View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10315_low_4 (Length: 239)

Name: NF10315_low_4
Description: NF10315
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10315_low_4
NF10315_low_4
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (1-223)||(25219113-25219336)
chr8 (1-223)||(30306625-30306848)
chr8 (1-215)||(7781205-7781420)
chr8 (1-215)||(7821295-7821510)
chr8 (1-223)||(33861928-33862152)
chr8 (1-223)||(31979075-31979298)
chr8 (1-223)||(14713740-14713962)
chr8 (1-215)||(14767015-14767234)
chr8 (47-223)||(13425065-13425242)
chr8 (107-223)||(25209632-25209749)
chr8 (1-118)||(21114292-21114409)
chr8 (1-55)||(25209581-25209635)
[»] chr4 (10 HSPs)
chr4 (1-223)||(35855355-35855578)
chr4 (1-223)||(1860125-1860348)
chr4 (5-223)||(49709621-49709840)
chr4 (1-223)||(49787377-49787599)
chr4 (1-223)||(31920920-31921144)
chr4 (1-208)||(787344-787552)
chr4 (1-204)||(37531953-37532155)
chr4 (1-188)||(38517579-38517767)
chr4 (1-118)||(55559586-55559703)
chr4 (187-223)||(55559701-55559737)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (1-223)||(24196348-24196571)
chr6 (1-223)||(12516836-12517059)
chr6 (1-223)||(31512059-31512282)
chr6 (1-223)||(29641895-29642118)
chr6 (4-223)||(15333090-15333309)
chr6 (1-223)||(2202728-2202951)
chr6 (1-215)||(10187000-10187215)
chr6 (1-214)||(4220253-4220470)
chr6 (4-214)||(18343582-18343793)
chr6 (1-223)||(12519055-12519278)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (1-223)||(43448924-43449147)
chr5 (1-223)||(8429123-8429346)
chr5 (1-223)||(37260763-37260986)
chr5 (1-223)||(37372384-37372607)
chr5 (1-223)||(39882631-39882854)
chr5 (1-223)||(3689426-3689649)
chr5 (1-223)||(3877138-3877361)
chr5 (1-223)||(27880533-27880755)
chr5 (4-223)||(4051259-4051479)
chr5 (1-223)||(6088658-6088881)
chr5 (1-223)||(15033129-15033352)
chr5 (1-223)||(26832069-26832292)
chr5 (3-223)||(2261538-2261759)
chr5 (2-223)||(25543342-25543562)
chr5 (1-223)||(14193360-14193584)
chr5 (1-223)||(43524378-43524603)
chr5 (65-223)||(18116307-18116466)
chr5 (1-110)||(24630409-24630518)
chr5 (1-118)||(30347092-30347209)
chr5 (1-118)||(10024617-10024734)
chr5 (4-62)||(30313813-30313871)
chr5 (159-223)||(30313722-30313786)
chr5 (141-204)||(10692495-10692558)
chr5 (187-223)||(10024583-10024619)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (1-223)||(32258-32481)
chr3 (1-223)||(10038088-10038311)
chr3 (1-223)||(11361706-11361929)
chr3 (1-223)||(11368094-11368317)
chr3 (1-223)||(41763910-41764134)
chr3 (1-223)||(10110048-10110271)
chr3 (1-215)||(50409628-50409843)
chr3 (1-212)||(46912531-46912742)
chr3 (1-223)||(13529488-13529711)
chr3 (1-223)||(10969329-10969551)
chr3 (1-223)||(9999855-10000078)
chr3 (1-223)||(10231272-10231495)
chr3 (1-223)||(10234870-10235093)
chr3 (1-214)||(37801971-37802188)
chr3 (1-215)||(15329111-15329330)
chr3 (127-223)||(41221630-41221726)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (1-223)||(16041473-16041696)
chr1 (1-223)||(37390693-37390916)
chr1 (1-223)||(6311541-6311763)
chr1 (1-223)||(48775883-48776106)
chr1 (4-223)||(25074401-25074621)
chr1 (1-215)||(2328626-2328840)
chr1 (1-214)||(48239025-48239240)
chr1 (43-223)||(16748259-16748440)
chr1 (3-223)||(36206664-36206884)
chr1 (1-223)||(18148136-18148359)
chr1 (1-204)||(28961543-28961745)
chr1 (1-118)||(52500223-52500340)
[»] chr7 (6 HSPs)
chr7 (1-223)||(7036169-7036391)
chr7 (1-223)||(9001693-9001916)
chr7 (1-223)||(12786528-12786750)
chr7 (1-223)||(21070610-21070833)
chr7 (1-223)||(5829103-5829326)
chr7 (1-118)||(42231638-42231755)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (1-215)||(21394826-21395041)
chr2 (1-223)||(28666722-28666944)
chr2 (1-223)||(37825556-37825778)
chr2 (1-223)||(41920722-41920945)
chr2 (1-223)||(17684377-17684600)
chr2 (1-223)||(27508822-27509045)
chr2 (1-214)||(27191946-27192160)
chr2 (1-214)||(27841760-27841974)
chr2 (1-223)||(24245299-24245523)
chr2 (1-223)||(35609132-35609356)
chr2 (1-214)||(2867604-2867821)
chr2 (50-223)||(40488287-40488461)
chr2 (1-118)||(24269618-24269735)
chr2 (136-214)||(3642841-3642919)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (1-223)||(49486-49708)
[»] scaffold0550 (2 HSPs)
scaffold0550 (1-223)||(1120-1343)
scaffold0550 (95-223)||(4168-4297)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (1-223)||(164978-165201)
scaffold0003 (1-223)||(182259-182482)
scaffold0003 (168-223)||(173093-173148)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (1-223)||(31382-31605)
scaffold0073 (1-223)||(18904-19128)
[»] scaffold1139 (1 HSPs)
scaffold1139 (1-223)||(445-668)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-199)||(132423-132622)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (1-199)||(310240-310439)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (1-223)||(18454-18677)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-223)||(125677-125900)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-223)||(97372-97595)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-223)||(186007-186228)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (1-223)||(5807-6030)
[»] scaffold0888 (1 HSPs)
scaffold0888 (1-223)||(450-673)
[»] scaffold1424 (1 HSPs)
scaffold1424 (1-222)||(1133-1355)
[»] scaffold0196 (1 HSPs)
scaffold0196 (38-223)||(23790-23977)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (1-126)||(16230-16356)
scaffold0025 (127-222)||(13937-14033)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (1-118)||(29182-29299)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (144-223)||(34413-34492)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 25219113 - 25219336
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25219113 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctc 25219212  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25219213 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 25219312  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  25219313 agtatgatcattggttatgtttta 25219336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30306848 - 30306625
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30306848 atgacaataaataaaagccagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctatgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctc 30306749  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30306748 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcattctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 30306649  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  30306648 agtatgatcattggttatgtttta 30306625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7781420 - 7781205
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7781420 atgacaataaataaaagctagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagtctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctc 7781321  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7781320 gagtaacttcaagaaaaggtcttaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttataaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 7781221  T
Q  200 agtatgatcattggtt 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  7781220 agtatgatcattggtt 7781205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7821510 - 7821295
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7821510 atgacaataaataaaagctagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagtctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctc 7821411  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7821410 gagtaacttcaagaaaaggtctaaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttataaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 7821311  T
Q  200 agtatgatcattggtt 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  7821310 agtatgatcattggtt 7821295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 33861928 - 33862152
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33861928 atgacaatacataaaagtgagggtcaatctttatctcaagtgggggtttatcttcttaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctc 33862027  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttc-aaa 198  Q
     ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  33862028 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagttggtcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaaatttttcaaaa 33862127  T
Q  199 aagtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  33862128 aagtatgatcattggttatgtttta 33862152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 31979075 - 31979298
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  31979075 atgacaataaataaaaaccagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcttaagtctgtgttcacgcatgaacaactttatttcggtgtctctc 31979174  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31979175 gagtaacttgaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgttagtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 31979274  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  31979275 agtacgatcattggttatgtttta 31979298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14713962 - 14713740
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14713962 atgacaataaataaaattcagggtcaatctttatctcgagtggga-tttatcttcctaagcccgtgttcacgtatgaacaactttatgtcgctgtctctc 14713864  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14713863 gagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttgaatggagataataatgtttgcaaggagaccacgaatgttgtttatcgtgaagtttttcaaaa 14713764  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  14713763 agtatgatcattggttatgtttta 14713740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14767234 - 14767015
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcat----ggacaactttatgtcgttgtc 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||| || |||||||||    |||||||| ||||||| ||||    
T  14767234 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatcttgagtaggagttgatcttcctaagcccgtattcacgcatatatggacaactctatgtcgctgtc 14767135  T
Q  97 tctcaagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttc 195  Q
    |||| ||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14767134 tctcgagttacttctataaaaggtttgaagctgctcattttgaatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc 14767035  T
Q  196 aaaaagtatgatcattggtt 215  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  14767034 aaaaagtatgttcattggtt 14767015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13425242 - 13425065
Alignment:
Q  47 tttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctcaagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaaga 145  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  13425242 tttatcttcctaagtccgtgttcacgcatggacaactctatgtcactgtctctcgagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaaga 13425143  T
Q  146 taataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaaagtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13425142 taataatgtttgcaaggagatcacaaatgttatgtatcgtgaagtttttcaaaaagtatgatcattggttatgtttta 13425065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 25209632 - 25209749
Alignment:
Q  107 cttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaaagtatg 205  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25209632 cttcaagaaaaggtcttaagctgcttatcctggataaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaaagtatg 25209731  T
Q  206 atcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||| |||||||    
T  25209732 atcattggttatgtttta 25209749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 21114292 - 21114409
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  21114292 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagtctgtgttcacgcatgagcaactctatgtcgctgtctctc 21114391  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaag 118  Q
     ||| ||||| |||||||    
T  21114392 gagttacttctagaaaag 21114409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 25209581 - 25209635
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttc 55  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25209581 atgataataaataaaagccagggtcagtctttatctcgagtgggggtttatcttc 25209635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 10)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35855578 - 35855355
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35855578 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctc 35855479  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35855478 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 35855379  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  35855378 agtatgatcattggttatgtttta 35855355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1860348 - 1860125
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1860348 atgacaataaataaaagctagggtcaatctttatctcaagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctc 1860249  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1860248 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagctactcatcgtggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 1860149  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  1860148 agtatgatcattggttatgtttta 1860125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 49709840 - 49709621
Alignment:
Q  5 caataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctcaagt 104  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  49709840 caataaataaaagtcaaggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctcgagt 49709741  T
Q  105 aacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaaagta 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49709740 aacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaaagta 49709641  T
Q  204 tgatcattggttgtgtttta 223  Q
    ||||| |||||| |||||||    
T  49709640 tgatccttggttatgtttta 49709621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 49787377 - 49787599
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49787377 atgacaataaataaaagccagg-tcaatctttatctcgggtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatagacaactttatgtcgttgtctctc 49787475  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49787476 gagtaacttcatgaaaaggtccgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 49787575  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  49787576 agtatgatcattggttatgtttta 49787599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31921144 - 31920920
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31921144 atgacaatacataaaagtgagggtcaatctttatctcaagtgggggtttatcttcttaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctc 31921045  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttc-aaa 198  Q
     ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  31921044 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagttggtcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaaatttttcaaaa 31920945  T
Q  199 aagtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  31920944 aagtatgatcattggttatgtttta 31920920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 787552 - 787344
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  787552 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcaagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacacatgaacaactctatgttgttgtctctc 787453  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| || |  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  787452 gagttacatatagaaaaggtgtgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtatatcctgaagtttttcaaaa 787353  T
Q  200 agtatgatc 208  Q
    |||||||||    
T  787352 agtatgatc 787344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 37531953 - 37532155
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||    
T  37531953 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtggaagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatgg--aactctatgtcgctgtctctc 37532050  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||| |||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37532051 gagttacttctagaaaaagtttgaagctgctcatcttgaatgaagataataatgtttgcaaggagaccacgaatgttgtgtatggtgaagtttttcaaaa 37532150  T
Q  200 agtat 204  Q
    |||||    
T  37532151 agtat 37532155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 38517767 - 38517579
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| || ||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38517767 atgacaataaataaaagccaaggtcaatctttatcttgaatggagttttagcttcataagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctc 38517668  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaa 188  Q
      |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  38517667 gggtaacttcaagaaaaggtctaaagctgctcatcctggatgacgataataatgtttgtaaggagaccacagatgttgtgtatcgtgaa 38517579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 55559586 - 55559703
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  55559586 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttattttcctaagcctgtgttcacgcatgggcaactctatgtcgctgtctctc 55559685  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaag 118  Q
     ||| ||||| |||||||    
T  55559686 gagttacttctagaaaag 55559703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 223
Target Start/End: Original strand, 55559701 - 55559737
Alignment:
Q  187 aagtttttcaaaaagtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  55559701 aagttttttaaaaagtatgatcattggttatgtttta 55559737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24196571 - 24196348
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24196571 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctc 24196472  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24196471 aagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctagatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 24196372  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  24196371 agtatgatcattggttatgtttta 24196348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12517059 - 12516836
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12517059 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctatgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctc 12516960  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12516959 aagtaacttcaagaaaaggtctgaagctactcatcctggatgaagatgataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 12516860  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    ||||||||||||| || |||||||    
T  12516859 agtatgatcattgcttatgtttta 12516836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 31512059 - 31512282
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31512059 atgacaataaataaaagccagggtcaatctttatttcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcttggacaactttatgtcgctgtctctc 31512158  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31512159 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 31512258  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  31512259 agtatgatcattggttatgtttta 31512282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 29641895 - 29642118
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29641895 atgacaataaataaaagccagggtcaatctttatttcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcttggacaactttatgtcgctgtctctc 29641994  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29641995 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccataaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 29642094  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  29642095 agtatgatcattggttatgtttta 29642118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15333309 - 15333090
Alignment:
Q  4 acaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctcaag 103  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15333309 acaataaataaaagccagggtcaatctttatctcgagtgggg-tttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctcgag 15333211  T
Q  104 taacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaaagt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  15333210 taacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcctgaagtttttcaaaaagt 15333111  T
Q  203 atgatcattggttgtgtttta 223  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  15333110 atgatcattggttatgtttta 15333090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 2202728 - 2202951
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2202728 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcaaatgggagtttatctttctaagcccgtgttcacgcatggaaaactttatgttgttgtctctc 2202827  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2202828 gagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttgaaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaaatttttcaaaa 2202927  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  2202928 agtatgatcattggttatgtttta 2202951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10187215 - 10187000
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10187215 atgacgataaataaaagtcaaggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcattgtctctc 10187116  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     | | ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10187115 gacttacttctagaaaaggtttgaagttgctcatcttggatgaatataataatgtttgcaaggagaccacatatgttgtgtatcgtgaactttttcaaaa 10187016  T
Q  200 agtatgatcattggtt 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  10187015 agtatgatcattggtt 10187000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 4220253 - 4220470
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4220253 atgacaataaaaaaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagctcgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctc 4220352  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagata---ataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttca 196  Q
     ||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4220353 gagttacttctataaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataatgataatgtttgcaagtagaccataaatgttgtgtatcgtgaagtttttca 4220452  T
Q  197 aaaagtatgatcattggt 214  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4220453 aaaagtatgatcattggt 4220470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18343793 - 18343582
Alignment:
Q  4 acaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctcaag 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||    
T  18343793 acaataaaaaaaagttagggtcaatctttatctcaagtgggagtttatcttcctaagcccatcttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctcttgag 18343694  T
Q  104 taacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaaagt 202  Q
    | ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18343693 ttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttgcaaggaaaccacaactgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaaagt 18343594  T
Q  203 atgatcattggt 214  Q
    ||||||||||||    
T  18343593 atgatcattggt 18343582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12519278 - 12519055
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  12519278 atgacaataaataaaagtcaaggtcaatctttatctcgagtgggagtttatattcctaagcacgtgttcacgcatggacaactctatgttgctgtctctc 12519179  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| || |  ||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| || || ||||||||||    
T  12519178 gagttacatatagaaaaggtttgaagctgctcatattggatgaagataataatgtttgcaaggagatcacaaatgttgtctatcgtaaattttttcaaaa 12519079  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    ||||||||| | |||| |||||||    
T  12519078 agtatgatcttaggttatgtttta 12519055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 43449147 - 43448924
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  43449147 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctc 43449048  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43449047 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 43448948  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  43448947 agtatgatcattggttatgtttta 43448924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 8429123 - 8429346
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  8429123 atgacaataaataaaagacagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcatgtgttcacgcatagacaactttatgtcgatgtctctc 8429222  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8429223 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 8429322  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  8429323 agtatgatcattggttatgtttta 8429346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37260986 - 37260763
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37260986 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgcgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctc 37260887  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  37260886 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcatggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaattttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 37260787  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  37260786 agtatgatcattggttatgtttta 37260763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37372607 - 37372384
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37372607 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtattcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctc 37372508  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37372507 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagatgataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 37372408  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    ||||||||||||| || |||||||    
T  37372407 agtatgatcattgattatgtttta 37372384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39882854 - 39882631
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  39882854 atgacaataaataaaagccagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcataagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctatctctc 39882755  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39882754 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagttgctcatcctggatgaaaataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 39882655  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  39882654 agtatgatcattggttatgtttta 39882631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3689649 - 3689426
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3689649 atgacaataaataaaagtcaaggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcttgtgttcacgcatgggcaactttatgtcgctgtctctc 3689550  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  3689549 gagtaacttcaagaaaaggtttgaagctgctcgtcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatattgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 3689450  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  3689449 agtatgatcattggttatgtttta 3689426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 3877138 - 3877361
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3877138 atgacaataaataaaagtcaaggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcttgtgttcacgcatgggcaactttatgtcgctgtctctc 3877237  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  3877238 gagtaacttcaagaaaaggtttgaagctgctcgtcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatattgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 3877337  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  3877338 agtatgatcattggttatgtttta 3877361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27880755 - 27880533
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27880755 atgacaataaataaaagtcagcgtcaatctttatctcgagtggggttttatcttcctaagcctgtgtttacgcatggacaactt-atgtcgctgtctctc 27880657  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27880656 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 27880557  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    ||||||||||||| || |||||||    
T  27880556 agtatgatcattgcttatgtttta 27880533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4051479 - 4051259
Alignment:
Q  4 acaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctcaag 103  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  4051479 acaatatataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacacatggacaactttatgttgctgtctctcgag 4051380  T
Q  104 taacttcaagaaaaggtctgaa-gtgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaaagt 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  4051379 taacttcaagaaaaggtctgaaggtgctcattgtggatgaagataataatgtttgtaaggagaccagaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaagt 4051280  T
Q  203 atgatcattggttgtgtttta 223  Q
    ||||| ||| ||| |||||||    
T  4051279 atgattatttgttatgtttta 4051259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6088881 - 6088658
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6088881 atgacaataaataaaagtcagggtcaacctttatctcgagtgggagtttatattcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctc 6088782  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||    
T  6088781 gagttacttctagaaaaggtttgaagttgctcatcttggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgcatcgttaagtttttcaaaa 6088682  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||| ||| |||||||    
T  6088681 agtatgatcatttgttatgtttta 6088658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 15033129 - 15033352
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15033129 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctc 15033228  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||  |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15033229 gagttacttatagaaaatgtttgaagttgctcatcttggatgaagataataatatttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 15033328  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    ||||||||| | |||| |||||||    
T  15033329 agtatgatcttaggttatgtttta 15033352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26832292 - 26832069
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  26832292 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtggcagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatgagcaactctatgtcgttgtctctc 26832193  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctg-aagtgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||| ||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26832192 gagttacttctagaaaaggtttgaaactgctcatcttggatgaagataataatgttttcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagttttttaaaa 26832093  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  26832092 agtatgatcattggttatgtttta 26832069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Original strand, 2261538 - 2261759
Alignment:
Q  3 gacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctcaa 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  2261538 gacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcaagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgtatgaacaactttatgtcgctgtctctcga 2261637  T
Q  103 gtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaaag 201  Q
    || ||||| ||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2261638 gttacttctagaaaaggtttgaagttgctcatattggatggagataataatgtttgcaaggagaccacgaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaaag 2261737  T
Q  202 tatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  2261738 tatgatcattggttatgtttta 2261759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 25543342 - 25543562
Alignment:
Q  2 tgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctca 101  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  25543342 tgacaataaataaaag--agggtcaatctttatctcgagtgggagtttatatccctaagcccgtgttcacgcatgggcaactgtatgtcgctgtctctcg 25543439  T
Q  102 agtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaaa 200  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25543440 agttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaaaataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaaa 25543539  T
Q  201 gtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||| || |||||||    
T  25543540 gtatgatcattgattatgtttta 25543562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 14193360 - 14193584
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  14193360 atgacaataaataaaagtcagggtcaatgtttatcttgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcaagcatgaacaactctatgttgctgtctctc 14193459  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtatt-gtgaagtttttcaaa 198  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14193460 gagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataacgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtattcgtgaagtttttcaaa 14193559  T
Q  199 aagtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||| || ||| |||||||    
T  14193560 aagtatgatcgttagttatgtttta 14193584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 43524378 - 43524603
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttat--cttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctc 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43524378 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatcccgagtgggagtttatatcttcctaggcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctc 43524477  T
Q  99 tcaagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaa 197  Q
    || ||| ||||| |||| |||| || || |||||||  ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43524478 tcgagttacttctagaagaggtttgtagctgctcatattggatgaagataataatatgtgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaa 43524577  T
Q  198 aaagtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||| |||| || |||||||    
T  43524578 aaagtatgataattgattatgtttta 43524603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18116466 - 18116307
Alignment:
Q  65 tgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctcaagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaagga 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||| |||| || || |||||||  ||||||||||||||||| | || |||||    
T  18116466 tgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctcgagttacttctagaagaggtttgtagctgctcatattggatgaagataataatatgtgcaagga 18116367  T
Q  164 gactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaaagtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18116366 gaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaaagtatgatcattggttatgtttta 18116307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 24630409 - 24630518
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  24630409 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatgggcaactctatgtcgctgtctctc 24630508  T
Q  101 aagtaacttc 110  Q
     ||| |||||    
T  24630509 gagttacttc 24630518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 30347092 - 30347209
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  30347092 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaaacccgtgttcacgcatgggcaactctatgtcgctgtctctc 30347191  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaag 118  Q
     ||| ||||| |||||||    
T  30347192 gagttacttctagaaaag 30347209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 10024734 - 10024617
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  10024734 atgacaataaataaaagtcaggttcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacacatgggcaactctatgtcgctgtctctc 10024635  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaag 118  Q
     ||| ||||| |||||||    
T  10024634 gagttacttctagaaaag 10024617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 30313871 - 30313813
Alignment:
Q  4 acaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcc 62  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313871 acaataaataaaagccagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcc 30313813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30313786 - 30313722
Alignment:
Q  159 aaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaaagtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  30313786 aaggagaccacaaatgttgtatatcatgaagtttttcaaaaagtatgatcatttgttatgtttta 30313722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Original strand, 10692495 - 10692558
Alignment:
Q  141 gaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaaagtat 204  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||||||| |||| || |||||||||||||    
T  10692495 gaagataataatatttgcaaggagaccataaatattgtgtatcgtgaggtctttcaaaaagtat 10692558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10024619 - 10024583
Alignment:
Q  187 aagtttttcaaaaagtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10024619 aagttttttaaaaagtatgatcattggttatgtttta 10024583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32481 - 32258
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32481 atgacaataaataaaagccagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacacatggacaactttatgtcgctgtctctc 32382  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32381 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 32282  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  32281 agtatgatcattggttatgtttta 32258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10038311 - 10038088
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10038311 atgacaatagataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctc 10038212  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10038211 aagtaacttcaagagaaggtctaaagctgctcatcatggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 10038112  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  10038111 agtatgatcattggttatgtttta 10038088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11361929 - 11361706
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11361929 atgacaataaataaaagtcaaggtcaatctttatctcaagtgggggtttatcttcctaagcctatgttcacgcatgggcaactttatgtcgctgtctctc 11361830  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11361829 gagtaacttcaagaaaaggtttgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 11361730  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  11361729 agtatgatcattggttatgtttta 11361706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11368317 - 11368094
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11368317 atgacaataaataaaagccagagtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcttaagtctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctc 11368218  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11368217 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccaaaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 11368118  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  11368117 agtatgatcattggttatgtttta 11368094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 41763910 - 41764134
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41763910 atgacaatacataaaagtgagggtcaatctttatctcaagtgggggtttatcttcttaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctc 41764009  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttc-aaa 198  Q
     ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  41764010 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagttggtcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaaatttttcaaaa 41764109  T
Q  199 aagtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  41764110 aagtatgatcattggttatgtttta 41764134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10110271 - 10110048
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  10110271 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatgagcaactctatgtcgttgtctctc 10110172  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctg-aagtgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||| ||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10110171 gagttacttctagaaaaggtttgaaactgctcatcttggatgaagataataatgttttcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagttttttaaaa 10110072  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  10110071 agtatgatcattggttatgtttta 10110048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50409843 - 50409628
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  50409843 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagattatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgttgtcaatc 50409744  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50409743 gagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggataaatataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 50409644  T
Q  200 agtatgatcattggtt 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  50409643 agtatgatcattggtt 50409628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 46912742 - 46912531
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  46912742 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtt-atcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcattgtctctc 46912644  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46912643 gagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttacaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 46912544  T
Q  200 agtatgatcattg 212  Q
    |||||||||||||    
T  46912543 agtatgatcattg 46912531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13529711 - 13529488
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13529711 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgactgggagtttatcttcctaagcccgtgttcatgcatggacaactctatgtcgctgtctctc 13529612  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  13529611 aagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttgcaacgagaccacaaatattgtgtatcgtgaagtatttcaaaa 13529512  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  13529511 aatatgatcattggttatgtttta 13529488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 10969329 - 10969551
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | ||||||    
T  10969329 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggataactctgtgttgctttctctc 10969428  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  10969429 gagttacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcttgaatgaagatgataatgtttgcaaggagaccac-aatgttgtgtatcgtgaagtttttcgaaa 10969527  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  10969528 agtatgatcattggttatgtttta 10969551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10000078 - 9999855
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  10000078 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgtgagtttatcttcctaaacccgtgttcacgcatgagcaactctatgtcgttgtctctc 9999979  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctg-aagtgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
    |||| ||||| ||||||||| || || | |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9999978 aagttacttctagaaaaggtttgaaactactcatcttggatgaaaataataatgttttcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagttttttaaaa 9999879  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  9999878 agtatgatcattggttatgtttta 9999855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10231495 - 10231272
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  10231495 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtggcagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatgagcaactctatgtcgttgtctctc 10231396  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctg-aagtgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||| ||||||||| || || | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  10231395 gagttacttctagaaaaggtttgaaactactcatcttggatgaagataataatgttttcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagttttttagaa 10231296  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  10231295 agtatgatcattggttatgtttta 10231272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10235093 - 10234870
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||     
T  10235093 atgacaataaataaaagtcaaggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatgagcaactctatgtcgttgtctctt 10234994  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctg-aagtgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||| ||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10234993 gagttacttctagaaaaggtttgaaactgctcatcttggatgaagataataatgttttcaaggagaccataaatgttgtgtatcgtgaagttttttaaaa 10234894  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  10234893 agtatgatcattggttatgtttta 10234870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 37801971 - 37802188
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  37801971 atgacaataaaaaaaagttagggtaaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctc 37802070  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaag---ataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttca 196  Q
     ||| ||| | | ||||||| ||||| |||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  37802071 gagttactcctataaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataataatgtttgcaagtagaccataaatgttgtgtatcgtgaagtttttca 37802170  T
Q  197 aaaagtatgatcattggt 214  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37802171 aaaagtatgatcattggt 37802188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 15329111 - 15329330
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcat----ggacaactttatgtcgttgtc 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||| || |||||||||    |||||||| ||||||| ||||    
T  15329111 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatcttgagtaggagttgatcttcctaagcccgtattcacgcatatatggacaactctatgtcgctgtc 15329210  T
Q  97 tctcaagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttc 195  Q
    |||| ||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15329211 tctcgagttacttctataaaaggtttgaagctgctcattttgaatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc 15329310  T
Q  196 aaaaagtatgatcattggtt 215  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  15329311 aaaaagtatgttcattggtt 15329330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41221726 - 41221630
Alignment:
Q  127 tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaaagtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41221726 tgctcatcttcgatgaagataataatgtttgcaaggagaccacatatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaaagtatgatcattggttatgtttta 41221630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16041696 - 16041473
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041696 atgacaataaataaaagccatggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcataagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 16041597  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16041596 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagttgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 16041497  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  16041496 agtatgatcattggttatgtttta 16041473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 37390693 - 37390916
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  37390693 atgacaataaataaaagccagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtagctgtctctc 37390792  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  37390793 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaagaagaccacaaatgttttgtatcgtgaagtttttcaaaa 37390892  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  37390893 agtatgatcattggttatgtttta 37390916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 6311541 - 6311763
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6311541 atgaaaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtt-atcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactttatgccgctgtctctc 6311639  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6311640 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaatataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 6311739  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  6311740 agtatgatcattggttatgtttta 6311763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 48775883 - 48776106
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||    
T  48775883 atgacaataaataaaagcgagagtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacacatggacaactttatgtcactatctctc 48775982  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  48775983 gagtaacttgaagaaaaggtctgaagttgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcatgaagtttttcaaaa 48776082  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    ||||||| |||||||| |||||||    
T  48776083 agtatgaacattggttatgtttta 48776106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 25074401 - 25074621
Alignment:
Q  4 acaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctcaag 103  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  25074401 acaatatataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacacatggacaactttatgttgctgtctctcgag 25074500  T
Q  104 taacttcaagaaaaggtctgaa-gtgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaaagt 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25074501 taacttcaagaaaaggtctgaaggtgctcattgtggatgaagataataatgtttgtaaggagaccagaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaagt 25074600  T
Q  203 atgatcattggttgtgtttta 223  Q
    ||||| ||| ||| |||||||    
T  25074601 atgattatttgttatgtttta 25074621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2328840 - 2328626
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2328840 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttacctcgagtggga-tttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctc 2328742  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaagt-gctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2328741 gagttacttctagaaaaggtttgaagttgctcatcttggataaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtattgtgaactttttcaaaa 2328642  T
Q  200 agtatgatcattggtt 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  2328641 agtatgatcattggtt 2328626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 48239025 - 48239240
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaa-gttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctct 99  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  48239025 atgacaataaaaaaaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgatgtatct 48239124  T
Q  100 caagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaa 198  Q
    | | | ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48239125 cgaattacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaa 48239224  T
Q  199 aagtatgatcattggt 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  48239225 aagtatgatcattggt 48239240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 43 - 223
Target Start/End: Original strand, 16748259 - 16748440
Alignment:
Q  43 ggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctcaagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16748259 ggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatg 16748358  T
Q  142 aagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaaagtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16748359 aagataataatgtttgcaaggagaccgcaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaaagtatgatccttggttatgtttta 16748440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36206884 - 36206664
Alignment:
Q  3 gacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  36206884 gacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgaga-tttatcttcctaagcccgtgatcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctcga 36206786  T
Q  103 gtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaaag 201  Q
    || ||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  36206785 gttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagatcataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagttttttaaaaag 36206686  T
Q  202 tatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  36206685 tatgatcattggttatgtttta 36206664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18148359 - 18148136
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||    
T  18148359 atgacaataaataaaagtcagtgtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcacgagcaactctatgtcgttgtctctc 18148260  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  18148259 gagttacttctataaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtcaagttttttaaaa 18148160  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  18148159 agtatgatcattggttatgtttta 18148136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28961745 - 28961543
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||    
T  28961745 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtggaagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatgg--aactctatgtcgctgtctctc 28961648  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||| |||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28961647 gagttacttctagaaaaagtttgaagctgctcatcttgaatgaagataataatgtttgcaaggagaccacgaatgttgtgtatggtgaagtttttcaaaa 28961548  T
Q  200 agtat 204  Q
    |||||    
T  28961547 agtat 28961543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 52500340 - 52500223
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  52500340 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatgggcaactctatgtcgctgtctctc 52500241  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaag 118  Q
     ||| ||||| |||||||    
T  52500240 gagttacttctagaaaag 52500223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 6)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7036391 - 7036169
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7036391 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtt-atcttcctaagcctgtgctcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctc 7036293  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7036292 aagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcatggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 7036193  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  7036192 agtatgatcattggttatgtttta 7036169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 9001693 - 9001916
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9001693 atgacaataaataaaagccagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcttgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 9001792  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9001793 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagttgcttatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagattttcaaaa 9001892  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    ||||||| |||||||| |||||||    
T  9001893 agtatgaccattggttatgtttta 9001916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 12786528 - 12786750
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12786528 atgacaataaataaaagctagg-tcaatctttatctcgggtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatagacaactttatgtcgttgtctctc 12786626  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12786627 gagtaacttcatgaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 12786726  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  12786727 agtatgatcattggttatgtttta 12786750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 21070610 - 21070833
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  21070610 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatgggcaactctatgtcgctgtctctc 21070709  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21070710 gagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgcatcgtgaagtttttcaaaa 21070809  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||| ||| |||||||    
T  21070810 agtatgatcattagttatgtttta 21070833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5829103 - 5829326
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||    
T  5829103 atgacaataaataaaagtccgggtcaatctctatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatgggcaactctatttcgctgtctctc 5829202  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctg-aagtgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
    |||| ||||| ||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| || | | ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5829203 aagttacttctagaaaaggtttgaaactgctcatcttggatgaagataataatgttttcaaggataccatatatgttgtgtatcgtgaagttttttaaaa 5829302  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  5829303 agtatgatcattggttatgtttta 5829326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 42231755 - 42231638
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  42231755 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatgggcaactctatgtcgctgtctctc 42231656  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaag 118  Q
     ||| ||||| |||||||    
T  42231655 gagttacttctagaaaag 42231638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21395041 - 21394826
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21395041 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctc 21394942  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21394941 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 21394842  T
Q  200 agtatgatcattggtt 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  21394841 agtatgatcattggtt 21394826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 28666722 - 28666944
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28666722 atgacaataaataaaagctagg-tcaatctttatctcgggtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatagacaactttatgtcgttgtctctc 28666820  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28666821 gagtaacttcatgaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 28666920  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  28666921 agtatgatcattggttatgtttta 28666944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 37825556 - 37825778
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37825556 atgacaataaataaaagctagg-tcaatctttatctcgggtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatagacaactttatgtcgttgtctctc 37825654  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37825655 gagtaacttcatgaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 37825754  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  37825755 agtatgatcattggttatgtttta 37825778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 41920722 - 41920945
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  41920722 atgacaataaataaaagccagggtcaatctttatctcgggtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatagacaactttatgtcgctgtctctc 41920821  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  41920822 gagtaacttcatgaaaaggtctgaagctactcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagttttttaaaa 41920921  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    ||||||||||| |||| |||||||    
T  41920922 agtatgatcatcggttatgtttta 41920945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 17684377 - 17684600
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  17684377 atgacgataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcattgtctctc 17684476  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17684477 gagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaatataataatgtttgcaaggagaccacatatgttgtgtgtcgtgaagtttttcaaaa 17684576  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  17684577 agtatgatcattggttatgtttta 17684600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27509045 - 27508822
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27509045 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatattcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctc 27508946  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||  ||||||||| ||||| | | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27508945 gagttacttttagaaaaggtttgaagctacccatcttggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 27508846  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  27508845 agtatgatcattggttatgtttta 27508822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27192160 - 27191946
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27192160 atgacaatgaaaaaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctc 27192061  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  27192060 gagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaatataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcagaa 27191961  T
Q  200 agtatgatcattggt 214  Q
    |||||||||||||||    
T  27191960 agtatgatcattggt 27191946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27841974 - 27841760
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27841974 atgacaatgaaaaaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctc 27841875  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  27841874 gagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaatataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcagaa 27841775  T
Q  200 agtatgatcattggt 214  Q
    |||||||||||||||    
T  27841774 agtatgatcattggt 27841760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24245523 - 24245299
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctc-gagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctct 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24245523 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttgtttccgagtgggaatttatcttcctaagcccgtgttcatgcatgggcaactctatgtcgttgtctct 24245424  T
Q  100 caagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaa 198  Q
    | ||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24245423 cgagttacttctagaaaaggtatgaagctgctcatctaggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaa 24245324  T
Q  199 aagtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  24245323 aagtatgatcattggttatgtttta 24245299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35609356 - 35609132
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  35609356 atgacaataaataaaagtcaaggtcaatgtttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgttgctgtctctc 35609257  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtatt-gtgaagtttttcaaa 198  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  35609256 gagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataacttttgcaaggagaccacaaatgttgtgtattcatgaagtttttcaaa 35609157  T
Q  199 aagtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  35609156 aagtatgatcattggttatgtttta 35609132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 2867604 - 2867821
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2867604 atgacaataaaaaaaagttcgggtcaatctttatctcaagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctc 2867703  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaag---ataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttca 196  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||    
T  2867704 gagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataataatgtttgcaagtagaccataaatgttgtgtatcctgaagtttttca 2867803  T
Q  197 aaaagtatgatcattggt 214  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2867804 aaaagtatgatcattggt 2867821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 223
Target Start/End: Original strand, 40488287 - 40488461
Alignment:
Q  50 atcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctcaagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataa 148  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  40488287 atcttcctaagcccgtgttcacgcatgggcaactctatgtcgctgtctctcgagttacttctagaaaaggtttgaagctgttcatcttggatgaagataa 40488386  T
Q  149 taatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaaagtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  40488387 taatgtttgcaaggagaccataaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaaagtatgatcattgattatgtttta 40488461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 24269618 - 24269735
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  24269618 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcatgtgttcacgcatgggcaactctatgtcgctgtctctc 24269717  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaag 118  Q
     ||| ||||| |||||||    
T  24269718 gagttacttctagaaaag 24269735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3642919 - 3642841
Alignment:
Q  136 tggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaaagtatgatcattggt 214  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3642919 tggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaaagtatgatcattggt 3642841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 49486 - 49708
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49486 atgacaataaataaaagctagg-tcaatctttatctcgggtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatagacaactttatgtcgttgtctctc 49584  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49585 gagtaacttcatgaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 49684  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  49685 agtatgatcattggttatgtttta 49708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 1120 - 1343
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  1120 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcttaagtttgtgttcacgcatggataactttatctcgctgtctctc 1219  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1220 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 1319  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  1320 agtatgatcattggttatgtttta 1343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 223
Target Start/End: Original strand, 4168 - 4297
Alignment:
Q  95 tctctcaagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttt 193  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4168 tctctcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttt 4267  T
Q  194 tcaaaaagtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4268 tcaaaaagtatgatcattggttatgtttta 4297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 165201 - 164978
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  165201 atgacaataaataaaagtcaaggtcaatctttatctcaagtgggggtttatcttcctaagcctatgttcacgcatgggcaactttatgtcgctgtctctc 165102  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  165101 gagtaacttcaagaaaaggtttgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 165002  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  165001 agtatgatcattggttatgtttta 164978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 182482 - 182259
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  182482 atgataataaataaaagtcaaggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaaacctgtgttcacgcatgggcaactttatgtcgctgtctctc 182383  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  182382 gattaacttcaagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttgtaaggaaaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 182283  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  182282 agtatgatcattggttatgtttta 182259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 173148 - 173093
Alignment:
Q  168 acaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaaagtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  173148 acaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaaagtatgatcattggttatgtttta 173093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31605 - 31382
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31605 atgacaataaataaaagccagggtcaatctttatctcgagtggcggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatgaacaactttatgtcgctgtctctc 31506  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  31505 gagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcctgaaatttttcaaaa 31406  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||| ||||||| |||||||    
T  31405 agtatgataattggttatgtttta 31382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19128 - 18904
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  19128 atgacaataaataaaaaccagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcttaagtctgtgttcacgcatgaacaactttatttcggtgtctctc 19029  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttc-aaa 198  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  19028 gagtaacttgaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgttagtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 18929  T
Q  199 aagtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  18928 aagtatgatcattggttatgtttta 18904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1139 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold1139
Description:

Target: scaffold1139; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 668 - 445
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  668 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctc 569  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  568 gagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgttcgcaaggagaccacaaatgtcgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 469  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  468 agtatgatcattggttatgtttta 445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 132423 - 132622
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  132423 atgacaataaataaaagtcaggatcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactctatgtcactgtctctc 132522  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  132523 gagtaacttcaagaaaatgtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 132622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 310240 - 310439
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  310240 atgacaataaataaaagtcaggatcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactctatgtcactgtctctc 310339  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  310340 gagtaacttcaagaaaatgtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 310439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18677 - 18454
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  18677 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcttgtgttcacgcatgggcaactctatgtcgctgtctctc 18578  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18577 gagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacatatgttgtgtatcgtgaagttttttaaaa 18478  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  18477 agtatgatcattggttatgtttta 18454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 125900 - 125677
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  125900 atgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatcttgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgttgttgtttctc 125801  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     | | ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  125800 gatttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaata 125701  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  125700 agtatgatcattggttatgtttta 125677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 97372 - 97595
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  97372 atgacaataaataaaagtcagggtcaatttttatctcgagtgggattttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctc 97471  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  97472 gagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataacgtttgcaaggagaccacgaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 97571  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  97572 agtatgatcattggttatgtttta 97595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 186228 - 186007
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  186228 atgacaataaataaaag--agggtcaatctttatctcaagtgggagtttatctacctaagcccgtgttcacgcatgggcaactctatgtcgctgtctctc 186131  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  186130 gagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaaaataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 186031  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  186030 agtatgatcattggttatgtttta 186007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5807 - 6030
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||||    
T  5807 atgacaataaataaaagttaggctcaaactttatctcgagtgagagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatgggaaactccatgtcgctgtctctc 5906  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5907 gagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacagatgttttgtattgtgaagttttttaaaa 6006  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  6007 agtatgatcattggttatgtttta 6030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0888 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0888
Description:

Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 450 - 673
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  450 atgacaataaataaaagtcagagtcaatctttatctcaagtgggagtttatcttcctaaacccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctatctctc 549  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  550 gagttactactagaaaaggtttgaagttgttcatcttggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa 649  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    || |||||| |||||| |||||||    
T  650 agaatgatcgttggttatgtttta 673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1355 - 1133
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  1355 atgacaataaataaaagtcagggtcaatttttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatgggcaactctatgtcgctgtctctc 1256  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaa 199  Q
     ||| ||||| | ||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  1255 gagttacttctataaaaggtttgaagctattcatcttggatgaagataataatgtttgcaacgagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcagaa 1156  T
Q  200 agtatgatcattggttgtgtttt 222  Q
    |||||||| |||| || ||||||    
T  1155 agtatgattattgattatgtttt 1133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0196 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0196
Description:

Target: scaffold0196; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23977 - 23790
Alignment:
Q  38 gagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctcaagtaacttcaagaaaaggtctgaag-tgctcatcct 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |    
T  23977 gagtgggagtttatcttcctaagtccatgttcacgcatggacaactctatgtcactatctctcgagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatctt 23878  T
Q  137 ggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttca-aaaagtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23877 ggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgtttta 23790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16356 - 16230
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16356 atgacaatgaataaaagtcagggtcaatatttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcatgcatggacaactctatgtcgttgtctctc 16257  T
Q  101 aagtaacttca-agaaaaggtctgaag 126  Q
     ||| | |||| ||||||||| |||||    
T  16256 gagttatttcatagaaaaggtttgaag 16230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14033 - 13937
Alignment:
Q  127 tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtg-aagtttttcaaaaagtatgatcattggttgtgtttt 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14033 tgctcatcttggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaaagtttttcaaaaagtatgatcattggttatgtttt 13937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 29182 - 29299
Alignment:
Q  1 atgacaataaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  29182 atgacaataaataaaagtcagggtcaatatttatctcgagtgtgagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatgggcaactctatgtcgctgtctctc 29281  T
Q  101 aagtaacttcaagaaaag 118  Q
     ||| ||||| |||||||    
T  29282 gagttacttctagaaaag 29299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34492 - 34413
Alignment:
Q  144 gataataatgtttgtaaggagactacaaatgttgtgtattgtgaagtttttcaaaaagtatgatcattggttgtgtttta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34492 gataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgatgtttttcaaaaagtatgatcattggttatgtttta 34413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University