View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10261A_low_419 (Length: 225)

Name: NF10261A_low_419
Description: NF10261A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10261A_low_419
NF10261A_low_419
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (21-225)||(44241374-44241579)
chr1 (21-225)||(29001748-29001953)
chr1 (21-225)||(9869122-9869327)
chr1 (21-225)||(31072335-31072540)
chr1 (19-225)||(4599545-4599753)
chr1 (21-225)||(1174622-1174828)
chr1 (21-217)||(6238680-6238877)
chr1 (21-217)||(39053338-39053535)
chr1 (21-217)||(39059710-39059907)
chr1 (21-217)||(42091921-42092118)
chr1 (21-217)||(45015806-45016003)
chr1 (21-225)||(26621486-26621692)
chr1 (21-225)||(44916347-44916560)
chr1 (21-225)||(41305514-41305720)
chr1 (21-185)||(11913262-11913427)
chr1 (21-225)||(41297533-41297739)
chr1 (52-208)||(27240161-27240318)
chr1 (21-199)||(43686672-43686851)
chr1 (21-225)||(32797753-32797945)
chr1 (21-225)||(1115982-1116189)
chr1 (21-225)||(41299188-41299394)
chr1 (110-225)||(23764521-23764637)
chr1 (85-225)||(5445028-5445168)
chr1 (21-100)||(23762336-23762415)
chr1 (26-225)||(28413678-28413879)
chr1 (26-225)||(39806074-39806274)
chr1 (30-156)||(47646755-47646883)
chr1 (26-225)||(2824824-2825024)
chr1 (27-168)||(23251426-23251568)
chr1 (43-225)||(38672788-38672973)
chr1 (26-133)||(5357752-5357861)
chr1 (26-133)||(45620149-45620258)
chr1 (25-69)||(9316137-9316181)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (21-225)||(2662-2867)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (21-225)||(37026065-37026270)
chr7 (21-225)||(26601929-26602134)
chr7 (21-225)||(39432925-39433129)
chr7 (21-225)||(15914655-15914860)
chr7 (21-225)||(3924093-3924298)
chr7 (21-225)||(15949176-15949381)
chr7 (21-225)||(21642535-21642740)
chr7 (21-225)||(36875562-36875767)
chr7 (21-225)||(14298917-14299122)
chr7 (21-225)||(5049912-5050117)
chr7 (21-225)||(14287732-14287937)
chr7 (21-225)||(23612406-23612611)
chr7 (21-225)||(1948633-1948839)
chr7 (21-217)||(2446671-2446868)
chr7 (21-217)||(6795463-6795660)
chr7 (21-208)||(6020864-6021052)
chr7 (21-208)||(8185392-8185580)
chr7 (21-208)||(8192952-8193140)
chr7 (21-208)||(48353480-48353668)
chr7 (21-225)||(9642916-9643123)
chr7 (21-225)||(33850643-33850848)
chr7 (21-208)||(48347096-48347284)
chr7 (21-199)||(5056307-5056486)
chr7 (24-225)||(45433602-45433805)
chr7 (21-225)||(19089824-19090030)
chr7 (21-217)||(1378972-1379169)
chr7 (21-217)||(8142446-8142643)
chr7 (21-95)||(13774130-13774204)
chr7 (26-225)||(10831130-10831331)
chr7 (26-225)||(11024922-11025123)
chr7 (26-225)||(21901193-21901395)
chr7 (26-87)||(27954243-27954303)
chr7 (26-69)||(28442628-28442671)
chr7 (192-225)||(1942062-1942095)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (21-222)||(22359984-22360186)
chr5 (21-225)||(4973580-4973785)
chr5 (21-225)||(22313847-22314052)
chr5 (21-225)||(5876235-5876440)
chr5 (21-217)||(34357288-34357485)
chr5 (21-217)||(34359079-34359276)
chr5 (21-208)||(2957893-2958081)
chr5 (21-208)||(2966362-2966550)
chr5 (21-225)||(2438818-2439022)
chr5 (21-217)||(29980484-29980681)
chr5 (21-217)||(30041244-30041441)
chr5 (21-225)||(40958617-40958822)
chr5 (21-208)||(25894649-25894837)
chr5 (21-186)||(12505765-12505931)
chr5 (23-225)||(42150835-42151039)
chr5 (21-225)||(29414669-29414874)
chr5 (26-225)||(33794109-33794309)
chr5 (26-225)||(9843366-9843566)
chr5 (26-168)||(2156125-2156268)
chr5 (30-132)||(19853484-19853588)
chr5 (26-133)||(12918955-12919064)
chr5 (26-133)||(30580195-30580304)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (21-225)||(13671817-13672022)
chr6 (21-225)||(27670111-27670316)
chr6 (21-225)||(32328493-32328698)
chr6 (21-225)||(31547912-31548117)
chr6 (21-217)||(1428423-1428620)
chr6 (21-217)||(34711557-34711754)
chr6 (21-223)||(9864760-9864964)
chr6 (21-222)||(4186705-4186907)
chr6 (21-225)||(21262574-21262780)
chr6 (21-217)||(11058150-11058347)
chr6 (21-208)||(4020235-4020423)
chr6 (21-208)||(4026661-4026849)
chr6 (21-208)||(34655285-34655473)
chr6 (21-208)||(7069702-7069890)
chr6 (21-208)||(34648834-34649022)
chr6 (21-208)||(4738323-4738511)
chr6 (88-225)||(29906907-29907045)
chr6 (88-225)||(30117335-30117473)
chr6 (21-164)||(1167480-1167630)
chr6 (116-208)||(7062578-7062671)
chr6 (26-219)||(10081567-10081762)
chr6 (21-83)||(7062516-7062578)
chr6 (26-162)||(9846601-9846738)
chr6 (21-58)||(29907044-29907081)
chr6 (21-58)||(30117299-30117336)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (21-225)||(2021448-2021653)
chr2 (21-225)||(21341882-21342087)
chr2 (21-225)||(21331994-21332199)
chr2 (21-225)||(16856487-16856691)
chr2 (21-225)||(16817330-16817534)
chr2 (21-225)||(42931372-42931577)
chr2 (21-217)||(12950821-12951018)
chr2 (21-208)||(36782184-36782372)
chr2 (21-217)||(34834812-34835009)
chr2 (21-217)||(34841256-34841453)
chr2 (21-208)||(29484961-29485149)
chr2 (21-208)||(45012017-45012205)
chr2 (21-217)||(43267883-43268081)
chr2 (21-208)||(15852584-15852772)
chr2 (21-217)||(2157637-2157834)
chr2 (21-217)||(2164053-2164250)
chr2 (21-217)||(13901957-13902154)
chr2 (21-170)||(45700644-45700793)
chr2 (21-225)||(21067958-21068163)
chr2 (26-225)||(41455623-41455823)
chr2 (21-185)||(11909950-11910116)
chr2 (26-185)||(17784443-17784604)
chr2 (30-168)||(13162892-13163032)
chr2 (26-185)||(17789096-17789257)
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (21-225)||(55462772-55462977)
chr4 (21-221)||(16405363-16405568)
chr4 (21-225)||(16838359-16838563)
chr4 (21-223)||(27590324-27590527)
chr4 (21-225)||(41373003-41373209)
chr4 (22-208)||(37368315-37368502)
chr4 (21-225)||(7780424-7780629)
chr4 (21-208)||(8103916-8104104)
chr4 (21-225)||(13594123-13594330)
chr4 (21-225)||(30238277-30238482)
chr4 (21-215)||(30211536-30211731)
chr4 (21-208)||(17456889-17457077)
chr4 (21-225)||(36754791-36755004)
chr4 (21-168)||(5660549-5660696)
chr4 (44-225)||(13003809-13003992)
chr4 (26-225)||(2947862-2948062)
[»] chr3 (20 HSPs)
chr3 (21-222)||(10941304-10941506)
chr3 (21-225)||(4311486-4311691)
chr3 (21-222)||(6036286-6036488)
chr3 (21-225)||(32746387-32746592)
chr3 (21-208)||(24179108-24179296)
chr3 (21-225)||(9570548-9570755)
chr3 (21-222)||(9577050-9577254)
chr3 (21-208)||(27501967-27502155)
chr3 (21-225)||(13015003-13015208)
chr3 (21-225)||(43995086-43995300)
chr3 (21-223)||(25893249-25893458)
chr3 (21-223)||(43931601-43931799)
chr3 (21-225)||(23068481-23068686)
chr3 (31-168)||(20651135-20651272)
chr3 (117-225)||(41353878-41353987)
chr3 (93-225)||(41354142-41354275)
chr3 (26-225)||(4590811-4591012)
chr3 (177-222)||(3577095-3577140)
chr3 (26-133)||(4644354-4644463)
chr3 (26-83)||(2785865-2785922)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (21-225)||(12768761-12768966)
chr8 (21-208)||(11358193-11358381)
chr8 (21-217)||(7311374-7311571)
chr8 (21-217)||(8013320-8013517)
chr8 (21-217)||(36005482-36005679)
chr8 (21-208)||(36425730-36425918)
chr8 (21-217)||(6464576-6464773)
chr8 (21-225)||(15012405-15012610)
chr8 (21-217)||(36075992-36076189)
chr8 (21-217)||(41242116-41242313)
chr8 (21-199)||(36021799-36021978)
chr8 (21-225)||(16710668-16710874)
chr8 (21-225)||(1238230-1238436)
chr8 (21-164)||(26250591-26250734)
chr8 (21-213)||(45068416-45068609)
chr8 (21-168)||(31017459-31017608)
chr8 (26-133)||(7933931-7934040)
chr8 (183-225)||(31017416-31017458)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (21-225)||(15188-15393)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (21-225)||(49708-49912)
[»] scaffold0936 (1 HSPs)
scaffold0936 (21-225)||(3264-3468)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (21-217)||(5005-5202)
[»] scaffold0510 (2 HSPs)
scaffold0510 (21-225)||(8881-9087)
scaffold0510 (21-225)||(2560-2766)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (21-162)||(12014-12155)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (137-225)||(99931-100020)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (44-225)||(24268-24451)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44241579 - 44241374
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44241579 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 44241480  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44241479 aatgaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttcatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 44241380  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  44241379 aatgat 44241374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29001953 - 29001748
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  29001953 tattatttggacatgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgacc 29001854  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29001853 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 29001754  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  29001753 aatgat 29001748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9869327 - 9869122
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9869327 tattgtttggacacgaaagatgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 9869228  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  9869227 aaggaactctaatcctaacaagtttcacaccttattaatctcaattttatcatttgcaacttagtcattaaaacaaactaccaattatcttttaacttag 9869128  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  9869127 aatgat 9869122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31072540 - 31072335
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  31072540 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagagtccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 31072441  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  31072440 aaggaactctaatcctaacaagtttcatgccttattaatctcaattttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttagcttag 31072341  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  31072340 aatgat 31072335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4599753 - 4599545
Alignment:
Q  19 agtattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  4599753 agtattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaa 4599654  T
Q  119 tcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaact 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4599653 tcaaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaact 4599554  T
Q  217 tagaatgat 225  Q
    |||||||||    
T  4599553 tagaatgat 4599545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1174828 - 1174622
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  1174828 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgctc 1174729  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  1174728 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatctttcaactta 1174629  T
Q  219 gaatgat 225  Q
    |||||||    
T  1174628 gaatgat 1174622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6238877 - 6238680
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  6238877 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 6238778  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  6238777 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatctagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 6238680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Original strand, 39053338 - 39053535
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39053338 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 39053437  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  39053438 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 39053535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Original strand, 39059710 - 39059907
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39059710 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 39059809  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  39059810 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 39059907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 42092118 - 42091921
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  42092118 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 42092019  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  42092018 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 42091921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45016003 - 45015806
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  45016003 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 45015904  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  45015903 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 45015806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26621692 - 26621486
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  26621692 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaatc 26621593  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtttaactta 218  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || | || ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  26621592 aaggaaccctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgaaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 26621493  T
Q  219 gaatgat 225  Q
    |||||||    
T  26621492 gaatgat 26621486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44916560 - 44916347
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |     
T  44916560 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgtttggtt 44916461  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgc---------aacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtt 211  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  44916460 aaggaattctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttcaacatagttaacttagtttttaaaacaaacaacaaactatcttt 44916361  T
Q  212 taacttagaatgat 225  Q
    ||| ||||||||||    
T  44916360 taatttagaatgat 44916347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 41305514 - 41305720
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  41305514 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttaatc 41305613  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  41305614 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatctttaaactta 41305713  T
Q  219 gaatgat 225  Q
    |||||||    
T  41305714 gaatgat 41305720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 11913262 - 11913427
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| ||    
T  11913262 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacatgtgatgcttggtc 11913361  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagtt 185  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  11913362 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattcgcaacttagtt 11913427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41297739 - 41297533
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||    
T  41297739 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgaggatcgatc 41297640  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||    
T  41297639 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacaaactatctttcaactta 41297540  T
Q  219 gaatgat 225  Q
    |||||||    
T  41297539 gaatgat 41297533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Original strand, 27240161 - 27240318
Alignment:
Q  52 gatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgcc 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27240161 gatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgcc 27240260  T
Q  152 ttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27240261 ttattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatc 27240318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 43686851 - 43686672
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||    
T  43686851 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttaaatgagacgctcgatc 43686752  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaa 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  43686751 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaa 43686672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32797945 - 32797753
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  32797945 tattgtttggacacgaattgtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 32797846  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaag-tttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||            |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32797845 aaggaactctaatcctaacaagtttttacgccctattactc------------ttgcaacttagtttctaaaacaaacaacaaattatc-tttaacttag 32797759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 1115982 - 1116189
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggt---gttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttg 117  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  1115982 tattgtttggacacaaatggtagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaaggtagaatccatgtatagtcattaggttacgtgtgacgcttg 1116081  T
Q  118 atcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaact 216  Q
    || |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||    
T  1116082 attaaggaactctaatcataagaagtttcacaccttattactctcaacttttactcttgcaacttagttact-aaacaaacaacaaattagcttttaact 1116180  T
Q  217 tagaatgat 225  Q
    |||||||||    
T  1116181 tagaatgat 1116189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 41299188 - 41299394
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||| |||    
T  41299188 tattgtttggaaaagaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagcttgaatccatgaatggtcattaggttatatgtgacgcttaatc 41299287  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  41299288 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaataaattatcttttaactta 41299387  T
Q  219 gaatgat 225  Q
    |||||||    
T  41299388 gaatgat 41299394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 110 - 225
Target Start/End: Original strand, 23764521 - 23764637
Alignment:
Q  110 gacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23764521 gacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc 23764620  T
Q  209 gtttaacttagaatgat 225  Q
    |||||||||||||||||    
T  23764621 gtttaacttagaatgat 23764637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 225
Target Start/End: Original strand, 5445028 - 5445168
Alignment:
Q  85 catgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttag 183  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  5445028 catgtatggtcattaggttatgtgtgaggcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacaccttattaatctcaacttttactcttgcaacttag 5445127  T
Q  184 ttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgat 225  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5445128 ttactaaaacaaacaacaaattatc-tttaacttagaatgat 5445168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 100
Target Start/End: Original strand, 23762336 - 23762415
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23762336 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 23762415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 28413678 - 28413879
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 123  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||     ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  28413678 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatattggtaaaatgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 28413777  T
Q  124 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 222  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28413778 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcaacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaat 28413876  T
Q  223 gat 225  Q
    |||    
T  28413877 gat 28413879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39806274 - 39806074
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 123  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| ||| |||||||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  39806274 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctggaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 39806175  T
Q  124 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaa-ctttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 222  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||  ||||   |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  39806174 gaactctaattccaac-gtttttacgccttattactctcaatttttactcttgcaacttagtttctaaaacgaacaacaaattatc-tttaacttaaaat 39806077  T
Q  223 gat 225  Q
    |||    
T  39806076 gat 39806074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 47646883 - 47646755
Alignment:
Q  30 gacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatcc--atgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaac 127  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  || | |||||||||| |||  |||||  |||| |||| ||||    
T  47646883 gacatgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcgattaaaagctagaatccgtatatgtgatcattaggttatatgtgattcttggtcaacgaac 47646784  T
Q  128 tctaatactaacaagtttcacgccttatt 156  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  47646783 tctaatcataacaagttttacgccttatt 47646755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 2824824 - 2825024
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 123  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||     ||| |||||||| ||| ||||  || ||||| ||| || |||||| | ||||||    
T  2824824 tttggacatgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatgggtaaaacgctagaattcatatatgtgattattaggttatgtttgacgcataatcaag 2824923  T
Q  124 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatg 223  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | ||   |||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2824924 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaactttcacttttatacttggttactaaaacaaacaacatattatcttttaacttagaatg 2825022  T
Q  224 at 225  Q
    ||    
T  2825023 at 2825024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23251568 - 23251426
Alignment:
Q  27 ttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtat--gatcattagattacgtgtgacgcttgatcaagg 124  Q
    ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| |||  ||| ||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  23251568 ttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgcgattattaggttatgtttgacgcttaatcaagg 23251469  T
Q  125 aactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 168  Q
    ||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23251468 aactctaattccaac-gtttttacgccttattactctcaacttt 23251426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 225
Target Start/End: Original strand, 38672788 - 38672973
Alignment:
Q  43 ttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaaca 140  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| || || ||| || |||||||| |||||||||||||||| | ||      
T  38672788 ttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattatcaggttatgtttgacgcttaatcaaggaactctaattccaa-t 38672886  T
Q  141 agtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtt-taacttagaatgat 225  Q
      ||| ||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  38672887 gtttttacgccttattactctcaacttttactcttgcaacttagtttctaaaacgaacaacaaattatctttcaaacttagaatgat 38672973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 133
Target Start/End: Original strand, 5357752 - 5357861
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 123  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||     ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  5357752 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatattgggaaaatgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 5357851  T
Q  124 gaactctaat 133  Q
    ||||||||||    
T  5357852 gaactctaat 5357861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 133
Target Start/End: Original strand, 45620149 - 45620258
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 123  Q
    |||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || ||| |||| ||||||    
T  45620149 tttggacacgaataatcttgtcgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgaagcttaatcaag 45620248  T
Q  124 gaactctaat 133  Q
    ||||||||||    
T  45620249 gaactctaat 45620258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 9316181 - 9316137
Alignment:
Q  25 gtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaa 69  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  9316181 gtttggacacgaatgatgttgttgagcaatatgtgataatatcaa 9316137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2867 - 2662
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2867 tattgtttggatacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctataatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 2768  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2767 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttgcagcttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 2668  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  2667 aatgat 2662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37026270 - 37026065
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37026270 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaactagaatcaatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 37026171  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37026170 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttacaacttagttagtcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 37026071  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  37026070 aatgat 37026065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26602134 - 26601929
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26602134 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgttcattaggttatgtgtgacgcttgatc 26602035  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26602034 aaggaattctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 26601935  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  26601934 aatgat 26601929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39433129 - 39432925
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39433129 tattgtttggacacgaatggcgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaattcatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 39433030  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttaga 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39433029 aaggaactctaatcctaacaagtttcacaccttattaatctcaactttatcatttgcacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttaga 39432930  T
Q  221 atgat 225  Q
    |||||    
T  39432929 atgat 39432925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15914860 - 15914655
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15914860 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgcgacgcttgatc 15914761  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15914760 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 15914661  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  15914660 aatgat 15914655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 3924093 - 3924298
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3924093 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 3924192  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  3924193 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 3924292  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  3924293 aatgat 3924298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15949381 - 15949176
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||||    
T  15949381 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatatgcgacgcttgatc 15949282  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15949281 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 15949182  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  15949181 aatgat 15949176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21642740 - 21642535
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  21642740 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaatgaaaagctagaatccatgtttgttcattaggttatgtgtgatgcttgatc 21642641  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21642640 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 21642541  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  21642540 aatgat 21642535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36875767 - 36875562
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36875767 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatatatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 36875668  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  36875667 aaggaactccaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 36875568  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  36875567 aatgat 36875562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14299122 - 14298917
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||    
T  14299122 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagggtacgtgcgacgttcgatc 14299023  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14299022 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 14298923  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  14298922 aatgat 14298917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 5049912 - 5050117
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  5049912 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 5050011  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || ||||||||||||| |    
T  5050012 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttgg 5050111  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  5050112 aatgat 5050117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14287937 - 14287732
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||    
T  14287937 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagggtacgtgcgacgttcgatc 14287838  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14287837 aaggaactctaatcctaacaagatttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 14287738  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  14287737 aatgat 14287732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23612611 - 23612406
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23612611 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 23612512  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  23612511 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgtaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 23612412  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  23612411 aatgat 23612406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 1948633 - 1948839
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||     
T  1948633 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatctcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatt 1948732  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1948733 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaactttatcttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 1948832  T
Q  219 gaatgat 225  Q
    |||||||    
T  1948833 gaatgat 1948839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2446868 - 2446671
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  2446868 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 2446769  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  2446768 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 2446671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6795660 - 6795463
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  6795660 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 6795561  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  6795560 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 6795463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 6020864 - 6021052
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6020864 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 6020963  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6020964 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatc 6021052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 8185392 - 8185580
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8185392 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 8185491  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8185492 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatc 8185580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 8192952 - 8193140
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8192952 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 8193051  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8193052 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatc 8193140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 48353480 - 48353668
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48353480 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 48353579  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  48353580 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatc 48353668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 9642916 - 9643123
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9642916 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 9643015  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatc-gtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  9643016 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaaacatattatctttttaactt 9643115  T
Q  218 agaatgat 225  Q
    ||||||||    
T  9643116 agaatgat 9643123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 33850643 - 33850848
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||     
T  33850643 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatacatgtatagtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 33850742  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  33850743 aaggaactctaatcctaacaagtttaacgccttactactctcaacttttactattgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattgacttttaacttag 33850842  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  33850843 aatgat 33850848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 48347096 - 48347284
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48347096 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 48347195  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  48347196 aaggaactctaatcctaacaagtttcatgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatc 48347284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Original strand, 5056307 - 5056486
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  5056307 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 5056406  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaa 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  5056407 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaa 5056486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 45433805 - 45433602
Alignment:
Q  24 tgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  45433805 tgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgattaag 45433706  T
Q  124 gaactctaatactaacaag-tttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaa 221  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45433705 gaactctaatcctaacaagtttttacgccttattactctcaacttttactcttgaaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaa 45433606  T
Q  222 tgat 225  Q
    ||||    
T  45433605 tgat 45433602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19090030 - 19089824
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19090030 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagttagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 19089931  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19089930 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 19089831  T
Q  219 gaatgat 225  Q
    |||||||    
T  19089830 gaatgat 19089824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1379169 - 1378972
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  1379169 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagacaagctagaatccatgtatgctcattaggttacgtgcgacgctcgatc 1379070  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  1379069 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 1378972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Original strand, 8142446 - 8142643
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  8142446 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagacaagctagaatccatgtatgctcattaggttacgtgcgacgctcgatc 8142545  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||| || | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  8142546 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgtaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 8142643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 95
Target Start/End: Original strand, 13774130 - 13774204
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatc 95  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13774130 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatc 13774204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 10831130 - 10831331
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 123  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||||    |||  ||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  10831130 tttggacatgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaactctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 10831229  T
Q  124 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 222  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10831230 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcaacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaat 10831328  T
Q  223 gat 225  Q
    |||    
T  10831329 gat 10831331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 11024922 - 11025123
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 123  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||||    |||  ||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  11024922 tttggacatgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaactctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 11025021  T
Q  124 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 222  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11025022 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcaacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaat 11025120  T
Q  223 gat 225  Q
    |||    
T  11025121 gat 11025123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 21901193 - 21901395
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 123  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||||||| || |||||||| ||||||    
T  21901193 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatgtttgacgcttaatcaag 21901292  T
Q  124 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtttaacttagaa 221  Q
    ||||||| || |||||   ||| ||||| ||||| ||||||||||  | || | || ||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  21901293 gaactctgattctaacgttttt-acgccctattactctcaacttttacttttgaaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatctttcaacttagaa 21901391  T
Q  222 tgat 225  Q
    ||||    
T  21901392 tgat 21901395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 27954303 - 27954243
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccat 87  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  27954303 tttggacacgaatgatgttgttgaggaatatgtgataatatc-gagtaaagctagaatccat 27954243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 28442671 - 28442628
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaa 69  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28442671 tttggacacgaatgatgttgttgagcgatatgtgataatatcaa 28442628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1942095 - 1942062
Alignment:
Q  192 acaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1942095 acaaacaacaaattatcgtttaacttataatgat 1942062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22360186 - 22359984
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22360186 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatc 22360087  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22360086 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 22359987  T
Q  220 aat 222  Q
    |||    
T  22359986 aat 22359984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4973785 - 4973580
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4973785 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattatgttacgtgtgacgcttgatc 4973686  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4973685 aaggaactctgatcctaacaagtttcaccccttattaatctcaattttatcatttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 4973586  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  4973585 aatgat 4973580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22314052 - 22313847
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22314052 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtacggtcattaggttacgtgtgacgcttgatc 22313953  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22313952 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaataacaaattatcgtttaacttag 22313853  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  22313852 aatgat 22313847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5876440 - 5876235
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  5876440 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgcgacgcttgatc 5876341  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5876340 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 5876241  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  5876240 aatgat 5876235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Original strand, 34357288 - 34357485
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34357288 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34357387  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  34357388 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 34357485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Original strand, 34359079 - 34359276
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34359079 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34359178  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  34359179 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 34359276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2958081 - 2957893
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2958081 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 2957982  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2957981 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatc 2957893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2966550 - 2966362
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2966550 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 2966451  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2966450 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatc 2966362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2439022 - 2438818
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  2439022 tattgtttggacacaaatgatgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgcatg-tcattaggttacgtgtgacgcttgatt 2438924  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||     
T  2438923 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcacttttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattttcttttaacttat 2438824  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  2438823 aatgat 2438818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29980681 - 29980484
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  29980681 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 29980582  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  29980581 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 29980484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Original strand, 30041244 - 30041441
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  30041244 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 30041343  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  30041344 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 30041441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 40958617 - 40958822
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40958617 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgaggaatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 40958716  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |    
T  40958717 aaggaactctaatcctaacaagtgttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaataaccaattatcttttaacttgg 40958816  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  40958817 aatgat 40958822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 25894649 - 25894837
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25894649 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatcgatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 25894748  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  25894749 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatc 25894837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Original strand, 12505765 - 12505931
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  12505765 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagagaagctagaatccatgtataatcattaggttacgtgggactcttgatc 12505864  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagtta 186  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  12505865 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttattattcgcaacatagtta 12505931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 42151039 - 42150835
Alignment:
Q  23 ttgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaa 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  42151039 ttgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaactagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgattaa 42150940  T
Q  123 ggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaacttaga 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||||    
T  42150939 ggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacaaactatctttcaacttaga 42150840  T
Q  221 atgat 225  Q
    |||||    
T  42150839 atgat 42150835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 29414669 - 29414874
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29414669 tattgtttgaacatgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 29414768  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||| || |||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||| |||||    ||   | ||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29414769 aagaaattctaatcctaataagttttacgccctattactctcgactttcaattttatatttgcttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaacttag 29414868  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  29414869 aatgat 29414874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33794309 - 33794109
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 123  Q
    |||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| |||||     
T  33794309 tttggatacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcagtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaaa 33794210  T
Q  124 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 222  Q
    |||||||||| | ||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  33794209 gaactctaattccaac-atttttacgccttattactctcaacttttactcttgcaacttagtttctaaaacatacaacaaattatc-tttaacttagaat 33794112  T
Q  223 gat 225  Q
    |||    
T  33794111 gat 33794109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9843566 - 9843366
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 123  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  9843566 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 9843467  T
Q  124 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatg 223  Q
    |||||||||| | ||    ||| ||||| ||||| ||||||||||  | ||   | || |||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  9843466 gaactctaattccaa-tgtttttacgccctattactctcaactttcacttttatatttggttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttagaatg 9843368  T
Q  224 at 225  Q
    ||    
T  9843367 at 9843366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Original strand, 2156125 - 2156268
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 123  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    |||  ||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  2156125 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacactagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 2156224  T
Q  124 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 168  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2156225 gaactctaattccaac-gtttttacgccttattactctcaacttt 2156268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 132
Target Start/End: Original strand, 19853484 - 19853588
Alignment:
Q  30 gacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaac 127  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  19853484 gacatgaatgatgttgttgagtgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatgtttgacgcttaatcaacgaac 19853583  T
Q  128 tctaa 132  Q
    |||||    
T  19853584 tctaa 19853588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 133
Target Start/End: Original strand, 12918955 - 12919064
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 123  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  || | ||||| ||| || |||||||| | ||||    
T  12918955 tttggacacgaatagtcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtggttattaggttatgtttgacgcttaaccaag 12919054  T
Q  124 gaactctaat 133  Q
    ||||||||||    
T  12919055 gaactctaat 12919064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 133
Target Start/End: Original strand, 30580195 - 30580304
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 123  Q
    |||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| |||||     
T  30580195 tttggacacgaatgatgtcgtcgaccgatacgtgataatatcgataaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaac 30580294  T
Q  124 gaactctaat 133  Q
    ||||||||||    
T  30580295 gaactctaat 30580304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 13671817 - 13672022
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13671817 tattgtttggacactaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 13671916  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  13671917 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgcattattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaataaacaacaaattatcgtttaacttat 13672016  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  13672017 aatgat 13672022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27670316 - 27670111
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27670316 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaattcatgtatgattattaggttacgtgtgacacttgatc 27670217  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27670216 aaggaactctaatcctaacaagtttcacactttattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 27670117  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  27670116 aatgat 27670111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 32328493 - 32328698
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||    
T  32328493 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttatatgtgacgctcgatc 32328592  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  32328593 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 32328692  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  32328693 aatgat 32328698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31548117 - 31547912
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31548117 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtgtgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 31548018  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  31548017 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaactaag 31547918  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  31547917 aatgat 31547912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Original strand, 1428423 - 1428620
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  1428423 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 1428522  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  1428523 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 1428620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Original strand, 34711557 - 34711754
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34711557 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34711656  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  34711657 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 34711754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 223
Target Start/End: Original strand, 9864760 - 9864964
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9864760 tattgtttggacacgaatagtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaagttacgtgtgacgcttgatc 9864859  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  9864860 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaactta 9864959  T
Q  219 gaatg 223  Q
    |||||    
T  9864960 gaatg 9864964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4186907 - 4186705
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  4186907 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagttagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 4186808  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4186807 aaggaactctaatcctaacaagttctacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 4186708  T
Q  220 aat 222  Q
    |||    
T  4186707 aat 4186705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 21262574 - 21262780
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  21262574 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaactagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaatc 21262673  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21262674 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 21262773  T
Q  219 gaatgat 225  Q
    |||||||    
T  21262774 gaatgat 21262780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Original strand, 11058150 - 11058347
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  11058150 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 11058249  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  11058250 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 11058347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 4020235 - 4020423
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4020235 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 4020334  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4020335 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatc 4020423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 4026661 - 4026849
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4026661 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 4026760  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4026761 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatc 4026849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 34655473 - 34655285
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34655473 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 34655374  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34655373 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatc 34655285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 7069702 - 7069890
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7069702 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 7069801  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7069802 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatc 7069890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 34649022 - 34648834
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34649022 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 34648923  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | || || ||||||||||||| |||||||    
T  34648922 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagatactaaaacaaacaaccaattatc 34648834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 4738323 - 4738511
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4738323 tattgtttggactcgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 4738422  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4738423 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatc 4738511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 88 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29907045 - 29906907
Alignment:
Q  88 gtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagtta 186  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  29907045 gtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattagcaatttagtta 29906946  T
Q  187 ttaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgat 225  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29906945 ctaaaacaaacaacaaattatattttaacttagaatgat 29906907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 88 - 225
Target Start/End: Original strand, 30117335 - 30117473
Alignment:
Q  88 gtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagtta 186  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  30117335 gtatggtccttaggttacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattagcaatttagtta 30117434  T
Q  187 ttaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgat 225  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30117435 ctaaaacaaacaacaaattatattttaacttagaatgat 30117473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 164
Target Start/End: Original strand, 1167480 - 1167630
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaaga-------aaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacg 113  Q
    |||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||| ||| |       ||| ||||||||| | ||||||||| || ||| ||||||||    
T  1167480 tattatttggacacgaacgatattgttgagggatacatgataatataaaaaataaaaaaaaaactagaatccgtatatgatcatcaggttatgtgtgacg 1167579  T
Q  114 cttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaa 164  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1167580 cttgatcaaagaattctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaa 1167630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 208
Target Start/End: Original strand, 7062578 - 7062671
Alignment:
Q  116 tgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7062578 tgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatc 7062671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 219
Target Start/End: Original strand, 10081567 - 10081762
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 123  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  10081567 tttggacacgaataatcttgttgagcgatatgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 10081666  T
Q  124 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctc-aactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| |||| || ||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10081667 gaactctaattccaac-gtttttacgccttattactctcaaattttactcttgcaacttagtttctaaaacaaacaacaaattatcttttaacttag 10081762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Original strand, 7062516 - 7062578
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaat 83  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7062516 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaat 7062578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9846738 - 9846601
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatcc--atgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 123  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |  ||| ||||||||||  || | |||| || || ||| || |||||||| |||||     
T  9846738 tttgaacacgaatgatgttgtcgagcgatacgtgataatatcgataaaatgctagaatccgtatatgtgattatcaggttatgtttgacgcttaatcaac 9846639  T
Q  124 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctc 162  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||||||||    
T  9846638 gaactctaattccaac-gcttttacgccttattaatctc 9846601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 29907081 - 29907044
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgt 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29907081 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggacacgt 29907044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 58
Target Start/End: Original strand, 30117299 - 30117336
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgt 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30117299 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggacacgt 30117336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 2021448 - 2021653
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2021448 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 2021547  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2021548 aaggaactctaatcctaacaagttttacaccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 2021647  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  2021648 aatgat 2021653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 21341882 - 21342087
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21341882 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 21341981  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21341982 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagtcattaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 21342081  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  21342082 aatgat 21342087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 21331994 - 21332199
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21331994 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 21332093  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  21332094 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgaaatttagtcattaaaacaaacaaccaactatcttttaacttag 21332193  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  21332194 aatgat 21332199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 16856487 - 16856691
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16856487 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 16856586  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16856587 aagaaactctaatcctaacaagtnttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc-tttaactttg 16856685  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  16856686 aatgat 16856691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 16817330 - 16817534
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16817330 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 16817429  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16817430 aagaaactctaatcctaacaagtgttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc-tttaactttg 16817528  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  16817529 aatgat 16817534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 42931372 - 42931577
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  42931372 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacatttgatc 42931471  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| |    
T  42931472 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatctgttaacttgg 42931571  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  42931572 aatgat 42931577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12951018 - 12950821
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  12951018 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 12950919  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  12950918 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 12950821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 36782184 - 36782372
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36782184 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 36782283  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  36782284 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatc 36782372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Original strand, 34834812 - 34835009
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34834812 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34834911  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  34834912 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatctagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 34835009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Original strand, 34841256 - 34841453
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34841256 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34841355  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  34841356 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatctagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 34841453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29485149 - 29484961
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29485149 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 29485050  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  29485049 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatc 29484961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 45012205 - 45012017
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45012205 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 45012106  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  45012105 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatc 45012017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 43268081 - 43267883
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  43268081 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 43267982  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  43267981 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaactt 43267883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15852772 - 15852584
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15852772 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtgtgatcattaggttaagtgtgacgcttgatc 15852673  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15852672 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatc 15852584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2157834 - 2157637
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  2157834 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagatagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 2157735  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  2157734 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 2157637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2164250 - 2164053
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  2164250 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtataatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 2164151  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  2164150 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 2164053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Original strand, 13901957 - 13902154
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  13901957 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagacaagctagaatccatgtatgctcattaggttacgtgcgacgctcgatc 13902056  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  13902057 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 13902154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Original strand, 45700644 - 45700793
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  45700644 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccaggtatgatcattaggttatgtgtgacgtttgatc 45700743  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttat 170  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45700744 aaggaactctaattctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttat 45700793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 21067958 - 21068163
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || || ||    
T  21067958 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgatgcctgctc 21068057  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 218  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21068058 aaggaactctaatcctaa-aagtttcacaccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaatacaaacaaacaaattatcttttaactta 21068156  T
Q  219 gaatgat 225  Q
    |||||||    
T  21068157 gaatgat 21068163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41455823 - 41455623
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 123  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| | | |||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  41455823 tttggacacgaataatcttgttgagtgatacgtgataatatcggtaaaacggtggaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 41455724  T
Q  124 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatg 223  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | ||   |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41455723 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaatg 41455625  T
Q  224 at 225  Q
    ||    
T  41455624 at 41455623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 11909950 - 11910116
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatga--tcattagattacgtgtgacgcttga 118  Q
    |||| |||||||||||||  | |||| ||  |||||||||||||||  |  |||||||||||||| | ||||   ||||| |||||  || || ||||||    
T  11909950 tattatttggacacgaataatattgtcgactgatacgtgataatatagattaaaagctagaatccgtatatgtggtcattggattatatgggatgcttga 11910049  T
Q  119 tcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagtt 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||    
T  11910050 tcaaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcacttttattcttgcaaattagtt 11910116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 185
Target Start/End: Original strand, 17784443 - 17784604
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 123  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    ||| |||||||| ||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  17784443 tttggacacgaatgatgttgtcgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaattcatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 17784542  T
Q  124 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagtt 185  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  17784543 gaactctaattccaac-gcttttacgccttattactctcaacttttatctttgcaaattagtt 17784604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13163032 - 13162892
Alignment:
Q  30 gacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaac 127  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||  | ||||  |||||||  |||  || ||  |||| |||| ||||    
T  13163032 gacatgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatattgattaaaagctagaatctgtatatgtgatcattatgttatatgcgattcttggtcaatgaac 13162933  T
Q  128 tctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 168  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13162932 tctaatcctaacaagttttacgccttattactctcaacttt 13162892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 185
Target Start/End: Original strand, 17789096 - 17789257
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 123  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| ||||  ||| || |||||||| ||||||    
T  17789096 tttggacaggaatgatgttgtcgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattatgttatgtttgacgcttaatcaag 17789195  T
Q  124 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagtt 185  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  17789196 gaactctaattccaac-gcttttacgccttattactctcaacttttatctttgcaaattagtt 17789257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 55462772 - 55462977
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55462772 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 55462871  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  55462872 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 55462971  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  55462972 aatgat 55462977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16405568 - 16405363
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatat----caaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgctt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16405568 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacattataatatatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctt 16405469  T
Q  117 gatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaac 215  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16405468 gatcaaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaac 16405369  T
Q  216 ttagaa 221  Q
    ||||||    
T  16405368 ttagaa 16405363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 16838359 - 16838563
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16838359 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagatagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatc 16838458  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16838459 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttttactcttgcaacttagttactaaaacaaacaacaaatcatc-tttaacttag 16838557  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  16838558 aatgat 16838563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27590527 - 27590324
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27590527 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 27590428  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  27590427 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 27590328  T
Q  220 aatg 223  Q
    ||||    
T  27590327 aatg 27590324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41373209 - 41373003
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  41373209 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 41373110  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  41373109 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaactta 41373010  T
Q  219 gaatgat 225  Q
    |||||||    
T  41373009 gaatgat 41373003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 208
Target Start/End: Original strand, 37368315 - 37368502
Alignment:
Q  22 attgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatca 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37368315 attgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatca 37368414  T
Q  122 aggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  37368415 aggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatc 37368502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7780629 - 7780424
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  7780629 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaatc 7780530  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactta 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7780529 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttatcatttgcaatttcgttactaaaacaaacaacaaatcatc-tttaactta 7780431  T
Q  219 gaatgat 225  Q
    |||||||    
T  7780430 gaatgat 7780424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8104104 - 8103916
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8104104 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtgtgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 8104005  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8104004 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatc 8103916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13594330 - 13594123
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13594330 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 13594231  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatc-gtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  13594230 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaaacatattatctttttaactt 13594131  T
Q  218 agaatgat 225  Q
    ||||||||    
T  13594130 agaatgat 13594123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30238482 - 30238277
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30238482 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggataaatgataatatcaaagaaaagctagaatacatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 30238383  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  30238382 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 30238283  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  30238282 aatgat 30238277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 30211536 - 30211731
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||     
T  30211536 tattttttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaagttatgtgtgacgcttgatt 30211635  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaac 215  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30211636 aaggaactctaatcataacaagtttcatgccttattaatctcaattttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaac 30211731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17457077 - 17456889
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17457077 tattgtttggacatgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 17456978  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17456977 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttgtcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatc 17456889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 36754791 - 36755004
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||     
T  36754791 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggtaatgtgtgacgcttgatt 36754890  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgc---------aacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtt 211  Q
    ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  36754891 aaggaacttcaatcctaataagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttcaatatagttaacttagttactaaaacaaacaacaaactatcttt 36754990  T
Q  212 taacttagaatgat 225  Q
    ||| ||||||||||    
T  36754991 taatttagaatgat 36755004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Original strand, 5660549 - 5660696
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  5660549 tattatttggacacgaatgatattgtcgagggatacgtgattatatcaaagaaaagttagaatccgtatatgatcattaggttacatgtgatgcttgatc 5660648  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 168  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5660649 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 5660696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 225
Target Start/End: Original strand, 13003809 - 13003992
Alignment:
Q  44 tgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaa 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||| | |||      
T  13003809 tgttgagtgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaaagaactctaattccaacgt 13003908  T
Q  142 gtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgat 225  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  13003909 tttt-acgccttattactctcaacttttactcttgcaactttgttactaaaacaaacaacaaattgtcttttaacttataatgat 13003992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2948062 - 2947862
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 123  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  2948062 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 2947963  T
Q  124 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatg 223  Q
    |||||||||| | ||    ||| ||||| ||||| ||||||||||  | ||   | || |||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  2947962 gaactctaattccaa-tgtttttacgccctattactctcaactttcacttttatatttggttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttagaatg 2947864  T
Q  224 at 225  Q
    ||    
T  2947863 at 2947862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 20)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 222
Target Start/End: Original strand, 10941304 - 10941506
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  10941304 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagttagaatccatatatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 10941403  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10941404 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttag 10941503  T
Q  220 aat 222  Q
    |||    
T  10941504 aat 10941506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 4311486 - 4311691
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  4311486 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgcgacgattgatc 4311585  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4311586 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcatttaacttag 4311685  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  4311686 aatgat 4311691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6036488 - 6036286
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6036488 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgagtgacgcttgatc 6036389  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  6036388 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcattttcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 6036289  T
Q  220 aat 222  Q
    |||    
T  6036288 aat 6036286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32746592 - 32746387
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32746592 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 32746493  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  32746492 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 32746393  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  32746392 aatgat 32746387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24179296 - 24179108
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24179296 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 24179197  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24179196 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatc 24179108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 9570548 - 9570755
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9570548 tattgtttggacacgaatggtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 9570647  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcat-tgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgttt-aactt 217  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  9570648 aaggaattctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatctgcaatttagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaaactt 9570747  T
Q  218 agaatgat 225  Q
    ||||||||    
T  9570748 agaatgat 9570755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 222
Target Start/End: Original strand, 9577050 - 9577254
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9577050 tattgtttggacacgaatggtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 9577149  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcat-tgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgttt-aactt 217  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  9577150 aaggaattctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatctgcaatttagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaaactt 9577249  T
Q  218 agaat 222  Q
    |||||    
T  9577250 agaat 9577254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 27501967 - 27502155
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27501967 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 27502066  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27502067 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatc 27502155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13015208 - 13015003
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13015208 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 13015109  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  13015108 aagaaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 13015009  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  13015008 aatgat 13015003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43995300 - 43995086
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaa-gaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  43995300 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtaataatatcaaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttggt 43995201  T
Q  120 caaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt---------gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgt 210  Q
     ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||  |||||||||||||||| |||| |    
T  43995200 taaggaactctaatcctgacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttcaacatagtcaacttagtttctaaaacaaacaacaaactatctt 43995101  T
Q  211 ttaacttagaatgat 225  Q
    |||||||||||||||    
T  43995100 ttaacttagaatgat 43995086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25893458 - 25893249
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25893458 tattgtttggacacgaatagtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaagttacgtgtgacgcttgatc 25893359  T
Q  121 aagg-----aactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gttta 213  Q
    ||||     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||    
T  25893358 aaggaatttaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattaacttttta 25893259  T
Q  214 acttagaatg 223  Q
    ||||||||||    
T  25893258 acttagaatg 25893249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 43931799 - 43931601
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgt--gtgacgcttga 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  43931799 tattgtttgaacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataa-------gaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtatgtgacgcttga 43931707  T
Q  119 tcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcat-tgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43931706 ttaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattatccgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaactt 43931607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23068686 - 23068481
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||    
T  23068686 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaag-tagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgatgctcgatc 23068588  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatc-gtttaactt 217  Q
    || |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  23068587 aaagaactctaatcctaacaagtttc-cgccctattaatttcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacagattatctttttaactt 23068489  T
Q  218 agaatgat 225  Q
    ||||||||    
T  23068488 agaatgat 23068481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 168
Target Start/End: Original strand, 20651135 - 20651272
Alignment:
Q  31 acacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactct 130  Q
    ||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20651135 acacgaatgatattgtcaagggatacgtgataatatcaaagaaaaggtagaatccgtatatgatcattaaattacgtgtgatgcttgatcaaggaactct 20651234  T
Q  131 aatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 168  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20651235 aatcctaacgagtttcacgccttattaatctcaacttt 20651272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41353987 - 41353878
Alignment:
Q  117 gatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaac 215  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41353987 gatcaaggaactctaatcctaacaagttttacgtcctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaac 41353888  T
Q  216 ttagaatgat 225  Q
    ||| ||||||    
T  41353887 ttaaaatgat 41353878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 225
Target Start/End: Original strand, 41354142 - 41354275
Alignment:
Q  93 atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaa 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| ||||    
T  41354142 atcattaggttacgtgtgacgcttgctcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaa 41354241  T
Q  192 acaaac-aacaaattatcgtttaacttagaatgat 225  Q
    |||||| ||||||||||  || |||||||||||||    
T  41354242 acaaacaaacaaattat-tttcaacttagaatgat 41354275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4591012 - 4590811
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 123  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  4591012 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 4590913  T
Q  124 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaacttagaat 222  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||   | || |||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4590912 gaactctaattccaac-gtttttacgccctattactctcaactttaacttttatatttggttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaacttggaat 4590814  T
Q  223 gat 225  Q
    |||    
T  4590813 gat 4590811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 222
Target Start/End: Original strand, 3577095 - 3577140
Alignment:
Q  177 aacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3577095 aacttagttattcaaacaaacaacaaattatcatttaacttagaat 3577140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 133
Target Start/End: Original strand, 4644354 - 4644463
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 123  Q
    ||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| ||||  ||| || |||||||| | ||||    
T  4644354 tttggacacgaatagtcttgttgaacgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattatgttatgtttgacgcttaaccaag 4644453  T
Q  124 gaactctaat 133  Q
    ||||||||||    
T  4644454 gaactctaat 4644463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 2785922 - 2785865
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaat 83  Q
    ||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  2785922 tttggacacaaatgattttgtcgagggatacgtgataatatcgattaaaagctagaat 2785865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12768966 - 12768761
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12768966 tattgtttggacacgaatggtcttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtataatcattaggttacgtgtgaagcttgatc 12768867  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12768866 aaagaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttgcaatttagttattaaaacaaacaacgaattatcatttaacttag 12768767  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  12768766 aatgat 12768761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 11358193 - 11358381
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11358193 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 11358292  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11358293 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatc 11358381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7311571 - 7311374
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  7311571 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 7311472  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  7311471 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 7311374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Original strand, 8013320 - 8013517
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  8013320 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 8013419  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  8013420 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 8013517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Original strand, 36005482 - 36005679
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  36005482 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 36005581  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  36005582 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 36005679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 36425730 - 36425918
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36425730 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 36425829  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  36425830 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatc 36425918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Original strand, 6464576 - 6464773
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  6464576 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 6464675  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  6464676 aaggaactctaatcctaacgagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 6464773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15012610 - 15012405
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||     
T  15012610 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagatagaatccatgtatagtcattaggttccgtgtgacgcttgatt 15012511  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||   |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15012510 aaggaactctaatcctaacaagtttcacaccctattactctcaacttttactcttgcaacttagtaactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttag 15012411  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  15012410 aatgat 15012405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36076189 - 36075992
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  36076189 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 36076090  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || ||| |||||||||    
T  36076089 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactattgtttaactt 36075992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Original strand, 41242116 - 41242313
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  41242116 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 41242215  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||| ||||||||    
T  41242216 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcatttaactt 41242313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Original strand, 36021799 - 36021978
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  36021799 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 36021898  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaa 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  36021899 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaa 36021978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 16710668 - 16710874
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16710668 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaattcatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 16710767  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||  ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||| | |||| || ||||||    
T  16710768 aaggaactctaatcctaacaagttttatgccctattgctctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacatactatctttcaactta 16710867  T
Q  219 gaatgat 225  Q
    |||||||    
T  16710868 gaatgat 16710874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1238436 - 1238230
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||||    
T  1238436 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcatcaggttatttgtgacgcttgatc 1238337  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattg-caacttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtttaactta 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||  | ||  ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  1238336 aaggaactctaatcctaacaagttttacgctctattactctcaacttttactttttcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattattttttaactta 1238237  T
Q  219 gaatgat 225  Q
    |||||||    
T  1238236 gaatgat 1238230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 164
Target Start/End: Original strand, 26250591 - 26250734
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||     
T  26250591 tattgtttggacacgaatgatattgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctataaaccatgtatggttattagattacgtgtgacgcttgatt 26250690  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaa 164  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26250691 aaggaactctaatcctaacaaatttcacgccttattaatctcaa 26250734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 45068416 - 45068609
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||     
T  45068416 tattgttcggacacgaatggtgttatcgagggttacatgataatatcaaagaaaaactagaatccatgtatggtcattaggttacgtgcgacgcttgatt 45068515  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttta 213  Q
    || |||||||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45068516 aaagaactctaatcctaacaaattttacgttttattactctcaacttttactcttgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatctttta 45068609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 31017608 - 31017459
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatg--tatgatcattagattacgtgtgacgcttga 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  31017608 tattttttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaattagaatccatgtatatggtcattaggttacatgtgacgcttga 31017509  T
Q  119 tcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 168  Q
    | || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  31017508 ttaaagaactctaatcctaactagtttcacgccttattattcgcaacttt 31017459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 133
Target Start/End: Original strand, 7933931 - 7934040
Alignment:
Q  26 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 123  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  7933931 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 7934030  T
Q  124 gaactctaat 133  Q
    ||||||||||    
T  7934031 gaactctaat 7934040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31017458 - 31017416
Alignment:
Q  183 gttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgat 225  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  31017458 gttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttaaaatgat 31017416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15393 - 15188
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  15393 tattgtttggacacgaacggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctggaat 15294  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15293 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttactattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaagttag 15194  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  15193 aatgat 15188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 49912 - 49708
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||     
T  49912 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccgtgtatggtcattaggttatgtgcgacgcttgatg 49813  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49812 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc-tttaacttag 49714  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  49713 aatgat 49708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0936 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0936
Description:

Target: scaffold0936; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 3264 - 3468
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| ||||||||    
T  3264 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtaattaggttaagtgtgaagcttgatc 3363  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3364 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttttactcttgcaacttagttactaaaacaaacaacaaatcatc-tttaacttag 3462  T
Q  220 aatgat 225  Q
    ||||||    
T  3463 aatgat 3468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Original strand, 5005 - 5202
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  5005 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 5104  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  5105 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaactt 5202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 8881 - 9087
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||    
T  8881 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgaggatcgatc 8980  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||    
T  8981 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacaaactatctttcaactta 9080  T
Q  219 gaatgat 225  Q
    |||||||    
T  9081 gaatgat 9087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 2560 - 2766
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||| |||    
T  2560 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagcttgaatccatgaatggtcattaggttatatgtgacgcttaatc 2659  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  2660 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaataaattatcttttaactta 2759  T
Q  219 gaatgat 225  Q
    |||||||    
T  2760 gaatgat 2766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12155 - 12014
Alignment:
Q  21 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12155 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatttatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 12056  T
Q  121 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctc 162  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  12055 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctc 12014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 137 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 100020 - 99931
Alignment:
Q  137 aacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgat 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100020 aacaagtttcacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgat 99931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 225
Target Start/End: Original strand, 24268 - 24451
Alignment:
Q  44 tgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaa 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||| | |||      
T  24268 tgttgagtgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaaagaactctaattccaacgt 24367  T
Q  142 gtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgat 225  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  24368 tttt-acgccttattactctcaacttttactcttgcaactttgttactaaaacaaacaacaaattgtcttttaacttataatgat 24451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University