View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10258_low_18 (Length: 290)

Name: NF10258_low_18
Description: NF10258
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10258_low_18
NF10258_low_18
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (1-272)||(55933389-55933663)
chr4 (2-272)||(53619491-53619766)
chr4 (2-272)||(50000852-50001128)
chr4 (2-169)||(3329901-3330073)
chr4 (1-240)||(600651-600895)
chr4 (79-272)||(31847072-31847267)
chr4 (2-216)||(23255618-23255828)
chr4 (88-273)||(12918298-12918485)
chr4 (8-219)||(34107674-34107892)
chr4 (11-242)||(48656867-48657108)
chr4 (10-139)||(4419176-4419310)
chr4 (11-240)||(46440848-46441082)
chr4 (1-241)||(30940697-30940935)
chr4 (19-220)||(56462086-56462291)
chr4 (2-143)||(39001302-39001448)
chr4 (90-272)||(132381-132567)
chr4 (2-241)||(26521394-26521637)
chr4 (121-248)||(50462897-50463024)
chr4 (3-272)||(53170418-53170687)
chr4 (129-238)||(16957579-16957688)
chr4 (11-272)||(25504209-25504473)
chr4 (85-174)||(50483221-50483312)
chr4 (117-241)||(12053438-12053562)
chr4 (11-114)||(16955374-16955480)
chr4 (11-169)||(7536601-7536764)
chr4 (12-161)||(38535607-38535760)
chr4 (37-206)||(28739845-28740020)
chr4 (11-73)||(50442610-50442672)
chr4 (85-147)||(54190903-54190967)
chr4 (72-197)||(43849350-43849477)
chr4 (81-174)||(53098408-53098503)
chr4 (57-176)||(6865843-6865967)
chr4 (2-73)||(8738110-8738181)
chr4 (12-74)||(18981669-18981729)
chr4 (10-51)||(1041338-1041379)
chr4 (224-272)||(3330082-3330130)
chr4 (130-206)||(41440075-41440151)
chr4 (11-51)||(50464449-50464489)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (2-272)||(34644471-34644746)
chr1 (2-272)||(2764384-2764659)
chr1 (2-272)||(28041054-28041329)
chr1 (2-219)||(22346800-22347022)
chr1 (11-221)||(31737301-31737515)
chr1 (2-210)||(21472908-21473121)
chr1 (117-271)||(19035472-19035626)
chr1 (85-241)||(29169751-29169909)
chr1 (3-272)||(45659574-45659847)
chr1 (23-239)||(4861949-4862170)
chr1 (94-242)||(16500034-16500184)
chr1 (2-228)||(20259768-20259999)
chr1 (11-220)||(2898616-2898833)
chr1 (151-241)||(50161375-50161465)
chr1 (2-169)||(24177541-24177713)
chr1 (2-163)||(47459587-47459753)
chr1 (12-201)||(50314622-50314815)
chr1 (120-242)||(25375790-25375912)
chr1 (34-187)||(38731546-38731704)
chr1 (90-220)||(42919856-42919987)
chr1 (3-109)||(48841174-48841283)
chr1 (121-272)||(37200012-37200162)
chr1 (5-67)||(4611097-4611159)
chr1 (151-216)||(35387643-35387708)
chr1 (11-60)||(45835330-45835379)
chr1 (2-58)||(28493477-28493533)
chr1 (2-73)||(868534-868603)
chr1 (5-49)||(1114023-1114067)
chr1 (144-220)||(23043929-23044005)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (2-272)||(17249232-17249507)
chr6 (2-272)||(33220638-33220913)
chr6 (2-272)||(34304401-34304676)
chr6 (2-273)||(357643-357918)
chr6 (12-241)||(4206554-4206788)
chr6 (11-273)||(959495-959761)
chr6 (85-272)||(45604-45793)
chr6 (12-201)||(4165920-4166114)
chr6 (12-248)||(29338030-29338271)
chr6 (130-273)||(28008913-28009059)
chr6 (130-241)||(34415474-34415585)
chr6 (2-110)||(32115623-32115734)
chr6 (137-242)||(34168913-34169018)
chr6 (2-231)||(28625836-28626070)
chr6 (116-241)||(28543399-28543524)
chr6 (90-218)||(34554258-34554388)
chr6 (178-240)||(32115775-32115837)
chr6 (11-73)||(3137378-3137440)
chr6 (130-211)||(6225110-6225191)
chr6 (145-242)||(12401384-12401481)
chr6 (85-217)||(24016328-24016462)
chr6 (117-217)||(3714942-3715042)
chr6 (11-169)||(13398212-13398375)
chr6 (2-57)||(7749386-7749441)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (1-272)||(28517214-28517490)
chr7 (5-273)||(21326764-21327037)
chr7 (2-233)||(19277196-19277434)
chr7 (6-272)||(5825182-5825451)
chr7 (11-241)||(22197901-22198135)
chr7 (11-241)||(22239686-22239920)
chr7 (11-271)||(27521385-27521650)
chr7 (5-201)||(40726478-40726679)
chr7 (1-233)||(982853-983090)
chr7 (11-272)||(32584514-32584781)
chr7 (3-272)||(4501165-4501438)
chr7 (11-272)||(43856788-43857054)
chr7 (2-272)||(45613769-45614044)
chr7 (11-169)||(48539095-48539258)
chr7 (2-262)||(24527494-24527759)
chr7 (130-272)||(3676677-3676820)
chr7 (11-217)||(30216040-30216251)
chr7 (11-221)||(10905032-10905246)
chr7 (11-209)||(42295174-42295377)
chr7 (8-240)||(34772693-34772927)
chr7 (85-240)||(9281091-9281247)
chr7 (85-240)||(9292062-9292218)
chr7 (91-218)||(47679122-47679250)
chr7 (2-73)||(45003028-45003099)
chr7 (2-73)||(41117901-41117972)
chr7 (2-262)||(25186873-25187133)
chr7 (97-239)||(2904368-2904512)
chr7 (11-217)||(23037459-23037669)
chr7 (2-73)||(27027761-27027832)
chr7 (181-272)||(33202392-33202483)
chr7 (179-241)||(1249673-1249735)
chr7 (144-206)||(43383221-43383283)
chr7 (97-171)||(6634991-6635067)
chr7 (10-73)||(5714953-5715016)
chr7 (85-176)||(10032194-10032287)
chr7 (5-58)||(38839234-38839287)
chr7 (11-63)||(2904294-2904346)
chr7 (11-59)||(36559012-36559060)
chr7 (117-149)||(45424758-45424790)
chr7 (4-72)||(45974731-45974799)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (13-272)||(35310364-35310628)
chr5 (2-242)||(13166867-13167112)
chr5 (5-225)||(25663006-25663231)
chr5 (2-272)||(27336600-27336873)
chr5 (2-242)||(37873595-37873840)
chr5 (2-272)||(33691982-33692254)
chr5 (9-241)||(32269755-32269992)
chr5 (5-176)||(430510-430686)
chr5 (130-248)||(3114114-3114232)
chr5 (90-272)||(14423678-14423858)
chr5 (9-272)||(15291953-15292220)
chr5 (117-241)||(35455981-35456105)
chr5 (28-220)||(38875570-38875766)
chr5 (2-197)||(42921603-42921802)
chr5 (85-272)||(43129525-43129714)
chr5 (130-241)||(32230465-32230576)
chr5 (90-248)||(43115409-43115568)
chr5 (90-195)||(34335333-34335440)
chr5 (4-167)||(22188687-22188855)
chr5 (129-218)||(26212564-26212653)
chr5 (4-272)||(8100461-8100732)
chr5 (2-102)||(2566194-2566297)
chr5 (170-272)||(433370-433472)
chr5 (11-73)||(23023509-23023571)
chr5 (92-149)||(23423921-23423980)
chr5 (125-272)||(9829281-9829426)
chr5 (151-210)||(8858975-8859034)
chr5 (12-49)||(12033346-12033383)
chr5 (119-192)||(13307383-13307456)
chr5 (117-200)||(14436525-14436605)
chr5 (81-169)||(15833049-15833136)
chr5 (195-272)||(38446267-38446346)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (2-272)||(39434572-39434847)
chr8 (5-272)||(3187878-3188149)
chr8 (11-269)||(38815208-38815471)
chr8 (16-272)||(24124947-24125208)
chr8 (85-272)||(500219-500407)
chr8 (2-217)||(6592481-6592700)
chr8 (1-273)||(25021740-25022017)
chr8 (85-272)||(35739914-35740102)
chr8 (11-217)||(6618199-6618409)
chr8 (5-169)||(37514129-37514298)
chr8 (94-217)||(8540359-8540484)
chr8 (130-243)||(4073573-4073686)
chr8 (11-200)||(28196106-28196300)
chr8 (136-210)||(8882371-8882445)
chr8 (11-272)||(4699785-4700048)
chr8 (2-141)||(22589395-22589538)
chr8 (82-241)||(8619802-8619963)
chr8 (117-219)||(10189568-10189670)
chr8 (120-242)||(42922084-42922206)
chr8 (21-162)||(3821148-3821294)
chr8 (12-73)||(24451036-24451096)
chr8 (85-162)||(3863308-3863387)
chr8 (11-67)||(8882258-8882314)
chr8 (161-241)||(37517163-37517243)
chr8 (130-240)||(8115849-8115959)
chr8 (5-97)||(42659135-42659230)
chr8 (11-73)||(4066759-4066821)
chr8 (96-162)||(3825637-3825705)
chr8 (10-114)||(9259379-9259486)
chr8 (179-220)||(11611223-11611264)
chr8 (2-110)||(18804518-18804628)
chr8 (98-200)||(36004126-36004230)
chr8 (35-156)||(43823927-43824053)
chr8 (3-51)||(24320243-24320291)
[»] chr3 (30 HSPs)
chr3 (2-272)||(39583156-39583431)
chr3 (2-239)||(26772663-26772905)
chr3 (11-272)||(44198681-44198947)
chr3 (14-272)||(53785626-53785889)
chr3 (10-272)||(7900771-7901038)
chr3 (15-241)||(3443270-3443501)
chr3 (1-233)||(52741477-52741715)
chr3 (1-241)||(13582414-13582658)
chr3 (2-198)||(32546700-32546901)
chr3 (2-192)||(38670887-38671082)
chr3 (11-241)||(49017881-49018112)
chr3 (3-242)||(5338552-5338796)
chr3 (11-272)||(38145970-38146236)
chr3 (2-222)||(37132976-37133201)
chr3 (5-240)||(4472970-4473209)
chr3 (11-176)||(52411914-52412084)
chr3 (58-192)||(51234577-51234716)
chr3 (117-240)||(46940729-46940852)
chr3 (10-241)||(25324942-25325180)
chr3 (2-169)||(26856792-26856964)
chr3 (90-240)||(37992328-37992480)
chr3 (94-215)||(54508367-54508491)
chr3 (96-200)||(7502010-7502117)
chr3 (11-73)||(4669794-4669856)
chr3 (2-59)||(26276520-26276577)
chr3 (11-106)||(4763888-4763985)
chr3 (133-200)||(35484691-35484758)
chr3 (2-110)||(44738-44852)
chr3 (11-169)||(38978829-38978992)
chr3 (11-75)||(32690995-32691059)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (2-272)||(4412993-4413268)
chr2 (2-272)||(28224905-28225180)
chr2 (2-263)||(41867844-41868109)
chr2 (29-272)||(44686348-44686599)
chr2 (4-272)||(27502269-27502541)
chr2 (2-272)||(9685342-9685617)
chr2 (5-241)||(17344546-17344787)
chr2 (11-272)||(3825640-3825907)
chr2 (131-272)||(23484865-23485006)
chr2 (85-240)||(5532411-5532567)
chr2 (2-197)||(18744956-18745156)
chr2 (11-241)||(19161741-19161976)
chr2 (55-208)||(34814810-34814967)
chr2 (54-169)||(20142755-20142875)
chr2 (10-219)||(16351821-16352038)
chr2 (96-220)||(2888518-2888644)
chr2 (11-150)||(13413265-13413409)
chr2 (90-217)||(29808071-29808199)
chr2 (151-218)||(1296031-1296098)
chr2 (2-65)||(15515286-15515349)
chr2 (9-114)||(8036569-8036679)
chr2 (2-110)||(11921301-11921406)
chr2 (184-270)||(20142669-20142755)
chr2 (85-187)||(32029098-32029202)
chr2 (5-73)||(27494219-27494287)
chr2 (121-175)||(10579803-10579857)
chr2 (2-51)||(26407847-26407896)
chr2 (2-43)||(42122722-42122763)
chr2 (85-182)||(2886632-2886731)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (46-272)||(6283-6513)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (2-241)||(103011-103254)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (11-272)||(33164-33429)
[»] scaffold1768 (1 HSPs)
scaffold1768 (11-272)||(111-377)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (123-222)||(49442-49541)
[»] scaffold0470 (1 HSPs)
scaffold0470 (11-217)||(7517-7727)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (98-272)||(10364-10544)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (120-241)||(47497-47618)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (90-220)||(18344-18475)
[»] scaffold0119 (1 HSPs)
scaffold0119 (151-218)||(16193-16260)
[»] scaffold0493 (1 HSPs)
scaffold0493 (117-190)||(8525-8598)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 55933663 - 55933389
Alignment:
Q  1 tcgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatg 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||    
T  55933663 tcgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacaacattcacggacctaggagacataatattgttatgtataaccctttggactctatg 55933564  T
Q  98 tagaaggtcaacaacctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccac 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55933563 tagaaggtcaacaacctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccac 55933464  T
Q  198 tttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  55933463 tttgtttgacgcaacttttagggctgactgtcctaccgtaaaagccctgacccttaaacccacaaggggtgaaac 55933389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 272
Target Start/End: Original strand, 53619491 - 53619766
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||   ||| |||||| ||| ||||||||||    
T  53619491 cgctagacctttttggatggcaaaaccaattctcgtaaacacaacattcatggacctaagagacataacattgttatgcataaccctttagactctatgt 53619590  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    |||||||||||  |||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||    
T  53619591 agaaggtcaactgcctctgatgctaggaagtcaaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 53619690  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||| || ||   |||||||||||| ||||||||    
T  53619691 ctttgcttgacgcagcttttagggttgcctgtcctactgtaaaagcccccacctctaaacccacaagtggtgaaac 53619766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 50001128 - 50000852
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||   ||| |||||| |||||||| |||||    
T  50001128 cgctagatctttttggatggcaaaatcaatcttcgtaaacacaacatttatggatctaggagacataacattgctatgcataaccctttggactatatgt 50001029  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaat-aaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcc 195  Q
    |||||||||||  |||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||    
T  50001028 agaaggtcaactgcctctgatgctagaaagccaaaagtgtcaaaagcaaattgtattaaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttgacc 50000929  T
Q  196 actttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| || || | | |||||||||| ||||||||    
T  50000928 actttgcttgacgcagcttttagagctgtctgtcctaccgtaaaagcccccaccccttaacccacaagtggtgaaac 50000852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 169
Target Start/End: Original strand, 3329901 - 3330073
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacat---tatgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||    
T  3329901 cgctagacctttttggatggcaaaaccaatcatcgtaaacacagcattcatggacctaggagacataacattgctatgcataaccctttggactctatgt 3330000  T
Q  99 agaaggtcaacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgt 169  Q
    |||||||||||  |  |||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3330001 agaaggtcaactgcctctgatgctaggaagccaaaagtgtcaaaagcaaatagtataaaagcatgttgattgt 3330073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 600895 - 600651
Alignment:
Q  1 tcgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacat---tatgtataaccatttggactctatg 97  Q
    |||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||   |||  || ||| |||| ||||||||    
T  600895 tcgctatacatttttggatggcaaaactaatcatcgtaaacacagcattaatggacctaggagacatgacatagttatacatgaccttttgaactctatg 600796  T
Q  98 tagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcc 195  Q
    |||||||||||||||||  | || ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |    
T  600795 tagaaggtcaacaacctctggtgttaggaaaccgaaagtgacaaaagcaaatggtataaaagcatgttaattgttagaacacgttttctcatgtttggtc 600696  T
Q  196 actttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaa 240  Q
    |||||| |||||  ||||||||||| |  ||||||||| ||||||    
T  600695 actttgcttgacataacttttagggttgtctgtcctacagtaaaa 600651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 272
Target Start/End: Original strand, 31847072 - 31847267
Alignment:
Q  79 taaccatttggactctatgtagaaggtcaacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaaca 176  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| ||||||    
T  31847072 taaccgtttggactctatgtagaaggtcaaccgcttctgatgctaggaagccaaaagtgtcaaaagcaaatggtaaaaaaacatgttgactgtcagaaca 31847171  T
Q  177 aactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
       ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  31847172 tggtttctcatgtttgaccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctactgtaaaagcccccacccctaaacccacaagtggtgaaac 31847267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 23255618 - 23255828
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataaca---ttatgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||   ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23255618 cgctagacttttctggatggcaaaatcaatcctcgtaaacacaatattcatggacttaggagacataacattgttatgcataaccctttggactctatgt 23255717  T
Q  99 agaaggtcaacaacc--tgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    |||||||||||  ||  |||||||| |||         ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  23255718 agaaggtcaactgcctatgatgctaagaa---------gtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttaattgtcagaacacgctttctcatgtttggcca 23255808  T
Q  197 ctttgtttgacgcaactttt 216  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  23255809 ctttgcttgacgcaactttt 23255828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 88 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12918485 - 12918298
Alignment:
Q  88 ggactctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctc 185  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||  |||||||||| ||||||   |||||     
T  12918485 ggactctatctagaaggtcaacaatctctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagtaaatagtataaaagtgtgttgattgtcagaacacgatttctt 12918386  T
Q  186 atgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaact 273  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| | |||||||    
T  12918385 atgtttgaccactttgtttgacgcaacttttagggttgtttgtcctaccgtaaaagccccgaatcttaatcccacaagtgatgaaact 12918298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34107892 - 34107674
Alignment:
Q  8 acttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaagg 104  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||   ||| || ||  |||| |||||||||||||||    
T  34107892 acttttttggatgacaaaaccaatcctcgtgaacacaacattcatggatctaggagacataacattgttatgcatgactttttgaactctatgtagaagg 34107793  T
Q  105 tcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaac--tttctcatgtttggccacttt 200  Q
    |||||| |||  | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |  ||||| ||  ||||||||||||||||||||     
T  34107792 tcaacagcctctggtgctaggaaatcgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaaacatgttgattatctgaacacacgttttctcatgtttggccacttc 34107693  T
Q  201 gtttgacgcaacttttagg 219  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  34107692 gtttgacgcaatttttagg 34107674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 48657108 - 48656867
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaagg--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||       
T  48657108 tttttggacggcaaaatcaatcatcgtaaacacaacattcatagacctatgagacataacattgctatgcataatcatttggactctatgtagaaggaag 48657009  T
Q  105 -tcaacaacctg--at-gctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccacttt 200  Q
     ||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||  | |||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  48657008 gtcaacaacctctaatcgctaagaagtcgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaaacattttgattgacataacacactttctcatgtttgtccatttt 48656909  T
Q  201 gtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagc 242  Q
      |||| | |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||    
T  48656908 acttgatgaaacttttagggctgtctgtcatactgtaaaagc 48656867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 139
Target Start/End: Original strand, 4419176 - 4419310
Alignment:
Q  10 ttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataaca---ttatgtataaccatttggactctatgtagaaggtc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  4419176 ttttttggatggcaaaaccaatcatcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattgttatgcataaccctttgaactctatgtagaaggtc 4419275  T
Q  107 aacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaa 139  Q
    ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4419276 aacaacctctgatgctacgaagccgaaagtgtcaa 4419310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 46441082 - 46440848
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| | |   |||| | ||||| |||||||| ||||   ||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  46441082 tttttagatgacaaaatcaatcatcgtaaatataattttcatgaacctatgagacatagcattgctatgcacaaccctttggactctatgtagaaggtca 46440983  T
Q  108 acaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttg 205  Q
     || |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| | |||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  46440982 gcagcttctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcaaatgatataaaaacgtgttaattgttagaacacacttttttatgtttgaccactttgtttg 46440883  T
Q  206 acgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaa 240  Q
    |||  ||||||||| |||  | |||||| ||||||    
T  46440882 acgttacttttaggactatttatcctactgtaaaa 46440848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30940935 - 30940697
Alignment:
Q  1 tcgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatg 97  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||  ||||||||| | || |||||   ||| || ||| |||| ||||||||    
T  30940935 tcgctagacctttttggatggcaaaatcaatcctcatgaacacaacattcatagacctaggatatatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatg 30940836  T
Q  98 tagaaggtcaacaacctga--tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcc 195  Q
    |||||      || ||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||    
T  30940835 tagaa------cagcctcaggtgctaggaaatcgaaagtgtcaaaagcaa-tggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttgacc 30940743  T
Q  196 actttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaag 241  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||    
T  30940742 actttacttgacgcaacttttagggttgtctgtcctatggtaaaag 30940697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 56462291 - 56462086
Alignment:
Q  19 tggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtcaacaacct- 114  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||   ||| || | | |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  56462291 tggcaaaaccaattctcgtaaacacaacatttatggacttaggagacatgacattgtcatgcatgatcctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctc 56462192  T
Q  115 -gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaact 213  Q
     | |||||||||  | |||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  56462191 tggtgctaggaaaccaaaagtgtctaaaacaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttatcatgttt-gccactttgtttgacgcaact 56462093  T
Q  214 tttaggg 220  Q
    |||||||    
T  56462092 tttaggg 56462086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 39001302 - 39001448
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataaca---ttatgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||   ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  39001302 cgctagacctttttggatgacaaaaccaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacacaacattgttatgcataatcctttggactctatgt 39001401  T
Q  99 agaaggtcaacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagc 143  Q
    |||||||||||  |  ||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  39001402 agaaggtcaactgcctctgatcctaggaagccaaaagtgtcaaaagc 39001448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 272
Target Start/End: Original strand, 132381 - 132567
Alignment:
Q  90 actctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcat 187  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||  |||  ||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  132381 actctgtgtagaatgtcaacaatctctgatattaggaaaccgaaagtgtaaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgatttctcat 132480  T
Q  188 gtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcct--accgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    |||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  132481 gttttgccattttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacaccgtaaaagtcccgacccctaatccaacaagtggtgaaac 132567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Original strand, 26521394 - 26521637
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    ||||| || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| || || ||||||| |||| |||||   | | || ||| |||| ||| |||||    
T  26521394 cgctaaacctttttggatgacaaaaccaatcctcgtaaacacaacat-catgggcctaggatacatgacattgctacgcatgaccctttgaactgtatgt 26521492  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    |||||||||||| |||  | |||||||||  | |||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||||| | ||||   ||| |||||||| ||||    
T  26521493 agaaggtcaacagcctctggtgctaggaaaccaaaagtgttgaaagcatatgatataaaagcatgttgattgtcataacacgttttttcatgtttagcca 26521592  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaag 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||||    
T  26521593 ctttgtttgacgcaacttttagggttgtttgtcctaccataaaag 26521637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 50463024 - 50462897
Alignment:
Q  121 aggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttaggg 220  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||    
T  50463024 aggaaatcaaaagtgtcaaaagcaaatggtatgaaagcatgttgattgtcggaagacactttctcatgtttggtcatcttgcttgacgcaacttttaagg 50462925  T
Q  221 ctacctgtcctaccgtaaaagcaccgac 248  Q
    ||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  50462924 ctgtctgtcctaccgtagaagtaccgac 50462897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Original strand, 53170418 - 53170687
Alignment:
Q  3 gctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacc--taggagacataacat---tatgtataaccatttggactctatg 97  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||  |||||||||| ||||   |||| || ||| |||| ||||||||    
T  53170418 gctagacctttttagatagcaaaatcaatcctcgtgaacacaacattca-tgacctataggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatg 53170516  T
Q  98 tagaaggtcaacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcc 195  Q
    ||||||||||||| |  ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||     
T  53170517 tagaaggtcaacagcctctggtgctagcaaaccgaaagtgtcaaaagcaaat------caagcatgttgactgtcagaacacgctttctcatgtttggct 53170610  T
Q  196 actttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    |||||   | || | |||||||||||| |||||| ||| |||||||  ||||| | ||| ||||| || ||||||||    
T  53170611 actttacctaacacgacttttagggctgcctgtcatactgtaaaaggtccgacacctaatcccacgagtggtgaaac 53170687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 238
Target Start/End: Original strand, 16957579 - 16957688
Alignment:
Q  129 gaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||| || ||| |    
T  16957579 gaaagtgtcaaaagcaaatggtatataagcatgttgattatcagagcacactttctcatgtttggtcattttgctctacgcaacttttaggactgcctat 16957678  T
Q  229 cctaccgtaa 238  Q
    ||||| ||||    
T  16957679 cctactgtaa 16957688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Original strand, 25504209 - 25504473
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatta---tgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    |||||| ||||||||| ||||| || ||||||||  ||||| ||||||| ||||||| ||||||   || || ||| |||  ||||||| || |||||||    
T  25504209 tttttgaatggcaaaagcaatcctcataaacacaatattcatggacctatgagacatgacattactatgcatgaccttttaaactctatttaaaaggtca 25504308  T
Q  108 acaacctga--tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttg 205  Q
    |||  ||    |||||||||  | ||| ||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||| |||| |||    
T  25504309 acagtctctagtgctaggaaaccaaaaatgtcaaaagcaaacggtataaaaacatgtcgattgttagaacacgttttctcatgtttgacca-tttgcttg 25504407  T
Q  206 acgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    | ||||| ||||||| | |||||| |||||||||||  | ||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  25504408 atgcaac-tttagggttgcctgtcataccgtaaaaggcctgacgcctaatcccacaagtggtgaaac 25504473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 50483312 - 50483221
Alignment:
Q  85 tttggactctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaa 174  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  50483312 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcgaaagcaaatggtataaaatcatgttgattgtcagaa 50483221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 241
Target Start/End: Original strand, 12053438 - 12053562
Alignment:
Q  117 tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaactttt 216  Q
    ||||||||| | ||||| ||| ||||||||||  |||||| | | |||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  12053438 tgctaggaaattgaaagagtcgaaagcaaatgatataaaaacgttttgattgttagaacacgatttctcatgtttgacaactttgtttgacgcagctttt 12053537  T
Q  217 agggctacctgtcctaccgtaaaag 241  Q
    || |||   |||||||| |||||||    
T  12053538 agagctgtttgtcctactgtaaaag 12053562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Original strand, 16955374 - 16955480
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacat---tatgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||   |||| || ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16955374 ttttttgatggccaaatcaatcctcgtaaacacaacattcatgggcctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtca 16955473  T
Q  108 acaacct 114  Q
     ||||||    
T  16955474 gcaacct 16955480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7536764 - 7536601
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    |||||||||  ||||| ||||||| ||||||| | |||||| ||| ||| ||||||||| |||   ||| |  | |||||| ||||||||||||||||||    
T  7536764 tttttggatcacaaaaccaatcattgtaaacataacattcatggatctacgagacataaaattgctatgcacgatcatttgaactctatgtagaaggtca 7536665  T
Q  108 acaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgt 169  Q
    |||||  ||| |||||||||   |||| |||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  7536664 acaacctctggtgctaggaaactgaaattgtcaaaaacaaattgtataaaaacatgttgattgt 7536601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 38535760 - 38535607
Alignment:
Q  12 ttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtcaa 108  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||| || |||||||  |||||| |||||   ||| || ||  |||| |||||||||||| ||| ||    
T  38535760 ttttggatg-caaaactaatcctcgtaaacacaacatccatggacctataagacatgacattgctatgcatgactctttgaactctatgtagagggtgaa 38535662  T
Q  109 caacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatg 161  Q
    ||||||  | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  38535661 caacctctggtgctaggaagtcaaaagtgtcaaatgcaaatggtataagagcatg 38535607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Original strand, 28739845 - 28740020
Alignment:
Q  37 taaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtcaacaacctga--tgctaggaagtcgaa 131  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||   ||| ||  |   ||| |||||||||| |||||||||||| ||   || ||||||||||||    
T  28739845 taaacacaacatttatggacctaggagacataacattgttatgcattgcacgttgaactctatgtaaaaggtcaacaacttgtggtgttaggaagtcgaa 28739944  T
Q  132 agtgtcaaaagcaaatggaataaaa-gcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttga 206  Q
    |||||||||   |||||| ||||||  |||||| | ||| | |||| | |||||| |||||||||||||| |||||    
T  28739945 agtgtcaaacataaatggtataaaacacatgttaactgtcacaacacaatttctcgtgtttggccactttatttga 28740020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 50442672 - 50442610
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt 73  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| || | |||||||||||||||||||    
T  50442672 tttttggatggcaaaaccaatcctcttaaacacaacatccatgaacctaggagacataacatt 50442610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 54190967 - 54190903
Alignment:
Q  85 tttggactctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaat 147  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  54190967 tttgaactctatgtggaaggtcaacaacctctgatactagaaagtcaaaagtgtcaaaagcaaat 54190903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 43849477 - 43849350
Alignment:
Q  72 ttatgtataaccatttggactctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgt 169  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||  | | |||||||| | |||||||||||  ||||| | |||||||||||||| || |    
T  43849477 ttatgcatgaccatttgaactctttgtagaagatccacaacctttggttctaggaagccaaaagtgtcaaacacaaatagtataaaagcatgttggttat 43849378  T
Q  170 tagaacaaactttctcatgtttggccac 197  Q
      |||||  ||||||| |||||||||||    
T  43849377 ctgaacacgctttctcgtgtttggccac 43849350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 174
Target Start/End: Original strand, 53098408 - 53098503
Alignment:
Q  81 accatttggactctatgtagaaggtcaacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaa 174  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  | ||| ||||||||| ||| ||   |||| |||||||||||| ||||    
T  53098408 accatttgaactctatgtagaaggttaacaacctctgatgctaggaaaccaaaaatgtcaaaaggaaacggttcaaaaacatgttgattgtcagaa 53098503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6865967 - 6865843
Alignment:
Q  57 ctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtcaacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaa 151  Q
    ||||||||||| |||||   ||| || ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||  ||  ||||| ||||   |||||||||||||||||||  |    
T  6865967 ctaggagacatgacattgctatgcattaccctttgaactctatgtaaaaggttaacaacatctagtgctatgaagctcaaagtgtcaaaagcaaatgata 6865868  T
Q  152 taaaagcatgttgattgttagaaca 176  Q
    ||||||||||||||| || ||||||    
T  6865867 taaaagcatgttgatagtcagaaca 6865843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 73
Target Start/End: Original strand, 8738110 - 8738181
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt 73  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||    
T  8738110 cgctaaacttttttggatgacaaaatcaatctttgtatacacaacattcatgaacctaagagacatgacatt 8738181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18981729 - 18981669
Alignment:
Q  12 ttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatta 74  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  18981729 ttttggatggcaaac-caatcatcgtaaacacaacattcatggaccta-gagacatgacatta 18981669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Original strand, 1041338 - 1041379
Alignment:
Q  10 ttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattca 51  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  1041338 ttttttggatggtaaaatcaatcatcgaaaacacaacattca 1041379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 272
Target Start/End: Original strand, 3330082 - 3330130
Alignment:
Q  224 cctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||||||||||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  3330082 cctgtcctaccgtaaaagcccccacccctaaacccacaagtggtgaaac 3330130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 41440151 - 41440075
Alignment:
Q  130 aaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttga 206  Q
    ||||||||||| | |||| | |||||| || ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| | |||||||||||    
T  41440151 aaagtgtcaaatgtaaatagtataaaaacacgttgaatgttagaacacattttcttatgtttgactactttgtttga 41440075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 50464489 - 50464449
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattca 51  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  50464489 tttttggatggcaaaataaatcctcgtaaacacaacattca 50464449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 272
Target Start/End: Original strand, 34644471 - 34644746
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||||||||||||    
T  34644471 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattgatatgcataaccctttggactctatgt 34644570  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  34644571 agaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgtaggttgtcagaacacgctttctcatgtttggcca 34644670  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  34644671 ctttgtttgacgcaacttttagggttgcttgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaac 34644746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 272
Target Start/End: Original strand, 2764384 - 2764659
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatta---tgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    || |||||| |||||||| |||||    
T  2764384 cgctaaacctttttggatggtaaaatcaatcatcgtaaacacaacatttatggacctaagagacataacattgatttgcataaccctttggactttatgt 2764483  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||   ||||||||||||| |||    
T  2764484 agaaggtcaacaacctctgatgctaggaagctgaaagtgtcaaaagaaaatggcataaaagcatgttgattgtcggaacacgttttctcatgtttgacca 2764583  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    |||||| |||| ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||    
T  2764584 ctttgtctgacacaacttttaggactgcctatcctaccataaaagcaccaacccctaaacccacaagtggtgaaac 2764659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28041329 - 28041054
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| || | | |||| |||||| |||| |||  ||||| |||||   ||| || ||| |||| |||||||||    
T  28041329 cgctagacctttttggatggaaaaatcaatcctcatgagcacaacattcatggacttagaggacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgt 28041230  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    |||||||||||  |||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  28041229 agaaggtcaaccgcctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacctgttgattgtcagaacacactttctcatgtttggcca 28041130  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    |||||||||||||   |||||| ||| ||| |||||| |||||||  ||||| | ||| ||||||||  |||||||    
T  28041129 ctttgtttgacgcggattttagagctgcctatcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtagtgaaac 28041054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 22346800 - 22347022
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||   ||||||||||||| |||||   ||| || ||| |||| ||||| |||    
T  22346800 cgctagacctttttggatggcaaaactaatcctcgtgaacacaacattcataaacctaggagacatgacatttctatgcatgaccttttgaactctgtgt 22346899  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    ||||||||||||||||  | | |||||||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  22346900 agaaggtcaacaacctctgctactaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaaaggtataaacgcatgttgattgtcagaacacgctttctcatatttggcca 22346999  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagg 219  Q
    ||||| |||||  ||||||||||    
T  22347000 ctttgcttgacataacttttagg 22347022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31737515 - 31737301
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||| |||||| ||||||||||   ||| || ||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  31737515 tttttggatggcaaaatcaatcctcgtaaacacta-attcatggatctaggaaacataacattgatatgcatgaccttttgaactctatgtagaatgtca 31737417  T
Q  108 acaacctg--atgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttg 205  Q
    | | |||   ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |   |||||||||||||||||||||| |||    
T  31737416 atagcctctaatgctagaaaatcgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaatatgttttctcatgtttggccactttgcttg 31737317  T
Q  206 acgcaacttttagggc 221  Q
    ||||  ||||||||||    
T  31737316 acgccgcttttagggc 31737301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 21472908 - 21473121
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || || || | ||| || |||||| ||||||||||||||| |||||   ||| || ||| |||| |||||||||    
T  21472908 cgctagacctttttggatggcaaaaccagtcctcctgaacgcaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgt 21473007  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    |||||||||||| |||  | |||||||||   | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  21473008 agaaggtcaacagcctctggtgctaggaaactgcaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggcca 21473107  T
Q  197 ctttgtttgacgca 210  Q
     |||  ||||||||    
T  21473108 ttttacttgacgca 21473121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 117 - 271
Target Start/End: Original strand, 19035472 - 19035626
Alignment:
Q  117 tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaactttt 216  Q
    |||||||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19035472 tgctaggaaaccgtaagtgtcaaaagtaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagctttt 19035571  T
Q  217 agggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaa 271  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||  ||||| | ||| |||||||  |||||||    
T  19035572 agggctgcctgccctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaactggtgaaa 19035626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29169909 - 29169751
Alignment:
Q  85 tttggactctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaacttt 182  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   |||    
T  29169909 tttgaactctatgtagaaggttaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgtttt 29169810  T
Q  183 ctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaag 241  Q
    ||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  29169809 ctcgtgtttggccaccttacttgacacaactttaagggctgtctgtcctacggtaaaag 29169751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 45659847 - 45659574
Alignment:
Q  3 gctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgta 99  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| |  || ||||||||||  |||| |  |||||||||||||| |||||   ||| || | | |||| |||||||  |    
T  45659847 gctagacctttttgggtgacaaaaccggtcctcgtaaacacgacatttattgacctaggagacatgacattgctatgcatgatcttttgaactctat--a 45659750  T
Q  100 gaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccac 197  Q
    ||||||||||| |||  | || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||    
T  45659749 gaaggtcaacagcctctggtgataggaaatcgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcgtgtttggccac 45659650  T
Q  198 tttgtttgacgcaactttt-agggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
     ||  |||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||  ||||  | ||| |||||||| ||||||||    
T  45659649 cttacttgacgcagcttttaagggctgcatgtcctacggtaaaaggcccgatacctaatcccacaagtggtgaaac 45659574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4862170 - 4861949
Alignment:
Q  23 aaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtcaacaacct--gat 117  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||| ||| ||| | ||| | |||||   ||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  | |    
T  4862170 aaaatcaatcctcgtaatcacaacattcatggatctaagggacgtgacattgttatgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacttttggt 4862071  T
Q  118 gctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaactttta 217  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||| |  |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||    
T  4862070 gttaggaaatcgaaagtgtcaaaagcaaattgtataaaagtatgttgcttgtcagaagacgctttctcatgtttgaccattttacttgacgcaactttta 4861971  T
Q  218 gggctacctgtcctaccgtaaa 239  Q
     ||||  |||||||||| ||||    
T  4861970 aggctgtctgtcctaccataaa 4861949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Original strand, 16500034 - 16500184
Alignment:
Q  94 tatgtagaaggtcaacaacctg--atgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgttt 191  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||   ||||| || |||    
T  16500034 tatgtagaaggtcaacagcctctaatgctaggaagtcaaaagtgtcaaaagcaaatagtataaaggcatgttaattgttagaacatgttttcttatattt 16500133  T
Q  192 ggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagc 242  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  16500134 ggccactttacgtgacgcaacttttaggattgtctgtcctaccgtaaaagc 16500184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20259999 - 20259768
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatta---tgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||    |||||||| |||| |   || || ||||||| ||||||   || || ||| |||| |||||||||    
T  20259999 cgctagacctttttggatggcaaaaccaatccatataaacacaacatttattaacttatgagacatgacattactatgcatgaccttttgaactctatgt 20259900  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| |||  |||||||||||| |  |||||| |||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| |||  |||    
T  20259899 agaaggtcaacaacctctggtgctaagaaaccgaaagtgtcaacaataaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttctcatttttaacca 20259800  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgt 228  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  20259799 ctttgcttgacgtagcttttagggctacctgt 20259768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Original strand, 2898616 - 2898833
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |  | || ||||||| | |||   ||| || | | |||| ||||||||||||||||||    
T  2898616 tttttggatggcaaaatcaatcctcttaaacacaacattcatgatcgtatgagacatgatattgttatgcatgatcttttgaactctatgtagaaggtca 2898715  T
Q  108 acaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaaca----aactttctcatgtttggccactttg 201  Q
    |||||  ||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||| | | |||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||    
T  2898716 acaacctctggtgctaggaaaccgaaagtatcaaaagcaaatggtataaaaac-tattgattgtcagaacacgctcactttctcatgtttggccactttg 2898814  T
Q  202 tttgacgcaacttttaggg 220  Q
     |||| ||| |||||||||    
T  2898815 cttgatgcatcttttaggg 2898833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 50161465 - 50161375
Alignment:
Q  151 ataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaag 241  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  50161465 ataaaagcatgttgattgtgagaacacgctttctcatgtttgtccactttgcttgacgcaacttttagggttgtctgtcctaccgtaaaag 50161375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 24177713 - 24177541
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| || |||||   ||| || ||  |||| |||||||||    
T  24177713 cgctagacctttttggttggcaaaaccaatcctcgtgaacacaacattcatggacctaggagatatgacattgctatgcatgactttttgaactctatgt 24177614  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgt 169  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  24177613 agaaggtaaacagcctctgatgctaggaaaccgaaactgtcaaaaacaaatggtataaaaatatgttgattgt 24177541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 163
Target Start/End: Original strand, 47459587 - 47459753
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||   ||| |||  | ||||||||||||||    
T  47459587 cgctagacctttttgaatggctaaatcaattctcgtaaacacaacatttatagacttaggagacataacattgctatgcatattcctttggactctatgt 47459686  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgtt 163  Q
    |||||||||||  |||  ||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  47459687 agaaggtcaactgcctctgatactaggaagccaaaagtatcaaaagcaaatggtataaaaacatgtt 47459753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 50314815 - 50314622
Alignment:
Q  12 ttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacattat---gtataaccatttggactctatgtagaaggtcaa 108  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||||||||  ||||| |||| |||||| ||| ||||| |   |||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  50314815 ttttggatagcaaaatcagtaatggtaaacacattattcatggac-taggagtcatgacattgttgcgtataaccctttgaactctatgtagaaagtcaa 50314717  T
Q  109 caac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttg 201  Q
    ||||  ||  || |||||| |  ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  50314716 caacatcttgtgttaggaaataaaaaatgtcaaaagtaaatggtataaaagcatgttgattgtgagaacaagttttgtcatgtttgaccactttg 50314622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25375912 - 25375790
Alignment:
Q  120 taggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagg 219  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||   ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |     
T  25375912 taggaagccaaaagtgtcaatagcaaatggtataaaaacatgttgatggtaagaacatgttttgtcatgtttggtcactttgcttgacgcaacttttgga 25375813  T
Q  220 gctacctgtcctaccgtaaaagc 242  Q
    | |  ||||||||||||||||||    
T  25375812 gttgtctgtcctaccgtaaaagc 25375790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 187
Target Start/End: Original strand, 38731546 - 38731704
Alignment:
Q  34 tcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacattat---gtataaccatttggactctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtc 128  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||   | || ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||| |    
T  38731546 tcgtaaacacaatattcatggacctaggagtcatgacattattgtgcatgaccctttgaactctatgtagaaggttaacaacctctggtgctaagaagcc 38731645  T
Q  129 gaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcat 187  Q
     ||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  38731646 aaaagtttcaaaagcaaattgtataaaagtatgttgattgtcagaacacgctttctcat 38731704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 90 - 220
Target Start/End: Original strand, 42919856 - 42919987
Alignment:
Q  90 actctatgtagaaggtcaacaacctga--tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcat 187  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||    |||| |||| || ||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  42919856 actctatgtagaaggttaacaatctctactgcttggaaatcaaaagtgtcaaaagcagatgacataaaaacatgttgattgtgagaacacg-tttctcat 42919954  T
Q  188 gtttggccactttgtttgacgcaacttttaggg 220  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  42919955 gtttggccgctttgtttgatgcaacttttaggg 42919987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 48841283 - 48841174
Alignment:
Q  3 gctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataac---attatgtataaccatttggactctatgta 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||||  ||  |||||||||||||   |||||| |||||  ||| |||||||||||    
T  48841283 gctagacttttttggattgcaaaatcaatcctcgtaaacataatattcatagatttaggagacataacattattatgcataactctttagactctatgta 48841184  T
Q  100 gaaggtcaac 109  Q
    ||||||||||    
T  48841183 gaaggtcaac 48841174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 272
Target Start/End: Original strand, 37200012 - 37200162
Alignment:
Q  121 aggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttaggg 220  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||  |||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||    
T  37200012 aggaagccaaaagtgtaaaaa-caaatggtataaaaacatattgattgttagcacatgctttcttatgtttgaccactttacttgacgtaacttttatgg 37200110  T
Q  221 ctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    || | |||||||  |||||||| |||   ||||| ||||| || ||||||||    
T  37200111 ctgcatgtcctattgtaaaagctccggtccttaatcccacgagtggtgaaac 37200162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 67
Target Start/End: Original strand, 4611097 - 4611159
Alignment:
Q  5 tagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacat 67  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  4611097 tagacctttttggatgacaaaatcaatcatcgtgaacacaatattcatggacctaggagacat 4611159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35387708 - 35387643
Alignment:
Q  151 ataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaactttt 216  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  35387708 ataaaagcttgttgatcgtcagaacacactttttcatgtttggccactttgcttgatgcaaatttt 35387643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 45835379 - 45835330
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctag 60  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  45835379 tttttggatggcaaaatcaatcctcgtaaacacaacattcatagacctag 45835330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 28493533 - 28493477
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacct 58  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| ||||||    
T  28493533 cgctagacctttttggatggcaaaatcaatcctcgtgaacataacattcatggacct 28493477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 868603 - 868534
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt 73  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| | || ||||||  ||||| |||| |||||||||| |||||    
T  868603 cgctagacctttttggatggcaaaaccaatccttgtgaacaca--attcatggacttaggagacatgacatt 868534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 1114067 - 1114023
Alignment:
Q  5 tagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcatt 49  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  1114067 tagacctttttggatggcaaaaccaatcctcgtaaacacaacatt 1114023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 23043929 - 23044005
Alignment:
Q  144 aaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttaggg 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || ||    |||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||| ||||    
T  23043929 aaatggtataaaagcatgttgattgtgagtacttgttttctcatatttggccactttgcttgatgcagctttgaggg 23044005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17249507 - 17249232
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||   ||  |||| | ||||||||||||||    
T  17249507 cgctagacctttttggatggcaaaaccaatcctcgtaaacacaacattcatgaacttaggagacataacattgctatacataatcctttggactctatgt 17249408  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    |||||||||||  |||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17249407 agaaggtcaactgcctctgatgctaggaagccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacactttctcatgtttggcca 17249308  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||  ||||||||    
T  17249307 ctttgtttgacgcaacttttagggttgtttgtcctaccgtaaaagcgcccactccgaaacccacaaatggtgaaac 17249232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 33220913 - 33220638
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||||| ||||| ||||||   ||| |||||| |||||||| |||||    
T  33220913 cgctagaccttttaggatggcaaaaccaattatcgtaaacgcaacattcatggacctagaagacacaacattgctatgcataaccctttggactatatgt 33220814  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||    
T  33220813 agaaggtcaacaacctcggatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcaacacacgctttctcatgtttggcca 33220714  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  33220713 ctttgcttgatgcagcttttagagctgtctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaac 33220638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 272
Target Start/End: Original strand, 34304401 - 34304676
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||  |||||| ||||||| | |||   ||| |||||  ||||||||||||||    
T  34304401 cgctatacctttttggattgcaaaatcaatcctcgtaaatacaacattcatagacctatgagacatgatattgctatgcataactctttggactctatgt 34304500  T
Q  99 agaaggtcaacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||  |    
T  34304501 agaaggtcaacatcatctgatgctaggaagcccaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggtta 34304600  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
     |||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  34304601 ttttgcttgacgcagcttttagggctagctgtccaaccgtaaaagccccgactcctaaacccacaagtggtgaaac 34304676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 357918 - 357643
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||   |||  ||| ||||||||||||||||    
T  357918 cgctatacatttttagatggcaaaattaatcttcgtaaacacaacattcatggacctaggagagataacattgctatgcttaatcatttggactctatgt 357819  T
Q  99 agaaggtcaacaacctg--atgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    ||||||||| ||||||   ||| ||||||  | ||||||| |||| |||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  357818 agaaggtcatcaacctctaatgttaggaaa-caaaagtgttaaaaacaaaggttataaaagcatgttcattgtcagaacacgctttctcatgtttggcca 357720  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaact 273  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  357719 ctttgcttgacgaagcttttagggctgcctgtcctaccgtaaaagcaccgacccctaaacccacaagtggtgaaact 357643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4206788 - 4206554
Alignment:
Q  12 ttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtcaa 108  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |||||  |||||||| ||||| |||||   ||| || ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4206788 ttttggatggcaaaaccaatcctcgtaaacactatattcattgacctaggtgacatgacattgtcatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaa 4206689  T
Q  109 caacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttga 206  Q
    ||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4206688 caacctctggtgctaggaacccgaaagtgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttcattgtcagaacacgctttctcatgtttagccactttgcttga 4206589  T
Q  207 cgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaag 241  Q
    ||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  4206588 cgccacttttaaggctgcatgtcctaccgtaaaag 4206554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 959495 - 959761
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||   ||| || ||| |||| ||| || |||||||||||    
T  959495 tttttagatgacaaaatcaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacacaacattgctatgcatgaccttttgaact-tacgtagaaggtca 959593  T
Q  108 acaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttg 205  Q
    |||||||  | |||||||||  ||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||   ||||||||| || ||||||||| |||    
T  959594 acaacctctggtgctaggaaaccgaaaatgtcaaaaacaaatggtataaagacatgttgattgtcagaacacgttttctcatggttagccactttgcttg 959693  T
Q  206 acgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaact 273  Q
    || |||||||||||| |   ||||||||||||||||  ||||| | ||| |||| ||| |||||||||    
T  959694 acacaacttttagggttgtttgtcctaccgtaaaaggcccgacacctaatcccataagtggtgaaact 959761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 45793 - 45604
Alignment:
Q  85 tttggactctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaacttt 182  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  | ||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||    
T  45793 tttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaagaaaccgaaagtgtcaaaaacaaatggaataaaagcatgttgattgtcagaacacgtttt 45694  T
Q  183 ctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||  ||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  45693 ctcatgtttgatcactttgcttgatgcagcttttagagctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtgaaac 45604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4166114 - 4165920
Alignment:
Q  12 ttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtcaa 108  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||| |  |||||||| ||||| |||||   ||| || ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  4166114 ttttggatggcaaaaccaatcctcgtaaacactatatttattgacctaggtgacatgacattgtcatgcatgaccttttaaactctatgtagaaggtcaa 4166015  T
Q  109 caacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttg 201  Q
    ||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  4166014 caacctctggtgctaggaacccgaaagtgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttagccactttg 4165920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29338271 - 29338030
Alignment:
Q  12 ttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt-atgt--ataaccatttggactctatgtagaaggtcaa 108  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||  || ||| |||| ||  |||||||||||||||    
T  29338271 ttttggatagaaaaatcaatccttgtaaacacaacattcatggacctaggagtcatgacattgatgtgcatgaccctttgaaccatatgtagaaggtcaa 29338172  T
Q  109 caacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttga 206  Q
    | | ||  | ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||| ||||    
T  29338171 cgatctctggtgctaggaagtcagaagtgtcaaaagcaaatggtataagagcatgttgattgttagaacacgttttctcatgtttggcagctttgcttga 29338072  T
Q  207 cgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgac 248  Q
    | || |||||| |  |   ||||||||||||||||| |||||    
T  29338071 cacatcttttatgattgtttgtcctaccgtaaaagccccgac 29338030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 130 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28009059 - 28008913
Alignment:
Q  130 aaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgtt---gattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacct 226  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| | ||||||||| | | |    
T  28009059 aaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaccatattcttgattgttagaacaagctttctcatgtttgaccgctttgcttgacgtagcttttagggttgcat 28008960  T
Q  227 gtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaact 273  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| || |||||||||    
T  28008959 gtcctaccgtaaaagccccgacccctaatcccacgagtggtgaaact 28008913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 241
Target Start/End: Original strand, 34415474 - 34415585
Alignment:
Q  130 aaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtc 229  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||| || || | ||| ||    
T  34415474 aaagtgtcaaaaacaaatggcataaaagcatgttgattgtcagaacacactttctcatgtttcgccattttgcttgacgcagcttgtaaggatgcctatc 34415573  T
Q  230 ctaccgtaaaag 241  Q
    ||||||||||||    
T  34415574 ctaccgtaaaag 34415585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 110
Target Start/End: Original strand, 32115623 - 32115734
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataaca---ttatgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||   ||||| || ||| |||| ||||| |||    
T  32115623 cgctagacctttttagatagcaaaatcaatcatcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctttgt 32115722  T
Q  99 agaaggtcaaca 110  Q
    ||||||||||||    
T  32115723 agaaggtcaaca 32115734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 137 - 242
Target Start/End: Original strand, 34168913 - 34169018
Alignment:
Q  137 caaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgt 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||   ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | |||||||| ||    
T  34168913 caaaagcaaatggtataaaagcatgttgcttgtccaaacatgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcaaattttagggttgcatgtcctacggt 34169012  T
Q  237 aaaagc 242  Q
    ||||||    
T  34169013 aaaagc 34169018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 28625836 - 28626070
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataaca--ttatgtataaccatttggactctatgta 99  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||  |||||| |||| || |||  ||||| || ||| |||| ||| ||||||    
T  28625836 cgctagatctttttgaatggcaaaatcaatctccgtaaacacaacattcatagacctatgagatatgacatgttatgcatgaccttttgaactttatgta 28625935  T
Q  100 gaaggtcaacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaat-aaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||||| || ||||  ||||||||||| ||||||   |||||| ||||| ||||    
T  28625936 gaagctcaacaacctctggtgctaggaaattgaaagtgtaaaaaacaaatggtataaaaaaaatgttgattgtcagaacacgttttctcgtgtttagcca 28626035  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcct 231  Q
    | ||  |||||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  28626036 ccttacttgacgcagctttaagggctgcctatcct 28626070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 241
Target Start/End: Original strand, 28543399 - 28543524
Alignment:
Q  116 atgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttt 215  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||| | |||| |||||  ||||| | | ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  28543399 atgctaggaagctgaaagtgtcaaaatcaaatagtataagagcatagtgattttcaaaacacgatttctcatgtttggccactttgcttgacgcgacttt 28543498  T
Q  216 tagggctacctgtcctaccgtaaaag 241  Q
    || |||| |||||| |||||||||||    
T  28543499 taaggctgcctgtcttaccgtaaaag 28543524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34554388 - 34554258
Alignment:
Q  90 actctatgtagaaggtcaacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcat 187  Q
    ||||||||||||| ||||| | |  ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| ||| |||||| | ||||||  |||||||||    
T  34554388 actctatgtagaaagtcaatagcatctggtgctaggaagccgaatgtgtcaaaagtaaatggtataaaaacatcttgattatcagaacacgctttctcat 34554289  T
Q  188 gtttggccactttgtttgacgcaacttttag 218  Q
    |||||| |  |||| ||||||||||||||||    
T  34554288 gtttggtcgttttgcttgacgcaacttttag 34554258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 240
Target Start/End: Original strand, 32115775 - 32115837
Alignment:
Q  178 actttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||    
T  32115775 actttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttaaggctgcatgtcctaacgtaaaa 32115837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 3137440 - 3137378
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt 73  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3137440 tttttggatggcaaaaccaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacatt 3137378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 211
Target Start/End: Original strand, 6225110 - 6225191
Alignment:
Q  130 aaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaa 211  Q
    |||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6225110 aaagtgtcaaacacaaatgacatataagcatgttgattgtcacaacaaaatttctcatgtttgaccactttatttgacgcaa 6225191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 242
Target Start/End: Original strand, 12401384 - 12401481
Alignment:
Q  145 aatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagc 242  Q
    ||||| ||| |||||||||||||   | ||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||    
T  12401384 aatggtatataagcatgttgattagcaaaacacgctatcttatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagtgctgcttgtcctaccataaaagc 12401481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 217
Target Start/End: Original strand, 24016328 - 24016462
Alignment:
Q  85 tttggactctatgtagaaggtcaacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaacttt 182  Q
    |||| |||||||||| ||  ||||||||  ||| |||||||||  | ||| | |||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  24016328 tttgaactctatgtaaaaaatcaacaacatctggtgctaggaaaccaaaactatcaatagcaaatggtataaaaacatgttgattgtgagaacaagcttt 24016427  T
Q  183 ctcatgtttggccactttgtttgacgcaactttta 217  Q
    |||||||||| | | |||  |||| ||||||||||    
T  24016428 ctcatgtttgactattttacttgatgcaactttta 24016462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 117 - 217
Target Start/End: Original strand, 3714942 - 3715042
Alignment:
Q  117 tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaactttt 216  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| || |||  |||||| |||||| ||||| ||||||   ||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  3714942 tgctaagaagtcaaaagtgtcaaaaacagatgatataaaaacatgttaattgtgagaacacgttttctcatgtttaaccattttgtttgacacaactttt 3715041  T
Q  217 a 217  Q
    |    
T  3715042 a 3715042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13398375 - 13398212
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | | | |||| || | | |||||   ||| || | | |||| ||||||||||||| ||||    
T  13398375 tttttggatgacaaaatcaaccatcgtaaacacaacatttatgcatctagaagtcgtgacattgttatgcatcatcttttgaactctatgtagaatgtca 13398276  T
Q  108 acaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgt 169  Q
    |||||  |||||| ||||||||| ||| | ||||||| |||| | ||||||  |||||||||||    
T  13398275 acaacttctgatgttaggaagtcaaaaatatcaaaagtaaatagtataaaaatatgttgattgt 13398212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Original strand, 7749386 - 7749441
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacc 57  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  7749386 cgctagaccttttaggatggcaaaaccaatcctcgtaaacacaacattcatggacc 7749441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28517490 - 28517214
Alignment:
Q  1 tcgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatg 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||   ||| |||||| |||||||||||||    
T  28517490 tcgctagacttttttggatggcaaaaccaatcctcgtaaacacaacattcatggacttaggagacataacattgttatgcataaccctttggactctatg 28517391  T
Q  98 tagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcc 195  Q
    ||||||||||||   ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||    
T  28517390 tagaaggtcaactgtctctgatgctaggaagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgtctaaacacgctttctcatgtttggcc 28517291  T
Q  196 actttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |  ||||||||| |||||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  28517290 actttgcttgacgcagcttttagggttgtctgtcctactgtaaaagcccccacccctaaacccacaagtggtgaaac 28517214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21327037 - 21326764
Alignment:
Q  5 tagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtaga 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||   ||| || ||| |||| |||||||||| |    
T  21327037 tagacctttttggatggcaaaatcaatcctcgtgaacacaacattcatggacctaggagacataacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtaaa 21326938  T
Q  102 aggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactt 199  Q
    ||||||||| |||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21326937 aggtcaacagcctctggtgctaggaaatcgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactt 21326838  T
Q  200 tgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaact 273  Q
    || |||||||  |||||||||||   |||||||| |||||||  ||||| | ||| |||||||| |||||||||    
T  21326837 tgcttgacgcggcttttagggctgtttgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtgaaact 21326764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 233
Target Start/End: Original strand, 19277196 - 19277434
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgta--aacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctat 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||   |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||   ||| || ||| |||| |||||||    
T  19277196 cgctagacctttttggatggcaaaaccaattttcgtgtgaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctat 19277295  T
Q  97 gtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggc 194  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  19277296 gtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggc 19277395  T
Q  195 cactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctac 233  Q
     |||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  19277396 tactttgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctac 19277434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 272
Target Start/End: Original strand, 5825182 - 5825451
Alignment:
Q  6 agacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaa 102  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||   ||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  5825182 agacctttttcgatggcaaaaccaatcctcgtaaacacaacatccatagacctaggagacataacattgctatgcataaccctttcgactctatgtagaa 5825281  T
Q  103 ggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccacttt 200  Q
    ||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| | ||||  | || |||||||||  ||||||    
T  5825282 ggtcaacaacctctggtgctaggatgccgaaagtgtcaaaagtaaatggtataaaaacatgttgattgtcataacacgcattgtcatgtttg--cacttt 5825379  T
Q  201 gtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    | |||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||| ||||||||    
T  5825380 gcttgatgcagcttttagggcttcctgtcctgccgtaaaagcctcgacccctaaacccacaagtggtgaaac 5825451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 22197901 - 22198135
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatta-tgt-ataaccatttggactctatgtagaaggtcaa 108  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||| || ||  | | |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  22197901 tttttggatgacaaaatcaattatcgtaaacacaacattcattgacctaggagacatgacgttgctatcataaccttttgaactctatgtagaaggtcaa 22198000  T
Q  109 caacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttga 206  Q
    ||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22198001 caacctctgatgctaggaaaccgaaagtgacaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgttggaacacactttctcatgtttggtcactttgcttga 22198100  T
Q  207 cgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaag 241  Q
    |||  ||||||||||| |  |||||||| ||||||    
T  22198101 cgccgcttttagggctgcgcgtcctaccataaaag 22198135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22239920 - 22239686
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatta-tgt-ataaccatttggactctatgtagaaggtcaa 108  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||| || ||  | | |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  22239920 tttttggatgacaaaatcaattatcgtaaacacaacattcattgacctaggagacatgacgttgctatcataaccttttgaactctatgtagaaggtcaa 22239821  T
Q  109 caacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttga 206  Q
    ||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22239820 caacctctgatgctaggaaaccgaaagtgacaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgttggaacacactttctcatgtttggtcactttgcttga 22239721  T
Q  207 cgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaag 241  Q
    |||  ||||||||||| |  |||||||| ||||||    
T  22239720 cgccgcttttagggctgcgcgtcctaccataaaag 22239686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 271
Target Start/End: Original strand, 27521385 - 27521650
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| |||||   ||| || ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27521385 tttttcgatggcaaaatcaatcctcgtaaacacaacattcatagacttaggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtca 27521484  T
Q  108 acaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttg 205  Q
    |||||||  |||||||||||  | ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| |||||||||||     
T  27521485 acaacctctgatgctaggaaaccaaaagtgtcaaaagtaaattgtataaatgcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgaccactttgttta 27521584  T
Q  206 acgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaa 271  Q
    |||||||||||| || | | ||||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||  |||||||    
T  27521585 acgcaacttttaagggtgcatgtcctaccgtaaaaggcccgacacctaatcccacaaatggtgaaa 27521650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40726679 - 40726478
Alignment:
Q  5 tagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtaga 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||   ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  40726679 tagacatttttggatggcaaaatcaatcctcataaacacaacattcatggatctaggagacatagcattgttatgcataaccctttggactctatgtaga 40726580  T
Q  102 aggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactt 199  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||||    
T  40726579 aggtcaacaacctctgatgctatgaagccgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacattttattatgtttggccactt 40726480  T
Q  200 tg 201  Q
    ||    
T  40726479 tg 40726478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 982853 - 983090
Alignment:
Q  1 tcgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatg 97  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||| |||| ||| |||||| |||||   ||| || ||| |||| ||||||||    
T  982853 tcgctagacctttttggatggcaataccaatcctcgtgaacacaacattcatggacatagaagacatgacattgatatgcatgaccttttgaactctatg 982952  T
Q  98 tagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcc 195  Q
    ||||||| |||||||||  | |||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  982953 tagaaggccaacaacctctggtgctagaaaaccgaaagtatcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgatttctcatgtttggcc 983052  T
Q  196 actttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctac 233  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  983053 actttgcttgacgcagcttttatggctgcctgtcctac 983090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Original strand, 32584514 - 32584781
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttgga-ctctatgtagaaggtc 106  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||  || ||| |||||||||||||   ||| || | | |||||| |||||| |||||||||    
T  32584514 tttttggatggtaaaatcaatctttgtaaacacaacattcatcgatctatgagacataacattgatatgcatgatcttttggaactctatctagaaggtc 32584613  T
Q  107 aacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgttt 204  Q
    ||||||||  | |||||||||    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||   ||||||||||||| |||||||||||    
T  32584614 aacaacctctggtgctaggaaacataaagtgtcaaaagcaaatggtgtaaaagcatcttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgaccactttgttt 32584713  T
Q  205 gacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    || |||| |||||||| | | ||||||||||||||| | ||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  32584714 gatgcaatttttagggttgcatgtcctaccgtaaaatccccgacccctaatcccacaagaggtgaaac 32584781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Original strand, 4501165 - 4501438
Alignment:
Q  3 gctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgta 99  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||   |||| ||||||||||| |||||| | | ||||||||||| |||||   ||| || | | |||| ||||||||||    
T  4501165 gctagacctttttagatgacaaagctaatcctcgtaaacacaacattcatgaatctaggagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgta 4501264  T
Q  100 gaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccac 197  Q
    |||||||||||||||  | |||||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  4501265 gaaggtcaacaacctctggtgctagaaaacc-aaagtgtcaaaagcaaattatataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 4501363  T
Q  198 tttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |   |||||||| |||||||  ||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  4501364 tttgtttgacgcagcttttagggttgtttgtcctacggtaaaaggcccgacacctaatcccacaagtggtgaaac 4501438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Original strand, 43856788 - 43857054
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacattat---gtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||| | |||||| ||||||||||| ||| ||||| |   | || ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  43856788 tttttggatagcaaaatcaattctcgtaaacataacattcatggacctaggagtcatgacattgttgtgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtca 43856887  T
Q  108 acaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttg 205  Q
    |||||||  | || ||||||  | ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||||| | ||||||||| |||    
T  43856888 acaacctctggtgttaggaaaccaaaaatgtcaaaagcaaattgtataaacgcatgttgattgtcaaaacacgctttctcatgtctagccactttgattg 43856987  T
Q  206 acgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||||| ||||||  | |  ||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  43856988 acgcatcttttaatgttgtctgtcctactgtaaaagccccgacccctaatcccacaagtggtgaaac 43857054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 45614044 - 45613769
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||  | |||||   ||| || | | |||| |||||||||    
T  45614044 cgctagaccttttcggatggcaaaaccaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagatttgacattgttatgcatgaacttttgaactctatgt 45613945  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    ||||||  |||| |||  | |||| ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||| | ||||||| ||    
T  45613944 agaaggctaacagcctctggtgcttggaaaccgaaagtgtcaaaatcaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacactttcccgtgtttggtca 45613845  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    | ||  |||||||||||||||||| |  ||||||||| | |||||  ||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  45613844 ccttacttgacgcaacttttagggttgtctgtcctacggaaaaaggcccgacacctaatcctacaagtggtgaaac 45613769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Original strand, 48539095 - 48539258
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacat---tatgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||| || ||| ||||||||||||||||| | |||    
T  48539095 tttttggatggcaaaaccaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttggactctatgtagacgatca 48539194  T
Q  108 acaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgt 169  Q
    ||| |  ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48539195 acagcctctggtgctagaaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgt 48539258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 262
Target Start/End: Original strand, 24527494 - 24527759
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||| || ||| |||||| ||||| |||||| || |||||   ||| || ||| |||| |||||||||    
T  24527494 cgctagatctttttggatgacaaaaccaatcctcgtgaatacaacattcatggaccaaggagaaatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgt 24527593  T
Q  99 agaaggtcaacaacctga--tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    |||||||||||  |||    |||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||  |||    
T  24527594 agaaggtcaaccgcctctcgtgctaggaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttttccca 24527693  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaa 262  Q
    ||||  ||||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | ||| |||||||    
T  24527694 ctttacttgacactgcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaa 24527759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 130 - 272
Target Start/End: Original strand, 3676677 - 3676820
Alignment:
Q  130 aaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggct-acctgt 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||  |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||    
T  3676677 aaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatattgatagtaagaacacgctttctgatgtttgaccactttgcttgacgcagcttttagggctggcctgt 3676776  T
Q  229 cctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  3676777 cctacggtaaaaggaccgacacctaatcccacaagtggtgaaac 3676820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30216251 - 30216040
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    |||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||  ||||||||||| || |||||   ||| || |||||||| ||| ||||| |||| |||    
T  30216251 tttttgaatgacaaaatcgatcctcgtgaacacaacattcatagacctaggagatatgacattgctatgcatgaccatttgaactttatgtggaagatca 30216152  T
Q  108 acaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttg 205  Q
    |||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||  ||||||||| |||| ||| |||| |||    
T  30216151 acaaactctgatgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgtcaaaacacgctttctcatatttgaccattttgcttg 30216052  T
Q  206 acgcaactttta 217  Q
    ||||| ||||||    
T  30216051 acgcagctttta 30216040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Original strand, 10905032 - 10905246
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    |||||||||||  | ||||||| | ||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||   ||| ||  |  |||| ||||||||||||||||||    
T  10905032 tttttggatggtcagatcaatccttgtaaacacgacattcatggacctaggagacatgacattgttatgcatggctctttgaactctatgtagaaggtca 10905131  T
Q  108 aca-ac-ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttg 205  Q
    ||| || ||| ||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||   |||||||| ||||||||||||| |||    
T  10905132 acatactctggtgctaggcaaccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaa-gcatgttgagtgtcagaacactttttctcatatttggccactttgcttg 10905230  T
Q  206 acgcaacttttagggc 221  Q
    ||||| ||||||||||    
T  10905231 acgcagcttttagggc 10905246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42295377 - 42295174
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataaca---ttatgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||   ||||| || |   |||| || |||||||||||||||    
T  42295377 tttttggataacaaaactaatcatcgtaaacacaagattcatggacctaggagacatgacaatgttatgcatgatattttgaacgctatgtagaaggtca 42295278  T
Q  108 acaacc--tgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttg 205  Q
    ||||||  || || ||||||  ||||||| | |||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| |||| |||    
T  42295277 acaacccctggtgttaggaaaccgaaagtataaaaaacaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaagaagctttcttatgtttggccattttgcttg 42295178  T
Q  206 acgc 209  Q
    ||||    
T  42295177 acgc 42295174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Original strand, 34772693 - 34772927
Alignment:
Q  8 acttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaagg 104  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| |||||||| | |||| |||||   ||| || ||  |||| | | |||||||||||    
T  34772693 acttttttgaatggcaaaaccaattatcgtaaacacaatattcatggacctagaaaacatgacattgatatgcatgactttttgaagtttatgtagaagg 34772792  T
Q  105 tcaacaacctg-atgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtt 203  Q
    ||||||||||  |  ||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || |||||  ||||| |||||||||| |||||| |||||| |    
T  34772793 tcaacaacctctaatctaagaaattgaaagtttcaaaagcaaatggtataaaaacatattaattgtccgaacacactttctcatatttggctactttgat 34772892  T
Q  204 tgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaa 240  Q
    |||  |||||||||| ||| ||| || ||||||||||    
T  34772893 tga--caacttttagagctgcctatcataccgtaaaa 34772927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9281247 - 9281091
Alignment:
Q  85 tttggactctatgtagaaggtcaacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaacttt 182  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||   ||| |||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  9281247 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacatctggtgctaggaagcaaaaaatgtcaaatccaaatagtataaaagcatgttgattgttagaacacgcttt 9281148  T
Q  183 ctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaa 240  Q
    ||||||||| || | |||| |||| ||| ||||||||| |  ||||||||| ||||||    
T  9281147 ctcatgttt-gctagtttgcttgatgcagcttttagggttgtctgtcctactgtaaaa 9281091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9292218 - 9292062
Alignment:
Q  85 tttggactctatgtagaaggtcaacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaacttt 182  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||   ||| |||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  9292218 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacatctggtgctaggaagcaaaaaatgtcaaatccaaatagtataaaagcatgttgattgttagaacacgcttt 9292119  T
Q  183 ctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaa 240  Q
    ||||||||| || | |||| |||| ||| ||||||||| |  ||||||||| ||||||    
T  9292118 ctcatgttt-gctagtttgcttgatgcagcttttagggttgtctgtcctactgtaaaa 9292062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 218
Target Start/End: Original strand, 47679122 - 47679250
Alignment:
Q  91 ctctatgtagaaggtcaacaacctg--atgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatg 188  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||||| |||||| | ||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||     
T  47679122 ctctatttagaaggtcaacaacctgtgatgctaggaaaccgaaaatgtcaaacgcaaatagtataaaagtatattgattgtgagaacacactttctcata 47679221  T
Q  189 tttggccactttgtttgacgcaacttttag 218  Q
    ||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  47679222 ttttgtcactttg-ctgacgcaacttttag 47679250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 45003099 - 45003028
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt 73  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||    
T  45003099 cgctagacctttttggatggcaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcatggtcctatgagacataacatt 45003028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 41117972 - 41117901
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt 73  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||| |||||    
T  41117972 cgctggacttttttggatagcaaaatcaatcatcgtgaacacaacattcatggacctaggaaacatgacatt 41117901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25187133 - 25186873
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacat---tatgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||  ||||| ||||| |||||||||||| |  |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||   |||| || ||| |||| ||||||| |    
T  25187133 cgctagatctttttagatggtaaaatcaatcattgggaacacaacattcatggatctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatat 25187034  T
Q  99 agaaggtcaacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    ||||||||||||||  ||  || | ||||  |||     |||||||||||||| | |||| |||||||||| |  |||||  |||||||||||| | |||    
T  25187033 agaaggtcaacaacctctagtgttcggaaaccga-----tcaaaagcaaatggtagaaaaacatgttgattatcggaacacgctttctcatgttagacca 25186939  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaa 262  Q
    ||||  ||||| |||||||||||| |   |||||||| |||||||  ||||| | ||| |||||||    
T  25186938 ctttacttgacacaacttttagggttttatgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaa 25186873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 239
Target Start/End: Original strand, 2904368 - 2904512
Alignment:
Q  97 gtagaaggtcaacaacctga--tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggc 194  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||| | ||  ||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||  |||||  |||||||||||||| |    
T  2904368 gtagaaggtcaacaacctctagtgctaggaagccaaacatgtcacaaacaaatgatataaaatcatgttgattgtcggaacatgctttctcatgtttgac 2904467  T
Q  195 cactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaa 239  Q
     | |||| |||||| |||||||||| ||  || ||||||||||||    
T  2904468 tattttgcttgacgtaacttttaggactgtctatcctaccgtaaa 2904512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 23037459 - 23037669
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacat---tatgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||  |||||| |||| || ||||   |||| |||||| |||| || ||| ||||| |||||    
T  23037459 tttttagatggcaaaatcaatcctcgtaaacacaaaattcatagacctaagagaaatgacattgctatgcataaccctttgaaccctacgtagatggtca 23037558  T
Q  108 acaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgt-tagaacaaactttctcatgtttggccactttgttt 204  Q
    |||||  |||| | || ||| |  ||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||| | || ||||   |||||||| |||  | |||||||||    
T  23037559 acaacctctgacgtta-gaaattaaaagtgtcaaaag-aaatgatataaaaacatgttgattatataaaacatgttttctcatatttaactactttgttt 23037656  T
Q  205 gacgcaactttta 217  Q
    |||||||||||||    
T  23037657 gacgcaactttta 23037669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 27027832 - 27027761
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt 73  Q
    |||||||  ||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27027832 cgctagatctttttggatagcaaaaccaatcctcgtgaacacaacattcatggacctaggagacatgacatt 27027761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 33202483 - 33202392
Alignment:
Q  181 ttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||  || |||||| |||||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  33202483 ttctcatgtttggccacttagttggacgcaacttccagggctttctatcctactgtaaaagccccaacccctaatcccacaagcggtgaaac 33202392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 241
Target Start/End: Original strand, 1249673 - 1249735
Alignment:
Q  179 ctttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaag 241  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  1249673 ctttctcatgtttgaccactttatttgacgcaggttttagggctgtctatcctaccgtaaaag 1249735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 206
Target Start/End: Original strand, 43383221 - 43383283
Alignment:
Q  144 aaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttga 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43383221 aaatggcataaaagcatgttgattgctggaacatgctttctcatggttggccactttatttga 43383283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 6635067 - 6634991
Alignment:
Q  97 gtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgtta 171  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||  || |||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||    
T  6635067 gtagaaggtcaacaacctctgatgctaaaaaatcgaaactgtcaaaagcaaatgatataaaaatatgttgattgtta 6634991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 73
Target Start/End: Original strand, 5714953 - 5715016
Alignment:
Q  10 ttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt 73  Q
    |||||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  5714953 ttttttagatgacaaaaccaatcttcataaacacaacatttatggacctaggagacataacatt 5715016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10032287 - 10032194
Alignment:
Q  85 tttggactctatgtagaaggtcaacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaaca 176  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||  || |||||| ||||  |||| | |||||||||||| | |||||| ||| |||||||| ||||||    
T  10032287 tttgaactctatgtagaaggttaacaacatctaatgctaagaagctgaaaatatcaaaagcaaatagtataaaaacatattgattgtcagaaca 10032194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 58
Target Start/End: Original strand, 38839234 - 38839287
Alignment:
Q  5 tagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacct 58  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  38839234 tagacatttttggatggtaaaaccaatcttcgtaaacacaacattcatggacct 38839287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Original strand, 2904294 - 2904346
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggag 63  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  2904294 tttttggatagcaaaaccaattatcgtaaacacaacattcatagacctaggag 2904346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 36559060 - 36559012
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggaccta 59  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  36559060 tttttagatagcaaaatcattcatcgtaaacacaacattcatggaccta 36559012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 45424790 - 45424758
Alignment:
Q  117 tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatgg 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45424790 tgctaggaagtcgaaagtttcaaaagcaaatgg 45424758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 45974799 - 45974731
Alignment:
Q  4 ctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacat 72  Q
    |||||| |||||||||| ||||||  ||| | ||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  45974799 ctagacctttttggatgacaaaatttatccttgtaaacacaacattcatgaacctaggagacatgacat 45974731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 272
Target Start/End: Original strand, 35310364 - 35310628
Alignment:
Q  13 tttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtcaac 109  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||   ||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  35310364 tttggatggcaaaaccaattctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattgatatgcaaaaccctttggactctatgtagaaggttaac 35310463  T
Q  110 aacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgac 207  Q
    | |||  ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35310464 agcctctgatgccaggaagccgaaagtgtcaaaagcagatggtataaaagcatgttgattgtcagaacatgctttctcatgtttggccactttgcttgac 35310563  T
Q  208 gcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  35310564 gcatcttttagggttgtctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaac 35310628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13167112 - 13166867
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||  |||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||   ||| |||||| ||||||||||||||    
T  13167112 cgctagatctttttggataacagaatcaatcatcgtaaacccaacattcatggacctaggagacataccattgctatgcataaccctttggactctatgt 13167013  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    ||||||||||||  ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  13167012 agaaggtcaacagtctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttagcca 13166913  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagc 242  Q
    ||||| ||||||||  |||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  13166912 ctttgcttgacgcagattttagggttgtctgtcccaccgtaaaagc 13166867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25663231 - 25663006
Alignment:
Q  5 tagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtaga 101  Q
    ||||| |||||||||| ||||  ||||| |||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||   ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25663231 tagacctttttggatgacaaagccaatcctcgtaaactcaacattcatggacctaggggacataacattgatatgcataaccctttggactctatgtaga 25663132  T
Q  102 aggtcaacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactt 199  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  25663131 agatcaacaacttctgatgctaggaagctgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattatcagaacacgctttctcatgtttggccactt 25663032  T
Q  200 tgtttgacgcaacttttagggctacc 225  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25663031 tgtttgatgcagcttttagggctacc 25663006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 272
Target Start/End: Original strand, 27336600 - 27336873
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||   ||  ||||||||||   ||||||||    
T  27336600 cgctagaccttttttgatggcaaaatcaatccttgtaaaaacaacattcatggacttaggagacataacattgctatacataaccatttt--ctctatgt 27336697  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    |||||||||||  |||  |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||||||| |||    
T  27336698 agaaggtcaactgcctctgatgctaggaagccacaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagtatgttgattgtcagaacacgatttctcatgtttgacca 27336797  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  27336798 ctttgcttgacgcaacttttagggctgtctgtcctattgtaaaagcccccacccctaaacccacaagtggtgaaac 27336873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37873840 - 37873595
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacattat---gtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||| | ||||| ||| |||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||||| || ||| ||||| |   | || ||| |||| |||||||||    
T  37873840 cgctaggccttttttgatagcaaaatcaatcctcttaaacacaacattcatagacctagaagtcatgacattgttctgcatgaccctttgaactctatgt 37873741  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  37873740 agaaggtcaacaacctctggtgctaggaagccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggcca 37873641  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagc 242  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  37873640 ctttgcttgacgcaacttttagagctgtctgtcctaccgtaaaagc 37873595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 33692254 - 33691982
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |||||| | ||||| |||||||||||||   ||| ||| || ||||||| ||||||    
T  33692254 cgctagatctttttggatggaaaaaccaa--atcgtaaacagaacattcatgaacctatgagacataacattgttatgcataccc-tttggacactatgt 33692158  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    ||||||||||||  ||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||   ||| |||||||||||||    
T  33692157 agaaggtcaacagtctctgatgctaagaagccgaaagtgtcaaaagcaaatggtacaaaagcatgttgattgtcataacacgttttgtcatgtttggcca 33692058  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  33692057 ctttgcttgacgcagcttttaggcctgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaac 33691982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32269992 - 32269755
Alignment:
Q  9 cttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||   ||| || ||| |||| |||  ||| |||||||    
T  32269992 cttttttggatggcgaaatcaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaacttcatgcagaaggt 32269893  T
Q  106 caacaacctga--tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtt 203  Q
    |||||||||    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |    
T  32269892 caacaacctctagtgctaggaaatcgaaagtatcaaaagcaaatggtataaaagcgtgttgattgtcagaacacactttctcatgtttgaccactttggt 32269793  T
Q  204 tgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaag 241  Q
    ||| ||| ||||||||| | | ||||||||| ||||||    
T  32269792 tgatgcagcttttagggttgcatgtcctaccataaaag 32269755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 430510 - 430686
Alignment:
Q  5 tagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacat---tatgtataaccatttggactctatgtaga 101  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  430510 tagacctttttggatggcataatcaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattactatgcataaccctttggaatctatgtaga 430609  T
Q  102 aggtcaacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaaca 176  Q
    ||||||||  |  ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  430610 aggtcaactgcctctgatgctatgaagacaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaaca 430686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3114232 - 3114114
Alignment:
Q  130 aaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtc 229  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3114232 aaagtgtcaaaaacaaatggtataaaaacatgttgactgtcagaacatgctttctcatgtttggccactttgtttgatgcaacttttagggctgcctgtc 3114133  T
Q  230 ctaccgtaaaagcaccgac 248  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  3114132 ctaccgtaaaagccccgac 3114114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 272
Target Start/End: Original strand, 14423678 - 14423858
Alignment:
Q  90 actctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcat 187  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  14423678 actctatgtagaaggtcaacagcctctgatgctagga----gaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcat 14423773  T
Q  188 gtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||| || ||||||| ||||||||  |||||||| | |||||||||| || ||||  ||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  14423774 gttcggtcactttgcttgacgcattttttagggttgcctgtcctacggttaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtgaaac 14423858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15292220 - 15291953
Alignment:
Q  9 cttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||  | |||||   ||| || ||| |||| ||| | |||||||| |    
T  15292220 cttttttggatggcaaaatcaatcctcataaacacaacattcatggacctaggagatgtgacattgctatgcatgaccttttgaacttt-tgtagaagat 15292122  T
Q  106 caacaacctga--tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtt 203  Q
    ||| |||||    |||||| ||    ||||||| |||| ||||| | |||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  15292121 caataacctctagtgctagaaaactaaaagtgtaaaaaacaaattgtataaaaacatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccactttgtt 15292022  T
Q  204 tgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||| ||||| |||||  ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  15292021 tgacgccacttttagggttgtctgtcataccgcaaaaggcccgacacttaatccaacaagtggtgaaac 15291953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 241
Target Start/End: Original strand, 35455981 - 35456105
Alignment:
Q  117 tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaactttt 216  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||  || || ||||||||    
T  35455981 tgctaggaagccaaaattgtcaaaagcaaaaggtataaaagcatgttgattgttagaacacgctttctcatgtttgaccattttacttaacacaactttt 35456080  T
Q  217 agggctacctgtcctaccgtaaaag 241  Q
     |||||||||  |||||||||||||    
T  35456081 tgggctacctaccctaccgtaaaag 35456105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Original strand, 38875570 - 38875766
Alignment:
Q  28 caatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctag 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||  |||||   ||| || ||| |||| |||||| ||||||||||| || |||  | ||||||    
T  38875570 caatcatcgtaaacacaacat-cattgacctaggagacaagacattgttatgcatgaccttttgaactctacgtagaaggtcagcagcctctggtgctag 38875668  T
Q  123 gaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttaggg 220  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||  ||||||||    
T  38875669 gaagctgaaagtgtcaaaaacaaatggtacaaaaacatgttgattgtcagaacacactttctcatgtttggtcgctttgtttgatgcagtttttaggg 38875766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 197
Target Start/End: Original strand, 42921603 - 42921802
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||| | |||| |||||||||| |||||   ||| || ||| | || |||||||||    
T  42921603 cgctagatctttttggatggcaaaaccaatccttgtaaacacaatatt-atggacttaggagacatgacattgttatgcatgaccttctgaactctatgt 42921701  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    |||||| |||||||||  | |||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| |||||| |||    
T  42921702 agaaggccaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcataagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcgtgtttgacca 42921801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 272
Target Start/End: Original strand, 43129525 - 43129714
Alignment:
Q  85 tttggactctatgtagaaggtcaacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaacttt 182  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||  ||| || ||||||  ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||   |||    
T  43129525 tttgaactctctgtagaaggtcaaaaacatctggtgttaggaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatggtagaaaaacatgttgattgtcagaacacgtttt 43129624  T
Q  183 ctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||   ||||| ||||||||||  ||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  43129625 ctcatgtttgaccactttgcttgacgcatcttttaggactgaatgtccaaccgtaaaagttccgacccctaatccaacaagtggtgaaac 43129714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32230576 - 32230465
Alignment:
Q  130 aaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtc 229  Q
    |||||||| || ||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||    
T  32230576 aaagtgtcgaacgcagatggtataaaagcttgttgattgtcagaacacattttctcatgtttggtcactttgcttgacgcaacttttaaagctacttgtc 32230477  T
Q  230 ctaccgtaaaag 241  Q
     |||||||||||    
T  32230476 ttaccgtaaaag 32230465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 43115568 - 43115409
Alignment:
Q  90 actctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcat 187  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  | || || ||||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| | ||||  |||||||||    
T  43115568 actctacgtagaaggtcaacaatctctggtgttacgaagtcagaagtgtcaaaagcaaatgctatgaaagcatgttgattgtcaaaacacgctttctcat 43115469  T
Q  188 gtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgac 248  Q
     |||| || |||| ||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||    
T  43115468 atttgaccgctttattt-acgcaacttttagggctgtctatcctaccgtaaaagccccgac 43115409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 195
Target Start/End: Original strand, 34335333 - 34335440
Alignment:
Q  90 actctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcat 187  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  | ||  || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  34335333 actctatgtagaaggtcaacagcctctggtgtcagaaagtcgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcaggacacgctttctcat 34335432  T
Q  188 gtttggcc 195  Q
    ||||||||    
T  34335433 gtttggcc 34335440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22188855 - 22188687
Alignment:
Q  4 ctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataaca---ttatgtataaccatttggactctatgtag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||| | | ||||||||||| | |   ||||| || ||| |||| |||||||||||    
T  22188855 ctagacttttttggatgacaaaaccaattctcgtaaacacaacattcatgaatctaggagacatgatattgttatgcatgaccttttgaactctatgtag 22188756  T
Q  101 aaggtcaacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgatt 167  Q
    |||||||||| |  ||| |||||  || ||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||    
T  22188755 aaggtcaacagcctctggtgctaaaaaatcgaaagtgtcaaaaacaaatagtataaaatcatgttgatt 22188687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26212653 - 26212564
Alignment:
Q  129 gaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttag 218  Q
    ||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26212653 gaaagggtaaaaaacaaatggtataaaagcatgttgatcgtcagaatacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcaacttttag 26212564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 272
Target Start/End: Original strand, 8100461 - 8100732
Alignment:
Q  4 ctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtag 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||| |||||| |||||| |||||   ||| || |   |||  |||||| ||||    
T  8100461 ctaggcttttttggatggcaaaatcaatcatcgcaaa-acaacatttacg-acctagaagacatgacattgatatgcatgaatctttaaactctacgtag 8100558  T
Q  101 aaggtcaacaacctga--tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccact 198  Q
    ||||||||||||||    ||  ||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||  ||||| | ||||   ||||||||||||| ||| |    
T  8100559 aaggtcaacaacctctagtggaaggaagttgaaagtgtcacaaacaaatggtataaaagcatgtaaattgtcacaacacgttttctcatgtttgaccatt 8100658  T
Q  199 ttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||  |||| ||| | ||||||| | | ||||||||  | ||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8100659 ttacttgatgcagcgtttagggatgcatgtcctactattaaagtcccgactcttaatcccacaagtggtgaaac 8100732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 2566297 - 2566194
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacat---tatgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||| ||||||||||| ||||   |||| || ||| |||| |||||||||    
T  2566297 cgctagacctttttggatggcaaaatcaatcctcgtaaacacaacattgatggatctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgt 2566198  T
Q  99 agaa 102  Q
    ||||    
T  2566197 agaa 2566194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 272
Target Start/End: Original strand, 433370 - 433472
Alignment:
Q  170 tagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtga 269  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| || |  || ||||||||||||||| || || |||||||||||| | |||||    
T  433370 tagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacacagcttttaaggttgtctatcctaccgtaaaagcccctacccttaaacccacaggtggtga 433469  T
Q  270 aac 272  Q
    |||    
T  433470 aac 433472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 23023509 - 23023571
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt 73  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||    
T  23023509 tttttggatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcatcgacctaggagacatgacatt 23023571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23423980 - 23423921
Alignment:
Q  92 tctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatgg 149  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23423980 tctatgtagaaggtcaacaacatttgatgttaggaagttgaaagtgtcaaaagcaaatgg 23423921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9829426 - 9829281
Alignment:
Q  125 agtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctac 224  Q
    |||| |||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| | |||| | ||| ||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||     
T  9829426 agtcaaaagtgtcaaatataaatggtataaaagcatgttgattgtcaaaacacattttatcatg-ttagccactttgctt-acgcaacttttagggctat 9829329  T
Q  225 ctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    || || |||  ||||||  ||||||| ||| |  ||||| ||||||||    
T  9829328 ctatcttactataaaagatccgactcctaatcttacaagtggtgaaac 9829281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 210
Target Start/End: Original strand, 8858975 - 8859034
Alignment:
Q  151 ataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgca 210  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  8858975 ataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttgactactttgcttgacgca 8859034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 49
Target Start/End: Original strand, 12033346 - 12033383
Alignment:
Q  12 ttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcatt 49  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12033346 ttttggatggcaaaaccaatcatcgtaaacacaacatt 12033383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 192
Target Start/End: Original strand, 13307383 - 13307456
Alignment:
Q  119 ctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttg 192  Q
    |||||| ||| |||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  13307383 ctaggatgtcaaaagtgtcgaacgcaaaaggtataaaaacatgttgatagtaagaatacactttctcatgtttg 13307456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 200
Target Start/End: Original strand, 14436525 - 14436605
Alignment:
Q  117 tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccacttt 200  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||  |||||| ||||||||   ||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  14436525 tgctaggaagtcaaaggtgtcaaaaacaaatgatataaaaacatgttga---ttagaacacgttttttcatgtttggccacttt 14436605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 169
Target Start/End: Original strand, 15833049 - 15833136
Alignment:
Q  81 accatttggactctatgtagaaggtcaacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgt 169  Q
    |||||||| ||||||| ||||   ||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||  || ||||||||    
T  15833049 accatttgaactctatataga---tcaacaacatctggtgctaggaagtcaaaagtgtcaaacgtaaatggaataaaaatatcttgattgt 15833136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 38446267 - 38446346
Alignment:
Q  195 cactttgtttgacgcaactttt--agggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||||||| |||||||| |||||  |||| | | |||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  38446267 cactttgcttgacgcagcttttttagggatgcatgtcataccgtaaaagccccaactcctaaacccacaagtggtgaaac 38446346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 272
Target Start/End: Original strand, 39434572 - 39434847
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacat---tatgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||||   |||| |||||| ||||||||||||||    
T  39434572 cgctagacctttttggatggcaaaatcaatcctcgtaaacacaacattcatggatctaagagacattacattgatatgcataaccctttggactctatgt 39434671  T
Q  99 agaaggtcaacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    ||||| ||||   |  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  39434672 agaagatcaaatgcctctgatgctaggaagtcaaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggcca 39434771  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  | || | |||||||||||| ||||||||    
T  39434772 ctttgcttgacgcaacttttagagcttcctgtcctactgtaaaagcctccacccctaaacccacaagtggtgaaac 39434847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 272
Target Start/End: Original strand, 3187878 - 3188149
Alignment:
Q  5 tagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtaga 101  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  3187878 tagacctttttggatggcaaaaccaattctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattgctatgcataaccctttg-actctatgtaga 3187976  T
Q  102 aggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactt 199  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||    
T  3187977 aggttaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtttcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgcttcctcatgttttgccactt 3188076  T
Q  200 tgtttgacgcaacttttag-ggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    || |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  3188077 tgcttgatgcaacttttagaggcttcctgtcctaccgtaaaagccccgac-cctaaacccacaagtggtgaaac 3188149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 269
Target Start/End: Original strand, 38815208 - 38815471
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||   ||| || ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38815208 tttttggatggaaaaaccaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtca 38815307  T
Q  108 acaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttg 205  Q
    ||| |||  | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  38815308 acaccctctggtgctaggaagcggaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgtttg 38815407  T
Q  206 acgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtga 269  Q
     ||   |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||    
T  38815408 gcgtggcttttagggctgtctgtcctaccataaaagccccgacccctaatcccacaagtggtga 38815471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Original strand, 24124947 - 24125208
Alignment:
Q  16 ggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtcaacaac 112  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||   ||| || ||| |||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  24124947 ggatggcaaaactaatccttgtaaacacaacattcatggacctatgagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactttatgtagaaggccaacaac 24125046  T
Q  113 ct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgca 210  Q
    ||  | ||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  24125047 ctctggtgctaggaaatcaaaattgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagagcacgctttctcatgtttggccattttgcttgatgca 24125146  T
Q  211 acttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
     ||||||||||| | ||||| ||||||||||   |||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  24125147 gcttttagggctgcttgtcccaccgtaaaaggcacgacgcataatcccacaagtggtgaaac 24125208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 272
Target Start/End: Original strand, 500219 - 500407
Alignment:
Q  85 tttggactctatgtagaaggtcaacaac-ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttc 183  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| | || || |||||||  ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||    
T  500219 tttgaactctatgtagaaggccaacacctctcatactaggaaaccgaaaatgtcaaaagtaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttc 500318  T
Q  184 tcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  500319 tcatgtttggccactttgcttgacgcaacttttagggctgtcggtcctaccgtaaaaggcccgacacctaatcccacaagtggtgaaac 500407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Original strand, 6592481 - 6592700
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacattatgt--ataaccatttggactctatgta 99  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||| |  || ||| |||| |||||||| |    
T  6592481 cgctagacctttctggatgacaaaaccaatactcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattatatgcatgaccttttgaactctatgca 6592580  T
Q  100 gaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccac 197  Q
    |||||||||||||||  |  ||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  6592581 gaaggtcaacaacctctggagctaggaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtttaaaatcatgttgattgtgagaacacgctttctcatgtttggccac 6592680  T
Q  198 tttgtttgacgcaactttta 217  Q
    |||| |||||||| ||||||    
T  6592681 tttgcttgacgcagctttta 6592700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25022017 - 25021740
Alignment:
Q  1 tcgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacattat---gtataaccatttggactctatg 97  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |   | || ||| |||| ||| | ||    
T  25022017 tcgctagaattttttggatgataaaatcaatcattgtaaacacaacattcctggacctaggagatatgacattgttgtgcatgaccctttgaactttgtg 25021918  T
Q  98 tagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcc 195  Q
    | || ||||||||||||  | |||||||||| | ||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||  ||    
T  25021917 tggatggtcaacaacctctggtgctaggaagccaaaaatgtcaaaagaaaatggtataaaaacatgttgattgtgagaacacactttctcatatttcacc 25021818  T
Q  196 actttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaact 273  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||   |||| ||| |||||| || |||| | ||| |||||||| |||||||||    
T  25021817 actttgcttgacacaacttttagggctgtatgtcatactgtaaaaacatcgacccctaatcccacaagtggtgaaact 25021740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 35740102 - 35739914
Alignment:
Q  85 tttggactctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaacttt 182  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||   ||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||   ||||    
T  35740102 tttgaactctatgtagaaggtcaacaatctctggtgctaggaaactgaaagtgtcaaaagctaattgtataaaaacatgttgattgtcagaacccgcttt 35740003  T
Q  183 ctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  35740002 ctcatgtttggccactttgcttaacacaacttttagggatgtctgtcctaccgtaaaaggcccgac-cttaatcccactagtggtgaaac 35739914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 6618199 - 6618409
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacattatgt--ataaccatttggactctatgtagaaggtcaa 108  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |  || ||| |||| || ||||| | ||||||||    
T  6618199 tttttggatgacaaaaccaatactcgtaaacataacattcatggacctatgagacatgacattatatgcatgaccttttgaacgctatgcaaaaggtcaa 6618298  T
Q  109 caacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttga 206  Q
    ||| ||  |  ||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||  | ||| | |||||    
T  6618299 caatctctggagctaggaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtttaaaatcatgttgattgtgagaacacgctttctcatgtttaactactctatttga 6618398  T
Q  207 cgcaactttta 217  Q
    |||||||||||    
T  6618399 cgcaactttta 6618409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Original strand, 37514129 - 37514298
Alignment:
Q  5 tagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtaga 101  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| || ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||   ||| || ||| |||| ||||||||||||    
T  37514129 tagacctttttgggtggcaagatcaatcctcgtgaatacaacattcatggacctaagagacgtaacattgatatgcatgaccttttgaactctatgtaga 37514228  T
Q  102 aggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgt 169  Q
    ||||||||| |||  |  |||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  37514229 aggtcaacagcctctggcgctaggaaattgaaagtgtcaaaagcaaatagtataaacgcatgttgattgt 37514298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8540484 - 8540359
Alignment:
Q  94 tatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgttt 191  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||||| ||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  8540484 tatgtagaaagtcaacaacctctgatgttagaaagttgaaagtgtcaaatgcagatgacataaaaacatgtcgattgttagaacacattttctaatgttt 8540385  T
Q  192 ggccactttgtttgacgcaactttta 217  Q
    | | | ||||||||||||||||||||    
T  8540384 gactattttgtttgacgcaactttta 8540359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 243
Target Start/End: Original strand, 4073573 - 4073686
Alignment:
Q  130 aaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtc 229  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||| || ||||   |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||     
T  4073573 aaagtgtcaaatgcaaattgtataaaatcatgttgattggtaaaacacgttttctcttgtttgaccactttgtttgatgcaacttttagggttgtctgtt 4073672  T
Q  230 ctaccgtaaaagca 243  Q
    | ||||||||||||    
T  4073673 ccaccgtaaaagca 4073686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 200
Target Start/End: Original strand, 28196106 - 28196300
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacattat---gtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||||| ||| |  ||| ||||||||||| ||||| |   | || | | |||| |||||| ||||| |||||    
T  28196106 tttttggatgacaaaatcaattcccgtaaacacaacatccgtggatctaggagacatgacattgttgtgcatgatcctttgaactctacgtagatggtca 28196205  T
Q  108 acaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccacttt 200  Q
    |||||||  | |||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||| | | |||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  28196206 acaacctatggtgctaggaagacaaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaaacatgtttattatcataacacactttctcatgtttagccgcttt 28196300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 210
Target Start/End: Original strand, 8882371 - 8882445
Alignment:
Q  136 tcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgca 210  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8882371 tcaaaaacaaatggtttaaaagcatattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgca 8882445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Original strand, 4699785 - 4700048
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacat---tatgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    ||||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||   |||  || ||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  4699785 tttttggatggcaaaactaatccttgtaaacacaacattcatggacctaggtgacataatattgctattcatgacc-tttgaactttatatagaaggtca 4699883  T
Q  108 acaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttg 205  Q
    ||| |  ||| ||||| |||| | ||||||| || | |||||||  ||||| |||||| ||||| ||||||  | || |||||||||||||||||| |||    
T  4699884 acagcctctggtgctatgaagccaaaagtgttaaca-caaatggtgtaaaaacatgttaattgtgagaacacgc-ttatcatgtttggccactttgcttg 4699981  T
Q  206 acgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    || ||||||| |||| |  || ||| |  ||||||||  |||  |||||||||||||| ||||||||    
T  4699982 acacaactttgagggttgtctatccgattgtaaaagccgcgatccttaaacccacaagtggtgaaac 4700048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22589538 - 22589395
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacat---tatgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||   |||| || ||| |||| |||||||||    
T  22589538 cgctagacctttttggatggcaaaaccaatcctcgtgaacacaacattcatagacctatgagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgt 22589439  T
Q  99 agaaggtcaacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaa 141  Q
    | || ||||||| |  ||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  22589438 a-aaagtcaacagcctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaa 22589395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 241
Target Start/End: Original strand, 8619802 - 8619963
Alignment:
Q  82 ccatttggactctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaac 179  Q
    |||||||  |||||||| ||| |||||||||||  | || ||| ||| | ||| ||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | || |  |    
T  8619802 ccatttgagctctatgtcgaaagtcaacaacctctggtgttagaaagccaaaaatgttaaaaacaaatggtataaaagcacgttgattgtcaaaatacgc 8619901  T
Q  180 tttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaag 241  Q
    ||| ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||    
T  8619902 tttttcatgtttgaccattttacttgacgcaacttttagggctgtctgttctatcgtaaaag 8619963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Original strand, 10189568 - 10189670
Alignment:
Q  117 tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaactttt 216  Q
    |||||||||| | ||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| | |||||  ||| ||||||||||    
T  10189568 tgctaggaagccaaaaatgtcaaatgcaaatgatataaaaacatgttgattgtcagaacatgctttctcttgtttgactactttaattggcgcaactttt 10189667  T
Q  217 agg 219  Q
    |||    
T  10189668 agg 10189670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 42922206 - 42922084
Alignment:
Q  120 taggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagg 219  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||| | ||||   |||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  42922206 taggaagccaaaagtgtcaaaggcaaatgatttaaaagcattttgattgtcaaaacacgttttctcaaatttgaccattttgtttgacgcaacttttatg 42922107  T
Q  220 gctacctgtcctaccgtaaaagc 242  Q
    ||| | |||| |||| |||||||    
T  42922106 gctgcatgtcttaccataaaagc 42922084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Original strand, 3821148 - 3821294
Alignment:
Q  21 gcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtcaacaac--ctg 115  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||| | | ||||||||||||| |||||   ||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||    
T  3821148 gcaatatcaatcctcgtaaacataacatttatgaacctaggagacatgacattgctatgcattaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctg 3821247  T
Q  116 atgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgt 162  Q
     | |||||| | | ||||||||| | | ||||||||||||| |||||    
T  3821248 gttctaggatgccaaaagtgtcacatggaaatggaataaaatcatgt 3821294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 73
Target Start/End: Original strand, 24451036 - 24451096
Alignment:
Q  12 ttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt 73  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24451036 ttttggatggcaaaa-caatcatcgtgaacacaacattcatggacctaggagacatgacatt 24451096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 162
Target Start/End: Original strand, 3863308 - 3863387
Alignment:
Q  85 tttggactctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgt 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3863308 tttgaactctatgtagaaggtcaataacctctggtcctaggaagccaaaagtgtcacatgcaaatggaataaaagcatgt 3863387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 8882258 - 8882314
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacat 67  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8882258 ttttttgatggcaaaattaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacat 8882314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 241
Target Start/End: Original strand, 37517163 - 37517243
Alignment:
Q  161 gttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaag 241  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||  ||||||||| |||||||    
T  37517163 gttgattgtcggaacaccctttctcatgtttggccactttgcttgatgcagcttttagagctgtctgtcctacggtaaaag 37517243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Original strand, 8115849 - 8115959
Alignment:
Q  130 aaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtc 229  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||| |||||||||  ||||| | ||||| ||||| || |||||  |||||||||| || | |||     
T  8115849 aaagtgtcaaatgcaaatggtataaaagtatattgattattagaacaagatttcttacgtttgaccactctgattgacataacttttaggactgcttgtt 8115948  T
Q  230 ctaccgtaaaa 240  Q
    |||||| ||||    
T  8115949 ctaccgaaaaa 8115959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 97
Target Start/End: Original strand, 42659135 - 42659230
Alignment:
Q  5 tagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacat---tatgtataaccatttggactctatg 97  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||| ||   |||| |||||| ||| |||||||||    
T  42659135 tagacctttttggatgacaaaattaatcctcgtaaacacaacattcatgaacctagaagacataatattgctatgcataaccctttagactctatg 42659230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 4066759 - 4066821
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt 73  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| || ||| |||||||||| |||| |||||    
T  4066759 tttttggatggtaaaaccaatcatcgtgaacacaacagtcatggacctaggacacattacatt 4066821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 162
Target Start/End: Original strand, 3825637 - 3825705
Alignment:
Q  96 tgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgt 162  Q
    |||||||||||||||||||  | | |||||||| | || |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3825637 tgtagaaggtcaacaacctatggttctaggaagccaaaggtgtcacatgcaaatggaataaaagcatgt 3825705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 9259486 - 9259379
Alignment:
Q  10 ttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacat---tatgtataaccatttggactctatgtagaaggtc 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||| | || ||||   |||| || |   | || |||||||||||||||||    
T  9259486 ttttttggatgacaaaatcaatcttcgtaaatacaacattcatggacttaggatatatgacattgctatgcatgagtctgtgaactctatgtagaaggtc 9259387  T
Q  107 aacaacct 114  Q
    ||||||||    
T  9259386 aacaacct 9259379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11611264 - 11611223
Alignment:
Q  179 ctttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttaggg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  11611264 ctttctcatatttggccactttatttgacacaacttttaggg 11611223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 110
Target Start/End: Original strand, 18804518 - 18804628
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataaca---ttatgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||  | ||||||||| ||| |||   ||||| || ||| |||| | |||||||    
T  18804518 cgctagacctttttggatggcaaaaccaatcctcgtaaacaaaacactc-tgaacctaggagtcatgacattgttatgcatgaccttttgaaatctatgt 18804616  T
Q  99 agaaggtcaaca 110  Q
    ||||||||||||    
T  18804617 agaaggtcaaca 18804628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 200
Target Start/End: Original strand, 36004126 - 36004230
Alignment:
Q  98 tagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcc 195  Q
    |||| ||||||||||||  | || ||||||||| ||| ||||||| | |||||| |||||| |||||||||||| | |||  ||||| |||| ||| |||    
T  36004126 tagatggtcaacaacctctggtgataggaagtcaaaaatgtcaaatgtaaatggtataaaaacatgttgattgtcataacgcactttgtcatatttagcc 36004225  T
Q  196 acttt 200  Q
    |||||    
T  36004226 acttt 36004230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 156
Target Start/End: Original strand, 43823927 - 43824053
Alignment:
Q  35 cgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtcaacaacctg--atgctaggaagtcg 129  Q
    |||||||||| |||| | ||| || |||||||| |||||   ||| || |||||||| |||||||||  |||||||| | |||   |||| |||||| |     
T  43823927 cgtaaacacaacattaatggatctcggagacatgacattgctatgcatgaccatttgaactctatgtgaaaggtcaatagcctctaatgcaaggaagcca 43824026  T
Q  130 aaagtgtcaaaagcaaatggaataaaa 156  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  43824027 aaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 43824053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 51
Target Start/End: Original strand, 24320243 - 24320291
Alignment:
Q  3 gctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattca 51  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24320243 gctagacctttttggatatcaaaatcaatcctcgtaaacacaacattca 24320291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 30)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 39583431 - 39583156
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||||| |||||   ||| || ||| |||| ||||||||     
T  39583431 cgctagacctttttggatggcaaaatcaatcctcgtaaacacgacattcatgaacctaggagacatgacattgctatgcatgaccctttgaactctatgc 39583332  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  39583331 agaaggtcaacaacctatgatgctaggaaaccgaaagtgtcgaaaacaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggcca 39583232  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| |  ||||| ||||| |||||||| ||| ||||    
T  39583231 ctttgcttgacgcagcttttagggctgcctatcctaccataaatggcccgacccttaatcccacaagtggtaaaac 39583156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 239
Target Start/End: Original strand, 26772663 - 26772905
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||   ||| |||| | |||| ||||||| |    
T  26772663 cgctagacctttttggatggcaaaatcaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattgttatgcataatcctttgtactctatat 26772762  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    |||||||||||  |||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||    
T  26772763 agaaggtcaactgcctctgatgctaggaagccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctgatgtttggcca 26772862  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaa 239  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| | | |||||||| |||||    
T  26772863 ctttgcttgacacaacttttagggatgcatgtcctactgtaaa 26772905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Original strand, 44198681 - 44198947
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||   ||| |||||| | || ||||||||||||||||||    
T  44198681 tttttggatggcaaaatcaattatcgcaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcataaccttctgaactctatgtagaaggtca 44198780  T
Q  108 acaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttg 205  Q
    ||| |||  | || || |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  44198781 acagcctcgggtgttaagaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattctcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttg 44198880  T
Q  206 acgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||  ||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  44198881 acgcaacttttagagctgcctgacctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtgaaac 44198947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 53785626 - 53785889
Alignment:
Q  14 ttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtcaaca 110  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||   ||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  53785626 ttggatggcaaaaccaatcctcgtaaacataacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaaca 53785725  T
Q  111 acct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacg 208  Q
    ||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| ||  ||||||    
T  53785726 acctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcgtgtttggccaccttacttgacg 53785825  T
Q  209 caacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    |  |||| |||||| ||| |||||| |||||||  ||||| | ||| ||||| || ||||||||    
T  53785826 cggctttaagggctgcctatcctacggtaaaaggcccgacacctaatcccactagtggtgaaac 53785889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 272
Target Start/End: Original strand, 7900771 - 7901038
Alignment:
Q  10 ttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtc 106  Q
    |||||||||||| ||||  |||||| ||||||| |  ||| | |||||||||| ||||||||||   |||||||| | ||   |||||||||||||||||    
T  7900771 ttttttggatggtaaaactaatcattgtaaacaaaatattgatggacctaggaaacataacattgctatgtataatccttcaaactctatgtagaaggtc 7900870  T
Q  107 aacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgttt 204  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||| ||| | |||| ||    
T  7900871 aacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaaaacgctttctcatgttcggctattttgctt 7900970  T
Q  205 gacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||||||  |||||||| || | |||||||||||||||  || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  7900971 gacgcagtttttagggatatccgtcctaccgtaaaagacccaacccctaatcccacaagtggtgaaac 7901038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3443501 - 3443270
Alignment:
Q  15 tggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtcaacaa 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||  |||||||||  |||||   | | || ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  3443501 tggatggcaaaaccaatcatcgtaaacacaacattcatagatttaggagacaagacattcctacgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaa 3443402  T
Q  112 cctga--tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgc 209  Q
    |||    |||||||||   ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  3443401 cctctagtgctaggaaactgaaagtgtcaacagaaaatggtataaaagcatgttgattgttagaatacactttttcatgtttggccattttgcttgacgc 3443302  T
Q  210 aacttttagggctacctgtcctaccgtaaaag 241  Q
    |||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  3443301 aacttttaggactctctgtcctatcgtaaaag 3443270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 52741715 - 52741477
Alignment:
Q  1 tcgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatg 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||| || |||  ||  | ||| ||||||||||| |||||   ||| || ||| |||| ||||||||    
T  52741715 tcgctagacctttttggatggcaaaacaaatcttcgtgaatacaagataaatggatctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatg 52741616  T
Q  98 tagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcc 195  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |    
T  52741615 tagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggtc 52741516  T
Q  196 actttgtttgacgcaac-ttttagggctacctgtcctac 233  Q
    | |||||||||| || | |||||||||| ||||||||||    
T  52741515 aatttgtttgactcagctttttagggctgcctgtcctac 52741477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 13582414 - 13582658
Alignment:
Q  1 tcgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatg 97  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||   ||| || ||| |||| ||||| ||    
T  13582414 tcgctaggcctttttggatggctaaatcaatcttcgtaaacacaacattcatggtcctaggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctctg 13582513  T
Q  98 tagaaggtcaacaacc--tgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcc 195  Q
    ||||||||||||||    || ||||||||| || ||||||| |||| ||||||| |||||| || ||||||||| |||||| ||||||| |||||||  |    
T  13582514 tagaaggtcaacaattgttggtgctaggaaatcaaaagtgtaaaaa-caaatggtataaaaacacgttgattgtcagaacacactttcttatgtttgatc 13582612  T
Q  196 actttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaag 241  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  13582613 actttgattgacgcagcttttagggctgcttgtcctacggtaaaag 13582658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Original strand, 32546700 - 32546901
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatta---tgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||   || || ||  |||| |||||||||    
T  32546700 cgctagacctttttggatggcaaaaccaatcctcgtgaacacaacattcatggacctaggagacatgacattactatgcatgactttttgaactctatgt 32546799  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    |||||||||||| |||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  32546800 agaaggtcaacagcctttggtgctaggaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagtatgttgattgtccgaacacgctttctcatgtttggcca 32546899  T
Q  197 ct 198  Q
    ||    
T  32546900 ct 32546901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 38671082 - 38670887
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacat---tatgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||| |||||  ||| ||||||||||    
T  38671082 cgctagacttttttagatggcaaaaccaatcctcgtacacacaacattcatggacctaggagacataacattgctatgcataactctttagactctatgt 38670983  T
Q  99 agaaggtcaacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttg 192  Q
    ||||||||| |  |  |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  38670982 agaaggtcatccgcctctgatgctagaaagccaaaagtgtcaaaaacaaattgtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttg 38670887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 49017881 - 49018112
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||||    |||| |||||   ||| || ||| |||| ||| || ||||||| |||    
T  49017881 tttttggatggcaaaatcaatcctcataaacacaacattcattgaccta----acatgacatttatatgcatgaccttttgaactttacgtagaagatca 49017976  T
Q  108 acaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttg 205  Q
    |||||||  | |||||||||  ||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  49017977 acaacctcgggtgctaggaaaccgaaagtgtaaaaaaaaaatggtataaaaacatgttgattgttagaacacactttctcatgtttggtcactttgtttt 49018076  T
Q  206 acgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaag 241  Q
    ||| |||||| |||| | | ||||||||||||||||    
T  49018077 acgtaactttcagggttgcttgtcctaccgtaaaag 49018112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Original strand, 5338552 - 5338796
Alignment:
Q  3 gctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgta 99  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||   |||||| ||||||  |||||   | | || ||| |||| ||||||||||    
T  5338552 gctagaccattttggatggcaaaaccaatcctcgtaaacacaacattc---gacctatgagacaagacattgctacgcatgaccttttgaactctatgta 5338648  T
Q  100 gaaggtcaacaacctga--tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaa---actttctcatgtttggc 194  Q
    ||| |||||||| ||    |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |   |||   |||||||||||||||||    
T  5338649 gaatgtcaacaatctctagtgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcaaattgtataaaagcatgttgactgtcaacgcaacgcactttctcatgtttggc 5338748  T
Q  195 cactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagc 242  Q
     | |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5338749 aattttgtttgacgcaactcttagggctttctgtcctaccgtaaaagc 5338796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Original strand, 38145970 - 38146236
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataaca---ttatgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||   ||||| || ||| |||| |||||| |||||| || |    
T  38145970 tttttagatgacaaaatcaatcatcgtaaacacaacgttcatggacctaggagacatgacattgttatgcatgaccctttgaactctaagtagaatgtaa 38146069  T
Q  108 acaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttg 205  Q
    |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||| | ||||   | ||||  ||||| |||||||| |||    
T  38146070 acaacctctggtgctaggaagtcaaaagtgtcaaatgtaaatggtataaaaacatgttgattgtcaaaacacgttgtctcgcgtttgaccactttgattg 38146169  T
Q  206 acgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    | ||  ||||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||| | ||| ||||||||  |||||||    
T  38146170 atgccgcttttagggctgcatgtcctaccctcaaagctccgacccctaatcccacaagtcgtgaaac 38146236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37133201 - 37132976
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| ||||||   || |||||||||| |||||   ||| || ||| || | |||||||||    
T  37133201 cgctagacctttttggatcgcaaaaccaatccttataaacacaacattcattaacttaggagacatgacattgctatgcatgacctttagaactctatgt 37133102  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| |||  ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |||    
T  37133101 agaaggtcaacaacctctggtgctaagaaaccgaaagtgtaaaaaacaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttaacca 37133002  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggct 222  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||    
T  37133001 ctttgcttgacgtagcttttagggct 37132976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 240
Target Start/End: Original strand, 4472970 - 4473209
Alignment:
Q  5 tagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtaga 101  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||  |||||  |||||||||||||| | |||   ||| || |   |||| ||| ||||||||    
T  4472970 tagacttttttggatgacaaaaccaattctcgtaaacacaatattcatagacctaggagacatgaaattgctatgcatgattctttgaactttatgtaga 4473069  T
Q  102 aggtcaacaac-ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccacttt 200  Q
    |||| || ||  ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||  |||| |||||||| | ||||||    
T  4473070 aggttaagaattctggtgctaggaagccgaaagtgtcaaaaacaaatagtataaaaacatattgatggttagaacacgctttttcatgttttgacacttt 4473169  T
Q  201 gtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaa 240  Q
    | ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  4473170 gcttgacgcaatttttaaggctctctgtcctaccgtaaaa 4473209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 52412084 - 52411914
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||  ||||||||||| |||||   ||| || ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  52412084 tttttggatggcaaaatcaatcattgtaaacacaatatttatgggtctaggagacatgacattgttatgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtca 52411985  T
Q  108 acaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaaca 176  Q
    || ||  ||  || ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52411984 acgacatctagtgttagaaagctgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgtcagaaca 52411914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 192
Target Start/End: Original strand, 51234577 - 51234716
Alignment:
Q  58 taggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaat 152  Q
    ||||||||||||||||   ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  51234577 taggagacataacattgttatgcataaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctagaaagtcgaaagtgtcaaaaataaatggtat 51234676  T
Q  153 aaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttg 192  Q
    |||||||||||| |||| | ||||  |||| |||||||||    
T  51234677 aaaagcatgttggttgtcataacatgctttttcatgtttg 51234716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 46940852 - 46940729
Alignment:
Q  117 tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaactttt 216  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  46940852 tgctaggacgtcaaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcggaacatgttttctaatgtttggccactttgcttgacgcatctttt 46940753  T
Q  217 agggctacctgtcctaccgtaaaa 240  Q
    || | |  |||||||||| |||||    
T  46940752 agagttgtctgtcctaccataaaa 46940729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Original strand, 25324942 - 25325180
Alignment:
Q  10 ttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtc 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| |||  ||||| || | |||||   ||| || | |||||| |||||||||||||||||    
T  25324942 ttttttggatggcaaaagcaatcatcgtaagcacaatattcatggatttaggaaacttgacattgctatgcatgatcatttgaactctatgtagaaggtc 25325041  T
Q  107 aacaacc--tgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagc--atgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgt 202  Q
    ||||| |  || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| |  ||||||||||  | || |   ||| | |||||| | |||||||     
T  25325042 aacaatctatggtgctaggaaatcgaaagtgttgaaagcaaatggtataaaaacatatgttgattgccaaaatacgttttataatgttttgtcactttgc 25325141  T
Q  203 ttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaag 241  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  25325142 ttgacgcaacttttagaactacatgtcctaccataaaag 25325180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26856964 - 26856792
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||| | ||||||||||| |||| ||||| ||| || |||| ||||||   ||||||||||||| |||||   ||| || ||| |||| |||||||||    
T  26856964 cgctaggcctttttggatggtaaaaccaatcctcgcaagcacaacattcataaacctaggagacatgacattgctatgcatgaccctttgaactctatgt 26856865  T
Q  99 agaaggtcaacaacctga--tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgt 169  Q
    ||||||||||||  ||    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  26856864 agaaggtcaacagtctctagtgctaggaaatcgaaagcgtcaaaagcagatggtataaaagcatgttgattgt 26856792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 90 - 240
Target Start/End: Original strand, 37992328 - 37992480
Alignment:
Q  90 actctatgtagaaggtcaacaacctga--tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcat 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    ||||| |||| | |||   ||||||| |||||  |||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||    
T  37992328 actctttgtagaaggtcaacaacctctagtgctatgaagccaaaaccatcaaaagtaaatgatataaaatcatgttgattgtcagaacatgcttcctcat 37992427  T
Q  188 gtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaa 240  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||  |||||||||||||||    
T  37992428 gtttggtcactttgtttgacacaacttgcagggctatatgtcctaccgtaaaa 37992480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 54508491 - 54508367
Alignment:
Q  94 tatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaacttt-ctcatgtt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||  | |||||| || || ||| |||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||    
T  54508491 tatgcagaaggtcaacaacctctggtgctagaaaatcaaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaaacatgttaattgtcagaacaagtttttctcatgtt 54508392  T
Q  191 tggccactttgtttgacgcaacttt 215  Q
    | |||| ||||||||||||||||||    
T  54508391 tagccattttgtttgacgcaacttt 54508367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7502117 - 7502010
Alignment:
Q  96 tgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaag-catgttgattgttagaacaaactttctcatgtttg 192  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||  | ||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  7502117 tgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccaaaaatgtcaaaagaaaatggtataaaaaacatgttgattgttcgaacacgctttctcatgtttg 7502018  T
Q  193 gccacttt 200  Q
     |||||||    
T  7502017 accacttt 7502010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 4669856 - 4669794
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt 73  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  4669856 tttttggataacaaaatcaatcatcgtaaacacaacattcatggaccaaggagacatgacatt 4669794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 59
Target Start/End: Original strand, 26276520 - 26276577
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggaccta 59  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||    
T  26276520 cgctagatctttttggatggcaaaatcaatcctcataaacacaacattcatggaccta 26276577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 4763985 - 4763888
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtc 106  Q
    ||||||||||||||    |||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||   ||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  4763985 tttttggatggcaattctaatcctcgtaaacacaacattcatggacc-aggagacatgacattgctatgcataaccttttgaactctatgtagaaggtc 4763888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 35484758 - 35484691
Alignment:
Q  133 gtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccacttt 200  Q
    |||||||| |||||| | | |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  35484758 gtgtcaaatgcaaatagtacaaaaacatgttgattgttggaacatattttctcatgtttgaccacttt 35484691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 110
Target Start/End: Original strand, 44738 - 44852
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaac---acagcattcacggacctaggagacataacat---tatgtataaccatttggactcta 95  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || |||   ||| |||||| |||||||||| |||| ||||   |||| || ||| |||| ||||||    
T  44738 cgctagacctttttggatggcaaaacaaatccttgtgaacacaacaacattcatggacctaggaaacatgacattgctatgcatgaccttttgaactcta 44837  T
Q  96 tgtagaaggtcaaca 110  Q
    |||||||||||||||    
T  44838 tgtagaaggtcaaca 44852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 38978992 - 38978829
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    ||||||||||||||||  |||  ||||||||||| |||| |   ||||| ||||||| |||||   ||| || ||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  38978992 tttttggatggcaaaactaattttcgtaaacacaacattgataaacctatgagacatgacattgttatgcatcaccttttgaactatatgtagaaggtca 38978893  T
Q  108 acaacctga--tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgt 169  Q
    ||  ||| |  |||||||||  | |||||||||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  38978892 acggcctcaggtgctaggaaaccaaaagtgtcaaaaacaaatagtataaaaacatattgattgt 38978829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 32691059 - 32690995
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacattat 75  Q
    ||||||||||  |||||||||| || |||||||| ||||||  ||| |||||||||||| |||||    
T  32691059 tttttggatgataaaatcaatcctcttaaacacaacattcatagacttaggagacataatattat 32690995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4413268 - 4412993
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||| ||||||||||||||| || ||   ||| || ||| |||| || ||||||    
T  4413268 cgctagacctttttggatggcaaaatcaatcctcatgaacacaacattcatggacctaggagacatgactttgctatgcatgaccttttgaaccctatgt 4413169  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    ||||||||||||| ||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  4413168 agaaggtcaacaatctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggcca 4413069  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||| |||||||  | ||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  4413068 ctttgcttgacacagcttttagggttgcctgtcctacggtaaaaggtctgacacttaatcccacaagtggtgaaac 4412993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 272
Target Start/End: Original strand, 28224905 - 28225180
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||   ||| |||| | ||||||||||||||    
T  28224905 cgctagacctttttggatggcaaaacaaatcttcataaacacaacattcattgacctaggagacataatattgtcatgcataatcctttggactctatgt 28225004  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||| ||||| ||    
T  28225005 agaaggtcaacaacctctgaagctaggaagccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaatacgctttctcatatttggtca 28225104  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||||| |||||||| ||||||  | |   ||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||  |||||||    
T  28225105 ctttgcttgacgcagcttttaaagttgtttgtcctaccgtaaaagccctaactcctaagcccacaagtagtgaaac 28225180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41868109 - 41867844
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||   ||| || ||| |||| |||||||||    
T  41868109 cgctagatctttttgg-tggcaaaaccaatcctcgtaaacacaacattcatggacctgggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgt 41868011  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    |||||||||||| |||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||    
T  41868010 agaaggtcaacagcctctggtgctaggaacccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacatgctttctcatgtttgacca 41867911  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaag 263  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||  ||||||  ||||| | ||| ||||||||    
T  41867910 ctttgcttgacgcagcttttaaggctgcctgtcctacgataaaaggtccgacacctaatcccacaag 41867844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 272
Target Start/End: Original strand, 44686348 - 44686599
Alignment:
Q  29 aatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacat---tatgtataaccatttggactctatgtagaaggtcaacaa--cctgatgctagg 123  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  44686348 aatcctcgtaaacacaacattcacggacctaggagacataacattgctatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaaactctgatgctagg 44686447  T
Q  124 aagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatg----ttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagg 219  Q
    ||| |||||||||||||||| ||    |||||||||||    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  44686448 aagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac-cagcttttagg 44686546  T
Q  220 gctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
     ||  |||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  44686547 actgtctgtcctatcgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaac 44686599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 272
Target Start/End: Original strand, 27502269 - 27502541
Alignment:
Q  4 ctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtag 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||| | |||   ||| |||||| |||||| |||||||||    
T  27502269 ctagacctttttggattgcaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcatagatctaggagacatgatattgctatgcataaccctttggattctatgtag 27502368  T
Q  101 aaggtcaaca--acctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccact 198  Q
    ||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||| ||||  |||||   ||||||||||||| |||||    
T  27502369 aaggtcaacagtatatgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaaagcaattgtataaaagcatgttgtttgtcggaacacgttttctcatgtttgaccact 27502468  T
Q  199 ttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||| |||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||    
T  27502469 ttgcttgacgcagcttttagggtta-ttgtcctatcgtaaaagctctgacccctaaacccacaagtggtgaaac 27502541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9685617 - 9685342
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||   ||  || ||| |||| ||||||| |    
T  9685617 cgctagacctttttggatggcaaaaacaatctttgtgaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatccatgaccttttgaactctatat 9685518  T
Q  99 agaaggtcaacaacctga--tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    |||||||| ||| |||    |||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||    
T  9685517 agaaggtccacagcctctagtgctagaaaatcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttttcatgtttggcca 9685418  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||||| |||||||   |||||||||| ||| |||||| |||||||  | ||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  9685417 ctttgcttgacgcggattttagggctgcctatcctacggtaaaaggtctgacacctaatcccacaagtggtgaaac 9685342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 241
Target Start/End: Original strand, 17344546 - 17344787
Alignment:
Q  5 tagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtaga 101  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||   ||| || ||| |||| ||||||||||||    
T  17344546 tagacctttttggatcgaaaaatcaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtaga 17344645  T
Q  102 aggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactt 199  Q
    ||||||||| |||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||   |||||| ||||||||||| |    
T  17344646 aggtcaacagcctatggtgctaggaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtgaaaacacgttttctcgtgtttggccacct 17344745  T
Q  200 tgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaag 241  Q
    |  |||||||| |||| ||| ||  || |||||| |||||||    
T  17344746 tacttgacgcagctttaaggactggctttcctacggtaaaag 17344787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Original strand, 3825640 - 3825907
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || |||||||| |||| | || ||||| |||||| |||||   ||| || |   |||| |||| |||| ||||||||    
T  3825640 tttttggatgacaaaatcgatcttcataaacacaacatttatggtcctagaagacatgacattgctatgcatgattctttgaactcgatgttgaaggtca 3825739  T
Q  108 acaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttag-aacaaactttctcatgtttggccactttgttt 204  Q
    |||||||  ||||||||||| | |||||||||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||| || || ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  3825740 acaacctttgatgctaggaaattgaaagtgtctgaagcaaatgaaataaaaacatgtagattgtcaggaaaaaactttttcatgtttgaccactttgctt 3825839  T
Q  205 gacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||  | ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  3825840 gacgcagcttttagggctctctgtcataccgtaaaagtcctgacccctaatcccacaaggggtgaaac 3825907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23485006 - 23484865
Alignment:
Q  131 aagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcc 230  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  23485006 aagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacatgctttctcatatttggccactttgtttgacgtagcttttagggctagttgtcc 23484907  T
Q  231 taccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
     ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  23484906 caccgttaaaggcccgacacttaatcccacaagtggtgaaac 23484865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 240
Target Start/End: Original strand, 5532411 - 5532567
Alignment:
Q  85 tttggactctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaacttt 182  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||   |||    
T  5532411 tttgaactctatgtagaagctcaacaacctatggtgctaggaag-ctaaagtgtcaaaagtaaatagtataaaagcatgttgattgtcacaacacgtttt 5532509  T
Q  183 ctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaa 240  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  5532510 ctcatgtttgaccactttgcttgacgcagcttttagggctgcatgtcctaccgtaaaa 5532567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18745156 - 18744956
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||  ||||||||| | || |||||   ||| || | | |||| |||||||||    
T  18745156 cgctagacctttttggatggcaaaaccaatccttataaacacaacattcatagacctaggaaatatgacattgctatgcatgatcttttgaactctatgt 18745057  T
Q  99 agaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    |||||| ||||| |||  | |||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  18745056 agaaggccaacagcctatggtgctagaaaatcgaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagtatgttgattgtcagaacacgctttctcgtgtttggcca 18744957  T
Q  197 c 197  Q
    |    
T  18744956 c 18744956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19161976 - 19161741
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  |||||  |||||||||||||| |||||   ||| || ||| |||| |||||||||| ||||| |    
T  19161976 tttttggatgacaaaatcaatcctcgaaaacacactattcattgacctaggagacatgacattgatatgcatgaccttttgaactctatgtaaaaggtaa 19161877  T
Q  108 acaacctga--tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttg 205  Q
     || |||    || ||  ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||  |||    
T  19161876 gcagcctctagtgttacaaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttttcatgtttgcccacttttcttg 19161777  T
Q  206 acgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaag 241  Q
    |||||  |||||||| |   ||||||||| ||||||    
T  19161776 acgcagattttagggatgtatgtcctaccataaaag 19161741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 34814967 - 34814810
Alignment:
Q  55 acctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatgg 149  Q
    ||||| |||||||||||||   ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  | || ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  34814967 acctaagagacataacattgttatgcatgaccatttgaactctatgtagaaggtcaacagtctctggtgttaggaac-cgaaagtgtcgaaagcaaatgg 34814869  T
Q  150 aataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacg 208  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  34814868 tataaaagcatattgattgtcagaacacgctttctcatgtttgatcactttatttgacg 34814810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 20142875 - 20142755
Alignment:
Q  54 gacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatg 148  Q
    |||||||||||||| |||||   |||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||  | ||||||||||||| |||||    
T  20142875 gacctaggagacatgacattgttatgtatgaccttttgaactctatgtataaggtcaacaacctttgatgctagaaaaccaaaagtgtcaaaagaaaatg 20142776  T
Q  149 gaataaaagcatgttgattgt 169  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  20142775 gtataaaagcatgttgattgt 20142755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16352038 - 16351821
Alignment:
Q  10 ttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacattat---gtataaccatttggactctatgtagaaggtc 106  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| | ||||| ||||||| ||||| |   | || |||||||| |||||||||||||||||    
T  16352038 ttttttagatggcaaaaacaatcatcgtaaacataatattcatgtacctaagagacatgacattgttgtgcatgaccatttgaactctatgtagaaggtc 16351939  T
Q  107 aacaac--ctgatgctaggaagtc---gaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttg 201  Q
    ||||||  |||||| ||   || |    ||| |||||||||||||    ||||||  ||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  16351938 aacaacctctgatgataaagagccaaacaaaatgtcaaaagcaaacaatataaaattatgttgattgtgagaacacattttctcatgtttgaccactttg 16351839  T
Q  202 tttgacgcaacttttagg 219  Q
     ||||| |||||||||||    
T  16351838 cttgacacaacttttagg 16351821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 220
Target Start/End: Original strand, 2888518 - 2888644
Alignment:
Q  96 tgtagaaggtcaacaacctgatgc--taggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttgg 193  Q
    |||||||||||||||||||  ||   ||||||| | ||||||||| || | ||||| |||||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||||     
T  2888518 tgtagaaggtcaacaacctcttgtgttaggaagccaaaagtgtcataaacgaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgt 2888617  T
Q  194 ccactttgtttgacgcaacttttaggg 220  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||    
T  2888618 ccactttgctagacgcaacttttaggg 2888644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 150
Target Start/End: Original strand, 13413265 - 13413409
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataaca---ttatgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    |||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||   ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  13413265 tttttggatggcaaaaccaattctcataaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtca 13413364  T
Q  108 acaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatgga 150  Q
    ||| |  ||| |||| | ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  13413365 acagcctctgctgcttgaaaaccgaaagtgtcaaaaacaaatgga 13413409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 217
Target Start/End: Original strand, 29808071 - 29808199
Alignment:
Q  90 actctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcat 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  | | ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||  || ||||||    
T  29808071 actctatgtaaaaggtcaacaacctccgatgctaggaaataaataatgtgaaaagcaaatggtataaaa-catgttgattgttataacacgctgtctcat 29808169  T
Q  188 gtttggccactttgtttgacgcaactttta 217  Q
    ||||||  |||||  |||| ||||||||||    
T  29808170 gtttggtgactttacttgaggcaactttta 29808199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1296098 - 1296031
Alignment:
Q  151 ataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttag 218  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1296098 ataaaaacatgtttattgtcagaacatattttctcatgtttggccattttgtttgacgcagcttttag 1296031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 15515349 - 15515286
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagac 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||   |||||||||||||    
T  15515349 cgctagacttttttggatggcaaaaccaatcctcgtgaacacaacattggtggacctaggagac 15515286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 8036679 - 8036569
Alignment:
Q  9 cttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt-----atgtataaccatttggactctatgtagaag 103  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||  ||  ||||||||||||||||| |||||     ||| |||| | |||| |||||||||| |||    
T  8036679 cttttttgaatgacaaaatcaatcattgtaaagacaatatctacggacctaggagacatgacattgatatatgcataaacctttgaactctatgtaaaag 8036580  T
Q  104 gtcaacaacct 114  Q
    |||||||||||    
T  8036579 gtcaacaacct 8036569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 11921406 - 11921301
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacattatgtataaccatttggactctatgtaga 101  Q
    |||||||  |||||||||||| |||  |||| | ||||||||| |||||| |||||||| ||| |||| |||    |||||| |||| ||||||||||||    
T  11921406 cgctagatctttttggatggcgaaactaatcctagtaaacacaacattcatggacctagaagatataaaattg---ataaccctttgaactctatgtaga 11921310  T
Q  102 aggtcaaca 110  Q
    |||||||||    
T  11921309 aggtcaaca 11921301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20142755 - 20142669
Alignment:
Q  184 tcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaa 270  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||   |||| | ||| |||||||| ||||||    
T  20142755 tcatgtttggccactttgcttgacgaagcttttagagctgcctgtcctacggtaaaaggtacgacacctaatcccacaagtggtgaa 20142669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 32029202 - 32029098
Alignment:
Q  85 tttggactctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaacttt 182  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  || | | |||||  ||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||  ||||| || ||    
T  32029202 tttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctgaagttgggaagctgaaagtgtcaaaaacaaatgatatgaaagcatgttgattgtctgaacacacatt 32029103  T
Q  183 ctcat 187  Q
    |||||    
T  32029102 ctcat 32029098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 73
Target Start/End: Original strand, 27494219 - 27494287
Alignment:
Q  5 tagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt 73  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  27494219 tagacctttttggatggcaaaaccaatattcgtaaacacaatattcatagacttaggagacataacatt 27494287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 10579857 - 10579803
Alignment:
Q  121 aggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaac 175  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  10579857 aggaagccaaaagtgtcaaacgcaaatggtataaaggcatgttgatggttagaac 10579803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 26407896 - 26407847
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattca 51  Q
    ||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26407896 cgctaaacattttaggatagcaaaatcaatcatcgtaaacacaacattca 26407847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 43
Target Start/End: Original strand, 42122722 - 42122763
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacac 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  42122722 cgctagacttttttggatggcaaaaccagtcctcgtaaacac 42122763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 2886731 - 2886632
Alignment:
Q  85 tttggactctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaacttt 182  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||| |||  |||||| ||||  ||||| | |||||| ||||||  |||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  2886731 tttgaactctatgtaaaagatcaacagcctctgatgcttggaaaccgaaaatatcaaaaacaaatgatataaaaacatgttgattgtcagaacacacttt 2886632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 272
Target Start/End: Original strand, 6283 - 6513
Alignment:
Q  46 cattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaa 140  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||   ||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||   ||||||||||||    
T  6283 cattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaaactgaaagtgtcaaa 6382  T
Q  141 agcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaa 240  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  6383 agcaaatggtatagaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttacttgacgcaacttttagggctgtctgtcctacggtaaaa 6482  T
Q  241 gcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    |  ||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  6483 ggtccgac-cctaatcccacaagtggtgaaac 6513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Original strand, 103011 - 103254
Alignment:
Q  2 cgctagacttttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataaca---ttatgtataaccatttggactctatgt 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||   ||||| || ||| ||||  ||| ||||    
T  103011 cgctagacctttttggatggcaaaaccaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacacgacattgttatgcatgaccttttgagctcgatgt 103110  T
Q  99 agaaggtcaacaac--ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggcca 196  Q
    |||||||||||| |  ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||||||||||    
T  103111 agaaggtcaacagcctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcag-acacgctttctcgtgtttggcca 103209  T
Q  197 ctttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaag 241  Q
      ||  |||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  103210 tcttacttgacgcagctttgagggctgcctgtcctacggtaaaag 103254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Original strand, 33164 - 33429
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||||| |||   ||| || ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  33164 tttttggatgacaaaatcaatcctcgtaaacacgacgttcatggacctaggagacataaaattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtca 33263  T
Q  108 acaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttg 205  Q
    |||||||  | || ||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  33264 acaacctctggtgttaggaaaccgaaaatgtcaaaagtaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttagccactttgcttg 33363  T
Q  206 acgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    | || || |||| || | ||||||||||||||||||  ||||| | ||| |||| ||| ||||||||    
T  33364 atgccac-tttaaggttgcctgtcctaccgtaaaaggcccgacacctaatcccataagtggtgaaac 33429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1768 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1768
Description:

Target: scaffold1768; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 377 - 111
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacatt---atgtataaccatttggactctatgtagaaggtca 107  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | ||||  || ||||||||||| |||||   |||||| ||  |||| ||| |||| |||||||||    
T  377 tttttggatggcaaaactaatcctcgtaaacacaacgttcatcgatctaggagacatgacattgctatgtatgactttttgaactttatgcagaaggtca 278  T
Q  108 acaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttg 205  Q
    |||||||  | | |||| ||  | |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| || | |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  277 acaacctttggtactagaaaaccaaaagtgtcaaacacaaatggtataaaagcatgttgatggtcataacccactgtctcatgtttggccactttgcttg 178  T
Q  206 acgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    |||||  |||||||||| |||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  177 acgcagtttttagggctgcctgtcctacagtaaaaggcccgacacttaatcccacaagtggtgaaac 111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 222
Target Start/End: Original strand, 49442 - 49541
Alignment:
Q  123 gaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggct 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49442 gaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcacgttgattgtcagaacacgatttctcacatttgaccactttgtttgatgcaacttttagggct 49541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0470 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0470
Description:

Target: scaffold0470; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 7517 - 7727
Alignment:
Q  11 tttttggatggcaaaatcaatcatcgtaaacacagcattcacggacctaggagacataacattatgt--ataaccatttggactctatgtagaaggtcaa 108  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |  || ||| |||| || ||||| | ||||||||    
T  7517 tttttggatgacaaaaccaatactcgtaaacataacattcatggacctatgagacatgacattatatgcatgaccttttgaacgctatgcaaaaggtcaa 7616  T
Q  109 caacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttga 206  Q
    ||| ||  |  ||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||  | ||| | |||||    
T  7617 caatctctggagctaggaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtttaaaatcatgttgattgtgagaacacgctttctcatgtttaactactctatttga 7716  T
Q  207 cgcaactttta 217  Q
    |||||||||||    
T  7717 cgcaactttta 7727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 98 - 272
Target Start/End: Original strand, 10364 - 10544
Alignment:
Q  98 tagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgtt----agaacaaactttctcatgttt 191  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    ||||||  | || ||||||||    
T  10364 tagaaggtcaacaacctctggtgctaggaagccacaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgcattatcatgttt 10463  T
Q  192 ggccactttgtttgacgcaacttttagggctacctgtcctaccgtaaaagcaccgactcttaaacccacaaggggtgaaac 272  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| || || | ||| ||||| || ||||||||    
T  10464 ggccattttacttgacgcaacttttagggctgcttgtccaactgtaaaagccccaacccctaatcccacgagtggtgaaac 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 47618 - 47497
Alignment:
Q  120 taggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagg 219  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||| | ||| |||||| | ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  47618 taggaaatcgaaagtgttaaaagcaaatggtataaaaatatgttaactgtcagaacacattttctcatgtttggccattttacttgacgcaacttttagg 47519  T
Q  220 gctacctgtcctaccgtaaaag 241  Q
      ||  ||||||||||||||||    
T  47518 tttatttgtcctaccgtaaaag 47497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 90 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18475 - 18344
Alignment:
Q  90 actctatgtagaaggtcaacaacctga--tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcat 187  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||    |||| |||| || ||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  18475 actctatgtagaaggttaacaatctctactgcttggaaatcaaaagtgtcaaaagcagatgacataaaaacatgttgattgtgagaacacg-tttctcat 18377  T
Q  188 gtttggccactttgtttgacgcaacttttaggg 220  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  18376 gtttggccgctttgtttgatgcaacttttaggg 18344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 218
Target Start/End: Original strand, 16193 - 16260
Alignment:
Q  151 ataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttag 218  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16193 ataaaaacatgtttattgtcagaacatgttttctcatgtttggccattttgtttgacgcagcttttag 16260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0493 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0493
Description:

Target: scaffold0493; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8598 - 8525
Alignment:
Q  117 tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtt 190  Q
    |||||||||  | ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  8598 tgctaggaaaccaaaagtgttaaacgcaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacatgttttctcatgtt 8525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University