View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10261A_low_239 (Length: 250)

Name: NF10261A_low_239
Description: NF10261A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10261A_low_239
NF10261A_low_239
[»] chr5 (13 HSPs)
chr5 (25-250)||(37261564-37261789)
chr5 (25-250)||(3690238-3690463)
chr5 (25-250)||(3876324-3876549)
chr5 (25-250)||(25542526-25542751)
chr5 (25-250)||(27881345-27881570)
chr5 (25-250)||(30346362-30346587)
chr5 (25-250)||(37373197-37373422)
chr5 (25-250)||(39883444-39883669)
chr5 (25-250)||(14192545-14192770)
chr5 (29-250)||(17871375-17871596)
chr5 (25-247)||(10025242-10025464)
chr5 (25-209)||(24629686-24629870)
chr5 (25-250)||(8428318-8428532)
[»] chr3 (11 HSPs)
chr3 (25-250)||(10038891-10039116)
chr3 (25-250)||(10110861-10111086)
chr3 (25-250)||(10237815-10238040)
chr3 (25-244)||(11368906-11369125)
chr3 (25-250)||(33032-33257)
chr3 (25-250)||(10000668-10000893)
chr3 (25-250)||(13530300-13530525)
chr3 (25-250)||(10968515-10968740)
chr3 (25-247)||(50410432-50410654)
chr3 (25-205)||(52918332-52918512)
chr3 (91-246)||(11362524-11362681)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (25-250)||(17610-17834)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (25-250)||(2452850-2453075)
chr1 (25-250)||(36207476-36207701)
chr1 (25-250)||(16042286-16042511)
chr1 (25-250)||(37389885-37390110)
chr1 (25-246)||(48233643-48233864)
chr1 (25-250)||(48775068-48775293)
chr1 (29-250)||(6310731-6310952)
chr1 (36-250)||(2329427-2329641)
chr1 (25-209)||(52500879-52501063)
chr1 (125-250)||(18148949-18149074)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (25-250)||(186815-187040)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (25-250)||(321069-321294)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (34-250)||(314-530)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (25-250)||(32193-32418)
scaffold0073 (25-250)||(12-237)
[»] chr8 (6 HSPs)
chr8 (25-250)||(25218298-25218523)
chr8 (25-250)||(21113477-21113702)
chr8 (25-246)||(25208780-25209001)
chr8 (25-246)||(7822103-7822324)
chr8 (113-246)||(30307442-30307575)
chr8 (25-109)||(30325877-30325961)
[»] chr7 (8 HSPs)
chr7 (25-250)||(5828288-5828513)
chr7 (25-250)||(21069795-21070020)
chr7 (25-250)||(7036981-7037206)
chr7 (25-250)||(9000878-9001103)
chr7 (25-250)||(42232260-42232486)
chr7 (25-246)||(12780881-12781102)
chr7 (29-250)||(22844064-22844285)
chr7 (93-250)||(12785790-12785936)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (25-250)||(2201912-2202137)
chr6 (25-246)||(12517539-12517760)
chr6 (25-246)||(18344390-18344611)
chr6 (29-250)||(30881587-30881808)
chr6 (70-250)||(10187805-10187985)
chr6 (135-250)||(15333904-15334019)
chr6 (58-203)||(18814054-18814199)
chr6 (211-250)||(29639947-29639986)
chr6 (211-250)||(31510118-31510157)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (25-250)||(35856168-35856393)
chr4 (25-250)||(55558856-55559081)
chr4 (25-246)||(1860942-1861163)
chr4 (34-250)||(38518357-38518573)
chr4 (25-246)||(617957-618178)
chr4 (25-246)||(13337500-13337721)
chr4 (25-250)||(49710433-49710658)
chr4 (93-250)||(49786640-49786786)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (25-250)||(27509635-27509860)
chr2 (34-250)||(24246086-24246302)
chr2 (25-250)||(24268803-24269028)
chr2 (25-250)||(27192750-27192975)
chr2 (25-250)||(27842564-27842789)
chr2 (25-250)||(35609914-35610139)
chr2 (25-250)||(21395631-21395856)
chr2 (60-250)||(17683597-17683787)
chr2 (32-183)||(3642920-3643071)
chr2 (93-250)||(28665984-28666130)
chr2 (93-250)||(37824818-37824964)
chr2 (94-250)||(41919986-41920131)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (25-250)||(183072-183297)
scaffold0003 (25-246)||(165796-166019)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (25-250)||(19267-19491)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (25-250)||(28452-28677)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (25-246)||(4993-5214)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (92-250)||(40017-40175)
[»] scaffold1139 (1 HSPs)
scaffold1139 (93-246)||(1265-1418)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (25-177)||(14010-14162)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (93-250)||(48748-48894)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37261789 - 37261564
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37261789 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcctgttgtctgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgtctcgatcaattcatcaaa 37261690  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  37261689 gatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaagaagaaattgctaattttggcaag 37261590  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  37261589 tggatactctcaattggagacggcaa 37261564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3690463 - 3690238
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3690463 gaatgatagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 3690364  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  3690363 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaggaagaaactgctaattttggcaag 3690264  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3690263 tggatactctcaattggagacggcaa 3690238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 3876324 - 3876549
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3876324 gaatgatagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 3876423  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  3876424 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaggaagaaactgctaattttggcaag 3876523  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3876524 tggatactctcaattggagacggcaa 3876549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 25542526 - 25542751
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25542526 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgtggcagaatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 25542625  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  25542626 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcaaagcagaaagaaattgctaactttggcaag 25542725  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25542726 tggatactctcaattggagacggcaa 25542751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27881570 - 27881345
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27881570 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcatgttgtccgaggaggaacaaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcatcaaa 27881471  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27881470 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttaccgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacatgcagagcaggtagaaattgctaattttggcaag 27881371  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27881370 tggatactctcaattggagacggcaa 27881345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 30346362 - 30346587
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30346362 gaatgacaatagttttaggtggtgatgtcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 30346461  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  30346462 gatatgtgcttattttaatgtgttaagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 30346561  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  30346562 tggatactctgaattggagacggcaa 30346587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37373422 - 37373197
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  37373422 gaatcacagtagttttaggtggtgattttaagcagatattgcctgttgtctgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcgtcggtcaattcgtcaaa 37373323  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  37373322 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 37373223  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  37373222 tggatactctcaattggagacggcaa 37373197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 39883669 - 39883444
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |  |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  39883669 gaatgacagtagttttacgtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtcctaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaa 39883570  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  39883569 gatattggcttattgtaatatgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcagcttcggtacatgcagagcatgaagaaattgctaattttggcaag 39883470  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  39883469 tggatactctcaattggagacggcaa 39883444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 14192545 - 14192770
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||||||  |||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  14192545 gaatgacagttgttttaggtggtgatttcaggcatatattgcatgttgcccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgccccaattaattcattaaa 14192644  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  14192645 gatatgggcttattataatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgtagagtaggaagaaattgctaattttgacaag 14192744  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  14192745 tggatactctcaattggagacggcaa 14192770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 250
Target Start/End: Original strand, 17871375 - 17871596
Alignment:
Q  29 gacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagata 128  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17871375 gacaaaagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcatgtcatccgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcagttcatcaaagata 17871474  T
Q  129 tgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtgga 228  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  17871475 tgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatctttggtacctgcagagcaggaataaattgctaattttggcaaatgga 17871574  T
Q  229 tactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  17871575 tactctcaattagagaaggcaa 17871596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10025464 - 10025242
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| | |||| |||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10025464 gaatgacaatagttttaggtggtgatattaggcagatattgcctgctgtccgaaaaggaacgaggcaatatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 10025365  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  10025364 gatatgtgcttattttgatgtgttgagacttactgttaatatgagactgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 10025265  T
Q  225 tggatactctcaattggagacgg 247  Q
    |||||||||| |||| |||||||    
T  10025264 tggatactctgaattagagacgg 10025242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 209
Target Start/End: Original strand, 24629686 - 24629870
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24629686 gaatgacaatagttttaggtggtgatatcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 24629785  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaatt 209  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  24629786 gatatgtgcttattttaatgtgttgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaatt 24629870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 8428318 - 8428532
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  8428318 gaatggcagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccagatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 8428417  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  8428418 gatatgggcttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 8428506  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8428507 tggatactctcaattggagacggcaa 8428532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 11)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10039116 - 10038891
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10039116 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaagaagatattgcatgttgtctgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 10039017  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  10039016 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttattgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaagaagaaattgctaattttggcaag 10038917  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  10038916 tggatactctcaattgaagacggcaa 10038891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10111086 - 10110861
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10111086 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 10110987  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  10110986 gatatgagcttattttaatgtgttaatgcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctacagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 10110887  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||| | |||||||||||||||    
T  10110886 tggatactatgaattggagacggcaa 10110861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10238040 - 10237815
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10238040 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcttgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 10237941  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  10237940 gatatgggcttattttaatgtgttaaggcttactgttaatataagattggatgcatctttggtacctgctgagcagaaagaaattgctaattttggcaag 10237841  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  10237840 tggatactctgaattggagacggcaa 10237815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 11369125 - 11368906
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11369125 gaatgacagtagttttaagtggtgatttcaggcatatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 11369026  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||| |    
T  11369025 gatatggacttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagaaggaagaaactgataattttggcaag 11368926  T
Q  225 tggatactctcaattggaga 244  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  11368925 tggataccctcaattggaga 11368906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33257 - 33032
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||  |||||| | |  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  33257 gaatgacaatagttttaggtggtgattttaggcagatattgcatgttgtccgaggaggaacgacgccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 33158  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  33157 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 33058  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33057 tggatactctcaattagagacggcaa 33032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10000893 - 10000668
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10000893 gaatgacaatagttttaggtggggatttcaggcagatgttgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 10000794  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| |    
T  10000793 gatatgggcttattttaatgtgttaaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagtagaaagaaattgttaattttggcaag 10000694  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||| | |||||||||||||||    
T  10000693 tggatactatgaattggagacggcaa 10000668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13530525 - 13530300
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13530525 gaatgacagtagttttagctggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccaaaaaggaacgaggcacgatattgttgatgcctcaatcaattcatcaca 13530426  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  13530425 gatatgggcttattgtaatgtgtagaggcttactgttaatatgagattgagtgcatcttcggtacctgtagagcaggaataaattgctaattttggcaag 13530326  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |  |||||||||||||||||||||||    
T  13530325 tatatactctcaattggagacggcaa 13530300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 10968515 - 10968740
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| | || ||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968515 gaatgacagtagttttagatggtgatttcaggcagatattgtctgtagtccgaaacggatcgagggaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 10968614  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10968615 gatatgggtttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcagtacctatagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 10968714  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||    
T  10968715 tggacactctcaattggagatggcaa 10968740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 50410654 - 50410432
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| | |||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50410654 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatactgcctgttgtccgtaaagcaacgaggcacgatatttttgatgcctcaatcaattcatcaaa 50410555  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  50410554 gatattggcttattctaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgagtgcatcttcggtacctgtagagcaggaataaattgctaattttggcaag 50410455  T
Q  225 tggatactctcaattggagacgg 247  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  50410454 tggatactctcaattagagacgg 50410432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 52918512 - 52918332
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52918512 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcatgtagtccgaaaaggatcgagggaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 52918413  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaaga 205  Q
    |||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  52918412 gatacgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgtagagtaggaaga 52918332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11362681 - 11362524
Alignment:
Q  91 aggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacg 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  11362681 aggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacc 11362582  T
Q  191 tgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtgg--atactctcaattggagacg 246  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  11362581 tgcagagcaagaataaactgctaattttggcaagtggatatactctcaattggagacg 11362524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 17610 - 17834
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17610 gaatgacaagagttttatgtggtgatttcaggcagctattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 17709  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17710 gatatgggctt-ttgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttagcaag 17808  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17809 tggatactctcaattggagacagcaa 17834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 2452850 - 2453075
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2452850 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggaagatattgcccattgtccgaaaaggatcgaggcaggatattgttgatgcttcaatcaattcatcaaa 2452949  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    ||||| ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  2452950 gatataggcatattgtaatgtgtcgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcatgaagaaattgctaattttgacaag 2453049  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2453050 tggatactctcaattggagacggcaa 2453075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36207701 - 36207476
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36207701 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcagacagatattgcctgttgtctgaaaaggaaagaggcaggatattattgatgcctcaatcaattcatcaaa 36207602  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  36207601 gatatgagtttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggttcatcttcggtacctgcaaagcaggaagaaattgataattttggcaag 36207502  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  36207501 tggatactctcaattgaagacggcaa 36207476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16042511 - 16042286
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |  |||||| |||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  16042511 gaatgacagtagttttacgtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtcctaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagttaattcgtcaaa 16042412  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16042411 gatattggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcagcttcggtacatgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 16042312  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16042311 tggatactctcaattggagacggcaa 16042286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 37389885 - 37390110
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  37389885 gaatgacaatagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggctggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 37389984  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  37389985 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactattaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 37390084  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  37390085 tggatattctcaattggagacggcaa 37390110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 48233864 - 48233643
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48233864 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgagacaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 48233765  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||| | ||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  48233764 gatatgtgtttattgtaatttgttgaggcttactgttgatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcaggaagaaattcctaattttgacaag 48233665  T
Q  225 tggatactctcaattggagacg 246  Q
    || |||||||||| | ||||||    
T  48233664 tgaatactctcaacttgagacg 48233643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 48775068 - 48775293
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||  | ||||||   |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48775068 gaatgacggtagttttaggtggtgatttcagacaaatattgtatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 48775167  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
     ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  48775168 tatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatcagattgggtgcatcttcgggacctacagagcagaaagaaactgctaattttggcaag 48775267  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  48775268 tggatactctcaattggagacggcaa 48775293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 250
Target Start/End: Original strand, 6310731 - 6310952
Alignment:
Q  29 gacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagata 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| | |||||| ||  |||||  |||   |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  6310731 gacaatagttttaggtggtgattttaggcagatattgtctgttgtccgaggaggaatgaggcctgatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagata 6310830  T
Q  129 tgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtgga 228  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  6310831 tgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtgga 6310930  T
Q  229 tactctcaattggagacggcaa 250  Q
    || |||| ||||||||||||||    
T  6310931 tagtctccattggagacggcaa 6310952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2329641 - 2329427
Alignment:
Q  36 gttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggctt 135  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| | || |||||| |  ||| ||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2329641 gttttaggtggtgatttcaggcagatactacctgttgtccgtgaagcaacgaggcacgatattgttaatgccttaatcaattcatcaaagatatgggctt 2329542  T
Q  136 attgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctc 235  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2329541 attgtaatatgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcctcttcgttacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctc 2329442  T
Q  236 aattggagacggcaa 250  Q
    |||| ||||||||||    
T  2329441 aattagagacggcaa 2329427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 52501063 - 52500879
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52501063 gaatgacaatagttttaggtggtgatatcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 52500964  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaatt 209  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  52500963 gatatgtgcttattttaatgtgttgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaatt 52500879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 125 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18149074 - 18148949
Alignment:
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18149074 gatatggacttattttaatgtgttaaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 18148975  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  18148974 tggatactctgaattggagacggcaa 18148949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 187040 - 186815
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  187040 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaagcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcaccaatcaattcatcaaa 186941  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||||| |||  || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  186940 gatatgggcttattgtaatgttttaaggcctactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacttgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 186841  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  186840 tggatactctcaattggagacggcaa 186815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 321069 - 321294
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  321069 gaatgacaagagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgccttaatcaattcatcaac 321168  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  321169 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttacttttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 321268  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||    
T  321269 tggatattctcaatttgagacggcaa 321294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 250
Target Start/End: Original strand, 314 - 530
Alignment:
Q  34 tagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggc 133  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  314 tagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaggaggaacaaggccggatattgttgatgcctcaatcaattcgtcaaagatatgggc 413  T
Q  134 ttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactc 233  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  414 ttattgtaatgtgttgaggcttactattaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactc 513  T
Q  234 tcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||||||||||||    
T  514 tcaattggagacggcaa 530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 32418 - 32193
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  32418 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgacgaggaacgaggccagatattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaa 32319  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32318 gatatgtgcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 32219  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  32218 tggatactctcaattggatacggcaa 32193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 237 - 12
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  || || ||  |||||| |||  |||||||||||||| |||  ||||||| |||||    
T  237 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgccttttttccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgtctcggtcaattcgtcaaa 138  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
     |||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  137 tatattggcttattgtaatgttttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaagaagaaattgctaatttttgcaag 38  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  37 tggatactctcaattggagacggcaa 12  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 6)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 25218298 - 25218523
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  25218298 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 25218397  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  25218398 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 25218497  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25218498 tggatactctcaattggagacggcaa 25218523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 21113477 - 21113702
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  21113477 gaatgacaatagttttaggtggtgatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaca 21113576  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  21113577 gatatgtgcttattttaatgtgttgacgcttactgttaatatgcgattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 21113676  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  21113677 tggatactctgaattggagacggcaa 21113702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 25208780 - 25209001
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| || ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  25208780 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttttccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 25208879  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||| |    
T  25208880 gatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttaatgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggacgaaattactaatttttgcaag 25208979  T
Q  225 tggatactctcaattggagacg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25208980 tggatactctcaattggagacg 25209001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7822324 - 7822103
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||  |||||| |||  |  |||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  7822324 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctattgtccgaggaggaacgaggccgattattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 7822225  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| | | |    
T  7822224 gatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgagtgcatcttcggtacctgtagagcaggaagaaattgcgaatttttgtaag 7822125  T
Q  225 tggatactctcaattggagacg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7822124 tggatactctcaattggagacg 7822103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 30307575 - 30307442
Alignment:
Q  113 caattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgct 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  30307575 caattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagtgggaagaaattgct 30307476  T
Q  213 aattttggcatgtggatactctcaattggagacg 246  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  30307475 aatttttgcaagtagatactctcaattggagacg 30307442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 30325961 - 30325877
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctc 109  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  30325961 gaatgacagtagttttaggttgtgattttaggcagatattgcctattgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctc 30325877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 8)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 5828288 - 5828513
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5828288 gaatgatattagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 5828387  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5828388 gatatgggtttattttaatgtgttgaggcttactattaatatgagattgagtgcatcttcggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 5828487  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  5828488 tggatactctgaattggagacggcaa 5828513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 21069795 - 21070020
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  21069795 gaatcacagtagttttaggtggtgatttcaggtagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcattaaa 21069894  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  21069895 gatatgggtttattgtaatgtatcgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttgacaag 21069994  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21069995 tggatactctcaattggagacggcaa 21070020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 7037206 - 7036981
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  7037206 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 7037107  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  7037106 gatataggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaagaagaaattgctaatttttgcaag 7037007  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  7037006 tggatactctcaattggagacggcaa 7036981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 9000878 - 9001103
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9000878 gaatgacagtagttttaggttgtgattttaggcagatattgcctattgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaa 9000977  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9000978 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcatagcaggaagaaattgctaattttggcaag 9001077  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  9001078 tggatactctcaattggatacggcaa 9001103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 42232486 - 42232260
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagtttt-atgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaa 123  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42232486 gaatgacaatagtttttaggtggtgatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcagtatattgttgatgcatcaatcaattcatcaa 42232387  T
Q  124 agatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcat 223  Q
    ||||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||     
T  42232386 agatatgtgcttattttaatgtgttgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagtagaaagaaattgctaattttggcaa 42232287  T
Q  224 gtggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42232286 gtggatactctgaattggagacggcaa 42232260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 12780881 - 12781102
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| || |||  |  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  12780881 gaatgacaatagttttaggtggtgattttaggcagatgttgcctgtagtccaaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 12780980  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  12780981 gatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgtagagcaagaagaaattgctaatttttgcaag 12781080  T
Q  225 tggatactctcaattggagacg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12781081 tggatactctcaattggagacg 12781102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22844285 - 22844064
Alignment:
Q  29 gacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagata 128  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||  ||  || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22844285 gacaaaagttttaggtggtgatttcatgcagatattgcatgtcatccgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcagttcatcaaagata 22844186  T
Q  129 tgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtgga 228  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  22844185 tgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatctttggtacctgtagagcaggaataaattgctaattttggcaattgga 22844086  T
Q  229 tactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||| |||| |||| |||||    
T  22844085 tactcttaattagagaaggcaa 22844064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 250
Target Start/End: Original strand, 12785790 - 12785936
Alignment:
Q  93 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 192  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |     
T  12785790 gatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtaccta 12785878  T
Q  193 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12785879 cagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaa 12785936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 2201912 - 2202137
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2201912 gaatgacagtagttttaggtggtgacttcaggcagatattgcccattgtccgaaaaggatcgaggcaggatattgttgatgcctcgatcaattcatcaaa 2202011  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    ||||| ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  2202012 gatataggcatattgtaatgtgtcgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacttgcagagcatgaagaaattgctaattttggcaag 2202111  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  2202112 tggatactctcaattggagaaggcaa 2202137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12517760 - 12517539
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  12517760 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagttaattcgtcaaa 12517661  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12517660 gatatgggcttattgtaatgtgttgaagcttactgttaatatgagattgggtgcatcttctgttcctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 12517561  T
Q  225 tggatactctcaattggagacg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12517560 tggatactctcaattggagacg 12517539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18344611 - 18344390
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18344611 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaatttatcaaa 18344512  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  18344511 gatatgggcttattgtaatttgttgaggcttactgttaatatgagattgagtgcatctttggtatctacagagcaggaagaaattcctaattttgacaag 18344412  T
Q  225 tggatactctcaattggagacg 246  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  18344411 tgaatactctcaattggagacg 18344390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30881808 - 30881587
Alignment:
Q  29 gacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagata 128  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30881808 gacaaaagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcatgtcatccgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcagttcatcaaagata 30881709  T
Q  129 tgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtgga 228  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  30881708 tgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatctttggtacctgcagagcaggaataaattgctaattttggcaaatgga 30881609  T
Q  229 tactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  30881608 tactctcaattagagaaggcaa 30881587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10187985 - 10187805
Alignment:
Q  70 ttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgag 169  Q
    ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10187985 ttgtccgaaaaggaacgagacaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttattgttaatatgag 10187886  T
Q  170 attaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10187885 attgggtgcatcttcgatacctgtagagcaggaagaaattgctaattttcgcacgtggatgctctcaattggagacggcaa 10187805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 135 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15334019 - 15333904
Alignment:
Q  135 tattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactct 234  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15334019 tattgtaatgtgttgaagcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcgatacctgcagagcaagaagaaattgctaattttggcaagtggatactct 15333920  T
Q  235 caattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||    
T  15333919 caattggagacggcaa 15333904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18814199 - 18814054
Alignment:
Q  58 agatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttac 157  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||| ||  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18814199 agatattgcatgttgtccgaaaaggaacgagacatgatattgttgatcccttaatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttac 18814100  T
Q  158 tgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaa 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||| || ||||||||||    
T  18814099 tgttaatatgagattgggtgcatcgttggtacctgtagagcaggaa 18814054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 250
Target Start/End: Original strand, 29639947 - 29639986
Alignment:
Q  211 ctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29639947 ctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaa 29639986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 250
Target Start/End: Original strand, 31510118 - 31510157
Alignment:
Q  211 ctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31510118 ctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaa 31510157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 35856393 - 35856168
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  35856393 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 35856294  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  35856293 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 35856194  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  35856193 tggatactctcaattggagacggcaa 35856168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 55558856 - 55559081
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55558856 gaatgacaatagttttaggtggtgatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcagtatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 55558955  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  55558956 gatatgtgcttattttaatgtgttgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 55559055  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  55559056 tggatactctgaattggagacggcaa 55559081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1861163 - 1860942
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  1861163 gaatgacaatagtgtaaggtggtgatttcaggcaaatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcattaaa 1861064  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  1861063 gatatgggcttattttaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 1860964  T
Q  225 tggatactctcaattggagacg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  1860963 tggatactctgaattggagacg 1860942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 38518573 - 38518357
Alignment:
Q  34 tagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggc 133  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||  | |||||||||  |||||| ||   |||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  38518573 tagttttaggtggtgattttaggcagatattaactgttgtctgaggaggaacgagaccggatattgttaatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgggc 38518474  T
Q  134 ttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactc 233  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38518473 ttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactc 38518374  T
Q  234 tcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||||||||||||    
T  38518373 tcaattggagacggcaa 38518357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 617957 - 618178
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617957 gaatgacaatagctttaggtggtgatttcaagcagatattgcatgttgtctgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 618056  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    ||||| |||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  || |    
T  618057 gatataggcttattgtaatttgttgaggctaactgttaatatgagattgagtgcatctttggtatctgcagagcaggaagaaattcctaattttaacaag 618156  T
Q  225 tggatactctcaattggagacg 246  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  618157 tgaatactctcaattggagacg 618178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13337721 - 13337500
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  13337721 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 13337622  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    ||||||   ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  13337621 gatatgatattattgtaatgtgttgaggtttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 13337522  T
Q  225 tggatactctcaattggagacg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13337521 tggatactctcaattggagacg 13337500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 49710658 - 49710433
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||  |||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||| | |||    
T  49710658 gaatgacaatagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgttcgaggaggaacgaggccagatattgttgatgcctccgtcaattcgttaaa 49710559  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  49710558 gatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagaacagaaagaaattgctaattttggcaag 49710459  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  49710458 tggatactctcaattggacacggcaa 49710433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 250
Target Start/End: Original strand, 49786640 - 49786786
Alignment:
Q  93 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 192  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |     
T  49786640 gatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtaccta 49786728  T
Q  193 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49786729 cagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaa 49786786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27509860 - 27509635
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27509860 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccaaaaaggaacgagacaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 27509761  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27509760 gatatgggcttattgtaatgtattgaggcttactgttaatataagattgggtgcatctttgctacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 27509661  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||    
T  27509660 tagatactctcaattggagacagcaa 27509635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24246302 - 24246086
Alignment:
Q  34 tagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaa-ggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggg 132  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||||| ||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24246302 tagttttaggtggtgatttaaggcagatattgcatgttgtccgaaaaaggaatgatgcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggg 24246203  T
Q  133 cttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatact 232  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  24246202 cttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagatt-ggtgaatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatgttggcatgtggattct 24246104  T
Q  233 ctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24246103 ctcaattggagacggcaa 24246086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 24268803 - 24269028
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  24268803 gaatgacaatagttttaggtggtgatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaca 24268902  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  24268903 gatatgtgcttattttaatgtgttgacgcttattgttaatatgcgattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 24269002  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  24269003 tggatactctgaattggagacggcaa 24269028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27192975 - 27192750
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27192975 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 27192876  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||  |||||||| || |    
T  27192875 gatatgggcttattgtaatttgttgaggctgattgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgtagagcaggaagaaattcataattttgacaag 27192776  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27192775 tggatactctcaactggtgacggcaa 27192750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27842789 - 27842564
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27842789 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 27842690  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||  |||||||| || |    
T  27842689 gatatgggcttattgtaatttgttgaggctgattgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgtagagcaggaagaaattcataattttgacaag 27842590  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27842589 tggatactctcaactggtgacggcaa 27842564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 35610139 - 35609914
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  35610139 gaatgacagttgttttaggtggtgatttcaggcatatattgcctgttgcccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgccccaatcaattcattaaa 35610040  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35610039 gatatggacttattataatgtgttgaggcttactgttaatatgacattgggtgcatcttcggtacctttagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 35609940  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  35609939 tggatactctcaattggagacggcaa 35609914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21395856 - 21395631
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  21395856 gaatgaccgtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctccgtcaattcgtcaaa 21395757  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |    
T  21395756 gttatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagatcaggaagaaattgctaatttcggcaag 21395657  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21395656 tggatactctcaattggagacggcaa 21395631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 60 - 250
Target Start/End: Original strand, 17683597 - 17683787
Alignment:
Q  60 atattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactg 159  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||| ||    
T  17683597 atattgcttgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttaaggcttattg 17683696  T
Q  160 ttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17683697 ttaatatgagattgggtgcatcttcgatacctgtagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaa 17683787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3643071 - 3642920
Alignment:
Q  32 aatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgg 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3643071 aatagttttaggtggtgatttcaggtagatattgcctgttgcccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgg 3642972  T
Q  132 gcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatctt 183  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3642971 gcttattgtaatttgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctt 3642920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 250
Target Start/End: Original strand, 28665984 - 28666130
Alignment:
Q  93 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 192  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |     
T  28665984 gatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtaccta 28666072  T
Q  193 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28666073 cagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaa 28666130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 250
Target Start/End: Original strand, 37824818 - 37824964
Alignment:
Q  93 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 192  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |     
T  37824818 gatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtaccta 37824906  T
Q  193 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37824907 cagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaa 37824964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 250
Target Start/End: Original strand, 41919986 - 41920131
Alignment:
Q  94 atattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgc 193  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||| ||||| ||     
T  41919986 atattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatctttggtacctgt 41920074  T
Q  194 agagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41920075 agagcaggaagaaattgataatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaa 41920131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 183297 - 183072
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  183297 gaatgatagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaatgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 183198  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  183197 gatatggccttattgtaatgtgttgaggcttacagttaatatgatattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaggaagaaactgctaattttggcaag 183098  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  183097 tggatactctcaattggagacggcaa 183072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 166019 - 165796
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166019 gaatgatagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 165920  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |    
T  165919 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaagaataaactgctaattttggcaag 165820  T
Q  225 tgg--atactctcaattggagacg 246  Q
    |||  |||||||||||||||||||    
T  165819 tggatatactctcaattggagacg 165796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19491 - 19267
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19491 gaatgacaatagttttaggtggtaatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 19392  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  19391 gatatgggcttattttaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgcagagcagaaagaaattgctaa-tttggcaag 19293  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
     ||||||| | |||||||||||||||    
T  19292 gggatactttgaattggagacggcaa 19267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 28452 - 28677
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28452 gaatgacaatagtttaaggtggtgatatcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 28551  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  28552 gatatgtgcttattttaatgagttgagacttactgttaatatgagattggatgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 28651  T
Q  225 tggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||    
T  28652 tggatactctgaattgaagacagcaa 28677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 4993 - 5214
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||  ||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  4993 gaatgacaatagttttagatggtgattttaggcagatattgcctattgttcgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcataaaa 5092  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 224  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5093 gatatgtgcttattttaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgcaaagcagaaagaaattgctaattttggcaag 5192  T
Q  225 tggatactctcaattggagacg 246  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  5193 tggatactctgacttggagacg 5214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 92 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40175 - 40017
Alignment:
Q  92 ggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgt 191  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  40175 ggatattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgtgtgcatcttcggtacct 40076  T
Q  192 gcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40075 acagagcaggaagaaattgctaactttggcaagtgaatactctcaattggagatggcaa 40017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1139 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1139
Description:

Target: scaffold1139; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1418 - 1265
Alignment:
Q  93 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 192  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||    
T  1418 gatattatttatgcatcaatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatcttaggtacatg 1319  T
Q  193 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacg 246  Q
     | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1318 tatagcaggaagaaatttctaattttggcaagtggatactctcaattggagacg 1265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 177
Target Start/End: Original strand, 14010 - 14162
Alignment:
Q  25 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 124  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14010 gaatgataatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaagatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 14109  T
Q  125 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtg 177  Q
     ||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14110 tatatgggcttattttaatatgttgaggcttactattaatatgagattgggtg 14162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 250
Target Start/End: Original strand, 48748 - 48894
Alignment:
Q  93 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 192  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |     
T  48748 gatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtaccta 48836  T
Q  193 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48837 cagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaa 48894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University