View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10275_high_7 (Length: 233)

Name: NF10275_high_7
Description: NF10275
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10275_high_7
NF10275_high_7
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (4-233)||(27284189-27284419)
chr6 (1-223)||(27355948-27356171)
chr6 (4-223)||(16755961-16756182)
chr6 (1-223)||(13518031-13518254)
chr6 (1-233)||(27623534-27623769)
chr6 (4-221)||(27491274-27491492)
chr6 (1-223)||(27063620-27063842)
chr6 (4-220)||(16680280-16680498)
chr6 (1-223)||(28166632-28166856)
chr6 (4-223)||(4539595-4539815)
chr6 (1-223)||(4763901-4764124)
chr6 (4-223)||(26110248-26110467)
chr6 (4-223)||(28213596-28213816)
chr6 (1-223)||(34458345-34458566)
chr6 (1-223)||(8899536-8899759)
chr6 (4-223)||(29555699-29555919)
chr6 (4-223)||(29507557-29507779)
chr6 (4-223)||(4779022-4779242)
chr6 (4-223)||(27200328-27200548)
chr6 (4-223)||(27248685-27248905)
chr6 (1-227)||(33370264-33370491)
chr6 (1-233)||(22928708-22928943)
chr6 (4-223)||(26666495-26666714)
chr6 (4-223)||(26772466-26772685)
chr6 (1-223)||(29579153-29579375)
chr6 (4-223)||(26791957-26792177)
chr6 (3-223)||(30551837-30552058)
chr6 (1-223)||(16937862-16938084)
chr6 (4-223)||(4531429-4531649)
chr6 (4-223)||(13292788-13293002)
chr6 (4-223)||(14139237-14139451)
chr6 (4-223)||(27013874-27014087)
chr6 (1-223)||(26926906-26927113)
chr6 (4-233)||(27209045-27209271)
chr6 (4-233)||(27239957-27240183)
chr6 (1-223)||(27031161-27031381)
chr6 (1-222)||(24869848-24870064)
chr6 (1-223)||(27025283-27025502)
chr6 (1-223)||(24299597-24299815)
chr6 (1-223)||(15406370-15406588)
chr6 (1-223)||(15418157-15418375)
chr6 (3-233)||(20174689-20174930)
chr6 (3-233)||(22161061-22161302)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (4-223)||(11555505-11555724)
chr5 (18-223)||(18369322-18369527)
chr5 (1-223)||(30174613-30174837)
chr5 (1-223)||(33881274-33881497)
chr5 (26-223)||(3795713-3795910)
chr5 (1-223)||(9544497-9544722)
chr5 (4-223)||(40467343-40467563)
chr5 (1-223)||(6880452-6880675)
chr5 (4-223)||(13318618-13318837)
chr5 (1-223)||(32590066-32590288)
chr5 (1-223)||(28655390-28655614)
chr5 (4-220)||(23632120-23632339)
chr5 (4-223)||(30158185-30158405)
chr5 (1-223)||(9323626-9323847)
chr5 (1-223)||(12138325-12138546)
chr5 (27-220)||(18494561-18494754)
chr5 (1-223)||(37761130-37761354)
chr5 (4-223)||(13436464-13436689)
chr5 (18-223)||(8659262-8659467)
chr5 (1-222)||(30035574-30035795)
chr5 (4-229)||(34622670-34622896)
chr5 (1-223)||(24730118-24730341)
chr5 (1-223)||(37352434-37352657)
chr5 (1-223)||(5643948-5644169)
chr5 (4-223)||(15752648-15752862)
chr5 (4-223)||(2517216-2517437)
chr5 (1-223)||(13180583-13180801)
chr5 (1-223)||(31820200-31820421)
chr5 (4-223)||(37665276-37665496)
chr5 (1-223)||(43084406-43084629)
chr5 (33-223)||(26486566-26486756)
chr5 (3-223)||(33522532-33522754)
chr5 (1-223)||(37746112-37746341)
chr5 (1-233)||(22894564-22894796)
chr5 (1-223)||(41680852-41681076)
chr5 (18-223)||(11329803-11330010)
chr5 (4-223)||(31437615-31437828)
chr5 (26-223)||(33298708-33298908)
chr5 (4-222)||(18122207-18122426)
chr5 (1-223)||(28953570-28953793)
chr5 (1-221)||(25206426-25206653)
chr5 (1-221)||(25270582-25270809)
chr5 (4-223)||(15652550-15652768)
chr5 (4-223)||(22992914-22993126)
chr5 (4-222)||(23898025-23898238)
chr5 (1-223)||(33783635-33783853)
chr5 (1-223)||(30940785-30941001)
chr5 (3-223)||(24975999-24976214)
chr5 (4-223)||(24608397-24608612)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (4-223)||(39896211-39896430)
chr2 (4-223)||(12661681-12661900)
chr2 (4-223)||(37383820-37384039)
chr2 (1-223)||(37945745-37945969)
chr2 (1-223)||(27122664-27122885)
chr2 (1-223)||(27809840-27810065)
chr2 (1-223)||(254532-254755)
chr2 (1-223)||(34867822-34868044)
chr2 (1-223)||(3788633-3788855)
chr2 (1-223)||(31868666-31868888)
chr2 (29-223)||(22922023-22922217)
chr2 (1-223)||(13930424-13930649)
chr2 (4-223)||(9343867-9344087)
chr2 (4-223)||(39045702-39045922)
chr2 (1-223)||(12592949-12593176)
chr2 (1-223)||(16167617-16167840)
chr2 (1-223)||(32055941-32056163)
chr2 (29-223)||(19410364-19410558)
chr2 (26-223)||(37931543-37931741)
chr2 (4-223)||(34160986-34161208)
chr2 (4-223)||(12710481-12710701)
chr2 (1-223)||(37679771-37679995)
chr2 (1-223)||(37695036-37695260)
chr2 (4-223)||(31882429-31882648)
chr2 (1-223)||(21671050-21671275)
chr2 (3-223)||(16823217-16823438)
chr2 (3-223)||(16898042-16898263)
chr2 (6-223)||(27782376-27782594)
chr2 (1-223)||(40239648-40239870)
chr2 (1-223)||(11629065-11629287)
chr2 (1-233)||(21697043-21697279)
chr2 (4-220)||(34297298-34297508)
chr2 (1-233)||(27396462-27396705)
chr2 (58-223)||(23116993-23117158)
chr2 (4-233)||(19450288-19450527)
chr2 (4-222)||(34268807-34269021)
chr2 (1-223)||(23122458-23122675)
chr2 (1-223)||(28888418-28888636)
chr2 (1-223)||(20844052-20844274)
chr2 (1-233)||(27428323-27428549)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (4-223)||(18796851-18797071)
chr8 (1-223)||(9360763-9360985)
chr8 (26-223)||(28355802-28355999)
chr8 (4-223)||(33248510-33248729)
chr8 (1-223)||(19680590-19680811)
chr8 (1-223)||(44567122-44567347)
chr8 (4-223)||(12086575-12086795)
chr8 (1-223)||(31360669-31360892)
chr8 (1-223)||(21342022-21342245)
chr8 (1-223)||(29835464-29835686)
chr8 (4-223)||(15773718-15773938)
chr8 (1-220)||(18715621-18715843)
chr8 (29-223)||(31483722-31483916)
chr8 (4-208)||(33264875-33265079)
chr8 (1-223)||(19911014-19911239)
chr8 (33-223)||(19202227-19202417)
chr8 (7-231)||(22074773-22074999)
chr8 (1-233)||(19655189-19655417)
chr8 (1-223)||(27602766-27602982)
chr8 (1-223)||(2131120-2131337)
chr8 (4-223)||(22139051-22139264)
chr8 (1-117)||(16260364-16260480)
chr8 (1-221)||(19694237-19694453)
chr8 (1-223)||(14569297-14569518)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (4-223)||(4790566-4790786)
chr3 (1-223)||(5717172-5717396)
chr3 (1-223)||(5728082-5728306)
chr3 (1-223)||(5764062-5764286)
chr3 (1-223)||(47029557-47029781)
chr3 (1-223)||(29658901-29659124)
chr3 (26-223)||(32296760-32296957)
chr3 (4-223)||(48472034-48472258)
chr3 (1-223)||(10402253-10402475)
chr3 (1-223)||(18248842-18249065)
chr3 (1-223)||(20072137-20072362)
chr3 (1-223)||(5590294-5590517)
chr3 (1-223)||(17970799-17971020)
chr3 (1-223)||(28109884-28110111)
chr3 (29-223)||(31958388-31958582)
chr3 (1-223)||(10649175-10649398)
chr3 (29-223)||(5603246-5603440)
chr3 (29-223)||(24334308-24334502)
chr3 (1-223)||(4423022-4423245)
chr3 (4-223)||(22381514-22381733)
chr3 (28-220)||(22864784-22864976)
chr3 (28-220)||(22879843-22880035)
chr3 (1-223)||(11104294-11104518)
chr3 (1-223)||(18286288-18286510)
chr3 (1-223)||(18301589-18301811)
chr3 (1-223)||(4340609-4340832)
chr3 (4-223)||(5019820-5020039)
chr3 (1-223)||(5473092-5473314)
chr3 (1-223)||(51788126-51788349)
chr3 (4-223)||(28027398-28027616)
chr3 (1-223)||(28345275-28345497)
chr3 (3-223)||(17978883-17979105)
chr3 (1-233)||(16422286-16422520)
chr3 (1-223)||(8217736-8217961)
chr3 (4-229)||(6536670-6536896)
chr3 (4-223)||(7079329-7079554)
chr3 (1-223)||(18231297-18231520)
chr3 (1-223)||(4629889-4630111)
chr3 (1-223)||(29142687-29142913)
chr3 (1-223)||(31030178-31030394)
chr3 (1-223)||(21680805-21681027)
chr3 (5-233)||(18057369-18057600)
chr3 (1-233)||(16618412-16618649)
chr3 (4-223)||(18336736-18336949)
chr3 (6-223)||(20570779-20570997)
chr3 (1-233)||(19700590-19700835)
chr3 (1-233)||(6208005-6208233)
chr3 (4-233)||(4727740-4727964)
chr3 (4-223)||(32445261-32445472)
chr3 (1-223)||(15735033-15735251)
chr3 (1-223)||(5658240-5658458)
chr3 (1-222)||(4689756-4689971)
chr3 (1-223)||(35886869-35887087)
chr3 (1-223)||(15886674-15886891)
chr3 (35-223)||(8283391-8283591)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (4-223)||(9532-9751)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (1-223)||(39856789-39857010)
chr4 (18-223)||(40099526-40099732)
chr4 (1-223)||(20332312-20332536)
chr4 (4-223)||(14104698-14104917)
chr4 (1-223)||(54839543-54839765)
chr4 (1-223)||(24586251-24586474)
chr4 (1-223)||(27157202-27157427)
chr4 (1-223)||(30759916-30760137)
chr4 (1-223)||(33667693-33667914)
chr4 (4-223)||(5700696-5700915)
chr4 (4-223)||(34182854-34183072)
chr4 (1-223)||(14753384-14753606)
chr4 (1-223)||(18794507-18794730)
chr4 (1-223)||(5012030-5012253)
chr4 (7-223)||(21975862-21976079)
chr4 (3-223)||(31120400-31120622)
chr4 (4-220)||(36324210-36324419)
chr4 (4-220)||(36338419-36338628)
chr4 (4-223)||(24118818-24119037)
chr4 (3-233)||(1906406-1906642)
chr4 (1-233)||(15380118-15380351)
chr4 (1-233)||(15233968-15234205)
chr4 (4-223)||(6576017-6576229)
chr4 (1-233)||(15276509-15276745)
chr4 (1-231)||(1674012-1674244)
chr4 (5-223)||(14671173-14671388)
chr4 (1-223)||(17019205-17019423)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (1-223)||(24586311-24586533)
chr7 (4-223)||(5164525-5164745)
chr7 (4-223)||(5154225-5154444)
chr7 (29-223)||(4139021-4139215)
chr7 (1-223)||(26518931-26519152)
chr7 (26-223)||(26441418-26441615)
chr7 (1-223)||(26595806-26596031)
chr7 (1-223)||(45737439-45737664)
chr7 (1-223)||(26509471-26509695)
chr7 (1-223)||(4205528-4205750)
chr7 (1-223)||(11418555-11418778)
chr7 (18-223)||(26663688-26663894)
chr7 (18-223)||(26678880-26679086)
chr7 (4-223)||(31084398-31084618)
chr7 (1-223)||(31558170-31558393)
chr7 (1-223)||(26268861-26269088)
chr7 (1-223)||(26313625-26313846)
chr7 (1-221)||(16745298-16745520)
chr7 (1-223)||(39206915-39207138)
chr7 (1-223)||(5141110-5141334)
chr7 (4-223)||(45393360-45393580)
chr7 (1-233)||(2160708-2160943)
chr7 (5-223)||(3451460-3451680)
chr7 (4-223)||(11447029-11447249)
chr7 (1-233)||(16443769-16444003)
chr7 (4-223)||(2779393-2779607)
chr7 (4-223)||(31130046-31130260)
chr7 (1-232)||(16047453-16047682)
chr7 (1-233)||(10847721-10847956)
chr7 (1-223)||(10910702-10910919)
chr7 (1-223)||(16512216-16512433)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (1-223)||(3647289-3647512)
chr1 (1-223)||(10968808-10969032)
chr1 (1-223)||(28155869-28156094)
chr1 (4-223)||(41787199-41787420)
chr1 (4-223)||(28591229-28591448)
chr1 (1-223)||(51644363-51644588)
chr1 (1-223)||(10951234-10951458)
chr1 (4-233)||(20334295-20334527)
chr1 (1-229)||(16201911-16202148)
chr1 (1-233)||(20466920-20467161)
chr1 (54-223)||(21891652-21891818)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (4-233)||(4483-4714)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (1-223)||(12177-12399)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (4-223)||(18730-18951)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (4-223)||(8819-9038)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (1-223)||(10055-10277)
scaffold0143 (1-223)||(33439-33658)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (29-223)||(3069-3263)
scaffold0159 (29-223)||(17978-18172)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (4-223)||(14094-14314)
[»] scaffold0322 (3 HSPs)
scaffold0322 (1-223)||(1799-2021)
scaffold0322 (54-229)||(12252-12427)
scaffold0322 (1-49)||(12188-12236)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-223)||(15710-15940)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-233)||(25256-25497)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (73-231)||(1-159)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (1-223)||(6208-6427)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (1-223)||(24796-25014)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (138-223)||(40519-40606)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27284419 - 27284189
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284419 tgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 27284320  T
Q  103 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284319 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 27284220  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27284219 tcaatatgtgttacaaacaggctcttcccca 27284189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27356171 - 27355948
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356171 gcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 27356072  T
Q  101 tttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356071 tttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 27355972  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27355971 atttcaatatgtgttacaagcagg 27355948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 16755961 - 16756182
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat-- 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16755961 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatat 16756060  T
Q  102 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756061 tttgacaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 16756160  T
Q  202 ttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  16756161 ttcaatatatgttacaagcagg 16756182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13518254 - 13518031
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518254 gcctttgcttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 13518155  T
Q  100 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518154 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 13518055  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  13518054 atttcaatatatgttacaagcagg 13518031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27623769 - 27623534
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacatttt-ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaa 97  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623769 gcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaa 27623670  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27623669 acattttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgt 27623570  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623569 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 27623534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Original strand, 27491274 - 27491492
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491274 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 27491373  T
Q  104 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491374 ttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 27491473  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagca 221  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  27491474 tcaatatatgttacaagca 27491492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27063620 - 27063842
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063620 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 27063718  T
Q  101 tttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063719 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 27063818  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  27063819 atttcaatatatgttacaagcagg 27063842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 16680280 - 16680498
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680280 tgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 16680379  T
Q  102 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680380 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 16680479  T
Q  202 ttcaatatgtgttacaagc 220  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16680480 ttcaatatgtgttacaagc 16680498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 28166632 - 28166856
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166632 gcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 28166731  T
Q  101 tttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166732 ttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 28166831  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  28166832 tatttcaatatatgttacaagcagg 28166856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4539815 - 4539595
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttct-actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 102  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539815 tgtgctgttgtttgaaactctatttttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 4539716  T
Q  103 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4539715 ttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatt 4539616  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  4539615 tcaatatatgttacaagcagg 4539595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4763901 - 4764124
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763901 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 4763999  T
Q  100 atttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764000 atttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 4764099  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4764100 tatttcaatatgtgttacaagcagg 4764124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26110467 - 26110248
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110467 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 26110368  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26110367 tgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctattt 26110268  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    | |||| |||||||||||||    
T  26110267 ccatatatgttacaagcagg 26110248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 28213596 - 28213816
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28213596 tgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 28213695  T
Q  104 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28213696 ttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatt 28213795  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  28213796 tcaatatatgttacaagcagg 28213816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34458566 - 34458345
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34458566 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctattttctaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatggttgaaacaaac 34458468  T
Q  100 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34458467 attttgaaaattgaaaactttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtct 34458369  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34458368 atttcaatatgtgttacaagcagg 34458345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8899759 - 8899536
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899759 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 8899661  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8899660 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtc 8899561  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  8899560 tatttcaatatatgttacaaacagg 8899536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 29555699 - 29555919
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555699 tgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 29555798  T
Q  104 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555799 tagaaaattaaaagctttttgtctattttgaaaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 29555898  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  29555899 tcaatatatgttacaagcagg 29555919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 29507557 - 29507779
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 101  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507557 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 29507656  T
Q  102 ttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507657 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatggaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 29507756  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  29507757 tttcaatatatgttacaagcagg 29507779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 4779022 - 4779242
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaa-gctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4779022 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaaagctgtatacgaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 4779121  T
Q  103 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 201  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  4779122 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 4779220  T
Q  202 ttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  4779221 ttcaatatatgttacaagcagg 4779242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 27200328 - 27200548
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 102  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200328 tgtgcttttgattaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 27200426  T
Q  103 -ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27200427 cttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgtat 27200526  T
Q  202 ttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||| | |||||||||||||    
T  27200527 ttcaatgtatgttacaagcagg 27200548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27248905 - 27248685
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 102  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248905 tgtgcttttgattaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 27248807  T
Q  103 -ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27248806 cttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgtat 27248707  T
Q  202 ttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||| | |||||||||||||    
T  27248706 ttcaatgtatgttacaagcagg 27248685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33370491 - 33370264
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370491 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaagcattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaac 33370393  T
Q  100 atttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33370392 atttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcgaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 33370293  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcaggctct 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33370292 tatttcaatatatgttacaagcaggctct 33370264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22928943 - 22928708
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22928943 gcctatgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 22928844  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22928843 catcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaatagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgt 22928744  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22928743 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 22928708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26666714 - 26666495
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26666714 tgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 26666616  T
Q  104 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  26666615 ttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatt 26666516  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||| || ||||||||||    
T  26666515 tcaatatatgctacaagcagg 26666495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26772685 - 26772466
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772685 tgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 26772587  T
Q  104 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  26772586 ttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatt 26772487  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||| || ||||||||||    
T  26772486 tcaatatatgctacaagcagg 26772466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 29579153 - 29579375
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579153 gcctgtgcttttgtttgaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 29579251  T
Q  101 ttttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  29579252 ttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtct 29579351  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| || ||||||||||    
T  29579352 atttcaatatatgctacaagcagg 29579375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 26791957 - 26792177
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 102  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791957 tgtgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 26792055  T
Q  103 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 201  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  26792056 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctat 26792155  T
Q  202 ttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||| || ||||||||||    
T  26792156 ttcaatatatgctacaagcagg 26792177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30552058 - 30551837
Alignment:
Q  3 ctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 101  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552058 ctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 30551959  T
Q  102 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  30551958 tttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctat 30551859  T
Q  202 ttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||| || ||||||||||    
T  30551858 ttcaatatatgctacaagcagg 30551837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16938084 - 16937862
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16938084 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaattattttccttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaaca 16937986  T
Q  101 tttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16937985 tttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtct 16937886  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| |||||| ||||||    
T  16937885 atttcaatatatgttaccagcagg 16937862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 4531429 - 4531649
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tt 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4531429 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattctctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 4531528  T
Q  103 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat- 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | |||||||     
T  4531529 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgtgggtgtctatc 4531627  T
Q  202 ttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  4531628 ttcaatatatgttacaagcagg 4531649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13293002 - 13292788
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  13293002 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatct 13292903  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    |||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||    
T  13292902 tgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagcgtgtgttggtgtctattt 13292808  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  13292807 caatatatgttataagcagg 13292788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14139451 - 14139237
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14139451 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattt 14139352  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    |||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139351 tgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacatggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 14139257  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14139256 caatatgtgttacaagcagg 14139237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 27013874 - 27014087
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27013874 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattt 27013973  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    |||||||||||||  ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013974 tgaaaattgaaaaagtttt------tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 27014067  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
     |||||||||||||||||||    
T  27014068 taatatgtgttacaagcagg 27014087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 26926906 - 26927113
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26926906 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 26927004  T
Q  101 tttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||||||    
T  26927005 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaat---------------gagagtatgttgatgtct 26927089  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  26927090 atttcaatatatgttacaagcagg 26927113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 233
Target Start/End: Original strand, 27209045 - 27209271
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttg---ataatgacaa-tgcttgaaacaaa 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||    |||||||||| |||| ||||||||    
T  27209045 tgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaa 27209144  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  27209145 catcttgaaaattgaaaaagtttt-------ttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaa-cgtgcatgagcgagagtatgttgatgtc 27209236  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27209237 tatttcaatatatgttacaagcaggctcttcccca 27209271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27240183 - 27239957
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttg---ataatgacaa-tgcttgaaacaaa 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||    |||||||||| |||| ||||||||    
T  27240183 tgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaa 27240084  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  27240083 catcttgaaaattgaaaaagtttt-------ttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaa-cgtgcatgagcgagagtatgttgatgtc 27239992  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27239991 tatttcaatatatgttacaagcaggctcttcccca 27239957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27031161 - 27031381
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  27031161 gcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaa 27031260  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||    
T  27031261 acatcttgaaaattgaaaaagtttttt----tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgt 27031355  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  27031356 ctatttcaatatatgttacaagcagg 27031381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 24869848 - 24870064
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  24869848 gcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaa 24869947  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| |||    
T  24869948 acatcttgaaaattgaaaaagtttt-------ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgt 24870039  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcag 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  24870040 ctatttcaatatatgttacaagcag 24870064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27025283 - 27025502
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaaca 96  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||    
T  27025283 gcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaaca 27025382  T
Q  97 aacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 196  Q
    | ||| ||||||||||||||  ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || || ||||| ||    
T  27025383 agcatcttgaaaattgaaaaagtttt-------ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgagacatgcatgagctagtgtgtgttggtg 27025475  T
Q  197 tctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  27025476 tctatttcaatatatgttacaagcagg 27025502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24299815 - 24299597
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaaa 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||  || |||| |||||| ||| ||||||| | ||| | |||| |||| |||||||||| |||| | ||||||    
T  24299815 gcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactctcaaagttatgtacaaaaacgtttcccttcttttttaataatgacaaatgctcggaacaaa 24299716  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  24299715 catcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagtaacagggtacattcaaatg-aacatgcataagcgagtgtgtgttggtgtc 24299622  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  24299621 tatttcaatatatgttacaagcagg 24299597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15406588 - 15406370
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  15406588 gcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaa 15406489  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||| | |||||||| |||   |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  15406488 acatctggaaaattggaaaaagttt------tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgt 15406396  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||  | |||||||||||||    
T  15406395 ctatttcaacgtatgttacaagcagg 15406370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15418375 - 15418157
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  15418375 gcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaa 15418276  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||| | |||||||| |||   |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  15418275 acatctggaaaattggaaaaagttt------tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgt 15418183  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||  | |||||||||||||    
T  15418182 ctatttcaacgtatgttacaagcagg 15418157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 233
Target Start/End: Original strand, 20174689 - 20174930
Alignment:
Q  3 ctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttct--actttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaacaaa 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||  |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  20174689 ctgtgcttttgtttgaaactctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaacaaa 20174788  T
Q  99 cattttgaaa------attgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 191  Q
    |||| | |||      ||  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    |    
T  20174789 cattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagtgcgcat 20174888  T
Q  192 tgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
      |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20174889 caatgtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttcccca 20174930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22161302 - 22161061
Alignment:
Q  3 ctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttct--actttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaacaaa 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||  |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22161302 ctgtgcttttgtttgaaactctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaacaaa 22161203  T
Q  99 cattttgaaa------attgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 191  Q
    |||| | |||      ||  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    |    
T  22161202 cattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagtgcgcat 22161103  T
Q  192 tgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
      |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22161102 caatgtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttcccca 22161061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 11555505 - 11555724
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555505 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 11555604  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555605 tgaaaattgaaaacttcttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 11555704  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11555705 caatatgtgttacaagcagg 11555724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18369527 - 18369322
Alignment:
Q  18 aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369527 aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 18369428  T
Q  118 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369427 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 18369328  T
Q  218 agcagg 223  Q
    ||||||    
T  18369327 agcagg 18369322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 30174613 - 30174837
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174613 gcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 30174712  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30174713 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 30174812  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  30174813 tatttcaatatgtgttacaagcagg 30174837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 33881274 - 33881497
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881274 gcctttgcttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 33881373  T
Q  100 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881374 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 33881473  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  33881474 atttcaatatatgttacaagcagg 33881497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Original strand, 3795713 - 3795910
Alignment:
Q  26 tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3795713 tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtc 3795812  T
Q  126 tattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3795813 tattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttataagcagg 3795910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9544722 - 9544497
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544722 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 9544624  T
Q  101 tttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 196  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544623 ttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 9544524  T
Q  197 tctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  9544523 tctatttcaatatgtgttacaagcagg 9544497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40467563 - 40467343
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467563 tgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacattt 40467464  T
Q  104 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467463 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 40467364  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  40467363 tcaatatatgttacaagcagg 40467343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 6880452 - 6880675
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880452 gcctgtgcttttgtttaagactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 6880551  T
Q  101 tttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  6880552 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtct 6880651  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  6880652 atttcaatgtgtgttacaagcagg 6880675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13318837 - 13318618
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318837 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 13318738  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13318737 tgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctattt 13318638  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  13318637 caatatatgttacaagcagg 13318618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32590288 - 32590066
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32590288 gcctgtgcttttgtttaaaactctacttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttctttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaaca 32590190  T
Q  101 tttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590189 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 32590090  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  32590089 atttcaatatatgttacaagcagg 32590066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 28655390 - 28655614
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  28655390 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttaataatgacaatgctcgaaacaaaca 28655488  T
Q  101 tttt--gaaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655489 ttttttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 28655588  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  28655589 ctatttcaatatatgttacaagcagg 28655614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 23632120 - 23632339
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  23632120 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatct 23632219  T
Q  104 tgaaaattgaaaa--ctttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23632220 tgaaaattgaaaaagctttttgtctatttttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtcta 23632319  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagc 220  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  23632320 tttcaatatgtgttataagc 23632339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 30158185 - 30158405
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158185 tgtgcttttgtttaaaactctacctttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 30158284  T
Q  104 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30158285 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctatt 30158384  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  30158385 tcaatatatgttacaagcagg 30158405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 9323626 - 9323847
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323626 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 9323724  T
Q  101 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9323725 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtcta 9323824  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  9323825 tttcaatatatgttacaagcagg 9323847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 12138325 - 12138546
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138325 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 12138423  T
Q  101 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12138424 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtcta 12138523  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  12138524 tttcaatatatgttacaagcagg 12138546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18494754 - 18494561
Alignment:
Q  27 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtct 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494754 ttttcttctactttcaaagctatatacaatttactttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtct 18494655  T
Q  127 attttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494654 attttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 18494561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 37761130 - 37761354
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37761130 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaac 37761228  T
Q  100 atttt-gaaaattgaaaactttttgtctatttt-gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761229 atttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagggcacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 37761328  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  37761329 ctatttcaatatatgttacaagcagg 37761354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13436689 - 13436464
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacatttt-ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13436689 tgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttttctttctattttgataatggcaacgcttgaaacaaacat 13436590  T
Q  102 ttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436589 tttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 13436490  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||| | |||||||||||    
T  13436489 ctatttcaatatatattacaagcagg 13436464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8659467 - 8659262
Alignment:
Q  18 aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaa 116  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8659467 aaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa 8659369  T
Q  117 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  8659368 ctttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttac 8659269  T
Q  217 aagcagg 223  Q
    |||||||    
T  8659268 aagcagg 8659262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 30035574 - 30035795
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30035574 gcctgtgcttttgtttaaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaaca 30035672  T
Q  101 tttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30035673 tttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtct 30035772  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcag 222  Q
    |||||||||| |||||| |||||    
T  30035773 atttcaatatatgttaccagcag 30035795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 34622670 - 34622896
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34622670 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattt 34622769  T
Q  104 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622770 ttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 34622869  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcaggctcttc 229  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  34622870 tcaatatatgttacaagcaggttcttc 34622896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 24730118 - 24730341
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24730118 gcctgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 24730216  T
Q  101 tttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  24730217 ttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtc 24730316  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    
T  24730317 tatttcaatatatgctacaagcagg 24730341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37352657 - 37352434
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37352657 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccatttttgataatgacaatgcttgaaacaaa 37352559  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37352558 cattttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtc 37352459  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  37352458 tatttcaatatatgttacaagcagg 37352434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5643948 - 5644169
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5643948 gcctgtgcttttgtttgaaactctatttt-cttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaaca 5644046  T
Q  101 -ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5644047 tttttgaaaatcgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtct 5644145  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  5644146 atttcaatatatgttaaaagcagg 5644169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15752862 - 15752648
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15752862 tgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttct----tgataatgacaatacttgaaacaaacattt 15752768  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15752767 tgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctattt 15752668  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||| |||||| ||||||    
T  15752667 caatatatgttaccagcagg 15752648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 2517216 - 2517437
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2517216 tgtgcttttgtttgagattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattt 2517314  T
Q  104 t---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2517315 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtcta 2517414  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||  |||||||||||||||    
T  2517415 tttcaacgtgtgttacaagcagg 2517437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13180801 - 13180583
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13180801 gcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaac 13180702  T
Q  100 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    || ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180701 atcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 13180607  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13180606 atttcaatatgtgttacaagcagg 13180583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31820421 - 31820200
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820421 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 31820323  T
Q  101 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  31820322 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaaggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtcta 31820223  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  31820222 tttcaatatatgctacaagcagg 31820200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37665496 - 37665276
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tt 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37665496 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 37665397  T
Q  103 ttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  37665396 ttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 37665298  T
Q  202 ttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||| |||||||| ||||    
T  37665297 ttcaatatatgttacaaacagg 37665276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 43084406 - 43084629
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084406 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctattttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 43084504  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43084505 cattttgaaagttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtc 43084604  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||| | || ||||||||||    
T  43084605 tatttcaatgtatgctacaagcagg 43084629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Original strand, 26486566 - 26486756
Alignment:
Q  33 tctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg 132  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26486566 tctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttg 26486665  T
Q  133 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26486666 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 26486756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Original strand, 33522532 - 33522754
Alignment:
Q  3 ctgtgcttttgcttgaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522532 ctgtgcttttgtttgaaactctgttttcttttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 33522631  T
Q  101 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  33522632 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtcta 33522731  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  33522732 tttcaatatatgctacaagcagg 33522754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37746341 - 37746112
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37746341 gcctttgcttttgtttgaaaactctattttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaac 37746242  T
Q  100 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta------tgttg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      ||||     
T  37746241 attttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttaatgtta 37746142  T
Q  194 atgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37746141 atgtctatttcaatatatgttacaagcagg 37746112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 22894564 - 22894796
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22894564 gcctttgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaatattttctttctattttgataatgaccatgcttgaaacaaaca 22894663  T
Q  101 ttttgaaaattgaaaa-ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22894664 tcttgaaaattgaaaaggtttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtatgttgatgtct 22894762  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22894763 atttcgatatgtgttacaagcagactcttcccca 22894796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 41680852 - 41681076
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680852 gcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 41680951  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||    
T  41680952 cattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgt 41681050  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| | |||||||||||||    
T  41681051 ctatttcaatttatgttacaagcagg 41681076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Original strand, 11329803 - 11330010
Alignment:
Q  18 aaactctatttttcttctactttcaaagcta--tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaa-ttgaa 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11329803 aaactctatttt-cttctactttcaaagctaaatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttaaaaattgaa 11329901  T
Q  115 aactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11329902 aactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgtt 11330001  T
Q  215 acaagcagg 223  Q
    |||||||||    
T  11330002 acaagcagg 11330010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 31437615 - 31437828
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  31437615 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattt 31437714  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    |||||||||||||  ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437715 tgaaaattgaaaaagtttt------tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 31437808  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31437809 caatatgtgttacaagcagg 31437828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Original strand, 33298708 - 33298908
Alignment:
Q  26 tttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgt 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298708 ttttttttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgt 33298807  T
Q  125 ctatttt--gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcag 222  Q
    |||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33298808 ctatttttgaaaaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcag 33298907  T
Q  223 g 223  Q
    |    
T  33298908 g 33298908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18122426 - 18122207
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttctt-ctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 102  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122426 tgtgcttttgtttaaaactctatttttttttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 18122327  T
Q  103 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 201  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  18122326 tttgaaaattgagaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 18122228  T
Q  202 ttcaatatgtgttacaagcag 222  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  18122227 ttcaatatatgttacaagcag 18122207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28953793 - 28953570
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953793 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 28953695  T
Q  100 a-ttttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||    
T  28953694 atttttgggaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgt 28953596  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| | |||||||||||||    
T  28953595 ctatttcaatttatgttacaagcagg 28953570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 25206426 - 25206653
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25206426 gcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaa 25206525  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaac-----tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtt 192  Q
    |||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  25206526 acatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttgaaa-gcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtt 25206624  T
Q  193 gatgtctatttcaatatgtgttacaagca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25206625 gatgtctatttcaatatgtgttacaagca 25206653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 25270582 - 25270809
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25270582 gcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaa 25270681  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaac-----tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtt 192  Q
    |||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  25270682 acatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttgaaa-gcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtt 25270780  T
Q  193 gatgtctatttcaatatgtgttacaagca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25270781 gatgtctatttcaatatgtgttacaagca 25270809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15652768 - 15652550
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15652768 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattt 15652669  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    |||||||||||||  |||| | | |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  15652668 tgaaaattgaaaaagttttttttttaaaaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctattt 15652570  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  15652569 caatatatgttacaagcagg 15652550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22993126 - 22992914
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  22993126 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgatgatgctcgaaacaagcattt 22993027  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    |||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  22993026 tgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctattt 22992934  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  22992933 caatatatgttacaagcagg 22992914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Original strand, 23898025 - 23898238
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaaa 98  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  23898025 tgtgcttttgtttaaaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaaaacattttctttctattttaataatgacaaatgcttgaaacaaa 23898124  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23898125 catcttgaaaattgaaaaagttttg----------aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtc 23898214  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcag 222  Q
    ||||||||||| |||| |||||||    
T  23898215 tatttcaatatatgttgcaagcag 23898238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 33783635 - 33783853
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttg--ataatgacaa-tgcttgaaaca 96  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||| |||| ||||||    
T  33783635 gcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctattttttaataatgacaaatgctcgaaaca 33783734  T
Q  97 aacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 196  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  33783735 aacatcttgaaaattgaaaaagtttt-------ttgaaaagcaaaccggagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtg 33783826  T
Q  197 tctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  33783827 tctatttcaatatatgttacaagcagg 33783853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 30940785 - 30941001
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  30940785 gcctgtgcttttgtttgaaattctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaa 30940884  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||     
T  30940885 acatcttgaaaattgaaaaagtttt--------tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaaagaa-catgcatgagcgagtgtatgttggtgc 30940975  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  30940976 ctatttcaatatatgttacaagcagg 30941001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Original strand, 24975999 - 24976214
Alignment:
Q  3 ctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaac 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  24975999 ctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaac 24976098  T
Q  100 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    || |||||||||| |||  ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  24976099 atcttgaaaattggaaaagtttt--------tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtct 24976190  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  24976191 atttcaacatatgttacaagcagg 24976214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 24608397 - 24608612
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaaca 100  Q
    |||||||||| |||||||||   |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  24608397 tgtgcttttgtttgaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaaca 24608496  T
Q  101 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    | ||||||||||||||  ||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  24608497 tcttgaaaattgaaaaagtttt-------ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcaagtgtgtgttggtgtcta 24608589  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||| || |||||||||||||    
T  24608590 tttcaacatatgttacaagcagg 24608612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 39896211 - 39896430
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896211 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 39896310  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896311 tgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 39896410  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39896411 caatatgtgttacaagcagg 39896430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 12661681 - 12661900
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12661681 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattt 12661780  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661781 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 12661880  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  12661881 caatatatgttacaagcagg 12661900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 37383820 - 37384039
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383820 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 37383919  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383920 tgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 37384019  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  37384020 caatatgtgttacaagcagg 37384039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37945969 - 37945745
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945969 gcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 37945870  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  37945869 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtaagagtatgttgatgtc 37945770  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  37945769 tatttcaatatgtgttacaagcagg 37945745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27122664 - 27122885
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122664 gcctttgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 27122762  T
Q  101 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122763 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgagaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 27122862  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  27122863 tttcaatatatgttacaagcagg 27122885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27809840 - 27810065
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaa 97  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809840 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaa 27809939  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27809940 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggttacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgt 27810039  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27810040 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 27810065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 254755 - 254532
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254755 gcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 254656  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  254655 cattttgaaaattgaaaactttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 254557  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  254556 tatttcaatatgtgttacaagcagg 254532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 34867822 - 34868044
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867822 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 34867920  T
Q  101 tttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867921 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 34868020  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  34868021 atttcaatatatgttacaagcagg 34868044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 3788633 - 3788855
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3788633 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaac 3788731  T
Q  100 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3788732 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtct 3788831  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||| | |||||||||||||    
T  3788832 atttcaatgtatgttacaagcagg 3788855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31868888 - 31868666
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31868888 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 31868790  T
Q  101 tttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31868789 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtct 31868690  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  31868689 atttcaatatatgttacaagcagg 31868666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22922217 - 22922023
Alignment:
Q  29 ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22922217 ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctat 22922118  T
Q  129 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22922117 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 22922023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13930649 - 13930424
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930649 gcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 13930550  T
Q  99 catttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13930549 catttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgt 13930450  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  13930449 ctatttcaatatgtgttacgagcagg 13930424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9344087 - 9343867
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344087 tgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacattt 9343988  T
Q  104 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9343987 ttgaaaattgaaaactttttgtccattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 9343888  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  9343887 tcaatatatgttacaagcagg 9343867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39045922 - 39045702
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39045922 tgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttccattttaataatgacaatacttgaaacaaacattt 39045823  T
Q  104 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045822 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 39045723  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  39045722 tcaatatatgttacaagcagg 39045702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 12592949 - 12593176
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592949 gcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 12593048  T
Q  100 atttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgat 195  Q
    |||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12593049 attttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttggaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgat 12593148  T
Q  196 gtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12593149 gtctatttcaatatgtgttacaagcagg 12593176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 16167617 - 16167840
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167617 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 16167715  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16167716 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagggtatgttgatgtc 16167815  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16167816 tatttcaatatgtgttacaagcagg 16167840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 32055941 - 32056163
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055941 gcctgtgcttttgtttaaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 32056039  T
Q  101 tttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32056040 tttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtct 32056139  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| |||||| ||||||    
T  32056140 atttcaatatatgttaccagcagg 32056163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19410558 - 19410364
Alignment:
Q  29 ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctat 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19410558 ttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctat 19410459  T
Q  129 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19410458 tttgaaaagcaaacctgagcaacaggataccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 19410364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Original strand, 37931543 - 37931741
Alignment:
Q  26 tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37931543 tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgt 37931642  T
Q  125 ctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37931643 ttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 37931741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 34160986 - 34161208
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34160986 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattt 34161085  T
Q  104 t---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161086 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 34161185  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||| ||| |||||||||    
T  34161186 tttcaatatatgtcacaagcagg 34161208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12710701 - 12710481
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710701 tgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 12710603  T
Q  104 t--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 201  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  12710602 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctat 12710503  T
Q  202 ttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||| || ||||||||||    
T  12710502 ttcaatatatgctacaagcagg 12710481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37679995 - 37679771
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37679995 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaac 37679897  T
Q  100 atttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37679896 attttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 37679797  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| | |||||||||||||    
T  37679796 ctatttcaatgtatgttacaagcagg 37679771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37695260 - 37695036
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37695260 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaac 37695162  T
Q  100 atttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695161 attttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 37695062  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| | |||||||||||||    
T  37695061 ctatttcaatgtatgttacaagcagg 37695036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 31882429 - 31882648
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31882429 tgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacattt 31882527  T
Q  104 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31882528 ttgaaaattaaaaactttttttctattttgaaaagcaaacttgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctatt 31882627  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  31882628 tcaatatatgttacaagcagg 31882648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21671275 - 21671050
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21671275 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaac 21671177  T
Q  100 atttt--gaaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 196  Q
    |||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21671176 attttttgaaaattgaaattttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 21671077  T
Q  197 tctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||    
T  21671076 tctatttcaatgtatgttacaagcagg 21671050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16823438 - 16823217
Alignment:
Q  3 ctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 101  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823438 ctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 16823339  T
Q  102 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  16823338 tttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctat 16823239  T
Q  202 ttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||| || ||||||||||    
T  16823238 ttcaatatatgctacaagcagg 16823217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Original strand, 16898042 - 16898263
Alignment:
Q  3 ctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 101  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16898042 ctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 16898141  T
Q  102 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  16898142 tttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctat 16898241  T
Q  202 ttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||| || ||||||||||    
T  16898242 ttcaatatatgctacaagcagg 16898263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 27782376 - 27782594
Alignment:
Q  6 tgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 104  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782376 tgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 27782474  T
Q  105 -gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27782475 tgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctattt 27782574  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||| |||||||| ||||    
T  27782575 caatatatgttacaaacagg 27782594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 40239648 - 40239870
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239648 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 40239746  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  40239747 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 40239845  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||| || |||||||||||||    
T  40239846 tatttcaacatatgttacaagcagg 40239870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11629287 - 11629065
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11629287 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttttattttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaac 11629189  T
Q  100 atttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  11629188 atttttgaaaattgaaaactctttgtctattttgaaaaacaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 11629090  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  11629089 tatttcaatatatgttacaagcagg 11629065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21697279 - 21697043
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |  | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21697279 gcctgtgcttttgtttgaaactctactatcttcctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaa 21697180  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgat 195  Q
    |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21697179 acatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgat 21697081  T
Q  196 gtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21697080 gtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttcccca 21697043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 34297298 - 34297508
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34297298 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattt 34297397  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
     ||||||||||||  ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297398 cgaaaattgaaaaagtttt------tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 34297491  T
Q  204 caatatgtgttacaagc 220  Q
    |||||| ||||||||||    
T  34297492 caatatatgttacaagc 34297508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 27396462 - 27396705
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27396462 gcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatctttataatgacaatgcttgaaacaaa 27396561  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaac----------tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 188  Q
    ||| ||||||||||||||           ||||||||  |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  27396562 catcttgaaaattgaaaaaaaaaaaaagttttttgtcctttttgaaa-gcaaacctaagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgta 27396660  T
Q  189 tgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27396661 tgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 27396705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 223
Target Start/End: Original strand, 23116993 - 23117158
Alignment:
Q  58 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 157  Q
    ||||||| | |||| || || |||||||||||||||  ||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23116993 cattttcctcctatcttcatcatgacaatgcttgaactaacgtttttgaccattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgggcaacagggta 23117092  T
Q  158 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23117093 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 23117158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19450527 - 19450288
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19450527 tgtgcttttgtttgaaactctattttctctctactttcaaaggtatgtacaaaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaa 19450428  T
Q  99 cattttgaaaattg------aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtt 192  Q
    ||| ||||||||||      |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||| ||| ||||||     
T  19450427 catcttgaaaattgaaaaaaaaaagtttttgtctgttttg-aaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaatgtgcatgagtgagcgtatgtc 19450329  T
Q  193 gatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19450328 gatgtctatttcaatatgtgttataagcaggctcttcccca 19450288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34269021 - 34268807
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaaca 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  34269021 tgtgcttttgtttaaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaaca 34268922  T
Q  101 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    | || |||||||||||  ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  34268921 tcttaaaaattgaaaaagtttt-------ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtcta 34268829  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcag 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  34268828 tttcaatatatgttacaagcag 34268807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23122675 - 23122458
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaaa 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  23122675 gcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaa 23122576  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  23122575 catcttgaaaattgaaaaagtttt------tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 23122483  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    
T  23122482 tatttcaatatatgctacaagcagg 23122458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 28888418 - 28888636
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  28888418 gcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaa 28888517  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||    
T  28888518 acatcttgaaaattgaaaaagtttt------tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgt 28888610  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  28888611 ctatttcaatatatgttacaagcagg 28888636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 20844052 - 20844274
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaa-gctatatacaaaa--cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaac 95  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||  || ||| |||||| | ||| | |||||  ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||    
T  20844052 gcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttaccttcaaaagttatgttcaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaac 20844151  T
Q  96 aaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgat 195  Q
    || ||| ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  20844152 aagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggt 20844246  T
Q  196 gtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20844247 gtctatttcaatatatgttacaagcagg 20844274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27428549 - 27428323
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  || ||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| || | |||||||    
T  27428549 gcctgtgcttttgtttaaaactctattttctttttactttcaaagttatgtgcaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgttcgaaacaa 27428450  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||| |||||||||| |||  ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| |||    
T  27428449 acatcttgaaaattgcaaaagtttt--------tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-cgtgcatgagcgagtgtatgttggtgt 27428359  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  27428358 ctatttcaatatatgttacaagcaggttctccccca 27428323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 18796851 - 18797071
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796851 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 18796950  T
Q  103 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796951 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 18797050  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18797051 tcaatatgtgttacaagcagg 18797071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 9360763 - 9360985
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360763 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 9360861  T
Q  100 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360862 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 9360961  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  9360962 atttcaatatatgttacaagcagg 9360985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28355999 - 28355802
Alignment:
Q  26 tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355999 tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtc 28355900  T
Q  126 tattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355899 tattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 28355802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 33248510 - 33248729
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248510 tgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 33248609  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  33248610 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctattt 33248709  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  33248710 caatatatgttataagcagg 33248729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 19680590 - 19680811
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680590 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 19680688  T
Q  101 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19680689 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtcta 19680788  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  19680789 tttcaatatatgttacaagcagg 19680811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 44567122 - 44567347
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567122 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 44567220  T
Q  101 tttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 196  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44567221 ttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatg 44567320  T
Q  197 tctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44567321 tctatttcaatatatgttacaagcagg 44567347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12086795 - 12086575
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12086795 tgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 12086696  T
Q  104 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12086695 ttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatt 12086596  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  12086595 tcaatatatgttacaagcagg 12086575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 31360669 - 31360892
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360669 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 31360767  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31360768 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 31360867  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  31360868 tatttcaatatgtgttacaagcagg 31360892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21342245 - 21342022
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21342245 gcctgtgcttctgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaagca 21342146  T
Q  101 tttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342145 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 21342046  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21342045 atttcaatatgtgttacaagcagg 21342022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 29835464 - 29835686
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835464 gcctgtgcttttgtttgaaaactccatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 29835562  T
Q  100 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29835563 attttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtct 29835662  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  29835663 atttcaatatgtgttacgagcagg 29835686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 15773718 - 15773938
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773718 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcagagctatatacaaaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 15773817  T
Q  104 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773818 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 15773917  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  15773918 tcaatatatgttacaagcagg 15773938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 18715621 - 18715843
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715621 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 18715719  T
Q  101 ttttg----aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 196  Q
    ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715720 tttttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 18715819  T
Q  197 tctatttcaatatgtgttacaagc 220  Q
     |||||||||||| ||||||||||    
T  18715820 actatttcaatatatgttacaagc 18715843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31483916 - 31483722
Alignment:
Q  29 ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31483916 ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctat 31483817  T
Q  129 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31483816 tttgaaaagcaaacctgagcaacaaggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacgagcagg 31483722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 33264875 - 33265079
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33264875 tgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacgaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacattt 33264973  T
Q  104 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33264974 ttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcaatgtctatt 33265073  T
Q  203 tcaata 208  Q
    ||||||    
T  33265074 tcaata 33265079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19911239 - 19911014
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911239 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 19911140  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19911139 catcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgt 19911040  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19911039 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 19911014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19202417 - 19202227
Alignment:
Q  33 tctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg 132  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19202417 tctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttg 19202318  T
Q  133 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19202317 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctgtttcaatatatgttacaagcagg 19202227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22074999 - 22074773
Alignment:
Q  7 gcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  22074999 gcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacttct 22074900  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    |||||||  |||| ||||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22074899 tgaaaataaaaaagtttttgtctgttttgaaa-gcaagcatgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctattt 22074801  T
Q  204 caatatgtgttacaagcaggctcttccc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074800 caatatgtgttacaagcaggctcttccc 22074773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19655417 - 19655189
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  19655417 gcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaa 19655318  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||| |||||||||||||| |||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  19655317 acatcttgaaaattgaaaagttttt------tttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgt 19655225  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19655224 ctatttcaatatatgttacaagcagactcttcccca 19655189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27602982 - 27602766
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||  || ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  27602982 gcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaa 27602883  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||| |||||||||||||| |||||        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||    
T  27602882 acatcttgaaaattgaaaagttttt--------tgaaaagcaaacctgtgcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgt 27602792  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27602791 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 27602766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2131337 - 2131120
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  2131337 gcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaa 2131238  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||| ||||||||||||||  || |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||    
T  2131237 acatcttgaaaattgaaaaagttct-------ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgt 2131146  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  2131145 ctatttcaatatatgttacaagcagg 2131120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 22139051 - 22139264
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaaca 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||     
T  22139051 tgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacg 22139150  T
Q  101 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    | ||||||||||||||  ||||        ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22139151 tcttgaaaattgaaaaagtttt--------tgaaa-gcaaacttgagcaacagggtacattgaaatgaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtcta 22139241  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  22139242 tttcaatatatgttacaagcagg 22139264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 16260364 - 16260480
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16260364 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaac 16260462  T
Q  100 attttgaaaattgaaaac 117  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  16260463 attttgaaaatcgaaaac 16260480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 19694237 - 19694453
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||||| || ||||||   |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  19694237 gcctgtgcttttgtttaaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaa 19694336  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
     ||| ||||||||||||||  ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| |||    
T  19694337 gcatcttgaaaattgaaaaagtttt------tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgt 19694429  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagca 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  19694430 ctatttcaatatatgttacaagca 19694453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 14569297 - 14569518
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-----cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaa 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| | |||||     ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||    
T  14569297 gcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgttcaaaaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaa 14569396  T
Q  94 acaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttg 193  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  ||||       ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||    
T  14569397 acaagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-------ttgaaagacaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttg 14569488  T
Q  194 atgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
     ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14569489 gtgtctatttcaatacatgttacaagcagg 14569518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4790786 - 4790566
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790786 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 4790687  T
Q  103 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790686 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 4790587  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4790586 tcaatatgtgttacaagcagg 4790566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5717172 - 5717396
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717172 gcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 5717271  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5717272 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 5717371  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5717372 tatttcaatatgtgttacaagcagg 5717396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5728082 - 5728306
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728082 gcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 5728181  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5728182 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 5728281  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5728282 tatttcaatatgtgttacaagcagg 5728306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5764286 - 5764062
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764286 gcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 5764187  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5764186 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 5764087  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5764086 tatttcaatatgtgttacaagcagg 5764062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 47029557 - 47029781
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029557 gcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 47029656  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47029657 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 47029756  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  47029757 tatttcaatatgtgttacaagcagg 47029781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29659124 - 29658901
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659124 gcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagttatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 29659025  T
Q  101 tttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659024 tttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 29658925  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29658924 atttcaatatgtgttacaagcagg 29658901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Original strand, 32296760 - 32296957
Alignment:
Q  26 tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296760 tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtc 32296859  T
Q  126 tattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296860 tattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 32296957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 48472034 - 48472258
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472034 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 48472133  T
Q  104 tg-----aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    |      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472134 ttttttaaaaattgaaaactttctgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 48472233  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  48472234 tatttcaatatatgttacaagcagg 48472258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 10402253 - 10402475
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10402253 gcctgtgcttttgattaaaattctattttt-ttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaaca 10402351  T
Q  101 tttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402352 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 10402451  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  10402452 atttcaatatatgttacaagcagg 10402475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 18248842 - 18249065
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248842 gcctttgcttttgtttggaactctatttttcttctactttcaaagctacatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 18248941  T
Q  101 tttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248942 tttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 18249041  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  18249042 atttcaatatatgttacaagcagg 18249065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 20072137 - 20072362
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072137 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 20072235  T
Q  101 tttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 196  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072236 ttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 20072335  T
Q  197 tctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20072336 tctatttcaatatatgttacaagcagg 20072362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5590517 - 5590294
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590517 gcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 5590418  T
Q  100 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5590417 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtct 5590318  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  5590317 atttcaataggtgttacaagcagg 5590294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17971020 - 17970799
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971020 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 17970922  T
Q  101 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970921 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 17970822  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  17970821 tttcaatatgcgttacaagcagg 17970799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28110111 - 28109884
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110111 gcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 28110012  T
Q  100 ----attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgat 195  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28110011 gttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggt 28109912  T
Q  196 gtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28109911 gtctatttcaatatgtgttacaagcagg 28109884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31958582 - 31958388
Alignment:
Q  29 ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31958582 ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctat 31958483  T
Q  129 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31958482 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 31958388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 10649175 - 10649398
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649175 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 10649273  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10649274 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 10649373  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10649374 tatttcaatatgtgttacaagcagg 10649398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5603440 - 5603246
Alignment:
Q  29 ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5603440 ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctat 5603341  T
Q  129 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5603340 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaataaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 5603246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Original strand, 24334308 - 24334502
Alignment:
Q  29 ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctat 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24334308 ttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctat 24334407  T
Q  129 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24334408 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 24334502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4423022 - 4423245
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4423022 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaataaac 4423120  T
Q  100 atttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423121 atttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 4423220  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  4423221 tatttcaatatatgttacaagcagg 4423245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22381733 - 22381514
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tt 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22381733 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 22381634  T
Q  103 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  22381633 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagtgtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatt 22381535  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  22381534 tcaatatatgttacaagcagg 22381514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22864976 - 22864784
Alignment:
Q  28 tttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtcta 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22864976 tttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctg 22864877  T
Q  128 ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22864876 ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagc 22864784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22880035 - 22879843
Alignment:
Q  28 tttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtcta 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22880035 tttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctg 22879936  T
Q  128 ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22879935 ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagc 22879843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11104518 - 11104294
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagcta--tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||  |||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11104518 gcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagctaaatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaa 11104419  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104418 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 11104319  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  11104318 tatttcaatatatgttacaagcagg 11104294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18286510 - 18286288
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286510 gcctgtgcttttgattaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 18286412  T
Q  101 --ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  18286411 ttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 18286313  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18286312 tatttcaatatgtgttacaagcagg 18286288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18301811 - 18301589
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301811 gcctgtgcttttgattaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 18301713  T
Q  101 --ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  18301712 ttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 18301614  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18301613 tatttcaatatgtgttacaagcagg 18301589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4340832 - 4340609
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340832 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 4340734  T
Q  100 atttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340733 atttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 4340634  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  4340633 tatttcaatatatgttacaagcagg 4340609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 5019820 - 5020039
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5019820 tgtgcttttgtttaaaactctacttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacattt 5019918  T
Q  104 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019919 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 5020018  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  5020019 tcaatatatgttacaagcagg 5020039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5473092 - 5473314
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473092 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 5473190  T
Q  100 atttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473191 atttttgaaaattgaaaactttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 5473289  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  5473290 tatttcaatatatgttacaagcagg 5473314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 51788126 - 51788349
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788126 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaatattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 51788224  T
Q  100 atttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51788225 atttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtc 51788324  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  51788325 tatttcaatatatgttacaagcagg 51788349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 28027398 - 28027616
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28027398 tgtgcttttgtttaaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattt 28027496  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027497 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 28027596  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||| | |||||||||||||    
T  28027597 caatgtatgttacaagcagg 28027616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 28345275 - 28345497
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345275 gcctatgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 28345373  T
Q  101 ttttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  28345374 ttttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttggtgtct 28345473  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  28345474 atttcaatatgtgttacaagcagg 28345497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17979105 - 17978883
Alignment:
Q  3 ctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 101  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979105 ctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 17979006  T
Q  102 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17979005 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaaggaaatatgcatgagcgagggtatgttgatgtcta 17978906  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  17978905 tttcaatatatgttacaagcagg 17978883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 16422286 - 16422520
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422286 gcctttgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 16422385  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16422386 catcttgaaaattgaaaaagtttttgtgtattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgt 16422484  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422485 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 16422520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 8217736 - 8217961
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8217736 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaa 8217834  T
Q  99 catttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 196  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217835 cattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 8217934  T
Q  197 tctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8217935 tctatttcaatatatgttacaagcagg 8217961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6536896 - 6536670
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6536896 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattt 6536797  T
Q  104 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536796 ttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 6536697  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcaggctcttc 229  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6536696 tcaatatatgttacaagcaggttcttc 6536670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 7079329 - 7079554
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata----caaaacattttctttctatt-ttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7079329 tgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatatatacaaaacattttctttctattcttgataatgacaatgcttgaaacaaa 7079428  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaa-ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079429 cattttgaaaattaaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 7079528  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  7079529 ctatttcaatatatgttacaagcagg 7079554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 18231297 - 18231520
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231297 gcctttgcttttgtttaaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 18231396  T
Q  101 tttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  18231397 tttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacagtcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtct 18231496  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| || ||||||||||    
T  18231497 atttcaatatatgctacaagcagg 18231520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4629889 - 4630111
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629889 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 4629987  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  4629988 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 4630086  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||| || |||||||||||||    
T  4630087 tatttcaacatatgttacaagcagg 4630111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29142913 - 29142687
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142913 gcctttgcttttgtttgaaaactccattttttttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 29142814  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  29142813 cattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtg 29142714  T
Q  197 tctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29142713 tctatttcaatatatgttacaagcagg 29142687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31030394 - 31030178
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31030394 gcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaaca 31030295  T
Q  101 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    ||||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  31030294 ttttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtcta 31030201  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||| || |||||||||||||    
T  31030200 tttcaagatatgttacaagcagg 31030178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 21680805 - 21681027
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680805 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 21680903  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  21680904 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 21681002  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||| || |||||||||||||    
T  21681003 tatttcaacatatgttacaagcagg 21681027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Original strand, 18057369 - 18057600
Alignment:
Q  5 gtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaacatt 102  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  18057369 gtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatc 18057468  T
Q  103 ttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 201  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18057469 ttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctat 18057568  T
Q  202 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057569 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 18057600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16618649 - 16618412
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16618649 gcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaa 16618550  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaac---tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttga 194  Q
    |||| ||||||||||||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16618549 acatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtccattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcga 16618451  T
Q  195 tgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16618450 tgtctatttcaatatgtgttacaaggaggctcttcccca 16618412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 18336736 - 18336949
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  18336736 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattatgataatgataatgctcgaaacaaacatct 18336835  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    |||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  18336836 tgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctattt 18336929  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  18336930 caatatatgttacaagcagg 18336949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20570997 - 20570779
Alignment:
Q  6 tgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 104  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20570997 tgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttt 20570899  T
Q  105 -gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  20570898 tgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcaagtgtatgttggtgtctattt 20570799  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||| |||||||| ||||    
T  20570798 caatatatgttacaaacagg 20570779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 19700590 - 19700835
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-----------cattttctttctattttgataatgacaa-tgc 88  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||           |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19700590 gcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaaaaaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgc 19700689  T
Q  89 ttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagag 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  19700690 ttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtg 19700788  T
Q  187 tatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  19700789 tatgttggtgtctatttcaatatgtgttacgagcagattcttcccca 19700835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 6208005 - 6208233
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga-taatgacaatg-cttgaaacaa 97  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | || |||||||    
T  6208005 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctatttttaataatgacaaaggctcgaaacaa 6208104  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||    
T  6208105 acatcttgaaaattgaaaaagtttt------tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgt 6208197  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6208198 ctatttcaatatatgttacaagcaggctcttcccca 6208233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 233
Target Start/End: Original strand, 4727740 - 4727964
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacat 101  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||    
T  4727740 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacat 4727839  T
Q  102 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 201  Q
     ||||||||||||||  ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  4727840 cttgaaaattgaaaaagtttt------tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 4727932  T
Q  202 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4727933 ttcaatatatgttacaagcaggctcttcccca 4727964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 32445261 - 32445472
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  32445261 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatatacaaaacattttctttctgttttgataatgataatgctcgaaacaaacattt 32445360  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    |||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  32445361 tgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctattt 32445452  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  32445453 caatatatgttacaagcagg 32445472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15735251 - 15735033
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  15735251 gcctgtgcttttgtttgaaactctgcttt-cttttactttcaaagttatgtacaaaaacatttcccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaa 15735153  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
     ||| ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||    
T  15735152 gcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgt 15735059  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  15735058 ctatttcaatatatgttacaagcagg 15735033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5658240 - 5658458
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  5658240 gcctgtgcttttgtttgaaactctattttccttttactttcaacgttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaa 5658339  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||| || |||||||||||  ||||      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  5658340 acatcttaaaaattgaaaaagtttt------tttgaaaagcaaacctaagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgt 5658432  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||    |||||||||||||    
T  5658433 ctatttcaacgcatgttacaagcagg 5658458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 4689756 - 4689971
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  4689756 gcctgtgcttttgtttgaaactctgcttt-cttttactttctaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaa 4689854  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||     
T  4689855 acatcttgaaaattgaaaaagtttt-------ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgc 4689946  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcag 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  4689947 ctatttcaatatatgttacaagcag 4689971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 35886869 - 35887087
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||  || ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  35886869 gcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaa 35886968  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||      ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||| |||    
T  35886969 acatcttgaaaattgaaaaagtttt------tttgaaaagcaaacctgtgtaacagggtacattcaaacgaa-catacatgagcgagtgtgtgttggtgt 35887061  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  35887062 ctatttcaatatatgttacaagcagg 35887087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15886891 - 15886674
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||| ||| |||||||  | |||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||    
T  15886891 gcctgtgtttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaatactttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaagcaa 15886792  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  15886791 acatcttgaaaattgaaaaagtttt-------ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtatgttggtgt 15886700  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  15886699 ctatttcaatatatgttacaagcagg 15886674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8283591 - 8283391
Alignment:
Q  35 tactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac---------ttttt 122  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||          |||||    
T  8283591 tactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttttttttttt 8283492  T
Q  123 gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcag 222  Q
     | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8283491 tttttttttggaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcag 8283392  T
Q  223 g 223  Q
    |    
T  8283391 g 8283391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9751 - 9532
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9751 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 9652  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9651 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 9552  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  9551 caatatatgttataagcagg 9532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 39856789 - 39857010
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    |||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856789 gcctttgcttttgtttaaaactct-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 39856887  T
Q  101 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856888 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 39856987  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  39856988 tttcaatatgtgttacaagcagg 39857010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40099732 - 40099526
Alignment:
Q  18 aaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099732 aaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 40099633  T
Q  117 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099632 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 40099533  T
Q  217 aagcagg 223  Q
    |||||||    
T  40099532 aagcagg 40099526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20332536 - 20332312
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332536 gcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 20332437  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20332436 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 20332337  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20332336 tatttcaatatgtgttacaagcagg 20332312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 14104698 - 14104917
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14104698 tgtgcttttgtttaaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattt 14104797  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14104798 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctattt 14104897  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14104898 caatatgtgttacaagcagg 14104917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 54839543 - 54839765
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839543 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 54839641  T
Q  101 tttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839642 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 54839741  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  54839742 atttcaatatatgttacaagcagg 54839765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24586474 - 24586251
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24586474 gcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataaggacaatgctcgaaacaaac 24586375  T
Q  100 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586374 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaatagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 24586275  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  24586274 atttcaatatatgttacaagcagg 24586251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27157427 - 27157202
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaa 97  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157427 gcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaa 27157328  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27157327 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgt 27157228  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27157227 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 27157202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 30759916 - 30760137
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759916 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 30760014  T
Q  101 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30760015 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 30760114  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  30760115 tttcaatatatgttacaagcagg 30760137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33667914 - 33667693
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33667914 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 33667816  T
Q  101 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33667815 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 33667716  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  33667715 tttcaatatatgttacaagcagg 33667693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 5700696 - 5700915
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5700696 tgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacattt 5700794  T
Q  104 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700795 ttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 5700894  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  5700895 tcaatatatgttacaagcagg 5700915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34183072 - 34182854
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tt 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34183072 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 34182973  T
Q  103 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  34182972 ttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatt 34182875  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  34182874 tcaatatatgttacaagcagg 34182854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14753606 - 14753384
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753606 gcctgtgcttttgattaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 14753508  T
Q  101 --ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  14753507 ttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 14753409  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14753408 tatttcaatatgtgttacaagcagg 14753384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18794730 - 18794507
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794730 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 18794632  T
Q  100 att-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18794631 attcttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtc 18794532  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  18794531 tatttcaatatatgttacaagcagg 18794507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5012030 - 5012253
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5012030 gcctgtgcttttgtttaaaactctacttttcttctactttcaaagctatatacaaatcattttctttctacttggataatggcaatgcttgaaacaaaca 5012129  T
Q  101 tttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5012130 tttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggcacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtct 5012229  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  5012230 atttcaatatatgttacaagcagg 5012253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 223
Target Start/End: Original strand, 21975862 - 21976079
Alignment:
Q  7 gcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 105  Q
    ||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975862 gcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 21975961  T
Q  106 aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttca 205  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  21975962 aaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttca 21976061  T
Q  206 atatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||| || ||||||||||    
T  21976062 atatatgctacaagcagg 21976079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31120622 - 31120400
Alignment:
Q  3 ctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 101  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31120622 ctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 31120523  T
Q  102 tttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  31120522 tttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtcta 31120423  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  31120422 tttcaatatatgctacaagcagg 31120400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 36324419 - 36324210
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  36324419 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattt 36324320  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    |||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  36324319 tgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctattt 36324227  T
Q  204 caatatgtgttacaagc 220  Q
    |||||| ||||||||||    
T  36324226 caatatatgttacaagc 36324210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 36338628 - 36338419
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  36338628 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattt 36338529  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    |||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  36338528 tgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctattt 36338436  T
Q  204 caatatgtgttacaagc 220  Q
    |||||| ||||||||||    
T  36338435 caatatatgttacaagc 36338419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 24118818 - 24119037
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tt 102  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24118818 tgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 24118917  T
Q  103 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  24118918 ttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaaccggagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgctggtgtctatt 24119016  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||| || |||||||||||||    
T  24119017 tcaacatatgttacaagcagg 24119037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 233
Target Start/End: Original strand, 1906406 - 1906642
Alignment:
Q  3 ctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |  ||||||||||||||| || |||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1906406 ctgtgcttttgtttgaaactctactatctttctactttcaaagccatgtacaaaagaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaa 1906505  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgat 195  Q
    |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1906506 acatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgat 1906604  T
Q  196 gtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1906605 gtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttcccca 1906642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15380351 - 15380118
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15380351 gcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaa 15380252  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||| |||||| |  |||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  15380251 catcttgaaattaaaaaagtttttgtctgttttgaaa-gcaagcctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtc 15380153  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15380152 tttttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 15380118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 15233968 - 15234205
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15233968 gcctttgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaatttctttttatcttgataatgacaatgcttgaagcaaaca 15234067  T
Q  101 ttttgaaaattgaaaac------tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttga 194  Q
    | |||||| |||||||       |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  15234068 tcttgaaacttgaaaaagttttttttttgtctattttgaaa-gcaaacctgggcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttga 15234166  T
Q  195 tgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15234167 tgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttcccca 15234205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 6576017 - 6576229
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6576017 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattt 6576116  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    |||||||||||||  |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  6576117 tgaaaattgaaaaagttt------ctttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctattt 6576209  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  6576210 caatatatgttacaagcagg 6576229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15276745 - 15276509
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15276745 gcctgtgcttttgtttgaaactctattttctctctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaa 15276646  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaac---tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgat 195  Q
    ||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||    
T  15276645 catcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtctgttttgaaa-gtaaacttgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgat 15276547  T
Q  196 gtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15276546 gtctatttcaatatgtgttacaaacaggctcttcccca 15276509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 1674012 - 1674244
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacat--tttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |  ||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1674012 gcctgtgcttttgtttgaaactctactatctttctactttcaaagccatgtacaaaaaatattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaa 1674111  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgat 195  Q
    |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  1674112 acatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaa-gcaaacttgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttgat 1674210  T
Q  196 gtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 231  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  1674211 gtctatttca--atgtgttacaagcaggttcttccc 1674244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 223
Target Start/End: Original strand, 14671173 - 14671388
Alignment:
Q  5 gtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaa-aacattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacat 101  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||    
T  14671173 gtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaagaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacat 14671272  T
Q  102 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 201  Q
     ||||||||||||||  ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  14671273 cttgaaaattgaaaaagtttt------tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 14671366  T
Q  202 ttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  14671367 ttcaatatatgttacaagcagg 14671388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 17019205 - 17019423
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaa-gctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  17019205 gcctatgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaaagctatgtacaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaa 17019304  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||| |||| |||||||||  ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||    
T  17019305 acatcttgagaattgaaaaagtttt------tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgt 17019397  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  17019398 ctatttcaatatatgttacaagcagg 17019423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24586533 - 24586311
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586533 gcctgtgctttcgtttaagactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 24586434  T
Q  101 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24586433 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtcta 24586334  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24586333 tttcaatatgtgttacaagcagg 24586311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 5164525 - 5164745
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagc-tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5164525 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagcctatatacaaaacattttctttctattttgataataacaatgcttgaaacaaacatt 5164624  T
Q  103 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164625 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 5164724  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5164725 tcaatatgtgttacaagcagg 5164745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 5154225 - 5154444
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154225 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 5154324  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154325 tgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 5154424  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5154425 caatatgtgttacaagcagg 5154444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4139215 - 4139021
Alignment:
Q  29 ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139215 ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctat 4139116  T
Q  129 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4139115 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 4139021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 26518931 - 26519152
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518931 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 26519029  T
Q  101 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26519030 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtcta 26519129  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  26519130 tttcaatatatgttacaagcagg 26519152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Original strand, 26441418 - 26441615
Alignment:
Q  26 tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtc 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441418 tttttcttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtc 26441517  T
Q  126 tattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26441518 tattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 26441615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 26595806 - 26596031
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595806 gcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaacacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 26595905  T
Q  99 catttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26595906 catttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgt 26596005  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26596006 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 26596031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 45737439 - 45737664
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737439 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 45737537  T
Q  101 tttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 196  Q
    ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45737538 ttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgata 45737637  T
Q  197 tctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45737638 tctatttcaatatatgttacaagcagg 45737664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26509695 - 26509471
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26509695 gcctgtgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaac 26509596  T
Q  100 attttgaaaattgaaaa-ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26509595 attttgaaaattgaaaacctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 26509496  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||    
T  26509495 tatttcaatacatgtcacaagcagg 26509471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4205528 - 4205750
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205528 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 4205626  T
Q  101 ttttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4205627 ttttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtct 4205726  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  4205727 atttcaatatgtgttacaagcagg 4205750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11418778 - 11418555
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418778 gcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 11418679  T
Q  101 tttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11418678 tttttgaaaattgaaaactttctgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtct 11418579  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  11418578 atttcaatatgtgttacaagcagg 11418555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26663894 - 26663688
Alignment:
Q  18 aaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26663894 aaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 26663795  T
Q  117 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663794 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 26663695  T
Q  217 aagcagg 223  Q
    |||||||    
T  26663694 aagcagg 26663688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26679086 - 26678880
Alignment:
Q  18 aaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26679086 aaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 26678987  T
Q  117 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26678986 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 26678887  T
Q  217 aagcagg 223  Q
    |||||||    
T  26678886 aagcagg 26678880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31084618 - 31084398
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31084618 tgtgcttttgtttgaaattctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacattt 31084519  T
Q  104 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  31084518 ttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatt 31084419  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  31084418 tcaatatatgttacaagcagg 31084398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31558393 - 31558170
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31558393 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatacttgaaacaaac 31558295  T
Q  100 atttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558294 atttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 31558195  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  31558194 tatttcaatatatgttacaagcagg 31558170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26269088 - 26268861
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269088 gcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 26268989  T
Q  100 atttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgat 195  Q
    |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26268988 attttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgat 26268889  T
Q  196 gtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26268888 gtctatttcaatatatgttacaagcagg 26268861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26313846 - 26313625
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313846 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 26313748  T
Q  101 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26313747 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtcta 26313648  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  26313647 tttcaatatatgttacaagcagg 26313625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16745520 - 16745298
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745520 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 16745422  T
Q  100 atttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16745421 attttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtatattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgt 16745322  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16745321 ctatttcaatatgtgttacaagca 16745298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39207138 - 39206915
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207138 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaatattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 39207040  T
Q  100 atttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39207039 atttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtc 39206940  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  39206939 tatttcaatatatgttacaagcagg 39206915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5141334 - 5141110
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141334 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 5141236  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5141235 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgt 5141136  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  5141135 ctatttcaatatatgttacaagcagg 5141110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 45393360 - 45393580
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45393360 tgtgcttttgtttaaaactctacttttcttctactttcaaagctatacacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacattt 45393459  T
Q  104 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  45393460 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatggtgatgtccatt 45393559  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  45393560 tcagtatatgttacaagcagg 45393580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 2160708 - 2160943
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160708 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 2160807  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2160808 catcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgt 2160907  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160908 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 2160943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 223
Target Start/End: Original strand, 3451460 - 3451680
Alignment:
Q  5 gtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 104  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451460 gtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 3451558  T
Q  105 ---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 201  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  3451559 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatggaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctat 3451658  T
Q  202 ttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    | |||||| |||||||||||||    
T  3451659 tccaatatatgttacaagcagg 3451680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 11447029 - 11447249
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447029 tgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 11447127  T
Q  104 tg--aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 201  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  11447128 ttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaagtgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctat 11447227  T
Q  202 ttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||| || ||||||||||    
T  11447228 ttcaatatatgctacaagcagg 11447249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16444003 - 16443769
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16444003 gcctttgcttttgtttaaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaa 16443904  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16443903 catcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcatatgttgatgt 16443805  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16443804 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 16443769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 2779393 - 2779607
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2779393 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattt 2779492  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    |||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779493 tgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 2779587  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2779588 caatatgtgttacaagcagg 2779607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 31130046 - 31130260
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  31130046 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattt 31130145  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    |||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31130146 tgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 31130240  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  31130241 caatatatgttacaagcagg 31130260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 16047453 - 16047682
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16047453 gcctttgcttttgtttgaaactctactttctttctactgtcaaagctatgtacaaaa-attttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 16047551  T
Q  101 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16047552 tcctgaaaattgaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaagcctgagcaacaggatacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtcta 16047650  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16047651 tttcaatatgtgttacaagcaggttcttcccc 16047682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 10847721 - 10847956
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaa 97  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10847721 gcctgtgcttttgtctgaaactctattttctctctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaa 10847820  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaa---ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttga 194  Q
    |||| ||||||||||||||    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||    
T  10847821 acatcttgaaaattgaaaaaagttttttgtctgttttg-aaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcga 10847919  T
Q  195 tgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10847920 tgtctatttca--atgtgttacaagcaggctcttcccca 10847956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10910919 - 10910702
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  10910919 gcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaa 10910820  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
     ||| ||||||||||||||  ||||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  10910819 gcatcttgaaaattgaaaaagtttt-------ttgaaaagcaaacctgagcaacatggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtatgttggtgt 10910728  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  10910727 ctatttcaatatatgttacaagcagg 10910702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16512433 - 16512216
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  16512433 gcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaa 16512334  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||| |||| ||||| |||  ||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||    
T  16512333 acatcttgataattggaaaagtttt--------tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgt 16512242  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||| || |||||||||||||    
T  16512241 ctatttcaacatatgttacaagcagg 16512216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 3647289 - 3647512
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647289 gcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 3647388  T
Q  100 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647389 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 3647488  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| || ||||||||||    
T  3647489 atttcaatatatgctacaagcagg 3647512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 10968808 - 10969032
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968808 gcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 10968907  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968908 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 10969007  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  10969008 tatttcaatatatgttacaaacagg 10969032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 28155869 - 28156094
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155869 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 28155967  T
Q  101 tttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 196  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155968 ttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 28156067  T
Q  197 tctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28156068 tctatttcaatatatgttacaagcagg 28156094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41787420 - 41787199
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41787420 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattt 41787322  T
Q  104 t---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787321 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 41787222  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  41787221 tttcaatatatgttacaagcagg 41787199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 28591229 - 28591448
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591229 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 28591328  T
Q  104 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28591329 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtctattt 28591428  T
Q  204 caatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  28591429 caatatatgttacaagcagg 28591448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 51644363 - 51644588
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644363 gcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 51644462  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  51644463 cattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgt 51644562  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  51644563 ctatttcaatatatgttacaagcagg 51644588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 10951234 - 10951458
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951234 gcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 10951333  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10951334 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtc 10951433  T
Q  199 tatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  10951434 tatttcaatatatgttacaagcagg 10951458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20334527 - 20334295
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334527 tgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 20334428  T
Q  101 ttttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20334427 tcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtct 20334329  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334328 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 20334295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16202148 - 16201911
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-----aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaa 93  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||| || |||     ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16202148 gcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagccatgtacaaaaaaaaacattttctttctatttttgataatgacaaatgcttgaa 16202049  T
Q  94 acaaacattttgaaaattgaaaa---ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 190  Q
    |||||||| ||||||||||||||    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16202048 acaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttcgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatg 16201950  T
Q  191 ttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttc 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16201949 ttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttc 16201911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 20466920 - 20467161
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20466920 gcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttccactttcaaagctatgtacaaaaaccattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaa 20467019  T
Q  99 cattttgaaaattg--------aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 190  Q
    ||| || ||||||         |||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  20467020 catcttcaaaattagaaaaaaaaaaagttcctgtctattttgaaa-gcaaacctgagcagcaaggtacattcaaacgaaacatgcgtgagcgagtgtatg 20467118  T
Q  191 ttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20467119 ttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 20467161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21891818 - 21891652
Alignment:
Q  54 aaaacattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 151  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||   ||| |    |||||||||||||||||||||||    
T  21891818 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaaagttttt----tttgaaaagcaaacctgagcaac 21891723  T
Q  152 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21891722 agggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtgtgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 21891652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4714 - 4483
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4714 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatc 4615  T
Q  103 ttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 201  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4614 ttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctat 4515  T
Q  202 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4514 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 4483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 12177 - 12399
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 99  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12177 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatataaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 12275  T
Q  100 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12276 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 12375  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  12376 atttcaatatatgttacaagcagg 12399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 18730 - 18951
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18730 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattt 18828  T
Q  104 t---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 200  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18829 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 18928  T
Q  201 tttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  18929 tttcaatatatgttacaagcagg 18951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9038 - 8819
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9038 tgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacattt 8940  T
Q  104 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8939 ttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 8840  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  8839 tcaatatatgttacaagcagg 8819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 10055 - 10277
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10055 gcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca 10153  T
Q  101 tttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10154 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtct 10253  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  10254 atttcaatatatgttacaagcagg 10277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 33439 - 33658
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaaa 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  33439 gcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaa 33538  T
Q  99 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||    
T  33539 catcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgtaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgt 33632  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  33633 ctatttcaatatatgttacaagcagg 33658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3263 - 3069
Alignment:
Q  29 ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3263 ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctat 3164  T
Q  129 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3163 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 3069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Original strand, 17978 - 18172
Alignment:
Q  29 ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17978 ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctat 18077  T
Q  129 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18078 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 18172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 14094 - 14314
Alignment:
Q  4 tgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 103  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14094 tgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 14193  T
Q  104 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 202  Q
    | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14194 ttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatt 14293  T
Q  203 tcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  14294 tcaatatatgttacaagcagg 14314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 1799 - 2021
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1799 gcctgtgcttttgtttgaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 1897  T
Q  101 tttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1898 tttttgaaaattgaaaactttttgtttactttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacgatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtct 1997  T
Q  200 atttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  1998 atttcaatatatgttacaagcagg 2021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 229
Target Start/End: Original strand, 12252 - 12427
Alignment:
Q  54 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 152  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12252 aaaacatttgctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaaca 12350  T
Q  153 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttc 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12351 gggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttc 12427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 12188 - 12236
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctat 49  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  12188 gcctgtgcttttgtttgaaactctactatctttctactttcaaagctat 12236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 15710 - 15940
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgata-atgacaatgcttgaaacaaa 98  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||| ||||||||    
T  15710 gcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttaaacgatgacaatgctcgaaacaaa 15808  T
Q  99 catttt------gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 191  Q
    ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809 cattttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 15908  T
Q  192 tgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15909 tgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 15940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 25256 - 25497
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaa 97  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25256 gcctgcgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacgaaaaaacattatctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaa 25355  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaac-------tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 190  Q
    |||| ||||||||||||||        ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  25356 acatcttgaaaattgaaaaaaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatg 25454  T
Q  191 ttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25455 tcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 25497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 231
Target Start/End: Original strand, 1 - 159
Alignment:
Q  73 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaac 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaac 99  T
Q  172 atgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 231  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  100 atgcatgagcaagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccc 159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 6208 - 6427
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaaca 96  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| ||| | |||||  ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  6208 gcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgttcaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaaca 6307  T
Q  97 aacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 196  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  6308 aacatcttgaaaattgaaaaagtttt-------ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtg 6400  T
Q  197 tctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6401 tctatttcaatatatgttacaagcagg 6427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25014 - 24796
Alignment:
Q  1 gcctgtgcttttgcttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaa 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  25014 gcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaa 24915  T
Q  98 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 197  Q
    |||| |||||||||||||| |||||      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||    
T  24914 acatcttgaaaattgaaaatttttt------tttgaaaagaaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgt 24822  T
Q  198 ctatttcaatatgtgttacaagcagg 223  Q
    || ||||||||| |||||||||||||    
T  24821 ctgtttcaatatatgttacaagcagg 24796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40606 - 40519
Alignment:
Q  138 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaa-catgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatat-gtgttacaagcagg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  40606 caaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaataatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacataatgttacaagcagg 40519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University