View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10340_high_2 (Length: 431)

Name: NF10340_high_2
Description: NF10340
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10340_high_2
NF10340_high_2
[»] chr8 (127 HSPs)
chr8 (25-431)||(19807933-19808335)
chr8 (25-431)||(22237590-22237992)
chr8 (96-431)||(17460694-17461025)
chr8 (85-431)||(25483870-25484212)
chr8 (85-350)||(15635576-15635840)
chr8 (85-350)||(39694924-39695188)
chr8 (85-350)||(41680530-41680795)
chr8 (85-381)||(364148-364444)
chr8 (85-338)||(19882371-19882624)
chr8 (85-381)||(44522822-44523118)
chr8 (85-338)||(11775125-11775378)
chr8 (25-317)||(21321676-21321968)
chr8 (85-365)||(26454087-26454367)
chr8 (85-317)||(18024091-18024323)
chr8 (85-343)||(20454638-20454895)
chr8 (85-315)||(22207693-22207923)
chr8 (85-314)||(18833898-18834127)
chr8 (85-381)||(44432221-44432518)
chr8 (85-317)||(20178917-20179149)
chr8 (85-315)||(6573453-6573682)
chr8 (85-343)||(23478478-23478736)
chr8 (85-381)||(17795592-17795888)
chr8 (25-317)||(21326274-21326566)
chr8 (85-317)||(21861016-21861248)
chr8 (85-309)||(38185482-38185706)
chr8 (85-343)||(42559924-42560181)
chr8 (85-310)||(39363955-39364180)
chr8 (85-317)||(5760957-5761189)
chr8 (89-317)||(6102153-6102381)
chr8 (85-317)||(19140189-19140421)
chr8 (85-343)||(20455395-20455652)
chr8 (85-343)||(20460373-20460630)
chr8 (85-315)||(42818303-42818533)
chr8 (85-317)||(39936407-39936638)
chr8 (85-313)||(44476851-44477080)
chr8 (85-313)||(44480113-44480342)
chr8 (85-365)||(19880205-19880484)
chr8 (85-316)||(17437714-17437945)
chr8 (85-313)||(8728333-8728561)
chr8 (85-317)||(20084034-20084266)
chr8 (85-356)||(27941285-27941556)
chr8 (85-330)||(21579603-21579848)
chr8 (88-350)||(42265994-42266252)
chr8 (85-315)||(5082608-5082838)
chr8 (85-321)||(23914344-23914579)
chr8 (85-321)||(22258700-22258935)
chr8 (85-317)||(22483171-22483402)
chr8 (152-317)||(361675-361840)
chr8 (85-317)||(32950025-32950241)
chr8 (85-330)||(29763265-29763510)
chr8 (85-316)||(17501350-17501581)
chr8 (85-268)||(23660688-23660871)
chr8 (96-317)||(20517525-20517745)
chr8 (85-242)||(36732920-36733077)
chr8 (85-317)||(4381189-4381420)
chr8 (85-317)||(22344466-22344697)
chr8 (85-317)||(22356126-22356357)
chr8 (89-321)||(23670069-23670300)
chr8 (85-321)||(38988886-38989121)
chr8 (85-321)||(39019983-39020218)
chr8 (85-317)||(36305083-36305314)
chr8 (189-431)||(14397604-14397835)
chr8 (85-242)||(21399209-21399366)
chr8 (85-242)||(21793702-21793859)
chr8 (219-337)||(8414240-8414358)
chr8 (127-317)||(18816898-18817089)
chr8 (85-317)||(17978813-17979044)
chr8 (313-431)||(40492711-40492825)
chr8 (85-317)||(22474176-22474407)
chr8 (85-321)||(36405456-36405691)
chr8 (85-238)||(21513823-21513975)
chr8 (145-317)||(18815279-18815450)
chr8 (316-431)||(17439367-17439478)
chr8 (313-431)||(20533267-20533381)
chr8 (85-204)||(16198371-16198490)
chr8 (313-431)||(19154744-19154858)
chr8 (337-431)||(23943876-23943966)
chr8 (85-314)||(24907203-24907430)
chr8 (86-204)||(14397308-14397426)
chr8 (86-204)||(18677632-18677750)
chr8 (315-431)||(16799635-16799748)
chr8 (86-204)||(4541941-4542059)
chr8 (85-179)||(8414145-8414239)
chr8 (86-204)||(24485611-24485729)
chr8 (85-164)||(1484918-1484997)
chr8 (85-164)||(20045762-20045841)
chr8 (85-176)||(45290114-45290205)
chr8 (313-405)||(14103083-14103175)
chr8 (86-194)||(22002239-22002347)
chr8 (85-317)||(25757577-25757808)
chr8 (85-164)||(5852859-5852938)
chr8 (85-164)||(14409011-14409090)
chr8 (128-317)||(18118603-18118792)
chr8 (313-402)||(22525689-22525778)
chr8 (85-317)||(25295557-25295788)
chr8 (85-164)||(14824291-14824370)
chr8 (235-310)||(21345945-21346020)
chr8 (84-171)||(22313401-22313488)
chr8 (127-238)||(24624171-24624282)
chr8 (88-242)||(19331976-19332128)
chr8 (85-315)||(18827650-18827879)
chr8 (85-179)||(24238977-24239071)
chr8 (85-164)||(4483796-4483875)
chr8 (85-317)||(45559572-45559796)
chr8 (85-167)||(4233215-4233297)
chr8 (85-242)||(21495086-21495243)
chr8 (313-402)||(37515878-37515967)
chr8 (315-402)||(20501962-20502049)
chr8 (85-175)||(223324-223414)
chr8 (85-175)||(688095-688185)
chr8 (85-175)||(736947-737037)
chr8 (85-175)||(860842-860932)
chr8 (380-431)||(23659555-23659602)
chr8 (313-359)||(23668025-23668071)
chr8 (318-383)||(26222945-26223010)
chr8 (313-401)||(22253024-22253112)
chr8 (315-351)||(22996068-22996104)
chr8 (292-330)||(23410018-23410056)
chr8 (315-361)||(28397763-28397809)
chr8 (85-121)||(272183-272219)
chr8 (85-121)||(643630-643666)
chr8 (85-121)||(829436-829472)
chr8 (85-149)||(17150635-17150699)
chr8 (277-313)||(18122327-18122363)
chr8 (85-149)||(22007105-22007169)
chr8 (313-361)||(22381593-22381641)
chr8 (85-149)||(29759455-29759519)
[»] chr3 (169 HSPs)
chr3 (25-431)||(14966316-14966718)
chr3 (85-431)||(43550073-43550415)
chr3 (85-431)||(50243047-50243389)
chr3 (85-383)||(24152840-24153138)
chr3 (85-431)||(16643319-16643661)
chr3 (89-315)||(53646460-53646686)
chr3 (89-350)||(6158789-6159049)
chr3 (85-343)||(2248366-2248624)
chr3 (85-315)||(33564555-33564785)
chr3 (85-330)||(14641946-14642191)
chr3 (85-338)||(35961283-35961536)
chr3 (85-349)||(10833735-10833999)
chr3 (85-338)||(41930-42183)
chr3 (85-317)||(11192505-11192736)
chr3 (85-317)||(40807420-40807652)
chr3 (223-431)||(52989492-52989695)
chr3 (85-343)||(11913119-11913377)
chr3 (85-317)||(50351396-50351628)
chr3 (85-317)||(54875879-54876111)
chr3 (85-344)||(6819507-6819765)
chr3 (85-343)||(1988628-1988885)
chr3 (89-359)||(8928065-8928335)
chr3 (85-350)||(12275941-12276205)
chr3 (85-333)||(37038226-37038475)
chr3 (85-381)||(10989200-10989495)
chr3 (85-317)||(14441592-14441824)
chr3 (85-365)||(16979287-16979566)
chr3 (85-317)||(35064977-35065208)
chr3 (85-316)||(40812258-40812489)
chr3 (85-350)||(3394398-3394662)
chr3 (85-317)||(3803259-3803491)
chr3 (86-338)||(6805358-6805610)
chr3 (85-317)||(14508272-14508503)
chr3 (55-317)||(17693492-17693754)
chr3 (85-350)||(179103-179367)
chr3 (85-310)||(10541854-10542079)
chr3 (85-310)||(43889195-43889420)
chr3 (85-317)||(5206050-5206282)
chr3 (85-317)||(17538531-17538762)
chr3 (85-317)||(22306979-22307211)
chr3 (86-330)||(42324618-42324862)
chr3 (85-315)||(17044392-17044622)
chr3 (85-330)||(18367154-18367399)
chr3 (85-317)||(35354023-35354258)
chr3 (85-313)||(20248380-20248608)
chr3 (85-356)||(9533514-9533785)
chr3 (85-340)||(10554668-10554923)
chr3 (85-356)||(14763357-14763628)
chr3 (85-340)||(55292037-55292292)
chr3 (85-310)||(12511279-12511504)
chr3 (85-313)||(38311399-38311628)
chr3 (85-317)||(2841859-2842090)
chr3 (86-310)||(14671255-14671479)
chr3 (129-317)||(44273898-44274086)
chr3 (127-338)||(13029714-13029925)
chr3 (85-356)||(23371103-23371374)
chr3 (85-317)||(15931903-15932135)
chr3 (85-317)||(17519269-17519501)
chr3 (85-317)||(17534131-17534363)
chr3 (127-338)||(13026122-13026333)
chr3 (96-317)||(13519706-13519928)
chr3 (85-350)||(13522806-13523071)
chr3 (85-314)||(17670105-17670334)
chr3 (85-314)||(17685239-17685468)
chr3 (85-310)||(18699869-18700094)
chr3 (85-317)||(14519687-14519918)
chr3 (85-311)||(17513010-17513236)
chr3 (85-330)||(10563120-10563365)
chr3 (86-317)||(41172767-41172999)
chr3 (85-356)||(51300780-51301051)
chr3 (85-317)||(43928775-43929007)
chr3 (85-343)||(31224349-31224608)
chr3 (85-311)||(19443941-19444167)
chr3 (85-316)||(49900153-49900392)
chr3 (88-356)||(18889749-18890017)
chr3 (89-317)||(50348426-50348654)
chr3 (129-310)||(12470233-12470414)
chr3 (88-338)||(16324940-16325190)
chr3 (85-317)||(14152795-14153027)
chr3 (85-317)||(15565938-15566169)
chr3 (86-317)||(9511563-9511793)
chr3 (86-317)||(9519538-9519768)
chr3 (96-317)||(6156130-6156350)
chr3 (85-317)||(50755778-50756009)
chr3 (85-317)||(24546261-24546496)
chr3 (88-298)||(18893067-18893277)
chr3 (85-317)||(54330702-54330933)
chr3 (85-236)||(17046631-17046782)
chr3 (85-242)||(17938025-17938182)
chr3 (128-279)||(14567651-14567802)
chr3 (85-216)||(51602996-51603127)
chr3 (85-195)||(14647499-14647609)
chr3 (189-431)||(15465222-15465453)
chr3 (85-217)||(19568807-19568939)
chr3 (85-232)||(5215156-5215303)
chr3 (25-119)||(52989397-52989491)
chr3 (85-242)||(18739394-18739551)
chr3 (85-317)||(17207766-17207996)
chr3 (319-431)||(324382-324490)
chr3 (85-204)||(12305599-12305718)
chr3 (85-212)||(46723022-46723149)
chr3 (189-431)||(5223451-5223682)
chr3 (85-317)||(25104600-25104829)
chr3 (313-431)||(13919477-13919591)
chr3 (85-317)||(12952466-12952697)
chr3 (222-317)||(11258891-11258986)
chr3 (85-204)||(13436776-13436894)
chr3 (85-204)||(15465631-15465750)
chr3 (85-204)||(26054831-26054950)
chr3 (163-337)||(22652236-22652409)
chr3 (85-199)||(54521304-54521418)
chr3 (313-431)||(21837571-21837685)
chr3 (85-204)||(5223860-5223979)
chr3 (88-218)||(8631265-8631395)
chr3 (313-406)||(12378091-12378184)
chr3 (189-305)||(26055128-26055244)
chr3 (85-204)||(22764026-22764145)
chr3 (85-204)||(29544408-29544527)
chr3 (223-310)||(14682754-14682841)
chr3 (85-204)||(28848188-28848307)
chr3 (85-164)||(34159842-34159921)
chr3 (85-179)||(11258992-11259086)
chr3 (86-204)||(15978009-15978127)
chr3 (313-431)||(316267-316381)
chr3 (85-164)||(17463694-17463773)
chr3 (85-164)||(55477007-55477086)
chr3 (86-204)||(7780914-7781032)
chr3 (86-200)||(16453847-16453961)
chr3 (85-242)||(8023721-8023878)
chr3 (88-197)||(36528061-36528170)
chr3 (268-356)||(18892975-18893063)
chr3 (85-204)||(10247290-10247409)
chr3 (85-164)||(15412947-15413026)
chr3 (85-159)||(13151357-13151431)
chr3 (85-159)||(45606473-45606547)
chr3 (25-197)||(3264646-3264818)
chr3 (261-317)||(19568940-19568996)
chr3 (234-317)||(42353218-42353302)
chr3 (85-242)||(6002446-6002603)
chr3 (127-195)||(11986844-11986912)
chr3 (85-164)||(6468701-6468780)
chr3 (85-159)||(13153823-13153896)
chr3 (85-179)||(17759054-17759148)
chr3 (85-179)||(19060374-19060468)
chr3 (85-171)||(40039740-40039826)
chr3 (320-394)||(52523593-52523667)
chr3 (313-356)||(32402819-32402862)
chr3 (85-175)||(8269382-8269472)
chr3 (85-175)||(8276493-8276583)
chr3 (85-134)||(17956848-17956897)
chr3 (318-383)||(21618627-21618692)
chr3 (85-134)||(27840500-27840549)
chr3 (318-383)||(36166776-36166841)
chr3 (318-406)||(29172491-29172579)
chr3 (315-402)||(9577795-9577882)
chr3 (85-132)||(16820505-16820552)
chr3 (313-351)||(15207161-15207199)
chr3 (313-351)||(15246243-15246281)
chr3 (313-351)||(15265364-15265402)
chr3 (313-359)||(37427930-37427976)
chr3 (313-350)||(16059622-16059659)
chr3 (85-166)||(54039146-54039227)
chr3 (85-121)||(1468633-1468669)
chr3 (85-121)||(12808559-12808595)
chr3 (85-149)||(14528644-14528708)
chr3 (85-149)||(16934830-16934894)
chr3 (353-381)||(23274882-23274910)
chr3 (85-149)||(25058324-25058388)
chr3 (85-149)||(49231794-49231858)
[»] chr4 (120 HSPs)
chr4 (25-431)||(10056786-10057188)
chr4 (85-431)||(630299-630641)
chr4 (85-431)||(12611165-12611507)
chr4 (85-431)||(23802860-23803202)
chr4 (85-431)||(51463463-51463805)
chr4 (85-350)||(9638399-9638663)
chr4 (85-338)||(28385646-28385899)
chr4 (85-317)||(35660270-35660502)
chr4 (85-381)||(56115232-56115528)
chr4 (85-365)||(15008342-15008622)
chr4 (85-341)||(15990439-15990695)
chr4 (85-317)||(53630869-53631101)
chr4 (85-338)||(10694643-10694896)
chr4 (85-338)||(10908409-10908662)
chr4 (90-315)||(11479012-11479237)
chr4 (85-317)||(25091077-25091309)
chr4 (87-350)||(10704890-10705152)
chr4 (87-350)||(10918660-10918922)
chr4 (85-315)||(9923622-9923852)
chr4 (85-365)||(40619907-40620186)
chr4 (85-317)||(42875223-42875455)
chr4 (85-315)||(37019095-37019325)
chr4 (88-317)||(3337523-3337752)
chr4 (85-330)||(15447812-15448057)
chr4 (85-317)||(19435093-19435326)
chr4 (89-317)||(19609748-19609976)
chr4 (85-356)||(24046930-24047201)
chr4 (85-317)||(10356832-10357064)
chr4 (85-317)||(16997954-16998181)
chr4 (85-317)||(33243692-33243924)
chr4 (85-381)||(33849102-33849398)
chr4 (85-316)||(15114648-15114878)
chr4 (85-330)||(33186312-33186557)
chr4 (85-317)||(14549050-14549282)
chr4 (85-356)||(18212951-18213222)
chr4 (85-340)||(16277723-16277978)
chr4 (85-340)||(53387333-53387588)
chr4 (85-305)||(3485347-3485564)
chr4 (89-273)||(15011913-15012097)
chr4 (85-317)||(19566315-19566546)
chr4 (85-321)||(46740619-46740854)
chr4 (85-321)||(40229723-40229959)
chr4 (85-317)||(14630250-14630482)
chr4 (85-321)||(15344297-15344531)
chr4 (86-309)||(10237895-10238117)
chr4 (85-317)||(11425379-11425601)
chr4 (86-316)||(15214442-15214672)
chr4 (88-321)||(44024003-44024235)
chr4 (86-317)||(25513167-25513397)
chr4 (191-336)||(15883917-15884062)
chr4 (85-242)||(16026325-16026482)
chr4 (85-229)||(55582703-55582847)
chr4 (85-318)||(45314733-45314965)
chr4 (85-317)||(26445309-26445540)
chr4 (85-228)||(18108274-18108417)
chr4 (85-317)||(2425017-2425248)
chr4 (313-431)||(17333428-17333542)
chr4 (85-204)||(15534658-15534777)
chr4 (85-204)||(49547340-49547459)
chr4 (85-204)||(14049054-14049173)
chr4 (85-204)||(36038347-36038466)
chr4 (86-204)||(12033341-12033459)
chr4 (98-212)||(22725494-22725608)
chr4 (86-204)||(44615765-44615883)
chr4 (313-431)||(14825616-14825730)
chr4 (247-381)||(43251120-43251255)
chr4 (85-315)||(20595827-20596056)
chr4 (249-350)||(9871126-9871226)
chr4 (85-197)||(14185426-14185538)
chr4 (85-204)||(30147392-30147511)
chr4 (86-204)||(50221907-50222025)
chr4 (85-164)||(15117919-15117998)
chr4 (86-204)||(29267830-29267948)
chr4 (85-243)||(54364086-54364244)
chr4 (85-226)||(13046041-13046182)
chr4 (87-204)||(19243177-19243294)
chr4 (85-164)||(7640753-7640832)
chr4 (85-159)||(1837086-1837160)
chr4 (319-431)||(26050340-26050448)
chr4 (244-314)||(13036332-13036402)
chr4 (320-402)||(52243059-52243141)
chr4 (185-321)||(12622792-12622927)
chr4 (185-317)||(14508186-14508317)
chr4 (128-240)||(19081780-19081892)
chr4 (85-159)||(18239179-18239253)
chr4 (85-142)||(9871071-9871128)
chr4 (313-402)||(13591785-13591874)
chr4 (313-406)||(32306854-32306947)
chr4 (85-154)||(44772650-44772719)
chr4 (31-99)||(9886387-9886455)
chr4 (85-171)||(17376062-17376148)
chr4 (85-175)||(18247739-18247829)
chr4 (85-175)||(22355079-22355169)
chr4 (85-175)||(47357183-47357273)
chr4 (318-404)||(54798627-54798713)
chr4 (85-137)||(14873653-14873705)
chr4 (85-149)||(14951296-14951360)
chr4 (29-100)||(13234547-13234618)
chr4 (321-404)||(14280474-14280557)
chr4 (315-358)||(26789555-26789598)
chr4 (89-175)||(17146303-17146389)
chr4 (85-166)||(15287878-15287959)
chr4 (85-166)||(15294988-15295069)
chr4 (272-317)||(26922254-26922299)
chr4 (315-359)||(15791990-15792034)
chr4 (85-149)||(55377205-55377269)
chr4 (50-101)||(12230500-12230551)
chr4 (85-175)||(10643746-10643836)
chr4 (85-175)||(19020009-19020099)
chr4 (352-402)||(44928821-44928871)
chr4 (318-383)||(8574742-8574807)
chr4 (255-316)||(12134425-12134486)
chr4 (352-397)||(20157189-20157234)
chr4 (352-381)||(44102404-44102433)
chr4 (85-149)||(5683375-5683439)
chr4 (85-121)||(8374094-8374130)
chr4 (85-117)||(12622936-12622968)
chr4 (85-149)||(14995670-14995734)
chr4 (85-149)||(16731702-16731766)
chr4 (85-121)||(18168347-18168383)
[»] chr2 (110 HSPs)
chr2 (25-431)||(27472567-27472969)
chr2 (25-431)||(34873783-34874185)
chr2 (25-362)||(34858721-34859058)
chr2 (85-431)||(18358365-18358706)
chr2 (85-431)||(22173424-22173766)
chr2 (85-431)||(21081367-21081709)
chr2 (25-321)||(20915525-20915821)
chr2 (85-349)||(41301369-41301633)
chr2 (85-338)||(26903561-26903814)
chr2 (85-317)||(23969019-23969251)
chr2 (85-338)||(21915025-21915278)
chr2 (85-325)||(25183603-25183843)
chr2 (89-317)||(43707685-43707912)
chr2 (86-317)||(24273656-24273887)
chr2 (85-317)||(9975353-9975585)
chr2 (85-317)||(24781236-24781468)
chr2 (85-343)||(24883785-24884042)
chr2 (85-350)||(31520509-31520773)
chr2 (85-317)||(5031526-5031758)
chr2 (85-317)||(27484866-27485098)
chr2 (85-317)||(36839595-36839827)
chr2 (85-332)||(18388693-18388940)
chr2 (85-381)||(23338796-23339092)
chr2 (85-356)||(19662051-19662322)
chr2 (85-356)||(21073123-21073394)
chr2 (86-330)||(10039531-10039775)
chr2 (85-317)||(17306911-17307143)
chr2 (85-316)||(21368532-21368763)
chr2 (85-316)||(19201596-19201828)
chr2 (85-356)||(9242145-9242416)
chr2 (85-323)||(20590718-20590956)
chr2 (89-313)||(6482946-6483171)
chr2 (89-313)||(6486413-6486638)
chr2 (85-310)||(9785013-9785238)
chr2 (85-381)||(28349268-28349573)
chr2 (85-356)||(6260774-6261045)
chr2 (88-310)||(23068849-23069071)
chr2 (85-310)||(28652898-28653123)
chr2 (85-317)||(24515610-24515842)
chr2 (85-321)||(22690101-22690336)
chr2 (85-321)||(22694697-22694932)
chr2 (85-317)||(21316058-21316289)
chr2 (88-317)||(21335852-21336080)
chr2 (127-317)||(29113786-29113975)
chr2 (85-242)||(1384082-1384239)
chr2 (85-340)||(2524143-2524380)
chr2 (85-317)||(22686264-22686495)
chr2 (96-242)||(25587094-25587240)
chr2 (189-431)||(31345264-31345495)
chr2 (85-204)||(20261696-20261815)
chr2 (55-317)||(22332142-22332402)
chr2 (85-204)||(10684329-10684448)
chr2 (85-242)||(23778691-23778849)
chr2 (85-204)||(38967956-38968075)
chr2 (85-227)||(28345472-28345614)
chr2 (128-317)||(23609901-23610089)
chr2 (85-196)||(40911868-40911979)
chr2 (313-402)||(23004923-23005012)
chr2 (89-200)||(31345661-31345771)
chr2 (86-204)||(24897763-24897881)
chr2 (86-204)||(24900246-24900364)
chr2 (86-204)||(24902723-24902841)
chr2 (86-204)||(24905200-24905318)
chr2 (86-204)||(24907675-24907793)
chr2 (313-406)||(26392550-26392643)
chr2 (219-356)||(30643811-30643948)
chr2 (85-176)||(22255777-22255868)
chr2 (235-350)||(22501260-22501374)
chr2 (235-350)||(22509194-22509308)
chr2 (86-204)||(23136056-23136174)
chr2 (313-402)||(22412994-22413083)
chr2 (85-164)||(18809459-18809538)
chr2 (313-400)||(20520051-20520138)
chr2 (85-316)||(22786694-22786924)
chr2 (85-164)||(28577615-28577694)
chr2 (85-242)||(20272855-20273012)
chr2 (85-165)||(7186942-7187022)
chr2 (85-164)||(23711580-23711659)
chr2 (315-402)||(24697467-24697553)
chr2 (85-164)||(26505895-26505974)
chr2 (85-164)||(26508373-26508452)
chr2 (85-164)||(27920331-27920410)
chr2 (85-164)||(32039065-32039144)
chr2 (85-159)||(571919-571993)
chr2 (85-179)||(36734881-36734975)
chr2 (85-159)||(39682835-39682909)
chr2 (85-166)||(22501375-22501456)
chr2 (85-166)||(22509309-22509390)
chr2 (313-431)||(23287511-23287625)
chr2 (85-164)||(23131378-23131457)
chr2 (85-164)||(23133845-23133924)
chr2 (85-164)||(34402089-34402168)
chr2 (85-175)||(19887294-19887384)
chr2 (272-317)||(24841377-24841422)
chr2 (313-351)||(18546803-18546841)
chr2 (288-338)||(34492091-34492141)
chr2 (357-402)||(23708521-23708566)
chr2 (127-264)||(28031919-28032056)
chr2 (85-149)||(16900841-16900905)
chr2 (85-149)||(16994232-16994296)
chr2 (85-241)||(24302220-24302374)
chr2 (85-121)||(24383131-24383167)
chr2 (85-149)||(34823776-34823840)
chr2 (59-97)||(22497852-22497890)
chr2 (85-121)||(11232232-11232268)
chr2 (33-97)||(19445355-19445419)
chr2 (85-121)||(22514079-22514115)
chr2 (85-121)||(23760032-23760068)
chr2 (85-121)||(28776681-28776717)
chr2 (315-359)||(43947232-43947276)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (25-431)||(67408-67810)
scaffold0032 (129-241)||(62410-62522)
scaffold0032 (85-316)||(116801-117032)
[»] chr7 (176 HSPs)
chr7 (25-431)||(46580260-46580648)
chr7 (25-338)||(48812241-48812554)
chr7 (85-431)||(13647554-13647898)
chr7 (85-383)||(18456044-18456342)
chr7 (86-431)||(16998740-16999087)
chr7 (85-338)||(708951-709204)
chr7 (85-343)||(58814-59071)
chr7 (85-350)||(8756792-8757056)
chr7 (85-338)||(16462439-16462692)
chr7 (85-317)||(14415880-14416112)
chr7 (85-338)||(32160598-32160851)
chr7 (85-338)||(14191484-14191735)
chr7 (85-343)||(30820652-30820910)
chr7 (201-431)||(14273662-14273888)
chr7 (85-338)||(47975307-47975560)
chr7 (85-365)||(16550400-16550679)
chr7 (85-365)||(16614983-16615262)
chr7 (85-338)||(14188690-14188941)
chr7 (85-323)||(15213917-15214155)
chr7 (85-330)||(17070689-17070934)
chr7 (85-317)||(13745172-13745404)
chr7 (85-317)||(44374370-44374602)
chr7 (85-317)||(44383235-44383467)
chr7 (85-317)||(46386483-46386715)
chr7 (85-330)||(47094491-47094736)
chr7 (85-317)||(12371699-12371931)
chr7 (85-317)||(12465656-12465888)
chr7 (85-313)||(15167403-15167631)
chr7 (85-344)||(13408170-13408428)
chr7 (85-340)||(17505400-17505655)
chr7 (85-340)||(17547559-17547814)
chr7 (85-343)||(36685645-36685904)
chr7 (85-343)||(832419-832676)
chr7 (85-343)||(1197599-1197856)
chr7 (85-350)||(13699285-13699549)
chr7 (85-330)||(40555139-40555384)
chr7 (85-317)||(11066892-11067124)
chr7 (85-317)||(14928728-14928960)
chr7 (85-317)||(15352194-15352426)
chr7 (85-317)||(19282516-19282748)
chr7 (85-349)||(29004214-29004478)
chr7 (85-317)||(33001338-33001570)
chr7 (85-356)||(18872545-18872816)
chr7 (89-343)||(12755106-12755359)
chr7 (85-313)||(10896390-10896618)
chr7 (85-317)||(13147868-13148100)
chr7 (85-321)||(32433985-32434221)
chr7 (85-333)||(34957579-34957827)
chr7 (85-316)||(8851555-8851786)
chr7 (85-356)||(16008763-16009034)
chr7 (85-328)||(38828474-38828717)
chr7 (85-350)||(4325448-4325712)
chr7 (89-317)||(48743727-48743955)
chr7 (85-356)||(11661491-11661761)
chr7 (85-343)||(37727323-37727580)
chr7 (85-310)||(32301613-32301838)
chr7 (85-309)||(32771760-32771984)
chr7 (85-356)||(147803-148074)
chr7 (85-356)||(14422170-14422441)
chr7 (85-356)||(14566387-14566658)
chr7 (85-310)||(16580091-16580316)
chr7 (89-321)||(14153372-14153603)
chr7 (85-356)||(18607672-18607943)
chr7 (89-310)||(14258783-14259004)
chr7 (85-317)||(20585780-20586008)
chr7 (85-289)||(12323326-12323530)
chr7 (155-315)||(15119761-15119921)
chr7 (85-313)||(20619714-20619942)
chr7 (85-317)||(12127559-12127792)
chr7 (85-266)||(29052551-29052732)
chr7 (128-310)||(16585390-16585572)
chr7 (85-317)||(24270378-24270609)
chr7 (85-317)||(39292133-39292364)
chr7 (85-344)||(13864791-13865040)
chr7 (161-317)||(13745672-13745828)
chr7 (85-317)||(18875242-18875474)
chr7 (85-240)||(15720250-15720405)
chr7 (164-310)||(16460407-16460553)
chr7 (85-317)||(43277139-43277372)
chr7 (188-431)||(13918266-13918498)
chr7 (85-317)||(4691292-4691523)
chr7 (85-317)||(14161251-14161482)
chr7 (85-317)||(48213341-48213572)
chr7 (85-316)||(15978452-15978682)
chr7 (189-431)||(25926993-25927224)
chr7 (85-321)||(8514142-8514377)
chr7 (85-317)||(21538585-21538816)
chr7 (85-317)||(25941862-25942093)
chr7 (85-242)||(3287489-3287646)
chr7 (313-431)||(9177524-9177638)
chr7 (96-316)||(3192700-3192920)
chr7 (185-317)||(13894519-13894651)
chr7 (98-317)||(20252751-20252969)
chr7 (85-315)||(9743477-9743706)
chr7 (313-431)||(17017326-17017440)
chr7 (85-204)||(1856796-1856915)
chr7 (85-204)||(23664519-23664638)
chr7 (96-242)||(18080125-18080271)
chr7 (25-197)||(11309853-11310025)
chr7 (85-204)||(11303724-11303843)
chr7 (85-204)||(13917969-13918088)
chr7 (85-204)||(29800906-29801025)
chr7 (25-115)||(11091080-11091170)
chr7 (85-179)||(13897808-13897902)
chr7 (89-317)||(15576233-15576458)
chr7 (313-401)||(14044922-14045010)
chr7 (313-401)||(14354952-14355040)
chr7 (196-316)||(28719885-28720005)
chr7 (85-204)||(16108255-16108374)
chr7 (85-204)||(25926696-25926815)
chr7 (85-204)||(29797087-29797206)
chr7 (313-402)||(16091930-16092019)
chr7 (330-431)||(1858707-1858804)
chr7 (212-310)||(20487874-20487972)
chr7 (313-386)||(14036387-14036460)
chr7 (313-386)||(14346417-14346490)
chr7 (313-431)||(17060282-17060396)
chr7 (333-406)||(48991349-48991422)
chr7 (85-169)||(44190645-44190729)
chr7 (85-204)||(32125967-32126086)
chr7 (86-204)||(41523394-41523512)
chr7 (86-204)||(41525856-41525974)
chr7 (85-164)||(15376280-15376359)
chr7 (85-204)||(18431188-18431307)
chr7 (85-164)||(20384690-20384769)
chr7 (86-204)||(24702705-24702823)
chr7 (86-204)||(24705152-24705270)
chr7 (85-237)||(46473562-46473714)
chr7 (85-164)||(27217377-27217456)
chr7 (85-159)||(456843-456917)
chr7 (352-431)||(2529951-2530026)
chr7 (85-159)||(11392866-11392940)
chr7 (85-179)||(37538970-37539064)
chr7 (313-402)||(15008357-15008446)
chr7 (85-317)||(8563987-8564218)
chr7 (85-149)||(14105863-14105927)
chr7 (89-204)||(14948693-14948808)
chr7 (85-159)||(16233042-16233116)
chr7 (85-164)||(13869864-13869941)
chr7 (85-169)||(39431624-39431707)
chr7 (89-164)||(16410575-16410650)
chr7 (86-164)||(26355549-26355627)
chr7 (86-164)||(26358001-26358079)
chr7 (313-402)||(9725518-9725607)
chr7 (85-149)||(10001004-10001068)
chr7 (261-317)||(15720200-15720256)
chr7 (166-321)||(3136715-3136869)
chr7 (319-431)||(16996369-16996477)
chr7 (85-148)||(20487973-20488036)
chr7 (189-251)||(1857092-1857154)
chr7 (333-402)||(1867874-1867942)
chr7 (318-404)||(48273550-48273636)
chr7 (357-402)||(2280021-2280066)
chr7 (85-218)||(16065970-16066103)
chr7 (272-317)||(21675491-21675536)
chr7 (85-217)||(12191849-12191981)
chr7 (99-171)||(21660587-21660659)
chr7 (85-149)||(28720041-28720105)
chr7 (29-100)||(16379749-16379820)
chr7 (85-148)||(18628098-18628161)
chr7 (85-148)||(18640804-18640867)
chr7 (320-394)||(12255657-12255731)
chr7 (85-175)||(15760758-15760848)
chr7 (260-305)||(1858644-1858689)
chr7 (313-350)||(9033204-9033241)
chr7 (85-118)||(19194774-19194807)
chr7 (85-149)||(125991-126055)
chr7 (85-121)||(7822067-7822103)
chr7 (85-121)||(7829378-7829414)
chr7 (85-149)||(11287002-11287066)
chr7 (85-121)||(16383172-16383208)
chr7 (85-121)||(27102531-27102567)
chr7 (85-121)||(27109879-27109915)
chr7 (85-121)||(27175759-27175795)
chr7 (386-431)||(32301435-32301476)
chr7 (85-121)||(38784623-38784659)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (25-338)||(11100-11413)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (85-431)||(307-649)
[»] chr6 (124 HSPs)
chr6 (25-350)||(27851394-27851719)
chr6 (25-350)||(20733783-20734107)
chr6 (85-402)||(15817154-15817469)
chr6 (85-431)||(25619353-25619695)
chr6 (85-431)||(14979018-14979360)
chr6 (85-431)||(20556489-20556831)
chr6 (85-317)||(28947768-28948000)
chr6 (85-350)||(18658598-18658862)
chr6 (85-338)||(23956265-23956518)
chr6 (85-365)||(15173851-15174130)
chr6 (71-315)||(18928149-18928393)
chr6 (85-321)||(5834131-5834366)
chr6 (85-343)||(611139-611396)
chr6 (85-343)||(19825885-19826142)
chr6 (85-317)||(7827396-7827628)
chr6 (85-317)||(19655625-19655857)
chr6 (85-321)||(20177166-20177401)
chr6 (85-317)||(23491567-23491799)
chr6 (85-317)||(23497165-23497397)
chr6 (89-317)||(18708923-18709151)
chr6 (85-321)||(22158590-22158825)
chr6 (85-365)||(13764730-13765002)
chr6 (85-317)||(17318518-17318750)
chr6 (89-317)||(18702988-18703216)
chr6 (85-317)||(23150663-23150894)
chr6 (85-316)||(25601673-25601904)
chr6 (85-283)||(1254215-1254413)
chr6 (85-330)||(29847899-29848146)
chr6 (85-304)||(15891107-15891326)
chr6 (85-311)||(8767659-8767885)
chr6 (85-311)||(25347556-25347782)
chr6 (85-310)||(19773105-19773330)
chr6 (85-310)||(15705007-15705232)
chr6 (85-317)||(31734132-31734362)
chr6 (85-321)||(20182984-20183219)
chr6 (85-321)||(22152772-22153007)
chr6 (85-356)||(4477043-4477314)
chr6 (85-276)||(23655804-23655995)
chr6 (85-317)||(27125872-27126105)
chr6 (85-328)||(16133066-16133309)
chr6 (89-328)||(19443681-19443919)
chr6 (85-311)||(8759913-8760138)
chr6 (89-274)||(755-940)
chr6 (55-313)||(27317919-27318179)
chr6 (85-343)||(34296664-34296923)
chr6 (85-259)||(31022093-31022267)
chr6 (85-317)||(18455468-18455699)
chr6 (85-317)||(25921154-25921385)
chr6 (85-271)||(25807602-25807788)
chr6 (265-431)||(25752864-25753026)
chr6 (265-431)||(25755034-25755196)
chr6 (89-321)||(20411072-20411303)
chr6 (85-317)||(32259272-32259502)
chr6 (188-431)||(27556790-27557022)
chr6 (190-431)||(23415032-23415262)
chr6 (89-242)||(29044809-29044962)
chr6 (313-431)||(33443193-33443307)
chr6 (85-195)||(7430069-7430179)
chr6 (85-242)||(34141023-34141178)
chr6 (85-242)||(34153639-34153794)
chr6 (85-242)||(18585117-18585274)
chr6 (85-314)||(22556676-22556905)
chr6 (88-316)||(17857091-17857319)
chr6 (85-317)||(18398343-18398574)
chr6 (85-293)||(23838447-23838655)
chr6 (85-314)||(13285136-13285364)
chr6 (85-204)||(12942666-12942785)
chr6 (313-402)||(18696660-18696749)
chr6 (85-204)||(28288903-28289022)
chr6 (85-195)||(14594021-14594131)
chr6 (313-427)||(20224095-20224205)
chr6 (313-427)||(22118079-22118189)
chr6 (85-214)||(22806276-22806405)
chr6 (85-204)||(23415441-23415560)
chr6 (85-205)||(27330368-27330488)
chr6 (85-205)||(27391108-27391228)
chr6 (313-402)||(18706478-18706568)
chr6 (89-204)||(19858493-19858608)
chr6 (85-321)||(15938622-15938857)
chr6 (85-204)||(27557199-27557318)
chr6 (85-319)||(23221288-23221521)
chr6 (86-204)||(33862270-33862388)
chr6 (85-204)||(1540478-1540597)
chr6 (89-204)||(15891979-15892094)
chr6 (85-164)||(18334159-18334238)
chr6 (85-164)||(24423063-24423142)
chr6 (85-179)||(35057066-35057160)
chr6 (85-164)||(33864794-33864873)
chr6 (85-159)||(2290747-2290821)
chr6 (85-159)||(8055551-8055625)
chr6 (86-204)||(17883065-17883183)
chr6 (86-164)||(26924015-26924093)
chr6 (85-164)||(22782743-22782822)
chr6 (90-204)||(12742794-12742908)
chr6 (85-168)||(19234658-19234741)
chr6 (89-175)||(25175112-25175198)
chr6 (85-175)||(27654616-27654706)
chr6 (244-316)||(16135519-16135591)
chr6 (318-402)||(16448435-16448519)
chr6 (85-172)||(16135613-16135699)
chr6 (313-359)||(20078033-20078079)
chr6 (85-171)||(31163536-31163622)
chr6 (313-402)||(18453355-18453444)
chr6 (108-315)||(22523388-22523594)
chr6 (85-171)||(3007508-3007594)
chr6 (85-175)||(16826387-16826477)
chr6 (85-175)||(21776115-21776205)
chr6 (108-242)||(31161878-31162012)
chr6 (353-402)||(19362598-19362646)
chr6 (128-228)||(32277441-32277541)
chr6 (85-175)||(1555527-1555617)
chr6 (352-402)||(18456888-18456938)
chr6 (352-402)||(25644495-25644545)
chr6 (353-402)||(8227409-8227458)
chr6 (315-356)||(17229776-17229817)
chr6 (353-402)||(18896215-18896263)
chr6 (85-134)||(19609621-19609670)
chr6 (85-121)||(10488025-10488061)
chr6 (85-149)||(16240322-16240386)
chr6 (85-121)||(16377267-16377303)
chr6 (85-121)||(16384591-16384627)
chr6 (85-149)||(22226588-22226652)
chr6 (85-149)||(25904501-25904565)
chr6 (85-121)||(33315095-33315131)
[»] chr5 (104 HSPs)
chr5 (85-431)||(6765976-6766317)
chr5 (85-383)||(22412365-22412662)
chr5 (89-431)||(30138564-30138901)
chr5 (85-405)||(29448174-29448494)
chr5 (85-383)||(18418770-18419068)
chr5 (85-350)||(24277002-24277266)
chr5 (85-350)||(24384947-24385211)
chr5 (89-343)||(17812795-17813048)
chr5 (85-338)||(263260-263513)
chr5 (89-338)||(33472964-33473213)
chr5 (85-317)||(32607721-32607953)
chr5 (85-343)||(36460368-36460626)
chr5 (85-314)||(21399400-21399628)
chr5 (85-365)||(17011102-17011382)
chr5 (85-317)||(41875989-41876221)
chr5 (85-315)||(26761827-26762057)
chr5 (85-330)||(17875410-17875655)
chr5 (85-317)||(20197982-20198216)
chr5 (85-317)||(20565978-20566210)
chr5 (85-356)||(38145134-38145405)
chr5 (85-317)||(19921058-19921289)
chr5 (85-317)||(27868971-27869203)
chr5 (85-315)||(8833603-8833824)
chr5 (85-343)||(31456196-31456454)
chr5 (85-343)||(21557440-21557699)
chr5 (85-356)||(28370652-28370923)
chr5 (85-313)||(22750372-22750597)
chr5 (85-313)||(19511614-19511843)
chr5 (107-315)||(33895300-33895508)
chr5 (85-356)||(42960761-42961033)
chr5 (85-356)||(37598513-37598784)
chr5 (85-381)||(22758286-22758583)
chr5 (85-240)||(40917369-40917524)
chr5 (85-323)||(21554775-21555013)
chr5 (85-317)||(16062910-16063141)
chr5 (86-317)||(36509181-36509405)
chr5 (85-313)||(22336748-22336976)
chr5 (86-317)||(8504266-8504496)
chr5 (85-317)||(16605000-16605231)
chr5 (85-313)||(22340286-22340514)
chr5 (85-317)||(18744074-18744305)
chr5 (85-317)||(14026204-14026435)
chr5 (85-212)||(24617319-24617446)
chr5 (85-212)||(24713550-24713677)
chr5 (85-212)||(24746578-24746705)
chr5 (85-195)||(43243054-43243164)
chr5 (85-242)||(23199788-23199942)
chr5 (85-317)||(1627777-1628008)
chr5 (85-204)||(37804469-37804588)
chr5 (85-212)||(24668593-24668720)
chr5 (85-212)||(24738362-24738489)
chr5 (85-212)||(24751131-24751258)
chr5 (85-316)||(28901346-28901576)
chr5 (85-316)||(28937741-28937971)
chr5 (155-317)||(22111024-22111185)
chr5 (85-242)||(17908966-17909123)
chr5 (244-343)||(12122077-12122175)
chr5 (85-204)||(29351402-29351521)
chr5 (86-204)||(10732508-10732626)
chr5 (55-164)||(20909528-20909637)
chr5 (85-164)||(264335-264414)
chr5 (85-164)||(23065030-23065109)
chr5 (315-406)||(25576716-25576807)
chr5 (85-204)||(29346456-29346575)
chr5 (85-204)||(29348929-29349048)
chr5 (86-204)||(42244933-42245051)
chr5 (313-431)||(26740505-26740619)
chr5 (319-431)||(26732698-26732806)
chr5 (85-164)||(39245652-39245731)
chr5 (313-402)||(23469975-23470064)
chr5 (55-164)||(38619952-38620061)
chr5 (318-402)||(18318942-18319026)
chr5 (315-406)||(25574330-25574421)
chr5 (315-406)||(25575523-25575614)
chr5 (85-312)||(31478801-31479026)
chr5 (85-175)||(11903-11993)
chr5 (85-175)||(25426177-25426267)
chr5 (184-317)||(30613937-30614069)
chr5 (313-376)||(20572086-20572149)
chr5 (85-164)||(39363900-39363979)
chr5 (55-101)||(13938457-13938503)
chr5 (85-175)||(35791744-35791834)
chr5 (86-175)||(21074229-21074318)
chr5 (272-321)||(26749534-26749583)
chr5 (184-317)||(30611977-30612109)
chr5 (85-149)||(22367114-22367178)
chr5 (59-94)||(25582095-25582130)
chr5 (85-166)||(7424886-7424967)
chr5 (318-383)||(20765993-20766058)
chr5 (85-149)||(27183188-27183252)
chr5 (85-149)||(43444028-43444092)
chr5 (85-176)||(7528427-7528518)
chr5 (85-116)||(19499487-19499518)
chr5 (85-147)||(9776699-9776761)
chr5 (85-175)||(11342190-11342280)
chr5 (85-175)||(18778625-18778715)
chr5 (85-149)||(1168811-1168875)
chr5 (85-149)||(1220363-1220427)
chr5 (85-121)||(21933262-21933298)
chr5 (85-121)||(21939432-21939468)
chr5 (85-149)||(23506529-23506593)
chr5 (53-101)||(23908687-23908735)
chr5 (85-121)||(35581394-35581430)
chr5 (85-121)||(36990658-36990694)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (85-431)||(331-672)
[»] scaffold0153 (2 HSPs)
scaffold0153 (25-270)||(4568-4813)
scaffold0153 (25-179)||(11679-11833)
[»] chr1 (82 HSPs)
chr1 (85-431)||(22130461-22130803)
chr1 (85-431)||(13881012-13881354)
chr1 (85-431)||(45574448-45574779)
chr1 (85-350)||(21180721-21180985)
chr1 (85-350)||(24815248-24815512)
chr1 (85-330)||(44822518-44822763)
chr1 (85-317)||(21239691-21239923)
chr1 (85-331)||(50000883-50001130)
chr1 (85-317)||(7052451-7052684)
chr1 (85-342)||(20031286-20031543)
chr1 (85-338)||(46198121-46198374)
chr1 (85-317)||(20588103-20588335)
chr1 (85-317)||(20592641-20592873)
chr1 (85-350)||(8276388-8276652)
chr1 (93-317)||(14238016-14238240)
chr1 (85-356)||(28312733-28313004)
chr1 (85-350)||(7792248-7792512)
chr1 (85-317)||(38887483-38887716)
chr1 (85-309)||(19676143-19676367)
chr1 (89-317)||(41227104-41227332)
chr1 (85-309)||(42912482-42912706)
chr1 (89-317)||(51082640-51082868)
chr1 (85-328)||(2332606-2332849)
chr1 (86-317)||(51323699-51323930)
chr1 (85-317)||(21046445-21046677)
chr1 (85-338)||(29764030-29764287)
chr1 (85-350)||(16401060-16401324)
chr1 (85-317)||(20634030-20634263)
chr1 (85-317)||(4596241-4596473)
chr1 (85-317)||(12710312-12710544)
chr1 (85-317)||(16058710-16058942)
chr1 (89-317)||(41225851-41226079)
chr1 (85-317)||(45496369-45496602)
chr1 (85-381)||(296715-297011)
chr1 (85-350)||(22349980-22350244)
chr1 (85-311)||(23194947-23195173)
chr1 (85-356)||(20437623-20437894)
chr1 (88-343)||(38057050-38057304)
chr1 (85-321)||(14792958-14793193)
chr1 (85-317)||(22823803-22824034)
chr1 (85-317)||(50544276-50544507)
chr1 (85-317)||(1643020-1643249)
chr1 (85-317)||(39060520-39060752)
chr1 (85-313)||(16372178-16372407)
chr1 (85-317)||(24720090-24720321)
chr1 (85-321)||(44891869-44892103)
chr1 (85-242)||(9784739-9784896)
chr1 (85-317)||(17902158-17902389)
chr1 (313-431)||(27653081-27653195)
chr1 (313-406)||(20345973-20346066)
chr1 (85-317)||(18121029-18121260)
chr1 (85-196)||(21659689-21659800)
chr1 (162-381)||(294396-294624)
chr1 (85-204)||(13227340-13227459)
chr1 (135-242)||(6833713-6833820)
chr1 (85-316)||(16655793-16656023)
chr1 (85-204)||(29535528-29535647)
chr1 (86-204)||(16362395-16362513)
chr1 (86-204)||(21841243-21841361)
chr1 (86-204)||(21922859-21922977)
chr1 (85-197)||(10812765-10812877)
chr1 (86-204)||(41372948-41373066)
chr1 (85-164)||(13989382-13989461)
chr1 (319-404)||(16093748-16093833)
chr1 (313-402)||(52940736-52940825)
chr1 (86-194)||(23593301-23593409)
chr1 (315-431)||(21533735-21533846)
chr1 (313-400)||(26065114-26065201)
chr1 (85-159)||(21474653-21474727)
chr1 (313-402)||(35260939-35261028)
chr1 (320-395)||(16758831-16758906)
chr1 (85-175)||(22366527-22366617)
chr1 (96-171)||(20708730-20708805)
chr1 (315-431)||(21043142-21043254)
chr1 (315-402)||(22124458-22124545)
chr1 (315-359)||(47190817-47190861)
chr1 (313-356)||(48520787-48520830)
chr1 (312-350)||(42697112-42697150)
chr1 (330-402)||(14800707-14800779)
chr1 (330-402)||(14809581-14809653)
chr1 (85-121)||(17003963-17003999)
chr1 (85-149)||(21650889-21650953)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (93-431)||(105228-105560)
scaffold0023 (85-378)||(162647-162940)
scaffold0023 (85-164)||(94927-95006)
scaffold0023 (88-147)||(17202-17261)
scaffold0023 (85-133)||(154871-154919)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (84-431)||(12283-12626)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (85-431)||(565-905)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (85-431)||(15890-16229)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (90-431)||(1510-1847)
scaffold0125 (85-317)||(27724-27956)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (86-431)||(82301-82641)
[»] scaffold0371 (2 HSPs)
scaffold0371 (85-315)||(10843-11073)
scaffold0371 (185-277)||(17223-17315)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (85-350)||(19040-19304)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (85-338)||(21484-21737)
scaffold0026 (85-356)||(110872-111143)
scaffold0026 (85-317)||(146156-146388)
scaffold0026 (85-311)||(123956-124182)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (85-338)||(176195-176448)
scaffold0001 (85-334)||(168846-169095)
scaffold0001 (89-342)||(152610-152863)
scaffold0001 (85-330)||(77098-77343)
[»] scaffold0338 (3 HSPs)
scaffold0338 (85-338)||(3338-3591)
scaffold0338 (85-159)||(1-75)
scaffold0338 (85-149)||(8592-8656)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (85-365)||(5835-6114)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (85-330)||(3117-3362)
[»] scaffold0108 (3 HSPs)
scaffold0108 (89-330)||(5828-6069)
scaffold0108 (85-317)||(7179-7409)
scaffold0108 (313-356)||(3395-3438)
[»] scaffold0051 (3 HSPs)
scaffold0051 (85-314)||(64465-64694)
scaffold0051 (189-431)||(31271-31502)
scaffold0051 (85-204)||(31680-31799)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (85-317)||(21679-21911)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (85-317)||(28764-28996)
scaffold0180 (85-179)||(9997-10091)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (85-317)||(78488-78720)
scaffold0047 (313-431)||(22426-22540)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (85-356)||(9352-9623)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (85-343)||(395-653)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (85-378)||(2702-2994)
scaffold0109 (85-317)||(373-605)
scaffold0109 (89-315)||(5680-5906)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (85-317)||(5109-5341)
scaffold0737 (89-341)||(6077-6330)
[»] scaffold0672 (1 HSPs)
scaffold0672 (89-317)||(7956-8184)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (85-338)||(4433-4690)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (85-338)||(4433-4690)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (107-431)||(169415-169722)
scaffold0020 (86-316)||(143038-143268)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (85-327)||(8478-8720)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (85-310)||(5722-5947)
[»] scaffold0077 (6 HSPs)
scaffold0077 (85-381)||(22929-23225)
scaffold0077 (85-289)||(33791-33995)
scaffold0077 (85-311)||(17653-17879)
scaffold0077 (85-274)||(22575-22765)
scaffold0077 (185-311)||(23386-23512)
scaffold0077 (313-356)||(55543-55586)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (85-317)||(14982-15214)
scaffold0061 (85-317)||(24040-24272)
[»] scaffold1766 (1 HSPs)
scaffold1766 (107-398)||(1112-1390)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (86-317)||(58172-58403)
scaffold0064 (85-204)||(68438-68557)
[»] scaffold0335 (2 HSPs)
scaffold0335 (85-315)||(1130-1360)
scaffold0335 (85-149)||(6215-6279)
[»] scaffold0123 (4 HSPs)
scaffold0123 (85-359)||(6407-6681)
scaffold0123 (316-402)||(710-796)
scaffold0123 (314-431)||(25255-25367)
scaffold0123 (154-317)||(16362-16524)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (85-343)||(159346-159603)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (85-313)||(6984-7213)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (85-338)||(11903-12156)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (85-317)||(863-1095)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (85-317)||(39523-39755)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (90-316)||(1332-1558)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (85-315)||(5063-5293)
[»] scaffold0546 (3 HSPs)
scaffold0546 (89-315)||(7401-7627)
scaffold0546 (85-195)||(10313-10423)
scaffold0546 (269-317)||(11219-11267)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (55-317)||(9479-9741)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (88-338)||(70227-70477)
scaffold0057 (85-217)||(71935-72067)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (85-350)||(6191-6455)
[»] scaffold0632 (1 HSPs)
scaffold0632 (85-317)||(589-821)
[»] scaffold0220 (3 HSPs)
scaffold0220 (86-330)||(16175-16419)
scaffold0220 (85-330)||(13357-13602)
scaffold0220 (96-291)||(8686-8881)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (85-317)||(21157-21389)
scaffold0106 (313-356)||(19505-19548)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (85-317)||(22187-22419)
scaffold0080 (89-349)||(29124-29384)
scaffold0080 (89-349)||(34589-34849)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (85-365)||(22165-22444)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (25-210)||(767-952)
scaffold0686 (85-149)||(6949-7013)
[»] scaffold0452 (2 HSPs)
scaffold0452 (85-310)||(13061-13286)
scaffold0452 (85-316)||(8046-8277)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (89-286)||(106603-106800)
[»] scaffold0635 (1 HSPs)
scaffold0635 (86-330)||(7295-7539)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (85-317)||(1509-1741)
scaffold0334 (85-253)||(4-172)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (86-330)||(8468-8712)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (127-317)||(7823-8013)
[»] scaffold0462 (3 HSPs)
scaffold0462 (85-325)||(10636-10877)
scaffold0462 (85-321)||(740-974)
scaffold0462 (85-321)||(6246-6480)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (85-317)||(3843-4076)
scaffold0439 (89-317)||(11583-11811)
[»] scaffold0364 (2 HSPs)
scaffold0364 (96-317)||(7557-7778)
scaffold0364 (29-100)||(13877-13948)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (85-310)||(6944-7169)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (85-310)||(3701-3926)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (85-310)||(21499-21724)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (85-317)||(168861-169094)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (85-310)||(21083-21308)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (89-310)||(126179-126400)
scaffold0011 (85-321)||(32874-33109)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (85-317)||(30036-30268)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (87-343)||(35969-36224)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (85-317)||(7643-7875)
scaffold0104 (85-317)||(14274-14506)
scaffold0104 (85-309)||(26358-26582)
scaffold0104 (85-309)||(27740-27964)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (85-356)||(2123-2394)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (87-345)||(51355-51612)
scaffold0042 (94-222)||(67187-67315)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (85-313)||(10325-10554)
scaffold0039 (85-149)||(19919-19983)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (85-310)||(120341-120566)
scaffold0034 (85-277)||(29593-29785)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (85-317)||(12932-13164)
scaffold0111 (255-317)||(19369-19431)
[»] scaffold0083 (4 HSPs)
scaffold0083 (85-317)||(378-610)
scaffold0083 (85-317)||(5682-5914)
scaffold0083 (85-196)||(1480-1591)
scaffold0083 (85-121)||(11401-11437)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (138-314)||(8752-8928)
[»] scaffold0241 (3 HSPs)
scaffold0241 (85-317)||(1988-2220)
scaffold0241 (85-237)||(5413-5565)
scaffold0241 (229-317)||(5141-5229)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (97-381)||(138135-138419)
[»] scaffold0529 (2 HSPs)
scaffold0529 (135-317)||(7941-8123)
scaffold0529 (175-286)||(8152-8263)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (85-314)||(632-861)
[»] scaffold0019 (4 HSPs)
scaffold0019 (85-402)||(133089-133406)
scaffold0019 (96-356)||(133571-133831)
scaffold0019 (138-317)||(29582-29761)
scaffold0019 (85-176)||(33803-33894)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (85-284)||(23600-23799)
[»] scaffold0146 (2 HSPs)
scaffold0146 (166-317)||(22482-22633)
scaffold0146 (85-142)||(22627-22684)
[»] scaffold1186 (1 HSPs)
scaffold1186 (85-317)||(1135-1367)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (85-321)||(65377-65612)
scaffold0054 (312-359)||(75686-75733)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (85-317)||(186901-187133)
scaffold0005 (313-431)||(13979-14093)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (89-317)||(66432-66660)
[»] scaffold1160 (1 HSPs)
scaffold1160 (85-321)||(106-341)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (129-285)||(11101-11257)
scaffold0413 (352-381)||(15513-15542)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (127-327)||(12748-12948)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (86-316)||(747-977)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (85-321)||(8240-8476)
[»] scaffold0117 (4 HSPs)
scaffold0117 (85-217)||(21285-21417)
scaffold0117 (189-431)||(39400-39631)
scaffold0117 (86-163)||(42271-42348)
scaffold0117 (158-204)||(39809-39855)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (173-314)||(9711-9851)
scaffold0134 (85-164)||(38338-38417)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (85-321)||(18050-18285)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (85-321)||(62139-62374)
scaffold0063 (85-152)||(39305-39372)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (89-321)||(56397-56628)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (85-317)||(25940-26171)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (189-343)||(21040-21193)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (85-317)||(10135-10356)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (313-431)||(9943-10057)
scaffold0107 (85-149)||(30496-30560)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (85-317)||(18589-18820)
scaffold0213 (85-149)||(28495-28559)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (85-316)||(7931-8162)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (85-317)||(34689-34916)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (85-226)||(2403-2543)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (85-317)||(35913-36144)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (85-316)||(11603-11833)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (313-431)||(3186-3300)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (85-242)||(1-158)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (313-431)||(24456-24570)
scaffold0076 (85-121)||(38429-38465)
[»] scaffold0825 (2 HSPs)
scaffold0825 (85-228)||(1030-1173)
scaffold0825 (247-343)||(1373-1468)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (85-316)||(11614-11844)
[»] scaffold0293 (3 HSPs)
scaffold0293 (188-431)||(19951-20183)
scaffold0293 (85-204)||(19655-19774)
scaffold0293 (313-395)||(17682-17764)
[»] scaffold2015 (1 HSPs)
scaffold2015 (85-195)||(79-189)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (85-242)||(7251-7408)
scaffold0230 (86-204)||(14424-14542)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (313-431)||(4555-4669)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (85-229)||(2449-2593)
scaffold0256 (227-317)||(3059-3149)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (85-205)||(24459-24579)
scaffold0162 (272-321)||(24586-24635)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (85-316)||(2176-2406)
scaffold0409 (85-316)||(10431-10661)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (190-325)||(33334-33469)
scaffold0138 (88-204)||(33648-33764)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (313-424)||(2849-2956)
scaffold0357 (314-402)||(13303-13391)
scaffold0357 (314-402)||(15959-16047)
[»] scaffold0200 (2 HSPs)
scaffold0200 (189-431)||(17721-17952)
scaffold0200 (87-204)||(18130-18247)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (313-431)||(2285-2399)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (313-406)||(8296-8389)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (85-204)||(3500-3619)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (316-431)||(175-286)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (25-115)||(1361-1451)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (313-431)||(3743-3857)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (85-242)||(8016-8173)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (89-242)||(18526-18679)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (85-314)||(32671-32899)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (85-317)||(11743-11974)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (25-115)||(13060-13150)
scaffold0174 (85-242)||(20470-20627)
[»] scaffold0369 (2 HSPs)
scaffold0369 (85-194)||(16384-16493)
scaffold0369 (244-317)||(16525-16598)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (85-315)||(13168-13402)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (85-204)||(8495-8614)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (86-204)||(21225-21343)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (96-223)||(7784-7911)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (85-175)||(9606-9696)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (232-313)||(2377-2458)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (313-402)||(60573-60662)
scaffold0010 (54-101)||(142823-142870)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (85-204)||(6423-6542)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (90-204)||(53-168)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (85-164)||(13909-13988)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (85-164)||(40916-40995)
scaffold0044 (85-148)||(37886-37949)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (85-204)||(11766-11885)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (86-204)||(9718-9836)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (333-405)||(10643-10715)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (313-405)||(520-612)
[»] scaffold0956 (1 HSPs)
scaffold0956 (85-169)||(2319-2403)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (85-169)||(174544-174628)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (314-402)||(27526-27614)
scaffold0165 (352-402)||(27646-27696)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (315-431)||(621-733)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (313-395)||(85726-85807)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (85-321)||(874-1109)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (31-99)||(12089-12157)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (313-395)||(18026-18108)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (259-317)||(2364-2422)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (318-383)||(116608-116673)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (86-121)||(134770-134805)
scaffold0028 (86-121)||(137239-137274)
scaffold0028 (86-121)||(139708-139743)
scaffold0028 (86-121)||(142177-142212)
scaffold0028 (86-121)||(144646-144681)
[»] scaffold1405 (1 HSPs)
scaffold1405 (59-97)||(1214-1252)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (85-149)||(894-958)
[»] scaffold1662 (1 HSPs)
scaffold1662 (269-317)||(1-49)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (85-149)||(936-1000)
[»] scaffold0914 (1 HSPs)
scaffold0914 (315-351)||(1928-1964)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (313-361)||(29282-29330)
[»] scaffold1043 (1 HSPs)
scaffold1043 (54-101)||(856-903)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (127-242)||(17163-17278)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (85-176)||(35026-35117)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (85-134)||(1416-1465)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (315-368)||(10358-10411)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (352-381)||(11659-11688)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (85-149)||(18231-18295)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (85-149)||(53972-54036)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 127)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 431
Target Start/End: Original strand, 19807933 - 19808335
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  19807933 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattagatttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgtaagctttccaatgata 19808032  T
Q  125 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 224  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19808033 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatcctctaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 19808132  T
Q  225 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19808133 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagtt 19808232  T
Q  325 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatt 424  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  19808233 gatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaaactgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatt 19808328  T
Q  425 tgtatat 431  Q
    |||||||    
T  19808329 tgtatat 19808335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 25 - 431
Target Start/End: Original strand, 22237590 - 22237992
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22237590 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggca 22237689  T
Q  125 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 224  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  22237690 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgttgaaaatactccaaggaggtcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttct 22237789  T
Q  225 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237790 aagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattatgttgtttaagagtatttaacctatgttatgagtt 22237889  T
Q  325 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatt 424  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||    
T  22237890 gatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtattatatt 22237985  T
Q  425 tgtatat 431  Q
    |||||||    
T  22237986 tgtatat 22237992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 96 - 431
Target Start/End: Original strand, 17460694 - 17461025
Alignment:
Q  96 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 195  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17460694 tagataattttgttagtttttcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 17460793  T
Q  196 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 295  Q
      || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  17460794 ccttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgt 17460893  T
Q  296 ttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt 395  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17460894 ttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagttgttataatatgattt 17460993  T
Q  396 aatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    ||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  17460994 aatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 17461025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 85 - 431
Target Start/End: Original strand, 25483870 - 25484212
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  25483870 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgcctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 25483969  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25483970 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaacgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaattagaagtactatgagttc 25484069  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  25484070 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctatta 25484169  T
Q  385 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  25484170 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 25484212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Original strand, 15635576 - 15635840
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||     
T  15635576 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggcttttgagatataatgaagatactccaaggagg 15635675  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15635676 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaatcctcaaaactagaagtactatgagttc 15635775  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  15635776 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 15635840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Original strand, 39694924 - 39695188
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  39694924 catgaaaattttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacctgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 39695023  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39695024 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 39695123  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  39695124 aattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 39695188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Original strand, 41680530 - 41680795
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  41680530 catgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctttggattgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 41680629  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41680630 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 41680729  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  41680730 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatggaggttg 41680795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 364444 - 364148
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  364444 catgaaagttgtggataattttgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 364345  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  364344 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 364245  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 381  Q
    || |||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||||| | ||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  364244 aattaaggtgtttaagattatttaatccatgttgtgagttgaaccttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaagctg 364148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19882624 - 19882371
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  19882624 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagttataatgaaaatactccaaggagg 19882525  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  19882524 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcccaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtta 19882425  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  19882424 aattaaggtgtttaagggtatttaacctatgttgtgagttggtccttagggtag 19882371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 381
Target Start/End: Original strand, 44522822 - 44523118
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  44522822 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 44522921  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  44522922 tcttagtgaaatctcatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 44523021  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 381  Q
    || |||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||  ||||||||||    
T  44523022 aattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgacgtgtgaagctg 44523118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11775378 - 11775125
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  11775378 catgaaagttgtagataattttgttagatttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 11775279  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  11775278 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttt 11775179  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  11775178 aattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 11775125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Original strand, 21321676 - 21321968
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |     
T  21321676 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagtttttgataatttggttagctttccaatggct 21321775  T
Q  125 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 224  Q
    | | |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||||| |||| || |||||||||||||||||   ||||    
T  21321776 tagatttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatcaaaatactccaagatggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccagttct 21321875  T
Q  225 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||  || |||| || |||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21321876 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaattataagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgtt 21321968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26454367 - 26454087
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  26454367 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatataatgaaaatactccaaggagg 26454268  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  26454267 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacatcaaaactagaagtattatgagttc 26454168  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 365  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||   |||  |||||||  |||||||||||||    
T  26454167 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttggtccttgggggtagaaacgaggttgtttataatattaatg 26454087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 18024091 - 18024323
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18024091 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatagctttgatttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 18024190  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18024191 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggcatagttccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 18024290  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18024291 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18024323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20454895 - 20454638
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||     
T  20454895 catgaaagttgtagataattgagttagctttccattggctttcatttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcgaaggagg 20454796  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  20454795 tcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattcaaacccacaaaactagaagtactatgagttc 20454696  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  20454695 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 20454638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22207923 - 22207693
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22207923 catgaaagttgtaaataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttgggttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 22207824  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  ||| ||||    
T  22207823 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaaattaatccaaaacttatggaataattccaaacctgaaaactagaagtatcaggggttc 22207724  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 315  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22207723 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 22207693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 85 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18834127 - 18833898
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  18834127 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 18834028  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  18834027 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatcaaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 18833928  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 314  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||    
T  18833927 aattaaggggtttaagagtatttaacctat 18833898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 85 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 44432518 - 44432221
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt-ggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgag 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |  |||    
T  44432518 catgaaagttgtagataattttgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggag 44432419  T
Q  184 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 283  Q
     |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  44432418 gtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagtt 44432319  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 381  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  44432318 caattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaagctg 44432221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 20178917 - 20179149
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  20178917 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 20179016  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20179017 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttc 20179116  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20179117 aaatagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 20179149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 6573453 - 6573682
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  6573453 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatttt-gagatatgatgaaaatactccaaggagg 6573551  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6573552 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaggtactaggggttc 6573651  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 315  Q
    || |||| | ||||||||||| |||| ||||    
T  6573652 aattaagttgtttaagagtatctaacatatg 6573682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23478736 - 23478478
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  23478736 catgaaagttgtagataattgtgttacctttccagtggcttgggtttgacttgaaaatgatttttagtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 23478637  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23478636 tcttagtgaaatcttatgaaaatgcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 23478537  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||||    
T  23478536 aactaaggtgtttcatagtatttaacatatgttgtgagttggtccttggggtagaaatg 23478478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 17795888 - 17795592
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  17795888 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttgggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 17795789  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17795788 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 17795689  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 381  Q
    || |||||| ||||  ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  17795688 aattaaggtgtttacaagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatgtgtgaagctg 17795592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Original strand, 21326274 - 21326566
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 124  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |     
T  21326274 cgagtataggaaaatcaacgtttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtctgcatgaaagctttagataatttggttagctttccaatggct 21326373  T
Q  125 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 224  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||   | |||||||||||| || |||||||||||||||||   ||||    
T  21326374 ttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatcaaaatactccaagatggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccagttct 21326473  T
Q  225 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||  || |||| || |||||| | |||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  21326474 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaattaaaagtacaatgagttcaattaaagagtttaagagtatttaacctatgtt 21326566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 21861016 - 21861248
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | | |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  21861016 catgaaagttgtagataatttggttagctttctaaaggcttttgtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgctgaaaatactccaaggagg 21861115  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21861116 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtttatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 21861215  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21861216 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 21861248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 309
Target Start/End: Original strand, 38185482 - 38185706
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  38185482 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 38185581  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  38185582 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtattatgagttc 38185681  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaa 309  Q
    || |||||| |||||||||||||||    
T  38185682 aattaaggtgtttaagagtatttaa 38185706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Original strand, 42559924 - 42560181
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  42559924 catgaaagttgtagataattttgttagcttttcaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 42560023  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  42560024 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaagctc-aaactagaagtactatgagttc 42560122  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    || || ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| || | ||||||| ||||||    
T  42560123 aattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttggggttggaatg 42560181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39364180 - 39363955
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  39364180 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccaaagagg 39364081  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||  |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  39364080 tcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctccaaactagaagtgctatgagttc 39363981  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    || |||||| ||| ||||||||||||    
T  39363980 aattaaggtgtttgagagtatttaac 39363955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5761189 - 5760957
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5761189 catgaaagttgtcgataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 5761090  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5761089 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaggttaatcaaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtaccatgagttc 5760990  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5760989 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 5760957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 89 - 317
Target Start/End: Original strand, 6102153 - 6102381
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  6102153 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgcaaatggtttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtctt 6102252  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6102253 agtgaaatcttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 6102352  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||    
T  6102353 aggatatttaagagtatttaacctatgtt 6102381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19140421 - 19140189
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||     
T  19140421 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgtgatatgatgcaaatactccaaggagg 19140322  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19140321 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 19140222  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19140221 aactagggtgtttaacagtatttaacctatgtt 19140189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20455652 - 20455395
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | || | |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  20455652 catgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggctttcgtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaataccccaaggagg 20455553  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  20455552 tcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccatccctcaaaactagaagtactatgaggtc 20455453  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  20455452 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 20455395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20460630 - 20460373
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | || | |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  20460630 catgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggctttcgtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaataccccaaggagg 20460531  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  20460530 tcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccatccctcaaaactagaagtactatgaggtc 20460431  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  20460430 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 20460373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 42818303 - 42818533
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | |  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||     
T  42818303 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 42818402  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42818403 ttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 42818502  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 315  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  42818503 aactagggtgtttaagagtatttaatctatg 42818533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 39936407 - 39936638
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||  || | | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  39936407 catgaaagttgtagataattgagttagctttccggtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggctcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 39936506  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  39936507 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagaaataattccaaatctcgaaactagaagtactatgagttc 39936606  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  39936607 aact-aggtgtttaagagtatttaacctatgtt 39936638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44477080 - 44476851
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  ||     
T  44477080 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtagg 44476981  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaactagaagtactaggagtt 283  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || ||    
T  44476980 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaatt 44476881  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaaccta 313  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  44476880 caattaaggtgtttaagagtatttaaccta 44476851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44480342 - 44480113
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  ||     
T  44480342 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtagg 44480243  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaactagaagtactaggagtt 283  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || ||    
T  44480242 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaatt 44480143  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaaccta 313  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  44480142 caattaaggtgtttaagagtatttaaccta 44480113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19880484 - 19880205
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||   |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  19880484 catgaaagttgtagataattttgttagcttttcaatggctttggtttggtgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactacaaggagg 19880385  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19880384 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttattggataattccaaatctcgaaactagaagtactatgagttc 19880285  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 365  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| | |||  || |||| ||||||||||||||    
T  19880284 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttggtccttggggca-gaaacgaagttgtatataatattaatg 19880205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 316
Target Start/End: Original strand, 17437714 - 17437945
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  17437714 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtaaaaatgattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaatgagg 17437813  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||     
T  17437814 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaatttaatccaaaacttatggaataattccaaatctcaaaactagaaataataggatttt 17437913  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17437914 aattaaggagtttaagagtatttaacctatgt 17437945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 85 - 313
Target Start/End: Original strand, 8728333 - 8728561
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||  ||     
T  8728333 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgaattttagtttaggagttatgatgaaaatactacaagtagg 8728432  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatt-caaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 283  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  8728433 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcc-aaacttagggaataattccaaaacctcgaaactagaagtattatgagtt 8728531  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaaccta 313  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  8728532 caattaaggtgtttaagagtatttaaccta 8728561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 20084034 - 20084266
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  20084034 catgaaagttttagataattatgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaagagg 20084133  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  20084134 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcagtccaaaacttagagaataattccaaacctcaaa-ctagaagtactaggagttt 20084232  T
Q  285 aactaaggtat-ttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||    |||||| |||||||||||||||    
T  20084233 aattaagggggcttaagattatttaacctatgtt 20084266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Original strand, 27941285 - 27941556
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||  ||     
T  27941285 catggaagttttagataattttgttagctttccaatggcttcggtgtgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaagtagg 27941384  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  27941385 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaatgctcaaaactagaagtaatatgagtgc 27941484  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  27941485 aattaaggtgtttaatagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 27941556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 330
Target Start/End: Original strand, 21579603 - 21579848
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | || | | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||     
T  21579603 catgaaagttgtagataattttgttagatttctagtggctttggtttgactcgaatatgatttttagtttttgatttatgatgaaaatactccaaggagg 21579702  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  21579703 tcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaattagaaatactatgagttc 21579802  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 330  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  21579803 aattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatctt 21579848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 88 - 350
Target Start/End: Original strand, 42265994 - 42266252
Alignment:
Q  88 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 187  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| || | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  42265994 gaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 42266093  T
Q  188 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 287  Q
    ||||||||| ||   ||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  42266094 tagtgaaatctt---aaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaagcttatggaataattccaaccctccaaactagaagtactatgagttcaat 42266190  T
Q  288 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    |||||| |||||||||||| |||  |||||  ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||    
T  42266191 taaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagttaatc-ttgggataggaatggaagttg 42266252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 5082608 - 5082838
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||   | ||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  5082608 catgaaagttttagataattgagttagctttccagtggttttggtttaacatgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 5082707  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  5082708 tctgagtgaaattttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 5082807  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 315  Q
    || |||||  |||||||||||||||| ||||    
T  5082808 aattaaggggtttaagagtatttaacttatg 5082838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23914579 - 23914344
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||  ||     
T  23914579 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatgaaaatacttcaagtagg 23914480  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  23914479 tcctattgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaagtagaagtactaggagtt- 23914381  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
     | |||||  ||||| |||||||||| | ||||||||    
T  23914380 tattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttatga 23914344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Original strand, 22258700 - 22258935
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||     
T  22258700 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttttttagttatgatgaaaatactccaaggagg 22258799  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  22258800 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 22258898  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22258899 aattaaggtgtttaagagtatttaaactatgttatga 22258935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22483402 - 22483171
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  22483402 catgaaagttttagataattgtgtaagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 22483303  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| ||||||    
T  22483302 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 22483204  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22483203 aattaaggtgtttaagagtatttaacttatgtt 22483171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 152 - 317
Target Start/End: Original strand, 361675 - 361840
Alignment:
Q  152 tttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataat 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  361675 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 361774  T
Q  252 tcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  361775 tccaaagctcaaaactaggagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 361840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32950241 - 32950025
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||                ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  32950241 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttga----------------ttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 32950158  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  32950157 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttt 32950058  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32950057 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 32950025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 85 - 330
Target Start/End: Original strand, 29763265 - 29763510
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || | | ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  29763265 catgaaagttgtagataattttgttagctttctagtgtctttggtttgactcgaaaatgaattttagtttttgagttataatgaaaatactccaaggagg 29763364  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| || ||||   ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||    
T  29763365 tcttagtgaaatcttaggaaaatttagaataatcatttctaagttaatccgaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtaatatgagttc 29763464  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 330  Q
    || |||| |    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  29763465 aattaagatgggaaagagtgtttaacctatgttgtgaattgatctt 29763510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17501581 - 17501350
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | | ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| ||||  |      
T  17501581 catgaaagtttgagataattttattagctttccaatggcttgggtttaacttaaaaatgatttttagattttgagatatgatggaattaccccaagcaag 17501482  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| || || |||| |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  17501481 tcttggtaaatttttatgaaaaattagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 17501382  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    || ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  17501381 aattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 17501350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23660871 - 23660688
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||     
T  23660871 catgaaagttgtagataattgagttagctttacagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaattagtccaaggagg 23660772  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaacta 268  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  23660771 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaacta 23660688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 317
Target Start/End: Original strand, 20517525 - 20517745
Alignment:
Q  96 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 195  Q
    ||||||| | |||||| |||||| || | | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  20517525 tagataactgtgttagttttccagtggctttggcttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaa 20517624  T
Q  196 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 295  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||     || |||| |||||||| |  |||||| |||||||| |||||| |    
T  20517625 ttttatgaaaattccgcataactgtttctaagtcaacccaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgt 20517723  T
Q  296 ttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20517724 ttaagagtatttaacctatgtt 20517745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Original strand, 36732920 - 36733077
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  36732920 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaatgagg 36733019  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  36733020 tcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactta 36733077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 4381189 - 4381420
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | |  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| |||     
T  4381189 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttacgataaaaatacttcaaggagg 4381288  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| | | |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  4381289 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgaattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 4381387  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4381388 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 4381420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22344697 - 22344466
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| | || | | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  22344697 catgaaaattttagataattgtgttagctttctagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 22344598  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||  ||||||    
T  22344597 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttc 22344499  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22344498 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22344466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22356357 - 22356126
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| | || | | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  22356357 catgaaaattttagataattgtgttagctttctagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 22356258  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||  ||||||    
T  22356257 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttc 22356159  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22356158 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22356126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23670300 - 23670069
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||    
T  23670300 aaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggtctt 23670201  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| | | |   || |||| |||||  | |  |||||| |||||||| |    
T  23670200 agtgaaattttattaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtatccaaacttcaaagattg-tgtactatgagttcaatt 23670102  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23670101 aaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 23670069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 38989121 - 38988886
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||     
T  38989121 catgaaaattgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttaggttatgatgaaaatactccaaggagg 38989022  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  | || ||| |||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||||||  |||||    
T  38989021 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctagttcaacccagaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactataagttc 38988923  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38988922 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 38988886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 39020218 - 39019983
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||     
T  39020218 catgaaaattgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttaggttatgatgaaaatactccaaggagg 39020119  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  | || ||| |||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||||||  |||||    
T  39020118 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctagttcaacccagaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactataagttc 39020020  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39020019 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 39019983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 36305314 - 36305083
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | |  |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  36305314 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatggtttttgctttttgagttatgataaaaatactccaatgagg 36305215  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||| | ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| |||| |    
T  36305214 tcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtaaacccaaaactcatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagtcc 36305116  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  36305115 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 36305083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 431
Target Start/End: Original strand, 14397604 - 14397835
Alignment:
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  14397604 agtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 14397703  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 388  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14397704 aaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataat 14397796  T
Q  389 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  14397797 atgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 14397835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21399366 - 21399209
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21399366 catgaaagttgtagataattgagttagttttccaatggattcggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21399267  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  21399266 tcttagtaaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaactta 21399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21793859 - 21793702
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21793859 catgaaagttgtagataattgagttagttttccaatggattcggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21793760  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  21793759 tcttagtaaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaactta 21793702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 219 - 337
Target Start/End: Original strand, 8414240 - 8414358
Alignment:
Q  219 gtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  8414240 gtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttg 8414339  T
Q  319 tgagttgatctttggggta 337  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  8414340 tgagttggtccttggggta 8414358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 127 - 317
Target Start/End: Original strand, 18816898 - 18817089
Alignment:
Q  127 ggtttgacttgaaaatgatttttg--gtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 224  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||    
T  18816898 ggtttgacttgaaaatgatttttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataattatttct 18816997  T
Q  225 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18816998 aagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacatcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18817089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 17978813 - 17979044
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || | | |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||     
T  17978813 catgaaagttgtagataattgtgttagagttccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttggtttttgagttatgatgaaaatatttcaaagagg 17978912  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||  | |  |||||| ||||||    
T  17978913 tcttagtgaaattttatgaaaattccggataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttc 17979011  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17979012 aattaaggtgtttaatagtatttaacctatgtt 17979044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 40492711 - 40492825
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||     
T  40492711 atgttgtgagttgatccttgtggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtg 40492806  T
Q  413 atgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    
T  40492807 atgtaatatatttgtatat 40492825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22474407 - 22474176
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||     
T  22474407 catgaaagttgtagataattgtgttagctttcccatggctttagtttgacttgaaaacgatttttggtttttgaattatgatgaaaatagtccaaggagg 22474308  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||  ||||| | |||||| || || |||||| ||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  22474307 tcttagtgaaattttatgaaaactccacataattatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 22474209  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22474208 aattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 22474176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Original strand, 36405456 - 36405691
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || | | |  |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  36405456 catgaaaattgtagataattgtgttagctttcccgtggctttgaattgatttgaaaatgatttttgttttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 36405555  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| | | |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  36405556 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 36405654  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || ||| || ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  36405655 aattaatgtgtttaatagtatttaacctaagttatga 36405691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 85 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21513975 - 21513823
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| | || | | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  21513975 catgaaagttgtagataattgtgttagcattctagtggctttggtttggcttgaaaatgatttttgggttttgagatatgatcaaaatactccaa-gagg 21513877  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaa 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||    
T  21513876 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaa 21513823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 317
Target Start/End: Original strand, 18815279 - 18815450
Alignment:
Q  145 tttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| |    
T  18815279 tttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatg 18815378  T
Q  245 gaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |   || |||| |||||  | |  |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18815379 gattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgtt 18815450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Original strand, 17439367 - 17439478
Alignment:
Q  316 ttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatg 415  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||    
T  17439367 ttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatacagtattaatgatgatatgtgaagctgttataatatgatttaatgttgataa----taatg 17439462  T
Q  416 taatatatttgtatat 431  Q
    | ||||||||||||||    
T  17439463 tgatatatttgtatat 17439478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 20533267 - 20533381
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    |||||    
T  20533267 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgttctgtgaagctgttataatgtgatttattgttga----tagta 20533362  T
Q  413 atgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  20533363 atgtaatataattgtatat 20533381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16198490 - 16198371
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||     
T  16198490 catgaaagttgtatataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgattaaaatactccacggagg 16198391  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  16198390 tcttagtgaaattttatgaa 16198371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 19154744 - 19154858
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||    
T  19154744 atgttacgagttgatccttggtgtaggaatggaggttatatgtaatattaatgatgatttgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tacta 19154839  T
Q  413 atgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19154840 atgtaatatatttgtatat 19154858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 337 - 431
Target Start/End: Original strand, 23943876 - 23943966
Alignment:
Q  337 aggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  23943876 aggaatggaggttgaatataatattactgatgttctgtgaagctgttataatatgatttgatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 23943966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24907430 - 24907203
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||| ||| || |||||| ||||||||||| | || | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| || |||     
T  24907430 catgaatgttttatataattgtgttagctttctagtggctttggtttgactttaaaatgatttttgatttttgagttatgacgaaaatactctaaggagg 24907331  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    | | ||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||| || |||||||||| ||| |  |||  ||| |||||||| |  |||||| ||||||    
T  24907330 tttgagtgaaattttatgaaaattccgcataactaattctaagtcaacccaaaacttatggattgtttc-caacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 24907233  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 314  Q
    || |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  24907232 aattaagttgtttaagaatatttaacctat 24907203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Original strand, 14397308 - 14397426
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||   |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  14397308 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtatggtgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 14397407  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| ||| ||||    
T  14397408 cttagtgaaaatttatgaa 14397426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Original strand, 18677632 - 18677750
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  18677632 atgaaagttgtagataattttgttacctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 18677731  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  18677732 cttagtgaatttttatgaa 18677750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 315 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16799748 - 16799635
Alignment:
Q  315 gttatgagttgatc-tttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 413  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    ||||||    
T  16799748 gttaagagttgatcctttggggtatgaatggaggatgattataatattactgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagtaa 16799653  T
Q  414 tgtaatatatttgtatat 431  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16799652 tgtaatatatttgtatat 16799635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Original strand, 4541941 - 4542059
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  4541941 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 4542040  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  4542041 cttagtgaatttttatgaa 4542059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Original strand, 8414145 - 8414239
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  8414145 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaa 8414239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Original strand, 24485611 - 24485729
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||| | ||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||||||| ||| |    
T  24485611 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggcttggcgtgaaaatgacttttggtttaggagttatgattaaaatactccaaggaggt 24485710  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24485711 cttagtgaatttttatgaa 24485729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 1484997 - 1484918
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1484997 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 1484918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 20045762 - 20045841
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20045762 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 20045841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Original strand, 45290114 - 45290205
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactc 176  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||    
T  45290114 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttgttttaggagttatgatgaaaatactc 45290205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 313 - 405
Target Start/End: Original strand, 14103083 - 14103175
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatga-tttaatgttgata 405  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  14103083 atgttacgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatataaatgatgatctatgaagttg-tataatatgattttaatgttgata 14103175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22002347 - 22002239
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||| | ||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||| |    
T  22002347 atgaaagttgtagataatttggttagctttccaatggctttggtttgacgtaaaaataagttttggtttaggagttatgatgaaaataccccaaggaggt 22002248  T
Q  186 cttagtgaa 194  Q
    |||||||||    
T  22002247 cttagtgaa 22002239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25757808 - 25757577
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | ||| |||||   | |||||||||||||||| |||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||   |     
T  25757808 catgaaagttatagataattgtgttggtttttcaatggttttggtttgacttgaaaataatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtggg 25757709  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||  ||| ||| |||||||||||||||| | || ||||||||| |||||  ||| ||  |  ||| |||| |||||| | | |||| ||||||||     
T  25757708 tcttagcaaaactttatgaaaattcagcataattattcctaagttaaaccaaactttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagttt 25757610  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  25757609 aattaagaggtttaagagtatttaacctatgtt 25757577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 5852859 - 5852938
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  5852859 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 5852938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 14409011 - 14409090
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14409011 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 14409090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 317
Target Start/End: Original strand, 18118603 - 18118792
Alignment:
Q  128 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 227  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||| || ||| ||||  || |||| || || ||||  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  18118603 gtttgacttaaaaatgatttttagattttgagataagatggaattacaccaagtaggtcttggtaaatttttacgaaaattcagcctaaccgtttctaag 18118702  T
Q  228 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtacta-ggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    | ||||||||||||| ||  |  | | |||| |||||||| | |||| || ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18118703 tcaatccaaaacttatggtttgttcccaaacttcaaaacttg-agtattagggagttcaattaaggtgttttagagtatttaacctatgtt 18118792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 313 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 22525778 - 22525689
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22525778 atgttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttaattataatactcctgatgttttgtgaatctgttataacatgatttaatgttg 22525689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25295788 - 25295557
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | ||| |||||   | |||||||||||||||| |||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||   |     
T  25295788 catgaaagttatagataattgtgttggtttttcaatggttttggtttgacttgaaaataatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtggg 25295689  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| | || ||||||||| |||||  ||| ||  |  ||| |||| |||||| | | |||| ||||||||     
T  25295688 tcttagcaaaacttcatgaaaattcagcataattattcctaagttaaaccaaactttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagttt 25295590  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  25295589 aattaagaggtttaagagtatttaacctatgtt 25295557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 14824370 - 14824291
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  14824370 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaattatttttggtttatgagttatg 14824291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Original strand, 21345945 - 21346020
Alignment:
Q  235 aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  21345945 aaaacttagggaataattccaaatctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 21346020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 22313488 - 22313401
Alignment:
Q  84 tcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa 171  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||    
T  22313488 tcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggttccggtttgacttgaaaatgttttgtgaattttgagttatgatgaaaa 22313401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24624282 - 24624171
Alignment:
Q  127 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 226  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| ||||||  ||||||||| ||||||| |||||||    
T  24624282 ggtttgacttaaaaattatttttagattttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtctttgtgcaattttacgaaaattcaacataactatttctaa 24624183  T
Q  227 gttaatccaaaa 238  Q
    || || ||||||    
T  24624182 gtgaacccaaaa 24624171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 242
Target Start/End: Original strand, 19331976 - 19332128
Alignment:
Q  88 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 187  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    |  |||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||   | |||    
T  19331976 gaaagttttagataattgtgttagctttgcaatagtttttgtttgacttgaaaatgatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtgggtct 19332075  T
Q  188 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    |||| |||   |||||||||| ||||||| | || ||||||||| ||||| ||||    
T  19332076 tagtaaaa--ctttgaaaatttagcataaatattcctaagttaaaccaaatctta 19332128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18827879 - 18827650
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||   |||||| |||||||||   | |||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||| |||  |||    
T  18827879 catgaaagttttagataaagatgttagatttccaatggatttggtttggcttaaaaatgattgttagtttttgagttatggtgaaaatactacaagtaga 18827780  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||  |||||||||  ||||||||| ||||| | ||| | ||  |||||||||  || ||  | |||| ||| ||||||||| || |||||||||||      
T  18827779 tcttgctgaaattttacgaaaattcaacataattatttttgagcgaatccaaaagatatggtttgattccaaaactcaaaacttga-gtactaggagtct 18827681  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 315  Q
    || || | | ||||||||||||||| |||||    
T  18827680 aattaggatgtttaagagtatttaaactatg 18827650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24239071 - 24238977
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 179  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |  ||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  24239071 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttagtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagttataatgaaaacactccaa 24238977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 4483875 - 4483796
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  4483875 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 4483796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 45559572 - 45559796
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactcc-aatgag 183  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    | |||||||||||||||| |||||| | |||        |||||||||||||| ||||||    
T  45559572 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaattgttttggtttgacttgaaaataatttttagattt-------ggatgaaaatactccaaatgag 45559664  T
Q  184 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 283  Q
     ||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| | || ||||||||| ||||| |||| ||  |  ||| |||| |||||| | | |||| ||||| ||    
T  45559665 -tcttagtaaaactttatgaaaattcaacataattattcctaagttaaaccaaaccttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggattt 45559762  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
     || ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  45559763 taattaagaggtttaagagtatttaacctatgtt 45559796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4233297 - 4233215
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatg 167  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | |  ||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  4233297 catgaaagtttgagataattttattagctttccaatggctttcgtttgacttaaaaataatttttagattttgagatatgatg 4233215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Original strand, 21495086 - 21495243
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||| || ||||| || | | |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||| || |||     
T  21495086 catgaaagttttagacaattgagttggcattccattggccttggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggagg 21495185  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    | ||| | ||| |||  |||||||| ||| || ||||||||||| || ||||| ||||    
T  21495186 ttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtttctaagtcaacccaaacctta 21495243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 37515967 - 37515878
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| | | |||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  37515967 atgttataagttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttttatgagtctgatataatgtgatttaatgttg 37515878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 402
Target Start/End: Original strand, 20501962 - 20502049
Alignment:
Q  315 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  20501962 gttatgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattatataattgttgatgttcagtgaatctgatataatatgatttgatgttg 20502049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Original strand, 223324 - 223414
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  223324 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 223414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Original strand, 688095 - 688185
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  688095 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 688185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Original strand, 736947 - 737037
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  736947 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 737037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Original strand, 860842 - 860932
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  860842 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 860932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23659602 - 23659555
Alignment:
Q  380 tgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  23659602 tgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 23659555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23668071 - 23668025
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 359  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23668071 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattataata 23668025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 318 - 383
Target Start/End: Original strand, 26222945 - 26223010
Alignment:
Q  318 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 383  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26222945 atgagttggtctttcgggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgtt 26223010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 401
Target Start/End: Original strand, 22253024 - 22253112
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgtt 401  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || || |  ||| ||||||||||||| |||||    
T  22253024 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtaagtctgatataatatgatttgatgtt 22253112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22996104 - 22996068
Alignment:
Q  315 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttga 351  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22996104 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttga 22996068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23410056 - 23410018
Alignment:
Q  292 gtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 330  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23410056 gtatttaagagtatttaacatatgttgtgagttgatctt 23410018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 28397809 - 28397763
Alignment:
Q  315 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatatt 361  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28397809 gttatgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattataatatt 28397763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Original strand, 272183 - 272219
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  272183 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 272219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 643666 - 643630
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  643666 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 643630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 829472 - 829436
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  829472 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 829436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Original strand, 17150635 - 17150699
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | | |||| |||||  |||||||||||    
T  17150635 catgaaagttgcagataattatgttagctttctaatggctttggttggacttccaaatgattttt 17150699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 277 - 313
Target Start/End: Original strand, 18122327 - 18122363
Alignment:
Q  277 aggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 313  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18122327 aggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 18122363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Original strand, 22007105 - 22007169
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  22007105 catgaaagttatagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgattttt 22007169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 361
Target Start/End: Original strand, 22381593 - 22381641
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatatt 361  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22381593 atgttatgggtttatccttggggtaggaatcgaggttgattataatatt 22381641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 29759519 - 29759455
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  29759519 catgaaaggtttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttt 29759455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 169)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14966718 - 14966316
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 124  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14966718 cgagcatacgaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataatttttttagcttttcaatgaca 14966619  T
Q  125 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 224  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14966618 ttggtttgacttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 14966519  T
Q  225 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14966518 aagttaatccaaaacttagggaataattctaaacctaaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagtt 14966419  T
Q  325 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatt 424  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  14966418 gatcattggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatt 14966323  T
Q  425 tgtatat 431  Q
    |||||||    
T  14966322 tgtatat 14966316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 85 - 431
Target Start/End: Original strand, 43550073 - 43550415
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  43550073 catgaaagttgtagataattttgttaattttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccaaggagg 43550172  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  43550173 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 43550272  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  43550273 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctatta 43550372  T
Q  385 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  43550373 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 43550415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 85 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 50243389 - 50243047
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  50243389 catgaaagttgtagataattgagttacatttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 50243290  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  50243289 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 50243190  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  50243189 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtatgaatgagggttaaatataatattactgatgatctgtgaagctatta 50243090  T
Q  385 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  50243089 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 50243047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 85 - 383
Target Start/End: Original strand, 24152840 - 24153138
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24152840 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24152939  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24152940 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 24153039  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 383  Q
    || |||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24153040 aattaaggtgtctaagagtacttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattaattataatctgtgaagctgtt 24153138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 85 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16643661 - 16643319
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  16643661 catgaaagttgtagacaattgagttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttatagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 16643562  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16643561 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaacactcaaaactagaagtactatgagttc 16643462  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  16643461 aattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggagattgaagataacattactgatgatctgtgaagctgtta 16643362  T
Q  385 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  16643361 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 16643319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 89 - 315
Target Start/End: Original strand, 53646460 - 53646686
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53646460 aaagttgtagataattttgttagatttccaatgattttggtttgacttgaaaatgatttttgttttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatctt 53646559  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  53646560 agtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaatt 53646659  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatg 315  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  53646660 aaggtgtttaagagtatttaacatatg 53646686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 89 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6159049 - 6158789
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6159049 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatgtttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtctt 6158950  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6158949 agtgaaattttatgaaaattcaacataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 6158850  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  6158849 aaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 6158789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Original strand, 2248366 - 2248624
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  2248366 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 2248465  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  2248466 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttc 2248565  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  2248566 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatg 2248624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 33564785 - 33564555
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  33564785 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 33564686  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  33564685 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctatgttaatccaaaacttatggaataattccaatcctcaaaactagaagtactaggggttc 33564586  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 315  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33564585 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 33564555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 330
Target Start/End: Original strand, 14641946 - 14642191
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  14641946 catgaaagttttagataatttcgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 14642045  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14642046 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 14642145  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 330  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14642146 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 14642191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Original strand, 35961283 - 35961536
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  35961283 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 35961382  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35961383 tcttagtgaaattttatgaaaaattagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaaatagaagtactatgagttc 35961482  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  35961483 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 35961536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 349
Target Start/End: Original strand, 10833735 - 10833999
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  10833735 catgaaagttttagaaaattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 10833834  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  10833835 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 10833934  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggtt 349  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10833935 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggtt 10833999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 42183 - 41930
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  42183 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttggcatgaaaataatttttagtttaagagttatgatgaaaatactccaaggagg 42084  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42083 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 41984  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  41983 aattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 41930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11192736 - 11192505
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  11192736 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttt-tttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 11192638  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11192637 ccttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 11192538  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11192537 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 11192505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 40807652 - 40807420
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  40807652 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 40807553  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40807552 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 40807453  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  40807452 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 40807420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Original strand, 52989492 - 52989695
Alignment:
Q  223 ctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgag 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52989492 ctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgag 52989591  T
Q  323 ttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatata 422  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  52989592 ttgatcctt-gggtaggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatata 52989686  T
Q  423 tttgtatat 431  Q
    |||||||||    
T  52989687 tttgtatat 52989695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11913377 - 11913119
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  11913377 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttcacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 11913278  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  11913277 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 11913178  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    || || ||| ||||||||||| |||| |||||| ||| | || | ||||||||||||||    
T  11913177 aattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttttgattcgacccttggggtaggaatg 11913119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 50351396 - 50351628
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  50351396 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 50351495  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  50351496 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccatttctaagtcgatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactatgagttt 50351595  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  50351596 aattaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 50351628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 54875879 - 54876111
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  54875879 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggagttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 54875978  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54875979 tcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 54876078  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  54876079 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 54876111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 85 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6819765 - 6819507
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  6819765 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacatgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 6819666  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  6819665 tcttagtgaaatcttatgaaaattaaggataaccgtttctaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaagctcaaaactataagtactatgagttc 6819566  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgg 344  Q
    || |||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||    
T  6819565 aattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtgggttgatc-ttgggataggaatgg 6819507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Original strand, 1988628 - 1988885
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  1988628 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatatttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 1988727  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  1988728 tcttagtgcaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataactactatgagttc 1988827  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  1988828 aattaaggtgtttaagagtgtttaaccaatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 1988885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 89 - 359
Target Start/End: Original strand, 8928065 - 8928335
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  8928065 aaagttgtagataattttgttagatttccaatggctttggtttgacctgaaaatgatttttggtttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtctt 8928164  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||  || |||||||||||||||| |||||||| |    
T  8928165 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagataatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaactagaagtactatgagttcaatt 8928264  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 359  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  8928265 aaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtttattataata 8928335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12276205 - 12275941
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  12276205 catgaaaattttagataatttggttagctttccaatgactttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 12276106  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  12276105 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaagccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 12276006  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  12276005 aattaaggtgtttaagagtgtttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 12275941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 37038475 - 37038226
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa-tactccaatgag 183  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||    
T  37038475 catgaaagttttagataattttattagcttttcaatggctttggtttgatttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaaatactccagagag 37038376  T
Q  184 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 283  Q
     |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37038375 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 37038276  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttgg 333  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37038275 caattaagatgtttaagagtatttaacctatgttttgagttgatctttgg 37038226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 381
Target Start/End: Original strand, 10989200 - 10989495
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||     
T  10989200 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtctgacatgaaaataatttt-ggtttttaagatatgatgaaaatgctccaaggagg 10989298  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10989299 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 10989398  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 381  Q
    || |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||  |||| | |||  |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  10989399 aattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatatcaatgaaagttatataggatattaaggatgatctgtgaagctg 10989495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14441824 - 14441592
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  14441824 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 14441725  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14441724 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 14441625  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14441624 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14441592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16979566 - 16979287
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16979566 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 16979467  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16979466 tcttagtgaaatcttataaaaattcagcatgaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 16979367  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 365  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  16979366 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 16979287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 35064977 - 35065208
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  35064977 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactcccatgagg 35065076  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35065077 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattc-aaacctcaaaactagaagtactatgagttc 35065175  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  35065176 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 35065208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40812489 - 40812258
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  40812489 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtgcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 40812390  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  40812389 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 40812290  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40812289 aattaaggggtttaagagtatttaacctatgt 40812258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Original strand, 3394398 - 3394662
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  3394398 catgaaagttttagataactttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 3394497  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||||||| || |||    
T  3394498 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtactatgaattc 3394597  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  3394598 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 3394662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3803491 - 3803259
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  3803491 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 3803392  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  3803391 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatcaaaatcttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtta 3803292  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3803291 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 3803259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 86 - 338
Target Start/End: Original strand, 6805358 - 6805610
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || | | ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  6805358 atgaaagttgtggataattatgttagctttccagtggctttggtgtgacttgaaaatgatttctggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 6805457  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 285  Q
    | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6805458 cctagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttca 6805557  T
Q  286 actaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||    
T  6805558 attaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggttcttggggtag 6805610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14508503 - 14508272
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | | |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||     
T  14508503 catgaaagttgtagataattgagttagctttcctatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 14508404  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14508403 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttt-taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 14508305  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14508304 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14508272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 55 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17693754 - 17693492
Alignment:
Q  55 tttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggttt 154  Q
    |||||||| |||||||| ||| || ||   ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| | | |||||||  ||||| | ||||||||||     
T  17693754 tttctgttttgaattagcttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagttttccaatggctttggtttgatgtgaaagttatttttggttc 17693655  T
Q  155 ttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattca 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  17693654 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 17693555  T
Q  255 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17693554 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17693492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Original strand, 179103 - 179367
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||     
T  179103 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaataccccaagtagg 179202  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  179203 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttg 179302  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || |||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  179303 aattaaggtgtttaacagtatttaatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaggttg 179367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Original strand, 10541854 - 10542079
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||| |||     
T  10541854 catgaaagttgtagataattgtgttatctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatcatgaaaatacttcaaggagg 10541953  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  10541954 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 10542053  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    || |||||  ||||| ||||||||||    
T  10542054 aattaaggggtttaacagtatttaac 10542079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Original strand, 43889195 - 43889420
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  43889195 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 43889294  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  43889295 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaatttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 43889394  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  43889395 aattaagggttttaagagtatttaac 43889420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 5206050 - 5206282
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5206050 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 5206149  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5206150 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 5206249  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5206250 aattatggtgtttaagattatttaacctatgtt 5206282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17538762 - 17538531
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  | | |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17538762 catgaaagttgtagataaatgagttagctttccaatt-ctttggtttgacgtgcaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17538664  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17538663 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccttttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcgaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 17538564  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17538563 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17538531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 22306979 - 22307211
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||     
T  22306979 catgaaagttgtagataatttagttatctttccagtgactttggtttgacgtgaaaatgatttttgattattgagatatgatgaaaatactcgaaggagg 22307078  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||| ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22307079 tcttactgaaatcctatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcccaaacttaaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 22307178  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22307179 aactagggtgtttaagagtatttaacttatgtt 22307211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 86 - 330
Target Start/End: Original strand, 42324618 - 42324862
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |    
T  42324618 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatataatcaaaatactccaaggaggt 42324717  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 285  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42324718 cttagtgaaatcttagaaaaattcagtataaccatttctaagttagtcaaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttca 42324817  T
Q  286 actaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 330  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  42324818 attaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatctt 42324862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17044622 - 17044392
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| || |||||||||  ||||| |||||| || | |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17044622 catgaaatttatagataattgagttagatttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17044523  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  17044522 tcttagtgaaattttatgaaaattcaacataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaattagaaatactaggggttc 17044423  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 315  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17044422 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 17044392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 330
Target Start/End: Original strand, 18367154 - 18367399
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||| |||     
T  18367154 catgaaagttttagataatttttttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatatttcaaggagg 18367253  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18367254 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataacccgttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaagctagaagtactatgagttc 18367353  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 330  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18367354 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatctt 18367399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35354258 - 35354023
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgat---ttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  35354258 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacg 35354159  T
Q  182 agatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggag 281  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  35354158 agatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactgggag 35354059  T
Q  282 ttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35354058 tttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 35354023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 313
Target Start/End: Original strand, 20248380 - 20248608
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  20248380 catgaaagttgtagataattttgttagttttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 20248479  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  20248480 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaatatttccaaacctcgaaactagaagtattatgagttc 20248579  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaaccta 313  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||||    
T  20248580 aattaaggtgtttaaaagtatttaaccta 20248608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9533785 - 9533514
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  9533785 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 9533686  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||| |    
T  9533685 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgc 9533586  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9533585 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 9533514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10554923 - 10554668
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  10554923 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 10554824  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  10554823 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattcaaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 10554724  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 340  Q
    || |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  10554723 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 10554668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Original strand, 14763357 - 14763628
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  14763357 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 14763456  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  14763457 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 14763556  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14763557 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 14763628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 340
Target Start/End: Original strand, 55292037 - 55292292
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  55292037 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 55292136  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  55292137 tcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaacccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 55292236  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 340  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  55292237 aattaaggtgtttaaaagtatttaacccatgttatgagtagacctttgaggtagga 55292292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12511504 - 12511279
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  12511504 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 12511405  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  12511404 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaaccttaaaactagaagtactaggagttt 12511305  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  12511304 aattaaggggtttaagagtatttaac 12511279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 85 - 313
Target Start/End: Original strand, 38311399 - 38311628
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  38311399 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 38311498  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatt-caaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 283  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  38311499 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttagggaataattccaaaacctcgaaactagaagtattatgagtt 38311598  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaaccta 313  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  38311599 caattaaggtgtttaagagtatttaaccta 38311628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 2841859 - 2842090
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||     
T  2841859 catgaaagttttagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggagg 2841958  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2841959 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccg-ttccaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 2842057  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2842058 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 2842090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 86 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14671479 - 14671255
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |    
T  14671479 atgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcgatttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggt 14671380  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 285  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14671379 cttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttta 14671280  T
Q  286 actaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    | |||||  ||||| ||||||||||    
T  14671279 attaaggggtttaacagtatttaac 14671255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 129 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 44274086 - 44273898
Alignment:
Q  129 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44274086 tttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagt 44273987  T
Q  229 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44273986 taatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtttttaagagtatttaacctatgtt 44273898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 127 - 338
Target Start/End: Original strand, 13029714 - 13029925
Alignment:
Q  127 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||    
T  13029714 ggtttgacttgaaaatgatttttagttttttaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaa 13029813  T
Q  227 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 326  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13029814 gttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgg 13029913  T
Q  327 tctttggggtag 338  Q
    || |||||||||    
T  13029914 tcattggggtag 13029925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Original strand, 23371103 - 23371374
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  23371103 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactataaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 23371202  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  23371203 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 23371302  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23371303 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 23371374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 15931903 - 15932135
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || | | |||||||  || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15931903 catgaaagttatagataattgagttagctttccagtggccttggtttgatgtgcaaatgattttgggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15932002  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15932003 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagaaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 15932102  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  15932103 aactagggtgtttaagagtatttcatctatgtt 15932135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 17519269 - 17519501
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||| |||||   ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  17519269 catgaaagttgtaggtaattgacttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggatcttgagatgtgatgaaaatactccaaggagg 17519368  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17519369 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 17519468  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17519469 aactaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 17519501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 17534131 - 17534363
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||| |||||   ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  17534131 catgaaagttgtaggtaattgacttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggatcttgagatgtgatgaaaatactccaaggagg 17534230  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17534231 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 17534330  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17534331 aactaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 17534363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 127 - 338
Target Start/End: Original strand, 13026122 - 13026333
Alignment:
Q  127 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||    
T  13026122 ggtttgacttgaaaatgatttttagttttttaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaa 13026221  T
Q  227 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 326  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13026222 gttaatccaaaaattatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgg 13026321  T
Q  327 tctttggggtag 338  Q
    || |||||||||    
T  13026322 tcattggggtag 13026333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 96 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13519928 - 13519706
Alignment:
Q  96 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 195  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13519928 tagataattatgttagctttctattgactttcgtttgacttgaaattgatttttggtttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 13519829  T
Q  196 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaa-ggta 294  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||      
T  13519828 tcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttgattaaggggg 13519729  T
Q  295 tttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13519728 tttaagagtatttaacctatgtt 13519706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Original strand, 13522806 - 13523071
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||     
T  13522806 catgaaagttttagagaattttgttagctttccaatggctttggtttaacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgagaatactccaagtagg 13522905  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcc-aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 283  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  13522906 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttaatccaaaaacttatgcgataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagtt 13523005  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  13523006 caattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 13523071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 85 - 314
Target Start/End: Original strand, 17670105 - 17670334
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || || | | |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  17670105 catgaaagttgtagataattgagttagcttttcagtggcgttggtttgacgtgaaaatgaattttggtacttgagatatgatgaaaatactacaaggagg 17670204  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17670205 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttc 17670304  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 314  Q
    || || ||| ||||||||||||||| ||||    
T  17670305 aattagggtgtttaagagtatttaatctat 17670334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 85 - 314
Target Start/End: Original strand, 17685239 - 17685468
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17685239 catgaaaattgtagataattgagttagctttccagtggcgttggtttgacgtgaaaatgaattttggtacttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17685338  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  17685339 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgaattc 17685438  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 314  Q
    || || ||| ||||||||||||||| ||||    
T  17685439 aattagggtgtttaagagtatttaatctat 17685468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Original strand, 18699869 - 18700094
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | |   |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  18699869 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttaatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 18699968  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  18699969 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttttggaataattccaaacctcaaaactagaagtgctaggagttt 18700068  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||    
T  18700069 agttaagggatttaagagtatttaac 18700094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14519918 - 14519687
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  14519918 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 14519819  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  14519818 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 14519720  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14519719 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14519687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17513236 - 17513010
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17513236 catgaaagttgtagattattttgttagctttctaattgagttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17513137  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||  |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  17513136 tcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttattgaataattccaaacctccaaactagaagtgctatgagttc 17513037  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacc 311  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||    
T  17513036 aattaaggtgtttgagagtatttaacc 17513010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 10563365 - 10563120
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| || | | |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||  ||     
T  10563365 catgaaagttgcagataattgagttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggtgcttgagatatgatgaacatactcaaagtagg 10563266  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10563265 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 10563166  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 330  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10563165 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 10563120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 86 - 317
Target Start/End: Original strand, 41172767 - 41172999
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||  | | |  ||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  41172767 atgaaagttgtagataattgagttagctttccagcggctttcgtttgacgtgaaaacaattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 41172866  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 285  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41172867 cttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttta 41172966  T
Q  286 actaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    | ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  41172967 attaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 41172999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 51301051 - 51300780
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||  |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||  ||     
T  51301051 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggatttatgatgaaaatactccaagtagg 51300952  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||      
T  51300951 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgt 51300852  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  51300851 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 51300780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 43929007 - 43928775
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | | |||||  ||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  43929007 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgatttgatctgaaaataatttttaatttttgagatataatgaaaatactccaaggagg 43928908  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  43928907 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttgatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaattagaagtactatgagttc 43928808  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || ||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  43928807 aattaaggtgcttaagagtatttaacatatgtt 43928775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Original strand, 31224349 - 31224608
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  31224349 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttcacttgaaaatgatttttggtttttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 31224448  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| ||  |||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31224449 tcttagtgaaatcttaggaaatttcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 31224548  T
Q  285 aactaaggt-atttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    || || |||  ||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||||||| ||||||    
T  31224549 aattagggtgttttaagagtatttaacccatgctgtgagtcgacccttggggtcggaatg 31224608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19444167 - 19443941
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  19444167 catgaaagttgtagataattttgttagcttcccaatggctttggtttgacatgaaagtgatttttggtttttgagatattatgaaaatactccaaggagg 19444068  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| | | ||||||    
T  19444067 tcttattaaaattttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctccaaactagaagtgccatgagttc 19443968  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacc 311  Q
    || |||||| ||| ||| |||||||||    
T  19443967 aattaaggtgtttgagaatatttaacc 19443941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 49900392 - 49900153
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||   | |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  49900392 catgaaagttgtagataattaagttagcttttcagtggatttggtttgacgtgaaaatggtttttggttattgagatatgatgaaaatactccaaggagg 49900293  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttcta--------agttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtact 276  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49900292 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtact 49900193  T
Q  277 aggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    || |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  49900192 agaagtttaattaaggattttaagagtatttaacctatgt 49900153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 88 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18890017 - 18889749
Alignment:
Q  88 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||   || |||    
T  18890017 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatgtttgagttatgatggaaatactccaggtaggtct 18889918  T
Q  188 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 287  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||  |||||| ||||||||| || ||||||||     
T  18889917 tagtgaaatcttatgaaaattccgcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatagttccaaggctcaaatctagaagtaatatgagttcaat 18889818  T
Q  288 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  18889817 taaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagatgacccttgggacaggaatggaggttgattata 18889749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 89 - 317
Target Start/End: Original strand, 50348426 - 50348654
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || | |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  50348426 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtctt 50348525  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
     ||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| || |    
T  50348526 ggtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaactcatgggataattccaaacctcaaaactataagtactaggggtttaatt 50348625  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  50348626 aaggggtttaagagtatttaacctatgtt 50348654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 129 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12470414 - 12470233
Alignment:
Q  129 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 228  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  12470414 tttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaatt 12470315  T
Q  229 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  12470314 taatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 12470233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 88 - 338
Target Start/End: Original strand, 16324940 - 16325190
Alignment:
Q  88 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||| | |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16324940 gaaagttgtagataattttgttatctttccaatggatttggtttggcgtgaaaatgatttatggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtct 16325039  T
Q  188 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 287  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||  || |||||||||||||||||| ||||||     
T  16325040 tagtgaaattttatgaaaatttagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatcggataatttcaaggctaaaaactagaagtactaggggttcaat 16325139  T
Q  288 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    |||||| |||| || |||||| |||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  16325140 taaggtgtttatgaatatttatcctaagttgtgagttggtccttggggtag 16325190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 14152795 - 14153027
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||| || | | ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||     
T  14152795 catgaaagttgtagatttttgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaaagaattttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaagaagg 14152894  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||||||||||||||||||||||||||||     
T  14152895 tcttagtgaacttttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 14152994  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14152995 aattaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 14153027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15566169 - 15565938
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  15566169 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcatcagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 15566070  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    || |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |   |  ||||| ||||||    
T  15566069 tcatagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc-ctatttactatgagttc 15565971  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15565970 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 15565938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 86 - 317
Target Start/End: Original strand, 9511563 - 9511793
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9511563 atgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 9511662  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 285  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| |||     || |||| |||||||| |  |||||| ||| | |    
T  9511663 cttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagatta 9511761  T
Q  286 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9511762 attaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 9511793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 86 - 317
Target Start/End: Original strand, 9519538 - 9519768
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9519538 atgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 9519637  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 285  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| |||     || |||| |||||||| |  |||||| ||| | |    
T  9519638 cttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagatta 9519736  T
Q  286 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9519737 attaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 9519768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 96 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6156350 - 6156130
Alignment:
Q  96 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6156350 tagataattgtgttagctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 6156251  T
Q  196 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 295  Q
    |||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |    
T  6156250 ttttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgt 6156152  T
Q  296 ttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6156151 ttaagagtatttaacctatgtt 6156130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 50755778 - 50756009
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  50755778 catgaaagttttagataatcgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggtgg 50755877  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| ||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  50755878 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 50755976  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50755977 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 50756009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24546496 - 24546261
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24546496 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaga 24546397  T
Q  185 tcttagtgaaattttttga----aaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactagga 280  Q
    ||||||||||||||| |||    |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| | ||| |   || |||| ||||| |  |  |||||| ||    
T  24546396 tcttagtgaaattttatgaaattaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactcatggattgtctccaaacttcaaagcctg-tgtactatga 24546298  T
Q  281 gttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24546297 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 24546261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 88 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18893277 - 18893067
Alignment:
Q  88 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||    
T  18893277 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtct 18893178  T
Q  188 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 287  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  18893177 tagtgaaatcttatgaaaattcagcagaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactacaagtaatatgagtttaat 18893078  T
Q  288 taaggtattta 298  Q
    |||||| ||||    
T  18893077 taaggtgttta 18893067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 54330702 - 54330933
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||     
T  54330702 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgatttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacacttcaaggagg 54330801  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||| || ||||||    
T  54330802 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttc 54330900  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54330901 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 54330933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17046782 - 17046631
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17046782 catgaaagttatagataattgagttagatttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17046683  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaa 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17046682 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaa 17046631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17938182 - 17938025
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||     
T  17938182 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgatttatgatgaaaatactctaaggagg 17938083  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  17938082 tcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaacctta 17938025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 128 - 279
Target Start/End: Original strand, 14567651 - 14567802
Alignment:
Q  128 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 227  Q
    |||||| ||||||||||  ||| ||||||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14567651 gtttgaattgaaaatgacatttagtttttgatttatgatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 14567750  T
Q  228 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactagg 279  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14567751 ttaatccaaaacttatgaaataattccaaacctcaaaactagaagtactagg 14567802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 216
Target Start/End: Original strand, 51602996 - 51603127
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  51602996 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 51603095  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataa 216  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  51603096 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataa 51603127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 195
Target Start/End: Original strand, 14647499 - 14647609
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14647499 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 14647598  T
Q  185 tcttagtgaaa 195  Q
    ||||| |||||    
T  14647599 tcttaatgaaa 14647609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15465453 - 15465222
Alignment:
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  15465453 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 15465354  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 388  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| || |   ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15465353 aaggtgtttaagagtat------aataatatga-tttagtgttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataat 15465261  T
Q  389 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    || ||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  15465260 ataatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 15465222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 217
Target Start/End: Original strand, 19568807 - 19568939
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  19568807 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagcagg 19568906  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataac 217  Q
    |||||||||||| ||   ||||||||| |||||    
T  19568907 tcttagtgaaatcttagcaaaattcagtataac 19568939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5215303 - 5215156
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  5215303 catgaaagttgtagataaatgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactacaaggagg 5215204  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaat 232  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5215203 tcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 5215156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 119
Target Start/End: Original strand, 52989397 - 52989491
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaa 119  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52989397 cgagcataggaaaatcaatttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaa 52989491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18739551 - 18739394
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  18739551 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggctttggtttcactttaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 18739452  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  18739451 tcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaacctta 18739394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17207996 - 17207766
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| | ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  17207996 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggttttaattgcaaatgaattttggtttt-gagttatgatgaaaatactccaaggagg 17207898  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||| |||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||  || |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  17207897 tcttactgaaatgttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttattgattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 17207799  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17207798 aaataaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17207766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 319 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 324490 - 324382
Alignment:
Q  319 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 418  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  324490 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactaatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaa 324395  T
Q  419 tatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||    
T  324394 tatatttgtatat 324382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12305718 - 12305599
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  12305718 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 12305619  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  12305618 tcttagtgaatttttatgaa 12305599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 212
Target Start/End: Original strand, 46723022 - 46723149
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  46723022 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 46723121  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagc 212  Q
    ||||| | |||| || ||||||||||||    
T  46723122 tcttactaaaatcttatgaaaattcagc 46723149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 189 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 5223682 - 5223451
Alignment:
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  5223682 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatcaaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 5223583  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 388  Q
    ||||| |||||||||||   |   || ||||    ||    | ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5223582 aaggtgtttaagagtataata---atattatttagtg----tcggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataat 5223490  T
Q  389 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  5223489 atgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 5223451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 25104600 - 25104829
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | | |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  25104600 catgaaagtt-tagataattgtgttagctttccagtggctttgatttgacttgaaa-tgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 25104697  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| |  ||| |||| |||||| | |  ||||||  |||||    
T  25104698 tcttagtaaaattttacgaaaattccgcataactatttccaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaatttg-tgtactatcagttc 25104796  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25104797 aattaaggtgtttaagagtatttaacttatgtt 25104829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13919591 - 13919477
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||         
T  13919591 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattactaatgttatgtgaagctgttataatatgatttaatgtttatagc----g 13919496  T
Q  413 atgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13919495 atgtaatatatttgtatat 13919477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12952697 - 12952466
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||  |||||| || | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  12952697 catgaaagttttagataatagtgttaaatttccattggctttggtttgacttgaaactgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 12952598  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||||||  |||||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||||  || |   || |||| ||||| || |  || ||| ||| ||    
T  12952597 tcttagtgaaattttacgaaaatcccgcataactatttcaaagtcaacccaaaacttatagattgtgtccaaacttcaaatcttg-tgttctatgagctc 12952499  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12952498 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 12952466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 222 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11258986 - 11258891
Alignment:
Q  222 tctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11258986 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 11258891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13436894 - 13436776
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13436894 catgaaagttgtagataatgttgttagctttccaatggatttggtttggcttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa-gaga 13436796  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||| |||||| |||| ||||    
T  13436795 tctcagtgaatttttatgaa 13436776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15465750 - 15465631
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15465750 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15465651  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  15465650 tcttagtgaatttttatgaa 15465631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Original strand, 26054831 - 26054950
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  26054831 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcttcggttttacatgaaaatgatttttggtgtttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 26054930  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  26054931 tcttagtgaatttttatgaa 26054950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22652409 - 22652236
Alignment:
Q  163 tgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctca 262  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| |||    
T  22652409 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttca 22652310  T
Q  263 aaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggta 337  Q
    || || |  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  22652309 aagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta 22652236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 54521418 - 54521304
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  54521418 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttaattttactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 54521319  T
Q  185 tcttagtgaaatttt 199  Q
    |||||||||| ||||    
T  54521318 tcttagtgaattttt 54521304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21837685 - 21837571
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    |||||    
T  21837685 atgttatgagttgatccttcgggtaggaattgaggttgaatataatattactgatgatcagtgaagctgttacaatatgatttaatgatga----tagta 21837590  T
Q  413 atgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  21837589 atgtaataaatttgtatat 21837571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5223979 - 5223860
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  5223979 catgaaagttgtagatagttgtgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgcgatatgatgaaaatactccaaggagg 5223880  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  5223879 tcttagtgaatttttatgaa 5223860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 88 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8631395 - 8631265
Alignment:
Q  88 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 187  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||    
T  8631395 gaaagttttagataatgatgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgttgaaaacactccaaggagatct 8631296  T
Q  188 tagtgaaattttttgaaaattcagcataact 218  Q
    || |||||||||  |||||||| | ||||||    
T  8631295 tattgaaattttacgaaaattccgtataact 8631265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 313 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 12378184 - 12378091
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 406  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12378184 atgttttgagttgatccttagggtagcaatggaggttaaatacaatattaatgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttgatag 12378091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 189 - 305
Target Start/End: Original strand, 26055128 - 26055244
Alignment:
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  26055128 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 26055227  T
Q  289 aaggtatttaagagtat 305  Q
    ||||| |||||||||||    
T  26055228 aaggtgtttaagagtat 26055244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Original strand, 22764026 - 22764145
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||| || || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  22764026 catgaaagttatagataattgagttagcttttcagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaga 22764125  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  22764126 tcttagtgaatttttatgaa 22764145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Original strand, 29544408 - 29544527
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  29544408 catgaaagttgtagataatttgtttagctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 29544507  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||| ||||| |||| ||||    
T  29544508 tcttggtgaatttttatgaa 29544527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 223 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14682841 - 14682754
Alignment:
Q  223 ctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  14682841 ctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 14682754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Original strand, 28848188 - 28848307
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  28848188 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 28848287  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  28848288 tcttagtgaatttttatgaa 28848307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 34159921 - 34159842
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34159921 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 34159842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11259086 - 11258992
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  11259086 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggctcttgagatatgatgaaaatactccaa 11258992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15978127 - 15978009
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||  | | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  15978127 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtggggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 15978028  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  15978027 cttagtgaatttttatgaa 15978009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 316381 - 316267
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||| ||||| | |||||| || || |||| ||||||||||||||    |||||    
T  316381 atgttatgagttgatcattgggatatgaatggaggttgattatgatattactgatgctatgtgaatctattgtaatgtgatttaatgttga----tagta 316286  T
Q  413 atgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    
T  316285 atgtaatatatttgtatat 316267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 17463773 - 17463694
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17463773 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 17463694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 55477086 - 55477007
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  55477086 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 55477007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Original strand, 7780914 - 7781032
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| || ||||||  | | ||||||||||||||||||| ||| |    
T  7780914 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttctggtttaggcgttatgatgaaaatactccaaggaggt 7781013  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  7781014 cttagtgaatttttatgaa 7781032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 200
Target Start/End: Original strand, 16453847 - 16453961
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |    
T  16453847 atgaaagttgtagataattttattagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggt 16453946  T
Q  186 cttagtgaaattttt 200  Q
    ||||||||| |||||    
T  16453947 cttagtgaatttttt 16453961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8023878 - 8023721
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| |||  ||     
T  8023878 catgaaagttttagataaatatgttagctttctaatggcttgggtttgacttaaaaatgatttctagattttgagttatgatgaaaatactacaagtagg 8023779  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    | || ||| |||||   ||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  8023778 ttttggtgcaatttaacgaaaatttagcataactatttttaagtcaacccaaaactta 8023721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36528170 - 36528061
Alignment:
Q  88 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 187  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || | | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||| |||    
T  36528170 gaaagttttagataattttgtcagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgattcttggtgtttgatttatgatgaaaataccccaaggaggtct 36528071  T
Q  188 tagtgaaatt 197  Q
    ||| ||||||    
T  36528070 tagcgaaatt 36528061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 268 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18893063 - 18892975
Alignment:
Q  268 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    ||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18893063 agaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattata 18892975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Original strand, 10247290 - 10247409
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| | ||| |||| ||  |||     
T  10247290 catgaaagttgtagataattgcgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgtgttatggtcaaattactgcacggagg 10247389  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  10247390 tcttagtgaatttttatgaa 10247409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15413026 - 15412947
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  15413026 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcgatttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 15412947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 13151357 - 13151431
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 159  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  13151357 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgaattttggtttatgag 13151431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 45606473 - 45606547
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 159  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  45606473 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcgttttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 45606547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 197
Target Start/End: Original strand, 3264646 - 3264818
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 124  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||    || || ||   || ||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |     
T  3264646 cgagcttaggaaaaccaacttttctggaattttctgtttcgaattgtcctttggtgtaaacacgaaagttttagataattttgttagcttcccagtggcc 3264745  T
Q  125 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatt 197  Q
      |||||||| ||||||||||||||| | |||||  | |||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||    
T  3264746 atggtttgacgtgaaaatgatttttgatgtttgatttgtgatgaaaataccccaaggaggtcttagcgaaatt 3264818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 317
Target Start/End: Original strand, 19568940 - 19568996
Alignment:
Q  261 caaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19568940 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19568996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 234 - 317
Target Start/End: Original strand, 42353218 - 42353302
Alignment:
Q  234 caaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggta-tttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  42353218 caaaacttagggaataattctaaacctcaaaacaaaaagtattaggagtttaattaagggagtttaagagtatttaacgtatgtt 42353302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6002603 - 6002446
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||  ||     
T  6002603 catgaaggttttagataattatgttatctttccaatggcgttagtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtagg 6002504  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    |||| | ||||||||    ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||| |||||    
T  6002503 tcttggggaaattttaaagaaatttagcataactatttccaagtcattccaatactta 6002446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 195
Target Start/End: Original strand, 11986844 - 11986912
Alignment:
Q  127 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 195  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||    
T  11986844 ggtttgacttgaaaatgatctttagtttttgagttatgatgaaaatactacaagggggtcttagtgaaa 11986912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 6468701 - 6468780
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   || ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  6468701 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtccgtttgacttgaaaataattttcggtttatgagttatg 6468780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 13153823 - 13153896
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 159  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  13153823 catgaaagttgtagata-ttgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgaattttggtttatgag 13153896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Original strand, 17759054 - 17759148
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 179  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||| |||||| |||| |||||||    
T  17759054 catgaaagttttagataattttgttagcttttcaatggatttggtttgacttaaaaattgtttgtggattttgagttatgataaaaacactccaa 17759148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Original strand, 19060374 - 19060468
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 179  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||| |||||| |||| |||||||    
T  19060374 catgaaagttttagataattttgttagcttttcaatggatttggtttgacttaaaaattgtttgtggattttgagttatgataaaaacactccaa 19060468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 171
Target Start/End: Original strand, 40039740 - 40039826
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa 171  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||   | ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  40039740 catgaaagttttagataattttgttatcttttcaatggatttggtttgacttgaaaatattttatggattttgagttatgatgaaaa 40039826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 394
Target Start/End: Original strand, 52523593 - 52523667
Alignment:
Q  320 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatt 394  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  52523593 gagttgaactttggggtagtaatgaagattgtataagatattaatgatgatctgagaagctgttataagatgatt 52523667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 356
Target Start/End: Original strand, 32402819 - 32402862
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32402819 atgttatgagttgatctttagggtaggaatggaggttgattata 32402862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Original strand, 8269382 - 8269472
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  8269382 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggcttgggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 8269472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Original strand, 8276493 - 8276583
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  8276493 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtcgaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 8276583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 134
Target Start/End: Original strand, 17956848 - 17956897
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgac 134  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  17956848 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgac 17956897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 318 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21618692 - 21618627
Alignment:
Q  318 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 383  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21618692 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctatgaagctgtt 21618627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 27840549 - 27840500
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgac 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  27840549 catgaaagttgtagataattttgttagccttctaatgactttggtttgac 27840500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 318 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 36166841 - 36166776
Alignment:
Q  318 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 383  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36166841 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctatgaagctgtt 36166776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 406
Target Start/End: Original strand, 29172491 - 29172579
Alignment:
Q  318 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 406  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| ||||  ||||| || ||||  ||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  29172491 atgagttgatccttggggtaggaatggaggtcggttatagtattgttgatgttcagtgagtctgatataatataatttgatgttgatag 29172579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 9577882 - 9577795
Alignment:
Q  315 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||| |||||||||  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  9577882 gttataagttgatccttggggtgggaacgaaggttgattataatattgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttg 9577795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16820552 - 16820505
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttg 132  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  16820552 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcattggtttg 16820505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15207199 - 15207161
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttga 351  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15207199 atgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttga 15207161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15246281 - 15246243
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttga 351  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15246281 atgttatgagttgatccttgtggtaggaatggaggttga 15246243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15265402 - 15265364
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttga 351  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15265402 atgttattagttgatccttggggtaggaatggaggttga 15265364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 37427976 - 37427930
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 359  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  37427976 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttggttataata 37427930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16059659 - 16059622
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16059659 atgttatgagttggtctttggggtaggaatggaagttg 16059622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 166
Target Start/End: Original strand, 54039146 - 54039227
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgat 166  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   ||||||||||||    
T  54039146 catgaatgttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgat 54039227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Original strand, 1468633 - 1468669
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1468633 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 1468669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 12808595 - 12808559
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12808595 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 12808559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Original strand, 14528644 - 14528708
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||   | ||||||||||  |||||||||||    
T  14528644 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggatttggtttgacttccaaatgattttt 14528708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Original strand, 16934830 - 16934894
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  16934830 catgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgattttt 16934894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 353 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23274910 - 23274882
Alignment:
Q  353 tataatattaatgatgatctgtgaagctg 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23274910 tataatattaatgatgatctgtgaagctg 23274882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 25058388 - 25058324
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  25058388 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgattttt 25058324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 49231858 - 49231794
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  49231858 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgattttt 49231794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 120)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 25 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 10057188 - 10056786
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10057188 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcaccaaagttgtagataattttgttagctttccaatggca 10057089  T
Q  125 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 224  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10057088 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataacagtttct 10056989  T
Q  225 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10056988 aagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaatctagaagtaccaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttatgagtt 10056889  T
Q  325 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatt 424  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  10056888 gatcctttgggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatt 10056793  T
Q  425 tgtatat 431  Q
    |||||||    
T  10056792 tgtatat 10056786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 85 - 431
Target Start/End: Original strand, 630299 - 630641
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  630299 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 630398  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  630399 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 630498  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  630499 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtatgaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctatta 630598  T
Q  385 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  630599 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 630641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 85 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12611507 - 12611165
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  12611507 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaacgagg 12611408  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12611407 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 12611308  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  12611307 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatctatgaagctatta 12611208  T
Q  385 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  12611207 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 12611165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 85 - 431
Target Start/End: Original strand, 23802860 - 23803202
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||     
T  23802860 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatagtccaaggagg 23802959  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23802960 tcttagtgaaaccttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 23803059  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  23803060 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttatgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctatta 23803159  T
Q  385 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  23803160 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 23803202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 85 - 431
Target Start/End: Original strand, 51463463 - 51463805
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||     
T  51463463 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtctaaggagg 51463562  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||| | || |||||||||||||||||||| |||||     
T  51463563 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaatttatgcgataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttt 51463662  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  51463663 aattaaggcgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattattgatgatctgtgaagctatta 51463762  T
Q  385 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  51463763 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 51463805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9638663 - 9638399
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  9638663 catgaaagttttatataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 9638564  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  9638563 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaatctcaaaactagaagtactatgagttc 9638464  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  9638463 aattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 9638399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28385899 - 28385646
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  28385899 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 28385800  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28385799 tcttagtgaatttttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 28385700  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||| || |||||||||    
T  28385699 aattaaggtgtttaagagtatttaacccaagttgtgagttggtccttggggtag 28385646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35660502 - 35660270
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  35660502 catgaaagttttagatagttttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 35660403  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||     
T  35660402 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataatctcaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 35660303  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  35660302 aattaaagtgtttaagagtatttaacctatgtt 35660270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 381
Target Start/End: Original strand, 56115232 - 56115528
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  56115232 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 56115331  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  56115332 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaagcagaagtactatgagttc 56115431  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 381  Q
     | |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| | ||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  56115432 tattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaaccttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaagctg 56115528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15008622 - 15008342
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15008622 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15008523  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15008522 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggcataattcgaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 15008423  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 365  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||   |||  |||||||  |||||||||||||    
T  15008422 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttggtccttgggggtagaaacgaggttgtttataatattaatg 15008342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15990695 - 15990439
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15990695 catgaaagttttagataatttagttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15990596  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15990595 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttc 15990496  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaa 341  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  15990495 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttggtcattggggtaggaa 15990439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 53630869 - 53631101
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  53630869 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaatgagg 53630968  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  53630969 tcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 53631068  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  53631069 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 53631101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Original strand, 10694643 - 10694896
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||     
T  10694643 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggagg 10694742  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10694743 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 10694842  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  10694843 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 10694896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Original strand, 10908409 - 10908662
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||     
T  10908409 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggagg 10908508  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10908509 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 10908608  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  10908609 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 10908662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 90 - 315
Target Start/End: Original strand, 11479012 - 11479237
Alignment:
Q  90 aagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctta 189  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11479012 aagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtctta 11479111  T
Q  190 gtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaacta 289  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  11479112 gtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttccaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaatta 11479211  T
Q  290 aggtatttaagagtatttaacctatg 315  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  11479212 aggtgtttaagattatttaacctatg 11479237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25091309 - 25091077
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25091309 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 25091210  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25091209 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcgaaactagaagtactatgagttc 25091110  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25091109 aactagggtgtttaagagtatttaaccaatgtt 25091077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 87 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10705152 - 10704890
Alignment:
Q  87 tgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatc 186  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||    
T  10705152 tgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctctggcttgacttgaaaataattttttgtttttgagatatgatgaaaatattgcaaggaggtc 10705053  T
Q  187 ttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaa 286  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10705052 ttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 10704953  T
Q  287 ctaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  10704952 ttaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 10704890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 87 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10918922 - 10918660
Alignment:
Q  87 tgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatc 186  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||    
T  10918922 tgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctctggcttgacttgaaaataattttttgtttttgagatatgatgaaaatattgcaaggaggtc 10918823  T
Q  187 ttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaa 286  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10918822 ttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 10918723  T
Q  287 ctaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  10918722 ttaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 10918660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9923852 - 9923622
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  || | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  9923852 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 9923753  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9923752 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 9923653  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 315  Q
    || |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  9923652 aattaaggtgtttaatagtgtttaacctatg 9923622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 40620186 - 40619907
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40620186 catgaaagttgtaaataattgtgctagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaatgagg 40620087  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  40620086 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaatctcaaaactagaagtactatgagtta 40619987  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 365  Q
    || |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  40619986 aattaaggtgtttaagagtattatacctatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 40619907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 42875455 - 42875223
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  42875455 catgaaagttgtagataattaagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 42875356  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42875355 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcgtaactgtttctaagttaatccaaaacttaatgaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 42875256  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  42875255 aactagggtgtttaggagtatttaacctatgtt 42875223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 37019325 - 37019095
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  37019325 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 37019226  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  37019225 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttataagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgggttc 37019126  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 315  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37019125 aactaaggtgtttaagagtatttaacctatg 37019095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 88 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3337752 - 3337523
Alignment:
Q  88 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  3337752 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagttttcaatatatgatgaaaatactccaaggaggtct 3337653  T
Q  188 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 287  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  3337652 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaat 3337553  T
Q  288 taaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3337552 taaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 3337523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 330
Target Start/End: Original strand, 15447812 - 15448057
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| | || | | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15447812 catgaaagttgtaggtaattgagttagctttctattggctttggtctgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15447911  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15447912 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactggaagtactatgagttc 15448011  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 330  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15448012 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttctgagttgatctt 15448057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 19435093 - 19435326
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  19435093 catgaaagttgtagataactttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaagagg 19435192  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  19435193 tcttagtgaaattatatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcagtctaaaatttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 19435292  T
Q  285 aactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  19435293 aattaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 19435326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 89 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19609976 - 19609748
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19609976 aaagttgtagataattgagttacctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 19609877  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19609876 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttaaggtataattccaaacctcaaaactagaagtactatcagttcaact 19609777  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19609776 agggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19609748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Original strand, 24046930 - 24047201
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |   ||     
T  24046930 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattcttggtttttgagttatgatggaaatactctaggtagg 24047029  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  24047030 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 24047129  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||    
T  24047130 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgaccattagggtaggaatggaggttgattata 24047201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 10356832 - 10357064
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||| || | | ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||     
T  10356832 catgaaagttgtagataatggagttagctttccagtggctttggtgtgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatacaccaaggagg 10356931  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  10356932 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 10357031  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10357032 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 10357064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16998181 - 16997954
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  16998181 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttaaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 16998082  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||     |||||||| |||||     
T  16998081 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaa-----aagtactatgagttg 16997987  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16997986 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 16997954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 33243692 - 33243924
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |     
T  33243692 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgattttgatttgacttgaaaataatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaagggg 33243791  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  33243792 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 33243891  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || | |||| ||||||||||  |||||||||||    
T  33243892 aattgaggtgtttaagagtagctaacctatgtt 33243924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 33849398 - 33849102
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| | ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  33849398 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 33849299  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  33849298 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 33849199  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 381  Q
    || |||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||| | ||||||||    
T  33849198 aattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatgtttgaagctg 33849102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15114878 - 15114648
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  15114878 catgaaagttgtagataatttagttagatttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactcaaagtagg 15114779  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  15114778 tcttagtgaaatttat-gaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaccttaaaactagaagtactaggagttt 15114680  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15114679 aattaaggagtttaagagtatttaacctatgt 15114648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 85 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 33186557 - 33186312
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  33186557 catgaaagttgtagataattttgttagctttccagtggctttggtttgactcgaaaataatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaga 33186458  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  33186457 tcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataacattttctaagttagtccaaaacttatggaataactccaaccctcaaaattagaagtactatgagttc 33186358  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 330  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  33186357 aattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatctt 33186312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14549282 - 14549050
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||     
T  14549282 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgagttttggttcttgagatatgatgaaagtactccatggagg 14549183  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14549182 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaagactagaagtactatgagttc 14549083  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14549082 aactagggtgtttaagagtatttagcctatgtt 14549050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18213222 - 18212951
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  18213222 catggaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 18213123  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  18213122 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 18213023  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18213022 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 18212951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 340
Target Start/End: Original strand, 16277723 - 16277978
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  16277723 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaacggctttggtttgactcgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 16277822  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    | ||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  16277823 ttttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 16277922  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 340  Q
    || |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  16277923 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 16277978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 340
Target Start/End: Original strand, 53387333 - 53387588
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  53387333 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 53387432  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||    
T  53387433 tcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaattagaagtaatatgagttc 53387532  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 340  Q
    || |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  53387533 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 53387588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 85 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3485564 - 3485347
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| | || | || |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3485564 catgaaagttgtagataattgtgttagttttctagtggcgtcagtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaga 3485465  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||     
T  3485464 tcttagtgaa--ttgttaaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattc-caaccccaagactagaagtactaggagttt 3485368  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtat 305  Q
    || |||||| |||||||||||    
T  3485367 aattaaggtgtttaagagtat 3485347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 89 - 273
Target Start/End: Original strand, 15011913 - 15012097
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||  || | | |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  15011913 aaagttgtagataattaagttagctttcccgtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttagttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtctt 15012012  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagt 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15012013 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagt 15012097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 19566315 - 19566546
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  19566315 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 19566414  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| ||||||    
T  19566415 tcttactgaaattttgtgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 19566513  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19566514 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19566546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 46740854 - 46740619
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||      
T  46740854 catgaaagttgtagataattttgttagctttccagtgactttggtttgacttgaaaatgatgtttggtttttgagttatgataaaaatactccaaagacg 46740755  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  46740754 tcttagtgaaattttgtgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 46740656  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  46740655 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatga 46740619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40229959 - 40229723
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  40229959 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaggagg 40229860  T
Q  185 tctt-agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||    
T  40229859 tcttaagtgaaattttatgaaaattctgcataattatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagtt 40229761  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40229760 caattaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 40229723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14630482 - 14630250
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  14630482 catgaaagttgtagataattgtgttagttttccagtggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 14630383  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14630382 tcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 14630283  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14630282 aattagggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 14630250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15344531 - 15344297
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  15344531 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 15344432  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||||| ||| |   || |||  ||||| ||  | |||||| ||||||    
T  15344431 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttatggattgtctccaaa-ttcaaagct-tatgtactatgagttc 15344334  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15344333 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 15344297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 86 - 309
Target Start/End: Original strand, 10237895 - 10238117
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  10237895 atgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggt 10237994  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 285  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||| ||||| |    
T  10237995 cttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttaa 10238093  T
Q  286 actaaggtatttaagagtatttaa 309  Q
    | ||| || |||||||||||||||    
T  10238094 attaatgtgtttaagagtatttaa 10238117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11425601 - 11425379
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||| |  | | ||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  11425601 catgaaagttgtagatgattgagttagctttccagtagctttggttttacgtgcaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaaggagg 11425502  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  11425501 tcttagtgaaa----------attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactattagttc 11425412  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11425411 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 11425379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 86 - 316
Target Start/End: Original strand, 15214442 - 15214672
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |  |    
T  15214442 atgaaagttttaattaattttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttggattttgagatatgatggaattaccccaagcaagt 15214541  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 285  Q
    ||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  15214542 cttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaatatttccaaacctcgaaactggaagtactaggagttta 15214641  T
Q  286 actaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    | ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  15214642 attaagaggtttaagagtatttaacctatgt 15214672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 88 - 321
Target Start/End: Original strand, 44024003 - 44024235
Alignment:
Q  88 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 187  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  || | | |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  44024003 gaaagttgtagataattgtgttagatttcccgtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtttctgagttattatgaaaatactccaaggaggtct 44024102  T
Q  188 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 287  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||||     
T  44024103 tagtgaaattttatgaaaattccgcataactgtttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaat 44024201  T
Q  288 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44024202 taaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 44024235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 86 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25513397 - 25513167
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  25513397 atgaaagttgtagataattgtgttagctttccattgactttggttcgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggt 25513298  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 285  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||  |   |  |||||||||| || |  |||||| |||||||    
T  25513297 cttagtgaaattttatgaaagttccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgggttgtcttcaaacctcaaagcttg-tgtactacgagttca 25513199  T
Q  286 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    | || ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25513198 attacggtgtttaagaatatttaacctatgtt 25513167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 191 - 336
Target Start/End: Original strand, 15883917 - 15884062
Alignment:
Q  191 tgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaa 290  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  15883917 tgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttgatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa 15884016  T
Q  291 ggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggt 336  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  15884017 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggt 15884062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Original strand, 16026325 - 16026482
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  16026325 catgaaagttttagataattgtgctagctttccagtggcttcagtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 16026424  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  16026425 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataagtatttctaagttaacccaaaactta 16026482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 55582847 - 55582703
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  55582847 catgaaagttttagataatcgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatgtttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaga 55582748  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagtt 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  55582747 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtt 55582703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 318
Target Start/End: Original strand, 45314733 - 45314965
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | ||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  45314733 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgagtctggtttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 45314832  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||  ||| |   || |||| ||||| || |  | | || ||||||    
T  45314833 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttgtggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcattatgagttc 45314931  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtta 318  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45314932 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtta 45314965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26445540 - 26445309
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  | | ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  26445540 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtagctttggtttgaattgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 26445441  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| || |||    
T  26445440 tcttggtgaaattttatgaaaatttcggataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgatttc 26445342  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26445341 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 26445309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 228
Target Start/End: Original strand, 18108274 - 18108417
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||   |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  18108274 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggtgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 18108373  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18108374 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagt 18108417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 2425017 - 2425248
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||     
T  2425017 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttgctttttgagttatgatgaaactactccaaggagg 2425116  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||  |||||  | |  | |||| ||||||    
T  2425117 tcttagtgaaattttatgaaatttccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaaggttg-tgcactatgagttc 2425215  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2425216 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 2425248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17333542 - 17333428
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||    
T  17333542 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataataatactgatgttctgtgaagctgttataatatgatttaatgtt----gttagta 17333447  T
Q  413 atgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17333446 atgtaatatatttgtatat 17333428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15534777 - 15534658
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  15534777 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15534678  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  15534677 tcttagtgaatttttatgaa 15534658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Original strand, 49547340 - 49547459
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  49547340 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 49547439  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||| |||| |||| ||||    
T  49547440 tcttaatgaatttttatgaa 49547459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14049173 - 14049054
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||     
T  14049173 catgaaagttgtatataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatcataaaaatactccaaggagg 14049074  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  14049073 tcttagtgaatttttatgaa 14049054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 36038466 - 36038347
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||     
T  36038466 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgataaaaatactcaaaggagg 36038367  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  36038366 tcttagtgaatttttatgaa 36038347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Original strand, 12033341 - 12033459
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  12033341 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 12033440  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  12033441 cttagtgaatttttatgaa 12033459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 212
Target Start/End: Original strand, 22725494 - 22725608
Alignment:
Q  98 gataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| | | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||     
T  22725494 gataattttgttagctttccaaaggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaagtcttactgaaatc 22725593  T
Q  198 ttttgaaaattcagc 212  Q
    || ||||||||||||    
T  22725594 ttatgaaaattcagc 22725608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44615883 - 44615765
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  44615883 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 44615784  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  44615783 cttagtgaatttttatgaa 44615765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14825730 - 14825616
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    |||||    
T  14825730 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttga----tagta 14825635  T
Q  413 atgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14825634 atgtaatatatttgtatat 14825616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 381
Target Start/End: Original strand, 43251120 - 43251255
Alignment:
Q  247 ataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtattt-aagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgga 345  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||  |||| |    
T  43251120 ataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggataacaatgaa 43251219  T
Q  346 ggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 381  Q
     |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43251220 agttgtatatgatattaatgatgatctgtgaagctg 43251255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 20595827 - 20596056
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||  | | ||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||  ||     
T  20595827 catgaaagttttagatacatgtattagctttctaatggctttggtttgacatgaaaataatttttagattttgagttatgatgaaaatacttcaagtagg 20595926  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||| || || ||||||| ||  | || | ||||||||||||| | |||  |||||||||    
T  20595927 tcttggtgaaattttacgaaaattcagcataattatttgtaagtcaaccccaaacttatggtttgatgccaaacctcaaaacttg-agttataggagttc 20596025  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 315  Q
    || || | | |||||||||||||||||||||    
T  20596026 aattatgatgtttaagagtatttaacctatg 20596056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 249 - 350
Target Start/End: Original strand, 9871126 - 9871226
Alignment:
Q  249 aattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggt 348  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| ||    
T  9871126 aattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtttatc-ttgggataggaatggaagt 9871224  T
Q  349 tg 350  Q
    ||    
T  9871225 tg 9871226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14185538 - 14185426
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || | | ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||     
T  14185538 catgaaagttgtagataagtgtgttagctttccagtggctttggtgtgacttgaaaatgattcttggtttttgagttatgatgaaaatacgccaaggagg 14185439  T
Q  185 tcttagtgaaatt 197  Q
    |||||| ||||||    
T  14185438 tcttagcgaaatt 14185426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 30147511 - 30147392
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||  ||     
T  30147511 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggttttacttaaaaatgatttttaacttttgagatatgatggaaatactccaagtagg 30147412  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  30147411 tcttagtgaatttttatgaa 30147392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Original strand, 50221907 - 50222025
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  50221907 atgaaagttgtagataagtttgttggctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 50222006  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  50222007 cttagtgaatttttatgaa 50222025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 15117919 - 15117998
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15117919 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 15117998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29267948 - 29267830
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||   | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  29267948 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttagtgtggagtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 29267849  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    || |||||| |||| ||||    
T  29267848 ctcagtgaatttttatgaa 29267830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Original strand, 54364086 - 54364244
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||   |     
T  54364086 catgaaagttttagataattttgttagatttccaatgaatttagtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacactccaagtggg 54364185  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttag 243  Q
    |||| | ||||||||  | ||| | ||||||||| |||| |||| || |||||||||||    
T  54364186 tcttggagaaattttaagtaaacttagcataactatttccaagtcaacccaaaacttag 54364244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 226
Target Start/End: Original strand, 13046041 - 13046182
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||||||||||  ||     
T  13046041 catgaaagttttatataaatttgttagctttccaatgcctttggtttgacttgaaaatgatttttatatttttatttatgatgaaaatactccaagtagg 13046140  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 226  Q
    |||| || |||||||  ||||||||| ||||||  |||||||    
T  13046141 tcttggtaaaattttacgaaaattcaacataaccatttctaa 13046182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19243294 - 19243177
Alignment:
Q  87 tgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||   | || ||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  19243294 tgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggagtaaatatgatttttggtttaggtgttatgatgaaaatactccaaggaggtc 19243195  T
Q  187 ttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  19243194 ttagtgaatttttatgaa 19243177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 7640753 - 7640832
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  7640753 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 7640832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 1837086 - 1837160
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 159  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1837086 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgtcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 1837160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 319 - 431
Target Start/End: Original strand, 26050340 - 26050448
Alignment:
Q  319 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 418  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||  ||| ||||||||||||| |||||||    ||||||||| |    
T  26050340 tgagttgatccttgggttaggaatggaggttgattataatattattgatgttcaatgagtctgatataatatgatttgatgttga----tagtaatgtga 26050435  T
Q  419 tatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||    
T  26050436 tatatttgtatat 26050448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 314
Target Start/End: Original strand, 13036332 - 13036402
Alignment:
Q  244 ggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 314  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||||||||||||||    
T  13036332 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctat 13036402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 320 - 402
Target Start/End: Original strand, 52243059 - 52243141
Alignment:
Q  320 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  52243059 gagttgaactttggggtagtaatgaagattgtataagatattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg 52243141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12622927 - 12622792
Alignment:
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  12622927 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgt-gtactatgagttc 12622829  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12622828 aattaaggtgtttaagagtatttaacctattttatga 12622792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14508317 - 14508186
Alignment:
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| | ||| || |  |||||| ||||||    
T  14508317 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaactttaaagcttgt-gtactatgagttc 14508219  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14508218 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14508186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 240
Target Start/End: Original strand, 19081780 - 19081892
Alignment:
Q  128 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 227  Q
    ||||||| | ||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||    
T  19081780 gtttgacatcaaaatgatttttaaattttgagttatgatgaaaacacttcaaggagatcttggtaaaattttacgaaaattcagcataaccgtttccaag 19081879  T
Q  228 ttaatccaaaact 240  Q
    | || ||||||||    
T  19081880 tcaacccaaaact 19081892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 18239179 - 18239253
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 159  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | || |||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18239179 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtctgtttcacttgaaaatgattttcggtttatgag 18239253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 142
Target Start/End: Original strand, 9871071 - 9871128
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaat 142  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  9871071 catgaaagttttagataattttgttagcttttcaatgactttggtttgacttgaaaat 9871128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 402
Target Start/End: Original strand, 13591785 - 13591874
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| || ||||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  13591785 atgttattagttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttcagtgagtctgatataatgtgatttaatgttg 13591874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 406
Target Start/End: Original strand, 32306854 - 32306947
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 406  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || || |  ||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  32306854 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattattgatgttcagtaagtctgatataatatggtttgatgttgatag 32306947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Original strand, 44772650 - 44772719
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggttt 154  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44772650 catgaaagttgtagataattgtattatctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggttt 44772719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 9886455 - 9886387
Alignment:
Q  31 taggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtaga 99  Q
    ||||||||||||||||| |   | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9886455 taggaaaatcaacttttctaccactttcttttctgaattaggtttgggagtattcatgaaagttgtaga 9886387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 171
Target Start/End: Original strand, 17376062 - 17376148
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg-acatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa 171  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  17376062 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttaggttt-acttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaa 17376148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18247829 - 18247739
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  18247829 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 18247739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Original strand, 22355079 - 22355169
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  22355079 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22355169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 47357273 - 47357183
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  47357273 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggccttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 47357183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 318 - 404
Target Start/End: Original strand, 54798627 - 54798713
Alignment:
Q  318 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgat 404  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||    
T  54798627 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgat 54798713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 137
Target Start/End: Original strand, 14873653 - 14873705
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttg 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  14873653 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttg 14873705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 14951360 - 14951296
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  14951360 catgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttt 14951296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 13234618 - 13234547
Alignment:
Q  29 cataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagat 100  Q
    |||||||||||||| | || ||  | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13234618 cataggaaaatcaattgttctgtcactttatgttccgaattaggtttggtagtcttcatgaaagttgtagat 13234547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 14280557 - 14280474
Alignment:
Q  321 agttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgat 404  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||    
T  14280557 agttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgat 14280474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 26789598 - 26789555
Alignment:
Q  315 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataat 358  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26789598 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataat 26789555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 175
Target Start/End: Original strand, 17146303 - 17146389
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  17146303 aaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 17146389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 166
Target Start/End: Original strand, 15287878 - 15287959
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgat 166  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   ||||||||||||    
T  15287878 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgat 15287959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 166
Target Start/End: Original strand, 15294988 - 15295069
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgat 166  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   ||||||||||||    
T  15294988 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgat 15295069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Original strand, 26922254 - 26922299
Alignment:
Q  272 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26922254 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 26922299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15792034 - 15791990
Alignment:
Q  315 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 359  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15792034 gttatgagttgatcattgaggtaggaatggaggttgattataata 15791990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Original strand, 55377205 - 55377269
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  55377205 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttt 55377269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12230551 - 12230500
Alignment:
Q  50 ggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagata 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  12230551 ggaattttcggttctgaattaggatttggtgtcttcatcaaagttgtagata 12230500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 10643836 - 10643746
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  10643836 catgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggttttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 10643746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19020099 - 19020009
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  19020099 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 19020009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 402
Target Start/End: Original strand, 44928821 - 44928871
Alignment:
Q  352 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||    
T  44928821 atataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattttatgttg 44928871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 383
Target Start/End: Original strand, 8574742 - 8574807
Alignment:
Q  318 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 383  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8574742 atgagttggtctttagggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctatgaagctgtt 8574807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 316
Target Start/End: Original strand, 12134425 - 12134486
Alignment:
Q  255 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  12134425 aaacttcaaaactaaaagtattaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 12134486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 397
Target Start/End: Original strand, 20157189 - 20157234
Alignment:
Q  352 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaa 397  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  20157189 atatgatattaatgatgatctgtgaagttgttatatgatgatttaa 20157234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 44102433 - 44102404
Alignment:
Q  352 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102433 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 44102404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Original strand, 5683375 - 5683439
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   | |||||||| |  |||||||||||    
T  5683375 catgaaagttttaggtaattttgttagctttccaatggttttggtttgacgtccaaatgattttt 5683439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 8374130 - 8374094
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8374130 catgaaagttgtagataattttgttaactttctaatg 8374094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12622968 - 12622936
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttcc 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12622968 catgaaagttgtagataattgtgttagctttcc 12622936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 14995734 - 14995670
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  14995734 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatgtcgttggtttgaggtctaaatgattttt 14995670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16731766 - 16731702
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| || |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  16731766 catgaaagttttagataattatgttagctctctaatggctttggtttgacttccaaatgattttt 16731702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 18168383 - 18168347
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18168383 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 18168347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 110)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 25 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27472969 - 27472567
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27472969 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcattaaagttgtagataattttgttagctttccagtgaaa 27472870  T
Q  125 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 224  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27472869 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 27472770  T
Q  225 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27472769 aagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttatgagtt 27472670  T
Q  325 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatt 424  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||    
T  27472669 gatccttggggtaggactggaggttgaatataatattactaatgatctgtgaagctgttaaaatatgatttaatgttga----tagtaatataatatatt 27472574  T
Q  425 tgtatat 431  Q
    |||||||    
T  27472573 tgtatat 27472567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 25 - 431
Target Start/End: Original strand, 34873783 - 34874185
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34873783 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttggaagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggca 34873882  T
Q  125 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 224  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  34873883 ttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttct 34873982  T
Q  225 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34873983 aagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagtt 34874082  T
Q  325 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatt 424  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| |||||||||||    
T  34874083 gatccttgggataggaatggaggttgaatataatattactgatgatatgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----aagtattgtaatatatt 34874178  T
Q  425 tgtatat 431  Q
    |||||||    
T  34874179 tgtatat 34874185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 25 - 362
Target Start/End: Original strand, 34858721 - 34859058
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34858721 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttggaagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggca 34858820  T
Q  125 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 224  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  34858821 ttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttct 34858920  T
Q  225 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34858921 aagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagtt 34859020  T
Q  325 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatatta 362  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34859021 gatccttgggataggaatggaggttgaatataatatta 34859058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 85 - 431
Target Start/End: Original strand, 18358365 - 18358706
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18358365 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgttttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 18358464  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18358465 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 18358564  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  18358565 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattaccgatgatctgcgaagctgtta 18358664  T
Q  385 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    | |||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||    
T  18358665 t-atatgatttaatgttga----tagtaatgtattatatttgtatat 18358706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 85 - 431
Target Start/End: Original strand, 22173424 - 22173766
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  22173424 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgggtttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 22173523  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||    
T  22173524 tcttagtgaaaccttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaccctcaaaactcaaagtactatgagttc 22173623  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22173624 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctatta 22173723  T
Q  385 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  22173724 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 22173766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 85 - 431
Target Start/End: Original strand, 21081367 - 21081709
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21081367 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttaaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21081466  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21081467 tcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 21081566  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21081567 aattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtaggaatggaggatgaatataatattactgatgatatgtgaagctgtta 21081666  T
Q  385 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||    
T  21081667 taatatgatttaatgttga----tactaatgtaatatatttgtatat 21081709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20915821 - 20915525
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||  |     
T  20915821 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttatgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagatttagataattttgttagttttccaattgct 20915722  T
Q  125 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 224  Q
    | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||     
T  20915721 ttggtttgacttgaaaatgattcttattttttgagatatgatgaaaatactccaatgatatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttcc 20915622  T
Q  225 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20915621 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagctgtttaagagtatttaacctatgctatga 20915525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 349
Target Start/End: Original strand, 41301369 - 41301633
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  41301369 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaagtgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 41301468  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41301469 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttc 41301568  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggtt 349  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  41301569 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtt 41301633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26903814 - 26903561
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  26903814 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 26903715  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26903714 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttc 26903615  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  26903614 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatattgtgagttggtcattggggtag 26903561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 23969019 - 23969251
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |  |||     
T  23969019 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatacgatgaaaataattaatggagg 23969118  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23969119 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 23969218  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23969219 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 23969251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21915278 - 21915025
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| | ||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||| |||| |||     
T  21915278 catgaaagttgtagataattttgttagatttccaatggctttggtttggcgtgaaaataagttttggtttaggagttatgatgaaaataccccaaggagg 21915179  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21915178 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 21915079  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  21915078 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 21915025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25183843 - 25183603
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25183843 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 25183744  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  25183743 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtattatgagttc 25183644  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttg 325  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25183643 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 25183603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 89 - 317
Target Start/End: Original strand, 43707685 - 43707912
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  43707685 aaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 43707784  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  43707785 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccg-ttctaagttaatctaaaacttatggaataattcgaaacctcaaaactagaagtaccatgagttcaatt 43707883  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  43707884 aaggtgtttaagattatttaacctatgtt 43707912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 317
Target Start/End: Original strand, 24273656 - 24273887
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  24273656 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacctgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 24273755  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 285  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24273756 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 24273855  T
Q  286 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    | |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24273856 attaaggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 24273887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9975585 - 9975353
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  9975585 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 9975486  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9975485 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 9975386  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9975385 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 9975353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 24781236 - 24781468
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24781236 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 24781335  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24781336 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 24781435  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24781436 aactagggtgtttaagaatatttaacctatgtt 24781468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24884042 - 24883785
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24884042 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24883943  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24883942 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccctttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaattactatgagttc 24883843  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  24883842 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtagtgagttgatc-ttgggataggaatg 24883785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31520773 - 31520509
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31520773 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 31520674  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||  |||||||| ||||||    
T  31520673 tcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactgaaagtactatgagttc 31520574  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| ||||    
T  31520573 aattaaggtgtttaagagtatttaactcatgttgtgagtttatc-ttgggataggaatggaagttg 31520509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 5031526 - 5031758
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5031526 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 5031625  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5031626 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttc 5031725  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| ||||||    
T  5031726 aactaggctgtttaagagtatttaacatatgtt 5031758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 27484866 - 27485098
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||     
T  27484866 catgaaagatgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatataatgaaaatactccaagtagg 27484965  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27484966 tcttagtggaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 27485065  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27485066 aactagggtgtttaagagtatttaacatatgtt 27485098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 36839827 - 36839595
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||   | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  36839827 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggatttggttttacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 36839728  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36839727 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 36839628  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36839627 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 36839595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 85 - 332
Target Start/End: Original strand, 18388693 - 18388940
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18388693 catgaaagttgtagataattgggttagctttccagtgactttggtttgacttaaaaatgatttatggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 18388792  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18388793 tcttagtgaaatctttggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 18388892  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttg 332  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||  |||||  |||||||| ||||    
T  18388893 aattaaggtgtttaagagtattttactcatgttgagagttgatttttg 18388940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 381
Target Start/End: Original strand, 23338796 - 23339092
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  23338796 catgaaagttgtagataattttactagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 23338895  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23338896 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 23338995  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 381  Q
    || |||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  23338996 aattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatgtgtgaagctg 23339092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Original strand, 19662051 - 19662322
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  19662051 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 19662150  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  19662151 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 19662250  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19662251 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 19662322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Original strand, 21073123 - 21073394
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  |      
T  21073123 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaag 21073222  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||||    
T  21073223 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaattcaaaacttatgggataattccaatactcaaaactagaagcaatatgagttc 21073322  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21073323 aattaaggtatttcagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 21073394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 86 - 330
Target Start/End: Original strand, 10039531 - 10039775
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  10039531 atgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccagggaggt 10039630  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 285  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10039631 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 10039730  T
Q  286 actaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 330  Q
    | |||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||    
T  10039731 attaaggtgtttaagagtatttaatccatgatgtgagttgatctt 10039775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17307143 - 17306911
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | || | | |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||     
T  17307143 catgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcctgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17307044  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17307043 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttcttagttaatccaaaacttaaggaataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttc 17306944  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  17306943 aactaaggtgtttaagatcatttaacatatgtt 17306911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21368763 - 21368532
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||   | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  21368763 catgaaagttttagataattgtgttagctttccggtggatttggtttggcttgaaaatgagttttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 21368664  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  21368663 tcttagtgaaattttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaaattatggaataattctaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 21368564  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    || ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  21368563 aaataagaggtttaagagtatttaacctatgt 21368532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 316
Target Start/End: Original strand, 19201596 - 19201828
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa-tactccaatgag 183  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  19201596 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatatgtggttcttgagatatgatgaaaaatactccaaggag 19201695  T
Q  184 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 283  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19201696 gtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatttaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 19201795  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
     || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19201796 taattaaggggtttaagagtatttaacctatgt 19201828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9242416 - 9242145
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||    
T  9242416 catggaagttttagataattttgttagcttcccaatggctttggtttgactttaaagtgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaga 9242317  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  9242316 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 9242217  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9242216 aactaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattata 9242145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 323
Target Start/End: Original strand, 20590718 - 20590956
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  20590718 catgaaagctgtagataattttgttatctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 20590817  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  20590818 tcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttaagggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 20590917  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagt 323  Q
    || |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20590918 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagt 20590956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 89 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6483171 - 6482946
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  || ||||    
T  6483171 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtctt 6483072  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaactagaagtactaggagttcaac 287  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || |||||     
T  6483071 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaat 6482972  T
Q  288 taaggtatttaagagtatttaaccta 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  6482971 taaggtgtttaagagtatttaaccta 6482946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 89 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6486638 - 6486413
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  || ||||    
T  6486638 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtctt 6486539  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaactagaagtactaggagttcaac 287  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || |||||     
T  6486538 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaat 6486439  T
Q  288 taaggtatttaagagtatttaaccta 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  6486438 taaggtgtttaagagtatttaaccta 6486413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9785238 - 9785013
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  9785238 catgaaagttgttgataattgtgttagctttcaagtggcgttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 9785139  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  9785138 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagaactaggagttt 9785039  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    || |||||  ||||| ||||||||||    
T  9785038 aattaaggggtttaacagtatttaac 9785013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 28349573 - 28349268
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||     
T  28349573 catgaaagttttagataattttgttagctttgcaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatggaaatactccaagtagg 28349474  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta-ggga--------ataattcaaaacctcaaaactagaagtac 275  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28349473 tcttcgtgaaatcttatgaaaattcagctcaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgggataattccaaagctcaaaactagaagtac 28349374  T
Q  276 taggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtg 375  Q
    || |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  |||||||||||||||||||    
T  28349373 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgatttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaatgatgatctgtg 28349274  T
Q  376 aagctg 381  Q
    ||||||    
T  28349273 aagctg 28349268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Original strand, 6260774 - 6261045
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  6260774 catgaaagttgtagataattttgttaactttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 6260873  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||      
T  6260874 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaaatattacgagtga 6260973  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||    
T  6260974 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttagggtaggaatggaggttgattata 6261045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 88 - 310
Target Start/End: Original strand, 23068849 - 23069071
Alignment:
Q  88 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 187  Q
    |||||||||||||||||  ||| | |||| | || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  23068849 gaaagttgtagataattgagtttgttttctagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttattgagatatgatgaaaatactccaagtaggtct 23068948  T
Q  188 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 287  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||     
T  23068949 tagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactataagtactaagagtttaat 23069048  T
Q  288 taaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    |||||  ||||||||||||||||    
T  23069049 taaggggtttaagagtatttaac 23069071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Original strand, 28652898 - 28653123
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||| || || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||     
T  28652898 catgaaagttgtagataattgagttagattttcagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggagg 28652997  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28652998 tcttagtgaaatcttatggaaattcagcataaccgtttttaggttaatccgaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 28653097  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28653098 aactagggtgtttaagagtatttaac 28653123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24515842 - 24515610
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||     
T  24515842 catgaaagttgtagatagttgagttagctttccagtgtctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttctttagatatgatgaaaatactccaaggagg 24515743  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24515742 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataatcgtttctacgttaatccaaaacttaaggaataaattcaaatctcaaaactagaagtactatgagttc 24515643  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24515642 aattaaggtgtttaagagtatttaatctatgtt 24515610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22690336 - 22690101
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  22690336 catgaaagttggagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 22690237  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||   ||  |||||| ||||||    
T  22690236 tcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtcag-tgtactatgagttc 22690138  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22690137 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatga 22690101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22694932 - 22694697
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  22694932 catgaaagttggagataattgtgttagctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 22694833  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| |||||   ||  |||||| ||||||    
T  22694832 tcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtcag-tgtactatgagttc 22694734  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22694733 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatga 22694697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 21316058 - 21316289
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |  ||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  21316058 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgtccttcgtttgacgtgaaaataatatttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagg 21316157  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  21316158 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcttaactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 21316256  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21316257 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 21316289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 88 - 317
Target Start/End: Original strand, 21335852 - 21336080
Alignment:
Q  88 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  21335852 gaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtct 21335951  T
Q  188 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 287  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||  || ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||||     
T  21335952 tagtgaagttttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaagctatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaat 21336050  T
Q  288 taaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21336051 taagatgtttaagagtatttaacctatgtt 21336080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 127 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 29113975 - 29113786
Alignment:
Q  127 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||    
T  29113975 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactattcctaa 29113876  T
Q  227 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || |||||||||| ||| |  ||| |||| |||||| | |  ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29113875 gtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaatttg-tgtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 29113786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Original strand, 1384082 - 1384239
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  1384082 catgaaagttgtagataattgtattagctttccagtggctttggattgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaacgagg 1384181  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  1384182 tcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctaagtcaactcaaaactta 1384239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 340
Target Start/End: Original strand, 2524143 - 2524380
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |       
T  2524143 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagg--- 2524239  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa-gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 283  Q
                 || |||||||||||||||||    ||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2524240 -------------ttatgaaaattcagcataacc---tctaaagttaatctaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactatgagtt 2524323  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 340  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  2524324 caatcaaggtatttaagagtatttaacctatgttgtgagttgacctttagggtagga 2524380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22686495 - 22686264
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  ||     
T  22686495 catgaacgttttagatatttttattagctttccaatggctttggtttgacttgaatatgatttttggtttttgaggtatgatgaaaacactctaagtagg 22686396  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| | || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  22686395 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcacaactatttctaattcaacccaaaacttatggattgtctcgaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 22686297  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22686296 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22686264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Original strand, 25587094 - 25587240
Alignment:
Q  96 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25587094 tagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 25587193  T
Q  196 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    |||| |||||||||  ||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  25587194 ttttatgaaaattccacataactatttctaggtcaacccaaaactta 25587240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 189 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 31345495 - 31345264
Alignment:
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  31345495 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttataggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 31345396  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 388  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| || |   ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  31345395 aaggtgtttaagagtat------aataatatga-tttagtgttggggtaggaatgtgggttgaatataatattattgatgatttgtgaagctattataat 31345303  T
Q  389 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||| ||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  31345302 atgaattagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 31345264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20261815 - 20261696
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  20261815 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 20261716  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  20261715 tcttagtgaatttttatgaa 20261696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22332402 - 22332142
Alignment:
Q  55 tttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggttt 154  Q
    |||||||| |||||| | ||| |||||   ||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||||| | ||    
T  22332402 tttctgttttgaattggcttttggagtgaacataaatgttttagataattgtgttagctttccagtggctttgatttgacttgaaaatgatttttagatt 22332303  T
Q  155 ttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattca 254  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |  |||     
T  22332302 ttgagttatggcgaaaacactccaatgaggtcttggtg-aattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttcc 22332204  T
Q  255 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||| |||||| | |  |||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22332203 aaacttcaaaaattg-tgtactatgagttcaattaaggtgttcaagagtatttaacctatgtt 22332142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Original strand, 10684329 - 10684448
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  10684329 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagttttactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 10684428  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  10684429 tcttagtgaatttttatgaa 10684448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Original strand, 23778691 - 23778849
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||     
T  23778691 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggagg 23778790  T
Q  185 tcttagtgaaattttttg-aaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    | |||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  23778791 ttttagtgaaattttacgaaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaacctta 23778849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 38968075 - 38967956
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  38968075 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttttgtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 38967976  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  38967975 tcttagtgaatttttatgaa 38967956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 227
Target Start/End: Original strand, 28345472 - 28345614
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || | | | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||     
T  28345472 catgaaaattttagataattgtgttagctttccagtggctttgattttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaaggagg 28345571  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 227  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||    
T  28345572 tcttggtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaag 28345614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 128 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23610089 - 23609901
Alignment:
Q  128 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 227  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||    
T  23610089 gtttgacttgaaaatgatttacgatttttgagttatgatgaaaatactcgaaggaggtcttagtgaaattttatgcaaattctgcataactatttctaag 23609990  T
Q  228 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    | || ||||||| || ||| |   || |||| ||||| || |  |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23609989 tcaacccaaaacctatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 23609901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 40911979 - 40911868
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  | | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40911979 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtagctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatataatgaaaatactccaatgaga 40911880  T
Q  185 tcttagtgaaat 196  Q
    ||||||||||||    
T  40911879 tcttagtgaaat 40911868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 313 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 23005012 - 23004923
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23005012 atgttatgagttgatcctttgggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttatactatgatttaacgttg 23004923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 89 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 31345771 - 31345661
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || || | | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31345771 aaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 31345672  T
Q  189 agtgaaattttt 200  Q
    ||| ||||||||    
T  31345671 agt-aaattttt 31345661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Original strand, 24897763 - 24897881
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |    
T  24897763 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggt 24897862  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24897863 cttagtgaatttttatgaa 24897881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Original strand, 24900246 - 24900364
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |    
T  24900246 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggt 24900345  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24900346 cttagtgaatttttatgaa 24900364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Original strand, 24902723 - 24902841
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |    
T  24902723 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggt 24902822  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24902823 cttagtgaatttttatgaa 24902841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Original strand, 24905200 - 24905318
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |    
T  24905200 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggt 24905299  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24905300 cttagtgaatttttatgaa 24905318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Original strand, 24907675 - 24907793
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |    
T  24907675 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggt 24907774  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24907775 cttagtgaatttttatgaa 24907793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 313 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 26392643 - 26392550
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 406  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  26392643 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgttctgtgaatttgttattacatgatctaatgttgatag 26392550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 219 - 356
Target Start/End: Original strand, 30643811 - 30643948
Alignment:
Q  219 gtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtta 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||| ||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  30643811 gtttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttg 30643910  T
Q  319 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||    
T  30643911 tgagttgaccattagggtaggaatggaggttgattata 30643948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22255868 - 22255777
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactc 176  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22255868 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactc 22255777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 235 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22501374 - 22501260
Alignment:
Q  235 aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggg 334  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  22501374 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtgagttgatc-ttggg 22501276  T
Q  335 gtaggaatggaggttg 350  Q
     |||||||||| ||||    
T  22501275 ataggaatggaagttg 22501260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 235 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22509308 - 22509194
Alignment:
Q  235 aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggg 334  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  22509308 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtgagttgatc-ttggg 22509210  T
Q  335 gtaggaatggaggttg 350  Q
     |||||||||| ||||    
T  22509209 ataggaatggaagttg 22509194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23136174 - 23136056
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  23136174 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 23136075  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  23136074 cttagtgaatttttatgaa 23136056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 313 - 402
Target Start/End: Original strand, 22412994 - 22413083
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22412994 atgttattagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgttaatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg 22413083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 18809538 - 18809459
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18809538 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 18809459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 313 - 400
Target Start/End: Original strand, 20520051 - 20520138
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgt 400  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  20520051 atgttatgagtttatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgataatctgtgaagttgttataagatgatttgatgt 20520138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 316
Target Start/End: Original strand, 22786694 - 22786924
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| | |  ||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||| | || ||| ||||  |      
T  22786694 catgaaagttttagctaattttattagctttccaatggctttagtttgacttaaaaatgttttttagattttgagatatgagggaattaccccaagcaag 22786793  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| || || |||| ||||||||  ||||||| |||||||| | |||||||||| || ||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  22786794 tcttggtaaatttttgtgaaaatt-tgcataaccgtttctaactcaatccaaaacctatggaacgtttccaaacctcaaaactagaagtattaggagttt 22786892  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    ||   ||  |||  ||||||||||||||||||    
T  22786893 aatcgagagattggagagtatttaacctatgt 22786924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 28577694 - 28577615
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28577694 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 28577615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20273012 - 20272855
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  |  | |||| || |||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||  ||     
T  20273012 catgaaagttttagataatctcgttagctttccaatgaatttagattgatttaaaaatgatttttagattttgagttatgatggaaatactccaagtagg 20272913  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    |||| || || ||||   ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  20272912 tcttggtaaatttttaccaaaattcagcataaccgtttctatgtcaatccaaaactta 20272855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 7187022 - 7186942
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatga 165  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7187022 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatga 7186942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 23711580 - 23711659
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23711580 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 23711659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 315 - 402
Target Start/End: Original strand, 24697467 - 24697553
Alignment:
Q  315 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24697467 gttatgagtagatccttagggtaggagtggaggttgtatttaatattaatgatgatctgtgaagctg-tataatatgattttatgttg 24697553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 26505974 - 26505895
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26505974 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 26505895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 26508452 - 26508373
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26508452 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 26508373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 27920331 - 27920410
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27920331 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 27920410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 32039065 - 32039144
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32039065 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 32039144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 571993 - 571919
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 159  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  571993 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 571919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Original strand, 36734881 - 36734975
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 179  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  36734881 catgaaagttttagataatgttgttagatttccaatggctttggtttgacttgaaaatgttttgtgggttttgagttatgatgaaaacactccaa 36734975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 39682909 - 39682835
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  39682909 catgaaagttgtagctaattgtgttagctttccagtggcatcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 39682835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22501456 - 22501375
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgat 166  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22501456 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttgtagtttttgagatatgat 22501375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22509390 - 22509309
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgat 166  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22509390 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttgtagtttttgagatatgat 22509309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23287625 - 23287511
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| || |||||| | |||    |||||    
T  23287625 atgttgtgagttgatccttagggtaggaatggaggttgattataatattactgatgttctgtggatctgttataacattatttaacgatga----tagta 23287530  T
Q  413 atgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  23287529 atgtgatatatttgtatat 23287511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23131457 - 23131378
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  23131457 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 23131378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23133924 - 23133845
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  23133924 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 23133845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 34402089 - 34402168
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  34402089 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 34402168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Original strand, 19887294 - 19887384
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  19887294 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 19887384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24841422 - 24841377
Alignment:
Q  272 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24841422 gtactatgagttcaattaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 24841377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 351
Target Start/End: Original strand, 18546803 - 18546841
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttga 351  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18546803 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttga 18546841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 338
Target Start/End: Original strand, 34492091 - 34492141
Alignment:
Q  288 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  34492091 taaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 34492141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 357 - 402
Target Start/End: Original strand, 23708521 - 23708566
Alignment:
Q  357 atattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  23708521 atattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttg 23708566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 264
Target Start/End: Original strand, 28031919 - 28032056
Alignment:
Q  127 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 226  Q
    |||||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||| || ||| | ||| | ||| |||  |||||||| ||| || |||||||||    
T  28031919 ggtttggcttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggaggttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtttctaa 28032018  T
Q  227 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaa 264  Q
    || || ||||| |||| ||| || ||| |||| |||||    
T  28032019 gtcaacccaaaccttatggattatttccaaacttcaaa 28032056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16900905 - 16900841
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||||||||||    
T  16900905 catgaaaattttagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgattttt 16900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16994296 - 16994232
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||||||||||    
T  16994296 catgaaaattttagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgattttt 16994232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24302374 - 24302220
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||| |||| | ||| ||| |||| |||||| |||| |||||| | | ||||||||||||||| |||  ||     
T  24302374 catgaaagttttagataaagatgttagctttctaatggcttcgatttaactt-aaaatgtttttaggtttt-gtgctatgatgaaaatactacaagtagg 24302277  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactt 241  Q
    ||||  || |||| |  ||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||    
T  24302276 tcttgatgcaattgtacgaaaattcagcataactatttttaagtgaacccaaaactt 24302220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 24383167 - 24383131
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24383167 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatg 24383131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 34823840 - 34823776
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||  |  |||||||||||    
T  34823840 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatgacgttggtttgaggtccaaatgattttt 34823776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 97
Target Start/End: Original strand, 22497852 - 22497890
Alignment:
Q  59 tgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgta 97  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22497852 tgttccgaattaggtctgggagtcttcatgaaagttgta 22497890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Original strand, 11232232 - 11232268
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11232232 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 11232268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 19445355 - 19445419
Alignment:
Q  33 ggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgta 97  Q
    |||||||||| || | || || ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19445355 ggaaaatcaaattgtgtgcaactttatgttccgaattaggtttggaagtctgcatgaaagttgta 19445419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Original strand, 22514079 - 22514115
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22514079 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 22514115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Original strand, 23760032 - 23760068
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23760032 catggaagttttagataattttgttagctttccaatg 23760068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Original strand, 28776681 - 28776717
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28776681 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 28776717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 359
Target Start/End: Original strand, 43947232 - 43947276
Alignment:
Q  315 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 359  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  43947232 gttatgagttgacccttagggtaggaatggaggttgattataata 43947276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 25 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 67810 - 67408
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 124  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  67810 cgagcataggaaaatccacttttatgaaattttctgttctgaattagatttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttcctatggct 67711  T
Q  125 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 224  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  67710 ttggtttgactttaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 67611  T
Q  225 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 324  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  67610 aagttaatccaaaacttagagaataattccaaatctgaaaactagaagtactaggatttcaattaaggtgtttaagaatatttaacctatgttaagagtt 67511  T
Q  325 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatt 424  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  67510 gatcattggggtaggaatggatgttgaatataatattacttatgatctgtgaagttgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatt 67415  T
Q  425 tgtatat 431  Q
    | |||||    
T  67414 tttatat 67408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 129 - 241
Target Start/End: Original strand, 62410 - 62522
Alignment:
Q  129 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  62410 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagt 62509  T
Q  229 taatccaaaactt 241  Q
     || |||||||||    
T  62510 caaaccaaaactt 62522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 316
Target Start/End: Original strand, 116801 - 117032
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||| || || | | ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||  | ||||| |||     
T  116801 catgaaagtttcagataattgtgttagctttgcagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgaggaaaccattccaaggagg 116900  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| |||||||||| |||||||||   |||||| ||||||||| || |||||||||| ||  |  ||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||     
T  116901 tcttggtgaaattttatgaaaattctatataactatttctaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaaccagaagtattaggagttt 117000  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    || ||||   |||||||||||| |||||||||    
T  117001 aagtaagaggtttaagagtattaaacctatgt 117032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 176)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 25 - 431
Target Start/End: Original strand, 46580260 - 46580648
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  46580260 cgagcataggaaaatcaaattttcctgaattttctattctgaattgggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagttttccaatgact 46580359  T
Q  125 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 224  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||             
T  46580360 ttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagttcttactgaaattttatgaaaattcagcata--------- 46580450  T
Q  225 aagttaatccaaaactta-gggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagt 323  Q
        ||||  |  ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46580451 ----taat--attactgatgggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagt 46580544  T
Q  324 tgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatat 423  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  46580545 tgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatat 46580640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 25 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 48812554 - 48812241
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  48812554 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttccgaattaggtttggaagtcttcatgaaagttgtatataattttgttagctttccaatggct 48812455  T
Q  125 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 224  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  48812454 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactgcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 48812355  T
Q  225 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 324  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48812354 aagttaatccaaaacttagagaataattccaaacctcaaaactagaagtattaggagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtt 48812255  T
Q  325 gatctttggggtag 338  Q
    | || |||||||||    
T  48812254 ggtccttggggtag 48812241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 85 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13647898 - 13647554
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13647898 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 13647799  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13647798 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 13647699  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  13647698 aattaaggtgtttaagattatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgcgaagctatta 13647599  T
Q  385 ta--atatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    ||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  13647598 taatatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 13647554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 85 - 383
Target Start/End: Original strand, 18456044 - 18456342
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18456044 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 18456143  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18456144 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 18456243  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 383  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18456244 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttaaatataatattaattataatctgtgaagctgtt 18456342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 86 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16999087 - 16998740
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16999087 atgaaagtagtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagagatgatgaaaatactccaaggagat 16998988  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagt------actagg 279  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||      || | |    
T  16998987 cttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctatgttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtaccatcaccatg 16998888  T
Q  280 agttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagc 379  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16998887 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggagattgaatataatattactgatgatctgtgaagc 16998788  T
Q  380 tgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
     |||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||    
T  16998787 agttataatatgatttaatgttga----taataatgtaatatatttgtatat 16998740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Original strand, 708951 - 709204
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  708951 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 709050  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  709051 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcttaactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactattagttc 709150  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  709151 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 709204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Original strand, 58814 - 59071
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  58814 catgaaagttttatataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 58913  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  58914 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttt 59013  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  59014 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 59071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Original strand, 8756792 - 8757056
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||     
T  8756792 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccgaggagg 8756891  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8756892 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttttgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 8756991  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  8756992 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 8757056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16462692 - 16462439
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16462692 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16462593  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  16462592 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcatagctgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtta 16462493  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    || ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  16462492 aattaaggtgattaacagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 16462439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 14415880 - 14416112
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||| |||     
T  14415880 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtgtttgatttatgatgaaaatactccaaggagg 14415979  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14415980 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 14416079  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14416080 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14416112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Original strand, 32160598 - 32160851
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  32160598 catgaaagttgtagataattgtcttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 32160697  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32160698 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 32160797  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  32160798 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttagggtag 32160851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Original strand, 14191484 - 14191735
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  14191484 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgactta--gtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 14191581  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  14191582 tcttagtgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactataagttc 14191681  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  14191682 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 14191735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Original strand, 30820652 - 30820910
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  30820652 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaataatttttggtttttaagatatgataaaaatactccaaggaga 30820751  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30820752 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagataatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 30820851  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  30820852 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatg 30820910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 201 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14273888 - 14273662
Alignment:
Q  201 tgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaag 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||    
T  14273888 tgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaag 14273789  T
Q  301 agtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgt 400  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14273788 agtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgt 14273689  T
Q  401 tgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||    
T  14273688 tga----tagtaatgtaatatatttgtatat 14273662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Original strand, 47975307 - 47975560
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  47975307 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatgtttgagatatgatgaaaatgctccaaggagg 47975406  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  47975407 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacatcaaaactagaagtactatgagttc 47975506  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||    
T  47975507 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttcgtccttggggtag 47975560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 365
Target Start/End: Original strand, 16550400 - 16550679
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16550400 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtatttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16550499  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  16550500 tcttagtgaaatcttatgaaaattgagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttt 16550599  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 365  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  16550600 aattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgttccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 16550679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16615262 - 16614983
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16615262 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtatttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16615163  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  16615162 tcttagtgaaatcttatgaaaattgagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttt 16615063  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 365  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  16615062 aattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgttccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 16614983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Original strand, 14188690 - 14188941
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  14188690 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgactta--gtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 14188787  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  14188788 tctttgtgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactattagttc 14188887  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  14188888 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 14188941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 15214155 - 15213917
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15214155 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15214056  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15214055 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 15213956  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagt 323  Q
    || || ||| ||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  15213955 aattagggtgtttaagagtatgtaatttatgttgtgagt 15213917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 85 - 330
Target Start/End: Original strand, 17070689 - 17070934
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17070689 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttgttttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17070788  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17070789 tcttattgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaattctcaaaactagaagtactatgagttc 17070888  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 330  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17070889 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttgatctt 17070934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 13745172 - 13745404
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  13745172 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 13745271  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13745272 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcgatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 13745371  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13745372 aattaaggtgtttcagagtatttaacctatgtt 13745404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 44374602 - 44374370
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  44374602 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 44374503  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44374502 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttc 44374403  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44374402 aaatagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 44374370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 44383467 - 44383235
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  44383467 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 44383368  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44383367 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttc 44383268  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44383267 aaatagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 44383235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 46386483 - 46386715
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| || | | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  46386483 catgaaagttgtagatagttgagttagctttccagtggctttggtttgaagtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaaggagg 46386582  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46386583 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 46386682  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  46386683 aactatggtgtttaagagtatttaacctatgtt 46386715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 47094736 - 47094491
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  47094736 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 47094637  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  47094636 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagtagtactatgatttc 47094537  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 330  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47094536 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 47094491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12371931 - 12371699
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||| |||     
T  12371931 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgcgatatggtaaaaatactccaaggagg 12371832  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12371831 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 12371732  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  12371731 aactaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 12371699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 12465656 - 12465888
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  12465656 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 12465755  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  12465756 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgacttc 12465855  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || | | |||||||||||||||| ||||||    
T  12465856 aattaggatgtttaagagtatttaacttatgtt 12465888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15167631 - 15167403
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  15167631 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaagtagg 15167532  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  15167531 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaactagaagtattatgagttc 15167432  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaaccta 313  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||    
T  15167431 aattaaggtgtttaagagtatttaaccta 15167403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 85 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13408428 - 13408170
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  13408428 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaattctccaagtagg 13408329  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  13408328 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 13408229  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgg 344  Q
    || |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  13408228 aattaagttttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgat-tttgggataggaatgg 13408170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 85 - 340
Target Start/End: Original strand, 17505400 - 17505655
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  17505400 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 17505499  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  17505500 tcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 17505599  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 340  Q
    || |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  17505600 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 17505655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 85 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17547814 - 17547559
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  17547814 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 17547715  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  17547714 tcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 17547615  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 340  Q
    || |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  17547614 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 17547559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Original strand, 36685645 - 36685904
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  36685645 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 36685744  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36685745 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcgtaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 36685844  T
Q  285 aactaaggt-atttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    || |||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  36685845 aattaagatgttttaagagtatttaacccatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatg 36685904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Original strand, 832419 - 832676
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  832419 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 832518  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  832519 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 832618  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    || |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  832619 aattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 832676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Original strand, 1197599 - 1197856
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  1197599 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 1197698  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  1197699 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 1197798  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    || |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  1197799 aattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 1197856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Original strand, 13699285 - 13699549
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13699285 catgaaagctttagataattgtgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 13699384  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
     ||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||     
T  13699385 ccttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccatttctaagttaatctgaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttt 13699484  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  13699485 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttt-ggataggaatggaagttg 13699549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 330
Target Start/End: Original strand, 40555139 - 40555384
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||      
T  40555139 catgaaagttttagataattttgttaactttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttgatttttgagatatgatgtaaatactccaaggaag 40555238  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40555239 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 40555338  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 330  Q
    || |||||| |||||| |||||||||| || || ||||||||||||    
T  40555339 aattaaggtgtttaagtgtatttaacccatattgtgagttgatctt 40555384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11067124 - 11066892
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||     
T  11067124 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccatggagg 11067025  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  11067024 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattgcaaacctcaaaactagaagtactatgatttc 11066925  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11066924 aactagggtgtttaagagtatttaacttatgtt 11066892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 14928728 - 14928960
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||| |||     
T  14928728 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggcgtcagtttgactagaaaatgatttttggtttacgagttatgatgaaaataatacaaggagt 14928827  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  14928828 acttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagttt 14928927  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || ||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  14928928 aattaaagtgtttaaaagtatctaacctatgtt 14928960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 15352194 - 15352426
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||| |||     
T  15352194 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggcgtcagtttgactagaaaatgatttttggtttacgagttatgatgaaaataatacaaggagt 15352293  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15352294 acttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagttt 15352393  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || ||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  15352394 aattaatgtgtttaaaagtatctaacctatgtt 15352426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19282748 - 19282516
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  | || | | |  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  19282748 catgaaagttgtagataattgtgttagctttttagtggctttgagttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 19282649  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19282648 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaaatagaagtactatgagttc 19282549  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19282548 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19282516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 29004478 - 29004214
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||     
T  29004478 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcaagggagg 29004379  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    || ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||||||| |   || |||||||||||||||| ||||||    
T  29004378 tcctagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccgtttccaagttaatcgaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtactatgagttc 29004279  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggtt 349  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || || |||||||| |||||    
T  29004278 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcctttggttaggaatgaaggtt 29004214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 33001570 - 33001338
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  33001570 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttaacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 33001471  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  33001470 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttc 33001371  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33001370 aattaaggtgtttaagagaatttaacctatgtt 33001338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18872816 - 18872545
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  18872816 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 18872717  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  18872716 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 18872617  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18872616 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 18872545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Original strand, 12755106 - 12755359
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12755106 aaagttgtagataattttgttagatttccaatggctttggtttgactagaaaatgagttttagattttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 12755205  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
     ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||||||| |||||| |||||||| |    
T  12755206 ggtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaggtactatgagttcaatt 12755305  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  12755306 aaggtgtttaagagtatttgacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 12755359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 313
Target Start/End: Original strand, 10896390 - 10896618
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  10896390 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttagtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 10896489  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  10896490 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcgaaactagaagtattatgagttc 10896589  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaaccta 313  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||    
T  10896590 aattaagctgtttaagagtatttaaccta 10896618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 13147868 - 13148100
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   | |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13147868 catgaaagttgtagataattgagttagctttccattggatttggtttgacgtgaaaatcattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 13147967  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  13147968 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactacaagtattatgagatc 13148067  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13148068 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 13148100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Original strand, 32433985 - 32434221
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||  |||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||      
T  32433985 catgaaagttgtagataattgagctagtgttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaag 32434084  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32434085 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttaatgaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 32434184  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  32434185 aactagggtgtttaagagtatttaatctatgttatga 32434221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 34957827 - 34957579
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||     
T  34957827 catgaaagttgtagataattttgttagctttcaaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttagtttttgagatatgattaaaatactccaagtagg 34957728  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||   ||||||||||||||| || ||||||    
T  34957727 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaaggtaatccaaaacttatgggataattccaaggatcaaaactagaagtattatgagttc 34957628  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttgg 333  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  34957627 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttatgagttgatccttgg 34957579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 316
Target Start/End: Original strand, 8851555 - 8851786
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||     
T  8851555 catgaaagttgtagataattgagttaggtttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttctggagatatgatgaaaatactccaaggagg 8851654  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  8851655 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 8851754  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  8851755 aattaaggggtttaagattatttaacctatgt 8851786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16009034 - 16008763
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  16009034 catgaaagttgtagataattttgctagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 16008935  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  16008934 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 16008835  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16008834 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 16008763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 38828717 - 38828474
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  |||     
T  38828717 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggagg 38828618  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  38828617 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaactatttctaagttaatccaaaacttatgagacaattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 38828518  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatc 328  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  38828517 aattaaggtgtttaagagtatttaacccacgttgtgagttgatc 38828474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4325712 - 4325448
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  4325712 catgaatgttgtagataattgcgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagaagg 4325613  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4325612 tcttaatgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgcgataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 4325513  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  4325512 aattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 4325448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 89 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 48743955 - 48743727
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  48743955 aaagttttagataattttgttagcttttcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagaactt 48743856  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  48743855 agtgaaatcttataaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagatgtactatgagttcaatt 48743756  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  48743755 aaggtgtttaggagtatttaacatatgtt 48743727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11661761 - 11661491
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||  ||     
T  11661761 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttattttttgagttatgatggaaatactccaagtagg 11661662  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  11661661 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 11661562  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11661561 aattaatgtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-ccctggggtaggaatggaggttgattata 11661491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Original strand, 37727323 - 37727580
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||     
T  37727323 catgaaagttgtatataattttgttagctttccagtggctttggtttgactcaaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatgctccaaggagg 37727422  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||    
T  37727423 tcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccatcaaaactagaagtactatgagttc 37727522  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  37727523 aatcaaggtgtttaagagtttttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 37727580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32301838 - 32301613
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  32301838 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 32301739  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  32301738 tcttaatgaaattttatgaaaatacagcataaccgtttataagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactataagtactaggagttt 32301639  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  32301638 aattaaggggtttaagagtatttaac 32301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 32771984 - 32771760
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||   ||     
T  32771984 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaataatccaggtagg 32771885  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  32771884 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 32771785  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaa 309  Q
    || |||||| |||||||||||||||    
T  32771784 aattaaggtgtttaagagtatttaa 32771760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 148074 - 147803
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | | |||||||||  ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  148074 catgaaagttgtagataattctgttagctttacaatggctttggtttgactctaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 147975  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  147974 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 147875  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  147874 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgaattgacccttggggtaggaatggaggttgattata 147803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14422441 - 14422170
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  14422441 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 14422342  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  14422341 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 14422242  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | | | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14422241 aattaaggtgtttaagagcatttaacccatgttgtgaggttacccttggggtaggaatggaggttgattata 14422170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14566658 - 14566387
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  14566658 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 14566559  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||      
T  14566558 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgt 14566459  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14566458 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 14566387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16580316 - 16580091
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |  ||||||| |||||||| ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||     
T  16580316 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggcgttagtttgacatgaaaatggtttttggtttaggagttgtgatgaaaatactccaaggagg 16580217  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  16580216 tcttagtgaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 16580117  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    || |||||  ||||| ||||||||||    
T  16580116 aattaaggggtttaacagtatttaac 16580091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 89 - 321
Target Start/End: Original strand, 14153372 - 14153603
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14153372 aaagttgtagataattttgttagctttacaatggctttggtttgacttgaaaataatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 14153471  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |   || |||| ||||| |  |  |||||| |||||||| |    
T  14153472 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcctg-tgtactatgagttcaatt 14153570  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14153571 aaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 14153603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18607943 - 18607672
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  18607943 catggaagttttagatacttttgtcagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 18607844  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||  ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  18607843 tcttaaggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 18607744  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18607743 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 18607672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 89 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14259004 - 14258783
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || | | | |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||  || ||||    
T  14259004 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttgctttgacatgaaaatgaactttggttcttgagatatgatgaaaggactccaagtaggtctt 14258905  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  14258904 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaatt 14258805  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
T  14258804 aaggggtttaagagtatttaac 14258783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20586008 - 20585780
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||  || | | |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  20586008 catgaaagttgtagataattgagttagctttcccgtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttcttgaggtatgatgaaaatactccaaggagg 20585909  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20585908 t----gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaattagaagtactatgagttc 20585813  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20585812 aactagggtgtttaagagtatttaacttatgtt 20585780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Original strand, 12323326 - 12323530
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||   | | | |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  || |||     
T  12323326 catgaaagttgtagataattgagttagctttccgggggctttggtttgacgtgaaaatgatatttggttcttgagatatgatgaaaatacttgaaggagg 12323425  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12323426 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactaaaagtactatgagttc 12323525  T
Q  285 aacta 289  Q
    |||||    
T  12323526 aacta 12323530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 155 - 315
Target Start/End: Original strand, 15119761 - 15119921
Alignment:
Q  155 ttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattca 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  15119761 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttataaatattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 15119860  T
Q  255 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15119861 aaaactcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 15119921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 85 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20619942 - 20619714
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  | ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  20619942 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtagcttcggtgtgacgtgaaaaagatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 20619843  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||     
T  20619842 tcttaataaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccataacttatggaataattccaaaactcaaaattagaagtattaggatttt 20619743  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaaccta 313  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||    
T  20619742 aattaaggggtttaagagtatttaaccta 20619714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 12127559 - 12127792
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt-ggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgag 183  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||   || | || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  12127559 catgaaagtagtagataattgagttagctatcacgtggcttctgtttgacgtgaaaatgattttttggttcttgagatatgatgaaaatacttcagggag 12127658  T
Q  184 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 283  Q
     | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12127659 gtattagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaagttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 12127758  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  12127759 caaatagggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 12127792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 85 - 266
Target Start/End: Original strand, 29052551 - 29052732
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  29052551 catgaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 29052650  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 266  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  29052651 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 29052732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 128 - 310
Target Start/End: Original strand, 16585390 - 16585572
Alignment:
Q  128 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 227  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16585390 gtttgacatgaaaatggtttttggtttaggagttgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 16585489  T
Q  228 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  16585490 ttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 16585572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 24270378 - 24270609
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24270378 catgaaagttttagataattgtgttagctttcaaatggaattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagg 24270477  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| || | |||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||| |  ||||||    
T  24270478 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaagtcaaccgaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattgtgagttc 24270576  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24270577 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 24270609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 39292133 - 39292364
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  39292133 catgaaaattttagataattttgttagctttccattgactttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 39292232  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| | ||  ||||||||| ||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||| ||||||    
T  39292233 tcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaaatcaactcaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 39292331  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39292332 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 39292364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 344
Target Start/End: Original strand, 13864791 - 13865040
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  13864791 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttgggttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgaggaaaatactccaaggagg 13864890  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| ||   ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13864891 tcttagtgaaatcttagaaaaattcagtacaaccttttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaagtagaagtactatgagttc 13864990  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgg 344  Q
    ||         |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13864991 aa---------ttaagagtatttaatccatgttatgagttgatc-ttgggataggaatgg 13865040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 161 - 317
Target Start/End: Original strand, 13745672 - 13745828
Alignment:
Q  161 tatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacct 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  13745672 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatagccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaataattccaaacct 13745771  T
Q  261 caaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13745772 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 13745828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 18875242 - 18875474
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   | |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||      
T  18875242 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggatttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggatg 18875341  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||  ||| |   || ||||||||||||||||||||  |||||||     
T  18875342 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaatccaaaacttgtggattgtctccaaacctcaaaactagaagtaacaggagttt 18875441  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18875442 aattaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 18875474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15720405 - 15720250
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||     
T  15720405 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgaggtatgataaaaatactccaaggagg 15720306  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaact 240  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15720305 tcttagcgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 15720250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 164 - 310
Target Start/End: Original strand, 16460407 - 16460553
Alignment:
Q  164 gatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaa 263  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16460407 gatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaa 16460506  T
Q  264 aactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  ||||| | ||||||||    
T  16460507 aactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaatattatttaac 16460553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 43277139 - 43277372
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  ||     
T  43277139 catgaaagttgtagataattgtgttagctttcaagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatacttcaagaagg 43277238  T
Q  185 tcttagtgaaatttt-ttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 283  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |||||| || ||  ||||||||| ||| |   || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43277239 tcttagtgaaattttatcaaaaattccgcataactatttctaggtcaactcaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 43277338  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
     || |||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  43277339 taattaaggggtttaagagtatttaacatatgtt 43277372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 188 - 431
Target Start/End: Original strand, 13918266 - 13918498
Alignment:
Q  188 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 287  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  13918266 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaat 13918365  T
Q  288 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataa 387  Q
    |||||| |||||||||||       || |||||| ||  | ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13918366 taaggtgtttaagagtat------aatattatgatttagtgttt-gggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataa 13918458  T
Q  388 tatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    ||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  13918459 tatgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 13918498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 4691292 - 4691523
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||     
T  4691292 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggagtcggtttgacttgaaaataatttttggtttttgatttatgatgaaaatactccaaggagg 4691391  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||  | |  |||||| |||||     
T  4691392 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagtta 4691490  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4691491 aattaaggtgtttaagagtatttaaccaatgtt 4691523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 14161251 - 14161482
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  ||     
T  14161251 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccattggctttggtttgacttgaaaatcatttttggtttttgaggtttgataaaaatactccaagaagg 14161350  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  14161351 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 14161449  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14161450 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 14161482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 48213341 - 48213572
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  48213341 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccattcgctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagg 48213440  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| || | |||||||| ||| |   || |||| ||||| | |   |||||| ||||||    
T  48213441 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaagtcaacctaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc-atgtgtactatgagttc 48213539  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  48213540 aattaaggtgtttaagaatatttaacctatgtt 48213572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 316
Target Start/End: Original strand, 15978452 - 15978682
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||     
T  15978452 catgaaagttttagataattgtgttagctttccactgactttggcttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgatgaaaacactccaaggagg 15978551  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||  || ||| ||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15978552 tctcggtaaaactttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggggtt- 15978650  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    || ||||   |||||||| | |||||||||||    
T  15978651 aattaagaggtttaagagcacttaacctatgt 15978682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 431
Target Start/End: Original strand, 25926993 - 25927224
Alignment:
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  25926993 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 25927092  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 388  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| || |   | ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25927093 aaggtgtttaagagtat------aataatatga-tttagtgtcggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataat 25927185  T
Q  389 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  25927186 atgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 25927224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Original strand, 8514142 - 8514377
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| | |  | | ||||||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||     
T  8514142 catgaaagttgtagataattgtgttagatttcgagttgctttggtttgacttgaaaaagaattttgggttttgaattatgatgaaaatactccaaggagg 8514241  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   | ||||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  8514242 tcttagtgaaattttgtgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtcttaaaacttcaaatcttg-tgtactatgagttc 8514340  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8514341 aattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttatga 8514377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 21538585 - 21538816
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||| |||     
T  21538585 catgaaagttttagataattttgttagttttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttaaattttgagttatgatgaaaacactccaaggagg 21538684  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||||| || ||||||||||  || |  ||| |||| |||||||| |  ||||||  |||||    
T  21538685 tcttggtgaaattttatgaaaattccgcataatcatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactattagttc 21538783  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21538784 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 21538816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25942093 - 25941862
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||     
T  25942093 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatgctccaaggagg 25941994  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||| || || ||||| |||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  25941993 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcatgataatttctaggtcaacccaaatcttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 25941895  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25941894 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 25941862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3287646 - 3287489
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  3287646 catgacagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaagaagg 3287547  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  3287546 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaactta 3287489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 9177524 - 9177638
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    |||||    
T  9177524 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttttaacatgatttaatgttga----tagta 9177619  T
Q  413 atgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9177620 atgtaatatatttgtatat 9177638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 316
Target Start/End: Original strand, 3192700 - 3192920
Alignment:
Q  96 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 195  Q
    ||||||||| |||||| ||| || || | | ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||    
T  3192700 tagataattgtgttagttttgcagtgtctttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaa 3192799  T
Q  196 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 295  Q
    |||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||| |   |  ||| |||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||   |    
T  3192800 ttttatgaaaattgtgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgatttgtttctaaacttcaaaactagaagtattatgagtttaattaagaggt 3192899  T
Q  296 ttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3192900 ttaagagtatttaacctatgt 3192920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 185 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13894651 - 13894519
Alignment:
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  13894651 tcttagtgaaatcttattaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 13894552  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13894551 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 13894519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 317
Target Start/End: Original strand, 20252751 - 20252969
Alignment:
Q  98 gataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatt 197  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||   | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20252751 gataattgtattagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtaaaatt 20252850  T
Q  198 ttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtattt 297  Q
    ||  |||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| ||| ||| |   || |||| ||||| ||    |||||| |||||||| |||| | |||    
T  20252851 ttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactatgagttcaattaagatgttt 20252949  T
Q  298 aagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20252950 aagagtatttaacctatgtt 20252969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 9743477 - 9743706
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || || | | ||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||| |||     
T  9743477 catgaaagttgtagataattgttttagcttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgattttgtctttttaagttatgatgaaaatactccaaggagg 9743576  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| | ||| || |  |||||| ||||||    
T  9743577 tcttagtgaaattttatgaaaattcggcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaactttaaagcttg-tgtactatgagttc 9743675  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 315  Q
    || |||||  |||||| ||||||||||||||    
T  9743676 aattaaggcgtttaagcgtatttaacctatg 9743706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 17017326 - 17017440
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  17017326 atgttatgagttgatccttggggtagggatggaggttgaatatagtattactaatgttctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagta 17017421  T
Q  413 atgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17017422 atgtaatatatttgtatat 17017440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Original strand, 1856796 - 1856915
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  1856796 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 1856895  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  1856896 tcttagtgaatttttatgaa 1856915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Original strand, 23664519 - 23664638
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  23664519 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 23664618  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  23664619 tcttagtgaatttttatgaa 23664638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Original strand, 18080125 - 18080271
Alignment:
Q  96 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 195  Q
    ||||||||| |||||||||| || || | | | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18080125 tagataattgtgttagctttacagtggctttgatttgacttgaaaatgatttttggtttttgacttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 18080224  T
Q  196 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    |||  ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  18080225 tttaatgaaaattccgcataactatttctatgtcaacccaaaactta 18080271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11310025 - 11309853
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||    || || ||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |     
T  11310025 cgagcttaggaaaatcaacttttctggaatttcctgtttcgaattgtcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccattggct 11309926  T
Q  125 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatt 197  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||    
T  11309925 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaataccccaagggaatcttagcgaaatt 11309853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11303843 - 11303724
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  11303843 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttaatttgactcgaaattgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 11303744  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  11303743 tcttagtgaatttttatgaa 11303724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Original strand, 13917969 - 13918088
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13917969 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgattattggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 13918068  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  13918069 tcttagtgaatttttatgaa 13918088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29801025 - 29800906
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||     
T  29801025 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccacggagg 29800926  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  29800925 tcttagtgaatttttatgaa 29800906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 11091170 - 11091080
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagcttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  11091170 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaagtttgggagtcttcatgaaagttgtagatatggttgttagcttt 11091080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13897902 - 13897808
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 179  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13897902 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattattagtttttgagatatgatgaaaatactccaa 13897808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 89 - 317
Target Start/End: Original strand, 15576233 - 15576458
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||  || | ||    
T  15576233 aaagttgtagataatt--gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatttttggtttttgagttatcataaaaatgctccaagaaggtttt 15576330  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |   ||||| |||||||| |    
T  15576331 agtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tctactatgagttcaatt 15576429  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  15576430 aaggtgtttaagggtatttaacttatgtt 15576458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 313 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 14045010 - 14044922
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgtt 401  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14045010 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatgttaatgatgatctgtgaagctgttatactatgatttaatgtt 14044922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 313 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 14355040 - 14354952
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgtt 401  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14355040 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatgttaatgatgatctgtgaagctgttatactatgatttaatgtt 14354952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 196 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28720005 - 28719885
Alignment:
Q  196 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 295  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||   |    
T  28720005 ttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagggaatatttccaaacctcaaaactatgagtactaggagtttaattaagaggt 28719906  T
Q  296 ttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  28719905 ttaaaagtatttaacctatgt 28719885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Original strand, 16108255 - 16108374
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||   | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  16108255 catgaaagttgtagataattttgttacctttttaatggatttggtttggcttgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16108354  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  16108355 tcttagtgaatttttatgaa 16108374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Original strand, 25926696 - 25926815
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25926696 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 25926795  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  25926796 tcttagtgaatttttatgaa 25926815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29797206 - 29797087
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||     
T  29797206 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctctaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccacggagg 29797107  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  29797106 tcttagtgaatttttatgaa 29797087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 313 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 16092019 - 16091930
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  16092019 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttatactatgaattattgttg 16091930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 330 - 431
Target Start/End: Original strand, 1858707 - 1858804
Alignment:
Q  330 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtat 429  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  1858707 ttggggtaggaatgtgggttgaatataatattattgatgatctgtgaagctattataatatgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtat 1858802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20487972 - 20487874
Alignment:
Q  212 cataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  20487972 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactaggagtactaggtgtttaattaaggggtttaacagtatttaac 20487874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 313 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 14036460 - 14036387
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata 386  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14036460 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgatgatctgtgaagctgttata 14036387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 313 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 14346490 - 14346417
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata 386  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14346490 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgatgatctgtgaagctgttata 14346417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 17060282 - 17060396
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    ||    
T  17060282 atgttatgagttgatccttggggtagaaacggaggttgaatataatattactgatgttctatgaatctgttataacatgatttaatgttgatag----ta 17060377  T
Q  413 atgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  17060378 atgtcaaatatttgtatat 17060396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 333 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 48991422 - 48991349
Alignment:
Q  333 gggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 406  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48991422 gggtaggaatagaggttgaatacaatattgatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 48991349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 169
Target Start/End: Original strand, 44190645 - 44190729
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 169  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44190645 catgaaagttgtagataattgcgttagcttttcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 44190729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32126086 - 32125967
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  32126086 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 32125987  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  32125986 tcttagtgaatttttatgaa 32125967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41523512 - 41523394
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  41523512 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 41523413  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  41523412 cttagtgaatttttatgaa 41523394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41525974 - 41525856
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  41525974 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 41525875  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  41525874 cttagtgaatttttatgaa 41525856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 15376280 - 15376359
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15376280 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 15376359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18431307 - 18431188
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||| ||  ||     
T  18431307 catgaaagttgtagataattgtgttatctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttaggtgttatgatgaaaatactcaaagtagg 18431208  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  18431207 tcttagtgaatttttatgaa 18431188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 20384690 - 20384769
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20384690 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 20384769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24702823 - 24702705
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  24702823 atgaaatttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 24702724  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24702723 cttagtgaatttttatgaa 24702705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24705270 - 24705152
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  24705270 atgaaatttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 24705171  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24705170 cttagtgaatttttatgaa 24705152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 46473714 - 46473562
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    | ||||||||| |||||||| ||||   ||| ||| |||||||||||||||||||   |     
T  46473714 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatagttttggtttgactagaaaatgaattttacatttggaggtatgatgaaaatactccaagcggg 46473615  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaa 237  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | || ||||||||| |||||    
T  46473614 tcttagtaaaactttatgaaaattcagcataattattcctaagttaaaccaaa 46473562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 27217456 - 27217377
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27217456 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 27217377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 456917 - 456843
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 159  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  456917 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggcgtcggttggacttgaaaatgaattttggtttatgag 456843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 352 - 431
Target Start/End: Original strand, 2529951 - 2530026
Alignment:
Q  352 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||    
T  2529951 atataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtgatgtaatatatttgtatat 2530026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 11392866 - 11392940
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 159  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11392866 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgtcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 11392940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 37539064 - 37538970
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 179  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  37539064 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgtctttggtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagttattatgaaaacactccaa 37538970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 313 - 402
Target Start/End: Original strand, 15008357 - 15008446
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||||||||||||| | || | ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15008357 atgttatgagttgaaccttcgagtatgaatggaggttgtatatgatattaatgataatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg 15008446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 8563987 - 8564218
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||   |  || |||  |||| ||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||   |     
T  8563987 catgaaagttttagataattgtgttagcttttcaatggttttcgtgtgatgtgaagatgatttttagattttaagttatgatgaaaatactccaagtggg 8564086  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| || ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || | ||  |  ||| ||||  ||||| | |  |||||| || |||    
T  8564087 tcttggtaaaactttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaacccaaagctaatggtttgtttccaaactccaaaaattg-tgtactatgatttc 8564185  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8564186 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 8564218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Original strand, 14105863 - 14105927
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||    
T  14105863 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgattttt 14105927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 204
Target Start/End: Original strand, 14948693 - 14948808
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  || || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14948693 aaagttgtagataattttgttagccttccaatggctttagtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 14948792  T
Q  189 agtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||| |||| ||||    
T  14948793 agtgaatttttatgaa 14948808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16233116 - 16233042
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 159  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16233116 catggaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 16233042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13869941 - 13869864
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  13869941 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtg--gtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 13869864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 169
Target Start/End: Original strand, 39431624 - 39431707
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 169  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||| | || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39431624 catgaaagttgtagataattgtgttaacttttcagtgactttggcttgacttggaaatgatttttgg-ttttgagatatgatgaa 39431707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 16410650 - 16410575
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || || | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16410650 aaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggcttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 16410575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 164
Target Start/End: Original strand, 26355549 - 26355627
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26355549 atgaaagttgtagataattgtgtaagccttccagtggcgtctgtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 26355627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 164
Target Start/End: Original strand, 26358001 - 26358079
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26358001 atgaaagttgtagataattgtgtaagccttccagtggcgtctgtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 26358079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 402
Target Start/End: Original strand, 9725518 - 9725607
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| || ||||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  9725518 atgttattagttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttcagtgagtctgatataatgtgatttaatgttg 9725607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Original strand, 10001004 - 10001068
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||||||||||    
T  10001004 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgattttt 10001068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15720256 - 15720200
Alignment:
Q  261 caaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15720256 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacttatgtt 15720200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 3136869 - 3136715
Alignment:
Q  166 tgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaa 265  Q
    ||||||||||||||  || |||| || |||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||| ||  |  ||| |||| ||||||    
T  3136869 tgaaaatactccaagtaggtcttggtaaaattttaagaaaattaagcataactgtttccaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacatcaaaa 3136770  T
Q  266 ctagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || | ||||||| ||||| || || | | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3136769 cttg-agtactaagagtttaattaggatgtttaagagtgtttaacctatgatatga 3136715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16996477 - 16996369
Alignment:
Q  319 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 418  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||    | ||||||||| |    
T  16996477 tgagttgacccttaggttaggaatggaggttgattataatattattgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgtga 16996382  T
Q  419 tatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||    
T  16996381 tatatttgtatat 16996369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 20488036 - 20487973
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttt 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||    
T  20488036 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgccggtttgactttaaaatgatttt 20487973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Original strand, 1857092 - 1857154
Alignment:
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataat 251  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1857092 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 1857154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Original strand, 1867874 - 1867942
Alignment:
Q  333 gggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  1867874 gggtaggaatggaggttatatatgatattaatgatgatctgtgaagct-ttttaagatgatttgatgttg 1867942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 48273636 - 48273550
Alignment:
Q  318 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgat 404  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  | ||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||    
T  48273636 atgagttggtctttggggtaggaatggtagctgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgat 48273550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 357 - 402
Target Start/End: Original strand, 2280021 - 2280066
Alignment:
Q  357 atattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2280021 atatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg 2280066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16066103 - 16065970
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||| |||| || | | | |||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||||||||| |||||||  ||     
T  16066103 catgaaagtattagataaagttgttagatttctaacggctttggtttgactttaaaataatttttagattttgtgttatgatgaaaacactccaagtagg 16066004  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataact 218  Q
    |||| ||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  16066003 tcttggtgcaattttacaaaaattcagcataact 16065970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Original strand, 21675491 - 21675536
Alignment:
Q  272 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21675491 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 21675536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12191981 - 12191849
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || | | ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||| ||  ||| |||||||  ||     
T  12191981 catgaaagttttagataattctgttaactttccattggctttggtttgacttgaaaatattttgtggattttgagttatcatataaacactccaagtagg 12191882  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataac 217  Q
    |||| |   ||||||  ||||||||||||||||    
T  12191881 tcttggaagaattttacgaaaattcagcataac 12191849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 21660659 - 21660587
Alignment:
Q  99 ataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa 171  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | | |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  21660659 ataattatgttatctttccaatggcgttggtttgacatgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaa 21660587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 28720105 - 28720041
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    | |||||||||| ||||||||||||    
T  28720105 catgaaagttttagataattttattagctttccaattggtttggtttgacttaaaaatgattttt 28720041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Original strand, 16379749 - 16379820
Alignment:
Q  29 cataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagat 100  Q
    ||||||||||| || |||| ||  | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16379749 cataggaaaatgaatttttctgccactttatgttttgaattagatttgggagtcttcatgaaagtcgtagat 16379820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18628161 - 18628098
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttt 148  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || | || |||| || |||||||||||||    
T  18628161 catgaaagttgtagataactgtgttagctttccagtggcgtccgttttacctgaaaatgatttt 18628098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18640867 - 18640804
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttt 148  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || | ||||||| || | |||||||||||    
T  18640867 catgaaagttgtagataactgtgttagctttccagtggcgtcggttttacctaaaaatgatttt 18640804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 394
Target Start/End: Original strand, 12255657 - 12255731
Alignment:
Q  320 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatt 394  Q
    |||||||  |||||||||| |||| || ||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  12255657 gagttgaattttggggtagtaatgaagattgtataatatattaatgatgatctatgaagttgttataagatgatt 12255731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Original strand, 15760758 - 15760848
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  15760758 catgaaagttataaataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 15760848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 305
Target Start/End: Original strand, 1858644 - 1858689
Alignment:
Q  260 tcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtat 305  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  1858644 tcaaaactagaagttctacgagttcaattaaggtgtttaagagtat 1858689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 350
Target Start/End: Original strand, 9033204 - 9033241
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9033204 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 9033241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 19194807 - 19194774
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttcca 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19194807 catgaaagttttagataattttgttagctttcca 19194774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 126055 - 125991
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  |||||| ||||    
T  126055 catgaaagttttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgagtttt 125991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 7822103 - 7822067
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7822103 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 7822067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 7829414 - 7829378
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7829414 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 7829378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 11287066 - 11287002
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||| |||  |||||||||||    
T  11287066 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgtcttccaaatgattttt 11287002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16383208 - 16383172
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16383208 catgaaagttttagataattttgttagcttttcaatg 16383172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Original strand, 27102531 - 27102567
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27102531 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 27102567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Original strand, 27109879 - 27109915
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27109879 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 27109915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 27175795 - 27175759
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27175795 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 27175759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 386 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 32301476 - 32301435
Alignment:
Q  386 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  32301476 aatatgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttgtatat 32301435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Original strand, 38784623 - 38784659
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  38784623 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 38784659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 25 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11413 - 11100
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |     
T  11413 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctattctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattgtgttatctttccagtggct 11314  T
Q  125 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 224  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11313 ttggtttgacttgaaaatgacttttggtttttgagatatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttct 11214  T
Q  225 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11213 aagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtt 11114  T
Q  325 gatctttggggtag 338  Q
    | || |||||||||    
T  11113 ggtccttggggtag 11100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 85 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 649 - 307
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  649 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaagg 550  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  549 tcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 450  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  449 aattaaggtgtttaagagcatttaacccgtgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgtta 350  T
Q  385 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  349 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 124)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27851719 - 27851394
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       
T  27851719 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttttgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggat 27851620  T
Q  125 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 224  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  27851619 ttggtttcacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttct 27851520  T
Q  225 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 324  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  27851519 aagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtc 27851420  T
Q  325 gatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || | |||||||||||||||||||||    
T  27851419 gaccattggggtaggaatggaggttg 27851394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 20733783 - 20734107
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 124  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  20733783 cgagcattggaaaatcaatttttctggaattttctattctgaattaggtttgggagtattcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggct 20733882  T
Q  125 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 224  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  20733883 ttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa-tctatgaaaattcagcataactgtttct 20733981  T
Q  225 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 324  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20733982 aagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtc 20734081  T
Q  325 gatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || | |||||||||||||| ||||||    
T  20734082 gacccttggggtaggaatgaaggttg 20734107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 85 - 402
Target Start/End: Original strand, 15817154 - 15817469
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||     
T  15817154 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgataatactccaagaagg 15817253  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||    
T  15817254 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaccctcaaaactagaagtattatgaggtc 15817353  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||| | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15817354 aattaagttgtttaagattatttaacccatgttgtgagttgatc-ttggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctgtgaagctg-ta 15817451  T
Q  385 taatatgatttaatgttg 402  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  15817452 taatatgatttgatgttg 15817469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 85 - 431
Target Start/End: Original strand, 25619353 - 25619695
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||     
T  25619353 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatggaaatagtccaaggagg 25619452  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||    
T  25619453 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtaccatgagttc 25619552  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||    
T  25619553 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcattggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgatctgtgatgttgtta 25619652  T
Q  385 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  25619653 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 25619695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 85 - 431
Target Start/End: Original strand, 14979018 - 14979360
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  14979018 catgaaagttgtagataattaagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatgtttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 14979117  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  14979118 tcttggtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaatttaatccaaaacttatagaataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 14979217  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  14979218 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcattggggtagggatggaggttgaatataacattactgaggatctgtgaagctgtta 14979317  T
Q  385 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  14979318 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 14979360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 85 - 431
Target Start/End: Original strand, 20556489 - 20556831
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  20556489 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 20556588  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||     
T  20556589 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaaatactatgagtta 20556688  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||    
T  20556689 aattaaggtgttaaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttcgggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatatgagaagctatta 20556788  T
Q  385 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  20556789 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 20556831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28948000 - 28947768
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  28948000 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 28947901  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  28947900 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttt 28947801  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28947800 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 28947768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18658862 - 18658598
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||     
T  18658862 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgaaatatgataaaaatactccgaggagg 18658763  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18658762 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 18658663  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  18658662 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 18658598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23956518 - 23956265
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  23956518 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 23956419  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  23956418 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttt 23956319  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  23956318 aattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 23956265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 365
Target Start/End: Original strand, 15173851 - 15174130
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15173851 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaatgagg 15173950  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15173951 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 15174050  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 365  Q
    || |||  | |||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  15174051 aattaaattgtttaagggtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 15174130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 71 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18928393 - 18928149
Alignment:
Q  71 ggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaa 170  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18928393 ggtttgggtgtatacatgaaagttgtagagaattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagatatgatgaaa 18928294  T
Q  171 atactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactaga 270  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18928293 atactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattcaaaaactcaaaactaga 18928194  T
Q  271 agtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 315  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18928193 agtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtattttacctatg 18928149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Original strand, 5834131 - 5834366
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  5834131 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagtagg 5834230  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5834231 tcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-taatccaaaacatagggaataattctaaatctcaaaactagaagtactaggagttc 5834329  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5834330 aattaaggtgactaagagtatttaacctatgttatga 5834366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 611396 - 611139
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  611396 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 611297  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  611296 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaattactatgagttc 611197  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  611196 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 611139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Original strand, 19825885 - 19826142
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  19825885 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgaatttgttttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 19825984  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19825985 tcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatcggataattccaaaccttaaaactagaagtactatgagttc 19826084  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    || |||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  19826085 aattaaggtgtttaagagtatttaaattatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 19826142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 7827628 - 7827396
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  7827628 catgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagaagg 7827529  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7827528 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttc 7827429  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7827428 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 7827396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 19655625 - 19655857
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  19655625 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 19655724  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19655725 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 19655824  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19655825 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19655857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20177401 - 20177166
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  20177401 catgaaagttttagacaattttgttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 20177302  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20177301 tcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-caatccaaaacatagggaataattctaaacctcaaaactataagtactaggagttc 20177203  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20177202 aattaaggtgtctaagagtatttaacctatgttatga 20177166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 23491567 - 23491799
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||     
T  23491567 catggaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggattgaaaataatttttggtttttgagatatgatgacaatattccaaggagg 23491666  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  23491667 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagttt 23491766  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  23491767 aattaaggtgtttaagagtatctaacatatgtt 23491799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 23497165 - 23497397
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||     
T  23497165 catggaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggattgaaaataatttttggtttttgagatatgatgacaatattccaaggagg 23497264  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  23497265 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagttt 23497364  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  23497365 aattaaggtgtttaagagtatctaacatatgtt 23497397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 89 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18709151 - 18708923
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || || |    
T  18709151 aaagttgtagatcattgagttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcat 18709052  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18709051 agtgaaatctaatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaact 18708952  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18708951 agggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18708923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Original strand, 22158590 - 22158825
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  22158590 catgaaagttttagacaattttgttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 22158689  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22158690 tcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-aaatccaaaacatagggaataattctaaacctcaaaactaaaagtactaggagttc 22158788  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  22158789 aattaaggtgactaagagtatttaacctatgttatga 22158825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 85 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13765002 - 13764730
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||       || ||||||||||||||||||| |||     
T  13765002 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttg-------agttatgatgaaaatactccaaggagg 13764910  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  13764909 tcttaatgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtta 13764810  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 365  Q
    || |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||| ||| || ||||  |||||||||||||    
T  13764809 aattaaggtgttttagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttagggtagaaat-gaagttgtttataatattaatg 13764730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 17318518 - 17318750
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  17318518 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttcttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 17318617  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17318618 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaggtaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 17318717  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17318718 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17318750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 89 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18703216 - 18702988
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || || |    
T  18703216 aaagttgtagattattgagttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcat 18703117  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  18703116 agtgaaatctaatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 18703017  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18703016 agggtttttaagagtatttaacctatgtt 18702988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 23150663 - 23150894
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | | |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||     
T  23150663 catgaaagttgtagataattgagttagcttttcaatggctttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaagtagg 23150762  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23150763 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttc 23150862  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23150863 aact-aggtgtttaagagtatttaacctatgtt 23150894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 316
Target Start/End: Original strand, 25601673 - 25601904
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  25601673 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgagttttggtttttgcgttatgatgaaaatactccaaggagg 25601772  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||     
T  25601773 ttttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtaataagagttt 25601872  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25601873 aattaaggggtttaagagtatttaacctatgt 25601904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 85 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1254413 - 1254215
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||     
T  1254413 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggagg 1254314  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 283  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  1254313 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagtt 1254215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 330
Target Start/End: Original strand, 29847899 - 29848146
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  29847899 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgaatttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 29847998  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaa--ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagt 282  Q
    ||||| |||||| || ||||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29847999 tcttaatgaaatcttatgaaaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagt 29848098  T
Q  283 tcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 330  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  29848099 tcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatctt 29848146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 304
Target Start/End: Original strand, 15891107 - 15891326
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15891107 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 15891206  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||    
T  15891207 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctaaaaactagaagtactatgatttc 15891306  T
Q  285 aactaaggtatttaagagta 304  Q
    || || ||| ||||||||||    
T  15891307 aattagggtgtttaagagta 15891326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 85 - 311
Target Start/End: Original strand, 8767659 - 8767885
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||     
T  8767659 catgaaagttgtagatacttttgttagctttccaatggctttggtttgacatgaaaataatttttggtttttgagatattatgaaagtactccaaggagg 8767758  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  8767759 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 8767858  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacc 311  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||    
T  8767859 aattaaggtgtttaagaatatttaacc 8767885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 85 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25347782 - 25347556
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25347782 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttaacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 25347683  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||  |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||||    
T  25347682 tcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctccaaactagaagtgccatgagttc 25347583  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacc 311  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||    
T  25347582 aattaaggtgtttgagagtatttaacc 25347556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Original strand, 19773105 - 19773330
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||   |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  19773105 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggtttttgtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 19773204  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  19773205 tcttagtgaaattttatgaaaatttagcataactgtttttaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 19773304  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  19773305 aattaaggggtttaagagtatttaac 19773330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Original strand, 15705007 - 15705232
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||   | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||     
T  15705007 catgaaaattgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatacctcaagtagg 15705106  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  15705107 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttcttagttaatccaaaatttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 15705206  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  15705207 aattaaggggtttaagagtatttaac 15705232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31734362 - 31734132
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| ||||||| || || | || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31734362 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatattagattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 31734263  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  31734262 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtact--gagttc 31734165  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31734164 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 31734132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20183219 - 20182984
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  20183219 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgatttttcgtttttgagttatgatgaaaatactccaagtagg 20183120  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| || |||||||||||| |||||     
T  20183119 tcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctc-aagctagaagtactatgagttt 20183021  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  20183020 aattaaggtgtttaagagtatttaacctttgttatga 20182984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Original strand, 22152772 - 22153007
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  22152772 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgatttttcgtttttgagttatgatgaaaatactccaagtagg 22152871  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| || |||||||||||| |||||     
T  22152872 tcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctc-aagctagaagtactatgagttt 22152970  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22152971 aattaaggtgtttaagagtatttaacctttgttatga 22153007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4477314 - 4477043
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||     
T  4477314 catgaaagttgtagataatttcgttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttatgagttatgatgaaaatactccaagtagg 4477215  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  4477214 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatcaaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 4477115  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4477114 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 4477043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 23655995 - 23655804
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  23655995 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgccttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 23655896  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtact 276  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23655895 tcttagtaaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataattccaaacctcaaaactagaagtact 23655804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 27125872 - 27126105
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt-ggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgag 183  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | |  ||||||  |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  ||  ||    
T  27125872 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggcttttgtttgaggtgaaaatgattttttggttcttgagatacgatgaaaatactttaaaaag 27125971  T
Q  184 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 283  Q
     |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27125972 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaagaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 27126071  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27126072 caactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 27126105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 328
Target Start/End: Original strand, 16133066 - 16133309
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  16133066 catgaaagttgtagaaaattttgttagctttccaatgtcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 16133165  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||| |  |  ||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||| || ||||||| |   || |||||||||||||||| ||||||    
T  16133166 tcttagtgaattcataggaaaattcagcataaccatttccaagttaatcggaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtactatgagttc 16133265  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatc 328  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16133266 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 16133309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 89 - 328
Target Start/End: Original strand, 19443681 - 19443919
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||    
T  19443681 aaagttgtagaaaattt-gttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgaagaaaatactccacgtaggtctt 19443779  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| || ||||||| | | || |||||||||||||||| |||||||| |    
T  19443780 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttccaagttaatcgaaaacttatgggataattccagaactaaaaactagaagtactatgagttcaatt 19443879  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatc 328  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19443880 aaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 19443919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 311
Target Start/End: Original strand, 8759913 - 8760138
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  8759913 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctgtggattgacatgaaaataatttt-ggtttttgagatattatgaaaatactccaaggagg 8760011  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  8760012 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttc 8760111  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacc 311  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||    
T  8760112 aattaaggtgtttaagaatatttaacc 8760138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 89 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 940 - 755
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  940 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggttttacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 841  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagta 274  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  840 agtgaaatcttatgaaaattcagtataattgtttctaagttaatctaaaatttatggaataattccaaagctcaaaactagaagta 755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 55 - 313
Target Start/End: Original strand, 27317919 - 27318179
Alignment:
Q  55 tttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagcttt--ccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggt 152  Q
    |||||||| ||||||||  || |||||   ||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||| || | | | |||||| |||||| ||||||||||    
T  27317919 tttctgttttgaattagcctttggagtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctatatccagtggctttgatttgacgtgaaaaggatttttggt 27318018  T
Q  153 ttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatt 252  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  27318019 tcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaattcaaaactagaggaataatt 27318118  T
Q  253 caaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  27318119 caaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatatggtgtttaagagtatttaaccta 27318179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Original strand, 34296664 - 34296923
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgtt-agctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgag 183  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| | | | || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  34296664 catgaaagttgtagatatttttttttagcttcccaaaggctttggcttcacttgaaaatgatttttggtttttgggatatgatgaaaatactccaaggag 34296763  T
Q  184 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 283  Q
     |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  34296764 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaaggactatgagtt 34296863  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
     || || ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| || | ||||||| ||||||    
T  34296864 taattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttggggttggaatg 34296923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 259
Target Start/End: Original strand, 31022093 - 31022267
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  31022093 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaaggaga 31022192  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacc 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31022193 tcttagtgaaattttatgaaaattcactaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacc 31022267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 18455468 - 18455699
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  18455468 catgaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagg 18455567  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || | | ||||| ||||||    
T  18455568 ttttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgta-tactatgagttc 18455666  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18455667 aattaaggtctttaagagtatttaacctatgtt 18455699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25921385 - 25921154
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25921385 catgaaagttttagataattgtgttatctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 25921286  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| | | |   || |||| |||||  | |  |||||| ||||||    
T  25921285 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttc 25921187  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25921186 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 25921154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 25807788 - 25807602
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  25807788 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttgtcgtgaaaattatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 25807689  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||    
T  25807688 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaa 25807602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 265 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 25753026 - 25752864
Alignment:
Q  265 actagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaat 364  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  25753026 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattact 25752927  T
Q  365 gatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  25752926 gatgatctatgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 25752864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 265 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 25755196 - 25755034
Alignment:
Q  265 actagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaat 364  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  25755196 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgtgggttgaatataatattact 25755097  T
Q  365 gatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  25755096 gatgatctttgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 25755034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 321
Target Start/End: Original strand, 20411072 - 20411303
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||| || | | |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20411072 aaagttgtagacaattgtgttagcattccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttggtttttgaggtatgatgaaaatactccaaggagatctt 20411171  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||| || |||||||| |    
T  20411172 agtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaagcttg-tgtaatatgagttcaatt 20411270  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20411271 aagttgtttaagagtatttaacctatgttatga 20411303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32259502 - 32259272
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  32259502 catgaaagttgtagataattgtgttagttttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgctttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 32259403  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| || || || |  |||||| ||||||    
T  32259402 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttc-aagcttg-tgtactatgagttc 32259305  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32259304 aattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 32259272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 188 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27557022 - 27556790
Alignment:
Q  188 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 287  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||| ||||||| ||| ||||||||     
T  27557022 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaattagaagttctatgagttcaat 27556923  T
Q  288 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataa 387  Q
    |||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27556922 taaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataa 27556830  T
Q  388 tatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    ||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  27556829 tatgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 27556790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 190 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23415262 - 23415032
Alignment:
Q  190 gtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaacta 289  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  23415262 gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatta 23415163  T
Q  290 aggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataata 389  Q
    |||| ||||||| |||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23415162 aggtgtttaagaatata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataata 23415070  T
Q  390 tgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    ||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  23415069 tgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 23415032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29044962 - 29044809
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  29044962 aaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagatctt 29044863  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  29044862 agtgaaatgttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactta 29044809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 33443307 - 33443193
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  33443307 atgttatgagttgatccttagggtaggaatggaggttgaatataatattattgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagta 33443212  T
Q  413 atgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33443211 atgtaatatatttgtatat 33443193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7430179 - 7430069
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7430179 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 7430080  T
Q  185 tcttagtgaaa 195  Q
    ||||| |||||    
T  7430079 tcttaatgaaa 7430069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Original strand, 34141023 - 34141178
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| | || | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  34141023 catgaaagttttagataatt--gttagctttctagtggcgttggtatgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccaagaaga 34141120  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  34141121 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactta 34141178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Original strand, 34153639 - 34153794
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| | || | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  34153639 catgaaagttttagataatt--gttagctttctagtggcgttggtatgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccaagaaga 34153736  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  34153737 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactta 34153794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18585274 - 18585117
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  18585274 catgaatgttttagataattgtgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 18585175  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  18585174 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaactta 18585117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22556905 - 22556676
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| | |||| | ||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||  ||     
T  22556905 catgaaacttgtagataattgtgtttgatttctagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagttatgatgaacatactccaagaagg 22556806  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||  |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  22556805 tcttagtgaaattttatgaaaattttgcataaccatttctaggtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacatcaaaactagaagtactaggagttt 22556706  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 314  Q
     | |||||  ||||||||||||||||||||    
T  22556705 cattaaggggtttaagagtatttaacctat 22556676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 88 - 316
Target Start/End: Original strand, 17857091 - 17857319
Alignment:
Q  88 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 187  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  17857091 gaaagttttagataattgtgttagatttccaatggctttggtatgacttgaaaatgatttttagattttgggttatgatgaaaacactccaaggaggtct 17857190  T
Q  188 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 287  Q
    | |||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| || |||||||||| ||  |  ||| |||| ||||||| ||||||| ||||| || ||     
T  17857191 tggtgaaattttatgaaaattccggataactatttctaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaacgagaagtattaggaatttaat 17857290  T
Q  288 taaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  17857291 taagaggtttaagagtatttaacctatgt 17857319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18398574 - 18398343
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||     
T  18398574 catgaaagttttagataattgtgttagctttctattggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccagggagg 18398475  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||  || |   || |||| |||||||| |  || ||| ||| ||    
T  18398474 tcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtgtccaaacttcaaaacttg-tgttctatgagctc 18398376  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18398375 aattaaggtgtttaagagtatttaacttatgtt 18398343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23838655 - 23838447
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |      
T  23838655 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtatg 23838556  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||| |||  || | |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||| |    
T  23838555 tcttagggaaatcttaagaaaattcagcacaaccattaccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtaatatgagtgc 23838456  T
Q  285 aactaaggt 293  Q
    || ||||||    
T  23838455 aattaaggt 23838447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 85 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13285364 - 13285136
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| | || | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||     
T  13285364 catgaaaattttagataattatgttagctttctagtggctttagttttacttgaaaatgatttttggtttttgatttatgatgaaaacactccaaggagg 13285265  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| ||||||    
T  13285264 tcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagccaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 13285166  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 314  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13285165 atttaaggtgtttaagagtatttaacctat 13285136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12942785 - 12942666
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  12942785 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 12942686  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  12942685 tcttagtgaatttttatgaa 12942666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 313 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 18696749 - 18696660
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18696749 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttatcatatgatttaatgttg 18696660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Original strand, 28288903 - 28289022
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  28288903 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggttggactcgaaaatgagttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 28289002  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  28289003 tcttagtgaatttttatgaa 28289022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 195
Target Start/End: Original strand, 14594021 - 14594131
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14594021 catgaaagttgtagataattttgttagctttccgatggctttggtttgatttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 14594120  T
Q  185 tcttagtgaaa 195  Q
    ||||| |||||    
T  14594121 tcttaatgaaa 14594131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 313 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20224205 - 20224095
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    |||||    
T  20224205 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattgctgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagta 20224110  T
Q  413 atgtaatatatttgt 427  Q
    |||||||||||||||    
T  20224109 atgtaatatatttgt 20224095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 313 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22118189 - 22118079
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    |||||    
T  22118189 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattgctgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagta 22118094  T
Q  413 atgtaatatatttgt 427  Q
    |||||||||||||||    
T  22118093 atgtaatatatttgt 22118079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22806405 - 22806276
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  22806405 catgaaatttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacctgaaaatgatttttggttcgtgagatatgatgaaaatactccaagtagg 22806306  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcat 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22806305 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcat 22806276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23415560 - 23415441
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  23415560 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttgttgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 23415461  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  23415460 tcttagtgaatttttatgaa 23415441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 205
Target Start/End: Original strand, 27330368 - 27330488
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  27330368 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 27330467  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaa 205  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  27330468 tcttagtgaaatcttatgaaa 27330488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 205
Target Start/End: Original strand, 27391108 - 27391228
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  27391108 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 27391207  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaa 205  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  27391208 tcttagtgaaatcttatgaaa 27391228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 313 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 18706568 - 18706478
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggg-gtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18706568 atgttatgagttgatccttggttgtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgatgttg 18706478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 89 - 204
Target Start/End: Original strand, 19858493 - 19858608
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | || | |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  19858493 aaagttgtagataattgtgttagctttctagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactcaaaggagatctt 19858592  T
Q  189 agtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||| |||| ||||    
T  19858593 agtgaatttttatgaa 19858608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Original strand, 15938622 - 15938857
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||| | ||| || | ||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||  ||     
T  15938622 catgaaagttatagatgaattttttggttttccaatggctttggtttgacttgaaaattatttttatcttttgagttatgatgaaaatactctaagtagg 15938721  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||  |  ||| |||  |||||| | | |||  |||||||||    
T  15938722 tcttggtgaaattttacgaaaatttagcataactatttttaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaaattcaaaaattg-agtgttaggagttc 15938820  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  15938821 aattaaggtgtttaagggtatttaacctatgatatga 15938857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27557318 - 27557199
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||   |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||      
T  27557318 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtggatttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggatg 27557219  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  27557218 tcttagtgaatttttatgaa 27557199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 23221521 - 23221288
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    | ||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| ||||||||||||||||||    |     
T  23221521 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatttttttggtttgacttgaaaatgatatttagatttggagttatgatgaaaatactccatgtggg 23221422  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | || |||||||||  |||| |||| ||  |  ||| |||| |||||| | | |||| ||||||||     
T  23221421 tcttagtaaaactttatgaaaattcagcataatttttcctaagttaaatcaaaccttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagttt 23221323  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttat 319  Q
    || |||| | |||||||||||| |||||| |||||    
T  23221322 aattaagatgtttaagagtattaaacctaggttat 23221288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33862388 - 33862270
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  33862388 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 33862289  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  33862288 cttagtgaatttttatgaa 33862270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Original strand, 1540478 - 1540597
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  | | ||||||||||||||||||| |||     
T  1540478 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcataaaaatgagttttggtttaggcgttatgatgaaaatactccaaggagg 1540577  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  1540578 tcttagtgaatttttatgaa 1540597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 204
Target Start/End: Original strand, 15891979 - 15892094
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||    | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15891979 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttttgttttgtgttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 15892078  T
Q  189 agtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||||| ||||    
T  15892079 agtgaaattttatgaa 15892094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 18334159 - 18334238
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18334159 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 18334238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 24423142 - 24423063
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24423142 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 24423063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 35057160 - 35057066
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 179  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  35057160 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgttttatggattttgagttatgatgaaaacactccaa 35057066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 33864873 - 33864794
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33864873 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 33864794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 2290747 - 2290821
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 159  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2290747 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggcatcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 2290821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8055625 - 8055551
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 159  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8055625 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 8055551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Original strand, 17883065 - 17883183
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | | |||||| | | ||  |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  17883065 atgaaagttgtagataatttctttagctttccaatggctttggtttggcgttaatttgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 17883164  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  17883165 cttagtgaatttttatgaa 17883183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 164
Target Start/End: Original strand, 26924015 - 26924093
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26924015 atgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 26924093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 22782822 - 22782743
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  22782822 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccactggcgtcagtttgacttgaaaatgatatttggtttatgagttatg 22782743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12742908 - 12742794
Alignment:
Q  90 aagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctta 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  || ||   | ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  12742908 aagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtgtggagtaaaattgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctta 12742809  T
Q  190 gtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||| |||| ||||    
T  12742808 gtgaatttttatgaa 12742794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19234741 - 19234658
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatga 168  Q
    ||||| |||| |||| |||| |||||| ||| || || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19234741 catgatagttttagacaattgtgttagattttcattggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatga 19234658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 25175198 - 25175112
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| | | |||||||||||| ||| ||||    
T  25175198 aaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagatattgagatatgattaaattact 25175112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Original strand, 27654616 - 27654706
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  27654616 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 27654706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16135591 - 16135519
Alignment:
Q  244 ggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  16135591 ggaatatttccaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 16135519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 318 - 402
Target Start/End: Original strand, 16448435 - 16448519
Alignment:
Q  318 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  16448435 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgatggtctatgaagttgttataacatgattcaatgttg 16448519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16135699 - 16135613
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaat 172  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | ||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  16135699 catgaaagttttagttaattttgttagctttccaatggctttggtttaactt-aaaatgatttttatattttgagatatgatgtaaat 16135613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 359
Target Start/End: Original strand, 20078033 - 20078079
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 359  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20078033 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataata 20078079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 31163622 - 31163536
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa 171  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  31163622 catgaaggttttagataattatgttatatttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaa 31163536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 18453444 - 18453355
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||| ||||||||| ||||||    
T  18453444 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatactactgttgatgttcagtgagtctgatattatatgatttgatgttg 18453355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 315
Target Start/End: Original strand, 22523388 - 22523594
Alignment:
Q  108 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 207  Q
    ||||||||| |||| | | | |||| ||| || ||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||  ||  || |||| ||||||||||  ||||||    
T  22523388 ttagctttctaatggctttgttttggcttaaagatgatttttaggttttgagttatggtgaaaatactaaaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaat 22523487  T
Q  208 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaagg-tatttaagagtatt 306  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || ||| || ||| ||  |  |   ||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||    
T  22523488 tcagcataactatttttaagtgaacccataagttatggtttggtcgcaaacctcaaaacttg-agtactaggagtttaa-taaggatgtttaagagtatt 22523585  T
Q  307 taacctatg 315  Q
    |||||||||    
T  22523586 taacctatg 22523594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 171
Target Start/End: Original strand, 3007508 - 3007594
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa 171  Q
    |||||| ||| |||||||||  |||| |||| ||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  3007508 catgaaggttttagataattaggttatcttttcaatggcgttggtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaa 3007594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Original strand, 16826387 - 16826477
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  16826387 catgaaagttgtagacaattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 16826477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Original strand, 21776115 - 21776205
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||   |||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  21776115 catgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgccaaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21776205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 242
Target Start/End: Original strand, 31161878 - 31162012
Alignment:
Q  108 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 207  Q
    ||||| |||||||||| | | |||||| | |||||||||||| | ||||||| |||| |||||| |||||||  || |||| | ||||||||  | ||||    
T  31161878 ttagcattccaatgactttgatttgacatcaaaatgatttttagattttgagttatgttgaaaacactccaagtaggtcttggagaaattttaagtaaat 31161977  T
Q  208 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    | ||||| ||| |||| |||| || ||||||||||    
T  31161978 ttagcatgactatttccaagtcaacccaaaactta 31162012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 353 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 19362646 - 19362598
Alignment:
Q  353 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19362646 tataatattactgatgatctgtgaaactgttataa-atgatttaatgttg 19362598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Original strand, 32277441 - 32277541
Alignment:
Q  128 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 227  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||| || ||| | ||| | ||| |||  |||||||| ||| || ||||||||||    
T  32277441 gtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggaggttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtttctaag 32277540  T
Q  228 t 228  Q
    |    
T  32277541 t 32277541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 1555617 - 1555527
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  1555617 catgaaagttttaaataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 1555527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 18456938 - 18456888
Alignment:
Q  352 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||    
T  18456938 atataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg 18456888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 25644545 - 25644495
Alignment:
Q  352 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  25644545 atatgatattaatgatgatctgtgaagctgatatatgatgatttgatgttg 25644495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 402
Target Start/End: Original strand, 8227409 - 8227458
Alignment:
Q  353 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||    
T  8227409 tataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg 8227458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 356
Target Start/End: Original strand, 17229776 - 17229817
Alignment:
Q  315 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17229776 gttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 17229817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 402
Target Start/End: Original strand, 18896215 - 18896263
Alignment:
Q  353 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  18896215 tataatattactgatgatctgtgaatctgttataa-aagatttaatgttg 18896263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19609670 - 19609621
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgac 134  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | ||||||||    
T  19609670 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgac 19609621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 10488061 - 10488025
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10488061 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 10488025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16240386 - 16240322
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  16240386 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttt 16240322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Original strand, 16377267 - 16377303
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16377267 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 16377303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Original strand, 16384591 - 16384627
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16384591 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 16384627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Original strand, 22226588 - 22226652
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  22226588 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttt 22226652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 25904565 - 25904501
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  25904565 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttt 25904501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Original strand, 33315095 - 33315131
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33315095 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 33315131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 104)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 85 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6766317 - 6765976
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  6766317 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacttttgtttgacttaaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaag 6766218  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  6766217 tcttggtaaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaaatagaagtactatgagttc 6766118  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  6766117 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggtggaatataatattgctgttgatctgtgaagctgtta 6766018  T
Q  385 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    | |||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||    
T  6766017 t-atatgatttaatgttga----tagtaatgtattatatttgtatat 6765976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 85 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22412662 - 22412365
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  22412662 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttattttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 22412563  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22412562 tcttagtgaaattttatgaaagttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 22412463  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 383  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22412462 aattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatc-ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaattataatctgtgaagctgtt 22412365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 89 - 431
Target Start/End: Original strand, 30138564 - 30138901
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  30138564 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtttt 30138663  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    ||||||  || | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  30138664 agtgaaccttat-gaaaattcagcataaccgtttctaagttaacccaaaatttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 30138762  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 388  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  30138763 aaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataat 30138862  T
Q  389 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||    
T  30138863 atgatttaatgtt----cgtagtaatgtaatatatttgtatat 30138901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 85 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 29448494 - 29448174
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  || | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  29448494 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatattatgaaaatactccaaggagg 29448395  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  29448394 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtagtatgagttc 29448295  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29448294 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggatgaatactatattaatgatgatttgtgaagttgtta 29448195  T
Q  385 taatatgatttaatgttgata 405  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  29448194 taatatgatttgatgttgata 29448174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 85 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 18419068 - 18418770
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18419068 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 18418969  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18418968 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataatcgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 18418869  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 383  Q
    || ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18418868 aattaaagtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattaattataacctgtgaagctgtt 18418770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Original strand, 24277002 - 24277266
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24277002 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24277101  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24277102 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataagtactatgagttc 24277201  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  24277202 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 24277266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24385211 - 24384947
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24385211 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24385112  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24385111 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataagtactatgagttc 24385012  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  24385011 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 24384947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17813048 - 17812795
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17813048 aaagttgtagataatttttttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 17812949  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  17812948 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgaattcaatt 17812849  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  17812848 aaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 17812795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 263513 - 263260
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  263513 catgaaagttatagataattgtgttagctttccgatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatacgccaaggagg 263414  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  263413 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 263314  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  263313 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 263260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 89 - 338
Target Start/End: Original strand, 33472964 - 33473213
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33472964 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 33473063  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  33473064 agtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggtttaatt 33473163  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  33473164 aaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 33473213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 32607721 - 32607953
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  32607721 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgtctttggtttgacttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaag 32607820  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  32607821 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagctaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactataagttc 32607920  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  32607921 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 32607953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 36460626 - 36460368
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  36460626 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 36460527  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36460526 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 36460427  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    || || ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| || | ||||||| ||||||    
T  36460426 aattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttggggttggaatg 36460368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 314
Target Start/End: Original strand, 21399400 - 21399628
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  21399400 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgactt-aaaatgattttcagtttttgagatatgataaaaatactccaaggagg 21399498  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21399499 ttttagtgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 21399598  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 314  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21399599 aattaaggtgtttaagagtatttaacctat 21399628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17011382 - 17011102
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  17011382 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttcagatatgatgaaaatactccaaggagg 17011283  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  17011282 tcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacttcaaaactaaaagtactatgagttc 17011183  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 365  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||   |||  |||||||  |||||||||||||    
T  17011182 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttgggggtagaaacgaggttgtttataatattaatg 17011102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 41875989 - 41876221
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  41875989 catgaaagttgtagataattttgttagatttccaatgactctggtttggcatgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 41876088  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  41876089 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaatcttagggaataattccaaacctcaaaactaaaagtactatgagtta 41876188  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41876189 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 41876221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 26762057 - 26761827
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || | | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  26762057 catgaaagttgtagataaatgtgttagctttccagtggctttggttttacttgaaactgatttttgatttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 26761958  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26761957 tcttagtgaaattttatgaacattcaacataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataactccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 26761858  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 315  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26761857 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 26761827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17875655 - 17875410
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||     
T  17875655 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccgaggagg 17875556  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17875555 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 17875456  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 330  Q
    || |||||| |||||||||||||||||  | || ||||||||||||    
T  17875455 aattaaggtgtttaagagtatttaacccctattgtgagttgatctt 17875410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 20197982 - 20198216
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttg--agatatgatgaaaatactccaatga 182  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  20197982 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttttttttttttagatatgatgaaaatactccaagga 20198081  T
Q  183 gatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagt 282  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20198082 ggtcttagtgacattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactaggagt 20198181  T
Q  283 tcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    | || |||||  | |||||||||||||||||||||    
T  20198182 ttaattaaggggtataagagtatttaacctatgtt 20198216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20566210 - 20565978
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  ||| || || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  20566210 catgaaagttgtagataattgagttaaattttcagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 20566111  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20566110 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaattactatgagttc 20566011  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20566010 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 20565978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Original strand, 38145134 - 38145405
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  38145134 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 38145233  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  38145234 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatacgagtgc 38145333  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  38145334 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 38145405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19921289 - 19921058
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||   | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  19921289 catgaaagttgtagatgattgagttagctttccagtggttt-ggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaaa 19921191  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19921190 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaaccttaaaactagaagtactatgagttc 19921091  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19921090 aactagggtgtttaagagtatttaacatatgtt 19921058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 27868971 - 27869203
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  27868971 catgaaagttgtagataattctgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 27869070  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||    
T  27869071 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaacatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaccatgagttc 27869170  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27869171 aattaaggtgtttgagagtatttaacctatgtt 27869203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 8833603 - 8833824
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||     
T  8833603 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttt--------gagatatgatgaaaatactccaaggagg 8833694  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8833695 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 8833794  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 315  Q
     | |||| | |||||||||||||||||||||    
T  8833795 -attaagttgtttaagagtatttaacctatg 8833824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31456454 - 31456196
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31456454 catgaaagttgtagataattgagttaactttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 31456355  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||     
T  31456354 tcttagtgaaatcttgggaaaattaagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaaaaattccaaccctcaaaactagaaatactatgagttt 31456255  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||||||||    
T  31456254 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatattgtgagtcgacccttggggtaggaatg 31456196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Original strand, 21557440 - 21557699
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||      
T  21557440 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttttggcttttaagatatgatgaaaatactccaaggatg 21557539  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  21557540 tcttagtgaaatcttacgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactataagttc 21557639  T
Q  285 aactaaggtattt-aagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    || |||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  21557640 aattaaggtgtttaaagagtatttaaactatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatg 21557699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Original strand, 28370652 - 28370923
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  28370652 catgaaagttgtagataattttgttagctttccagtggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 28370751  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||      
T  28370752 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgt 28370851  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28370852 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 28370923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22750597 - 22750372
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  |      
T  22750597 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcatg---ttgacttgaaaataacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaag 22750501  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  22750500 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcgaaactagaagtattatgagttc 22750401  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaaccta 313  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||    
T  22750400 aattaaggtgtttaagagtatttaaccta 22750372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19511843 - 19511614
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  ||     
T  19511843 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtagg 19511744  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaactagaagtactaggagtt 283  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| | || || ||    
T  19511743 tcttagtggaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagcattatgaatt 19511644  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaaccta 313  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19511643 caattaaggtgtttaagagtatttaaccta 19511614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Original strand, 33895300 - 33895508
Alignment:
Q  107 gttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaa 206  Q
    |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||    
T  33895300 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattgtgaaaa 33895399  T
Q  207 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 306  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||    
T  33895400 ttcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttatagaataaatccaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 33895499  T
Q  307 taacctatg 315  Q
    |||||||||    
T  33895500 taacctatg 33895508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42961033 - 42960761
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  42961033 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatggtttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 42960934  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| | |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  42960933 tcttcgggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 42960834  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgat-ctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || ||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  42960833 aattaaggtgcttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggggtaggaatggaggttgattata 42960761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Original strand, 37598513 - 37598784
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  37598513 catgaaagttgtaaataattttgttagatttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 37598612  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || | ||||| ||  ||||||||||||| || || |||| |    
T  37598613 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggacaattccaaggctcaaaactagaattaatatgagtgc 37598712  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  37598713 aattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 37598784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 85 - 381
Target Start/End: Original strand, 22758286 - 22758583
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttg-agatatgatgaaaatactccaatgag 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||| |  |||    
T  22758286 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagcttgacttgaaaatgatttttggtttttttagttatgatggaaatactctagggag 22758385  T
Q  184 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 283  Q
     |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||| |||| |||||    
T  22758386 gtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagcactatgagtt 22758485  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 381  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||  |||| | |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  22758486 caattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggataacaatgaaagttgtataagatattaaggatgatatgtgaagctg 22758583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 85 - 240
Target Start/End: Original strand, 40917369 - 40917524
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||     
T  40917369 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactcaaaggagg 40917468  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaact 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40917469 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 40917524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 85 - 323
Target Start/End: Original strand, 21554775 - 21555013
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||     
T  21554775 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttt-ggtttttaagatatgatgaaaatactccaagtagg 21554873  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21554874 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtctaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactacgagttc 21554973  T
Q  285 aactaaggtattt-aagagtatttaacctatgttatgagt 323  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  21554974 aattaaggtgtttaaagagtatttaacccatgttgtgagt 21555013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16063141 - 16062910
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16063141 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16063042  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||  || |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  16063041 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 16062943  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16062942 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 16062910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 317
Target Start/End: Original strand, 36509181 - 36509405
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||| |||| |||||| || ||||||||||||| || | | |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  36509181 atgagagttttagatatttatgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaa--------ggtttttgagatatgatgaaaatgctccaaggaggt 36509272  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 285  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36509273 cttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttta 36509372  T
Q  286 actaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    | ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  36509373 attaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 36509405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 85 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22336976 - 22336748
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  22336976 catggaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 22336877  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||| ||||| || ||||      
T  22336876 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtga 22336777  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaaccta 313  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||    
T  22336776 aattaaggtgtttaagagtatttaaccta 22336748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 86 - 317
Target Start/End: Original strand, 8504266 - 8504496
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  8504266 atgaaagttgtagataattatgttagctttcctgtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggt 8504365  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 285  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   |  |||| ||||| || |  |||||| || ||||    
T  8504366 cttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtcttcaaacttcaaagcttg-tgtactatgaattca 8504464  T
Q  286 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8504465 attaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 8504496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 16605000 - 16605231
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16605000 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatggtttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 16605099  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||  ||||||    
T  16605100 tcttagtgaaagtttatgaaaattccgcataactatttataagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttc 16605198  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16605199 aattaaagtgtttaagagtatttaacctatgtt 16605231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22340514 - 22340286
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  22340514 catggaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaagagttatgatgaaaatactccaagtagg 22340415  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||  | ||||||| ||  |||||||||| ||||| || ||||      
T  22340414 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttataggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtga 22340315  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaaccta 313  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||    
T  22340314 aattaaggtgtttaagagtatttaaccta 22340286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18744305 - 18744074
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  18744305 catgaaagttatagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 18744206  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  | |||| ||||||    
T  18744205 tcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcactatgagttc 18744107  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18744106 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18744074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 14026204 - 14026435
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||  |||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  14026204 catgaaagttttagataattatgttatatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 14026303  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | || ||||| ||||||||| || ||||||| || ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||     
T  14026304 tcttagtgaaattttatgaaaatcccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacatatggattgtctccaaacttcaaatcttg-tgtactatgagttg 14026402  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14026403 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14026435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 212
Target Start/End: Original strand, 24617319 - 24617446
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  24617319 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 24617418  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagc 212  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  24617419 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24617446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 212
Target Start/End: Original strand, 24713550 - 24713677
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  24713550 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 24713649  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagc 212  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  24713650 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24713677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 212
Target Start/End: Original strand, 24746578 - 24746705
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  24746578 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 24746677  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagc 212  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  24746678 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24746705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 195
Target Start/End: Original strand, 43243054 - 43243164
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43243054 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgattttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 43243153  T
Q  185 tcttagtgaaa 195  Q
    ||||| |||||    
T  43243154 tcttaatgaaa 43243164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Original strand, 23199788 - 23199942
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||     
T  23199788 catgaaagttgtagataattgtgttagctttcccatggctttggtttgacttgaaaat---ttttggtttctgagttatgatgaaaatactccaaggagg 23199884  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  23199885 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaactta 23199942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 1627777 - 1628008
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | || | | |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| || |||     
T  1627777 catgaaagttttagataattgtgttatctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttaacttttgagttatgatgaaaatactcgaaggagg 1627876  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  1627877 tcttaatgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 1627975  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1627976 aattaacgtgtttaagagtatttaacctatgtt 1628008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Original strand, 37804469 - 37804588
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  37804469 catgaaagttgtagataatgttgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 37804568  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  37804569 tcttagtgaatttttatgaa 37804588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 212
Target Start/End: Original strand, 24668593 - 24668720
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||     
T  24668593 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggagg 24668692  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagc 212  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  24668693 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24668720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 212
Target Start/End: Original strand, 24738362 - 24738489
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||     
T  24738362 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggagg 24738461  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagc 212  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  24738462 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24738489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 212
Target Start/End: Original strand, 24751131 - 24751258
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||     
T  24751131 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggagg 24751230  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagc 212  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  24751231 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24751258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28901576 - 28901346
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||| ||||  |      
T  28901576 catgaaagttttagataattttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaag 28901477  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| || || |||| |||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  28901476 tcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagttt 28901378  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    || |||    ||  ||||||||||||||||||    
T  28901377 aattaaaaggttggagagtatttaacctatgt 28901346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28937971 - 28937741
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||| ||||  |      
T  28937971 catgaaagttttagataattttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaag 28937872  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| || || |||| |||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  28937871 tcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagttt 28937773  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    || |||    ||  ||||||||||||||||||    
T  28937772 aattaaaaggttggagagtatttaacctatgt 28937741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 155 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22111185 - 22111024
Alignment:
Q  155 ttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattca 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||     
T  22111185 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctcc 22111086  T
Q  255 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||| ||||| || |  |||||  |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22111085 aaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttctattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22111024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17909123 - 17908966
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||     
T  17909123 catgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggagg 17909024  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    | ||| | ||| |||  |||||||| ||| || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  17909023 ttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtctctaagtcaacccaaacctta 17908966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 244 - 343
Target Start/End: Original strand, 12122077 - 12122175
Alignment:
Q  244 ggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  12122077 ggaataattctaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 12122175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29351521 - 29351402
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||| |||| ||  |||     
T  29351521 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggagg 29351422  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  29351421 tcttagtgaatttttatgaa 29351402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Original strand, 10732508 - 10732626
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||| |    
T  10732508 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaaggaggt 10732607  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  10732608 cttagtgaatttttatgaa 10732626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 20909637 - 20909528
Alignment:
Q  55 tttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggttt 154  Q
    |||||||| |||||||| ||| || ||   |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909637 tttctgttttgaattagcttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggttt 20909538  T
Q  155 ttgagatatg 164  Q
     |||| ||||    
T  20909537 atgagttatg 20909528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 264335 - 264414
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  264335 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtgccgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 264414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23065109 - 23065030
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  23065109 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 23065030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 315 - 406
Target Start/End: Original strand, 25576716 - 25576807
Alignment:
Q  315 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 406  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25576716 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatattacagatgttcagtgagtctgatataatatgattttatgttgatag 25576807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29346575 - 29346456
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||| |||| ||  |||     
T  29346575 catgaaagttgtagataattgcgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggagg 29346476  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  29346475 tcttagtgaatttttatgaa 29346456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29349048 - 29348929
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||| |||| ||  |||     
T  29349048 catgaaagttgtagataattgcgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggagg 29348949  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  29348948 tcttagtgaatttttatgaa 29348929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Original strand, 42244933 - 42245051
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |    
T  42244933 atgaaagttgtagataattttattagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggt 42245032  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  42245033 cttagtgaatttttatgaa 42245051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 26740505 - 26740619
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||     |    
T  26740505 atgttgtgagttgatccttggggtaggagtggaggttgattataatgttactgatgttctgtgaatttgttattacatgatttaatgttgataga----a 26740600  T
Q  413 atgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  26740601 atgtgatatatttgtatat 26740619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 319 - 431
Target Start/End: Original strand, 26732698 - 26732806
Alignment:
Q  319 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 418  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||     ||||| |    
T  26732698 tgagttgatccttggggtaagaatggaggttgattataatgttactgatgttctgtgaatatgttattacatgatttaatgttgataga----aatgtga 26732793  T
Q  419 tatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||    
T  26732794 tatatttgtatat 26732806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 39245731 - 39245652
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  39245731 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaattattttcggtttatgagttatg 39245652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 23470064 - 23469975
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  23470064 atgttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttgattatagtaatgttgatgttcagtgagtctgttataatatgatttgatgttg 23469975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 38620061 - 38619952
Alignment:
Q  55 tttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggttt 154  Q
    |||||||| ||||||||  || || || | |||||||||||||||||||| |||||| ||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38620061 tttctgttttgaattagcctttggtgtatacatgaaagttgtagataattgtgttagattttcagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggttt 38619962  T
Q  155 ttgagatatg 164  Q
     |||| ||||    
T  38619961 atgagttatg 38619952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 402
Target Start/End: Original strand, 18318942 - 18319026
Alignment:
Q  318 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18318942 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgacgacctgtgaagctgttataacatgattcaatgttg 18319026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 406
Target Start/End: Original strand, 25574330 - 25574421
Alignment:
Q  315 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25574330 gttatgagttgatccttggggtaggaatagaggttgattataatactacagatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgatag 25574421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 406
Target Start/End: Original strand, 25575523 - 25575614
Alignment:
Q  315 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25575523 gttatgagttgatccttggggtaggaatagaggttgattataatactacagatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgatag 25575614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31479026 - 31478801
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||  |||||| | |||||||||| ||||  |||||| | ||||||  ||||||||||||||| || | ||     
T  31479026 catgaaagttttagataaagatgttagctttataatgactttggtttgacttaaaaagaatttttagattttgatttatgatgaaaatactacagt-agg 31478928  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||| ||  |||||  || ||  |  ||| ||| ||||||||| | |||||||||||||     
T  31478927 tcttggtgaaattttacgaaaattcagcataaccatttttaagtgaactcaaaagctatggtttggttccaaaactcaaaacttg-agtactaggagttt 31478829  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacct 312  Q
    || || | | ||||||||||||||||||    
T  31478828 aattatgatgtttaagagtatttaacct 31478801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11993 - 11903
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  11993 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 11903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 25426267 - 25426177
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  25426267 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 25426177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30614069 - 30613937
Alignment:
Q  184 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   |  |||  ||||| || |  |||||| |||||    
T  30614069 atcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctttaaaattcaaagcttg-tgtactatgagtt 30613971  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30613970 gaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 30613937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20572149 - 20572086
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtga 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||| |||||||    
T  20572149 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgattttactattgttgatgttctgtga 20572086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 39363979 - 39363900
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  39363979 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 39363900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 13938503 - 13938457
Alignment:
Q  55 tttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagata 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13938503 tttctgttccgaattaggtttgggcgtcttcatgaaagttgtagata 13938457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Original strand, 35791744 - 35791834
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  35791744 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgttcaaataatttttagaacttgagatatgattaaattact 35791834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 175
Target Start/End: Original strand, 21074229 - 21074318
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  21074229 atgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21074318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26749583 - 26749534
Alignment:
Q  272 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26749583 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 26749534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30612109 - 30611977
Alignment:
Q  184 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 283  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||| ||||| || |||||| ||| ||| |   || |||  |||||||| |  |||||| |||||    
T  30612109 atcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttgtaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaaattcaaaacttgt-gtactatgagtt 30612011  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30612010 gaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 30611977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Original strand, 22367114 - 22367178
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  22367114 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttt 22367178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Original strand, 25582095 - 25582130
Alignment:
Q  59 tgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagtt 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25582095 tgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagtt 25582130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 7424967 - 7424886
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgat 166  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   ||||||||||||    
T  7424967 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgat 7424886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 318 - 383
Target Start/End: Original strand, 20765993 - 20766058
Alignment:
Q  318 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 383  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20765993 atgagttggtctttggggttggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgtt 20766058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Original strand, 27183188 - 27183252
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  27183188 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttt 27183252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Original strand, 43444028 - 43444092
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  43444028 catgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttt 43444092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7528518 - 7528427
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactc 176  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||| || ||||| || | | |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7528518 catgaaagttttagacaattgagttggcattccattggccttggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactc 7528427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 19499518 - 19499487
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19499518 catgaaagttgtagataattttgttagctttc 19499487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 9776761 - 9776699
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattt 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | | |||||||||| |||| |||||    
T  9776761 catgaaagttgtagataattatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggattt 9776699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11342280 - 11342190
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  11342280 catgaaagttgtagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 11342190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Original strand, 18778625 - 18778715
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||| || |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  18778625 catgaaagttgtagataattttgttagatttctaatggctttggttttacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 18778715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Original strand, 1168811 - 1168875
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||| |||  |||||||||||    
T  1168811 catgaaagttttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttggcttccaaatgattttt 1168875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Original strand, 1220363 - 1220427
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  1220363 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgattttt 1220427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Original strand, 21933262 - 21933298
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21933262 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 21933298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Original strand, 21939432 - 21939468
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21939432 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 21939468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23506593 - 23506529
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||| |  |||||||||||    
T  23506593 catgaaagttttagataattatgttagttttctaatgactttggtttgacgtccaaatgattttt 23506529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 23908735 - 23908687
Alignment:
Q  53 attttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagata 101  Q
    ||||||| |||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23908735 attttctattcctaattaggttttggtgtcttcatgaaagttgtagata 23908687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 35581430 - 35581394
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  35581430 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 35581394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Original strand, 36990658 - 36990694
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36990658 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 36990694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 85 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 672 - 331
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||     
T  672 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagttttttagatatgatgaaaatagtccaaggagg 573  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  572 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 473  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || ||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  472 aattaaggt-gttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctttta 374  T
Q  385 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  373 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4813 - 4568
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4813 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggca 4714  T
Q  125 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 224  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4713 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 4614  T
Q  225 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactaga 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4613 aagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactaga 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11833 - 11679
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11833 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggca 11734  T
Q  125 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 179  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11733 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 11679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 82)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 85 - 431
Target Start/End: Original strand, 22130461 - 22130803
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22130461 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggaattggtttgatttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 22130560  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22130561 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataatcttttctaatttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 22130660  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  22130661 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtttatccttggggtaggaatggaagttgaatataatattactgatgatctgtgaagctacta 22130760  T
Q  385 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  22130761 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 22130803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 85 - 431
Target Start/End: Original strand, 13881012 - 13881354
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||   | ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| |||     
T  13881012 catgaaagttgtagataattgagttagctttacagtggttttggtttgacttggaaatgatttttagtttttgtgatatgatgaaattagtccaaggagg 13881111  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  13881112 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactaaaagtaatatgagttc 13881211  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  13881212 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgatctgtgaagctgtta 13881311  T
Q  385 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  13881312 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 13881354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 85 - 431
Target Start/End: Original strand, 45574448 - 45574779
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  45574448 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 45574547  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| |||||||           |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  45574548 tcttggtgaaat-----------tcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtgctatgagttc 45574636  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  45574637 aattaaggtgtttaagcgtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctatta 45574736  T
Q  385 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  45574737 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 45574779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Original strand, 21180721 - 21180985
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21180721 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21180820  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  || |||||||||||||||| ||||||    
T  21180821 tcttagtgaaattttatgaaatttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaattcttaaaactagaagtactatgagttc 21180920  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  21180921 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgat-tttgggataggaatggaagttg 21180985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Original strand, 24815248 - 24815512
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24815248 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgtctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24815347  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  24815348 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattctaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 24815447  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  24815448 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 24815512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 330
Target Start/End: Original strand, 44822518 - 44822763
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  44822518 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 44822617  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  44822618 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttacgggataattccaaacctcaaaactagaagtaatatgagttc 44822717  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 330  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44822718 aattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 44822763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 21239691 - 21239923
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21239691 catgaaagttttagataatttggttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21239790  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21239791 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 21239890  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  21239891 aattaaggtgtttaagaatttttaacctatgtt 21239923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 50001130 - 50000883
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  50001130 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 50001031  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcc-aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 283  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50001030 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaaacttatgagataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 50000931  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatcttt 331  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  50000930 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtcttt 50000883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 7052451 - 7052684
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  7052451 catgaaagttttagataattttgttaactttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 7052550  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  7052551 tattagtgaaattttatgaaaattctgcataaccgtttctaagtcagtccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 7052650  T
Q  285 aactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  7052651 aattaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 7052684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Original strand, 20031286 - 20031543
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||     
T  20031286 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgtttttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcaatggagg 20031385  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20031386 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttc 20031485  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaat 342  Q
    || |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  20031486 aattaaggtgtttaggagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaat 20031543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Original strand, 46198121 - 46198374
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  46198121 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 46198220  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46198221 tcttaatgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 46198320  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  46198321 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatattgtgagttggtccttggggtag 46198374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20588335 - 20588103
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20588335 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttggtgtgaaaatcatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaga 20588236  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20588235 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 20588136  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20588135 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 20588103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20592873 - 20592641
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20592873 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttggtgtgaaaatcatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaga 20592774  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20592773 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 20592674  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20592673 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 20592641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Original strand, 8276388 - 8276652
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  8276388 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 8276487  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||    
T  8276488 tcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaacctcaaaactagaagtactataggttc 8276587  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  8276588 aattaaggcgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 8276652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 93 - 317
Target Start/End: Original strand, 14238016 - 14238240
Alignment:
Q  93 ttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtg 192  Q
    |||||||||||| |||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14238016 ttgtagataattgtgttagcttttcagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttagtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtg 14238115  T
Q  193 aaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaagg 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  14238116 aaattttatgaaaattcagcataactgtttctgagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaagg 14238215  T
Q  293 tatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    | ||||||||||| |||||||||||    
T  14238216 tgtttaagagtatctaacctatgtt 14238240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28313004 - 28312733
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  ||     
T  28313004 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtagg 28312905  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  28312904 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 28312805  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28312804 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 28312733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Original strand, 7792248 - 7792512
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  7792248 catgaaagttgtagataattttgttagatttccaatggctttggtttgaattgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 7792347  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||    
T  7792348 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatgtgagttc 7792447  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  7792448 aattaaggtgtttaagagcatttaacccatgttgtgatttgatc-ttgggataggaatggaagttg 7792512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 38887483 - 38887716
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  38887483 catgaaagttgtagataattttgttagctttcgaatggctttggtttgatttgaaaatgatttttgatttttgaggtatgatgaaaatactccaaagagg 38887582  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  38887583 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataattacaaaactcaaaactagaagtactaggagttt 38887682  T
Q  285 aactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  38887683 aattaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 38887716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19676367 - 19676143
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   |  ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  19676367 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttagttggacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 19676268  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19676267 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 19676168  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaa 309  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||    
T  19676167 aactagggtgtttaagagtatttaa 19676143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 89 - 317
Target Start/End: Original strand, 41227104 - 41227332
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  41227104 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgcgaaaatgattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 41227203  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41227204 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaact 41227303  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||    
T  41227304 aggatgtttaagagtatttaacctatgtt 41227332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 42912706 - 42912482
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  42912706 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 42912607  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  42912606 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactataagttc 42912507  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaa 309  Q
    || || ||| |||||||||||||||    
T  42912506 aattagggtgtttaagagtatttaa 42912482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 89 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 51082868 - 51082640
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  51082868 aaagttgtagataattgtattatctttccagtggcgtaggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 51082769  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  51082768 agtgaaattttaagaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaatt 51082669  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  51082668 aaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 51082640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 85 - 328
Target Start/End: Original strand, 2332606 - 2332849
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |  |||     
T  2332606 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatggaaatactctagggagg 2332705  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2332706 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 2332805  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatc 328  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2332806 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 2332849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 86 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 51323930 - 51323699
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  51323930 atgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 51323831  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 285  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  51323830 cttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaattcaaaacttatggaataactccaaaccttaaaactagaagtactatgagttca 51323731  T
Q  286 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    | |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  51323730 attaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 51323699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 21046445 - 21046677
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  21046445 catgaaagttgtagataattgagttaggtttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaataatccaaagagg 21046544  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  21046545 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgggttc 21046644  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21046645 aattagggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 21046677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Original strand, 29764030 - 29764287
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  29764030 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggatttggtttaacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 29764129  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaa----aacctcaaaactagaagtactagga 280  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |    |||||||||||||||||||||| ||    
T  29764130 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatga 29764229  T
Q  281 gttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  29764230 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 29764287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16401324 - 16401060
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||  ||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  16401324 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgacttttagtgtttgagatatgatcaaaatactccaaggagg 16401225  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16401224 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcaaaatcgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 16401125  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  16401124 aattaaggtgtttaatagtatttaacccatgttttgagttgatc-ttgggacaggaatggaggttg 16401060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 20634030 - 20634263
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  20634030 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 20634129  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  20634130 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctatgtcaatccaaaacttggagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 20634229  T
Q  285 aactaag-gtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  20634230 aattaagagggtttaagagtatttaacctatgtt 20634263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 4596241 - 4596473
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4596241 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 4596340  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||   ||||    
T  4596341 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtaatataggttc 4596440  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  4596441 aactagggtgcttaagagtatttaacctatgtt 4596473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12710544 - 12710312
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  12710544 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggcgttggtttgacttacaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 12710445  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12710444 tcttagtgaaaatttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccgaaacttatggaataactccaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 12710345  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12710344 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 12710312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 16058710 - 16058942
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16058710 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttgatttgacgagaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16058809  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16058810 ttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 16058909  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  16058910 aactagggtgtttaagattatttaagctatgtt 16058942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 89 - 317
Target Start/End: Original strand, 41225851 - 41226079
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || | | || |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  41225851 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggattgacgagaaaatgatttttagttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtctt 41225950  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41225951 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaact 41226050  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||    
T  41226051 aggatgtttaagagtatttaacctatgtt 41226079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 45496602 - 45496369
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  45496602 catgaaaattttagataattgtgttagctttctaatgactttagttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 45496503  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||     
T  45496502 tcttggtgaaattttatgaaaactcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagggaataatttcaaacctccaaactagaagtactctgagttt 45496403  T
Q  285 aactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  45496402 aattaaggggatttaagagtatttaacctatgtt 45496369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 297011 - 296715
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| |||| |||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  297011 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttgatttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 296912  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||    
T  296911 tcttagcgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaccatgagttc 296812  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 381  Q
    || |||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  296811 aattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatgtgtgaagctg 296715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22350244 - 22349980
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| |||||||||| |  |||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22350244 catgaaatttgtagataactgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatcatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 22350145  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22350144 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactacgagttc 22350045  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || |||||| |||||||||||| |||  |||||  ||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  22350044 aattaaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 22349980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 311
Target Start/End: Original strand, 23194947 - 23195173
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||| | |||     
T  23194947 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttaacttgaaaatgacttttagtgtttgagttatgataaaaatactcctaagagg 23195046  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  23195047 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctccaaactagaagtaccatgagttc 23195146  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacc 311  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||    
T  23195147 aattaaggtgtttgagagtatttaacc 23195173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Original strand, 20437623 - 20437894
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  20437623 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 20437722  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  || ||||||||||||| || |||| |    
T  20437723 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggcttaaaactagaagtaatatgagtgc 20437822  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | | | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20437823 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgaggttacccttggggtaggaatggaggttgactata 20437894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 88 - 343
Target Start/End: Original strand, 38057050 - 38057304
Alignment:
Q  88 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 187  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || | |  |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | | |    
T  38057050 gaaagttttagataattttgttagctttctagtggctttcgtttaacttgcaaattatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagggggtat 38057149  T
Q  188 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 287  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  38057150 tagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatacaaaacttatgggattattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtacaat 38057249  T
Q  288 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||    
T  38057250 taaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttaatc-ttgggataggaatg 38057304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Original strand, 14792958 - 14793193
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  14792958 catgaaagttgtacataattgtgttagctttccagtgactttggttggacttgaaaatgatttttggttttagagttatgatgaaaatactccaaggagg 14793057  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  14793058 tcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 14793156  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14793157 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 14793193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 22823803 - 22824034
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22823803 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 22823902  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| ||||||    
T  22823903 tcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 22824001  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22824002 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 22824034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 50544507 - 50544276
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||   || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  50544507 catgaaagttgtagataattgtgttagctttcgggtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 50544408  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||  ||||| || |  |||||| ||||||    
T  50544407 ttttagtgaaattttatgaaaattcggcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaatttcaaagcttg-tgtactatgagttc 50544309  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50544308 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 50544276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1643249 - 1643020
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||     
T  1643249 catgaaagttttagataattgtgttaactttccaatggctttagtttgacttgaa--tgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacgccaaggagg 1643152  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| ||||||    
T  1643151 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 1643053  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1643052 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 1643020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 39060752 - 39060520
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaa-tgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgag 183  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  39060752 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggag 39060653  T
Q  184 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 283  Q
     ||||||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || ||||  |||| || |  |||||| |||||    
T  39060652 gtcttagtgaaattttatgaaaatttcgtataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaactccaaagcttg-tgtactatgagtt 39060554  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  39060553 caattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 39060520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16372407 - 16372178
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  16372407 catggaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 16372308  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacct-caaaactagaagtactaggagtt 283  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  || ||||| || ||||| || ||||     
T  16372307 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctacaaaaataaaagtaatatgagtg 16372208  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaaccta 313  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||    
T  16372207 aaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 16372178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 24720090 - 24720321
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  |||     
T  24720090 catgaaagttgtagataattgagttagccttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttttttagttatgatgaaaatacttcatggagg 24720189  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  | |||| ||||||    
T  24720190 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcactatgagttc 24720288  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24720289 agttaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 24720321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 44892103 - 44891869
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  44892103 catgaaagttgtagataattttgttagatttcccgtggctttggtttgccttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaga 44892004  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||| ||| ||| |   || |||| ||||| || | | ||||| |||| |    
T  44892003 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaatcttgta-tactatgagtac 44891905  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  44891904 aattaaggtgtttaagagta-ttaacctatgttatga 44891869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Original strand, 9784739 - 9784896
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  9784739 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaga 9784838  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    |||| |||||||||| | |||||||  ||||||| | || |||| || ||||||||||    
T  9784839 tcttggtgaaattttataaaaattccacataactatctccaagtcaacccaaaactta 9784896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 17902158 - 17902389
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| | |     
T  17902158 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggcttgacttgaaaatgatttttggttttcaagttatgatgaaaatactccaaggtgg 17902257  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||  ||||| | |   |||||| ||||||    
T  17902258 tcttgatgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaagc-atgtgtactatgagttc 17902356  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17902357 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17902389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 27653081 - 27653195
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||    
T  27653081 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgagaagcagttataatatgatttaatgttga----tagta 27653176  T
Q  413 atgtaatatatttgtatat 431  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  27653177 atgtattatatttgtatat 27653195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 313 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20346066 - 20345973
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 406  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20346066 atgttatgagttaatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctttgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 20345973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18121260 - 18121029
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||   | |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  18121260 catgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggatttggttggacttgaaaatgatttttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 18121161  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |  |  | |||| || |||    
T  18121160 tcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataattatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcctg-tgcactatgaattc 18121062  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18121061 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18121029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21659800 - 21659689
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21659800 catgaaagtcttagataattttgttagctttccaatggcttcggtttggcatgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21659701  T
Q  185 tcttagtgaaat 196  Q
    ||||||||||||    
T  21659700 tcttagtgaaat 21659689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 162 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 294624 - 294396
Alignment:
Q  162 atgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta-ggga--------ataatt 252  Q
    |||||| |||||||||||  |  |||||||||||| || |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||    
T  294624 atgatggaaatactccaagtatgtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgggataatt 294525  T
Q  253 caaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaa 352  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||| |||||||| | ||||| ||| |||| | |||| |    
T  294524 ccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaaccttgggatagcaatgaaagttgta 294425  T
Q  353 tataatattaatgatgatctgtgaagctg 381  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  294424 taggatattaatgatgatctgtgatgctg 294396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13227459 - 13227340
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||  ||     
T  13227459 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggttttacttgaaaatgatttttagcttttgagatatgatggaaatactccaagtagg 13227360  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  13227359 tcttagtgaatttttatgaa 13227340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6833820 - 6833713
Alignment:
Q  135 ttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||| || ||    
T  6833820 ttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgaataactatttctaagtcaaccc 6833721  T
Q  235 aaaactta 242  Q
    ||||||||    
T  6833720 aaaactta 6833713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16656023 - 16655793
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||| ||||  |      
T  16656023 catgaaagttttagataattttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaag 16655924  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| || || |||| |||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  16655923 tcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagttt 16655825  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    || |||    ||  ||||||||||||||||||    
T  16655824 aattaaaaggttggagagtatttaacctatgt 16655793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29535647 - 29535528
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||  ||     
T  29535647 catgaaaattttagataattttgttagctttccaatggctttggttttacttgaaaatgatttttagcttttgagatatgatggaaatactccaagtagg 29535548  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  29535547 tcttagtgaatttttatgaa 29535528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16362513 - 16362395
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  16362513 atgaaagttgtagataatttcgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 16362414  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  16362413 cttagtgaatttttatgaa 16362395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21841361 - 21841243
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  21841361 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 21841262  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  21841261 cttagtgaatttttatgaa 21841243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Original strand, 21922859 - 21922977
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  21922859 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 21922958  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  21922959 cttagtgaatttttatgaa 21922977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 197
Target Start/End: Original strand, 10812765 - 10812877
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  10812765 catgaaagtcgtagataattgtgttagctttccagtgcctttggtttgacttagaaatgatttttggtctttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 10812864  T
Q  185 tcttagtgaaatt 197  Q
    |||||| ||||||    
T  10812865 tcttagcgaaatt 10812877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41373066 - 41372948
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  41373066 atgaaagttgtagataattttgttagatttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 41372967  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  41372966 cttagtgaatttttatgaa 41372948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13989461 - 13989382
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13989461 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 13989382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 319 - 404
Target Start/End: Original strand, 16093748 - 16093833
Alignment:
Q  319 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgat 404  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16093748 tgagttgatccttggggtagaattggagattgaatataatgttagtgatgatctgtgaagctgttataagatgattgaatgttgat 16093833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 313 - 402
Target Start/End: Original strand, 52940736 - 52940825
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  52940736 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattataatattactgatgttcagtgactctgatataatatgatttgatgttg 52940825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 194
Target Start/End: Original strand, 23593301 - 23593409
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||   | |||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||| |    
T  23593301 atgaaagtcgtagataatttagttatctttccaatggctttggtttggagtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaattactccaaggaggt 23593400  T
Q  186 cttagtgaa 194  Q
    |||||||||    
T  23593401 cttagtgaa 23593409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 431
Target Start/End: Original strand, 21533735 - 21533846
Alignment:
Q  315 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 414  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||  | |||| | ||||||||||||||||||     |||    
T  21533735 gttatgagttgatccttggg-taggaatggaggttgattataatattactaatgttctgtgaatttattattacatgatttaatgttgataga----aat 21533829  T
Q  415 gtaatatatttgtatat 431  Q
    || ||||||||||||||    
T  21533830 gtgatatatttgtatat 21533846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 313 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26065201 - 26065114
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgt 400  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| ||||    
T  26065201 atgttatgagtttatccttggggtaggaatggatgttgtatatgatgttaatgataatctgtgaagttgttataagaggatttgatgt 26065114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 21474653 - 21474727
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 159  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21474653 catgaaagttgtagatacttgtgttagccttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 21474727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 402
Target Start/End: Original strand, 35260939 - 35261028
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  35260939 atgttatgagttgaacattggggtagtaatggagattgtatatgatattaacgataatatgtgaagttgttataagatgatttgatgttg 35261028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16758906 - 16758831
Alignment:
Q  320 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt 395  Q
    ||||||| | ||||||| | |||| || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16758906 gagttgaaccttggggtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt 16758831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22366617 - 22366527
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  22366617 catgaaagttgtagaaaattttgttagctttctaatgactttggtttgacatcgaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22366527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Original strand, 20708730 - 20708805
Alignment:
Q  96 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa 171  Q
    |||||||||||| || |||||||||| | | |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  20708730 tagataattttgctatctttccaatggcgttggtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaa 20708805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 431
Target Start/End: Original strand, 21043142 - 21043254
Alignment:
Q  315 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 414  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||||    
T  21043142 gttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttag----taat 21043237  T
Q  415 gtaatatatttgtatat 431  Q
    |  ||||||||||||||    
T  21043238 gagatatatttgtatat 21043254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 22124545 - 22124458
Alignment:
Q  315 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  22124545 gttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgactatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttg 22124458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 47190861 - 47190817
Alignment:
Q  315 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 359  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47190861 gttataagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataata 47190817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 48520830 - 48520787
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  48520830 atgttataagttgatcattggggtaggaatggaggttgattata 48520787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 42697150 - 42697112
Alignment:
Q  312 tatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  42697150 tatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaagttg 42697112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 330 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 14800779 - 14800707
Alignment:
Q  330 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  14800779 ttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttg 14800707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 330 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 14809653 - 14809581
Alignment:
Q  330 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  14809653 ttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttg 14809581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 17003999 - 17003963
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17003999 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 17003963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Original strand, 21650889 - 21650953
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  21650889 catgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgattttt 21650953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 93 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 105560 - 105228
Alignment:
Q  93 ttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtg 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  105560 ttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttagtttttgagatatgatgaaaatacaccaaggaggtctaagtg 105461  T
Q  193 aaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaagg 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  105460 aaattttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaag 105361  T
Q  293 tatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatga 392  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  105360 tgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctatgaagctg-tataatatga 105263  T
Q  393 tttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    ||| |||||    | ||||||||| ||||||||||||||    
T  105262 tttgatgtt----gttagtaatgtgatatatttgtatat 105228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 162940 - 162647
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||     
T  162940 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaagaagg 162841  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  162840 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacatatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 162741  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaag 378  Q
    || |||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  162740 aattaaggtgtttaagagtatttaattcatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaag 162647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 95006 - 94927
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  95006 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 94927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 147
Target Start/End: Original strand, 17202 - 17261
Alignment:
Q  88 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattt 147  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||| | | |||||||||| ||||||||||    
T  17202 gaaagttgtaggtatttttgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgattt 17261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 133
Target Start/End: Original strand, 154871 - 154919
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttga 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||    
T  154871 catgaaagttttagataattttgttagctttataatgacgttggtttga 154919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 84 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12283
Alignment:
Q  84 tcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgag 183  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  12626 tcatgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgaagaaaatagtccaaggag 12527  T
Q  184 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 283  Q
     |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  12526 gtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagtt 12427  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 383  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  12426 caattaatgtgtttaagagtatttaacccattttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaatctatt 12327  T
Q  384 ataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  12326 ataatatggtttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 12283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 85 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 905 - 565
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  905 catgaaagttgtagataattttgttagcttacgaatgactttggtttgacttgaaactgatatttcgtttttgagatatgatgaaaatactacaaggagg 806  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  805 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctccaaactagaagtactatgagttc 706  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  705 aattaaggtgtttaagattatttaacccatgttatgagttgatc-ttggagtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctatgaagctg-ta 608  T
Q  385 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||| |||| |||||    | ||||||||| ||||||||||||||    
T  607 taatataatttgatgtt----gttagtaatgtgatatatttgtatat 565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 85 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16229 - 15890
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16229 catgaaagttttagataactttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16130  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||    
T  16129 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaaatactataagttc 16030  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16029 aattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagtttatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattggtgatgatctgtgaagctgtta 15930  T
Q  385 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||    || |||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  15929 taa---catataatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 15890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 90 - 431
Target Start/End: Original strand, 1510 - 1847
Alignment:
Q  90 aagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaa-tgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||| || | | ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  1510 aagttgtagataattgagttatctttccagtggctttggtttgacttgaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccatggaggtctt 1609  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  1610 agtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaacccccaaaactagaagtactatgagttcaatt 1709  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 388  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  1710 aaggt-tttaagattatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaaaatgttataat 1808  T
Q  389 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  1809 atgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 1847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27956 - 27724
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | |  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | | |||     
T  27956 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttagtttgaattgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaataattccaggagg 27857  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  27856 tcttactgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtac 27757  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27756 aattaaggtgtttaagagtatttaatctatgtt 27724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 86 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 82641 - 82301
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  82641 atgaaagttgtagataattaagttagctttccaattgttttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggt 82542  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 285  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  82541 cttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaattcaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtattatgagttca 82442  T
Q  286 actaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttat 385  Q
    | ||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  82441 attaaggt-gttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggttggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattgt 82343  T
Q  386 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  82342 aatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 82301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 10843 - 11073
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10843 catgaaagttgtagataattgtgttaactttccagtggctttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 10942  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10943 tcttagtgaaattttatgaaaattcagaataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcgaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 11042  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 315  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11043 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 11073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17315 - 17223
Alignment:
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtacta 277  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  17315 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattttaaatctcaaaactagaagtacta 17223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Original strand, 19040 - 19304
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19040 catgaaagttttagataattttgttagctttacaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactacaaggaga 19139  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19140 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 19239  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  19240 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 19304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21737 - 21484
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21737 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttaacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21638  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21637 tcttagtgaaatcttatgaaaatccagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 21538  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  21537 aattaaggtgtttaagagtatttcacctatgttgtgagttggtccttggggtag 21484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 111143 - 110872
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  111143 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 111044  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  111043 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 110944  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  110943 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 110872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 146388 - 146156
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| || | | |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  146388 catgaaagttgtagataattgagtttgctttccagtggctttggtttgacgtgaaaaggatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 146289  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  146288 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagaataacagtttctaagttaatccaaaacatatgtaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 146189  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || | | ||||||||||||||| |||||||    
T  146188 aattaggatgtttaagagtatttaatctatgtt 146156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 311
Target Start/End: Original strand, 123956 - 124182
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  123956 catgaaagttgtagataattttgttagcattccaatggctttgaattgacatgaaaataatttttggtttttgagatattatgaaaatactccaatgagg 124055  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  124056 tgttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 124155  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacc 311  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||    
T  124156 aattaaggtgtttaagaatatttaacc 124182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 176448 - 176195
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  176448 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttgacgtgaaaataatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 176349  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  176348 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 176249  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  176248 aattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 176195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 85 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 169095 - 168846
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  169095 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttgacgtgaaaataatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 168996  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  168995 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 168896  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggg 334  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||    
T  168895 aattaaggagtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggg 168846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 89 - 342
Target Start/End: Original strand, 152610 - 152863
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  152610 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatatttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 152709  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  152710 agtgaaattttatgaaaattcagcaaaactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaatt 152809  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaat 342  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||| |||||||    
T  152810 aaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtaagttgatccttgggttaggaat 152863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 77343 - 77098
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | | |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  77343 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttgatttgacgtggaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 77244  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  77243 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataagcgtttctaagttaattcaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtacaatgagttc 77144  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 330  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  77143 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttgatctt 77098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Original strand, 3338 - 3591
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3338 catgaaagttgtcaataattgtgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttttctgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 3437  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3438 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 3537  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||    
T  3538 aattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagttggcccttggggtag 3591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 75 - 1
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 159  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  75 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgag 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 8656 - 8592
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  | |||||||||    
T  8656 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctagatgattttt 8592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 6114 - 5835
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||     
T  6114 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggagg 6015  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6014 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 5915  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 365  Q
    || |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  5914 aattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 5835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 85 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 3362 - 3117
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  3362 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgacttttgtttgacttgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 3263  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  3262 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 3163  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 330  Q
    || |||| | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  3162 aattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgcgagttgatctt 3117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 89 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6069 - 5828
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6069 aaagttgtagataattgtgttagctttccattggatttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtctt 5970  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  5969 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttcaaagtcagtccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 5870  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 330  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5869 aaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 5828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 7179 - 7409
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||| |||||||||||| |||     
T  7179 catgaaagttttatataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataattttttgtttta-agttatgataaaaatactccaaggagg 7277  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| ||| ||| |   || |||  |||||  | |  |||||| |||||     
T  7278 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaaattcaaagtttg-tgtactatgagtta 7376  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7377 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 7409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3438 - 3395
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  3438 atgttatgagttgatccttagggtaggaatggaggttgattata 3395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 85 - 314
Target Start/End: Original strand, 64465 - 64694
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  64465 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagaagg 64564  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  64565 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttgtggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 64664  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 314  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||    
T  64665 aattaaggtgtttaagagtagttaacctat 64694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 189 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 31502 - 31271
Alignment:
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||||| |    
T  31502 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaatccttaaaactagaagttctatgagttcaatt 31403  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 388  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||| | ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  31402 aaggtgtttaagagtata------ataatataatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatttgtgaagctattataat 31310  T
Q  389 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  31309 atgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 31271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31799 - 31680
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||  || | | || || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31799 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccggtggctttgggtttacatgaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 31700  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  31699 tcttagtgaatttttatgaa 31680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21911 - 21679
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  21911 catgaaagttgttgataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 21812  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21811 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 21712  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21711 aattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 21679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 28764 - 28996
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  28764 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 28863  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  28864 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 28963  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28964 aattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgtt 28996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 10091 - 9997
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10091 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgattttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaa 9997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 78720 - 78488
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  78720 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 78621  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  78620 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 78521  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  78520 aactaaggtgttaaagagtatttaacctatgtt 78488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22540 - 22426
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    |||||    
T  22540 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttga----tagta 22445  T
Q  413 atgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22444 atgtaatatatttgtatat 22426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Original strand, 9352 - 9623
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  9352 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactggaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 9451  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  9452 tcttagtgaaatcttatgataattcagcacaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtac 9551  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9552 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 9623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 653 - 395
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  653 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttcacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 554  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  553 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactttgagttc 454  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    || || ||| ||||||||||| |||| |||||| ||| | || | ||||||||||||||    
T  453 aattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttttgattcgacccttggggtaggaatg 395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2994 - 2702
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  2994 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 2895  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2894 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcc-aagcttatgggataattccaaagctcaaaactagaaatactacgagttc 2796  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaag 378  Q
    || |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||  |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  2795 aattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttttataggatattaaggatgatctgtgaag 2702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 373 - 605
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||     
T  373 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcatcggtttgacttgaaaaagtattttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaggagg 472  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  473 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactcgaagtactaggagttt 572  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  573 aattaaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 89 - 315
Target Start/End: Original strand, 5680 - 5906
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  5680 aaagatgtagataattgtgttagattttcagtggcatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaagaggtctt 5779  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5780 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaatt 5879  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatg 315  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||    
T  5880 aaggtgtttaagagtatcaaacctatg 5906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 5109 - 5341
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5109 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgtttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 5208  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5209 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 5308  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5309 aactagggtgtttaagagtatttaaactatgtt 5341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 89 - 341
Target Start/End: Original strand, 6077 - 6330
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6077 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgaaatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 6176  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6177 agtgaaatcttataaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagatcaaaactagaagtactatgagttcaatt 6276  T
Q  289 aagg-tatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaa 341  Q
    | || | |||||||||||||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  6277 agggttttttaagagtatttaacttatgttgtgagtagacccttggggtaggaa 6330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0672 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0672
Description:

Target: scaffold0672; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 89 - 317
Target Start/End: Original strand, 7956 - 8184
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7956 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 8055  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  8056 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 8155  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| |||| || ||||||||| |||||    
T  8156 aaggtgtttatgattatttaacccatgtt 8184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4690 - 4433
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4690 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 4591  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaa----aacctcaaaactagaagtactagga 280  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |    |||||||||||||||||||||| ||    
T  4590 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatga 4491  T
Q  281 gttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  4490 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 4433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4690 - 4433
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4690 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 4591  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaa----aacctcaaaactagaagtactagga 280  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |    |||||||||||||||||||||| ||    
T  4590 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatga 4491  T
Q  281 gttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  4490 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 4433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 107 - 431
Target Start/End: Original strand, 169415 - 169722
Alignment:
Q  107 gttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaa 206  Q
    |||||||||||| || | |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| || ||||||    
T  169415 gttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaa 169514  T
Q  207 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 306  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||             ||||||| ||||    
T  169515 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggag-------------tttaagaatatt 169601  T
Q  307 taacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 406  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |       
T  169602 taacctatattataagttgatccttgggataggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtaaagctgttataatatgatttaatattta--- 169698  T
Q  407 ctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  169699 -taataatgtaatatatttgtatat 169722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 86 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 143268 - 143038
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   |  ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |    
T  143268 atgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttagtttgacatgaaaagaatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggt 143169  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 285  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  143168 cttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttta 143069  T
Q  286 actaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  143068 attaaggggtttaagagtatttaacctatgt 143038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 8720 - 8478
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||      
T  8720 catgaaagttgtagataattatgttagctttccagtggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtgtttgatatatgatgaaaatactccaaggaag 8621  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8620 tcttggtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactacaagtactatgagttc 8521  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgat 327  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8520 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgat 8478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Original strand, 5722 - 5947
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  5722 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 5821  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  5822 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 5921  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    || |||||  ||||| ||||||||||    
T  5922 aattaaggggtttaacagtatttaac 5947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 6)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23225 - 22929
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  |||     
T  23225 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggagg 23126  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23125 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacatccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaatgctcaaaactagaagtactatgagttc 23026  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 381  Q
    || |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  23025 aattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaagctg 22929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33995 - 33791
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |  | |||||||||| ||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||     
T  33995 catgaaagttgtagataattgagttagcattccagtagcttcggtttgacgtgaaaataaattttggttctcgagatatgatgaaaatactccaaggagg 33896  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33895 tcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttc 33796  T
Q  285 aacta 289  Q
    |||||    
T  33795 aacta 33791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 311
Target Start/End: Original strand, 17653 - 17879
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |  ||      
T  17653 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatggaaatactctagggatg 17752  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  17753 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacagccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 17852  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacc 311  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||    
T  17853 aattaaggtgtttaagaatatttaacc 17879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Original strand, 22575 - 22765
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactcca-atgag 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |   |||    
T  22575 catgaaagttgtagataattttgttagcattccaatgactttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatggaaatactctaggggag 22674  T
Q  184 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagta 274  Q
     |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22675 gtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagta 22765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 185 - 311
Target Start/End: Original strand, 23386 - 23512
Alignment:
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  23386 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 23485  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacc 311  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||    
T  23486 aattaaggtgtttaagaatatttaacc 23512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 356
Target Start/End: Original strand, 55543 - 55586
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  55543 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 55586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 14982 - 15214
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  14982 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15081  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15082 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 15181  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15182 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 15214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 24040 - 24272
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24040 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24139  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24140 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 24239  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24240 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 24272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1766 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold1766
Description:

Target: scaffold1766; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 107 - 398
Target Start/End: Original strand, 1112 - 1390
Alignment:
Q  107 gttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaa 206  Q
    |||||||||||| || | |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| || ||||||    
T  1112 gttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaa 1211  T
Q  207 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 306  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||             ||||||| ||||    
T  1212 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggag-------------tttaagaatatt 1298  T
Q  307 taacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaat 398  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1299 taacctatattataagttgatccttgggataggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtaaagctgttataatatgatttaat 1390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 86 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 58403 - 58172
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  58403 atgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatctgatgaaaatactccaaggagat 58304  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 285  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  58303 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataagcgtttctaagttaatccaaaacataaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttca 58204  T
Q  286 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  58203 actagggtgtttaagagtatttaacctgtgtt 58172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 68557 - 68438
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||   |     
T  68557 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttatcttttgagatatgatggaaatactccaagttgg 68458  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  68457 tcttagtgaatttttatgaa 68438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1360 - 1130
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||||| || | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  1360 catgaaagttgtagataattgagtaagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggata 1261  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1260 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 1161  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 315  Q
    || |||| |  ||||||||||||||||||||    
T  1160 aattaagatggttaagagtatttaacctatg 1130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Original strand, 6215 - 6279
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  6215 catgaaagttatagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctaaatgattttt 6279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 4)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6681 - 6407
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  6681 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgacttcggtttgaattgaaaattagttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 6582  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6581 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataatcatttataagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 6482  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 359  Q
    || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||| | ||||| |||||||    
T  6481 aattagggtgtttaagagtgtttaacctatgttatgagtagatccttagggtagaaatgcaagttgattataata 6407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 316 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 796 - 710
Alignment:
Q  316 ttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  796 ttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgatgttg 710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 314 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 25367 - 25255
Alignment:
Q  314 tgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 413  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||     || |||    
T  25367 tgttgtgagttgatccttggggtagaaatgaaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataagacgatttgatgttg-----taataa 25273  T
Q  414 tgtaatatatttgtatat 431  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  25272 tgtgatatatttgtatat 25255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16362
Alignment:
Q  154 tttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattc 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||    
T  16524 tttgagttatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattttctc 16425  T
Q  254 aaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
     |||| |||||  |  | |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16424 caaacttcaaagat-catgtactatgagttcaattaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 16362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 343
Target Start/End: Original strand, 159346 - 159603
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  159346 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 159445  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  159446 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattcaaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 159545  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    || ||||||  ||||||||||| |||  |||||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  159546 aattaaggtgattaagagtattcaactcatgttgagagttgatc-ttgggataggaatg 159603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 313
Target Start/End: Original strand, 6984 - 7213
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatc-ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgag 183  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | |  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  6984 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggcttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatattatgaaaatactccaagtag 7083  T
Q  184 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7084 atcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 7183  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaaccta 313  Q
     || |||||  |||||||||||||||||||    
T  7184 taattaaggggtttaagagtatttaaccta 7213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Original strand, 11903 - 12156
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| |||     
T  11903 catgaaaattgtagataattgtgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtgtttgaattattatgaaaatactccaaggagg 12002  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12003 tcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataactgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 12102  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || |||||||||    
T  12103 aattaaggtgtttaagagtaattaacctatgttgtgagtttgtccttggggtag 12156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 863 - 1095
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  863 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttggattgacgtgaaaatgatttttagttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 962  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  963 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 1062  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1063 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 1095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 39755 - 39523
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  39755 catgaaagttttagataatttttttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 39656  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  39655 gcttagtgaaatcttatgaaaattcaggataatcgtttctatgttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgatttc 39556  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || | | |||||||||||||||||||||||    
T  39555 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 39523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 90 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1558 - 1332
Alignment:
Q  90 aagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctta 189  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||    
T  1558 aagttgtagataattgagttagctttccagtgactttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgggatatgatgaaaatactccaagtaggtctta 1459  T
Q  190 gtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaacta 289  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  1458 gtgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaatta 1359  T
Q  290 aggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  1358 aggggtttaagagtatttaacctatgt 1332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 5063 - 5293
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||     
T  5063 catgaaagttgtagataactgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttgatttttgagatatgatgaaaatacttcaagaagg 5162  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5163 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagttctaggggttc 5262  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 315  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5263 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 5293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 89 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7627 - 7401
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  7627 aaagatgtagataattgtgttagattttcagtggcatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaagaggtctt 7528  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  7527 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaatt 7428  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatg 315  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||    
T  7427 aaggtgtttaagagtatcaaacctatg 7401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 195
Target Start/End: Original strand, 10313 - 10423
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  10313 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 10412  T
Q  185 tcttagtgaaa 195  Q
    |||||||||||    
T  10413 tcttagtgaaa 10423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11267 - 11219
Alignment:
Q  269 gaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11267 gaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 11219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 55 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9741 - 9479
Alignment:
Q  55 tttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggttt 154  Q
    |||||||| |||||| ||||| || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9741 tttctgttttgaattgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgaattttagttt 9642  T
Q  155 ttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattca 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | |||||     
T  9641 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattaagcataactatttctaagttaatccaaaacttatgagacaattcc 9542  T
Q  255 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9541 aaggctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 9479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 88 - 338
Target Start/End: Original strand, 70227 - 70477
Alignment:
Q  88 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 187  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  70227 gaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 70326  T
Q  188 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 287  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||     
T  70327 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatcaaaaacttatgagataattccaaaactcaaaactagaagtactataagttcaat 70426  T
Q  288 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 338  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  70427 taaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttggtccttggggtag 70477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 72067 - 71935
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  72067 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaattgctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 71968  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataac 217  Q
    |||||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  71967 tcttagtgaaaccttatgaaaattcaggataac 71935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6455 - 6191
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||     
T  6455 catgaaagttttagataattttgttagctttgcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaaaactccaagtagg 6356  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  6355 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttttgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 6256  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 350  Q
    || |||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  6255 aattaaggtgtttaagagtttttaatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 6191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0632
Description:

Target: scaffold0632; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 821 - 589
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |  || | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  821 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttccgtggcttttgtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 722  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  721 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaaggtagtccaatatttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtcc 622  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  621 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 86 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16419 - 16175
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  || ||| |    
T  16419 atgaaagttttagatacttttgctagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgcgatatgatgaaaatactttaaggaggt 16320  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 285  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16319 cttagtgaaatcttatgaatattcagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataattctcaacctcaaaactagaagtactatgagttca 16220  T
Q  286 actaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 330  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16219 atgaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 16175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 85 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13602 - 13357
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  13602 catgaaagttttagatatttttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgattttaaatttttgaaatatgatgaaaatactccaaggagg 13503  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |  |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13502 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacatatgagataattcccaacctcaaaactagaagtactatgagttc 13403  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 330  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13402 aattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 13357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8881 - 8686
Alignment:
Q  96 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8881 tagatatttttgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgattttaaatttttgaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 8782  T
Q  196 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaag 291  Q
    | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |  |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  8781 tcttgtgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacatatgagataattcccaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaag 8686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21389 - 21157
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21389 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttggaaatgatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21290  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21289 tcttagtgaaatcttaagaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattttaattctcaaaactagaagtactatgagttc 21190  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21189 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 21157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 356
Target Start/End: Original strand, 19505 - 19548
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19505 atgttatgagttaatcattggggtaggaatggaggttgattata 19548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 22187 - 22419
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||     
T  22187 catgaaaattgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttcacgtgaaaattatttttggttattgagatatgatgaaaatgctccaaggagg 22286  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22287 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactatgagttc 22386  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22387 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 29384 - 29124
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | |  ||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  29384 aaagttttagataattttgtaagctttcgaatggctttagtttgacttaaaaatgatttttagtttttaaaatatgatgaaaatactccacggaggtctt 29285  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| || ||||||| |   || ||||||||||||| || |||||||| |    
T  29284 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccatgttaatcaaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtattatgagttcaatt 29185  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggtt 349  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  29184 aaggtgtttaagagtatttaagccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtt 29124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 34849 - 34589
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | |  ||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  34849 aaagttttagataattttgtaagctttcgaatggctttagtttgacttaaaaatgatttttagtttttaaaatatgatgaaaatactccacggaggtctt 34750  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| || ||||||| |   || ||||||||||||| || |||||||| |    
T  34749 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccatgttaatcaaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtattatgagttcaatt 34650  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggtt 349  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  34649 aaggtgtttaagagtatttaagccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtt 34589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 365
Target Start/End: Original strand, 22165 - 22444
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||   |  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  22165 catgaaagttgtagataattgtgttaactttccagtggattttgtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgacatatgatgaaaatactccaaggagg 22264  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  22265 tcttagtgaaatcttatgaagattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctaaaaactagaagtattatgagttc 22364  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 365  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  22365 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 22444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 952 - 767
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  952 cgagcataggaaaatcaacttttctggatttctctgttctgaattaggtttaggaatcttcatcaaagttgtagataattttgttagctttccaatgact 853  T
Q  125 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattca 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  852 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgacattttatgaaaattca 767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Original strand, 6949 - 7013
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  6949 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgattttt 7013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Original strand, 13061 - 13286
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  13061 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtgtgacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 13160  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13161 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagttt 13260  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  13261 aattaaggggtttaagagtatttaac 13286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 316
Target Start/End: Original strand, 8046 - 8277
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||   | |||||||||| |||||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||| ||||  |      
T  8046 catgaaaattttagataattttgttagccttcctatggatttggtttgacttaaaaatgatgtttagatttagagatatgatggaattaccccaagcaag 8145  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  8146 tcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaactcaatccaaaacttatggaatatttccaaaactcaaaactagaaatactaggagttt 8245  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    || ||||   |||||||||||||||| |||||    
T  8246 aattaagaggtttaagagtatttaacgtatgt 8277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 89 - 286
Target Start/End: Original strand, 106603 - 106800
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  106603 aaagttgtagataattgagttagctttccagtgaaattggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 106702  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaa 286  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  106703 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 106800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0635
Description:

Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 86 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 7539 - 7295
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  7539 atgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccagggaggt 7440  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 285  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  7439 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 7340  T
Q  286 actaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 330  Q
    | |||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||    
T  7339 attaaggtgtttaagagtatttaatccatgatgtgagttgatctt 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1741 - 1509
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  1741 catgaaagttttagataattttgttagctttacaatggctttggtttaacttgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatactccaaggagg 1642  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  1641 tcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccaattctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaacaagaagtactatgagttc 1542  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1541 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 1509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 172 - 4
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  172 catgaaagttttagataattttgttatctttccaatggctttggtttaactggaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatactccaaggagg 73  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattc 253  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||   ||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  72 tcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccaattctatgttaatccaaaacttatgggataattc 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 86 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8712 - 8468
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  8712 atgaaagttgtagataattgcgttagctttccagtgtctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggt 8613  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 285  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  8612 gttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 8513  T
Q  286 actaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 330  Q
    | |||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  8512 attaaggtgtttaaaagtatttaatccatgttgtgagttgatctt 8468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 127 - 317
Target Start/End: Original strand, 7823 - 8013
Alignment:
Q  127 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 226  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7823 ggttttacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 7922  T
Q  227 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7923 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacttcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 8013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10877 - 10636
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || |  | | ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  10877 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtagctttggtttcacttgaaaattatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 10778  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgttt-ctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 283  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10777 acttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagtt 10678  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttg 325  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10677 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 10636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 974 - 740
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||   | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||     
T  974 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtgggtttggtttgacttgaaaatgatttttggtttctgagttatgatgaaaatact-caatgagg 876  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| ||    ||||||  | |||    
T  875 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcagaactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactataaattc 777  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  776 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6480 - 6246
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||   | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||     
T  6480 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtgggtttggtttgacttgaaaatgatttttggtttctgagttatgatgaaaatact-caatgagg 6382  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| ||    ||||||  | |||    
T  6381 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcagaactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactataaattc 6283  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6282 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 6246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4076 - 3843
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  4076 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctctggtttgacttgaaaatgacttttggtatttgagatatgatgaaaatactccatggaga 3977  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  3976 tcttagtgaaattttatgaaaatttagtttaacagtttctaagtcaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactggaagtactaggagttt 3877  T
Q  285 aactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || ||| ||  ||| |||||||||||||||||||    
T  3876 aattaagggggttttagagtatttaacctatgtt 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 89 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11811 - 11583
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||| ||| ||||    
T  11811 aaagttgtagataattaagttagctttccattggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttattatcaaaatactccaaggaggtctt 11712  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    || ||||| || ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  11711 agcgaaatcttatgaaaattcagcacagccgtttctaagttaatccaaaacctagggaataattccaaacctcaaaactagaagtattaggagtttaatt 11612  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11611 acggtgtttaagagtatttgacctatgtt 11583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 96 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 7778 - 7557
Alignment:
Q  96 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   | | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  7778 tagataattttgttagctttccaatggttttgatttgacttgaaaattatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtcaaa 7679  T
Q  196 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 295  Q
    | || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  7678 tcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaagctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgt 7579  T
Q  296 ttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||  |||||||||||||||||    
T  7578 ttattagtatttaacctatgtt 7557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 13948 - 13877
Alignment:
Q  29 cataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagat 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||  | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13948 cataggaaaatcaatttttctgccactttatgttccgaattaggtttggaagtcttcatgaaagttgtagat 13877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7169 - 6944
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || | | |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||     
T  7169 catgaaagttgtagataattgagttagctctccagtggctttggtttgacgtaaaaatgatttttggttcttgatatatgatgaaaatactccaagtagg 7070  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  7069 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaagagttt 6970  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  6969 aattaaggggtttaagagtatttaac 6944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3926 - 3701
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  3926 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccattagagtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 3827  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  3826 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaggactaggagttt 3727  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    || |||||  ||||| | ||||||||    
T  3726 aattaaggggtttaacaatatttaac 3701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21724 - 21499
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||   | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  21724 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggttattgagatatgatgaaaatactccaagtagg 21625  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  21624 tcttggtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtattaggagttt 21525  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  21524 aattaaggggtttaagagtatttaac 21499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 169094 - 168861
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  169094 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacctgaaaatgacttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggaga 168995  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  168994 tcttagtgaaattttatgaaaatttagtataacagtttctaagtcaatccaaaacttagggaataattccaaacctctaaactggaagtactaggagttt 168895  T
Q  285 aactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || ||| ||  ||| |||||||||||| ||||||    
T  168894 aattaagggggttttagagtatttaacttatgtt 168861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21308 - 21083
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| |||||| |||||  ||||| |||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21308 catgaaaattgtaggtaattgagttagatttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcgtgagatatgatgaaaatactccaagtaga 21209  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  21208 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 21109  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    || |||||  ||||| ||||||||||    
T  21108 aattaaggggtttaatagtatttaac 21083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 89 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 126400 - 126179
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |  | | ||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  126400 aaagttgtagataattgagttagctttccagttgctttggtttaacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtctt 126301  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  126300 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattctaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaatt 126201  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
T  126200 aaggggtttaagagtatttaac 126179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 33109 - 32874
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||   | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  33109 catgaaagttgtagataattgtgttagatttcttgtggatttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 33010  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  33009 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactttttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 32911  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32910 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 32874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30268 - 30036
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||| |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  30268 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgtcgtaggtttgactagaaaatgatttttgatttaggagttatgatgaaaatactacaaggagt 30169  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  30168 acttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaggaaataattccaaacctcaagactagaagtaataggagttt 30069  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  30068 aattaaggtgtttaagagtatctaacttatgtt 30036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 87 - 343
Target Start/End: Original strand, 35969 - 36224
Alignment:
Q  87 tgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatc 186  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  35969 tgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttctggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtt 36068  T
Q  187 ttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaa 286  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36069 ttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaa 36168  T
Q  287 ctaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
     |||||| ||||||||||||  ||  |||||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  36169 ttaaggtgtttaagagtattcgactcatgttgagagttgatc-ttgggataggaatg 36224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 7875 - 7643
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  7875 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaaagatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagaagg 7776  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  7775 tctttgtgtaattttatgaaaattcagcataattgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 7676  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |  |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7675 agttaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 7643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14506 - 14274
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  14506 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaaagatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagaagg 14407  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  14406 tctttgtgtaattttatgaaaattcagcataattgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 14307  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |  |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14306 agttaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 14274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26582 - 26358
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   ||     
T  26582 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactagaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaggtagg 26483  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  26482 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtaatatgagttc 26383  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaa 309  Q
    || |||||| |||||||||||||||    
T  26382 aattaaggtgtttaagagtatttaa 26358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27964 - 27740
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   ||     
T  27964 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactagaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaggtagg 27865  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  27864 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtaatatgagttc 27765  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaa 309  Q
    || |||||| |||||||||||||||    
T  27764 aattaaggtgtttaagagtatttaa 27740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Original strand, 2123 - 2394
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  2123 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactataaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 2222  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  2223 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatcaaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 2322  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  2323 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 2394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 87 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 51612 - 51355
Alignment:
Q  87 tgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatc 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  || ||    
T  51612 tgaaagttttagataattttgttagctttccagtggatttggtctgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatcaaaatactccaagtaggtc 51513  T
Q  187 ttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaa 286  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  51512 ttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttaaa 51413  T
Q  287 ctaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgga 345  Q
     |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  51412 ataaggtgtttaagagtatttaatcaatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatgga 51355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 94 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 67315 - 67187
Alignment:
Q  94 tgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtga 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  67315 tgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtga 67216  T
Q  194 aattttttgaaaattcagcataactgttt 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  67215 aattttatgaaaattcagcataaccgttt 67187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 85 - 313
Target Start/End: Original strand, 10325 - 10554
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  10325 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtagctttggtttaacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 10424  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  10425 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaacgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 10524  T
Q  285 aactaa-ggtatttaagagtatttaaccta 313  Q
    || ||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  10525 aattaagggggtttatgagtatttaaccta 10554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Original strand, 19919 - 19983
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  19919 catgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctttggtttgaagtccaaatgattttt 19983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 85 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 120566 - 120341
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | |  |||||||  |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||  ||     
T  120566 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacgcgaaaatgatttttttttcttgagatatgatgaaaatacttcaagtagg 120467  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  120466 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttt 120367  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaac 310  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  120366 aattaaggggtttaagagtatttaac 120341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 85 - 277
Target Start/End: Original strand, 29593 - 29785
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  29593 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttgatttgacttgaaaatcatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 29692  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtacta 277  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29693 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtacta 29785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 12932 - 13164
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||   | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||     
T  12932 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcctgagatatgttgaaaatactccaaggagg 13031  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13032 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccatttttaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactaaaagtactatgagttc 13131  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13132 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 13164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 255 - 317
Target Start/End: Original strand, 19369 - 19431
Alignment:
Q  255 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19369 aaacctcaaaactaaaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 4)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 378 - 610
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  378 catgaaagttttagataattttgatagctttccaatggttttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactacaaggagg 477  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  478 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagtta 577  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  578 aattaaggtgtttaagagaatttaatctatgtt 610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 5682 - 5914
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  5682 catgaaagttttagataattttgatagctttccaatggttttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactacaaggagg 5781  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  5782 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagtta 5881  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  5882 aattaaggtgtttaagagaatttaatctatgtt 5914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1591 - 1480
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||   | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  1591 catgaaagttgtagataattgtgctagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 1492  T
Q  185 tcttagtgaaat 196  Q
    ||||||||||||    
T  1491 tcttagtgaaat 1480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Original strand, 11401 - 11437
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11401 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatg 11437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 8752 - 8928
Alignment:
Q  138 aaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaa 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8752 aaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 8851  T
Q  238 acttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 314  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  8852 acttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaaactat 8928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2220 - 1988
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  2220 catgaaaattgtagataaatgagttagctttccagtgactttagtttgacgtgaaaataatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 2121  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||| || ||||||    
T  2120 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcatacctcaaaactagaagtattatgagttc 2021  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
     | || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2020 tattagggtatttaagggtatttaacctatgtt 1988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5565 - 5413
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||     
T  5565 catgaaagttgtagataattaagttagctttccactgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactctaaggagg 5466  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaa 237  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5465 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 5413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 229 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5229 - 5141
Alignment:
Q  229 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5229 taatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 5141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 97 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 138419 - 138135
Alignment:
Q  97 agataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaat 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||| |||| ||||||     
T  138419 agataatttagttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttcgtgaaac 138320  T
Q  197 tttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatt 296  Q
     || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  138319 cttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgtgataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtt 138220  T
Q  297 taagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 381  Q
    || |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  138219 tacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatttgtgaagctg 138135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 135 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8123 - 7941
Alignment:
Q  135 ttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcc 234  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8123 ttgaaaatgatttttgactcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatcc 8024  T
Q  235 aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8023 aaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 7941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 175 - 286
Target Start/End: Original strand, 8152 - 8263
Alignment:
Q  175 tccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagta 274  Q
    ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||     
T  8152 tccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtt 8251  T
Q  275 ctaggagttcaa 286  Q
    ||| ||||||||    
T  8252 ctatgagttcaa 8263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 861 - 632
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || |  | | |||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||     
T  861 catgaaagttgtagataattgagttagcttttcagttgctttggtttgacgtgaaaatgaattttggttctcgagatatgataaaaatactccaaggagg 762  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  761 tcttagtgaaatcttaggaaaattcaacataaccgtttctaagttaattcaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttc 662  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 314  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  661 aactagggggtttaagagtatttaacctat 632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 133406 - 133089
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||  ||     
T  133406 catgaaagttttagataattttgttagcttttcaatggctttggtttgacttttaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactcaaagtagg 133307  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||  |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  133306 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccattttcaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 133207  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 384  Q
    || ||||   |||||| |||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |  ||||  | | ||    
T  133206 aattaagaggtttaagtgtatttaactcatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattataatactattgatgttgagtgagtcagata 133107  T
Q  385 taatatgatttaatgttg 402  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  133106 taatatgatttgatgttg 133089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 96 - 356
Target Start/End: Original strand, 133571 - 133831
Alignment:
Q  96 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  133571 tagataattttgttagctttccaatggctttagtttgactttaaaatgattttttgtttaggagttatgttgaaaatactccaagtaggtcttagggaaa 133670  T
Q  196 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 295  Q
    | || ||||| ||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||| ||| |||||| |    
T  133671 tcttatgaaatttcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtaatatgagtgcaattaaggtgt 133770  T
Q  296 ttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 356  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  133771 ttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 133831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 29761 - 29582
Alignment:
Q  138 aaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaa 237  Q
    |||||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29761 aaaatgatttttggtttagtagttatgatgaaaatactacaaggaatacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 29662  T
Q  238 acttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29661 acttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaagagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 29582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33894 - 33803
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactc 176  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  33894 catggaagttttagataattttgttagatttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactc 33803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 85 - 284
Target Start/End: Original strand, 23600 - 23799
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  23600 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttaaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 23699  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23700 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataagcgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 23799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 166 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22633 - 22482
Alignment:
Q  166 tgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaa 265  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22633 tgaaaatactccaaggaggtcgtagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaa 22534  T
Q  266 ctagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22533 ctagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 22482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 22684 - 22627
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaat 142  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  22684 catgaaaattgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaat 22627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1367 - 1135
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  1367 catgaaagttgtagataattgtgttagttttccagtggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 1268  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1267 tcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 1168  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1167 aattagggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 1135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Original strand, 65377 - 65612
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  65377 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaaggagttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 65476  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| | | |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  65477 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 65575  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  65576 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 65612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 359
Target Start/End: Original strand, 75686 - 75733
Alignment:
Q  312 tatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 359  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  75686 tatgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttggttataata 75733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 186901 - 187133
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  186901 catgaaagttgtagataattgtgttagttttccagtggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 187000  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  187001 tcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 187100  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  187101 aattagggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 187133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 13979 - 14093
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    |||||    
T  13979 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttga----tagta 14074  T
Q  413 atgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14075 atgtaatatatttgtatat 14093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 317
Target Start/End: Original strand, 66432 - 66660
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||    
T  66432 aaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttgatttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtctt 66531  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || || | ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  66532 agtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaagcttcaaaactagaagtactaggagttcaatt 66631  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  66632 aaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 66660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 341 - 106
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||    
T  341 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactgtaaggaga 242  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| || || | |||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  241 tcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaggtcaacctaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 143  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  142 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 129 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11257 - 11101
Alignment:
Q  129 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  11257 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgatatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagt 11158  T
Q  229 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 285  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11157 taatctaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 11101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 381
Target Start/End: Original strand, 15513 - 15542
Alignment:
Q  352 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15513 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 15542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 127 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12948 - 12748
Alignment:
Q  127 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  |||||||    
T  12948 ggttttacttgaaaatgatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaa 12849  T
Q  227 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||  |||||  |||||||    
T  12848 gttaatccaaaacttatggaataattccaatccataaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagttga 12749  T
Q  327 t 327  Q
    |    
T  12748 t 12748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 86 - 316
Target Start/End: Original strand, 747 - 977
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |  |    
T  747 atgaaagttttaattaattttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttggattttgagatatgatggaattaccccaagcaagt 846  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 285  Q
    ||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  847 cttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatacaaaacttatagaatatttccaaacctcgaaactagaagtactaggagttta 946  T
Q  286 actaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    | ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  947 attaagaggtttaagagtatttaacctatgt 977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 8476 - 8240
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggttttt-gagatatgatgaaaatactccaatgag 183  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  8476 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttgaattgacttgaaaatgatttttggttttttgagttatgatgaaaatactccaaggag 8377  T
Q  184 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 283  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| || ||    
T  8376 gtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgaatt 8278  T
Q  284 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8277 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 8240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 85 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21417 - 21285
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21417 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21318  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataac 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21317 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataac 21285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 189 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 39631 - 39400
Alignment:
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||| | ||| |||||||| |    
T  39631 agtgaaatcttaagaaaattcaggataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaatttctatgagttcaatt 39532  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 388  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  39531 aaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaaactattataat 39439  T
Q  389 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  39438 atgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 39400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 42348 - 42271
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatat 163  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||| || | | |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  42348 atgaaagttgtagataattgtgttatctatccagtggctttggtttgacatgaaaataatttttggtgtttgagatat 42271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39855 - 39809
Alignment:
Q  158 agatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  39855 agatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaacttttatgaa 39809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 173 - 314
Target Start/End: Original strand, 9711 - 9851
Alignment:
Q  173 actccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaag 272  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9711 actccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaag 9810  T
Q  273 tactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 314  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9811 tactatgagttcaact-aggtgtttaagagtatttaacctat 9851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 38417 - 38338
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38417 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 38338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Original strand, 18050 - 18285
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  18050 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaatcatgttttgtttttgagttatgatgaaaatactccaagcagg 18149  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||| || ||||||    
T  18150 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttc 18248  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18249 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 18285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 62374 - 62139
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||  || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  62374 catgaaagttgtagataactgtgttagatttcccgtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatagtccaaggagg 62275  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| || |||    
T  62274 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactacttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgaattc 62176  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  62175 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 62139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 152
Target Start/End: Original strand, 39305 - 39372
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggt 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39305 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 39372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 56628 - 56397
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  56628 aaagttgtagataattgtgttagctttccattggttttggtttaacttgcaaatgatttttggttttggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 56529  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |    
T  56528 agtaaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaatt 56430  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  56429 aaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 56397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26171 - 25940
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||     
T  26171 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaattatttttagtttttgagctatgatgaaaataccccaaggagg 26072  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| | |||     |  || | |||||||| |  |||||| ||||||    
T  26071 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactgatggatcgtcttcaatcttcaaaacttg-tgtactatgagttc 25973  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25972 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 25940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21193 - 21040
Alignment:
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  21193 agtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 21094  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||    
T  21093 aagggttttaagagcatttaacctatgttgtgagtttatc-ttgggataggaatg 21040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10356 - 10135
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||| |||| | ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  10356 catgaaagttttagaaaattgtgttagatttcaagtggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 10257  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||          |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  10256 tcttagtgaa-ttttatgaaaagtccgc----------ctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 10168  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  10167 aattaaggggtttgagagtatttaacctatgtt 10135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 9943 - 10057
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  9943 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagta 10038  T
Q  413 atgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10039 atgtaatatatttgtatat 10057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 30560 - 30496
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  30560 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttt 30496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18820 - 18589
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||      
T  18820 catgaaagttgtagatatttgtgttagctttccagtgactttggtttgacttgataatggtttttgtttttcgagttatgatgaaaatactccaaggaag 18721  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  18720 tcttagagaaatcttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 18622  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18621 aattaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 18589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 28559 - 28495
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  28559 catgaaagttgtagataatttttttagttttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttt 28495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 8162 - 7931
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||| || ||| ||||  |      
T  8162 catgaaaattttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttgtagattttgagatatgatggaattaccccaagaaag 8063  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || | |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  8062 tcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacatatgaaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 7963  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    || ||||   ||| ||| ||||||||||||||    
T  7962 aattaagaggtttgagaatatttaacctatgt 7931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34916 - 34689
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| |||     
T  34916 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttttttttttagttatgatgaaaatactccaaggagg 34817  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||    || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  34816 tcttagtgaaattttatgaaaataccgcataactatttcta----aacccaaaacttatggattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 34722  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34721 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 34689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2543 - 2403
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  2543 catgaaagttgtagataattttgttag-tttccaatggctttggttagacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactacaaagagg 2445  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 226  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2444 tcttagtgaagttttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 35913 - 36144
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||| || ||      
T  35913 catgaaagttttagataattttgctagctttccaatgacttcagttttacttgaaaatgattttttgctttttagttatgatgaaaatactcaaaggatg 36012  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||||||||| | | |   || |||| ||||| || |  ||||||||||||     
T  36013 tcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttctaagtcaactcaaaacttatgtattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactaggagttt 36111  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36112 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 36144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 316
Target Start/End: Original strand, 11603 - 11833
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||  ||||  ||     
T  11603 catgaaagttctagataatttagttagctttccaatgggtttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaacccaagcagg 11702  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| || || |||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11703 tcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 11802  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    || ||||   ||||||||| ||||||||||||    
T  11803 aattaagaggtttaagagt-tttaacctatgt 11833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 3186 - 3300
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||    
T  3186 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatattactgatgatctgtgaagctgttataatatcatttaatgttga----tagta 3281  T
Q  413 atgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3282 atgtaatatatttgtatat 3300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 158 - 1
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||     
T  158 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatggaaatagtccaaggagg 59  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  58 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaactta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 24456 - 24570
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  24456 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctgcaaagctgttataatatgatttaatgttga----tagta 24551  T
Q  413 atgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24552 atgtaatatatttgtatat 24570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 38465 - 38429
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  38465 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 38429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 228
Target Start/End: Original strand, 1030 - 1173
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  1030 catgaaagttttagataatttttttatctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 1129  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 228  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||    
T  1130 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagt 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 1373 - 1468
Alignment:
Q  247 ataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 343  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  1373 ataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 1468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 316
Target Start/End: Original strand, 11614 - 11844
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||   | ||||| | ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| | |     
T  11614 catgaaagtttaagataattgtgttagctttccagtggatttggtttaatttgaaaatgatttttagattttgagttatgatggaaatactccaaggcgg 11713  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| || ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11714 tcttggtaaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 11813  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    || ||| |   |||||||||||||||||||||    
T  11814 aattaa-gaggttaagagtatttaacctatgt 11844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 188 - 431
Target Start/End: Original strand, 19951 - 20183
Alignment:
Q  188 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 287  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  19951 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaat 20050  T
Q  288 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataa 387  Q
    |||||| |||||||||||       ||  ||||| || |   | ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20051 taaggtgtttaagagtat------aataatatga-tttagtgtaggggtaggaatgtggattgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataa 20143  T
Q  388 tatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    ||||||||| ||||||    |||||||||||||||||| |||||    
T  20144 tatgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttttatat 20183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Original strand, 19655 - 19774
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  19655 catgaaaattgtagataattgtgttagctttccattggctttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 19754  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  19755 tcttagtgaatttttatgaa 19774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 17764 - 17682
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt 395  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| |||||||||||||    
T  17764 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatagtaatgttgatgttcagtgagactgatataatatgattt 17682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2015 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold2015
Description:

Target: scaffold2015; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 195
Target Start/End: Original strand, 79 - 189
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  79 catgaaagtcgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 178  T
Q  185 tcttagtgaaa 195  Q
     |||| |||||    
T  179 acttaatgaaa 189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Original strand, 7251 - 7408
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  7251 catgaatgttttagataattgtgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 7350  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  7351 tcttagtgaaagtttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaactta 7408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14542 - 14424
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  || ||   | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  14542 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtgtggagtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 14443  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  14442 cttagtgaatttttatgaa 14424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 4555 - 4669
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    |||||    
T  4555 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatacaatattactgatgatctgtgaagttgttataatatgatttaatgatga----tagta 4650  T
Q  413 atgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4651 atgtaatatatttgtatat 4669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 85 - 229
Target Start/End: Original strand, 2449 - 2593
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  2449 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagttgctttgatttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatagtccaaggagg 2548  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagtt 229  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2549 tcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagtt 2593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 317
Target Start/End: Original strand, 3059 - 3149
Alignment:
Q  227 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3059 gttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 3149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 85 - 205
Target Start/End: Original strand, 24459 - 24579
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24459 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaagaga 24558  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaa 205  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  24559 tcttagtgaaattttatgaaa 24579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 321
Target Start/End: Original strand, 24586 - 24635
Alignment:
Q  272 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24586 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 24635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 316
Target Start/End: Original strand, 2176 - 2406
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||   | |||||| ||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||| ||||  ||     
T  2176 catgaaagttttagataatttagttagatttccaatggttttggtttgccttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagtagg 2275  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| || || |||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  2276 tcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagaactaggagttt 2375  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    || ||||   ||||||||| ||||||||||||    
T  2376 aattaagaggtttaagagt-tttaacctatgt 2406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 316
Target Start/End: Original strand, 10431 - 10661
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||   | |||||| ||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||| ||||  ||     
T  10431 catgaaagttttagataatttagttagatttccaatggttttggtttgccttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagtagg 10530  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    |||| || || |||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  10531 tcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagaactaggagttt 10630  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 316  Q
    || ||||   ||| ||||| ||||||||||||    
T  10631 aattaagaggtttgagagt-tttaacctatgt 10661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33469 - 33334
Alignment:
Q  190 gtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaacta 289  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  33469 gtgaaatcttatgaaaattcagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaacctcaaaactagaagcactatgagttcaatta 33370  T
Q  290 aggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttg 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33369 aggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 33334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33764 - 33648
Alignment:
Q  88 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  33764 gaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgactttggtttgacttgaaaatgagttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccgaggaggtct 33665  T
Q  188 tagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  33664 tagtgaatttttatgaa 33648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 313 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 2956 - 2849
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  2956 atgttatgaattgatccttggggtaggaatggaggttgaatacaatattaatgatgacctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagta 2861  T
Q  413 atgtaatatatt 424  Q
    ||||||||||||    
T  2860 atgtaatatatt 2849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 314 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 13391 - 13303
Alignment:
Q  314 tgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    ||||||||||| | | ||||||||| ||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13391 tgttatgagttaaaccttggggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg 13303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 314 - 402
Target Start/End: Original strand, 15959 - 16047
Alignment:
Q  314 tgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    ||||||||||||| | || |||||| ||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15959 tgttatgagttgaacctttgggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg 16047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 189 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17952 - 17721
Alignment:
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 288  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| || ||||| | || ||||||||||| |||| ||| |||||||| |    
T  17952 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtttatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactataagttctatgagttcaatt 17853  T
Q  289 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 388  Q
    ||| | |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  17852 aagatgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaaactattataat 17760  T
Q  389 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  17759 atgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 17721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18247 - 18130
Alignment:
Q  87 tgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatc 186  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18247 tgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcttttgtttgacatgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtc 18148  T
Q  187 ttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  18147 ttagtgaatttttatgaa 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 2285 - 2399
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  2285 atgttatgagttggtccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgtcctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagta 2380  T
Q  413 atgtaatatatttgtatat 431  Q
    || ||||||||||||||||    
T  2381 atttaatatatttgtatat 2399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 313 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8389 - 8296
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 406  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389 atgttatgagttaatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctttgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 8296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3619 - 3500
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||     
T  3619 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatgacgaaaataatccaaggagg 3520  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  3519 tcttagtgaatttttatgaa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 286 - 175
Alignment:
Q  316 ttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatg 415  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  286 ttatgagttgaaccttgggataggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatg 191  T
Q  416 taatatatttgtatat 431  Q
    ||||||||||||||||    
T  190 taatatatttgtatat 175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 1451 - 1361
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagcttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  1451 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagatatggttgttagcttt 1361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 3857 - 3743
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 412  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    |||||    
T  3857 atgttatgagttgatccttgaggtaggaatggaggttgattataatattactgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagta 3762  T
Q  413 atgtaatatatttgtatat 431  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3761 atgtaatatatttgtatat 3743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Original strand, 8016 - 8173
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| |||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||     
T  8016 catgaaaactgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgaagaaaataccacaaggagg 8115  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| || ||||||||||    
T  8116 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttcttagtcaacccaaaactta 8173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 242
Target Start/End: Original strand, 18526 - 18679
Alignment:
Q  89 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| || || | ||||||||||| ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  18526 aaagtcgtagacaattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgactcgaatataatttttggtttttgatttatgatgaaaatacttcaaggaggtctt 18625  T
Q  189 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  18626 agtgaaattttatgaaaattcggcataactatttctaagtcaaaccaaaactta 18679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 32899 - 32671
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||||| | | |||| |||||||||| || ||| ||||  |      
T  32899 catgaaagttttagataattttgttatctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttctagatttttagatatgatggaattaccccaagcaag 32800  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||  | || |||| |||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  32799 tcttgataaatttttatgaaaatt-agcataatcgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 32701  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 314  Q
    || ||||   ||  ||||||||||||||||    
T  32700 aattaagaagttggagagtatttaacctat 32671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Original strand, 11743 - 11974
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |     
T  11743 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggttttggttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaggggg 11842  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || || | |||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||| || ||||||    
T  11843 tcttagtgaaattttatgaaaatttcacataactatttctaggtcaaccgaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttc 11941  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11942 aattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 11974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 13150 - 13060
Alignment:
Q  25 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagcttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  13150 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattgtctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagatatggttgttagcttt 13060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Original strand, 20470 - 20627
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||   | ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||  ||     
T  20470 catgaaagttttagataattgtgttagtgttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgacggaaatactccaagtagg 20569  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 242  Q
    |||| | ||||||||  | ||| | ||||||||| |||| |||| || || |||||||    
T  20570 tcttggagaaattttaaggaaacttagcataactatttccaagtcaacccgaaactta 20627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 194
Target Start/End: Original strand, 16384 - 16493
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  16384 catgaaagttttagataattttgttagatttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagtagg 16483  T
Q  185 tcttagtgaa 194  Q
    ||||||||||    
T  16484 tcttagtgaa 16493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 317
Target Start/End: Original strand, 16525 - 16598
Alignment:
Q  244 ggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||  ||||| | |||||||||||||||    
T  16525 ggaataattcaaaacctcaaaactataagtactaggaatttaattaagggttttaaaaatatttaacctatgtt 16598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 13168 - 13402
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt-ggtttt---tgagatatgatgaaaatactccaat 180  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||| ||| |||| |   |||| ||||||||||| |||| ||     
T  13168 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatatttaggttgtgagtgagttatgatgaaaacactcgaag 13267  T
Q  181 gagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactagga 280  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |  | | |||| ||||||||| ||||| || ||    
T  13268 gaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgttcccaaacttcaaaactataagtattacga 13367  T
Q  281 gttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 315  Q
    ||| || ||||   |||||||||||||||| ||||    
T  13368 gtttaattaagaggtttaagagtatttaacatatg 13402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8614 - 8495
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  8614 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgaattgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaataatccaaggagg 8515  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  8514 tcttagtgaatttttatgaa 8495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21343 - 21225
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  21343 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 21244  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  21243 cttagtgaatttttatgaa 21225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 223
Target Start/End: Original strand, 7784 - 7911
Alignment:
Q  96 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||| || |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7784 tagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgaattaaaaatgatttttggtttgagagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 7883  T
Q  196 ttttttgaaaattcagcataactgtttc 223  Q
    ||||  |||||||| |||||||| ||||    
T  7884 ttttacgaaaattccgcataactatttc 7911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9696 - 9606
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  9696 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatact 9606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 232 - 313
Target Start/End: Original strand, 2377 - 2458
Alignment:
Q  232 tccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 313  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||    
T  2377 tccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaaccta 2458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 313 - 402
Target Start/End: Original strand, 60573 - 60662
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  60573 atgttatgagttgaaccttggggtaggaatggagattgtatatgatattaatgataatctgtgaagctgttataaaatgatttgatgttg 60662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 142870 - 142823
Alignment:
Q  54 ttttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagata 101  Q
    |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  142870 ttttctgttcagaattaggatttggtgtcttcatgaaagttgtagata 142823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6542 - 6423
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| || |||     
T  6542 catgaaagttgcagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtgtgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgcaaatactcaaaggagg 6443  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||| |||| |||| ||||    
T  6442 tcttaatgaatttttatgaa 6423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 168 - 53
Alignment:
Q  90 aagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaa-tgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  168 aagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 69  T
Q  189 agtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||| |||| ||||    
T  68 agtgaatttttatgaa 53  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13988 - 13909
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13988 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggaatcggtttgacttgaaaatgagttttggtttttgagttatg 13909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 40995 - 40916
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  40995 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcatcggtttgacttgaaaatgattttcggtttttgagttatg 40916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 37949 - 37886
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttt 148  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  ||||||||||    
T  37949 catgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttggtttgacttccaaatgatttt 37886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11885 - 11766
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||    | || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  11885 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttagagtaaacatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 11786  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaa 204  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  11785 tcttagtgaatttttatgaa 11766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9836 - 9718
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||   | ||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  9836 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggagtaaaaattatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 9737  T
Q  186 cttagtgaaattttttgaa 204  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  9736 cttagtgaatttttatgaa 9718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 333 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 10715 - 10643
Alignment:
Q  333 gggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatga-tttaatgttgata 405  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10715 gggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctgtgaagctg-tataatatgattttaatgttgata 10643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 313 - 405
Target Start/End: Original strand, 520 - 612
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatga-tttaatgttgata 405  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  520 atgttacgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatataaatgatgatctatgaagttg-tataatatgattttaatgttgata 612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0956 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0956
Description:

Target: scaffold0956; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 169
Target Start/End: Original strand, 2319 - 2403
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 169  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2319 catgaaagttgtagataattgcgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaa 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 169
Target Start/End: Original strand, 174544 - 174628
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 169  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  174544 catgaaagttgtagataattgcgttagccttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgatatatgatgaa 174628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 314 - 402
Target Start/End: Original strand, 27526 - 27614
Alignment:
Q  314 tgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27526 tgttatgagttgaaccttggggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg 27614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 402
Target Start/End: Original strand, 27646 - 27696
Alignment:
Q  352 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 402  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27646 atatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg 27696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 315 - 431
Target Start/End: Original strand, 621 - 733
Alignment:
Q  315 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 414  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || || |  ||| |||||| |||| | |||||||    |||||||    
T  621 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatattattgatgttcagtaagcctgatataatgtgatctgatgttga----tagtaat 716  T
Q  415 gtaatatatttgtatat 431  Q
    || ||||||||||||||    
T  717 gtgatatatttgtatat 733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 85807 - 85726
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt 395  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||    
T  85807 atgttacgagttgatccttggggtaggaatggaggttggatatgatattaatgatgatccgcgaagct-atataatatgattt 85726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 1109 - 874
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 184  Q
    |||||||||| || |||||| |||||| |||  |||||  |  ||||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||   |     
T  1109 catgaaagttttatataattgtgttagatttataatgattttagtttgacttgaaaatgatttttatattttaagttatgatgaaaatactccaagtggg 1010  T
Q  185 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 284  Q
    ||||||  ||| |||   |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||| |||| ||  |  ||| ||||  |||||||  | |||||  ||||||    
T  1009 tcttaggaaaactttacaaaaattcagcataaccatttcttagtcaacccaaagcttatggtttgtttccaaactccaaaact-tatgtactttgagttc 911  T
Q  285 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 321  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  910 aattaaggtgtttaagggtatttaacctatgatatga 874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 12089 - 12157
Alignment:
Q  31 taggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtaga 99  Q
    ||||||||||||||||| |   | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12089 taggaaaatcaacttttctaccactttcttttctgaattaggtttgggagtattcatgaaagttgtaga 12157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 395
Target Start/End: Original strand, 18026 - 18108
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt 395  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| |||||||||||||    
T  18026 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgattt 18108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 259 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2422 - 2364
Alignment:
Q  259 ctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  2422 ctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgtt 2364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 116673 - 116608
Alignment:
Q  318 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 383  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  116673 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgtt 116608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 134805 - 134770
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134805 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 134770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 137274 - 137239
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  137274 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 137239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 139743 - 139708
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139743 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 139708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 142212 - 142177
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142212 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 142177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 144681 - 144646
Alignment:
Q  86 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144681 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 144646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1405 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1405
Description:

Target: scaffold1405; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 1252 - 1214
Alignment:
Q  59 tgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgta 97  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1252 tgttctgaattaggtttggaagtcttcatgaaagttgta 1214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 958 - 894
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||| || |||||||||||    
T  958 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtgcaaatgattttt 894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 317
Target Start/End: Original strand, 1 - 49
Alignment:
Q  269 gaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 317  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1 gaagtgctatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 49  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 1000 - 936
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  1000 catgaaagttttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttt 936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1964 - 1928
Alignment:
Q  315 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttga 351  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1964 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttga 1928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 361
Target Start/End: Original strand, 29282 - 29330
Alignment:
Q  313 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatatt 361  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29282 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtatt 29330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1043 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1043
Description:

Target: scaffold1043; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 101
Target Start/End: Original strand, 856 - 903
Alignment:
Q  54 ttttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagata 101  Q
    |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  856 ttttctgttcagaattaggatttggtgtcttcatgaaagttgtagata 903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17278 - 17163
Alignment:
Q  127 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 226  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||  || | ||| | ||| |||  |||||||| ||| || |||||||||    
T  17278 ggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaagaaggttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtttctaa 17179  T
Q  227 gttaatccaaaactta 242  Q
    || || ||||| ||||    
T  17178 gtcaacccaaacctta 17163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Original strand, 35026 - 35117
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactc 176  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||| || ||||| || | | |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  35026 catgaaagttttagagaattgagttggcattccattggccttggtttgacttgaaaataatattttgtttttgagttatgaagaaaatactc 35117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 1465 - 1416
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgac 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||    
T  1465 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgac 1416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 10411 - 10358
Alignment:
Q  315 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatg 368  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| || ||||||    
T  10411 gttatgagttgatccttggtgtaggaatagaggttgattataatgtttatgatg 10358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 11688 - 11659
Alignment:
Q  352 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11688 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 11659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 18295 - 18231
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  18295 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgaggtccaaatgattttt 18231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 54036 - 53972
Alignment:
Q  85 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 149  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  54036 catgaaagttttagataattatgttaactttctaatggctttggtttgactttcaaatgattttt 53972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University