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Alignment Overview

Query: NF10271_low_56 (Length: 318)

Name: NF10271_low_56
Description: NF10271
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10271_low_56
NF10271_low_56
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (1-307)||(35015014-35015321)
chr6 (1-307)||(19983149-19983455)
chr6 (1-307)||(18583408-18583715)
chr6 (1-264)||(26089826-26090091)
chr6 (1-264)||(18002395-18002660)
chr6 (1-264)||(23995014-23995279)
chr6 (1-264)||(15742120-15742384)
chr6 (4-263)||(4991167-4991427)
chr6 (1-240)||(22585470-22585710)
chr6 (1-240)||(22590301-22590541)
chr6 (1-242)||(15889628-15889870)
chr6 (1-240)||(15004831-15005070)
chr6 (5-264)||(25640456-25640715)
chr6 (4-172)||(32276756-32276924)
chr6 (4-129)||(19629425-19629550)
chr6 (4-129)||(18823423-18823548)
chr6 (1-44)||(13014822-13014865)
chr6 (1-160)||(17374924-17375083)
chr6 (4-129)||(16300016-16300141)
chr6 (4-129)||(18839278-18839403)
chr6 (1-44)||(18432734-18432777)
chr6 (1-44)||(31628359-31628402)
chr6 (1-44)||(32898881-32898924)
chr6 (28-117)||(26512260-26512349)
chr6 (28-117)||(26517376-26517465)
chr6 (70-134)||(21931364-21931428)
chr6 (1-44)||(16106607-16106650)
chr6 (1-44)||(18570370-18570413)
chr6 (13-44)||(22441037-22441068)
chr6 (1-39)||(25744331-25744369)
chr6 (1-37)||(18381803-18381839)
chr6 (5-53)||(35009558-35009606)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (1-307)||(31137-31444)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-307)||(41400-41707)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (1-307)||(22274813-22275120)
chr2 (1-307)||(22284046-22284353)
chr2 (4-264)||(9652796-9653057)
chr2 (3-257)||(21273955-21274211)
chr2 (4-307)||(15633308-15633612)
chr2 (4-263)||(25213143-25213403)
chr2 (5-264)||(7321612-7321872)
chr2 (232-307)||(20627195-20627270)
chr2 (232-307)||(19794586-19794661)
chr2 (232-307)||(43642838-43642913)
chr2 (1-129)||(33128136-33128264)
chr2 (70-187)||(20279571-20279688)
chr2 (4-129)||(24826754-24826879)
chr2 (4-173)||(28031230-28031399)
chr2 (1-70)||(23836791-23836861)
chr2 (4-128)||(17204426-17204550)
chr2 (1-44)||(25876032-25876075)
chr2 (1-44)||(271261-271304)
chr2 (1-44)||(32465949-32465992)
chr2 (1-40)||(6879528-6879567)
chr2 (1-103)||(9636836-9636938)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (1-307)||(32493903-32494210)
chr7 (1-307)||(126506-126813)
chr7 (1-307)||(111126-111433)
chr7 (5-307)||(1936874-1937172)
chr7 (1-264)||(2029012-2029276)
chr7 (1-252)||(2190097-2190350)
chr7 (1-264)||(42056188-42056453)
chr7 (1-264)||(3049674-3049937)
chr7 (26-223)||(39291451-39291648)
chr7 (126-252)||(15516773-15516901)
chr7 (4-223)||(13352046-13352265)
chr7 (2-186)||(15977820-15978004)
chr7 (232-305)||(3060271-3060344)
chr7 (233-307)||(7283913-7283987)
chr7 (5-128)||(371185-371308)
chr7 (1-44)||(12369953-12369996)
chr7 (1-44)||(143730-143773)
chr7 (1-44)||(15822544-15822587)
chr7 (1-40)||(39046740-39046779)
chr7 (1-44)||(44865321-44865364)
chr7 (1-44)||(47289872-47289915)
chr7 (3-44)||(35094909-35094950)
chr7 (70-134)||(8563370-8563434)
chr7 (70-210)||(18151259-18151399)
chr7 (1-44)||(3895116-3895159)
chr7 (1-44)||(7284173-7284216)
chr7 (1-44)||(11287508-11287551)
chr7 (1-103)||(28722201-28722303)
chr7 (1-44)||(12248233-12248277)
chr7 (1-44)||(13274878-13274922)
chr7 (1-44)||(13863042-13863086)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (1-307)||(25119064-25119371)
chr4 (1-307)||(5682385-5682691)
chr4 (1-264)||(14951853-14952117)
chr4 (1-264)||(15272211-15272476)
chr4 (34-240)||(19559483-19559690)
chr4 (23-217)||(49071800-49071994)
chr4 (7-188)||(34177617-34177797)
chr4 (163-264)||(15135907-15136010)
chr4 (4-173)||(14500208-14500377)
chr4 (232-307)||(54118125-54118200)
chr4 (4-129)||(14996222-14996347)
chr4 (4-129)||(16522913-16523038)
chr4 (4-129)||(8045039-8045164)
chr4 (4-129)||(9295789-9295914)
chr4 (52-173)||(32460699-32460820)
chr4 (1-44)||(820029-820072)
chr4 (1-44)||(34395348-34395391)
chr4 (4-129)||(9795311-9795436)
chr4 (1-44)||(8872584-8872627)
chr4 (1-44)||(30457994-30458037)
chr4 (1-44)||(44056006-44056049)
chr4 (1-44)||(53704846-53704889)
chr4 (1-44)||(53907812-53907855)
chr4 (4-129)||(19697408-19697533)
chr4 (4-129)||(19707993-19708118)
chr4 (74-139)||(21417471-21417536)
chr4 (80-123)||(12133643-12133686)
chr4 (1-44)||(12837313-12837356)
chr4 (1-44)||(16732260-16732303)
chr4 (1-44)||(21959576-21959619)
chr4 (1-40)||(23270051-23270090)
chr4 (1-44)||(30232609-30232652)
chr4 (1-44)||(44346918-44346961)
chr4 (1-44)||(45458968-45459011)
chr4 (1-40)||(55376714-55376753)
chr4 (1-37)||(52265628-52265664)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (1-306)||(44034829-44035135)
chr1 (1-307)||(21860102-21860409)
chr1 (1-263)||(15861327-15861590)
chr1 (1-188)||(22367110-22367296)
chr1 (172-307)||(41218667-41218803)
chr1 (232-307)||(41394527-41394602)
chr1 (5-128)||(21650076-21650199)
chr1 (4-129)||(20254408-20254533)
chr1 (1-44)||(22403223-22403266)
chr1 (1-44)||(35522432-35522475)
chr1 (1-44)||(49967741-49967784)
chr1 (1-134)||(40436292-40436425)
chr1 (1-44)||(27329868-27329911)
chr1 (234-305)||(27675120-27675191)
chr1 (1-44)||(41212163-41212206)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-307)||(79955-80262)
scaffold0034 (1-44)||(46256-46299)
[»] chr8 (32 HSPs)
chr8 (1-307)||(24716719-24717026)
chr8 (1-307)||(274534-274841)
chr8 (1-307)||(641008-641315)
chr8 (1-307)||(826814-827121)
chr8 (1-307)||(39115366-39115673)
chr8 (1-264)||(41506709-41506973)
chr8 (3-264)||(24385652-24385914)
chr8 (24-174)||(22321437-22321587)
chr8 (1-240)||(23217968-23218208)
chr8 (26-264)||(21259391-21259630)
chr8 (23-240)||(17502274-17502492)
chr8 (1-129)||(16038917-16039045)
chr8 (23-223)||(4233968-4234168)
chr8 (232-307)||(16404857-16404932)
chr8 (4-129)||(18612501-18612626)
chr8 (4-129)||(18619406-18619531)
chr8 (4-129)||(22147533-22147658)
chr8 (4-129)||(2545041-2545166)
chr8 (70-187)||(18118259-18118376)
chr8 (33-173)||(21494452-21494592)
chr8 (5-128)||(3431317-3431440)
chr8 (1-44)||(19993167-19993210)
chr8 (1-44)||(22234916-22234959)
chr8 (23-129)||(22886440-22886546)
chr8 (2-134)||(16002089-16002222)
chr8 (1-44)||(20573305-20573348)
chr8 (1-44)||(37611759-37611802)
chr8 (1-44)||(41246749-41246792)
chr8 (1-44)||(20481696-20481739)
chr8 (1-103)||(22497263-22497365)
chr8 (1-44)||(21681093-21681137)
chr8 (5-77)||(22981286-22981358)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (1-306)||(5941-6247)
scaffold0686 (119-306)||(5735-5923)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-307)||(309-615)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (1-307)||(3992641-3992948)
chr3 (1-307)||(7854073-7854380)
chr3 (1-307)||(2844282-2844589)
chr3 (1-307)||(54037981-54038288)
chr3 (1-307)||(17955837-17956148)
chr3 (1-307)||(45581722-45582029)
chr3 (1-264)||(30153033-30153297)
chr3 (46-307)||(55513006-55513268)
chr3 (1-252)||(54685213-54685465)
chr3 (3-264)||(38168007-38168269)
chr3 (1-264)||(53771132-53771397)
chr3 (1-264)||(23492464-23492728)
chr3 (5-252)||(33341976-33342224)
chr3 (1-264)||(16261544-16261809)
chr3 (12-252)||(28558273-28558514)
chr3 (5-223)||(18970016-18970234)
chr3 (7-264)||(48421674-48421930)
chr3 (26-297)||(15550714-15550986)
chr3 (232-307)||(19232089-19232164)
chr3 (4-173)||(19946793-19946962)
chr3 (232-307)||(15857120-15857195)
chr3 (232-307)||(16743998-16744073)
chr3 (4-129)||(8275880-8276005)
chr3 (4-129)||(14285056-14285181)
chr3 (5-128)||(16934010-16934133)
chr3 (2-210)||(17393526-17393735)
chr3 (4-129)||(8268780-8268905)
chr3 (4-129)||(9303135-9303260)
chr3 (70-158)||(14177017-14177105)
chr3 (1-44)||(12349652-12349695)
chr3 (1-44)||(13817603-13817646)
chr3 (1-44)||(16996172-16996215)
chr3 (1-44)||(19570801-19570844)
chr3 (1-44)||(50112164-50112207)
chr3 (1-44)||(53898568-53898611)
chr3 (72-218)||(11402752-11402898)
chr3 (5-49)||(34439451-34439495)
chr3 (1-44)||(317621-317664)
chr3 (1-44)||(6146859-6146902)
chr3 (1-44)||(6154444-6154487)
chr3 (1-44)||(14298512-14298555)
chr3 (1-44)||(14304139-14304182)
chr3 (1-44)||(22144385-22144428)
chr3 (1-44)||(35123787-35123830)
chr3 (70-128)||(12539098-12539156)
chr3 (1-44)||(12349843-12349886)
chr3 (1-44)||(17100744-17100787)
chr3 (1-44)||(17101429-17101472)
chr3 (1-103)||(43427570-43427672)
chr3 (1-44)||(54424103-54424146)
chr3 (2-117)||(10912977-10913093)
chr3 (1-44)||(11061118-11061162)
chr3 (1-44)||(14295529-14295573)
chr3 (1-44)||(14301156-14301200)
chr3 (1-37)||(16182065-16182101)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (1-307)||(166121-166428)
scaffold0016 (1-306)||(162036-162342)
scaffold0016 (1-44)||(164306-164349)
scaffold0016 (230-305)||(116410-116485)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (1-263)||(11342776-11343039)
chr5 (1-264)||(2031901-2032165)
chr5 (1-251)||(21205017-21205268)
chr5 (1-264)||(21650786-21651050)
chr5 (4-264)||(16105738-16105999)
chr5 (35-187)||(22662653-22662805)
chr5 (9-188)||(25004915-25005094)
chr5 (4-129)||(7528995-7529120)
chr5 (4-129)||(108868-108993)
chr5 (4-129)||(17909600-17909725)
chr5 (5-128)||(9730419-9730542)
chr5 (233-307)||(11584374-11584448)
chr5 (1-44)||(21397183-21397226)
chr5 (1-44)||(24183245-24183288)
chr5 (3-44)||(24475671-24475712)
chr5 (1-44)||(1168317-1168360)
chr5 (1-44)||(4865354-4865397)
chr5 (1-44)||(20712167-20712210)
chr5 (1-44)||(28261612-28261655)
chr5 (9-44)||(11584153-11584188)
chr5 (2-103)||(23417333-23417435)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (1-264)||(55672-55936)
scaffold0032 (162-264)||(108075-108179)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (1-264)||(6443-6707)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (1-264)||(878-1142)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (1-252)||(17316-17568)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (1-264)||(13285-13550)
scaffold0251 (1-93)||(21432-21524)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (33-307)||(30217-30492)
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[»] scaffold0359 (2 HSPs)
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Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 35015321 - 35015014
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35015321 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 35015222  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35015221 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaatt 35015122  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35015121 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 35015022  T
Q  300 ctcctatg 307  Q
    ||||||||    
T  35015021 ctcctatg 35015014  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19983455 - 19983149
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983455 tcacaattcatcaacaatcatgcataattcactaattgagcatagtttt-aaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 19983357  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983356 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattggattcatgataatcacttattctcataatcaatt 19983257  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983256 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 19983157  T
Q  300 ctcctatg 307  Q
    ||||||||    
T  19983156 ctcctatg 19983149  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 18583408 - 18583715
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18583408 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 18583507  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  18583508 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaatg 18583607  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18583608 atgcatagaacaggagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttg 18583707  T
Q  300 ctcctatg 307  Q
    ||||||||    
T  18583708 ctcctatg 18583715  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 26089826 - 26090091
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26089826 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacattatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 26089925  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26089926 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 26090025  T
Q  201 atgcatagaa-caagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  26090026 atgcatagaatcaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 26090091  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18002660 - 18002395
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002660 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcatcaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 18002561  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18002560 tcatttaacatcaaatgaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttatgcccataatcaatt 18002461  T
Q  201 atgcatagaa-caagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  18002460 atgcatagaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 18002395  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 23995014 - 23995279
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23995014 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccat 23995113  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995114 tcatttaacatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaattccaaatattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 23995213  T
Q  201 atgcatagaa-caagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  23995214 atgcatagaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 23995279  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15742384 - 15742120
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742384 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatatacaaattacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 15742285  T
Q  101 tcatttaa-catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742284 tcatttaatcatcaaattaacataatcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaat 15742185  T
Q  200 tatgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  15742184 tatgcat-gaacaagagaaaaagaattaaccaaaggattatgataaagactaacccccttacctta 15742120  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 263
Target Start/End: Original strand, 4991167 - 4991427
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||| |||||    
T  4991167 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatattatttcatcatcaaccattca 4991266  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatg 203  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991267 tttaacatcaaat-aacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatg 4991365  T
Q  204 catagaa-caagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctt 263  Q
    |||| || |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  4991366 cataaaatcaagagaaaaagaattaaacaaatgattatgataaagactaacccccttacctt 4991427  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22585710 - 22585470
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22585710 tcacaattcaacaacaacatgtcataattcttcaattgagcataattcacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaat 22585611  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||    
T  22585610 tcaattatcatcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcaaaataatcacttattcaaataagcactt 22585511  T
Q  201 atgcatagaacaagagaaaag-aattaactaaatgattatg 240  Q
    |||||||||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||    
T  22585510 atgcatagaaaaagagagaagaaactaactaagtgattatg 22585470  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22590541 - 22590301
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22590541 tcacaattcaacaacaacatgtcataattcttcaattgagcataattcacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaat 22590442  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||    
T  22590441 tcaattatcatcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcaaaataatcacttattcaaataagcactt 22590342  T
Q  201 atgcatagaacaagagaaaag-aattaactaaatgattatg 240  Q
    |||||||||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||    
T  22590341 atgcatagaaaaagagagaagaaactaactaagtgattatg 22590301  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15889870 - 15889628
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||||   ||||||||| || |||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  15889870 tcacaattcatcaacaacatgtcataattcatcagttgaacataattcacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaaa 15889771  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||  |||| || ||    
T  15889770 tcaattatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaggttgggttcacaataatcacgtattcaaataaacactt 15889671  T
Q  201 atgcatagaacaagagaaaag-aattaactaaatgattatgat 242  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  15889670 atgcatagaaaaagagagaagaaattaactaagtgattatgat 15889628  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15005070 - 15004831
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  15005070 tcacaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattgaacataattcacaaactacccatttatatacatcataaacatgcaatttcctcatcaacaat 15004971  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||  |||| || ||    
T  15004970 tcaatcaacatcaaatt-acatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatctcttattcaaataagcactt 15004872  T
Q  201 atgcatagaacaagagaaaag-aattaactaaatgattatg 240  Q
    |||||||||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||    
T  15004871 atgcatagaaaaagagagaagaaactaactaagtgattatg 15004831  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25640715 - 25640456
Alignment:
Q  5 aattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcat 104  Q
    |||||||||||||||   || |||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  25640715 aattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattgagcacaattcacaaactacccatttatctacatcatgaacatgcaatttcatcatcaaaaattcaa 25640616  T
Q  105 ttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc 204  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||    
T  25640615 ttatcatcaaattaacatactcaaacatat-cctacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgc 25640517  T
Q  205 atagaacaagagaaaag-aattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    |||||| ||||||  || ||||| |||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||    
T  25640516 atagaaaaagagagtagaaattacctaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 25640456  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 32276924 - 32276756
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||| ||||   || |||||| ||||| ||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  32276924 caattcaacaataacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 32276825  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttca 172  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||  |||  | |  |||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  32276824 tttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttca 32276756  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Original strand, 19629425 - 19629550
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   || |||||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  19629425 caattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 19629524  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  19629525 tttatcattcaattaacatactcaaa 19629550  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 18823548 - 18823423
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||| ||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  18823548 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataacttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 18823449  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  18823448 tttatcattcaattaacatactcaaa 18823423  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 13014865 - 13014822
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13014865 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 13014822  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17375083 - 17374924
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||| ||||||||||||   |||| |||| || |||||||||||| |  || ||||||| |  ||||| ||||||| || |||||||||||||| |||    
T  17375083 tcacaaatcaacaacaacatgacatagttcatcatttgagcataattcatcaagtatccatatatatacaccatgaacatgtaatttcatcatcaataat 17374984  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaa 160  Q
    ||| ||| || ||||||| |||| ||||| ||||  |||| ||   ||||||||||||||    
T  17374983 tcaattatcaacaaattagcatactcaaacatatcactacaactagagcacgaatttcaa 17374924  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16300141 - 16300016
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||| ||||||   ||||||| | |||||  |||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  16300141 caattcaaccacaacatgtcataatttatcaattaggcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 16300042  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  16300041 tttatcattcaattaacatactcaaa 16300016  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 18839403 - 18839278
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||| ||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  18839403 caattcaacaataacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 18839304  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  | |||||||| |||||    
T  18839303 tttatcattcagttaacatactcaaa 18839278  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 18432734 - 18432777
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18432734 tcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcata 18432777  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 31628359 - 31628402
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31628359 tcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcata 31628402  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 32898881 - 32898924
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32898881 tcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcata 32898924  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 117
Target Start/End: Original strand, 26512260 - 26512349
Alignment:
Q  28 ttcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaatt 117  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||| || ||||||| || ||||||||||  || |||||||||    
T  26512260 ttcatcaattgagcataattcacaaactacccatttatatatatcataaacatgtaatttcaacaacaacaattcaaatatcatcaaatt 26512349  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 117
Target Start/End: Original strand, 26517376 - 26517465
Alignment:
Q  28 ttcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaatt 117  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||| || ||||||| || ||||||||||  || |||||||||    
T  26517376 ttcatcaattgagcataattcacaaactacccatttatatatatcataaacatgtaatttcaacaacaacaattcaaatatcatcaaatt 26517465  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 134
Target Start/End: Original strand, 21931364 - 21931428
Alignment:
Q  70 atcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaatatat 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| || | ||||||||| ||||    
T  21931364 atcatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaatttcatatattcaaacatat 21931428  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 16106607 - 16106650
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  16106607 tcacaattcaacaacaacaaggtataattcaccaattaagcata 16106650  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 18570370 - 18570413
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18570370 tcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata 18570413  T

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Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 44
Target Start/End: Original strand, 22441037 - 22441068
Alignment:
Q  13 aacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22441037 aacaacaatgcataattcaccaattgagcata 22441068  T

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Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 25744369 - 25744331
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattga 39  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25744369 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccacttga 25744331  T

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Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 18381839 - 18381803
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt 37  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18381839 tcacaattcaacaacaacaaagcataattcaacaatt 18381803  T

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Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 35009606 - 35009558
Alignment:
Q  5 aattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaa 53  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  35009606 aattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaaa 35009558  T

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Target: scaffold0184 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31444 - 31137
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31444 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 31345  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31344 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacacatgtctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 31245  T
Q  201 atgcatagaacaagagaaaa-gaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31244 atgcatagaacaagagaaaatgaattaactaaatgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 31145  T
Q  300 ctcctatg 307  Q
    ||||||||    
T  31144 ctcctatg 31137  T

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Target: scaffold0078 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 41400 - 41707
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41400 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 41499  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41500 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacacatgtctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 41599  T
Q  201 atgcatagaacaagagaaaa-gaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41600 atgcatagaacaagagaaaatgaattaactaaatgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 41699  T
Q  300 ctcctatg 307  Q
    ||||||||    
T  41700 ctcctatg 41707  T

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Target: chr2 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 22274813 - 22275120
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22274813 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaacaacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 22274912  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22274913 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 22275012  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275013 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaggctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 22275112  T
Q  300 ctcctatg 307  Q
    ||||||||    
T  22275113 ctcctatg 22275120  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 22284046 - 22284353
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284046 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttactaactattcattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 22284145  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22284146 tcatttaacattaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgagttcatgataatcacttattctcataatcaaat 22284245  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22284246 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttg 22284345  T
Q  300 ctcctatg 307  Q
    ||||||||    
T  22284346 ctcctatg 22284353  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9653057 - 9652796
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9653057 caattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 9652958  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9652957 tttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataaccacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatg 9652858  T
Q  204 catagaacaag-agaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  9652857 catagaacaagaaaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 9652796  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21274211 - 21273955
Alignment:
Q  3 acaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattc 102  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21274211 acaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattc 21274112  T
Q  103 atttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattat 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21274111 atttaacatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattat 21274012  T
Q  203 gcatagaa-caagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctt 257  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21274011 gcatagaatcaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccctt 21273955  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 307
Target Start/End: Original strand, 15633308 - 15633612
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  15633308 caattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcaaacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 15633407  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatg 203  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||  |||  | |  |||  |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15633408 tttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaagaattgggttcattataatcacttattctcataatcaattatg 15633507  T
Q  204 catagaacaagagaaaa-gaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctc 302  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15633508 catagaacaagagaaaaagaattaactaagtgattatgataaagactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgctc 15633607  T
Q  303 ctatg 307  Q
    |||||    
T  15633608 ctatg 15633612  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 263
Target Start/End: Original strand, 25213143 - 25213403
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||| |||||    
T  25213143 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatattatttcatcatcaaccattca 25213242  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatg 203  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213243 tttaacatcaa-ttaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatg 25213341  T
Q  204 catagaa-caagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctt 263  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  25213342 catagaatcaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctt 25213403  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 7321612 - 7321872
Alignment:
Q  5 aattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcat 104  Q
    |||||||||||||||   || |||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||| || ||||||||||| || ||||||     
T  7321612 aattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattgagcacaattcacaaactacccatttatatacatcataaacatgaaatttcatcataaaaaattcaa 7321711  T
Q  105 ttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc 204  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||| |||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||  |||| ||  |||||    
T  7321712 ttatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaatagtcacttattcaaataagcacgtatgc 7321811  T
Q  205 atagaacaagagaaaag-aattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    |||| | ||||||  || |||||||||| ||||||| || ||  ||||| || ||||||||    
T  7321812 ataggaaaagagagtagaaattaactaagtgattataatgaattctaacccccttacctta 7321872  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 232 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20627270 - 20627195
Alignment:
Q  232 atgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 307  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20627270 atgattatgataaagactaaccccgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 20627195  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 232 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19794661 - 19794586
Alignment:
Q  232 atgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 307  Q
    ||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19794661 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcttatg 19794586  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 232 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 43642913 - 43642838
Alignment:
Q  232 atgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 307  Q
    |||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43642913 atgattatgataaagactaacctccttcccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 43642838  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 33128136 - 33128264
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  33128136 tcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaat 33128235  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    ||||||| |||  |||||||||| |||||    
T  33128236 tcatttatcattcaattaacatactcaaa 33128264  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 187
Target Start/End: Original strand, 20279571 - 20279688
Alignment:
Q  70 atcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggt 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||  |||| |||| ||||  |||| |||||||||||||| ||||  ||    
T  20279571 atcatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcatatacccaaacatatctctataacatgagcacgaatttcaacgattaagt 20279670  T
Q  170 tcatgataatcacttatt 187  Q
    |||  |||||||||||||    
T  20279671 tcaccataatcacttatt 20279688  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 24826879 - 24826754
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  24826879 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 24826780  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  24826779 tttatcattcaattaacatactcaaa 24826754  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 28031399 - 28031230
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  28031399 caattcaacaacaacatatcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcacacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 28031300  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 173  Q
    |||| ||   |||||||||| | |||  |||  | |  |||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28031299 tttatcaatcaattaacatactaaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 28031230  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 23836861 - 23836791
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaac-tatccattttcataca 70  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || || |||||||||||||    
T  23836861 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttttcacacatacccattttcataca 23836791  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 17204426 - 17204550
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  17204426 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 17204525  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaa 128  Q
    ||||  ||  |||||||||| ||||    
T  17204526 tttatgatgcaattaacatactcaa 17204550  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 25876075 - 25876032
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25876075 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 25876032  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 271261 - 271304
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  271261 tcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgagcata 271304  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 32465949 - 32465992
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32465949 tcacaattcatcaagaacaatgcataattcaccaattgagcata 32465992  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 6879528 - 6879567
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgag 40  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6879528 tcacaattcatcaataacaatgcataattcaccaattgag 6879567  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 9636836 - 9636938
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaa 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||| | |  |||||| |||||||||| || ||||||    
T  9636836 tcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcataattcacaatatat-cattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaa 9636934  T
Q  100 ttca 103  Q
    ||||    
T  9636935 ttca 9636938  T

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Target: chr7 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 32494210 - 32493903
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32494210 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 32494111  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32494110 ttatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataaacacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaatt 32494011  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32494010 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 32493911  T
Q  300 ctcctatg 307  Q
    ||||||||    
T  32493910 ctcctatg 32493903  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 126506 - 126813
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126506 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 126605  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126606 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctgcaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 126705  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  126706 atgcatagaacaatagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcatttttg 126805  T
Q  300 ctcctatg 307  Q
    ||||||||    
T  126806 ctcctatg 126813  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 111433 - 111126
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  111433 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccat 111334  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  111333 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaatattgggttcatgataatcacttattttcataatcaatt 111234  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  111233 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaacttttagctcaagcttcacttttg 111134  T
Q  300 ctcctatg 307  Q
    ||||||||    
T  111133 ctcctatg 111126  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 1937172 - 1936874
Alignment:
Q  5 aattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcat 104  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1937172 aattcatcaacaaccatacataattcaccaattgagcataatttacaaactacccatttt-----atcatgaacttgcaatttcatcatgaacaattcat 1937078  T
Q  105 ttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1937077 ttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc 1936978  T
Q  205 atagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc 303  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  1936977 atagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgcttc 1936878  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 2029012 - 2029276
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029012 tcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcgtacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 2029111  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029112 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatatctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 2029211  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  2029212 atgcatagaacaagagaaaaaaaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 2029276  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 2190350 - 2190097
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2190350 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccat 2190251  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2190250 tcatttaacatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggtacatgataatcacttattctcataatcaatt 2190151  T
Q  201 atgcatagaa-caagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaac 252  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2190150 atgcatagaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaaaactaac 2190097  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 42056453 - 42056188
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42056453 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataattcacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccat 42056354  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056353 tcatttaacatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 42056254  T
Q  201 atgcatagaa-caagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  42056253 atgcatagaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 42056188  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 3049674 - 3049937
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  3049674 tcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccatattcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcc-caat 3049772  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3049773 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaatataaacacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 3049872  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3049873 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 3049937  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39291648 - 39291451
Alignment:
Q  26 aattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatatt 125  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  39291648 aattcaccaattgagcataattcacaaactacccatttatatacatcatcaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcatcaaattaacatact 39291549  T
Q  126 caaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaagaa 223  Q
    |||| ||||  |||| |||| |||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||  ||||  | |||||||||||| |||||| |||||    
T  39291548 caaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttaggttcacaataatcacttattcaaataagtacttatgcatagaaaaagagagaagaa 39291451  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 126 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15516901 - 15516773
Alignment:
Q  126 caaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-caagag-aaaagaa 223  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15516901 caaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatcaagagaaaaagaa 15516802  T
Q  224 ttaactaaatgattatgataaaaactaac 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15516801 ttaaccaaatgattatgataaagactaac 15516773  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 13352046 - 13352265
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| | | |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  13352046 caattcaacaacaacatgtcataattcatcaattgagcataattaaaatactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcaccatcaacaaatca 13352145  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatg 203  Q
      || ||||||||||||||| | ||| ||||  |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||  |||| || |||||    
T  13352146 aatatcatcaaattaacatactgaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaagggttgggttcacaataatcacttattcaaataaacacttatg 13352245  T
Q  204 catagaacaagagaaaagaa 223  Q
    ||||||| |||||| |||||    
T  13352246 catagaaaaagagagaagaa 13352265  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15978004 - 15977820
Alignment:
Q  2 cacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaatt 101  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| || ||||| |||||| |  || ||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15978004 cacaattcaacaacaacatgtcataattcatcatttgagtataattcatcaagtatccatatatatacaccatgaacatgcaatttcatcatcaataatt 15977905  T
Q  102 catttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttat 186  Q
    || ||| || |||||||||||| ||||| ||||  |||| ||   |||| |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  15977904 caattatcaacaaattaacatactcaaacatatcactacaactagagcatgaatttcaaacatttagttcataataatcacttat 15977820  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 232 - 305
Target Start/End: Original strand, 3060271 - 3060344
Alignment:
Q  232 atgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 305  Q
    |||||||||||||| ||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3060271 atgattatgataaagacttacccccttaccttcattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 3060344  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 7283987 - 7283913
Alignment:
Q  233 tgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 307  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7283987 tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttttgctcctatg 7283913  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 128
Target Start/End: Original strand, 371185 - 371308
Alignment:
Q  5 aattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcat 104  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  371185 aattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcat 371284  T
Q  105 ttaacatcaaattaacatattcaa 128  Q
    ||| |||  |||||||||| ||||    
T  371285 ttatcattcaattaacatactcaa 371308  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 12369996 - 12369953
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12369996 tcacaattcaacaacaacaaggcataattcaccaattgagcata 12369953  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 143730 - 143773
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  143730 tcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgagcata 143773  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 15822587 - 15822544
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15822587 tcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccatttgagcata 15822544  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 39046779 - 39046740
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgag 40  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39046779 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 39046740  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 44865321 - 44865364
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44865321 tcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaattgagcata 44865364  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 47289872 - 47289915
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47289872 tcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgagcata 47289915  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 44
Target Start/End: Original strand, 35094909 - 35094950
Alignment:
Q  3 acaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35094909 acaattcatcaacaacagtgcataattcaccaattgagcata 35094950  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 8563434 - 8563370
Alignment:
Q  70 atcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaatatat 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  8563434 atcatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcatatactcaaacatat 8563370  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18151399 - 18151259
Alignment:
Q  70 atcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggt 169  Q
    ||||||||| | ||| ||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||   ||  ||||  |||| |||| |||||||||||||| | ||  ||    
T  18151399 atcatgaacatacaaattcgtcatcaacaattcaattatcaacaaattaacatacctaatcatatcactacaacatgagcacgaatttcaacggttaagt 18151300  T
Q  170 tcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 210  Q
    |||  ||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||    
T  18151299 tcacaataatcacttattcaaataagaatttatgcatagaa 18151259  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 3895116 - 3895159
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3895116 tcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata 3895159  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 7284216 - 7284173
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  7284216 tcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaattaagcata 7284173  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 11287508 - 11287551
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11287508 tcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata 11287551  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 28722201 - 28722303
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaa 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||| | |  |||||| |||||||||| || ||||||    
T  28722201 tcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatat-cattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaa 28722299  T
Q  100 ttca 103  Q
    ||||    
T  28722300 ttca 28722303  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 12248277 - 12248233
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  12248277 tcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcata 12248233  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 13274878 - 13274922
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  13274878 tcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcata 13274922  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 13863086 - 13863042
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  13863086 tcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcata 13863042  T

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Target: chr4 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25119371 - 25119064
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25119371 tcacaattcatcaaaaaccatgcataattcaccaattgatcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 25119272  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25119271 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaattttcaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaatt 25119172  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25119171 atgcatagaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaaaactaactcccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 25119072  T
Q  300 ctcctatg 307  Q
    ||||||||    
T  25119071 ctcctatg 25119064  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 5682691 - 5682385
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5682691 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccaatttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 5682592  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5682591 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 5682492  T
Q  201 atgcatagaacaagagaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgc 300  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  5682491 atgcatagaacaagaggaaaaaattaactaaatgattatgataaaaactaacccacttaccttaattatcaccaactattagctcatgcttcacttttgc 5682392  T
Q  301 tcctatg 307  Q
    |||||||    
T  5682391 tcctatg 5682385  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 14951853 - 14952117
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14951853 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 14951952  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14951953 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 14952052  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  14952053 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 14952117  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15272476 - 15272211
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15272476 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccat 15272377  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272376 tcgtttaacatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 15272277  T
Q  201 atgcatagaa-caagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  15272276 atgcatagaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 15272211  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 240
Target Start/End: Original strand, 19559483 - 19559690
Alignment:
Q  34 aattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaatata 133  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  19559483 aattgagcataattcacaaactacccatttacatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattaacatcaaattaacatgctcaaacata 19559582  T
Q  134 tatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaag-aattaactaaa 232  Q
    |  |||| |||| |||| ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||     
T  19559583 tcactacaacatgagcaggaatttcaaaagttgggtacataataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagagagaagaaattaactaat 19559682  T
Q  233 tgattatg 240  Q
    ||||||||    
T  19559683 tgattatg 19559690  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Original strand, 49071800 - 49071994
Alignment:
Q  23 cataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 122  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |  || ||| ||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  49071800 cataattcatcaattgagcatatttcatcaagtattcatatacatatatcatgaacatgcaatttcatcatcaataattcaattaacatcaaattaacat 49071899  T
Q  123 attcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagaga 217  Q
    | ||||| ||||  |||| | || |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||    
T  49071900 actcaaacatatcactacaatatgagcacgaatttcaacggttgggttcacaatgatcacttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagaga 49071994  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 34177797 - 34177617
Alignment:
Q  7 ttcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcattt 106  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  34177797 ttcaacaacaacaagtcataattcaccaattgaacataattctcaa-ctacccatttatatacatcatgaacatgcaattttatcatcaacaattcaatt 34177699  T
Q  107 aacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 188  Q
    | |||  |||||||||| ||||| ||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  34177698 atcatgtaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaattttcaagattggattcacaataatcacttattc 34177617  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 163 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15136010 - 15135907
Alignment:
Q  163 attgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-caagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttac 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  15136010 attgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttac 15135911  T
Q  261 ctta 264  Q
    ||||    
T  15135910 ctta 15135907  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14500377 - 14500208
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||| ||||||    
T  14500377 caattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaataattca 14500278  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 173  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||  |||  | |  |||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14500277 tttatcattaaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 14500208  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 232 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 54118200 - 54118125
Alignment:
Q  232 atgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 307  Q
    ||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54118200 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcttatg 54118125  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Original strand, 14996222 - 14996347
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||     
T  14996222 caattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattct 14996321  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  14996322 tttatcattcaattaacatactcaaa 14996347  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Original strand, 16522913 - 16523038
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  16522913 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 16523012  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  16523013 tttatcattcaattaacatactcaaa 16523038  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Original strand, 8045039 - 8045164
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| | ||||| |||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  8045039 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattctcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 8045138  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  8045139 tttatcattcaattaacatactcaaa 8045164  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Original strand, 9295789 - 9295914
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||| | ||||||||||    
T  9295789 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcattaccaacaattca 9295888  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  9295889 tttatcattcaattaacatactcaaa 9295914  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 32460820 - 32460699
Alignment:
Q  52 aactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcac 151  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||  |||| | |  |||  |||||    
T  32460820 aactaccccttttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaaattataaccaaaacaagagcac 32460721  T
Q  152 gaatttcaaagattgggttcat 173  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  32460720 gaaattcaaagattgggttcat 32460699  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 820072 - 820029
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  820072 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 820029  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 34395348 - 34395391
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34395348 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 34395391  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Original strand, 9795311 - 9795436
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||   |||||  |||||| | |||| |||||| ||  ||||||||| ||| ||||||    
T  9795311 caattcaacaacaacatgtcataattcaccaattaaacataatttcacaactactcattttgacacattatgaacatgttatttcatcaccaagaattca 9795410  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  9795411 tttatcattcaattaacatactcaaa 9795436  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 8872627 - 8872584
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8872627 tcacaattcatcaacaacaacgcataattcaccaattgagcata 8872584  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 30457994 - 30458037
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30457994 tcacaattcatcaacaacaatgcgtaattcaccaattgagcata 30458037  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 44056006 - 44056049
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44056006 tcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcata 44056049  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 53704889 - 53704846
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53704889 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 53704846  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 53907855 - 53907812
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53907855 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgggcata 53907812  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 19697533 - 19697408
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||   ||| |  |||| |||||||| |||||| ||  ||||||| |  |||||||||    
T  19697533 caattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataacaactcattctcatacattatgaacatgttatttcataactaacaattca 19697434  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  19697433 tttatcattcaattaacatactcaaa 19697408  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 19708118 - 19707993
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||   ||| |  |||| |||||||| |||||| ||  ||||||| |  |||||||||    
T  19708118 caattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataacaactcattctcatacattatgaacatgttatttcataactaacaattca 19708019  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  19708018 tttatcattcaattaacatactcaaa 19707993  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 21417471 - 21417536
Alignment:
Q  74 tgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatcta 139  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  21417471 tgaacatgaaatttcatcatcaacaattcaattatcaacaaattcacatattcaaacatatctcta 21417536  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12133686 - 12133643
Alignment:
Q  80 tgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12133686 tgcaatttcatcattaacaattcaattaacaacaaattaacata 12133643  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 12837356 - 12837313
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12837356 tcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcata 12837313  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 16732260 - 16732303
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16732260 tcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata 16732303  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 21959619 - 21959576
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21959619 tcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata 21959576  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 23270090 - 23270051
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgag 40  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23270090 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcatcaattgag 23270051  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 30232652 - 30232609
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30232652 tcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcata 30232609  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 44346918 - 44346961
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44346918 tcacaattcatgaacaacaatgtataattcaccaattgagcata 44346961  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 45459011 - 45458968
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  45459011 tcacaattcaacaacagcaaagcataattcaccaattgaacata 45458968  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 55376753 - 55376714
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgag 40  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55376753 tcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaattgag 55376714  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 52265664 - 52265628
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt 37  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  52265664 tcacaattcaacaacaacattgcataattcaacaatt 52265628  T

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Target: chr1 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 44035135 - 44034829
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44035135 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaaatgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 44035036  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44035035 tcattaaacatcaaattaacatattcaaacatatatctacaacataaacaagaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 44034936  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44034935 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 44034836  T
Q  300 ctcctat 306  Q
    |||||||    
T  44034835 ctcctat 44034829  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 21860102 - 21860409
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21860102 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactactcattttcattcatcatgaacttgcaatttcatcattaacaat 21860201  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21860202 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagtacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaatt 21860301  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21860302 atgcatagaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 21860401  T
Q  300 ctcctatg 307  Q
    ||||||||    
T  21860402 ctcctatg 21860409  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15861590 - 15861327
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861590 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 15861491  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15861490 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaatt 15861391  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctt 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  15861390 atgcatagaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctt 15861327  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 22367110 - 22367296
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367110 tcacaattcatcaacaaccatgcata-ttcaccaattgagcataatttacaaactactcattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 22367208  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367209 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 22367296  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 172 - 307
Target Start/End: Original strand, 41218667 - 41218803
Alignment:
Q  172 atgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaa-gaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatc 270  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  41218667 atgagaatcacttattcccataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgatcatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc 41218766  T
Q  271 tccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 307  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41218767 accaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 41218803  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 232 - 307
Target Start/End: Original strand, 41394527 - 41394602
Alignment:
Q  232 atgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 307  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41394527 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttagctcctatg 41394602  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21650199 - 21650076
Alignment:
Q  5 aattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcat 104  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  21650199 aattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcat 21650100  T
Q  105 ttaacatcaaattaacatattcaa 128  Q
    ||| |||  |||||||||| ||||    
T  21650099 ttatcattcaattaacatactcaa 21650076  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Original strand, 20254408 - 20254533
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   || |||||| ||||| ||||||||||   ||| |  ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  20254408 caattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaactcattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 20254507  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  20254508 tttatcattcaattaacatactcaaa 20254533  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 22403266 - 22403223
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22403266 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 22403223  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 35522475 - 35522432
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35522475 tcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcata 35522432  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 49967741 - 49967784
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49967741 tcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaattgagcata 49967784  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 40436425 - 40436292
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaa 99  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||  |||| ||||||| | || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  40436425 tcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatc-attttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaa 40436327  T
Q  100 ttcatttaacatcaaattaacatattcaaatatat 134  Q
    |||| ||| || ||| || | ||||||||| ||||    
T  40436326 ttcaattatcaccaatttcatatattcaaacatat 40436292  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 27329911 - 27329868
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27329911 tcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcata 27329868  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 305
Target Start/End: Original strand, 27675120 - 27675191
Alignment:
Q  234 gattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 305  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||||| |||||||    
T  27675120 gattatgataaattctaacccccttaccttaattatctccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 27675191  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 41212163 - 41212206
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  41212163 tcacaattcatcaacaacagtgcataattcactaattgagcata 41212206  T

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Target: scaffold0034 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 79955 - 80262
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79955 tcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 80054  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80055 ttatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacaaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 80154  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  80155 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcaagcttcacttttg 80254  T
Q  300 ctcctatg 307  Q
    ||||||||    
T  80255 ctcctatg 80262  T

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Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 46256 - 46299
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  46256 tcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcata 46299  T

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Target: chr8 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 32)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24717026 - 24716719
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24717026 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcgtgaacttgcaatttcattatcaacaat 24716927  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716926 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctaccatataaccacgaatttcaaagatcgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 24716827  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716826 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctagcttcacttttg 24716727  T
Q  300 ctcctatg 307  Q
    ||||||||    
T  24716726 ctcctatg 24716719  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 274534 - 274841
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  274534 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgaacataatttacaaactacacattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 274633  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  274634 tcatttagcatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacatacgcacgaatttcaaagattgggttcatgataataacttattctcataatcaatt 274733  T
Q  201 atgcatagaacaagagaaaa-gaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  274734 atgcataggacaagagaaaatggattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 274833  T
Q  300 ctcctatg 307  Q
    ||||||||    
T  274834 ctcctatg 274841  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 641315 - 641008
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  641315 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgaacataatttacaaactacacattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 641216  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  641215 tcatttagcatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacatacgcacgaatttcaaagattgggttcatgataataacttattctcataatcaatt 641116  T
Q  201 atgcatagaacaagagaaaa-gaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  641115 atgcataggacaagagaaaatggattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 641016  T
Q  300 ctcctatg 307  Q
    ||||||||    
T  641015 ctcctatg 641008  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 827121 - 826814
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  827121 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgaacataatttacaaactacacattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 827022  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  827021 tcatttagcatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacatacgcacgaatttcaaagattgggttcatgataataacttattctcataatcaatt 826922  T
Q  201 atgcatagaacaagagaaaa-gaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826921 atgcataggacaagagaaaatggattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 826822  T
Q  300 ctcctatg 307  Q
    ||||||||    
T  826821 ctcctatg 826814  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 39115366 - 39115673
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39115366 tcacgattcatcaacaactatgcataattcaccaattgagcataatttacaaattacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 39115465  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39115466 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctttacaacataagcacgaatgtcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaatt 39115565  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  39115566 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacacccttaccttaattattaccaactattagctcaagcttcacttttg 39115665  T
Q  300 ctcctatg 307  Q
    ||||||||    
T  39115666 ctcctatg 39115673  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 41506973 - 41506709
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41506973 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 41506874  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41506873 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacggatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaatt 41506774  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  41506773 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 41506709  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24385914 - 24385652
Alignment:
Q  3 acaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattc 102  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385914 acaattcatcaacaacaatgcttaattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattc 24385815  T
Q  103 atttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattat 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385814 atttaacatcaaattatcatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcataataatcacttattctcataatcaattat 24385715  T
Q  203 gcatagaacaagagaaaa-gaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  24385714 gcatagaacaagagaaaaggaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 24385652  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22321587 - 22321437
Alignment:
Q  24 ataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22321587 ataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacgtcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcaattaacatcaaattaacata 22321488  T
Q  124 ttcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 174  Q
    |||||| |||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321487 ttcaaacatatctctacaacctgagcacgaatttcaaagattgggttcatg 22321437  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 23217968 - 23218208
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  23217968 tcacatttcaacaacaacatgtcataattcatcaattgaacataattcacaaactagccatttatatacatcattaacatgcaatttcatcattaacaat 23218067  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||    
T  23218068 tcaatcatcatcaaattaacatactcaaacatatcactaccacataagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaataagcactt 23218167  T
Q  201 atgcatagaacaagagaaaag-aattaactaaatgattatg 240  Q
    |||||||||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||    
T  23218168 atgcatagaaaaagagagaagaaactaactaagtgattatg 23218208  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21259630 - 21259391
Alignment:
Q  26 aattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatatt 125  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  21259630 aattcatcaattgagcacaattcacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaaaaattcaattatcatcaaattaacatact 21259531  T
Q  126 caaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaag-aat 224  Q
    |||| ||||  |||| |||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||  || |||    
T  21259530 caaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagagagtagaaat 21259431  T
Q  225 taactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    ||||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||    
T  21259430 taactaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 21259391  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 240
Target Start/End: Original strand, 17502274 - 17502492
Alignment:
Q  23 cataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 122  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||    
T  17502274 cataattcatcaattgaacataattcacaaactacccttttatatacatcatgaacatgcaatttcatcattaacaattcaatcatcatcaaattaacat 17502373  T
Q  123 attcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaag- 221  Q
    | ||||| ||||  |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||| |||||| |||     
T  17502374 actcaaacatatcactacaacatgagcacaaatttcaaagattgggttcataataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagagagaaga 17502473  T
Q  222 aattaactaaatgattatg 240  Q
    || ||||||| ||||||||    
T  17502474 aactaactaagtgattatg 17502492  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16039045 - 16038917
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16039045 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcactaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 16038946  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    ||||||| |||  |||||||||| |||||    
T  16038945 tcatttatcattcaattaacatactcaaa 16038917  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 223
Target Start/End: Original strand, 4233968 - 4234168
Alignment:
Q  23 cataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 122  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||    
T  4233968 cataattcatcaattgaaaataattcacaaactacccatttatatacatcataaacatgcaatttcatcattaacaattcaatcatcatcaaattaacat 4234067  T
Q  123 attcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaga 222  Q
    | ||||| ||||  || | |||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| || |||||||||||| |||||| ||||    
T  4234068 actcaaacatatcactgcaacatgagcacaaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagagagaaga 4234167  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  4234168 a 4234168  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 232 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16404932 - 16404857
Alignment:
Q  232 atgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 307  Q
    ||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16404932 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 16404857  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Original strand, 18612501 - 18612626
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   || |||||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  18612501 caattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaatccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 18612600  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  18612601 tttatcattcaattaacatactcaaa 18612626  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Original strand, 18619406 - 18619531
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   || |||||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  18619406 caattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaatccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 18619505  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  18619506 tttatcattcaattaacatactcaaa 18619531  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Original strand, 22147533 - 22147658
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   || |||||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  22147533 caattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 22147632  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  22147633 tttatcattcaattaacatactcaaa 22147658  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Original strand, 2545041 - 2545166
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||||  ||  ||||||||| ||||||||||    
T  2545041 caattcaacaacaacatgttataattcatcaattaagcataattttacaactacccattttcacacattatgaatatgttatttcatcaccaacaattca 2545140  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  2545141 tttatcattcaattaacatactcaaa 2545166  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18118376 - 18118259
Alignment:
Q  70 atcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggt 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||  |||| |||| ||||  |||  |||||||||||||| ||||  ||    
T  18118376 atcatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaatttatatacgcaaacatatctctataacacgagcacgaatttcaacgattaagt 18118277  T
Q  170 tcatgataatcacttatt 187  Q
    |||  |||||||||||||    
T  18118276 tcacaataatcacttatt 18118259  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 21494592 - 21494452
Alignment:
Q  33 caattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaatat 132  Q
    ||||| ||||||||||   ||||| || ||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||  |    
T  21494592 caattaagcataatttcacaactaccccttttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaaatt 21494493  T
Q  133 atatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 173  Q
    ||  | |  |||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21494492 atcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 21494452  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 3431440 - 3431317
Alignment:
Q  5 aattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcat 104  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |  ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  3431440 aattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaactcattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcat 3431341  T
Q  105 ttaacatcaaattaacatattcaa 128  Q
    ||| |||  |||||||||| ||||    
T  3431340 ttatcattcaattaacatactcaa 3431317  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 19993210 - 19993167
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Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19993210 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 19993167  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 22234959 - 22234916
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Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22234959 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 22234916  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 129
Target Start/End: Original strand, 22886440 - 22886546
Alignment:
Q  23 cataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 122  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  22886440 catagttcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 22886539  T
Q  123 attcaaa 129  Q
    | |||||    
T  22886540 actcaaa 22886546  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Original strand, 16002089 - 16002222
Alignment:
Q  2 cacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||  ||  |||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  16002089 cacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaatttacaatatactcattttcacatatcatgaacatacaatttcatcaacaacaat 16002188  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatat 134  Q
    | | ||| ||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  16002189 taaattatcatcaaattcatatactcaaacatat 16002222  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 20573348 - 20573305
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20573348 tcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaattgagcata 20573305  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 37611759 - 37611802
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37611759 tcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgagcata 37611802  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 41246749 - 41246792
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41246749 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattaagcata 41246792  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 20481696 - 20481739
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20481696 tcacaattcatcaacaacaaagtataattcaccaattgagcata 20481739  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 22497365 - 22497263
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaa 99  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||  |||| ||||||| | || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22497365 tcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatc-attttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaa 22497267  T
Q  100 ttca 103  Q
    ||||    
T  22497266 ttca 22497263  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 21681093 - 21681137
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataa-ttcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  21681093 tcacaattcaacaacaacaaagcataatttaaccaattgagcata 21681137  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 77
Target Start/End: Original strand, 22981286 - 22981358
Alignment:
Q  5 aattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaa 77  Q
    |||||||||||||||   || |||||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  22981286 aattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattgagtacaattcacaaactacccatttatatacatcatgaa 22981358  T

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Target: scaffold0686 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6247 - 5941
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  6247 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcattaacaaa 6148  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6147 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 6048  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6047 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactatatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 5948  T
Q  300 ctcctat 306  Q
    |||||||    
T  5947 ctcctat 5941  T

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Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5923 - 5735
Alignment:
Q  119 acatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagag-a 217  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5923 acatattcaaacacatctctacaacagaagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaa 5824  T
Q  218 aaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 306  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5823 aaagaattaactatatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 5735  T

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Target: scaffold0342 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 615 - 309
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  615 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactattcattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatctacaat 516  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  515 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatctctacaacataagcacaaatttcaaatattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 416  T
Q  201 atgcatagaacaagagaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  415 atgcatagaacaagagaaaagaattaactagatgattatgataaagaataaccccgttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgc 316  T
Q  301 tcctatg 307  Q
    |||||||    
T  315 tcctatg 309  T

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Target: chr3 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 3992641 - 3992948
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3992641 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcctacatcatgaacctgcaatttcatcatcaacaat 3992740  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3992741 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacggatttcaaaggttgagttcatgataattacttattctcataatcaatt 3992840  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3992841 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 3992940  T
Q  300 ctcctatg 307  Q
    ||||||||    
T  3992941 ctcctatg 3992948  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 7854073 - 7854380
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7854073 tcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgaacataatttaccaattatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 7854172  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7854173 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaatt 7854272  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  7854273 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttg 7854372  T
Q  300 ctcctatg 307  Q
    ||||||||    
T  7854373 ctcctatg 7854380  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 2844282 - 2844589
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2844282 tcacaattcatcaagaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 2844381  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2844382 tcatttaacatcaaattaacatattaaaacaaaaatctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcgcttattcccataatcaatt 2844481  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2844482 atgcatagaataagagaaaaagaatcaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcaaactattagctctagcttcacttttg 2844581  T
Q  300 ctcctatg 307  Q
    ||||||||    
T  2844582 ctcctatg 2844589  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 54038288 - 54037981
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54038288 tcacatttcatcaacaaccatgcataattcaccaatttagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 54038189  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54038188 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatatctacaatataagcacgaatgtcaaacattgagttcatgataatcacttattcccataatcaatt 54038089  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  54038088 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttg 54037989  T
Q  300 ctcctatg 307  Q
    ||||||||    
T  54037988 ctcctatg 54037981  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 17956148 - 17955837
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17956148 tcacaattcatcaacaaccatgcataatacaccaattgagtataatttacaaactactcattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 17956049  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17956048 tcatttaacatcaaattaacatattcagacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcgatt 17955949  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagct----ctagcttcact 295  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  17955948 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctacctagcttcact 17955849  T
Q  296 tttgctcctatg 307  Q
    ||||||||||||    
T  17955848 tttgctcctatg 17955837  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 45581722 - 45582029
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45581722 tcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 45581821  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45581822 tcattaatcatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaatt 45581921  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaa-ctcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttt 298  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45581922 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaaccccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttca-tttt 45582020  T
Q  299 gctcctatg 307  Q
     ||||||||    
T  45582021 tctcctatg 45582029  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 30153033 - 30153297
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30153033 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 30153132  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30153133 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 30153232  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30153233 atgcatagaacaagagaaaaagaattaattaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 30153297  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 46 - 307
Target Start/End: Original strand, 55513006 - 55513268
Alignment:
Q  46 tttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacat 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  55513006 tttacaaactacccattttcatacatcattaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcgaattaacatattcaaacatatctctacaacat 55513105  T
Q  146 aagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataa 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55513106 aagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttatttccataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataa 55513205  T
Q  245 aaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 307  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55513206 aaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 55513268  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 54685465 - 54685213
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54685465 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttaccaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 54685366  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54685365 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 54685266  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaac 252  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  54685265 atgcatagaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatcataaagactaac 54685213  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Original strand, 38168007 - 38168269
Alignment:
Q  3 acaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattc 102  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168007 acaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattc 38168106  T
Q  103 atttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38168107 atttaacatcaaattaacatattcaaacatatttctacaacataagtacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattat 38168206  T
Q  203 gcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  38168207 gcatagaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 38168269  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 53771132 - 53771397
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53771132 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccat 53771231  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771232 tcatttaacatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 53771331  T
Q  201 atgcatagaa-caagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  53771332 atgcatagaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 53771397  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 23492464 - 23492728
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23492464 tcacaattcatcaacaaccatccataattcaccatttgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcataatcaacaat 23492563  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23492564 tcatttaacatcaaattaacacattcaaacatatctctacaacataagcaagaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaatt 23492663  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  23492664 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 23492728  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 252
Target Start/End: Original strand, 33341976 - 33342224
Alignment:
Q  5 aattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcat 104  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33341976 aattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttaccaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcat 33342075  T
Q  105 ttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33342076 taaacatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacattagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgc 33342175  T
Q  205 atagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaac 252  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  33342176 atagaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaac 33342224  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 16261544 - 16261809
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16261544 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcgtacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccat 16261643  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261644 tcatttaacatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 16261743  T
Q  201 atgcatagaa-caagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    | |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  16261744 acgcatagaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 16261809  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 252
Target Start/End: Original strand, 28558273 - 28558514
Alignment:
Q  12 caacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacat 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  28558273 caacaaccatgcataattcaccaattgagcatcatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaatttatttatcat 28558372  T
Q  112 caaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaac 211  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28558373 caaattaacatattcaaacatatctctatcacataagcacgaatttcaaagattaggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatggaac 28558472  T
Q  212 aagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaac 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28558473 aagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaac 28558514  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 223
Target Start/End: Original strand, 18970016 - 18970234
Alignment:
Q  5 aattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcat 104  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||     
T  18970016 aattcaacaacaacatgtcataattcatcaattgagcataattcacaaactacccatttacatacatcatgaacatgaaatttcatcatcaacaattcaa 18970115  T
Q  105 ttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc 204  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  18970116 ttaacatcaaattaacatacttaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcataataatcacttattcaaataatcacttatgc 18970215  T
Q  205 atagaacaagagaaaagaa 223  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  18970216 atagaaaaagagaaaagaa 18970234  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 264
Target Start/End: Original strand, 48421674 - 48421930
Alignment:
Q  7 ttcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcattt 106  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  48421674 ttcaacaacaacatgtcataattcaccaattgaacataattctcaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcaccaacaattcaatt 48421773  T
Q  107 aacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcat 206  Q
    | ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||| || |||| |||    
T  48421774 atcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcatgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattcaattaagcacttattcat 48421873  T
Q  207 agaacaagagaaaagaatta-actaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    | |||||  ||||  ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||    
T  48421874 acaacaaatgaaa--aattacactaaatgattatgatgaattctaactctcttacctta 48421930  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 297
Target Start/End: Original strand, 15550714 - 15550986
Alignment:
Q  26 aattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatatt 125  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  15550714 aattcatcaattgagcacaattcacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaaaaattcaattatcatcaaattaacatact 15550813  T
Q  126 caaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaag-aat 224  Q
    |||| ||||  |||| |||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  || | || ||||||||| ||  |||||  || |||    
T  15550814 caaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaattagcacttatgcataaaaagagagagtagaaat 15550913  T
Q  225 taactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||  ||||| || ||| |||||||||| |||| |  |||| | |||||||||||    
T  15550914 taactaagtgattatgatgaattctaacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttt 15550986  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 232 - 307
Target Start/End: Original strand, 19232089 - 19232164
Alignment:
Q  232 atgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 307  Q
    ||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19232089 atgattaagataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg 19232164  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 173
Target Start/End: Original strand, 19946793 - 19946962
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||   |||||  ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  19946793 caattcaacaacaacatgtcataaatcatcaattaagcataatttcacaactactcattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 19946892  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 173  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||| |||  | |  |||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19946893 tttatcattcaattaacatactcaaatttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 19946962  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 232 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 15857195 - 15857120
Alignment:
Q  232 atgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 307  Q
    ||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15857195 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaagtattagctctagcttcactttagctcctatg 15857120  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 232 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16744073 - 16743998
Alignment:
Q  232 atgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 307  Q
    ||||||||| |||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16744073 atgattatggtaaagactaacctcgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttagctcctatg 16743998  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 8276005 - 8275880
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  8276005 caattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 8275906  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| | |  |||||||||| |||||    
T  8275905 tttatcgttcaattaacatactcaaa 8275880  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Original strand, 14285056 - 14285181
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||| |||   ||||| |||||||||||||  |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  14285056 caattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcatattttcacaactacccattttcatacactatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 14285155  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  14285156 tttatcattcaattaacatactcaaa 14285181  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16934133 - 16934010
Alignment:
Q  5 aattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcat 104  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  16934133 aattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcat 16934034  T
Q  105 ttaacatcaaattaacatattcaa 128  Q
    ||| |||  |||||||||| ||||    
T  16934033 ttatcattcaattaacatactcaa 16934010  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 17393526 - 17393735
Alignment:
Q  2 cacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaatt 101  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||||||| || | | |||||||| |  || ||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  17393526 cacaaatcaacaacaacatgtcataattcatcattcgtgcataattcatcaagtatccatatatatacagcatgaacatgcaatttcatcgtcaataatt 17393625  T
Q  102 catttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctca--taatcaat 199  Q
    || ||| || ||||||||||||  |||| ||||  |||| ||   ||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||    
T  17393626 caattatcaacaaattaacatacccaaacatatcactacaactagagcacgaatttcaacaattaagttcataataatcactta-tctcaattaagcaat 17393724  T
Q  200 tatgcatagaa 210  Q
    |||||||||||    
T  17393725 tatgcatagaa 17393735  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 8268905 - 8268780
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||   ||| | | |||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  8268905 caattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataacaaccaattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 8268806  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| | |  |||||||||| |||||    
T  8268805 tttatcgttcaattaacatactcaaa 8268780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 9303260 - 9303135
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    |||||||||| |||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  9303260 caattcaacagcaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 9303161  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  9303160 tttatcattcaattaacatactcaaa 9303135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14177105 - 14177017
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Q  70 atcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttc 158  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| | ||| ||||  |||| |||| || |||||||||    
T  14177105 atcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcatcaaatgaacatactgaaacatatcactacaacatgaggacgaatttc 14177017  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 12349695 - 12349652
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Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12349695 tcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcata 12349652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 13817603 - 13817646
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Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13817603 tcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 13817646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 16996215 - 16996172
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16996215 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 16996172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 19570844 - 19570801
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19570844 tcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 19570801  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 50112207 - 50112164
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50112207 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 50112164  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 53898611 - 53898568
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53898611 tcacaatgcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 53898568  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 218
Target Start/End: Original strand, 11402752 - 11402898
Alignment:
Q  72 catgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttc 171  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | ||| ||||| ||||  |||  | || ||||||||||||||  |||  ||||    
T  11402752 catgaacatgaaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcatatactcaaacatatcactataatatgagcacgaatttcaacaattaagttc 11402851  T
Q  172 atgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaa 218  Q
    |  ||||||||||||||  |||| || || |||||||||| ||||||    
T  11402852 acaataatcacttattcaaataagcacttgtgcatagaactagagaa 11402898  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 34439495 - 34439451
Alignment:
Q  5 aattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataattta 49  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34439495 aattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttta 34439451  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 317664 - 317621
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  317664 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatttagcata 317621  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 6146902 - 6146859
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6146902 tcacaattcatcaacaacaatgcatgattcaccaattgagcata 6146859  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 6154487 - 6154444
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6154487 tcacaattcatcaataacaatgcataattcaccaattgagcata 6154444  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 14298512 - 14298555
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14298512 tcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaattgagcata 14298555  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 14304139 - 14304182
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14304139 tcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaattgagcata 14304182  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 22144428 - 22144385
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22144428 tcacaattcatcaacaacaatgcatacttcaccaattgagcata 22144385  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 35123787 - 35123830
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35123787 tcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata 35123830  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12539156 - 12539098
Alignment:
Q  70 atcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaa 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| ||||    
T  12539156 atcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcaacaaattcacatactcaa 12539098  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 12349886 - 12349843
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12349886 tcacaattcatcaactacgatgcataattcaccaattgagcata 12349843  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 17100744 - 17100787
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17100744 tcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata 17100787  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 17101429 - 17101472
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17101429 tcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata 17101472  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 43427672 - 43427570
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaa 99  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||  |||| ||||||| | |  |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43427672 tcacaactcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaatttacaatatatc-attttcacatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaa 43427574  T
Q  100 ttca 103  Q
    ||||    
T  43427573 ttca 43427570  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 54424103 - 54424146
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  54424103 tcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata 54424146  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Original strand, 10912977 - 10913093
Alignment:
Q  2 cacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||| |||||| ||||||  ||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||  || ||||||||| | || ||| || ||||||||||||| |||||||    
T  10912977 cacatttcaaccacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatacccattttcacatattatggacatgcaatttcatcaacaacaat 10913076  T
Q  101 tcatttaacatcaaatt 117  Q
    ||| ||| || ||||||    
T  10913077 tcaattatcaccaaatt 10913093  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 11061162 - 11061118
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  11061162 tcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcata 11061118  T

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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 14295529 - 14295573
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  14295529 tcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcata 14295573  T

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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 14301156 - 14301200
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  14301156 tcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcata 14301200  T

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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 16182101 - 16182065
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt 37  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  16182101 tcacaattcatcaacgacaatgcataattcaccaatt 16182065  T

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Target: scaffold0016 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 166428 - 166121
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  166428 tcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcataatttacaaactacccatttacatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaaa 166329  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166328 tcatttaatatcaaattaacatattcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 166229  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166228 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactagatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 166129  T
Q  300 ctcctatg 307  Q
    ||||||||    
T  166128 ctcctatg 166121  T

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Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 162342 - 162036
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  162342 tcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcataatttacaaactacccatttacatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaaa 162243  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  162242 tcatttaatatcaaattaacatattcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 162143  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  162142 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactagatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 162043  T
Q  300 ctcctat 306  Q
    |||||||    
T  162042 ctcctat 162036  T

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Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 164306 - 164349
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164306 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 164349  T

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Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 116485 - 116410
Alignment:
Q  230 aaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 305  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| |||| |  |||| | ||||||||||| |||||||    
T  116485 aaatgattatgatgaaatctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 116410  T

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Target: chr5 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 11342776 - 11343039
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11342776 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 11342875  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11342876 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 11342975  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctt 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11342976 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctt 11343039  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 2031901 - 2032165
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2031901 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 2032000  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2032001 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaatt 2032100  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  2032101 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaacgattatgatgaaaactaacccccttacctta 2032165  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 21205017 - 21205268
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21205017 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 21205116  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21205117 tcatttaacatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 21205216  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaa 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  21205217 atgcatagaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaa 21205268  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 21650786 - 21651050
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21650786 tcacaattcaacaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 21650885  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  21650886 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaact 21650985  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||||||    
T  21650986 atgcacagaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaatattaacccccttacctta 21651050  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 264
Target Start/End: Original strand, 16105738 - 16105999
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||| |||||    
T  16105738 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatattatttcatcatcaaccattca 16105837  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatg 203  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105838 tttaacatcaa-ttaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatg 16105936  T
Q  204 catagaa-caagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  16105937 catagaatcaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 16105999  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22662805 - 22662653
Alignment:
Q  35 attgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaatatat 134  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22662805 attgaacataattctcaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcatcaaattaacatattcaaatatat 22662706  T
Q  135 atctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttatt 187  Q
      |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22662705 cactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttatt 22662653  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 188
Target Start/End: Original strand, 25004915 - 25005094
Alignment:
Q  9 caacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaa 108  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||     
T  25004915 caacaacaacatgtcataaatcaccaattgagcataattctcaaactacccatttacatacatcatgaacatgcaatttcataattaacaattcaattat 25005014  T
Q  109 catcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 188  Q
    | | ||||||||| | ||||| ||||  || | |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25005015 ccttaaattaacacactcaaacatatcacttcaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattc 25005094  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Original strand, 7528995 - 7529120
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||| |||||||||||||  |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  7528995 caattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcatacactatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 7529094  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  7529095 tttatcattcaattaacatactcaaa 7529120  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 108993 - 108868
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  | ||||||| ||||||||||    
T  108993 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaatccattttcatacattatgaacatgttaattcatcaccaacaattca 108894  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  108893 tttatcattcaattaacatactcaaa 108868  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Original strand, 17909600 - 17909725
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   || |||||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  17909600 caattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 17909699  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  17909700 tttatcattcaattaacatactcaaa 17909725  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 9730542 - 9730419
Alignment:
Q  5 aattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcat 104  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  9730542 aattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcat 9730443  T
Q  105 ttaacatcaaattaacatattcaa 128  Q
    ||| |||  |||||||||| ||||    
T  9730442 ttatcattcaattaacatactcaa 9730419  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 307
Target Start/End: Original strand, 11584374 - 11584448
Alignment:
Q  233 tgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 307  Q
    |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11584374 tgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 11584448  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 21397183 - 21397226
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21397183 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 21397226  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 24183288 - 24183245
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24183288 tcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcata 24183245  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 44
Target Start/End: Original strand, 24475671 - 24475712
Alignment:
Q  3 acaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24475671 acaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 24475712  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 1168360 - 1168317
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1168360 tcacaattcatcaacaacattgcataattcaccaattgagcata 1168317  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 4865354 - 4865397
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4865354 tcacaattcatcaaccacaatgcataattcaccaattgagcata 4865397  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 20712167 - 20712210
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20712167 tcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgagcata 20712210  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 28261612 - 28261655
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28261612 tcacaatttatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 28261655  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 44
Target Start/End: Original strand, 11584153 - 11584188
Alignment:
Q  9 caacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11584153 caacaacaacaaagcataattcaccaattgagcata 11584188  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 103
Target Start/End: Original strand, 23417333 - 23417435
Alignment:
Q  2 cacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||  || | ||||||| | || |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23417333 cacaaatcaacaacaacatagcacaattcagcaattagagcacaattcacaatataccaattttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaat 23417432  T
Q  101 tca 103  Q
    |||    
T  23417433 tca 23417435  T

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Target: scaffold0032 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 55672 - 55936
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55672 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcctacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 55771  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55772 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatatctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 55871  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  55872 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 55936  T

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Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 108179 - 108075
Alignment:
Q  162 gattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-caagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactccttta 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||    
T  108179 gattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatgaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaaccccctta 108080  T
Q  260 cctta 264  Q
    |||||    
T  108079 cctta 108075  T

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Target: scaffold0706 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6707 - 6443
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6707 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 6608  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  6607 tcatttgacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataagcacctattatcataatcaatt 6508  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  6507 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 6443  T

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Target: scaffold0597 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1142 - 878
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1142 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 1043  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1042 tcatttaacatcaaattaacatattaaaacaaacctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaatt 943  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  942 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 878  T

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Target: scaffold0234 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 17568 - 17316
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17568 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 17469  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17468 tcatttaaaatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcactaatttcaaagattgggttcatgataatcaattattctcataatcaatt 17369  T
Q  201 atgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaac 252  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  17368 atgcatagaacaagagaaaaagaattacctaaatgattatgataaagactaac 17316  T

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Target: scaffold0251 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13550 - 13285
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13550 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccat 13451  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13450 tcatttaacatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 13351  T
Q  201 atgcatagaa-caagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  13350 atgcatagaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 13285  T

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Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 21524 - 21432
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcat 93  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21524 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcat 21432  T

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Target: scaffold0116 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 33 - 307
Target Start/End: Original strand, 30217 - 30492
Alignment:
Q  33 caattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaatat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30217 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacat 30316  T
Q  133 atatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagag-aaaagaattaactaa 231  Q
    || ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30317 atctctacaacataagcatgaatttcaaagatagggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaacaagagaaaaataattaactaa 30416  T
Q  232 atgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 307  Q
    ||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  30417 atgattatgatgaaaaataacccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttttgcttctatg 30492  T

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Target: scaffold0039 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12684 - 12418
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12684 tcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 12585  T
Q  101 t--catttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaa 198  Q
    |  |||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12584 tcacattaatcatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacaaatttcaaagattgggttcatgataataacttattcccataatcaa 12485  T
Q  199 ttatgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12484 ttatgcatagaacaaaagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 12418  T

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Target: scaffold0303 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 20 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4592 - 4346
Alignment:
Q  20 atgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4592 atgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaa 4493  T
Q  120 catattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-caagag-a 217  Q
    |||||| ||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  4492 catatttaaacatatctctacaacataagcactaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaatgaagagaa 4393  T
Q  218 aaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctta 264  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||||||    
T  4392 aaagaattaaccaaatgattatgataaagtctaacccccttacctta 4346  T

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Target: scaffold0303; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 173 - 5
Alignment:
Q  20 atgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  173 atgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaa 74  T
Q  120 catattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 188  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73 catattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 5  T

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Target: scaffold0004 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 193641 - 193396
Alignment:
Q  12 caacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193641 caacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacat 193542  T
Q  112 caaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaac 211  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193541 caaattaacatattcaaacatatctct---------gcacgaatttcaatgattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaac 193451  T
Q  212 aagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaa 265  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  193450 aagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 193396  T

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Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 186679 - 186562
Alignment:
Q  12 caacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  186679 caacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacat 186580  T
Q  112 caaattaacatattcaaa 129  Q
    ||||||||||||||||||    
T  186579 caaattaacatattcaaa 186562  T

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Target: scaffold0465 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 58 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10090 - 9882
Alignment:
Q  58 ccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaattt 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10090 ccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaattt 9991  T
Q  158 caaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaa-ttatgcatagaacaagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  9990 caaagattgggttcatgataatcacttattttcataatcaatttatgcatagaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccc 9891  T
Q  256 tttacctta 264  Q
     ||||||||    
T  9890 cttacctta 9882  T

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Target: scaffold0175 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 15040 - 15236
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15040 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaaataaacattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 15139  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15140 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacgacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatca 15236  T

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Target: scaffold0132 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 131 - 307
Target Start/End: Original strand, 42575 - 42749
Alignment:
Q  131 atatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagag-aaaagaattaact 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42575 atatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaact 42674  T
Q  230 aaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42675 aaatgattatgataaaaactaacccccttacct---ttatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 42749  T

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Target: scaffold0028 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 263
Target Start/End: Original strand, 130651 - 130911
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||| |||||    
T  130651 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatattatttcatcatcaaccattca 130750  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatg 203  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130751 tttaacatcaa-ttaacgtatccaaacatatctctacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatg 130849  T
Q  204 catagaa-caagag-aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttacctt 263  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  130850 catagaatcaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctt 130911  T

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Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 89625 - 89578
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataattt 48  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  89625 tcacaatttaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcacaattt 89578  T

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Target: scaffold0063 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 44278 - 44036
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||   |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44278 tcacaattcaacaacaacatgtcataattcgtcaattgagcataactcacaaactacttatttacatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaat 44179  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 200  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  ||||||| ||    
T  44178 tcaattaccatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattaggttcacaataatcacttattcaaataatcactt 44079  T
Q  201 atgcatagaacaagagaaaag-aattaactaaatgattatgat 242  Q
    |||||||| | |||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  44078 atgcatagcaaaagagagaagaaattaactaagtgattatgat 44036  T

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Target: scaffold0507 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1659 - 1371
Alignment:
Q  7 ttcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcattt 106  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  1659 ttcaacaacaacatgtcataattcatcaattgagcataattctcaaactactcatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaatt 1560  T
Q  107 aacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcat 206  Q
    | ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||   ||| || |||| |||    
T  1559 atcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatcatttattcaattaagcacttattcat 1460  T
Q  207 agaacaagagaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 297  Q
    | |||||  ||||  | |  |||||||||||||||| ||  ||||| || |||||| ||||||| |||| |  |||||| |||||||||||    
T  1459 acaacaaatgaaa--actacactaaatgattatgatgaattctaacccccttacctcaattatcaccaattcctagctcaagcttcacttt 1371  T

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Target: scaffold1295 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 188
Target Start/End: Original strand, 203 - 384
Alignment:
Q  7 ttcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcattt 106  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  203 ttcaacaacaacatgtcataattcaacaattgagcataattcacaaactacacatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaatt 302  T
Q  107 aacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 188  Q
    | ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  303 atcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcaagaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattc 384  T

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Target: scaffold0574 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 9671 - 9543
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9671 tcacaattcatcaacaaccatgcataagtcactaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcataaacttgcaatttcatcatcaacaat 9572  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    ||||||| ||   |||||||||| |||||    
T  9571 tcatttagcaatcaattaacatactcaaa 9543  T

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Target: scaffold0079 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4005 - 3732
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4005 tcacaattcaataacaacatgtcgtaattcatcaattgaacataattcacaaactacccatttatatatatcatgaacatgcaatttcatcattaacaat 3906  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatat----ctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatc 196  Q
    ||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||    |||| |||| |||||||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||||  |||| |    
T  3905 tcaatcatcatcaaattaacatactcaaacatatatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttggtttcacaataatcacttattcaaataagc 3806  T
Q  197 aattatgcatagaacaagagaaaag-aattaactaaatgattatg-ataaaaactaactcctttaccttaatta 268  Q
    | |||||||||||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||| |||||    
T  3805 acttatgcatagaaaaagagagaagaaactaactaagtgattatgcttgaaatctaacccctttacctcaatta 3732  T

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Target: scaffold0037 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 95066 - 95198
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaa----ctatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaa 96  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  95066 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcactaattgagcataatttacaaataaactatctattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaa 95165  T
Q  97 caattcatttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| |||||    
T  95166 caattcatttatcattcaattaacatactcaaa 95198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 24884 - 24841
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24884 tcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata 24841  T

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Target: scaffold0057 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 5974 - 6133
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||||| ||||||   ||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5974 tcacaattcaactacaacatgtcataaatcatcaattgagcacaattcacaaactacccatttacttatatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaat 6073  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaa 160  Q
    ||| ||| |||||| |||||||| ||||| ||||  |||| |||| ||||| ||||||||    
T  6074 tcaattatcatcaatttaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacaaatttcaa 6133  T

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Target: scaffold0207 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 173
Target Start/End: Original strand, 17793 - 17962
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  17793 caattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 17892  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 173  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||  |||  | |  |||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  17893 tttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 17962  T

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Target: scaffold0335 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 5741 - 5616
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||  |||| ||||||||||  |||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  5741 caattcaacaacaacatgtcataattcattaattaagcataatttcaaaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 5642  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  5641 tttatcattcaattaacatactcaaa 5616  T

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Target: scaffold0118 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 34573 - 34448
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  34573 caattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcacacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 34474  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  34473 tttatcattcaattaacatactcaaa 34448  T

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Target: scaffold0023 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 61390 - 61262
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  61390 tcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaat 61291  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    ||||||| |||  |||||||||| |||||    
T  61290 tcatttatcattcaattaacatactcaaa 61262  T

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Target: scaffold1164 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 307
Target Start/End: Original strand, 1701 - 1775
Alignment:
Q  233 tgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 307  Q
    |||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1701 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 1775  T

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Target: scaffold0122 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19881 - 19807
Alignment:
Q  233 tgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 307  Q
    |||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  19881 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 19807  T

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Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24185 - 24111
Alignment:
Q  233 tgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 307  Q
    |||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  24185 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcatttttgctcctatg 24111  T

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Target: scaffold0077 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 15398 - 15324
Alignment:
Q  233 tgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 307  Q
    |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15398 tgattatgatgaatgctaacccccttaccttaattatctccaactattagcccaagcttcacttttgctcctatg 15324  T

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Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 15627 - 15584
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15627 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 15584  T

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Target: scaffold0173 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 173
Target Start/End: Original strand, 5316 - 5485
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   || |||||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  5316 caattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 5415  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaatatatatctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 173  Q
    |||| ||   |||||||||| |||||  |||  | |  |||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5416 tttatcaatcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 5485  T

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Target: scaffold0001 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 165126 - 165001
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||   ||  | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  165126 caattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataagaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 165027  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  165026 tttatcattcaattaacatactcaaa 165001  T

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Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 70778 - 70735
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  70778 tcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcata 70735  T

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Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 60897 - 60933
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt 37  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  60897 tcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaatt 60933  T

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Target: scaffold0876 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 303
Target Start/End: Original strand, 94 - 164
Alignment:
Q  233 tgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc 303  Q
    |||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  94 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcc 164  T

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Target: scaffold0367 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 17477 - 17355
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||   | | | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  17477 tcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacagcaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaat 17378  T
Q  101 tcatttaacatcaaattaacata 123  Q
    ||||||| |||  ||||||||||    
T  17377 tcatttatcattcaattaacata 17355  T

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Target: scaffold0310 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6335 - 6261
Alignment:
Q  233 tgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 307  Q
    |||||||||| || |||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6335 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcacccactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 6261  T

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Target: scaffold0049 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 307
Target Start/End: Original strand, 20493 - 20567
Alignment:
Q  233 tgattatgataaaaactaactcctttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 307  Q
    |||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  20493 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcatttttgctcctatg 20567  T

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Target: scaffold0029 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 50008 - 49883
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||| ||||||   ||||||||| ||||| || |||||||   ||||| |||||||||||||  |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  50008 caattcaaccacaacatgtcataattcatcaattaagtataatttcacaactacccattttcatacactatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 49909  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaaa 129  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||    
T  49908 tttatcattcaattaacatactcaaa 49883  T

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Target: scaffold0615 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 6376 - 6252
Alignment:
Q  4 caattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||| ||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  6376 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcttaatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 6277  T
Q  104 tttaacatcaaattaacatattcaa 128  Q
    |||| |||  |||||||||| ||||    
T  6276 tttatcattcaattaacatactcaa 6252  T

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Target: scaffold1867 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 235 - 278
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  235 tcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcata 278  T

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Target: scaffold0673 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 7001 - 6958
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7001 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 6958  T

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Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 978 - 935
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  978 tcacaaatcatcaataacaatgcataattcaccaattgagcata 935  T

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Target: scaffold0190 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 10028 - 10071
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10028 tcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcata 10071  T

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Target: scaffold0083 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 14965 - 15008
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14965 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 15008  T

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Target: scaffold0011 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 254970 - 254927
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254970 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 254927  T

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Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 261576 - 261533
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  261576 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 261533  T

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Target: scaffold0162 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 129
Target Start/End: Original strand, 11862 - 11964
Alignment:
Q  27 attcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattc 126  Q
    ||||| ||||| ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||    
T  11862 attcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcaaacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactc 11961  T
Q  127 aaa 129  Q
    |||    
T  11962 aaa 11964  T

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Target: scaffold0091 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 32294 - 32363
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaac-tatccattttcataca 70  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  32294 tcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcat-attttcaaacatacccattttcataca 32363  T

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Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 42009 - 41940
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataatttacaaac-tatccattttcataca 70  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||    
T  42009 tcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcatatttt-caaacatacccattttcataca 41940  T

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Target: scaffold0317 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12734 - 12637
Alignment:
Q  26 aattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||  ||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||    
T  12734 aattcatcaattgagcataatttatcaattattcatttatatataacatgaacatgcaatttcatcatcaataattcaattatcaacaagttaacata 12637  T

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Target: scaffold0231 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 12883 - 12787
Alignment:
Q  8 tcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 103  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||  |||||||||| | | || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12883 tcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaacatatccattttaacatattatgaacatgcaatttcatcatcaacaattca 12787  T

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Target: scaffold0740 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 4376 - 4419
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4376 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgaacata 4419  T

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Target: scaffold0480 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 5402 - 5359
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5402 tcacaattcatcaacaacaatgcctaattcaccaattgagcata 5359  T

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Target: scaffold0396 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 11860 - 11821
Alignment:
Q  5 aattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11860 aattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 11821  T

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Target: scaffold0359 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 1408 - 1451
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1408 tcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcata 1451  T

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Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 11810 - 11767
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11810 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcactaattgagcata 11767  T

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Target: scaffold0158 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 25049 - 25092
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25049 tcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgagcata 25092  T

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Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 25302 - 25345
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25302 tcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgagcata 25345  T

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Target: scaffold0117 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 11724 - 11681
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11724 tcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcata 11681  T

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Target: scaffold0044 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 38389 - 38432
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38389 tcacaattcatcaacaacaatgcataattcgccaattgagcata 38432  T

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Target: scaffold0021 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 132406 - 132363
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  132406 tcacaattcatcaacaacgatgcataattcaccaattgagcata 132363  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 253145 - 253102
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  253145 tcacaattcaacaacaacaaagcatgattcaccaattgagcata 253102  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 22782 - 22825
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22782 tcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaattgagcata 22825  T

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Target: scaffold0240 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 44
Target Start/End: Original strand, 7671 - 7703
Alignment:
Q  12 caacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7671 caacaacaatgcataattcaccaattgagcata 7703  T

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Target: scaffold0068 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 48238 - 48286
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataattta 49  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  48238 tcacaattcatcaacaacaaaacataattcaccaattgagcatatttta 48286  T

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Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 61686 - 61734
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcataattta 49  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  61686 tcacaattcatcaacaacaaaacataattcaccaattgagcatatttta 61734  T

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Target: scaffold0120 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 21603 - 21646
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21603 tcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata 21646  T

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Target: scaffold0075 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 5032 - 5075
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 44  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  5032 tcacaattcaacaacaacaaatcataattcaccaattaagcata 5075  T

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Target: scaffold0013 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 7165 - 7112
Alignment:
Q  70 atcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 123  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||    
T  7165 atcatgaacatgcaaattcatcatcaacaattcaattatcaacaagttaacata 7112  T

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Target: scaffold0031 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 70704 - 70748
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcata 44  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  70704 tcacaattcaacaacaacaaagcataattcaaccaattaagcata 70748  T

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Target: scaffold0022 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 68113 - 67997
Alignment:
Q  2 cacaattcaacaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||   || |||||| ||||| ||||| |||| ||||  || ||||||||| | || |||||| ||||||||||||  |||||||    
T  68113 cacatttcaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatacccattttcacatattatgaacatgcaatttcatctacaacaat 68014  T
Q  101 tcatttaacatcaaatt 117  Q
    ||| ||| || ||||||    
T  68013 tcaattatcaccaaatt 67997  T

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Target: scaffold0014 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 159390 - 159438
Alignment:
Q  1 tcacaattcaacaacaacaatgcataattc-accaattgagcataattt 48  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  159390 tcacaattcaacatcaacatagcataattcaaccaattgagcataattt 159438  T

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