View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10261A_low_188 (Length: 268)

Name: NF10261A_low_188
Description: NF10261A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10261A_low_188
NF10261A_low_188
[»] chr8 (10 HSPs)
chr8 (6-266)||(16755558-16755818)
chr8 (6-266)||(28329518-28329778)
chr8 (6-266)||(28892387-28892647)
chr8 (6-266)||(33034264-33034524)
chr8 (6-266)||(21039053-21039314)
chr8 (6-266)||(15946286-15946546)
chr8 (58-257)||(18867258-18867457)
chr8 (58-257)||(10685852-10686051)
chr8 (58-257)||(35743689-35743888)
chr8 (58-211)||(26299673-26299826)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (6-266)||(2737828-2738088)
chr2 (6-266)||(39683871-39684131)
chr2 (6-266)||(45569013-45569273)
chr2 (6-266)||(20053058-20053318)
chr2 (6-266)||(22715532-22715791)
chr2 (6-139)||(17933834-17933967)
chr2 (99-266)||(28455894-28456061)
chr2 (172-266)||(17933744-17933838)
chr2 (58-257)||(19347578-19347777)
chr2 (58-257)||(25394186-25394385)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (6-266)||(13880362-13880622)
chr6 (6-266)||(35204361-35204621)
chr6 (6-266)||(17693153-17693413)
chr6 (6-266)||(22349269-22349529)
chr6 (10-266)||(25943292-25943548)
chr6 (58-257)||(14739160-14739359)
chr6 (58-257)||(33332664-33332863)
chr6 (58-98)||(24433068-24433108)
chr6 (117-210)||(24077284-24077377)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (6-266)||(6304934-6305194)
chr3 (6-266)||(10097104-10097364)
chr3 (6-266)||(10203990-10204250)
chr3 (6-266)||(10898628-10898892)
chr3 (6-266)||(54190131-54190391)
chr3 (6-266)||(10611075-10611335)
chr3 (6-266)||(22624277-22624537)
chr3 (6-266)||(16459088-16459347)
chr3 (6-266)||(29912251-29912513)
chr3 (6-264)||(47881186-47881444)
chr3 (58-257)||(8515394-8515593)
chr3 (58-257)||(32478640-32478839)
chr3 (58-257)||(2673808-2674007)
chr3 (58-257)||(28490761-28490960)
chr3 (58-257)||(1309171-1309370)
chr3 (58-101)||(3325282-3325325)
[»] chr7 (12 HSPs)
chr7 (6-266)||(3323086-3323345)
chr7 (6-266)||(25407037-25407297)
chr7 (6-266)||(7071674-7071934)
chr7 (6-266)||(25352975-25353235)
chr7 (6-266)||(44012828-44013088)
chr7 (58-257)||(24262911-24263110)
chr7 (58-257)||(16883227-16883426)
chr7 (58-257)||(18411958-18412157)
chr7 (58-257)||(21644337-21644536)
chr7 (58-257)||(49089988-49090187)
chr7 (62-257)||(9186733-9186928)
chr7 (166-257)||(21987328-21987419)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (6-266)||(49504-49764)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (6-266)||(9523351-9523611)
chr1 (21-146)||(2397536-2397661)
chr1 (149-266)||(2399666-2399782)
chr1 (58-257)||(41396539-41396738)
chr1 (58-257)||(47100406-47100605)
chr1 (6-43)||(14189683-14189720)
[»] chr5 (12 HSPs)
chr5 (6-266)||(25447110-25447370)
chr5 (58-257)||(27448123-27448321)
chr5 (58-257)||(31398580-31398779)
chr5 (58-257)||(43595421-43595620)
chr5 (58-257)||(43628215-43628414)
chr5 (61-257)||(33789659-33789855)
chr5 (204-266)||(10628982-10629044)
chr5 (58-257)||(31302569-31302768)
chr5 (58-257)||(24557172-24557371)
chr5 (58-257)||(24598204-24598403)
chr5 (58-259)||(31334880-31335081)
chr5 (62-145)||(37558302-37558385)
[»] chr4 (10 HSPs)
chr4 (6-266)||(15313941-15314201)
chr4 (6-266)||(16634113-16634374)
chr4 (58-257)||(9225992-9226191)
chr4 (139-266)||(4559828-4559956)
chr4 (6-150)||(4567078-4567222)
chr4 (58-257)||(16625581-16625780)
chr4 (58-257)||(5146208-5146407)
chr4 (58-110)||(18858876-18858928)
chr4 (6-66)||(47564585-47564645)
chr4 (118-257)||(18860132-18860271)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (6-266)||(17948-18209)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (58-257)||(15897-16096)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (166-257)||(916-1007)
scaffold0006 (166-257)||(9072-9163)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (9-98)||(35261-35350)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 10)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 16755558 - 16755818
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755558 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgtgtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 16755657  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16755658 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacagaaatctagcttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgtt 16755757  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755758 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 16755818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28329778 - 28329518
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28329778 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgttggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 28329679  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28329678 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgttttcctaatgtgcagttatcacagaaatctagcttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgtt 28329579  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28329578 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 28329518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28892647 - 28892387
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28892647 atcaatgatagacatgaaatatgaaactcccccatgagtcttgactgatgctggaccccaaagatccaaatgaacatactcaaaaggcctactagatttg 28892548  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28892547 tgcagccccactccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacataaacctagcttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgtt 28892448  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28892447 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaatctcaaatgccatagtttagt 28892387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 33034524 - 33034264
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33034524 atcaataatagacatgaaattagaacctcccccatgagttttaactgatgttggaccccaaagatccgaatgaacaaactcaaaaggcctactagattta 33034425  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  33034424 tgcacacacaccccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcaattatcacagaaatctagtttgttcaatttttcattccctaacaaaccttgtt 33034325  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33034324 tagctagctcaaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 33034264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21039314 - 21039053
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  21039314 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccacatgagtcttaactgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatacttaaaaggcctactaaattta 21039215  T
Q  106 tgcacccccactcc-aaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgt 204  Q
    ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  21039214 tgcacacccaaccctaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacagaaatctagtttattcaatttttcattccctagcaagccttgt 21039115  T
Q  205 ttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21039114 ttagctagcttaaccaaacccctctcactaatatgacctaacctcaaatgccatagtttagt 21039053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15946546 - 15946286
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  15946546 atcaataatagacatgaaatatgaacctcctcgatgagttttaactgatgttggaccccaaagatctgaatgaacatactaaaaaagcctaccagaatta 15946447  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| | |||||  || ||||| ||| | |||||| |||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15946446 tgcacacccaccccaaacttcacatggtgttactttcctaacgtgtaattatcaaagaattatagtttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgtt 15946347  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  15946346 tagctagctcaaccaaacccttctcactgacatgacctaacctcaaataccacaatttagt 15946286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18867457 - 18867258
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttat 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||   ||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| |  |    
T  18867457 ggaccccaaagatccgaatgcacatactcaaaaggcctactagaatgatgcatgccacttccaaacttcaccctatgttgttttcctagtatgcaatgct 18867358  T
Q  158 catagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    || | || |||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  18867357 cacaaaattctagcttgtccaatttatctttccctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacccctttcactaacatgccccaacctcaaatgcca 18867258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10686051 - 10685852
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttat 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||   ||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| |  |    
T  10686051 ggaccccaaagatccgaatgcacatactcaaaaggtctactagaatgatgcatgccacttccaaacttcaccctatgttgtttgcctagtatgcaatgtt 10685952  T
Q  158 catagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    || | || |||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  10685951 cacaaaattctagcttgtccaatttatctttccctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacccctctcactaacatgccccaatctcaaatgcca 10685852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Original strand, 35743689 - 35743888
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttat 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||   ||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| |  |    
T  35743689 ggaccccaaagatccgaatgcacatactcaaaaggtctactagaatgatgcatgccacttccaaacttcaccctatgttgtttgcctagtatgcaatgtt 35743788  T
Q  158 catagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    || | || |||||||| | |||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  35743789 cacaaaattctagcttatccaatttatctttccctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacccctctcactaacatgccccaatctcaaatgcca 35743888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 211
Target Start/End: Original strand, 26299673 - 26299826
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccact-ccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagtta 156  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||| |||||||| || || ||||| || |||| | |||| |      
T  26299673 ggaccccaaagatccgaatgcacatactcaaaaggcctactagaatgatgca-taccactaccaaactttactttatgttgcttgcctagtatgcaatgc 26299771  T
Q  157 tcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagcta 211  Q
    ||| | || |||||||||| |||||| || ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  26299772 tcacaaaattctagcttgtccaatttatcttttcctatcaaaccttgttttgcta 26299826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2738088 - 2737828
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2738088 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 2737989  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2737988 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacagaaatctagcttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgtt 2737889  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2737888 tagctagctccaccaaacctctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 2737828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39684131 - 39683871
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39684131 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 39684032  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  39684031 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacagaaatctagcttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgtt 39683932  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39683931 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgtcaaagtttagt 39683871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 45569273 - 45569013
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45569273 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 45569174  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  45569173 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacagaaatctagcttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgtt 45569074  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45569073 tagcttgctccaccaaacccctttcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 45569013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 20053058 - 20053318
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20053058 atcaatgatagacatgaaatatgaacctccctcatgagtcttaactgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 20053157  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  20053158 tgcacacccaccccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacagaaatctagtttgttcaatttttcattccctagaaaaccttgtt 20053257  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20053258 tagctagctcaaccaaacccctctcactaacatgacctaacctcaaatgccatagtttagt 20053318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 22715532 - 22715791
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22715532 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccc-atgagtcttgactgatgctggaccacaaagatctgaatgaacatactcaaacggcctactagattta 22715630  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22715631 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtaaagttatcacagaaatctagcttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgtt 22715730  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22715731 tagctagctcaaccaaatccctctcactaacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 22715791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 17933967 - 17933834
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  17933967 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtattaactgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaatggcttaatagattta 17933868  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17933867 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtt 17933834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 266
Target Start/End: Original strand, 28455894 - 28456061
Alignment:
Q  99 agatttatgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaa 198  Q
    ||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28455894 agatttatgtacacctaccccaaacttcaccttgtgttgttttcctaacgtgcaattatcacagaaatataatttgttcaatttttcattccctagcaaa 28455993  T
Q  199 cattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    | |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  28455994 ccttgtttagttagctcaaccaaacccctctcattaacatgacttaacctgaaatgccatagtttagt 28456061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 172 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17933838 - 17933744
Alignment:
Q  172 ttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17933838 ttgttcaatttttcattccctagcaacccttgtttagctagctcaaccaaacccctctcactgacatgacccaacctcaaatgccacagtttagt 17933744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Original strand, 19347578 - 19347777
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttat 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||   ||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| |  |    
T  19347578 ggaccccaaagatccgaatgcacatactcaaaaggtctactagaatgatgcatgccacttccaaacttcaccctatgttgtttgcctagtatgcaatgtt 19347677  T
Q  158 catagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    || | || |||||||| | |||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  19347678 cacaaaattctagcttatccaatttatctttccctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacccctctcactaacatgccccaatctcaaatgcca 19347777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Original strand, 25394186 - 25394385
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccact-ccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagtta 156  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||   ||||| |||||||| ||  | ||||| || ||||   |||| |      
T  25394186 ggaccccaaagatccgaatgcacatactcaaaaggcctactagaatgataca-tgccactaccaaactttactctatgttgcttgcctagcatgcaatgc 25394284  T
Q  157 tcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcc 256  Q
    ||  | || |||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||    
T  25394285 tcgcaaaattctagcttgtccaatttatcttttcctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacctctttcactaacatgccccaatctcaaatgcc 25394384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13880622 - 13880362
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13880622 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgattcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 13880523  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  13880522 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacaaaaatctagcttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgtt 13880423  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13880422 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 13880362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 35204361 - 35204621
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35204361 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggtctactagattta 35204460  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  35204461 tgcacccccactccaaatttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacagaaatctagcttgttcaatttttcattccctagaaaaccttgtt 35204560  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35204561 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 35204621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 17693153 - 17693413
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17693153 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttttttgatgttggaccccaaagttccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 17693252  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17693253 tgcacacccaccccaaacttcaacttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacagaattctagcttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgtt 17693352  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17693353 tagctagctcaaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgtcatagtttagt 17693413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 22349269 - 22349529
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22349269 atcaataattgacatgaaatatgaaccttccccatgagtcttgactgatgctggaccccaaagatccgaataaacatactcaaaaggcctactagattta 22349368  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22349369 tgcacacccaccccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgaagttatcacagaaatctagtttgttcaatttttcattccctagcaaactttgtt 22349468  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22349469 tagctagctcaaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgtcatagtttagt 22349529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25943548 - 25943292
Alignment:
Q  10 atgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  25943548 atgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttaacagatgctggaccccaaagatccgaatgaatatacttaaaaggcctactagatttatgta 25943449  T
Q  110 cccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagc 209  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25943448 cacccactccaaacttcaccttatgttgtttgcctaatgtgcagttatcacagaaatctagtctgttcaatttttcattccctagcaaaccttgtttagc 25943349  T
Q  210 tagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25943348 tagctcaaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgtcatagtttagt 25943292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14739359 - 14739160
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactcc-aaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagtta 156  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  || ||||| |||||||||| | |||||||| |||| | |||| |      
T  14739359 ggaccccaaagatctgaatgcacatactcaaaaggcctactagaatgatgcatgcc-actcccaaacttcaccctatgttgtttgcctagtatgcaatgc 14739261  T
Q  157 tcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcc 256  Q
    ||| | || |||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  14739260 tcacaaaattctagcttgtccaatttatctttccctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacccctctcactaacatgccccaatctcaaatgcc 14739161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33332863 - 33332664
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttat 157  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||   ||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| |  |    
T  33332863 ggaccccaaagatctgaatgcacatactcaaaaggtctactagaatgatgcatgccacttccaaacttcaccctatgttgtttgcctagtatgcaatgtt 33332764  T
Q  158 catagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    || | || || ||||||| |||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  33332763 cacaaaattcaagcttgtccaatttatctttccctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacccctctcactaacatgccccaacctcaaatgcca 33332664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 24433108 - 24433068
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctact 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24433108 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggtctact 24433068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 210
Target Start/End: Original strand, 24077284 - 24077377
Alignment:
Q  117 tccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagct 210  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| | |||| | |||| | || |||| ||| | |||||| || |||||| |||||| ||||||||||    
T  24077284 tccaaacttcactttatgttgtttacctagtatgcaatgatcacaaaattctaacttatccaatttatcttttccttgcaaaccttgtttagct 24077377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6305194 - 6304934
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6305194 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 6305095  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6305094 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacagaaatctagcttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgtt 6304995  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6304994 tagctcgctccaccaaacccctttcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 6304934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 10097104 - 10097364
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10097104 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgattcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 10097203  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10097204 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacaaaaatctagcttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgtt 10097303  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10097304 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 10097364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 10203990 - 10204250
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10203990 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgattcttcgtcgatgttggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 10204089  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10204090 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacagaaatctagcttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgtt 10204189  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10204190 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 10204250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10898892 - 10898628
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10898892 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttagttgatgctggaccccacagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 10898793  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10898792 tgtacacccactccaaacttcaccttgtgttgttttcctaatgtgcagttatcacagaaatctagcttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgtt 10898693  T
Q  206 tagctagctccaccaaa----cccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    ||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10898692 tagatagctccaccaaaccggcccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccatagtttagt 10898628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 54190391 - 54190131
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54190391 atcaacgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttaactgatgctagaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 54190292  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  54190291 tgtacacccactccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacagaaatctagcttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgct 54190192  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  54190191 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgtcatagtttagt 54190131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 10611075 - 10611335
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10611075 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttaactgatgcaggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 10611174  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10611175 tgcacacccaccccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagtgatcacagaaatctagtttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgtt 10611274  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10611275 tagctagctcaaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgtcatagtttagt 10611335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 22624277 - 22624537
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22624277 atcaatgatagacatgaaatatgaacctctcccatgagtcttgactgatgctggaccccaaagatctgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 22624376  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  22624377 tgtacgcccactccaaacttcaccttgtgctgtttgcctaatgtgcagttatcacagaaatctagcttgttcaatttttcattccatagcaaaccttgtt 22624476  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22624477 tagctagctcaaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccatagtttagt 22624537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16459347 - 16459088
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16459347 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccc-atgagtcttgactgatgctggaccacaaagatctgaatgaacatactcaaacggcctactagattta 16459249  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16459248 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgtagttatcacagaaatctagcttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgtt 16459149  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16459148 tagctagctcaaccaaatccctctcactaacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 16459088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 29912251 - 29912513
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29912251 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtattaactgatgctggaccctaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 29912350  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  29912351 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacagaaatccagcttgttcaatttttcattccctagcaacccttgtt 29912450  T
Q  206 tagctagctccaccaaa--cccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    ||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29912451 tagctagttcaaccaaatccccctctcactgacatgacccaacctcaaatgccatagtttagt 29912513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 264
Target Start/End: Original strand, 47881186 - 47881444
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47881186 atcaataatagacatgaaatatgaacctcccccatgagttttaactgatgctggaccccaaagatccgaattaacatactcaaaaggcctactagattta 47881285  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||  |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  47881286 tgcatacccaccacaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcaattatcacagaaatctagtttgttcaatttttcatgccctagcaaaccttgtt 47881385  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagttta 264  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47881386 tggctagctcaaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccacagttta 47881444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Original strand, 8515394 - 8515593
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttat 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||   ||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| |  |    
T  8515394 ggaccccaaagatccgaatgcacatactcaaaaggtctactagaatgatgcatgccacttccaaacttcaccctatgttgtttgcctagtatgcaatgtt 8515493  T
Q  158 catagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    || | || |||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  8515494 cacaaaattctagcttgtccaatttatctttccctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacccctctcactaacatgccccaatctcaaatgcca 8515593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Original strand, 32478640 - 32478839
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttat 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||   ||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| |  |    
T  32478640 ggaccccaaagatccgaatgcacatactcaaaaggtctactagaatgatgcatgccacttccaaacttcaccctatgttgtttgcctagtatgcaatgtt 32478739  T
Q  158 catagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    || | || |||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  32478740 cacaaaattctagcttgtccaatttatctttccctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacccctctcactaacatgccccaatctcaaatgcca 32478839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2674007 - 2673808
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactcc-aaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagtta 156  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||  || ||||| |||||||||| | |||||||| |||| | |||| |      
T  2674007 ggaccccaaagatccgaatgcacatactcaaaaggtctactagaatgatgcatgcc-actcccaaacttcaccctatgttgtttgcctagtatgcaatgt 2673909  T
Q  157 tcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcc 256  Q
    ||| | || |||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  2673908 tcacaaaattctagcttgtccaatttatctttccctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacccctctcactaacatgccccaatctcaaatgcc 2673809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28490960 - 28490761
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttat 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||   |   ||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| |  |    
T  28490960 ggaccccaaagatccgaatgcacattctcaaaaggcctactagaatgatgcatgtcacttccaaacttcaccctatgttgtttgcctagtatgcaatgct 28490861  T
Q  158 catagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    || | || |||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  || || |||||||||||    
T  28490860 cacaaaattctagcttgtacaatttatctttccctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacccctctcactaacataccccaatctcaaatgcca 28490761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Original strand, 1309171 - 1309370
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccact-ccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagtta 156  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||  || ||| |||||||| ||  | ||||| || |||| | |||| |      
T  1309171 ggaccccaaagatctgaatgcacatactcaaaaggcttactagaatgatgcatacc-actaccaaactttactctatgttgctttcctagtatgcaatgc 1309269  T
Q  157 tcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcc 256  Q
    ||| | || |||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  1309270 tcacaaaattctagcttgtccaatttatcttttcctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacctctttcactaacatgcctcaacctcaaatgcc 1309369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 3325325 - 3325282
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactaga 101  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3325325 ggaccccaaaggtccgaatgtacatactcaaaaggtctactaga 3325282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 12)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 3323086 - 3323345
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3323086 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 3323185  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  3323186 tgcacccc-actccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacagaaatctagcttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgtt 3323284  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3323285 tagctagctccaccaaacccctttcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 3323345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25407297 - 25407037
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25407297 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttaactgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 25407198  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  25407197 tgtacacccactccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacagaaatctagcttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgtt 25407098  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25407097 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 25407037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7071934 - 7071674
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7071934 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttgactgatgctggaccccaaagatccaaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 7071835  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||  ||||    
T  7071834 tgtacacccactccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacagaaatctagcttgttcaattttccattccctcgcaaaccatgtt 7071735  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7071734 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 7071674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25353235 - 25352975
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25353235 atcaatgatagacacgaaatatgaacctcccccatgagtattaactgatgctggaccccaaagatccgaatggacatactcaaaaggcctactagattta 25353136  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  25353135 tgcatccccactccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacagaaatccagcttgttcaatttttcattccctagcaacccttgtt 25353036  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  25353035 tagctagctcaaccaaacccctctcactgacatgacccaacctcaaatgccacaatttagt 25352975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 44012828 - 44013088
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44012828 atcaataatagacatgaaatatgaacctccctcatgagttttaactgatgttggatcccagagatccgaatgaacatactcaaaagacctactagattta 44012927  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  44012928 tgcacacccactccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcaattatcacagaaatctagtttgttcaatttttcattccctagcaaaacttgtt 44013027  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  44013028 tagctagctcaaccaaaccgctctcactaacatgacccaacctcaaatgccacaatttagt 44013088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24263110 - 24262911
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttat 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||   ||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| |  |    
T  24263110 ggaccccaaagatccgaatgcacatactcaaaaggtctactagaatgatgcatgccacttccaaacttcaccctatgttgtttgcctagtatgcaatgtt 24263011  T
Q  158 catagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    || | || |||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  24263010 cacaaaattctagcttgtccaatttatctttccctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacccctctcactaacatgccccaatctcaaatgcca 24262911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Original strand, 16883227 - 16883426
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttat 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||   ||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| |  |    
T  16883227 ggaccccaaagatccgaatgcacatactcaaaaggtctactagaatgatgcatgccacttccaaacttcaccctatgttgtttgcctagtatgcaatgtt 16883326  T
Q  158 catagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    || | || |||||||| | |||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  16883327 cacaaaattctagcttatccaatttatctttccctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacccctctcactaacatgccccaatctcaaatgcca 16883426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Original strand, 18411958 - 18412157
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccact-ccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagtta 156  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||  || ||| |||||||| ||  | ||||| || |||| | |||| |      
T  18411958 ggacccaaaagatccgaatgcacatactcaaaaagcctactagaatgatgcatgcc-actaccaaactttactctatgttgcttgcctagtatgcaatgc 18412056  T
Q  157 tcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcc 256  Q
    ||| | || |||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  18412057 tcacaaaattctagcttgtccaatttatcttttcctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacctctttcactaacatgccccaacctcaaatgcc 18412156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Original strand, 21644337 - 21644536
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccact-ccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagtta 156  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||| |||||||||||  | ||||| || |||| | |||| |      
T  21644337 ggaccccaaagatccgaatgcacatactcaaaaggcctactagaatgatgca-tgccactaccaaacttcactatatgttgcttgcctagtatgcattgc 21644435  T
Q  157 tcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcc 256  Q
    ||| | || |||||||||| |||||| || || |||||||||  |||||||||||| || || ||| | || ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  21644436 tcacaaaattctagcttgtccaatttatctttccctagcaaatcttgtttagctagttcaactaaatctctttcactaacatgccccaacctcaaatgcc 21644535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Original strand, 49089988 - 49090187
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccact-ccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagtta 156  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||| |||||||| ||  | ||||| || |||| | |||| |      
T  49089988 ggaccccaaaggtctgaatgtacatactcaaaaggcctactagaatgatgca-taccactaccaaactttactctatgttgcttgcctagtatgcaatgc 49090086  T
Q  157 tcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcc 256  Q
    | | | || |||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||| ||| || || ||||| || ||||| |||||  | || ||||||||||    
T  49090087 ttacaaaattctagcttgtccaatttatcttttcctagcaaaccttgtttagttagttcaactaaacctctttcactaacatgctccaatctcaaatgcc 49090186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 9186928 - 9186733
Alignment:
Q  62 cccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccact-ccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcat 160  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||  || ||| |||||||| ||  | ||||| || |||| | |||| |  |||     
T  9186928 cccaaaggtctgaatgcacatactcaaaatgcctactagaatgatgcatacc-actaccaaactttactctatgttgcttgcctagtatgcaatgctcac 9186830  T
Q  161 agaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    | || |||||||||| |||||| || ||| |||| |||| |||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  9186829 aaaattctagcttgtccaatttatcttttactagaaaaccttgtttagctagttcaactaaacctctttcactaacatgccccaaactcaaatgcca 9186733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 257
Target Start/End: Original strand, 21987328 - 21987419
Alignment:
Q  166 tctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    |||||||||| |||| | || ||||||||||||| |||||||||||| |  || ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  21987328 tctagcttgtccaatgtatcttttcctagcaaaccttgtttagctagtttaactaaacctctttcactaacatgccccaatctcaaatgcca 21987419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 49504 - 49764
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49504 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtattgactgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 49603  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  49604 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacagaaatctagtttgttcaatttttcattccctagtaaaccttgtt 49703  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49704 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccatagtttagt 49764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9523611 - 9523351
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9523611 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttgaccgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 9523512  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9523511 tgtacacccactccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacagaaatctagtttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgtt 9523412  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9523411 tagctagctcaaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccatagtttagt 9523351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 146
Target Start/End: Original strand, 2397536 - 2397661
Alignment:
Q  21 gaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactcca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  2397536 gaaatatgaacctcccccatgagttttaactgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacacccacccca 2397635  T
Q  121 aacttcaccttgtgttgtttacctaa 146  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||    
T  2397636 aacttcaccttgtgctgtttgcctaa 2397661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 266
Target Start/End: Original strand, 2399666 - 2399782
Alignment:
Q  149 tgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacct 248  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2399666 tgcaattatcatagaaatctagtttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgtt-agctagatcaaccaaacccctatcactgacatgacctaacct 2399764  T
Q  249 caaatgccaaagtttagt 266  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  2399765 caaatgccacagtttagt 2399782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Original strand, 41396539 - 41396738
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttat 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||   ||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| |  |    
T  41396539 ggaccccaaagatccgaatgcacatactcaaaaggcctactagaatgatgcatgccacttccaaacttcaccctatgttgtttgcctagtatgcaatgct 41396638  T
Q  158 catagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    || | || |||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  41396639 cacaaaattctagcttgtccaatttatctttccctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacccctctcactaacatgccccaatctcaaatgcca 41396738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 47100605 - 47100406
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccact-ccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagtta 156  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  || ||| |||||||| ||  | ||||| || |||||| |||| |      
T  47100605 ggaccgcaaaggtccgaatgtacatactcaaaaggcctactagaatgatgcatacc-actaccaaactttactctatgttgcttgcctaatatgcaatgt 47100507  T
Q  157 tcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcc 256  Q
    ||| | || |||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||    
T  47100506 tcacaaaattctagcttgtccaatttatcttttcctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacctctttcactaacatgccccaatctcaaatgcc 47100407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 14189720 - 14189683
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgag 43  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14189720 atcaataatagacatgaaatatgaacctccccaatgag 14189683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 12)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25447370 - 25447110
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25447370 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttgactgatgctgaaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaagacctactagattta 25447271  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  25447270 tgtacacccactccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacagaaatctagcttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgct 25447171  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25447170 tagctagctccaccaaacccttctcactgacatgacctaacctcaaatgccatagtttagt 25447110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Original strand, 27448123 - 27448321
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttat 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||   ||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| |  |    
T  27448123 ggaccccaaagatccgaatgcacatactcaaaaggcctactagaatgatgcatgccacttccaaacttcaccctatgttgtttgcctagtatgcaatgct 27448222  T
Q  158 catagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    || | || |||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  27448223 cacaaaattctagcttgtccaatttatctttccctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacccctctcactaacatg-cccaatctcaaatgcca 27448321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31398779 - 31398580
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttat 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||   ||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| |  |    
T  31398779 ggaccccaaagatccgaatgcacatactcaaaaggtctactagaatgatgcatgccacttccaaacttcaccctatgttgtttgcctagtatgcaatgtt 31398680  T
Q  158 catagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    || | || |||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  31398679 cacaaaattctagcttgtccaatttatctttccctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacccctctcactaacatgccccaatctcaaatgcca 31398580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Original strand, 43595421 - 43595620
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttat 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||  ||   ||||||||||||| | |||||||| | || | |||| |  |    
T  43595421 ggaccccaaagatccgaatgcacatactcaaaagacctactagaatgatgcatgccacttccaaacttcaccctatgttgtttgcttagtatgcaatgct 43595520  T
Q  158 catagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    || | || |||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||  ||||| || || |||||||||||    
T  43595521 cacaaaattctagcttgtccaatttatctttccctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacccctctcacgaacatgccccaatctcaaatgcca 43595620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Original strand, 43628215 - 43628414
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttat 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||  ||   ||||||||||||| | |||||||| | || | |||| |  |    
T  43628215 ggaccccaaagatccgaatgcacatactcaaaagacctactagaatgatgcatgccacttccaaacttcaccctatgttgtttgcttagtatgcaatgct 43628314  T
Q  158 catagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    || | || |||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||  ||||| || || |||||||||||    
T  43628315 cacaaaattctagcttgtccaatttatctttccctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacccctctcacgaacatgccccaatctcaaatgcca 43628414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 257
Target Start/End: Original strand, 33789659 - 33789855
Alignment:
Q  61 ccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcat 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||   ||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| |  | |     
T  33789659 ccccaaagatccgaatgcacatactcaaaaggtctactagaatgatgcatgccacttccaaacttcaccctatgttgtttgcctagtatgcaatgtttac 33789758  T
Q  161 agaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    | || |||||||| | |||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  33789759 aaaattctagcttatccaatttatctttccctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacccctctcactaacatgccccaatctcaaatgcca 33789855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 204 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10629044 - 10628982
Alignment:
Q  204 tttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10629044 tttagctagctcaaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccacagtttagt 10628982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Original strand, 31302569 - 31302768
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttat 157  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||  ||   ||||||||| ||||| |||||||| |||  | |||| | ||    
T  31302569 ggaccccaaaaatccaaatgcacatactcaaagggcctactagaatgatgcatgccacatccaaacttaaccttatgttgttttccttgtatgcaatcat 31302668  T
Q  158 catagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    |||| || |||||||| | |||||| |  |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| | || |||||  |||  |||||||| ||||||||    
T  31302669 cataaaattctagcttttccaatttatattttcctagaaaaccttgtttagctagttctactaaatcactttcactagcattccctaaccttaaatgcca 31302768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24557371 - 24557172
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactc-caaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagtta 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||  || |||  ||||||| ||| | ||||| || |||| | |||| |      
T  24557371 ggaccccaaaggtccgaatgtacatactcaaaaggcttactagaataatgcatacc-actatcaaacttgaccctatgttgctttcctagtatgcaatgc 24557273  T
Q  157 tcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcc 256  Q
    ||| | || ||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| | || ||||| ||||| || || ||||||||||    
T  24557272 tcacaaaattctagcttgtctaatttatcttttcctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaatctctttcactaacatgccccaatctcaaatgcc 24557173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24598403 - 24598204
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactc-caaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagtta 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||  || |||  ||||||| ||| | ||||| || |||| | |||| |      
T  24598403 ggaccccaaaggtccgaatgtacatactcaaaaggcttactagaataatgcatacc-actatcaaacttgaccctatgttgctttcctagtatgcaatgc 24598305  T
Q  157 tcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcc 256  Q
    ||| | || ||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| | || ||||| ||||| || || ||||||||||    
T  24598304 tcacaaaattctagcttgtctaatttatcttttcctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaatctctttcactaacatgccccaatctcaaatgcc 24598205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 259
Target Start/End: Original strand, 31334880 - 31335081
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttat 157  Q
    ||||||| || |||| |||| ||||||||||| | ||||||||| | |||||  ||   ||||||||| ||||| |||||||| |||  | |||| | ||    
T  31334880 ggacccccaaaatccaaatgcacatactcaaaggacctactagaatgatgcatgccagatccaaacttaaccttatgttgttttccttgtatgcaatcat 31334979  T
Q  158 catagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    |||| || |||||||| | |||||| |  |||||||| |||  |||||||||||| || || ||| | || |||||  |||  |||||||| ||||||||    
T  31334980 cataaaattctagcttttccaatttatattttcctaggaaatcttgtttagctagttctactaaatcactttcactagcattccctaaccttaaatgcca 31335079  T
Q  258 aa 259  Q
    ||    
T  31335080 aa 31335081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 37558385 - 37558302
Alignment:
Q  62 cccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccact-ccaaacttcaccttgtgttgtttaccta 145  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||   ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||    
T  37558385 cccaaagatccgaatgcacatactcaaaaggtctactagaatgatgca-tgccactcccaaacttcaccctatgttgtttgccta 37558302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 10)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15314201 - 15313941
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||     ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15314201 atcaatgatagacgtgaaatatgaacctcccccataagtcttaactcatgctggacccaaaagatccgaatgaacctactcaaaaggcctactagattta 15314102  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15314101 tgcacacccactccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacagaaatctagtttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgtt 15314002  T
Q  206 tagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15314001 tagctagctcaaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccatagtttagt 15313941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16634374 - 16634113
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16634374 atcaataatagacatgaaatatgaacctcccccatgaggtttaattgatgttggaccccaaaggtccgaatgaacatacacaaaaggcctactagattta 16634275  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtt 205  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  16634274 tgcacacccaccccaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcaattatcaaagaaatctagtttgttcaatttttcattccctagcaaaccttgta 16634175  T
Q  206 tagctagctccaccaaa-cccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    ||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16634174 tagttagctcaatcaaaccccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccacaatttagt 16634113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 9226191 - 9225992
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttat 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||   ||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| |  |    
T  9226191 ggaccccaaagatccgaatgcacatactcaaaaggcctactagaatgatgcatgccacttccaaacttcaccctatgttgtttgcctagtatgcaatgct 9226092  T
Q  158 catagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    || | || ||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  9226091 cacaaaattctagcttgttcaatttatctttccctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacccctctcactaacatgccccaatctcaaatgcca 9225992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4559956 - 4559828
Alignment:
Q  139 ttacctaatgtgcagttatcatagaaatctag-cttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgaca 237  Q
    |||| |||||| || |||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4559956 ttacataatgtacaattatcacagaaatctagtctatttcaatttttcattccctagcaaaccttgtttagctagctcaaccaaacccctctcactgaca 4559857  T
Q  238 tgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  4559856 tgacccaacctcaaatgccacaatttagt 4559828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4567222 - 4567078
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4567222 atcaataatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtttaacttgatgttggaccctaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatata 4567123  T
Q  106 tgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtg 150  Q
    |  ||  |||  ||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  4567122 taaacatccatcccaaacttcactttatgttgtttgcctaatgtg 4567078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16625780 - 16625581
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccact-ccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagtta 156  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||  || ||| |||||||| ||  | ||||| || |||| | |||| |      
T  16625780 ggaccccaaaggtccgaatgtacatactcaaaaggcctattagaatgatgcatacc-actaccaaactttactctatgttgcttgcctagtatgcaatgc 16625682  T
Q  157 tcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcc 256  Q
    ||| | || |||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||    
T  16625681 tcacaaaattctagcttgtccaatttatcttttcctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacctctttcactaacatgccccaatcttaaatgcc 16625582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Original strand, 5146208 - 5146407
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccact-ccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagtta 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||| |||||||| ||  | ||||| || |||| | |||| |      
T  5146208 ggaccccaaaggtccgaatgaacatactcaaaaggcctactagaatgatgca-taccactaccaaactttactctatgttgcttgcctagtatgcaatgc 5146306  T
Q  157 tcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcc 256  Q
    ||| | || |||| ||||| |||||| || |||  |||||||  |||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||    
T  5146307 tcacaaaattctaacttgtccaatttatctttttttagcaaatcttgtttagctagttcaactaaacctctttcactaacatgccccaatctcaaatgcc 5146406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 110
Target Start/End: Original strand, 18858876 - 18858928
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcac 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18858876 ggaccccaaagatccgaatgcacatactcaaaaggcctactagaatgatgcac 18858928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 47564645 - 47564585
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaa 66  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||    
T  47564645 atcaataatagacatgaaatatgaacctcccccatgagttttaactgatgctggaccccaa 47564585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 257
Target Start/End: Original strand, 18860132 - 18860271
Alignment:
Q  118 ccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctcca 217  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| | |||| |  ||| | || ||||| || | |||||| || || |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  18860132 ccaaacttcaccctatgttgtttgcctagtatgcaatgctcacaaaattctagtttatccaatttatctttccctagcaaaccttgtttggctagttcaa 18860231  T
Q  218 ccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    | |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  18860232 ctaaacccctctcactaacatgccccaatctcaaatgcca 18860271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18209 - 17948
Alignment:
Q  6 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18209 atcaatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagttttaactgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatacttaaaaggcctactaaattta 18110  T
Q  106 tgcacccccactcc-aaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttatcatagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgt 204  Q
    ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18109 tgcacacccaaccctaaacttcaccttgtgttgtttgcctaatgtgcagttatcacagaaatctagtttattcaatttttcattccctagcaaaccttgt 18010  T
Q  205 ttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgccaaagtttagt 266  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18009 ttagctagctcaaccaaacctctttcactgacatgacccaacctcaaatgctaaagtttagt 17948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16096 - 15897
Alignment:
Q  58 ggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctactagatttatgcacccccactccaaacttcaccttgtgttgtttacctaatgtgcagttat 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||   ||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| |  |    
T  16096 ggaccccaaagatccgaatgcacatactcaaaaggtctactagaatgatgcatgccacttccaaacttcaccctatgttgtttgcctagtatgcaatgtt 15997  T
Q  158 catagaaatctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    || | || |||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  15996 cacaaaattctagcttgtccaatttatctttccctagcaaaccttgtttagctagttcaactaaacccctctcactaacatgccccaatctcaaatgcca 15897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 257
Target Start/End: Original strand, 916 - 1007
Alignment:
Q  166 tctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||  ||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  916 tctagcttgtccaatttatcttttcctagcaaaccctgtttagctagttcaactaaacctctttcactaacatgccccaatctcaaatgcca 1007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 257
Target Start/End: Original strand, 9072 - 9163
Alignment:
Q  166 tctagcttgttcaatttttcatttcctagcaaacattgtttagctagctccaccaaacccctctcactgacatgacctaacctcaaatgcca 257  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||  ||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  9072 tctagcttgtccaatttatcttttcctagcaaaccctgtttagctagttcaactaaacctctttcactaacatgccccaatctcaaatgcca 9163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 98
Target Start/End: Original strand, 35261 - 35350
Alignment:
Q  9 aatgatagacatgaaatatgaacctcccccatgagtcttcgtcgatgctggaccccaaagatccgaatgaacatactcaaaaggcctact 98  Q
    ||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |  |||   |  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  35261 aatgatagaaagaaaataggaacctcccccatgagtatgtgtcttggaaggaccccaaagatccgagtgcacatactcaaaaggtctact 35350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University