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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF10260_low_7 (Length: 526)
Name: NF10260_low_7
Description: NF10260
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF10260_low_7 |
 |  |
|
| [»] scaffold0078 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0266 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0023 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0077 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0195 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0106 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0175 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0302 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0413 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0008 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0012 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0218 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0025 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0498 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0162 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0141 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0124 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0049 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0018 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0132 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0125 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0026 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1542 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0215 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0075 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0028 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0529 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0622 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0076 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0022 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0772 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0369 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0116 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0139 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0104 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1560 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0420 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0034 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0016 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1711 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0184 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0066 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0686 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1404 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0361 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0342 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0053 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0021 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0483 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0109 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1164 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0122 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1734 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0396 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0456 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0240 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0160 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0123 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0084 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0058 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0044 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0970 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0507 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 426; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 16744508 - 16743991
Alignment:
| Q |
7 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaattcacaaatt |
106 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16744508 |
aatgagatcaacatcaactatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatt |
16744409 |
T |
 |
| Q |
107 |
tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16744408 |
tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaaca |
16744309 |
T |
 |
| Q |
207 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16744308 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactataacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaa |
16744209 |
T |
 |
| Q |
307 |
atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaa |
406 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16744208 |
atgtaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttaacaacaatcatccataatcaa |
16744109 |
T |
 |
| Q |
407 |
aattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacc-ccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactt |
505 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16744108 |
aattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacctcgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactt |
16744009 |
T |
 |
| Q |
506 |
tggctcctatgcttctcc |
523 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16744008 |
tagctcctatgattctcc |
16743991 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 111 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 17912771 - 17912483
Alignment:
| Q |
111 |
caaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacat |
210 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
17912771 |
caaaacacccacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacat |
17912672 |
T |
 |
| Q |
211 |
caattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg |
310 |
Q |
| |
|
| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17912671 |
cgattgaacatgaatcatagctcaattcaactacaacatatcaaattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgt |
17912572 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17912571 |
aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatc-aagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
17912483 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 105 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 12030443 - 12030073
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | | |
|
|
| T |
12030443 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaacca |
12030344 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||| | |||| | ||| | ||| | |||| |||| | ||| |||||| ||||| ||||| ||| || ||||||||| |
|
|
| T |
12030343 |
tagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttg |
12030244 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |
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|
| T |
12030243 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag |
12030144 |
T |
 |
| Q |
404 |
caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
12030143 |
caaaagtcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataatgattaacccccttacctta |
12030073 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 105 - 473
Target Start/End: Original strand, 2049777 - 2050147
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | |
|
|
| T |
2049777 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
2049876 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||| ||||| | ||||| | ||| ||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| || || |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
2049877 |
tagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttg |
2049976 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
2049977 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag |
2050076 |
T |
 |
| Q |
404 |
caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
2050077 |
caaaattgatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta |
2050147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 105 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 14842856 - 14842487
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
14842856 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatcca |
14842758 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
14842757 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttg |
14842658 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14842657 |
aacatgcaatttcaccaacaatcatacaattatcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat |
14842558 |
T |
 |
| Q |
404 |
caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14842557 |
cacaattcatacaacatttgagaatttgcaaagtgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta |
14842487 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 473
Target Start/End: Original strand, 13838770 - 13839232
Alignment:
| Q |
5 |
gcaatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaattcacaaa |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| | || || |||||| || |
|
|
| T |
13838770 |
gcaatgagattatcatcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcattcattccatcatatttcaacaacaacatgtcgta--------attcaccaa |
13838861 |
T |
 |
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||| || |||||| || ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| || | | |
|
|
| T |
13838862 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca |
13838960 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |
|
|
| T |
13838961 |
taacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg |
13839060 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
13839061 |
aacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattattcataat |
13839160 |
T |
 |
| Q |
404 |
caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13839161 |
caaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta |
13839232 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 94 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 15859331 - 15858996
Alignment:
| Q |
94 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct |
193 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
15859331 |
caattcaccattttcaccaaaacaacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
15859232 |
T |
 |
| Q |
194 |
attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcattt |
292 |
Q |
| |
|
|||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
15859231 |
attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt |
15859132 |
T |
 |
| Q |
293 |
ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa |
392 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15859131 |
gttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaa |
15859032 |
T |
 |
| Q |
393 |
tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa |
426 |
Q |
| |
|
| |||||| || ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15859031 |
ttatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaa |
15858996 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 234 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 2449404 - 2449238
Alignment:
| Q |
234 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
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| T |
2449404 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
2449305 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
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| T |
2449304 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
2449238 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 51158325 - 51158008
Alignment:
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94 |
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192 |
Q |
| |
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| T |
51158325 |
caattcacaaattt-agcaaaacacttaacaacatctcaaattaacatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatc |
51158227 |
T |
 |
| Q |
193 |
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291 |
Q |
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| T |
51158226 |
aattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt |
51158127 |
T |
 |
| Q |
292 |
tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaaca |
391 |
Q |
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| T |
51158126 |
tttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaca |
51158027 |
T |
 |
| Q |
392 |
atcatccataatcaaaatt |
410 |
Q |
| |
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| T |
51158026 |
attatccataagcaaaatt |
51158008 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 105 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15936922 - 15936634
Alignment:
| Q |
105 |
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204 |
Q |
| |
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| T |
15936922 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca |
15936824 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
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| T |
15936823 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg |
15936724 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat |
393 |
Q |
| |
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|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |
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| T |
15936723 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat |
15936634 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 338 - 521
Target Start/End: Original strand, 19231982 - 19232169
Alignment:
| Q |
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434 |
Q |
| |
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|
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| T |
19231982 |
atcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaa |
19232081 |
T |
 |
| Q |
435 |
aatgatgatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct |
521 |
Q |
| |
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|
| T |
19232082 |
aatgatgatgattaagataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
19232169 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 105 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15938764 - 15938476
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
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| T |
15938764 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcagcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca |
15938666 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
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| T |
15938665 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg |
15938566 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat |
393 |
Q |
| |
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| T |
15938565 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaat |
15938476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15468717 - 15468520
Alignment:
| Q |
18 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaatt-cacaaatttcaccaaaac |
116 |
Q |
| |
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| T |
15468717 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatacattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaatttcaccaaaac |
15468618 |
T |
 |
| Q |
117 |
accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat |
214 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| || |||||||||||| |
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| T |
15468617 |
aacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaat |
15468520 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 112 - 388
Target Start/End: Original strand, 15614808 - 15615085
Alignment:
| Q |
112 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
211 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15614808 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc |
15614907 |
T |
 |
| Q |
212 |
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310 |
Q |
| |
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| T |
15614908 |
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15615007 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca |
388 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || || ||| |||||||||| ||||| |
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| T |
15615008 |
aatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagca |
15615085 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 400
Target Start/End: Original strand, 45860773 - 45861068
Alignment:
| Q |
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
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| T |
45860773 |
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T |
 |
| Q |
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caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
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| T |
45860872 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttattt |
45860971 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
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| T |
45860972 |
aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
45861068 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 22275088 - 22275285
Alignment:
| Q |
18 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaatt-cacaaatttcaccaaaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |
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| T |
22275088 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcactaatttcacaaatttcaccaaaac |
22275187 |
T |
 |
| Q |
117 |
accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat |
214 |
Q |
| |
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| T |
22275188 |
accaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaat |
22275285 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13955185 - 13954890
Alignment:
| Q |
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
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|
| T |
13955185 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattatcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca |
13955087 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
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| T |
13955086 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttattt |
13954987 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
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| T |
13954986 |
aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
13954890 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13976017 - 13975722
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| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
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| T |
13976017 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattatcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca |
13975919 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
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| T |
13975918 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttattt |
13975819 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
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|
|
| T |
13975818 |
aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
13975722 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 354 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 19260869 - 19260749
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aaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggta |
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Q |
| |
|
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|
| T |
19260869 |
aaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatccataaaaaaaattcatacaacatttgaaaacttacaaaatgatgatgattatgata |
19260770 |
T |
 |
| Q |
454 |
aagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
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| T |
19260769 |
aagactaacccccttacctta |
19260749 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
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Query Start/End: Original strand, 105 - 388
Target Start/End: Original strand, 55316187 - 55316471
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| Q |
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
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| T |
55316187 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca |
55316285 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
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| T |
55316286 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat |
55316385 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca |
388 |
Q |
| |
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| T |
55316386 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 366
Target Start/End: Original strand, 16821099 - 16821369
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Q |
| |
|
||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| | || ||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | | |
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| T |
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ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaccatttat-ttatcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaat |
16821197 |
T |
 |
| Q |
197 |
agcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttct |
294 |
Q |
| |
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| ||| | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| ||||| ||| ||||| | |
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| T |
16821198 |
aacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacattttt |
16821297 |
T |
 |
| Q |
295 |
acatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
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| T |
16821298 |
acatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacataacatca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 388
Target Start/End: Original strand, 41270043 - 41270327
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| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| || ||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
41270043 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca |
41270141 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
41270142 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat |
41270241 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca |
388 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
41270242 |
gaacatgtaattccaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
41270327 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
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211 |
Q |
| |
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|||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||||| |
|
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| T |
47984624 |
aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatc |
47984723 |
T |
 |
| Q |
212 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac |
247 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| | |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
47984724 |
aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac |
47984759 |
T |
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Target: chr3; HSP #24
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112 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
211 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
48003198 |
aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatc |
48003297 |
T |
 |
| Q |
212 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac |
247 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| | |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
48003298 |
aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac |
48003333 |
T |
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Target: chr3; HSP #25
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211 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
47993911 |
aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatc |
47994010 |
T |
 |
| Q |
212 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac |
247 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| | |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
47994011 |
aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac |
47994046 |
T |
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Target: chr3; HSP #26
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Target Start/End: Original strand, 48012484 - 48012619
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| Q |
112 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
211 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
48012484 |
aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatc |
48012583 |
T |
 |
| Q |
212 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac |
247 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| | |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
48012584 |
aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac |
48012619 |
T |
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Target: chr3; HSP #27
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7 |
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79 |
Q |
| |
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2449463 |
aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac |
2449391 |
T |
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442 |
atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct |
521 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
3992873 |
atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
3992953 |
T |
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Target: chr3; HSP #29
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Query Start/End: Original strand, 442 - 521
Target Start/End: Original strand, 55513193 - 55513273
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| Q |
442 |
atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct |
521 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
55513193 |
atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
55513273 |
T |
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atgatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg |
516 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15857198 |
atgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaagtattagctctagcttcactttagctcctatg |
15857120 |
T |
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| Q |
442 |
atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct |
521 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
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2844514 |
atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcaaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
2844594 |
T |
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Target: chr3; HSP #32
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Target Start/End: Complemental strand, 54038056 - 54037976
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| Q |
442 |
atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct |
521 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
54038056 |
atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct |
54037976 |
T |
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Target: chr3; HSP #33
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Target Start/End: Complemental strand, 17955916 - 17955861
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| Q |
442 |
atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctcta |
496 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17955916 |
atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcta |
17955861 |
T |
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Target: chr3; HSP #34
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| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19231945 |
tttcaccaaaacaccaacaacaatccaaattatcatcatcaattcatgaa |
19231994 |
T |
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Target: chr3; HSP #35
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| Q |
442 |
atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct |
521 |
Q |
| |
|
||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
7854305 |
atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct |
7854385 |
T |
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Target: chr3; HSP #36
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18 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaatt |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
18969968 |
catcaacaatcaaccacaaccacaacttataatcatgctttccatcagaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
18970048 |
T |
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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
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Target Start/End: Original strand, 45581954 - 45582016
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| Q |
442 |
atgattatggtaaagactaacccc--ttaccttaattatctccaactactagctctaacttca |
502 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
45581954 |
atgattatgataaaaactaaccccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttca |
45582016 |
T |
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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 384
Target Start/End: Original strand, 14080715 - 14080756
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| Q |
343 |
ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt |
384 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14080715 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
14080756 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
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| Q |
94 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22144564 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
22144532 |
T |
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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 255
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| Q |
134 |
ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctc |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| | || | |||||| ||| | ||||||||||||| | ||| |||||| | ||| |
|
|
| T |
12265053 |
ttctcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctc |
12264954 |
T |
 |
| Q |
234 |
aattcaactacaacatgtcaaa |
255 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
12264953 |
atttcaacaacaacatatcaaa |
12264932 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 79
Target Start/End: Original strand, 48421624 - 48421685
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| Q |
18 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || || ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
48421624 |
catcaacaattaaccacaaccacaatttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaac |
48421685 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11329214 - 11329098
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| Q |
134 |
ttctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagct |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||| |||| | |||| | | |||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||| || | |
|
|
| T |
11329214 |
ttctcatcaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatca |
11329115 |
T |
 |
| Q |
233 |
caattcaactacaacat |
249 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11329114 |
caattcaacaacaacat |
11329098 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 462 - 514
Target Start/End: Original strand, 17191884 - 17191936
Alignment:
| Q |
462 |
ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctccta |
514 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17191884 |
ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta |
17191936 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22907607 - 22907214
Alignment:
| Q |
7 |
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106 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22907607 |
aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaatt |
22907508 |
T |
 |
| Q |
107 |
tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22907507 |
tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca |
22907408 |
T |
 |
| Q |
207 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22907407 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaac |
22907308 |
T |
 |
| Q |
307 |
atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22907307 |
atgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
22907214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 112 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 16194005 - 16193643
Alignment:
| Q |
112 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | |||||| |
|
|
| T |
16194005 |
aaaacaccaacaacatctcaaattaacatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc |
16193906 |
T |
 |
| Q |
212 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg |
310 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| | ||||| | ||| |||| || |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16193905 |
aattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt |
16193806 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaatt |
410 |
Q |
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| T |
16193805 |
aatttccccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagcaaaatt |
16193706 |
T |
 |
| Q |
411 |
catacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaaccccttacctta |
473 |
Q |
| |
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| T |
16193705 |
catacaatatttgaaaatttaccaaatgatgatgattatgataaagactaaccccttacctta |
16193643 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 105 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 16405268 - 16404852
Alignment:
| Q |
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204 |
Q |
| |
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| T |
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tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaa |
16405169 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
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| T |
16405168 |
taacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatttaac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttg |
16405072 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
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| T |
16405071 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccatcat |
16404972 |
T |
 |
| Q |
404 |
--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactactagctctaactt |
500 |
Q |
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16404971 |
gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagctt |
16404873 |
T |
 |
| Q |
501 |
cactttggctcctatgcttct |
521 |
Q |
| |
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16404872 |
cacttttgctcctatgattct |
16404852 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 24929178 - 24928716
Alignment:
| Q |
5 |
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104 |
Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
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| T |
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tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaacca |
24928988 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
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| T |
24928987 |
taacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaacttagcgaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg |
24928888 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
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| T |
24928887 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat |
24928788 |
T |
 |
| Q |
404 |
caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccc-ttacctta |
473 |
Q |
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| T |
24928787 |
caaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgacgatgattatgataaagactaaccccattacctta |
24928716 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 105 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 43373761 - 43373392
Alignment:
| Q |
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204 |
Q |
| |
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| T |
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tttcaccaaaacaccaacaa---ttcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
43373665 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
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| T |
43373664 |
tagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
43373565 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
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| T |
43373564 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccattat |
43373465 |
T |
 |
| Q |
404 |
--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
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| T |
43373464 |
acaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 234 - 400
Target Start/End: Original strand, 5238184 - 5238350
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333 |
Q |
| |
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| T |
5238184 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
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T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
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| T |
5238284 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 234 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24661414 - 24661248
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| Q |
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333 |
Q |
| |
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|
| T |
24661414 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
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T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
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|
|
| T |
24661314 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
24661248 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 234 - 400
Target Start/End: Original strand, 43685643 - 43685809
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| Q |
234 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
43685643 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
43685742 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
43685743 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
43685809 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 108 - 400
Target Start/End: Original strand, 17345540 - 17345832
Alignment:
| Q |
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caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa |
207 |
Q |
| |
|
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| T |
17345540 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataa |
17345639 |
T |
 |
| Q |
208 |
catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac |
306 |
Q |
| |
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| T |
17345640 |
tatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac |
17345738 |
T |
 |
| Q |
307 |
atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
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||| || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||||| |
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|
| T |
17345739 |
atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccat |
17345832 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 112 - 388
Target Start/End: Original strand, 24548956 - 24549233
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211 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc |
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T |
 |
| Q |
212 |
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310 |
Q |
| |
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| T |
24549056 |
aattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt |
24549155 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca |
388 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
24549156 |
aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca |
24549233 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 112 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 6774535 - 6774258
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| Q |
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aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| |||||| |
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|
| T |
6774535 |
aaaacaccaacaacaaatcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc |
6774436 |
T |
 |
| Q |
212 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg |
310 |
Q |
| |
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|
| T |
6774435 |
aattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt |
6774336 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca |
388 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
6774335 |
aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca |
6774258 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21844856 - 21844594
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204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
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|
| T |
21844856 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
21844758 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
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| T |
21844757 |
taacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt |
21844658 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
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| T |
21844657 |
aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
21844594 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21852249 - 21851987
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
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|
| T |
21852249 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
21852151 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
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| T |
21852150 |
taacatcatttgaacaagaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt |
21852051 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
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| T |
21852050 |
aaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
21851987 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 388
Target Start/End: Original strand, 30120690 - 30120974
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Q |
| |
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| T |
30120690 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattatcatcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
30120788 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
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| T |
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taacatcaattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat |
30120888 |
T |
 |
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aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca |
388 |
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gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
30120974 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 43685584 - 43685656
Alignment:
| Q |
7 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43685584 |
aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
43685656 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 222975 - 222754
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
222975 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
222877 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
222876 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
222777 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaat |
325 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
222776 |
gaacatgtaatttcaccaacaat |
222754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 736598 - 736377
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
736598 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
736500 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
736499 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
736400 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaat |
325 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
736399 |
gaacatgtaatttcaccaacaat |
736377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 860493 - 860272
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
860493 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
860395 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
860394 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
860295 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaat |
325 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
860294 |
gaacatgtaatttcaccaacaat |
860272 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 5238125 - 5238197
Alignment:
| Q |
7 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5238125 |
aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
5238197 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 24661473 - 24661401
Alignment:
| Q |
7 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24661473 |
aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
24661401 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16674672 - 16674392
Alignment:
| Q |
109 |
accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||| || ||| ||| | || ||| | ||| |
|
|
| T |
16674672 |
accaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataac |
16674574 |
T |
 |
| Q |
209 |
atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac |
306 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | ||| |
|
|
| T |
16674573 |
atcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaac |
16674474 |
T |
 |
| Q |
307 |
atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca |
388 |
Q |
| |
|
||| ||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16674473 |
atgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagca |
16674392 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 521
Target Start/End: Original strand, 274766 - 274846
Alignment:
| Q |
442 |
atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct |
521 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
274766 |
atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
274846 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 641083 - 641003
Alignment:
| Q |
442 |
atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct |
521 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
641083 |
atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
641003 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 826889 - 826809
Alignment:
| Q |
442 |
atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct |
521 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
826889 |
atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
826809 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 24716794 - 24716714
Alignment:
| Q |
442 |
atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct |
521 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
24716794 |
atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
24716714 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 249
Target Start/End: Original strand, 23837154 - 23837308
Alignment:
| Q |
95 |
aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct |
193 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||| |
|
|
| T |
23837154 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaccaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatca |
23837252 |
T |
 |
| Q |
194 |
attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat |
249 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23837253 |
cttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacat |
23837308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 22321654 - 22321597
Alignment:
| Q |
18 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaa |
75 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
22321654 |
catcaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatgcattccatcacaatttaacaa |
22321597 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Original strand, 41246613 - 41246735
Alignment:
| Q |
94 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc |
192 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| | |||| | | ||||| |
|
|
| T |
41246613 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttc-atttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatg |
41246711 |
T |
 |
| Q |
193 |
tattagcatcaacaacatcaattg |
216 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41246712 |
acttaacaacaacaacatcaattg |
41246735 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23226117 - 23226076
Alignment:
| Q |
343 |
ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt |
384 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23226117 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattt |
23226076 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 98
Target Start/End: Original strand, 23217924 - 23218004
Alignment:
| Q |
18 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaatt |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| || ||||||| | |||||||||||| | ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
23217924 |
catcaacaatcaaccacaactacaacttataatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
23218004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 521
Target Start/End: Original strand, 39115598 - 39115678
Alignment:
| Q |
442 |
atgattatggtaaagactaac-cccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct |
521 |
Q |
| |
|
||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
39115598 |
atgattatgatgaaaactaacacccttaccttaattattaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct |
39115678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13662561 - 13662492
Alignment:
| Q |
97 |
ttcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaa |
167 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
13662561 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttag-ttctcatcatcaatccataattatgtatacccaa |
13662492 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 79
Target Start/End: Original strand, 22981241 - 22981299
Alignment:
| Q |
21 |
caacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22981241 |
caacaatcaaccacaacaacaacttataatcatgcattccatcaaaattcaacaacaac |
22981299 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 41507190 - 41507116
Alignment:
| Q |
5 |
gcaatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41507190 |
gcaatgagattatcatcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac |
41507116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 400
Target Start/End: Original strand, 26680070 - 26680463
Alignment:
| Q |
7 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaattcacaaatt |
106 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |
|
|
| T |
26680070 |
aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcgattcccaaatt |
26680169 |
T |
 |
| Q |
107 |
tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26680170 |
tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca |
26680269 |
T |
 |
| Q |
207 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26680270 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaac |
26680369 |
T |
 |
| Q |
307 |
atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26680370 |
atgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
26680463 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 94 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 54118551 - 54118120
Alignment:
| Q |
94 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct |
193 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
54118551 |
caattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
54118452 |
T |
 |
| Q |
194 |
attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcattt |
292 |
Q |
| |
|
|||| || | | ||||||||||| |||||||||||| || ||| ||| ||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| ||| || |
|
|
| T |
54118451 |
attaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaatt |
54118352 |
T |
 |
| Q |
293 |
ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa |
392 |
Q |
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54118252 |
T |
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489 |
Q |
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54118152 |
T |
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521 |
Q |
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54118151 |
agctctagcttcacttttgctcttatgattct |
54118120 |
T |
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Target Start/End: Original strand, 13246386 - 13246769
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T |
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194 |
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292 |
Q |
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| T |
13246486 |
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13246585 |
T |
 |
| Q |
293 |
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392 |
Q |
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| T |
13246586 |
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13246685 |
T |
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473 |
Q |
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T |
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Target: chr4; HSP #4
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Q |
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T |
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| Q |
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307 |
Q |
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15675182 |
T |
 |
| Q |
308 |
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405 |
Q |
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| T |
15675181 |
tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa |
15675082 |
T |
 |
| Q |
406 |
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473 |
Q |
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| T |
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aaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta |
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Q |
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T |
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| Q |
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466 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
467 |
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473 |
Q |
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tacctta |
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T |
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Q |
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tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
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Q |
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T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
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tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
16327926 |
T |
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Target: chr4; HSP #8
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Q |
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31115702 |
T |
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| Q |
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310 |
Q |
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31115802 |
T |
 |
| Q |
311 |
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373 |
Q |
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31115803 |
aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
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208 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaac-------------------aacaac |
10104443 |
T |
 |
| Q |
209 |
atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca |
307 |
Q |
| |
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| T |
10104442 |
atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca |
10104343 |
T |
 |
| Q |
308 |
tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca |
405 |
Q |
| |
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|| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || | |
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| T |
10104342 |
tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatccaattatgaa |
10104243 |
T |
 |
| Q |
406 |
aaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
10104242 |
aaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta |
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T |
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Q |
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|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
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T |
 |
| Q |
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caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
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| T |
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taacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatattt |
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T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
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|||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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gaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
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T |
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Target: chr4; HSP #11
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Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
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| T |
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taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatattt |
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T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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Target: chr4; HSP #12
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Q |
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tttcaccaaaacaccaaca-cagctcaaattctcatcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
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T |
 |
| Q |
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caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
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| T |
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taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
47357820 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca |
388 |
Q |
| |
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|
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Q |
| |
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tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
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T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaat |
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Q |
| |
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taacatcaattgaacaagaatcataactcaat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
|
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|
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atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaa |
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T |
 |
| Q |
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----atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
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||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |
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| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
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25119059 |
T |
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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300 |
tttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt |
384 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||| | |||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| |
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T |
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521 |
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T |
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Q |
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T |
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203 |
Q |
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T |
 |
| Q |
204 |
acaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat |
249 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| ||||||| |
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15044893 |
acaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat |
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T |
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Q |
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T |
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249 |
Q |
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|
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caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
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Q |
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|
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T |
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Target: chr7; HSP #1
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Q |
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|
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aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaatt |
7292985 |
T |
 |
| Q |
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tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca |
206 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7292986 |
tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca |
7293085 |
T |
 |
| Q |
207 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac |
306 |
Q |
| |
|
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|
| T |
7293086 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaac |
7293185 |
T |
 |
| Q |
307 |
atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
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atgtaatttaaccaacaatcatacaattattattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
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T |
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Target: chr7; HSP #2
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|
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T |
 |
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291 |
Q |
| |
|
|||| || | ||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaaca |
391 |
Q |
| |
|
| | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
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| T |
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tgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaca |
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
|
|| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
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Target: chr7; HSP #3
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||| || | | |
|
|
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T |
 |
| Q |
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caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |
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| T |
16211833 |
taacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
16211932 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | || ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16211933 |
aacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccataag |
16212032 |
T |
 |
| Q |
404 |
caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16212033 |
caaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta |
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T |
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Target: chr7; HSP #4
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| || | | |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
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caacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
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T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
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aacatgtaattttaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccattat |
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T |
 |
| Q |
404 |
--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
36052931 |
acaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta |
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Target: chr7; HSP #5
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | |
|
|
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcgtcctcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca |
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T |
 |
| Q |
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caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |
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|
| T |
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taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg |
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T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| || |
|
|
| T |
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aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccattat |
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T |
 |
| Q |
404 |
---caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
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Query Start/End: Original strand, 105 - 514
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204 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |
|
|
| T |
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T |
 |
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caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| | |||| |||| |||||| ||| |||||||| || || |||||| ||||||||| |
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|
| T |
3060033 |
taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttaacaaaattca-ccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatattt |
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T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataa |
402 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |
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| T |
3060132 |
gaacatgtaatttcaccaacagtattacaattatcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataa |
3060231 |
T |
 |
| Q |
403 |
tcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagac-taaccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttc |
501 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
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gcaaaattcatataacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagacttacccccttaccttcattatctccaactattagctctagcttc |
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 |
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actttggctccta |
514 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |
|
|
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acttttgctccta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 234 - 400
Target Start/End: Original strand, 11516324 - 11516490
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aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
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T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
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|
| T |
11516424 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
11516490 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
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Query Start/End: Original strand, 234 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15441730 - 15441564
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aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
15441730 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
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T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15441630 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
15441564 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 234 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 30262295 - 30262129
Alignment:
| Q |
234 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
30262295 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
30262196 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
30262195 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
30262129 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 112 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 47481320 - 47481031
Alignment:
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211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | | | |||||| |
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|
| T |
47481320 |
aaaacaccaacaacaattcaaattatcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatc |
47481221 |
T |
 |
| Q |
212 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg |
310 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |
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| T |
47481220 |
aattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt |
47481121 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
47481120 |
aatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
47481031 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 105 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 18254130 - 18253842
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204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||| | |||||| |||| |||| | |
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|
| T |
18254130 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca |
18254032 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
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|
| T |
18254031 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg |
18253932 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat |
393 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |
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|
| T |
18253931 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat |
18253842 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 112 - 399
Target Start/End: Original strand, 13320988 - 13321278
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| Q |
112 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
211 |
Q |
| |
|
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| T |
13320988 |
aaaacaccaacaacaatccaaattctcatcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatc |
13321087 |
T |
 |
| Q |
212 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaacta-caacat-gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacata--tttaaaca |
307 |
Q |
| |
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||||| ||| |||||||| ||||||||||| | |||| | | ||||||| | ||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||||| |
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| T |
13321088 |
aattgaacatgaatcatatctcaattcaacaatcaacttagcaaaattcaccaattgagcacaa-tttcataacttgacatttatacatactttgaaaca |
13321186 |
T |
 |
| Q |
308 |
tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca |
399 |
Q |
| |
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|| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |
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| T |
13321187 |
tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatcca |
13321278 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16479244 - 16478985
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| Q |
108 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca |
206 |
Q |
| |
|
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|
| T |
16479244 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata |
16479145 |
T |
 |
| Q |
207 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa |
305 |
Q |
| |
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| T |
16479144 |
acatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaaaataacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa |
16479045 |
T |
 |
| Q |
306 |
catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatc |
365 |
Q |
| |
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| T |
16479044 |
catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatc |
16478985 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 25292633 - 25292338
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
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| T |
25292633 |
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25292535 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtca-aattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| | | |||||| | ||| ||||||| |||||| ||| || ||| |||||||||| |
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| T |
25292534 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacgacaacctaggagaattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatattta |
25292435 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
25292434 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatacatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaattatccat |
25292338 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 366
Target Start/End: Original strand, 13572644 - 13572906
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| || |||| ||| | || ||| | |
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|
| T |
13572644 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca |
13572742 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
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| T |
13572743 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt |
13572842 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
13572843 |
aaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
13572906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 388
Target Start/End: Original strand, 10989378 - 10989661
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
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|
| T |
10989378 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
10989476 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | ||||| | || ||||| | | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
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|
| T |
10989477 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat-tacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat |
10989575 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca |
388 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10989576 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
10989661 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13911292 - 13911046
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123 |
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222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | ||||||||||| ||| | |
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| T |
13911292 |
aacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatg |
13911193 |
T |
 |
| Q |
223 |
aatcatagctcaattcaactacaac---atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaacc |
319 |
Q |
| |
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||||| | ||||| ||||| ||||| | | ||||||| | ||| ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||| |
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| T |
13911192 |
aatcacatctcaaatcaacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcacc |
13911093 |
T |
 |
| Q |
320 |
aacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13911092 |
aacaatcatacaattaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
13911046 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 366
Target Start/End: Original strand, 2437425 - 2437687
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
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|
| T |
2437425 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
2437523 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | |||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
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|
| T |
2437524 |
taacatcatttgaacaagaatcaaatctcatattaacaacaacttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
2437623 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2437624 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
2437687 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 11516265 - 11516337
Alignment:
| Q |
7 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11516265 |
aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatatactcatacactccatcataattcaacaacaac |
11516337 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 15441789 - 15441717
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| Q |
7 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15441789 |
aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
15441717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 30262354 - 30262282
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| Q |
7 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
30262354 |
aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
30262282 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 521
Target Start/End: Original strand, 126738 - 126818
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521 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
126738 |
atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcatttttgctcctatgattct |
126818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 296257 - 295900
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108 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||| | | |||||||| || | |||||||||| |||||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
296257 |
caccaaaacaccaacacaaattcaatttttcaacatcaatccatgaataagcatacccaatcagtaattcatcaac---aacatcaattaatagcaacaa |
296161 |
T |
 |
| Q |
208 |
catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacta-caacatgtcaaa-ttcatccattttgc-acaattttcataacttctcatttctacatatttaa |
304 |
Q |
| |
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||||||||| ||| |||||| | | |||||||| | ||| | |||| |||| |||||| | | |||||| |||||||||||||| |||||| || | |
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|
| T |
296160 |
catcaattgaacatgaatcacaacacaattcaaacatcaatttagcaaaattca-ccatttggatataatttttataacttctcatttttacataattca |
296062 |
T |
 |
| Q |
305 |
acatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat- |
403 |
Q |
| |
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||||| ||| | ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| || | | || || ||| |||||||||||||| || ||| || |
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| T |
296061 |
acatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacacgaatttagcaacaattattcattatg |
295962 |
T |
 |
| Q |
404 |
caaaa-ttcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccc |
465 |
Q |
| |
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||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| | ||||| |||||| |
|
|
| T |
295961 |
caaaatttcatacaaagtttgaaaatgca-aaaatgatgagaattatgttgaagacaaacccc |
295900 |
T |
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Target: chr7; HSP #24
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Q |
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T |
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442 |
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Q |
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T |
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Target: chr7; HSP #26
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400 |
Q |
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atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
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T |
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Target: chr7; HSP #27
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358 |
atatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
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14423681 |
atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
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T |
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Target: chr7; HSP #28
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521 |
Q |
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atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaacttttagctcaagcttcacttttgctcctatgattct |
111121 |
T |
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Target: chr7; HSP #29
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98 |
Q |
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13351999 |
catcaacaatctaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcccaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
13352079 |
T |
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Target: chr7; HSP #30
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caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
126 |
Q |
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15822723 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
15822691 |
T |
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Target: chr7; HSP #31
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caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc |
192 |
Q |
| |
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|||||||| ||||| || ||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||||| | |||||| |
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| T |
17224230 |
caattcaccaattttacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatc |
17224132 |
T |
 |
| Q |
193 |
tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat |
249 |
Q |
| |
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| T |
17224131 |
acttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacat |
17224075 |
T |
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Target: scaffold0078 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
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Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
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106 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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aatgagatcaacattaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatacactccatcataattcaacaaaaacttatcatatttcatcaattcacaaatt |
37360 |
T |
 |
| Q |
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tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca |
206 |
Q |
| |
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|
| T |
37359 |
tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca |
37260 |
T |
 |
| Q |
207 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac |
306 |
Q |
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|
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| T |
37259 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaatccaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaac |
37160 |
T |
 |
| Q |
307 |
atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
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| T |
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atgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
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T |
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Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
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Target Start/End: Original strand, 41632 - 41712
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Q |
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|
|||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |
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|
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41632 |
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41712 |
T |
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Target: chr1 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 21)
Name: chr1
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Target: chr1; HSP #1
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206 |
Q |
| |
|
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|
| T |
41394191 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata |
41394290 |
T |
 |
| Q |
207 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa |
305 |
Q |
| |
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|
| T |
41394291 |
acatcaattgagcaagaatcaaatctcaacataacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa |
41394390 |
T |
 |
| Q |
306 |
catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatca |
405 |
Q |
| |
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| T |
41394391 |
catgtaacttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatca |
41394490 |
T |
 |
| Q |
406 |
aaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcact |
504 |
Q |
| |
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|
| T |
41394491 |
aaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcact |
41394590 |
T |
 |
| Q |
505 |
ttggctcctatgcttctcc |
523 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41394591 |
ttagctcctatgattctcc |
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T |
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | |
|
|
| T |
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagcca |
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T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
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||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| |||| |||||| | | || || |
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| T |
20445746 |
taacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttg |
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T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |
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| T |
20445846 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattat |
20445945 |
T |
 |
| Q |
404 |
--caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaac-cccttacctta |
473 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20445946 |
gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaactcccttacctta |
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T |
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | |
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| T |
20531411 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagcca |
20531510 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
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| T |
20531511 |
taacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttg |
20531610 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
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| T |
20531611 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaattatccattat |
20531710 |
T |
 |
| Q |
404 |
--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa |
461 |
Q |
| |
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|
|
| T |
20531711 |
gcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaa |
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T |
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
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| T |
20931312 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
20931411 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
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| T |
20931412 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg |
20931511 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
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| T |
20931512 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag |
20931611 |
T |
 |
| Q |
404 |
caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
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| T |
20931612 |
caaacttcatacaacaattgaaaatttgcaaaatgaggatgattatgataaaggctaacccccttacctta |
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Target: chr1; HSP #5
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193 |
Q |
| |
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| T |
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caattcacaaatttcttcaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatca |
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T |
 |
| Q |
194 |
attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcattt |
292 |
Q |
| |
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| T |
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attaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt |
20893734 |
T |
 |
| Q |
293 |
ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa |
392 |
Q |
| |
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| T |
20893733 |
gttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaa |
20893634 |
T |
 |
| Q |
393 |
tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
|
| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |
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| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
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Target Start/End: Original strand, 20913004 - 20913367
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204 |
Q |
| |
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaacca |
20913103 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
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| T |
20913104 |
taacatcaattgaacaagaatca------aatt-aacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg |
20913196 |
T |
 |
| Q |
304 |
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403 |
Q |
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| T |
20913197 |
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20913296 |
T |
 |
| Q |
404 |
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473 |
Q |
| |
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|
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| T |
20913297 |
caaaattcatacaacaattgaaaatttgcaaaatgaggatgattacgataaagactaacccccttacctta |
20913367 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
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Target Start/End: Complemental strand, 37844746 - 37844374
Alignment:
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204 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||| || | | |
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| T |
37844746 |
tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
37844648 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttca-taacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
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| T |
37844647 |
taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctactt |
37844548 |
T |
 |
| Q |
303 |
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402 |
Q |
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| T |
37844547 |
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37844448 |
T |
 |
| Q |
403 |
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473 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
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| T |
37844447 |
tgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta |
37844374 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
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Target Start/End: Original strand, 51452589 - 51452755
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234 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
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|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
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| T |
51452589 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
51452688 |
T |
 |
| Q |
334 |
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400 |
Q |
| |
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| T |
51452689 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagcaacaattatccat |
51452755 |
T |
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Target: chr1; HSP #9
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211 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2116228 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc |
2116327 |
T |
 |
| Q |
212 |
aattgcacaagaatc-atagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg |
309 |
Q |
| |
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||||| |||||||| | | |||| | ||| | ||| | | ||||||| | ||| |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |
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| T |
2116328 |
aattgagcaagaatcaaaatatcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatg |
2116427 |
T |
 |
| Q |
310 |
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366 |
Q |
| |
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||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
2116428 |
taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
2116484 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
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Target Start/End: Original strand, 22227777 - 22228022
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| | |
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| T |
22227777 |
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22227875 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
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| T |
22227876 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttg |
22227975 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca |
350 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||| |
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|
| T |
22227976 |
aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
22228022 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 350
Target Start/End: Original strand, 22232474 - 22232719
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| | |
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| T |
22232474 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca |
22232572 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
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|
| T |
22232573 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttg |
22232672 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca |
350 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||| |
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|
| T |
22232673 |
aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
22232719 |
T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18601402 - 18601140
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| || ||| ||| | || ||| | |
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| T |
18601402 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactctaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca |
18601304 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
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| T |
18601303 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat |
18601204 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18601203 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
18601140 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 5072672 - 5072388
Alignment:
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| || ||| ||| | || ||| | |
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|
| T |
5072672 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactctaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca |
5072574 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
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||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
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| T |
5072573 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat |
5072474 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca |
388 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5072473 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
5072388 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 366
Target Start/End: Original strand, 45051416 - 45051652
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| Q |
112 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
45051416 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaataa-------------------catc |
45051496 |
T |
 |
| Q |
212 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg |
310 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
45051497 |
aattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt |
45051596 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
45051597 |
aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatca |
45051652 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 51452530 - 51452602
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| Q |
7 |
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Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51452530 |
aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
51452602 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 521
Target Start/End: Original strand, 21860334 - 21860414
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| Q |
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atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct |
521 |
Q |
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||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |
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|
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21860334 |
atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
21860414 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 44034903 - 44034829
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| Q |
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atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctat |
515 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
44034903 |
atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 521
Target Start/End: Original strand, 41218749 - 41218808
Alignment:
| Q |
462 |
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Q |
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|
|
| T |
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ccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct |
41218808 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 126
Target Start/End: Original strand, 49967607 - 49967638
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| Q |
95 |
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126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49967607 |
aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 462 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 13376763 - 13376711
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| Q |
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ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctccta |
514 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13376763 |
ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta |
13376711 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 462 - 514
Target Start/End: Original strand, 27675139 - 27675191
Alignment:
| Q |
462 |
ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctccta |
514 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27675139 |
ccccttaccttaattatctccaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
27675191 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 94 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 19795011 - 19794581
Alignment:
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94 |
caattcacaaatttcaccaaaa-caccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19795011 |
caattcacaa-tttcaccaaaaacaccaacaaaaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatc |
19794913 |
T |
 |
| Q |
193 |
tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatt |
291 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
19794912 |
aattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt |
19794813 |
T |
 |
| Q |
292 |
tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaaca |
391 |
Q |
| |
|
| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |
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|
| T |
19794812 |
tgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgaca |
19794713 |
T |
 |
| Q |
392 |
atcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactac |
488 |
Q |
| |
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|| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
19794712 |
attatccattatgcaaaaattcatacaacatttg-aaatttacaaaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactat |
19794614 |
T |
 |
| Q |
489 |
tagctctaacttcactttggctcctatgcttct |
521 |
Q |
| |
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|
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 105 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 43643250 - 43642833
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T |
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caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
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T |
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aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
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T |
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500 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 105 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 36982737 - 36982364
Alignment:
| Q |
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T |
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303 |
Q |
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taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
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T |
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aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
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| T |
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aacatgtaatttcaccagcaatcttacaattatcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat |
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T |
 |
| Q |
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--caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
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Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 105 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 20627609 - 20627190
Alignment:
| Q |
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204 |
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T |
 |
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caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
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| T |
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taaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttg |
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T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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501 |
Q |
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| T |
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cataattcatacaatatttgaaaattttacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccccgttaccttaattatctccaactattagctctagcttc |
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T |
 |
| Q |
502 |
actttggctcctatgcttct |
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Q |
| |
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Target: chr2; HSP #5
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Query Start/End: Original strand, 105 - 473
Target Start/End: Original strand, 462706 - 463075
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204 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
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| T |
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taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
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T |
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| Q |
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403 |
Q |
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| T |
462905 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag |
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T |
 |
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caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
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| |
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|
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Target: chr2; HSP #6
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Query Start/End: Original strand, 105 - 467
Target Start/End: Original strand, 8891209 - 8891574
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Q |
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T |
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caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
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T |
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Q |
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8891409 |
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T |
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Q |
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gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccctt |
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Q |
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T |
 |
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tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca |
405 |
Q |
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tataatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatccaattatgaa |
24341382 |
T |
 |
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aaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
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Q |
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aaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
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Q |
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Target: chr2; HSP #9
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
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| |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
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Query Start/End: Original strand, 112 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 25265679 - 25265390
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 |
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310 |
Q |
| |
|
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|
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 |
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aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
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||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
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tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
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|
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|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
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| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||| || |||| ||| | || ||| | |
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|
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tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattca |
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 |
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| |
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aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
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| |
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| T |
17396749 |
aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
17396653 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 108 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7508138 - 7507894
Alignment:
| Q |
108 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| | |
|
|
| T |
7508138 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata |
7508039 |
T |
 |
| Q |
207 |
acatcaatt-gcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa |
304 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | | |||||||| | ||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| | |
|
|
| T |
7508038 |
acatcaattaaaacatgaatcatatctcaatt-aacaacaacttagccaaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttga |
7507940 |
T |
 |
| Q |
305 |
acatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca |
350 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7507939 |
acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
7507894 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 19886945 - 19886661
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
19886945 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
19886847 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| | |
|
|
| T |
19886846 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatat |
19886747 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca |
388 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19886746 |
gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
19886661 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 442 - 521
Target Start/End: Original strand, 22284278 - 22284358
Alignment:
| Q |
442 |
atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct |
521 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
22284278 |
atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
22284358 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 380 - 473
Target Start/End: Original strand, 22863171 - 22863267
Alignment:
| Q |
380 |
aatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22863171 |
aatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta |
22863267 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 14906665 - 14906593
Alignment:
| Q |
7 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14906665 |
aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac |
14906593 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 20015049 - 20015121
Alignment:
| Q |
7 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20015049 |
aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac |
20015121 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 23820109 - 23820181
Alignment:
| Q |
7 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23820109 |
aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac |
23820181 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 521
Target Start/End: Original strand, 22275045 - 22275125
Alignment:
| Q |
442 |
atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct |
521 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
22275045 |
atgattatgataaaggctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
22275125 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 443 - 521
Target Start/End: Original strand, 15633538 - 15633617
Alignment:
| Q |
443 |
tgattatggtaaagactaacc-ccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct |
521 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
15633538 |
tgattatgataaagactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgctcctatgattct |
15633617 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 19689600 - 19689554
Alignment:
| Q |
33 |
acaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19689600 |
acaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
19689554 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19669335 - 19669279
Alignment:
| Q |
160 |
atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19669335 |
atacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattg |
19669279 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 79
Target Start/End: Original strand, 25601898 - 25601972
Alignment:
| Q |
5 |
gcaatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25601898 |
gcaatgagattatcatcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac |
25601972 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 458 - 514
Target Start/End: Original strand, 19660217 - 19660273
Alignment:
| Q |
458 |
ctaaccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctccta |
514 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19660217 |
ctaaccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
19660273 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 94 - 126
Target Start/End: Original strand, 32465813 - 32465845
Alignment:
| Q |
94 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
126 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32465813 |
caattcataaatttcaccaaaacaccaacaaca |
32465845 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:
Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 105 - 473
Target Start/End: Original strand, 1091 - 1462
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| | || ||| |||| || | | |
|
|
| T |
1091 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaacca |
1190 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1191 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
1290 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1291 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag |
1390 |
T |
 |
| Q |
404 |
caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1391 |
aaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta |
1462 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 105 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 3877 - 3508
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| |||| | |||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
3877 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaactctcctcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatcca |
3779 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |||| || | | ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3778 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
3679 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
3678 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatctataat |
3579 |
T |
 |
| Q |
404 |
caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3578 |
caaaattcatacaacttttgaaaatttacaaaatgaagatgattatgacaaagactaacccccttacctta |
3508 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:
Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 105 - 473
Target Start/End: Original strand, 48565 - 48935
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | | | |
|
|
| T |
48565 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagcca |
48664 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||||| | | ||||| | |||| |||| | | | |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |
|
|
| T |
48665 |
taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctagcaacaacttagcaaaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttg |
48764 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
48765 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag |
48864 |
T |
 |
| Q |
404 |
caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
48865 |
caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta |
48935 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 366
Target Start/End: Original strand, 36065 - 36323
Alignment:
| Q |
109 |
accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac |
208 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| ||| ||| | || ||| | ||| |
|
|
| T |
36065 |
accataacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataac |
36163 |
T |
 |
| Q |
209 |
atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac |
306 |
Q |
| |
|
||| |||| ||| |||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | || |
|
|
| T |
36164 |
atctattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaat |
36263 |
T |
 |
| Q |
307 |
atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
||| ||| | ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
36264 |
atgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatacatacaaacataacatca |
36323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:
Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 105 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 37209 - 36836
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | |
|
|
| T |
37209 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca |
37110 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||| | | ||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37109 |
taacgtcaattgaacaagattcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
37010 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| || |
|
|
| T |
37009 |
aacatgtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccattat |
36910 |
T |
 |
| Q |
404 |
--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaa |
474 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
36909 |
gcaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa |
36836 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 15378 - 15319
Alignment:
| Q |
462 |
ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct |
521 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
15378 |
ccccttaccttaattatctccaactattagcccaagcttcacttttgctcctatgattct |
15319 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 178; Significance: 9e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:
Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 105 - 465
Target Start/End: Original strand, 19173 - 19537
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |
|
|
| T |
19173 |
tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa |
19272 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19273 |
taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
19372 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
19373 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat |
19472 |
T |
 |
| Q |
404 |
--caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaacccc |
465 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
19473 |
gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaattatgatgattatgatgaagactaacccc |
19537 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 105 - 400
Target Start/End: Original strand, 21257 - 21553
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |
|
|
| T |
21257 |
tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa |
21356 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21357 |
taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
21456 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21457 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
21553 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 94 - 473
Target Start/End: Original strand, 23153403 - 23153786
Alignment:
| Q |
94 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
23153403 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatccttaattcatgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatca |
23153502 |
T |
 |
| Q |
194 |
attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcattt |
292 |
Q |
| |
|
|||| || | | || |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
23153503 |
attaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt |
23153602 |
T |
 |
| Q |
293 |
ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa |
392 |
Q |
| |
|
| | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
23153603 |
gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaa |
23153702 |
T |
 |
| Q |
393 |
tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
|
| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23153703 |
ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta |
23153786 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 112 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 14626407 - 14626089
Alignment:
| Q |
112 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | |||||| |
|
|
| T |
14626407 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc |
14626308 |
T |
 |
| Q |
212 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtca-aattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg |
310 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | ||||| | ||| ||||| | || |||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14626307 |
aattgagcaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcataattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgt |
14626208 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaatt |
410 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14626207 |
aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaatt |
14626108 |
T |
 |
| Q |
411 |
catacaacatttgaaaatt |
429 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14626107 |
caaacaacatttgagaatt |
14626089 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 105 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 35009735 - 35009439
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |
|
|
| T |
35009735 |
tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaa |
35009636 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| | || | | |||||||| ||||||| | ||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |
|
|
| T |
35009635 |
caacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattg |
35009536 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
35009535 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
35009439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 108 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 1658040 - 1657748
Alignment:
| Q |
108 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| || |
|
|
| T |
1658040 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataa |
1657941 |
T |
 |
| Q |
208 |
catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac |
306 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||| ||||||||| | | ||| | |||| || ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
1657940 |
catcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac |
1657842 |
T |
 |
| Q |
307 |
atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
||| || | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1657841 |
atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
1657748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 108 - 400
Target Start/End: Original strand, 15862443 - 15862734
Alignment:
| Q |
108 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| || |
|
|
| T |
15862443 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataa |
15862542 |
T |
 |
| Q |
208 |
catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac |
306 |
Q |
| |
|
||| ||| | |||||||||||| ||||||||| | | ||| | |||| || ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
15862543 |
cataaat-gaacaagaatcataactcaattca-caataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaac |
15862640 |
T |
 |
| Q |
307 |
atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
||| || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
15862641 |
atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccat |
15862734 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 112 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 1650382 - 1650105
Alignment:
| Q |
112 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| |||||| |
|
|
| T |
1650382 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc |
1650283 |
T |
 |
| Q |
212 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg |
310 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1650282 |
aattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgt |
1650183 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca |
388 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
1650182 |
aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagca |
1650105 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 360
Target Start/End: Original strand, 25175531 - 25175787
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
25175531 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
25175629 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
25175630 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
25175729 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata |
360 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25175730 |
gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata |
25175787 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 27654267 - 27653983
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
27654267 |
tttcaccaaaacaccgaca-caattcaaattctcatcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
27654169 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| | | |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
27654168 |
taacatcattggaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
27654069 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca |
388 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27654068 |
gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
27653983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16826038 - 16825752
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| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||| |||| ||| || ||| | |
|
|
| T |
16826038 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattca |
16825940 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaa--catgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||| | | |||| || | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
16825939 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
16825840 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatca--tacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca |
388 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16825839 |
gaacatgtaatttcaccaacaattaattacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
16825752 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 241
Target Start/End: Original strand, 27740808 - 27740941
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108 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa |
207 |
Q |
| |
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|
| T |
27740808 |
caccaaaacaccaacaccaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaaaccatgattcatccacaacaacatcagataatagcaacca |
27740907 |
T |
 |
| Q |
208 |
catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac |
241 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27740908 |
catcaattgaacatgaatcatatctcaattcaac |
27740941 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
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Query Start/End: Original strand, 405 - 473
Target Start/End: Original strand, 23148266 - 23148335
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405 |
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473 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23148266 |
aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta |
23148335 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
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442 |
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521 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |
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19983224 |
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19983144 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
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Query Start/End: Original strand, 442 - 521
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442 |
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521 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
35015089 |
atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
35015009 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
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Target Start/End: Complemental strand, 18381975 - 18381821
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94 |
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192 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||| |
|
|
| T |
18381975 |
caattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatc |
18381877 |
T |
 |
| Q |
193 |
tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca |
248 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18381876 |
acttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaaca |
18381821 |
T |
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Target: chr6; HSP #15
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Target Start/End: Original strand, 27751605 - 27751688
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| Q |
317 |
accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||| ||| | |||||| |
|
|
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27751605 |
accaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat |
27751688 |
T |
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Target: chr6; HSP #16
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202 |
caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatat |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||||| | |||| |||| | ||| | ||||||| |||||||| ||||| | |||| |
|
|
| T |
29665937 |
caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattt-cataacttgacatttatgcatac |
29666035 |
T |
 |
| Q |
301 |
tt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcc |
398 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||| || ||| ||||| || | |||||| |||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
29666036 |
tttgaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatcc |
29666135 |
T |
 |
| Q |
399 |
at |
400 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
29666136 |
at |
29666137 |
T |
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Target: chr6; HSP #17
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79 |
Q |
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|
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15889914 |
catcaacaatcaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcacaattcatcaacaac |
15889853 |
T |
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Target: chr6; HSP #18
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| Q |
442 |
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521 |
Q |
| |
|
||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
18583640 |
atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct |
18583720 |
T |
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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
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| Q |
18 |
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98 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || ||| ||||||||| || | ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22585754 |
catcaacaatcaactataaccacaacttataatcatgcattgcatcacaattcaacaacaacatgtcataattcttcaatt |
22585674 |
T |
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Target: chr6; HSP #20
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Query Start/End: Original strand, 18 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 22590585 - 22590505
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| Q |
18 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaatt |
98 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || ||| ||||||||| || | ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22590585 |
catcaacaatcaactataaccacaacttataatcatgcattgcatcacaattcaacaacaacatgtcataattcttcaatt |
22590505 |
T |
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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
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Target Start/End: Complemental strand, 22362032 - 22361926
Alignment:
| Q |
119 |
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217 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| | |||||||| |||| |||||||| | || ||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22362032 |
caacaacaactcaa-ttctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattga |
22361934 |
T |
 |
| Q |
218 |
acaagaat |
225 |
Q |
| |
|
||| |||| |
|
|
| T |
22361933 |
acatgaat |
22361926 |
T |
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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 79
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| Q |
21 |
caacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25640760 |
caacaatcaaccacaacaacaacttataatcatgcattccatcaaaattcaacaacaac |
25640702 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 123
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| Q |
94 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32898745 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca |
32898774 |
T |
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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 98
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| Q |
18 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaatt |
98 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||| || || |||| |||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
15005114 |
catcaataatcaactacaaccacaacttataatcattcattctatcacaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
15005034 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
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Target Start/End: Complemental strand, 25367490 - 25367374
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134 |
ttctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagct |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||| |||| | |||||||| |||| | ||| | | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | |
|
|
| T |
25367490 |
ttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagccatgaattatcgataacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatca |
25367391 |
T |
 |
| Q |
233 |
caattcaactacaacat |
249 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25367390 |
caattcaacaacaacat |
25367374 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 175; Significance: 6e-94; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
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Target Start/End: Original strand, 23506932 - 23507302
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204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| || | | |
|
|
| T |
23506932 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
23507031 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23507032 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
23507131 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23507132 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattatccataag |
23507231 |
T |
 |
| Q |
404 |
caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23507232 |
caaaattcatacaacatttgaaatcttacaaaatggagatgattatgataaagactaacccccttacctta |
23507302 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 94 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 27182854 - 27182471
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193 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
27182854 |
caattcaaaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
27182755 |
T |
 |
| Q |
194 |
attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcattt |
292 |
Q |
| |
|
|||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
27182754 |
attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt |
27182655 |
T |
 |
| Q |
293 |
ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa |
392 |
Q |
| |
|
| | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27182654 |
gttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaattatcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaa |
27182555 |
T |
 |
| Q |
393 |
tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
|
| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27182554 |
ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta |
27182471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 109 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 22054125 - 22053753
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| Q |
109 |
accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||| |
|
|
| T |
22054125 |
accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataac |
22054026 |
T |
 |
| Q |
209 |
atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca |
307 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||| |
|
|
| T |
22054025 |
atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca |
22053926 |
T |
 |
| Q |
308 |
tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca |
405 |
Q |
| |
|
|| ||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
22053925 |
tgtaatttcaccaacaatcatacaactatcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa |
22053826 |
T |
 |
| Q |
406 |
aaattcatacaacatttgaaaa--ttcacaaa--atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22053825 |
aaattcataccacatttgaaaaatttcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta |
22053753 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 113 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 18531355 - 18530988
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| Q |
113 |
aaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||| |
|
|
| T |
18531355 |
aaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatca |
18531256 |
T |
 |
| Q |
213 |
attgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgga |
311 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||| |||| | ||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| | |
|
|
| T |
18531255 |
attgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgta |
18531156 |
T |
 |
| Q |
312 |
atctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcc-ataatcaaa-at |
409 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| || || ||| || |
|
|
| T |
18531155 |
atttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaacat |
18531056 |
T |
 |
| Q |
410 |
tcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgat---gattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18531055 |
tcataccacatttgaaaaattgcaaaatgatgatgacgattatgatgaagactaacccccttacctta |
18530988 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 234 - 400
Target Start/End: Original strand, 20623066 - 20623232
Alignment:
| Q |
234 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
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| T |
20623066 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
20623165 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20623166 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
20623232 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 234 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21233694 - 21233528
Alignment:
| Q |
234 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
21233694 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
21233595 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21233594 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
21233528 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 237 - 400
Target Start/End: Original strand, 37052844 - 37053007
Alignment:
| Q |
237 |
tcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat |
336 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
37052844 |
tcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattat |
37052943 |
T |
 |
| Q |
337 |
tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37052944 |
tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
37053007 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 234 - 400
Target Start/End: Original strand, 16536294 - 16536460
Alignment:
| Q |
234 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
16536294 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
16536393 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16536394 |
tattataaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
16536460 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 108 - 400
Target Start/End: Original strand, 34939248 - 34939540
Alignment:
| Q |
108 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| || |
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|
| T |
34939248 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataa |
34939347 |
T |
 |
| Q |
208 |
catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac |
306 |
Q |
| |
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|||||| || |||||||||||| ||||||||| | | || | |||| || ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||| |
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| T |
34939348 |
catcaactgaacaagaatcataactcaattca-caatgacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac |
34939446 |
T |
 |
| Q |
307 |
atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
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| T |
34939447 |
atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccat |
34939540 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 234 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 25900571 - 25900408
Alignment:
| Q |
234 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
25900571 |
aattcaacaacaacatgtcaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaat |
25900473 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcc |
398 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25900472 |
tatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc |
25900408 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22366765 - 22366481
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
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| T |
22366765 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
22366667 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
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| T |
22366666 |
taacatcatttgaacaagcatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
22366567 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca |
388 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22366566 |
gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
22366481 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 388
Target Start/End: Original strand, 25426596 - 25426880
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
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|
| T |
25426596 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
25426694 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
25426695 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
25426794 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca |
388 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25426795 |
gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
25426880 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18778276 - 18778014
Alignment:
| Q |
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || || | |
|
|
| T |
18778276 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattca |
18778178 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
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| T |
18778177 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
18778078 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18778077 |
gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
18778014 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 388
Target Start/End: Original strand, 12342 - 12626
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
12342 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
12440 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
12441 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatat |
12540 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca |
388 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12541 |
gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
12626 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 388
Target Start/End: Original strand, 19499867 - 19500151
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| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||| | || ||| | |
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|
| T |
19499867 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattca |
19499965 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
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| T |
19499966 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
19500065 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca |
388 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19500066 |
gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
19500151 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 21073879 - 21073595
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
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|
| T |
21073879 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattga |
21073781 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
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|
| T |
21073780 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
21073681 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca |
388 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21073680 |
gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
21073595 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 4200251 - 4200007
Alignment:
| Q |
124 |
acaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga |
223 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | ||||||||||| ||| || |
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|
| T |
4200251 |
acaattcaaattctcatcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatga |
4200152 |
T |
 |
| Q |
224 |
atcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaa |
321 |
Q |
| |
|
|||| | ||||| ||||| ||||||| | ||||||| | |||| ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||| |
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|
| T |
4200151 |
atcacatctcaaatcaacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaa |
4200052 |
T |
 |
| Q |
322 |
caatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4200051 |
caatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
4200007 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 366
Target Start/End: Original strand, 27009809 - 27010071
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| || |||| ||| | || ||| | |
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|
| T |
27009809 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca |
27009907 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
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|
| T |
27009908 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatattt |
27010007 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | ||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27010008 |
aaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
27010071 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 43443679 - 43443417
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
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|
| T |
43443679 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaatcctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
43443581 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||| ||| | ||||| ||||| ||||| | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
43443580 |
taacatcatttgaacaagactcacatctcaaatcaacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat |
43443481 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43443480 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
43443417 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17471956 - 17471768
Alignment:
| Q |
18 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaattcacaaatttcaccaaaaca |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17471956 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatgtttcaacaacaacatgtcata--------attcaccaatttcaccaaaaca |
17471865 |
T |
 |
| Q |
118 |
ccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
17471864 |
ccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaat |
17471768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 20623007 - 20623079
Alignment:
| Q |
7 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20623007 |
aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
20623079 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 21233753 - 21233681
Alignment:
| Q |
7 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21233753 |
aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
21233681 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29190552 - 29190478
Alignment:
| Q |
112 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactat |
186 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29190552 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactat |
29190478 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 268 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 29188404 - 29188284
Alignment:
| Q |
268 |
gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa |
367 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29188404 |
gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac |
29188305 |
T |
 |
| Q |
368 |
agttggagcacaaatttagca |
388 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
29188304 |
agtaagagcacgaatctagca |
29188284 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 25900630 - 25900558
Alignment:
| Q |
7 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25900630 |
aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac |
25900558 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 37052782 - 37052854
Alignment:
| Q |
7 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
37052782 |
aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcataccctccatcataactcaacaacaac |
37052854 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 16536235 - 16536307
Alignment:
| Q |
7 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16536235 |
aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatacaatcataccctccatcataattcaacaacaac |
16536307 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 249
Target Start/End: Original strand, 19862186 - 19862319
Alignment:
| Q |
116 |
caccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19862186 |
caccaacaacaactcat-ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaat |
19862284 |
T |
 |
| Q |
215 |
tgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat |
249 |
Q |
| |
|
|||||| || || || | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19862285 |
tgcacatgattcttatcacaattcaacaacaacat |
19862319 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 249
Target Start/End: Original strand, 23493885 - 23494029
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatca |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| | | ||||||||||||| |||||| ||| | |||||||| |||| |||||| | | |||||| |||||| || |
|
|
| T |
23493885 |
tttcaccaaaccaacaacaacaacttat-ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca |
23493983 |
T |
 |
| Q |
204 |
acaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat |
249 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23493984 |
acaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat |
23494029 |
T |
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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 79
Target Start/End: Original strand, 2031684 - 2031758
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| Q |
5 |
gcaatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
2031684 |
gcaatgagattatcatcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac |
2031758 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 516
Target Start/End: Original strand, 11584394 - 11584448
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| Q |
462 |
ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg |
516 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11584394 |
ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg |
11584448 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0106 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:
Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 94 - 473
Target Start/End: Original strand, 41686 - 42066
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| Q |
94 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |
|
|
| T |
41686 |
caattcacaa-tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctaataatcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaaca |
41784 |
T |
 |
| Q |
194 |
attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcattt |
292 |
Q |
| |
|
|||| || | | | ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| || || |||||| |
|
|
| T |
41785 |
attaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcattt |
41884 |
T |
 |
| Q |
293 |
ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa |
392 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||| ||| | ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41885 |
ttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaa |
41984 |
T |
 |
| Q |
393 |
tcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
41985 |
ttatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagaccaacccccttacctta |
42066 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0175 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:
Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 105 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 1250 - 882
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| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
1250 |
tttcaccaaaacaccaa-aacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatcca |
1152 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||| | | ||||||| ||| ||||| | | ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |
|
|
| T |
1151 |
taacatcacttgaacaagaataaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttg |
1053 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1052 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat |
953 |
T |
 |
| Q |
404 |
caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
952 |
cacaattcatacaacatttgagaatttgtaaagtgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta |
882 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0302 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:
Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 105 - 473
Target Start/End: Original strand, 12083 - 12450
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||| ||| | |
|
|
| T |
12083 |
tttcactaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattca |
12181 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||||| || ||||| | |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
12182 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt--acaacaacttaacaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacattta |
12279 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
|
|||||| | | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12280 |
aacatgtattttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataat |
12379 |
T |
 |
| Q |
404 |
caaaa-ttcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
12380 |
caaaatttcatacagcatttgaaagtt-acaaaattaagatgattatgataaagactaacccccttacctta |
12450 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0413 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:
Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 105 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 6358 - 5990
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| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
6358 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatcca |
6260 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||| | |||| |||| | ||| |||||||||| | ||||| | |||| ||||||||| |
|
|
| T |
6259 |
taacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttg |
6161 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6160 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat |
6061 |
T |
 |
| Q |
404 |
caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6060 |
cacaattcatacaacatttgagaatttgcaaagtgaaaatgattatgataaagactaacccccttacctta |
5990 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 105 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 128464 - 128095
Alignment:
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||||||| | |||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
128464 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatcca |
128365 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||| | |||| ||| | ||| |||||||||||| ||||| || | |||| |||| |
|
|
| T |
128364 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacctaacaaaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttg |
128266 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
128265 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccataag |
128166 |
T |
 |
| Q |
404 |
caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
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| T |
128165 |
caaaattcatacaacttttgaaaatttgcaaaatgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta |
128095 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31942 - 31697
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124 |
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223 |
Q |
| |
|
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| T |
31942 |
acaattcaaattctcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatga |
31843 |
T |
 |
| Q |
224 |
atcatagctcaattcaactacaac---atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaacca |
320 |
Q |
| |
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| T |
31842 |
atcacatctcaaatcaacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcacca |
31743 |
T |
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| Q |
321 |
acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
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| T |
31742 |
acaatcatacaactaacatcaattcatgcattcaaacataacatca |
31697 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008; HSP #3
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Target Start/End: Original strand, 22650 - 22678
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98 |
tcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
126 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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22650 |
tcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
22678 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
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Target Start/End: Complemental strand, 247738 - 247366
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204 |
Q |
| |
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| T |
247738 |
tttcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcagttcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtca |
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T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
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| T |
247638 |
taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg |
247539 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
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| T |
247538 |
aacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat |
247439 |
T |
 |
| Q |
404 |
--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
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| T |
247438 |
gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta |
247366 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 473
Target Start/End: Original strand, 171781 - 172242
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Q |
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| T |
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gcaatgagattatcatcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgttgta--------attcaccaa |
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T |
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| Q |
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
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| T |
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tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttcttaacaacaaatcatgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca |
171971 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
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| T |
171972 |
taacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg |
172071 |
T |
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| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
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| T |
172072 |
aacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataat |
172171 |
T |
 |
| Q |
404 |
caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
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| T |
172172 |
caaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 473
Target Start/End: Original strand, 177484 - 177945
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5 |
gcaatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaattcacaaa |
104 |
Q |
| |
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|||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| | | || |||||| || |
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| T |
177484 |
gcaatgagattatcatcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgttgta--------attcaccaa |
177575 |
T |
 |
| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
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| T |
177576 |
tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttcttaacaacaaatcatgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca |
177674 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
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| T |
177675 |
taacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg |
177774 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
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|||||| ||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |
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| T |
177775 |
aacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataat |
177874 |
T |
 |
| Q |
404 |
caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
177875 |
caaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta |
177945 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #3
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Query Start/End: Original strand, 94 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 70914 - 70882
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caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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70914 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 105 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 123460 - 123087
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
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Q |
| |
|
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| T |
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
123361 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
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| T |
123360 |
taacatcaattgaacaagaatcataacttaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg |
123261 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
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|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
123260 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattat |
123161 |
T |
 |
| Q |
404 |
--caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
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|
| T |
123160 |
gcaaaaattcatacaacatttgcaaatttacaaaaattatgatgattatggtgaagactaacccccttacctta |
123087 |
T |
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Target: scaffold0011; HSP #2
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caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
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255106 |
caattcacaaatttcacgaaaacaccaacaaca |
255074 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 94 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 261712 - 261680
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| Q |
94 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
261712 |
caattcacaaatttcacgaaaacaccaacaaca |
261680 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0218 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
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Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | |
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| T |
5356 |
tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagcca |
5258 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
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| T |
5257 |
taacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
5158 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
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| T |
5157 |
aacatgtactttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccattat |
5058 |
T |
 |
| Q |
404 |
-caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaaccc |
464 |
Q |
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| T |
5057 |
gaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgataatgattatgataaagactaaccc |
4996 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
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Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 105 - 432
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| || |||| || | | |
|
|
| T |
148688 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaacca |
148787 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
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| T |
148788 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
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T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || || |
|
|
| T |
148888 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatcaattat |
148987 |
T |
 |
| Q |
404 |
--caaaattcatacaacatttgaaaattcac |
432 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
148988 |
gcaaaaattcatacaacatttgaaatttcac |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #2
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | ||| ||| |
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T |
 |
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atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca |
307 |
Q |
| |
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| T |
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atcaattgaacattaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca |
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T |
 |
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308 |
tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca |
405 |
Q |
| |
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| T |
9020 |
tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa |
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T |
 |
| Q |
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aaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaac |
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Q |
| |
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| T |
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aaatacataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaac |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #3
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| |
|
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|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0498 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 1)
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Target: scaffold0498; HSP #1
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tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca |
8944 |
T |
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205 |
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303 |
Q |
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| T |
8945 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattg |
9044 |
T |
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304 |
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403 |
Q |
| |
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| T |
9045 |
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9144 |
T |
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473 |
Q |
| |
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|
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| T |
9145 |
caaaattcgtacaacttttgaaaatttgcaaaatgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta |
9215 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 105 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 26710 - 26340
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204 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | |
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| T |
26710 |
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26612 |
T |
 |
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205 |
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303 |
Q |
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| T |
26611 |
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26512 |
T |
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| Q |
304 |
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403 |
Q |
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| T |
26511 |
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26412 |
T |
 |
| Q |
404 |
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473 |
Q |
| |
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| T |
26411 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 112 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 8466 - 8180
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112 |
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211 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||| |
|
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| T |
8466 |
aaaacaccagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgtatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc |
8367 |
T |
 |
| Q |
212 |
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310 |
Q |
| |
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| T |
8366 |
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8270 |
T |
 |
| Q |
311 |
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400 |
Q |
| |
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||| | ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |
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| T |
8269 |
aatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
8180 |
T |
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Target: scaffold0009 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
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Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
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Target Start/End: Original strand, 271901 - 272362
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5 |
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104 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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204 |
Q |
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| T |
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272091 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
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| T |
272092 |
taacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg |
272191 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat |
403 |
Q |
| |
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|||||| ||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| | | ||||||||| |
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| T |
272192 |
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272291 |
T |
 |
| Q |
404 |
caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
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||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
272292 |
caaaatttatacaatatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta |
272362 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 4)
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Target: scaffold0141; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 26892 - 27058
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333 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
26892 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
26991 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26992 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
27058 |
T |
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Target: scaffold0141; HSP #2
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Target Start/End: Original strand, 22637 - 22796
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234 |
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333 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
22637 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
22736 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat |
393 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22737 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat |
22796 |
T |
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Target: scaffold0141; HSP #3
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Target Start/End: Original strand, 22578 - 22650
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7 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22578 |
aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac |
22650 |
T |
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Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 26833 - 26905
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7 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26833 |
aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac |
26905 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:
Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
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234 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
1748 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
1649 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1648 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
1582 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 1807 - 1735
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| Q |
7 |
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79 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1807 |
aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac |
1735 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0049 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:
Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
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Target Start/End: Original strand, 48155 - 48443
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
48155 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcta |
48253 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |
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|
| T |
48254 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg |
48353 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat |
393 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
48354 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaat |
48443 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:
Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
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gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa |
367 |
Q |
| |
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|||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
51314 |
gcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac |
51215 |
T |
 |
| Q |
368 |
agttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa |
461 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
51214 |
agttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaa |
51121 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0132 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:
Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 112 - 400
Target Start/End: Original strand, 13480 - 13769
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aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
211 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
13480 |
aaaacacctacaaaaattcaaattctcatcgtcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc |
13579 |
T |
 |
| Q |
212 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg |
310 |
Q |
| |
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||||| ||| | || | | |||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
13580 |
aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt |
13679 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13680 |
aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
13769 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 521
Target Start/End: Original strand, 42677 - 42754
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Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
42677 |
atgattatgataaaaactaacccccttacctt---tatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
42754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0125 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:
Target: scaffold0125; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 112 - 400
Target Start/End: Original strand, 41622 - 41911
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| Q |
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aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| || |||||||||| |
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|
| T |
41622 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatc |
41721 |
T |
 |
| Q |
212 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg |
310 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || | | |||||||| ||||||| | ||||||| | ||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| |
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|
| T |
41722 |
aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt |
41821 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
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||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |
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| T |
41822 |
aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccat |
41911 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 3)
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Target: scaffold0026; HSP #1
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Q |
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||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| | |||||| |||| |||| | |
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| T |
107715 |
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107813 |
T |
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| Q |
205 |
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303 |
Q |
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| T |
107814 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttg |
107913 |
T |
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304 |
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393 |
Q |
| |
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|
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| T |
107914 |
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108003 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
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Target Start/End: Complemental strand, 64812 - 64585
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105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| || |||| ||| | || ||| | |
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| T |
64812 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca |
64714 |
T |
 |
| Q |
205 |
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302 |
Q |
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| T |
64713 |
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64614 |
T |
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| Q |
303 |
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331 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | ||||||||||||||| |
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|
| T |
64613 |
aaacatgtaatttcaccaacaatcataca |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 89905 - 89863
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343 |
ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattta |
385 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
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89905 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1542 (Bit Score: 111; Significance: 9e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:
Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
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tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca |
206 |
Q |
| |
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| T |
828 |
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729 |
T |
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| Q |
207 |
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305 |
Q |
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| T |
728 |
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629 |
T |
 |
| Q |
306 |
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400 |
Q |
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| T |
628 |
catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
534 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
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Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
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Target Start/End: Complemental strand, 9626 - 9371
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211 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | |||||| |
|
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| T |
9626 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc |
9527 |
T |
 |
| Q |
212 |
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310 |
Q |
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| ||| ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | | ||||||| | ||| |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |
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| T |
9526 |
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9427 |
T |
 |
| Q |
311 |
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366 |
Q |
| |
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||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
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| T |
9426 |
aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
9371 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 112 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16269
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aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
211 |
Q |
| |
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|
|
| T |
16524 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc |
16425 |
T |
 |
| Q |
212 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg |
310 |
Q |
| |
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| T |
16424 |
atttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt |
16325 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
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| T |
16324 |
aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
16269 |
T |
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Target: scaffold0075 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:
Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 108 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 34755 - 34460
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108 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||| | |||||| | || || ||| | |
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|
| T |
34755 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata |
34656 |
T |
 |
| Q |
207 |
acatcaattgca-caagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa |
304 |
Q |
| |
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| T |
34655 |
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34556 |
T |
 |
| Q |
305 |
acatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
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||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||| ||| |||||| |
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|
| T |
34555 |
acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat |
34460 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:
Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
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Target Start/End: Complemental strand, 89586 - 89378
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367 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| | |||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
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| T |
89586 |
gcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac |
89487 |
T |
 |
| Q |
368 |
agttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccc |
464 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| |
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| T |
89486 |
agttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatagaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatcatgatgaagactaacccc |
89387 |
T |
 |
| Q |
465 |
cttacctta |
473 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
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| T |
89386 |
cttacctta |
89378 |
T |
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Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
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Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107708
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Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
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|
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107835 |
catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat |
107736 |
T |
 |
| Q |
447 |
tatggtaaagactaa-ccccttacctta |
473 |
Q |
| |
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||| | |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
107735 |
catgatgaagactaacccccttacctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 216
Target Start/End: Original strand, 79533 - 79616
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216 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
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79533 |
ttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattg |
79616 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0529 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:
Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 112 - 389
Target Start/End: Original strand, 2936 - 3215
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211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| |||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| |||||| |
|
|
| T |
2936 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc |
3035 |
T |
 |
| Q |
212 |
aattgca-caagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg |
309 |
Q |
| |
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|||| | || |||||||| ||||||||||| ||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| |
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|
| T |
3036 |
aattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatg |
3135 |
T |
 |
| Q |
310 |
gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaa |
389 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3136 |
taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
3215 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0622 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
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Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
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Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
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caattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
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T |
 |
| Q |
194 |
attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat |
236 |
Q |
| |
|
|||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat |
9480 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0076 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:
Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
42965 |
tttcaccaaaacaccaaca-caatttaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
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T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
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||||||| ||| ||| |||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |
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| T |
43064 |
taacatcacttgaacacgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatattt |
43163 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatc |
365 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
43164 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatagaaacataacatc |
43226 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 5498 - 5254
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| || | |||||| |||| ||| | |
|
|
| T |
5498 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattca |
5401 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
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| T |
5400 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaactcagcaaaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttg |
5301 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca |
350 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5300 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
5254 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0772 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:
Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
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Target Start/End: Original strand, 5660 - 5785
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268 |
gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
5660 |
gcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaa |
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T |
 |
| Q |
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agttggagcacaaatttagcaacaat |
393 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
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| T |
3690 |
tttcaccaaaacatcaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattca |
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T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctca-tttctacatattt |
302 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| |
|
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| T |
3789 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatattt |
3888 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca |
350 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3889 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
3936 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 3 - 265
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204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||| || |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
3 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca |
101 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |
|
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| T |
102 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatattt |
201 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
202 |
aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
265 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:
Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
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| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||| |||||||| | | ||| | |
|
|
| T |
14344 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattca |
14246 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||| | ||||| | | | ||||| | | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14245 |
taacattaattgaacaagaatccaatctcaaattatcaacaacttaggaaaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttc |
14146 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
14145 |
aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacagacataacatca |
14083 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21399 - 21138
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| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||| |||||||| | || ||| | |
|
|
| T |
21399 |
tttcaccaaaacaccaaca-cagttcaaattttcatcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattca |
21301 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| || |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21300 |
taacatcaattgaacaagaatccaatctcaaattaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttg |
21201 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21200 |
aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattaatggatacaaacataacatca |
21138 |
T |
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Target: scaffold0104 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
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Target: scaffold0104; HSP #1
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
48482 |
tttcatcaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatcca |
48580 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatca |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
48581 |
taacatcaagtgaacaagaatca |
48603 |
T |
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Target: scaffold1560 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
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Target: scaffold1560; HSP #1
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| Q |
105 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| | |
|
|
| T |
147 |
tttcaccaaaacaccaa-aacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca |
49 |
T |
 |
| Q |
205 |
caacatcaattgcacaagaatca |
227 |
Q |
| |
|
|| |||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
48 |
taatatcatttgaacaagaatca |
26 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0420 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:
Target: scaffold0420; HSP #1
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268 |
gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13445 |
gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
13347 |
T |
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Target: scaffold0034 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
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Target: scaffold0034; HSP #1
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442 |
atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct |
521 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
80187 |
atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct |
80267 |
T |
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Target: scaffold0016 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:
Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 441 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 166197 - 166116
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| Q |
441 |
gatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct |
521 |
Q |
| |
|
|||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
166197 |
gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
166116 |
T |
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Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 441 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 162111 - 162036
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| Q |
441 |
gatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctat |
515 |
Q |
| |
|
|||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
162111 |
gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat |
162036 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1711 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
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Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
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Target Start/End: Complemental strand, 1424 - 1304
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| Q |
268 |
gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa |
367 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1424 |
gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac |
1325 |
T |
 |
| Q |
368 |
agttggagcacaaatttagca |
388 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1324 |
agcaagagcacgaatttagca |
1304 |
T |
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Target: scaffold0184 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:
Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
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Target Start/End: Complemental strand, 31212 - 31132
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442 |
atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct |
521 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
31212 |
atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
31132 |
T |
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Target: scaffold0066 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0066
Description:
Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
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Target Start/End: Original strand, 54412 - 54630
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134 |
ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctc |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| | || | |||||| ||| | ||||||||||||| | ||| |||||| | ||| |
|
|
| T |
54412 |
ttctcatcatcaatccataaatatgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctc |
54511 |
T |
 |
| Q |
234 |
aattcaactacaacatgtc-aaattcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacata--tttaaacatggaatctaaccaacaatcatac |
330 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||| || ||||||| | ||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||| ||| | ||| |||||||||| |
|
|
| T |
54512 |
atttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaa-tttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaatcatac |
54610 |
T |
 |
| Q |
331 |
acttattatcaattcatgca |
350 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
54611 |
aattatcatcaattcatgca |
54630 |
T |
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Target: scaffold0066; HSP #2
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Target Start/End: Original strand, 45007 - 45051
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134 |
ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattca |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
45007 |
ttctcatcatcaatccataaatatgtatacccaagtcatgattca |
45051 |
T |
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Target: scaffold0066; HSP #3
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Target Start/End: Original strand, 45094 - 45244
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| Q |
202 |
caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttctcatttctacatat |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||| |||||| | |||| |||||| ||||||| ||||| |||| | ||| | ||||||| || ||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
45094 |
caacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaattt-caaaacttgacatttatacatac |
45192 |
T |
 |
| Q |
301 |
tt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca |
350 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
45193 |
tttgaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
45244 |
T |
 |
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Target: scaffold0686 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
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Description:
Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
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442 |
atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctat |
515 |
Q |
| |
|
||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
5809 |
atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat |
5735 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0686; HSP #2
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442 |
atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctat |
515 |
Q |
| |
|
||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6015 |
atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat |
5941 |
T |
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Target: scaffold1404; HSP #1
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1815 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaa |
1863 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0361 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
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Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
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113 |
aaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3183 |
aaacaccaacaacaattccaattctcttcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaa |
3252 |
T |
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Target: scaffold0361; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 317 - 400
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317 |
accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat |
400 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||| || | |||||| ||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
3370 |
accaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat |
3453 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0342; HSP #1
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gatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct |
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
385 |
gatgattatgataaagaataaccccgttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct |
304 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0053 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
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Target: scaffold0053; HSP #1
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94 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc |
192 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| | || ||| |
|
|
| T |
77139 |
caattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatc |
77041 |
T |
 |
| Q |
193 |
tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat |
249 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
77040 |
acttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacat |
76984 |
T |
 |
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94 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc |
192 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| | |||| | | ||||| |
|
|
| T |
132542 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttc-atttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatg |
132444 |
T |
 |
| Q |
193 |
tattagcatcaacaacatcaattg |
216 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
132443 |
acttaacaacaacaacatcaattg |
132420 |
T |
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Target: scaffold0483; HSP #1
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| Q |
18 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1089 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaac |
1028 |
T |
 |
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18 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
45876 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaac |
45815 |
T |
 |
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| Q |
462 |
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521 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
1721 |
ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct |
1780 |
T |
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| Q |
462 |
ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct |
521 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
19861 |
ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct |
19802 |
T |
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5 |
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79 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24570 |
gcaatgagattatcatcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac |
24496 |
T |
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| Q |
5 |
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79 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1273 |
gcaatgagattatcatcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac |
1347 |
T |
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| Q |
5 |
gcaatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| || ||||| || ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
12081 |
gcaatgagattatcatcaacaattaaacacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaac |
12007 |
T |
 |
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| Q |
343 |
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384 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
1587 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
1546 |
T |
 |
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Target: scaffold0456; HSP #2
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| Q |
343 |
ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt |
384 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
8732 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
8691 |
T |
 |
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Target: scaffold0240; HSP #1
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| Q |
94 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7522 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca |
7551 |
T |
 |
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Target: scaffold0160 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
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Target: scaffold0160; HSP #1
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| Q |
18 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
79 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3406 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac |
3467 |
T |
 |
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Target: scaffold0123 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
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Target: scaffold0123; HSP #1
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| Q |
343 |
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384 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
8216 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
8257 |
T |
 |
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| Q |
275 |
tttcataacttctcatttctacatattt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg |
372 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||| || ||||||| ||| | | | ||||||||||| |||| ||||| ||||||| || || ||| ||||| |||| |
|
|
| T |
56226 |
tttcataacttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagtta |
56127 |
T |
 |
| Q |
373 |
gagcacaaatttagcaacaat |
393 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
56126 |
gagcacgaatttaacaacaat |
56106 |
T |
 |
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Target: scaffold0058 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
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| Q |
343 |
ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt |
384 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
70348 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaattt |
70307 |
T |
 |
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Target: scaffold0044 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
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Target: scaffold0044; HSP #1
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| Q |
94 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38253 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca |
38282 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0970 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
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Target: scaffold0970; HSP #1
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| Q |
160 |
atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
2476 |
atacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg |
2532 |
T |
 |
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98 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||| || ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
1705 |
aacaattaatcacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
1629 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
© Oklahoma State University