View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10336_low_11 (Length: 400)

Name: NF10336_low_11
Description: NF10336
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10336_low_11
NF10336_low_11
[»] chr6 (73 HSPs)
chr6 (17-392)||(26655999-26656374)
chr6 (17-392)||(26761970-26762345)
chr6 (44-392)||(27337894-27338242)
chr6 (44-392)||(27398634-27398982)
chr6 (30-392)||(25579729-25580094)
chr6 (30-392)||(26142875-26143240)
chr6 (33-392)||(26055936-26056298)
chr6 (33-392)||(26075906-26076268)
chr6 (30-392)||(25538550-25538915)
chr6 (30-392)||(25481752-25482117)
chr6 (30-392)||(26646489-26646851)
chr6 (30-392)||(26752457-26752819)
chr6 (163-392)||(26048855-26049084)
chr6 (163-392)||(26070024-26070253)
chr6 (41-387)||(26884178-26884526)
chr6 (73-392)||(27718237-27718556)
chr6 (146-387)||(26622991-26623232)
chr6 (146-387)||(26728969-26729210)
chr6 (44-363)||(26823879-26824198)
chr6 (214-392)||(27678956-27679134)
chr6 (44-392)||(28781149-28781497)
chr6 (31-389)||(27592833-27593194)
chr6 (73-392)||(27610860-27611179)
chr6 (66-392)||(28786288-28786614)
chr6 (66-392)||(28792409-28792735)
chr6 (31-392)||(27531013-27531374)
chr6 (31-390)||(27677427-27677789)
chr6 (221-392)||(27698500-27698671)
chr6 (253-390)||(27706440-27706577)
chr6 (198-392)||(27724828-27725022)
chr6 (73-392)||(26802452-26802771)
chr6 (102-357)||(27427493-27427748)
chr6 (200-380)||(28139563-28139743)
chr6 (287-392)||(27229242-27229347)
chr6 (212-390)||(31284300-31284478)
chr6 (212-392)||(27604702-27604882)
chr6 (41-390)||(26861628-26861974)
chr6 (228-387)||(28149953-28150111)
chr6 (267-387)||(28181129-28181249)
chr6 (72-387)||(28185381-28185696)
chr6 (267-386)||(28242820-28242939)
chr6 (274-392)||(28234574-28234692)
chr6 (267-386)||(26341986-26342105)
chr6 (267-390)||(28226962-28227085)
chr6 (137-385)||(28098291-28098539)
chr6 (183-392)||(26937104-26937313)
chr6 (267-387)||(28297765-28297885)
chr6 (267-387)||(28514188-28514308)
chr6 (267-387)||(28325496-28325616)
chr6 (72-318)||(26949745-26949991)
chr6 (66-321)||(27214498-27214756)
chr6 (66-321)||(27234472-27234730)
chr6 (133-321)||(26848741-26848929)
chr6 (273-321)||(2184369-2184417)
chr6 (284-392)||(25506978-25507086)
chr6 (272-320)||(26975134-26975182)
chr6 (104-163)||(28234802-28234861)
chr6 (270-320)||(25071741-25071791)
chr6 (273-320)||(2184980-2185027)
chr6 (34-173)||(26959395-26959534)
chr6 (267-321)||(27665169-27665223)
chr6 (104-157)||(26617867-26617920)
chr6 (104-157)||(26723795-26723848)
chr6 (72-161)||(28297570-28297659)
chr6 (72-161)||(28514414-28514503)
chr6 (267-318)||(26635774-26635825)
chr6 (267-318)||(26741740-26741791)
chr6 (188-387)||(29826042-29826241)
chr6 (272-318)||(26959250-26959296)
chr6 (79-192)||(25506848-25506961)
chr6 (72-173)||(26635919-26636020)
chr6 (72-173)||(26741885-26741986)
chr6 (104-157)||(26811754-26811807)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (34-390)||(18731310-18731666)
chr4 (34-390)||(18655283-18655639)
chr4 (34-390)||(18699206-18699562)
chr4 (34-390)||(18723891-18724247)
chr4 (34-390)||(18679373-18679729)
chr4 (102-357)||(18073807-18074062)
chr4 (266-357)||(17989091-17989182)
chr4 (182-386)||(5090921-5091125)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (34-390)||(268163-268519)
chr1 (34-386)||(28127485-28127837)
chr1 (30-392)||(28164165-28164526)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (34-390)||(29273589-29273945)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (44-392)||(4500-4848)
scaffold0277 (58-392)||(13475-13809)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (73-392)||(14214-14532)
scaffold0349 (214-392)||(3420-3599)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (58-392)||(7535-7869)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (102-357)||(59615-59870)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (104-392)||(34735-35023)
scaffold0038 (267-386)||(42982-43101)
scaffold0038 (267-390)||(27460-27583)
scaffold0038 (267-387)||(116811-116931)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (267-390)||(3279700-3279823)
chr2 (58-320)||(17993527-17993789)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (267-387)||(58334-58454)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (335-392)||(37-94)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (274-386)||(16689027-16689139)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 73)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26656374 - 26655999
Alignment:
Q  17 aaatataaattacaggaaaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttcc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26656374 aaatataaattacaggaaaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttcc 26656275  T
Q  117 attgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26656274 attgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagt 26656175  T
Q  217 aggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgca 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26656174 aggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgca 26656075  T
Q  317 tagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26656074 tagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctc 26655999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26762345 - 26761970
Alignment:
Q  17 aaatataaattacaggaaaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttcc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26762345 aaatataaattacaggaaaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttcc 26762246  T
Q  117 attgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26762245 attgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagt 26762146  T
Q  217 aggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgca 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26762145 aggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgca 26762046  T
Q  317 tagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26762045 tagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctc 26761970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 44 - 392
Target Start/End: Original strand, 27337894 - 27338242
Alignment:
Q  44 ttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttcct 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  27337894 ttaagtaaagtggggtacccttgactaaaatggtggccggagaagttagcagcttgggtaagagccatcttccatttcttcaacctctccatgttttcct 27337993  T
Q  144 tgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaa 243  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27337994 tgttattttggaacttatcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccagtctgatgtcgtacgtgagtaggatccgcaccatagaaaacaggcaa 27338093  T
Q  244 aaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaa 343  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27338094 aaccgaacaaccccttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaa 27338193  T
Q  344 atcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27338194 atcctagactcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgctttcatctc 27338242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 44 - 392
Target Start/End: Original strand, 27398634 - 27398982
Alignment:
Q  44 ttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttcct 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  27398634 ttaagtaaagtggggtacccttgactaaaatggtggccggagaagttagcagcttgggtaagagccatcttccatttcttcaacctctccatgttttcct 27398733  T
Q  144 tgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaa 243  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27398734 tgttattttggaacttatcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccagtctgatgtcgtacgtgagtaggatccgcaccatagaaaacaggcaa 27398833  T
Q  244 aaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaa 343  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27398834 aaccgaacaaccccttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaa 27398933  T
Q  344 atcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27398934 atcctagactcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgctttcatctc 27398982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 30 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25580094 - 25579729
Alignment:
Q  30 aggaaaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttga---ctacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaa 126  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||   ||| |||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||   |||    
T  25580094 aggaaaaagaagttttaagtaaagtggggtacccatgaggactataatgatagccggacaagttagcagcttgggtaagagctatcttccattgacgcaa 25579995  T
Q  127 cctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccaca 226  Q
     | || |||||||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25579994 tcgctccatgtttttctcgttattttgaaacctctcttcatgcttagtaagatactcaccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccaca 25579895  T
Q  227 ccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcag 326  Q
     |||||||||| ||||| ||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25579894 tcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcag 25579795  T
Q  327 aaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25579794 aaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 25579729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 30 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26143240 - 26142875
Alignment:
Q  30 aggaaaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttga---ctacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaa 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||   ||| |||| ||||| |||||||| ||||||| | | ||||| |||||||||||   |||    
T  26143240 aggaaaaacaagttttaagtaaagtggggtacccatgaggactataatgatagccggacaagttagcagcttggataagagctatcttccattgacgcaa 26143141  T
Q  127 cctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccaca 226  Q
     | || |||||||| || ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26143140 tcgctccatgtttttctcgttattttgaaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataaatcccactctgatttcgtatgtgagtaggttccaca 26143041  T
Q  227 ccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcag 326  Q
     |||||||||| || || ||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143040 tcatagaaaacgggaaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcag 26142941  T
Q  327 aaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26142940 aaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 26142875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 33 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26056298 - 26055936
Alignment:
Q  33 aaaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttga---ctacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacct 129  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||   ||| |||| ||||| |||||||| |||||||  || |||||||||||||||||   ||| |     
T  26056298 aaaaacaagatttaagtaaagtagggtactcatgaggactataatgatagccggacaagttagcagcttgagtaagagccatcttccattgacgcaatcg 26056199  T
Q  130 ctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacacca 229  Q
    || |||||||| || |||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  26056198 ctccatgtttttctcgttattttggaacccctctttatgcttagtaagatgctcaccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatca 26056099  T
Q  230 tagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaa 329  Q
    |||||||| ||||| ||  | |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26056098 tagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaa 26055999  T
Q  330 atatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26055998 atatgggaataaaaatcccagattcttcgatggccttgacaagtgatgatgtgatttcatctc 26055936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 33 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26076268 - 26075906
Alignment:
Q  33 aaaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttga---ctacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacct 129  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||   ||| |||| ||||| |||||||| |||||||  || |||||||||||||||||   ||| |     
T  26076268 aaaaacaagatttaagtaaagtagggtactcatgaggactataatgatagccggacaagttagcagcttgagtaagagccatcttccattgacgcaatcg 26076169  T
Q  130 ctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacacca 229  Q
    || |||||||| || |||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  26076168 ctccatgtttttctcgttattttggaacccctctttatgcttagtaagatgctcaccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatca 26076069  T
Q  230 tagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaa 329  Q
    |||||||| ||||| ||  | |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26076068 tagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaa 26075969  T
Q  330 atatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26075968 atatgggaataaaaatcccagattcttcgatggccttgacaagtgatgatgtgatttcatctc 26075906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25538915 - 25538550
Alignment:
Q  30 aggaaaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttga---ctacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||| |||| ||||| |||||||| ||||||| | | ||||| |||||||||||   |||    
T  25538915 aggaaaaacaagatttaagtaaagtggggtacccatgaggactataatgatagccggacaagttagcagcttggataagagctatcttccattgacgcaa 25538816  T
Q  127 cctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccaca 226  Q
     | || |||||||| ||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  25538815 tcgctccatgtttttctcattattttgaaacctctcttcatgcttagtaaaatgctcaccataactcccactctgatgtcgtaactgagtaggttccaca 25538716  T
Q  227 ccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcag 326  Q
     |||||||||| ||||| ||  | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25538715 tcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatctggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcag 25538616  T
Q  327 aaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25538615 aaaatatgggaataaaaattctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 25538550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25482117 - 25481752
Alignment:
Q  30 aggaaaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttga---ctacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaa 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||   ||| |||| ||||| ||||| || |||||||  || |||||||||||||||||   |||    
T  25482117 aggaaaaacaagttttaagtaaagtggggtactcatgaggactataatgatagccggacaaattagcagcttgagtaagagccatcttccattgacgcaa 25482018  T
Q  127 cctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccaca 226  Q
     | || |||||||| || |||||||||||||  || |||||||||||| ||||  ||||| ||||| |  || ||| |||| |  | |||||||||||||    
T  25482017 tcgctccatgtttttctcgttattttggaacccctcttcatgcttagtcagatattcaccataactacatgtatgacgtcgaacatcagtaggatccaca 25481918  T
Q  227 ccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcag 326  Q
    ||||||||||| || || ||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25481917 ccatagaaaacgggtaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcag 25481818  T
Q  327 aaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25481817 aaaatatgggaatacaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 25481752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 30 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26646851 - 26646489
Alignment:
Q  30 aggaaaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacct 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| |     
T  26646851 aggaaaaacaaggtttaagtaaagtggggtacccaggactataatggtatccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaatcg 26646752  T
Q  130 ctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacacca 229  Q
     | | |||||| |||||||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  26646751 ttccttgtttttcttgttattttggaaactctcttcgtgcttagtgagatgttcaccataactcccactttgatgccgtatctgagtaggatccacgcca 26646652  T
Q  230 tagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaa 329  Q
    |||||||| ||||||||   || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  |||||    
T  26646651 tagaaaacgggcaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaa 26646552  T
Q  330 atatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26646551 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctc 26646489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 30 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26752819 - 26752457
Alignment:
Q  30 aggaaaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacct 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| |     
T  26752819 aggaaaaacaaggtttaagtaaagtggggtacccaggactataatggtatccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaatcg 26752720  T
Q  130 ctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacacca 229  Q
     | | |||||| |||||||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  26752719 ttccttgtttttcttgttattttggaaactctcttcgtgcttagtgagatgttcaccataactcccactttgatgccgtatctgagtaggatccacgcca 26752620  T
Q  230 tagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaa 329  Q
    |||||||| ||||||||   || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  |||||    
T  26752619 tagaaaacgggcaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaa 26752520  T
Q  330 atatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26752519 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctc 26752457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 163 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26049084 - 26048855
Alignment:
Q  163 ttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtc 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||  | |||| |||||||    
T  26049084 ttcatgcttagtaagatgctcaccataacttccactatgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcataaaaaacgggcaatactaagcaactctttgtc 26048985  T
Q  263 ttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatgg 362  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26048984 ttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatgg 26048885  T
Q  363 ccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  26048884 ccttgacaagtttgggtgtgatttcatctc 26048855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 163 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26070253 - 26070024
Alignment:
Q  163 ttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtc 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||  | |||| |||||||    
T  26070253 ttcatgcttagtaagatgctcaccataacttccactatgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcataaaaaacgggcaatactaagcaactctttgtc 26070154  T
Q  263 ttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatgg 362  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26070153 ttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatgg 26070054  T
Q  363 ccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  26070053 ccttgacaagtttgggtgtgatttcatctc 26070024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 26884526 - 26884178
Alignment:
Q  41 gatttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgtttt 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||| |||   ||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||||| |    
T  26884526 gatttaagtaaagtgggatacccaagactaaaatggtagccggacaagttagcaacttgcctcatagccattttccatcgctgcaacctctccatgttat 26884427  T
Q  141 ccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacag 239  Q
    |||| | |||||| ||| | |||||||| | ||  | ||||| |||| ||||| || || |||||||| |  | ||||||||||||||||   |||||||    
T  26884426 ccttatcattttgaaaccttttttcatggtcagcca-atgcttcaccataactacctgtatgatgtcgcacatcagtaggatccacaccaacaaaaacag 26884328  T
Q  240 gcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatga--tgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatggga 337  Q
    |||||||    | |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  26884327 gcaaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaatgacatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattgga 26884228  T
Q  338 ataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttc 387  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26884227 ataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttc 26884178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 73 - 392
Target Start/End: Original strand, 27718237 - 27718556
Alignment:
Q  73 atggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgctta 172  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | | |||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||| | ||| | |||||| ||| |||||||||||| |    
T  27718237 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgttattcttatcattttgaaacctcttttcatgctca 27718336  T
Q  173 gtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcag 271  Q
    |  | ||||| |||| ||||| ||  |||||||||| | || |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||    
T  27718337 gcca-atgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcag 27718435  T
Q  272 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaa 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |    
T  27718436 tgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgagga 27718535  T
Q  372 gtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27718536 gtgatggtgtgatttcatctc 27718556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 146 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 26623232 - 26622991
Alignment:
Q  146 ttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaa 244  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  26623232 ttattatggaacctctttgcatgcttagcaag-tgcttcgccataactcccagtttgatgccgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacgggcaaa 26623134  T
Q  245 accgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaa 344  Q
    ||   || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  26623133 acgagacgaccctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataaaaa 26623034  T
Q  345 tcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttc 387  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| |||||||    
T  26623033 tcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttc 26622991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 146 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 26729210 - 26728969
Alignment:
Q  146 ttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaa 244  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  26729210 ttattatggaacctctttgcatgcttagcaag-tgcttcgccataactcccagtttgatgccgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacgggcaaa 26729112  T
Q  245 accgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaa 344  Q
    ||   || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  26729111 acgagacgaccctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataaaaa 26729012  T
Q  345 tcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttc 387  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| |||||||    
T  26729011 tcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttc 26728969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 26824198 - 26823879
Alignment:
Q  44 ttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttcct 143  Q
    ||||||||| |  |||||||  ||||| ||||  ||||||||||||  |||||||   |||||||| ||||||||||   |||  ||| |||||||||||    
T  26824198 ttaagtaaattttggtacccaagactaaaatgaaagccagacaagtcagcagcttgtttcagagccttcttccattgaagcaatttctccatgttttcct 26824099  T
Q  144 tgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaa 243  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||   | | ||||| |||  |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  26824098 tgttatttccgaacctcttttcatgcttagtgagatgtatagcataactcccacgctgatgtcgtatgtcaccaggatccacaccatagaaaacaggcaa 26823999  T
Q  244 aaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaa 343  Q
    |||    |  ||||||  ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  26823998 aacgaggcgccccttttccttgtagacgcgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggcagaaaacacaggaataaaa 26823899  T
Q  344 atcctagattcttcgatggc 363  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  26823898 atcctagactcttcaatggc 26823879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 214 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27679134 - 27678956
Alignment:
Q  214 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 313  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27679134 agtaggttccacaccaaagaaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagag 27679035  T
Q  314 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27679034 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctc 27678956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28781497 - 28781149
Alignment:
Q  44 ttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttcct 143  Q
    ||||||||| ||  ||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  28781497 ttaagtaaattgtcgtacccaggactagaatggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccatgttatcct 28781398  T
Q  144 tgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggca 242  Q
    | | |||||| ||| ||||||||||   ||  | ||||| |||| |||   || || |||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28781397 tatcattttgaaacctcttttcatgtccagcca-atgcttcaccataaggacctgtatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggca 28781299  T
Q  243 aaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaa 342  Q
    ||||    | ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  |||||||||  |||||| |  ||||||||    
T  28781298 aaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaa 28781199  T
Q  343 aatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28781198 aatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctc 28781149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 389
Target Start/End: Original strand, 27592833 - 27593194
Alignment:
Q  31 ggaaaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttga---ctacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaac 127  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||  ||   |||  ||||||||| |||||||| ||||| | | |||||||    ||||||  || ||||    
T  27592833 ggaaaaataggatttaagtaaagttgggtacccaggaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcgtctttccatccctgcaac 27592932  T
Q  128 ctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccaca 226  Q
    |||| |||||||| |   | |||||| ||| |||||||||||| ||  | ||||| |||| ||||| ||  | |||||||| |  |||| ||||||||||    
T  27592933 ctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggatccaca 27593031  T
Q  227 ccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcag 326  Q
    ||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||    
T  27593032 ccaaagaaaacaggcaaaacagggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggtcaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatag 27593131  T
Q  327 aaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcat 389  Q
    |||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27593132 aaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcat 27593194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 392
Target Start/End: Original strand, 27610860 - 27611179
Alignment:
Q  73 atggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgctta 172  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| | | |||||||||  ||||||  || |||||||| |||||| | ||| | |||||| ||| |||||||||||| |    
T  27610860 atggtagccggaaaagtttgcagcctggctcagagccactttccatccctgcaacctctccatgttattcttatcattttgaaacctcttttcatgctca 27610959  T
Q  173 gtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcag 271  Q
    |  | ||||| |||| ||||| ||  |||||||||| |  | |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||    
T  27610960 gcca-atgcttcaccataactacctttctgatgtcgcactttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcag 27611058  T
Q  272 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaa 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |    
T  27611059 tgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgagga 27611158  T
Q  372 gtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27611159 gtgatggtgtgatttcatctc 27611179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28786614 - 28786288
Alignment:
Q  66 gactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttc 165  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  28786614 gactagaatggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccatgttatccttatcattttgaaacctcttttc 28786515  T
Q  166 atgcttagtaagatgc-tcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtctt 264  Q
    ||||  ||  | |||| ||||| ||||  || || |||||||| |  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    | ||| ||||||||    
T  28786514 atgcccagcca-atgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatcgacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctt 28786416  T
Q  265 atagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggcc 364  Q
     ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   || |  || ||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28786415 gtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggcc 28786316  T
Q  365 ttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28786315 ttgaggagtgatggtgtgatttcatctc 28786288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28792735 - 28792409
Alignment:
Q  66 gactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttc 165  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  28792735 gactagaatggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccatgttatccttatcattttgaaacctcttttc 28792636  T
Q  166 atgcttagtaagatgc-tcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtctt 264  Q
    ||||  ||  | |||| ||||| ||||  || || |||||||| |  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    | ||| ||||||||    
T  28792635 atgcccagcca-atgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatcgacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctt 28792537  T
Q  265 atagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggcc 364  Q
     ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   || |  || ||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28792536 gtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggcc 28792437  T
Q  365 ttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28792436 ttgaggagtgatggtgtgatttcatctc 28792409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 392
Target Start/End: Original strand, 27531013 - 27531374
Alignment:
Q  31 ggaaaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctc 130  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||  || |||| | |||||||||||| || |||| | |||||||    |||||||||| |||||||    
T  27531013 ggaaaaataggatttaagtaaagtgggctacccatgtttataatgctggccagacaagttagccgcttggctcagagcttctttccattgctgcaacctc 27531112  T
Q  131 tgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacacca 229  Q
    |   |||| ||||| | |||||| ||||| |||| ||||  ||  | ||||| |||| || || || || |||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  27531113 tcagtgttatccttatcattttgaaacttttttttatgcacagcta-atgcttcaccatatctacctgtgtgatgtcgcacatcagtaggatccacacca 27531211  T
Q  230 tagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaa 329  Q
       ||||||||||||||   |||||||||||| |  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  27531212 ataaaaacaggcaaaacaagacaaccctttgtatcgtagcaatgagtgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttttcagaaa 27531311  T
Q  330 atatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||||    
T  27531312 atacgggaataaaaatcctagatttttcaatggcattttttagtgatggtgtgatttcatctc 27531374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 390
Target Start/End: Original strand, 27677427 - 27677789
Alignment:
Q  31 ggaaaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttga---ctacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaac 127  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||  ||   |||  ||||||||| |||||||| ||||| | | ||||||||   ||||||  || ||||    
T  27677427 ggaaaaataggatttaagtaaagttgggtacccaggaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaac 27677526  T
Q  128 ctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccaca 226  Q
    |||| |||| ||| |   | |||||| ||| |||||||||||| ||  | ||||| |||| ||||| ||  |||||||||| |    |||||| ||||||    
T  27677527 ctctccatgcttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacaatagtaggttccaca 27677625  T
Q  227 ccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcag 326  Q
     || |||||||||||| |||    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  27677626 gcaaagaaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatag 27677725  T
Q  327 aaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatc 390  Q
    |||| |  | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27677726 aaaacacagcaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatc 27677789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 221 - 392
Target Start/End: Original strand, 27698500 - 27698671
Alignment:
Q  221 tccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 320  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||    | |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27698500 tccacaccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 27698599  T
Q  321 tggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    ||  |||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27698600 tgagagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctc 27698671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 253 - 390
Target Start/End: Original strand, 27706440 - 27706577
Alignment:
Q  253 accctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagat 352  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||| |  |||||||||||||||||     
T  27706440 accctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggtgatagaaaacacaggaataaaaatcctagac 27706539  T
Q  353 tcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatc 390  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27706540 tcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatc 27706577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 198 - 392
Target Start/End: Original strand, 27724828 - 27725022
Alignment:
Q  198 tctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaa 297  Q
    |||||||||| | || |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27724828 tctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaa 27724927  T
Q  298 acaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    |||||| |||||| | |||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27724928 acaaaacgaagaataggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctc 27725022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26802771 - 26802452
Alignment:
Q  73 atggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgctta 172  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | | |||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||||| | |||||| ||| | |||||||||| |    
T  26802771 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagccactttccatcgctccaacctctccatgttatccttatcattttgaaaccttttttcatgctca 26802672  T
Q  173 gtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcag 271  Q
    |  | ||||| |||| || || |  || ||||| || |  | |||||||||||||||| |||||| |||||| ||    | ||||||||||||||||||     
T  26802671 gcca-atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaataggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaa 26802573  T
Q  272 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaa 371  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |    
T  26802572 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatga 26802473  T
Q  372 gtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26802472 gtgatggtgtgatttcatctc 26802452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 357
Target Start/End: Original strand, 27427493 - 27427748
Alignment:
Q  102 tcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctc-accgtaacttccagtct 200  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| | | | |||||| ||| | |||||||||| ||  | |||||  ||| || || || || |    
T  27427493 tcagagccactttccattgctgcaacctctccatgtttttcgtatcattttgaaacctattttcatgctcagcca-atgctttaccatacctacctgtat 27427591  T
Q  201 gatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaaca 300  Q
    ||||||| |  | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27427592 gatgtcgcacatcagtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaaca 27427691  T
Q  301 aaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttc 357  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27427692 agatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttc 27427748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 200 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 28139743 - 28139563
Alignment:
Q  200 tgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaac 299  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  28139743 tgatgtcgaatgtgagaaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccaaacatccctttgtgttgaagcagtcaatgatgtggacaagttcgtccaagc 28139644  T
Q  300 aaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtg 380  Q
    |||| |||||||| |||||||||   ||||| |  || || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  28139643 aaaacgaagaagaggcatagttgatggaaaacacagggatgaaaatcctagattcttcaatggcttttacgagtgacggtg 28139563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 287 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27229347 - 27229242
Alignment:
Q  287 agttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgattt 386  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27229347 agttcgttcaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccgagattcgtcaatggccttgacgagtgatggtgtgattt 27229248  T
Q  387 catctc 392  Q
    | ||||    
T  27229247 cgtctc 27229242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 212 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31284478 - 31284300
Alignment:
Q  212 tgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaag 311  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    | ||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  31284478 tgagaaggatccacgccaaagaaaacgggcaaaacgaggcgaccattttgcttatacaagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgacgaag 31284379  T
Q  312 atgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatc 390  Q
    | ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  31284378 aggcatagttggcagaaaacacggggataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtgtgatttcatc 31284300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 392
Target Start/End: Original strand, 27604702 - 27604882
Alignment:
Q  212 tgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaag 311  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    | |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27604702 tgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaaggaagaag 27604801  T
Q  312 atgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    | ||||| |||  |||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27604802 aggcatatttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctc 27604882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 26861974 - 26861628
Alignment:
Q  41 gatttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgtttt 140  Q
    |||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||| |  ||||||  || |||||||| |||||| |    
T  26861974 gatttatgttaagtggggtacccaggactaaaatggtagcctgacaagttagcagcttggttcagagcaactttccatctctgcaacctctccatgttat 26861875  T
Q  141 ccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacag 239  Q
    || | | |||||| ||| | |||||||||||||  | ||||| |||| ||| | ||  | |||||||| |  | |||||||||||  |||||||||||||    
T  26861874 ccatatcattttgaaaccttttttcatgcttagcca-atgcttcaccataaatacctctatgatgtcgcacattagtaggatccatgccatagaaaacag 26861776  T
Q  240 gcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaat 339  Q
    |||||||    | |||||||  |||   ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||    
T  26861775 gcaaaacgacgcgacccttttcctt---gcagttaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttggcagaaaacacaggaat 26861679  T
Q  340 aaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatc 390  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||  | ||||||||||    
T  26861678 gaaaattctagactcttcaatggcattgtcgagtgatcttttgatttcatc 26861628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 228 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 28150111 - 28149953
Alignment:
Q  228 catagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcaga 327  Q
    ||||||||| ||||| |||  | |||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||    
T  28150111 catagaaaataggcagaactaagcaaccctttgccttgaagcagtgaataatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagtatagttgataga 28150012  T
Q  328 aaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttc 387  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28150011 gaagattggaatgaaaatcctggactcttcaatggccttga-gagtgatggtgtgatttc 28149953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 267 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 28181249 - 28181129
Alignment:
Q  267 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggcctt 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28181249 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 28181150  T
Q  367 gacaagtgatggtgtgatttc 387  Q
    || |||||||| ||| |||||    
T  28181149 gaaaagtgatgatgttatttc 28181129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 28185696 - 28185381
Alignment:
Q  72 aatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgctt 171  Q
    |||||| |||||| ||||| |||| ||  || |||||  ||||||||| || |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||  ||| |     
T  28185696 aatggtggccagagaagttagcagtttgagtaagagcactcttccatttctgcaacctctccatgctatccttgttattttggaacttctttatatgatc 28185597  T
Q  172 agtaagatgctc-accgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagca 270  Q
    |   || ||||  ||| ||||| || || |||||||| | ||||| ||| |||||| |||||||||  ||||||||   ||  ||  ||  |||  ||||    
T  28185596 atccag-tgctttaccataactgcccgtgtgatgtcgcacgtgagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactagacgcccgctttccttgaagca 28185498  T
Q  271 gtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaca 370  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || | |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  28185497 gttaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaa 28185398  T
Q  371 agtgatggtgtgatttc 387  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  28185397 agtgatgatgttatttc 28185381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 267 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 28242939 - 28242820
Alignment:
Q  267 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggcctt 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28242939 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 28242840  T
Q  367 gacaagtgatggtgtgattt 386  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  28242839 gaaaagtgatggtgttattt 28242820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 274 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28234692 - 28234574
Alignment:
Q  274 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  28234692 aatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagt 28234593  T
Q  374 gatggtgtgatttcatctc 392  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  28234592 gatggtgttatttcatctc 28234574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 267 - 386
Target Start/End: Original strand, 26341986 - 26342105
Alignment:
Q  267 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggcctt 366  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||   || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  26341986 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaagcatagttgattgagaaaattggaatgaaaatcctggactcttcaatggcttt 26342085  T
Q  367 gacaagtgatggtgtgattt 386  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  26342086 gacaagtgattgtgtgattt 26342105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 267 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 28227085 - 28226962
Alignment:
Q  267 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggcctt 366  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  28227085 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgacctt 28226986  T
Q  367 gacaagtgatggtgtgatttcatc 390  Q
    || |||||||| ||| ||||||||    
T  28226985 gaaaagtgatgatgttatttcatc 28226962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 385
Target Start/End: Original strand, 28098291 - 28098539
Alignment:
Q  137 ttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaa 235  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| |||| ||||| || ||||||||||| | ||||| ||| |||||  || | |||    
T  28098291 ttttctttgttattttggaacctctcttcatgcttagcta-atgcttcaccataactccccgtctgatgtcgcacgtgagaaggttccacgtcacaaaaa 28098389  T
Q  236 acaggcaaaaccgaacaaccctttgtctta-tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatg 334  Q
    | ||| |||||  | ||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||   ||| || |      
T  28098390 ataggaaaaacgaagcaacccttt-tcttcgtaacggtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatagttcttagagaagacc 28098488  T
Q  335 ggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatt 385  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  28098489 ggaattaaaatcctggactcttcgatggccttgacaagggattgtgtgatt 28098539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26937313 - 26937104
Alignment:
Q  183 caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtg 282  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| | ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||    |  ||| ||||||||  |||||| || ||||||    
T  26937313 caccataactcccagtttggtgtcgaacgtgagaaggatccacttcatagaaaataggcaaaattagatgaccttttgtcttgaagcagtcaacgatgtg 26937214  T
Q  283 gacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||  || ||   |||||  || ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26937213 gacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtggcatagttgatagagaatacaggtatggcaatcccggaatcttcaattgccttgacaagtgatggtgtg 26937114  T
Q  383 atttcatctc 392  Q
    ||||| ||||    
T  26937113 atttcttctc 26937104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 267 - 387
Target Start/End: Original strand, 28297765 - 28297885
Alignment:
Q  267 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggcctt 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || |  ||||| ||||||||||  ||||| |||  |||    
T  28297765 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatgtgctt 28297864  T
Q  367 gacaagtgatggtgtgatttc 387  Q
    || |||||||||||| |||||    
T  28297865 gaaaagtgatggtgttatttc 28297885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 267 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 28514308 - 28514188
Alignment:
Q  267 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggcctt 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || |  ||||| ||||||||||  ||||| |||  |||    
T  28514308 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatgtgctt 28514209  T
Q  367 gacaagtgatggtgtgatttc 387  Q
    || |||||||||||| |||||    
T  28514208 gaaaagtgatggtgttatttc 28514188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 267 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 28325616 - 28325496
Alignment:
Q  267 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggcctt 366  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||  ||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28325616 agcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 28325517  T
Q  367 gacaagtgatggtgtgatttc 387  Q
    || |||||| ||||| |||||    
T  28325516 gaaaagtgacggtgttatttc 28325496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26949991 - 26949745
Alignment:
Q  72 aatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgctt 171  Q
    ||||||||||||| ||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||| |  ||||| || ||||||||  ||| | ||||||||| ||| |||||||||    
T  26949991 aatggtagccagataagtcagcaactttgttcagagctatcttccatttcagcaaccgctccatgttttttttgctcttttggaacctctcttcatgctt 26949892  T
Q  172 agtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagca 270  Q
    || ||| |||| |||| |||||   | |||||||||| | ||||| ||| || ||| |||||||||| |||| |||    | ||| |||  |||  || |    
T  26949891 agcaag-tgcttcaccataactataattctgatgtcgcacgtgagaaggttctacatcatagaaaactggcagaacaaggcgacctttttccttgaagta 26949793  T
Q  271 gtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcata 318  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26949792 gtgaatgatatggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcata 26949745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 27214756 - 27214498
Alignment:
Q  66 gactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttc 165  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | | ||||| |||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  27214756 gactataatgatagccagataagttagcagcttggttaagagctatcttccatttctgcaaccgctccatgttttccttgttattttgaaacctctcttc 27214657  T
Q  166 atgcttagtaagatgctcaccgtaac--ttccag-tctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtc 262  Q
    |||||||| |||    ||||| ||||  ||   | || ||||||| | ||||| ||| || || |||||||||||||| | |||    | ||| |||  |    
T  27214656 atgcttagcaagcgcttcaccataactgttgttgttcagatgtcgcaagtgagaaggttcaacgccatagaaaacaggtagaacaaggcgacctttttcc 27214557  T
Q  263 ttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagtt 321  Q
    ||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27214556 ttggagcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagtt 27214498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 321
Target Start/End: Original strand, 27234472 - 27234730
Alignment:
Q  66 gactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttc 165  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | | ||||| |||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  27234472 gactataatgatagccagataagttagcagcttggttaagagctatcttccatttctgcaaccgctccatgttttccttgttattttgaaacctctcttc 27234571  T
Q  166 atgcttagtaagatgctcaccgtaac--ttccag-tctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtc 262  Q
    |||||||| |||    ||||| ||||  ||   | || ||||||| | ||||| ||| || || |||||||||||||| | |||    | ||| |||  |    
T  27234572 atgcttagcaagcgcttcaccataactgttgttgttcagatgtcgcaagtgagaaggttcaacgccatagaaaacaggtagaacaaggcgacctttttcc 27234671  T
Q  263 ttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagtt 321  Q
    ||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27234672 ttggagcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagtt 27234730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26848929 - 26848741
Alignment:
Q  133 catgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccata 231  Q
    |||| |||||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||| |||| |||| ||||| | | |||||||||| |  |||| ||| || |  |||||    
T  26848929 catgctttccttgttattttgaaacacctcttcatgcttagcaag-tgcttcaccataactactattctgatgtcgcacatgagaaggttctatgccata 26848831  T
Q  232 gaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagtt 321  Q
    ||||||||| | ||||   | |||||||  |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  26848830 gaaaacaggaataaccatgctacccttttccttggagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagtggcatagtt 26848741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 273 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 2184417 - 2184369
Alignment:
Q  273 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagtt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2184417 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagtt 2184369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 284 - 392
Target Start/End: Original strand, 25506978 - 25507086
Alignment:
Q  284 acaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtga 383  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||| |||||||||  |||||  |  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||||||    
T  25506978 acaagttcctccaaacaaaattttgaagaggcatagttgatagaaagaaccggaataaaaatcctagattcttcaatggcgatgacgactgatggtgtga 25507077  T
Q  384 tttcatctc 392  Q
    |||||||||    
T  25507078 tttcatctc 25507086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26975182 - 26975134
Alignment:
Q  272 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26975182 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagt 26975134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 28234861 - 28234802
Alignment:
Q  104 agagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttt 163  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28234861 agagccatcttccatttctgcaacctctccatgttatccttgttattttggaacttcttt 28234802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 25071791 - 25071741
Alignment:
Q  270 agtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25071791 agtgaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagt 25071741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 2185027 - 2184980
Alignment:
Q  273 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 320  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2185027 gaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagt 2184980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 26959534 - 26959395
Alignment:
Q  34 aaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgc 133  Q
    |||||||||| ||| |||||  ||||||||  || |  |||||| |||||| ||||| ||||||| | | |||||  ||||||||| |  ||||| || |    
T  26959534 aaaacaagatataaataaagaagggtacccaagattgaaatggtggccagataagttagcagcttggttaagagctttcttccatttcagcaaccgctcc 26959435  T
Q  134 atgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttag 173  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||    
T  26959434 atgttttccttgctattttgaaactgctcttcatgcttag 26959395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 321
Target Start/End: Original strand, 27665169 - 27665223
Alignment:
Q  267 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagtt 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  27665169 agcaatgaatgatgtggacaagttcatctaaacaaaatgaagaagtagcatagtt 27665223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 26617920 - 26617867
Alignment:
Q  104 agagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaac 157  Q
    ||||| |||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26617920 agagctatcttccatttctgcaaccgctccatgttttccttgttattttggaac 26617867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 26723848 - 26723795
Alignment:
Q  104 agagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaac 157  Q
    ||||| |||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26723848 agagctatcttccatttctgcaaccgctccatgttttccttgttattttggaac 26723795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 161
Target Start/End: Original strand, 28297570 - 28297659
Alignment:
Q  72 aatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttct 161  Q
    |||||| |||||| ||||| |||| ||  || |||||  ||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  28297570 aatggtggccagagaagttagcagtttgagtaagagcactcttccatttctgcaacctctccatgttattcttgttattttggaacttct 28297659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28514503 - 28514414
Alignment:
Q  72 aatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttct 161  Q
    |||||| |||||| ||||| |||| ||  || |||||  ||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  28514503 aatggtggccagagaagttagcagtttgagtaagagcactcttccatttctgcaacctctccatgttattcttgttattttggaacttct 28514414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26635825 - 26635774
Alignment:
Q  267 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcata 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||    
T  26635825 agcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcata 26635774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26741791 - 26741740
Alignment:
Q  267 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcata 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||    
T  26741791 agcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcata 26741740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 29826241 - 29826042
Alignment:
Q  188 taacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaa 287  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||   || ||||||  ||||    || | ||  || || ||||    
T  29826241 taactcccagtctgatgtcgcacatgagaaggatccacatcatagaaaataggcaaaacgagacgacccttcctcttgacacactcaactatatgcacaa 29826142  T
Q  288 gttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttc 387  Q
    |||| || || ||||| |||||||| ||||| |||| ||| || || |||||    |||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  29826141 gttcatctaagcaaaacgaagaagaagcataattggtagagaaaataggaatggctatcctagattcttgaattgccttcacaagtgagggtgtgatttc 29826042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26959296 - 26959250
Alignment:
Q  272 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcata 318  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||    
T  26959296 tgaatgatgtggacaagttcatccaaataaaacgaagaagaagcata 26959250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 192
Target Start/End: Original strand, 25506848 - 25506961
Alignment:
Q  79 gccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaaga 178  Q
    |||||||| ||| |||| ||  || ||||| || |||||||| | | | |||| |||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  25506848 gccagacaggttagcagattgtgttagagctattttccattgatgcgatctctccatgtttttcttattattttgaaacttctcttcatgcttagtcaga 25506947  T
Q  179 tgctcaccgtaact 192  Q
    |  ||||| |||||    
T  25506948 tcttcaccataact 25506961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 26636020 - 26635919
Alignment:
Q  72 aatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgctt 171  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||| | | |||||  ||||||||| |  ||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||  | |||||||||    
T  26636020 aatggtggccagataagttagcagcttggttaagagctttcttccatttcagcaaccactccatgttttccttgctattttgaaactgatcttcatgctt 26635921  T
Q  172 ag 173  Q
    ||    
T  26635920 ag 26635919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 26741986 - 26741885
Alignment:
Q  72 aatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgctt 171  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||| | | |||||  ||||||||| |  ||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||  | |||||||||    
T  26741986 aatggtggccagataagttagcagcttggttaagagctttcttccatttcagcaaccactccatgttttccttgctattttgaaactgatcttcatgctt 26741887  T
Q  172 ag 173  Q
    ||    
T  26741886 ag 26741885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 26811807 - 26811754
Alignment:
Q  104 agagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaac 157  Q
    ||||| |||||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  26811807 agagctatcttccatttctgcaaccgatccatgttttccttgttattttggaac 26811754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 34 - 390
Target Start/End: Original strand, 18731310 - 18731666
Alignment:
Q  34 aaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgc 133  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| || |    
T  18731310 aaaacaagaattaagtaaagaggagtacccatgactaaaatggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagccaacttccattgatgcaaccgctcc 18731409  T
Q  134 atgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccataga 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18731410 atgtttttcttgttattttggaaactctttttgtgcttagtgagatgttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgactaggatccacgccataga 18731509  T
Q  234 aaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatat 333  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |     
T  18731510 aaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacac 18731609  T
Q  334 gggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatc 390  Q
     ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  18731610 aggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatc 18731666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 34 - 390
Target Start/End: Original strand, 18655283 - 18655639
Alignment:
Q  34 aaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgc 133  Q
    |||||| || |||||| ||| || ||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| || |    
T  18655283 aaaacatgaattaagtgaagaggagtacccaggactagaatggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagccaacttccattgatgcaaccgctcc 18655382  T
Q  134 atgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccataga 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18655383 atgtttttcttgttattttggaaattctttctgtgcttagtgagatgttcaccataacttccagtttgatgtcgtatgtgagtaggatccacgccataga 18655482  T
Q  234 aaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatat 333  Q
    ||||||| |||||   || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |     
T  18655483 aaacaggaaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgcggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacac 18655582  T
Q  334 gggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatc 390  Q
     |||||||| |||||||| ||||  ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  18655583 aggaataaagatcctagactcttgaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatc 18655639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 390
Target Start/End: Original strand, 18699206 - 18699562
Alignment:
Q  34 aaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgc 133  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||   |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||| || |    
T  18699206 aaaacaagaattaagtaaagaggagtacccagaactaaaatggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagctaacttccattgatgcaaccgctcc 18699305  T
Q  134 atgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccataga 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18699306 atgtttttcttgttattttggaaactctttccgtgcttagtgagatgttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgagtaggatctacgccataga 18699405  T
Q  234 aaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatat 333  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |     
T  18699406 aaacaggcaaaacgagacgaccttttgtcttgtagcagtgaatgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacac 18699505  T
Q  334 gggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatc 390  Q
     ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  18699506 aggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatc 18699562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 390
Target Start/End: Original strand, 18723891 - 18724247
Alignment:
Q  34 aaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgc 133  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| || |    
T  18723891 aaaacaagaattaagtaaagaggagtacccaggactaaaatggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagccaacttccattgatgcaaccgctcc 18723990  T
Q  134 atgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccataga 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||  || |||  |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | || |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18723991 atgtttttcttgttattttggaaactcattttgtgcttagtgagatgttcaccataactcccactttggtgtcgtatgtgactaggatccacgccataga 18724090  T
Q  234 aaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatat 333  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |     
T  18724091 aaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgttcaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacac 18724190  T
Q  334 gggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatc 390  Q
     ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  18724191 aggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatc 18724247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 390
Target Start/End: Original strand, 18679373 - 18679729
Alignment:
Q  34 aaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgc 133  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||| || |    
T  18679373 aaaacaagaattaagtaaagaggagtacccaggactaaaatggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagctaacttccattgatgcaaccgctcc 18679472  T
Q  134 atgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccataga 233  Q
    |||||||  ||||||||||||||  |||||   || ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  18679473 atgtttttattgttattttggaaactctttcagtgattagtgagatgttcaccataactaccactttgatgtcatatgtgagtaggatccacgacataga 18679572  T
Q  234 aaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatat 333  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |     
T  18679573 aaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacac 18679672  T
Q  334 gggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatc 390  Q
     ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  18679673 aggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatc 18679729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18074062 - 18073807
Alignment:
Q  102 tcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctc-accgtaacttccagtct 200  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| | | | |||||| ||| | |||||||||| ||  | |||||  ||| || || || || |    
T  18074062 tcagagccactttccattgctgcaacctctccatgtttttcgtatcattttgaaacctattttcatgctcagcca-atgctttaccatacctacctgtat 18073964  T
Q  201 gatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaaca 300  Q
    ||||||| |  | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18073963 gatgtcgcacatcagtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaaca 18073864  T
Q  301 aaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttc 357  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18073863 agatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttc 18073807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 357
Target Start/End: Original strand, 17989091 - 17989182
Alignment:
Q  266 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17989091 tagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttc 17989182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 182 - 386
Target Start/End: Original strand, 5090921 - 5091125
Alignment:
Q  182 tcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgt 281  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |  |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||   ||||| |||  |||  |||||||||| || |    
T  5090921 tcaccataacttccagtctgatatcgcacatgagaaggttccacaccatagaaaataggcaaaaccaggcaaccattttccttggagcagtgaataatat 5091020  T
Q  282 ggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgt 381  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| |  ||| || | |  ||| | |||| |||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  5091021 ggacaagttcatctaaacaaaacgaagaagaagcatagtggttagagaaaacgataatgacaatcttagattcttgaatggccttgagaagtgacggtgt 5091120  T
Q  382 gattt 386  Q
     ||||    
T  5091121 tattt 5091125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 390
Target Start/End: Original strand, 268163 - 268519
Alignment:
Q  34 aaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgc 133  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| || |    
T  268163 aaaacaagaattaagtaaagagcagtacccacgactagaatggtagccagacaagttagaagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaaccgctcc 268262  T
Q  134 atgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccataga 233  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  268263 atgtttttcttgctattttggaaactctcttcgtgcttagtgagatgttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgagtaggatccacgccataga 268362  T
Q  234 aaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatat 333  Q
    | || |||||||    || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |     
T  268363 agacgggcaaaatgagacgaccctttttcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacac 268462  T
Q  334 gggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatc 390  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  268463 aggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatc 268519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 386
Target Start/End: Original strand, 28127485 - 28127837
Alignment:
Q  34 aaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgc 133  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||| | || |    
T  28127485 aaaacaagatttaagtatagtagggtaccctggactataatggtagccggacaagttagcagcttgggttagagctatcttccattggtgcaatcgctcc 28127584  T
Q  134 atgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccataga 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| |  ||||| ||||| || || |||| ||| |  | |||||||||||| ||| |||    
T  28127585 atgtttttcttgttattttggaacctctctccatgcttagcaagctcttcaccataactccctgtatgatatcgcacatcagtaggatccacgccaaaga 28127684  T
Q  234 aaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatat 333  Q
    |||||||||||||    | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  28127685 aaacaggcaaaactaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtgcacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggtagaaaatac 28127784  T
Q  334 gggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgattt 386  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||    
T  28127785 aggaataaaaattctagattcttcaatggcctttaaaagtgacggtgtgattt 28127837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 392
Target Start/End: Original strand, 28164165 - 28164526
Alignment:
Q  30 aggaaaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacct 129  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||| |     
T  28164165 aggaaaaacaagatttaagtattgtaaggtaccctggactataatggtagccggacaagttagcagcttgggttagagctatcttccattggtgcaatcg 28164264  T
Q  130 ctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacacca 229  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||||||||  |  || ||||| || || |||||||| |  | |||||||||||| |||    
T  28164265 ctccatgtttttcttgttattttggaacctctcaccatgcttagtaagatctttgccataactccctgtatgatgtcgcacatcagtaggatccacgcca 28164364  T
Q  230 tagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaa 329  Q
     ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |    
T  28164365 -agaaaacaggcaaaactaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagata 28164463  T
Q  330 atatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    | |  ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||    
T  28164464 acacaggaataaaaattcaagatttttcaatggccttgatgaatgacggtgtgatttcttctc 28164526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 34 - 390
Target Start/End: Original strand, 29273589 - 29273945
Alignment:
Q  34 aaaacaagatttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgc 133  Q
    |||||| || |||||||||| |  |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||  | |    
T  29273589 aaaacaggaattaagtaaagagcagtacccatgactagaatggtagccagacaagttagaagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaaccgatcc 29273688  T
Q  134 atgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccataga 233  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  ||| ||| | |||||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29273689 atgtttttcttgctattttggaaactctcttcgtacttagtgagatgttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgagtaggatccacgccataga 29273788  T
Q  234 aaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatat 333  Q
    | ||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |     
T  29273789 agacaggcaaaatgagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacac 29273888  T
Q  334 gggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatc 390  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||| | ||||||| | ||||||||||    
T  29273889 aggaataaaaattctagactcttcaatgacattgtcgagtgatgatttgatttcatc 29273945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 392
Target Start/End: Original strand, 4500 - 4848
Alignment:
Q  44 ttaagtaaagtggggtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttcct 143  Q
    |||||||||  || |||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| | ||    
T  4500 ttaagtaaataggcgtacccatgactagaatggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccatgttattct 4599  T
Q  144 tgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggca 242  Q
    | | |||||| ||| |||||||||||| ||  | ||||| |||| ||||| ||  || ||||||| | || |||||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  4600 tatcattttgaaacctcttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttcagatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggca 4698  T
Q  243 aaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaa 342  Q
    ||||    | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  |  |||||| |  ||||||||    
T  4699 aaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaaaaggcatagaagatagaaaacacaggaataaa 4798  T
Q  343 aatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    |||||||||||| || |||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  4799 aatcctagattcatcaatggccttgcggagggatggtgtgatttcatctc 4848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 58 - 392
Target Start/End: Original strand, 13475 - 13809
Alignment:
Q  58 gtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaac 157  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| | || |||||| | ||| | |||||| |||    
T  13475 gtacccatgactagaatggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaatcgctccatgttattcttatcattttgaaac 13574  T
Q  158 ttcttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccc 256  Q
     ||||||||||   ||  | ||||| |||| ||||  || || |||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    | |||     
T  13575 ctcttttcatgtccagcca-atgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgacct 13673  T
Q  257 tttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattctt 356  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  || ||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  13674 tttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattctt 13773  T
Q  357 cgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13774 cgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctc 13809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 392
Target Start/End: Original strand, 14214 - 14532
Alignment:
Q  73 atggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgctta 172  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | | ||||||||   ||||||  || |||||||| |||||||| |   | |||||| ||| |||||||||||| |    
T  14214 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctca 14313  T
Q  173 gtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcag 271  Q
    |  | ||||| |||| ||||| ||  |||||||||| | || |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||    
T  14314 gcca-atgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcag 14412  T
Q  272 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaa 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |    
T  14413 tgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaa-aggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgagga 14511  T
Q  372 gtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14512 gtgatggtgtgatttcatctc 14532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 214 - 392
Target Start/End: Original strand, 3420 - 3599
Alignment:
Q  214 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 313  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||| |||    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3420 agtaggttccacaccaaataaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagag 3519  T
Q  314 gcata-gttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    ||||| ||||  |||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3520 gcataggttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctc 3599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 58 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7869 - 7535
Alignment:
Q  58 gtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaac 157  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| | || |||||| | ||| | |||||| |||    
T  7869 gtacccatgactagaatggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaatcgctccatgttattcttatcattttgaaac 7770  T
Q  158 ttcttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccc 256  Q
     ||||||||||   ||  | ||||| |||| ||||  || || |||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    | |||     
T  7769 ctcttttcatgtccagcca-atgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgacct 7671  T
Q  257 tttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattctt 356  Q
    | |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  || ||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  7670 tctgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattctt 7571  T
Q  357 cgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7570 cgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctc 7535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 59870 - 59615
Alignment:
Q  102 tcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctc-accgtaacttccagtct 200  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| | | | |||||| ||| | |||||||||| ||  | |||||  ||| || || || || |    
T  59870 tcagagccactttccattgctgcaacctctccatgtttttcgtatcattttgaaacctattttcatgctcagcca-atgctttaccatacctacctgtat 59772  T
Q  201 gatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaaca 300  Q
    ||||||| |  | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  59771 gatgtcgcacatcagtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaaca 59672  T
Q  301 aaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttc 357  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  59671 agatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttc 59615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 35023 - 34735
Alignment:
Q  104 agagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctc-accgtaacttccagtctga 202  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | |   || ||||  ||| ||||| ||  | |||    
T  35023 agagccatcttccatttctgcaacctctccatgttatccttgttattttggaacttctttatatgatcatccag-tgctttaccataactgcccttgtga 34925  T
Q  203 tgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaa 302  Q
    ||||| | ||||| ||| |||||| |||||||||  ||||||||   ||  ||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34924 tgtcgcacgtgagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactagacgcccgctttccttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaa 34825  T
Q  303 atgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    |||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  34824 atgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttatttcatctc 34735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 267 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 43101 - 42982
Alignment:
Q  267 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggcctt 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  43101 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 43002  T
Q  367 gacaagtgatggtgtgattt 386  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  43001 gaaaagtgatggtgttattt 42982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 267 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 27583 - 27460
Alignment:
Q  267 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggcctt 366  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  27583 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgacctt 27484  T
Q  367 gacaagtgatggtgtgatttcatc 390  Q
    || |||||||| ||| ||||||||    
T  27483 gaaaagtgatgatgttatttcatc 27460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 267 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 116931 - 116811
Alignment:
Q  267 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggcctt 366  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||  ||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  116931 agcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 116832  T
Q  367 gacaagtgatggtgtgatttc 387  Q
    || |||||| ||||| |||||    
T  116831 gaaaagtgacggtgttatttc 116811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 267 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 3279823 - 3279700
Alignment:
Q  267 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggcctt 366  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||| || |  |||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  3279823 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaagaccggaataaaaatcatggactcttcgatggcctt 3279724  T
Q  367 gacaagtgatggtgtgatttcatc 390  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  3279723 gacaagtgattgtgtgatttcatc 3279700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 320
Target Start/End: Original strand, 17993527 - 17993789
Alignment:
Q  58 gtacccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaac 157  Q
    |||||||||| |  |||||| |||||| ||||| ||||||| | | |||||  ||||||||| |  ||||| || ||||||||||||| ||||||| ||     
T  17993527 gtacccttgattgaaatggtggccagataagttagcagcttggttaagagctttcttccatttcaacaaccgctccatgttttccttgctattttgaaaa 17993626  T
Q  158 ttcttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccc 256  Q
      || ||||||||||| ||| |||| |||| |||||  || |||||||||| |  |||| ||| ||    |||||||||||||| |  ||||    ||||    
T  17993627 ccctcttcatgcttagcaag-tgcttcaccataactatcattctgatgtcgcacctgagaaggttctgtgccatagaaaacaggaattaccgtcgtaccc 17993725  T
Q  257 tttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 320  Q
    |||   ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17993726 ttttcattggagcattgaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagt 17993789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 267 - 387
Target Start/End: Original strand, 58334 - 58454
Alignment:
Q  267 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggcctt 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||  ||| || | |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  58334 agcagtgaatgatgtggacaagttcgttcaagcaaaatgaagaagaagcatagttgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactctttaatggcctt 58433  T
Q  367 gacaagtgatggtgtgatttc 387  Q
    || |||||||||||| |||||    
T  58434 gaaaagtgatggtgttatttc 58454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 335 - 392
Target Start/End: Original strand, 37 - 94
Alignment:
Q  335 ggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctc 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  37 ggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctc 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 16689139 - 16689027
Alignment:
Q  274 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgacaagt 373  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||   |||||| | ||| ||   |||||| || ||||| || ||||||| ||||    
T  16689139 aatgatgttgacaagttcatccaaacaaaacgaggaaaatgcatagttcttagaaaacacggggattgcaatccttgagtcttcaattgccttgataagt 16689040  T
Q  374 gatggtgtgattt 386  Q
    |||||||||||||    
T  16689039 gatggtgtgattt 16689027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University