View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10260_high_16 (Length: 316)

Name: NF10260_high_16
Description: NF10260
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10260_high_16
NF10260_high_16
[»] chr6 (56 HSPs)
chr6 (5-316)||(27283380-27283692)
chr6 (3-316)||(27209768-27210083)
chr6 (3-316)||(27239145-27239460)
chr6 (3-316)||(26792684-26792996)
chr6 (7-316)||(26927621-26927935)
chr6 (43-316)||(27492007-27492280)
chr6 (3-316)||(29508289-29508605)
chr6 (3-316)||(13517208-13517525)
chr6 (3-316)||(29556424-29556741)
chr6 (30-316)||(29579902-29580188)
chr6 (3-309)||(24298778-24299084)
chr6 (3-309)||(22927868-22928178)
chr6 (3-309)||(27026018-27026325)
chr6 (3-316)||(27201065-27201380)
chr6 (3-316)||(27247853-27248168)
chr6 (3-316)||(28167362-28167679)
chr6 (7-316)||(16937025-16937337)
chr6 (4-316)||(33369441-33369761)
chr6 (3-316)||(27014592-27014907)
chr6 (37-316)||(30551032-30551311)
chr6 (47-316)||(4532162-4532431)
chr6 (3-316)||(16681027-16681343)
chr6 (3-309)||(13291960-13292268)
chr6 (7-316)||(16756690-16757000)
chr6 (3-316)||(26109415-26109732)
chr6 (3-316)||(26665652-26665968)
chr6 (3-316)||(26771623-26771939)
chr6 (3-309)||(15405546-15405854)
chr6 (3-309)||(15417333-15417641)
chr6 (3-316)||(4538773-4539090)
chr6 (3-316)||(20131382-20131692)
chr6 (3-316)||(22201178-22201488)
chr6 (3-316)||(28214336-28214653)
chr6 (2-316)||(4779779-4780093)
chr6 (45-316)||(27355141-27355414)
chr6 (44-309)||(24870584-24870848)
chr6 (3-316)||(8898688-8899008)
chr6 (3-309)||(27031897-27032205)
chr6 (3-298)||(20175442-20175733)
chr6 (3-298)||(22160258-22160549)
chr6 (3-316)||(14138421-14138732)
chr6 (70-316)||(27064369-27064605)
chr6 (2-316)||(4764630-4764936)
chr6 (3-132)||(34457559-34457690)
chr6 (198-316)||(34457699-34457817)
chr6 (2-155)||(27622486-27622643)
chr6 (2-127)||(4755699-4755824)
chr6 (3-53)||(27621993-27622043)
chr6 (184-316)||(27622905-27623038)
chr6 (9-55)||(27622050-27622096)
chr6 (3-74)||(27064630-27064702)
chr6 (3-55)||(27622153-27622205)
chr6 (3-55)||(27622372-27622424)
chr6 (1-53)||(27622099-27622152)
chr6 (2-53)||(27622267-27622319)
chr6 (3-53)||(27622320-27622371)
[»] chr3 (69 HSPs)
chr3 (3-316)||(16617580-16617894)
chr3 (6-316)||(22041263-22041574)
chr3 (3-316)||(35887593-35887905)
chr3 (3-316)||(18249572-18249886)
chr3 (3-316)||(16423040-16423353)
chr3 (3-316)||(11103474-11103789)
chr3 (3-311)||(5658972-5659282)
chr3 (3-316)||(5602402-5602718)
chr3 (3-316)||(29141864-29142181)
chr3 (3-316)||(4339790-4340104)
chr3 (3-316)||(21681574-21681890)
chr3 (3-316)||(19701250-19701565)
chr3 (3-316)||(20072867-20073184)
chr3 (3-316)||(48472764-48473081)
chr3 (3-316)||(28109052-28109368)
chr3 (3-316)||(31029353-31029671)
chr3 (3-316)||(16599467-16599782)
chr3 (3-316)||(20569946-20570261)
chr3 (3-309)||(22380693-22381000)
chr3 (3-316)||(31957547-31957861)
chr3 (3-316)||(17978041-17978356)
chr3 (3-309)||(18337464-18337768)
chr3 (3-316)||(35221713-35222024)
chr3 (7-316)||(8282579-8282887)
chr3 (3-316)||(22863954-22864269)
chr3 (3-316)||(22879013-22879328)
chr3 (3-316)||(51788876-51789191)
chr3 (70-316)||(4789812-4790058)
chr3 (3-316)||(18232046-18232360)
chr3 (1-316)||(24335030-24335346)
chr3 (3-310)||(4423756-4424066)
chr3 (3-316)||(4630613-4630930)
chr3 (3-316)||(18285467-18285784)
chr3 (70-316)||(8218479-8218725)
chr3 (3-310)||(7080089-7080398)
chr3 (3-316)||(17969967-17970285)
chr3 (3-316)||(18300767-18301085)
chr3 (3-309)||(18058108-18058416)
chr3 (48-316)||(28346025-28346293)
chr3 (3-316)||(32297485-32297803)
chr3 (70-309)||(15885898-15886137)
chr3 (45-316)||(16403924-16404197)
chr3 (3-309)||(4690515-4690829)
chr3 (3-316)||(5020565-5020887)
chr3 (30-309)||(15734256-15734536)
chr3 (3-316)||(32445984-32446301)
chr3 (3-309)||(4728466-4728772)
chr3 (3-316)||(10649924-10650237)
chr3 (3-316)||(28028125-28028443)
chr3 (3-309)||(6208735-6209041)
chr3 (3-316)||(5473821-5474125)
chr3 (3-316)||(15368099-15368408)
chr3 (3-316)||(6535834-6536148)
chr3 (141-316)||(10403006-10403181)
chr3 (197-316)||(5589642-5589761)
chr3 (3-132)||(5718036-5718167)
chr3 (3-132)||(5728946-5729077)
chr3 (3-132)||(5763291-5763422)
chr3 (198-316)||(5717909-5718027)
chr3 (198-316)||(5728819-5728937)
chr3 (198-316)||(5763431-5763549)
chr3 (198-316)||(29658254-29658372)
chr3 (198-316)||(47030310-47030428)
chr3 (3-132)||(29658115-29658245)
chr3 (7-134)||(5589510-5589638)
chr3 (46-132)||(47030437-47030524)
chr3 (3-68)||(8218747-8218813)
chr3 (5-74)||(9526981-9527051)
chr3 (3-68)||(10403195-10403261)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (3-316)||(25207187-25207501)
chr5 (3-316)||(25271343-25271657)
chr5 (3-316)||(22895305-22895621)
chr5 (3-316)||(28952745-28953059)
chr5 (7-316)||(33784360-33784671)
chr5 (3-316)||(18121381-18121697)
chr5 (3-316)||(6881190-6881505)
chr5 (3-316)||(43085144-43085460)
chr5 (3-316)||(23898774-23899088)
chr5 (3-316)||(34623396-34623710)
chr5 (3-316)||(37761871-37762185)
chr5 (3-316)||(2517942-2518256)
chr5 (3-316)||(9543675-9543992)
chr5 (3-316)||(8658443-8658757)
chr5 (7-316)||(23727115-23727427)
chr5 (3-316)||(37664454-37664768)
chr5 (3-316)||(11556232-11556545)
chr5 (3-316)||(18493717-18494032)
chr5 (30-309)||(24976729-24977008)
chr5 (3-316)||(33882003-33882320)
chr5 (3-316)||(18368476-18368794)
chr5 (37-316)||(33523281-33523560)
chr5 (70-316)||(13179834-13180080)
chr5 (37-316)||(15651744-15652025)
chr5 (3-316)||(23632848-23633162)
chr5 (3-316)||(30175365-30175679)
chr5 (3-316)||(24730846-24731162)
chr5 (43-316)||(31819412-31819685)
chr5 (1-316)||(30158917-30159233)
chr5 (37-316)||(15751843-15752122)
chr5 (3-316)||(33299414-33299736)
chr5 (3-316)||(28656142-28656460)
chr5 (3-316)||(32589224-32589539)
chr5 (3-316)||(30036323-30036637)
chr5 (3-316)||(31438334-31438648)
chr5 (3-316)||(3796430-3796746)
chr5 (3-316)||(37745297-37745613)
chr5 (30-316)||(13435642-13435933)
chr5 (7-309)||(30941515-30941819)
chr5 (7-309)||(24609130-24609433)
chr5 (3-316)||(13317776-13318090)
chr5 (3-309)||(22992091-22992397)
chr5 (3-310)||(37351611-37351922)
chr5 (3-316)||(26487271-26487585)
chr5 (3-316)||(9324361-9324675)
chr5 (3-316)||(12139059-12139373)
chr5 (2-316)||(41681584-41681897)
chr5 (197-316)||(5644697-5644816)
chr5 (3-132)||(40466555-40466686)
chr5 (202-316)||(11330531-11330645)
chr5 (198-316)||(40466695-40466813)
chr5 (3-134)||(5644820-5644952)
chr5 (3-145)||(11330640-11330785)
chr5 (184-316)||(13178630-13178763)
[»] chr4 (31 HSPs)
chr4 (3-316)||(54840292-54840605)
chr4 (3-316)||(5701430-5701745)
chr4 (3-316)||(24585420-24585734)
chr4 (3-316)||(14105445-14105759)
chr4 (3-316)||(36323387-36323701)
chr4 (3-316)||(36337596-36337910)
chr4 (3-316)||(15234721-15235034)
chr4 (3-308)||(40098682-40098989)
chr4 (3-316)||(14752564-14752880)
chr4 (3-316)||(18793689-18794007)
chr4 (3-316)||(30760665-30760980)
chr4 (37-316)||(31119595-31119874)
chr4 (3-316)||(33666850-33667165)
chr4 (3-316)||(39857516-39857831)
chr4 (7-309)||(14671899-14672204)
chr4 (37-316)||(21976605-21976884)
chr4 (2-316)||(24119543-24119860)
chr4 (3-316)||(6576738-6577058)
chr4 (3-310)||(34182007-34182315)
chr4 (70-316)||(24814419-24814665)
chr4 (3-316)||(5012783-5013098)
chr4 (3-214)||(1907228-1907440)
chr4 (3-316)||(15275683-15275989)
chr4 (3-309)||(17019938-17020235)
chr4 (3-316)||(15379295-15379601)
chr4 (141-316)||(27156516-27156690)
chr4 (198-316)||(20331681-20331799)
chr4 (3-132)||(20331541-20331672)
chr4 (257-316)||(1907170-1907229)
chr4 (184-316)||(24813628-24813761)
chr4 (30-98)||(15399377-15399449)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (3-316)||(21696227-21696540)
chr2 (3-316)||(37678936-37679250)
chr2 (3-316)||(37694201-37694515)
chr2 (3-316)||(34267959-34268274)
chr2 (3-316)||(37932267-37932579)
chr2 (3-316)||(34298039-34298354)
chr2 (1-316)||(37384545-37384862)
chr2 (3-316)||(39896959-39897273)
chr2 (3-316)||(27123390-27123706)
chr2 (3-316)||(34161731-34162047)
chr2 (3-316)||(253689-254004)
chr2 (37-316)||(16822411-16822690)
chr2 (37-316)||(16898790-16899069)
chr2 (37-316)||(32056642-32056921)
chr2 (3-316)||(19409522-19409836)
chr2 (3-316)||(21670211-21670525)
chr2 (3-316)||(12709660-12709976)
chr2 (3-316)||(3789333-3789648)
chr2 (3-316)||(34868524-34868839)
chr2 (3-316)||(22921182-22921496)
chr2 (3-316)||(40240413-40240730)
chr2 (3-316)||(31883161-31883475)
chr2 (43-316)||(13929688-13929963)
chr2 (43-306)||(23117675-23117938)
chr2 (3-309)||(28889130-28889436)
chr2 (30-309)||(12662367-12662646)
chr2 (3-316)||(12593704-12594021)
chr2 (70-316)||(27427578-27427824)
chr2 (1-316)||(37944900-37945217)
chr2 (70-309)||(20844791-20845030)
chr2 (3-316)||(11628223-11628537)
chr2 (45-316)||(31867892-31868160)
chr2 (3-316)||(27397226-27397532)
chr2 (3-316)||(19449455-19449763)
chr2 (3-132)||(9343081-9343212)
chr2 (3-132)||(16168495-16168626)
chr2 (3-132)||(27783240-27783371)
chr2 (3-132)||(27810720-27810851)
chr2 (198-316)||(16168368-16168486)
chr2 (198-316)||(27783113-27783231)
chr2 (198-316)||(39045116-39045234)
chr2 (198-316)||(9343221-9343339)
chr2 (198-316)||(27810593-27810711)
chr2 (3-132)||(39044975-39045106)
chr2 (184-316)||(3790534-3790667)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (3-316)||(26678037-26678351)
chr7 (7-316)||(16048202-16048511)
chr7 (3-316)||(26662845-26663159)
chr7 (7-316)||(26508644-26508955)
chr7 (3-316)||(26596545-26596859)
chr7 (3-316)||(2780112-2780428)
chr7 (7-316)||(11417740-11418049)
chr7 (3-316)||(16442937-16443251)
chr7 (3-316)||(5154952-5155264)
chr7 (3-316)||(5165253-5165565)
chr7 (3-316)||(31557334-31557651)
chr7 (3-311)||(2161445-2161755)
chr7 (3-316)||(26442133-26442447)
chr7 (3-309)||(10909877-10910189)
chr7 (30-309)||(16511404-16511688)
chr7 (3-316)||(26519696-26520010)
chr7 (3-316)||(45738169-45738489)
chr7 (3-316)||(5140267-5140584)
chr7 (43-316)||(31130785-31131058)
chr7 (3-316)||(45394108-45394421)
chr7 (3-316)||(11447777-11448092)
chr7 (3-316)||(22148756-22149071)
chr7 (3-316)||(24585467-24585782)
chr7 (3-316)||(31083555-31083870)
chr7 (43-316)||(4206264-4206539)
chr7 (3-316)||(26312796-26313110)
chr7 (157-316)||(10848474-10848633)
chr7 (198-316)||(39206293-39206411)
chr7 (2-132)||(16744508-16744640)
chr7 (198-316)||(4138374-4138492)
chr7 (2-132)||(4138233-4138365)
chr7 (198-316)||(16744649-16744767)
chr7 (3-132)||(39206153-39206284)
chr7 (45-103)||(10848680-10848738)
chr7 (184-316)||(3452119-3452252)
chr7 (203-316)||(26268219-26268333)
chr7 (3-67)||(26267896-26267961)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (3-316)||(12908-13225)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (3-316)||(20333465-20333780)
chr1 (7-316)||(51645116-51645427)
chr1 (3-316)||(14691968-14692280)
chr1 (3-316)||(14694650-14694962)
chr1 (3-316)||(14697334-14697646)
chr1 (3-316)||(14700015-14700327)
chr1 (3-316)||(20467679-20467998)
chr1 (3-316)||(28591975-28592291)
chr1 (3-316)||(16201078-16201394)
chr1 (3-316)||(10969537-10969852)
chr1 (3-316)||(41786384-41786698)
chr1 (3-316)||(28156599-28156915)
chr1 (3-316)||(10951986-10952301)
chr1 (30-309)||(21890827-21891106)
chr1 (3-316)||(3648041-3648363)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (30-316)||(21341226-21341512)
chr8 (3-316)||(9361498-9361815)
chr8 (3-316)||(44567876-44568191)
chr8 (7-309)||(19910198-19910502)
chr8 (7-316)||(16260808-16261119)
chr8 (3-316)||(18716351-18716668)
chr8 (3-316)||(19681351-19681666)
chr8 (7-309)||(27601946-27602248)
chr8 (3-311)||(15774449-15774760)
chr8 (3-316)||(29836218-29836534)
chr8 (3-309)||(2130296-2130603)
chr8 (3-316)||(12085738-12086055)
chr8 (70-316)||(22139784-22140030)
chr8 (5-316)||(31482888-31483198)
chr8 (7-309)||(19694993-19695299)
chr8 (3-316)||(31361424-31361739)
chr8 (7-309)||(33249240-33249547)
chr8 (3-309)||(14570032-14570340)
chr8 (3-316)||(33265615-33265937)
chr8 (3-313)||(19654350-19654665)
chr8 (70-316)||(18797579-18797825)
chr8 (3-296)||(22388891-22389190)
chr8 (143-316)||(22074081-22074254)
chr8 (3-132)||(28355021-28355152)
chr8 (198-316)||(19201592-19201710)
chr8 (198-316)||(28355161-28355279)
chr8 (3-132)||(19201452-19201583)
chr8 (184-316)||(15775349-15775482)
chr8 (3-103)||(22073948-22074048)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (3-316)||(7991-8305)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (3-316)||(10811-11127)
scaffold0143 (3-309)||(34172-34484)
[»] scaffold0685 (1 HSPs)
scaffold0685 (43-303)||(1154-1414)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (3-316)||(2226-2541)
scaffold0159 (3-302)||(23646-23948)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (3-309)||(3661-3972)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (3-316)||(14834-15151)
[»] scaffold0322 (3 HSPs)
scaffold0322 (7-313)||(12947-13258)
scaffold0322 (198-316)||(2549-2667)
scaffold0322 (3-132)||(2676-2807)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (30-309)||(24047-24330)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (3-316)||(16468-16788)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (3-309)||(8707-9017)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (3-302)||(13022-13325)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (3-316)||(28185-28491)
[»] scaffold0241 (2 HSPs)
scaffold0241 (157-316)||(25774-25933)
scaffold0241 (3-101)||(25627-25725)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (70-309)||(39725-39973)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (203-316)||(665-778)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (7-161)||(6850-7005)
[»] scaffold0748 (11 HSPs)
scaffold0748 (3-55)||(1298-1350)
scaffold0748 (1-53)||(1353-1405)
scaffold0748 (3-55)||(1406-1458)
scaffold0748 (1-53)||(1461-1513)
scaffold0748 (3-55)||(1514-1566)
scaffold0748 (1-53)||(1569-1621)
scaffold0748 (3-55)||(1622-1674)
scaffold0748 (1-53)||(1677-1729)
scaffold0748 (3-55)||(1730-1782)
scaffold0748 (3-53)||(1247-1297)
scaffold0748 (1-41)||(1785-1825)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 56)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Original strand, 27283380 - 27283692
Alignment:
Q  5 tacaagctgttcttggatc-gaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgac 103  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  |||||| ||||  | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27283380 tacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattagttttttgacaaaatatagattgagattgacttgac 27283479  T
Q  104 gtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgaca 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||||  ||||||    
T  27283480 gtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattgactcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagattgatgttgaca 27283579  T
Q  204 ttggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgact 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27283580 ttggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgact 27283679  T
Q  304 gttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||    
T  27283680 gttggcagtttgt 27283692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27210083 - 27209768
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-gacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  27210083 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattagtttttttgacaaaatatagattgaaactgactt 27209984  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||  |||    
T  27209983 gacgtcgattcaatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcataaggttttgacagagaacatgacataagtattgaattgagactgatgttg 27209884  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27209883 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 27209784  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  27209783 actgttggcagtttgt 27209768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 27239145 - 27239460
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt-tgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  27239145 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattagtttttttgacaaaatatagattgaaactgactt 27239244  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||  |||    
T  27239245 gacgtcgattcaatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcataaggttttgacagagaacatgacataagtattgaattgagactgatgttg 27239344  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27239345 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 27239444  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  27239445 actgttggcagtttgt 27239460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26792996 - 26792684
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  | |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792996 ggtacaagctgttcttggacttgaactagtcacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgg--ttttgacaaaatatagattgagattgacttg 26792899  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  26792898 acgtcgattcgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggcttacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 26792799  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26792798 cattggaaatgcaatattcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 26792699  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  26792698 ctgttggcagtttgt 26792684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26927935 - 26927621
Alignment:
Q  7 caagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgg-----gtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26927935 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattggtttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttg 26927836  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||     
T  26927835 acgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgt 26927736  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26927735 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 26927636  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  26927635 ctgttggcagtttgt 26927621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 43 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27492280 - 27492007
Alignment:
Q  43 acagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacat 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  27492280 acagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattat 27492181  T
Q  143 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttat 242  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||  |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27492180 tggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcat 27492081  T
Q  243 taaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27492080 taaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgt 27492007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29508605 - 29508289
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt--tttgacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29508605 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgact 29508506  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  ||    
T  29508505 tgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgtt 29508406  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  29508405 gacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcataattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 29508306  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||| |||||    
T  29508305 gactgttggcattttgt 29508289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 13517208 - 13517525
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt---tgacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  13517208 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgac 13517307  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| || |  || ||| ||  |||| |||||| ||| ||    
T  13517308 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgagactgatat 13517407  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13517408 tgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 13517507  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13517508 tgactgttggcagtttgt 13517525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29556741 - 29556424
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt---tgacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  29556741 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgac 29556642  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    ||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |    
T  29556641 ttgacatcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgt 29556542  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29556541 tgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 29556442  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29556441 tgactgttggcagtttgt 29556424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29580188 - 29579902
Alignment:
Q  30 gccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaat 129  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  29580188 gccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatacagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaat 29580089  T
Q  130 tgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgat 229  Q
    ||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29580088 tgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgat 29579989  T
Q  230 ataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29579988 ataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgt 29579902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Original strand, 24298778 - 24299084
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24298778 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacaaattcacaggggattag--ttttgacaaaatatagattgagattgacttg 24298875  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagc-attgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| ||  ||||| |||||| ||| ||||    
T  24298876 acgtcggtttgatttgaaaggtagaaattaaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagttattgagttgagactgatattg 24298975  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  24298976 acattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 24299075  T
Q  301 actgttggc 309  Q
    |||||||||    
T  24299076 actgttggc 24299084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Original strand, 22927868 - 22928178
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttg---acaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    ||||||||||| |||| ||||||    
T  22927868 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttacaaaatataggttgaaattgac 22927967  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |    
T  22927968 ttgatgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgt 22928067  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  22928068 tgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtgatgca 22928167  T
Q  299 tgactgttggc 309  Q
    |||||||||||    
T  22928168 tgactgttggc 22928178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27026325 - 27026018
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27026325 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttttttgacaaaatataggttgaaattgacttg 27026226  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| | |  ||||    
T  27026225 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactaatgttga 27026126  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27026125 cattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatga 27026026  T
Q  302 ctgttggc 309  Q
    ||||||||    
T  27026025 ctgttggc 27026018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27201380 - 27201065
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-gacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  27201380 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcaccggggattggtttttttgacaaaatatagattgagattgacct 27201281  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||    
T  27201280 gacatcgatttgatttgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttg 27201181  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27201180 acattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 27201081  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||| |||||    
T  27201080 actgttggcattttgt 27201065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 27247853 - 27248168
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt-tgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  27247853 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcaccggggattggtttttttgacaaaatatagattgagattgacct 27247952  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||    
T  27247953 gacatcgatttgatttgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttg 27248052  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27248053 acattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 27248152  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||| |||||    
T  27248153 actgttggcattttgt 27248168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28167679 - 28167362
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt---gacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  28167679 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactagggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgac 28167580  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |    
T  28167579 ttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgt 28167480  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28167479 tgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 28167380  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||| |||||    
T  28167379 tgactgttggcattttgt 28167362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Original strand, 16937025 - 16937337
Alignment:
Q  7 caagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt---tgacaaaatatagattgagattgacttgac 103  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16937025 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgacttgac 16937124  T
Q  104 gtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgaca 203  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||||    
T  16937125 atcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgaca 16937224  T
Q  204 ttggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgact 303  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16937225 ttggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgact 16937324  T
Q  304 gttggcagtttgt 316  Q
    ||||||| |||||    
T  16937325 gttggcattttgt 16937337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 316
Target Start/End: Original strand, 33369441 - 33369761
Alignment:
Q  4 gtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt-------tgacaaaatatagattgagatt 95  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||||    
T  33369441 gtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttttttgacaaaatatagattgagatt 33369540  T
Q  96 gacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattga 195  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||    
T  33369541 gacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga 33369640  T
Q  196 aattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaat 295  Q
      |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  33369641 tgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaat 33369740  T
Q  296 gcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33369741 gcatgactgttggcagtttgt 33369761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27014907 - 27014592
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt--tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||| |||||||| || |  |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27014907 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcacgggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgactt 27014808  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||    
T  27014807 aacgtcgattcgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttg 27014708  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27014707 acattggaaatgcagtatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 27014608  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||| |||||    
T  27014607 actgttggcattttgt 27014592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 37 - 316
Target Start/End: Original strand, 30551032 - 30551311
Alignment:
Q  37 gaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 136  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||  |    
T  30551032 gaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagataaaaattgactga 30551131  T
Q  137 taacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacag 236  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  30551132 tattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaa 30551231  T
Q  237 ttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  30551232 tttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgt 30551311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 47 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4532431 - 4532162
Alignment:
Q  47 aaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggc 146  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  4532431 aaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggc 4532332  T
Q  147 tcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaa 246  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||| ||  |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  4532331 tcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtgttgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaa 4532232  T
Q  247 tgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    || ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  4532231 tgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgt 4532162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16681343 - 16681027
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt--tttgacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16681343 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgact 16681244  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    |||| |||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   || || || || || |||||| |||  ||    
T  16681243 tgacatcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgatatgagtatcgaattgagactgatgtt 16681144  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16681143 gacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 16681044  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||| |||||    
T  16681043 gactgttggcattttgt 16681027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Original strand, 13291960 - 13292268
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt-tgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13291960 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgactt 13292059  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  |||    
T  13292060 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaacattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatgttg 13292159  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13292160 acattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatg 13292259  T
Q  301 actgttggc 309  Q
    |||||||||    
T  13292260 actgttggc 13292268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16757000 - 16756690
Alignment:
Q  7 caagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgt 105  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16757000 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaagcagaaacagattcactggggattagtttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgt 16756901  T
Q  106 cgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacag-agaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacat 204  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||||| ||||  |||||| || ||||| |||||| |||  | |||||    
T  16756900 cgatttgatttgaaacgtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttt-gacaggagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgtcgacat 16756802  T
Q  205 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactg 304  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16756801 tggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactg 16756702  T
Q  305 ttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||    
T  16756701 ttggcagtttgt 16756690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 26109415 - 26109732
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt---gacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||    
T  26109415 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttgttctgacaaaatatagattgagattgac 26109514  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||  |||| |||||| |||  |    
T  26109515 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatgt 26109614  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  ||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26109615 tgacattgaaaatgcaatatgcacggatgatataacgatttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 26109714  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||| |||||    
T  26109715 tgactgttggcattttgt 26109732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 26665652 - 26665968
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt--gacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26665652 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacctgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttctgacaaaatatagattgagattgact 26665751  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||    
T  26665752 tgacgtcgatttgaattgaaagttagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgtt 26665851  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  26665852 gacgttggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtat 26665951  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||    
T  26665952 gactgttggcagtttgt 26665968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 26771623 - 26771939
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt--gacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26771623 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacctgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttctgacaaaatatagattgagattgact 26771722  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||    
T  26771723 tgacgtcgatttgaattgaaagttagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgtt 26771822  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  26771823 gacgttggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtat 26771922  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||    
T  26771923 gactgttggcagtttgt 26771939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Original strand, 15405546 - 15405854
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt-tgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  15405546 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgactt 15405645  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| ||   |||    
T  15405646 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgttgttg 15405745  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  15405746 atattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 15405845  T
Q  301 actgttggc 309  Q
    |||||||||    
T  15405846 actgttggc 15405854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Original strand, 15417333 - 15417641
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt-tgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  15417333 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgactt 15417432  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| ||   |||    
T  15417433 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgttgttg 15417532  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  15417533 atattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 15417632  T
Q  301 actgttggc 309  Q
    |||||||||    
T  15417633 actgttggc 15417641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 4538773 - 4539090
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt---tgacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  4538773 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaatatagattgagattgac 4538872  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||||||||||   |||  ||||| |||||||  ||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |    
T  4538873 ttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgattgatattattggatcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgt 4538972  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4538973 tgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 4539072  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||| |||||    
T  4539073 tgactgttggcattttgt 4539090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20131692 - 20131382
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaa-ttcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||| | ||||||||| | |||||||||||||      || |||||||| ||||||| ||||||||    
T  20131692 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgactaaacagaaacatagttcactggggatt------ttaacaaaatacagattgatattgactt 20131599  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt-gaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||  ||    
T  20131598 gacattgatttgatttgaaaggtagaaatttgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaacttgacataagcattgaattgagacagatgtt 20131499  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  20131498 gacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatggatgcttgaaatgcat 20131399  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    ||  ||||||| |||||    
T  20131398 gatggttggcaatttgt 20131382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 22201178 - 22201488
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaa-ttcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||| | ||||||||| | |||||||||||||      || |||||||| ||||||| ||||||||    
T  22201178 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgactaaacagaaacatagttcactggggatt------ttaacaaaatacagattgatattgactt 22201271  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt-gaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||  ||    
T  22201272 gacattgatttgatttgaaaggtagaaatttgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaacttgacataagcattgaattgagacagatgtt 22201371  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  22201372 gacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatggatgcttgaaatgcat 22201471  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    ||  ||||||| |||||    
T  22201472 gatggttggcaatttgt 22201488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28214653 - 28214336
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt---tgacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||   |||| ||| ||||||||||||||||    
T  28214653 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaacatagattgagattgac 28214554  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||||||||||   |||  ||||| |||||||  ||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |    
T  28214553 ttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgattgatattattggatcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgt 28214454  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28214453 tgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 28214354  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||| |||||    
T  28214353 tgactgttggcattttgt 28214336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4780093 - 4779779
Alignment:
Q  2 gggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    |||||||||||| |||||||| || |  | |||| ||||| || |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4780093 gggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattcaccggggattggtttgttgacaaaatatagattgaggttgacttg 4779994  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || || || |||||| |||  ||||    
T  4779993 acgtcgacttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtatcgaattgagactgatgttga 4779894  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  4779893 cattggaaatgcaatatgcacggatgatataacggtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 4779794  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||| |||||    
T  4779793 ctgttggcattttgt 4779779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 316
Target Start/End: Original strand, 27355141 - 27355414
Alignment:
Q  45 agaaacaaattcactggggattgggtttt--tgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacat 142  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||| |||  ||    
T  27355141 agaaacagattcactggggattagttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcaaaaattgaccgatattat 27355240  T
Q  143 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttat 242  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  27355241 tggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcat 27355340  T
Q  243 taaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27355341 taaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgt 27355414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24870848 - 24870584
Alignment:
Q  44 cagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacatt 143  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |  |||    
T  24870848 cagaaacagattcactggggattgt-tttttgacaaagtatagattgaaattgacttgacgttgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgacattatt 24870750  T
Q  144 ggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttatt 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  24870749 ggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcatt 24870650  T
Q  244 aaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggc 309  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24870649 aaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgctggc 24870584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 8898688 - 8899008
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt----gacaaaatatagattgagattga 97  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||    |||||||||||| ||||||||||    
T  8898688 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggttttttatttgacaaaatataggttgagattga 8898787  T
Q  98 cttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt--gaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattga 195  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||  |||  ||   ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||    
T  8898788 cttgacatcgatttggtttgaaaggtagaaattaagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga 8898887  T
Q  196 aattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaat 295  Q
      |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  8898888 tgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaat 8898987  T
Q  296 gcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  8898988 gcatgactgttggcattttgt 8899008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27032205 - 27031897
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-gacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | || |  |||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  27032205 ggtacaagctgttcttggacttgagctagccacttgaccgaacagaaacaaattcagaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgactt 27032106  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||    
T  27032105 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgagttgagactgatgttg 27032006  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  27032005 acattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatg 27031906  T
Q  301 actgttggc 309  Q
    |||||||||    
T  27031905 actgttggc 27031897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20175733 - 20175442
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaa-ttcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||       ||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  20175733 ggtacaagctgttcttggattgaactagccacttgaccaaacagaaacaaagttca-------ttgggattttaacaaaatacagattgaaattgacttg 20175641  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt--gaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    || | |||  |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||  |||||| ||||||| || |||    
T  20175640 acattgatctgatttggaaggtagaaattttgaccaataacattggctcacaaggctttgacagagaaattgtcatagacattgaattgagatagatatt 20175541  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  20175540 gacattgggaatgcaaaatgcatggatgatataatagttttattaaatgcatgggcacatagtatgcatgattatgcatgtacgaatgcttgaaatgca 20175442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 298
Target Start/End: Original strand, 22160258 - 22160549
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaa-ttcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||       ||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  22160258 ggtacaagctgttcttggattgaactagccacttgaccaaacagaaacaaagttca-------ttgggattttaacaaaatacagattgaaattgacttg 22160350  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt--gaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    || | |||  |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||  |||||| ||||||| || |||    
T  22160351 acattgatctgatttggaaggtagaaattttgaccaataacattggctcacaaggctttgacagagaaattgtcatagacattgaattgagatagatatt 22160450  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  22160451 gacattgggaatgcaaaatgcatggatgatataatagttttattaaatgcatgggcacatagtatgcatgattatgcatgtacgaatgcttgaaatgca 22160549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 14138421 - 14138732
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt-------tgacaaaatatagattgagat 94  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||    
T  14138421 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttttttgacaaaatatagattgagat 14138520  T
Q  95 tgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattg 194  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| ||    
T  14138521 tgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactg 14138620  T
Q  195 aaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaa 294  Q
    |  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||          ||||||||||||||| ||    
T  14138621 atgttgacattgaaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgc----------atgtatgaatgcttgtaa 14138710  T
Q  295 tgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  14138711 tgcatgactgttggcattttgt 14138732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27064605 - 27064369
Alignment:
Q  70 tttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatt 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  27064605 tttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaactgaaaggcagaaattgaccgataacattggctcacaaggttttgacagagaacc 27064506  T
Q  170 tgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatg 269  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  || |||||       
T  27064505 tgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcatgtaatatgc--- 27064409  T
Q  270 attatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
           ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27064408 -------atgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgt 27064369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4764936 - 4764630
Alignment:
Q  2 gggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt--tttgacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    |||||||||||| |||||||| || |  | |||| ||||| || |||||| ||| || ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764936 gggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgact 4764837  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  ||    
T  4764836 taacgtcgattcgaattgaaaggcagaaattgaccggtattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgtt 4764737  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    ||||||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||          ||||||||||||||| |||||||    
T  4764736 gacattgaaaatgcaatatacacggaggatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgc----------atgtatgaatgcttgtaatgcat 4764647  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||| |||||    
T  4764646 gactgttggcattttgt 4764630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Original strand, 34457559 - 34457690
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34457559 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 34457658  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34457659 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 34457690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 316
Target Start/End: Original strand, 34457699 - 34457817
Alignment:
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  34457699 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgc 34457798  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34457799 atgactgttggcagtttgt 34457817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 155
Target Start/End: Original strand, 27622486 - 27622643
Alignment:
Q  2 gggtacaagctgttctt-ggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcact-ggggattgggtt--tttgacaaaatatagattgagattga 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | ||||| ||||| ||  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| | |||    
T  27622486 gggtacaagctgttctttggatcgaacttgccacttgaccagaaagaaagaaattgacgaggggattggtttgttttgacaaaatatatattgaaagtga 27622585  T
Q  98 cttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagat 155  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27622586 cttgacgtcgatttaatttgaaaagtagaaattgaccaatattattggctcacaagat 27622643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 127
Target Start/End: Original strand, 4755699 - 4755824
Alignment:
Q  2 gggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    |||||||||||| |||||||| || |  | |||| ||||| || |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4755699 gggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattcaccggggattggtttgttgacaaaatatagattgaggttgacttg 4755798  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaa 127  Q
    ||||||| | || |||||||||||||    
T  4755799 acgtcgacttgaattgaaaggtagaa 4755824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Original strand, 27621993 - 27622043
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27621993 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccacttgaccacacagaaacaaa 27622043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 316
Target Start/End: Original strand, 27622905 - 27623038
Alignment:
Q  184 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataac-agttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtat 282  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||| | |||||| | ||  || |||||||||| ||| ||||||    
T  27622905 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtat 27623004  T
Q  283 gaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  27623005 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgt 27623038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 55
Target Start/End: Original strand, 27622050 - 27622096
Alignment:
Q  9 agctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaatt 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27622050 agctgttcttggatcgaacctgccactcgaccaaatagaaacaaatt 27622096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 27064702 - 27064630
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt 74  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27064702 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttt 27064630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 55
Target Start/End: Original strand, 27622153 - 27622205
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaatt 55  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  27622153 ggtacgagctgtccttggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaatt 27622205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 55
Target Start/End: Original strand, 27622372 - 27622424
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaatt 55  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  27622372 ggtacgagctgtccttggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaatt 27622424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 27622099 - 27622152
Alignment:
Q  1 tgggtacaagctgttctt-ggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaa 53  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  27622099 tgggtacaagctgttctttggatcgaacttgccacttgaccagacagaaacaaa 27622152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 53
Target Start/End: Original strand, 27622267 - 27622319
Alignment:
Q  2 gggtacaagctgttctt-ggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaa 53  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  27622267 gggtacaagctgttctttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacaaa 27622319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Original strand, 27622320 - 27622371
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttctt-ggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaa 53  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27622320 ggtacgagctgttctttggatcgaacttgccactcgaccagacagaaacaaa 27622371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 69)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 16617580 - 16617894
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16617580 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggattagttttttgacaaaatatagattgaaattgacttg 16617679  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||    
T  16617680 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagagtttgacagagaacctgacataagtattgaattgagactgatgttga 16617779  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16617780 cattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttatcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgaaatgcatga 16617879  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  16617880 ctgttggcagtttgt 16617894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22041574 - 22041263
Alignment:
Q  6 acaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacg 104  Q
    |||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22041574 acaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggattagttttttgacaaaatatagattgaaattgacttgacg 22041475  T
Q  105 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||    
T  22041474 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagaatttgacagagaacctgacataagtattgaattgagactgatgttgacat 22041375  T
Q  205 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactg 304  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22041374 tggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttatcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgaaatgcatgactg 22041275  T
Q  305 ttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||    
T  22041274 ttggcagtttgt 22041263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 35887905 - 35887593
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35887905 ggtacaagctgttcttggactcgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattag--ttttgacaaaatgtagattgagattgacttg 35887808  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  35887807 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgagttgagactgatgttga 35887708  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  35887707 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 35887608  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||| ||||||||    
T  35887607 ctgttgacagtttgt 35887593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18249886 - 18249572
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18249886 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcaccggggattggttttttgacaaaatatagattgagattgacctg 18249787  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    || |||||| || |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || | ||| |||||| |||  ||||    
T  18249786 acatcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgaaattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtactgaattgagactgatgttga 18249687  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18249686 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 18249587  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  18249586 ctgttggcagtttgt 18249572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16423353 - 16423040
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttga 102  Q
    |||||||||||||||||||| || |  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16423353 ggtacaagctgttcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattagttttttgacaaaatatagattgagattgacttga 16423254  T
Q  103 cgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgac 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  ||||     
T  16423253 cgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatgttgat 16423154  T
Q  203 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgac 302  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16423153 atcggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattatatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 16423054  T
Q  303 tgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||| ||||||    
T  16423053 tgttggcggtttgt 16423040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 11103474 - 11103789
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt-tgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11103474 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatatagattgagattgactt 11103573  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||    
T  11103574 gacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttg 11103673  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  11103674 acattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 11103773  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  11103774 actgttggcagtttgt 11103789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5659282 - 5658972
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-gacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  5659282 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgactt 5659183  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||    
T  5659182 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttg 5659083  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  5659082 acattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 5658983  T
Q  301 actgttggcag 311  Q
    |||||||||||    
T  5658982 actgttggcag 5658972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 5602402 - 5602718
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | || |  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5602402 ggtacaagctgttcttggacttgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 5602501  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||    
T  5602502 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttg 5602601  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5602602 acattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 5602701  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||| |||||    
T  5602702 gactgttggcattttgt 5602718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 29141864 - 29142181
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgg---gtttttgacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29141864 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttttgacaaaatatagattgagattgac 29141963  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  |    
T  29141964 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatgt 29142063  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29142064 tgacattggaaacgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 29142163  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29142164 tgactgttggcagtttgt 29142181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 4339790 - 4340104
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4339790 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactagggattggtttgttaacaaaatatagattgaggttgacttg 4339889  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  4339890 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 4339989  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  4339990 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacataatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 4340089  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||| |||||    
T  4340090 ctgttggcattttgt 4340104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21681890 - 21681574
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt--tttgacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21681890 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgact 21681791  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    |||| | |||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||    
T  21681790 tgacattgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgtt 21681691  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21681690 gacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 21681591  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||    
T  21681590 gactgttggcagtttgt 21681574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19701565 - 19701250
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt-tgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19701565 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggaatagtttttatgacaaaatatagattgagattgactt 19701466  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||    
T  19701465 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatagaattgagactgatgttg 19701366  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||   || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  19701365 acattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcatcaaatgcatgggcttgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatg 19701266  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  19701265 actgttggcagtttgt 19701250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20073184 - 20072867
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt---gacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  20073184 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgac 20073085  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |    
T  20073084 ttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgt 20072985  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20072984 tgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 20072885  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||| |||||    
T  20072884 tgactgttggcattttgt 20072867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48473081 - 48472764
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt---gacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  48473081 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgac 48472982  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |    
T  48472981 ttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgt 48472882  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  48472881 tgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 48472782  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||| |||||    
T  48472781 tgactgttggcattttgt 48472764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 28109052 - 28109368
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt--tttgacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28109052 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgggggttggtttgttttgacaaaatatagattgaaattgact 28109151  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||    
T  28109152 tgacgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgtt 28109251  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  28109252 gacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtgatgcat 28109351  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||| |||||||||    
T  28109352 gactgttagcagtttgt 28109368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 31029353 - 31029671
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgg----gtttttgacaaaatatagattgagattga 97  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31029353 ggtacaagctgtccttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttgacaaaatatagattgagattga 31029452  T
Q  98 cttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaa 197  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||      
T  31029453 cttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatg 31029552  T
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  31029553 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31029652  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  31029653 atgactgttggcattttgt 31029671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16599782 - 16599467
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16599782 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 16599683  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||    
T  16599682 gacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttg 16599583  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16599582 acattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 16599483  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||| |||||| |||||    
T  16599482 actattggcattttgt 16599467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 20569946 - 20570261
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20569946 ggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 20570045  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
     ||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||    
T  20570046 aacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttg 20570145  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20570146 tcattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 20570245  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  20570246 actgttggcagtttgt 20570261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Original strand, 22380693 - 22381000
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  |||||||||||||||| |||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22380693 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacagggggttagttttttgacaaagtatagattgagattgacttg 22380792  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  22380793 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatgttga 22380892  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  22380893 cattggaaatgcaatatgcatggatgatacaacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatgcatga 22380992  T
Q  302 ctgttggc 309  Q
    ||||||||    
T  22380993 ctgttggc 22381000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 31957547 - 31957861
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31957547 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttg 31957646  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| || |  || ||| ||  |||| |||||| ||| |||||    
T  31957647 acgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgagactgatattga 31957746  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  31957747 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 31957846  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||| |||||    
T  31957847 ctgttggcattttgt 31957861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 17978041 - 17978356
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17978041 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttacaaaatatagattgagattgactt 17978140  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    ||| |||||| || |||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||    
T  17978141 gacatcgatttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcgcaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttg 17978240  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  17978241 acattggaactgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 17978340  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||| |||||    
T  17978341 actgttggcattttgt 17978356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18337768 - 18337464
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttga 102  Q
    ||||||||||| |||||||| || |  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18337768 ggtacaagctgctcttggattgagctgggcactcgaccaaacagaaacaaattcacaggggattag--ttttgacaaaatataggttgaaattgacttga 18337671  T
Q  103 cgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgac 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||    
T  18337670 cgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgagttgagactgatgttgac 18337571  T
Q  203 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgac 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  18337570 attggaaatgcaatatgcatggatgatacaacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatgcatgac 18337471  T
Q  303 tgttggc 309  Q
    |||||||    
T  18337470 tgttggc 18337464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 35222024 - 35221713
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-gacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||   ||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  35222024 ggtacaagctgttcttggacttgaactaaccacttgaccgaacagaaacaaattcactggagattagtttttttgacaaaatatagattgaaactgactt 35221925  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    ||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||   ||    
T  35221924 gacgtcgatt----ttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcataagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgctg 35221829  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    | |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  35221828 atattggaaatgcactatgcacggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatg 35221729  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  35221728 actgttggcagtttgt 35221713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Original strand, 8282579 - 8282887
Alignment:
Q  7 caagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtc 106  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||| ||||  ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8282579 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccgaacagaaacagattcagtggggattgt-tttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtc 8282677  T
Q  107 gattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || |||||  || || |||  |||||||||    
T  8282678 gatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaactgcgactgatgttgacattg 8282777  T
Q  207 gaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgtt 306  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8282778 gaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 8282877  T
Q  307 ggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||    
T  8282878 ggcagtttgt 8282887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 22863954 - 22864269
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt--gacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||| |||||||| || |  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22863954 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgactt 22864053  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||  | |||  || ||||| |||||| |||  |||    
T  22864054 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctaacacgagtattgaattgagactgatgttg 22864153  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22864154 acattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaggttcatcaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 22864253  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||| |||||    
T  22864254 actgttggcattttgt 22864269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 22879013 - 22879328
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt--gacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||| |||||||| || |  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22879013 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgactt 22879112  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||  | |||  || ||||| |||||| |||  |||    
T  22879113 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctaacacgagtattgaattgagactgatgttg 22879212  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22879213 acattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaggttcatcaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 22879312  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||| |||||    
T  22879313 actgttggcattttgt 22879328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 51789191 - 51788876
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  51789191 ggtacaagctgctcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttggcaaaatgtagattgagattgacttg 51789092  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  51789091 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 51788992  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttatta-aatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||| ||||| || || |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  51788991 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattagtatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatg 51788892  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||| |||||    
T  51788891 actgttggcattttgt 51788876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 316
Target Start/End: Original strand, 4789812 - 4790058
Alignment:
Q  70 tttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatt 169  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||      
T  4789812 tttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacc 4789911  T
Q  170 tgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatg 269  Q
     |||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  4789912 cgacataagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatg 4790011  T
Q  270 attatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4790012 attatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgt 4790058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18232360 - 18232046
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| || | |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18232360 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacgggaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgaggttgacttg 18232261  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || | ||| |||||| |||  ||||    
T  18232260 acgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtactgaattgagactgacgttga 18232161  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18232160 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 18232061  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    || |||||| |||||    
T  18232060 ctattggcattttgt 18232046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24335346 - 24335030
Alignment:
Q  1 tgggtacaagctgttcttggat-cgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||  |  ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24335346 tgggtacaagtcgttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcaatggggattggtttgttgacaaaatatagattgaggttgact 24335247  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    |||||| |||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||    
T  24335246 tgacgttgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgtt 24335147  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24335146 gacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 24335047  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  24335046 gaccgttggcattttgt 24335030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4424066 - 4423756
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt--tgacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4424066 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacggaaacatattcactggggattggtttttattgacaaaatatagattgagattgact 4423967  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |     
T  4423966 taacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgaccggtattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgtc 4423867  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4423866 gacattggacatgcagtatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 4423767  T
Q  300 gactgttggca 310  Q
    |||||||||||    
T  4423766 gactgttggca 4423756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4630930 - 4630613
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt---tgacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  4630930 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaatcagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgac 4630831  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    ||||| | |||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |    
T  4630830 ttgacattgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgt 4630731  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4630730 tgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 4630631  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||| |||||    
T  4630630 tgactgttggcattttgt 4630613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 18285467 - 18285784
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattg---ggtttttgacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||     |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18285467 ggtacaagctgttcttgaacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgttttttttttgacaagatatagattgagattgac 18285566  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |    
T  18285567 ttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgt 18285666  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  18285667 tgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatgca 18285766  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||| |||||    
T  18285767 tgactgttggcattttgt 18285784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 8218725 - 8218479
Alignment:
Q  70 tttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatt 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||      
T  8218725 tttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacc 8218626  T
Q  170 tgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatg 269  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  8218625 tgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatg 8218526  T
Q  270 attatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8218525 attatgcatgtatgaacgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgt 8218479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7080398 - 7080089
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-gacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7080398 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatatagattgaaattgactt 7080299  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||    
T  7080298 gacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttg 7080199  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  7080198 acattggaaatgcaatatgcacggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 7080099  T
Q  301 actgttggca 310  Q
    || |||||||    
T  7080098 accgttggca 7080089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 17969967 - 17970285
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgg----gtttttgacaaaatatagattgagattga 97  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17969967 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttgacaaaatatagattgagattga 17970066  T
Q  98 cttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaa 197  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||  |||| |||||| ||| |    
T  17970067 cttgacgtcgatttgaattgaaaagtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgata 17970166  T
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17970167 ttgttattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaagtgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 17970266  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  17970267 atgactattggcactttgt 17970285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 18300767 - 18301085
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattg----ggtttttgacaaaatatagattgagattga 97  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||      |||||||||| |||||||||||||||||    
T  18300767 ggtacaagctgttcttgaacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgtttttttttttgacaagatatagattgagattga 18300866  T
Q  98 cttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaa 197  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||      
T  18300867 cttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatg 18300966  T
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  18300967 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18301066  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  18301067 atgactgttggcattttgt 18301085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18058416 - 18058108
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-gacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  18058416 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgactt 18058317  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  |||    
T  18058316 gacgtcaatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggtttggacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatgttg 18058217  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18058216 acattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 18058117  T
Q  301 actgttggc 309  Q
    |||||||||    
T  18058116 actgttggc 18058108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28346293 - 28346025
Alignment:
Q  48 aacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggct 147  Q
    |||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  28346293 aacatattcacaggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggct 28346194  T
Q  148 cacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaat 247  Q
    |||||| |||||||| || |  || ||| ||  |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  28346193 cacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaat 28346094  T
Q  248 gtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  28346093 gcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgt 28346025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32297803 - 32297485
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt---gacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||  |||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  32297803 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgatcgaacagaaacatattcactggggattgttttttttttgacaaaatatagattgagattgac 32297704  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| || ||||| ||||||  ||  |    
T  32297703 ttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagacggatgt 32297604  T
Q  199 t-gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  32297603 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 32297504  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32297503 atgactgttggcagtttgt 32297485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 70 - 309
Target Start/End: Original strand, 15885898 - 15886137
Alignment:
Q  70 tttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatt 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||      
T  15885898 tttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacc 15885997  T
Q  170 tgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatg 269  Q
     ||||| || |||||  ||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  15885998 cgacatgagtattgaactgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatg 15886097  T
Q  270 attatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggc 309  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15886098 attatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggc 15886137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 316
Target Start/End: Original strand, 16403924 - 16404197
Alignment:
Q  45 agaaacaaattcactggggattgggtttt--tgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacat 142  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||| |||  ||    
T  16403924 agaaacagattcactggggattagttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcaaaaattgaccgatattat 16404023  T
Q  143 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttat 242  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  16404024 tggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcat 16404123  T
Q  243 taaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16404124 taaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgt 16404197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4690829 - 4690515
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-------gacaaaatatagattgagat 94  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||  |||||       ||||||||||||||||||||    
T  4690829 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacggaaacatattcactagggattgttttttttttttttgacaaaatatagattgagat 4690730  T
Q  95 tgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattg 194  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| ||    
T  4690729 tgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtggaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactg 4690630  T
Q  195 aaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaa 294  Q
    |  |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  4690629 atgttgatattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 4690530  T
Q  295 tgcatgactgttggc 309  Q
    |||||||||||||||    
T  4690529 tgcatgactgttggc 4690515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5020887 - 5020565
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt-------tgacaaaatatagattgagat 94  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||    
T  5020887 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcacaggggattggtttttatttttttgacaaaatatagattgagat 5020788  T
Q  95 tgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattg 194  Q
    |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||||  |||||  |    
T  5020787 tgacttgacgccgatttaaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaaatgagacgg 5020688  T
Q  195 aaatt-gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgca 293  Q
    |  || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  5020687 atgtttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 5020588  T
Q  294 atgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5020587 atgcatgactgttggcagtttgt 5020565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 309
Target Start/End: Original strand, 15734256 - 15734536
Alignment:
Q  30 gccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt-tgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaa 128  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15734256 gccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaa 15734355  T
Q  129 ttgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatga 228  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  15734356 ttgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatga 15734455  T
Q  229 tataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggc 309  Q
    ||||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  15734456 tataacaatttcattaaatgcataggcacataatatgcatgactatgcatgtatgaattcttgtaatgcatgactgttggc 15734536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32446301 - 32445984
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgg----gtttttgacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||| |||||||| || |  | |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| |     ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  32446301 ggtacaagctgctcttggattgagctgggcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttttttttttgacaaaatataggttgaaattgac 32446202  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |    
T  32446201 ttgacgttgatttgatttgaaaggtagaaatcgaccgatactaatggctcacaaggttttgatagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgt 32446102  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  32446101 tgacattggaaatgcaatatgcatagatgacataacagttttattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 32446002  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||| |||||    
T  32446001 tgactgttggcattttgt 32445984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4728772 - 4728466
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-gacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  | |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||  | |||| ||||||||    
T  4728772 ggtacaagctgttcttggacttgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaacata--ggttgaaattgactt 4728675  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  |||    
T  4728674 ggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattataggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatgttg 4728575  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4728574 acattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatg 4728475  T
Q  301 actgttggc 309  Q
    |||||||||    
T  4728474 actgttggc 4728466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10650237 - 10649924
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    |    
T  10650237 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttggccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagatt----t 10650142  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga--ccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |  ||   ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||  || ||||| |||||| |||  |    
T  10650141 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgagactgatgttattggcttacaaggttttgacagagaacctgacacgagtattgaattgagactgatgt 10650042  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  10650041 tgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 10649942  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||| |||||    
T  10649941 tgactgttggcattttgt 10649924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28028443 - 28028125
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-----------gacaaaatatagattg 90  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||    
T  28028443 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgggttttttttttttttttgacaaaatatagattg 28028344  T
Q  91 agattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgag 190  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||    
T  28028343 agatcgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgag 28028244  T
Q  191 attgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgctt 290  Q
    | |||  |||||||||||||||| ||||| |||       ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28028243 actgatgttgacattggaaatgcgatatgcatg-------taacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 28028151  T
Q  291 gcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  28028150 gtaatgcatgactgttggcagtttgt 28028125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6209041 - 6208735
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-gacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  | |||| ||||  ||| |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||  | |||| ||||||||    
T  6209041 ggtacaagctgttcttggacttgaactagtcacttgaccgaacaaaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaacata--ggttgaaattgactt 6208944  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  |||    
T  6208943 ggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattataggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatgttg 6208844  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6208843 acattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatg 6208744  T
Q  301 actgttggc 309  Q
    |||||||||    
T  6208743 actgttggc 6208735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5474125 - 5473821
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||| ||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5474125 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacataaacatattcacaggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttg 5474026  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  ||||    
T  5474025 acgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacagatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttga 5473926  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||          ||||||||||||||| |||||||||    
T  5473925 cattgaaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgc----------atgtatgaatgcttgtaatgcatga 5473836  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||| |||||    
T  5473835 ctgttggcattttgt 5473821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15368408 - 15368099
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt--gacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||   ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  15368408 ggtacaagctgttcttggacttgaactaaccacttgaccaaacagaaacacattcactggggattagttttttttgacaaaatatagattgaaattgact 15368309  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    |||| | ||    || |      |||| || |||||||  || |||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||    
T  15368308 tgacattgac---atgtcc----tagagatggaccaatggcactggctccccagatcttgacagagaatttgacataagtattgaattgagactgatgtt 15368216  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15368215 gacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 15368116  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||    
T  15368115 gactgttggcagtttgt 15368099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 6535834 - 6536148
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  6535834 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttattggcacaatatagattgaggttgacttg 6535933  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt--gaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    |||||||||   ||||||| |   |||||  |||  ||   ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||    
T  6535934 acgtcgatttagtttgaaatg---aaattaagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgtt 6536030  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6536031 gacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 6536130  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||| |||||    
T  6536131 tgactgttggcattttgt 6536148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 141 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10403181 - 10403006
Alignment:
Q  141 attggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt 240  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  10403181 attggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttc 10403082  T
Q  241 attaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10403081 attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgt 10403006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 197 - 316
Target Start/End: Original strand, 5589642 - 5589761
Alignment:
Q  197 attgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatg 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5589642 attgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5589741  T
Q  297 catgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5589742 catgactgttggcagtttgt 5589761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 5718167 - 5718036
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5718167 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 5718068  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5718067 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 5718036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 5729077 - 5728946
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5729077 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 5728978  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5728977 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 5728946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Original strand, 5763291 - 5763422
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5763291 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 5763390  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5763391 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 5763422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 198 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5718027 - 5717909
Alignment:
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5718027 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5717928  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5717927 atgactgttggcagtttgt 5717909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 198 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5728937 - 5728819
Alignment:
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5728937 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5728838  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5728837 atgactgttggcagtttgt 5728819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 198 - 316
Target Start/End: Original strand, 5763431 - 5763549
Alignment:
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5763431 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5763530  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5763531 atgactgttggcagtttgt 5763549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 316
Target Start/End: Original strand, 29658254 - 29658372
Alignment:
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  29658254 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatgtaacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29658353  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29658354 atgactgttggcagtttgt 29658372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 47030428 - 47030310
Alignment:
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  47030428 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatatagcagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 47030329  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  47030328 atgactgttggcattttgt 47030310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Original strand, 29658115 - 29658245
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| || |  | |||| ||||| || ||| || |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658115 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaagcatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttg 29658214  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 132  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29658215 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 29658245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 134
Target Start/End: Original strand, 5589510 - 5589638
Alignment:
Q  7 caagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgt 105  Q
    ||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5589510 caagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcattggggattagtttgttgaaaaaatatagattgagattgacttgacgt 5589609  T
Q  106 cgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 134  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  5589610 cgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 5589638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 47030524 - 47030437
Alignment:
Q  46 gaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 132  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  47030524 gaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgatttgaaaggtagaaattga 47030437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 8218813 - 8218747
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgg 68  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8218813 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgg 8218747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 9527051 - 9526981
Alignment:
Q  5 tacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt 74  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  9527051 tacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttt 9526981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 10403261 - 10403195
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgg 68  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10403261 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgg 10403195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25207501 - 25207187
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25207501 ggtacaagctgttcttggacttgaaccagccacttgaccgaacagaaacaaattcactagggattagttttttgacaaaatatagattgaaattgacttg 25207402  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||   |||    
T  25207401 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgctga 25207302  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  25207301 tattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 25207202  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  25207201 ctgttggcagtttgt 25207187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25271657 - 25271343
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25271657 ggtacaagctgttcttggacttgaaccagccacttgaccgaacagaaacaaattcactagggattagttttttgacaaaatatagattgaaattgacttg 25271558  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||   |||    
T  25271557 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgctga 25271458  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  25271457 tattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 25271358  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  25271357 ctgttggcagtttgt 25271343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22895621 - 22895305
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt--gacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  22895621 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacagattcactggggattagttttttttgacaaaatatagattgaaattgact 22895522  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||   |    
T  22895521 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagagattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgct 22895422  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22895421 gatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgcaatgcat 22895322  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||    
T  22895321 gactgttggcagtttgt 22895305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 28952745 - 28953059
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28952745 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgaaattgacttg 28952844  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  28952845 acgtcgatttgatttgaaagatagaaattgaccgataacattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 28952944  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  28952945 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 28953044  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  28953045 ctgttggcagtttgt 28953059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33784671 - 33784360
Alignment:
Q  7 caagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt--gacaaaatatagattgagattgacttgacg 104  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33784671 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacg 33784572  T
Q  105 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacat 204  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||    
T  33784571 tcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacat 33784472  T
Q  205 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactg 304  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33784471 tggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactg 33784372  T
Q  305 ttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||    
T  33784371 ttggcagtttgt 33784360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 18121381 - 18121697
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt--tgacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18121381 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacaggttcactggggattggttttttttgacaaagtatagattgagattgact 18121480  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||| |||||| |||  ||    
T  18121481 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagcattgaattgagactgatgtt 18121580  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18121581 gccattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 18121680  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||    
T  18121681 gactgttggcagtttgt 18121697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6881505 - 6881190
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-gacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6881505 ggtacaagctgttctcggactcgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatataaattgagattgactt 6881406  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||    
T  6881405 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttg 6881306  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  6881305 acattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 6881206  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  6881205 actgttggcagtttgt 6881190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43085460 - 43085144
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt---gacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||| |||||||| || |  |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  43085460 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatattcactggggattggttttttcctgacaaaatatagattgagattgact 43085361  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||    
T  43085360 tggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgtt 43085261  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  43085260 gacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 43085161  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||    
T  43085160 gactgttggcagtttgt 43085144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23899088 - 23898774
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23899088 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttttttgacaaaatataggttgaaattgacttg 23898989  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  23898988 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 23898889  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  23898888 cattgaaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtacgaatgcttgtaatgtatga 23898789  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  23898788 ctgttggcagtttgt 23898774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34623710 - 34623396
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34623710 ggtacaagctgttcctggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagttttttgacaaaatatagattgagattgacttg 34623611  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | ||||| |||||| |||  ||||    
T  34623610 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgggtattgaattgagactgatgttga 34623511  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  34623510 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 34623411  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||| |||||    
T  34623410 ctgttggcattttgt 34623396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37762185 - 37761871
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37762185 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttg 37762086  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  ||||    
T  37762085 acgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgataatattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttga 37761986  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  37761985 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 37761886  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||| |||||    
T  37761885 ctgttggcattttgt 37761871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2518256 - 2517942
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttt-ttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2518256 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgcttgacaaaatatagattgagattgactt 2518157  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||    
T  2518156 gacgtcgatttgatt-gaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttg 2518058  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  2518057 acattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 2517958  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  2517957 actgttggcagtttgt 2517942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 9543675 - 9543992
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt---tgacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  9543675 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgac 9543774  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |    
T  9543775 ttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgt 9543874  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  9543875 tgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 9543974  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9543975 tgactgttggcagtttgt 9543992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 8658443 - 8658757
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8658443 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttg 8658542  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  8658543 acgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 8658642  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8658643 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 8658742  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||| |||||    
T  8658743 ctgttggcattttgt 8658757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23727427 - 23727115
Alignment:
Q  7 caagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgg---gtttttgacaaaatatagattgagattgacttgac 103  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| |    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23727427 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttttgacaaagtatagattgagattgacttgac 23727328  T
Q  104 gtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgaca 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  ||||||    
T  23727327 gtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatgttgaca 23727228  T
Q  204 ttggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgact 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23727227 ttggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgact 23727128  T
Q  304 gttggcagtttgt 316  Q
    || ||||||||||    
T  23727127 gtcggcagtttgt 23727115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 37664454 - 37664768
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37664454 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttg 37664553  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| || ||| |||  ||||    
T  37664554 acgtcgattcgaattgaaaggtagagattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattaagactgatgttga 37664653  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  37664654 cattggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 37664753  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  37664754 ctgttggcagtttgt 37664768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11556545 - 11556232
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-gacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  11556545 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacctgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaata--ggttgagattgactt 11556448  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||    
T  11556447 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttg 11556348  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  11556347 acattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 11556248  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  11556247 actgttggcagtttgt 11556232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 18493717 - 18494032
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18493717 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 18493816  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||||   || || || || || |||||| |||  |||    
T  18493817 gacgtcgatttgatttgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgatagagaacccgatatgagtatcgaattgagactgatgttg 18493916  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18493917 acattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 18494016  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  18494017 actgttggcagtttgt 18494032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 30 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24977008 - 24976729
Alignment:
Q  30 gccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaat 129  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24977008 gccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattgtttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaat 24976909  T
Q  130 tgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgat 229  Q
    ||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  24976908 tgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgat 24976809  T
Q  230 ataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggc 309  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24976808 ataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggc 24976729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33882320 - 33882003
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt---tgacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  33882320 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgac 33882221  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| || |  || ||| ||  |||| |||||| ||| ||    
T  33882220 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgagactgatat 33882121  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  33882120 tgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 33882021  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33882020 tgactgttggcagtttgt 33882003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 18368476 - 18368794
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgg----gtttttgacaaaatatagattgagattga 97  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18368476 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgtccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttgacaaaatatagattgagattga 18368575  T
Q  98 cttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaa 197  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||      
T  18368576 cttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatg 18368675  T
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18368676 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18368775  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  18368776 atgactgttggcattttgt 18368794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33523560 - 33523281
Alignment:
Q  37 gaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 136  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  |    
T  33523560 gaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactga 33523461  T
Q  137 taacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacag 236  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  33523460 tattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaa 33523361  T
Q  237 ttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  33523360 tttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgt 33523281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 70 - 316
Target Start/End: Original strand, 13179834 - 13180080
Alignment:
Q  70 tttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatt 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| |||||||||||||      
T  13179834 tttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacc 13179933  T
Q  170 tgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatg 269  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  13179934 tgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatg 13180033  T
Q  270 attatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13180034 attatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgt 13180080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 316
Target Start/End: Original strand, 15651744 - 15652025
Alignment:
Q  37 gaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt--tgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 134  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15651744 gaccaaacagaaacaggttcactggggattggttttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 15651843  T
Q  135 aataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataac 234  Q
     |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||  |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15651844 gatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtgttgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataac 15651943  T
Q  235 agttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15651944 agtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgt 15652025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23633162 - 23632848
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-gacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |  | |||| || |  |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  23633162 ggtacaagctgctcttggatcgagctgggcacttgagcgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttg 23633063  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  23633062 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 23632963  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  23632962 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 23632863  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  23632862 ctgttggcagtttgt 23632848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30175679 - 30175365
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30175679 ggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttggcaaaatatagattgagattgacttg 30175580  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| || |  || ||| ||  |||| |||||| ||| |||||    
T  30175579 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgagactgatattga 30175480  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  30175479 tattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtattacgcatgattgtgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 30175380  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  30175379 ctgttggcagtttgt 30175365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24731162 - 24730846
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt--tttgacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24731162 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattaagattgact 24731063  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| ||  |||| |||||| ||| |||    
T  24731062 taacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgaccggtattattggcttacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatatt 24730963  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24730962 gttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 24730863  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||| |||||    
T  24730862 gactgttggcattttgt 24730846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 43 - 316
Target Start/End: Original strand, 31819412 - 31819685
Alignment:
Q  43 acagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacat 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  31819412 acagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacctgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattat 31819511  T
Q  143 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttat 242  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || ||| || |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  31819512 tggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgggactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcat 31819611  T
Q  243 taaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  31819612 taaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgt 31819685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30159233 - 30158917
Alignment:
Q  1 tgggtacaagctgttcttggat-cgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||  |  ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  30159233 tgggtacaagtcgttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgaggttgact 30159134  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||    
T  30159133 tgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgtt 30159034  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  30159033 gacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 30158934  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||| |||||    
T  30158933 gactgttggcattttgt 30158917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 37 - 316
Target Start/End: Original strand, 15751843 - 15752122
Alignment:
Q  37 gaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 136  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |    
T  15751843 gaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccga 15751942  T
Q  137 taacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacag 236  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  15751943 tattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaa 15752042  T
Q  237 ttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  15752043 tttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgaccgttggcattttgt 15752122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33299736 - 33299414
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt--------gacaaaatatagattgaga 93  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||||        |||||||||||||||||||    
T  33299736 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttttttttttttttgacaaaatatagattgaga 33299637  T
Q  94 ttgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagatt 193  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |    
T  33299636 ttgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagact 33299537  T
Q  194 gaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgca 293  Q
    ||  ||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  33299536 gatgttgacatcggaaacgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 33299437  T
Q  294 atgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33299436 atgcatgactgttggcagtttgt 33299414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28656460 - 28656142
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt--tttgacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28656460 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgact 28656361  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt--gaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaa 197  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||  |||  ||   ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||      
T  28656360 tgacgtcgatttggtttgaaaggtagaaattaagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatg 28656261  T
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  28656260 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28656161  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  28656160 atgactgttggcattttgt 28656142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 32589224 - 32589539
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32589224 ggtacaagccgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 32589323  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |  || || ||| || |||  |||    
T  32589324 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaatatcgaattgggactgatgttg 32589423  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  32589424 acattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcacgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 32589523  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    |  |||||||||||||    
T  32589524 atcgttggcagtttgt 32589539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30036637 - 30036323
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  | |||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30036637 ggtacaagctgttcttggacttgaactagtcacttgaccaaatagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgaggttgacttg 30036538  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    || |||||| || |||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  30036537 acatcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccggtattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 30036438  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  30036437 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 30036338  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||| |||||    
T  30036337 ctgttggcattttgt 30036323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31438648 - 31438334
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31438648 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgaggttgacttg 31438549  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| || || || |||||| |||  ||||    
T  31438548 acgtcgacttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacaaagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttga 31438449  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  31438448 cattggaaatgcagcatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 31438349  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||| |||||    
T  31438348 ctgttggcattttgt 31438334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3796746 - 3796430
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt--gacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3796746 ggtacaagctgttcctggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttattctgacaaaatatagattgagattgact 3796647  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||| |||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||    
T  3796646 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaagtttcgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgtt 3796547  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||| ||||  || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  3796546 gacattggaaatgcaatatgcatggacgatataacagattcattaaatgcatggatacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 3796447  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||| |||||    
T  3796446 gactgttggcattttgt 3796430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 37745297 - 37745613
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt--tttgacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  37745297 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgctttgacagaatagagattgagattgact 37745396  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||  ||  ||    
T  37745397 tgacgtcgacttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagaccgatgtt 37745496  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  37745497 gacattggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 37745596  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||    
T  37745597 gactgttggcagtttgt 37745613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 316
Target Start/End: Original strand, 13435642 - 13435933
Alignment:
Q  30 gccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-----tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggta 124  Q
    |||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13435642 gccacttgaccaaacatgaacatattcactggggattggtttgttcttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggta 13435741  T
Q  125 gaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatgg 224  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||    
T  13435742 gaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacgg 13435841  T
Q  225 atgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13435842 atgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgt 13435933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 30941819 - 30941515
Alignment:
Q  7 caagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattg--ggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacg 104  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30941819 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattattgttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacg 30941720  T
Q  105 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| ||   |||| ||    
T  30941719 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgttgttgatat 30941620  T
Q  205 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactg 304  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30941619 tggaaatgtaatatgcatgaatgatagaacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactg 30941520  T
Q  305 ttggc 309  Q
    |||||    
T  30941519 ttggc 30941515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24609433 - 24609130
Alignment:
Q  7 caagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgt 105  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24609433 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattgttttttttgaaaaagtatagattgagattgacttgacgt 24609334  T
Q  106 cgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacatt 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |   |||||||||    
T  24609333 cgatttgatttgaaaggtagaaattgacctatattattggcacacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagacttgtattgacatt 24609234  T
Q  206 ggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgt 305  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24609233 ggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgt 24609134  T
Q  306 tggc 309  Q
    ||||    
T  24609133 tggc 24609130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 13317776 - 13318090
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatc-gaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    |||||||||||||||||||   ||||  |||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13317776 ggtacaagctgttcttggacgtgaactagccacttgaccaaacatgaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgaggttgacttg 13317875  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||  ||||  ||||| ||| ||||     
T  13317876 acgtcgacttgaattgaaaggtagaaattgaccggtattattggctcacaaggtttcgacagagaacctgacatgagttttgaactgagactgatattgt 13317975  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13317976 tattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 13318075  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||| |||||    
T  13318076 ctgttggcattttgt 13318090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Original strand, 22992091 - 22992397
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttga 102  Q
    ||||||||||| |||||||| || |  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||   | || |||| |||| |||||||||     
T  22992091 ggtacaagctgctcttggattgagctgggcactcgaccaaacagaaacaaattcacaggggattagttttttttgacaacataggttgaaattgacttgg 22992190  T
Q  103 cgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgac 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  |||||    
T  22992191 cgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattataggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatgttgac 22992290  T
Q  203 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgac 302  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22992291 attggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 22992390  T
Q  303 tgttggc 309  Q
    |||||||    
T  22992391 tgttggc 22992397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 37351611 - 37351922
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt---tgacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  37351611 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaatatagattgagattgac 37351710  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||  ||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |    
T  37351711 ttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgattgatattattggctcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgt 37351810  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  37351811 tgatattggaaatgcaatatgcatggatgttataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 37351910  T
Q  299 tgactgttggca 310  Q
    ||||||||||||    
T  37351911 tgactgttggca 37351922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26487585 - 26487271
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26487585 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatataaattgagattgacttg 26487486  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||  ||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  ||||    
T  26487485 acgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttga 26487386  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||| || | ||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26487385 tattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 26487286  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    || |||||| |||||    
T  26487285 ctattggcattttgt 26487271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9324675 - 9324361
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9324675 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggagattggtttgttgacaaaatataaattgagattgacttg 9324576  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||  ||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  ||||    
T  9324575 acgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttga 9324476  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||| || | ||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  9324475 tattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 9324376  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    || |||||| |||||    
T  9324375 ctattggcattttgt 9324361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12139373 - 12139059
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12139373 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatataaattgagattgacttg 12139274  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||  ||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  ||||    
T  12139273 acgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttga 12139174  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||| || | ||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  12139173 tattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtatgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 12139074  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    || |||||| |||||    
T  12139073 ctattggcattttgt 12139059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41681897 - 41681584
Alignment:
Q  2 gggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaa-ttcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  | ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  41681897 gggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaaattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgac 41681798  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||  |||| |||||| |||  |    
T  41681797 ttgacgtcgatttgaattgaaaggcagacattgaccgatattattggctcacaaggtttggacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatgt 41681698  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||     || |||    
T  41681697 tggtattggaaatacgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcgtgattatgcatgtatgaatgt----aacgca 41681602  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41681601 tgactgttggcagtttgt 41681584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 197 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5644816 - 5644697
Alignment:
Q  197 attgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatg 296  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5644816 attgacattggaaatgcgatgtgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5644717  T
Q  297 catgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  5644716 catgactgttggcattttgt 5644697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Original strand, 40466555 - 40466686
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40466555 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 40466654  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40466655 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 40466686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 202 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11330645 - 11330531
Alignment:
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11330645 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 11330546  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  11330545 ctgttggcagtttgt 11330531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 316
Target Start/End: Original strand, 40466695 - 40466813
Alignment:
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  40466695 ttgacattggaaatgcgatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 40466794  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||    
T  40466795 atgactgttggcagtttgt 40466813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 5644952 - 5644820
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5644952 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgctgacaaaatatagattgagattgacttg 5644853  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 134  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5644852 acgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 5644820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11330785 - 11330640
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt--tttgacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11330785 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttttgacaaaatatagattgagattgact 11330686  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattgg 145  Q
    | ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  11330685 taacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatatcattgg 11330640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 316
Target Start/End: Original strand, 13178630 - 13178763
Alignment:
Q  184 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataac-agttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtat 282  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||| | |||||| | ||  || |||||||||| ||| ||| ||    
T  13178630 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcat 13178729  T
Q  283 gaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  13178730 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgt 13178763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 31)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 54840605 - 54840292
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54840605 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgg-tttttgacaaaatatagattgagattgacttg 54840507  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  ||||    
T  54840506 acgtcaattcgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttga 54840407  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  54840406 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 54840307  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  54840306 ctgttggcagtttgt 54840292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5701745 - 5701430
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5701745 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 5701646  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||    
T  5701645 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttg 5701546  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  5701545 acattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 5701446  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||| |||||    
T  5701445 actgttggcattttgt 5701430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 24585420 - 24585734
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| || |  | |||| ||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24585420 ggtacaagctgctcttggattgagctgggcacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttg 24585519  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  24585520 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaaatgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 24585619  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  24585620 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 24585719  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  24585720 ctgttggcagtttgt 24585734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14105759 - 14105445
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14105759 ggtacaagctattcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttg 14105660  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  14105659 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 14105560  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  14105559 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 14105460  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||| |||| |||||    
T  14105459 ctgtgggcattttgt 14105445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 36323387 - 36323701
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36323387 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactagggattagttttttgacaaaatatagattgagattgacttg 36323486  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| | |||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  36323487 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggtcttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 36323586  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  36323587 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgcttgtaatgcatga 36323686  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  36323687 ctgttggcagtttgt 36323701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 36337596 - 36337910
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36337596 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactagggattagttttttgacaaaatatagattgagattgacttg 36337695  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| | |||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  36337696 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggtcttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 36337795  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  36337796 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgcttgtaatgcatga 36337895  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  36337896 ctgttggcagtttgt 36337910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15235034 - 15234721
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||   ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  15235034 ggtacaagctgttcttggacttgaacaaaccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggattag-tttttgacaaaatgtagattgaaactgacttg 15234936  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||   |||    
T  15234935 acgtcgatttgatttgaaaggcagagattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacatgacatgagtattgaattgagactgatgctga 15234836  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15234835 tattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatggtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 15234736  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
     ||| ||||| ||||    
T  15234735 ttgtgggcagcttgt 15234721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 308
Target Start/End: Original strand, 40098682 - 40098989
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40098682 ggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 40098781  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||    
T  40098782 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcataaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttg 40098881  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  40098882 atattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 40098981  T
Q  301 actgttgg 308  Q
    ||||||||    
T  40098982 actgttgg 40098989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 14752564 - 14752880
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt--tgacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14752564 ggtacaagctgttcttgaacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgact 14752663  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||    
T  14752664 tgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgtt 14752763  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14752764 gatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 14752863  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||| |||||    
T  14752864 gactgttggcattttgt 14752880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 18793689 - 18794007
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatac-agaaacaaattcactggggattgggttttt---gacaaaatatagattgagattga 97  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||    
T  18793689 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaaatagaaacatattcactggggattggttttttcctgacaaaatatagattgagattga 18793788  T
Q  98 cttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaa 197  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||      
T  18793789 cttggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatg 18793888  T
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18793889 ttgacattggaaatgcgatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18793988  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18793989 atgactgttggcagtttgt 18794007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30760980 - 30760665
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  30760980 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttggcaaaatgtagattgagattgacttg 30760881  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  30760880 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 30760781  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| || || |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  30760780 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatg 30760681  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||| |||||    
T  30760680 actgttggcattttgt 30760665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 316
Target Start/End: Original strand, 31119595 - 31119874
Alignment:
Q  37 gaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 136  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  |    
T  31119595 gaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactga 31119694  T
Q  137 taacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacag 236  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  31119695 tattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaa 31119794  T
Q  237 ttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  31119795 tttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgt 31119874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 33666850 - 33667165
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  33666850 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttggcaaaatgtagattgagattgacttg 33666949  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  33666950 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 33667049  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| || || |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  33667050 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatg 33667149  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||| |||||    
T  33667150 actgttggcattttgt 33667165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39857831 - 39857516
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39857831 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 39857732  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||    
T  39857731 gacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttg 39857632  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  39857631 acattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 39857532  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||| |||||| |||||    
T  39857531 actattggcattttgt 39857516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 14672204 - 14671899
Alignment:
Q  7 caagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattg---ggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgac 103  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14672204 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattgttttttttttgacaaagtatagattgagattgacttgac 14672105  T
Q  104 gtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgaca 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| ||| |||||||    
T  14672104 gtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatattgaca 14672005  T
Q  204 ttggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgact 303  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14672004 ttggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcacgact 14671905  T
Q  304 gttggc 309  Q
    ||||||    
T  14671904 gttggc 14671899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 37 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21976884 - 21976605
Alignment:
Q  37 gaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 136  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||  |    
T  21976884 gaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagataaaaattgactga 21976785  T
Q  137 taacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacag 236  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  21976784 tattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaa 21976685  T
Q  237 ttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21976684 tttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgt 21976605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24119860 - 24119543
Alignment:
Q  2 gggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaa-ttcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  | ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24119860 gggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaaattcactggggattggtttgtttgacaaaatataggttgaaattgac 24119761  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| | |||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |    
T  24119760 ttgacgttgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggtcttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgt 24119661  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24119660 tgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 24119561  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||| |||||    
T  24119560 tgactgttggcattttgt 24119543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6577058 - 6576738
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt------gacaaaatatagattgagatt 95  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||      ||| |||||| ||||||||||    
T  6577058 ggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttttgaccaaatatggattgagatt 6576959  T
Q  96 gacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattga 195  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||    
T  6576958 gacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatactaatggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga 6576859  T
Q  196 aattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaat 295  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  6576858 tgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaat 6576759  T
Q  296 gcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6576758 gcatgactgttggcagtttgt 6576738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 34182007 - 34182315
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgg----gtttttgacaaaatatagattgagattga 97  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||     ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34182007 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacaggttcactggggattggttttttttttgacaaagtatagattgagattga 34182106  T
Q  98 cttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattga-a 196  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||  |||| |||||| |||      
T  34182107 cttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtgttgaattgagactgatg 34182206  T
Q  197 attgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatg 296  Q
     |||||||||||     |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  34182207 tttgacattgga-----aatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 34182301  T
Q  297 catgactgttggca 310  Q
    ||||||||||||||    
T  34182302 catgactgttggca 34182315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 70 - 316
Target Start/End: Original strand, 24814419 - 24814665
Alignment:
Q  70 tttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatt 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| |||| |||| |||      
T  24814419 tttttgacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctgacaaggttttaacagggaacc 24814518  T
Q  170 tgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatg 269  Q
    |||||| || ||||| | |||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  24814519 tgacatgagtattgaatggagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatg 24814618  T
Q  270 attatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  24814619 attatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgt 24814665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5013098 - 5012783
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||  ||||| |||||||||  |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5013098 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacctgaccaaacagaaacatgttcactagggattggtttgttgaccaaatatagattgaaattgacttg 5012999  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  5012998 acgtcgatttgatttaaaaggtagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagaggacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 5012899  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttta-ttaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  5012898 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcatttaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcgtg 5012799  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||| |||||| |||||    
T  5012798 actattggcattttgt 5012783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1907440 - 1907228
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1907440 ggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactagggattagttttttgacaaaatatagattcaaattgacttg 1907341  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||    
T  1907340 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgatagagaacctgacataagtattgaattgagattgatgttga 1907241  T
Q  202 cattggaaatgca 214  Q
    |||||||||||||    
T  1907240 cattggaaatgca 1907228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 15275683 - 15275989
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15275683 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcactggggattag-tttttgacaaaatataaattgaaattgacttg 15275781  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
     | | ||    || |      |||| || | |||||  || |||||||| || | |||||||||||||||||||| | || || |||||| |||||||||    
T  15275782 gcattgac---atatcc----tagagatgggccaatggcactggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggtatcgaattgagactgaaattga 15275874  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15275875 cattggaaatgcaacatgtataggtggtataatagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 15275974  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  15275975 ctgttggcagtttgt 15275989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 17020235 - 17019938
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-gacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  17020235 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgactt 17020136  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  |||    
T  17020135 gacgtcgatttgatttgaaaagtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatgttg 17020036  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    |           ||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  17020035 a-----------caacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 17019947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 15379295 - 15379601
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15379295 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcattggggattag-tttttgacaaaatataaattgaaattgacttg 15379393  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    || | ||    || |      |||| || | |||||  || |||||||| || | |||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |  ||||||    
T  15379394 acattgac---atatcc----tagagatgggccaatggcactggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggtattgaatcgagactataattga 15379486  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  15379487 cattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagttttattaaatgtatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaacgcttgtaatgcatga 15379586  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  15379587 ctgttggcagtttgt 15379601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 316
Target Start/End: Original strand, 27156516 - 27156690
Alignment:
Q  141 attggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt 240  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  27156516 attggctcacagg-ttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattc 27156614  T
Q  241 attaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27156615 attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgt 27156690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 198 - 316
Target Start/End: Original strand, 20331681 - 20331799
Alignment:
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20331681 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 20331780  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20331781 atgactgttggcagtttgt 20331799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Original strand, 20331541 - 20331672
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||  ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20331541 ggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttaaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 20331640  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20331641 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 20331672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1907229 - 1907170
Alignment:
Q  257 catagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1907229 cataatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggtagtttgt 1907170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 316
Target Start/End: Original strand, 24813628 - 24813761
Alignment:
Q  184 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataac-agttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtat 282  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||| | |||||| | ||  || |||||||||| ||| ||| ||    
T  24813628 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcat 24813727  T
Q  283 gaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  24813728 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgt 24813761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 98
Target Start/End: Original strand, 15399377 - 15399449
Alignment:
Q  30 gccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt----tgacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  15399377 gccacttgaccaaacagaaacagattcactagggatttgttttttttttgacaaaatatagattgagattgac 15399449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 21696227 - 21696540
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  21696227 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacaaattcgctggggattagctttt-gacaaaatatagattgaaactgacttg 21696325  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| |||   |||    
T  21696326 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgatttgagactgatgctga 21696425  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21696426 tattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 21696525  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  21696526 ctgttggcagtttgt 21696540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 37678936 - 37679250
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37678936 ggtacaagctattcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttg 37679035  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  37679036 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 37679135  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  37679136 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 37679235  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  37679236 ctgttggcagtttgt 37679250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 37694201 - 37694515
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37694201 ggtacaagctattcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttg 37694300  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  37694301 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 37694400  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  37694401 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 37694500  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  37694501 ctgttggcagtttgt 37694515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 34267959 - 34268274
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt-tgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34267959 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacaaattcacagggtattagtttttttgacaaaatatagattgagattgactt 34268058  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||    
T  34268059 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttg 34268158  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  34268159 acattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 34268258  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  34268259 actgttggcagtttgt 34268274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37932579 - 37932267
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37932579 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgg--ttttgacaaaatatagattgagattgacttg 37932482  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  37932481 acgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 37932382  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  37932381 tattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 37932282  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||| |||||    
T  37932281 ctgttggcattttgt 37932267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34298354 - 34298039
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttt-ttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34298354 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccactagaccaaatagaaacatattcactggggattggtttgcttgacaaaatatagattgagattgactt 34298255  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||||  | |    
T  34298254 gacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatactattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagattgatgtcg 34298155  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  34298154 acattggaaatgcaaaatgaatggatgatataacagtttcactaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 34298055  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  34298054 actgttggcagtttgt 34298039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37384862 - 37384545
Alignment:
Q  1 tgggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-gacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  37384862 tgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgatttttttgacaaagtatagattgagattgac 37384763  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || |  |||||| |||  |    
T  37384762 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcggattgagactgatgt 37384663  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  37384662 tgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 37384563  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||| |||||    
T  37384562 tgactgttggcattttgt 37384545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39897273 - 39896959
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39897273 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttg 39897174  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  39897173 acgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 39897074  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  39897073 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatgcatga 39896974  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||| |||||    
T  39896973 ctgttggcattttgt 39896959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27123706 - 27123390
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt--gacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27123706 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgactaaacagaaacatattcactggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgact 27123607  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  ||    
T  27123606 tgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgtt 27123507  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27123506 gacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 27123407  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27123406 gactgttggcattttgt 27123390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34162047 - 34161731
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt--tttgacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34162047 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgact 34161948  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||    
T  34161947 taacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgtt 34161848  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  34161847 gtcattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgcat 34161748  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||    
T  34161747 gactgttggcagtttgt 34161731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 253689 - 254004
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  253689 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 253788  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||    
T  253789 gacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttg 253888  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  253889 acattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 253988  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  253989 actgttggcagtttgt 254004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 316
Target Start/End: Original strand, 16822411 - 16822690
Alignment:
Q  37 gaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 136  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  |    
T  16822411 gaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactga 16822510  T
Q  137 taacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacag 236  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  16822511 tattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaa 16822610  T
Q  237 ttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16822611 tttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgt 16822690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16899069 - 16898790
Alignment:
Q  37 gaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 136  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  |    
T  16899069 gaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactga 16898970  T
Q  137 taacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacag 236  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  16898969 tattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaa 16898870  T
Q  237 ttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16898869 tttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgt 16898790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32056921 - 32056642
Alignment:
Q  37 gaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 136  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  |    
T  32056921 gaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactga 32056822  T
Q  137 taacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacag 236  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  32056821 tattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaa 32056722  T
Q  237 ttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  32056721 tttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgt 32056642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 19409522 - 19409836
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatc-gaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19409522 ggtacaagctgttcttggacctgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttgacaaaatatagattgaggttgacttg 19409621  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    |||| |||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  19409622 acgttgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 19409721  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  19409722 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 19409821  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    | ||||||| |||||    
T  19409822 ccgttggcattttgt 19409836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 21670211 - 21670525
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21670211 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttg 21670310  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| || ||| |||  ||||    
T  21670311 acgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattaagactgatgttga 21670410  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21670411 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgcttatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 21670510  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  21670511 ctgttggcagtttgt 21670525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 12709660 - 12709976
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt--tttgacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12709660 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgaggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgact 12709759  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| ||  |||| |||||| ||| |||    
T  12709760 taacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgaccggtattattggcttacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatatt 12709859  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12709860 gttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 12709959  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||| |||||    
T  12709960 gactgttggcattttgt 12709976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3789648 - 3789333
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| || |  |||||| ||||| || |||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3789648 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatattcaccggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttg 3789549  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  3789548 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 3789449  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttatta-aatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3789448 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattagtatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 3789349  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||| |||||    
T  3789348 actgttggcattttgt 3789333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34868839 - 34868524
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  34868839 ggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttggcaaaaagtagattgagattgacttg 34868740  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  34868739 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 34868640  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  34868639 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 34868540  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||| |||||    
T  34868539 actgttggcattttgt 34868524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 22921182 - 22921496
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921182 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttg 22921281  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| |  |  || ||| ||  |||| |||||| ||| |||||    
T  22921282 acgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaatgacctgtcatgagttttgaattgagactgatattga 22921381  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22921382 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 22921481  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||| |||||    
T  22921482 ctgttggcattttgt 22921496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40240730 - 40240413
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40240730 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactagggattagtttgtttgacaaaatatagattgagcttgactt 40240631  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga--ccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |  ||   ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| ||| ||    
T  40240630 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatat 40240531  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40240530 tgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaaggcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgca 40240431  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40240430 tgactgttggcagtttgt 40240413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31883475 - 31883161
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31883475 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgatttg 31883376  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| || |  || ||| ||  |||| |||||| ||| |||||    
T  31883375 acgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgagactgatattga 31883276  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  31883275 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 31883176  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||| |||||    
T  31883175 ctgttggcattttgt 31883161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 43 - 316
Target Start/End: Original strand, 13929688 - 13929963
Alignment:
Q  43 acagaaacaaattcactggggattgggtt--tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataac 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| | |||      
T  13929688 acagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgtattgaaaggcagaaattgatcgatatt 13929787  T
Q  141 attggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt 240  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  13929788 attggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc 13929887  T
Q  241 attaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13929888 attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgt 13929963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 43 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23117938 - 23117675
Alignment:
Q  43 acagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacat 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  23117938 acagaaacaaattcacaggggattagttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattat 23117839  T
Q  143 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttat 242  Q
    |||||| |||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  23117838 tggctcccaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcat 23117739  T
Q  243 taaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgtt 306  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23117738 taaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgtt 23117675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 28889436 - 28889130
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||  |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28889436 ggtacaagctgtttttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattgt-tttttgacaaaatatagattgaaactgacttg 28889338  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| || ||||| ||||||||||  || |    
T  28889337 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaactgaccaaaattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagattgatgttaa 28889238  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    || |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  28889237 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggtgtgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgttatgcatga 28889138  T
Q  302 ctgttggc 309  Q
    ||||||||    
T  28889137 ctgttggc 28889130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 12662646 - 12662367
Alignment:
Q  30 gccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaat 129  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12662646 gccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattattgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaat 12662547  T
Q  130 tgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgat 229  Q
    ||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| |  ||||| |||||| ||   |||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  12662546 tgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgaatattgagttgagactgttgttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgat 12662447  T
Q  230 ataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggc 309  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12662446 ataacagtttcattaaatgcaggggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggc 12662367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12594021 - 12593704
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12594021 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgggggttagtttgtttgacaaaatatagattgagtttgactt 12593922  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga--ccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |  ||   ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |    
T  12593921 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgt 12593822  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  12593821 tgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttactaaatgcatgggcacgtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgcctgtaatgca 12593722  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  12593721 tgactgttgacagtttgt 12593704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 316
Target Start/End: Original strand, 27427578 - 27427824
Alignment:
Q  70 tttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatt 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||      
T  27427578 tttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacc 27427677  T
Q  170 tgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatg 269  Q
     ||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||    
T  27427678 cgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcctgaatgatataacagtttcattaaatgcatggacacgtaatatgcatg 27427777  T
Q  270 attatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27427778 attatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgt 27427824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 37944900 - 37945217
Alignment:
Q  1 tgggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-gacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37944900 tgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatatagattgagattgac 37944999  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    | |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   || || || || || |||||| |||  |    
T  37945000 tcgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgatatgagtatcgaattgagactgatgt 37945099  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  37945100 tgacattggaaacgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctggtaatgca 37945199  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  37945200 tgactattggcagtttgt 37945217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 20845030 - 20844791
Alignment:
Q  70 tttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatt 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||      
T  20845030 tttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaagtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacc 20844931  T
Q  170 tgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatg 269  Q
     | ||| || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  20844930 cgtcatgagtattgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcataggcacgtaatatgcatg 20844831  T
Q  270 attatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggc 309  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20844830 attatgcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgttggc 20844791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 11628223 - 11628537
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11628223 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgggggttggtttgttgacaaaatataaactgagattgacttg 11628322  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| |  |||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |  ||||| |||||| |||  ||||    
T  11628323 acgtcgatttgtattgaaaggcagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaatattgaattgagactgatgttga 11628422  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||| ||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11628423 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcactaaatgcatgggtacgtaatatgtatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 11628522  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    || |||||| |||||    
T  11628523 ctattggcattttgt 11628537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 45 - 316
Target Start/End: Original strand, 31867892 - 31868160
Alignment:
Q  45 agaaacaaattcactggggattgggtttt--tgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacat 142  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  ||    
T  31867892 agaaacagattcactggggattagttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggaagaaattgaccgatattat 31867991  T
Q  143 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttat 242  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||     |||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  31867992 tggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattgga-----aatatgcatggatgatataacagtctcat 31868086  T
Q  243 taaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  31868087 taaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgt 31868160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27397532 - 27397226
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27397532 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcactggggaatag-tttttgacaaaatatagattgaaattgacttg 27397434  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    || | ||    || |      |||| || | |||||  || |||||||| || | |||||||||||||||||||| | || || |||||| |||||||||    
T  27397433 acattgac---atgtcc----tagagatgggccaatggcactggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggtatcgaattgagactgaaattga 27397341  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  27397340 cattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 27397241  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  27397240 ctgttggcagtttgt 27397226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 19449455 - 19449763
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-gacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19449455 ggtacaagctgttcttggacttgaactaggcacttgaccaaacagaaacacattcactggggattagtttttttgacaaaatatagattgaaattgactt 19449554  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    ||| | ||    || |      |||| || | |||||  || |||||| | || | |||| ||||||||||||||| | ||  | |||||| ||||||||    
T  19449555 gacattgac---atgtcc----tagagatgggccaatggcactggctccccaggtcttgatagagaatttgacataggtatcaaattgagactgaaattg 19449647  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  19449648 acattgaaaatgcaatatacatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatg 19449747  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  19449748 actgttggcagtttgt 19449763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Original strand, 9343081 - 9343212
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9343081 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 9343180  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9343181 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 9343212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16168626 - 16168495
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16168626 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 16168527  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16168526 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 16168495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 27783371 - 27783240
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27783371 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 27783272  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27783271 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 27783240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 27810851 - 27810720
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27810851 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 27810752  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27810751 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 27810720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 198 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16168486 - 16168368
Alignment:
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16168486 ttgacattggaaatgcgatatgtatggatgatataacattttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16168387  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16168386 atgactgttggcagtttgt 16168368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 198 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27783231 - 27783113
Alignment:
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27783231 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27783132  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27783131 atgactgttggcagtttgt 27783113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 198 - 316
Target Start/End: Original strand, 39045116 - 39045234
Alignment:
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  39045116 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 39045215  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39045216 atgactgttggcagtttgt 39045234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 316
Target Start/End: Original strand, 9343221 - 9343339
Alignment:
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9343221 ttgacattggaaatgcgatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 9343320  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9343321 atgactgttggcagtttgt 9343339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27810711 - 27810593
Alignment:
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27810711 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27810612  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27810611 atgactgttggcagtttgt 27810593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Original strand, 39044975 - 39045106
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-gacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  39044975 ggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttcgacaaaatatagattgagattgactt 39045074  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39045075 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 39045106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3790667 - 3790534
Alignment:
Q  184 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataac-agttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtat 282  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||| | |||||| | ||  || |||||||||| ||| ||| ||    
T  3790667 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcat 3790568  T
Q  283 gaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  3790567 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgt 3790534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 26678037 - 26678351
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26678037 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttggcaaaatatagattgagattgacttg 26678136  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  26678137 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 26678236  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26678237 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 26678336  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  26678337 ctgttggcagtttgt 26678351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16048511 - 16048202
Alignment:
Q  7 caagctgttcttggat-cgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgt 105  Q
    ||||||| |||||||| |||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16048511 caagctgctcttggattcgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggattaggtttt-gacaaaatatagattgaaactgacttgacgt 16048413  T
Q  106 cgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacatt 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||| |||||| |||  ||| ||||    
T  16048412 cgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaacctaacataagtattgaattgagactgatgttggcatt 16048313  T
Q  206 ggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgt 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16048312 ggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatacatgtatgaatgctcgtaatgcatgactgt 16048213  T
Q  306 tggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||    
T  16048212 tggcagtttgt 16048202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 26662845 - 26663159
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26662845 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttggcaaaatatagattgagattgacttg 26662944  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  26662945 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 26663044  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26663045 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 26663144  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  26663145 ctgttggcagtttgt 26663159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Original strand, 26508644 - 26508955
Alignment:
Q  7 caagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgacttgacg 104  Q
    ||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26508644 caagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacg 26508743  T
Q  105 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||    
T  26508744 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacat 26508843  T
Q  205 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactg 304  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26508844 tgggaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatggttgtaatgcatgactg 26508943  T
Q  305 ttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||    
T  26508944 ttggcagtttgt 26508955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26596859 - 26596545
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26596859 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagttttttgacaaaatatagattgagattgacttg 26596760  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||     
T  26596759 acgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgt 26596660  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26596659 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatga 26596560  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  26596559 ctgttggcagtttgt 26596545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2780428 - 2780112
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt--tttgacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2780428 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgact 2780329  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||    
T  2780328 tgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgtt 2780229  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2780228 gacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 2780129  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||    
T  2780128 gactgttggcagtttgt 2780112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Original strand, 11417740 - 11418049
Alignment:
Q  7 caagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtc 106  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||| ||||  ||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11417740 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccgaacataaacaaattcacaggggattagttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtc 11417839  T
Q  107 gattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||    
T  11417840 gatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattg 11417939  T
Q  207 gaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgtt 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11417940 gaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 11418039  T
Q  307 ggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||    
T  11418040 ggcagtttgt 11418049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 16442937 - 16443251
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16442937 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcaatggggattagttttttgacaaaatatagattgaaactgacttg 16443036  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| | |   |||    
T  16443037 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattaaccaacgttgttggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactaatgctga 16443136  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16443137 tattggaaatgcaatatgtatggatgatataaaagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 16443236  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  16443237 ctgttggcagtttgt 16443251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5155264 - 5154952
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5155264 ggtacaagctgttcttggactcgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattag--ttttgacaaaatatagattgaaattgacttg 5155167  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  5155166 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 5155067  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5155066 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 5154967  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  5154966 ctgttggcagtttgt 5154952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5165565 - 5165253
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5165565 ggtacaagctgttcttggactcgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattag--ttttgacaaaatatagattgaaattgacttg 5165468  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   || || || ||| | |||||| ||| |||||    
T  5165467 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgatatgagtattaaattgagactgatattga 5165368  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5165367 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 5165268  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  5165267 ctgttggcagtttgt 5165253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 31557334 - 31557651
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt---gacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||    
T  31557334 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttgttctgacaaaatatagattgagattgac 31557433  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||  |||| |||||| |||  |    
T  31557434 ttgacgtcgattcgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatgt 31557533  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  31557534 tgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatgca 31557633  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||| |||||    
T  31557634 tgactgttggcattttgt 31557651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2161755 - 2161445
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-gacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  | |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  2161755 ggtacaagctgttcttggacttgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattggtttttttgacaaaatataggttgaaattgactt 2161656  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||    
T  2161655 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttg 2161556  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  2161555 acattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 2161456  T
Q  301 actgttggcag 311  Q
    | |||||||||    
T  2161455 attgttggcag 2161445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26442447 - 26442133
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26442447 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgagattgacttg 26442348  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    || |||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||  ||| || || ||||| |||||| |||  |||     
T  26442347 acatcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaagttttgacagagaacctgatatgagtattgaattgagactgatgttgt 26442248  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26442247 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 26442148  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  26442147 ctgttggcagtttgt 26442133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Original strand, 10909877 - 10910189
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt-----tgacaaaatatagattgagattg 96  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||    
T  10909877 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacggaaacatattcactggggattgttttttttttttgacaaaatatagattgagattg 10909976  T
Q  97 acttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaa 196  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||     
T  10909977 acttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgat 10910076  T
Q  197 attgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10910077 attgacattggaaatgcaatatgtatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 10910176  T
Q  297 catgactgttggc 309  Q
    || ||||||||||    
T  10910177 cacgactgttggc 10910189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 30 - 309
Target Start/End: Original strand, 16511404 - 16511688
Alignment:
Q  30 gccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt-----tgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggta 124  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16511404 gccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattgttttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggta 16511503  T
Q  125 gaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatgg 224  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  16511504 gaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatga 16511603  T
Q  225 atgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggc 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16511604 atgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggc 16511688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26520010 - 26519696
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26520010 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacctg 26519911  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || ||| || |||  ||||    
T  26519910 acatcgatttgatttgaaaggtagaaactgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgggactgatgttga 26519811  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26519810 cattggaactgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 26519711  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||| |||||    
T  26519710 ctgttggcattttgt 26519696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 45738489 - 45738169
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt------gacaaaatatagattgagatt 95  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||      |||||||||||||||||||||    
T  45738489 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgttgacaaaatatagattgagatt 45738390  T
Q  96 gacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattga 195  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||    
T  45738389 gacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga 45738290  T
Q  196 aattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaat 295  Q
      |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  45738289 tgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaat 45738190  T
Q  296 gcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  45738189 gcatgactgttggcattttgt 45738169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 5140267 - 5140584
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5140267 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgattt 5140366  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga--ccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |  ||   ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |    
T  5140367 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgt 5140466  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5140467 tgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 5140566  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5140567 tgactgttggcagtttgt 5140584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 43 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31131058 - 31130785
Alignment:
Q  43 acagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacat 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||| | |||  ||    
T  31131058 acagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttggtttgaaaggtaaaatttgatcgatattat 31130959  T
Q  143 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttat 242  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||  |||| |||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31130958 tggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatattgttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttat 31130859  T
Q  243 taaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31130858 taaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgt 31130785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 45394421 - 45394108
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt--tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||| |||||||| || |  |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45394421 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaagtatagattgagattgactt 45394322  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||  |  |||||| || || || |||||| |||  |||    
T  45394321 gacgtcgattcgatttgaaagatagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaga--acctgacatgagtatcgaattgagactgatgttg 45394224  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  45394223 acattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 45394124  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||| |||||    
T  45394123 actgttggcattttgt 45394108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11448092 - 11447777
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11448092 ggtacaagctgctcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttggcaaaatgtagattgagattgacttg 11447993  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  || ||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  11447992 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgtcatgagtattgaattgagactgatgttga 11447893  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  11447892 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggcacgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatg 11447793  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||| |||||    
T  11447792 actgttggcattttgt 11447777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22149071 - 22148756
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22149071 ggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgagattgacttg 22148972  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattga-aattg 200  Q
    || |||||| || |||||||| |||||| |||| |||  || |||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||   |||    
T  22148971 acatcgatttgaattgaaaggcagaaatcgaccgatattatcggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgtttg 22148872  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22148871 acattggaaatgcgatatgcatggatgatataatagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 22148772  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  22148771 actgttggcagtttgt 22148756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 24585467 - 24585782
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24585467 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 24585566  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| || |  || ||| ||  |||| |||||| ||| ||||    
T  24585567 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgagactgatattg 24585666  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  24585667 atattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatg 24585766  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  24585767 actgttggcagtttgt 24585782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 31083555 - 31083870
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatc-gaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttt-ttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31083555 ggtacaagctgttcttggacctgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggaggttggtttggttgacaaaatatagattgagattgattt 31083654  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    ||| |||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||  |||| |||||| |||  |||    
T  31083655 gacatcgatttgaattgaaaggtagaaattgactgataacattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtgttgaattgagactgatgttg 31083754  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31083755 tcattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 31083854  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||| ||||||||||||    
T  31083855 actattggcagtttgt 31083870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 43 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4206539 - 4206264
Alignment:
Q  43 acagaaacaaattcactggggattgggtt--tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataac 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| | |||      
T  4206539 acagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgtattgaaaggcagaaattgatcgatatt 4206440  T
Q  141 attggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt 240  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  4206439 attggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattc 4206340  T
Q  241 attaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    | |||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  4206339 actaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgt 4206264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 26312796 - 26313110
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26312796 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatataaattgagattgacttg 26312895  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||  ||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  ||||    
T  26312896 acgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttga 26312995  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||| || | ||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26312996 tattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 26313095  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    || |||||| |||||    
T  26313096 ctattggcattttgt 26313110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 157 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10848633 - 10848474
Alignment:
Q  157 ttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggca 256  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10848633 ttgacagagaatttgacaaaagtattggattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcagatgtatgggca 10848534  T
Q  257 catagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  10848533 cgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgt 10848474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 198 - 316
Target Start/End: Original strand, 39206293 - 39206411
Alignment:
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  39206293 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 39206392  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  39206393 atgactgttggcattttgt 39206411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 132
Target Start/End: Original strand, 16744508 - 16744640
Alignment:
Q  2 gggtacaagctgttcttggatc-gaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744508 gggtacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgact 16744607  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 132  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16744608 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 16744640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 198 - 316
Target Start/End: Original strand, 4138374 - 4138492
Alignment:
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4138374 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4138473  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4138474 atgactgttggcagtttgt 4138492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 132
Target Start/End: Original strand, 4138233 - 4138365
Alignment:
Q  2 gggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4138233 gggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactagggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgact 4138332  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 132  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4138333 tgacatcgatttgatttgaaaggtagaaattga 4138365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 316
Target Start/End: Original strand, 16744649 - 16744767
Alignment:
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16744649 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16744748  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16744749 atgactgttggcagtttgt 16744767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Original strand, 39206153 - 39206284
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttt-ttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206153 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgggggttagtttgcttgacaaaatatagattgagattgactt 39206252  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39206253 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 39206284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 10848738 - 10848680
Alignment:
Q  45 agaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  10848738 agaaacaaattcactagggattagttttttgacaaaatataaattgaaattgacttgac 10848680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3452252 - 3452119
Alignment:
Q  184 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataac-agttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtat 282  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||| | |||||| | ||  || |||||||||| ||| ||| ||    
T  3452252 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcat 3452153  T
Q  283 gaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  3452152 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgt 3452119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 316
Target Start/End: Original strand, 26268219 - 26268333
Alignment:
Q  203 attggaaatgcaatatgtatggatgatataac-agttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||| | |||||| | ||  || |||||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  26268219 attggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattgaaatgcatga 26268318  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
      |||| ||||||||    
T  26268319 tggttgacagtttgt 26268333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 67
Target Start/End: Original strand, 26267896 - 26267961
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattg 67  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  26267896 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattg 26267961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13225 - 12908
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgg---gtttttgacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13225 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttttgacaaaatatagattgagattgac 13126  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |    
T  13125 ttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgt 13026  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13025 tgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 12926  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12925 tgactgttggcagtttgt 12908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 20333465 - 20333780
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-gacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20333465 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccactagaccgaacagaaacaaattcattggggattagtttttttgacaaaatgtagattgagattgactt 20333564  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||| || ||| |||   ||    
T  20333565 gaagtcgatttggtttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgggtattgaattcagactgatgctg 20333664  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20333665 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 20333764  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  20333765 actgttggcagtttgt 20333780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 51645427 - 51645116
Alignment:
Q  7 caagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgacttgacg 104  Q
    ||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51645427 caagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgaca 51645328  T
Q  105 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacat 204  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||| |||    
T  51645327 tcgatttgatttgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgtcat 51645228  T
Q  205 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51645227 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactg 51645128  T
Q  305 ttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||    
T  51645127 ttggcagtttgt 51645116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 14691968 - 14692280
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14691968 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatct--tttttgacaaaatatagattgagattgacttg 14692065  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  14692066 acgtcgatttgatttgaaaggtaggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatgttga 14692165  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  14692166 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgg 14692265  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  14692266 ctgttggcagtttgt 14692280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 14694650 - 14694962
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14694650 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatct--tttttgacaaaatatagattgagattgacttg 14694747  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  14694748 acgtcgatttgatttgaaaggtaggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatgttga 14694847  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  14694848 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgg 14694947  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  14694948 ctgttggcagtttgt 14694962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 14697334 - 14697646
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14697334 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatct--tttttgacaaaatatagattgagattgacttg 14697431  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  14697432 acgtcgatttgatttgaaaggtaggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatgttga 14697531  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  14697532 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgg 14697631  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  14697632 ctgttggcagtttgt 14697646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 14700015 - 14700327
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14700015 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatct--tttttgacaaaatatagattgagattgacttg 14700112  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  14700113 acgtcgatttgatttgaaaggtaggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatgttga 14700212  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  14700213 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgg 14700312  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  14700313 ctgttggcagtttgt 14700327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20467998 - 20467679
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttg-----acaaaatatagattgagattg 96  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||      |||||||||||||||| | ||    
T  20467998 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcactggggattagttttttttttgtacaaaatatagattgaaactg 20467899  T
Q  97 acttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaa 196  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||     
T  20467898 acttgacgtggatttgatttgaaaggtagaaattgaccagtattattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgat 20467799  T
Q  197 attgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatg 296  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20467798 gctgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 20467699  T
Q  297 catgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  20467698 catgactgttggcagcttgt 20467679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28592291 - 28591975
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt---tgacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||| |||||||| || |  |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  28592291 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgact 28592192  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    | || | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||    
T  28592191 taacattgattcgatttgaaaggtagaaattgaccgatactattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgtt 28592092  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28592091 gacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 28591992  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||    
T  28591991 gactgttggcagtttgt 28591975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 16201078 - 16201394
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt--tgacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||||||||||||  ||||||    
T  16201078 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactagggattagttttttttgacaaaatatagattgaagttgact 16201177  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  ||    
T  16201178 ggacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgatcaatattattggctcacaagattttgatagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatgtt 16201277  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16201278 gacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 16201377  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||    
T  16201378 gactgttggcagtttgt 16201394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10969852 - 10969537
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10969852 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccagacagaaacatattcactggggattggtttgttggcaaaatgtagattgagattgacttg 10969753  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  10969752 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 10969653  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  10969652 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 10969553  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  10969552 actgttggcagtttgt 10969537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 41786384 - 41786698
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| || |  |||||| ||||| || |||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41786384 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatattcaccggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattggcttg 41786483  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  41786484 acgtcgatttgatttgaaaggcggaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 41786583  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  41786584 cattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 41786683  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||| |||||    
T  41786684 ctgttggcattttgt 41786698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28156915 - 28156599
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt---gacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||| |||||||| || |  |||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  28156915 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgactggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgact 28156816  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  ||    
T  28156815 tgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgtt 28156716  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28156715 gacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 28156616  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||| |||||    
T  28156615 gactgttggcattttgt 28156599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10952301 - 10951986
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10952301 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccagacagaaacatattcactggggattggtttgttggcaaaatgtagattgagattgacttg 10952202  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||  || ||| ||  |||| |||||| ||| |||||    
T  10952201 acgtcgatttgatttgaaaggtagaagttgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaagaacctgtcatgagttttgaattgagactgatattga 10952102  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  10952101 tattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 10952002  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  10952001 actgttggcagtttgt 10951986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 309
Target Start/End: Original strand, 21890827 - 21891106
Alignment:
Q  30 gccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaat 129  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21890827 gccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattgtttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaat 21890926  T
Q  130 tgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgat 229  Q
    ||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  | |||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  21890927 tgaccgatattattggcacacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatgtcgacattggaaatgcaacatgcatgaatgat 21891026  T
Q  230 ataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggc 309  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  21891027 ataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcctgtaatgcacgactgttggc 21891106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3648363 - 3648041
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3648363 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgaggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 3648264  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt--gaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||   ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |    
T  3648263 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgt 3648164  T
Q  199 tgacattggaaatgc-----aatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgca 293  Q
    |||||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  3648163 tgacattggaaatgcgatatgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 3648064  T
Q  294 atgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  3648063 atgcatgactgttggcagtttgt 3648041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 30 - 316
Target Start/End: Original strand, 21341226 - 21341512
Alignment:
Q  30 gccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaat 129  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21341226 gccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaat 21341325  T
Q  130 tgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgat 229  Q
    ||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || | ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21341326 tgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtactgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgat 21341425  T
Q  230 ataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21341426 ataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgt 21341512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9361815 - 9361498
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt---gacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  9361815 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgac 9361716  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |    
T  9361715 ttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgt 9361616  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  9361615 tgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 9361516  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||| |||||    
T  9361515 tgactgttggcattttgt 9361498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 44568191 - 44567876
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  44568191 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttggcataatatagattgagattgacttg 44568092  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  44568091 acgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 44567992  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  44567991 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 44567892  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||| |||||    
T  44567891 actgttggcattttgt 44567876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 309
Target Start/End: Original strand, 19910198 - 19910502
Alignment:
Q  7 caagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattg--ggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacg 104  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19910198 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattattgttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacg 19910297  T
Q  105 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| ||| ||||||||    
T  19910298 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatattgacat 19910397  T
Q  205 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactg 304  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19910398 tggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactg 19910497  T
Q  305 ttggc 309  Q
    |||||    
T  19910498 ttggc 19910502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16261119 - 16260808
Alignment:
Q  7 caagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt--gacaaaatatagattgagattgacttgacg 104  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261119 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcattggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacg 16261020  T
Q  105 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||    
T  16261019 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgactaatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacat 16260920  T
Q  205 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactg 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  16260919 tggaaatgcaatatgcatggatgatataacggtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgttatgcatgactg 16260820  T
Q  305 ttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||    
T  16260819 ttggcagtttgt 16260808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18716668 - 18716351
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt---gacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  18716668 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgac 18716569  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |    
T  18716568 ttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgt 18716469  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18716468 tgacattggaagtgcgatatgcgtggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 18716369  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||| |||||    
T  18716368 tgactgttggcattttgt 18716351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19681666 - 19681351
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19681666 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttggcaaaatgtagattgagattgacttg 19681567  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  19681566 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 19681467  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| || || |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  19681466 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatg 19681367  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||| |||||    
T  19681366 actgttggcattttgt 19681351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 309
Target Start/End: Original strand, 27601946 - 27602248
Alignment:
Q  7 caagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtc 106  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27601946 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccgaacagaaacaaaatcacaggggattagttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtc 27602045  T
Q  107 gattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||    
T  27602046 gatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattg 27602145  T
Q  207 gaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgtt 306  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27602146 gaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 27602245  T
Q  307 ggc 309  Q
    |||    
T  27602246 ggc 27602248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15774760 - 15774449
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgg---gtttttgacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||| ||| |||| || |  |||||| |||||  |||||||| ||||||||||  || |    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15774760 ggtacaagctgctctaggattgagctagccacttgaccaagcagaaacagattcactgggatttagtttttttttgacaaaatatagattgaaattgact 15774661  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||    
T  15774660 tgacgtcaattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgtt 15774561  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15774560 gacattggaaatgcgacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 15774461  T
Q  300 gactgttggcag 311  Q
    ||||||||||||    
T  15774460 gactgttggcag 15774449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29836534 - 29836218
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt--tttgacaaaatatagattgagattgact 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29836534 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaagtatagattgagattgact 29836435  T
Q  100 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt 199  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  ||    
T  29836434 taacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgaccggtattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgtt 29836335  T
Q  200 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  29836334 gacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 29836235  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||| |||||    
T  29836234 gactgttggcattttgt 29836218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Original strand, 2130296 - 2130603
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  2130296 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttttttgacaaagtataggttgaaattgacttg 2130395  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| ||| |||||    
T  2130396 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgacattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatattga 2130495  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  2130496 cattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 2130595  T
Q  302 ctgttggc 309  Q
    ||| ||||    
T  2130596 ctgctggc 2130603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 12085738 - 12086055
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt---gacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||    
T  12085738 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttgttctgacaaaatatagattgagattgac 12085837  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| ||  | || |||||| |||  |    
T  12085838 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaagaacctgacatgagtttcgaattgagactgatgt 12085937  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    |||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12085938 tgatgttggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 12086037  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||| |||||    
T  12086038 tgactgttggcattttgt 12086055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22140030 - 22139784
Alignment:
Q  70 tttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatt 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||      
T  22140030 tttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgtcagagaacc 22139931  T
Q  170 tgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatg 269  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  22139930 tgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgacataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatg 22139831  T
Q  270 attatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22139830 attatgcgtgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgt 22139784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Original strand, 31482888 - 31483198
Alignment:
Q  5 tacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgac 103  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31482888 tacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatggg--ttttgacaaaatatagattgagattgacttgac 31482985  T
Q  104 gtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgaca 203  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||||    
T  31482986 gtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaagttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgaca 31483085  T
Q  204 ttggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgact 303  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31483086 ttggaaatgcactgtgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgact 31483185  T
Q  304 gttggcagtttgt 316  Q
    || ||||||||||    
T  31483186 gtcggcagtttgt 31483198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19695299 - 19694993
Alignment:
Q  7 caagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattg----ggtttttgacaaaatatagattgagattgacttga 102  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19695299 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattgttgttttttttgacaaaatatagattgagattgacttga 19695200  T
Q  103 cgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgac 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| ||| ||||||    
T  19695199 cgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatattgac 19695100  T
Q  203 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgac 302  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19695099 attggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 19695000  T
Q  303 tgttggc 309  Q
    |||||||    
T  19694999 tgttggc 19694993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31361739 - 31361424
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31361739 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggatcggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttg 31361640  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt-g 200  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||  |||   |||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||||  |||||  ||  || |    
T  31361639 acgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgactgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaaatgagacggatgtttg 31361540  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31361539 atattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 31361440  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  31361439 actgttggcagtttgt 31361424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 33249547 - 33249240
Alignment:
Q  7 caagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgg-----gtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33249547 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacaggttcactggggattggtttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttg 33249448  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || |||||  ||||| |||  ||||    
T  33249447 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaactgagactgatgttga 33249348  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  33249347 cattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 33249248  T
Q  302 ctgttggc 309  Q
    ||||||||    
T  33249247 ctgttggc 33249240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 14570340 - 14570032
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-gacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  14570340 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgactt 14570241  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  |||    
T  14570240 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatgttg 14570141  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  14570140 acattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 14570041  T
Q  301 actgttggc 309  Q
    | |||||||    
T  14570040 attgttggc 14570032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33265937 - 33265615
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt--------tgacaaaatatagattgaga 93  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||        ||||||||||||||||||||    
T  33265937 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgttttttattttttttgacaaaatatagattgaga 33265838  T
Q  94 ttgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagatt 193  Q
    ||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |    
T  33265837 ttgacttgacgccgatttaaattgaaaagtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagact 33265738  T
Q  194 gaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgca 293  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  33265737 gatgttgacattggaaatgcgatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatggatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 33265638  T
Q  294 atgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33265637 atgcatgactgttggcagtttgt 33265615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 313
Target Start/End: Original strand, 19654350 - 19654665
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgg----gtttttgacaaaatatagattgagattga 97  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| |     ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  19654350 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttttttttttgacaaaatataggttgaaattga 19654449  T
Q  98 cttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaa 197  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||  | |||| || ||||| |||||| |||      
T  19654450 cttgacgtcggtttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgatagagaacctaacatgagtattgaattgagactgatg 19654549  T
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  19654550 ttgacattggaaattcaatatgcatggatgatatgacagtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgt 19654649  T
Q  298 atgactgttggcagtt 313  Q
    |||||||||| |||||    
T  19654650 atgactgttgacagtt 19654665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 70 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18797825 - 18797579
Alignment:
Q  70 tttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatt 169  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||||| ||||| |||||||||||||      
T  18797825 tttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcaatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggcttacaaggttttgacagagaacc 18797726  T
Q  170 tgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatg 269  Q
    ||||||||| ||||| |||| | |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  18797725 tgacataagtattgaattgaaactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatg 18797626  T
Q  270 attatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18797625 attatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgt 18797579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 296
Target Start/End: Original strand, 22388891 - 22389190
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatc-gaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt-----tgacaaaatatagattgagattg 96  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  | |||| ||||| || |||||| |||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||    
T  22388891 ggtacaagctgttcttggatttgaactagtcacttgaccaaacggaaacatattcactggggattgttttttttttttgacaaaatatagattgagattg 22388990  T
Q  97 acttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaa 196  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||     
T  22388991 acttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgat 22389090  T
Q  197 attgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatg 296  Q
     | |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22389091 gtcgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 22389190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Original strand, 22074081 - 22074254
Alignment:
Q  143 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttat 242  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| | || || | |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  22074081 tggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggtatcgaatcgagactgtaattgacattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagttttat 22074180  T
Q  243 taaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22074181 taaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgt 22074254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Original strand, 28355021 - 28355152
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355021 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 28355120  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28355121 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 28355152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 198 - 316
Target Start/End: Original strand, 19201592 - 19201710
Alignment:
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19201592 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 19201691  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19201692 atgactgttggcagtttgt 19201710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 316
Target Start/End: Original strand, 28355161 - 28355279
Alignment:
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  28355161 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaacgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28355260  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28355261 atgactgttggcagtttgt 28355279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Original strand, 19201452 - 19201583
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19201452 ggtacaagctgtccttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 19201551  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19201552 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 19201583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15775482 - 15775349
Alignment:
Q  184 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataac-agttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtat 282  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||| | |||||| | ||  || |||||||||| ||| ||| ||    
T  15775482 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcat 15775383  T
Q  283 gaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  15775382 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgt 15775349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 103
Target Start/End: Original strand, 22073948 - 22074048
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  22073948 ggtacaaggtgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcattggggattag-tttttggcaaaatataaattgaaattgacttg 22074046  T
Q  102 ac 103  Q
    ||    
T  22074047 ac 22074048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 7991 - 8305
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7991 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttg 8090  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  8091 acgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 8190  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8191 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 8290  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||| |||||    
T  8291 ctgttggcattttgt 8305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11127 - 10811
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11127 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 11028  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattg 200  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| ||| ||||    
T  11027 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatattg 10928  T
Q  201 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcat 299  Q
      |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10927 ttattggaaatgtaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 10828  T
Q  300 gactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||||    
T  10827 gactgttggcagtttgt 10811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 34484 - 34172
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttg-----acaaaatatagattgagattg 96  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||  | ||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||||      ||||||||||| |||| ||||    
T  34484 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccgtttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttttttttttgtacaaaatataggttgaaattg 34385  T
Q  97 acttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaa 196  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| ||      
T  34384 acttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgtt 34285  T
Q  197 attgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatg 296  Q
     |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  34284 gttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 34185  T
Q  297 catgactgttggc 309  Q
    |||||||||||||    
T  34184 catgactgttggc 34172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0685 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0685
Description:

Target: scaffold0685; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 43 - 303
Target Start/End: Original strand, 1154 - 1414
Alignment:
Q  43 acagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacat 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  1154 acagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattat 1253  T
Q  143 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttat 242  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||  |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  1254 tggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcat 1353  T
Q  243 taaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgact 303  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1354 taaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgact 1414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 2226 - 2541
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||| | |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2226 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacagaggatcggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttg 2325  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  2326 acgtcgattcgatttgaaagatagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 2425  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatg 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  2426 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatg 2525  T
Q  301 actgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||| |||||    
T  2526 actgttggcattttgt 2541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 302
Target Start/End: Original strand, 23646 - 23948
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||  |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23646 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcaaaggggatcggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttg 23745  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||    
T  23746 acgtcgattcgatttgaaagatagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttga 23845  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgc-ttgcaatgcat 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  23846 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctttgtaatgcat 23945  T
Q  300 gac 302  Q
    |||    
T  23946 gac 23948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Original strand, 3661 - 3972
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt----gacaaaatatagattgagattga 97  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||    
T  3661 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttatttgacaaaatatagattgagattga 3760  T
Q  98 cttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaa 197  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| || ||||| |||||| |||      
T  3761 cttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttggcagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatg 3860  T
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3861 ttgacattggaaatgcgatatgcgtggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 3960  T
Q  298 atgactgttggc 309  Q
    ||||||||||||    
T  3961 atgactgttggc 3972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15151 - 14834
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt---tgacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||   |||| ||| ||||||||||||||||    
T  15151 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaacatagattgagattgac 15052  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||||||||||   |||  ||||| |||||||  ||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |    
T  15051 ttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgattgatattattggatcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgt 14952  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14951 tgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 14852  T
Q  299 tgactgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||| |||||    
T  14851 tgactgttggcattttgt 14834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13258 - 12947
Alignment:
Q  7 caagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgg----gtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||||| ||||||| |||||| |     ||||||||||||| || ||||| | |||||||    
T  13258 caagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaacagaaacacattcacttgggattagttttttttttgacaaaatgtaaattgaaactgacttg 13159  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||  |||| | |||  ||||    
T  13158 acgtcgatttgatttgaaagataaaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgggttgaaactgatgttga 13059  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  13058 cattggaaatgcaatatgcatgggtgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatga 12959  T
Q  302 ctgttggcagtt 313  Q
    ||||||||||||    
T  12958 ctgttggcagtt 12947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2667 - 2549
Alignment:
Q  198 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgc 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2667 ttgacattggaaatgcaatatgcatggttgatataacagtttcattaaatgcatggatacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 2568  T
Q  298 atgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  2567 atgactgttggcattttgt 2549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2807 - 2676
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtt-tttgacaaaatatagattgagattgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2807 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacaggaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 2708  T
Q  101 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 132  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2707 gacgtcgatttggtttgaaaggtagaaattga 2676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 309
Target Start/End: Original strand, 24047 - 24330
Alignment:
Q  30 gccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt----tgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtag 125  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24047 gccacttgaccaaacagaaacagattcactagggattgtttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaagtag 24146  T
Q  126 aaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatgga 225  Q
    ||||||||| ||   ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  24147 aaattgaccgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaa 24246  T
Q  226 tgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggc 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  24247 tgatataacagttttattaaatgcatgggcatgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgctggc 24330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16788 - 16468
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt------gacaaaatatagattgagatt 95  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||  |||||      |||||||||||||||||||||    
T  16788 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacaaaaacatattcactggggattgtttttttttttttgacaaaatatagattgagatt 16689  T
Q  96 gacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattga 195  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||    
T  16688 gacttggcgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga 16589  T
Q  196 aattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaat 295  Q
      |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||| |||    
T  16588 tgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattgtgcatgtatgaatgcttgtaat 16489  T
Q  296 gcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  16488 gcatgactgttggcattttgt 16468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Original strand, 8707 - 9017
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgg---gtttttgacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| |    ||||||||||| |||| |||||||||||     
T  8707 ggtacaagctgttcttggactcgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttttgacaaagtataaattgagattgaa 8806  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||| | |||||| ||| ||    
T  8807 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattaaattgagactgatat 8906  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||||||||   |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8907 tgacattgatgatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 9006  T
Q  299 tgactgttggc 309  Q
    |||||||||||    
T  9007 tgactgttggc 9017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 302
Target Start/End: Original strand, 13022 - 13325
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttt---tgacaaaatatagattgagattgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  13022 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaatatagattgagattgac 13121  T
Q  99 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaat 198  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||||||||||   |||  ||||| | |||||  ||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |    
T  13122 ttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgattgatattattggattacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgt 13221  T
Q  199 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgca 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13222 tgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 13321  T
Q  299 tgac 302  Q
    ||||    
T  13322 tgac 13325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28491 - 28185
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28491 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcactggggattag-tttttgacaaaatatagattgaaattgacttg 28393  T
Q  102 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattga 201  Q
    || | ||    || |      |||| || | |||||  || |||||||| || | |||||||||||||||||| | | || || |||||| |||||||||    
T  28392 acattgac---atgtcc----tagagatgggccaatggcactggctcaccaggtcttgacagagaatttgacacaggtatcgaattgagactgaaattga 28300  T
Q  202 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatga 301  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  28299 catgggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 28200  T
Q  302 ctgttggcagtttgt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  28199 ctgttggcagtttgt 28185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 157 - 316
Target Start/End: Original strand, 25774 - 25933
Alignment:
Q  157 ttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggca 256  Q
    |||||||||||||||||||| | || || |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25774 ttgacagagaatttgacataggtatcgaattgagactgaaattgacattggaaatgaaagatgtatgggtggtataatagttttatcaaatgtatgggca 25873  T
Q  257 catagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgt 316  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25874 catagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgt 25933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Original strand, 25627 - 25725
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggtttttgacaaaatatagattgagattgacttg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  25627 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcactggggatt-agtttttgacaaaatataaattgaaattaacttg 25725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 309
Target Start/End: Original strand, 39725 - 39973
Alignment:
Q  70 tttttgacaaaa-tatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggt-agaaatt-gaccaataacattgg-ctcacaagattttgacagag 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  39725 tttttgacaaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggttagaaatttgaccgatattattggtctcacaaggttttgacagag 39824  T
Q  166 aatttgacataagca-ttgatttgagattgaaattgacattggaaat-gcaatatgtatgga-tgatataacagtttta-ttaaatgtat-gggcacata 260  Q
    ||   ||||| || | |||| |||||| |||  |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||| ||    
T  39825 aacccgacatgagtaattgaattgagactgatgttgacattggaaatagcaacatgcatggaatgatataacagtttcaattaaatgcattgggcacgta 39924  T
Q  261 gtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggc 309  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39925 atatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggc 39973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 203 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 778 - 665
Alignment:
Q  203 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgcaatgcatgac 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  778 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcactttgtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgat 679  T
Q  303 tgttggcagtttgt 316  Q
    ||| ||||| ||||    
T  678 tgtgggcagcttgt 665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7005 - 6850
Alignment:
Q  7 caagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaattcactggggattgggttttt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgt 105  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  7005 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattgttttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgc 6906  T
Q  106 cgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaagattttgac 161  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  6905 tgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgac 6850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 11)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 55
Target Start/End: Original strand, 1298 - 1350
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaatt 55  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1298 ggtacgagctgttcttggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaatt 1350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 1353 - 1405
Alignment:
Q  1 tgggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  1353 tgggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccagacagaaacaaa 1405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 55
Target Start/End: Original strand, 1406 - 1458
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaatt 55  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1406 ggtacgagctgttcttggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaatt 1458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 1461 - 1513
Alignment:
Q  1 tgggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  1461 tgggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccagacagaaacaaa 1513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 55
Target Start/End: Original strand, 1514 - 1566
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaatt 55  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1514 ggtacgagctgttcttggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaatt 1566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 1569 - 1621
Alignment:
Q  1 tgggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  1569 tgggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccagacagaaacaaa 1621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 55
Target Start/End: Original strand, 1622 - 1674
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaatt 55  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1622 ggtacgagctgttcttggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaatt 1674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 1677 - 1729
Alignment:
Q  1 tgggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  1677 tgggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccagacagaaacaaa 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 55
Target Start/End: Original strand, 1730 - 1782
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaatt 55  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1730 ggtacgagctgttcttggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaatt 1782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Original strand, 1247 - 1297
Alignment:
Q  3 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgaccatacagaaacaaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  1247 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccacacagaaacaaa 1297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 1785 - 1825
Alignment:
Q  1 tgggtacaagctgttcttggatcgaacctgccactcgacca 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  1785 tgggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgacca 1825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University