View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10269_low_13 (Length: 340)

Name: NF10269_low_13
Description: NF10269
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10269_low_13
NF10269_low_13
[»] chr6 (55 HSPs)
chr6 (46-323)||(3409542-3409818)
chr6 (46-253)||(29518871-29519078)
chr6 (46-235)||(2378096-2378284)
chr6 (46-212)||(29518495-29518661)
chr6 (46-212)||(32741171-32741337)
chr6 (20-212)||(35210196-35210386)
chr6 (46-236)||(2578443-2578634)
chr6 (56-212)||(3409251-3409407)
chr6 (35-237)||(10074352-10074553)
chr6 (44-312)||(10073989-10074255)
chr6 (22-212)||(3058218-3058409)
chr6 (33-237)||(16454872-16455078)
chr6 (35-213)||(3415449-3415629)
chr6 (46-212)||(14748342-14748504)
chr6 (46-202)||(2377756-2377912)
chr6 (20-204)||(2579848-2580030)
chr6 (46-211)||(1846741-1846906)
chr6 (32-233)||(2579478-2579678)
chr6 (33-229)||(2578822-2579016)
chr6 (56-212)||(26544041-26544197)
chr6 (34-212)||(1127352-1127530)
chr6 (20-202)||(16454577-16454758)
chr6 (55-202)||(16107680-16107827)
chr6 (20-236)||(2579085-2579297)
chr6 (46-198)||(2843560-2843713)
chr6 (34-237)||(10073604-10073804)
chr6 (24-202)||(5832007-5832182)
chr6 (47-254)||(16108011-16108208)
chr6 (49-201)||(6999799-6999951)
chr6 (33-204)||(593694-593867)
chr6 (61-201)||(1950200-1950340)
chr6 (96-199)||(32460630-32460733)
chr6 (50-204)||(10911565-10911720)
chr6 (79-198)||(9062383-9062501)
chr6 (20-204)||(12071666-12071849)
chr6 (85-237)||(8481893-8482045)
chr6 (33-204)||(12085021-12085191)
chr6 (34-204)||(12092470-12092640)
chr6 (52-209)||(5958613-5958766)
chr6 (72-237)||(6071098-6071264)
chr6 (23-204)||(31714671-31714849)
chr6 (131-237)||(35210456-35210551)
chr6 (35-200)||(17135058-17135223)
chr6 (88-236)||(2975521-2975668)
chr6 (20-197)||(30618593-30618766)
chr6 (145-237)||(33605943-33606034)
chr6 (92-136)||(22605301-22605345)
chr6 (53-100)||(3409405-3409452)
chr6 (85-136)||(11637760-11637811)
chr6 (121-167)||(14789279-14789325)
chr6 (92-136)||(21130103-21130147)
chr6 (54-112)||(10902438-10902496)
chr6 (20-79)||(2975296-2975354)
chr6 (86-128)||(11638053-11638095)
chr6 (21-70)||(35210554-35210602)
[»] chr7 (72 HSPs)
chr7 (46-296)||(37533011-37533259)
chr7 (20-204)||(1085591-1085774)
chr7 (22-204)||(7517580-7517762)
chr7 (85-312)||(22566702-22566929)
chr7 (19-210)||(29157559-29157750)
chr7 (75-253)||(7553974-7554154)
chr7 (46-236)||(30244236-30244428)
chr7 (49-236)||(14681478-14681663)
chr7 (20-212)||(37533339-37533530)
chr7 (46-204)||(23377-23535)
chr7 (21-236)||(30245043-30245255)
chr7 (21-197)||(11845198-11845373)
chr7 (46-202)||(6054562-6054718)
chr7 (34-202)||(45433243-45433411)
chr7 (46-204)||(40094774-40094932)
chr7 (24-204)||(22567017-22567196)
chr7 (54-204)||(36939741-36939891)
chr7 (57-202)||(45754718-45754862)
chr7 (56-196)||(19122740-19122879)
chr7 (46-233)||(45434607-45434794)
chr7 (46-204)||(24177435-24177593)
chr7 (48-198)||(34218036-34218186)
chr7 (20-202)||(47129097-47129277)
chr7 (22-204)||(118277-118459)
chr7 (20-204)||(8128415-8128599)
chr7 (23-204)||(36622960-36623140)
chr7 (46-199)||(30032572-30032725)
chr7 (48-201)||(9901648-9901799)
chr7 (84-204)||(16569196-16569316)
chr7 (84-204)||(16596346-16596466)
chr7 (50-204)||(40230295-40230449)
chr7 (78-231)||(1085280-1085436)
chr7 (69-201)||(24838724-24838857)
chr7 (49-201)||(20599317-20599471)
chr7 (55-204)||(36534795-36534942)
chr7 (46-204)||(41854635-41854792)
chr7 (48-183)||(37167808-37167937)
chr7 (46-162)||(30253534-30253646)
chr7 (22-158)||(28300229-28300366)
chr7 (134-236)||(30244667-30244771)
chr7 (131-233)||(30255308-30255412)
chr7 (52-201)||(41910592-41910749)
chr7 (21-123)||(47129450-47129550)
chr7 (83-204)||(43241495-43241616)
chr7 (131-233)||(30245463-30245567)
chr7 (116-204)||(28301613-28301701)
chr7 (47-121)||(28300569-28300644)
chr7 (136-204)||(36109007-36109075)
chr7 (48-116)||(37532753-37532821)
chr7 (207-275)||(37532822-37532890)
chr7 (22-103)||(30244453-30244533)
chr7 (22-103)||(30253671-30253751)
chr7 (99-199)||(44361517-44361616)
chr7 (86-253)||(37345868-37346036)
chr7 (154-236)||(40094502-40094583)
chr7 (86-137)||(21416181-21416232)
chr7 (20-103)||(30245256-30245338)
chr7 (22-94)||(7517767-7517839)
chr7 (22-94)||(7518033-7518105)
chr7 (87-135)||(23569043-23569091)
chr7 (86-204)||(4124128-4124246)
chr7 (167-210)||(14681281-14681324)
chr7 (57-136)||(40094424-40094503)
chr7 (59-121)||(45755010-45755072)
chr7 (92-137)||(21619091-21619136)
chr7 (46-149)||(37393114-37393216)
chr7 (152-202)||(36967335-36967385)
chr7 (46-162)||(15902342-15902457)
chr7 (92-136)||(27391815-27391859)
chr7 (55-109)||(4719305-4719359)
chr7 (22-68)||(7517982-7518028)
chr7 (97-137)||(27598052-27598092)
[»] chr3 (87 HSPs)
chr3 (63-311)||(4823549-4823796)
chr3 (27-236)||(22304537-22304747)
chr3 (22-295)||(37990615-37990888)
chr3 (52-274)||(15773119-15773346)
chr3 (20-236)||(54017791-54018008)
chr3 (47-307)||(11661846-11662108)
chr3 (20-202)||(37990951-37991133)
chr3 (48-202)||(43346793-43346947)
chr3 (46-270)||(29644581-29644808)
chr3 (20-204)||(15772854-15773037)
chr3 (46-202)||(35946524-35946680)
chr3 (20-204)||(42342362-42342546)
chr3 (34-204)||(29644890-29645060)
chr3 (46-232)||(41359765-41359949)
chr3 (48-237)||(42342092-42342283)
chr3 (34-204)||(12114550-12114720)
chr3 (46-204)||(32589704-32589861)
chr3 (46-204)||(33803252-33803410)
chr3 (54-213)||(39934963-39935124)
chr3 (46-236)||(21832345-21832532)
chr3 (46-204)||(54018198-54018356)
chr3 (55-212)||(39389062-39389219)
chr3 (54-237)||(22303963-22304141)
chr3 (46-204)||(25739425-25739583)
chr3 (49-202)||(32462903-32463057)
chr3 (20-202)||(52634678-52634858)
chr3 (46-237)||(32462558-32462752)
chr3 (46-212)||(50612447-50612618)
chr3 (45-204)||(31190017-31190168)
chr3 (46-204)||(53577364-53577522)
chr3 (46-202)||(25755396-25755552)
chr3 (22-204)||(1634291-1634473)
chr3 (49-204)||(45395656-45395811)
chr3 (72-253)||(3135099-3135280)
chr3 (46-202)||(3135454-3135617)
chr3 (53-236)||(9240118-9240300)
chr3 (45-202)||(45901715-45901873)
chr3 (46-203)||(53117975-53118131)
chr3 (44-204)||(39914252-39914412)
chr3 (45-204)||(8327904-8328067)
chr3 (149-237)||(22304213-22304301)
chr3 (46-212)||(37726496-37726654)
chr3 (54-202)||(49336694-49336843)
chr3 (45-212)||(51886553-51886714)
chr3 (22-146)||(22303634-22303759)
chr3 (22-202)||(33175635-33175820)
chr3 (46-204)||(44160547-44160702)
chr3 (72-223)||(47964544-47964694)
chr3 (22-194)||(42584800-42584970)
chr3 (22-130)||(41359467-41359575)
chr3 (97-215)||(3384317-3384435)
chr3 (80-178)||(33362327-33362425)
chr3 (34-204)||(39336219-39336387)
chr3 (20-134)||(54017522-54017636)
chr3 (46-204)||(47964915-47965073)
chr3 (112-201)||(7767380-7767469)
chr3 (20-95)||(22304302-22304378)
chr3 (225-312)||(22303759-22303846)
chr3 (86-202)||(11661537-11661638)
chr3 (96-201)||(46546375-46546480)
chr3 (148-204)||(43346650-43346706)
chr3 (76-162)||(39336000-39336086)
chr3 (57-162)||(12749211-12749316)
chr3 (94-154)||(52634990-52635050)
chr3 (47-100)||(8328374-8328427)
chr3 (72-201)||(25317161-25317290)
chr3 (86-202)||(25991405-25991521)
chr3 (86-137)||(53596027-53596078)
chr3 (86-137)||(53596342-53596393)
chr3 (92-149)||(17731950-17732007)
chr3 (92-149)||(19033181-19033238)
chr3 (46-124)||(43978865-43978947)
chr3 (86-137)||(53596542-53596593)
chr3 (46-122)||(7766783-7766857)
chr3 (90-137)||(48127859-48127906)
chr3 (19-77)||(9239940-9239997)
chr3 (172-204)||(12747878-12747910)
chr3 (92-136)||(16871005-16871049)
chr3 (92-136)||(17735037-17735081)
chr3 (92-136)||(19036306-19036350)
chr3 (180-242)||(2299937-2300000)
chr3 (92-137)||(16143505-16143550)
chr3 (92-133)||(16869843-16869884)
chr3 (138-199)||(36986040-36986101)
chr3 (138-199)||(37011479-37011540)
chr3 (20-73)||(41360111-41360164)
chr3 (105-141)||(50329391-50329427)
[»] chr8 (81 HSPs)
chr8 (34-311)||(3669953-3670229)
chr8 (46-213)||(3669678-3669845)
chr8 (54-312)||(1013879-1014137)
chr8 (34-214)||(30441071-30441255)
chr8 (20-253)||(9309304-9309537)
chr8 (20-202)||(3038263-3038446)
chr8 (36-226)||(34835185-34835377)
chr8 (36-237)||(34835439-34835643)
chr8 (36-237)||(34835705-34835909)
chr8 (48-237)||(40518550-40518738)
chr8 (54-202)||(34834878-34835026)
chr8 (22-212)||(20870550-20870741)
chr8 (46-236)||(8918764-8918956)
chr8 (53-270)||(45121663-45121882)
chr8 (56-204)||(45122067-45122215)
chr8 (20-202)||(30359273-30359456)
chr8 (54-212)||(1014253-1014411)
chr8 (50-253)||(30359558-30359763)
chr8 (34-204)||(45121898-45122068)
chr8 (46-231)||(45122604-45122782)
chr8 (44-236)||(6731872-6732055)
chr8 (50-226)||(9482608-9482784)
chr8 (43-202)||(25561812-25561972)
chr8 (46-204)||(6876862-6877021)
chr8 (45-204)||(9608745-9608904)
chr8 (47-202)||(33113368-33113523)
chr8 (46-202)||(40518071-40518229)
chr8 (46-236)||(45122972-45123164)
chr8 (46-202)||(37544490-37544646)
chr8 (46-201)||(147454-147609)
chr8 (33-179)||(9483174-9483320)
chr8 (46-202)||(1513915-1514071)
chr8 (49-197)||(70277-70425)
chr8 (50-253)||(18371665-18371863)
chr8 (52-210)||(40579512-40579670)
chr8 (46-204)||(5915872-5916025)
chr8 (48-204)||(5420651-5420807)
chr8 (49-204)||(41972158-41972316)
chr8 (20-194)||(18371968-18372142)
chr8 (132-253)||(18372342-18372463)
chr8 (56-237)||(147794-147968)
chr8 (46-233)||(6651476-6651652)
chr8 (46-204)||(9308977-9309139)
chr8 (132-253)||(18372785-18372905)
chr8 (56-201)||(32640542-32640682)
chr8 (100-253)||(18372988-18373139)
chr8 (47-200)||(18380020-18380171)
chr8 (46-210)||(32305478-32305635)
chr8 (56-204)||(4154678-4154824)
chr8 (53-204)||(9507777-9507933)
chr8 (67-181)||(9609108-9609222)
chr8 (160-249)||(18372485-18372574)
chr8 (126-212)||(41416251-41416335)
chr8 (91-201)||(43274824-43274934)
chr8 (35-237)||(4154270-4154472)
chr8 (33-126)||(41129066-41129159)
chr8 (86-202)||(8794113-8794229)
chr8 (34-204)||(9620666-9620834)
chr8 (46-129)||(40579269-40579352)
chr8 (55-204)||(12283873-12284021)
chr8 (46-122)||(8919144-8919220)
chr8 (96-202)||(18372656-18372758)
chr8 (114-201)||(3037776-3037865)
chr8 (55-200)||(43398077-43398225)
chr8 (131-194)||(25561729-25561792)
chr8 (99-199)||(20130454-20130553)
chr8 (72-204)||(5274775-5274907)
chr8 (34-127)||(20995404-20995497)
chr8 (37-201)||(40991756-40991920)
chr8 (46-110)||(43274635-43274699)
chr8 (20-93)||(3037942-3038016)
chr8 (66-123)||(16524446-16524503)
chr8 (112-168)||(18373236-18373292)
chr8 (178-253)||(43274699-43274776)
chr8 (63-150)||(40417733-40417820)
chr8 (50-104)||(18372288-18372342)
chr8 (96-133)||(12156708-12156745)
chr8 (147-204)||(20995502-20995559)
chr8 (127-204)||(33831978-33832055)
chr8 (105-146)||(11442911-11442952)
chr8 (172-204)||(18645713-18645745)
[»] chr2 (77 HSPs)
chr2 (48-236)||(37106156-37106344)
chr2 (46-236)||(5542625-5542815)
chr2 (20-212)||(41283449-41283641)
chr2 (46-213)||(36178605-36178772)
chr2 (97-296)||(36178320-36178519)
chr2 (46-212)||(14745667-14745833)
chr2 (46-208)||(37105920-37106082)
chr2 (50-214)||(5543002-5543166)
chr2 (52-232)||(15880233-15880415)
chr2 (20-202)||(6421387-6421568)
chr2 (49-204)||(962598-962753)
chr2 (47-312)||(29676794-29677065)
chr2 (49-236)||(40679632-40679818)
chr2 (20-204)||(42514649-42514832)
chr2 (53-311)||(14745300-14745558)
chr2 (46-237)||(6422084-6422268)
chr2 (36-236)||(7598577-7598769)
chr2 (46-197)||(15511495-15511646)
chr2 (46-204)||(35580724-35580881)
chr2 (48-237)||(28531316-28531504)
chr2 (46-186)||(36178171-36178311)
chr2 (21-202)||(6712978-6713160)
chr2 (20-204)||(38796591-38796778)
chr2 (53-202)||(36005887-36006035)
chr2 (22-199)||(33731653-33731831)
chr2 (46-237)||(40733482-40733675)
chr2 (22-204)||(37632575-37632755)
chr2 (46-237)||(40733848-40734040)
chr2 (20-212)||(1769884-1770075)
chr2 (65-200)||(28254258-28254391)
chr2 (36-193)||(40163362-40163520)
chr2 (22-191)||(23346250-23346417)
chr2 (45-204)||(7598228-7598387)
chr2 (17-237)||(3673050-3673254)
chr2 (60-202)||(5367457-5367599)
chr2 (96-224)||(31468800-31468926)
chr2 (126-236)||(38796298-38796410)
chr2 (23-142)||(6421793-6421911)
chr2 (97-204)||(16542449-16542556)
chr2 (46-196)||(29676543-29676687)
chr2 (20-234)||(30313147-30313360)
chr2 (56-204)||(12529038-12529186)
chr2 (22-204)||(16590888-16591065)
chr2 (87-237)||(30323430-30323581)
chr2 (116-201)||(31899496-31899581)
chr2 (147-237)||(36785664-36785756)
chr2 (86-237)||(33561491-33561641)
chr2 (34-237)||(29873525-29873729)
chr2 (23-132)||(3672773-3672882)
chr2 (46-202)||(29874023-29874179)
chr2 (92-196)||(37895107-37895211)
chr2 (88-201)||(31259658-31259774)
chr2 (86-236)||(37894732-37894881)
chr2 (50-142)||(6421688-6421780)
chr2 (59-151)||(36784273-36784365)
chr2 (96-223)||(33953821-33953947)
chr2 (97-237)||(41678419-41678559)
chr2 (46-201)||(9231252-9231407)
chr2 (73-203)||(31385738-31385868)
chr2 (99-188)||(28254165-28254254)
chr2 (142-236)||(42514981-42515078)
chr2 (48-201)||(3594180-3594333)
chr2 (33-114)||(31899090-31899170)
chr2 (50-140)||(35580443-35580534)
chr2 (97-201)||(12910231-12910335)
chr2 (156-202)||(6421306-6421352)
chr2 (63-204)||(33954279-33954419)
chr2 (86-162)||(30312831-30312907)
chr2 (91-150)||(25390313-25390372)
chr2 (86-137)||(28226404-28226455)
chr2 (105-162)||(2336666-2336723)
chr2 (86-134)||(8904498-8904546)
chr2 (86-133)||(28226726-28226772)
chr2 (22-100)||(2109988-2110066)
chr2 (182-237)||(40734243-40734300)
chr2 (88-137)||(13792536-13792585)
chr2 (168-204)||(3672719-3672755)
[»] chr1 (79 HSPs)
chr1 (46-236)||(44290458-44290648)
chr1 (20-214)||(44290798-44290993)
chr1 (35-266)||(41157311-41157545)
chr1 (24-312)||(48588465-48588754)
chr1 (46-311)||(26661522-26661789)
chr1 (55-242)||(37556071-37556260)
chr1 (46-212)||(41759475-41759641)
chr1 (35-212)||(3537589-3537765)
chr1 (46-204)||(41142372-41142531)
chr1 (45-236)||(34364891-34365084)
chr1 (35-235)||(22077484-22077683)
chr1 (22-204)||(41156991-41157175)
chr1 (50-212)||(3550712-3550871)
chr1 (46-231)||(11977251-11977438)
chr1 (20-204)||(31767136-31767319)
chr1 (125-308)||(3537226-3537410)
chr1 (49-202)||(17294579-17294733)
chr1 (19-213)||(45493948-45494146)
chr1 (20-204)||(34364507-34364690)
chr1 (46-204)||(29798199-29798357)
chr1 (46-202)||(34649440-34649596)
chr1 (20-212)||(50051999-50052189)
chr1 (46-204)||(5319965-5320123)
chr1 (20-200)||(9955911-9956092)
chr1 (46-196)||(14318875-14319025)
chr1 (54-203)||(40082408-40082556)
chr1 (22-212)||(32168674-32168853)
chr1 (78-210)||(32594748-32594880)
chr1 (22-204)||(45084382-45084557)
chr1 (48-204)||(3875333-3875489)
chr1 (33-204)||(37850588-37850758)
chr1 (61-207)||(38804370-38804516)
chr1 (69-202)||(26661921-26662054)
chr1 (55-201)||(37555733-37555878)
chr1 (20-204)||(66447-66630)
chr1 (53-204)||(24600321-24600472)
chr1 (46-204)||(39066201-39066358)
chr1 (37-236)||(22077101-22077311)
chr1 (57-236)||(66100-66278)
chr1 (22-198)||(5575110-5575284)
chr1 (56-237)||(30630648-30630828)
chr1 (20-204)||(41184381-41184583)
chr1 (22-204)||(24131965-24132143)
chr1 (84-213)||(44043810-44043944)
chr1 (52-203)||(22793279-22793431)
chr1 (20-194)||(5528728-5528902)
chr1 (35-204)||(22077818-22077986)
chr1 (24-204)||(19283434-19283613)
chr1 (56-202)||(45839629-45839779)
chr1 (21-204)||(21378035-21378199)
chr1 (46-133)||(11977015-11977102)
chr1 (56-204)||(44685456-44685605)
chr1 (33-204)||(1188574-1188746)
chr1 (172-235)||(50051777-50051840)
chr1 (46-134)||(50051689-50051776)
chr1 (33-204)||(1187349-1187522)
chr1 (22-133)||(47380143-47380254)
chr1 (47-189)||(44091909-44092051)
chr1 (145-222)||(50469180-50469256)
chr1 (86-162)||(10351202-10351278)
chr1 (57-177)||(4956218-4956340)
chr1 (152-253)||(47379891-47379990)
chr1 (157-204)||(35154150-35154197)
chr1 (138-204)||(4878803-4878869)
chr1 (55-237)||(24448245-24448426)
chr1 (110-155)||(41184152-41184197)
chr1 (46-105)||(4266798-4266855)
chr1 (44-204)||(5996870-5997029)
chr1 (89-149)||(35154046-35154106)
chr1 (139-212)||(4266875-4266948)
chr1 (47-163)||(9499020-9499136)
chr1 (86-122)||(12466365-12466401)
chr1 (136-195)||(30630912-30630972)
chr1 (85-131)||(9956212-9956258)
chr1 (34-111)||(30697310-30697387)
chr1 (22-64)||(45084576-45084617)
chr1 (86-122)||(31973375-31973411)
chr1 (219-274)||(41184198-41184254)
chr1 (68-204)||(50556451-50556587)
[»] chr5 (81 HSPs)
chr5 (20-212)||(6500443-6500634)
chr5 (24-236)||(6500791-6501002)
chr5 (33-253)||(3295002-3295225)
chr5 (22-204)||(40296292-40296473)
chr5 (22-212)||(27502013-27502202)
chr5 (21-229)||(624171-624379)
chr5 (50-212)||(18603124-18603286)
chr5 (46-212)||(32487386-32487551)
chr5 (46-211)||(41170627-41170792)
chr5 (47-207)||(36492218-36492378)
chr5 (20-201)||(25327938-25328119)
chr5 (22-231)||(26074122-26074330)
chr5 (19-237)||(26074577-26074797)
chr5 (35-236)||(13415750-13415951)
chr5 (46-204)||(15370099-15370257)
chr5 (46-201)||(3295345-3295498)
chr5 (22-202)||(42405574-42405752)
chr5 (24-204)||(41632782-41632961)
chr5 (46-213)||(9498655-9498821)
chr5 (21-202)||(1028492-1028673)
chr5 (34-202)||(6224198-6224366)
chr5 (46-197)||(11416977-11417128)
chr5 (22-204)||(36568545-36568725)
chr5 (46-203)||(299490-299647)
chr5 (50-194)||(34753029-34753173)
chr5 (46-204)||(12662652-12662810)
chr5 (53-202)||(26075168-26075318)
chr5 (34-237)||(24489194-24489394)
chr5 (45-204)||(35150007-35150165)
chr5 (72-237)||(26074807-26074975)
chr5 (46-212)||(623810-623976)
chr5 (33-178)||(15370428-15370573)
chr5 (50-192)||(33747783-33747925)
chr5 (69-207)||(29549278-29549416)
chr5 (66-212)||(5723811-5723957)
chr5 (54-236)||(38427525-38427697)
chr5 (54-204)||(26590918-26591068)
chr5 (48-202)||(300961-301107)
chr5 (72-237)||(36521922-36522086)
chr5 (46-202)||(35167838-35167994)
chr5 (35-201)||(2411010-2411176)
chr5 (86-270)||(36522277-36522463)
chr5 (46-201)||(35914852-35915007)
chr5 (129-212)||(7768842-7768925)
chr5 (86-237)||(31509589-31509742)
chr5 (36-118)||(26900007-26900089)
chr5 (109-202)||(42508614-42508707)
chr5 (124-202)||(26074320-26074398)
chr5 (67-201)||(41635212-41635346)
chr5 (47-202)||(13786002-13786157)
chr5 (79-190)||(31509745-31509857)
chr5 (86-137)||(13042606-13042657)
chr5 (46-117)||(38427306-38427377)
chr5 (123-202)||(39309686-39309764)
chr5 (45-146)||(13785631-13785732)
chr5 (68-120)||(795254-795306)
chr5 (66-133)||(9498343-9498410)
chr5 (68-147)||(36527117-36527196)
chr5 (109-202)||(42524719-42524811)
chr5 (86-146)||(32445943-32446003)
chr5 (90-137)||(13112604-13112651)
chr5 (169-232)||(13785732-13785794)
chr5 (144-201)||(6225047-6225104)
chr5 (164-212)||(5660290-5660338)
chr5 (79-167)||(19275566-19275653)
chr5 (86-124)||(13042784-13042822)
chr5 (86-124)||(13112782-13112820)
chr5 (162-204)||(35150747-35150789)
chr5 (162-204)||(35151038-35151080)
chr5 (48-146)||(42435486-42435583)
chr5 (50-102)||(24489583-24489635)
chr5 (192-236)||(15370380-15370426)
chr5 (86-137)||(36389016-36389067)
chr5 (92-122)||(5963765-5963795)
chr5 (72-150)||(9510546-9510624)
chr5 (155-212)||(22298956-22299014)
chr5 (70-106)||(795152-795189)
chr5 (50-114)||(5660340-5660405)
chr5 (92-133)||(34103625-34103666)
chr5 (46-99)||(35150810-35150863)
chr5 (92-136)||(41341523-41341567)
[»] chr4 (107 HSPs)
chr4 (23-237)||(36629205-36629418)
chr4 (24-214)||(50630731-50630921)
chr4 (20-204)||(25483336-25483519)
chr4 (46-212)||(41370349-41370515)
chr4 (37-212)||(55933113-55933288)
chr4 (33-274)||(44620587-44620830)
chr4 (20-204)||(10245920-10246103)
chr4 (47-266)||(39404334-39404555)
chr4 (49-204)||(54017596-54017751)
chr4 (21-235)||(22027935-22028150)
chr4 (56-232)||(54108888-54109060)
chr4 (20-204)||(3340807-3340990)
chr4 (47-204)||(1731646-1731803)
chr4 (33-202)||(39792845-39793014)
chr4 (46-207)||(50002423-50002584)
chr4 (34-204)||(36608647-36608817)
chr4 (20-202)||(39404020-39404202)
chr4 (56-204)||(52884695-52884844)
chr4 (56-234)||(52884856-52885038)
chr4 (46-232)||(18932747-18932943)
chr4 (20-204)||(22028340-22028527)
chr4 (47-202)||(34646648-34646803)
chr4 (66-212)||(49880152-49880297)
chr4 (47-201)||(50459724-50459878)
chr4 (46-194)||(54343006-54343147)
chr4 (46-195)||(44620362-44620511)
chr4 (46-202)||(36572021-36572177)
chr4 (37-204)||(22183253-22183420)
chr4 (19-185)||(54936215-54936379)
chr4 (63-204)||(4955332-4955473)
chr4 (51-236)||(20826186-20826370)
chr4 (46-195)||(44621011-44621160)
chr4 (20-204)||(49076805-49076986)
chr4 (20-198)||(20825842-20826020)
chr4 (45-236)||(3244448-3244638)
chr4 (36-203)||(16888804-16888971)
chr4 (53-204)||(32941128-32941279)
chr4 (46-241)||(49076449-49076643)
chr4 (45-201)||(49302907-49303065)
chr4 (95-237)||(2741039-2741180)
chr4 (46-205)||(54108537-54108694)
chr4 (33-204)||(2740700-2740869)
chr4 (46-247)||(3341083-3341286)
chr4 (47-203)||(16889535-16889691)
chr4 (75-189)||(45496820-45496934)
chr4 (49-204)||(4390102-4390257)
chr4 (33-228)||(43174480-43174677)
chr4 (47-236)||(45489331-45489522)
chr4 (46-150)||(23817679-23817783)
chr4 (20-204)||(54741152-54741334)
chr4 (86-202)||(41707503-41707618)
chr4 (81-212)||(6975489-6975620)
chr4 (49-204)||(34004586-34004739)
chr4 (58-202)||(19504707-19504842)
chr4 (115-311)||(10246253-10246436)
chr4 (49-204)||(51768061-51768216)
chr4 (49-204)||(3700365-3700512)
chr4 (48-158)||(18879852-18879962)
chr4 (46-164)||(43827480-43827597)
chr4 (52-153)||(31691203-31691306)
chr4 (138-274)||(44621353-44621492)
chr4 (96-191)||(54017750-54017845)
chr4 (67-202)||(40067045-40067181)
chr4 (46-204)||(28034229-28034387)
chr4 (46-183)||(48111696-48111833)
chr4 (46-182)||(3271806-3271947)
chr4 (35-199)||(760194-760356)
chr4 (63-162)||(15841383-15841482)
chr4 (152-212)||(50788087-50788147)
chr4 (138-196)||(44620304-44620362)
chr4 (72-204)||(23556890-23557022)
chr4 (46-198)||(45489712-45489864)
chr4 (46-112)||(43174233-43174299)
chr4 (86-137)||(11197293-11197344)
chr4 (86-201)||(34544107-34544225)
chr4 (48-179)||(39698944-39699077)
chr4 (138-220)||(44620926-44621011)
chr4 (20-141)||(11783526-11783646)
chr4 (19-91)||(23817428-23817498)
chr4 (167-233)||(41370673-41370738)
chr4 (50-124)||(41370738-41370812)
chr4 (116-204)||(11348396-11348484)
chr4 (86-198)||(15841023-15841134)
chr4 (208-274)||(16889315-16889383)
chr4 (86-137)||(10396198-10396249)
chr4 (86-137)||(10396483-10396534)
chr4 (85-137)||(922485-922537)
chr4 (97-136)||(1868119-1868158)
chr4 (55-94)||(19895406-19895445)
chr4 (88-146)||(11706584-11706641)
chr4 (92-138)||(51681604-51681650)
chr4 (33-90)||(11702284-11702341)
chr4 (90-150)||(2891864-2891924)
chr4 (156-204)||(45050601-45050649)
chr4 (20-76)||(45496678-45496734)
chr4 (50-126)||(50787996-50788072)
chr4 (260-311)||(10246187-10246237)
chr4 (86-137)||(11197003-11197054)
chr4 (181-212)||(18933103-18933134)
chr4 (106-149)||(45484774-45484817)
chr4 (86-160)||(31249896-31249970)
chr4 (86-128)||(41707279-41707321)
chr4 (163-204)||(11706636-11706677)
chr4 (56-93)||(19895533-19895570)
chr4 (108-141)||(29802604-29802637)
chr4 (36-76)||(1731581-1731621)
chr4 (86-122)||(34946151-34946187)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (21-236)||(1082-1298)
scaffold0391 (20-157)||(1658-1802)
scaffold0391 (153-237)||(3092-3178)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (46-202)||(514-670)
scaffold0702 (46-235)||(147-330)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (84-312)||(5247-5477)
scaffold0078 (20-204)||(4982-5166)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (55-237)||(5742-5931)
scaffold0734 (55-204)||(5396-5546)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (88-236)||(17496-17648)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (46-204)||(47360-47518)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (127-202)||(10192-10267)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (72-202)||(39459-39588)
scaffold0113 (79-237)||(39805-39963)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (126-210)||(2869-2953)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (126-166)||(10406-10446)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 55)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 46 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3409818 - 3409542
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409818 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaaataaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 3409719  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacg 245  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409718 tataagatgttcaacttttactattttatctgatgtggtacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacg 3409619  T
Q  246 tgctcccc-tagagcggaagctttttacttttgcatgtatcgccattgctgcacaaggagccacttgcctacttgtacc 323  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3409618 tgctccccttagagccgaagcttttgac-tttgcctgtattgccatccctgcacaaggagccacttg-ctacttgtacc 3409542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 46 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29519078 - 29518871
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29519078 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 29518979  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||    
T  29518978 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcaattcatcg 29518879  T
Q  246 tgctcccc 253  Q
    ||||||||    
T  29518878 tgctcccc 29518871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 46 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2378284 - 2378096
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2378284 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 2378185  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  2378184 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccc-caaatgtgagtccat 2378096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29518661 - 29518495
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29518661 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 29518562  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518561 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 29518495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32741337 - 32741171
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32741337 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 32741238  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741237 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 32741171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35210386 - 35210196
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210386 actgttgggtcactg-ggggagcc-aggggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaaaagaaacaccacactcttacccaaaaccttaag 35210289  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210288 gcaatggttttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 35210196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 46 - 236
Target Start/End: Original strand, 2578443 - 2578634
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2578443 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttact 2578542  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2578543 tataaagtgttcaacctttactcttttatccg-tgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatc 2578634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3409407 - 3409251
Alignment:
Q  56 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 155  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409407 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 3409308  T
Q  156 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409307 tcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3409251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 237
Target Start/End: Original strand, 10074352 - 10074553
Alignment:
Q  35 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 134  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10074352 aggggagcctgggggactatccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 10074451  T
Q  135 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtcca 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  10074452 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacctctaactcacacttgcaca-caacactcccccttaagtgtgagtcca 10074550  T
Q  235 tca 237  Q
    |||    
T  10074551 tca 10074553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 44 - 312
Target Start/End: Original strand, 10073989 - 10074255
Alignment:
Q  44 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 143  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10073989 taggggaccgtccacgtcgaggctagaacaaccaaataagcgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 10074088  T
Q  144 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaa 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||| || |     
T  10074089 cttataaggtgttcaacgtttacttttctatccgatgtgggatatataactcacccttgcaca-caacactccccctcaagtgcgagtctatcaattcat 10074187  T
Q  244 cgtgctcccc--tagagcggaagctttttacttttgcatgtatcgccattgctgcacaaggagccacttgc 312  Q
    | ||||||||  |  ||||||||| | ||||  |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  10074188 catgctcccccttcaagcggaagc-tcttac--ttgcttgtatcgccgttgttgcacaatgagccacttgc 10074255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3058409 - 3058218
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctagggg-accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 120  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||| || ||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3058409 tgttggttcggtgaggggagctttgggggacggtccacatcgaggttagaaccaccctacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 3058310  T
Q  121 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3058309 caatgggtttatggatcctcatacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacacttgcaaaccaaca 3058218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16455078 - 16454872
Alignment:
Q  33 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 132  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16455078 tgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttat 16454979  T
Q  133 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgag 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  || | |||||||||||||||| |||||     
T  16454978 gggtcctattacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacacataactcacatttgtacacaacaacactccccctcaactgtgac 16454879  T
Q  231 tccatca 237  Q
    |||||||    
T  16454878 tccatca 16454872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3415629 - 3415449
Alignment:
Q  35 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctaga--acaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 132  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3415629 aggggagcttgggggaccttccacatcgaggctagagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttat 3415530  T
Q  133 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3415529 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatgtgatgtgggacatataactcacactcgcaaaccaacac 3415449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Original strand, 14748342 - 14748504
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  14748342 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga----ccacactcttacccaaaaccttaacgcaatgagtttatgggtcctcttatt 14748437  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14748438 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaatcaaca 14748504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2377912 - 2377756
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377912 ggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 2377813  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377812 tataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttg 2377756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 2579848 - 2580030
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||| | |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2579848 actgttgggtaa-tgaggggagctt-ggggaccttccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacattcttacccaaaaccttaag 2579945  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2579946 gctgtgggtttatgggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 2580030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1846906 - 1846741
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1846906 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtgctcttact 1846807  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||    
T  1846806 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatagaattcacacttgcaacccaac 1846741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 233
Target Start/End: Original strand, 2579478 - 2579678
Alignment:
Q  32 gtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttta 131  Q
    |||||||||||||  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2579478 gtgaggggagcctgtggaaccatccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccatacttttacccaaaaccttaaggcaatgagttta 2579577  T
Q  132 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagt 231  Q
    |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  2579578 tgggccctcttacttataaggtatccgacctttacttttttgtccgatgtgggacatataactcacacctgctaa-caacactctccctcaagtgtgagt 2579676  T
Q  232 cc 233  Q
    ||    
T  2579677 cc 2579678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 33 - 229
Target Start/End: Original strand, 2578822 - 2579016
Alignment:
Q  33 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 132  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2578822 tgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggtcagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgagtttat 2578921  T
Q  133 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtga 229  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  2578922 ggatcctcttatttataaggtattcaacatttact-ttttatccgatgagggacatataaatcacacttgctca-caacactccccctcaagtgtga 2579016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26544197 - 26544041
Alignment:
Q  56 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 155  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26544197 cacattgaggctagaacaatcgcacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaaccttaaggcggtgggtttatgggtcctcttacttataacgtgt 26544098  T
Q  156 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26544097 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 26544041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1127530 - 1127352
Alignment:
Q  34 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 133  Q
    ||||||||| | |||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1127530 gaggggagctttggggaccacccacatcgaggttagagcaaccacataagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatg 1127431  T
Q  134 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  1127430 agtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttacccgatgtgggatatataactcacagttgcaaaccaaca 1127352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16454758 - 16454577
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    ||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  16454758 actgttgggtcac-gaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttatccaaaatcttaag 16454660  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16454659 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttattcttttatctgatgtgggacacataactcacacttg 16454577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16107827 - 16107680
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 154  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16107827 ccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtg 16107728  T
Q  155 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16107727 tttaacctttacttttttatccgatgtgacacatataactcacacttg 16107680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Original strand, 2579085 - 2579297
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  2579085 actgttgggtca-tgaggggagc-tcggggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacgagcaagagagacaccacactcttagccaaagccttaaa 2579182  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccc 217  Q
    |  |||||||||||| ||||    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || | ||||||||||    
T  2579183 gttatgggtttatggttcct----cttataaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgggacatataactaacacttgtacacaacaacactccc 2579278  T
Q  218 cctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2579279 cctcaagtgtgagtccatc 2579297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 46 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2843713 - 2843560
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-gggtcctcttac 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2843713 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggggtcctcttac 2843614  T
Q  145 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 198  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2843613 ttataaggtgttcaacttttattattttatccgatgtgaaacatataactcaca 2843560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Original strand, 10073604 - 10073804
Alignment:
Q  34 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 133  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  10073604 gaggggagcctgaaggaccgtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagccaatgagtttatg 10073703  T
Q  134 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtcc 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||| || ||||||||||||    
T  10073704 gatcctcttacttataaggtgttcaacctttac--ttttctccgatgtgggacatataactaacacttgcaca-caacaccccctcttaagtgtgagtcc 10073800  T
Q  234 atca 237  Q
    ||||    
T  10073801 atca 10073804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 5832007 - 5832182
Alignment:
Q  24 ttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 123  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||       
T  5832007 ttgggtca-tgaggggagcct-ggggaccgtctacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacacttttacccaaaatcttaagggg- 5832103  T
Q  124 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5832104 tggctttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataacttacacttg 5832182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16108208 - 16108011
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 146  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16108208 gggaccgtccacatcgaggttataacaaccccacaagcaagagagacaccacac------------ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 16108121  T
Q  147 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaac 244  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  16108120 ataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatcaattcatc 16108021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 201
Target Start/End: Original strand, 6999799 - 6999951
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 148  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||    
T  6999799 gaccgtccacatcgagactagaacaaccacattagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcagtgagtttatggatcctcttacatat 6999898  T
Q  149 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6999899 aaggtgttcaacttttacttttttatccgatgtaggacatataactcacactt 6999951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 204
Target Start/End: Original strand, 593694 - 593867
Alignment:
Q  33 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagaca--ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt 130  Q
    ||||||||||   |||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  593694 tgaggggagctcgggggaccgtcaacatcgagcctagaacaaccgtacaagtaagagagagataccacactattacccaaaaccttaaggcagtcggttt 593793  T
Q  131 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  593794 atgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatacaactcacacttgca 593867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 201
Target Start/End: Original strand, 1950200 - 1950340
Alignment:
Q  61 cgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 160  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1950200 cgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcattagatttatggctcctcttacttgtaaggtgttcaac 1950299  T
Q  161 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1950300 ctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 1950340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 199
Target Start/End: Original strand, 32460630 - 32460733
Alignment:
Q  96 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32460630 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatacgatgtgggacatataactc 32460729  T
Q  196 acac 199  Q
    ||||    
T  32460730 acac 32460733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10911720 - 10911565
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10911720 accgtccacatcgaggcttgaacaacaacattagtaagagagacatcacactcttattcaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttata 10911621  T
Q  150 aggtgttcaacctttac-tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10911620 aggtgttcaacctttactttttttatctgatgtaggacatataactcacacttgca 10911565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 198
Target Start/End: Original strand, 9062383 - 9062501
Alignment:
Q  79 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 178  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9062383 acaagtaagagagataccacacttttacccaaaac-ttaagacaatgagtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccga 9062481  T
Q  179 tgtgggacatataactcaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9062482 tgtgggacatataactcaca 9062501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 12071666 - 12071849
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12071666 actgttaggtca-tgaggggagcttaggggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaag 12071764  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |  || |||||||| ||||| |   |||||| |||||||| ||  | | || |||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  12071765 gtcataggtttatgagtcctttctattataaagtgttcaaactccatttttctatctgatgcgagacatataactcacacttgca 12071849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8482045 - 8481893
Alignment:
Q  85 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||    
T  8482045 aagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcatctcatttataaagtgttcaacctccacttttatatctgatgt-gg 8481947  T
Q  185 acatataactcacacttgcaaaccaaca--ctccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8481946 acatataactcacacttgcaca-caacaatctccccctcaagtgtgagtccatca 8481893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 204
Target Start/End: Original strand, 12085021 - 12085191
Alignment:
Q  33 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 132  Q
    |||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12085021 tgaggggagcttaggagaccgttcgcatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggccatggttttat 12085120  T
Q  133 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    | ||||| |   |||||| |||||||| ||  ||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12085121 gagtcctttctattataaagtgttcaaactccact-ttctatctgatgcaggacatataactcacacttgca 12085191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 204
Target Start/End: Original strand, 12092470 - 12092640
Alignment:
Q  34 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 133  Q
    |||||| ||| ||||||||  ||||||| |||| ||| ||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  12092470 gaggggggccaaggggaccacccacatccaggccagagcaacctcacaagtgagagagacaccacagtcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 12092569  T
Q  134 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    | |||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  12092570 gatcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgggacatctaacacacccttgca 12092640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 5958613 - 5958766
Alignment:
Q  52 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 151  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||    ||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||| || |||||| |||||||    
T  5958613 cgtccacatcgaggttagaacaatcacacaag----agagacatcacactctatcccaaaactttaagacaatgagtttatgagttctcttatttataag 5958708  T
Q  152 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaacca 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5958709 gtgttcaacctttactgttttatccgatgtaacacatataactcacaattgcacacca 5958766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6071264 - 6071098
Alignment:
Q  72 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 171  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  6071264 caaccatacaagcgagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcatctcacttataaagtgttcaacctccacttttc 6071165  T
Q  172 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca--ctccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  || |||||||| |||||||||||||    
T  6071164 tattcaatgtgggacatataactcacacttgcaca-caacaatcttcccctcaaatgtgagtccatca 6071098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31714849 - 31714671
Alignment:
Q  23 gttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 122  Q
    ||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | | || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31714849 gttgggtcattgaggggagtctgggagaccgtccacatcgaggctagagcaaccacacaagcga-aaaaacgccacactcttactcaaaaccttaaggca 31714751  T
Q  123 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||| ||| ||||||||||| | |||||    |||||||||  ||| || |||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  31714750 atgagttaatgggtcctctca-ttatataacgttcaacctccacttttctatccgatgtaggacatat-agtcacacttgca 31714671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35210551 - 35210456
Alignment:
Q  131 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgag 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210551 atgggtcctcttacttacaaggtattcaacctttactattttatccgatgtggg-----------gcacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgag 35210463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 200
Target Start/End: Original strand, 17135058 - 17135223
Alignment:
Q  35 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 134  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| | |||| |  |||||||||| ||||||| ||    ||||| |||||||     
T  17135058 aggggagtctgggggaccgtccacatcaaggccggaacaaccgcacaagcgaaagagccgtcacactcttatccaaaactttctaacaatgagtttatga 17135157  T
Q  135 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacact 200  Q
     ||||||| |||||||||| || ||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17135158 atcctcttgcttataaggtattaaacatttacttctctatccgatgtgagacatataactcacact 17135223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2975668 - 2975521
Alignment:
Q  88 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggaca 187  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| || |||  |||||||||||    
T  2975668 agagacatcacactcttattcaaaactttaagacaaaggatttatgggtcatcttgcttataaggtgttcaacatttacttttctatttgatgtgggaca 2975569  T
Q  188 t-ataactcacacttgcaaac-caacactccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    | || ||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2975568 taattacttacactt--aaacacaacactccccc-caagtgtgagtgcatc 2975521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Original strand, 30618593 - 30618766
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||  ||||||  |||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  30618593 actgttgggtcac-gaggggagccttggggaccacccacatt-aggcaagagcaaccacataagtaagagagacaccacatttttacccataaccttaag 30618690  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 197  Q
     |||  ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||  ||| ||| | ||||||| |||| | ||||||||    
T  30618691 acaa-cggtttat-ggtcatcttacttataaagtgttcatcctccactttttcaaccgatgtaggacttctaactcac 30618766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33606034 - 33605943
Alignment:
Q  145 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    |||||| |||||||||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  33606034 ttataaagtgttcaacctccacttttctattcgatgtgggacatataacttacatttgcaca-catcactccccctcaagtgtgagtccatca 33605943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 136
Target Start/End: Original strand, 22605301 - 22605345
Alignment:
Q  92 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22605301 acaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 22605345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 3409452 - 3409405
Alignment:
Q  53 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  3409452 gtccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccacac 3409405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 136
Target Start/End: Original strand, 11637760 - 11637811
Alignment:
Q  85 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 136  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11637760 aagagagacaccacactcttatccaaaatcttaagacaatgggtttatgggt 11637811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 167
Target Start/End: Original strand, 14789279 - 14789325
Alignment:
Q  121 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 167  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14789279 caattggtttatgggtcctcttacttgtaaggtgttcaacctttact 14789325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 136
Target Start/End: Original strand, 21130103 - 21130147
Alignment:
Q  92 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21130103 acaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggt 21130147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 112
Target Start/End: Original strand, 10902438 - 10902496
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa 112  Q
    |||||||| |||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10902438 tccacatctaggtcagaacaaccatacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 10902496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 2975354 - 2975296
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccaca 79  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2975354 actgttaggtcactgaggggagtc-agaggactgtccacatcgaggctagaacaaccaca 2975296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 128
Target Start/End: Original strand, 11638053 - 11638095
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggt 128  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11638053 agagagacaccatactcttacccaaaatcctaaggcaatgggt 11638095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 35210602 - 35210554
Alignment:
Q  21 ctgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctaga 70  Q
    ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  35210602 ctgttgggtcactg-ggggagccagggggaccgtccacatcgaggctaga 35210554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 72)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 46 - 296
Target Start/End: Original strand, 37533011 - 37533259
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37533011 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaagcgcacaagcaagagagacaccacact-ttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact 37533109  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37533110 tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagcgtgagtccatcactttaacg 37533209  T
Q  246 tgctcccctagagcggaagctttttacttttgcatgtatcgccattgctgc 296  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  37533210 tgttcccctagagcggaagctttttac-tttgtctgtatcgccgttgctgc 37533259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 1085591 - 1085774
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1085591 actgttgggtca-tgaggggagccagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaag 1085689  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085690 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 1085774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7517762 - 7517580
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517762 tgttgggttactgaggggagccaaggggaccacccacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagacagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 7517663  T
Q  122 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517662 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 7517580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 312
Target Start/End: Original strand, 22566702 - 22566929
Alignment:
Q  85 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 184  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22566702 aagagagac-ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggg 22566800  T
Q  185 acatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgct-cccctagagcggaagctttttacttttgcatg 281  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||    
T  22566801 acatattactcacacttgcatacaacaacactccccctcaaatgttagtctatcactttatcgtgctccccccagagcggaagctttttac--ttgcttg 22566898  T
Q  282 tatcgccattgctgcacaaggagccacttgc 312  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  22566899 tattgtcgttgctgcacaaggagccacttgc 22566929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29157750 - 29157559
Alignment:
Q  19 tactgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| || ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29157750 tactgttgggtcagtgaggagagtctgggagaccgtccacatcaagactagagcaactacacgagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 29157651  T
Q  119 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 210  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29157650 ggcaatggatttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccggtgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 29157559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7554154 - 7553974
Alignment:
Q  75 ccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554154 ccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 7554055  T
Q  175 ccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctcccc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7554054 ccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatcaattcatcgtgctcccc 7553974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30244428 - 30244236
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30244428 ggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttact 30244329  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30244328 tataaggtcttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacactccccctcaagtgtgagttcatc 30244236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 49 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14681663 - 14681478
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 148  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  14681663 gaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacttg--tgagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggccctcttacttac 14681566  T
Q  149 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14681565 aaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataacttacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 14681478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Original strand, 37533339 - 37533530
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    ||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533339 actgttgggtcac-gaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 37533437  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37533438 gcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtagaacatataactcacacttacaaatcaaca 37533530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Original strand, 23377 - 23535
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23377 ggggaccgtccaaatcgaggctagaacaaccgcacatgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttact 23476  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23477 tataaggtgttcaacctttactattgtatccgatgtggaacatataactcacaattgca 23535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30245255 - 30245043
Alignment:
Q  21 ctgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 120  Q
    |||||||||||  |||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30245255 ctgttgggtcac-gaggggagctcgggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 30245161  T
Q  121 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactcccc 218  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||||||||||    
T  30245160 caatgagtttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaacactcccc 30245061  T
Q  219 ctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    |||||||| |||||||||    
T  30245060 ctcaagtgcgagtccatc 30245043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11845373 - 11845198
Alignment:
Q  21 ctgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 120  Q
    ||||||||||| || |||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11845373 ctgttgggtcactg-ggggagcacgggggaccgtctacatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaagg 11845275  T
Q  121 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 197  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11845274 caatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11845198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6054718 - 6054562
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6054718 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccatacaagtaggagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttact 6054619  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6054618 tataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactaacacttg 6054562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 45433411 - 45433243
Alignment:
Q  34 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 133  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  45433411 gaggggagccagggggaccgaccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatg 45433312  T
Q  134 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45433311 agttctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggatcatataactcacacttg 45433243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Original strand, 40094774 - 40094932
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  40094774 ggggaccgaccacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacgatgggtttatgggtcctcttact 40094873  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40094874 tataaggtgttgaacctttactcttttattcgatgtgagacatataactcacacttgca 40094932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 22567017 - 22567196
Alignment:
Q  24 ttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 123  Q
    |||||||  ||||||||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22567017 ttgggtcgttgaggggagctcgggggaccatccacatcgaggcccgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaa 22567116  T
Q  124 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22567117 tgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgt-ggacatattactcacacttgca 22567196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 204
Target Start/End: Original strand, 36939741 - 36939891
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36939741 tccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagaaacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggt 36939840  T
Q  154 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36939841 gttcaacttttactattttatacgatttgggacatataactcacacttgca 36939891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 57 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 45754862 - 45754718
Alignment:
Q  57 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  45754862 acatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgagtcatcttacttataaggtgtt 45754763  T
Q  157 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45754762 caacatttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttg 45754718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 56 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19122879 - 19122740
Alignment:
Q  56 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 155  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19122879 cacatcgagactagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgagtcctcttacttataaggtgt 19122780  T
Q  156 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19122779 tcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactca 19122740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 45434794 - 45434607
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  45434794 ggggaccgatcacatcgaggctagaacaactccacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcagtaagtttatgggtcctcttact 45434695  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtcc 233  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |  || ||||| |||||||||||||    
T  45434694 tataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggacatataacttacacttgtacacaacaacacccccccaagtgtgagtcc 45434607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24177593 - 24177435
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24177593 ggggaccgtccacgtcgaggctaagacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttaccaaaaactttaaggcaatgggtttatgggtccgcttact 24177494  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24177493 tataaggtgttcagcctttactcttttatccgatgtgggacatataactcatacttgca 24177435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 198
Target Start/End: Original strand, 34218036 - 34218186
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  34218036 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 34218135  T
Q  148 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 198  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34218136 taaggtgttcaacatttacttttttatccgatgtgagacatataactcaca 34218186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 47129277 - 47129097
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  47129277 actgttggatca-tgaggggagc-tcggggaccgtctacattgaggctagaacaaccacacttgtgagagagacaccacactcctacccaaaaccttaaa 47129180  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47129179 gcgatgggtttatgggtcctcttacttataagaggttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 47129097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 204
Target Start/End: Original strand, 118277 - 118459
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga--gacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  118277 tgttgggtcactg-ggggagcct-ggggaccgtccacatcaaagctagaacaaccacacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttacg 118374  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  118375 gtaatgggtttatggatcctcttacttattaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataacttacacttgca 118459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 8128415 - 8128599
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||| |||||||||||    |||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8128415 actgttgggttagtgaggggagtgcgggggactgttcacatcgatgctagaacaaccacataagcgagagtgacaccacactcttaaccaaaaccttaag 8128514  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8128515 gttatgggtttatgggtcctcttacatataaggtgttcaacctttatttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 8128599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 36623140 - 36622960
Alignment:
Q  23 gttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 122  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  36623140 gttgggtca-tgaggggagctcaagggaccgtccacatcaaggtcagaacaatcacacaagtaagagaggcaccatactcctacccaaaaccttaaggca 36623042  T
Q  123 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36623041 atggatttatggatcctcctacttataaaatgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36622960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 30032725 - 30032572
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  30032725 ggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccgcacaagcaagagagatgtcacactcttacccaaaaccttaaggctataggtttatggatactcttact 30032626  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 199  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30032625 tataaggtgttcaacacttactcttttattcgatgtgggacatataactcacac 30032572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9901799 - 9901648
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 147  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||    
T  9901799 ggacagtccacaccgaggctagaacaaccgcactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatggatcctc-tacgta 9901701  T
Q  148 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9901700 taagatgttcaacctttactgttttatccgatgt-ggacatataactcacactt 9901648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16569316 - 16569196
Alignment:
Q  84 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 183  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||     
T  16569316 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16569217  T
Q  184 gacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16569216 gacatataactcacacttgca 16569196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Original strand, 16596346 - 16596466
Alignment:
Q  84 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 183  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||     
T  16596346 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16596445  T
Q  184 gacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16596446 gacatataactcacacttgca 16596466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 204
Target Start/End: Original strand, 40230295 - 40230449
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 149  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  40230295 accgtccacatagaggttagaataactacacttgcaagagagacaccagacttttacccaaaaccttaagactatgggtttatgggtcctcttacttata 40230394  T
Q  150 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    || |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40230395 agatgttcaacttttacttttttattcgatgtgggacatataacttacacttgca 40230449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 231
Target Start/End: Original strand, 1085280 - 1085436
Alignment:
Q  78 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 177  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  1085280 cacaaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttatgagttgttcaacttttactattttatccg 1085379  T
Q  178 atgtgggacat-ataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagt 231  Q
    || |||||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  1085380 atatgggacataaaaactcacacttgcacacaacaacactccccttcaagtgtgagt 1085436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 201
Target Start/End: Original strand, 24838724 - 24838857
Alignment:
Q  69 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcc-tcttacttataaggtgttcaacctttact 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24838724 gaacaaccacacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaacgggtttatggatccttcttacttataaggtgttcaacctttact 24838823  T
Q  168 attttatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24838824 cttttattcgatgtgagacatataacttacactt 24838857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20599471 - 20599317
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct--tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 146  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||| ||    
T  20599471 gaccgttcacatcaaggttaaaacaaccatacaagcaagagagacaccacactctcttacccaaaacgttaaggcaatgagtttatatgtcctcttattt 20599372  T
Q  147 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20599371 ataaagtgtttatcctttacttttttatccgatatgggacatataactcacactt 20599317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 204
Target Start/End: Original strand, 36534795 - 36534942
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 154  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36534795 ccacatcgaggctggaacaaccacacttgt--gagagacgccacactcttacccaaaaccttaagactttaggtttatgggtcctcttacttataaggtg 36534892  T
Q  155 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  36534893 ttcaacctctactgttttatccgaggtgggacatataagttacacttgca 36534942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41854792 - 41854635
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||| |||| ||    
T  41854792 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattatatttataggtcatcttgct 41854693  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  41854692 tataaggtgttcaacctttactctttta-ctgatgtgggacatataactcatacttgca 41854635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 37167937 - 37167808
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||      
T  37167937 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagtcaatggatttatggatcctcttact-- 37167840  T
Q  148 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 183  Q
         |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  37167839 ----ctgttcaacatttactattttatctgatgtgg 37167808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30253646 - 30253534
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30253646 ggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttact 30253551  T
Q  146 tataaggtgttcaacct 162  Q
    |||||||| ||||||||    
T  30253550 tataaggtcttcaacct 30253534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 158
Target Start/End: Original strand, 28300229 - 28300366
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||||||||| | ||||||| |  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  28300229 tgttgggtcaataaggggagtcaggaggaccgtccacatcgaggcccgaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggc 28300328  T
Q  122 aatgggtttat-gggtcctcttacttataaggtgttca 158  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28300329 aatgggtttatggggttctcttacttataaggtgttca 28300366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30244771 - 30244667
Alignment:
Q  134 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagt 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  30244771 ggtcctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacactccccctcaagtgtgagt 30244672  T
Q  232 ccatc 236  Q
    |||||    
T  30244671 ccatc 30244667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 131 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30255412 - 30255308
Alignment:
Q  131 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtg 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  30255412 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacgcacacttgcacacaacaacactccccctcaagtgtg 30255313  T
Q  229 agtcc 233  Q
    |||||    
T  30255312 agtcc 30255308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Original strand, 41910592 - 41910749
Alignment:
Q  52 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacc--------ttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||| |||| |        ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  41910592 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacttgtgagagaaacaccacactcttaccaaaaatccaaaaatcttaagccaatgggtttatgggtcctctca 41910691  T
Q  144 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41910692 gttataaggtattcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 41910749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 47129550 - 47129450
Alignment:
Q  21 ctgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 120  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47129550 ctgttgggtca-tgaggggagc-tcggggaccgtccacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 47129453  T
Q  121 caa 123  Q
    |||    
T  47129452 caa 47129450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 43241616 - 43241495
Alignment:
Q  83 gcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 182  Q
    |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  43241616 gcaagagagacatcatacttttacctaaaaccttaagtcaataagtttatgagtccttttacttataaggtgttcaacctttatttttttatccgatgtg 43241517  T
Q  183 ggacatataactcacacttgca 204  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  43241516 gaacatataactcacacttgca 43241495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 131 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30245567 - 30245463
Alignment:
Q  131 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtg 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||    
T  30245567 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacagtccccctcaagtgtg 30245468  T
Q  229 agtcc 233  Q
     ||||    
T  30245467 tgtcc 30245463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 116 - 204
Target Start/End: Original strand, 28301613 - 28301701
Alignment:
Q  116 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28301613 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgca 28301701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 121
Target Start/End: Original strand, 28300569 - 28300644
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctta-cccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28300569 gggatcgtccacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggc 28300644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 204
Target Start/End: Original strand, 36109007 - 36109075
Alignment:
Q  136 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  36109007 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagaaatataactcacacttgca 36109075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 116
Target Start/End: Original strand, 37532753 - 37532821
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532753 ggaccgtccacatcgaggctagaacaacagcacaagctagagagacaccacactcttacccaaaacctt 37532821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 207 - 275
Target Start/End: Original strand, 37532822 - 37532890
Alignment:
Q  207 ccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctcccctagagcggaagctttttacttt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  37532822 ccaacactccccctcaagtgtgagtccttcactttaacgtgttcccctatagcggaagctttttacttt 37532890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 30244533 - 30244453
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30244533 tgttgggtca-tgaggggagcctgagggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30244453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 30253751 - 30253671
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct 103  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30253751 tgttgggtca-tgaggggagcctgggggacagtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30253671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 199
Target Start/End: Original strand, 44361517 - 44361616
Alignment:
Q  99 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 198  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44361517 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcaca 44361615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 37346036 - 37345868
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 185  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||||  ||| || |||| ||| |  ||    
T  37346036 agagagacgtcacactcttactcaaaactttaaggcaatatgtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttctatcagatatatga 37345937  T
Q  186 c--atataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctcccc 253  Q
    |  |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||||    
T  37345936 catatataactcacacttgcaca-caacactccccttcaagtgtgagttcatcaattcatcgtgctcccc 37345868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 40094502 - 40094583
Alignment:
Q  154 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40094502 gttcaacctttactcttttatctgatgttggacatataactcacacttgcaca-caacactcctcctaaagtgtgagtccatc 40094583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 137
Target Start/End: Original strand, 21416181 - 21416232
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21416181 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 21416232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 30245338 - 30245256
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct 103  Q
    |||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30245338 actgttgggtca-taaggggagcatgggggaccgtccacattgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30245256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 7517839 - 7517767
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagaca 94  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7517839 tgttgggtcactgaggggagccaaggggaccacccatatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagaca 7517767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 7518105 - 7518033
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagaca 94  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7518105 tgttgggtcactgaggggagccaaggggaccacccatatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagaca 7518033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 135
Target Start/End: Original strand, 23569043 - 23569091
Alignment:
Q  87 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23569043 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 23569091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Original strand, 4124128 - 4124246
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 185  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||  | | || || ||||||| |||    
T  4124128 agagagacaccacacttttatccaaaaccttaatgcaatgagtttattggtcctctcacttataaagtgtcaaacctcaaattttctaaccgatgtagga 4124227  T
Q  186 catataactcacacttgca 204  Q
    ||| ||| ||||| |||||    
T  4124228 catgtaattcacagttgca 4124246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14681324 - 14681281
Alignment:
Q  167 tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14681324 tattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 14681281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 136
Target Start/End: Original strand, 40094424 - 40094503
Alignment:
Q  57 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 136  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  40094424 acatcggggctagaacaaccacataagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaactttaaagtaatgagtttatgggt 40094503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 45755072 - 45755010
Alignment:
Q  59 atcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  45755072 atcgaggcttgaacaaccacacaagtaagggagacaccacacttttacccaaaattttaaggc 45755010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 137
Target Start/End: Original strand, 21619091 - 21619136
Alignment:
Q  92 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21619091 acaccacacttttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtc 21619136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 37393216 - 37393114
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||    |||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| || |||||| |||| |||||||    
T  37393216 ggggatcgtccacatcgaggttagagcaaccacataagtggaagagacgccacacttttactcaaaacctcaaggcattgagtttat-ggtcatcttact 37393118  T
Q  146 tata 149  Q
    ||||    
T  37393117 tata 37393114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 202
Target Start/End: Original strand, 36967335 - 36967385
Alignment:
Q  152 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36967335 gtgtttaatctttacttttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 36967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15902457 - 15902342
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | | ||||| ||  | | |||    
T  15902457 ggggaccacccacatccaggc-agaacaatcacacaagtgagagcgacaccacacttttatccaaaaccttaagacaacgagcttatgtgtgatttcact 15902359  T
Q  146 tataaggtgttcaacct 162  Q
    ||||| |||||||||||    
T  15902358 tataaagtgttcaacct 15902342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 136
Target Start/End: Original strand, 27391815 - 27391859
Alignment:
Q  92 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27391815 acaccacactcttacctaaaaccttaaggcagtggatttatgggt 27391859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 109
Target Start/End: Original strand, 4719305 - 4719359
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccca 109  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  4719305 ccacaacgaggctagagcaaccgcacaaacaagagaaataccacactcttaccca 4719359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 7518028 - 7517982
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggcta 68  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  7518028 tgttgggtcactgaggggagccaaggggaccacccacatcgaggcta 7517982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 27598092 - 27598052
Alignment:
Q  97 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 137  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27598092 acactcttacgcaaaaccctaagacaatgggtttatgggtc 27598052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 87)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 63 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4823796 - 4823549
Alignment:
Q  63 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 162  Q
    ||||||||||| || || |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  4823796 aggctagaacatccgcataagcaaaaaagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcctacttataaggtgtttaactt 4823697  T
Q  163 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctcccctagagcgga 262  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4823696 ttactattttatccgatgtgagacttataactcacacttgcaaaccaacactccccttcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctcccctagagcgga 4823597  T
Q  263 agctttttacttttgcatgtatcgccattgctgcacaaggagccacttg 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4823596 agctttttac-tttgcatgtatcgccattcctgcacaaggagccacttg 4823549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 27 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22304747 - 22304537
Alignment:
Q  27 ggtcagtgaggggagcctagggg-accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg 125  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304747 ggtcagtgaggggaagctagggggactgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg 22304648  T
Q  126 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagt 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304647 tgtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattttatccgatgtgggacatatagctcacacttgcaaaccaacactccccctcaagt 22304548  T
Q  226 gtgagtccatc 236  Q
    |||||||||||    
T  22304547 gtgagtccatc 22304537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Original strand, 37990615 - 37990888
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37990615 tgttgggtcattgaggagagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 37990714  T
Q  122 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccc 219  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||    
T  37990715 aatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaacactccccc 37990814  T
Q  220 tcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctcccctagagcggaagctttttacttttgcatgtatcgccattgctg 295  Q
    |||| ||||||||||||| || | | ||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  37990815 tcaactgtgagtccatcaattcatcatgcccccctcaagcggaagc-ttttac-tttgcatgtatcgccgttgctg 37990888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 52 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15773346 - 15773119
Alignment:
Q  52 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaag--agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 149  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  15773346 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagcaagagacatcacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgagtcctcttacttata 15773247  T
Q  150 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtg 247  Q
    || |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15773246 agatgttcaacttttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttatcgtg 15773147  T
Q  248 ct-cccctagagcggaagctttttactt 274  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||    
T  15773146 ctcccccaagagcggaagctttttactt 15773119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Original strand, 54017791 - 54018008
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||||| || ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017791 actgttgggtcactg-ggggagccagggggaccgcccacatcgaagctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 54017889  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccc 217  Q
    ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||    
T  54017890 gcgttaggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgcacacaacaatactccc 54017989  T
Q  218 cctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||||    
T  54017990 cctcaagtgtgagtccatc 54018008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 47 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 11662108 - 11661846
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| |||    
T  11662108 gggactgttcacatcgaggctagaacaaccacacaatga-gagagacacctcactcttacccaaaaaccttaaggcaattggtttatgaggcctctcact 11662010  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaa 243  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  11662009 tttaaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtggggcatttaactcacacttacatacaacaacactcccccaaaagtgtgagtccatcactttat 11661910  T
Q  244 cgtgctcc-cctagagcggaagctttttacttttgcatgtatcgccattgctgcacaaggagcca 307  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11661909 cgtgctcctcctagagcggaagctttttac-tttgcatgtatcgccgttgctgcacaaggagcca 11661846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 202
Target Start/End: Original strand, 37990951 - 37991133
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgagggg-agcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 118  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37990951 actgttgggtca-tgagggggagcctgagggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 37991049  T
Q  119 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37991050 ggcgatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgagacatataactcacacttg 37991133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 48 - 202
Target Start/End: Original strand, 43346793 - 43346947
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 147  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43346793 ggaccgtccacatagaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttactta 43346892  T
Q  148 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43346893 taaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 43346947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 270
Target Start/End: Original strand, 29644581 - 29644808
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29644581 ggggaccatccacatcgaagctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggttctcttact 29644680  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac---tccccctcaagtgtgagtccatcacttta 242  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||    ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29644681 tataaggtgttcaacctttactctttaatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaaaacattcccccctcaagtgtgacttcatcacttta 29644780  T
Q  243 acgtgctcccctagagcggaagcttttt 270  Q
     |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  29644781 tcgtgctcccccagagcgaaagattttt 29644808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15773037 - 15772854
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  15773037 actgttgggtca-tgaggggagtcaaaaggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaa 15772939  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15772938 gcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatatgggacatataactcacacttgca 15772854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 35946680 - 35946524
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35946680 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaattgcacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttact 35946581  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35946580 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 35946524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 42342362 - 42342546
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  42342362 actgttgggtcactaaggggagccagggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaag 42342461  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342462 acaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatcggatgtgggacatataactcacacttgca 42342546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 204
Target Start/End: Original strand, 29644890 - 29645060
Alignment:
Q  34 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 133  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29644890 gaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 29644989  T
Q  134 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29644990 ggtcctcttacttataaggtgtttaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttgca 29645060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 46 - 232
Target Start/End: Original strand, 41359765 - 41359949
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41359765 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcgagagagacgccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 41359864  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtc 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  41359865 tataaggtattcaacctttactattgtatccgatgtggg----ataactcacacttgcacacaacaacactcccccttaagtgtgagtc 41359949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 237
Target Start/End: Original strand, 42342092 - 42342283
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  42342092 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttactta 42342191  T
Q  148 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    |||||  || ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342192 taaggcattgaacatttactcttttatccgatgtggaacatatgaatcacacttgcacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatca 42342283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 204
Target Start/End: Original strand, 12114550 - 12114720
Alignment:
Q  34 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 133  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12114550 gaggggagtctgggggaccgaccacatcgtggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 12114649  T
Q  134 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12114650 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggatatataacttacacttgca 12114720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32589861 - 32589704
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32589861 ggggaccgtccacatcgagcctagaacaaccacacaagcaagagagacatcgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 32589762  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  32589761 tataaggtgttcaacctttattattttatcttatgtgggacatat-actcacacttgca 32589704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Original strand, 33803252 - 33803410
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33803252 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagagagggagacgccacactcttacccaataccttaatgcaatgggtttatgggtcctcttact 33803351  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33803352 tatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacaattgca 33803410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 54 - 213
Target Start/End: Original strand, 39934963 - 39935124
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39934963 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaactttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggt 39935062  T
Q  154 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaacac 213  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  39935063 gttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactctcacacttgcaaaccaacac 39935124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 236
Target Start/End: Original strand, 21832345 - 21832532
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  21832345 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagagagacgccac--tcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgagtcctcttact 21832442  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21832443 tataaggtgttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacacttgcaca-taacactccgcctcaagtgtgagtccatc 21832532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Original strand, 54018198 - 54018356
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  54018198 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcatgagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgggtcctcttact 54018297  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54018298 tataaggtgttcaatctttactcttttatccgatgcaggacatataactcacacttgca 54018356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 55 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39389219 - 39389062
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 154  Q
    ||||||| ||||||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  39389219 ccacatcaaggctagaacaattgcacaggcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttagttttaaggtg 39389120  T
Q  155 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39389119 ttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcaaaccaaca 39389062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 237
Target Start/End: Original strand, 22303963 - 22304141
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  22303963 tccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataag-- 22304060  T
Q  154 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
         ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || | ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22304061 -----acctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacattctccctcaagtgtgagtccatca 22304141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Original strand, 25739425 - 25739583
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  25739425 ggggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacaagctagagagacgtcacactcttacccaaaacctaaaagcaatgagtttatgggtcctcttact 25739524  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25739525 tatatgatgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 25739583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Original strand, 32462903 - 32463057
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32462903 gaccgtacacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcttcttacttat 32463002  T
Q  149 aaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    ||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32463003 aaggtattcaaccttttactcttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 32463057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 52634858 - 52634678
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||||| || |||||||   |||||| ||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  52634858 actgttgggtcactg-ggggagctcgggggacagtctacatcaaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaag 52634760  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634759 gcaatgggtttatgggt-ctcttacttataaggcgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 52634678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 237
Target Start/End: Original strand, 32462558 - 32462752
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||    
T  32462558 gggggccgtctacatcgaggctaaaacaatcccacaaacaagagagaccccacactcttatccaaaaccttaaagcaataggtttatggatcatcttact 32462657  T
Q  146 tataaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32462658 tataaggtgttcaaccttttactctttcattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatca 32462752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Original strand, 50612447 - 50612618
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt-----tatgggtcctc 140  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||     |||| ||||||    
T  50612447 ggggaccgtccacgtcgaggatggaacaaccactcaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagataatatgttagatttatgagtcctc 50612546  T
Q  141 ttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50612547 ttacttataaggtgttcaatctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 50612618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31190168 - 31190017
Alignment:
Q  45 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 144  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||    
T  31190168 aggggagcgtccaaatcgaggctagaacaacccgacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc--------tatgggtcctctaac 31190077  T
Q  145 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31190076 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatatcactcacacttgca 31190017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 53577522 - 53577364
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| |||| |    
T  53577522 ggggaccatccacaccgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaagaccttaaggcaatatgtttatggatccacttatt 53577423  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53577422 tttaagatgttcaacctttactgttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 53577364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25755552 - 25755396
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | |||||| |||||| |||||||||||    
T  25755552 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacacttttacccacaactttaggacaatggatttatgagtcctcttact 25755453  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25755452 tataaggtattcaacctttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttg 25755396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 204
Target Start/End: Original strand, 1634291 - 1634473
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 121  Q
    ||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  1634291 tgttgtgtcactgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccatata-gtgagagagataccgcactcttacccaaaaccttaagcc 1634389  T
Q  122 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1634390 aatgggtttatgggtcctcttacttataatgtgtttaaccttttatttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 1634473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 204
Target Start/End: Original strand, 45395656 - 45395811
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 148  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  45395656 gaccctccacatcgaggctagagcaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgggtttatggatcctcttacttat 45395755  T
Q  149 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    || ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  45395756 aacgtgtttaacctttactcttttattcgatgtgggatatataacttacacttgca 45395811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 72 - 253
Target Start/End: Original strand, 3135099 - 3135280
Alignment:
Q  72 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3135099 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttatggcagtgggtttatgggttcttttacttataaggtgttcaacatttactattt 3135198  T
Q  172 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca-aaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctcccc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   | || ||| ||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||||||    
T  3135199 tatccgatgtgggacatataactcacttgtacacaacaaacactcaccatcaagtgtgagt-catcaattcatcgtgctcccc 3135280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Original strand, 3135454 - 3135617
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat--gggtcctctta 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3135454 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggggtcctctta 3135553  T
Q  144 c-----ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |     | |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3135554 ctaatataataaggtgttcaacttttactcttttatctgaggtgggacatataactcacacttg 3135617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 53 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9240300 - 9240118
Alignment:
Q  53 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 152  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |   |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9240300 gtccacatcgaggctagaataaccgcactattgagagagacaccacattcttatccgaaatcttaaggtaatggatttatgggtcctcttacttataagg 9240201  T
Q  153 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    |||||| | ||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9240200 tgttcagcttttacttctctatccgatgtggaacatataactcacacttgcaca-caacactcctcctcaagtgtgagtccatc 9240118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 45901873 - 45901715
Alignment:
Q  45 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 144  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  45901873 aggggaccgtccacatcgaagttagaacaaccctataagtaagagagacaccacactcttaccaaaaactttaaggccatgagtttatgcgtcctcttac 45901774  T
Q  145 ttataaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    ||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45901773 ttataaggtgttcaacctttttttcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 45901715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 203
Target Start/End: Original strand, 53117975 - 53118131
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||| |||    
T  53117975 ggggaccgttcacatcgatgctagaacaaccacacttgtgagagagacactacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggttt-tgaatcctctcact 53118073  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  53118074 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttgc 53118131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39914412 - 39914252
Alignment:
Q  44 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 143  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39914412 tagggggctgtctacatcgaggctagaacaaccgcataagtgagagagacaccacactcttatccaaaatattaaggcattaggtttatgggtcctctta 39914313  T
Q  144 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39914312 tttataaggtgttcaacctctactgttttatctgatgtgagacatataactcacacttgca 39914252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8328067 - 8327904
Alignment:
Q  45 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaac----cacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctc 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    | |||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||    
T  8328067 aggggagcgtccacatcgaggctagaacaactgcactcacttgtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattacgtttatgggttctc 8327968  T
Q  141 ttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8327967 ttacttataagatattcatcctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 8327904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 149 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22304301 - 22304213
Alignment:
Q  149 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304301 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 22304213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 37726654 - 37726496
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| | ||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |        |||||||||    
T  37726654 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaactatacaagtaagataaacgtcacactcttatccaaaacctaaaggcaatggat--------cctcttact 37726563  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726562 tataaggtattcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 37726496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 202
Target Start/End: Original strand, 49336694 - 49336843
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaa-gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 152  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49336694 tccacattgaggatagaacaaccgcacaaaaaaagagagacaccacactcttacccagaactttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataagg 49336793  T
Q  153 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  49336794 tggtcaacctttacttttctatccgatgtgagacatgtaactcacacttg 49336843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 51886714 - 51886553
Alignment:
Q  45 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 144  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||||||| |||||  |||| ||||||| |||||||||| |||||||      |||||| ||||||||||||||||||    
T  51886714 agggtaccgttcacatcgagattagaacaatcacacttgcaaaagagacatcacactcttatccaaaac------gcaatgagtttatgggtcctcttac 51886621  T
Q  145 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51886620 ttatatgatgttcaacctttactattttattcgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 51886553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 146
Target Start/End: Original strand, 22303634 - 22303759
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggg-gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 120  Q
    ||||| |||||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22303634 tgttgagtcagtgaggagaagctagggagaccgtctacatcgaggctagaacaatcgcacaagtaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaagg 22303733  T
Q  121 caatgggtttatgggtcctcttactt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  22303734 caatgggtttatgggtcctcttactt 22303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 202
Target Start/End: Original strand, 33175635 - 33175820
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacac--tcttacccaaaaccttaag 119  Q
    ||||||| || ||||||||||   |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  33175635 tgttgggccactgaggggagctcgggggactgcccacaccgaggctagaacaatcacacaagtgagagagacgtcacacactcttacccaaaaccttaag 33175734  T
Q  120 gcaatgggtttat---gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    || ||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  33175735 gctatgagtttattatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgagacatataactcacacttg 33175820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Original strand, 44160547 - 44160702
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  44160547 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgca--agtaagagagacgccacattcttacc-aaaaccttaagacaatgggtttatggatcctcttatt 44160643  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  44160644 tataaggtgttcaacctttattgttttatccaatatgaaacatataactgacacttgca 44160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 223
Target Start/End: Original strand, 47964544 - 47964694
Alignment:
Q  72 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 171  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||  ||  ||     
T  47964544 caaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctcacttatatagcgttcaacctccacatttc 47964643  T
Q  172 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaa 223  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  47964644 tatccgatgcgggacatacaactcacacttgcaca-caacactcgccctcaa 47964694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 194
Target Start/End: Original strand, 42584800 - 42584970
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||||||||| ||||| ||| |  |||  |||||||||| ||  ||||||||||| || ||| |||||  ||||||||||||| | ||||| |||||| |    
T  42584800 tgttgggtcattgaggagagtcgggggagccgtccacattgaaactagaacaaccgcataagtaagag--acaccacactctttctcaaaatcttaagac 42584897  T
Q  122 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 194  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  42584898 aattggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaatctttactcttctatccgatgtgggacatataact 42584970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 130
Target Start/End: Original strand, 41359467 - 41359575
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 121  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  41359467 tgttgggtcagcgaggggagtctgggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggt 41359566  T
Q  122 aatgggttt 130  Q
     ||||||||    
T  41359567 tatgggttt 41359575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 215
Target Start/End: Original strand, 3384317 - 3384435
Alignment:
Q  97 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 196  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  3384317 acactcttacccaaaactttaaggcattaagtttatgggtcctcttccttataaagtgtttaacctatactgttttatcatatgtgggacatataactca 3384416  T
Q  197 cacttgcaaaccaacactc 215  Q
    | |||||| ||||||||||    
T  3384417 cgcttgcacaccaacactc 3384435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 178
Target Start/End: Original strand, 33362327 - 33362425
Alignment:
Q  80 caagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 178  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33362327 caagcaagagagagacgccacacttacccaaaatcttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttattattttatccga 33362425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 204
Target Start/End: Original strand, 39336219 - 39336387
Alignment:
Q  34 gaggggagcctagggg-accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 132  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||  ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  39336219 gaggggagccaagggggaccatccacatccaggc-agagcaaccacacgagcgagagaggca--acactattatccaaaaccttaaagcaatgagtttat 39336315  T
Q  133 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    || |||||| |||||||| |||||||||||  |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39336316 ggatcctctcacttataaagtgttcaacctccaactttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 39336387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 134
Target Start/End: Original strand, 54017522 - 54017636
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    ||||||||||||  ||||||||    |||||||| |||||||||||| | ||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017522 actgttgggtcatagaggggagttagggggaccgaccacatcgaggccaaaacaatcacataagtaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 54017621  T
Q  120 gcaatgggtttatgg 134  Q
    |||||||||||||||    
T  54017622 gcaatgggtttatgg 54017636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Original strand, 47964915 - 47965073
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||| || | |||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||| |||    
T  47964915 ggggaacgtccacatctaggccagaacaatcatataagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggcttatgagccctctcact 47965014  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||   |||| |||||  ||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  47965015 tatataatgtttaacctccacttttctatccgatgtaaaacatataactcacacttgca 47965073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 201
Target Start/End: Original strand, 7767380 - 7767469
Alignment:
Q  112 accttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7767380 accttaagacaatgggtttatgagtcctcttagttataaagtgtccaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcagactt 7767469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 22304378 - 22304302
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctagggg-accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacac 95  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22304378 actgttgggtcagtgaggggaagctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacac 22304302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 312
Target Start/End: Original strand, 22303759 - 22303846
Alignment:
Q  225 tgtgagtccatcactttaacgtgctcccctagagcggaagctttttacttttgcatgtatcgccattgctgcacaaggagccacttgc 312  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22303759 tgtgagtccatcaattcaacgtgttcccctaaagcggaagctttttacttttgcctgaatcgccgttgctgcacaagaagccacttgc 22303846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11661638 - 11661537
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11661638 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc---------------cctcttacttataagatgtttaaccgttactattttatccgatgtggga 11661554  T
Q  186 catataactcacacttg 202  Q
    |||||||||||||||||    
T  11661553 catataactcacacttg 11661537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 201
Target Start/End: Original strand, 46546375 - 46546480
Alignment:
Q  96 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 195  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||  ||  ||  |||| |||| |||||||||||||    
T  46546375 cacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggattctctaacttataaagtgttcaacctccacatttcaatccaatgtaggacatataactc 46546474  T
Q  196 acactt 201  Q
    ||||||    
T  46546475 acactt 46546480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 43346706 - 43346650
Alignment:
Q  148 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43346706 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatacaactcacacttgca 43346650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 162
Target Start/End: Original strand, 39336000 - 39336086
Alignment:
Q  76 cacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 162  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | | | |||||| |||||||||||    
T  39336000 cacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgattttatgagtcttatcatttataaagtgttcaacct 39336086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12749316 - 12749211
Alignment:
Q  57 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 156  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  12749316 acatccagactagaacaaccacataagtaagagtgagtccacactcttatcaaaaaccttaatgcaattggtttatgggtcctcacacttataaagtgtt 12749217  T
Q  157 caacct 162  Q
    ||||||    
T  12749216 caacct 12749211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 52635050 - 52634990
Alignment:
Q  94 accacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52635050 accacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttatttataaggtg 52634990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 8328427 - 8328374
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8328427 gggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccccacaagcaagagagacaccacac 8328374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25317290 - 25317161
Alignment:
Q  72 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 171  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||  ||| ||     
T  25317290 caaccacacaagtgagagacacactacacttttacccaaaaccttaaggcaacaagtttatgggtcctctcagttacaaagtgctcaacctccacttttc 25317191  T
Q  172 tatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
     ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  25317190 catctggtgtgggacacataactcacactt 25317161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25991521 - 25991405
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 185  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| ||||||||  |||| ||| || |||  |||||  |||||||||    
T  25991521 agagagagaccacactttaacccaaaaccttaaggcattaggtttataggttctctcacttataaaatgtttaacattaacttgtttatttgatgtggga 25991422  T
Q  186 catataactcacacttg 202  Q
    ||||| |||||||||||    
T  25991421 catattactcacacttg 25991405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 53596078 - 53596027
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53596078 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggtc 53596027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 53596393 - 53596342
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53596393 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggtc 53596342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 149
Target Start/End: Original strand, 17731950 - 17732007
Alignment:
Q  92 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 149  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  17731950 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttccctttcttata 17732007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 149
Target Start/End: Original strand, 19033181 - 19033238
Alignment:
Q  92 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 149  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  19033181 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttccctttcttata 19033238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 124
Target Start/End: Original strand, 43978865 - 43978947
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacact----cttacccaaaaccttaaggcaat 124  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  43978865 ggggacagtccacatcgaggttagaacaaacacacaagtgagagagacgccacactctagcttacccaaaaccttaaggcaat 43978947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 53596593 - 53596542
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 137  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  53596593 agagagacaccacactcttacctaaaatcttaagtcaatgggtttatgggtc 53596542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 122
Target Start/End: Original strand, 7766783 - 7766857
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 122  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7766783 ggggaccatctacatcgaggctagaacaaccatacaag--tgagagacgccacaatcttacctaaaaccttaaggca 7766857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 137
Target Start/End: Original strand, 48127859 - 48127906
Alignment:
Q  90 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  48127859 agacaccacactcttatccaaaacattaaagcaatgggtttatgggtc 48127906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 9239997 - 9239940
Alignment:
Q  19 tactgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaacca 77  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9239997 tactgttggatca-tgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggctagaaaaacca 9239940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 204
Target Start/End: Original strand, 12747878 - 12747910
Alignment:
Q  172 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747878 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 12747910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 136
Target Start/End: Original strand, 16871005 - 16871049
Alignment:
Q  92 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 136  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16871005 acacgacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 16871049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 136
Target Start/End: Original strand, 17735037 - 17735081
Alignment:
Q  92 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17735037 acaccgcactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggt 17735081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 136
Target Start/End: Original strand, 19036306 - 19036350
Alignment:
Q  92 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19036306 acaccgcactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggt 19036350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2300000 - 2299937
Alignment:
Q  180 gtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca--ctccccctcaagtgtgagtccatcacttta 242  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2300000 gtgggacatataacccacacttgcaca-caacaatatccccctcaagtgtgagtccatcaattta 2299937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16143550 - 16143505
Alignment:
Q  92 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 137  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  16143550 acactacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgggtc 16143505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 133
Target Start/End: Original strand, 16869843 - 16869884
Alignment:
Q  92 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 133  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  16869843 acaccacactcttgctcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 16869884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 199
Target Start/End: Original strand, 36986040 - 36986101
Alignment:
Q  138 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 199  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36986040 ctctcacttataaagttctcaaccttcacttttctattcgatgtgggacatataactcacac 36986101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 199
Target Start/End: Original strand, 37011479 - 37011540
Alignment:
Q  138 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 199  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37011479 ctctcacttataaagttctcaaccttcacttttctattcgatgtgggacatataactcacac 37011540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 73
Target Start/End: Original strand, 41360111 - 41360164
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaaca 73  Q
    |||||| || ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41360111 actgttaggacagcgaggggagcccggggaaccgtccacatcgaggctagaaca 41360164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 50329391 - 50329427
Alignment:
Q  105 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctct 141  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  50329391 acccaaaaccttaaggcattggatttatgggtcctct 50329427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 81)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 34 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3670229 - 3669953
Alignment:
Q  34 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 133  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3670229 gaggggagc-tagggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttatg 3670131  T
Q  134 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtcc 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3670130 ggtcctcatacttataaggtgttaaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacagtccccctcaagtgtgagtcc 3670031  T
Q  234 atcactttaacgtgct--cccctagagcggaagctttttacttttgcatgtatcgccattgctgcacaaggagccacttg 311  Q
    |||| || | | ||||  ||| |  ||| ||||| | |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  3670030 atcaattcatcatgctcacccttcaagcagaagc-tcttac-tttgcatgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttg 3669953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3669845 - 3669678
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3669845 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttact 3669746  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3669745 tataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 3669678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 312
Target Start/End: Original strand, 1013879 - 1014137
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  1013879 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaaaagagacaacacactcttactcaaaactctaaggcaatgggtttattggtcctcttacttatagggt 1013978  T
Q  154 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctcccc 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | ||||||    
T  1013979 gttcaacttttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcaattcatcatactcccc 1014078  T
Q  254 --tagagcggaagctttttacttttgcatgtatcgccattgctgcacaaggagccacttgc 312  Q
      |  ||||||||| | |||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  1014079 cttcaagcggaagc-tcttac-tttgcatgtatcgtcgttcctgcacaaggagccacttgc 1014137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 34 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30441255 - 30441071
Alignment:
Q  34 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 133  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30441255 gaggggagccaaggtgactgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 30441156  T
Q  134 ggtcctcttactta----taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacact 214  Q
    || |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30441155 ggccctcttacttataattaaggtgttcaacctttactattttagccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacact 30441071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9309537 - 9309304
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||||| || |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9309537 actgttgggtcactg-ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacatactga-gagagacaccacactcttacccgacaccttaag 9309440  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccc 217  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  9309439 gcaatgagtttaagggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacactccc 9309340  T
Q  218 cctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctcccc 253  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9309339 cctcaattgtgagtccatcactttatcgtgctcccc 9309304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 202
Target Start/End: Original strand, 3038263 - 3038446
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgag-gggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 118  Q
    |||||||||||| |||| ||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3038263 actgttgggtcactgagagggagctcggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaa 3038362  T
Q  119 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038363 ggcaatgggtttatgggtccttttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 3038446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 36 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34835377 - 34835185
Alignment:
Q  36 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 135  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34835377 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835278  T
Q  136 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||||    
T  34835277 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacccttgtacacagcaacactccccctcaagtg 34835185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34835643 - 34835439
Alignment:
Q  36 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 135  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34835643 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835544  T
Q  136 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatc-cgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtc 232  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||||||||||    
T  34835543 tcctcttacttataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttgtacacagcaacactccccctcaagtgtgagtc 34835444  T
Q  233 catca 237  Q
    |||||    
T  34835443 catca 34835439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34835909 - 34835705
Alignment:
Q  36 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 135  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34835909 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835810  T
Q  136 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatc-cgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtc 232  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||||||||||    
T  34835809 tcctcttacttataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttgtacacagcaacactccccctcaagtgtgagtc 34835710  T
Q  233 catca 237  Q
    |||||    
T  34835709 catca 34835705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 48 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40518738 - 40518550
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 147  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  40518738 ggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcattgggtttatgggtcctcttattta 40518639  T
Q  148 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40518638 taaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg-aacacaatactccccctcaagtgtgagtccatca 40518550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 54 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 34835026 - 34834878
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34835026 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcatcttacttataaggt 34834927  T
Q  154 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34834926 gtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttg 34834878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Original strand, 20870550 - 20870741
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20870550 tgttgggtca-tgaggggagccaggaggaccgtccatatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggc 20870648  T
Q  122 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac--atataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20870649 agtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatctgatgtggaacatatataactcacacttgcaaaccaaca 20870741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 236
Target Start/End: Original strand, 8918764 - 8918956
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8918764 ggggaccgtccacatcgaggttaaaacaaccacacacgcaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcaataggtttatgggtcctcttact 8918863  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    ||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8918864 tataaagtgttcaacctttactctgctatctgatgtgggacatgtaactcacacttgcacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatc 8918956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 53 - 270
Target Start/End: Original strand, 45121663 - 45121882
Alignment:
Q  53 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  45121663 gtccacatcgaggctagaacaaccccataagtaagagagatatcacactcttactcaaaaccttaaggctgtaggtttatggatcctcttacttataagg 45121762  T
Q  153 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgct- 249  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  45121763 tgatcaacctttactcttttatccgatgtgggaca-acaactcacacttgtacacaacaacactcccccttaagtgtgagtccatcactttatcgtgctc 45121861  T
Q  250 cccctagagcggaagcttttt 270  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  45121862 cccccagagcggaagcttttt 45121882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Original strand, 45122067 - 45122215
Alignment:
Q  56 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 155  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45122067 cacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgt 45122166  T
Q  156 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45122167 tcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 45122215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 30359456 - 30359273
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagc-ctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 118  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||| ||| ||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30359456 actgttgggtcattgaggggagctcgagggaaccatccacattgaggctaaaacaacatcacaagaaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 30359357  T
Q  119 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30359356 ggctatgggtttatgggtcctcttgcttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 30359273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 212
Target Start/End: Original strand, 1014253 - 1014411
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1014253 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaggagagacaccacactcttacccaaaactttaaggtaacgagtttacgggtcctcttacttataaggt 1014352  T
Q  154 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1014353 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactcacacttgcaaaccaaca 1014411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 30359763 - 30359558
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 149  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30359763 accgtccacatcgaagttagaacaaccgcataagtaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggttatgggtttatgagtcctcttacttata 30359664  T
Q  150 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtg 247  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  30359663 aggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaacattccccctcaagtgtgagtccatcaatttatcatg 30359564  T
Q  248 ctcccc 253  Q
    ||||||    
T  30359563 ctcccc 30359558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 34 - 204
Target Start/End: Original strand, 45121898 - 45122068
Alignment:
Q  34 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 133  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  45121898 gaggggagcctgggggaccttccacatcgaggcttgaataaccacacgagcaaaagagacgccacactgttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatg 45121997  T
Q  134 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45121998 agtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatgcgatgtgggacatataactcacacttgca 45122068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45122782 - 45122604
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45122782 ggggaccttccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttact 45122683  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||      |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  45122682 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgcgggccatat------cacttgcaca-caacactccccctcaagtgtgagt 45122604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6732055 - 6731872
Alignment:
Q  44 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 143  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  6732055 taggggatcatccacatcgaggttagaacaaccgcataagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctctta 6731956  T
Q  144 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    |||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6731955 ctt---------tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaacaacactccccctcaaatgtgagtccatc 6731872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 9482608 - 9482784
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9482608 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagataccacactcttatacaaaatctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 9482707  T
Q  150 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtg 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||   | || | |||||||||||||||||||    
T  9482708 aggtgttcaacctttactcttttatcccatgtggaacatataactcacttgtacacaacaacactccccctcaagtg 9482784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 202
Target Start/End: Original strand, 25561812 - 25561972
Alignment:
Q  43 ctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctct 141  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25561812 ctaggggaccttccacatcgaggctagagcaaccacacaagcaagagagatgtcacactcttaccccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctct 25561911  T
Q  142 tacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25561912 tacttataaggtgttcaacgtttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 25561972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Original strand, 6876862 - 6877021
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  6876862 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaaacaagagaaacaccacactcttacccaaaaccctaagacaatgagtgtatgggtcatcttatt 6876961  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac-atataactcacacttgca 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6876962 tataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggactatataactcacacttgca 6877021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9608904 - 9608745
Alignment:
Q  45 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 144  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  9608904 agggggccgtccacatcgaggctagaacaacctcactagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaaggtgatgggtttatgggtcatcttac 9608805  T
Q  145 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9608804 ttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 9608745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 202
Target Start/End: Original strand, 33113368 - 33113523
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 146  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33113368 gggaccgtccgcattgagcctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactt 33113467  T
Q  147 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33113468 ataagacgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcaaacttg 33113523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 40518229 - 40518071
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  40518229 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcattgggtttatgggtccatttact 40518130  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttac--tattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40518129 tataaggtgttcaacctttacttttttttatccaatgtggaacatataactcacacttg 40518071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 45123164 - 45122972
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct--tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 143  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||    
T  45123164 ggggaccgtccacatcgagattagaacaaccccacaaataagagagacaccacactctcttacccaaaaccttaagaaaataggtttatgggtcatctta 45123065  T
Q  144 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45123064 ctta--aggtgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacagcaacactccccctcaagtgtaagtccatc 45122972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Original strand, 37544490 - 37544646
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||    
T  37544490 ggggatcgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaagtaatggatttatgggtcctctttct 37544589  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  37544590 tataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacttataactcacacttg 37544646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 147609 - 147454
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||  ||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  147609 ggggaccacccacatcaatgctagaactaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaataggtttatgggtcctcttatt 147510  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  147509 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 147454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 179
Target Start/End: Original strand, 9483174 - 9483320
Alignment:
Q  33 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 132  Q
    ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9483174 tgaggggagctatgggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacgagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttat 9483273  T
Q  133 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgat 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9483274 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgat 9483320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Original strand, 1513915 - 1514071
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  1513915 ggggaccgtccacatcgaggctagaataaccccacatgtaagagagataccacacttttacccaaaaccttaaggttatgggtttaagggtcctcttact 1514014  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1514015 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggatatataactcatacttg 1514071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 197
Target Start/End: Original strand, 70277 - 70425
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 148  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  70277 gaccgtccgcattgaggttagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacctaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttat 70376  T
Q  149 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 197  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  70377 aagatgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcac 70425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 253
Target Start/End: Original strand, 18371665 - 18371863
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 149  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||      
T  18371665 accgtccacatcgaagctagagcaaccgcacaaatgagagacacaccacactcttacccaaaaccttaaggca-tgggtttatgggtcttcttacttaa- 18371762  T
Q  150 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgct 249  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | || | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  18371763 ---tgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcacttctacacaacagcactccccctcaagtgtgagtccatcactttatcgtgcc 18371859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 210
Target Start/End: Original strand, 40579512 - 40579670
Alignment:
Q  52 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 151  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  40579512 cgtccacatcgaggatagaacaaccgtacaagcaatagagacaccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggtcctcttacttataag 40579611  T
Q  152 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  40579612 gtgttcaacctttactattttatccaatatgaaacatataattcacacttggaaaccaa 40579670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5916025 - 5915872
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  5916025 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta-- 5915928  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
      ||| ||||| ||| |||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5915927 --taaagtgttaaac-tttacatttttatccaatgtaggacatataactcacacttgca 5915872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5420807 - 5420651
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 147  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5420807 ggacggtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagggagacgtcacactcttacaaaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttactta 5420708  T
Q  148 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5420707 taagatgttcaacctttactattctatccgatgtgggacatataatacacacttgca 5420651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41972316 - 41972158
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaa---aaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  41972316 gaccgtccatattgaggctggaacaaccacacaagcaagagtgacgccacactcttacccaacaaaactttatggcaatgggtttatgggtcctatcact 41972217  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41972216 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 41972158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Original strand, 18371968 - 18372142
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctagggga-ccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||   ||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18371968 actgttgggtca-tgaggggagctcgggggaaccgttcacattgaggctagagcaaccgcacaagcgagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaa 18372066  T
Q  119 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 194  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  18372067 agcaatgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattggatgtggtacatataact 18372142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 132 - 253
Target Start/End: Original strand, 18372342 - 18372463
Alignment:
Q  132 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagt 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  18372342 tgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactttcacaacaacactccccctcaagtgtgagt 18372441  T
Q  232 ccatcactttaacgtgctcccc 253  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  18372442 ccatcactttatcgtgctcccc 18372463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 56 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 147968 - 147794
Alignment:
Q  56 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 155  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||         ||||| | |||    
T  147968 cacattgaggctagaacaactgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggg---------ttatatgttgt 147878  T
Q  156 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  147877 tcaacatttacttttttatcagatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatca 147794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6651652 - 6651476
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||      
T  6651652 ggggaccatccacatcgaggttagaacaatcgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctctta-- 6651555  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtcc 233  Q
           | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  6651554 -------ttttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataact--cacttgcaaaacaacacctcccctcaagtgtgagtcc 6651476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9309139 - 9308977
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacact---cttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9309139 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactactcttgcccaaaacctttaggcaatgggtttatgggtcctctt 9309041  T
Q  143 acttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg--ggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9309040 acttataacatgttcaacttttactcttttatctgatgtgtaggacatataactcacacttgca 9308977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 253
Target Start/End: Original strand, 18372785 - 18372905
Alignment:
Q  132 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||| | ||||||||||||||    
T  18372785 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcacactttcacaacaacact-ctcctcaagtgtgagt 18372883  T
Q  232 ccatcactttaacgtgctcccc 253  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  18372884 ccatcactttatcgtgctcccc 18372905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 201
Target Start/End: Original strand, 32640542 - 32640682
Alignment:
Q  56 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 155  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     |||    
T  32640542 cacatcgaggctagaacaatcacaaaagcaagagagacgcaacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatcggtcctcttaccta-----tgt 32640636  T
Q  156 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32640637 tcaacctttactcttttatccgatgtgagacagataactcacactt 32640682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 253
Target Start/End: Original strand, 18372988 - 18373139
Alignment:
Q  100 ctcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 199  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18372988 ctcttacccaaaacct---ggcaatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgaagtgggacatataaatcacac 18373084  T
Q  200 t-tgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctcccc 253  Q
    | | || | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18373085 tgtacacaacaacactccatctcaagtgtgagtccatcactttatcgtgctcccc 18373139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 200
Target Start/End: Original strand, 18380020 - 18380171
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 146  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| || || |||||||    
T  18380020 gggactgtccacatcgaagctagaagaatcgcacaagcaagagg--caccacactcttactcaaaaccttaaggtagtgggtttataggcccccttactt 18380117  T
Q  147 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18380118 ataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggatatataactcacact 18380171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 46 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 32305635 - 32305478
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||| || | |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  32305635 ggggaccgtccacatcaaggttagaacaactgcataagtaataaagacgccacactcttatccaaaatcttaaggtaatgggtttataggtcttcttact 32305536  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  32305535 tataaggtgttcaacctttactattttatcc-------gacatataactcacacttgcaaaccaa 32305478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Original strand, 4154678 - 4154824
Alignment:
Q  56 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 155  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  4154678 cacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctttcacttataaagtgt 4154775  T
Q  156 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4154776 tcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgca 4154824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 53 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9507933 - 9507777
Alignment:
Q  53 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9507933 gtccacatcgaggcttgaacaaccatataagagatagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataagg 9507834  T
Q  153 tgttcaacctttact---attttatccgatgtg--ggacatataactcacacttgca 204  Q
    | |||||||||||||    |||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  9507833 tattcaacctttactgtacttttatccaatatggaggagatataactcacacttgca 9507777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9609222 - 9609108
Alignment:
Q  67 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9609222 tagaacaaccacactagcaagagagacgccacactcttaccgaaaacattaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagatgttcaacctttac 9609123  T
Q  167 tattttatccgatgt 181  Q
    | || |||| |||||    
T  9609122 ttttctatctgatgt 9609108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 249
Target Start/End: Original strand, 18372485 - 18372574
Alignment:
Q  160 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgct 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18372485 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactttcacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttatcgtgct 18372574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 212
Target Start/End: Original strand, 41416251 - 41416335
Alignment:
Q  126 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41416251 ggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact--cacttgcaaaccaaca 41416335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 91 - 201
Target Start/End: Original strand, 43274824 - 43274934
Alignment:
Q  91 gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||    
T  43274824 gacaccacactcttactcaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcttacttataatatattcaacctttactcttttatctgatgtgaaacatat 43274923  T
Q  191 aactcacactt 201  Q
    |||||||||||    
T  43274924 aactcacactt 43274934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 237
Target Start/End: Original strand, 4154270 - 4154472
Alignment:
Q  35 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 134  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||| |||| ||| |||||| ||||   ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  4154270 aggggagtctcggggaccacccacatctaggccagagcaaccaaacaattgagagagacatcacacacttacccaaaatattaaggcaatgagtttatgg 4154369  T
Q  135 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca--ctccccctcaagtgtgagtc 232  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||   |||||||||||||||||||    
T  4154370 gt-ctctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtaggacatataactcacatttgcaca-caacaatttccccctcaagtgtgagtc 4154467  T
Q  233 catca 237  Q
    |||||    
T  4154468 catca 4154472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 41129159 - 41129066
Alignment:
Q  33 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgg 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41129159 tgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggtttgaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcatacccaaaaccttaagacaatgg 41129066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8794229 - 8794113
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 185  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||    
T  8794229 agagagacaccgcactctcacccaaaaccttaagatattaggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacatttattcttttatccgatgtgaga 8794130  T
Q  186 catataactcacacttg 202  Q
    |||||||||||||||||    
T  8794129 catataactcacacttg 8794113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 204
Target Start/End: Original strand, 9620666 - 9620834
Alignment:
Q  34 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 133  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||  ||||||||| || |||||||   |||| |||||||||||| |||||||    
T  9620666 gaggggagcccgggggaccgtccacatccaggcctgagcaaccacacaagtgagagagacatcaaactcttat--aaaatcttaaggcaatgagtttatg 9620763  T
Q  134 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||| | |||| || |||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  9620764 ggtcctctcacttataaagtgatcaacttctacttttctatctgttgtgagacatataactcacacttgca 9620834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 129
Target Start/End: Original strand, 40579269 - 40579352
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 129  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  40579269 ggggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggcaatgggtt 40579352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12284021 - 12283873
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 154  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  || ||||||| ||| | |||||| |||| |     
T  12284021 ccacatagaggctagaacaaccacacaagtgagagagacactacactcttatccaaaaccttaagac-ttgagtttatgtgtcattttacttttaagata 12283923  T
Q  155 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  12283922 ttcaacatttacttttttatctgacgtgggacatataacttacacttgca 12283873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 122
Target Start/End: Original strand, 8919144 - 8919220
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8919144 ggggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggca 8919220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 202
Target Start/End: Original strand, 18372656 - 18372758
Alignment:
Q  96 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 195  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||    
T  18372656 cacactcttacccaaaacct---ggcaatgggtttatgagtcctcttacttataag-tgttcaacctttactattttatccgaaatggaacatataaatc 18372751  T
Q  196 acacttg 202  Q
    |||||||    
T  18372752 acacttg 18372758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 201
Target Start/End: Original strand, 3037776 - 3037865
Alignment:
Q  114 cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac--atataactcacactt 201  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  3037776 cttaagacaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactatttcatccgatgtggaacatatataactcacactt 3037865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 200
Target Start/End: Original strand, 43398077 - 43398225
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctc---ttacttataag 151  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||| || || ||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||| |||||||    
T  43398077 ccacatcgaggttagagcaaccgcactagtaaaagaaacgccacattcttatccaaaactttaaggcaatgaatttatgggtcctcctcttatttataag 43398176  T
Q  152 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacact 200  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  43398177 gtgttcaacctttacttttctatccgatatgagatatataactcacact 43398225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 25561729 - 25561792
Alignment:
Q  131 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 194  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25561729 atgggtactcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataact 25561792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20130553 - 20130454
Alignment:
Q  99 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 198  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20130553 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcaca 20130455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5274907 - 5274775
Alignment:
Q  72 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 171  Q
    |||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||  | |||||| ||||||||||| | || |||    
T  5274907 caacaacacaagcgatagagacatcacactcttactcaaaatcttaaggcaatgattttatgggtcttcccatttataaagtgttcaacctctccttttt 5274808  T
Q  172 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||| | |||| | |||||||||||| |||||||    
T  5274807 tattcaatgtagaacatataactcatacttgca 5274775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 127
Target Start/End: Original strand, 20995404 - 20995497
Alignment:
Q  34 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggg 127  Q
    ||||||||||   ||||||  ||| ||| |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20995404 gaggggagccagagggaccacccatatctaggccagagcaaccacacaagtgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatggg 20995497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40991920 - 40991756
Alignment:
Q  37 gggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 135  Q
    |||||||||||||| | ||||||| | | ||||| |||||||||| |  ||   ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40991920 gggagcctaggggatcatccacattgggcctagagcaaccacacaggtgagttggacaccaca-tcttaacccaaaaccttgaggcattgggtttatggg 40991822  T
Q  136 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||  ||| || ||  | ||||||||| | ||||||||||||    
T  40991821 tcctctcacttatgaagtgttcaacctccacttttctaagcaatgtgggacttctaactcacactt 40991756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 110
Target Start/End: Original strand, 43274635 - 43274699
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  43274635 ggggaccgtccacatcgaggctggaacaaccccataagtaagagagacaccacactcatacccaa 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 93
Target Start/End: Original strand, 3037942 - 3038016
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgagggg-agcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagac 93  Q
    |||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3037942 actgttgggtcactgagggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagatagagagac 3038016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16524503 - 16524446
Alignment:
Q  66 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 123  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16524503 ctagagcaaccacacaagtaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaagcaa 16524446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 168
Target Start/End: Original strand, 18373236 - 18373292
Alignment:
Q  112 accttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 168  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18373236 accttaagacaatgggttaatggatcctcttatttataaggtgttcaacctttacta 18373292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 253
Target Start/End: Original strand, 43274699 - 43274776
Alignment:
Q  178 atgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctcccc 253  Q
    ||||| || |||||||||||||||| | ||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43274699 atgtgagatatataactcacacttgtacacaacaacactgtccctcaagtgtgagtccatcactttatcgtgctcccc 43274776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 150
Target Start/End: Original strand, 40417733 - 40417820
Alignment:
Q  63 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 150  Q
    |||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||||    
T  40417733 aggcaagagcaatcacacaagtgagagagacaccacacttttatccaaaatcttaacgcaatggatttacgagtcatcttacttataa 40417820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 104
Target Start/End: Original strand, 18372288 - 18372342
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctt 104  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18372288 accgtccacatcgagactaaagcaaccgcacaagcgagagagacaccacactctt 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 133
Target Start/End: Original strand, 12156708 - 12156745
Alignment:
Q  96 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12156708 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 12156745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 204
Target Start/End: Original strand, 20995502 - 20995559
Alignment:
Q  147 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20995502 ataaagtgttcaacctccacttttttatctgatgtgagacatataactcacacttgca 20995559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33832055 - 33831978
Alignment:
Q  127 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || | | | | ||| |||||||||||||||||||||    
T  33832055 gtttataggtcctcttacttataaagtgttcaacttctacttttctcttcaacgtgagacatataactcacacttgca 33831978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 11442952 - 11442911
Alignment:
Q  105 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 146  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  11442952 acccaaaaccttaaggcattgagtttatgggtcctctcactt 11442911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 204
Target Start/End: Original strand, 18645713 - 18645745
Alignment:
Q  172 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18645713 tatccgatgtgagacatataactcacacttgca 18645745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 77)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 48 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37106344 - 37106156
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37106344 ggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaatgggtttatgggtcctcttactta 37106245  T
Q  148 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106244 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 37106156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 46 - 236
Target Start/End: Original strand, 5542625 - 5542815
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5542625 ggggaccgtccacatcgagacttgaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttact 5542724  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542725 tataaggtgttcaacctttactattttattcgatatgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 5542815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Original strand, 41283449 - 41283641
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  41283449 actgttgggtaagtgaggggagcatgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaaacaagagagacgccacactcttacctaaaaccttaag 41283548  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41283549 gcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatatgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 41283641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Original strand, 36178605 - 36178772
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178605 ggggatcgtccacatagaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 36178704  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36178705 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaactaacac 36178772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 97 - 296
Target Start/End: Original strand, 36178320 - 36178519
Alignment:
Q  97 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36178320 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtccccttacttataaggtgttccacctttactattttatccgaagtgggacatataactca 36178419  T
Q  197 cacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctcccctagagcggaagctttttacttttgcatgtatcgccattgctgc 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||    
T  36178420 cacttgcaaaccaacagtccccctcaagtgtgagtccatcactttaatgtgttcccctagagcggaagctttttacttttgtctatatcgtcattgctgc 36178519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Original strand, 14745667 - 14745833
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745667 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 14745766  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745767 tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 14745833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 46 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37106082 - 37105920
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  37106082 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtccccttact 37105983  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaacc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37105982 tataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgcaaacc 37105920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 214
Target Start/End: Original strand, 5543002 - 5543166
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 149  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5543002 accgtccacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatggatcctcttacttata 5543101  T
Q  150 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacact 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5543102 aggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacact 5543166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15880415 - 15880233
Alignment:
Q  52 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15880415 cgtccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 15880316  T
Q  152 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtc 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | ||||||| ||||| |||||||||||    
T  15880315 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaacacttccccttaagtgtgagtc 15880233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6421568 - 6421387
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    ||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6421568 actgttgggtcac-gaggggagctcgggggaccgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaag 6421470  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6421469 gcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 6421387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 962753 - 962598
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  962753 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacaacacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctctcacttat 962654  T
Q  149 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  962653 aaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 962598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29677065 - 29676794
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg-----tcctct 141  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||     ||||||    
T  29677065 gggaccatccacatcgaggttggaacaaccccacaattaagagagacaccacactcttacttaaagccttaaggcaatgggtttatgggtcttctcctct 29676966  T
Q  142 tacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatcact 239  Q
     || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29676965 cacctataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgcacacaacaacacaccccctcaagtgtgagtccatcact 29676866  T
Q  240 ttaacgtgct-cccctagagcggaagctttttacttttgcatgtatcgccattgctgcacaaggagccacttgc 312  Q
    ||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||| |||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  29676865 ttatcgtgctccccccagaccggaagctttttac--ttgcttgtatttccgttgctgcacaaggagccacttgc 29676794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 236
Target Start/End: Original strand, 40679632 - 40679818
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 148  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  40679632 gaccgtccacatcgagactagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggttctcttacttat 40679731  T
Q  149 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40679732 aaggtgttcaacccttacttttctatccgatatgggacatataactcacatttgcaca-caacactccccctcaagtgtgagtccatc 40679818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42514832 - 42514649
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    ||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  42514832 actgttgggtcac-gaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaag 42514734  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42514733 gcgatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtaggacatataactcacacttgca 42514649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 53 - 311
Target Start/End: Original strand, 14745300 - 14745558
Alignment:
Q  53 gtccacatcgaggctagaacaaccac-acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  14745300 gtccacatcgaggctagaacaaccaccacttacaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcatacttacaag 14745399  T
Q  152 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctcc 251  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||  || | | ||||||    
T  14745400 atgttcaaccattactattttattcgatgtgggacatataactcacagttgcaaaccaacact-cccctcaagtttgagtacatctattcatcatgctcc 14745498  T
Q  252 cc--tagagcggaagctttttacttttgcatgtatcgccattgctgcacaaggagccacttg 311  Q
    ||  |  ||||||||| | |||| ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  14745499 cccttcaagcggaagc-tcttac-tttgtctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttg 14745558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6422268 - 6422084
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  6422268 ggggacagtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttaat 6422169  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||      ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6422168 tataatgtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggaca------tcacatttgcaca-caagactccccctcaagtgtgagtccatca 6422084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7598769 - 7598577
Alignment:
Q  36 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 135  Q
    |||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||        |||||||    
T  7598769 ggggagcccagtgggccgtccacatcgatgcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttaccaaaaacgttaagg--------ttatggg 7598678  T
Q  136 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7598677 tcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacaccaacactccctctcaagtgtgagtccat 7598578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 197
Target Start/End: Original strand, 15511495 - 15511646
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15511495 ggggatcgtccacatcgagactagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcctcttact 15511594  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 197  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15511595 tataacgtgttcaacctttactcttttatccgttgtgtgacatataactcac 15511646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Original strand, 35580724 - 35580881
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  35580724 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-ggtcctctcact 35580822  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580823 tataaggtgttcaacatttattgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 35580881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 48 - 237
Target Start/End: Original strand, 28531316 - 28531504
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28531316 ggaccatccacatcgaggctagagcaactgcataactgagagagtcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggacctcttactta 28531415  T
Q  148 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28531416 taaggtgttcaacctttgcttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcaca-caacactccccctcaagtgtgagtccatca 28531504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 186
Target Start/End: Original strand, 36178171 - 36178311
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  36178171 ggggaccgtctacatcgaggctataacaaccacacaagcaagagaggcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggttcccttact 36178270  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178271 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 36178311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6713160 - 6712978
Alignment:
Q  21 ctgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaag 119  Q
    ||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  6713160 ctgttggatcagtgagggaagttcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaaccttaaa 6713061  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6713060 gcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 6712978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 38796591 - 38796778
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctagg--ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccaca--ctcttacccaaaacct 115  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  38796591 actgttgggtcattg-ggggagccttggagggaccgtcgacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaatagagacgccacatactcttacccaaaacct 38796689  T
Q  116 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38796690 taaggcattaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttattgttttatcagatgtgggacatataactcacacttgca 38796778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 53 - 202
Target Start/End: Original strand, 36005887 - 36006035
Alignment:
Q  53 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36005887 gtccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagg 36005986  T
Q  153 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36005987 tgttcaacttttact-ttctattcgatgtgggacatataactcacacttg 36006035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33731831 - 33731653
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctagg-ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 120  Q
    ||||||||||  ||||||||| | || |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33731831 tgttgggtcaccgaggggagctttggaggaccgtttacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaagg 33731732  T
Q  121 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 199  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  33731731 caataggtttatggatcctcttacttataaggtgctcaacctttactcttttatccgatgtgagatatataactcacac 33731653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40733675 - 40733482
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||    
T  40733675 ggggaccatccacatcgagacttgaactaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggttgtaggtttatgggtcctcttact 40733576  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |  |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  40733575 tataaggtgttcaacatttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaataacacttcccctcaagtgtgagtctatca 40733482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 204
Target Start/End: Original strand, 37632575 - 37632755
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 121  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  37632575 tgttgggacactgaggggagcc-agggg-ccgtccacatcgaggctagaacaatcacacttgtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaagt 37632672  T
Q  122 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37632673 tatgggtttatgggtcctcttacttataaaatgtcaaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 37632755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40734040 - 40733848
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  | || ||||| | |||||||||    
T  40734040 ggggaccgtccacatcgagacttgaacaaccacacaagcgagacagacaccacactcttacccaaaactttaaggctgtagg-ttatgagccctcttact 40733942  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40733941 tataaggtgttaaatctttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaataacactccccctcaagtgtgagtccatca 40733848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1770075 - 1769884
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctagg-ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 118  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | ||    
T  1770075 actgttgggtcattg-ggggagc-taggaggatcgttcacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttattcaaagcttcaa 1769978  T
Q  119 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
     || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1769977 agctatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcacaccaaca 1769884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 200
Target Start/End: Original strand, 28254258 - 28254391
Alignment:
Q  65 gctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttt 164  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28254258 gctagaacaaccccacaag--agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaaccttt 28254355  T
Q  165 actattttatccgatgtgggacatataactcacact 200  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28254356 acttttctatccgatgtgggacatataagtcacact 28254391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 193
Target Start/End: Original strand, 40163362 - 40163520
Alignment:
Q  36 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgg 134  Q
    |||||||  ||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | |||| ||||    
T  40163362 ggggagctcaggagaccatctacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaagacactaggttaatgg 40163461  T
Q  135 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataac 193  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40163462 gtcatcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataac 40163520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23346417 - 23346250
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23346417 tgttgggtca-tgaggggagctcgggcgaccgtccacatctaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttaccgaaaaccttaaggc 23346319  T
Q  122 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 191  Q
     ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  23346318 tatgggtttatgggccctctta-ttataaggtgtttaacctttacttttctatacgatgtgagacatata 23346250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7598387 - 7598228
Alignment:
Q  45 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 144  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||     
T  7598387 aggggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagtgagagagacaccatattcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctcttat 7598288  T
Q  145 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||| |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  7598287 ttataaggtgttgaacctttacttttctattcgatgtagaacatataattcacacttgca 7598228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3673254 - 3673050
Alignment:
Q  17 aatactgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt 116  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  3673254 aatattgttgggtcactg-ggggagccagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtaagagagacatcacactcttagccaaaatctt 3673156  T
Q  117 aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacact 214  Q
    || |||||| |||||||| |||||||||||||||                 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  3673155 aaagcaatgagtttatggatcctcttacttataa-----------------attttatccaatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacact 3673073  T
Q  215 ccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  3673072 cctcctcaagtgtgagtccatca 3673050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5367599 - 5367457
Alignment:
Q  60 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 159  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  5367599 tcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgtgttcatggatcatcttacttataaggtgttcaa 5367500  T
Q  160 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  5367499 cctttgctcttttatccgatctgggacatatatatcacacttg 5367457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 224
Target Start/End: Original strand, 31468800 - 31468926
Alignment:
Q  96 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468800 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta----taagatattcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 31468895  T
Q  196 acacttgcaaac--caacactccccctcaag 224  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  31468896 acacttgcacacaacaacactccccctcaag 31468926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 236
Target Start/End: Original strand, 38796298 - 38796410
Alignment:
Q  126 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaa 223  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  38796298 ggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacactccccctcaa 38796397  T
Q  224 gtgtgagtccatc 236  Q
    |||||||||||||    
T  38796398 gtgtgagtccatc 38796410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 6421911 - 6421793
Alignment:
Q  23 gttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 122  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6421911 gttgggtca-tgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggccagaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 6421813  T
Q  123 atgggtttatgggtcctctt 142  Q
    || |||||||||||||||||    
T  6421812 ataggtttatgggtcctctt 6421793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16542556 - 16542449
Alignment:
Q  97 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16542556 acactcttactcaaaatcttaaggcaatgagtttataagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacttataactca 16542457  T
Q  197 cacttgca 204  Q
    ||||||||    
T  16542456 cacttgca 16542449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29676687 - 29676543
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  29676687 ggggaccgtccacatcgaggtttgaataaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaa------aaggcaatgagtttatgggttctctcact 29676594  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 196  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  29676593 tataatgtgttcaatctttactcttttatccaatgtgagacatataactca 29676543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30313360 - 30313147
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    ||||||||||||  |||| |||||  ||||| |||| | ||| |||| ||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  30313360 actgttgggtcac-gaggagagcccgggggatcgtcaaaatccaggccagagcaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaag 30313262  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca--ctccc 217  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| | |||||  || ||    
T  30313261 gcaatgagtttttgggtcctctcacttataa-gtgttcaacctccacttttctatccgatgtgagacatataacacacgcttgcaca-caacaatcttcc 30313164  T
Q  218 cctcaagtgtgagtcca 234  Q
    |||||||||||||||||    
T  30313163 cctcaagtgtgagtcca 30313147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Original strand, 12529038 - 12529186
Alignment:
Q  56 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 155  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12529038 cacattgaggttagaacaaccgcacaaacaagagagacactacgttcttatctaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttatacggtgt 12529137  T
Q  156 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12529138 tcaatctttactgttttatttgatgtaggacatataactcacacttgca 12529186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16591065 - 16590888
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||||||||| ||||||||||   || ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | | ||||||  |||||||||||||    
T  16591065 tgttgggtcattgaggggagctcgggagactgtccacattgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacattagattcttacttaaaaccttaaggc 16590966  T
Q  122 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac-tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||      |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16590965 aatgtgtttatgggtcctcttactt------tgttcaacctttactttttttatttgatgtgggacatataactcacacttgca 16590888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30323581 - 30323430
Alignment:
Q  87 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 186  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||  | | || |||| ||| ||||||    
T  30323581 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttataggtcctctcacttctaaagtgttcaacctccaattttctatctgatttgggac 30323482  T
Q  187 atataactcacacttgcaaaccaaca--ctccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30323481 atataacacacacttgcaca-caacaatctccccctcaagtgtgagtccatca 30323430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 116 - 201
Target Start/End: Original strand, 31899496 - 31899581
Alignment:
Q  116 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31899496 taaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacactt 31899581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 147 - 237
Target Start/End: Original strand, 36785664 - 36785756
Alignment:
Q  147 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36785664 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacactccccctaaagtgtgagtccatca 36785756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 237
Target Start/End: Original strand, 33561491 - 33561641
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 185  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||| || |||| ||||||| |    
T  33561491 agagagatatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccacttttctatctgatgtggaa 33561590  T
Q  186 catataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| | ||||||||    
T  33561591 catataactcacacttgcaca-caacattccccatcaagtgcgtgtccatca 33561641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Original strand, 29873525 - 29873729
Alignment:
Q  34 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 133  Q
    ||||||||||  | |||||| | ||||| || | ||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  29873525 gaggggagccaggaggaccgcctacatccagaccagagcaaccacacaagtgagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 29873624  T
Q  134 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca--ctccccctcaagtgtgagt 231  Q
     ||||||  ||||||||  ||||||||||  ||| || |||| |||||||||||| |||| ||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  29873625 agtcctcccacttataaaatgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacatgtaacacacccttgcaca-caacaatctccccctcaagtgtgagt 29873723  T
Q  232 ccatca 237  Q
    ||||||    
T  29873724 ccatca 29873729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 3672882 - 3672773
Alignment:
Q  23 gttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 122  Q
    ||||||||| |  ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3672882 gttgggtcactagggggagccaggggaaccgtccacatcgagactagaacaaccacacaattaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggca 3672783  T
Q  123 atgggtttat 132  Q
    ||||||||||    
T  3672782 atgggtttat 3672773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Original strand, 29874023 - 29874179
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||| ||||||| |||| | | ||||| ||||||   || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  29874023 ggggaccgcccacatccaggccaaagcaaccgcacaagtgggatagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcccaat 29874122  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29874123 tataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacatataacacacacttg 29874179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 196
Target Start/End: Original strand, 37895107 - 37895211
Alignment:
Q  92 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||| |||||| |||| | || ||||||||||||||||||||    
T  37895107 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgtgttcttttacttttaaggttttcaacttttatttttctatccgatgtgggacatata 37895206  T
Q  192 actca 196  Q
    |||||    
T  37895207 actca 37895211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 88 - 201
Target Start/End: Original strand, 31259658 - 31259774
Alignment:
Q  88 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcc---gatgtggg 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||| |    
T  31259658 agagataccacactcttacccaaaaccttaaggtgataggtttatgggtcatcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatccgatgatgtgag 31259757  T
Q  185 acatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259758 acatataactcgcactt 31259774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 236
Target Start/End: Original strand, 37894732 - 37894881
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 185  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||| || ||| | ||||||||    
T  37894732 agagacacaccacacttttaaccaaaatcttaaggcaatggatttatgagtcttcttacttataaggtttttagcctttacttttctattcaatgtggga 37894831  T
Q  186 catataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  37894832 catataactcacatttgcaca-caatactcccccttaagtatgagtccatc 37894881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 6421780 - 6421688
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 142  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  6421780 accgtccacatcgaggccggaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaacctttagtcaataggtttatgggtcctctt 6421688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 59 - 151
Target Start/End: Original strand, 36784273 - 36784365
Alignment:
Q  59 atcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 151  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36784273 atcgaggcttgaataaccacacaagcaagagagacacaacacttttatccaaaaccttaagacaaagggtttatgggtcatcttacttataag 36784365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 223
Target Start/End: Original strand, 33953821 - 33953947
Alignment:
Q  96 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 195  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||| || |||| |||||||||| ||||||||    
T  33953821 cacactcttacccaaaattttaaggcaacaggtttatgggtcctctcacttatatagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacttataactc 33953920  T
Q  196 acacttgcaaaccaacactccccctcaa 223  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  33953921 acatttgcaca-caacactccccctcaa 33953947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 41678419 - 41678559
Alignment:
Q  97 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac--atataact 194  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||   || || |||| |||||| |||  ||||||||    
T  41678419 acactcttactcaaaaccttaaggcaaagg-tttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccccttttctatctgatgtgagacatatataact 41678517  T
Q  195 cacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41678518 cacacttgcaca-caacactccccttcaagtgtgagtccatca 41678559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9231407 - 9231252
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||| |||| || |||  ||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||| |||||||| |    
T  9231407 ggggatcgtccacatcaaggttagaataaccgcataagttagagagatactacactcttaaccaaaactttaaggcggtgggttgatggatcctcttatt 9231308  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
    |||||  ||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  9231307 tataatatgttcaacctttacttttctatctgatatgagacatataactcatactt 9231252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 31385868 - 31385738
Alignment:
Q  73 aaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatttt 172  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  | | || |    
T  31385868 aaccacacaagtgaaagagacaccacacttattcccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctttcacttataaggtgctcaacctccatttttct 31385769  T
Q  173 atccgatgtgggacatataactcacacttgc 203  Q
    | |||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  31385768 aaccgatgtcagacttctaactcacacttgc 31385738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Original strand, 28254165 - 28254254
Alignment:
Q  99 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacat 188  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  28254165 actcttaccctaaactttaaggcaaagtgtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacat 28254254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 42515078 - 42514981
Alignment:
Q  142 tacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga----catataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42515078 tacttataaggtgtttaacctttacttttctatccgatgtgggacatacatataactcacacctgcaca-caacactccccctcaaatgtgagtccatc 42514981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 201
Target Start/End: Original strand, 3594180 - 3594333
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 147  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || | |||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| | |||||    
T  3594180 ggaccgttcacatcgaggttagaataaacacactagtatgagagatatcacactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctatcactta 3594279  T
Q  148 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
    ||| |||||| ||||  ||| || ||| || ||||  ||||| |||||||||||    
T  3594280 taaagtgttcgacctccacttttctattcgttgtgaaacatacaactcacactt 3594333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 114
Target Start/End: Original strand, 31899090 - 31899170
Alignment:
Q  33 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacc 114  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  31899090 tgaggggagctt-ggggaccgttcacatcgaggttagaagaaccccacaagcaagagagatacctcactcttacccaaaacc 31899170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 140
Target Start/End: Original strand, 35580443 - 35580534
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct--tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctc 140  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| | | | ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35580443 accgtccacatcgaggctaaaacaatcacataggga-gagagacgccacactctcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctc 35580534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12910335 - 12910231
Alignment:
Q  97 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||| | | |||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  12910335 acactcttacccaaaaccttaagacaatgaatttataagtcatttcacttataaggggttcaacctgtacttttccatccgatgtggaacatataactca 12910236  T
Q  197 cactt 201  Q
     ||||    
T  12910235 aactt 12910231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6421352 - 6421306
Alignment:
Q  156 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6421352 tcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttg 6421306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 204
Target Start/End: Original strand, 33954279 - 33954419
Alignment:
Q  63 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 162  Q
    |||| |||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | | |||||| ||| | | | |||||   |||| |||||    
T  33954279 aggccagaacaaccatataagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcgtaaggca-tagatttatgagtcatttaagttatataatgtttaacct 33954377  T
Q  163 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
      ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33954378 caacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttgca 33954419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30312907 - 30312831
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 162  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||    
T  30312907 agagagactacacacttttacccaaaaccttaaggaaataagtttatgggtcatctaagttataaagtgttcaacct 30312831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 25390313 - 25390372
Alignment:
Q  91 gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 150  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  25390313 gacaccacacttctacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcttcttagttataa 25390372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 28226455 - 28226404
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 137  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  28226455 agagagacaccacactcttacctaaaaccctaagacaatgtgtttatgggtc 28226404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 2336723 - 2336666
Alignment:
Q  105 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 162  Q
    |||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2336723 acccaaaatcttaaggcattgaatttatgggtcctctcacttataaagtgttcaacct 2336666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 8904546 - 8904498
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 134  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  8904546 agagagacaccacacttttacccaaaaccatatggcaattggtttatgg 8904498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 28226772 - 28226726
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  28226772 agagagacaccacactcttaccaaaaacc-taagacaatgggtttatg 28226726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 2110066 - 2109988
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacac 100  Q
    |||||||| | ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||| |||| ||| ||||||    
T  2110066 tgttgggttactgaggggagtcagggggaccgtccacatcgagactagagcaatcatacaagcgagagggacgccacac 2109988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40734300 - 40734243
Alignment:
Q  182 gggacatataactcacacttgcaaacca--acactccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  40734300 gggacatataactcacacttgtacacaataacactccccctcaagtgtgattccatca 40734243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 137
Target Start/End: Original strand, 13792536 - 13792585
Alignment:
Q  88 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 137  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||    
T  13792536 agagacatcacactcttacccaaaacctcaagtcaatgggtgtacgggtc 13792585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3672755 - 3672719
Alignment:
Q  168 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3672755 attttattcgatgtgggacatataactcatacttgca 3672719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 79)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 46 - 236
Target Start/End: Original strand, 44290458 - 44290648
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290458 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagaaagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 44290557  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290558 tataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 44290648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Original strand, 44290798 - 44290993
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaa 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44290798 actgttgggtcagtggggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagatacaccacactctttacccaaaaccttaa 44290897  T
Q  119 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacact 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290898 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacact 44290993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 35 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41157545 - 41157311
Alignment:
Q  35 aggggagcctag-gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 133  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  41157545 aggggagccttgagggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagacagacaccacactcttactcaaaacctaaaggcaatgggtttatg 41157446  T
Q  134 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||    
T  41157445 ggtcctcttacttataaggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaatactcccccttaagtgtgagt 41157346  T
Q  232 ccatcactttaacgtgctcccctagagcggaagct 266  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41157345 ccatcaatttatcgtgctcccccagagcggaagct 41157311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Original strand, 48588465 - 48588754
Alignment:
Q  24 ttgggtcagtgaggggagcctaggg-gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48588465 ttggttcagtgaggggaactttgggcgaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccgcactcttacccaaaaccttaaggca 48588564  T
Q  123 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctca 222  Q
    |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48588565 atgaatttacgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtcggacatagaactcacacttgcaaaccaacactccccctca 48588664  T
Q  223 agtgtgagtccatcactttaacgtgct--cccctagagcggaagctttttacttttgcatgtatcgccattgctgcacaaggagccacttgc 312  Q
    ||||||||||||||  || | | ||||  ||| |  |||||||||| ||   |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  48588665 agtgtgagtccatctattcatcatgctaccccttcaagcggaagctctt--attttgcatgtatcgtcgttcctgcacaaggagccacttgc 48588754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 46 - 311
Target Start/End: Original strand, 26661522 - 26661789
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  26661522 ggggaccgtccatatcgaggcttgaacaaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcact 26661621  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||| |||||||||||||||  || |     
T  26661622 tataaggtgttcaacctttactcttttacccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacactcccccttaagtgtgagtccatctattcat 26661721  T
Q  244 cgt--gctcccctagagcggaagctttttacttttgcatgtatcgccattgctgcacaaggagccacttg 311  Q
    | |   ||||| |  ||||||||| | |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  26661722 catactctcccttcaagcggaagc-tcttac-tttgcatgtatcgtcgttgctgcacaaggagccacttg 26661789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 55 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37556260 - 37556071
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 154  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  37556260 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttat-ggtcctcttacttataagatg 37556162  T
Q  155 ttcaacctttacta-ttttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcacttta 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556161 ttcaacctttactatttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatcacttta 37556071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41759641 - 41759475
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  41759641 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcatcttact 41759542  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41759541 tataaggtgttcaacttttactattttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcaaaccaaca 41759475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 3537589 - 3537765
Alignment:
Q  35 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 134  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  3537589 aggggagcc-aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttatag 3537687  T
Q  135 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  3537688 gtcctcttactcataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacacgtacaaaccaaca 3537765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41142531 - 41142372
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41142531 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactctttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttac 41142432  T
Q  145 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142431 ttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 41142372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 45 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34365084 - 34364891
Alignment:
Q  45 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 144  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34365084 agggaaccatccacatcgaggttagagcaactgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttac 34364985  T
Q  145 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34364984 ttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatc 34364891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 235
Target Start/End: Original strand, 22077484 - 22077683
Alignment:
Q  35 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 134  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  22077484 aggggagcctgggggaccgtccatatcgatgcttgaacaaccgcataagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggctacgagtttatgg 22077583  T
Q  135 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtcca 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22077584 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgcaca-caacactccccctcaagtgtgagtcca 22077682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41157175 - 41156991
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtga-ggggagcctagggg-accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41157175 tgttgggtcactgaaggggagccttgggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaa 41157076  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  41157075 gcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgttatgggacatataattcacacttgca 41156991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 50 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3550871 - 3550712
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3550871 accgtccacatcgaggctagaacaaccgta---gcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttata 3550775  T
Q  150 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3550774 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgccaaccaaca 3550712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11977438 - 11977251
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||    
T  11977438 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacttgcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtgctcttact 11977339  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagt 231  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||    
T  11977338 tataaggtgttcaacatttactgttttacccgatgtgggacatataactcacacttgtacacagcaacactccccctcaagtgtgagt 11977251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 31767136 - 31767319
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31767136 actgttgggtca-tgagggaagcttgggggaccgtccacatcgagtctagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacccaaaaccttaag 31767234  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31767235 gcattaggttaatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataacccacacttgca 31767319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 125 - 308
Target Start/End: Original strand, 3537226 - 3537410
Alignment:
Q  125 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaag 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537226 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaag 3537325  T
Q  225 tgtgagtccatcactttaacgtgctcccc--tagagcggaagctttttacttttgcatgtatcgccattgctgcacaaggagccac 308  Q
    ||||||||||||| || | | ||||||||  |  |||||||||| |||||  |||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  3537326 tgtgagtccatcaattcatcttgctcccccttcaagcggaagctctttac-cttgcatgtatcgtcgttcctgcacaaggagccac 3537410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17294733 - 17294579
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggctagaacaacca-cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 147  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294733 gaccgtccacatcgaggctagagcaacctgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 17294634  T
Q  148 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294633 taaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 17294579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Original strand, 45493948 - 45494146
Alignment:
Q  19 tactgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  45493948 tactgttgggtcattggggggagc-tgggggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacataaggaagagagacaccacactcttatccaaaactttaa 45494046  T
Q  119 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa----ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat-aactcacacttgcaaaccaacac 213  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45494047 ggcaatgggtttatggatcatcttacttatatatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataaactcacacttgcaaaccaacac 45494146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34364690 - 34364507
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||||| || |||||||  |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34364690 actgttgggtcactg-ggggagctcagggaaccatccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaag 34364592  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34364591 gctatgggtttacggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 34364507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29798357 - 29798199
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29798357 ggggaccgtctatatcgaggttagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttatccaagaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttact 29798258  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29798257 tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtaggacatataactcacacttgca 29798199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 34649596 - 34649440
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   |||    
T  34649596 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacgcctcactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggttcttgcact 34649497  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649496 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 34649440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Original strand, 50051999 - 50052189
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    ||||||||||||  |||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50051999 actgttgggtcac-gaggggagctcgggggactgtccacatcgaggttagaacaac-acataaacaagagagacaccacactcttacccaaaactttaag 50052096  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  50052097 aaaataggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttaaaaaccaaca 50052189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Original strand, 5319965 - 5320123
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  5319965 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccacataagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctctcact 5320064  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5320065 tataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtggaacatataactcacacttgca 5320123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 9956092 - 9955911
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9956092 actgttgggtcac-gaggagagcctaggggaccgctcacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaag 9955994  T
Q  120 gcaatgggttt-atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac-tattttatccgatgtgggacatataactcacact 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9955993 gcaattggtttaatgggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactttttttatctgatgtgggacatataactcacact 9955911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14319025 - 14318875
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  14319025 ggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaaataagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatagatttatgggtcttcttact 14318926  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14318925 tataaggtgttcaacctttactattttatccgacgtggaacatataactca 14318875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40082556 - 40082408
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 153  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  40082556 tccacatcgaggctagaacaaacgcacaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatga-tcctcttacttataaggt 40082458  T
Q  154 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40082457 gttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgc 40082408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Original strand, 32168674 - 32168853
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcct-aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 120  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32168674 tgttgggtcact-aggggagccttaggggactgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctcaagg 32168772  T
Q  121 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    |||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32168773 caatgggtttatgggtcctct------taaggtgttcaacctttactattttatcc-----gggacatataactcacacttgcaaaccaaca 32168853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 210
Target Start/End: Original strand, 32594748 - 32594880
Alignment:
Q  78 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32594748 cacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctg 32594847  T
Q  178 atgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32594848 atgtaggacatataactcacacttgcaaaccaa 32594880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 45084557 - 45084382
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  45084557 tgttgggtca-tgagggaagcctgggggaccgtccgcatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacaccactctcttacccaaaaccttaagac 45084459  T
Q  122 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45084458 g------ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggagatataactcacacttgca 45084382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 204
Target Start/End: Original strand, 3875333 - 3875489
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3875333 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagactccacattcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttactta 3875432  T
Q  148 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  3875433 taaggtgtacaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactgactcttgca 3875489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 204
Target Start/End: Original strand, 37850588 - 37850758
Alignment:
Q  33 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 132  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||  || | |||||||    
T  37850588 tgaggggagc-taggggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacaccacactcttatccgaaaccttaaaacattaggtttat 37850686  T
Q  133 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37850687 gggttctcttacttataaggtgttcaacctctactgttttatgcgatgtgggacatataactcacacttgca 37850758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Original strand, 38804370 - 38804516
Alignment:
Q  61 cgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 160  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  38804370 cgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggttatgggtttatggatcctcttacttataatgtgttcaac 38804469  T
Q  161 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 207  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38804470 ctttactcttttattcgatgtgggacgtataactcacacttgtaaac 38804516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 69 - 202
Target Start/End: Original strand, 26661921 - 26662054
Alignment:
Q  69 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  26661921 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttctcacttataaggtgttcaacctttactc 26662020  T
Q  169 ttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26662021 ttttatctgatatgggatatataactcacacttg 26662054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37555878 - 37555733
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 154  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||| ||     
T  37555878 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaggattta-aggtcctcttacttataatgta 37555780  T
Q  155 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37555779 ttcaaccttcactattttatccgatgtgggacttataactcacactt 37555733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 66447 - 66630
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  66447 actgttgggtca-tgaggggagcttggataaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcgagagagacgctatactcttacccaaaaccttaag 66545  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    || ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  66546 gccatatgtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatggaacatataactcacacttgca 66630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 204
Target Start/End: Original strand, 24600321 - 24600472
Alignment:
Q  53 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||      
T  24600321 gtccacatcgaggctagaacaaccatactagcgagagagacaccacactcttacacaaaaccttaagacaatgagtttatgagttctcttacttataata 24600420  T
Q  153 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24600421 tgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 24600472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Original strand, 39066201 - 39066358
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |    
T  39066201 ggggaccgtc-acatcaaggctagaacaaccacataagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgattttatgggtcatcttagt 39066299  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39066300 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtggaatatataactcacacttgca 39066358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 236
Target Start/End: Original strand, 22077101 - 22077311
Alignment:
Q  37 gggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||  || |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22077101 gggagcctgggggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccgcataagtgagggagacgtcacactcttatccaaaaccttagggcaatgagtttatgggt 22077200  T
Q  137 cctcttacttataaggtgttcaacctttact----------attt--tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaag 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||          ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22077201 cctcttacttataaggtattcaacctttacttttctatccgattttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcaca-caacactccccctcaag 22077299  T
Q  225 tgtgagtccatc 236  Q
    |||| |||||||    
T  22077300 tgtgtgtccatc 22077311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 66100 - 66278
Alignment:
Q  57 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 156  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66100 acatcgaggccagaacaaccatacaagt--gagaggcgccacactcttacccaaaaccttaaggccataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 66197  T
Q  157 c-aacctttactattttatccgatgtgggacat-ataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    | |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  66198 caaacctttacttttctatccgatgtgagacatgattactcacacttgcaca-caacacttcccctcaagtgtgagtccatc 66278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5575284 - 5575110
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||||||||| ||||| ||| || ||||||  ||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  5575284 tgttgggtcactgaggagagtctgggggacattccacatcgaggctagaactacctcataag--agagagacgccacactcttatccaaaaccttaaagc 5575187  T
Q  122 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 198  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5575186 tatggatttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttctatccgacgtgggacatataattcaca 5575110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 237
Target Start/End: Original strand, 30630648 - 30630828
Alignment:
Q  56 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||  | || ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30630648 cacatcgaggccagaacaaccacataagtgatagggacgccccactcttacccaaaactttaaggcaatgtgtttatgggttctcttacttataaagtgt 30630747  T
Q  156 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
      |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30630748 caaacctttaattttttatccgatgtgagacatataaatcacacttgcaca-taacactccctctcaagtgtgagtccatca 30630828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 41184381 - 41184583
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagc-ctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacac---cacactcttacccaaaac-- 113  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||    ||||||||||||||||||      
T  41184381 actgttggatcagtgaggggagctcggggggaccgtcgacatcgaggctggaacaaccgcacaagtaagagcgacaatatcacactcttacccaaaacct 41184480  T
Q  114 ------------cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41184481 taaggctgaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactt 41184580  T
Q  202 gca 204  Q
    |||    
T  41184581 gca 41184583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 204
Target Start/End: Original strand, 24131965 - 24132143
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||||||||| ||||||| ||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  24131965 tgttgggtca-tgaggggggctcaggagatcgtctacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacact--tacccaaa-ccttaaggc 24132060  T
Q  122 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24132061 aatgagtttatggatccccttatttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgagggacatataactcacagttgca 24132143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Original strand, 44043810 - 44043944
Alignment:
Q  84 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct------ttactattttatccg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |      |||||||||||| ||    
T  44043810 caagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacatttactattactattttattcg 44043909  T
Q  178 atgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44043910 atgtgggacatataact-acacttgcaaaccaacac 44043944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22793431 - 22793279
Alignment:
Q  52 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa-tgggtttatgggtcctcttacttataa 150  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22793431 cgtccatattgaggccagaacaaccacacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccgtaaggcaaatgggtttatggatcctctcacttataa 22793332  T
Q  151 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 203  Q
     || |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22793331 agttttcaacctctacttttctatacgatgtgggacatataactcacacttgc 22793279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Original strand, 5528728 - 5528902
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||||||  ||||||| |  ||||  | |||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  5528728 actgttgggtcaggaaggggagtccggggggtcatccacatcgaggatagaacaaccgcataaagaagagagacgccacacatttacccaaaaccttaag 5528827  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 194  Q
      |||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5528828 aaaatgagtttatgagtcctcttatttataagatgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 5528902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 204
Target Start/End: Original strand, 22077818 - 22077986
Alignment:
Q  35 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 134  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||    
T  22077818 aggggagcctggaggaccgtccacatcgatgcttgaacaaccgcataagtgaaagagacgccacactcttaccccaaacctta-ggctatgagtttatgg 22077916  T
Q  135 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  22077917 gtcctcttacttataagatgttcaacctttatttttctatccgatttaaaacatataactcacacttgca 22077986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 19283434 - 19283613
Alignment:
Q  24 ttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 123  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  19283434 ttgggtca-tgaggggagtcaaggggacctcccacatccaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcga 19283532  T
Q  124 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    || ||||||| ||||||| | ||| || ||| |||||||  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19283533 tgagtttatgtgtcctctcatttacaaagtgctcaacctccacttttctatccggtgtgggacatataactcacacttgca 19283613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 45839779 - 45839629
Alignment:
Q  56 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 155  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  45839779 cacatcgaggccagaacaatcccacaagcaagagagacaccacaatcttacccaaaaccttaaggcattacatttatgggtcttcttacttataaggtgt 45839680  T
Q  156 tc-----aacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    ||     |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45839679 tcgattcaacctttatt-ttctatccgatgtgggacatataactcatacttg 45839629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 204
Target Start/End: Original strand, 21378035 - 21378199
Alignment:
Q  21 ctgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 120  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||                   
T  21378035 ctgttgggtcactg-ggggagcgcaggggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaatatagacgccacactctta--------------- 21378118  T
Q  121 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
       |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21378119 ---tgggtttatgggtcctcttacttataagatattcaacctttactgttctatccgatctgggacatataactgacacttgca 21378199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 11977102 - 11977015
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11977102 ggggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatg 11977015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44685605 - 44685456
Alignment:
Q  56 cacatcgaggctagaacaaccac-acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 154  Q
    |||||||||| |||||| ||| | |||||  ||| ||||  |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  44685605 cacatcgaggttagaactacccccacaagagagaaagacgtcacactgttacccaaa-cattaaggcaatgagtttattggtcctcttacttataaggtt 44685507  T
Q  155 ttcaa-cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44685506 ttcaaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 44685456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 204
Target Start/End: Original strand, 1188574 - 1188746
Alignment:
Q  33 tgaggggagcc-taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttta 131  Q
    ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||  ||| |||||||| |||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1188574 tgaggggagcccttggggaccgcacacatctaggtcagagcaaccacataagtgagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaagcaatgagttta 1188673  T
Q  132 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    || ||| ||| ||||||||  | ||||||||  ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1188674 tgagtcttctcacttataaaatattcaacctccacttttctatccgatatggaacatataactcacacttgca 1188746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 50051777 - 50051840
Alignment:
Q  172 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccat 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50051777 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacattccccctcaagtgtgagtccat 50051840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 134
Target Start/End: Original strand, 50051689 - 50051776
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 134  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  50051689 ggggaccgtccacatcgatgctagaacaac-acataaacaagagagacaccacactcttacgcaaaaccttaagataatgggtttatgg 50051776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 204
Target Start/End: Original strand, 1187349 - 1187522
Alignment:
Q  33 tgaggggagc-ctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaa-gcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||| | | || |  ||||||||  |||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||    
T  1187349 tgaggggagctctaggggaccgtccacatctaggtcagaacaactataaaaagtgagagagacgtcacacttttactcaaaatcttaaggtaatgagttt 1187448  T
Q  131 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||| |||||  ||| || ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1187449 atgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttatattcgatgtgagacatataattcacacttgca 1187522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 133
Target Start/End: Original strand, 47380143 - 47380254
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| || |||||| |||||  |||||||   |||||||||||||||||| |||||||    
T  47380143 tgttgggtcaattaggggagtctaggggaccacccacatctaggcttgagcaaccagacaagtgagagagatgtcacactcttacccaaaactttaaggc 47380242  T
Q  122 aatgggtttatg 133  Q
    |||| |||||||    
T  47380243 aatgagtttatg 47380254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 44092051 - 44091909
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 146  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||  ||| |||| ||||||||||||||| || |||||   | | | ||||||||| |||| ||||    
T  44092051 gggaccgtctacatcgaggccagaacaacaaaacaagtgagaaagacgccacactcttacccacaatcttaaaatattagatttatgggttctctcactt 44091952  T
Q  147 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacata 189  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||    
T  44091951 ataaagtgttcaacctttacttttacatctgatgtgtgacata 44091909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Original strand, 50469180 - 50469256
Alignment:
Q  145 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctca 222  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  50469180 ttataaagtgttcaacctttactttattatctgatgtaggacatataactcacacttgcaca-caacactccccctca 50469256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10351278 - 10351202
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 162  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  10351278 agagagacgccacactcttacccaaaatcttaaagtaatgtgtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacct 10351202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4956340 - 4956218
Alignment:
Q  57 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacac--cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 154  Q
    ||||||||| || | ||| | ||||||||||||| | ||  |||||| ||||| ||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  4956340 acatcgaggttaaagcaatcgcacaagcaagagatagacgtcacacttttacctaaaactttagagcaatgagtttatggatcctcttacttataagatg 4956241  T
Q  155 ttcaacctttactattttatccg 177  Q
    ||||||||||||| || ||||||    
T  4956240 ttcaacctttacttttctatccg 4956218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 253
Target Start/End: Original strand, 47379891 - 47379990
Alignment:
Q  152 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctcc 251  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| |||||| || || | ||||||||    
T  47379891 gtgttcaacctccacttttctatccgatgtgggatatataactcacacttgc--atcaacactccccctcaaatgtaagtccaacaattcatcgtgctcc 47379988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 204
Target Start/End: Original strand, 35154150 - 35154197
Alignment:
Q  157 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35154150 caacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 35154197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4878869 - 4878803
Alignment:
Q  138 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4878869 ctctcacttataaaatgttcaagcttcactattttatccgatgtggaacatataactcacaattgca 4878803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24448426 - 24448245
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 154  Q
    ||||||| ||||  |||||||| || |||  ||||| || ||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||    
T  24448426 ccacatctaggcctgaacaacctcataagtgagagacacgccacacttttatccaaaatcttaagacaatgagtttatgagccctctcacttataaaatg 24448327  T
Q  155 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    |||||| |  ||| || | |  |||||   |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24448326 ttcaacttccacttttctttgagatgtctaacatataacttacacttgcacac-aacactccccctcaattgtgagcccatca 24448245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 155
Target Start/End: Original strand, 41184152 - 41184197
Alignment:
Q  110 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41184152 aaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaagtgt 41184197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 105
Target Start/End: Original strand, 4266798 - 4266855
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctta 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4266798 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaac--cacaagtaagagagacatcacactctta 4266855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 204
Target Start/End: Original strand, 5996870 - 5997029
Alignment:
Q  44 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 143  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||| | ||||| |||||| |    
T  5996870 taggggactgcccacatctcggctagagcaaccacacaaatgagagagacaccacactctcactcaaaaccttaa-acaatggatatatggatcctctca 5996968  T
Q  144 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
     ||||||  ||||||| |   ||| || || |  |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5996969 tttataaaatgttcaagcaccacttttctaacttatgtgggacatataacccacgcttgca 5997029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 149
Target Start/End: Original strand, 35154046 - 35154106
Alignment:
Q  89 gagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 149  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  35154046 gagacaccacactcttgccaaaaaccttaagacaatcagtttatgggccctcttacttata 35154106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 212
Target Start/End: Original strand, 4266875 - 4266948
Alignment:
Q  139 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  4266875 tcttacttctaatgtgttcaacatttactcttttatctaatgtaggacatataactcacatttgtaaaacaaca 4266948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 9499136 - 9499020
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 146  Q
    ||||||||||||||  ||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||  | |||| ||||  ||||| |||| ||| || |    
T  9499136 gggaccgtccacatataggataaaacaaccacacaagtaaaagtgacaccacacttttatccaaaatttgaaggtaatgaatttataggtcatctaacat 9499037  T
Q  147 ataaggtgttcaacctt 163  Q
    ||||  |||||||||||    
T  9499036 ataaaatgttcaacctt 9499020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 12466401 - 12466365
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12466401 agagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggca 12466365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 30630912 - 30630972
Alignment:
Q  136 tcctcttacttataaggtgttcaaccttt-actattttatccgatgtgggacatataactc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||  ||||||||||||    
T  30630912 tcctcttacttataaggtgttcagcctttaatttttttatccgatgtaagacatataactc 30630972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 131
Target Start/End: Original strand, 9956212 - 9956258
Alignment:
Q  85 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttta 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  9956212 aagagagacatcacactcttacccaaaacattaagacaatgtgttta 9956258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 30697387 - 30697310
Alignment:
Q  34 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaa-gcaagagagacaccacactcttacccaaa 111  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | | ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30697387 gaggggagcct-ggggaccgcccacatctaggccatagcaaccacgcaaagtgagagagacaccacactcttacccaaa 30697310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 45084617 - 45084576
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgag 64  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45084617 tgttgggtca-tgagggaagcctaggggaccgtccacatcgag 45084576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 122
Target Start/End: Original strand, 31973375 - 31973411
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31973375 agagagacatcacactcttacccaaaatcttaaggca 31973411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 274
Target Start/End: Original strand, 41184198 - 41184254
Alignment:
Q  219 ctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgct-cccctagagcggaagctttttactt 274  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  41184198 ctcaagtgtgagtccatcacttcatcgtgctccccctcaagcggaagctctttactt 41184254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 50556587 - 50556451
Alignment:
Q  68 agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 167  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| |||  ||||||||||||  ||| |||||| || | |||| ||||||||  ||||||||||   ||    
T  50556587 agaacaatcacacaagtgagagagataccaaacttttattcaaaaccttaagaaaataggtttacggattctctcacttataaattgttcaacctccgct 50556488  T
Q  168 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
     || |||  |||||| || ||||||| ||||||||||    
T  50556487 tttctatatgatgtgtgatatataacccacacttgca 50556451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 81)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6500634 - 6500443
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500634 actgttgggtaagtgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 6500535  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500534 gcaatgggtttaaaggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttgcaaaccaaca 6500443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6501002 - 6500791
Alignment:
Q  24 ttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 123  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6501002 ttgggtaagtgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaa 6500903  T
Q  124 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaa 223  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6500902 tgagtttatgggtccttttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccatcaa 6500804  T
Q  224 gtgtgagtccatc 236  Q
    |||||||||||||    
T  6500803 gtgtgagtccatc 6500791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 33 - 253
Target Start/End: Original strand, 3295002 - 3295225
Alignment:
Q  33 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 132  Q
    ||||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3295002 tgaggggagcgagggggactgtccacatcgaggctacaacaaccacacaaccaagagagacaccacactcatacccaaaacctcaaggcaatgggtttat 3295101  T
Q  133 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac----caacactccccctcaagtgtg 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||    
T  3295102 gggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat-actcacacttgcacacacaacaacactccccctcaagtgtg 3295200  T
Q  229 agtccatcactttaacgtgctcccc 253  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  3295201 agtccatcactttttcgtgctcccc 3295225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 204
Target Start/End: Original strand, 40296292 - 40296473
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40296292 tgttgggtca-tgagggaggcctgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggc 40296390  T
Q  122 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40296391 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttttctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 40296473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Original strand, 27502013 - 27502202
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  27502013 tgttgggtca-tgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttaccaaaaatcttaaggc 27502111  T
Q  122 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27502112 aataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 27502202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 624379 - 624171
Alignment:
Q  21 ctgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 120  Q
    ||||||||||| |  |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  624379 ctgttgggtcactagggggagctcggggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacctcaagg 624280  T
Q  121 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccct 220  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  624279 ctatgggtttatgggtcatcttacttataacgtgttcaacctttactattttatacaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacacttcccct 624180  T
Q  221 caagtgtga 229  Q
    |||||||||    
T  624179 caagtgtga 624171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 50 - 212
Target Start/End: Original strand, 18603124 - 18603286
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 149  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18603124 accgtccacatcgaggctagaactaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 18603223  T
Q  150 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18603224 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgaaaactaaca 18603286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32487551 - 32487386
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487551 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagatacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 32487452  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487451 tat-aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 32487386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 46 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 41170792 - 41170627
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41170792 ggggaccgtctacaccgaggctagaacaaccacacaagcaagaaaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 41170693  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaac 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41170692 tataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacaattacaaaccaac 41170627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Original strand, 36492218 - 36492378
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  36492218 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaacctaaaggtaatgtgtttattggtcctcttactt 36492317  T
Q  147 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36492318 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 36492378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25328119 - 25327938
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328119 actgttgggtcactgaggggagctcgggggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 25328020  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25328019 gcattaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttactgttttatccgatgtaggacatataactcacactt 25327938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 231
Target Start/End: Original strand, 26074122 - 26074330
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 121  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||| |  ||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074122 tgttgggtcagagaggggagctttggggatcacccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 26074221  T
Q  122 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctc 221  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  26074222 aatgggttcatgggtcctcttacatatgaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcaca-caacactccccctc 26074320  T
Q  222 aagtgtgagt 231  Q
    ||||||||||    
T  26074321 aagtgtgagt 26074330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26074797 - 26074577
Alignment:
Q  19 tactgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 118  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |  |||| |  ||||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074797 tactattgggtcagagaggggagctttagggatcacccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 26074698  T
Q  119 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactcc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || |  ||||||||    
T  26074697 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttgtacacaaaaacactcc 26074598  T
Q  217 ccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26074597 ccctcaagtgtgagtccatca 26074577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 236
Target Start/End: Original strand, 13415750 - 13415951
Alignment:
Q  35 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 134  Q
    |||||||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13415750 aggggagccacggggaccg-ccatttcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaataggtttatgg 13415848  T
Q  135 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||| |||||||||||||||||    
T  13415849 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactaatttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacagcact-cccctcaagtgtgagtc 13415947  T
Q  233 catc 236  Q
    ||||    
T  13415948 catc 13415951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15370257 - 15370099
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  15370257 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctgtggatttatgggtcctcttact 15370158  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370157 tataagatgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 15370099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 3295345 - 3295498
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3295345 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaacacactcttacc-aaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttact 3295443  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3295444 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatat-actcacactt 3295498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 202
Target Start/End: Original strand, 42405574 - 42405752
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42405574 tgttgggtcactggggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagag--acaccacactcttacccaaaaccttaaggc 42405671  T
Q  122 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    | | |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42405672 attaggtttatgagtccttttacttgtaaggtgttcaacctttactattttatccgatgttggacatataactcacacttg 42405752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41632961 - 41632782
Alignment:
Q  24 ttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 123  Q
    |||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  41632961 ttgggtcattaaggggagc-tgggggaccgtccacatcgagactaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaagcat 41632863  T
Q  124 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41632862 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataacttacacttgca 41632782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Original strand, 9498655 - 9498821
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9498655 ggggaccgtccacattgaggctagaccagc-acataaacaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 9498753  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9498754 tataaggtgttcaacctttactattctatctgatgtgagacatataactcacatttgcaaaccaacac 9498821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Original strand, 1028492 - 1028673
Alignment:
Q  21 ctgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1028492 ctgttgggtcactgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttaccaaaaaccttaagg 1028591  T
Q  121 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
      || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1028592 ttataggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcatcctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 1028673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 34 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6224366 - 6224198
Alignment:
Q  34 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 133  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  6224366 gaggggagcctgggggaccgtccatattgaggctagaccaaccgcacaagcaactgaggcaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgagtttatg 6224267  T
Q  134 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6224266 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgaagtgggacatataactcacacttg 6224198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 197
Target Start/End: Original strand, 11416977 - 11417128
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11416977 ggggaccatccacatcgaagctagaacaatcccacaagcaagagagagatcacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttact 11417076  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11417077 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11417128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 204
Target Start/End: Original strand, 36568545 - 36568725
Alignment:
Q  22 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36568545 tgttgggtcattgaggggagctcgggggaccttccacatcgaggatagaacaaccacacaag--agagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggc 36568642  T
Q  122 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36568643 aatgggtttacgggtcatctcacttataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36568725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 299647 - 299490
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  299647 ggggactgtccacatcgatgctagaacaaccgtacaagcaatagagacgccacactcttacacaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcatcttact 299548  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  299547 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 299490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 194
Target Start/End: Original strand, 34753029 - 34753173
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34753029 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttcttacttata 34753128  T
Q  150 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 194  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  34753129 aggtgttcaacttttacttttctatccaatgtgggacatataact 34753173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Original strand, 12662652 - 12662810
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||  |||||||    
T  12662652 ggggaccgaccacatcgaggctagaagaaccccacaagcaagaaaggcaccacactcttacccaaaaacttaagacaatggatttatgggttttcttact 12662751  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12662752 tataaaatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 12662810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 53 - 202
Target Start/End: Original strand, 26075168 - 26075318
Alignment:
Q  53 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 151  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26075168 gtccacatcgaggctaaaacaaccacacttgcaagagagacgacacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 26075267  T
Q  152 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  26075268 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataaatcacacttg 26075318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Original strand, 24489194 - 24489394
Alignment:
Q  34 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 133  Q
    |||||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24489194 gaggggagtctgagggaccgcccacatcgagactagaacaaccgcacaagtaaaagagacgccacactcttacgcaaaatcttaaggcaatgggtttatg 24489293  T
Q  134 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtcc 233  Q
    |||  ||||||| |||||||||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24489294 ggt--tcttactaataaggtgtttaaccttttcttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg-aacacaacactccccctcaagtgtgagtcc 24489390  T
Q  234 atca 237  Q
    ||||    
T  24489391 atca 24489394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 35150165 - 35150007
Alignment:
Q  45 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 144  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  35150165 aggggacggtccacattgaggttagaacaaccacactagtgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtc-tcttac 35150067  T
Q  145 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35150066 ttataaggtgttcaaccttgactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 35150007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 72 - 237
Target Start/End: Original strand, 26074807 - 26074975
Alignment:
Q  72 caaccacacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatt 170  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  26074807 caaccacacttgcaagagagacgccacactctttacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcctacttatattgtgttcaacctttactctt 26074906  T
Q  171 ttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074907 ttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatca 26074975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 623976 - 623810
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||  ||||||    
T  623976 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggctataagtttatggctcaacttact 623877  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  623876 tgtaaagtgttcaacctttactattatatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 623810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15370573 - 15370428
Alignment:
Q  33 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 132  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15370573 tgaggggagcatggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccacactcttacgcaaaaccttaaggctatgggtttat 15370474  T
Q  133 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  15370473 gggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgtttcatccga 15370428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33747925 - 33747783
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 149  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33747925 accgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcctcttacttata 33747826  T
Q  150 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 192  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33747825 aagtatttaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 33747783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 207
Target Start/End: Original strand, 29549278 - 29549416
Alignment:
Q  69 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  29549278 gaacaaccacataagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggtaatgtgtttatgggtcttcttacttatatggtgttcatcctttacta 29549377  T
Q  169 ttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 207  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29549378 ttttatctgatatggaacatataactcacacttgcaaac 29549416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 212
Target Start/End: Original strand, 5723811 - 5723957
Alignment:
Q  66 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||   || |||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  5723811 ctagaacaaccgcacaagcaagagagacactatactctttcccaaaaccttaagacaataaattaatgggttctcttacatataatgtgttcaactttta 5723910  T
Q  166 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5723911 ttattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 5723957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 38427697 - 38427525
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 153  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| |    
T  38427697 tccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtgagagagacgtcacactcttacacaaaaccttaagacaatggattaatgggtcctc-tacttataagat 38427599  T
Q  154 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38427598 gttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcaca---------caacactccccctcaagtgtgagtccatc 38427525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 204
Target Start/End: Original strand, 26590918 - 26591068
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 153  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26590918 tccacatcgaggttagaacaaccacactagtgagagagacgccacactcttactcaaaaccttaaggcattgaatttatggatcctcttacttataaggt 26591017  T
Q  154 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||||||||| ||  || |||| ||| |||| ||| |||||||||||    
T  26591018 gttcaacctttacttttcgattcgatatggaacatttaaatcacacttgca 26591068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 301107 - 300961
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 147  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||        ||||||||||    
T  301107 ggaccgttcacgtcgagacttgaacagccacacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaatcttaaggcaatggatt--------ctcttactta 301016  T
Q  148 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  301015 taaggtattcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataacccacacttg 300961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 237
Target Start/End: Original strand, 36521922 - 36522086
Alignment:
Q  72 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 171  Q
    |||||||||||   |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |  |||||||||||  ||| ||     
T  36521922 caaccacacaaatgagagagatgacacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctctcatttaaagagtgttcaacctcaacttttc 36522021  T
Q  172 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36522022 tatctgatgtgggacatataactcacacttgcgca-caacactctccctcaagtgtgagtccatca 36522086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Original strand, 35167838 - 35167994
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||| || ||||    
T  35167838 ggggacagtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgtgagagacatcacactcttaccaaaaacatcaaggcaatagatttatgggtcatcctact 35167937  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || | |||||||| |||||    
T  35167938 tataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgagatacataactcatacttg 35167994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2411176 - 2411010
Alignment:
Q  35 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 134  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  2411176 aggggagcttgggggaccgtccatatcgaggttagaacaatcattcaagtaatagagaaactacactcttactcaaaaccttaaggcaataagtttatgg 2411077  T
Q  135 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
    || |||||||||| ||| |||||||| ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  2411076 gttctcttacttacaagatgttcaacttttacttctctatccaatgtaggacatataactcacactt 2411010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 270
Target Start/End: Original strand, 36522277 - 36522463
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||| |  | | || ||||| ||||| ||    
T  36522277 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaagataatgggtttattggtcctctcacttataaaatgttcaacttccatttttctatccaatgtgaga 36522376  T
Q  186 catataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtg---ctcccctagagcggaagcttttt 270  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||| | ||||||| || | ||||   |||||||  ||||||||||||||    
T  36522377 catataactcacactttcata-caacactccccctcaattgtaaatccatcaattcatcgtgttcctcccctcaagcggaagcttttt 36522463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35915007 - 35914852
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||| |||| | || ||| || | |||||||||||| |||||| ||||| |||| |  ||| |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  35915007 ggggaccgtccacattgaggtttgaccaatcatataagcaagagagataccacattcttatccaataatttagggcaatggatttacgggtcttcttact 35914908  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35914907 tataaaatgttcaacctttactcttttatccgatgtgtgacatataactcatactt 35914852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7768925 - 7768842
Alignment:
Q  129 ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7768925 ttatgggtccttttacttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtaggatatataactcacacttgaaaaccaaca 7768842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31509742 - 31509589
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 184  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||||||||| |    
T  31509742 agagagacactacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgag 31509643  T
Q  185 acatataactcacacttgcaaaccaaca--ctccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  31509642 acatataactcacacttgcaca-caacaatctctccctcaagtgtgagtccatca 31509589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 118
Target Start/End: Original strand, 26900007 - 26900089
Alignment:
Q  36 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 118  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26900007 ggggagcttgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaacccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 26900089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 109 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 42508707 - 42508614
Alignment:
Q  109 aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  42508707 aaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttattagatgtttaacctttacttttctatccgatgtgggatatataattcacacttg 42508614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26074398 - 26074320
Alignment:
Q  124 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26074398 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaatctttagttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 26074320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 201
Target Start/End: Original strand, 41635212 - 41635346
Alignment:
Q  67 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 166  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  41635212 tagagcaaccatacaagtaaaagagatactacactcttacctaaaattttaagacaatggatttatggatcctcttatttataaggtgttcaacatttac 41635311  T
Q  167 tattttatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
    | ||||||| |||| |  |||||||||||| ||||    
T  41635312 tcttttatctgatgggaaacatataactcatactt 41635346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 202
Target Start/End: Original strand, 13786002 - 13786157
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 146  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||| || |  ||  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| | |||| ||||| ||||||||    
T  13786002 gggaccgtcgacaacgaggccagaacaatcataatagtgagagagacatcacactcttatccaaaatcttaagacaatagatttacgggtcatcttactt 13786101  T
Q  147 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacat-ataactcacacttg 202  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||    
T  13786102 ataaagtgttcaaccatcact-ttttatccgatgtgaaacataattactcacacttg 13786157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 31509857 - 31509745
Alignment:
Q  79 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 177  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||||    
T  31509857 acaagcgagagagacaccacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccg 31509758  T
Q  178 atgtgggacatat 190  Q
    ||||| |||||||    
T  31509757 atgtgagacatat 31509745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 13042657 - 13042606
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 137  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13042657 agagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 13042606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 38427377 - 38427306
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctta 117  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  38427377 ggggaccgccaacatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaatctta 38427306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39309764 - 39309686
Alignment:
Q  123 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39309764 atgggtttatgg-tcctcttatttataatgtgttcaacatttacccttttatccgatgtgggacatataactcatacttg 39309686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 146
Target Start/End: Original strand, 13785631 - 13785732
Alignment:
Q  45 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 144  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||    
T  13785631 aggggaccgtccacatcgaagttagaacaaccatacaaacgagagaaacaccacacttttacttaaaaccttaaggttatgggtttatagatcctattac 13785730  T
Q  145 tt 146  Q
    ||    
T  13785731 tt 13785732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 120
Target Start/End: Original strand, 795254 - 795306
Alignment:
Q  68 agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  795254 agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaagg 795306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 133
Target Start/End: Original strand, 9498343 - 9498410
Alignment:
Q  66 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 133  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  9498343 ctagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttactcaaatgcttaaggcaatgggtttatg 9498410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Original strand, 36527117 - 36527196
Alignment:
Q  68 agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 147  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  36527117 agaacagccacacaagtgagagagacagcacactcttatccaaaatcttaaggcaatgcgtttatggatcctctcactta 36527196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 42524811 - 42524719
Alignment:
Q  109 aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |||||||| || |||||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42524811 aaaaccttcagacaatggatttatgagtcctcttattcataagatgttcaac-tttacttttctatccgatgtgagacatataattcacacttg 42524719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 32446003 - 32445943
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 146  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  32446003 agagagacaccacactttaacccaaaaccttaaggcgttgggtttatgggtcctctcactt 32445943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 13112651 - 13112604
Alignment:
Q  90 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13112651 agacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtc 13112604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 232
Target Start/End: Original strand, 13785732 - 13785794
Alignment:
Q  169 ttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtc 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||    
T  13785732 ttttatccgatttgggacatataactcacacttccaca-caacactccccctcaaatgtgagtc 13785794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6225104 - 6225047
Alignment:
Q  144 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  6225104 cttataaggtgttcaacctttattcttttatctgatgtgggatatataactcagactt 6225047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 164 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5660338 - 5660290
Alignment:
Q  164 tactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5660338 tactattttattcgatgtggaacatataactcacatttgcaaaccaaca 5660290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19275653 - 19275566
Alignment:
Q  79 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 167  Q
    |||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  19275653 acaagcgagacagacgccacaatcttacccaaaatcttaagacaatgaatttatgggtcttcttccttataa-gtgttcaacctctact 19275566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 13042822 - 13042784
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 124  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13042822 agagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaat 13042784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 13112820 - 13112782
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 124  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13112820 agagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaat 13112782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 35150789 - 35150747
Alignment:
Q  162 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35150789 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 35150747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 35151080 - 35151038
Alignment:
Q  162 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35151080 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 35151038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 42435583 - 42435486
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 146  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||  | |||||| |||||||||||    
T  42435583 ggaccgtccacatcgatgctagaacaaccacacttatgagagagacatcacactctgattcaaaaccttaaggtaat-agattatggatcctcttactt 42435486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 24489635 - 24489583
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactc 102  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24489635 accgttcatatcgaggttagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactc 24489583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15370426 - 15370380
Alignment:
Q  192 actcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370426 actcacacttgcacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatc 15370380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 137
Target Start/End: Original strand, 36389016 - 36389067
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 137  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  36389016 agagaaacaccacactctgacccaaaaccctaaggcactgagtttatgggtc 36389067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 5963795 - 5963765
Alignment:
Q  92 acaccacactcttacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963795 acaccacactcttacccaaaaccttaaggca 5963765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 150
Target Start/End: Original strand, 9510546 - 9510624
Alignment:
Q  72 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 150  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | | | ||||| ||||  |||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||    
T  9510546 caaccacacaagtaagagagacactatatttttacctaaaattttaaggcattaggtttatggctcctctcacttataa 9510624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 212
Target Start/End: Original strand, 22298956 - 22299014
Alignment:
Q  155 ttcaacctttactatttt-atccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22298956 ttcaacctttattatttttatctgatgtgagacatataacccacacatgcaaaccaaca 22299014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 106
Target Start/End: Original strand, 795152 - 795189
Alignment:
Q  70 aacaaccacacaa-gcaagagagacaccacactcttac 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  795152 aacaaccacacaaagcaagagagacaccacactcttac 795189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 5660405 - 5660340
Alignment:
Q  50 accgtccacatc-gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacc 114  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| ||| ||||||||    
T  5660405 accgtccacatttgaggctagaacaaccacacaaacaagaaaaacaccatacttttatccaaaacc 5660340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 34103666 - 34103625
Alignment:
Q  92 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 133  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  34103666 acaccacactcttattcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 34103625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 35150863 - 35150810
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccaca 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  35150863 ggggaccatccacatcgaggctaaaacaatcacactagtgagagagacaccaca 35150810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 41341567 - 41341523
Alignment:
Q  92 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 136  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  41341567 acaccacattcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtgtatgggt 41341523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 107)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36629418 - 36629205
Alignment:
Q  23 gttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 122  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36629418 gttgggtcattgaggggagcatgtgggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 36629319  T
Q  123 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctca 222  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  36629318 atgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg-aacacaacactccccctca 36629220  T
Q  223 agtgtgagtccatca 237  Q
    |||||||| ||||||    
T  36629219 agtgtgagcccatca 36629205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 214
Target Start/End: Original strand, 50630731 - 50630921
Alignment:
Q  24 ttgggtcagtgaggggagcctagg-ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50630731 ttgggtcagtgaggggag-ctaggcggaccgcccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 50630829  T
Q  123 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacact 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50630830 atgggtttatgggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacgcttgcaaaccaacact 50630921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25483519 - 25483336
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||||| || ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483519 actgttgggtcactg-ggggagccagggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 25483421  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25483420 gcaatgggtttatggatcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 25483336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41370515 - 41370349
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370515 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacactacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 41370416  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370415 tataaggttttcaacatttactattttatccgatttgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 41370349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 212
Target Start/End: Original strand, 55933113 - 55933288
Alignment:
Q  37 gggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 136  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55933113 gggagcttgggggaccgtccacatcgaggctagaacaactgtacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggt 55933212  T
Q  137 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55933213 cctcttacttataaggtgttcaacccttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcaaaccaaca 55933288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44620830 - 44620587
Alignment:
Q  33 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 132  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  44620830 tgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggatataacaaccgcacaagcaagagagaaaccacactcttacccaaaaccttaaggttatgg-tttat 44620732  T
Q  133 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgag 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||| |||||||||||||    
T  44620731 gggtcctcttacttataaagtgttcaacctctactatttcatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacgacactccacctcaagtgtgag 44620632  T
Q  231 tccatcactttaacgtgct-cccctagagcggaagctttttactt 274  Q
    ||||||| || | |||||| |||| | |||||||||| |||||||    
T  44620631 tccatcaattcatcgtgctcccccaaaagcggaagctctttactt 44620587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10246103 - 10245920
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10246103 actgttgggtcagcgaggggagcttgggggagcgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagggagacaccacactcttacccaaaaccttaag 10246004  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10246003 gctttgggtttat-ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggggcatataactcacacttgca 10245920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39404555 - 39404334
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39404555 gggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacattcttgcccaaaaccttaaggctataggtttatgggtcctcttactt 39404456  T
Q  147 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaac 244  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| |||||||||| ||||||||| || | |    
T  39404455 ataaggtgttccacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacactcctcctcaagtgt-agtccatcaattcatc 39404357  T
Q  245 gtgctc-ccctagagcggaagct 266  Q
    |||||| ||||  ||||||||||    
T  39404356 gtgctctccctcaagcggaagct 39404334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 204
Target Start/End: Original strand, 54017596 - 54017751
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017596 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacatcacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 54017695  T
Q  149 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  54017696 aagatgttcaacctttactattttatctgacgtgggacatataactcacacttgca 54017751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 22027935 - 22028150
Alignment:
Q  21 ctgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22027935 ctgttgggtca-tgaggggagcctgagggactgtccacatcgagactaaaacaaccacataagcgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaagg 22028033  T
Q  121 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactcccc 218  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| || |    
T  22028034 caatatgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttcgtattttatccgatgtgggacatataagtcacacttgcacacaacaacacccctc 22028133  T
Q  219 ctcaagtgtgagtccat 235  Q
    || ||||||||||||||    
T  22028134 cttaagtgtgagtccat 22028150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 56 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 54109060 - 54108888
Alignment:
Q  56 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 155  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54109060 cacatcgaagctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaac-ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 54108962  T
Q  156 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  54108961 tcaacctttactattttatccgatgtgggac--ataactgacacttgcaca-caacactcccccttaagtgtgagtc 54108888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3340990 - 3340807
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||||| || |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3340990 actgttgggtcactg-ggggagctcaggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaag 3340892  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3340891 gcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgctcaacctttactctttcatctgatgcgggacatataactcacacttgca 3340807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 204
Target Start/End: Original strand, 1731646 - 1731803
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 146  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  1731646 gggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttattt 1731745  T
Q  147 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1731746 ataagatgttcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataactcacatttgca 1731803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 33 - 202
Target Start/End: Original strand, 39792845 - 39793014
Alignment:
Q  33 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 132  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  39792845 tgaggggagctcagaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttac 39792944  T
Q  133 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39792945 ggttcctctttcttataaggtgttcaacatttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 39793014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 46 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 50002584 - 50002423
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  50002584 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttact 50002485  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 207  Q
    || || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50002484 taaaaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaac 50002423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 34 - 204
Target Start/End: Original strand, 36608647 - 36608817
Alignment:
Q  34 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 133  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  36608647 gaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatg 36608746  T
Q  134 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36608747 gatcctcttacttatgaggtgttcaacttttactcttttatccgatgttggacatataactcacacttgca 36608817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39404202 - 39404020
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  39404202 actgttggattagtgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaat 39404103  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    || ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  39404102 gctatgagtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttattcaatgtaggacatataactcacacttg 39404020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 52884844 - 52884695
Alignment:
Q  56 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 154  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  52884844 cacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatcgatcatcttacttataaggtg 52884745  T
Q  155 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884744 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 52884695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 56 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 52885038 - 52884856
Alignment:
Q  56 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagaga--caccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52885038 cacatcgaggctagatcaaccacacaaataagagagagacaccacattcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataagg 52884939  T
Q  153 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtcca 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  52884938 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacact-cccctcaagtgtgagtcca 52884856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 232
Target Start/End: Original strand, 18932747 - 18932943
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18932747 ggggaccgtacacatcgaggctataacaaccactcaagtaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttatt 18932846  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttat-----------ccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtc 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18932847 tataaggtattcaacctttactattttatccgatgtaggaccgatgtgggacatataactcagacttgcaaaccaacac-ccccctcaagtgtgagtc 18932943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 22028340 - 22028527
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctagggg-accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22028340 actgttgggtcagtgaggggagctttgggggaccgtccacattgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacattaa 22028439  T
Q  119 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta--ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  22028440 gacaatgagtttatgggtcctcttactaataaggtgttcaacctttatttttttttatccgatgtaggacatataagtaacacttgca 22028527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 202
Target Start/End: Original strand, 34646648 - 34646803
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 146  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  34646648 gggaccgtccacaacaaggctagaacaaccacacagaccagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttagtt 34646747  T
Q  147 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34646748 ataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 34646803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 49880297 - 49880152
Alignment:
Q  66 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 165  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49880297 ctagaacaac-acataaacaagagagacaccacgctcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 49880199  T
Q  166 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49880198 ctattttattcaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 49880152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 50459878 - 50459724
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  50459878 gggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacgctcttacctaaaaccttaagataatgggtttatgagtcctcttactt 50459779  T
Q  147 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  50459778 ataagatgttcaacctttactcttttaaccgatgtggaacatataactcacactt 50459724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 194
Target Start/End: Original strand, 54343006 - 54343147
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||    
T  54343006 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-------gggtcctcttact 54343098  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54343099 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 54343147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 44620511 - 44620362
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  44620511 ggggaccgtccacatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagaaacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggctctcttatt 44620412  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 195  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  44620411 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataactc 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 36572177 - 36572021
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  36572177 ggggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcgagagagacaccatactctaacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcttcttact 36572078  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36572077 tataaggtgttcaacatttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttg 36572021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 204
Target Start/End: Original strand, 22183253 - 22183420
Alignment:
Q  37 gggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 136  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22183253 gggagtctgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 22183352  T
Q  137 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22183353 ccttttacttataaattgttcaacatttactcttttatccgatgtgggatatataactcacacttgca 22183420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 54936379 - 54936215
Alignment:
Q  19 tactgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 118  Q
    ||||||||||||| || |||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54936379 tactgttgggtcactg-ggggagctcgggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 54936282  T
Q  119 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54936281 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtggga 54936215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 204
Target Start/End: Original strand, 4955332 - 4955473
Alignment:
Q  63 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 162  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4955332 aggctagagcaaccgcacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacct 4955431  T
Q  163 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4955432 taactattttatccgatatgagacatataactcacacttgca 4955473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 51 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20826370 - 20826186
Alignment:
Q  51 ccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 150  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20826370 ccgtccacatcgaggctagaacaatcgcataaggaagagagacatcacactcttacctaaaatgttaaggctatgggtttatgggttctcttacttataa 20826271  T
Q  151 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20826270 cgtgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcaca-tttctacataacactccccctcaagtgtgagtccatc 20826186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 44621160 - 44621011
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||    
T  44621160 ggggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgtgccctcttact 44621061  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  44621060 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggtcatacaactc 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 49076805 - 49076986
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||||| |||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49076805 actgttgggtca-tgaggg-agctcaggggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaaagacaccacactctaacccaaaaccttaag 49076902  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||    
T  49076903 gttatgggtttatgggttctcttac-tataaggtgttcaacctttactattttagccaatatggaacatataactcacacttgca 49076986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20826020 - 20825842
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||| ||| ||| |||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20826020 actgttggatcattgaagggagcatgggggactgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaag 20825921  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 198  Q
    || |  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20825920 gctaaaggtttatgggtgctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcaca 20825842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 236
Target Start/End: Original strand, 3244448 - 3244638
Alignment:
Q  45 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 144  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3244448 aggggactgcccacatcgaggctggaacaaccatacaagtgagagagacgacacattcttacccaaaactttaagacaatgagtttatgggtcctcttac 3244547  T
Q  145 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  3244548 ttataagatgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgcaca-caacactctcccttaagcgtgagtccatc 3244638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 203
Target Start/End: Original strand, 16888804 - 16888971
Alignment:
Q  36 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 135  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||    
T  16888804 ggggagcttaggggaccgtctacatcgaaactagaacaatcgcacaaacaagagagacatcacactcttacccaaaaccgtaagacaatgagtttatagg 16888903  T
Q  136 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 203  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16888904 ttctcttacttataaggtattcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgc 16888971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 53 - 204
Target Start/End: Original strand, 32941128 - 32941279
Alignment:
Q  53 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  32941128 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagccctcttatttataagg 32941227  T
Q  153 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32941228 tgttcaacctttactgttctttccgatgtaagacatataactcacacttgca 32941279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 241
Target Start/End: Original strand, 49076449 - 49076643
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||| ||||||| | ||  |||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  49076449 ggggaccgtccacatcgaggctataacaatcgcataagcgagacagacaccgccct--tacccaaa-ctttaagacaatgggtttataggtcctcttact 49076545  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatcacttt 241  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49076546 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatatggtacatataactcacacttgcacacaacaacactcctcctcaagtgtgagtccatcacttt 49076643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 49303065 - 49302907
Alignment:
Q  45 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 144  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49303065 aggggatcgtccacatcgaggatagaacaatcgcataagtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 49302966  T
Q  145 --ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 201  Q
      ||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  49302965 ttttataagatgttcaacctttacttttttatttgatgtgggacatataactcacactt 49302907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2741180 - 2741039
Alignment:
Q  95 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2741180 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggagttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattctatctgatgtgggacatataact 2741081  T
Q  195 cacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    |||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2741080 cacacttgcaca-taacactccccttcaagtgtgagtccatca 2741039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 54108694 - 54108537
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-ggtttatgggtcctcttac 144  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||    
T  54108694 ggggaccg-ccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttagccaaaaccttaaggcaatgaattttatgggtccttttac 54108596  T
Q  145 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||    
T  54108595 ttataaggtgttcaacctttactattttatcctatatgggac--ataactcacacttgcaa 54108537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2740869 - 2740700
Alignment:
Q  33 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 132  Q
    ||||||||||   ||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||    
T  2740869 tgaggggagctcgggggaccatccatatcgaggctagaacaaccaca--agtgagagagacgccacactcttacgtaaaaccttaaggctctgggtttat 2740772  T
Q  133 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2740771 aggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 2740700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3341286 - 3341083
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||   |||||||||||||||||    
T  3341286 ggggaccgtctacatcgaggttaaaataaccacataattaagaaagacatcacactcttacccaaaatcttaaaacaatgatgttatgggtcctcttact 3341187  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaa 243  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  3341186 tataaagtgtttaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacactctgcctcaagtgtgagtccatcactttat 3341087  T
Q  244 cgtg 247  Q
    ||||    
T  3341086 cgtg 3341083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 203
Target Start/End: Original strand, 16889535 - 16889691
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 146  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  |||||||||||    
T  16889535 gggaccgtccacatcgaggttagaacaatcacacaaggaagagagacaccatactcttacccaaaactttaaggcagtaggtttatgaatcctcttactt 16889634  T
Q  147 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 203  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16889635 ataaggtattcaacctttacttttctatccgatttgagacatataactcacacttgc 16889691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 45496934 - 45496820
Alignment:
Q  75 ccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45496934 ccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacgattttat 45496835  T
Q  175 ccgatgtgggacata 189  Q
    |||||||||||||||    
T  45496834 ccgatgtgggacata 45496820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 204
Target Start/End: Original strand, 4390102 - 4390257
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 148  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | | | || |||||||||||||    
T  4390102 gaccgtccgcatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaacgcaatgtgctaaaggatcctcttacttat 4390201  T
Q  149 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  4390202 aaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggatatgtaactcacacttgca 4390257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43174677 - 43174480
Alignment:
Q  33 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 132  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  || |||||||    
T  43174677 tgaggggagc-tagggaaccgtccacatcaaggctacaacaaccatataaacaagagagacgccacactcttacccaacactttaaggtcataggtttat 43174579  T
Q  133 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact-attttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtg 228  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||    
T  43174578 gtgtcctcttacttataaggtgttcaacctttactctttttatctgatgtgtggcatataactcacacttgtacacaacaacactccccctcaagtgtg 43174480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 236
Target Start/End: Original strand, 45489331 - 45489522
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 146  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||  || | |||||| | || |||||||||    
T  45489331 gggaccatccacatcgaggctagaacaatcacactagcaaaagagacatcacactcttaccaaaaatcttaaa-cagtaggtttaagagttctcttactt 45489429  T
Q  147 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacact-ccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  || | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45489430 atatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataattcacacttgtacacaacaacactcccccctcaagtgtgagtccatc 45489522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Original strand, 23817679 - 23817783
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23817679 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgaatcctcttact 23817778  T
Q  146 tataa 150  Q
    |||||    
T  23817779 tataa 23817783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 54741152 - 54741334
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||   |||||| || |||  |||||||||||||| ||||  |  ||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  54741152 actgttgggtcactgaggggagcccgagggaccatctacactgaggctagaacaacaacacgtg--agagagagactacactcttatccaaaaccttaag 54741249  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
     ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  54741250 acaatctgtgtatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataattcacacttgca 54741334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 202
Target Start/End: Original strand, 41707503 - 41707618
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 185  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41707503 agagagacaccacactcttacc-aaaaccttaagacaatgagtttatgggttcttttacttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggga 41707601  T
Q  186 catataactcacacttg 202  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707602 catataactcacacttg 41707618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 81 - 212
Target Start/End: Original strand, 6975489 - 6975620
Alignment:
Q  81 aagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatg 180  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6975489 aagcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaagataatggatttatgagtcctcttacttataagatattcaacctttactattttatcggatg 6975588  T
Q  181 tgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6975589 tgagacatataactcacatttgcaaactaaca 6975620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 204
Target Start/End: Original strand, 34004586 - 34004739
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  34004586 gaccgttcacatcgaggctagaacaaccgcacaagggagagagacggcacactcttatcgaaaaccttaagg-aatgagtttatgggtcctcttacttat 34004684  T
Q  149 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34004685 aagttgttcaacctttagt-ttttatcatatgtgtgacatataactcacacttgca 34004739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 58 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19504842 - 19504707
Alignment:
Q  58 catcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||         ||||||    
T  19504842 catcgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaatagatttatgggtcctctt---------gtgttc 19504752  T
Q  158 aacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19504751 aacttttactattttatccgatatgggacatataactcatacttg 19504707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10246436 - 10246253
Alignment:
Q  115 ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caaca 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||| ||  || ||    
T  10246436 ttaaggctatgggtttatgggtcctctaacttataagatgttcaacctttactcttttatccgatttgagacatataacagacacttgcacacaacagca 10246337  T
Q  213 ctccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctcccctagagcggaagctttttacttttgcatgtatcgccattgctgcacaaggagccacttg 311  Q
    |||||||||||| |||||||              |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10246336 ctccccctcaagcgtgagtc--------------gctcccctagagtggaagctttttac-tttgcatgtatagccattgctgcacaagaagccacttg 10246253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 49 - 204
Target Start/End: Original strand, 51768061 - 51768216
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 148  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || ||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  51768061 gaccgtccacatcgaggttagaacaatcccataagtaagagagacatcgtacttttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgagtcctcttatttat 51768160  T
Q  149 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||||||| |||||| || ||| |||| | |||||||||||||||| |||||    
T  51768161 aaggtgttcaacatttactcttatattcgatataggacatataactcacatttgca 51768216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3700512 - 3700365
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||        ||| ||||||||    
T  3700512 gaccgtccacatcgaggcttgaataaccacacaaatgagagagacatcatactcttatccaaaaccttaaggcaatgagt--------ccttttacttat 3700421  T
Q  149 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3700420 aaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 3700365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 18879962 - 18879852
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  18879962 ggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaaccaaaagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttataggtcatcttactta 18879863  T
Q  148 taaggtgttca 158  Q
    |||||||||||    
T  18879862 taaggtgttca 18879852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 43827597 - 43827480
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  43827597 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatcc-aaaccttaaggcaatgaatttatgggtcctcttatt 43827499  T
Q  146 tataaggtgttcaaccttt 164  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  43827498 tataaggagttcaatcttt 43827480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31691306 - 31691203
Alignment:
Q  52 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga--gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 149  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31691306 cgtccacatcgaggctagaacaatcgtacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttata 31691207  T
Q  150 aggt 153  Q
    ||||    
T  31691206 aggt 31691203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44621492 - 44621353
Alignment:
Q  138 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccat 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  44621492 ctcttacttataaggtgtttaacctttactgttttatcccatgttggacatataactcacacttgcacacaacgacactccccctcaagtgtgagtccat 44621393  T
Q  236 cactttaacgtgct-cccctagagcggaagctttttactt 274  Q
    || || | |||||| |||| | |||||||||| |||||||    
T  44621392 caattcatcgtgctcccccaaaagcggaagctctttactt 44621353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 191
Target Start/End: Original strand, 54017750 - 54017845
Alignment:
Q  96 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 191  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  54017750 cacactcttacctaaaaccttaagacaatgggaatatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggatatata 54017845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 40067181 - 40067045
Alignment:
Q  67 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac-cttta 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  40067181 tagaacaaccacataagcaagagagacatcacacttttacccaaaatcttaaggtagtggatctatgtgtcctcttacttataatgtgttcaacttttta 40067082  T
Q  166 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40067081 cacttttatccgatgtagaacatataactcacacttg 40067045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28034387 - 28034229
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||| |||||||| || | ||| ||||| || |||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||    
T  28034387 ggggaccatccacatccagaccagagcaaccgcataagtgagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggttctctcact 28034288  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28034287 tataaagtgttcaacctccacttttctatccgatgcgggacatataattcacacttgca 28034229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 183
Target Start/End: Original strand, 48111696 - 48111833
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||   |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||    
T  48111696 ggggaccgtccacattgaggttagaaaaaccacatttgtgagagagacaccacactcatacctaaaaccttaaggtaatggatttataagtccttttact 48111795  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 183  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  48111796 tataatgtgttcaacctttactcttttatccgaggtgg 48111833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 3271947 - 3271806
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaa-gagagacac-cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3271947 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacataataaacgagagagacacacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggttctctta 3271848  T
Q  144 ctt---ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 182  Q
    |||   |||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||    
T  3271847 cttataataaggtgtttaacttttacttttctatctgatgtg 3271806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 760356 - 760194
Alignment:
Q  35 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 134  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||   ||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  760356 aggggagcccaggggaccacccacatccagta-agagcaaccacacaaatgagagagacaccacacttttacc-aaaatcttaaggcaatgagtttatgg 760259  T
Q  135 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 199  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||||||| | | || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  760258 gtcctctcacttataaagttctcaaccttcatttttctattcgatgtgggacatataactcacac 760194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 162
Target Start/End: Original strand, 15841383 - 15841482
Alignment:
Q  63 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 162  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| || |||||||||||    
T  15841383 aggctagagcaaccacacaagtgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgaatcctctcacttacaaagtgttcaacct 15841482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 212
Target Start/End: Original strand, 50788087 - 50788147
Alignment:
Q  152 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50788087 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataacttacacttgcaaaccaaca 50788147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 44620362 - 44620304
Alignment:
Q  138 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44620362 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcccatgtgggacatataactca 44620304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 204
Target Start/End: Original strand, 23556890 - 23557022
Alignment:
Q  72 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 171  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||  ||| ||     
T  23556890 caaccacacaagtaagagagacgtcacactcttatccaaaactttaaggcaatgattttatggattctcttatttataaaatgttcaacctccacttttc 23556989  T
Q  172 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  23556990 tatccgatgtaaaacatttaactcacacttgca 23557022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 198
Target Start/End: Original strand, 45489712 - 45489864
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||| || || |||||||    
T  45489712 ggggatcggccacatcgagactagaacaaccatgcaagcgagagagacaccacactattacccaaaaccttaaactttaaggtttaaggatcatcttact 45489811  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 198  Q
    |||| | | ||||| ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  45489812 tatatgatattcaatctttactcttttatccaatgtgatacatataactcaca 45489864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 43174299 - 43174233
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  43174299 ggggaccgtccacatcaaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 43174233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11197344 - 11197293
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11197344 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 11197293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34544225 - 34544107
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||  ||| || ||| ||||||| |    
T  34544225 agagagataccacactcttacccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcatttataaagtgatcaacctccacttttctattcgatgtgag 34544126  T
Q  185 --acatataactcacactt 201  Q
      | |||||||||||||||    
T  34544125 atatatataactcacactt 34544107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 179
Target Start/End: Original strand, 39698944 - 39699077
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt--aaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||  || |  | || ||||||| ||||||||||    
T  39698944 ggactgtccacatcgagactagaataaccgcacaagcaagagagatgctacactcttactcaaaaccttaaaacgacacggatttatggatcctcttact 39699043  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgat 179  Q
    || ||  ||||||||||||||| || ||||||||    
T  39699044 tagaatatgttcaacctttacttttatatccgat 39699077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44621011 - 44620926
Alignment:
Q  138 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatg-tgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  || | |||||||||||||    
T  44621011 ctcttacttataaggtgttcaacctttacagttttatccgatgttgggacatctaactcacacttgtccacaacaacactccccct 44620926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 141
Target Start/End: Original strand, 11783526 - 11783646
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||  ||||||| |||||||| |||| | |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |    
T  11783526 actgttgggtca-tgaggggtgccagggggaccacccacatctaggctagagcaactatacaagcgagagaaacgacacactcttacccaaaactttatg 11783624  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctct 141  Q
    ||||| ||| ||||||||||||    
T  11783625 gcaataggtgtatgggtcctct 11783646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Original strand, 23817428 - 23817498
Alignment:
Q  19 tactgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagag 91  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23817428 tactgttgggtcactg-ggggagcct-gggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagag 23817498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41370738 - 41370673
Alignment:
Q  167 tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtcc 233  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41370738 tattttatccgatatgggatatataactcactctttcaaaccaacact-cccctcaagtgtgagtcc 41370673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 41370812 - 41370738
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||| |||| |||||||||||    
T  41370812 accgtccacatcgaggttagaacaaccactcaagtaagagagacatcacatttttacctaaaatcttaaggcaat 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 204
Target Start/End: Original strand, 11348396 - 11348484
Alignment:
Q  116 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||||||||  | ||||| |||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||    
T  11348396 taaggcaatgaatatatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccactattttatctgatgtagaacatataactcacaattgca 11348484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 198
Target Start/End: Original strand, 15841023 - 15841134
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 185  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||| |||  ||| || |||| ||| |||||    
T  15841023 agagagacaatacactcttacccaaaac-ttaaagcaatgggtttatagatcctctcacttataaaatgttcagcctccacttttctatctgatatggga 15841121  T
Q  186 catataactcaca 198  Q
    ||||||| |||||    
T  15841122 catataattcaca 15841134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 274
Target Start/End: Original strand, 16889315 - 16889383
Alignment:
Q  208 caacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaa-cgtgct-cccctagagcggaagctttttactt 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  16889315 caacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaatcgtgctccccctcaagcggaagctctttactt 16889383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 10396249 - 10396198
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 137  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10396249 agagagacaccaccctcttacctaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 10396198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 10396534 - 10396483
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 137  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10396534 agagagagaccacactcttatccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 10396483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 922537 - 922485
Alignment:
Q  85 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  922537 aagagagacaccacactcttatccaaacccctaagacaatgggtttatgggtc 922485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1868158 - 1868119
Alignment:
Q  97 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1868158 acactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggt 1868119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 19895445 - 19895406
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagaca 94  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19895445 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagaca 19895406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 146
Target Start/End: Original strand, 11706584 - 11706641
Alignment:
Q  88 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 146  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||    
T  11706584 agagacgccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttat-agtcctcttactt 11706641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 51681650 - 51681604
Alignment:
Q  92 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcc 138  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  51681650 acaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtatatgagtcc 51681604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 90
Target Start/End: Original strand, 11702284 - 11702341
Alignment:
Q  33 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga 90  Q
    ||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11702284 tgaggggagcgagggggactgttcacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaga 11702341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 150
Target Start/End: Original strand, 2891864 - 2891924
Alignment:
Q  90 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 150  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||    
T  2891864 agacatcacactttaacccaaaaccttaagacattaggtttatggatcctcttacttataa 2891924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 45050649 - 45050601
Alignment:
Q  156 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45050649 tcaacctttactcttttatttgatgtgagacatataactcacacttgca 45050601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 45496734 - 45496678
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaacc 76  Q
    |||||||||||||| ||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45496734 actgttgggtcagtaaggggagctcgagggaccgtctacatcgaggctagaacaacc 45496678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 126
Target Start/End: Original strand, 50787996 - 50788072
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgg 126  Q
    |||||| |||| || | |||| |||||| | |||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  50787996 accgtctacattgaagttagagcaaccaaataagcgacagagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaatgg 50788072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10246237 - 10246187
Alignment:
Q  260 ggaagctttttacttttgcatgtatcgccattgctgcacaaggagccacttg 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  10246237 ggaagctttttacttt-gcatgtatagccgttgctgcacaagaagccacttg 10246187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11197054 - 11197003
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 137  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||    
T  11197054 agagagacacctcactcttacctaaaatcctaaggcaatgggtttaagggtc 11197003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 212
Target Start/End: Original strand, 18933103 - 18933134
Alignment:
Q  181 tgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18933103 tgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 18933134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 45484817 - 45484774
Alignment:
Q  106 cccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 149  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  45484817 cccaaaaccttaaggcattgggtttatgggttctctcacttata 45484774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 160
Target Start/End: Original strand, 31249896 - 31249970
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 160  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||| | | | || | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  31249896 agagagagaccacactttaacccaaaacttgacgtcattaggtttatgggtcctctaacttataaagtgttcaac 31249970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 128
Target Start/End: Original strand, 41707279 - 41707321
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggt 128  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  41707279 agagagataccacacttttacccaaaaccttaaggtaatgggt 41707321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 204
Target Start/End: Original strand, 11706636 - 11706677
Alignment:
Q  163 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11706636 ttacttttttatccgatgtgggacatacaactcacccttgca 11706677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 19895570 - 19895533
Alignment:
Q  56 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagac 93  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19895570 cacatcgaagctagaacaaccacacaagcaagatagac 19895533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 29802637 - 29802604
Alignment:
Q  108 caaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctct 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29802637 caaaaccttaaggcattgggtttatgggtcctct 29802604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 1731581 - 1731621
Alignment:
Q  36 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaacc 76  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1731581 ggggagcctgggggaccatccacatcgaggctagaataacc 1731621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 122
Target Start/End: Original strand, 34946151 - 34946187
Alignment:
Q  86 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34946151 agagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggca 34946187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Original strand, 1082 - 1298
Alignment:
Q  21 ctgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 120  Q
    ||||||||||| || ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1082 ctgttgggtcactg-ggggagcttggggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataaacaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaagg 1180  T
Q  121 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactcccc 218  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||||| |||||    
T  1181 caatgggtttatgagtcctttttcttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacattcccc 1280  T
Q  219 ctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1281 ctcaagtgtgagtccatc 1298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Original strand, 1658 - 1802
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacaca--------agcaagagagacaccacactcttacccaaa 111  Q
    ||||||||||||  |||||||||   |||||| | ||||||||||||||||||||||||||         ||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  1658 actgttgggtcac-gaggggagctagggggactgcccacatcgaggctagaacaaccacacttgtgtgagagagagagagacaccacactcttaccaaaa 1756  T
Q  112 accttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1757 accttaaggcaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgttc 1802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 237
Target Start/End: Original strand, 3092 - 3178
Alignment:
Q  153 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3092 tgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgcacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatca 3178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Original strand, 514 - 670
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  514 ggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 613  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  614 tataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttg 670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 46 - 235
Target Start/End: Original strand, 147 - 330
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||   |||| ||||||| ||||||||||    
T  147 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaa-cctaaagt--atgg-tttatgg-tcctcttact 241  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  242 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccc-caaatgtgagtccat 330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 84 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5477 - 5247
Alignment:
Q  84 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 183  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5477 caagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgg 5378  T
Q  184 gacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctcccc--tagagcggaagctttttacttttgca 279  Q
     |||||||||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||  |  ||||||||| | |||| |||||     
T  5377 aacatataactcacacttgcacacaacaaaactctccctcaagtgtgagtccatcagttcatcgtgctcccccttcaagcggaagc-tcttac-tttgcc 5280  T
Q  280 tgtatcgccattgctgcacaaggagccacttgc 312  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5279 tgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgc 5247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5166 - 4982
Alignment:
Q  20 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 119  Q
    |||||||||||| | |||||||   |||| |  |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5166 actgttgggtcacttaggggagaaaagggaatggtccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccataag 5067  T
Q  120 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||| | || |||||||||| || | ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5066 gcaatgagtttatgggtctttttacttataagatattaaacctttactgttctctccgatgtgagacatataattcacacttgca 4982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5931 - 5742
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaac-----cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 149  Q
    ||||||||| | | |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5931 ccacatcgaagtttgaacaaccccacaagtaaaagagacaccacactcttactcaaaatttaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 5832  T
Q  150 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5831 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacatataactcacacttgcacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatca 5742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5546 - 5396
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 153  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5546 ccacatcgaggcttgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaactttaagacaatatgtttatgggccctcttacttataaggt 5447  T
Q  154 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5446 gttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 5396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 88 - 236
Target Start/End: Original strand, 17496 - 17648
Alignment:
Q  88 agagacaccacactcttacccaaaa--ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 185  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17496 agagacaccatactcttacccaaaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgtga 17595  T
Q  186 catataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatc 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17596 catataactcacacttgcacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatc 17648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 47518 - 47360
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  47518 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcgcaagcaagagagacaccacatttttacccaaaactttaaggcaatgggtttatggattctcttact 47419  T
Q  146 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  47418 tataaggtgttcaaactttactattttatcggatgtgagacatttaattcacacttgca 47360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 202
Target Start/End: Original strand, 10192 - 10267
Alignment:
Q  127 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10192 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttaccattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 10267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39588 - 39459
Alignment:
Q  72 caaccacacaagcaagagagacacc-acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatt 170  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||    
T  39588 caaccacacaagcaagagagacgccaacacttttacccaaaa-cttaaggcaacatgtttatagttcctctcacttataaggagttcaacctccactttt 39490  T
Q  171 ttatccgatgtgggacatataactcacacttg 202  Q
     ||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  39489 ctatgcg-tgtgagacatataactcacacttg 39459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39963 - 39805
Alignment:
Q  79 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 178  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||| ||||||  |||||| |||  ||||||   || ||| |||||||| | || |||||   ||| || |||||||    
T  39963 acaagcgagagagacaccacatttttaaccaaaattttaaggtaataagtttatatctcatctcacttataaagagtccaaccaccacttttctatccga 39864  T
Q  179 tgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |  | |||||||||||||||||| |||||    
T  39863 tgtgggacatataactcacacttgaacacaacaattccccctcaagtgtgagttcatca 39805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2953 - 2869
Alignment:
Q  126 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 210  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||  |||||  | |||||  || ||||||||| |||||||| ||||    
T  2953 ggtttatggatcctcttatatataaagtgttcaacctttacatttttaaacaatgtgaaacttataactcatacttgcaatccaa 2869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 166
Target Start/End: Original strand, 10406 - 10446
Alignment:
Q  126 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 166  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10406 ggtttatggatcctcttacatataaagtgttcaacctttac 10446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University