View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10261A_low_304 (Length: 243)

Name: NF10261A_low_304
Description: NF10261A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10261A_low_304
NF10261A_low_304
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (22-226)||(51052414-51052618)
chr1 (22-226)||(11909107-11909311)
chr1 (22-226)||(35540983-35541187)
chr1 (22-226)||(6050537-6050741)
chr1 (99-195)||(16917842-16917938)
chr1 (113-194)||(47623111-47623192)
chr1 (113-195)||(43388392-43388474)
chr1 (32-195)||(37191243-37191406)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (22-226)||(30732316-30732520)
chr5 (22-226)||(12825133-12825337)
chr5 (22-226)||(27117163-27117367)
chr5 (23-226)||(42513655-42513858)
chr5 (22-142)||(12820035-12820155)
chr5 (22-225)||(23238318-23238521)
chr5 (32-226)||(28535677-28535871)
chr5 (22-210)||(8227960-8228148)
chr5 (36-226)||(35983793-35983983)
chr5 (85-195)||(19255155-19255265)
chr5 (32-218)||(42928075-42928261)
chr5 (89-226)||(31641513-31641649)
chr5 (99-195)||(25857457-25857553)
chr5 (109-195)||(27767063-27767149)
chr5 (113-194)||(10776789-10776870)
chr5 (99-195)||(8300215-8300311)
chr5 (113-195)||(33385407-33385489)
chr5 (22-86)||(3418717-3418781)
chr5 (59-195)||(18359125-18359260)
chr5 (89-205)||(33169659-33169775)
chr5 (85-193)||(27795480-27795588)
chr5 (113-218)||(26072917-26073022)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (22-226)||(4552103-4552307)
chr2 (85-195)||(41207013-41207123)
chr2 (89-195)||(15917655-15917761)
chr2 (47-193)||(28252679-28252825)
chr2 (109-195)||(12645557-12645643)
chr2 (89-195)||(17764995-17765101)
chr2 (74-193)||(14439738-14439857)
chr2 (92-195)||(40176672-40176775)
chr2 (86-195)||(38604407-38604516)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (22-226)||(2364211-2364415)
chr3 (22-226)||(7312710-7312914)
chr3 (22-226)||(19920231-19920435)
chr3 (22-226)||(10323573-10323777)
chr3 (22-226)||(34332817-34333021)
chr3 (32-226)||(40930530-40930724)
chr3 (109-196)||(7032339-7032426)
chr3 (113-195)||(29523778-29523860)
chr3 (113-195)||(11203844-11203926)
chr3 (113-194)||(33496572-33496653)
chr3 (113-195)||(12342259-12342340)
chr3 (89-195)||(26771022-26771128)
chr3 (99-182)||(7031063-7031146)
chr3 (74-195)||(35214404-35214525)
chr3 (113-195)||(36801108-36801190)
chr3 (96-205)||(963186-963295)
chr3 (89-205)||(2755843-2755959)
chr3 (71-195)||(19890661-19890785)
chr3 (92-182)||(16178952-16179042)
chr3 (89-205)||(3140853-3140969)
chr3 (89-209)||(15312584-15312704)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (22-226)||(11207-11411)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (22-226)||(105845-106049)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (22-226)||(7924320-7924524)
chr8 (22-226)||(8299737-8299941)
chr8 (22-226)||(172037-172241)
chr8 (22-226)||(13396322-13396526)
chr8 (22-216)||(32266498-32266692)
chr8 (22-226)||(41665371-41665575)
chr8 (32-226)||(9922545-9922739)
chr8 (99-195)||(20824307-20824403)
chr8 (32-195)||(13200067-13200230)
chr8 (113-195)||(17699507-17699589)
chr8 (74-195)||(2170328-2170449)
chr8 (113-195)||(37434157-37434239)
chr8 (95-180)||(34137011-34137096)
chr8 (22-160)||(2529820-2529958)
chr8 (85-193)||(13879522-13879630)
chr8 (113-180)||(43270475-43270542)
chr8 (22-56)||(20497018-20497052)
chr8 (85-195)||(25090384-25090494)
[»] chr7 (11 HSPs)
chr7 (22-226)||(4938130-4938334)
chr7 (22-226)||(11277254-11277458)
chr7 (22-226)||(47876917-47877121)
chr7 (22-226)||(29967909-29968113)
chr7 (53-226)||(235439-235614)
chr7 (31-226)||(37919487-37919682)
chr7 (22-226)||(17720569-17720773)
chr7 (22-112)||(31177421-31177511)
chr7 (32-195)||(25619403-25619566)
chr7 (113-195)||(18532653-18532735)
chr7 (73-195)||(37254743-37254865)
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (22-226)||(23642593-23642797)
chr4 (22-226)||(47418738-47418942)
chr4 (31-226)||(13270893-13271088)
chr4 (22-226)||(47685897-47686101)
chr4 (22-226)||(15740155-15740359)
chr4 (22-226)||(1828542-1828746)
chr4 (22-226)||(19755198-19755405)
chr4 (22-226)||(19784401-19784608)
chr4 (32-226)||(7403857-7404051)
chr4 (92-195)||(55725719-55725822)
chr4 (113-195)||(12697838-12697920)
chr4 (113-195)||(45472742-45472824)
chr4 (95-193)||(11587233-11587331)
chr4 (114-195)||(8361126-8361207)
chr4 (113-195)||(20002750-20002832)
chr4 (22-77)||(159842-159897)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (22-203)||(12734059-12734240)
chr6 (22-226)||(2553571-2553775)
chr6 (32-226)||(18651236-18651430)
chr6 (31-226)||(24767426-24767621)
chr6 (109-226)||(21168220-21168337)
chr6 (99-195)||(17579114-17579210)
chr6 (99-195)||(17573688-17573784)
chr6 (113-195)||(17606367-17606449)
chr6 (109-195)||(21630140-21630226)
chr6 (56-193)||(14373026-14373163)
chr6 (113-195)||(10577282-10577364)
chr6 (95-180)||(15958861-15958946)
chr6 (46-195)||(20883066-20883215)
chr6 (96-205)||(13937708-13937817)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (22-226)||(3186-3390)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 51052414 - 51052618
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51052414 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 51052513  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51052514 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtg 51052613  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  51052614 atgtc 51052618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11909311 - 11909107
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11909311 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacatagccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 11909212  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11909211 cgatccctcagaagtcgccaagcaatgatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtg 11909112  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  11909111 atgtc 11909107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 35540983 - 35541187
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35540983 caaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataatcgttcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattatgttttgtgggtaac 35541082  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35541083 cgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtg 35541182  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  35541183 atgtc 35541187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 6050537 - 6050741
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6050537 caaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcagaaccgctcctccacagatagaatgccacaatttgccaaattaagttttgtaggtaac 6050636  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6050637 cgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtg 6050736  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  6050737 atgtc 6050741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16917938 - 16917842
Alignment:
Q  99 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16917938 ccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 16917842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 47623192 - 47623111
Alignment:
Q  113 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatat 194  Q
    |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  47623192 gtaggtaagcggtccctcaaaagccgccaagcaagaatagatactttgagaggtacctgtttatgccaaattaattccatat 47623111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Original strand, 43388392 - 43388474
Alignment:
Q  113 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    |||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  43388392 gtaggtaaacgatccctcaacaatcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 43388474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 37191406 - 37191243
Alignment:
Q  32 acatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctca 131  Q
    |||||||| |||  ||||||||| |  ||||| || || ||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||| ||||| ||||    
T  37191406 acatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaaatcgatcctccacagatgtaatgccacgatctgccaagttggatttagtaggtaatcgatctctca 37191307  T
Q  132 gaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
      || ||||||||||||||| | ||||| | | ||||| |||||||||| | ||| ||||||||    
T  37191306 acagccgccaagcaaggatataaacttttaaatgaaccagtttatgccagattaactccatatt 37191243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30732520 - 30732316
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30732520 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 30732421  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30732420 cgatccctcagaagtcgccaagcaaagatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtg 30732321  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  30732320 atgtc 30732316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 12825133 - 12825337
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12825133 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 12825232  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12825233 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatacatactttgagaggaacttgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtg 12825332  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  12825333 atgtc 12825337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27117367 - 27117163
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27117367 caaatgagaaacatcttcgacattcccacagccagaaacacataaccgctcctccatagatagaatgccacggtttaccaaattaagttttgtgggtaac 27117268  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  27117267 cggtccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggatctgctcctgtg 27117168  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  27117167 atgtc 27117163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Original strand, 42513655 - 42513858
Alignment:
Q  23 aaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaacc 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42513655 aaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagatagaatgtcacgatttgccaaattaagttttgtaggtaacc 42513754  T
Q  123 gatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatga 222  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42513755 gatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtga 42513854  T
Q  223 tgtc 226  Q
    ||||    
T  42513855 tgtc 42513858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 12820155 - 12820035
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12820155 caaatgagagacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 12820056  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaa 142  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  12820055 cgatccctcataagtcgccaa 12820035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 23238318 - 23238521
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  || ||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  23238318 caaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaagctaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaac 23238417  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  23238418 cgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagaaactttgagaggaacctatttatgccaaattaactccatattatggtgtaactggggttgctcctgtg 23238517  T
Q  222 atgt 225  Q
    ||||    
T  23238518 atgt 23238521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28535871 - 28535677
Alignment:
Q  32 acatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctca 131  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | | || |||||| |  || ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28535871 acatcttctacattcccacaaccagaaacacacatctgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctca 28535772  T
Q  132 gaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatgatgtc 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || || |||||||| |||||||||| |||||||    
T  28535771 gaagtcgccaagcaaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgccaaattaactccatgttttgatgtaactgaggctgctcctgtgatgtc 28535677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 210
Target Start/End: Original strand, 8227960 - 8228148
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||  ||||||||| ||  || |||||||||||||||| |||||| |||||| |  || |||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  8227960 caaatgattaacatcttcaacgttctcacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgtcacggtttgccaaattacttttcgtaggtaac 8228059  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactgggg 210  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8228060 cgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgtcaaattaactccatattatggtgtaactgggg 8228148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35983983 - 35983793
Alignment:
Q  36 cttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaag 135  Q
    |||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||| |  || |||| || | ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35983983 cttctacattcccacaaccaaaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgtcatggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgattcctcagaag 35983884  T
Q  136 tcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatgatgtc 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| || || |||||||| |||||||||| |||||||    
T  35983883 tcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtgtaagccaaattaactccatgttttgatgtaactgaggctgctcctgtgatgtc 35983793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19255265 - 19255155
Alignment:
Q  85 aatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaact 184  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  19255265 aatgccacaatttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaaaccgccaagcaaggatagatactttgagagaaatctgtttatgccaaatt 19255166  T
Q  185 aagtccatatt 195  Q
    || ||||||||    
T  19255165 aactccatatt 19255155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 218
Target Start/End: Original strand, 42928075 - 42928261
Alignment:
Q  32 acatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctca 131  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||    || ||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  42928075 acatcttcaacgttcccgcatccagagacacacaaccgcacctccaagggtaaaatgccacagtttgtcaaattattttttgtagttaaccgatccctca 42928174  T
Q  132 gaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcct 218  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  42928175 gaagccgccaaacaaggatagagactttgagaggaacctgtttataccaaattaactccatatttggatgtaactggggctgttcct 42928261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 226
Target Start/End: Original strand, 31641513 - 31641649
Alignment:
Q  89 ccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagt 188  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  31641513 ccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagtagtctccatgcaaggatagaaacttt-agaggaacctgtgtatgccaaattaact 31641611  T
Q  189 ccatattatggtgtaactggggctgctcctatgatgtc 226  Q
    |||| || || ||||| || |||||||||| |||||||    
T  31641612 ccatgttttgatgtaagtgaggctgctcctgtgatgtc 31641649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25857553 - 25857457
Alignment:
Q  99 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  25857553 ccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 25857457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 195
Target Start/End: Original strand, 27767063 - 27767149
Alignment:
Q  109 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27767063 ttttgtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatataaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 27767149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 194
Target Start/End: Original strand, 10776789 - 10776870
Alignment:
Q  113 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatat 194  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10776789 gtaggtaaacgatccctcagcagtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactccatat 10776870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8300311 - 8300215
Alignment:
Q  99 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8300311 ccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 8300215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33385489 - 33385407
Alignment:
Q  113 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  33385489 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 33385407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 86
Target Start/End: Original strand, 3418717 - 3418781
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaa 86  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||    
T  3418717 caaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataatcgttcctccacagatagaa 3418781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18359260 - 18359125
Alignment:
Q  59 acacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactt 158  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||   ||| |||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| || ||||    
T  18359260 acacaaaaccgatcctccacatatataatgc-acgatctgccaagttggatttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaggattgaaactt 18359162  T
Q  159 tgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    | | |||||||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  18359161 ttaaaggaacctgtttatgctagattaactccatatt 18359125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 205
Target Start/End: Original strand, 33169659 - 33169775
Alignment:
Q  89 ccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagt 188  Q
    |||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||  ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||  || |    
T  33169659 ccacgacttgccaaattttgtttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaaaatagacactttcaaaggcacctgtttgtgccaaatcaact 33169758  T
Q  189 ccatattatggtgtaac 205  Q
    ||||||| || ||||||    
T  33169759 ccatattttgatgtaac 33169775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 193
Target Start/End: Original strand, 27795480 - 27795588
Alignment:
Q  85 aatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaact 184  Q
    |||||||||||||||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |  |||||||||| ||  |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  27795480 aatgccacgatttgccaaattggctttagtaggcaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaagactgtaactttgagaggtacctgtttgtgccagact 27795579  T
Q  185 aagtccata 193  Q
    || ||||||    
T  27795580 aactccata 27795588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 218
Target Start/End: Original strand, 26072917 - 26073022
Alignment:
Q  113 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggct 212  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||||  ||||| | |||||| | ||||||||||| ||| |||| ||| || || || |||||||    
T  26072917 gtaggtaatcgatccctcaacagtcgccaaacaaagatagggactttcaaaggaacatatttatgccaaattaactccaaattttgatgcaaatggggct 26073016  T
Q  213 gctcct 218  Q
    | ||||    
T  26073017 gttcct 26073022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 4552103 - 4552307
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4552103 caaatgagaaacattttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 4552202  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4552203 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttaagaggaacctatttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtg 4552302  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  4552303 atgtc 4552307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 195
Target Start/End: Original strand, 41207013 - 41207123
Alignment:
Q  85 aatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaact 184  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41207013 aatgccacgatttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaagccgccaagcaaggatagagactttgagaggaacctgtttatgccaaatt 41207112  T
Q  185 aagtccatatt 195  Q
    || ||||||||    
T  41207113 aactccatatt 41207123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 195
Target Start/End: Original strand, 15917655 - 15917761
Alignment:
Q  89 ccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagt 188  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||| ||| ||| |    
T  15917655 ccacgatttgccaaattaacttttgtaggtaaacgatccctcagcagtccccaagcaaggatacagactttcagaggaacctatttatgcgaaattaact 15917754  T
Q  189 ccatatt 195  Q
    | |||||    
T  15917755 caatatt 15917761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 193
Target Start/End: Original strand, 28252679 - 28252825
Alignment:
Q  47 ccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaa 146  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||| ||  | ||||||| | |||||||||||    || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  28252679 ccacaaccggaaacacataaccgcccctccatatgaataatgccatggtttgccaaatttcccttcgtaggtaagcgatccctcaaaagccgccaagcaa 28252778  T
Q  147 ggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccata 193  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28252779 gaatagatacttttagaggtacctgtttatgccaaattaattccata 28252825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 195
Target Start/End: Original strand, 12645557 - 12645643
Alignment:
Q  109 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12645557 ttttgtaggtaagcgatccctcaatagccgccaagcaaggattgaaacttttagagaaacctgtttatgccaaattaactccatatt 12645643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17765101 - 17764995
Alignment:
Q  89 ccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagt 188  Q
    ||||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| | ||| |    
T  17765101 ccacggtttgccaaatttgctttcgtaggtaaatgatccctcaatagccgccaagcaagaatagagactttaagaggagcctgtttatgccatattaact 17765002  T
Q  189 ccatatt 195  Q
    |||||||    
T  17765001 ccatatt 17764995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 193
Target Start/End: Original strand, 14439738 - 14439857
Alignment:
Q  74 tccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtt 173  Q
    |||||| ||||||| ||||| | | |||||||   ||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||    
T  14439738 tccacagatagaatcccacgttctaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgtcaagccaagatagaaacttttaaaggaacctgtt 14439837  T
Q  174 tatgccaaactaagtccata 193  Q
    ||||||| | ||| ||||||    
T  14439838 tatgccagattaactccata 14439857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 195
Target Start/End: Original strand, 40176672 - 40176775
Alignment:
Q  92 cgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtcca 191  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  40176672 cgatttgtcaaattgactttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaggactgaaacttttagaggtacctgtttgtgccagactaactcca 40176771  T
Q  192 tatt 195  Q
    ||||    
T  40176772 tatt 40176775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 38604516 - 38604407
Alignment:
Q  86 atgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaacta 185  Q
    |||||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||| || |  ||  |||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| | ||    
T  38604516 atgccacgatatgccaaattgactattgtaggtaaacgatctcttaacagcagccatgcaaggattgaaacttttagaggtacttgtttatgccagatta 38604417  T
Q  186 agtccatatt 195  Q
    | ||||||||    
T  38604416 actccatatt 38604407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 2364211 - 2364415
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2364211 caaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 2364310  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2364311 cgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtg 2364410  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  2364411 atgtc 2364415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 7312710 - 7312914
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7312710 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacaaagccgctcctccacagacagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 7312809  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7312810 cgatccctcattagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggtacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtg 7312909  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  7312910 atgtc 7312914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19920435 - 19920231
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19920435 caaatgagaagcatcttcgacattcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaac 19920336  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  19920335 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatgatggtgtaactggggcttctcctgtg 19920236  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  19920235 atgtc 19920231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10323777 - 10323573
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10323777 caaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcatccccagatagaatgccacgagttgccaaattaagttttgtaggtaac 10323678  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  10323677 cgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatactatggtgtaactggggctgctcctgtg 10323578  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  10323577 atgtc 10323573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34333021 - 34332817
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  || ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||     
T  34333021 caaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaat 34332922  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  34332921 cgatctctcagaagttgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatgatgtaactggggctgctcctgtg 34332822  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  34332821 atgtc 34332817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40930724 - 40930530
Alignment:
Q  32 acatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctca 131  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |  || || |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  40930724 acatcttcgacgttcccacaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaaggccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatccctca 40930625  T
Q  132 gaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatgatgtc 226  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| || ||||||| |||||||    
T  40930624 aaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgtcaaactaactccatgttttgatgcaactgaggttgctcctgtgatgtc 40930530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 196
Target Start/End: Original strand, 7032339 - 7032426
Alignment:
Q  109 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatta 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||    
T  7032339 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaattttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactccaaatta 7032426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29523860 - 29523778
Alignment:
Q  113 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  29523860 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 29523778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Original strand, 11203844 - 11203926
Alignment:
Q  113 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  11203844 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaagtatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 11203926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 194
Target Start/End: Original strand, 33496572 - 33496653
Alignment:
Q  113 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatat 194  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  33496572 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaatgatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatat 33496653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12342340 - 12342259
Alignment:
Q  113 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12342340 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaactttta-aagaacctgtttatgccaaattaactccatatt 12342259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26771128 - 26771022
Alignment:
Q  89 ccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagt 188  Q
    ||||| |||||||||||   ||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| | ||| |    
T  26771128 ccacggtttgccaaatttgctttcgtaggtaaacgatccctcaaaagccgccaagtaagaatagagactttaagaggagcctgtttatgccacattaact 26771029  T
Q  189 ccatatt 195  Q
    |||||||    
T  26771028 ccatatt 26771022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 7031146 - 7031063
Alignment:
Q  99 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaa 182  Q
    ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  7031146 ccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagacgccaagcaaggatagaaagttttaaaggaacctgtttatgccaaa 7031063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35214525 - 35214404
Alignment:
Q  74 tccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtt 173  Q
    |||||||||||||| ||||| | || ||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |  |||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  35214525 tccacatatagaatcccacgttctggcaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacatccgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctgtt 35214426  T
Q  174 tatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    ||||||| | ||| ||||||||    
T  35214425 tatgccagattaactccatatt 35214404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36801190 - 36801108
Alignment:
Q  113 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| |  ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  36801190 gtaggtaaacgatccctcagcagttgccaagcaaggatataaacttttaagggaacctatttatgctaaattaactccatatt 36801108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 963295 - 963186
Alignment:
Q  96 ttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||  ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||  || ||||||||    
T  963295 ttgccaaattttgtttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaaaatagacactttcaaaggcacctgtttgtgccaaatcaactccatatt 963196  T
Q  196 atggtgtaac 205  Q
     || ||||||    
T  963195 ttgatgtaac 963186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 205
Target Start/End: Original strand, 2755843 - 2755959
Alignment:
Q  89 ccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagt 188  Q
    |||||| ||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||  ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||  || |    
T  2755843 ccacgacttgccaaattttatttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaatatagacactttcaaaggtacctgtttgtgccaaatcaact 2755942  T
Q  189 ccatattatggtgtaac 205  Q
    ||||||| || ||||||    
T  2755943 ccatattttgatgtaac 2755959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 195
Target Start/End: Original strand, 19890661 - 19890785
Alignment:
Q  71 tcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacct 170  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||| ||||||||||  |  ||| | |||||||| || ||||| | ||||||||    
T  19890661 tcctccacaaatgtaatgccacgatctgccaagttggatttagtaggtaatcgatccctcaacaaccgcaatgcaaggatggaaacttttaaaggaacct 19890760  T
Q  171 gtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||    
T  19890761 gtttatgccagattaactccatatt 19890785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 182
Target Start/End: Original strand, 16178952 - 16179042
Alignment:
Q  92 cgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaa 182  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||||  |||||| |||  || ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16178952 cgatttgccaaattctctttagtaggtagacgatccttcatcaggcgccacgcaaaaatagatactttaagaggtacctgtttatgccaaa 16179042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 205
Target Start/End: Original strand, 3140853 - 3140969
Alignment:
Q  89 ccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagt 188  Q
    |||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| |   |||||||||  ||||| ||||| | ||| |||||||| | |||||  || |    
T  3140853 ccacgacttgccaaattttgtttagtaggtaaccggtccctcagtaaatgccaagcaaatatagacactttcaaaggcacctgtttgtaccaaatcaact 3140952  T
Q  189 ccatattatggtgtaac 205  Q
    ||||||| || ||||||    
T  3140953 ccatattttgatgtaac 3140969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 209
Target Start/End: Original strand, 15312584 - 15312704
Alignment:
Q  89 ccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagt 188  Q
    ||||||||| |||||||   |||  |||| || |||| |||||| |||| ||||||||  ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  15312584 ccacgattttccaaattctctttaataggcaaacgattcctcagcagtcaccaagcaaatatatagacttttagaggtacctgtttatgccaaattaact 15312683  T
Q  189 ccatattatggtgtaactggg 209  Q
    ||| ||| || ||||| ||||    
T  15312684 ccaaattttgatgtaaatggg 15312704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11411 - 11207
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11411 caaatgaaaaacattttcgacattcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacggtttgccaaattaagttttgtaggtaac 11312  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  11311 cgatccctgagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccagattatggtgtagctgggtctgctcctgtg 11212  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  11211 atgtc 11207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 106049 - 105845
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106049 caaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 105950  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  105949 cgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtg 105850  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  105849 atgtc 105845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 7924320 - 7924524
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7924320 caaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 7924419  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7924420 cgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtg 7924519  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  7924520 atgtc 7924524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 8299737 - 8299941
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8299737 caaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacacataatcgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 8299836  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  8299837 cgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccaaattatggtgtaattggggctactcctgtg 8299936  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  8299937 atgtc 8299941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 172037 - 172241
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  172037 caaatgagaaacatcttcgacattaccacagccagaaacacataaccgctcctccatagatagaatgtcacggtttaccaaattaagttttgtgggtaac 172136  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||    
T  172137 cggtccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccattttatggtgtaactggttctgctcctgtg 172236  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  172237 atgtc 172241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 13396322 - 13396526
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  || ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  13396322 caaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaac 13396421  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  13396422 cgatctctcaggagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacttgtttatgccaaattaactccatatgatgatgtaattggggctgctcctgtg 13396521  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  13396522 atgtc 13396526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 216
Target Start/End: Original strand, 32266498 - 32266692
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  || ||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  32266498 caaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaac 32266597  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctc 216  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| || |||||    
T  32266598 cgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccaaattatggtgtaactgtggttgctc 32266692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41665575 - 41665371
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  || |||| || | ||||||||||||  |||||||||||||    
T  41665575 caaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgtcatggtttgccaaattattttttgtaggtaac 41665476  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
     |||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  41665475 tgatctcttaggaatcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatgatgatgtaattggggctgctcctgtg 41665376  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  41665375 atgtc 41665371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 226
Target Start/End: Original strand, 9922545 - 9922739
Alignment:
Q  32 acatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctca 131  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||| |  || ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9922545 acatcttctacattcccacaaccagaaacacacatccgcgcctccagaggtaaaatgccacggtttgccaaattatcttttgtaggtaaccgatccctca 9922644  T
Q  132 gaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatgatgtc 226  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  || || ||||| || |||||||||| |||||||    
T  9922645 gaagtcgtcatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgccaaattaactccaagttttgatgtaagtgaggctgctcctgtgatgtc 9922739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 195
Target Start/End: Original strand, 20824307 - 20824403
Alignment:
Q  99 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  20824307 ccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 20824403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 195
Target Start/End: Original strand, 13200067 - 13200230
Alignment:
Q  32 acatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctca 131  Q
    |||||||| |||  |||||| |||| |||||| |||||  |||||| |  |||||| |  || | |||||||||   |||||||||||| ||||||||||    
T  13200067 acatcttcaacatgcccacacccagtaacacaaaaccgagcctccataggtagaattctgcgctctgccaaattgtattttgtaggtaaacgatccctca 13200166  T
Q  132 gaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
      ||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13200167 atagctgccaagcaaggattgaaacttttagaggaacctgtttatgccaaactaactccatatt 13200230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Original strand, 17699507 - 17699589
Alignment:
Q  113 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17699507 gtaggtaaacgatccctcagcagtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 17699589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 195
Target Start/End: Original strand, 2170328 - 2170449
Alignment:
Q  74 tccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtt 173  Q
    |||||| ||||||| ||||| | | |||||||   ||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  2170328 tccacagatagaatcccacgttctaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacggtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtt 2170427  T
Q  174 tatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    ||||||| | ||| ||||||||    
T  2170428 tatgccagattaactccatatt 2170449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Original strand, 37434157 - 37434239
Alignment:
Q  113 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  37434157 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaagaatagagacttttaaaggaacatgtttatgccaaattaactccatatt 37434239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 34137096 - 34137011
Alignment:
Q  95 tttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgcca 180  Q
    |||||||||||   ||| |||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34137096 tttgccaaattttctttcgtaggtaaacgatccatcataagccgccaagcaagaatagagactttgagaggtacctgtttatgcca 34137011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 160
Target Start/End: Original strand, 2529820 - 2529958
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    ||||||||  |||||||| |||  |||||| || | |||||| |||||  |||||| |  |||||| ||||||| | |||||||   ||||||||||||     
T  2529820 caaatgagtcacatcttcaacatgcccacaccctgtaacacaaaaccgagcctccaaaagtagaattccacgatctaccaaattgtattttgtaggtaag 2529919  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttg 160  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| || ||||||    
T  2529920 cgatccctcaatagccgccaagcaaggattgaaactttg 2529958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13879630 - 13879522
Alignment:
Q  85 aatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaact 184  Q
    |||||||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||  |  |||||||||| ||  |  ||||||||||| |||| ||| ||||| |||    
T  13879630 aatgccacgatttgccaaattggctttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaagactgtaactttgagaggtacctatttgtgccagact 13879531  T
Q  185 aagtccata 193  Q
    || ||||||    
T  13879530 aactccata 13879522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 180
Target Start/End: Original strand, 43270475 - 43270542
Alignment:
Q  113 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgcca 180  Q
    ||||| || |||||| |||  |||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  43270475 gtaggcaaacgatccttcaacagtcgccaagtaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgcca 43270542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 56
Target Start/End: Original strand, 20497018 - 20497052
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccag 56  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20497018 caaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccag 20497052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 195
Target Start/End: Original strand, 25090384 - 25090494
Alignment:
Q  85 aatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaact 184  Q
    |||||| ||||||| ||||||   ||| |||||||  ||||||||||  |  |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| | |||    
T  25090384 aatgccgcgatttgtcaaattggctttagtaggtagtcgatccctcaacaaccgccaagcaaggattgaaacttttagaggtacctgtttgtgctagact 25090483  T
Q  185 aagtccatatt 195  Q
    || ||||||||    
T  25090484 aactccatatt 25090494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 11)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4938334 - 4938130
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4938334 caaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 4938235  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4938234 cgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtg 4938135  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  4938134 atgtc 4938130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11277458 - 11277254
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  || ||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  11277458 caaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattatttttcgtaggtaac 11277359  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  11277358 cgatctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatggtgtaactggggttgctcctgtg 11277259  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  11277258 atgtc 11277254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 47876917 - 47877121
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||  ||||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||| |||||| |  || ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  47876917 caaatgattaacatcttcaacgttcccgcatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaac 47877016  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  47877017 tgatctctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccctattttgatgtaactggggctgctcctgtg 47877116  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  47877117 atgtc 47877121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 29967909 - 29968113
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  || ||||||| | ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  29967909 caaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccatggtttgccaaattacttttcgtaggtaac 29968008  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29968009 cgatctctcaaaagtcctcaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactggggttgctcctgtg 29968108  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  29968109 atgtc 29968113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 53 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 235614 - 235439
Alignment:
Q  53 ccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaat--taagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggat 150  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |  || ||||||||| ||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  235614 ccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaatgattttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggat 235515  T
Q  151 agatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatgatgtc 226  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  235514 agagactttgagatgaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgtaactggggctgctcctgtgatgtc 235439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 226
Target Start/End: Original strand, 37919487 - 37919682
Alignment:
Q  31 aacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctc 130  Q
    ||||||||| ||  ||||||| | ||||||||| |||||| |||||| |  || ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||    
T  37919487 aacatcttcaacgttcccacaactagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctc 37919586  T
Q  131 agaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatgatgtc 226  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  37919587 aggagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttataccaaattaacttcatatgatgatgtaattggggctgctcctgtgatgtc 37919682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 17720569 - 17720773
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||  |||||||||  || ||||||| | ||||||||| | |||| |||||| |  || ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  17720569 caaatgattaacatcttcttcattcccacaactagaaacacacatccgcgcctccagaggtaaaatgccacggtttgccaaattatcttttgtaggtaac 17720668  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  || || ||||| || |||||||||| ||    
T  17720669 cgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgccaaattaactccaagttttgatgtaagtgaggctgctcctgtg 17720768  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  17720769 atgtc 17720773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 31177511 - 31177421
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagtttt 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31177511 caaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgtcaaattaagtttt 31177421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 195
Target Start/End: Original strand, 25619403 - 25619566
Alignment:
Q  32 acatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctca 131  Q
    |||||||| |||  ||||||||| |  ||||| || || ||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||| || |||||||    
T  25619403 acatcttcaacatgcccacatcctgtgacacaaaatcggtcctccacagatgcaatgccacgatctgccaagttggatttagtaggtaatcgttccctca 25619502  T
Q  132 gaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  25619503 acaaccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccatattaactccatatt 25619566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Original strand, 18532653 - 18532735
Alignment:
Q  113 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  18532653 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatataaacttttaaaggaacctgtttatgcgagattaactccatatt 18532735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 195
Target Start/End: Original strand, 37254743 - 37254865
Alignment:
Q  73 ctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgt 172  Q
    ||||||| ||| |||||||| || |||||| ||   ||| |||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| || ||||| | || |||||||    
T  37254743 ctccacagatataatgccacaatctgccaagttggatttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaggattgaaacttttaaagtaacctgt 37254842  T
Q  173 ttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    |||||||| | ||| ||||||||    
T  37254843 ttatgccagattaactccatatt 37254865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23642797 - 23642593
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23642797 caaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 23642698  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23642697 cgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtg 23642598  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  23642597 atgtc 23642593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 47418738 - 47418942
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47418738 caaatgagtaacatcttcgacaatcccacatcctgcaacgcataaccgctcctccccagatagaatgccacgagttgccaaattaagttttgtaggtaac 47418837  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  47418838 cgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatactatggtgtaactggggctgctcctgtg 47418937  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  47418938 atgtc 47418942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13271088 - 13270893
Alignment:
Q  31 aacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13271088 aacatcttcgacaatcccacatccagtaactcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctc 13270989  T
Q  131 agaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatgatgtc 226  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13270988 attagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 13270893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47686101 - 47685897
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47686101 caaacgagaaacatcttcgacattcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagataaaatgccacggtttgccaaattatgttttgtaggtaac 47686002  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  47686001 cgatctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgtcaaattaagtccagattatggtgtaacttgggctgctcttgtg 47685902  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  47685901 atgtc 47685897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 15740155 - 15740359
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||  ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |  || |||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||    
T  15740155 caaatgattaacatctttaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggcttgtcaaattattttttgtaggtaac 15740254  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15740255 cgatctcgcaaaagtctccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 15740354  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  15740355 atgtc 15740359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1828746 - 1828542
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |  || ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  1828746 caaatgatcaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattagtttttgtaggtaac 1828647  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    | ||| | ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  1828646 ctatctcgcaatagtctccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatgatgtaactggggctgctcctgtg 1828547  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  1828546 atgtc 1828542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 19755198 - 19755405
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacat---atagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggt 118  Q
    |||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    ||| |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  19755198 caaatgattaacatcttcaacgctcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaataaaatgtcacggtttgccaaattattttttgtaggt 19755297  T
Q  119 aaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcct 218  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || || ||||||||||| |    
T  19755298 aaccgatctctcaggagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatgatgatgaaattggggctgctctt 19755397  T
Q  219 atgatgtc 226  Q
     |||||||    
T  19755398 gtgatgtc 19755405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19784608 - 19784401
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacat---atagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggt 118  Q
    |||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    ||| |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  19784608 caaatgattaacatcttcaacgctcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaataaaatgtcacggtttgccaaattattttttgtaggt 19784509  T
Q  119 aaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcct 218  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || || ||||||||||| |    
T  19784508 aaccgatctctcaggagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatgatgatgaaattggggctgctctt 19784409  T
Q  219 atgatgtc 226  Q
     |||||||    
T  19784408 gtgatgtc 19784401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 226
Target Start/End: Original strand, 7403857 - 7404051
Alignment:
Q  32 acatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctca 131  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||| ||||| |||||| |||||| |  || ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  7403857 acatcttcaacgttcccgcatccagagacacacaaccgcgcctccaaacgtaaaatgccacggtttgccaaattcttttttgtaggtaaccgatccctca 7403956  T
Q  132 gaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatgatgtc 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  7403957 gaagtcgccaagcaaggatagagactttgaaatgaacttgtttatgccaaattaacttcatattttgatgtaactggggctgctcctgtgatgtc 7404051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 55725822 - 55725719
Alignment:
Q  92 cgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtcca 191  Q
    |||| |||||||||   |||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  55725822 cgatctgccaaattgtattttgtaggtaagcgatccctcaatagccgccaagcaaggattgaaacttttagaggaacttgtttatgccaaattaactcca 55725723  T
Q  192 tatt 195  Q
    ||||    
T  55725722 tatt 55725719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Original strand, 12697838 - 12697920
Alignment:
Q  113 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  12697838 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaatttcatatt 12697920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 45472824 - 45472742
Alignment:
Q  113 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  45472824 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 45472742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11587331 - 11587233
Alignment:
Q  95 tttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccata 193  Q
    |||||||||||   ||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||| ||||||    
T  11587331 tttgccaaattttctttcgtaggtaaacgattcctcagaagccgccaagcaagaatagatactttgataggtatctatttatgccaaattaactccata 11587233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 195
Target Start/End: Original strand, 8361126 - 8361207
Alignment:
Q  114 taggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8361126 taggtaaacgattcctcagcagtcgccaaacaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 8361207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Original strand, 20002750 - 20002832
Alignment:
Q  113 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||||||||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  20002750 gtaggtaaacgatccctcaacagccgccaagcaatgatagaaacttttaaaagaacctgtttatgccaaattaactccatatt 20002832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 159897 - 159842
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctcca 77  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||    
T  159897 caaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataatcgttcctcca 159842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 203
Target Start/End: Original strand, 12734059 - 12734240
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  12734059 caaatgagaaacatcttcgacattcccacatctagaaacacataaccgctcctccagagatagaatgccacgggttaccaaattaagttttgtaggtaac 12734158  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  12734159 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaaatccatattatgatgta 12734240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 2553571 - 2553775
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| || |||||| |  || ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  2553571 caaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaactgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaac 2553670  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  2553671 cgatctttcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatggtgtaactggggctgctcttgtg 2553770  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  2553771 atgtc 2553775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18651430 - 18651236
Alignment:
Q  32 acatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctca 131  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||| ||||| |||||| | |||| |  || ||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18651430 acatcttcaacggtcccgcatccagagacacacaaccgcgcatccaaaggtaaaatcccacggttttccaaattattttttgtaggtaaccgatccctca 18651331  T
Q  132 gaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatgatgtc 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||    
T  18651330 gaagtcgccaagcaaggatagagactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatctaactggggctgctcctgtgatgtc 18651236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24767621 - 24767426
Alignment:
Q  31 aacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctc 130  Q
    ||||||||| ||  |||| || ||| ||||||| |||||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  24767621 aacatcttcaacgttcccgcaaccaaaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacgatttgccaaattattttttgtaggtaaccgatcccta 24767522  T
Q  131 agaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatgatgtc 226  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24767521 agaagtcgtcaagcaaggatagagactttgataggaacctgtttatgcaaaattaactccatattttgatgtaactagggctgctcctgtgatgtc 24767426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 109 - 226
Target Start/End: Original strand, 21168220 - 21168337
Alignment:
Q  109 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactgg 208  Q
    |||||||||||| |||||   || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21168220 ttttgtaggtaatcgatcttgcaaaagtctccaagctaggatagatactttgagaggaacctatttatgccaaattaactccatattatggtgtaactgg 21168319  T
Q  209 ggctgctcctatgatgtc 226  Q
    |||||||||| |||||||    
T  21168320 ggctgctcctgtgatgtc 21168337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17579210 - 17579114
Alignment:
Q  99 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17579210 ccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 17579114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17573784 - 17573688
Alignment:
Q  99 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17573784 ccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaatcttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 17573688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17606449 - 17606367
Alignment:
Q  113 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17606449 gtaggtaaatgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 17606367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21630226 - 21630140
Alignment:
Q  109 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  21630226 ttttgtaggtaaacgatccctcaatagtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctggttatgccaaattaactccatatt 21630140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14373163 - 14373026
Alignment:
Q  56 gaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagata 155  Q
    |||||||| |||||| |||||| | | | ||||||||| |||||||||||   ||| |||||||| |  | ||||| |||  |||||||||| |||||||    
T  14373163 gaaacacacaaccgcccctccatagaaataatgccacggtttgccaaatttcctttcgtaggtaagccgttcctcaaaagctgccaagcaagaatagata 14373064  T
Q  156 ctttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccata 193  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14373063 cttttagaggtacctgtttatgccaaattaaatccata 14373026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 10577364 - 10577282
Alignment:
Q  113 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  10577364 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatataaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactctatatt 10577282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15958946 - 15958861
Alignment:
Q  95 tttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgcca 180  Q
    |||||||||||   ||| ||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15958946 tttgccaaatttgctttcgtaggtaaatgatccctcaaaagccgccaagcaagaatagagactttaagaggaacctgtttatgcca 15958861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20883215 - 20883066
Alignment:
Q  46 cccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagca 145  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||  |||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||   ||| |||||||| | ||||||||  || |||||||||    
T  20883215 cccacatcccgtgacacaaaaccgagcctccacagatataatgccacgatctaccaagttcgatttagtaggtaaacaatccctcaacagccgccaagca 20883116  T
Q  146 aggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| | ||| ||||||||    
T  20883115 aggatagaaacttttaaaggaacctatttatgccagattaactccatatt 20883066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 205
Target Start/End: Original strand, 13937708 - 13937817
Alignment:
Q  96 ttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatatt 195  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||  ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||  || ||||||||    
T  13937708 ttgccaaattttgtttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaaaatagacactttcaaaggcacctgtttgtgccaaatcaactccatatt 13937807  T
Q  196 atggtgtaac 205  Q
     || ||||||    
T  13937808 ttgatgtaac 13937817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 3186 - 3390
Alignment:
Q  22 caaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaac 121  Q
    |||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  || ||||||| | |||||||||||   ||| |||||||||    
T  3186 caaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccatggtttgccaaattgcttttcgtaggtaac 3285  T
Q  122 cgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaactaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctatg 221  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  3286 cgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagaaactttaagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatggtgtaactagggttgctcctgtg 3385  T
Q  222 atgtc 226  Q
    |||||    
T  3386 atgtc 3390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University