View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10271_low_45 (Length: 355)

Name: NF10271_low_45
Description: NF10271
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10271_low_45
NF10271_low_45
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (15-337)||(27283561-27283883)
chr6 (23-337)||(27622914-27623228)
chr6 (30-332)||(16756496-16756806)
chr6 (32-332)||(26927427-26927735)
chr6 (28-332)||(27209574-27209886)
chr6 (28-332)||(27239342-27239654)
chr6 (28-333)||(22928067-22928380)
chr6 (27-313)||(24870402-24870696)
chr6 (28-305)||(15405743-15406028)
chr6 (28-305)||(15417530-15417815)
chr6 (27-332)||(24298972-24299285)
chr6 (28-327)||(27025822-27026129)
chr6 (28-332)||(13292157-13292470)
chr6 (28-327)||(27031701-27032008)
chr6 (28-332)||(33369643-33369954)
chr6 (28-332)||(29556231-29556542)
chr6 (27-334)||(13517406-13517720)
chr6 (28-334)||(30551193-30551506)
chr6 (28-332)||(29508096-29508407)
chr6 (28-334)||(4538972-4539285)
chr6 (28-274)||(20131253-20131500)
chr6 (28-274)||(22201370-22201617)
chr6 (28-334)||(29579707-29580020)
chr6 (28-337)||(28214138-28214454)
chr6 (28-332)||(26792491-26792802)
chr6 (28-307)||(27200897-27201183)
chr6 (28-307)||(27248050-27248336)
chr6 (28-334)||(27491811-27492125)
chr6 (28-334)||(34457699-34458012)
chr6 (28-332)||(27014399-27014710)
chr6 (28-355)||(27355296-27355630)
chr6 (28-313)||(28167188-28167480)
chr6 (28-334)||(4531967-4532280)
chr6 (28-307)||(8898890-8899176)
chr6 (28-334)||(16937219-16937532)
chr6 (28-339)||(26109614-26109933)
chr6 (51-334)||(26665873-26666163)
chr6 (51-334)||(26771844-26772134)
chr6 (28-334)||(4779584-4779897)
chr6 (28-334)||(16680832-16681145)
chr6 (28-334)||(27064174-27064477)
chr6 (28-332)||(14138624-14138925)
chr6 (28-327)||(4764442-4764738)
chr6 (27-209)||(20175368-20175543)
chr6 (27-209)||(22160448-22160623)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (28-337)||(26508837-26509154)
chr7 (28-332)||(5154758-5155070)
chr7 (27-332)||(5165059-5165372)
chr7 (28-332)||(2161247-2161558)
chr7 (28-332)||(11417931-11418243)
chr7 (33-333)||(16443138-16443446)
chr7 (27-333)||(16511576-16511890)
chr7 (32-313)||(16048027-16048316)
chr7 (28-334)||(26663041-26663354)
chr7 (27-332)||(10910077-10910390)
chr7 (28-334)||(26678233-26678546)
chr7 (28-313)||(10848299-10848592)
chr7 (28-332)||(2779919-2780230)
chr7 (32-334)||(31083756-31084066)
chr7 (28-334)||(31557533-31557847)
chr7 (28-334)||(16744649-16744962)
chr7 (28-334)||(45393913-45394226)
chr7 (32-334)||(26441938-26442247)
chr7 (28-332)||(22148563-22148874)
chr7 (32-334)||(26596349-26596659)
chr7 (33-307)||(31130616-31130898)
chr7 (28-334)||(4138374-4138687)
chr7 (28-334)||(4206069-4206382)
chr7 (28-334)||(26519501-26519814)
chr7 (28-313)||(39206293-39206585)
chr7 (28-313)||(45737995-45738287)
chr7 (28-334)||(11447582-11447896)
chr7 (28-334)||(26312992-26313306)
chr7 (23-332)||(3451926-3452243)
chr7 (28-299)||(5140466-5140744)
chr7 (27-334)||(24585663-24585978)
chr7 (16-334)||(26268202-26268527)
chr7 (167-332)||(22152790-22152963)
chr7 (167-332)||(22208705-22208878)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (33-333)||(21696427-21696735)
chr2 (28-327)||(34268156-34268463)
chr2 (27-333)||(27397031-27397345)
chr2 (28-332)||(23117471-23117783)
chr2 (28-334)||(13929845-13930158)
chr2 (28-313)||(27427706-27428000)
chr2 (27-313)||(19449644-19449939)
chr2 (28-334)||(19409718-19410031)
chr2 (28-334)||(37679132-37679445)
chr2 (28-334)||(37694397-37694710)
chr2 (27-332)||(20844590-20844903)
chr2 (31-332)||(28888929-28889238)
chr2 (51-332)||(31868065-31868354)
chr2 (28-334)||(16822572-16822885)
chr2 (28-334)||(16898595-16898908)
chr2 (28-334)||(16168173-16168486)
chr2 (28-334)||(32056447-32056760)
chr2 (28-334)||(37932072-37932385)
chr2 (30-322)||(34297856-34298155)
chr2 (28-334)||(3789138-3789452)
chr2 (28-334)||(253886-254199)
chr2 (28-334)||(21670407-21670720)
chr2 (28-334)||(27810398-27810711)
chr2 (28-332)||(12662165-12662478)
chr2 (28-313)||(37384371-37384663)
chr2 (28-334)||(9343221-9343534)
chr2 (28-334)||(39045116-39045430)
chr2 (28-334)||(39896764-39897077)
chr2 (28-334)||(11628419-11628732)
chr2 (27-313)||(31882987-31883280)
chr2 (28-334)||(37945099-37945412)
chr2 (28-313)||(27123216-27123508)
chr2 (27-334)||(22921377-22921691)
chr2 (28-334)||(34868329-34868643)
chr2 (28-334)||(12593509-12593822)
chr2 (32-334)||(34161536-34161845)
chr2 (33-332)||(12709863-12710169)
chr2 (28-334)||(27782918-27783231)
chr2 (27-307)||(40240245-40240532)
chr2 (23-208)||(3790473-3790658)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (28-333)||(24585616-24585929)
chr4 (33-333)||(15234526-15234834)
chr4 (27-313)||(15275870-15276164)
chr4 (27-313)||(15379482-15379776)
chr4 (27-313)||(14671717-14672011)
chr4 (28-334)||(54840097-54840410)
chr4 (55-332)||(17019737-17020022)
chr4 (87-333)||(1906975-1907229)
chr4 (28-334)||(27156572-27156885)
chr4 (28-334)||(31119756-31120069)
chr4 (28-334)||(21976410-21976723)
chr4 (28-334)||(20331681-20331994)
chr4 (28-332)||(6576544-6576856)
chr4 (28-332)||(36323583-36323894)
chr4 (28-332)||(36337792-36338103)
chr4 (28-313)||(5701256-5701548)
chr4 (28-332)||(14752762-14753073)
chr4 (28-313)||(39857342-39857634)
chr4 (28-307)||(18793889-18794175)
chr4 (28-334)||(40098879-40099192)
chr4 (28-332)||(24119349-24119661)
chr4 (28-328)||(5012593-5012902)
chr4 (28-334)||(14105250-14105563)
chr4 (51-333)||(34182226-34182515)
chr4 (28-334)||(33667046-33667360)
chr4 (28-208)||(24814547-24814726)
chr4 (28-334)||(30760470-30760784)
chr4 (23-208)||(24813637-24813822)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (33-325)||(22895118-22895418)
chr5 (28-332)||(23726921-23727233)
chr5 (28-327)||(22992286-22992593)
chr5 (28-333)||(23898578-23898892)
chr5 (28-327)||(11556043-11556350)
chr5 (28-332)||(33784166-33784478)
chr5 (28-327)||(23632659-23632966)
chr5 (28-332)||(24976528-24976840)
chr5 (27-332)||(24608929-24609242)
chr5 (28-299)||(13179962-13180241)
chr5 (28-334)||(15752004-15752317)
chr5 (33-327)||(25206998-25207300)
chr5 (33-327)||(25271154-25271456)
chr5 (28-332)||(33299220-33299532)
chr5 (28-334)||(6880995-6881308)
chr5 (28-334)||(30036128-30036441)
chr5 (28-334)||(32589421-32589734)
chr5 (28-334)||(31819567-31819880)
chr5 (28-334)||(33523086-33523399)
chr5 (28-334)||(28952941-28953254)
chr5 (28-332)||(9543874-9544185)
chr5 (27-334)||(33881808-33882122)
chr5 (28-332)||(30941314-30941626)
chr5 (28-334)||(43084956-43085262)
chr5 (28-332)||(2517749-2518060)
chr5 (32-327)||(18121583-18121886)
chr5 (28-334)||(30158722-30159035)
chr5 (28-334)||(40466695-40467008)
chr5 (28-334)||(18493914-18494227)
chr5 (28-332)||(15651907-15652218)
chr5 (28-334)||(37351810-37352123)
chr5 (28-334)||(37761676-37761989)
chr5 (28-332)||(31438141-31438452)
chr5 (27-334)||(5644502-5644816)
chr5 (28-307)||(37745495-37745781)
chr5 (28-334)||(34623201-34623514)
chr5 (28-313)||(8658639-8658931)
chr5 (28-334)||(3796235-3796548)
chr5 (32-334)||(11330336-11330645)
chr5 (28-334)||(13435815-13436128)
chr5 (28-334)||(28655947-28656260)
chr5 (33-332)||(24730653-24730959)
chr5 (28-334)||(18368676-18368989)
chr5 (28-332)||(37664650-37664961)
chr5 (28-334)||(9324165-9324479)
chr5 (28-334)||(26487075-26487389)
chr5 (33-334)||(13317977-13318285)
chr5 (27-334)||(30175170-30175484)
chr5 (28-334)||(12138864-12139177)
chr5 (51-313)||(41681408-41681675)
chr5 (23-208)||(13178639-13178824)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (29-327)||(20333663-20333969)
chr1 (28-332)||(14692162-14692474)
chr1 (28-332)||(14694844-14695156)
chr1 (28-332)||(14697528-14697840)
chr1 (28-322)||(14700209-14700511)
chr1 (28-327)||(16201276-16201583)
chr1 (30-333)||(21890997-21891308)
chr1 (29-333)||(20467484-20467796)
chr1 (32-334)||(51644921-51645230)
chr1 (28-334)||(28591780-28592093)
chr1 (28-332)||(41786580-41786891)
chr1 (28-332)||(10969344-10969656)
chr1 (28-313)||(28156425-28156717)
chr1 (27-334)||(10951791-10952106)
chr1 (51-334)||(3647846-3648136)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (28-332)||(15774250-15774562)
chr8 (28-327)||(22139595-22139902)
chr8 (15-313)||(18797404-18797710)
chr8 (27-313)||(22074135-22074429)
chr8 (28-327)||(21341394-21341702)
chr8 (28-332)||(33249039-33249351)
chr8 (28-327)||(14569836-14570143)
chr8 (27-332)||(2130491-2130804)
chr8 (28-333)||(16260613-16260926)
chr8 (27-333)||(19694791-19695105)
chr8 (27-305)||(19910390-19910676)
chr8 (28-333)||(19654550-19654863)
chr8 (28-332)||(27602137-27602449)
chr8 (28-334)||(29836023-29836336)
chr8 (28-296)||(31361267-31361542)
chr8 (28-334)||(28355161-28355474)
chr8 (28-334)||(31483080-31483393)
chr8 (52-313)||(18716177-18716445)
chr8 (28-334)||(33265420-33265733)
chr8 (34-337)||(12085943-12086253)
chr8 (28-334)||(19201592-19201906)
chr8 (28-334)||(44567680-44567995)
chr8 (28-334)||(19681156-19681470)
chr8 (28-334)||(9361304-9361616)
chr8 (23-208)||(15775288-15775473)
chr8 (30-126)||(22389094-22389190)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (28-332)||(5658773-5659085)
chr3 (28-332)||(29142063-29142375)
chr3 (28-333)||(19701055-19701368)
chr3 (28-332)||(4728265-4728577)
chr3 (28-332)||(6208534-6208846)
chr3 (28-332)||(18057907-18058219)
chr3 (28-327)||(8282769-8283076)
chr3 (28-333)||(15886026-15886339)
chr3 (28-332)||(4789940-4790252)
chr3 (28-332)||(35887399-35887711)
chr3 (28-327)||(16617776-16618084)
chr3 (28-332)||(22380889-22381201)
chr3 (28-313)||(22041087-22041381)
chr3 (36-333)||(16422845-16423150)
chr3 (28-332)||(11103671-11103982)
chr3 (28-327)||(18337268-18337575)
chr3 (28-333)||(4690313-4690626)
chr3 (28-334)||(5020370-5020683)
chr3 (28-333)||(15367903-15368217)
chr3 (28-305)||(15734425-15734710)
chr3 (28-334)||(24334835-24335148)
chr3 (28-334)||(28109250-28109564)
chr3 (28-334)||(32297290-32297603)
chr3 (23-334)||(18231851-18232169)
chr3 (28-334)||(5717714-5718027)
chr3 (28-334)||(5728624-5728937)
chr3 (28-334)||(5763431-5763744)
chr3 (28-334)||(10649730-10650042)
chr3 (28-334)||(17978238-17978551)
chr3 (28-332)||(4339986-4340297)
chr3 (28-332)||(31029553-31029864)
chr3 (28-332)||(4630420-4630731)
chr3 (27-334)||(5589642-5589956)
chr3 (28-334)||(18249377-18249690)
chr3 (28-332)||(18285666-18285977)
chr3 (28-332)||(18300967-18301278)
chr3 (28-334)||(6536029-6536343)
chr3 (28-334)||(29658254-29658567)
chr3 (28-355)||(16404079-16404413)
chr3 (27-334)||(28345830-28346144)
chr3 (28-332)||(32445791-32446102)
chr3 (28-334)||(22864151-22864464)
chr3 (28-334)||(22879210-22879523)
chr3 (28-334)||(10402811-10403124)
chr3 (28-313)||(48472590-48472882)
chr3 (53-332)||(4423557-4423843)
chr3 (28-307)||(21681406-21681692)
chr3 (28-334)||(47030114-47030428)
chr3 (32-334)||(20570147-20570456)
chr3 (28-313)||(20072693-20072985)
chr3 (28-334)||(5602599-5602913)
chr3 (33-334)||(17970172-17970481)
chr3 (27-307)||(31957742-31958029)
chr3 (28-334)||(8218284-8218597)
chr3 (28-334)||(51788681-51788995)
chr3 (28-332)||(5473628-5473929)
chr3 (28-208)||(16599406-16599585)
chr3 (61-334)||(28027930-28028210)
chr3 (28-208)||(7080022-7080201)
chr3 (231-332)||(7079867-7079968)
chr3 (53-147)||(35221712-35221806)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (27-333)||(27992-28304)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (33-336)||(467-778)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (27-313)||(25814-26108)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (28-332)||(3861-4173)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (28-313)||(12769-13062)
scaffold0322 (28-334)||(2354-2667)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (51-327)||(8929-9214)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (28-332)||(33971-34283)
scaffold0143 (33-334)||(10615-10925)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (27-332)||(24218-24531)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (28-337)||(14636-14952)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (28-332)||(12715-13026)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (28-313)||(8187-8479)
[»] scaffold0159 (3 HSPs)
scaffold0159 (28-334)||(2422-2736)
scaffold0159 (28-120)||(23842-23935)
scaffold0159 (257-334)||(18505-18582)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (28-334)||(16273-16586)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (28-332)||(39858-40181)
[»] scaffold0685 (1 HSPs)
scaffold0685 (28-131)||(1309-1412)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (28-131)||(13221-13324)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (266-332)||(6741-6807)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 337
Target Start/End: Original strand, 27283561 - 27283883
Alignment:
Q  15 attgaaattgacattgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgg 114  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||     
T  27283561 attgagattgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatga 27283660  T
Q  115 atgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcat 214  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27283661 atgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttttgaagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcat 27283760  T
Q  215 agaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  27283761 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggtagatagctaatcaacttactggggatagaattctggaagacc 27283860  T
Q  315 cgactggggataacgccgttatg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27283861 cgactggggataacgccgttatg 27283883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 337
Target Start/End: Original strand, 27622914 - 27623228
Alignment:
Q  23 tgacattgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| || ||| ||| |||    
T  27622914 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattg 27623013  T
Q  122 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaagtc 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27623014 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatc 27623112  T
Q  222 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623113 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccagaaccatggctgagggtagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgg 27623212  T
Q  322 ggataacgccgttatg 337  Q
    ||||||||||||||||    
T  27623213 ggataacgccgttatg 27623228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 30 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16756806 - 16756496
Alignment:
Q  30 gacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcat 129  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||    
T  16756806 gacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 16756707  T
Q  130 gatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtc 221  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| ||    
T  16756706 gactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatc 16756607  T
Q  222 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgg 321  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  16756606 ctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgg 16756507  T
Q  322 ggataacgccg 332  Q
    | |||| ||||    
T  16756506 gaataatgccg 16756496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26927735 - 26927427
Alignment:
Q  32 cattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 131  Q
    |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  26927735 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 26927636  T
Q  132 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcct 223  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| ||||    
T  26927635 ctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 26927536  T
Q  224 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | ||||||     
T  26927535 ctttggagataacgccgttgggagacgtatcggaaccaaggctgaggatagatagctaatcaactcgctggggatagaatctcgggagactctactggga 26927436  T
Q  324 ataacgccg 332  Q
    |||| ||||    
T  26927435 ataatgccg 26927427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27209886 - 27209574
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27209886 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27209787  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--cata------gaag 219  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||       ||     
T  27209786 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctagattacatattccagtaaa 27209687  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  27209686 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 27209587  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  27209586 gggaataatgccg 27209574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 27239342 - 27239654
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27239342 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27239441  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--cata------gaag 219  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||       ||     
T  27239442 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctagattacatattccagtaaa 27239541  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  27239542 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 27239641  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  27239642 gggaataatgccg 27239654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 333
Target Start/End: Original strand, 22928067 - 22928380
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||    
T  22928067 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtgatgc 22928166  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||     
T  22928167 atgactgttggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 22928266  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  22928267 tcctctttggagataacatcgttgggagatgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 22928366  T
Q  320 ggggataacgccgt 333  Q
     ||||||| |||||    
T  22928367 agggataatgccgt 22928380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24870696 - 24870402
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  24870696 attgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 24870597  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    |||||  | ||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||    
T  24870596 catgactgctggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaa 24870497  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24870496 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 24870402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 305
Target Start/End: Original strand, 15405743 - 15406028
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||| |||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  15405743 ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15405842  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |  ||     
T  15405843 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaa 15405942  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatct 305  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15405943 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 15406028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 305
Target Start/End: Original strand, 15417530 - 15417815
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||| |||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  15417530 ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15417629  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |  ||     
T  15417630 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaa 15417729  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatct 305  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15417730 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 15417815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 332
Target Start/End: Original strand, 24298972 - 24299285
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  24298972 attgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 24299071  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    |||||  ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | |||    
T  24299072 catgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 24299171  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  24299172 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 24299271  T
Q  319 tggggataacgccg 332  Q
    |||| |||| ||||    
T  24299272 tgggaataatgccg 24299285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 27026129 - 27025822
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||    
T  27026129 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgc 27026030  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |  ||     
T  27026029 atgactgttggcgatttgtagacaaagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaa 27025930  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  27025929 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagttatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 27025830  T
Q  320 ggggataa 327  Q
    ||| ||||    
T  27025829 gggaataa 27025822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 13292157 - 13292470
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||    
T  13292157 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgc 13292256  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  13292257 atgactgttggcgatttgtagacacaatttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 13292356  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatag-ctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  13292357 tcctctttggagatgacgtcgttgggggacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagtctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctac 13292456  T
Q  319 tggggataacgccg 332  Q
    |||| |||| ||||    
T  13292457 tgggaataatgccg 13292470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 27032008 - 27031701
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||    
T  27032008 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgc 27031909  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |        || | |||     
T  27031908 atgactgttggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagcattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27031809  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||    
T  27031808 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggataggatctcggaagactctact 27031709  T
Q  320 ggggataa 327  Q
    ||| ||||    
T  27031708 gggaataa 27031701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 33369643 - 33369954
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  33369643 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 33369742  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  33369743 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 33369841  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  33369842 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 33369941  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  33369942 gggaataatgccg 33369954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29556542 - 29556231
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  29556542 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29556443  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  29556442 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 29556344  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  29556343 tcctttttgaagatgacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagataggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 29556244  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  29556243 gggaataatgccg 29556231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 334
Target Start/End: Original strand, 13517406 - 13517720
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  13517406 attgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 13517505  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  13517506 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 13517604  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  13517605 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgac 13517704  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
    |||||| || ||||||    
T  13517705 tggggaaaatgccgtt 13517720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 30551193 - 30551506
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  30551193 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 30551292  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  30551293 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 30551391  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30551392 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 30551491  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  30551492 ggggaaaacgccgtt 30551506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29508407 - 29508096
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  29508407 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcataattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29508308  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  29508307 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 29508209  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  29508208 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgtaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 29508109  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||||||||    
T  29508108 gggaataacgccg 29508096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 4538972 - 4539285
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4538972 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4539071  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  4539072 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4539170  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||   |||    
T  4539171 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgagagactttact 4539270  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    |||||||| ||||||    
T  4539271 ggggataatgccgtt 4539285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20131500 - 20131253
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20131500 ttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatggatgcttgaaatgc 20131401  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaag 219  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||       |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||        | |||     
T  20131400 atgatggttggcaatttgta-agacagtttc------tcagacaagacatcggagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcctggaaa 20131308  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcag 274  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20131307 tcctctttggagatatcgtcgttgggagacgtatcgaaaccatggctgagggcag 20131253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 22201370 - 22201617
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22201370 ttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatggatgcttgaaatgc 22201469  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaag 219  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||       |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||        | |||     
T  22201470 atgatggttggcaatttgta-agacagtttc------tcagacaagacatcggagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcctggaaa 22201562  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcag 274  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22201563 tcctctttggagatatcgtcgttgggagacgtatcgaaaccatggctgagggcag 22201617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29580020 - 29579707
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  29580020 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29579921  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |        || | |||     
T  29579920 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggcccgtgctatattacacattcttggaaa 29579822  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29579821 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtgtgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 29579722  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  29579721 ggggagaatgccgtt 29579707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 28214454 - 28214138
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  28214454 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28214355  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  28214354 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28214256  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  || |||||| ||||| |   |||    
T  28214255 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatacaacttgctggaaattgaatctcggaaggctttact 28214156  T
Q  320 ggggataacgccgttatg 337  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  28214155 ggggaaaacgccgttatg 28214138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26792802 - 26792491
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  26792802 ttgacattggaaatgcaatattcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26792703  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  26792702 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26792604  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||    
T  26792603 tcctctttggagacgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttact 26792504  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    |||||||| ||||    
T  26792503 ggggataatgccg 26792491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27201183 - 27200897
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27201183 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27201084  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||        | || | |||     
T  27201083 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgagctatattacaccttcttggaaa 27200985  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 307  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27200984 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttg 27200897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 307
Target Start/End: Original strand, 27248050 - 27248336
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27248050 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27248149  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||        | || | |||     
T  27248150 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgagctatattacaccttcttggaaa 27248248  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 307  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27248249 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttg 27248336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27492125 - 27491811
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27492125 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27492026  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||        | || | |||     
T  27492025 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctcgtgctatattacaccttcttggaaa 27491927  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||    
T  27491926 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggaccatggctgagggcaggtaggtaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagacctcac 27491827  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
     ||||| |||||||||    
T  27491826 cggggaaaacgccgtt 27491811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 34457699 - 34458012
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||    
T  34457699 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgc 34457798  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |        || | |||     
T  34457799 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacatagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 34457897  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  34457898 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagagtcttggaagacctgact 34457997  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  34457998 ggggaaaatgccgtt 34458012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27014710 - 27014399
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27014710 ttgacattggaaatgcagtatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27014611  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  27014610 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27014512  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  27014511 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcgactcgctggggatagaatctcggaagactctact 27014412  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  27014411 gggaataatgccg 27014399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 355
Target Start/End: Original strand, 27355296 - 27355630
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27355296 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27355395  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  27355396 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27355494  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||  ||     
T  27355495 tcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagacctcacc 27355594  T
Q  320 ggggataacgccgttatgatgtccatctcattgctg 355  Q
    ||||| ||||||||| || ||  ||||||| |||||    
T  27355595 ggggaaaacgccgttgtgctgggcatctcagtgctg 27355630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28167480 - 28167188
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  28167480 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28167381  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  28167380 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28167282  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28167281 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagac 28167188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4532280 - 4531967
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4532280 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4532181  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |        || | |||     
T  4532180 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgagctatattacacattcttggaaa 4532082  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||    
T  4532081 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggctggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttact 4531982  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    |||||||| ||||||    
T  4531981 ggggataatgccgtt 4531967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 307
Target Start/End: Original strand, 8898890 - 8899176
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  8898890 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 8898989  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgct-------acatcatagaag- 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||  | | ||     
T  8898990 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggaga 8899088  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 307  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||    
T  8899089 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttg 8899176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 16937219 - 16937532
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16937219 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16937318  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||      
T  16937319 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 16937417  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    | |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||    |||||||||||||||| |||||  |||| | |||    
T  16937418 ttctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtgacttgctggggatagagtcttgagagactccact 16937517  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  16937518 ggggaaaacgccgtt 16937532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 339
Target Start/End: Original strand, 26109614 - 26109933
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||| ||||||||  || | ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  26109614 ttgacattgaaaatgcaatatgcacggatgatataacgatttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26109713  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||        | || | |||     
T  26109714 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacaccttcttggaaa 26109812  T
Q  220 tcctctttggagataacgccg-ttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||   ||    
T  26109813 tcctctttggagatgacgtcgtttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgagagactttac 26109912  T
Q  319 tggggataacgccgttatgat 339  Q
    ||||||||| |||||| ||||    
T  26109913 tggggataatgccgttgtgat 26109933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 51 - 334
Target Start/End: Original strand, 26665873 - 26666163
Alignment:
Q  51 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| |    
T  26665873 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagtttgtaggc 26665972  T
Q  151 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgtt 242  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  26665973 acgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatgacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 26666071  T
Q  243 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 334  Q
    |||||||||  ||| |||  |||||||||  |  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  26666072 gggagacgtttcgggacctaggctgagggtgggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 26666163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 51 - 334
Target Start/End: Original strand, 26771844 - 26772134
Alignment:
Q  51 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| |    
T  26771844 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagtttgtaggc 26771943  T
Q  151 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgtt 242  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  26771944 acgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatgacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 26772042  T
Q  243 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 334  Q
    |||||||||  ||| |||  |||||||||  |  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  26772043 gggagacgtttcgggacctaggctgagggtgggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 26772134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4779897 - 4779584
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4779897 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacggtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4779798  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  4779797 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaattttgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4779699  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  4779698 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 4779599  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  4779598 ggggaaaacgccgtt 4779584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16681145 - 16680832
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16681145 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16681046  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgct-------acatcatagaag- 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||       ||||  | | ||     
T  16681045 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcgtgctatgttacacattctcggaga 16680947  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | ||     
T  16680946 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccacc 16680847  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  16680846 ggggaaaacgccgtt 16680832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27064477 - 27064174
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||          || ||| ||||||| |||||    
T  27064477 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcatgtaatatgca----------tgtatgaatgcttgtaatgc 27064388  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  27064387 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27064289  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |  ||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27064288 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccatggctgagggcaggcaagtatgcgacttgctggagatagaatcttggaagacccgact 27064189  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  27064188 ggggaaaacgccgtt 27064174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 14138624 - 14138925
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||| ||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||           ||| ||||||| |||||    
T  14138624 ttgacattgaaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgt----------atgaatgcttgtaatgc 14138713  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  14138714 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 14138812  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  14138813 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctact 14138912  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  14138913 gggaataatgccg 14138925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4764738 - 4764442
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||| ||||||||  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||           ||| ||||||| |||||    
T  4764738 ttgacattgaaaatgcaatatacacggaggatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgt----------atgaatgcttgtaatgc 4764649  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  4764648 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4764550  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||    
T  4764549 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttact 4764450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20175543 - 20175368
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | | ||||||||||||    
T  20175543 attgacattgggaatgcaaaatgcatggatgatataatagttttattaaatgcatgggcacatagtatgcatgattatgcatgtacgaatgcttgaaatg 20175444  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 209  Q
    || ||||||||| | |||||| | |||||||        ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20175443 cacgatggttggtaatttgta-agacagttt------ttcagacgagacatcggagtattgagcacgtagtggctcgtgctac 20175368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 209
Target Start/End: Original strand, 22160448 - 22160623
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | | ||||||||||||    
T  22160448 attgacattgggaatgcaaaatgcatggatgatataatagttttattaaatgcatgggcacatagtatgcatgattatgcatgtacgaatgcttgaaatg 22160547  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 209  Q
    || ||||||||| | |||||| | |||||||        ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22160548 cacgatggttggtaatttgta-agacagttt------ttcagacgagacatcggagtattgagcacgtagtggctcgtgctac 22160623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 337
Target Start/End: Original strand, 26508837 - 26509154
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||    
T  26508837 ttgacattgggaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatggttgtaatgc 26508936  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || | |||     
T  26508937 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctggaaa 26509036  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26509037 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaacttgctgggggtagaatcttggaagacccgact 26509136  T
Q  320 ggggataacgccgttatg 337  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26509137 ggggataacgccgttatg 26509154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5155070 - 5154758
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5155070 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5154971  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  5154970 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5154871  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  5154870 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 5154771  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  5154770 gggaataatgccg 5154758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 27 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5165372 - 5165059
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  5165372 attgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5165273  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  5165272 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 5165173  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| | ||    
T  5165172 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctac 5165073  T
Q  319 tggggataacgccg 332  Q
    | ||||||| ||||    
T  5165072 tagggataatgccg 5165059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2161558 - 2161247
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  2161558 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 2161459  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  2161458 atgattgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 2161359  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  2161358 tcctctttggagacgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcag-tagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 2161260  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  2161259 gggaataatgccg 2161247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 11417931 - 11418243
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  11417931 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 11418030  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  11418031 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacgcattcctggaaa 11418130  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  11418131 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 11418230  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  11418231 gggaataatgccg 11418243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 33 - 333
Target Start/End: Original strand, 16443138 - 16443446
Alignment:
Q  33 attggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 132  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  16443138 attggaaatgcaatatgtatggatgatataaaagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 16443237  T
Q  133 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctc 224  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |        || | ||| |||||    
T  16443238 tgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcatgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctc 16443337  T
Q  225 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 324  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  16443338 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggagccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctgctgggga 16443437  T
Q  325 taacgccgt 333  Q
    ||| |||||    
T  16443438 taatgccgt 16443446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 333
Target Start/End: Original strand, 16511576 - 16511890
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  16511576 attgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 16511675  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    |||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |        || | |||    
T  16511676 catgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatgactcgtgctatattacacattcctggaa 16511775  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  16511776 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 16511875  T
Q  319 tggggataacgccgt 333  Q
    |||| |||| |||||    
T  16511876 tgggaataatgccgt 16511890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 32 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16048316 - 16048027
Alignment:
Q  32 cattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 131  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||| | || ||| ||||| | |||||||||    
T  16048316 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatacatgtatgaatgctcgtaatgcatga 16048217  T
Q  132 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcct 223  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| ||||    
T  16048216 ctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcct 16048117  T
Q  224 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16048116 ctttggagataaagtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 16048027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 26663041 - 26663354
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  26663041 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26663140  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  26663141 atgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26663239  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26663240 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 26663339  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  26663340 ggggaaaatgccgtt 26663354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 332
Target Start/End: Original strand, 10910077 - 10910390
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  10910077 attgacattggaaatgcaatatgtatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 10910176  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    || ||  ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||    
T  10910177 cacgactgttggcgatttgtagacacagttcagcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaa 10910276  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||| | ||    
T  10910277 atcctctttggagatgacgttgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggatagaatctcgggagactctac 10910376  T
Q  319 tggggataacgccg 332  Q
    |||| |||| ||||    
T  10910377 tgggaataatgccg 10910390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 26678233 - 26678546
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  26678233 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26678332  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  26678333 atgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26678431  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26678432 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 26678531  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  26678532 ggggaaaatgccgtt 26678546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 10848592 - 10848299
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||    
T  10848592 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgc 10848493  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaag 219  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||        | |||     
T  10848492 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctatatcacacattcttggaaa 10848393  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||  | |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10848392 tcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatggctgagggcgggttgctacgcgacttgctggggacagaatctcggaagac 10848299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2780230 - 2779919
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  2780230 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 2780131  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  2780130 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 2780032  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  2780031 tcctctttgaagatgacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 2779932  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  2779931 gggaataatgccg 2779919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 334
Target Start/End: Original strand, 31083756 - 31084066
Alignment:
Q  32 cattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 131  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  31083756 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 31083855  T
Q  132 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcct 223  Q
       |||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| ||||    
T  31083856 ctattggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 31083954  T
Q  224 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggg 322  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || |||    
T  31083955 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggg 31084054  T
Q  323 gataacgccgtt 334  Q
    || |||||||||    
T  31084055 gaaaacgccgtt 31084066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 31557533 - 31557847
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| ||||||| |||||    
T  31557533 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31557632  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||        | || | |||     
T  31557633 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctcgtgctatattacaccttcttggaaa 31557731  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   ||    
T  31557732 tcctctttggagatggcgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtaaacaacttgcttggggatagaatcttggaagactttac 31557831  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
    |||||| |||||||||    
T  31557832 tggggaaaacgccgtt 31557847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 16744649 - 16744962
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16744649 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16744748  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  16744749 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16744847  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16744848 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgacggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 16744947  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  16744948 ggggaaaatgccgtt 16744962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 45394226 - 45393913
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  45394226 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 45394127  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| |        || | | |     
T  45394126 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcatgctatattacacattcttgggaa 45394028  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  45394027 tcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 45393928  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  45393927 ggggaaaacgccgtt 45393913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26442247 - 26441938
Alignment:
Q  32 cattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 131  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  26442247 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 26442148  T
Q  132 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcct 223  Q
      ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| ||||    
T  26442147 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 26442049  T
Q  224 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggg 323  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||    
T  26442048 ctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagaccccaccgggg 26441949  T
Q  324 ataacgccgtt 334  Q
    | |||||||||    
T  26441948 aaaacgccgtt 26441938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22148874 - 22148563
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  22148874 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataatagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 22148775  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  22148774 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 22148676  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||    
T  22148675 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctact 22148576  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  22148575 gggaataatgccg 22148563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26596659 - 26596349
Alignment:
Q  32 cattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 131  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||    
T  26596659 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatga 26596560  T
Q  132 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcct 223  Q
      ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |        || | ||| ||||    
T  26596559 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcatgctatattacacattcttggaaatcct 26596461  T
Q  224 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaacc-atggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 322  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26596460 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggg 26596361  T
Q  323 gataacgccgtt 334  Q
    || || ||||||    
T  26596360 gaaaatgccgtt 26596349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31130898 - 31130616
Alignment:
Q  33 attggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 132  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  31130898 attggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 31130799  T
Q  133 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctc 224  Q
     ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||    
T  31130798 tgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctc 31130700  T
Q  225 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaacc-atggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 307  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31130699 tttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccaatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttg 31130616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 4138374 - 4138687
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4138374 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4138473  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  4138474 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4138572  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||    
T  4138573 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccact 4138672  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  4138673 ggggaaaacgccgtt 4138687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4206382 - 4206069
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||| |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4206382 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcactaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4206283  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  4206282 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 4206184  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||     
T  4206183 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgccggaaccatggccgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccacc 4206084  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  4206083 ggggaaaacgccgtt 4206069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26519814 - 26519501
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||| ||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  26519814 ttgacattggaactgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26519715  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  26519714 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26519616  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  26519615 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 26519516  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  26519515 ggggaaaacgccgtt 26519501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Original strand, 39206293 - 39206585
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  39206293 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 39206392  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  39206393 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 39206491  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39206492 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctgaggatagaatcttgggagac 39206585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45738287 - 45737995
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  45738287 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 45738188  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  45738187 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 45738089  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45738088 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaatttgctggggatagaatcttgggagac 45737995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11447896 - 11447582
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| ||| ||| ||||    
T  11447896 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggcacgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgtttgtaatg 11447797  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  11447796 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 11447698  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  11447697 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttac 11447598  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
    |||||| |||||||||    
T  11447597 tggggaaaacgccgtt 11447582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 26312992 - 26313306
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||| |||||||||||||  || | ||||||||||| || |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  26312992 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26313091  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||   |||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  26313092 atgactattggcattttgtaggcaagacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26313190  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | ||    
T  26313191 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccac 26313290  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
     ||||| |||||||||    
T  26313291 cggggaaaacgccgtt 26313306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3452243 - 3451926
Alignment:
Q  23 tgacattgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  3452243 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattg 3452144  T
Q  122 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata------ 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || || ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| || | |          
T  3452143 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agccaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 3452045  T
Q  216 --gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
      ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3452044 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtaccggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 3451945  T
Q  314 ccgactggggataacgccg 332  Q
     | |||||| |||| ||||    
T  3451944 tctactgggaataatgccg 3451926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 5140466 - 5140744
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5140466 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5140565  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgct-------acatcatagaag- 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||  | | ||     
T  5140566 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggaga 5140664  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggata 299  Q
    |||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||||||||||||||    
T  5140665 tcctctatggagatgacgtcattgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggata 5140744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 334
Target Start/End: Original strand, 24585663 - 24585978
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    ||||| ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| || |    
T  24585663 attgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacg 24585762  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagaca-ttggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcataga 217  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||   ||  | | || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||    
T  24585763 catgactgttggcagtttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacatttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgga 24585861  T
Q  218 agtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 317  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |    
T  24585862 aatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgaaggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctcca 24585961  T
Q  318 ctggggataacgccgtt 334  Q
    ||||||| |||||||||    
T  24585962 ctggggaaaacgccgtt 24585978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 334
Target Start/End: Original strand, 26268202 - 26268527
Alignment:
Q  16 ttgaaattgacattgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgg 114  Q
    ||||| ||||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| ||||||     
T  26268202 ttgaatttgacatttgtattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatga 26268301  T
Q  115 atgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcat 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  26268302 atgattgaaatgcatgatggttgacagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattac 26268400  T
Q  215 a--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatctt 306  Q
    |        ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||| | | ||||||||||||  || ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  26268401 acattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaccta-ggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatctt 26268499  T
Q  307 ggaagacccgactggggataacgccgtt 334  Q
    |||||||   |||||||| |||||||||    
T  26268500 ggaagactttactggggaaaacgccgtt 26268527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22152963 - 22152790
Alignment:
Q  167 agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaa 258  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  22152963 agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaa 22152864  T
Q  259 ccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 332  Q
    || ||||||||||||| |||  |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  22152863 ccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctactgggaataatgccg 22152790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22208878 - 22208705
Alignment:
Q  167 agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaa 258  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  22208878 agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaa 22208779  T
Q  259 ccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 332  Q
    || ||||||||||||| |||  |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  22208778 ccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctactgggaataatgccg 22208705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 33 - 333
Target Start/End: Original strand, 21696427 - 21696735
Alignment:
Q  33 attggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 132  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  21696427 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 21696526  T
Q  133 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaagtcctc 224  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||| |||||    
T  21696527 tgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcaatattacacattcctggaaatcctc 21696626  T
Q  225 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||    
T  21696627 tttggagataacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctactgggga 21696726  T
Q  325 taacgccgt 333  Q
    ||| |||||    
T  21696727 taatgccgt 21696735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 327
Target Start/End: Original strand, 34268156 - 34268463
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  34268156 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 34268255  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaag 219  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | |||     
T  34268256 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcctggaaa 34268355  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  34268356 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 34268455  T
Q  320 ggggataa 327  Q
    ||||||||    
T  34268456 ggggataa 34268463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27397345 - 27397031
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  27397345 attgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 27397246  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaa 218  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        | |||    
T  27397245 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgtagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaa 27397146  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  27397145 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactccgc 27397046  T
Q  319 tggggataacgccgt 333  Q
    ||||||||| |||||    
T  27397045 tggggataatgccgt 27397031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23117783 - 23117471
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||    
T  23117783 ttgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgc 23117684  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  23117683 atgactgtttgcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 23117584  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  23117583 tcctctttggagatgacgtcgttgggaggcgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 23117484  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  23117483 gggaataatgccg 23117471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 13929845 - 13930158
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  13929845 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 13929944  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  13929945 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 13930043  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  13930044 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagatagaatcttgggagacctgact 13930143  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  13930144 ggggagaacgccgtt 13930158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Original strand, 27427706 - 27428000
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27427706 ttgacattggaaatgcaacatgcctgaatgatataacagtttcattaaatgcatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27427805  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||     
T  27427806 atgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 27427905  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaat-caacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27427906 tcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagcttatgcaacttgctggggacagaatctcggaagac 27428000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Original strand, 19449644 - 19449939
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    |||||||||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| || |    
T  19449644 attgacattgaaaatgcaatatacatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacg 19449743  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaa 218  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||        |||||    
T  19449744 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctatatcacacattcttagaa 19449843  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19449844 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 19449939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 19409718 - 19410031
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  19409718 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 19409817  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  19409818 atgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 19409916  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19409917 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagaccccact 19410016  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  19410017 ggggaaaacgccgtt 19410031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 37679132 - 37679445
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  37679132 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37679231  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||      
T  37679232 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 37679330  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37679331 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 37679430  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  37679431 ggggaaaatgccgtt 37679445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 37694397 - 37694710
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  37694397 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37694496  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||      
T  37694497 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 37694595  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37694596 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 37694695  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  37694696 ggggaaaatgccgtt 37694710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20844903 - 20844590
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  20844903 attgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcataggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 20844804  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    || ||  ||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |        || | |||    
T  20844803 cacgactgttggcgatttgtaaacatagttccgcagagacagacaagacactggagtattaggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaa 20844704  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     || ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  20844703 atcatctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 20844604  T
Q  319 tggggataacgccg 332  Q
    |||| |||| ||||    
T  20844603 tgggaataatgccg 20844590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28889238 - 28888929
Alignment:
Q  31 acattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatg 130  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||| |||||||  |||||||    
T  28889238 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggtgtgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgttatgcatg 28889139  T
Q  131 atggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcc 222  Q
    |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |        || | ||| |||    
T  28889138 actgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagatgttggagtattgggcatgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcc 28889039  T
Q  223 tctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 322  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||    
T  28889038 tctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactggg 28888939  T
Q  323 gataacgccg 332  Q
     |||| ||||    
T  28888938 aataatgccg 28888929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 51 - 332
Target Start/End: Original strand, 31868065 - 31868354
Alignment:
Q  51 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 150  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||    
T  31868065 atggatgatataacagtctcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagac 31868164  T
Q  151 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgtt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  31868165 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 31868264  T
Q  243 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 332  Q
    |||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||| ||   |||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  31868265 gggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtaggtatgaaacttgatggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 31868354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 16822572 - 16822885
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16822572 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16822671  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  16822672 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16822770  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16822771 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 16822870  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  16822871 ggggaaaacgccgtt 16822885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16898908 - 16898595
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16898908 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16898809  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  16898808 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16898710  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16898709 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 16898610  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  16898609 ggggaaaacgccgtt 16898595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16168486 - 16168173
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16168486 ttgacattggaaatgcgatatgtatggatgatataacattttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16168387  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  16168386 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16168288  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16168287 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 16168188  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  16168187 ggggaaaatgccgtt 16168173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 32056760 - 32056447
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  32056760 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 32056661  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  32056660 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 32056562  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32056561 tcctctttggagatgacgtcgttgggagatgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 32056462  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  32056461 ggggaaaacgccgtt 32056447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 37932385 - 37932072
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  37932385 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37932286  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  37932285 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 37932187  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37932186 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgact 37932087  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  37932086 ggggaaaacgccgtt 37932072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 34298155 - 34297856
Alignment:
Q  30 gacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcat 129  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||    
T  34298155 gacattggaaatgcaaaatgaatggatgatataacagtttcactaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 34298056  T
Q  130 gatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtc 221  Q
    ||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| ||    
T  34298055 gactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatc 34297957  T
Q  222 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgg 321  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  34297956 ctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgg 34297857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3789452 - 3789138
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  3789452 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattagtatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 3789353  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 218  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  3789352 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 3789254  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3789253 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgac 3789154  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
    |||||| |||||||||    
T  3789153 tggggaaaacgccgtt 3789138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 253886 - 254199
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  253886 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 253985  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  253986 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 254084  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  254085 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatacaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 254184  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  254185 ggggaaaatgccgtt 254199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 21670407 - 21670720
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||    
T  21670407 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgcttatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 21670506  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  21670507 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 21670605  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21670606 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 21670705  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  21670706 ggggaaaacgccgtt 21670720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27810711 - 27810398
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27810711 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27810612  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  27810611 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27810513  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27810512 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 27810413  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  27810412 ggggaaaatgccgtt 27810398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12662478 - 12662165
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||| |||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  12662478 ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcaggggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 12662379  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||  |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | |||     
T  12662378 atgactgttggcgatttgtaaacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 12662279  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||    
T  12662278 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgcttgaggatagaatctcggaagactctac 12662179  T
Q  319 tggggataacgccg 332  Q
    |||| |||| ||||    
T  12662178 tgggaataatgccg 12662165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 37384663 - 37384371
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  37384663 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37384564  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  37384563 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaat 37384465  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
    || ||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37384464 tcttctgtggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 37384371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 9343221 - 9343534
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  9343221 ttgacattggaaatgcgatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 9343320  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |        || | |||     
T  9343321 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaaa 9343419  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9343420 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 9343519  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  9343520 ggggaaaatgccgtt 9343534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 39045116 - 39045430
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  39045116 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 39045215  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | |||     
T  39045216 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 39045314  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac-ttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  39045315 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaactttgctggagatagaatcttggaagacctgac 39045414  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
    |||||| || ||||||    
T  39045415 tggggaaaatgccgtt 39045430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 39897077 - 39896764
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||    
T  39897077 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatgc 39896978  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| | |   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  39896977 atgactgttggcattttgtaggcgcgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 39896879  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  39896878 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttggaagactttact 39896779  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  39896778 ggggaaaacgccgtt 39896764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 11628419 - 11628732
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  11628419 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcactaaatgcatgggtacgtaatatgtatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 11628518  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  11628519 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 11628617  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||     
T  11628618 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccacc 11628717  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  11628718 ggggaaaacgccgtt 11628732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31883280 - 31882987
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  31883280 attgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 31883181  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  31883180 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 31883082  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31883081 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 31882987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 37945099 - 37945412
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||    
T  37945099 ttgacattggaaacgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctggtaatgc 37945198  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||   |||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  37945199 atgactattggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 37945297  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37945298 tcctctttggagatgacgtcgttgggagatgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 37945397  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  37945398 ggggaaaatgccgtt 37945412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27123508 - 27123216
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27123508 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27123409  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  27123408 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27123310  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27123309 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 27123216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 334
Target Start/End: Original strand, 22921377 - 22921691
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  22921377 attgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 22921476  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  22921477 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 22921575  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | ||    
T  22921576 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccac 22921675  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
    |||||| |||||||||    
T  22921676 tggggaaaacgccgtt 22921691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 34868643 - 34868329
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  34868643 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 34868544  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  34868543 catgactgttggcattttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 34868445  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  34868444 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttac 34868345  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
    |||||| |||||||||    
T  34868344 tggggaaaacgccgtt 34868329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12593822 - 12593509
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| |||| || |||||    
T  12593822 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttactaaatgcatgggcacgtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgcctgtaatgc 12593723  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta-------catcatagaag- 219  Q
    ||||  |||| |||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||       |||  | | ||     
T  12593722 atgactgttgacagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggaga 12593624  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12593623 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 12593524  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  12593523 ggggaaaatgccgtt 12593509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 34161845 - 34161536
Alignment:
Q  32 cattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 131  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||    
T  34161845 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatga 34161746  T
Q  132 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaagtcct 223  Q
      ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||| ||||    
T  34161745 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcct 34161647  T
Q  224 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggg 323  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||    
T  34161646 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagagccaaggctgagggctggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccaccgggg 34161547  T
Q  324 ataacgccgtt 334  Q
    | |||||||||    
T  34161546 aaaacgccgtt 34161536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 332
Target Start/End: Original strand, 12709863 - 12710169
Alignment:
Q  33 attggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 132  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  12709863 attggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 12709962  T
Q  133 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctc 224  Q
     ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |        || | ||| |||||    
T  12709963 tgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggcccgtgctatattacacattcttggaaatcctc 12710061  T
Q  225 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 324  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||    
T  12710062 tttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaatcttgagagactttactgggga 12710161  T
Q  325 taacgccg 332  Q
    ||| ||||    
T  12710162 taatgccg 12710169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27783231 - 27782918
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27783231 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27783132  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  27783131 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27783033  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||| ||||||| | | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||||||||||||||||||||||  |||| | |||    
T  27783032 tcctctatggagatgatgtcgttggtagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagaatcttgagagactccact 27782933  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||| | |||||||||    
T  27782932 gggaaaaacgccgtt 27782918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 40240532 - 40240245
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    ||||| ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| ||||    
T  40240532 attgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaaggcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatg 40240433  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgct-------acatcatagaag 219  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||       ||||  | | ||    
T  40240432 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggag 40240334  T
Q  220 -tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 307  Q
     |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||    
T  40240333 atcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttg 40240245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3790658 - 3790473
Alignment:
Q  23 tgacattgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  3790658 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattg 3790559  T
Q  122 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3790558 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 3790473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 28 - 333
Target Start/End: Original strand, 24585616 - 24585929
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  24585616 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 24585715  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  24585716 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 24585815  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  24585816 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 24585915  T
Q  320 ggggataacgccgt 333  Q
    ||| |||| |||||    
T  24585916 gggaataatgccgt 24585929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 33 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15234834 - 15234526
Alignment:
Q  33 attggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 132  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  15234834 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatggtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgat 15234735  T
Q  133 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctc 224  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||    
T  15234734 tgtgggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctc 15234635  T
Q  225 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 324  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  15234634 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctgctgggga 15234535  T
Q  325 taacgccgt 333  Q
    ||| |||||    
T  15234534 taatgccgt 15234526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Original strand, 15275870 - 15276164
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  15275870 attgacattggaaatgcaacatgtataggtggtataatagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 15275969  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaa 218  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        | |||    
T  15275970 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaa 15276069  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15276070 atcctctttggagataacgttgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgacttgctggggacagaatctcggaagac 15276164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Original strand, 15379482 - 15379776
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||    
T  15379482 attgacattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagttttattaaatgtatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaacgcttgtaatg 15379581  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaa 218  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||        | |||    
T  15379582 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggaatattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaa 15379681  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15379682 atcctctttggatataacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 15379776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14672011 - 14671717
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  14672011 attgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 14671912  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    || ||  ||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||    
T  14671911 cacgactgttggcgatttgtggacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaa 14671812  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14671811 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 14671717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 54840410 - 54840097
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  54840410 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 54840311  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  54840310 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggattattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 54840212  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54840211 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacccgact 54840112  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  54840111 ggggaaaacgccgtt 54840097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 55 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17020022 - 17019737
Alignment:
Q  55 atgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacag 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||    
T  17020022 atgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacag 17019923  T
Q  155 tttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttggga 246  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17019922 ttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttggga 17019823  T
Q  247 gacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  17019822 gacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 17019737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 87 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1907229 - 1906975
Alignment:
Q  87 cataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt 186  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1907229 cataatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggtagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt 1907130  T
Q  187 gggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatag 278  Q
    |||||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  1907129 gggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtag 1907030  T
Q  279 ctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 333  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||| |||||    
T  1907029 ctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctactggggataatgccgt 1906975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 27156572 - 27156885
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27156572 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27156671  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  27156672 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27156770  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27156771 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 27156870  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  27156871 ggggaaaatgccgtt 27156885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 31119756 - 31120069
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  31119756 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31119855  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  31119856 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 31119954  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31119955 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 31120054  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  31120055 ggggaaaacgccgtt 31120069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21976723 - 21976410
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  21976723 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 21976624  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  21976623 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 21976525  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21976524 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 21976425  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  21976424 ggggaaaacgccgtt 21976410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 20331681 - 20331994
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  20331681 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 20331780  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  20331781 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 20331879  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20331880 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 20331979  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  20331980 ggggaaaatgccgtt 20331994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6576856 - 6576544
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  6576856 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 6576757  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   |||   | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  6576756 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcatgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 6576658  T
Q  220 tcctc-tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  6576657 tcctcttttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaagtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactccac 6576558  T
Q  319 tggggataacgccg 332  Q
    ||||||||| ||||    
T  6576557 tggggataatgccg 6576544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 36323583 - 36323894
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  36323583 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgcttgtaatgc 36323682  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  36323683 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 36323781  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  36323782 tcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 36323881  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  36323882 gggaataatgccg 36323894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 36337792 - 36338103
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  36337792 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgcttgtaatgc 36337891  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  36337892 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 36337990  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  36337991 tcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 36338090  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  36338091 gggaataatgccg 36338103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5701548 - 5701256
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5701548 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5701449  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  5701448 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5701350  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5701349 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 5701256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 14752762 - 14753073
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||| |||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  14752762 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14752861  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  14752862 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 14752960  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  14752961 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 14753060  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  14753061 gggaataatgccg 14753073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 39857634 - 39857342
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  39857634 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 39857535  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  39857534 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaat 39857436  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
    || ||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39857435 tcttctgtggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 39857342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 307
Target Start/End: Original strand, 18793889 - 18794175
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  18793889 ttgacattggaaatgcgatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18793988  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  18793989 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 18794087  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 307  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||    
T  18794088 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttg 18794175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 40098879 - 40099192
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||| ||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  40098879 ttgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 40098978  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||| | ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  40098979 atgactgttggtattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 40099077  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||    
T  40099078 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccact 40099177  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  40099178 ggggaaaacgccgtt 40099192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24119661 - 24119349
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  24119661 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 24119562  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata---------gaa 218  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |          ||    
T  24119561 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaaa 24119463  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  24119462 atcctctttggagatgacatcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccagtagatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 24119363  T
Q  319 tggggataacgccg 332  Q
    |||| |||| ||||    
T  24119362 tgggaataatgccg 24119349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5012902 - 5012593
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcatt-aaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  5012902 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcatttaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5012803  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattggg-cacgtagtggctcgtgctacatcata--------ga 217  Q
    | |||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| || | |        ||    
T  5012802 cgtgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtgttggggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgga 5012704  T
Q  218 agtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 317  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5012703 aatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagacccga 5012604  T
Q  318 ctggggataac 328  Q
    |||||||||||    
T  5012603 ctggggataac 5012593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14105563 - 14105250
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  14105563 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14105464  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  || |||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||      
T  14105463 atgactgtgggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 14105365  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||  | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | |||    
T  14105364 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggtcggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccact 14105265  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  14105264 ggggaaaacgccgtt 14105250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 51 - 333
Target Start/End: Original strand, 34182226 - 34182515
Alignment:
Q  51 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| || |||| |    
T  34182226 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcaattcgtaggc 34182325  T
Q  151 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgtt 242  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  34182326 acgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacatagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 34182424  T
Q  243 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 333  Q
    |||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| |||| |||||    
T  34182425 gggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctactgggaataatgccgt 34182515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 33667046 - 33667360
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||    
T  33667046 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatg 33667145  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  33667146 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 33667244  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  33667245 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttac 33667344  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
    |||||| |||||||||    
T  33667345 tggggaaaacgccgtt 33667360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 208
Target Start/End: Original strand, 24814547 - 24814726
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  24814547 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 24814646  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 208  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||  | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24814647 atgactgttggcattttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 24814726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30760784 - 30760470
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||    
T  30760784 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatg 30760685  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  30760684 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 30760586  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  30760585 atcctttttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttac 30760486  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
    |||||| |||||||||    
T  30760485 tggggaaaacgccgtt 30760470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 208
Target Start/End: Original strand, 24813637 - 24813822
Alignment:
Q  23 tgacattgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  24813637 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattg 24813736  T
Q  122 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||   | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24813737 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcatgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 24813822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 33 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22895418 - 22895118
Alignment:
Q  33 attggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 132  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  22895418 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgcaatgcatgac 22895319  T
Q  133 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctc 224  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||    
T  22895318 tgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagtcattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctc 22895219  T
Q  225 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 324  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  22895218 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggga 22895119  T
Q  325 t 325  Q
    |    
T  22895118 t 22895118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23727233 - 23726921
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  23727233 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 23727134  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  23727133 atgactgtcggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 23727034  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  23727033 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 23726934  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  23726933 gggaataatgccg 23726921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 327
Target Start/End: Original strand, 22992286 - 22992593
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||    
T  22992286 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgc 22992385  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  22992386 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 22992485  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  22992486 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 22992585  T
Q  320 ggggataa 327  Q
    ||| ||||    
T  22992586 gggaataa 22992593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23898892 - 23898578
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  || | | ||||||| ||||     
T  23898892 ttgacattgaaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtacgaatgcttgtaatgt 23898793  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||     
T  23898792 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 23898693  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||    
T  23898692 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgcttggggatagaatctcggaagactctac 23898593  T
Q  319 tggggataacgccgt 333  Q
    ||||||||| |||||    
T  23898592 tggggataatgccgt 23898578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11556350 - 11556043
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  11556350 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 11556251  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  11556250 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacgcattcctggaaa 11556151  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| | |||    
T  11556150 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctact 11556051  T
Q  320 ggggataa 327  Q
    ||| ||||    
T  11556050 gggaataa 11556043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 33784478 - 33784166
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  33784478 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 33784379  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  33784378 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacgcattcctggaaa 33784279  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||   | ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  33784278 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaagttgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 33784179  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  33784178 gggaataatgccg 33784166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23632966 - 23632659
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  23632966 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 23632867  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| |        || | |||     
T  23632866 atgactgttggcagtttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcggtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 23632767  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  23632766 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 23632667  T
Q  320 ggggataa 327  Q
    ||| ||||    
T  23632666 gggaataa 23632659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24976840 - 24976528
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  24976840 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 24976741  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | |||     
T  24976740 atgactgttggcgatttgtagacacagttctgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 24976641  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  24976640 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 24976541  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  24976540 gggaataatgccg 24976528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24609242 - 24608929
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  24609242 attgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 24609143  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    || ||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||    
T  24609142 cacgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaa 24609043  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  24609042 atcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 24608943  T
Q  319 tggggataacgccg 332  Q
    |||| |||| ||||    
T  24608942 tgggaataatgccg 24608929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 13179962 - 13180241
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  13179962 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 13180061  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  13180062 atgactgttggcattttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 13180161  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggata 299  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||    
T  13180162 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggata 13180241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 15752004 - 15752317
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  15752004 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15752103  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  15752104 atgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 15752202  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752203 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgact 15752302  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  15752303 ggggaaaacgccgtt 15752317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 33 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 25207300 - 25206998
Alignment:
Q  33 attggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 132  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  25207300 attggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 25207201  T
Q  133 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctc 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || | | | |||||    
T  25207200 tgttggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctgggaatcctc 25207101  T
Q  225 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 324  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||    
T  25207100 tttggagataacgtcgtcgggagacgtatcagaaccagggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgagga 25207001  T
Q  325 taa 327  Q
    |||    
T  25207000 taa 25206998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 33 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 25271456 - 25271154
Alignment:
Q  33 attggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 132  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  25271456 attggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 25271357  T
Q  133 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctc 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || | | | |||||    
T  25271356 tgttggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctgggaatcctc 25271257  T
Q  225 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 324  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||    
T  25271256 tttggagataacgtcgtcgggagacgtatcagaaccagggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgagga 25271157  T
Q  325 taa 327  Q
    |||    
T  25271156 taa 25271154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 33299532 - 33299220
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  33299532 ttgacatcggaaacgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 33299433  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  33299432 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 33299333  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  ||| |||||| | ||||||  |||||||||||||||||||| | || |||| | |||    
T  33299332 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggcggagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatatcgggagactctact 33299233  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  33299232 gggaataatgccg 33299220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6881308 - 6880995
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  6881308 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 6881209  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  6881208 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 6881110  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  6881109 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 6881010  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||| |||||||||||    
T  6881009 gggaataacgccgtt 6880995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30036441 - 30036128
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  30036441 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 30036342  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  30036341 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 30036243  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30036242 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgact 30036143  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  30036142 ggggaaaacgccgtt 30036128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 32589421 - 32589734
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  32589421 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcacgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 32589520  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||   ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  32589521 atgatcgttggcagtttgtaggcacgacttcgc-gggaaagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 32589619  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  32589620 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatacaacttgctggagatagaatcttgggagacctgact 32589719  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  32589720 ggggagaacgccgtt 32589734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 31819567 - 31819880
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  31819567 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31819666  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| || | |        |||     
T  31819667 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcatgctatattacacattcttggaaa 31819765  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31819766 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacccgact 31819865  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  31819866 ggggaaaacgccgtt 31819880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33523399 - 33523086
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  33523399 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 33523300  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  33523299 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 33523201  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33523200 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 33523101  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  33523100 ggggaaaacgccgtt 33523086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 28952941 - 28953254
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  28952941 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28953040  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--cata------gaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||       ||     
T  28953041 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacatattcttgaaaa 28953139  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||||   |||    
T  28953140 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggacagaatctcggaagactttact 28953239  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  28953240 ggggaaaacgccgtt 28953254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 9543874 - 9544185
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  9543874 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 9543973  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  9543974 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 9544072  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  9544073 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctact 9544172  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  9544173 gggaataatgccg 9544185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33882122 - 33881808
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  33882122 attgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 33882023  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  33882022 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 33881924  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  33881923 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgac 33881824  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
    |||||| || ||||||    
T  33881823 tggggaaaatgccgtt 33881808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 30941626 - 30941314
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||| |||||||||| ||  || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  30941626 ttgatattggaaatgtaatatgcatgaatgatagaacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 30941527  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |        || | |||     
T  30941526 atgactgttggcgatttgtagacacagttccgcggagacagacaagacactggagtattgggcacacagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 30941427  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||| | |||    
T  30941426 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggatagaatctcgggagactctact 30941327  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  30941326 gggaataatgccg 30941314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 43085262 - 43084956
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  43085262 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 43085163  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca-tcatagaagtcctctt 226  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || | ||| ||||||     
T  43085162 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattcttggaaatcctctc 43085064  T
Q  227 tggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggata 326  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | || ||||| |    
T  43085063 tggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaa 43084964  T
Q  327 acgccgtt 334  Q
    ||||||||    
T  43084963 acgccgtt 43084956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2518060 - 2517749
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  2518060 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 2517961  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  2517960 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 2517862  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| |||||||||||| |||||   |||    
T  2517861 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtaccggagccacggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttgaaagactttact 2517762  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    |||||||| ||||    
T  2517761 ggggataatgccg 2517749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 32 - 327
Target Start/End: Original strand, 18121583 - 18121886
Alignment:
Q  32 cattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 131  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  18121583 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 18121682  T
Q  132 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagaca-ttggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaagtcc 222  Q
      ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||        | ||| |||    
T  18121683 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcaccggga-agacaagacatttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacgcattcctggaaatcc 18121781  T
Q  223 tctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 322  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||    
T  18121782 tctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactggg 18121881  T
Q  323 gataa 327  Q
     ||||    
T  18121882 aataa 18121886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30159035 - 30158722
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  30159035 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 30158936  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  30158935 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 30158837  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||  || ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  30158836 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgaggataggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacttgact 30158737  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  30158736 ggggaaaatgccgtt 30158722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 40466695 - 40467008
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  40466695 ttgacattggaaatgcgatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 40466794  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  40466795 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 40466893  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40466894 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 40466993  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  40466994 ggggaaaatgccgtt 40467008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 18493914 - 18494227
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  18493914 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18494013  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||     ||||   || | |||     
T  18494014 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 18494112  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||     
T  18494113 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggccagtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctacc 18494212  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  18494213 ggggaaaacgccgtt 18494227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 15651907 - 15652218
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  15651907 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15652006  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  15652007 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 15652105  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||  || ||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  15652106 tcctctttggagatgatgtcgttgggagacgtgtcgaaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 15652205  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  15652206 gggaataatgccg 15652218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 37351810 - 37352123
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||| |||||||||||||  || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  37351810 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgttataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37351909  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||| || |||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  37351910 atgactgttggcatttggtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 37352008  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||   |||    
T  37352009 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgagagactttact 37352108  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    |||||||| ||||||    
T  37352109 ggggataatgccgtt 37352123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 37761989 - 37761676
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  37761989 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37761890  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  37761889 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 37761791  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  37761790 tcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctgtgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 37761691  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  37761690 ggggaaaacgccgtt 37761676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31438452 - 31438141
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  31438452 ttgacattggaaatgcagcatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31438353  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  31438352 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 31438254  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||    
T  31438253 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaagtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttact 31438154  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    |||||||| ||||    
T  31438153 ggggataatgccg 31438141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5644816 - 5644502
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  5644816 attgacattggaaatgcgatgtgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5644717  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  5644716 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 5644618  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||  || |||||||||  || | | ||    
T  5644617 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgtagacagaatcttgagaggctccac 5644518  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
    |||||| |||||||||    
T  5644517 tggggaaaacgccgtt 5644502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 307
Target Start/End: Original strand, 37745495 - 37745781
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||  |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  37745495 ttgacattggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37745594  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||        | || | |||     
T  37745595 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-aaacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacaccttcttggaaa 37745693  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 307  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  37745694 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaactcgctggggatagaatcttg 37745781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 34623514 - 34623201
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  34623514 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 34623415  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  34623414 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 34623316  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||     
T  34623315 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgggggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccacc 34623216  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  34623215 ggggaaaacgccgtt 34623201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Original strand, 8658639 - 8658931
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  8658639 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 8658738  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  8658739 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 8658837  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  8658838 tcctctttggagatgacgtcgctgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggaaatagaatctcggaagac 8658931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3796548 - 3796235
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  3796548 ttgacattggaaatgcaatatgcatggacgatataacagattcattaaatgcatggatacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 3796449  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  3796448 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 3796350  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  3796349 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 3796250  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  3796249 ggggaaaacgccgtt 3796235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11330645 - 11330336
Alignment:
Q  32 cattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 131  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  11330645 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 11330546  T
Q  132 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcct 223  Q
      ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |        || | ||| ||||    
T  11330545 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagcggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 11330447  T
Q  224 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggg 323  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||    
T  11330446 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagacctgactgggg 11330347  T
Q  324 ataacgccgtt 334  Q
    | || ||||||    
T  11330346 aaaatgccgtt 11330336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 13435815 - 13436128
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  13435815 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 13435914  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  13435915 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 13436013  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||| | || ||| |||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||     
T  13436014 tcctctttggagatgacgtcattgggagacgtatcagagccaaggctgagggctggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccacc 13436113  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  13436114 ggggaaaacgccgtt 13436128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28656260 - 28655947
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  28656260 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28656161  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | |||     
T  28656160 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 28656062  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    || ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  || |||||||||||| ||| ||  || |||||||||||||||||||||  |||| | ||     
T  28656061 tcttctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagtcaaggctgagggcaggtaggtatgcaccttgctggggatagaatcttgagagactccacc 28655962  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  28655961 ggggaaaacgccgtt 28655947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24730959 - 24730653
Alignment:
Q  33 attggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 132  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  24730959 attggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 24730860  T
Q  133 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctc 224  Q
     ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |        || | ||| |||||    
T  24730859 tgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggcccgtgctatattacacattcttggaaatcctc 24730761  T
Q  225 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 324  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||    
T  24730760 tttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaatcttgagagactttactgggga 24730661  T
Q  325 taacgccg 332  Q
    ||| ||||    
T  24730660 taatgccg 24730653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 18368676 - 18368989
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  18368676 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18368775  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||      
T  18368776 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 18368874  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    | |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||||||||||||||||  ||||  |||| | |||    
T  18368875 ttctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagccttgagagactccact 18368974  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  18368975 ggggaaaacgccgtt 18368989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 37664650 - 37664961
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||  |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  37664650 ttgacattggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37664749  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  37664750 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 37664848  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||  |  || ||  ||||||||||| |||||||||||| |||||   |||    
T  37664849 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccaaggctgagggtgggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttgaaagactttact 37664948  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||||| |||||||    
T  37664949 ggggaaaacgccg 37664961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9324479 - 9324165
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||| |||||||||||||  || | ||||||||||| || |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  9324479 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 9324380  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  9324379 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 9324281  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | ||    
T  9324280 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccac 9324181  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
     ||||| |||||||||    
T  9324180 cggggaaaacgccgtt 9324165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26487389 - 26487075
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||| |||||||||||||  || | ||||||||||| || |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  26487389 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26487290  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  26487289 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26487191  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | ||    
T  26487190 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccac 26487091  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
     ||||| |||||||||    
T  26487090 cggggaaaacgccgtt 26487075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 334
Target Start/End: Original strand, 13317977 - 13318285
Alignment:
Q  33 attggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 132  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  13317977 attggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 13318076  T
Q  133 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctc 224  Q
     ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||    
T  13318077 tgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctc 13318175  T
Q  225 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 324  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||    
T  13318176 tttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactgggga 13318275  T
Q  325 taacgccgtt 334  Q
     |||||||||    
T  13318276 aaacgccgtt 13318285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30175484 - 30175170
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    ||||| ||||||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||| || ||| ||||||| ||||    
T  30175484 attgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtattacgcatgattgtgcatgtatgaatgcttgtaatg 30175385  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||   ||  | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  30175384 catgactgttggcagtttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 30175286  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     || ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | ||    
T  30175285 atcttctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccac 30175186  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
    |||||| |||||||||    
T  30175185 tggggaaaacgccgtt 30175170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12139177 - 12138864
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||| |||||||||||||  || | ||||||||||| || |||||||| |||| ||| |  |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  12139177 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtatgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 12139078  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  12139077 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 12138979  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  12138978 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 12138879  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  12138878 ggggaaaacgccgtt 12138864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 51 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41681675 - 41681408
Alignment:
Q  51 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||| |||     || ||||||  ||||||||||||||| |    
T  41681675 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcgtgattatgcatgtatgaatgt----aacgcatgactgttggcagtttgtaggc 41681580  T
Q  151 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat----cat------agaagtcctctttggagataacgccg 240  Q
    ||   ||| | | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||      | || |||||||||||||| ||| ||    
T  41681579 acgacttcacgggga-agacaagtcattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaaaatcctctttggagatgacgtcg 41681481  T
Q  241 ttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41681480 ttgggagacgtgtcggaaccatgactgagggcaggtaactatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 41681408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 208
Target Start/End: Original strand, 13178639 - 13178824
Alignment:
Q  23 tgacattgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  13178639 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattg 13178738  T
Q  122 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13178739 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 13178824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 327
Target Start/End: Original strand, 20333663 - 20333969
Alignment:
Q  29 tgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgca 128  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  20333663 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 20333762  T
Q  129 tgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagt 220  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| |    
T  20333763 tgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaat 20333862  T
Q  221 cctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactg 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| |  |||    
T  20333863 cctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctg 20333962  T
Q  321 gggataa 327  Q
    |||||||    
T  20333963 gggataa 20333969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 14692162 - 14692474
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  14692162 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14692261  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  14692262 atggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 14692361  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  14692362 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 14692461  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  14692462 gggaataatgccg 14692474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 14694844 - 14695156
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  14694844 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14694943  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  14694944 atggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 14695043  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  14695044 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 14695143  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  14695144 gggaataatgccg 14695156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 14697528 - 14697840
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  14697528 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14697627  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  14697628 atggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 14697727  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  14697728 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 14697827  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  14697828 gggaataatgccg 14697840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 322
Target Start/End: Original strand, 14700209 - 14700511
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  14700209 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14700308  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  14700309 atggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 14700408  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  14700409 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 14700508  T
Q  320 ggg 322  Q
    |||    
T  14700509 ggg 14700511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 327
Target Start/End: Original strand, 16201276 - 16201583
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16201276 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16201375  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        || | |||     
T  16201376 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcatgctatattacacattcctggaaa 16201475  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||    
T  16201476 tcctctttggagataacaccgttgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctgggggtagaatctcggaagactctact 16201575  T
Q  320 ggggataa 327  Q
    ||||||||    
T  16201576 ggggataa 16201583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 333
Target Start/End: Original strand, 21890997 - 21891308
Alignment:
Q  30 gacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcat 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||||     
T  21890997 gacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcctgtaatgcac 21891096  T
Q  130 gatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtc 221  Q
    ||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||| ||    
T  21891097 gactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacatacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatc 21891196  T
Q  222 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgg 321  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  21891197 ctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatctcggaagactctactgg 21891296  T
Q  322 ggataacgccgt 333  Q
    | |||| |||||    
T  21891297 gaataatgccgt 21891308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 20467796 - 20467484
Alignment:
Q  29 tgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgca 128  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  20467796 tgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 20467697  T
Q  129 tgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagt 220  Q
    |||  |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |        || | ||| |    
T  20467696 tgactgttggcagcttgtagacaccgtttcgtagagacagacaaggcattggagtattggccacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaat 20467597  T
Q  221 cctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactg 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||    
T  20467596 cctctttggagataacgtcgttgggagacatatcggaaccatggctgagggtaggtagctatgtaacttgctggggatagaatctcggaagactctgctg 20467497  T
Q  321 gggataacgccgt 333  Q
    ||||||| |||||    
T  20467496 gggataatgccgt 20467484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 51645230 - 51644921
Alignment:
Q  32 cattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 131  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  51645230 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 51645131  T
Q  132 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcct 223  Q
      ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| ||||    
T  51645130 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 51645032  T
Q  224 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggg 323  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||    
T  51645031 ctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactgggg 51644932  T
Q  324 ataacgccgtt 334  Q
    | |||||||||    
T  51644931 aaaacgccgtt 51644921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28592093 - 28591780
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  28592093 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28591994  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  28591993 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28591895  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||||||| |||||||| |||||  |||| | |||    
T  28591894 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggctggtaggtatgtaacttgctagggatagagtcttgagagactccact 28591795  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  28591794 ggggaaaacgccgtt 28591780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 41786580 - 41786891
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  41786580 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 41786679  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  41786680 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 41786778  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| |||||||||||| |||||   |||    
T  41786779 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttgaaagactttact 41786878  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    |||||||| ||||    
T  41786879 ggggataatgccg 41786891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10969656 - 10969344
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  10969656 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 10969557  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |        || | |||    
T  10969556 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaa 10969458  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||  ||||   ||    
T  10969457 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaatcttgagagactttac 10969358  T
Q  319 tggggataacgccg 332  Q
    ||||||||| ||||    
T  10969357 tggggataatgccg 10969344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28156717 - 28156425
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  28156717 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28156618  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  28156617 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28156519  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28156518 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 28156425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 27 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10952106 - 10951791
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaat 125  Q
    ||||| ||||||||||| |  || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||    
T  10952106 attgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaat 10952007  T
Q  126 gcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------ga 217  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||   ||  | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||    
T  10952006 gcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgga 10951908  T
Q  218 agtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 317  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  || | | |    
T  10951907 aatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagatagaatcttgagaggctcca 10951808  T
Q  318 ctggggataacgccgtt 334  Q
    ||||||| |||||||||    
T  10951807 ctggggaaaacgccgtt 10951791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 51 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3648136 - 3647846
Alignment:
Q  51 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |    
T  3648136 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggc 3648037  T
Q  151 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgct-------acatcatagaag-tcctctttggagataacgccgtt 242  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||  | | || |||||| ||||||| ||| ||||    
T  3648036 acgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgtt 3647938  T
Q  243 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 334  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  3647937 gggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 3647846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15774562 - 15774250
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  15774562 ttgacattggaaatgcgacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15774463  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || | |||     
T  15774462 atgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctggaaa 15774363  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  15774362 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 15774263  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  15774262 gggaataatgccg 15774250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22139902 - 22139595
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  22139902 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgacataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcgtgtatgaatgcttgtaatgc 22139803  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  22139802 atgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 22139703  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||    
T  22139702 tcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatacaacttgctggggacagaatctcggaagactctact 22139603  T
Q  320 ggggataa 327  Q
    ||||||||    
T  22139602 ggggataa 22139595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18797710 - 18797404
Alignment:
Q  15 attgaaattgacattgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgg 114  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||| |  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||     
T  18797710 attgaaactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatga 18797611  T
Q  115 atgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca---- 210  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        
T  18797610 atgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattac 18797511  T
Q  211 ----tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatctt 306  Q
        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  18797510 acattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctaaggatagaatctt 18797411  T
Q  307 ggaagac 313  Q
    || ||||    
T  18797410 gggagac 18797404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Original strand, 22074135 - 22074429
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  22074135 attgacattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagttttattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 22074234  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaa 218  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||        | |||    
T  22074235 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggaatattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaa 22074334  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22074335 atcctctttggatataacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 22074429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 327
Target Start/End: Original strand, 21341394 - 21341702
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  21341394 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 21341493  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  21341494 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 21341593  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||    
T  21341594 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgcttgaggatagaatctcggaagactctac 21341693  T
Q  319 tggggataa 327  Q
    |||| ||||    
T  21341694 tgggaataa 21341702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 33249351 - 33249039
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  33249351 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 33249252  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  33249251 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacaaacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 33249152  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  33249151 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttggaagactctact 33249052  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  33249051 gggaataatgccg 33249039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 14570143 - 14569836
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  14570143 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14570044  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |        || | |||     
T  14570043 atgattgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacacagtggctcgtgctatactacacattcttggaaa 14569944  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  14569943 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctact 14569844  T
Q  320 ggggataa 327  Q
    ||| ||||    
T  14569843 gggaataa 14569836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 332
Target Start/End: Original strand, 2130491 - 2130804
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  2130491 attgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 2130590  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    |||||  | ||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  2130591 catgactgctggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 2130690  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  2130691 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 2130790  T
Q  319 tggggataacgccg 332  Q
    |||| |||| ||||    
T  2130791 tgggaataatgccg 2130804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16260926 - 16260613
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||    
T  16260926 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacggtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgttatgc 16260827  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||     
T  16260826 atgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 16260727  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | | |||    
T  16260726 tcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctact 16260627  T
Q  320 ggggataacgccgt 333  Q
    ||| |||| |||||    
T  16260626 gggaataatgccgt 16260613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19695105 - 19694791
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  19695105 attgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 19695006  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    |||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |        || | |||    
T  19695005 catgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgttatattacacattcctggaa 19694906  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  19694905 atcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 19694806  T
Q  319 tggggataacgccgt 333  Q
    |||| |||| |||||    
T  19694805 tgggaataatgccgt 19694791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 305
Target Start/End: Original strand, 19910390 - 19910676
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  19910390 attgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 19910489  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    |||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |        || | |||    
T  19910490 catgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacacagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 19910589  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatct 305  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  19910590 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggatagaatct 19910676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 333
Target Start/End: Original strand, 19654550 - 19654863
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||| |||  || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||     
T  19654550 ttgacattggaaattcaatatgcatggatgatatgacagtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgt 19654649  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||     
T  19654650 atgactgttgacagttggtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 19654749  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | | |||    
T  19654750 tcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctact 19654849  T
Q  320 ggggataacgccgt 333  Q
    ||| |||| |||||    
T  19654850 gggaataatgccgt 19654863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 27602137 - 27602449
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27602137 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27602236  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| |        || | |||     
T  27602237 atgactgttggcgatttgtagacgcagtttcgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcggtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27602336  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||| |||| | |||    
T  27602337 tcctctttggagctgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctaaggatagaatcttgggagactctact 27602436  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  27602437 gggaataatgccg 27602449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29836336 - 29836023
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  29836336 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29836237  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  29836236 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 29836138  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29836137 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacccgact 29836038  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  29836037 ggggaaaacgccgtt 29836023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31361542 - 31361267
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  31361542 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31361443  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  31361442 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaaa 31361344  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 296  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  31361343 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 31361267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 28355161 - 28355474
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  28355161 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaacgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28355260  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  28355261 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28355359  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  28355360 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 28355459  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  28355460 ggggaaaatgccgtt 28355474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 31483080 - 31483393
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  31483080 ttgacattggaaatgcactgtgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31483179  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  || |||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  31483180 atgactgtcggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 31483278  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  31483279 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaatttgctggagatagaatcttggaagactttact 31483378  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  31483379 ggggaaaacgccgtt 31483393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18716445 - 18716177
Alignment:
Q  52 tggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||    
T  18716445 tggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggca 18716346  T
Q  152 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttg 243  Q
    |   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  18716345 cgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 18716247  T
Q  244 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18716246 ggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 18716177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33265733 - 33265420
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  33265733 ttgacattggaaatgcgatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatggatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 33265634  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  33265633 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 33265535  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||    
T  33265534 tcctctttggaaatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttact 33265435  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  33265434 ggggaaaacgccgtt 33265420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 337
Target Start/End: Original strand, 12085943 - 12086253
Alignment:
Q  34 ttggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatg 133  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||      
T  12085943 ttggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgact 12086042  T
Q  134 gttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctct 225  Q
    ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| ||||||    
T  12086043 gttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctct 12086141  T
Q  226 ttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggat 325  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  || |||||| ||||| |   ||||||||     
T  12086142 ttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatacaacttgctggaaattgaatctcggaaggctttactggggaa 12086241  T
Q  326 aacgccgttatg 337  Q
    ||||||||||||    
T  12086242 aacgccgttatg 12086253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 19201592 - 19201906
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  19201592 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 19201691  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||  ||||  ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  19201692 atgactgttggcagtttgtaagcacaacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 19201790  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | ||    
T  19201791 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacagctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccac 19201890  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
     ||||| |||||||||    
T  19201891 cggggaaaacgccgtt 19201906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 44567995 - 44567680
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  44567995 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 44567896  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca---------tcataga 217  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| |         || | ||    
T  44567895 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagcggctcgcgctatattacacatttcttgga 44567797  T
Q  218 agtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 317  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||   |    
T  44567796 aatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgaggacaggtagctatgcaacttgctggaaatagaatcttggaagacttta 44567697  T
Q  318 ctggggataacgccgtt 334  Q
    ||||||| |||||||||    
T  44567696 ctggggaaaacgccgtt 44567680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19681470 - 19681156
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||    
T  19681470 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatg 19681371  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  19681370 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 19681272  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  19681271 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttac 19681172  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
    |||||| |||||||||    
T  19681171 tggggaaaacgccgtt 19681156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9361616 - 9361304
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  9361616 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 9361517  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |  ||     
T  9361516 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgaaaa 9361418  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| | ||| ||   |||| |||||||||||| |||||  |||| | ||     
T  9361417 tcctctttggagatgacgtcgttgggggacgtatcgg-accatagctgagggccggtaggtatgtaactggctggggatagagtcttgagagactccacc 9361319  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  9361318 ggggaaaacgccgtt 9361304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15775473 - 15775288
Alignment:
Q  23 tgacattgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  15775473 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattg 15775374  T
Q  122 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15775373 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 15775288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 126
Target Start/End: Original strand, 22389094 - 22389190
Alignment:
Q  30 gacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  22389094 gacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 22389190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5659085 - 5658773
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5659085 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5658986  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaag 219  Q
    ||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | || | |||     
T  5658985 atgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacaccttcctggaaa 5658886  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  5658885 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 5658786  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  5658785 gggaataatgccg 5658773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 29142063 - 29142375
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  29142063 ttgacattggaaacgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29142162  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  29142163 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 29142262  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  29142263 tcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 29142362  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  29142363 gggaataatgccg 29142375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19701368 - 19701055
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||     
T  19701368 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcatcaaatgcatgggcttgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgt 19701269  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  19701268 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcatagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 19701169  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  19701168 tcttctttggagataacgccattgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatacaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 19701069  T
Q  320 ggggataacgccgt 333  Q
    |||||||| |||||    
T  19701068 ggggataatgccgt 19701055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4728577 - 4728265
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||    
T  4728577 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgc 4728478  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  4728477 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4728378  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  4728377 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 4728278  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  4728277 gggaataatgccg 4728265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6208846 - 6208534
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||    
T  6208846 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgc 6208747  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  6208746 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 6208647  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  6208646 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 6208547  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  6208546 gggaataatgccg 6208534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18058219 - 18057907
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  18058219 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18058120  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  18058119 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 18058020  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  18058019 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 18057920  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  18057919 gggaataatgccg 18057907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 327
Target Start/End: Original strand, 8282769 - 8283076
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  8282769 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 8282868  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | |||     
T  8282869 atgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 8282968  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  8282969 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 8283068  T
Q  320 ggggataa 327  Q
    ||| ||||    
T  8283069 gggtataa 8283076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 333
Target Start/End: Original strand, 15886026 - 15886339
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  15886026 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15886125  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||     
T  15886126 atgactgttggcgatttgtagacatagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 15886225  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  15886226 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatctcggaagactctact 15886325  T
Q  320 ggggataacgccgt 333  Q
    ||| |||| |||||    
T  15886326 gggaataatgccgt 15886339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 4789940 - 4790252
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4789940 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4790039  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||     
T  4790040 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 4790139  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||| |||| | |||    
T  4790140 tcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctaaggatagaatcttgggagactctact 4790239  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  4790240 gggaataatgccg 4790252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 35887711 - 35887399
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  35887711 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 35887612  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |        || |  ||     
T  35887611 atgactgttgacagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaa 35887512  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| | |||    
T  35887511 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctact 35887412  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  35887411 gggaataatgccg 35887399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 327
Target Start/End: Original strand, 16617776 - 16618084
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  16617776 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttatcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgaaatgc 16617875  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaag 219  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||        | |||     
T  16617876 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctcgtgctatatcacacattcttggaaa 16617975  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  16617976 tcctctttggagatatcgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactccgc 16618075  T
Q  319 tggggataa 327  Q
    |||||||||    
T  16618076 tggggataa 16618084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 22380889 - 22381201
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||    
T  22380889 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatacaacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatgc 22380988  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||        |||     
T  22380989 atgactgttggcgatttgtagacatagtttcgcagagacagacaggacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattatactttcctggaaa 22381088  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  22381089 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 22381188  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  22381189 gggaataatgccg 22381201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22041381 - 22041087
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  22041381 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttatcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgaaatgc 22041282  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaag 219  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||        | |||     
T  22041281 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctcgtgctatatcacacattcttggaaa 22041182  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22041181 tcctctttggagatatcgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 22041087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 36 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16423150 - 16422845
Alignment:
Q  36 ggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggt 135  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||    
T  16423150 ggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattatatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgt 16423051  T
Q  136 tggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctcttt 227  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |        || | ||| ||||||||    
T  16423050 tggcggtttgtagacacagttccgcagagacagacaaggcactggagtattgggtacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctcttt 16422951  T
Q  228 ggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 327  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  16422950 ggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgcaggggatagaatctcggaagactctactggggataa 16422851  T
Q  328 cgccgt 333  Q
     |||||    
T  16422850 tgccgt 16422845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 11103671 - 11103982
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  11103671 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 11103770  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  11103771 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 11103869  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  11103870 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 11103969  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  11103970 gggaataatgccg 11103982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18337575 - 18337268
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||    
T  18337575 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatacaacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatgc 18337476  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||        |||     
T  18337475 atgactgttggcgatttgtagacatagtttcgcagagacagacaggacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattatactttcctggaaa 18337376  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  18337375 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccctggctgagggcaggtagctacgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 18337276  T
Q  320 ggggataa 327  Q
    ||| ||||    
T  18337275 gggaataa 18337268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4690626 - 4690313
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4690626 ttgatattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4690527  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | |||     
T  4690526 atgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4690427  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  4690426 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 4690327  T
Q  320 ggggataacgccgt 333  Q
    ||| |||| |||||    
T  4690326 gggaataatgccgt 4690313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5020683 - 5020370
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5020683 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5020584  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  5020583 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaaa 5020485  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||    
T  5020484 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttact 5020385  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  5020384 ggggaaaacgccgtt 5020370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15368217 - 15367903
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  15368217 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15368118  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaag 219  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        | |||     
T  15368117 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcccagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctacatcacacattcttggaaa 15368018  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  15368017 tcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatggttgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctgc 15367918  T
Q  319 tggggataacgccgt 333  Q
    ||||||||| |||||    
T  15367917 tggggataatgccgt 15367903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 305
Target Start/End: Original strand, 15734425 - 15734710
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| || |||| |||||    
T  15734425 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcataggcacataatatgcatgactatgcatgtatgaattcttgtaatgc 15734524  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  15734525 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgtagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 15734624  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatct 305  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15734625 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggttgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 15734710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24335148 - 24334835
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  24335148 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 24335049  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  24335048 atgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 24334950  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24334949 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagaccccact 24334850  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  24334849 ggggaaaacgccgtt 24334835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 28109250 - 28109564
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||| |||||||  ||||    
T  28109250 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtgatgc 28109349  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||| ||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  28109350 atgactgttagcagtttgtaggcacgacttcaccggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28109448  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc-gac 318  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  28109449 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagatagaatcttggaaaaccctgac 28109548  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
    |||||| |||||||||    
T  28109549 tggggaaaacgccgtt 28109564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 32297603 - 32297290
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  32297603 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 32297504  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||      
T  32297503 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 32297405  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32297404 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaactcgctggagatagaatcttggaagacctgact 32297305  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  32297304 ggggaaaatgccgtt 32297290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18232169 - 18231851
Alignment:
Q  23 tgacattgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  18232169 tgacgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 18232070  T
Q  123 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata------- 215  Q
    |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |           
T  18232069 aatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctt 18231971  T
Q  216 -gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 314  Q
     ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231970 ggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacc 18231871  T
Q  315 cgactggggataacgccgtt 334  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  18231870 cgaccggggaaaacgccgtt 18231851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5718027 - 5717714
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5718027 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5717928  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  5717927 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5717829  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5717828 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 5717729  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  5717728 ggggaaaatgccgtt 5717714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5728937 - 5728624
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5728937 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5728838  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  5728837 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5728739  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5728738 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 5728639  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  5728638 ggggaaaatgccgtt 5728624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 5763431 - 5763744
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5763431 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5763530  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  5763531 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5763629  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5763630 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 5763729  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  5763730 ggggaaaatgccgtt 5763744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10650042 - 10649730
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  10650042 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 10649943  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  10649942 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 10649844  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  10649843 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttggaaga-cttact 10649745  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  10649744 ggggaaaacgccgtt 10649730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 17978238 - 17978551
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  17978238 ttgacattggaactgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 17978337  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  17978338 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaaa-acaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 17978436  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17978437 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 17978536  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  17978537 ggggaaaacgccgtt 17978551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 4339986 - 4340297
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4339986 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacataatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4340085  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  4340086 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4340184  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  4340185 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 4340284  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    |||||||| ||||    
T  4340285 ggggataatgccg 4340297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 31029553 - 31029864
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  31029553 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31029652  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| |||||||  ||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  31029653 atgactgttggcattttgtaggtacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 31029751  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  31029752 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 31029851  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  31029852 gggaataatgccg 31029864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4630731 - 4630420
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4630731 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4630632  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | |||     
T  4630631 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 4630533  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  4630532 tcctctttggtgatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcatgtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 4630433  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  4630432 gggaataatgccg 4630420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 334
Target Start/End: Original strand, 5589642 - 5589956
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  5589642 attgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5589741  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |        || | |||    
T  5589742 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaa 5589840  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  5589841 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtaggtatgcaacttgctagagatagaatcttggaagacctgac 5589940  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
    |||||| || ||||||    
T  5589941 tggggaaaatgccgtt 5589956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18249690 - 18249377
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  18249690 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18249591  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  18249590 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 18249492  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | ||     
T  18249491 tcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccacc 18249392  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  18249391 ggggaaaacgccgtt 18249377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 18285666 - 18285977
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||| |||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| ||||||| |||||    
T  18285666 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18285765  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  18285766 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 18285864  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  18285865 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 18285964  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  18285965 gggaataatgccg 18285977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 18300967 - 18301278
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||| |||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| ||||||| |||||    
T  18300967 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18301066  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  18301067 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 18301165  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  18301166 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 18301265  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  18301266 gggaataatgccg 18301278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 6536029 - 6536343
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  6536029 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 6536128  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 218  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  6536129 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 6536227  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  6536228 atcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttac 6536327  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
    |||||| |||||||||    
T  6536328 tggggaaaacgccgtt 6536343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 29658254 - 29658567
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  29658254 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatgtaacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29658353  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| | |   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | |||     
T  29658354 atgactgttggcagtttgtaggcgcgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 29658452  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29658453 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgttggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 29658552  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  29658553 ggggaaaatgccgtt 29658567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 355
Target Start/End: Original strand, 16404079 - 16404413
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16404079 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16404178  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  16404179 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16404277  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||  ||     
T  16404278 tcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagacctcacc 16404377  T
Q  320 ggggataacgccgttatgatgtccatctcattgctg 355  Q
    ||||| ||||||||| || ||  ||||||| |||||    
T  16404378 ggggaaaacgccgttgtgctgggcatctcagtgctg 16404413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28346144 - 28345830
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  28346144 attgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 28346045  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaa 218  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        | || | |||    
T  28346044 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacaccttcttggaa 28345946  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | ||    
T  28345945 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccac 28345846  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
    |||||| |||||||||    
T  28345845 tggggaaaacgccgtt 28345830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32446102 - 32445791
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  32446102 ttgacattggaaatgcaatatgcatagatgacataacagttttattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 32446003  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta-------cat-catagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||       ||| | | |||     
T  32446002 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 32445904  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  32445903 tcctctttggtgatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 32445804  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  32445803 gggaataatgccg 32445791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 22864151 - 22864464
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  22864151 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaggttcatcaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 22864250  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   |||   | || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  22864251 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcatgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 22864349  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||    
T  22864350 tcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactttact 22864449  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  22864450 ggggaaaacgccgtt 22864464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 22879210 - 22879523
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  22879210 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaggttcatcaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 22879309  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   |||   | || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  22879310 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcatgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 22879408  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||    
T  22879409 tcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactttact 22879508  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  22879509 ggggaaaacgccgtt 22879523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10403124 - 10402811
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  10403124 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 10403025  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgct-------acatcatagaag- 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||  | | ||     
T  10403024 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggaga 10402926  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||     
T  10402925 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgggggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagaccccacc 10402826  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  10402825 ggggaaaacgccgtt 10402811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 48472882 - 48472590
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  48472882 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 48472783  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  48472782 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 48472684  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48472683 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 48472590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 53 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4423843 - 4423557
Alignment:
Q  53 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||| ||| |||    
T  4423843 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttataggcac 4423744  T
Q  153 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgg 244  Q
       ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  4423743 gacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 4423645  T
Q  245 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 332  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||    
T  4423644 gagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccg 4423557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21681692 - 21681406
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  21681692 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 21681593  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||      
T  21681592 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 21681494  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 307  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||    
T  21681493 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttg 21681406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 47030428 - 47030114
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  47030428 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatatagcagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 47030329  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  47030328 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 47030230  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac-ttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  47030229 tcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaactttgctggagatagaatcttggaagactccac 47030130  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
    |||||| |||||||||    
T  47030129 tggggaaaacgccgtt 47030114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 334
Target Start/End: Original strand, 20570147 - 20570456
Alignment:
Q  32 cattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 131  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  20570147 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 20570246  T
Q  132 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcct 223  Q
      ||||||||||||||| |||   ||| | | |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| ||||    
T  20570247 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcac-gggggagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 20570345  T
Q  224 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggg 323  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| | | ||| ||   |||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||    
T  20570346 ctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgaggaccggtaggtatgtaacttgctggggatagaatcttgagagactccactgggg 20570445  T
Q  324 ataacgccgtt 334  Q
    | |||||||||    
T  20570446 aaaacgccgtt 20570456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20072985 - 20072693
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  20072985 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 20072886  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||    || | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  20072885 atgactgttggcattttgtaggcacgacatcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 20072787  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20072786 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 20072693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 5602599 - 5602913
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  5602599 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5602698  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  5602699 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 5602797  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | ||    
T  5602798 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccac 5602897  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
    |||||| |||||||||    
T  5602898 tggggaaaacgccgtt 5602913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 334
Target Start/End: Original strand, 17970172 - 17970481
Alignment:
Q  33 attggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 132  Q
    |||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  17970172 attggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaagtgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 17970271  T
Q  133 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctc 224  Q
      |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||    
T  17970272 tattggcactttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctc 17970370  T
Q  225 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactgggg 323  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||    
T  17970371 tttggagatgacgtcgttgggagacatattggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccgggg 17970470  T
Q  324 ataacgccgtt 334  Q
    | |||||||||    
T  17970471 aaaacgccgtt 17970481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 307
Target Start/End: Original strand, 31957742 - 31958029
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  31957742 attgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 31957841  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  31957842 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 31957940  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 307  Q
     |||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  31957941 atcctctttggagatgacgttgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttg 31958029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8218597 - 8218284
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| | ||||| |||||    
T  8218597 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaacgcttgtaatgc 8218498  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||| |        || | |||     
T  8218497 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaaggcgttagagtattgggcacgtggtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 8218399  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||||||||| |||||| |||||  |||| | |||    
T  8218398 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggagatagagtcttgagagactccact 8218299  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  8218298 ggggaaaacgccgtt 8218284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 51788995 - 51788681
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||    
T  51788995 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattagtatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatg 51788896  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 218  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  51788895 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 51788797  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  51788796 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttac 51788697  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
    |||||| |||||||||    
T  51788696 tggggaaaacgccgtt 51788681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5473929 - 5473628
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||| ||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||           ||| ||||||| |||||    
T  5473929 ttgacattgaaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgt----------atgaatgcttgtaatgc 5473840  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  5473839 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5473741  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  5473740 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctact 5473641  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  5473640 gggaataatgccg 5473628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16599585 - 16599406
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16599585 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16599486  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 208  Q
    ||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16599485 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 16599406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28028210 - 28027930
Alignment:
Q  61 taacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgc 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||    ||| |    
T  28028210 taacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcatgacttcac 28028111  T
Q  161 agagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgta 252  Q
     | || |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||        || | ||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||     
T  28028110 gggga-agacaagacattagagtaatgggcaagtagtggctcgtgctacattacacattcttggaaatcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtg 28028012  T
Q  253 ccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 334  Q
     ||| |||  |||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||| |||||||||    
T  28028011 tcgggacctaggctgagggccggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggaaaacgccgtt 28027930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 7080201 - 7080022
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  7080201 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 7080102  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 208  Q
    ||||  ||||||| || |||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7080101 atgaccgttggcaattcgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 7080022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7079968 - 7079867
Alignment:
Q  231 gataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgc 330  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||    
T  7079968 gataacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgc 7079869  T
Q  331 cg 332  Q
    ||    
T  7079868 cg 7079867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 53 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 35221806 - 35221712
Alignment:
Q  53 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgta 147  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||  ||||||||||||||    
T  35221806 ggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgta 35221712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 27 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 28304 - 27992
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  28304 attgacatgggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 28205  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta-ca-----tcatagaagt 220  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||     || | ||| |    
T  28204 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgctgagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgttatatcacacattcttggaaat 28105  T
Q  221 cctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactg 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||    
T  28104 cctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatataacttgctggggatagaatctcggaagactccgctg 28005  T
Q  321 gggataacgccgt 333  Q
    ||||||| |||||    
T  28004 gggataatgccgt 27992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 33 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 778 - 467
Alignment:
Q  33 attggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 132  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  778 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcactttgtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgat 679  T
Q  133 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctc 224  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |        ||| |||||    
T  678 tgtgggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtgtctcgtgctatattacacattcccggaaatcctc 579  T
Q  225 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 324  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  578 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcagaaccatggttgagggcaggtagctatgcaacctgctggggatagaatctcggaagactctgctgggga 479  T
Q  325 taacgccgttat 336  Q
    ||| ||||||||    
T  478 taatgccgttat 467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Original strand, 25814 - 26108
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  25814 attgacattggaaatgaaagatgtatgggtggtataatagttttatcaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 25913  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaa 218  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||        | |||    
T  25914 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacacacaaaacattggactattgggcacgtagtggctcatgctatatcacacattcttggaa 26013  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26014 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaagcaacttgctggggaaagaatctcggaagac 26108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 3861 - 4173
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  3861 ttgacattggaaatgcgatatgcgtggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 3960  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |        || | ||      
T  3961 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcttggaca 4060  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  4061 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctaagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 4160  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  4161 gggaataatgccg 4173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13062 - 12769
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||     
T  13062 ttgacattggaaatgcaatatgcatgggtgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgt 12963  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--------catagaag 219  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | | |||     
T  12962 atgactgttggcagttagtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacatccctggaaa 12863  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||   |||||| || ||||||||||| |||||||    
T  12862 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggccgagggcaggtagctatgaaacttgttgcggatagaatctcggaagac 12769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2667 - 2354
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  2667 ttgacattggaaatgcaatatgcatggttgatataacagtttcattaaatgcatggatacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 2568  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  2567 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 2469  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  2468 tcctctttggagatgacgttgttgggagacgtgtcggaaccaaagctgagggcaggtagatatacaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 2369  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| || ||||||    
T  2368 ggggaaaatgccgtt 2354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 51 - 327
Target Start/End: Original strand, 8929 - 9214
Alignment:
Q  51 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 150  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||    
T  8929 atggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagac 9028  T
Q  151 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgtt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||  |||||||||||||| ||| ||||    
T  9029 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggacatcctctttggagatgacgtcgtt 9128  T
Q  243 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 327  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  9129 gggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagccatgcaacttgcttgaggatagaatctcggaagactctactgggaataa 9214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 34283 - 33971
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    |||| |||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  34283 ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 34184  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | |||     
T  34183 atgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 34084  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||| | |||    
T  34083 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggatagaatctcgggagactctact 33984  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  33983 gggaataatgccg 33971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10925 - 10615
Alignment:
Q  33 attggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 131  Q
    |||||||||| ||  || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  10925 attggaaatgtaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 10826  T
Q  132 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca---------tcatagaagtcc 222  Q
      ||||||||||||||  |||   ||| ||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |         || | ||| |||    
T  10825 ctgttggcagtttgtaagcacgacttcacaggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacatttcttggaaatcc 10727  T
Q  223 tctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 322  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||   ||||||    
T  10726 tctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgaggacaggtagctatgcaacttgctggaaatagaatcttggaagactttactggg 10627  T
Q  323 gataacgccgtt 334  Q
    || |||||||||    
T  10626 gaaaacgccgtt 10615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 332
Target Start/End: Original strand, 24218 - 24531
Alignment:
Q  27 attgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  24218 attgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagttttattaaatgcatgggcatgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 24317  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    || ||  | ||||  ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||    
T  24318 cacgactgctggcgatttgtagacgcagttccgcggagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaa 24417  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     | |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  24418 attctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 24517  T
Q  319 tggggataacgccg 332  Q
    |||| |||| ||||    
T  24518 tgggaataatgccg 24531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14952 - 14636
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  14952 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14853  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  14852 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 14754  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  || |||||| ||||| |   |||    
T  14753 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatacaacttgctggaaattgaatctcggaaggctttact 14654  T
Q  320 ggggataacgccgttatg 337  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  14653 ggggaaaacgccgttatg 14636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13026 - 12715
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  13026 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 12927  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  12926 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 12828  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| | |||    
T  12827 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctact 12728  T
Q  320 ggggataacgccg 332  Q
    ||| |||| ||||    
T  12727 gggaataatgccg 12715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Original strand, 8187 - 8479
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  8187 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 8286  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  8287 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 8385  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 313  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8386 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 2422 - 2736
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 126  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  2422 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 2521  T
Q  127 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 218  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  2522 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 2620  T
Q  219 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 318  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | ||    
T  2621 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccac 2720  T
Q  319 tggggataacgccgtt 334  Q
    |||||| |||||||||    
T  2721 tggggaaaacgccgtt 2736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 120
Target Start/End: Original strand, 23842 - 23935
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgctt 120  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  23842 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 23935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18582 - 18505
Alignment:
Q  257 aaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 334  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  18582 aaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 18505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16586 - 16273
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| ||||||| |||||    
T  16586 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattgtgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16487  T
Q  128 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || |        || | |||     
T  16486 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaaaacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgttatattacacattcttggaaa 16388  T
Q  220 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||| |||||||||||| |||||  |||| | ||     
T  16387 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaactggctggggatagagtcttgagagactccacc 16288  T
Q  320 ggggataacgccgtt 334  Q
    ||||| |||||||||    
T  16287 ggggaaaacgccgtt 16273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 39858 - 40181
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaat-gcaacgtgtatgga-tgatataacagtttca-ttaaatgcat-gggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 123  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  39858 ttgacattggaaatagcaacatgcatggaatgatataacagtttcaattaaatgcattgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 39957  T
Q  124 atgcatgatggttggc-agtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagt-attgggc-acgtagtggctcgtgctacatcata----- 215  Q
    ||||||||  ||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||||| || | |         
T  39958 atgcatgactgttggcgtatttgtagacacagttctgcagagacagacaagacactggagtggttgggcaacgcagtggctcgtgctatattacacattt 40057  T
Q  216 -----gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctga-gggcagatagctaat-caacttgctggggatagaatcttgg 308  Q
          || |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  40058 cctggaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgaggggcaggtagttaatgcaacttgctggggatagaatctcgg 40157  T
Q  309 aagacccgactggggataacgccg 332  Q
    ||||| | |||||| |||| ||||    
T  40158 aagactctactgggaataatgccg 40181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0685 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0685
Description:

Target: scaffold0685; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Original strand, 1309 - 1412
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  1309 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 1408  T
Q  128 atga 131  Q
    ||||    
T  1409 atga 1412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Original strand, 13221 - 13324
Alignment:
Q  28 ttgacattggaaatgcaacgtgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 127  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  13221 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 13320  T
Q  128 atga 131  Q
    ||||    
T  13321 atga 13324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6807 - 6741
Alignment:
Q  266 tgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 332  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  6807 tgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 6741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University