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Alignment Overview

Query: NF10291_low_24 (Length: 226)

Name: NF10291_low_24
Description: NF10291
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10291_low_24
NF10291_low_24
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (1-226)||(22081062-22081287)
chr8 (29-226)||(44562932-44563132)
chr8 (29-226)||(9354453-9354653)
chr8 (29-226)||(19659223-19659423)
chr8 (1-195)||(19286265-19286459)
chr8 (1-153)||(31490013-31490165)
chr8 (1-153)||(19674238-19674390)
chr8 (1-153)||(28362218-28362370)
chr8 (1-156)||(19687898-19688053)
chr8 (71-156)||(16277424-16277509)
chr8 (71-156)||(27609165-27609250)
chr8 (68-156)||(18710453-18710541)
chr8 (1-153)||(19208623-19208775)
chr8 (2-153)||(33258524-33258675)
chr8 (71-156)||(2137519-2137604)
chr8 (71-108)||(19518451-19518488)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (1-226)||(15391563-15391789)
chr4 (1-226)||(14235750-14235981)
chr4 (1-226)||(15285153-15285381)
chr4 (1-226)||(15227688-15227916)
chr4 (1-226)||(1900075-1900303)
chr4 (1-153)||(5005685-5005837)
chr4 (1-153)||(30753557-30753709)
chr4 (1-156)||(21969516-21969671)
chr4 (1-156)||(27163618-27163773)
chr4 (1-153)||(33674114-33674266)
chr4 (1-153)||(39850438-39850590)
chr4 (1-195)||(54833205-54833399)
chr4 (29-226)||(24460830-24461030)
chr4 (1-156)||(24592612-24592767)
chr4 (71-156)||(17013885-17013970)
chr4 (1-108)||(14098356-14098463)
chr4 (1-108)||(31126867-31126974)
chr4 (71-156)||(14664903-14664988)
chr4 (68-156)||(14763605-14763693)
chr4 (8-108)||(18800971-18801071)
chr4 (68-156)||(24112547-24112635)
chr4 (68-156)||(34189258-34189346)
chr4 (1-153)||(40105942-40106094)
chr4 (71-153)||(6569738-6569820)
chr4 (68-108)||(19373143-19373183)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-226)||(21367-21592)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (9-173)||(27392797-27392961)
chr2 (1-226)||(19456635-19456863)
chr2 (29-226)||(31891542-31891742)
chr2 (1-226)||(21703378-21703606)
chr2 (29-225)||(27118515-27118714)
chr2 (1-156)||(32049594-32049749)
chr2 (29-226)||(34156838-34157038)
chr2 (29-226)||(34303517-34303717)
chr2 (1-153)||(11635482-11635634)
chr2 (1-153)||(11641671-11641823)
chr2 (29-226)||(3784481-3784681)
chr2 (29-226)||(16163426-16163626)
chr2 (1-153)||(261058-261210)
chr2 (1-153)||(12586597-12586749)
chr2 (1-153)||(21677475-21677627)
chr2 (1-156)||(34279245-34279400)
chr2 (1-153)||(13936837-13936989)
chr2 (1-108)||(12716943-12717050)
chr2 (1-156)||(27434734-27434889)
chr2 (1-153)||(27803488-27803640)
chr2 (1-153)||(37925289-37925441)
chr2 (1-153)||(40233295-40233447)
chr2 (1-108)||(16829676-16829783)
chr2 (1-108)||(16891698-16891805)
chr2 (1-156)||(28882010-28882165)
chr2 (71-156)||(12655408-12655493)
chr2 (71-156)||(20837784-20837869)
chr2 (71-156)||(23128856-23128941)
chr2 (194-226)||(27392964-27392996)
chr2 (1-153)||(27777003-27777155)
chr2 (1-153)||(27816770-27816922)
chr2 (1-153)||(31876077-31876229)
chr2 (1-153)||(34861476-34861628)
chr2 (1-153)||(37686202-37686354)
chr2 (1-153)||(37701467-37701619)
chr2 (2-153)||(19416792-19416943)
chr2 (1-156)||(34286150-34286305)
chr2 (1-156)||(34291210-34291365)
chr2 (1-108)||(39889858-39889965)
chr2 (68-153)||(39052121-39052206)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (1-226)||(16208256-16208481)
chr1 (1-173)||(20460907-20461079)
chr1 (29-226)||(20340560-20340760)
chr1 (1-155)||(41793610-41793764)
chr1 (2-153)||(28584781-28584932)
chr1 (1-153)||(10962469-10962621)
chr1 (1-108)||(51638017-51638124)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (1-225)||(20160501-20160728)
chr6 (1-225)||(22172103-22172330)
chr6 (29-226)||(28162485-28162685)
chr6 (1-226)||(22477441-22477672)
chr6 (29-226)||(8892478-8892678)
chr6 (29-226)||(13522241-13522441)
chr6 (29-226)||(33374424-33374624)
chr6 (1-156)||(26918177-26918332)
chr6 (29-226)||(8903713-8903913)
chr6 (1-153)||(3695860-3696012)
chr6 (1-153)||(34463608-34463760)
chr6 (1-156)||(26999870-27000025)
chr6 (1-108)||(30558308-30558415)
chr6 (1-195)||(4525086-4525280)
chr6 (1-153)||(16673924-16674076)
chr6 (1-156)||(26988798-26988953)
chr6 (71-156)||(13299195-13299280)
chr6 (71-156)||(15424561-15424646)
chr6 (71-156)||(16749721-16749806)
chr6 (119-156)||(22935121-22935158)
chr6 (119-156)||(23857566-23857603)
chr6 (68-156)||(29549342-29549430)
chr6 (1-153)||(29572810-29572962)
chr6 (2-153)||(16944274-16944425)
chr6 (1-156)||(24304862-24305017)
chr6 (1-108)||(27007509-27007616)
chr6 (2-108)||(26777919-26778025)
chr6 (71-156)||(24863584-24863669)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (1-226)||(16626772-16627000)
chr3 (1-226)||(18530158-18530380)
chr3 (1-156)||(7996323-7996478)
chr3 (1-156)||(10642831-10642986)
chr3 (29-226)||(17994050-17994250)
chr3 (1-153)||(28116302-28116454)
chr3 (1-153)||(47023214-47023366)
chr3 (29-226)||(4625736-4625936)
chr3 (1-153)||(11110706-11110858)
chr3 (1-153)||(51781772-51781924)
chr3 (1-153)||(51796861-51797013)
chr3 (1-156)||(4721392-4721547)
chr3 (1-156)||(7072973-7073128)
chr3 (29-226)||(5652179-5652379)
chr3 (1-153)||(20577207-20577359)
chr3 (1-153)||(29665330-29665482)
chr3 (1-153)||(36997434-36997586)
chr3 (1-156)||(4796995-4797150)
chr3 (1-156)||(6192077-6192232)
chr3 (1-108)||(17985346-17985453)
chr3 (1-156)||(35880527-35880682)
chr3 (29-147)||(5713016-5713134)
chr3 (29-147)||(5723926-5724044)
chr3 (29-147)||(5757433-5757551)
chr3 (29-147)||(5768324-5768442)
chr3 (1-195)||(8211502-8211696)
chr3 (68-153)||(48465743-48465828)
chr3 (1-153)||(5013473-5013625)
chr3 (1-153)||(18224952-18225104)
chr3 (1-108)||(5466746-5466853)
chr3 (1-156)||(15741424-15741579)
chr3 (1-108)||(22871264-22871371)
chr3 (1-108)||(22886323-22886430)
chr3 (71-156)||(8295806-8295891)
chr3 (68-156)||(4893041-4893129)
chr3 (68-156)||(18277394-18277482)
chr3 (68-156)||(18292695-18292783)
chr3 (68-156)||(18307996-18308084)
chr3 (68-156)||(32438985-32439073)
chr3 (1-108)||(6542864-6542971)
chr3 (2-153)||(24327921-24328072)
chr3 (71-108)||(29149145-29149182)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (1-226)||(16450109-16450337)
chr7 (1-226)||(16041127-16041355)
chr7 (29-226)||(31088575-31088775)
chr7 (29-226)||(45733292-45733492)
chr7 (1-153)||(3445095-3445247)
chr7 (1-153)||(5147530-5147682)
chr7 (1-156)||(5127793-5127948)
chr7 (1-156)||(16503567-16503722)
chr7 (1-156)||(16518603-16518758)
chr7 (1-153)||(11441361-11441513)
chr7 (1-153)||(45387144-45387296)
chr7 (68-153)||(26435125-26435210)
chr7 (1-186)||(2154374-2154559)
chr7 (1-156)||(4145310-4145465)
chr7 (68-153)||(26485934-26486019)
chr7 (68-153)||(26538063-26538148)
chr7 (68-156)||(5159390-5159478)
chr7 (1-153)||(9618452-9618604)
chr7 (1-153)||(24592731-24592883)
chr7 (1-153)||(26275284-26275436)
chr7 (1-153)||(26320059-26320211)
chr7 (1-156)||(11424963-11425118)
chr7 (71-156)||(10917052-10917137)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (29-226)||(2883-3083)
[»] chr5 (41 HSPs)
chr5 (6-226)||(22888287-22888510)
chr5 (1-226)||(23892015-23892246)
chr5 (29-226)||(13184770-13184970)
chr5 (29-226)||(13440616-13440816)
chr5 (29-226)||(33877087-33877287)
chr5 (1-153)||(8665676-8665828)
chr5 (71-225)||(24969903-24970057)
chr5 (29-226)||(11325634-11325834)
chr5 (1-153)||(18500949-18501101)
chr5 (1-153)||(30168278-30168430)
chr5 (68-226)||(25198908-25199069)
chr5 (8-153)||(43078065-43078210)
chr5 (9-153)||(31431245-31431389)
chr5 (1-108)||(18375658-18375765)
chr5 (1-156)||(22999312-22999467)
chr5 (1-108)||(24681246-24681353)
chr5 (1-108)||(24723773-24723880)
chr5 (1-108)||(33516165-33516272)
chr5 (1-156)||(33777296-33777451)
chr5 (71-156)||(9548741-9548826)
chr5 (1-153)||(30151827-30151979)
chr5 (1-153)||(37754777-37754929)
chr5 (1-153)||(40473753-40473905)
chr5 (1-156)||(11549163-11549318)
chr5 (1-156)||(23718186-23718341)
chr5 (1-156)||(23752648-23752803)
chr5 (68-199)||(33292404-33292535)
chr5 (1-153)||(3789335-3789487)
chr5 (1-153)||(5637719-5637871)
chr5 (1-153)||(9317260-9317412)
chr5 (1-153)||(12131964-12132116)
chr5 (1-153)||(15759058-15759210)
chr5 (1-153)||(26480201-26480353)
chr5 (1-153)||(31826620-31826772)
chr5 (1-153)||(37771200-37771352)
chr5 (1-156)||(15658958-15659113)
chr5 (2-153)||(29967267-29967418)
chr5 (2-153)||(30029225-30029376)
chr5 (71-108)||(28649105-28649142)
chr5 (71-156)||(30934515-30934600)
chr5 (72-153)||(41674589-41674670)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-173)||(20212-20384)
scaffold0124 (71-156)||(30323-30408)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-156)||(431-586)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-108)||(15279-15386)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (71-156)||(27162-27247)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (1-153)||(37-189)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-153)||(26506-26658)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (71-156)||(47286-47371)
scaffold0089 (119-156)||(40370-40407)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (8-147)||(5796-5936)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (1-153)||(7543-7695)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (9-156)||(8040-8187)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (188-226)||(253-291)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22081287 - 22081062
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22081287 tcaatccatggctactgttgcccccatcaatgctgctcagctacctccgccgtatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 22081188  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaacagcagcagcaacaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22081187 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcagcaacagccgttggctcaacagcagcagcaacaaa 22081088  T
Q  201 ccagacctacctttcctccgatacca 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  22081087 ccagacctacctttcctccgatacca 22081062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Original strand, 44562932 - 44563132
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   |||| |    
T  44562932 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggac 44563028  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||   | ||||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  44563029 aacctcaggtacccgttaatgccgccgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgat 44563128  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  44563129 acca 44563132  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Original strand, 9354453 - 9354653
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  9354453 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 9354549  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  9354550 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 9354649  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  9354650 acca 9354653  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19659423 - 19659223
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  19659423 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 19659327  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || ||||| || |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  19659326 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacaacctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 19659227  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  19659226 acca 19659223  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 19286265 - 19286459
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||  |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19286265 tcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttat 19286364  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaacagcagcagca 195  Q
    || ||||| ||   | | ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| || || ||||  | |||||||||||||||    
T  19286365 catcagtaccctttaccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccattgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagcagcagca 19286459  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31490165 - 31490013
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31490165 tcaatcaatggctactgttgcccctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 31490066  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  31490065 catcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 31490013  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 19674238 - 19674390
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19674238 tcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttat 19674337  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || || || || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  19674338 catcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 19674390  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28362370 - 28362218
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28362370 tcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 28362271  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  28362270 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 28362218  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 19687898 - 19688053
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | |||||| |||| |  ||   ||  || || |||||||||||||| || ||||| |||    
T  19687898 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattcccagcatcctttctttccgccattctat 19687997  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    |||||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  19687998 caccagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctca 19688053  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 16277424 - 16277509
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  16277424 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 16277509  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27609250 - 27609165
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  27609250 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 27609165  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 156
Target Start/End: Original strand, 18710453 - 18710541
Alignment:
Q  68 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  18710453 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcccgtcaatgcagttgctca 18710541  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19208775 - 19208623
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19208775 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 19208676  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  19208675 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 19208623  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Original strand, 33258524 - 33258675
Alignment:
Q  2 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 101  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33258524 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 33258623  T
Q  102 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  33258624 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 33258675  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 2137604 - 2137519
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  2137604 tctcagcatcctttctttccgtcattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 2137519  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 19518488 - 19518451
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagta 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19518488 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagta 19518451  T

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Target: chr4 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15391789 - 15391563
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgtt-gcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccatttta 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15391789 tcaatccatggctactgtttgcccccatcaatgttgctcagctacctccgccgtatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccatttta 15391690  T
Q  100 tcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaacagcagcagcaacaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15391689 tcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccatcaatgccattgctcagcaaatgcagcaacagccgctggctcaacaacagcagcaacaa 15391590  T
Q  200 accagacctacctttcctccgatacca 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  15391589 accagacctacctttcctccgatacca 15391563  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14235981 - 14235750
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14235981 tcaatccatggccactgttacccctattaatgctgctcagttacctctgccgtaccagtatatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctat 14235882  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct------caacagcagcagc 194  Q
    || ||||| || | | |  ||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||      ||||||||||| |    
T  14235881 catcagtaccctctaccatcgggtcacccataggtacccgttaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgccggctcagcaacaacagcagcaac 14235782  T
Q  195 aacaaaccagacctacctttcctccgatacca 226  Q
    ||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  14235781 aacaagctagacctacctttcctctgatacca 14235750  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15285381 - 15285153
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    || |  ||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  15285381 tcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccattgtacccatatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctat 15285282  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct---caacagcagcagcaac 197  Q
    || |||||||| | | |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||| |   ||   ||||| ||||||||||    
T  15285281 catcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaggtgcccgttaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccaactcaacaacaacagcagcaac 15285182  T
Q  198 aaaccagacctacctttcctccgatacca 226  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||    
T  15285181 aagctagacctacctttcctccgatacca 15285153  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 15227688 - 15227916
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | || | |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  15227688 tcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctat 15227787  T
Q  101 caccagtatcc---gccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct---caacagcagcagc 194  Q
    || || |||||   |||||   |||||||||||||||||||||| |||||  | | ||||||||| || |||||||| |  |||   ||||| |||||||    
T  15227788 catcaatatcctttgccat---cgggtcaacctcaggtacccgttaatgctgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagc 15227884  T
Q  195 aacaaaccagacctacctttcctccgatacca 226  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15227885 aacaagctagacctacctttcctccgatacca 15227916  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 1900075 - 1900303
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | || |  ||   || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  1900075 tcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctat 1900174  T
Q  101 caccagtatcc---gccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaacag---cagcagc 194  Q
    || ||||||||   |||||   |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||| || |||||||| |  | |||||||   || || |    
T  1900175 catcagtatcctttgccat---cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacatc 1900271  T
Q  195 aacaaaccagacctacctttcctccgatacca 226  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1900272 aacaagctagacctacctttcctccgatacca 1900303  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 5005685 - 5005837
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5005685 tcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttat 5005784  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5005785 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 5005837  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 30753557 - 30753709
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30753557 tcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttat 30753656  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  30753657 catcagtaccctctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 30753709  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 21969516 - 21969671
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21969516 tcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccgttttat 21969615  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  21969616 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctca 21969671  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27163773 - 27163618
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27163773 tcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttat 27163674  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  27163673 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctca 27163618  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 33674266 - 33674114
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  33674266 tcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccattttac 33674167  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  33674166 catcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 33674114  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 39850438 - 39850590
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  39850438 tcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttac 39850537  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  39850538 catcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 39850590  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 54833205 - 54833399
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||  |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  54833205 tcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttat 54833304  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaacagcagcagca 195  Q
    || ||||| ||   | | ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| || || ||||  | |||||||||||||||    
T  54833305 catcagtaccctttaccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccattgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagcagcagca 54833399  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24461030 - 24460830
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |   |||||||   ||||    
T  24461030 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcg---ggtc 24460934  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  24460933 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 24460834  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  24460833 acca 24460830  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24592767 - 24592612
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24592767 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttat 24592668  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  24592667 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 24592612  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 17013885 - 17013970
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  17013885 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctca 17013970  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 14098356 - 14098463
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14098356 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 14098455  T
Q  101 caccagta 108  Q
    || |||||    
T  14098456 catcagta 14098463  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 31126974 - 31126867
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31126974 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 31126875  T
Q  101 caccagta 108  Q
    || |||||    
T  31126874 catcagta 31126867  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 14664903 - 14664988
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  14664903 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 14664988  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14763693 - 14763605
Alignment:
Q  68 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  14763693 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 14763605  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18801071 - 18800971
Alignment:
Q  8 atggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagt 107  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18801071 atggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagt 18800972  T
Q  108 a 108  Q
    |    
T  18800971 a 18800971  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 156
Target Start/End: Original strand, 24112547 - 24112635
Alignment:
Q  68 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  24112547 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctca 24112635  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 34189346 - 34189258
Alignment:
Q  68 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  34189346 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctca 34189258  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 40106094 - 40105942
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  40106094 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 40105995  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  40105994 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 40105942  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 153
Target Start/End: Original strand, 6569738 - 6569820
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  6569738 tctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgc 6569820  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 108
Target Start/End: Original strand, 19373143 - 19373183
Alignment:
Q  68 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagta 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  19373143 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagta 19373183  T

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Target: scaffold0109 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 21367 - 21592
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21367 tcaatccgtggctactgttgcccccatcaatgcttctcagctacctccgccgtaccagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctat 21466  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaacagcagcagcaacaaa 200  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  21467 caccagtatccaccaccgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagctgctggcttaacagcagcaacaacaaa 21566  T
Q  201 ccagacctacctttcctccgatacca 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21567 ccagacctacctttcctccgatacca 21592  T

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Target: chr2 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 173
Target Start/End: Original strand, 27392797 - 27392961
Alignment:
Q  9 tggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagta 108  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27392797 tggctactgttgcccccatcgatgctgctcagctacctccaccgtaccagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagta 27392896  T
Q  109 tccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagc 173  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  27392897 tccgccaccgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagc 27392961  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19456863 - 19456635
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | || |  ||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  19456863 tcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgcaatactttcagcatcctttctttccaccattctat 19456764  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct---caacagcagcagcaac 197  Q
    || |||||||| | | |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| | | ||||||| || |||||||| |  |||   ||||| ||||||||||    
T  19456763 catcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaggtgcccgttaatgccatcgtttagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaac 19456664  T
Q  198 aaaccagacctacctttcctccgatacca 226  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||    
T  19456663 aagctagacctacctttcctccgatacca 19456635  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31891742 - 31891542
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   |||| |    
T  31891742 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggac 31891646  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| | | ||||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  31891645 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgat 31891546  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  31891545 acca 31891542  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21703606 - 21703378
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| | || |  ||   || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  21703606 tcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcctagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctat 21703507  T
Q  101 caccagtatcc---gccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct---caacagcagcagc 194  Q
    || ||||||||   |||||   |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||| || |||||||| |  | |   ||||| ||||| |    
T  21703506 catcagtatcctttgccat---cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatc 21703410  T
Q  195 aacaaaccagacctacctttcctccgatacca 226  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  21703409 aacaagctagacctaccttccctccgatacca 21703378  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 225
Target Start/End: Original strand, 27118515 - 27118714
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | | |   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  27118515 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgcatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 27118611  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| | | ||||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  27118612 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctaccttccctccgat 27118711  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 32049594 - 32049749
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32049594 tcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttat 32049693  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  32049694 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctca 32049749  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Original strand, 34156838 - 34157038
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  34156838 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 34156934  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  34156935 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 34157034  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  34157035 acca 34157038  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34303717 - 34303517
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  34303717 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 34303621  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||| | | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  34303620 aacctcaggtacccgttaatgtcgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgat 34303521  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  34303520 acca 34303517  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 11635634 - 11635482
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11635634 tcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttat 11635535  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11635534 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 11635482  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 11641823 - 11641671
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11641823 tcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttat 11641724  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11641723 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 11641671  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Original strand, 3784481 - 3784681
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  3784481 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 3784577  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    ||| |||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  3784578 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagtagcaacaggctagacctacctttcctctgat 3784677  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  3784678 acca 3784681  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Original strand, 16163426 - 16163626
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |   |||||||   ||||    
T  16163426 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcg---ggtc 16163522  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  16163523 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 16163622  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  16163623 acca 16163626  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 261210 - 261058
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  261210 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttat 261111  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  261110 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 261058  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 12586597 - 12586749
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||||||| |||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| ||||||  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  12586597 tcaatccatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatatccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttac 12586696  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  12586697 catcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 12586749  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21677627 - 21677475
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | ||||||||||| |  || ||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21677627 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttat 21677528  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  21677527 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 21677475  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 34279245 - 34279400
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||     
T  34279245 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttac 34279344  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  34279345 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctca 34279400  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13936989 - 13936837
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||     
T  13936989 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttac 13936890  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  13936889 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 13936837  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12717050 - 12716943
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12717050 tcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttat 12716951  T
Q  101 caccagta 108  Q
    || |||||    
T  12716950 catcagta 12716943  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27434889 - 27434734
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | |||||| | || |  ||   ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27434889 tcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaccattctat 27434790  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| ||     | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  27434789 catcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctca 27434734  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 27803488 - 27803640
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| ||| |||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  27803488 tcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttac 27803587  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  27803588 catcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 27803640  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 37925289 - 37925441
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  37925289 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 37925388  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  37925389 catcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 37925441  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 40233295 - 40233447
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  40233295 tcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttac 40233394  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  40233395 catcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 40233447  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16829783 - 16829676
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16829783 tcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 16829684  T
Q  101 caccagta 108  Q
    || |||||    
T  16829683 catcagta 16829676  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 16891698 - 16891805
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16891698 tcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 16891797  T
Q  101 caccagta 108  Q
    || |||||    
T  16891798 catcagta 16891805  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 28882010 - 28882165
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  28882010 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttat 28882109  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  28882110 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 28882165  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 12655408 - 12655493
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  12655408 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 12655493  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 20837784 - 20837869
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  20837784 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 20837869  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23128941 - 23128856
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  23128941 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 23128856  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 226
Target Start/End: Original strand, 27392964 - 27392996
Alignment:
Q  194 caacaaaccagacctacctttcctccgatacca 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27392964 caacaaaccagacctacctttcctccgatacca 27392996  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 27777003 - 27777155
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| ||| |||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  27777003 tcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttac 27777102  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   | || ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  27777103 catcagtaccccctgccaccaggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 27777155  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 27816770 - 27816922
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| ||| |||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  27816770 tcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttac 27816869  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   | || ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  27816870 catcagtaccccctgccaccaggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 27816922  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 31876077 - 31876229
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31876077 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 31876176  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  31876177 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 31876229  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 34861476 - 34861628
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  34861476 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 34861575  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  34861576 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 34861628  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 37686354 - 37686202
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  37686354 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 37686255  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  37686254 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 37686202  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 37701619 - 37701467
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  37701619 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 37701520  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  37701519 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 37701467  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19416943 - 19416792
Alignment:
Q  2 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 101  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19416943 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 19416844  T
Q  102 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  19416843 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 19416792  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 34286150 - 34286305
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || || |||||||||||||| || ||||||||     
T  34286150 tcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattcccagcatcctttctttccgccattttac 34286249  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||    
T  34286250 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctccagtacccgtcaatgcagttgctca 34286305  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 34291210 - 34291365
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || || |||||||||||||| || ||||||||     
T  34291210 tcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattcccagcatcctttctttccgccattttac 34291309  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||    
T  34291310 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctccagtacccgtcaatgcagttgctca 34291365  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 39889858 - 39889965
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39889858 tcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 39889957  T
Q  101 caccagta 108  Q
    || |||||    
T  39889958 catcagta 39889965  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 39052206 - 39052121
Alignment:
Q  68 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |   | |||||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  39052206 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaacgcaattgc 39052121  T

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Target: chr1 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16208481 - 16208256
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16208481 tcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgccgtatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctat 16208382  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaacagcagcagcaacaaa 200  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||||||| || |||||||| |  | |||||| || || ||||||     
T  16208381 caccagtatccaccaccatcgggtcagcctcaggtacccattaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacatcaacaag 16208282  T
Q  201 ccagacctacctttcctccgatacca 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  16208281 ctagacctacctttcctccgatacca 16208256  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 20460907 - 20461079
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || | |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  20460907 tcaatccatggctactattgcccctattaatgctgcccagttacctccgccgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctat 20461006  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagc 173  Q
    || || ||||| | | |  |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  20461007 catcaatatcctctaccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagc 20461079  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20340760 - 20340560
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | ||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  20340760 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 20340664  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct---caacagcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| || |||||||| |  |||   ||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||    
T  20340663 aacctcaggtacccgtcaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaacagcctccagctcaacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcctccgat 20340564  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  20340563 acca 20340560  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 41793764 - 41793610
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  41793764 tcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatcctttcttcccgccattttat 41793665  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctc 155  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  41793664 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctc 41793610  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Original strand, 28584781 - 28584932
Alignment:
Q  2 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 101  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| | ||| ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28584781 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccgtatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 28584880  T
Q  102 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  28584881 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 28584932  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 10962469 - 10962621
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10962469 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 10962568  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  10962569 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 10962621  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 51638017 - 51638124
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  51638017 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 51638116  T
Q  101 caccagta 108  Q
    || |||||    
T  51638117 catcagta 51638124  T

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Target: chr6 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 20160501 - 20160728
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||| ||||| | ||     || |||||||| ||||||||||  |||||||||||     
T  20160501 tcaatccatggctactgttgcccctgttaatgctactcaattacctccaccatacctgtttgcacattactctcaacatcctttctatccaccattttac 20160600  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct---caacagcagcagcaac 197  Q
    || |||||||| | | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||   ||||| || |||||||    
T  20160601 catcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaaaacagcaacagccaccagctcaacaacaacaacagcaac 20160700  T
Q  198 aaaccagacctacctttcctccgatacc 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20160701 aaactagacctacctttcctccgatacc 20160728  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22172330 - 22172103
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||| ||||| | ||     || |||||||| ||||||||||  |||||||||||     
T  22172330 tcaatccatggctactgttgcccctgttaatgctactcaattacctccaccatacctgtttgcacattactctcaacatcctttctatccaccattttac 22172231  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct---caacagcagcagcaac 197  Q
    || |||||||| | | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||   ||||| || |||||||    
T  22172230 catcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaaaacagcaacagccaccagctcaacaacaacaacagcaac 22172131  T
Q  198 aaaccagacctacctttcctccgatacc 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22172130 aaactagacctacctttcctccgatacc 22172103  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Original strand, 28162485 - 28162685
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | || | |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   |||| |    
T  28162485 aatgctgctcagctacctccatcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggac 28162581  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| | | ||||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  28162582 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgat 28162681  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  28162682 acca 28162685  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22477672 - 22477441
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| | | || | |||   ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  22477672 tcaatccatggctactgttgccccaattaatgctgcccaattacctctgtcgtacccgtatgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattctat 22477573  T
Q  101 caccagtatcc---gccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca------gcagc 191  Q
    ||  |||||||   |||||   |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||| | | || ||||||       || |    
T  22477572 cattagtatcctttgccat---cgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattgctcaacaaatgcaacaacagtcaccggttcaacaacaacgacaac 22477476  T
Q  192 agcaacaaaccagacctacctttcctccgatacca 226  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  22477475 agcaacaagctagacctacctttcctctgatacca 22477441  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8892678 - 8892478
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |   |||||||   ||||    
T  8892678 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtattctttgccatcg---ggtc 8892582  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| | | ||||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  8892581 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 8892482  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  8892481 acca 8892478  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13522441 - 13522241
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  13522441 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 13522345  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  13522344 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 13522245  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  13522244 acca 13522241  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33374624 - 33374424
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  33374624 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 33374528  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  33374527 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 33374428  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  33374427 acca 33374424  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 26918177 - 26918332
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  26918177 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttat 26918276  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26918277 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctca 26918332  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8903913 - 8903713
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| |||||| |   |||||||   ||||    
T  8903913 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatctcttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcg---ggtc 8903817  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| | | ||||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  8903816 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 8903717  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  8903716 acca 8903713  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 3695860 - 3696012
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3695860 tcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttat 3695959  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  3695960 catcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 3696012  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 34463760 - 34463608
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| ||| |||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  34463760 tcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttac 34463661  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  34463660 catcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 34463608  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 26999870 - 27000025
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  26999870 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttat 26999969  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  26999970 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctca 27000025  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 30558415 - 30558308
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  30558415 tcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 30558316  T
Q  101 caccagta 108  Q
    || |||||    
T  30558315 catcagta 30558308  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 4525086 - 4525280
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4525086 tcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 4525185  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaacagcagcagca 195  Q
    || ||||||||     | || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||  |||| || || ||||  | |||||||||||||||    
T  4525186 catcagtatcctttgccaccaggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagcagcagca 4525280  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 16673924 - 16674076
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| ||||||  || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  16673924 tcaatcaatagctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatatccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttac 16674023  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  16674024 catcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 16674076  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 26988798 - 26988953
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  26988798 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttat 26988897  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  26988898 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 26988953  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13299280 - 13299195
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  13299280 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 13299195  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15424646 - 15424561
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  15424646 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 15424561  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 16749721 - 16749806
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  16749721 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 16749806  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22935158 - 22935121
Alignment:
Q  119 ccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22935158 ccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgcaattgctca 22935121  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23857603 - 23857566
Alignment:
Q  119 ccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23857603 ccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgcaattgctca 23857566  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 156
Target Start/End: Original strand, 29549342 - 29549430
Alignment:
Q  68 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  29549342 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 29549430  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 29572810 - 29572962
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29572810 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 29572909  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  29572910 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 29572962  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16944425 - 16944274
Alignment:
Q  2 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 101  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16944425 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 16944326  T
Q  102 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  16944325 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 16944274  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24305017 - 24304862
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||||||||||||||| || || || |||||||| ||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  24305017 tcaatccatggctactgtcgctcctatcaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttat 24304918  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  24304917 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 24304862  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 27007509 - 27007616
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27007509 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacctatatatgccgtattctcagcatccattcttcccaccgttttat 27007608  T
Q  101 caccagta 108  Q
    || |||||    
T  27007609 catcagta 27007616  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 26778025 - 26777919
Alignment:
Q  2 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 101  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||| | || ||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26778025 caatcaatggctactgttgcacctatcaatacagcccaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatc 26777926  T
Q  102 accagta 108  Q
    | |||||    
T  26777925 atcagta 26777919  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 24863584 - 24863669
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | | | ||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  24863584 tctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctaccaccgagtcaaccccaagtacccgttaatgcaattgctca 24863669  T

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Target: chr3 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16627000 - 16626772
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | || | |||    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  16627000 tcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtatgcacaatactctcagcatcccttctttccaccgttctat 16626901  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct---caacagcagcagcaac 197  Q
    || |||||||| | | |  |||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||| |  |||   ||||| ||||||||||    
T  16626900 catcagtatcctctaccatcgggtcaacctccggtacccgttaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaac 16626801  T
Q  198 aaaccagacctacctttcctccgatacca 226  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||    
T  16626800 aagctagacctacctttcctccgatacca 16626772  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 18530158 - 18530380
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||  | || | |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  18530158 tcaatccatggctactgttacccctattaatgctgcccagttacctccatcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctat 18530257  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaacagcagcagcaacaaa 200  Q
    || |||||||| | | |  ||||||||||||| || ||||| |||||| | | ||||||||| || |||||||| |  ||||||   ||||||||||||     
T  18530258 catcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaagtgcccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctcaa---cagcagcaacaag 18530354  T
Q  201 ccagacctacctttcctccgatacca 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  18530355 ctagacctacctttcctccgatacca 18530380  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 7996323 - 7996478
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7996323 tcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttat 7996422  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  7996423 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctca 7996478  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 10642831 - 10642986
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10642831 tcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttat 10642930  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  10642931 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctca 10642986  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17994250 - 17994050
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  17994250 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 17994154  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  17994153 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 17994054  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  17994053 acca 17994050  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28116454 - 28116302
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28116454 tcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttat 28116355  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28116354 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 28116302  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 47023214 - 47023366
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47023214 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttat 47023313  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  47023314 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaggtgcccgtcaatgcaattgc 47023366  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Original strand, 4625736 - 4625936
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  4625736 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 4625832  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||| | | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  4625833 aacctcaggtacccgttaatgtcgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 4625932  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  4625933 acca 4625936  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 11110858 - 11110706
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11110858 tcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttat 11110759  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  11110758 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 11110706  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 51781772 - 51781924
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  51781772 tcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttac 51781871  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  51781872 catcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 51781924  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 51796861 - 51797013
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  51796861 tcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttac 51796960  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  51796961 catcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 51797013  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 4721392 - 4721547
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||  |||  || |||||||||| |||||| || |||||||||    
T  4721392 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcttttctttccgccattttat 4721491  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4721492 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctca 4721547  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 7072973 - 7073128
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||     
T  7072973 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttac 7073072  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  7073073 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctca 7073128  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Original strand, 5652179 - 5652379
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    || ||||   ||||    
T  5652179 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcgtttgcaatcg---ggtc 5652275  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  5652276 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 5652375  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  5652376 acca 5652379  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20577359 - 20577207
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20577359 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttac 20577260  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  20577259 catcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 20577207  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 29665482 - 29665330
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29665482 tcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttat 29665383  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  29665382 catcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 29665330  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 36997586 - 36997434
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36997586 tcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttat 36997487  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   | || || ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36997486 catcagtaccctctgccacccggccaacctcaggtgcccgtcaatgcaattgc 36997434  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4797150 - 4796995
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4797150 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttat 4797051  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  4797050 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctca 4796995  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 6192077 - 6192232
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||  |||  || |||||||||||||||||  | |||||||||    
T  6192077 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttcttttcgccattttat 6192176  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    ||  |||| || |   | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6192177 cattagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctca 6192232  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 17985453 - 17985346
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17985453 tcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 17985354  T
Q  101 caccagta 108  Q
    || |||||    
T  17985353 catcagta 17985346  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 35880527 - 35880682
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  35880527 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttat 35880626  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  35880627 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 35880682  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Original strand, 5713016 - 5713134
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaac 128  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |   | ||||||||||    
T  5713016 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaac 5713115  T
Q  129 ctcaggtacccgtcaatgc 147  Q
    |||| || |||||||||||    
T  5713116 ctcaagtgcccgtcaatgc 5713134  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Original strand, 5723926 - 5724044
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaac 128  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |   | ||||||||||    
T  5723926 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaac 5724025  T
Q  129 ctcaggtacccgtcaatgc 147  Q
    |||| || |||||||||||    
T  5724026 ctcaagtgcccgtcaatgc 5724044  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5757551 - 5757433
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaac 128  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |   | ||||||||||    
T  5757551 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaac 5757452  T
Q  129 ctcaggtacccgtcaatgc 147  Q
    |||| || |||||||||||    
T  5757451 ctcaagtgcccgtcaatgc 5757433  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5768442 - 5768324
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaac 128  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |   | ||||||||||    
T  5768442 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaac 5768343  T
Q  129 ctcaggtacccgtcaatgc 147  Q
    |||| || |||||||||||    
T  5768342 ctcaagtgcccgtcaatgc 5768324  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 8211502 - 8211696
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||   ||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8211502 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttat 8211601  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaacagcagcagca 195  Q
    || ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||  |||| || || ||||  | |||||||||||||||    
T  8211602 catcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagcagcagca 8211696  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 153
Target Start/End: Original strand, 48465743 - 48465828
Alignment:
Q  68 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || ||  | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  48465743 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccccgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 48465828  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 5013473 - 5013625
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5013473 tcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 5013572  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  5013573 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 5013625  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 18224952 - 18225104
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18224952 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 18225051  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  18225052 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 18225104  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 5466746 - 5466853
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5466746 tcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccattttat 5466845  T
Q  101 caccagta 108  Q
    || |||||    
T  5466846 catcagta 5466853  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15741579 - 15741424
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  15741579 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttat 15741480  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  15741479 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 15741424  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 22871371 - 22871264
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||| | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22871371 tcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcagatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 22871272  T
Q  101 caccagta 108  Q
    || |||||    
T  22871271 catcagta 22871264  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 22886430 - 22886323
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||| | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22886430 tcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcagatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 22886331  T
Q  101 caccagta 108  Q
    || |||||    
T  22886330 catcagta 22886323  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 8295806 - 8295891
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |  || |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  8295806 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgtcaccgggtcaacctcaagtacctgttaatgcaatcgctca 8295891  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 156
Target Start/End: Original strand, 4893041 - 4893129
Alignment:
Q  68 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  4893041 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctca 4893129  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18277482 - 18277394
Alignment:
Q  68 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  18277482 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 18277394  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18292783 - 18292695
Alignment:
Q  68 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  18292783 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 18292695  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18308084 - 18307996
Alignment:
Q  68 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  18308084 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 18307996  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 156
Target Start/End: Original strand, 32438985 - 32439073
Alignment:
Q  68 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  32438985 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctca 32439073  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 6542971 - 6542864
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  6542971 tcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 6542872  T
Q  101 caccagta 108  Q
    || |||||    
T  6542871 catcagta 6542864  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Original strand, 24327921 - 24328072
Alignment:
Q  2 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 101  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24327921 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 24328020  T
Q  102 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  24328021 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 24328072  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 29149182 - 29149145
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  29149182 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagta 29149145  T

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Target: chr7 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16450337 - 16450109
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | || | ||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16450337 tcaatccatagctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtacgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattttat 16450238  T
Q  101 caccagtatcc---gccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaacag---cagcagc 194  Q
    || ||||||||   |||||   |||||||||||||||||||| | |||||| | | ||||||| | || |||||||| |  |||||||||   |||||||    
T  16450237 catcagtatcctttgccat---cgggtcaacctcaggtacccattaatgccgtcgttcagcaagtgcaacaacagccaccagctcaacagcaacagcagc 16450141  T
Q  195 aacaaaccagacctacctttcctccgatacca 226  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16450140 aacaagctagacctacctttcctccgatacca 16450109  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 16041127 - 16041355
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | || |  ||   || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  16041127 tcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctat 16041226  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct---caacagcagcagcaac 197  Q
    || ||||||||    ||  |||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||| || |||||||| |  | |   ||||| ||||| ||||    
T  16041227 catcagtatcctttgtcatcgggtcaacctcaggtacccgttaattccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaac 16041326  T
Q  198 aaaccagacctacctttcctccgatacca 226  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  16041327 aagctagacctaccttccctccgatacca 16041355  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31088775 - 31088575
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  31088775 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 31088679  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  31088678 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 31088579  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  31088578 acca 31088575  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Original strand, 45733292 - 45733492
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  45733292 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 45733388  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  45733389 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 45733488  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  45733489 acca 45733492  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 3445095 - 3445247
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  3445095 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttac 3445194  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  3445195 catcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 3445247  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 5147682 - 5147530
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||||||||||||  |||| || || ||||| |||||  | |||||| ||||||  || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5147682 tcaatccatggctaccattgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatatccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttat 5147583  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5147582 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 5147530  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 5127793 - 5127948
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5127793 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttat 5127892  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || |||||||| |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  5127893 catcagtatcctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctca 5127948  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16503722 - 16503567
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | |||||| |||| |  ||   ||  |||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  16503722 tcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctat 16503623  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||||||     | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16503622 catcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattgctca 16503567  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16518758 - 16518603
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | |||||| |||| |  ||   ||  |||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  16518758 tcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctat 16518659  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||||||     | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16518658 catcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattgctca 16518603  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 11441361 - 11441513
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11441361 tcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttat 11441460  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  11441461 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 11441513  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 45387144 - 45387296
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45387144 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttat 45387243  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  45387244 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 45387296  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 153
Target Start/End: Original strand, 26435125 - 26435210
Alignment:
Q  68 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26435125 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 26435210  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 2154374 - 2154559
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  2154374 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttat 2154473  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca 186  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| || ||| | ||||||  ||||| ||||||    
T  2154474 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtatccgttaatgcaattgctcaacagataaaacaacagttgctggttcaaca 2154559  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4145465 - 4145310
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4145465 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 4145366  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  4145365 catcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 4145310  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26486019 - 26485934
Alignment:
Q  68 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  26486019 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 26485934  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26538148 - 26538063
Alignment:
Q  68 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  26538148 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 26538063  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 156
Target Start/End: Original strand, 5159390 - 5159478
Alignment:
Q  68 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  5159390 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctca 5159478  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 9618452 - 9618604
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9618452 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 9618551  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  9618552 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 9618604  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24592883 - 24592731
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24592883 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 24592784  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  24592783 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 24592731  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26275436 - 26275284
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26275436 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 26275337  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  26275336 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 26275284  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26320211 - 26320059
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26320211 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 26320112  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  26320111 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 26320059  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11425118 - 11424963
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||  || ||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||     
T  11425118 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgtagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttac 11425019  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  11425018 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 11424963  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10917137 - 10917052
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |   | |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  10917137 tctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtatcctctgccaccgggtcaacctcaagtacctgttaatgcaatcgctca 10917052  T

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Target: scaffold0260 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3083 - 2883
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | ||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  3083 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 2987  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct---caacagcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| || |||||||| |  |||   ||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||    
T  2986 aacctcaggtacccgtcaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaacagcctccagctcaacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcctccgat 2887  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  2886 acca 2883  T

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Target: chr5 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 41)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 226
Target Start/End: Original strand, 22888287 - 22888510
Alignment:
Q  6 ccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcacca 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | || |  ||   || ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  22888287 ccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatca 22888386  T
Q  106 gtatcc---gccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct---caacagcagcagcaacaa 199  Q
    ||||||   |||||   ||||||||||||||||| |||| |||||| | | ||||||||| || |||||||| |  | |   ||||| ||||| ||||||    
T  22888387 gtatcctttgccat---cgggtcaacctcaggtaaccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaa 22888483  T
Q  200 accagacctacctttcctccgatacca 226  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||    
T  22888484 gctagacctaccttccctccgatacca 22888510  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 23892015 - 23892246
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | |||||| | || |  ||   ||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  23892015 tcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaacattctat 23892114  T
Q  101 caccagtatcc---gccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct------caacagcagc 191  Q
    || ||||||||   |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| | || |      ||||| || |    
T  23892115 catcagtatcctttgccat---cgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccggttcaacaacaacaacaac 23892211  T
Q  192 agcaacaaaccagacctacctttcctccgatacca 226  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23892212 atcaacaagctagacctacctttcctccgatacca 23892246  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13184970 - 13184770
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  13184970 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 13184874  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  13184873 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 13184774  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  13184773 acca 13184770  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13440816 - 13440616
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  13440816 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 13440720  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  13440719 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 13440620  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  13440619 acca 13440616  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Original strand, 33877087 - 33877287
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  33877087 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 33877183  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  33877184 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 33877283  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  33877284 acca 33877287  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8665828 - 8665676
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | ||||||||||| |  || ||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  8665828 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttat 8665729  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |  || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  8665728 catcagtaccctctgtcaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 8665676  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 225
Target Start/End: Original strand, 24969903 - 24970057
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaac 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||     | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||  | ||||    
T  24969903 tctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 24970002  T
Q  171 agccgctggctcaacagcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 225  Q
    ||| || || |||||| || || |||||| | |||||||| || |||||||||||    
T  24970003 agctgccggttcaacaacaacatcaacaagctagacctactttccctccgatacc 24970057  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Original strand, 11325634 - 11325834
Alignment:
Q  29 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||    ||| |    
T  11325634 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---tgggac 11325730  T
Q  126 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| | | ||||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  11325731 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 11325830  T
Q  223 acca 226  Q
    ||||    
T  11325831 acca 11325834  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18501101 - 18500949
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18501101 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttat 18501002  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  18501001 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 18500949  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 30168278 - 30168430
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  30168278 tcaatccatggctactattgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 30168377  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  30168378 catcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 30168430  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 226
Target Start/End: Original strand, 25198908 - 25199069
Alignment:
Q  68 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatac 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   |||||||||||||||||| ||| || ||| | | ||||||||| |    
T  25198908 tactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtcaacctcaggtactcgttaacgccgtcgttcagcaaatgc 25199004  T
Q  165 agcaacagccgctggct---caacagcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgatacca 226  Q
    | |||||||| |  | |   ||||| ||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  25199005 aacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttttctccgatacca 25199069  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 43078065 - 43078210
Alignment:
Q  8 atggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagt 107  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| | || |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  43078065 atggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagt 43078164  T
Q  108 atccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    | || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  43078165 accctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 43078210  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Original strand, 31431245 - 31431389
Alignment:
Q  9 tggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagta 108  Q
    ||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  31431245 tggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagta 31431344  T
Q  109 tccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
     || |   | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31431345 ccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 31431389  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18375765 - 18375658
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18375765 tcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 18375666  T
Q  101 caccagta 108  Q
    || |||||    
T  18375665 catcagta 18375658  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22999467 - 22999312
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22999467 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttat 22999368  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  22999367 catcagtaccctctgccgccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 22999312  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 24681246 - 24681353
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24681246 tcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttat 24681345  T
Q  101 caccagta 108  Q
    || |||||    
T  24681346 catcagta 24681353  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 24723773 - 24723880
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24723773 tcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttat 24723872  T
Q  101 caccagta 108  Q
    || |||||    
T  24723873 catcagta 24723880  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 33516165 - 33516272
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  33516165 tcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 33516264  T
Q  101 caccagta 108  Q
    || |||||    
T  33516265 catcagta 33516272  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 33777296 - 33777451
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  33777296 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttat 33777395  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  33777396 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 33777451  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9548826 - 9548741
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9548826 tctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctca 9548741  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 30151827 - 30151979
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  30151827 tcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 30151926  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  30151927 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 30151979  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 37754777 - 37754929
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| ||||||  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  37754777 tcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatatccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 37754876  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  37754877 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 37754929  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 40473905 - 40473753
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||| |||| |   ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  40473905 tcaatcaatggctactgttgcccctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccacacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttac 40473806  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| || |   ||||||| || ||||| || |||||||| || |||||    
T  40473805 catcagtaccccctgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaacgcaattgc 40473753  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 11549163 - 11549318
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||  |||  || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11549163 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattcacagcatcctttctttccaccattttat 11549262  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  11549263 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 11549318  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23718341 - 23718186
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23718341 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttat 23718242  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  23718241 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 23718186  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23752803 - 23752648
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23752803 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttat 23752704  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  23752703 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 23752648  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 199
Target Start/End: Original strand, 33292404 - 33292535
Alignment:
Q  68 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagc 167  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||  | || |    
T  33292404 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 33292503  T
Q  168 aacagccgctggctcaacagcagcagcaacaa 199  Q
    | || ||||  | |||||||||||||||||||    
T  33292504 atcaaccgccagttcaacagcagcagcaacaa 33292535  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 3789335 - 3789487
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3789335 tcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttat 3789434  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     | ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  3789435 catcagtaccctttgccaccgggccagcctcaggtgcccgtcaatgcaattgc 3789487  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 5637719 - 5637871
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5637719 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 5637818  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  5637819 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 5637871  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 9317260 - 9317412
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9317260 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 9317359  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  9317360 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 9317412  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 12131964 - 12132116
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12131964 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 12132063  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  12132064 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 12132116  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15759210 - 15759058
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15759210 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 15759111  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  15759110 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 15759058  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 26480201 - 26480353
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26480201 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 26480300  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  26480301 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 26480353  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31826772 - 31826620
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31826772 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 31826673  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  31826672 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 31826620  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 37771352 - 37771200
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| | ||||  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  37771352 tcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtatccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 37771253  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  37771252 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 37771200  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15659113 - 15658958
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| ||||||  ||  |||  || ||||||||||||||||| || || |||||     
T  15659113 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatatccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccgttttac 15659014  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  15659013 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctca 15658958  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 29967418 - 29967267
Alignment:
Q  2 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 101  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29967418 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 29967319  T
Q  102 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  29967318 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 29967267  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Original strand, 30029225 - 30029376
Alignment:
Q  2 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 101  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30029225 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 30029324  T
Q  102 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  30029325 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 30029376  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 108
Target Start/End: Original strand, 28649105 - 28649142
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagta 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28649105 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagta 28649142  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 30934515 - 30934600
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  30934515 tctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 30934600  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Original strand, 41674589 - 41674670
Alignment:
Q  72 ctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |   | ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  41674589 ctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtccacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 41674670  T

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Target: scaffold0124 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 20212 - 20384
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | || |  ||   || ||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||    
T  20212 tcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccatcattctat 20311  T
Q  101 caccagtatcc---gccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagc 173  Q
    || ||||||||   |||||   |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||| || |||||||    
T  20312 catcagtatcctttgccat---cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagc 20384  T

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Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 30323 - 30408
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  30323 tctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 30408  T

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Target: scaffold0029 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 586 - 431
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  586 tcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttat 487  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  486 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctca 431  T

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Target: scaffold0237 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 15386 - 15279
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15386 tcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 15287  T
Q  101 caccagta 108  Q
    || |||||    
T  15286 catcagta 15279  T

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Target: scaffold0143 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 27162 - 27247
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || | | | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  27162 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctaccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 27247  T

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Target: scaffold0496 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 189 - 37
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| ||||||  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  189 tcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatatccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 90  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  89 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 37  T

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Target: scaffold0144 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26658 - 26506
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26658 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 26559  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| |||    ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  26558 catcagtacccgttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 26506  T

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Target: scaffold0089 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 47371 - 47286
Alignment:
Q  71 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  47371 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 47286  T

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Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40407 - 40370
Alignment:
Q  119 ccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40407 ccgggtcaacctcaggtacccgtaaatgcaattgctca 40370  T

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Target: scaffold0415 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Original strand, 5796 - 5936
Alignment:
Q  8 atggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccacc-attttatcaccag 106  Q
    |||||||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  5796 atggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgtttttatcatcag 5895  T
Q  107 tatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgc 147  Q
    || || |   | |||||||||||||| || |||||||||||    
T  5896 taccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 5936  T

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Target: scaffold0350 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 7695 - 7543
Alignment:
Q  1 tcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7695 tcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttat 7596  T
Q  101 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 153  Q
    || ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  7595 catcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 7543  T

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Target: scaffold0336 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Original strand, 8040 - 8187
Alignment:
Q  9 tggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagta 108  Q
    ||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  8040 tggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagta 8139  T
Q  109 tccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 156  Q
    |||     | || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  8140 tcctttgccaccaggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 8187  T

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Target: scaffold0558 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 291 - 253
Alignment:
Q  188 cagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgatacca 226  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  291 cagcagcaacaagctagacctacctttcctccgatacca 253  T

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