27163235 - 27163487
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  27163235 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27163334  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  27163335 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 27163434  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27163435 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 27163487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Original strand, 33673716 - 33673965
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  33673716 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 33673815  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  33673816 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 33673915  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    || ||||||| |||||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  33673916 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtggaggcttgccctg 33673965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 39850991 - 39850742
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  39850991 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagggggttgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 39850892  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | || |||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||     
T  39850891 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacattta 39850792  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    || ||||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||    
T  39850791 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctg 39850742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 40105556 - 40105808
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  40105556 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 40105655  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  40105656 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 40105755  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40105756 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 40105808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14098894 - 14098642
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  14098894 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 14098795  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  14098794 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 14098695  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || |||| || |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14098694 agatcagtcctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 14098642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 31126436 - 31126688
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  31126436 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 31126535  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  31126536 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31126635  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  31126636 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgtct 31126688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21970054 - 21969808
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||| | |  |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  21970054 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacatttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 21969955  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||     
T  21969954 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 21969855  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgcc 262  Q
    || ||||| |||||||| | |||||| || || ||||||||||||||    
T  21969854 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgcc 21969808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30754107 - 30753855
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  30754107 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 30754008  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  30754007 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 30753908  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30753907 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 30753855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 54833740 - 54833491
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  54833740 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 54833641  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  54833640 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 54833541  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    || ||||||| |||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  54833540 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctg 54833491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 265
Target Start/End: Original strand, 34188909 - 34189127
Alignment:
Q  47 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttc 146  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |  || ||||||||     
T  34188909 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 34189008  T
Q  147 acaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctggaaggtaacggat 246  Q
    || ||||| || | ||||||||| || || |||||||| || | ||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| | |||||| || |    
T  34189009 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcaccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 34189108  T
Q  247 caggtggaggcttgccctg 265  Q
    | |||||||||||||||||    
T  34189109 ccggtggaggcttgccctg 34189127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24112984 - 24112766
Alignment:
Q  47 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttc 146  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |  || ||||||||     
T  24112984 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 24112885  T
Q  147 acaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctggaaggtaacggat 246  Q
    || ||||| || | ||||||||| || || |||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| | |||||| || |    
T  24112884 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 24112785  T
Q  247 caggtggaggcttgccctg 265  Q
    | |||||||||||||||||    
T  24112784 ccggtggaggcttgccctg 24112766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 51 - 271
Target Start/End: Original strand, 22080790 - 22081010
Alignment:
Q  51 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  22080790 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaa 22080889  T
Q  151 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcagg 250  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| | |||    
T  22080890 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttagg 22080989  T
Q  251 tggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    ||||||||| ||||| |||||    
T  22080990 tggaggctttccctgcctggt 22081010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16283787 - 16283532
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  16283787 ggacaacaagtctaggagcttcctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 16283688  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  16283687 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccttcgacatcatgacccagggtgccttgatggaaatcacatttg 16283588  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16283587 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 16283532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18710924 - 18710672
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  18710924 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18710825  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||    
T  18710824 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccctgatgaaaatcacacttg 18710725  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| | |||||||||||  ||||| ||||||||    
T  18710724 agatcagacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgagggcttaccctgtct 18710672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 44563424 - 44563184
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  44563424 gggagcttcctcatatacctcaatcatgtt-acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaagtcaactttcct 44563326  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    ||||  ||||| || || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  44563325 tggtctatgagtttttt-acaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacgga 44563227  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563226 acttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 44563184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 27608782 - 27609037
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  27608782 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 27608881  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  27608882 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 27608981  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27608982 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 27609037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Original strand, 19658930 - 19659171
Alignment:
Q  29 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| || || ||||||    
T  19658930 gggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttcct 19659029  T
Q  129 tggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 228  Q
    ||||  ||||| || || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  19659030 tggtctatgagtttttt-acaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacgga 19659128  T
Q  229 acctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || ||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19659129 acttgggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggt 19659171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33244988 - 33244748
Alignment:
Q  31 gagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttg 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||    
T  33244988 gagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtggttcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttg 33244889  T
Q  131 gttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaac 230  Q
    ||  ||||| || || ||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  33244888 gtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagcgcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaac 33244789  T
Q  231 ctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
     | | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33244788 ttaggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggt 33244748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19688436 - 19688181
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  19688436 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 19688337  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19688336 agtcaactttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 19688237  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19688236 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 19688181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16277892 - 16277637
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  16277892 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 16277793  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  16277792 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 16277693  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16277692 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 16277637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 12092601 - 12092853
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  12092601 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 12092700  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||    
T  12092701 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 12092800  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12092801 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 12092853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14557962 - 14557707
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||  || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  14557962 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcacatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaa 14557863  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  14557862 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 14557763  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  14557762 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgagggcttgccctgtctggt 14557707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 29829660 - 29829405
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  29829660 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 29829561  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||     
T  29829560 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 29829461  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29829460 agatcagagcggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctggt 29829405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 3329384 - 3329636
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3329384 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 3329483  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||    
T  3329484 agtcagcttcccttgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 3329583  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3329584 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 3329636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 2137136 - 2137391
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| || | || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  2137136 ggacatcaagtctaggagctttctcacatgcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgagacattattctcaaa 2137235  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  2137236 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttg 2137335  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2137336 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 2137391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 9354961 - 9354705
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  9354961 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 9354862  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttc-acaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacattt 214  Q
     || || ||||||||||  ||||| || ||  ||||||||  |||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  9354861 ggtcaattttccttggtctatgagttttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacgtcatgacccatagcaccttgatggaaatcacactt 9354762  T
Q  215 gaggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    |||||| || |||||| ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9354761 gaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 9354705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 31489627 - 31489879
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  31489627 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 31489726  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  31489727 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 31489826  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31489827 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 31489879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19674779 - 19674527
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  19674779 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 19674680  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||    
T  19674679 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacctctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 19674580  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  19674579 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtct 19674527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31354862 - 31354610
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  31354862 ggacatcaagtctgggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 31354763  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  31354762 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 31354663  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  31354662 agatcagacctgaaccttggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtct 31354610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 19208237 - 19208489
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  19208237 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 19208336  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  19208337 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 19208436  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19208437 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtct 19208489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19286800 - 19286551
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  19286800 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 19286701  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  19286700 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 19286601  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctg 265  Q
    || ||||||| |||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19286600 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctg 19286551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 28361832 - 28362084
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  28361832 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 28361931  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  28361932 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 28362031  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28362032 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 28362084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33259061 - 33258809
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||| | || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  33259061 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 33258962  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  33258961 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 33258862  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33258861 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 33258809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 189432 - 189256
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  189432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattaacagaggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 189333  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagag 192  Q
    ||| | ||||||||| | ||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  189332 agtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagag 189256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 71 - 271
Target Start/End: Original strand, 1 - 201
Alignment:
Q  71 attcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcat 170  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttgttctcgaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcat 100  T
Q  171 ccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctgg 270  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  101 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggaggcttgccatgtctgg 200  T
Q  271 t 271  Q
    |    
T  201 t 201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21899 - 21644
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||||||||| |||||| |||  |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  21899 ggacatcaagaccgggaactttttcataagtctcgatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttcttaaa 21800  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  21799 agttaactttccctggtcaatgagcttctttacaatctacttcaaagcgtaacatccttcaacatcttggcccagagccccttgatggaaatcgcacttg 21700  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||||||| |||||    
T  21699 aggtcagaacggaacctgggaggcaacaggttaggtggaggcttgccctgcctggt 21644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 39987 - 40242
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  39987 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 40086  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | |||||||| |||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40087 agtcagctttccttgatcaatgagctccttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 40186  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40187 agatcggacctgaacctggggggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 40242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 46903 - 47158
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  46903 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 47002  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  47003 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 47102  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47103 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 47158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30101 - 29846
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  30101 ggacatcaagtctaagagcttcctcacatacttcgatcatatttacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 30002  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  30001 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcgtgacccagggcgccttggtggaaatcacatttg 29902  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29901 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 29846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27629 - 27375
Alignment:
Q  17 gacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaa 116  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  27629 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaa 27530  T
Q  117 gttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttga 216  Q
    || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  27529 gtcagctttccttgatcaataagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttga 27430  T
Q  217 ggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    | || |||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27429 gatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggt 27375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 47 - 302
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  47 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 146  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  147 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccaacgcgccttgatgaaaatcacatttg 246  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggt 271  Q
    || || |||| |||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  247 agatcggacctgaacttgggaggcaacggatccggtgggggcttgccctgtctggt 302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9904 - 9652
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  9904 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9805  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  9804 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 9705  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||| | |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9704 agatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtct 9652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 51 - 208
Target Start/End: Original strand, 571 - 728
Alignment:
Q  51 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||    
T  571 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattattctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttctttacaa 670  T
Q  151 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatc 208  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  671 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcatcttgatggaaatc 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8287 - 8035
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  8287 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 8188  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| | |||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||    
T  8187 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 8088  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8087 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtct 8035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 7157 - 7409
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  7157 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 7256  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  7257 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 7356  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7357 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 7409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 8984 - 9236
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  8984 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9083  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  9084 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 9183  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9184 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 9236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20353 - 20101
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  20353 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 20254  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  20253 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 20154  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20153 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 20101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 14848 - 15100
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  14848 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcacattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 14947  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| || |||||||||    
T  14948 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 15047  T
Q  216 aggtcagaccggaacctggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15048 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 15100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 26119 - 26372
Alignment:
Q  16 ggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaa 115  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  26119 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26218  T
Q  116 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 215  Q
    ||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  26219 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26318  T
Q  216 aggtcagaccggaacc-tggaaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 268  Q
    || ||||||| ||||| | | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26319 agatcagacctgaacctttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 26372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Original strand, 46764 - 46981
Alignment:
Q  60 acagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaa-gttaacttt-ccttggttaatgagcttcttcacaatgtattt 157  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||   |||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||    
T  46764 acagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaaagtccgcttttccttgatcaatgagcttcttcacgatatactt 46863  T
Q  158 caaagcata-gcatccttcgacatc-at--gacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagacc-ggaacctggaaggtaacggatcaggtg 252  Q
    ||||||||| ||| || |||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| | ||| |||||||||||||    
T  46864 caaagcatacgcacccctcgacatccattcgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggaccttgaaccttggaggcaacggatcaggtg 46963  T
Q  253 gaggc--ttgccctgtct 268  Q
    | |||  |||||||||||    
T  46964 ggggcgtttgccctgtct 46981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 395 - 277
Alignment:
Q  48 tcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttca 147  Q
    ||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| |||  |    
T  395 tcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttggtcaataagcctctgga 296  T
Q  148 caatgtatttcaaagcata 166  Q
    |||| || || ||||||||    
T  295 caatatactttaaagcata 277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University